AlfalfaGEDB | MsG0380017584.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017584.01

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Find 121 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 137 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CATACTGGCTTGTGGGATGA+GGG	0.426425	3:-98113365	MsG0380017584.01.T01:CDS
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TCATACTGGCTTGTGGGATG+AGG	0.428079	3:-98113366	MsG0380017584.01.T01:CDS
GCGCATGATTTAATCACAAA+AGG	0.428939	3:+98114088	None:intergenic
AAAGGGAACGTGAATTTGTC+TGG	0.440652	3:+98114106	None:intergenic
CATATCAATCAACGCATTCT+CGG	0.442671	3:+98113988	None:intergenic
GGTTCTGATGATAGCGTTGT+AGG	0.452234	3:+98114207	None:intergenic
TGCCAATAAAGCCGGATTCA+AGG	0.454053	3:-98113214	MsG0380017584.01.T01:CDS
ATTTCTTGGAGTACAATGAT+TGG	0.459277	3:-98113503	MsG0380017584.01.T01:CDS
CAACTTGGAGCTCTTGAGGT+TGG	0.459631	3:-98113668	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTGGAACTTGTTTGATCAGT+TGG	0.462370	3:-98113540	MsG0380017584.01.T01:CDS
ATTGGAGGGCTGGCTAATCA+TGG	0.470990	3:-98113485	MsG0380017584.01.T01:CDS
CTATGCGTGCAAGGTGTTTG+AGG	0.472781	3:-98113942	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTCAAAGATGCCAATAAAGC+CGG	0.472873	3:-98113222	MsG0380017584.01.T01:CDS
AACGACCAAGAAGATCAATA+AGG	0.473016	3:+98113276	None:intergenic
GAGTTCCATATCCTTGAATC+CGG	0.474289	3:+98113203	None:intergenic
TTATCATCATCTTCTTCTAC+GGG	0.479328	3:+98112849	None:intergenic
TATGGGAGAATGGGTTGTTA+TGG	0.481563	3:-98113779	MsG0380017584.01.T01:CDS
TCGTTCAGGACACCTTGGTC+AGG	0.485405	3:-98113258	MsG0380017584.01.T01:CDS
ATAACTGGGTATGGGAGAAT+GGG	0.485708	3:-98113788	MsG0380017584.01.T01:CDS
ACCTCAATCGAACTACTCCC+CGG	0.487537	3:+98112990	None:intergenic
GAGTACAATGATTGGAGGGC+TGG	0.488985	3:-98113495	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTCATCAATGCAACCACACT+TGG	0.493914	3:+98113565	None:intergenic
CTTGGTCGTTCAGGACACCT+TGG	0.494870	3:-98113263	MsG0380017584.01.T01:CDS
AGGTGAAGATATTTGGGTGT+AGG	0.495075	3:+98114227	None:intergenic
ACATAGTTTCCAGATTCCTC+TGG	0.497843	3:+98113104	None:intergenic
GTCTTGGGATGCAGGTTCAT+GGG	0.510019	3:-98114048	MsG0380017584.01.T01:CDS
ACGACTATGATAACTGGGTA+TGG	0.511468	3:-98113797	MsG0380017584.01.T01:CDS
CTTGCTCTCATACTGGCTTG+TGG	0.518160	3:-98113373	MsG0380017584.01.T01:CDS
CGCATGATTTAATCACAAAA+GGG	0.520921	3:+98114089	None:intergenic
GCTATAATACTAATCTCATC+CGG	0.526502	3:+98113710	None:intergenic
TGCACAACTTGGAGCTCTTG+AGG	0.526721	3:-98113672	MsG0380017584.01.T01:CDS
TCTTGGAGTACAATGATTGG+AGG	0.528012	3:-98113500	MsG0380017584.01.T01:CDS
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GTGGTTGCATTGATGAAGCT+TGG	0.536805	3:-98113559	MsG0380017584.01.T01:CDS
GCAAATGGTGGGTATTGAAC+CGG	0.538297	3:-98113729	MsG0380017584.01.T01:CDS
TGCAAGGTGTTTGAGGAAAT+GGG	0.538848	3:-98113935	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTGCCAGCGTGTGCACAACT+TGG	0.539535	3:-98113683	MsG0380017584.01.T01:CDS
