AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680032489.01

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MsG0680032489.01.T02 AT2G35620 40.072 277 157 5 30 305 304 572 2.63e-58 198
MsG0680032489.01.T02 AT2G35620 40.072 277 157 5 30 305 304 572 2.63e-58 198
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MsG0680032489.01.T02 AT2G18470 37.248 298 175 6 14 306 268 558 4.74e-58 198
MsG0680032489.01.T02 AT1G23540 39.604 303 152 7 18 305 359 645 4.78e-58 199
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MsG0680032489.01.T02 AT4G28670 36.808 307 178 7 18 316 319 617 1.83e-56 194
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MsG0680032489.01.T02 AT1G52540 38.305 295 166 8 16 304 23 307 2.97e-54 181
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MsG0680032489.01.T02 AT5G63930 34.932 292 180 3 18 304 728 1014 3.25e-54 191
MsG0680032489.01.T02 AT4G11490 38.305 295 172 6 30 320 321 609 3.25e-54 188
MsG0680032489.01.T02 AT4G23190 36.842 304 180 6 10 307 252 549 3.27e-54 187
MsG0680032489.01.T02 AT4G23190 36.842 304 180 6 10 307 252 549 3.27e-54 187
MsG0680032489.01.T02 AT4G23220 37.124 299 175 7 18 311 325 615 3.29e-54 188
MsG0680032489.01.T02 AT1G17230 37.241 290 175 4 18 304 787 1072 3.39e-54 191
MsG0680032489.01.T02 AT4G11530 37.261 314 187 6 4 313 326 633 3.42e-54 189
MsG0680032489.01.T02 AT4G23140 37.874 301 172 7 20 311 341 635 3.78e-54 188
MsG0680032489.01.T02 AT1G52540 38.305 295 166 8 16 304 26 310 4.41e-54 181
MsG0680032489.01.T02 AT1G17230 37.241 290 175 4 18 304 787 1072 4.57e-54 191
MsG0680032489.01.T02 AT5G01020 38.047 297 169 6 18 305 57 347 5.79e-54 182
MsG0680032489.01.T02 AT5G35370 35.385 325 172 7 15 314 502 813 6.40e-54 190
MsG0680032489.01.T02 AT4G23240 38.144 291 170 6 18 304 323 607 7.64e-54 187
MsG0680032489.01.T02 AT2G18890 32.566 304 192 6 1 300 39 333 7.85e-54 180
MsG0680032489.01.T02 AT4G23190 36.842 304 180 6 10 307 330 627 9.02e-54 187
MsG0680032489.01.T02 AT1G49730 37.349 332 180 10 16 334 345 661 9.89e-54 187
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MsG0680032489.01.T02 AT1G61590 37.374 297 171 6 18 305 87 377 1.30e-53 182
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MsG0680032489.01.T02 AT2G28250 36.424 302 172 6 18 305 198 493 2.61e-52 182
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MsG0680032489.01.T02 AT1G67520 37.542 301 177 8 16 310 482 777 8.30e-52 184
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MsG0680032489.01.T02 AT4G03230 37.000 300 181 5 11 308 572 865 2.61e-51 182
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MsG0680032489.01.T02 AT1G61420 35.294 323 194 7 17 333 481 794 1.88e-50 180
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MsG0680032489.01.T02 AT1G61430 35.826 321 196 7 17 333 453 767 1.98e-50 179
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MsG0680032489.01.T02 AT1G51830 38.542 288 162 9 18 301 376 652 4.55e-50 177
MsG0680032489.01.T02 AT1G16260 35.274 292 181 5 16 305 376 661 4.92e-50 178
MsG0680032489.01.T02 AT1G16260 35.274 292 181 5 16 305 376 661 4.92e-50 178
MsG0680032489.01.T02 AT1G51830 38.542 288 162 9 18 301 383 659 4.98e-50 177
MsG0680032489.01.T02 AT4G21390 45.374 227 118 4 17 242 516 737 5.12e-50 178
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MsG0680032489.01.T02 AT5G16500 35.185 324 191 7 16 328 60 375 7.54e-50 176
MsG0680032489.01.T02 AT1G61490 36.050 319 192 7 17 331 327 637 1.00e-49 176
MsG0680032489.01.T02 AT4G00970 36.735 294 172 8 25 311 339 625 1.07e-49 176
MsG0680032489.01.T02 AT1G76370 36.207 290 176 7 16 301 61 345 1.18e-49 171
MsG0680032489.01.T02 AT4G04570 43.056 216 117 4 18 232 336 546 1.40e-49 174
MsG0680032489.01.T02 AT1G52290 40.541 222 124 4 17 237 130 344 1.43e-49 170
MsG0680032489.01.T02 AT1G65800 37.838 296 169 7 17 304 510 798 1.45e-49 177