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GTTTGATCAGTTGGTTGAGA+AGG	0.549592	3:-98113531	MsG0380017584.01.T01:CDS
CATTGCAATGAAACAACTCA+TGG	0.553681	3:-98113135	MsG0380017584.01.T01:CDS
ACTCTTTGTTAAGCTCGTGT+AGG	0.554320	3:-98113184	MsG0380017584.01.T01:CDS
GGATTTAACCTATGCGTGCA+AGG	0.560180	3:-98113951	MsG0380017584.01.T01:CDS
AAGAGGTTAAAGAAAACCCC+GGG	0.561259	3:-98113008	MsG0380017584.01.T01:CDS
GTTGGATTCATGCGACAACA+TGG	0.562024	3:-98114287	MsG0380017584.01.T01:CDS
CCCGGGGAGTAGTTCGATTG+AGG	0.562376	3:-98112991	MsG0380017584.01.T01:CDS
CTTGGACGACTATGATAACT+GGG	0.564721	3:-98113802	MsG0380017584.01.T01:CDS
CTTGGAGTACAATGATTGGA+GGG	0.573892	3:-98113499	MsG0380017584.01.T01:CDS
CTCAAACACCTTGCACGCAT+AGG	0.576313	3:+98113943	None:intergenic
CGACTATGATAACTGGGTAT+GGG	0.580556	3:-98113796	MsG0380017584.01.T01:CDS
TGGGCTAGTTTACAAATTTG+GGG	0.583228	3:-98114029	MsG0380017584.01.T01:CDS
ATACTGGCTTGTGGGATGAG+GGG	0.586098	3:-98113364	MsG0380017584.01.T01:CDS
GGGTTGTTATGGTGATGCAT+TGG	0.595450	3:-98113768	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTGGAGGGCTGGCTAATCAT+GGG	0.600161	3:-98113484	MsG0380017584.01.T01:CDS
ACTCATGGAGCTTGAGCCAG+AGG	0.600344	3:-98113120	MsG0380017584.01.T01:CDS
TAGGAGTTGCTTGAAGAGCA+AGG	0.604485	3:+98114246	None:intergenic
AGAGTGTGATTGCTGAAGAA+TGG	0.606113	3:+98114167	None:intergenic
TTTGTGATTAAATCATGCGC+GGG	0.612370	3:-98114085	MsG0380017584.01.T01:CDS
TGGGGCAGATGAATAGTGCA+AGG	0.614642	3:-98113862	MsG0380017584.01.T01:CDS
TGATATGTATACGAAATTTG+GGG	0.624964	3:-98113972	MsG0380017584.01.T01:CDS
GGGCTGGCTAATCATGGGAA+AGG	0.625167	3:-98113479	MsG0380017584.01.T01:CDS
GGAAACTCATAAGAAACAAG+AGG	0.632781	3:-98113025	MsG0380017584.01.T01:CDS
TATTTGGGTATGTGAAATTG+GGG	0.633057	3:-98113880	MsG0380017584.01.T01:CDS
TATATGCAGAACATGGCAAG+TGG	0.633700	3:-98113067	MsG0380017584.01.T01:CDS
GCTCCAAGTTGTGCACACGC+TGG	0.636267	3:+98113680	None:intergenic
TTCGATTGAGGTCAACAATG+TGG	0.642011	3:-98112979	MsG0380017584.01.T01:CDS
CAAGAGGTTAAAGAAAACCC+CGG	0.645142	3:-98113009	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTTCTGGAGATGCAAATGGT+GGG	0.649979	3:-98113740	MsG0380017584.01.T01:CDS
CATGAACCTGCATCCCAAGA+CGG	0.659408	3:+98114050	None:intergenic
TTGGATTCATGCGACAACAT+GGG	0.659432	3:-98114286	MsG0380017584.01.T01:CDS
GTGTGATTGCTGAAGAATGG+TGG	0.665682	3:+98114170	None:intergenic
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GGGGCAGATGAATAGTGCAA+GGG	0.671020	3:-98113861	MsG0380017584.01.T01:CDS
TTGTGTAAAGAGCCTGACCA+AGG	0.671919	3:+98113246	None:intergenic
TTGTGATTAAATCATGCGCG+GGG	0.675253	3:-98114084	MsG0380017584.01.T01:CDS
ATTGAAATGTATGCCAAGTG+TGG	0.677658	3:-98113578	MsG0380017584.01.T01:CDS
GCAAACATATATGCAGAACA+TGG	0.681491	3:-98113074	MsG0380017584.01.T01:CDS
ATGGTGGTGATTGTGAGCGT+AGG	0.692236	3:+98114186	None:intergenic
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CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	ATTGATATGTATACGAAATT+TGG	-	Chr3:98113151-98113170	MsG0380017584.01.T01:CDS	20.0%
!!	TTGATATGTATACGAAATTT+GGG	-	Chr3:98113152-98113171	MsG0380017584.01.T01:CDS	20.0%
!	ATATTTGGGTATGTGAAATT+GGG	-	Chr3:98113244-98113263	MsG0380017584.01.T01:CDS	25.0%
!	CTTGGAATAGTTTGATATTT+GGG	-	Chr3:98113230-98113249	MsG0380017584.01.T01:CDS	25.0%
!	GGGAAAATGTATCAAATATT+AGG	-	Chr3:98114079-98114098	MsG0380017584.01.T01:CDS	25.0%
!	TCTTGGAATAGTTTGATATT+TGG	-	Chr3:98113229-98113248	MsG0380017584.01.T01:CDS	25.0%
!	TGATATGTATACGAAATTTG+GGG	-	Chr3:98113153-98113172	MsG0380017584.01.T01:CDS	25.0%
!	TTTATCATCATCTTCTTCTA+CGG	+	Chr3:98114280-98114299	None:intergenic	25.0%
	ATATGTATGCCGACAAAAAT+GGG	-	Chr3:98113491-98113510	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
	ATTTCTTGGAGTACAATGAT+TGG	-	Chr3:98113622-98113641	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
	CCAAGAAATGTTATCTCATT+AGG	+	Chr3:98113721-98113740	None:intergenic	30.0%
	CCTAATGAGATAACATTTCT+TGG	-	Chr3:98113718-98113737	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
	CGCATGATTTAATCACAAAA+GGG	+	Chr3:98113039-98113058	None:intergenic	30.0%
	GATATTTGGGTATGTGAAAT+TGG	-	Chr3:98113243-98113262	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
	GCTATAATACTAATCTCATC+CGG	+	Chr3:98113418-98113437	None:intergenic	30.0%
	TATTTGGGTATGTGAAATTG+GGG	-	Chr3:98113245-98113264	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
	TTATCATCATCTTCTTCTAC+GGG	+	Chr3:98114279-98114298	None:intergenic	30.0%
!	TTTTGTGATTAAATCATGCG+CGG	-	Chr3:98113039-98113058	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
!!	ATGGGCTAGTTTACAAATTT+GGG	-	Chr3:98113095-98113114	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
!!!	GTATTTTGATGTTATGAGTG+CGG	-	Chr3:98113789-98113808	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
!!!	TATTTTGATGTTATGAGTGC+GGG	-	Chr3:98113790-98113809	MsG0380017584.01.T01:CDS	30.0%
	AACGACCAAGAAGATCAATA+AGG	+	Chr3:98113852-98113871	None:intergenic	35.0%
	ACTCTTCGAAGAAATGTGTA+AGG	-	Chr3:98113684-98113703	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	ATTGAAATGTATGCCAAGTG+TGG	-	Chr3:98113547-98113566	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	CAAAAGACCTCTTGTGAAAA+TGG	+	Chr3:98114204-98114223	None:intergenic	35.0%
	CAACCATAATGCTCAATTTC+TGG	+	Chr3:98113829-98113848	None:intergenic	35.0%
	CATATCAATCAACGCATTCT+CGG	+	Chr3:98113140-98113159	None:intergenic	35.0%
	CATATGTATGCCGACAAAAA+TGG	-	Chr3:98113490-98113509	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	CATTGCAATGAAACAACTCA+TGG	-	Chr3:98113990-98114009	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	CGTTGTAGGTGAAGATATTT+GGG	+	Chr3:98112907-98112926	None:intergenic	35.0%
	GAACCAGAAATTGAGCATTA+TGG	-	Chr3:98113823-98113842	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	GACTAGAACAAATGACTTGA+TGG	-	Chr3:98114251-98114270	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	GCAAACATATATGCAGAACA+TGG	-	Chr3:98114051-98114070	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	GCGCATGATTTAATCACAAA+AGG	+	Chr3:98113040-98113059	None:intergenic	35.0%