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MsG0680032489.01.T05 AT5G01550 38.462 117 65 3 38 154 541 650 7.77e-15 78.2
MsG0680032489.01.T05 AT3G55550 35.644 303 177 7 248 547 331 618 1.53e-56 202
MsG0680032489.01.T05 AT3G55550 34.586 133 80 4 38 167 505 633 9.28e-16 81.3
MsG0680032489.01.T05 AT1G15530 37.582 306 173 7 248 551 346 635 3.87e-56 201
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MsG0680032489.01.T05 AT5G10290 37.288 118 69 3 38 153 450 564 5.51e-15 78.6
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MsG0680032489.01.T05 AT4G23190 33.550 307 175 6 253 549 262 549 9.16e-48 176
MsG0680032489.01.T05 AT4G23190 30.612 147 94 4 36 177 429 572 2.47e-12 70.1
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MsG0680032489.01.T05 AT4G05200 33.667 300 183 6 250 547 352 637 1.27e-46 174
MsG0680032489.01.T05 AT4G05200 31.746 126 83 2 36 161 522 644 1.30e-11 68.2
MsG0680032489.01.T05 AT5G42120 35.144 313 190 7 244 552 347 650 1.91e-46 174
MsG0680032489.01.T05 AT5G42120 33.871 124 74 4 42 165 540 655 1.37e-12 71.2
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MsG0680032489.01.T05 AT5G63710 36.441 118 69 3 38 153 414 527 2.02e-12 70.5
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MsG0680032489.01.T05 AT1G61440 34.130 293 177 6 256 546 471 749 9.59e-43 164
MsG0680032489.01.T05 AT1G61440 31.343 134 88 3 37 169 636 766 2.30e-11 67.4
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MsG0680032489.01.T05 AT5G24080 34.884 129 77 4 39 164 563 687 1.40e-12 71.2
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MsG0680032489.01.T05 AT4G00970 35.556 225 134 4 250 474 331 544 4.27e-40 154
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MsG0680032489.01.T05 AT5G16900 29.503 322 211 5 249 570 561 866 3.42e-38 151
MsG0680032489.01.T05 AT4G04570 35.160 219 129 3 256 474 177 382 3.64e-38 145
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MsG0680032489.01.T05 AT1G51790 29.866 298 191 6 249 546 617 896 2.25e-36 145
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MsG0680032489.01.T05 AT1G07570 39.316 117 67 3 38 153 237 350 8.21e-15 77.0
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MsG0680032489.01.T04 AT2G13800 29.825 342 209 10 415 745 124 445 2.14e-43 164
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MsG0680032489.01.T04 AT3G13690 32.911 316 193 7 416 729 386 684 2.24e-40 159
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MsG0680032489.01.T04 AT5G10290 31.343 335 207 6 429 759 276 591 1.65e-47 179
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MsG0680032489.01.T04 AT4G35600 29.254 335 205 9 424 743 65 382 2.21e-37 145
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MsG0680032489.01.T04 AT2G07180 30.631 333 202 8 423 741 70 387 3.21e-37 145
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MsG0680032489.01.T04 AT5G01020 31.046 306 179 6 435 727 61 347 8.98e-35 137
MsG0680032489.01.T04 AT4G05200 34.568 324 180 7 18 341 353 644 9.31e-49 184
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MsG0680032489.01.T04 AT5G18610 30.100 299 194 5 431 726 71 357 9.56e-33 133
MsG0680032489.01.T04 AT5G18610 35.150 367 187 11 16 361 69 405 2.09e-46 173
MsG0680032489.01.T04 AT5G18610 30.100 299 194 5 431 726 71 357 9.56e-33 133
MsG0680032489.01.T04 AT2G26290 35.366 328 172 9 16 336 74 368 2.09e-46 171
MsG0680032489.01.T04 AT2G26290 31.818 308 186 7 429 727 74 366 4.69e-36 142
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MsG0680032489.01.T04 AT4G03230 33.333 297 174 5 436 726 526 804 2.81e-41 162
MsG0680032489.01.T04 AT4G00340 34.451 328 171 8 14 333 447 738 1.92e-44 172
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MsG0680032489.01.T04 AT4G00960 34.914 232 140 4 430 661 43 263 9.60e-42 154