	GGAAACTCATAAGAAACAAG+AGG	-	Chr3:98114100-98114119	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
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	TAATCATGGGAAAGGTTATG+AGG	-	Chr3:98113654-98113673	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
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	TTGTTGAATGTGTGAGCATT+TGG	+	Chr3:98112988-98113007	None:intergenic	35.0%
	TTTGTGATTAAATCATGCGC+GGG	-	Chr3:98113040-98113059	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
!	CATTTTCACAAGAGGTCTTT+TGG	-	Chr3:98114202-98114221	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
!	TGATGCATTGGATGTTTTTC+TGG	-	Chr3:98113369-98113388	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
!	TTGGAACTTGTTTGATCAGT+TGG	-	Chr3:98113585-98113604	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
!!	CATGGGCTAGTTTACAAATT+TGG	-	Chr3:98113094-98113113	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
!!	CTGCAAAAACCCATTTTTGT+CGG	+	Chr3:98113503-98113522	None:intergenic	35.0%
!!	TGGGCTAGTTTACAAATTTG+GGG	-	Chr3:98113096-98113115	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
!!	TGTTTTTCTGGAGATGCAAA+TGG	-	Chr3:98113381-98113400	MsG0380017584.01.T01:CDS	35.0%
	AAAGGGAACGTGAATTTGTC+TGG	+	Chr3:98113022-98113041	None:intergenic	40.0%
	AAGAGGTTAAAGAAAACCCC+GGG	-	Chr3:98114117-98114136	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	ACATAGTTTCCAGATTCCTC+TGG	+	Chr3:98114024-98114043	None:intergenic	40.0%
	ACGACTATGATAACTGGGTA+TGG	-	Chr3:98113328-98113347	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
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	AGAGTGTGATTGCTGAAGAA+TGG	+	Chr3:98112961-98112980	None:intergenic	40.0%
	AGGTGAAGATATTTGGGTGT+AGG	+	Chr3:98112901-98112920	None:intergenic	40.0%
	ATAACTGGGTATGGGAGAAT+GGG	-	Chr3:98113337-98113356	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	ATATGCAGAACATGGCAAGT+GGG	-	Chr3:98114059-98114078	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	ATTGATCTTCTTGGTCGTTC+AGG	-	Chr3:98113853-98113872	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	CAAGAGACAATTGTCCTAAC+AGG	+	Chr3:98113307-98113326	None:intergenic	40.0%
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	CTGTTAGGACAATTGTCTCT+TGG	-	Chr3:98113305-98113324	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
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	CTTGGAGTACAATGATTGGA+GGG	-	Chr3:98113626-98113645	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	GAGTTCCATATCCTTGAATC+CGG	+	Chr3:98113925-98113944	None:intergenic	40.0%
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	TATATGCAGAACATGGCAAG+TGG	-	Chr3:98114058-98114077	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	TCTTGGACGACTATGATAAC+TGG	-	Chr3:98113322-98113341	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	TCTTGGAGTACAATGATTGG+AGG	-	Chr3:98113625-98113644	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	TTCATCAATGCAACCACACT+TGG	+	Chr3:98113563-98113582	None:intergenic	40.0%
	TTCGATTGAGGTCAACAATG+TGG	-	Chr3:98114146-98114165	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
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	TTGTGATTAAATCATGCGCG+GGG	-	Chr3:98113041-98113060	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!	AACATTTCTTGGCGTTTTGC+TGG	-	Chr3:98113729-98113748	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
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!	ATCCTTGAATCCGGCTTTAT+TGG	+	Chr3:98113916-98113935	None:intergenic	40.0%
!	GGTTGCCTTATTGATCTTCT+TGG	-	Chr3:98113844-98113863	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!	TGCAAGGTGTTTGAGGAAAT+GGG	-	Chr3:98113190-98113209	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!	TTTCTGGAGATGCAAATGGT+GGG	-	Chr3:98113385-98113404	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!!	AATGGGTTTTTGCAGAAGAC+TGG	-	Chr3:98113508-98113527	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!!	CTCAAAGCCATTTTCACAAG+AGG	-	Chr3:98114194-98114213	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!!	TATGGGAGAATGGGTTGTTA+TGG	-	Chr3:98113346-98113365	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTTCTGGAGATGCAAATGG+TGG	-	Chr3:98113384-98113403	MsG0380017584.01.T01:CDS	40.0%
	AACTTGGAGCTCTTGAGGTT+GGG	-	Chr3:98113458-98113477	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	AGAGGTTAAAGAAAACCCCG+GGG	-	Chr3:98114118-98114137	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	GATAACTGGGTATGGGAGAA+TGG	-	Chr3:98113336-98113355	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	GGATTTAACCTATGCGTGCA+AGG	-	Chr3:98113174-98113193	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	GTGTGATTGCTGAAGAATGG+TGG	+	Chr3:98112958-98112977	None:intergenic	45.0%
	GTTGGATTCATGCGACAACA+TGG	-	Chr3:98112838-98112857	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	TAGGAGTTGCTTGAAGAGCA+AGG	+	Chr3:98112882-98112901	None:intergenic	45.0%
	TGCCAATAAAGCCGGATTCA+AGG	-	Chr3:98113911-98113930	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	TTGTGTAAAGAGCCTGACCA+AGG	+	Chr3:98113882-98113901	None:intergenic	45.0%
!	GAGGTCTTTTGGATCCTAGA+AGG	-	Chr3:98114213-98114232	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
!	GATTTAAAGCCAGCCCTTCT+AGG	+	Chr3:98114230-98114249	None:intergenic	45.0%
!	GGGTTGTTATGGTGATGCAT+TGG	-	Chr3:98113357-98113376	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
!	GGTTCTGATGATAGCGTTGT+AGG	+	Chr3:98112921-98112940	None:intergenic	45.0%
!	GTGCAAGGTGTTTGAGGAAA+TGG	-	Chr3:98113189-98113208	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
!	GTGGTTGCATTGATGAAGCT+TGG	-	Chr3:98113566-98113585	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