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MsG0680032489.01.T04 AT1G61380 33.333 294 178 5 436 726 481 759 6.92e-39 155
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MsG0680032489.01.T04 AT2G18470 30.800 250 148 6 420 659 251 485 3.85e-32 132
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MsG0680032489.01.T04 AT1G34110 30.566 265 159 6 483 744 817 1059 4.47e-33 137
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MsG0680032489.01.T06 AT2G43700 30.435 345 210 9 124 458 297 621 2.97e-46 170
MsG0680032489.01.T06 AT2G13790 30.117 342 208 10 111 441 260 581 3.05e-46 169
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MsG0680032489.01.T06 AT4G11480 33.000 300 184 5 126 422 308 593 3.21e-46 170
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MsG0680032489.01.T06 AT4G23290 33.110 299 183 5 127 422 351 635 1.50e-45 169
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MsG0680032489.01.T06 AT2G35620 34.237 295 176 7 130 423 295 572 4.47e-44 163
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MsG0680032489.01.T06 AT1G55200 33.230 322 193 8 112 430 354 656 6.23e-44 164
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MsG0680032489.01.T06 AT4G03230 33.333 297 174 5 132 422 526 804 1.07e-43 164
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MsG0680032489.01.T06 AT4G04540 32.302 291 174 5 132 419 317 587 1.31e-43 162
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MsG0680032489.01.T06 AT4G04540 32.302 291 174 5 132 419 346 616 2.00e-43 162
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MsG0680032489.01.T06 AT2G18470 30.650 323 195 8 116 424 251 558 2.50e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT2G18470 30.650 323 195 8 116 424 251 558 2.50e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT1G31420 34.343 297 177 7 128 423 295 574 2.60e-43 161
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MsG0680032489.01.T06 AT4G23210 31.778 343 202 7 87 429 324 634 2.70e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT4G02010 31.054 351 218 9 107 446 348 685 2.71e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT1G61500 31.975 319 201 6 135 451 487 791 2.75e-43 163
MsG0680032489.01.T06 AT1G61500 31.975 319 201 6 135 451 492 796 2.92e-43 163
MsG0680032489.01.T06 AT5G60300 33.553 304 183 7 127 428 332 618 3.17e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT1G61360 33.333 291 178 4 135 422 413 690 3.32e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT1G61360 33.333 291 178 4 135 422 413 690 3.32e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT1G61360 33.333 291 178 4 135 422 413 690 3.32e-43 162
MsG0680032489.01.T06 AT1G70740 31.270 307 184 6 129 422 40 332 3.34e-43 157
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MsG0680032489.01.T06 AT1G61430 33.447 293 179 5 132 422 459 737 9.33e-43 161
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MsG0680032489.01.T06 AT3G45440 32.903 310 189 8 124 431 327 619 1.20e-41 157
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MsG0680032489.01.T06 AT1G61420 31.366 322 205 6 132 451 339 646 3.15e-41 156
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MsG0680032489.01.T06 AT1G61420 31.366 322 205 6 132 451 489 796 5.89e-41 156
MsG0680032489.01.T06 AT3G09830 32.143 336 201 10 101 423 45 366 6.42e-41 151
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MsG0680032489.01.T06 AT3G09830 32.143 336 201 10 101 423 45 366 6.42e-41 151
MsG0680032489.01.T06 AT1G61420 31.366 322 205 6 132 451 487 794 7.01e-41 156
MsG0680032489.01.T06 AT1G52310 33.333 294 180 5 130 419 181 462 8.49e-41 152
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MsG0680032489.01.T06 AT4G34440 31.023 303 190 7 127 425 300 587 9.37e-41 155
MsG0680032489.01.T06 AT5G18500 32.333 300 185 6 127 423 154 438 1.02e-40 152