!!	GCAAATGGTGGGTATTGAAC+CGG	-	Chr3:98113396-98113415	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
!!	TTGCTCTCATACTGGCTTGT+GGG	-	Chr3:98113753-98113772	MsG0380017584.01.T01:CDS	45.0%
	ACCTCAATCGAACTACTCCC+CGG	+	Chr3:98114138-98114157	None:intergenic	50.0%
	CAACTTGGAGCTCTTGAGGT+TGG	-	Chr3:98113457-98113476	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	CATGAACCTGCATCCCAAGA+CGG	+	Chr3:98113078-98113097	None:intergenic	50.0%
	CTCAAACACCTTGCACGCAT+AGG	+	Chr3:98113185-98113204	None:intergenic	50.0%
	GAGCTCTTGAGGTTGGGAAA+TGG	-	Chr3:98113464-98113483	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	GAGTACAATGATTGGAGGGC+TGG	-	Chr3:98113630-98113649	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	GGATTCTGTGTCACCGTCTT+GGG	-	Chr3:98113062-98113081	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	GGGGCAGATGAATAGTGCAA+GGG	-	Chr3:98113264-98113283	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	GTCTTGGGATGCAGGTTCAT+GGG	-	Chr3:98113077-98113096	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	TGCACAACTTGGAGCTCTTG+AGG	-	Chr3:98113453-98113472	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	TGGGGCAGATGAATAGTGCA+AGG	-	Chr3:98113263-98113282	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!	ATGGTGGTGATTGTGAGCGT+AGG	+	Chr3:98112942-98112961	None:intergenic	50.0%
!	CTATGCGTGCAAGGTGTTTG+AGG	-	Chr3:98113183-98113202	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!	CTTTTGGATCCTAGAAGGGC+TGG	-	Chr3:98114218-98114237	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	ATACTGGCTTGTGGGATGAG+GGG	-	Chr3:98113761-98113780	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	ATTGGAGGGCTGGCTAATCA+TGG	-	Chr3:98113640-98113659	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	CATACTGGCTTGTGGGATGA+GGG	-	Chr3:98113760-98113779	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	CTTGCTCTCATACTGGCTTG+TGG	-	Chr3:98113752-98113771	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	TCATACTGGCTTGTGGGATG+AGG	-	Chr3:98113759-98113778	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	TTGCTGGCTTGCTCTCATAC+TGG	-	Chr3:98113745-98113764	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
!!	TTGGAGGGCTGGCTAATCAT+GGG	-	Chr3:98113641-98113660	MsG0380017584.01.T01:CDS	50.0%
	ACTCATGGAGCTTGAGCCAG+AGG	-	Chr3:98114005-98114024	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	CCTCAATCGAACTACTCCCC+GGG	+	Chr3:98114137-98114156	None:intergenic	55.0%
	CGTCTTGGGATGCAGGTTCA+TGG	-	Chr3:98113076-98113095	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	CTCAATCGAACTACTCCCCG+GGG	+	Chr3:98114136-98114155	None:intergenic	55.0%
	CTTGGTCGTTCAGGACACCT+TGG	-	Chr3:98113862-98113881	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	GAGCTTGAGCCAGAGGAATC+TGG	-	Chr3:98114012-98114031	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	GGGATTCTGTGTCACCGTCT+TGG	-	Chr3:98113061-98113080	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	TCGTTCAGGACACCTTGGTC+AGG	-	Chr3:98113867-98113886	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	TTGCCAGCGTGTGCACAACT+TGG	-	Chr3:98113442-98113461	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