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MsG0680032489.01.T06 AT5G18500 32.333 300 185 6 127 423 154 438 1.02e-40 152
MsG0680032489.01.T06 AT5G18500 32.333 300 185 6 127 423 154 438 1.02e-40 152
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MsG0680032489.01.T06 AT1G56720 32.776 299 185 7 127 423 167 451 7.86e-40 150
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MsG0680032489.01.T06 AT1G54820 29.560 318 206 6 128 437 136 443 3.13e-39 147
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MsG0680032489.01.T06 AT2G07180 30.631 333 202 8 119 437 70 387 4.71e-39 147
MsG0680032489.01.T06 AT1G26150 36.910 233 129 5 125 355 415 631 6.29e-39 149
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MsG0680032489.01.T06 AT1G21590 30.065 306 196 7 127 429 357 647 7.69e-39 149
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MsG0680032489.01.T06 AT2G28250 30.065 306 195 5 126 422 197 492 8.87e-39 148
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MsG0680032489.01.T06 AT5G01950 30.769 299 193 5 125 423 612 896 1.49e-38 149
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MsG0680032489.01.T06 AT1G61430 35.808 229 134 3 132 360 482 697 1.78e-38 149
MsG0680032489.01.T06 AT1G14370 30.225 311 190 7 125 423 72 367 1.84e-38 145
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MsG0680032489.01.T06 AT3G26940 29.661 354 216 9 76 422 24 351 2.17e-38 145
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MsG0680032489.01.T06 AT1G69790 30.449 312 188 7 123 422 68 362 3.08e-38 143
MsG0680032489.01.T06 AT1G11330 30.508 295 191 4 129 422 512 793 3.16e-38 148
MsG0680032489.01.T06 AT1G79620 29.642 307 191 7 119 419 618 905 3.82e-38 148
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MsG0680032489.01.T06 AT1G29730 37.946 224 124 5 127 350 661 869 4.08e-38 148
MsG0680032489.01.T06 AT1G79620 29.642 307 191 7 119 419 644 931 4.52e-38 148
MsG0680032489.01.T06 AT4G22130 29.967 307 192 6 123 422 379 669 4.57e-38 147
MsG0680032489.01.T06 AT5G02290 31.098 328 195 10 125 439 54 363 4.66e-38 143
MsG0680032489.01.T06 AT5G02290 31.098 328 195 10 125 439 54 363 4.66e-38 143
MsG0680032489.01.T06 AT1G20650 30.897 301 194 4 125 423 64 352 4.94e-38 142
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MsG0680032489.01.T01 AT5G59270 36.721 305 175 6 513 815 333 621 1.39e-53 198
MsG0680032489.01.T01 AT4G02410 37.342 316 162 7 106 419 345 626 5.56e-62 222
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MsG0680032489.01.T01 AT4G23320 32.333 300 186 5 516 812 170 455 1.64e-44 169
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MsG0680032489.01.T01 AT2G13800 29.240 342 211 9 501 831 124 445 3.60e-43 164
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MsG0680032489.01.T01 AT4G23130 33.775 302 179 6 516 812 331 616 1.16e-44 172
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MsG0680032489.01.T01 AT5G10290 35.569 343 183 9 81 419 256 564 2.20e-50 188
MsG0680032489.01.T01 AT5G10290 31.343 335 207 6 515 845 276 591 2.30e-47 179
MsG0680032489.01.T01 AT4G23280 36.182 351 183 10 86 433 320 632 2.24e-50 189
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MsG0680032489.01.T01 AT4G38830 32.686 309 185 6 525 826 340 632 6.88e-41 160
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MsG0680032489.01.T01 AT2G18470 36.086 327 164 11 100 419 268 556 4.73e-50 187
MsG0680032489.01.T01 AT2G18470 30.650 323 195 8 506 814 251 558 2.76e-41 161
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MsG0680032489.01.T01 AT2G07180 30.631 333 202 8 509 827 70 387 2.06e-37 146
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MsG0680032489.01.T01 AT4G23260 35.333 300 177 6 516 812 326 611 2.67e-46 177
MsG0680032489.01.T01 AT4G23260 34.906 318 172 9 112 427 335 619 5.23e-46 176
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MsG0680032489.01.T01 AT4G00340 30.744 309 184 7 517 814 451 740 4.60e-38 153
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MsG0680032489.01.T01 AT4G04570 37.184 277 134 9 70 346 148 384 6.28e-43 161
MsG0680032489.01.T01 AT4G04570 35.160 219 129 3 522 740 177 382 2.56e-37 145
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MsG0680032489.01.T01 AT1G11340 31.293 294 189 4 522 815 508 788 5.27e-42 166
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MsG0680032489.01.T01 AT5G03320 28.804 368 224 10 457 812 21 362 2.99e-36 142
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MsG0680032489.01.T01 AT4G00960 34.914 232 140 4 516 747 43 263 1.16e-41 154
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MsG0680032489.01.T01 AT1G61480 30.919 359 229 8 485 841 455 796 1.66e-40 160
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MsG0680032489.01.T01 AT4G04570 35.160 219 129 3 522 740 341 546 6.70e-36 144
MsG0680032489.01.T01 AT2G18470 36.704 267 130 9 100 363 268 498 1.23e-41 160
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MsG0680032489.01.T01 AT4G04540 36.073 219 127 3 522 740 346 551 5.02e-37 148
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MsG0680032489.01.T01 AT5G54380 30.333 300 186 6 515 809 496 777 1.06e-31 133
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MsG0680032489.01.T01 AT2G23200 30.284 317 201 8 517 829 476 776 6.92e-35 143
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MsG0680032489.01.T03 AT3G26940 29.661 354 216 9 476 822 24 351 9.10e-37 144
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MsG0680032489.01.T03 AT4G23320 32.333 300 186 5 526 822 170 455 1.94e-44 168
MsG0680032489.01.T03 AT4G23320 34.417 369 203 11 114 477 192 526 2.88e-53 194
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MsG0680032489.01.T03 AT5G02290 31.098 328 195 10 525 839 54 363 2.33e-36 142
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MsG0680032489.01.T03 AT2G13800 29.825 342 209 10 511 841 241 562 2.40e-42 164
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MsG0680032489.01.T03 AT5G63710 28.615 325 215 5 525 845 240 551 1.35e-41 161
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MsG0680032489.01.T03 AT4G23270 32.229 332 200 6 502 822 281 598 5.77e-44 169
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MsG0680032489.01.T03 AT4G23190 33.550 307 175 6 529 825 262 549 3.89e-46 175
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MsG0680032489.01.T03 AT4G34440 33.654 416 224 15 110 517 296 667 1.74e-47 180
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MsG0680032489.01.T03 AT1G11330 30.508 295 191 4 529 822 512 793 3.55e-36 147
MsG0680032489.01.T03 AT3G45390 34.682 346 169 9 110 454 335 624 4.46e-45 173
MsG0680032489.01.T03 AT3G45390 29.642 307 181 7 524 828 336 609 6.91e-31 130
MsG0680032489.01.T03 AT5G42440 34.161 322 174 8 114 432 69 355 4.76e-45 166
MsG0680032489.01.T03 AT5G42440 31.457 302 187 8 526 823 68 353 1.42e-30 124
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MsG0680032489.01.T03 AT1G67520 33.876 307 185 7 527 828 247 540 2.46e-44 169
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MsG0680032489.01.T03 AT5G03320 28.804 368 224 10 467 822 21 362 2.64e-36 142
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MsG0680032489.01.T03 AT1G61360 32.997 297 183 4 535 828 413 696 8.08e-41 161
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MsG0680032489.01.T03 AT3G17410 29.641 334 213 8 517 842 43 362 7.68e-33 131
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MsG0680032489.01.T03 AT1G61490 32.710 321 197 7 532 849 483 787 3.53e-39 157
MsG0680032489.01.T03 AT5G49660 33.121 314 164 9 128 431 658 935 1.89e-40 161