!!	GGGCTGGCTAATCATGGGAA+AGG	-	Chr3:98113646-98113665	MsG0380017584.01.T01:CDS	55.0%
	CCCGGGGAGTAGTTCGATTG+AGG	-	Chr3:98114134-98114153	MsG0380017584.01.T01:CDS	60.0%
	GCTCCAAGTTGTGCACACGC+TGG	+	Chr3:98113448-98113467	None:intergenic	60.0%
	GTGTCACCGTCTTGGGATGC+AGG	-	Chr3:98113069-98113088	MsG0380017584.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr3	gene	98112836	98114311	98112836	ID=MsG0380017584.01;Name=MsG0380017584.01
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Chr3	exon	98112836	98114311	98112836	ID=MsG0380017584.01.T01:exon:6175;Parent=MsG0380017584.01.T01
Chr3	CDS	98112836	98114311	98112836	ID=MsG0380017584.01.T01:cds;Parent=MsG0380017584.01.T01

Gene Sequence

>MsG0380017584.01.T01

ATGTTGGATTCATGCGACAACATGGGTCACGTGAGTTACGCTACCTTGCTCTTCAAGCAACTCCTACACCCAAATATCTTCACCTACAACGCTATCATCAGAACCTACGCTCACAATCACCACCATTCTTCAGCAATCACACTCTTCATCCAAATGCTCACACATTCAACAAATTCAGTTTTTCCAGACAAATTCACGTTCCCTTTTGTGATTAAATCATGCGCGGGGATTCTGTGTCACCGTCTTGGGATGCAGGTTCATGGGCTAGTTTACAAATTTGGGGCTGATTCGCACTGTATAACCGAGAATGCGTTGATTGATATGTATACGAAATTTGGGGATTTAACCTATGCGTGCAAGGTGTTTGAGGAAATGGGTCATAGAGATGTGATTTCTTGGAATAGTTTGATATTTGGGTATGTGAAATTGGGGCAGATGAATAGTGCAAGGGAACTGTTTGATGAAATGCCTGTTAGGACAATTGTCTCTTGGACGACTATGATAACTGGGTATGGGAGAATGGGTTGTTATGGTGATGCATTGGATGTTTTTCTGGAGATGCAAATGGTGGGTATTGAACCGGATGAGATTAGTATTATAGCTGTTTTGCCAGCGTGTGCACAACTTGGAGCTCTTGAGGTTGGGAAATGGATTCATATGTATGCCGACAAAAATGGGTTTTTGCAGAAGACTGGTATATGCAATGCATTGATTGAAATGTATGCCAAGTGTGGTTGCATTGATGAAGCTTGGAACTTGTTTGATCAGTTGGTTGAGAAGGATGTGATTTCTTGGAGTACAATGATTGGAGGGCTGGCTAATCATGGGAAAGGTTATGAGGCAATTCAACTCTTCGAAGAAATGTGTAAGGTGCGAGTCGCTCCTAATGAGATAACATTTCTTGGCGTTTTGCTGGCTTGCTCTCATACTGGCTTGTGGGATGAGGGGTTGAAGTATTTTGATGTTATGAGTGCGGGCTATCATATAGAACCAGAAATTGAGCATTATGGTTGCCTTATTGATCTTCTTGGTCGTTCAGGACACCTTGGTCAGGCTCTTTACACAATTTCAAAGATGCCAATAAAGCCGGATTCAAGGATATGGAACTCTTTGTTAAGCTCGTGTAGGATTCATCGCAATCTTGAGATTGCTGTCATTGCAATGAAACAACTCATGGAGCTTGAGCCAGAGGAATCTGGAAACTATGTTTTGCTTGCAAACATATATGCAGAACATGGCAAGTGGGAAAATGTATCAAATATTAGGAAACTCATAAGAAACAAGAGGTTAAAGAAAACCCCGGGGAGTAGTTCGATTGAGGTCAACAATGTGGTTCAAGAATTTGTATCATCTGATGACTCAAAGCCATTTTCACAAGAGGTCTTTTGGATCCTAGAAGGGCTGGCTTTAAATCAGACTAGAACAAATGACTTGATGGAACCCGTAGAAGAAGATGATGATAAAAGTTCACTGTAA

Protein sequence

>MsG0380017584.01.T01

MLDSCDNMGHVSYATLLFKQLLHPNIFTYNAIIRTYAHNHHHSSAITLFIQMLTHSTNSVFPDKFTFPFVIKSCAGILCHRLGMQVHGLVYKFGADSHCITENALIDMYTKFGDLTYACKVFEEMGHRDVISWNSLIFGYVKLGQMNSARELFDEMPVRTIVSWTTMITGYGRMGCYGDALDVFLEMQMVGIEPDEISIIAVLPACAQLGALEVGKWIHMYADKNGFLQKTGICNALIEMYAKCGCIDEAWNLFDQLVEKDVISWSTMIGGLANHGKGYEAIQLFEEMCKVRVAPNEITFLGVLLACSHTGLWDEGLKYFDVMSAGYHIEPEIEHYGCLIDLLGRSGHLGQALYTISKMPIKPDSRIWNSLLSSCRIHRNLEIAVIAMKQLMELEPEESGNYVLLANIYAEHGKWENVSNIRKLIRNKRLKKTPGSSSIEVNNVVQEFVSSDDSKPFSQEVFWILEGLALNQTRTNDLMEPVEEDDDKSSL*