MsG0680032489.01.T03 AT5G49660 32.129 249 149 5 577 822 702 933 1.05e-31 134
MsG0680032489.01.T03 AT1G11300 31.034 377 216 11 71 445 442 776 1.92e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11300 29.932 294 187 5 529 822 484 758 2.89e-35 144
MsG0680032489.01.T03 AT4G21380 35.780 327 177 8 113 437 513 808 1.92e-40 161
MsG0680032489.01.T03 AT4G21380 31.333 300 189 6 527 822 514 800 1.19e-39 158
MsG0680032489.01.T03 AT1G11350 32.782 363 207 9 113 475 499 824 1.93e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11350 30.892 314 194 7 512 822 490 783 1.60e-33 139
MsG0680032489.01.T03 AT1G66150 34.603 315 170 10 123 432 585 868 1.94e-40 161
MsG0680032489.01.T03 AT1G66150 28.902 346 220 10 485 822 538 865 1.82e-31 133
MsG0680032489.01.T03 AT1G61490 32.036 334 194 7 113 445 451 752 1.97e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G61490 32.710 321 197 7 532 849 457 761 4.29e-39 156
MsG0680032489.01.T03 AT1G61490 32.036 334 194 7 113 445 451 752 1.97e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G61490 32.710 321 197 7 532 849 457 761 4.29e-39 156
MsG0680032489.01.T03 AT4G32300 31.579 380 212 12 111 487 480 814 2.05e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT4G32300 29.316 307 191 9 524 824 480 766 4.81e-35 144
MsG0680032489.01.T03 AT5G35370 33.631 336 166 11 111 426 502 800 2.10e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT5G35370 28.529 340 198 6 517 832 495 813 5.45e-39 156
MsG0680032489.01.T03 AT4G00970 35.968 253 134 5 121 373 339 563 2.17e-40 157
MsG0680032489.01.T03 AT4G00970 35.556 225 134 4 526 750 331 544 6.10e-39 153
MsG0680032489.01.T03 AT1G11300 31.034 377 216 11 71 445 457 791 2.23e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11300 29.932 294 187 5 529 822 499 773 2.64e-35 144
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 32.468 308 186 6 524 822 494 788 2.78e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 30.435 322 193 6 122 442 511 802 1.97e-36 148
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 32.468 308 186 6 524 822 472 766 2.88e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 28.342 374 223 8 70 442 451 780 6.05e-37 150
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 32.515 326 190 7 106 431 84 379 2.90e-40 155
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 31.773 299 188 6 527 822 92 377 6.99e-36 142
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 32.515 326 190 7 106 431 84 379 2.90e-40 155
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 31.773 299 188 6 527 822 92 377 6.99e-36 142
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 32.515 326 190 7 106 431 84 379 2.90e-40 155
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 31.773 299 188 6 527 822 92 377 6.99e-36 142
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 32.515 326 190 7 106 431 84 379 2.90e-40 155
MsG0680032489.01.T03 AT4G35030 31.773 299 188 6 527 822 92 377 6.99e-36 142
MsG0680032489.01.T03 AT1G34110 33.546 313 170 7 126 432 772 1052 3.03e-40 161
MsG0680032489.01.T03 AT1G34110 30.566 265 159 6 579 840 817 1059 5.52e-33 138
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 32.468 308 186 6 524 822 484 778 3.21e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 30.435 322 193 6 122 442 501 792 2.32e-36 148
MsG0680032489.01.T03 AT5G37450 32.923 325 181 9 114 437 595 883 3.26e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT5G37450 32.381 315 191 8 509 819 576 872 3.74e-37 151
MsG0680032489.01.T03 AT4G04540 36.559 279 133 9 83 356 314 553 3.34e-40 157
MsG0680032489.01.T03 AT4G04540 36.073 219 127 3 532 750 346 551 5.33e-37 148
MsG0680032489.01.T03 AT1G34110 33.546 313 170 7 126 432 772 1052 3.57e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G34110 30.224 268 162 6 579 843 817 1062 6.16e-33 137
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 32.468 308 186 6 524 822 482 776 3.64e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT1G11280 28.342 374 223 8 70 442 461 790 6.40e-37 149
MsG0680032489.01.T03 AT2G23200 34.295 312 170 9 116 426 478 755 3.93e-40 160
MsG0680032489.01.T03 AT2G23200 30.284 317 201 8 527 839 476 776 9.18e-35 143

Find 137 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 175 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCATATTAGGCCTCAAATT+TGG 0.195069 6:+42614203 None:intergenic
CAAAGAGGTAAGATTGTTAA+AGG 0.219395 6:-42614764 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTTTCAACCACAGGAAAATT+TGG 0.224206 6:+42613903 None:intergenic
TAGAATTGATCATTTCAAAT+TGG 0.234474 6:-42614537 MsG0680032489.01.T03:CDS
GAATGATGGCAGTGGATTTC+AGG 0.247099 6:-42613200 MsG0680032489.01.T03:CDS
CGACGACAATTGTCATGTTT+TGG 0.274960 6:-42613775 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAAGCTTCGACATCGGAATT+TGG 0.277319 6:-42613682 MsG0680032489.01.T03:CDS
GATACTACCAAATCAGTTAA+AGG 0.282990 6:-42613324 MsG0680032489.01.T03:CDS
GCAGCCGATGTTTATAGTTT+TGG 0.293977 6:-42613249 MsG0680032489.01.T03:CDS
AATGCTAAGTTAGGTGATTT+CGG 0.302100 6:-42614644 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTAAAACAATGCAAAGATTA+TGG 0.305630 6:+42615440 None:intergenic
GAAAATCCCTTTAACTGATT+TGG 0.313371 6:+42613317 None:intergenic
TCTCATTACAATGCTAAGTT+AGG 0.335548 6:-42614653 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATTTGAGGCCTAATATGAAA+TGG 0.339195 6:-42614199 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCCACAACCCATTTCATATT+AGG 0.359149 6:+42614191 None:intergenic
AGAATTGATCATTTCAAATT+GGG 0.362015 6:-42614536 MsG0680032489.01.T03:CDS
CTTTCTTTGAAGATTGTTGT+TGG 0.362224 6:+42615371 None:intergenic
CAAATTGTGAGCATTCTTGA+TGG 0.362697 6:-42613000 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTCAATGAAGAACAAGTTCT+AGG 0.372340 6:-42615073 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTTCTAGGAAGTGGAGGCTT+TGG 0.381226 6:-42615058 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAAGCTAAATACATCGCATT+TGG 0.383220 6:+42614439 None:intergenic
CTTCACCTTCTGAAACTACT+AGG 0.386655 6:-42614094 MsG0680032489.01.T03:CDS
CGGAATTTGGTTCAGCTTCG+CGG 0.387663 6:-42613669 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTCTTTATTTACATGAAGAA+TGG 0.390727 6:-42613479 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAATGCGATGTATTTAGCTT+TGG 0.392807 6:-42614437 MsG0680032489.01.T03:CDS
GACTTTGGAACTGCTTATCA+TGG 0.400612 6:-42613804 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCTTTGTATGAAATTTCTCT+TGG 0.403736 6:+42613879 None:intergenic
TCAAACGAACTCAGGAATCT+AGG 0.403843 6:-42613705 MsG0680032489.01.T03:CDS
AGGTAAGATTGTTAAAGGTT+TGG 0.406004 6:-42614759 MsG0680032489.01.T03:CDS
CTCATGCTTGGTCTTAATTG+AGG 0.406048 6:+42613024 None:intergenic
ACAAGGAAAGTAGGGAAGAA+TGG 0.407050 6:-42612951 MsG0680032489.01.T03:CDS
CATTTGGAAGTTCCGTTGCT+TGG 0.414431 6:+42614455 None:intergenic
TTGATAAGGTTGGTAAGATT+AGG 0.418649 6:-42613069 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTTGTGCTTGAAATTGTATC+TGG 0.419736 6:-42614410 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAAGAACTCGGTCAAGGCTT+CGG 0.421722 6:+42614831 None:intergenic
ACAAGCCCTTGGAGAAACTT+TGG 0.423079 6:+42615336 None:intergenic
CAGGTACCAAGAGGTTCTTT+TGG 0.425607 6:-42613181 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATCAGAAGGCTTTGTGATGA+AGG 0.426717 6:-42614332 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCTCCAAGGGCTTGTGGTGG+AGG 0.427667 6:-42615328 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCGCCTGAGTCAACATATTC+CGG 0.428383 6:+42613282 None:intergenic
TTCGACACAAGAATCTTGTT+AGG 0.430815 6:-42614913 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTACAATTTGCTGTCAAGAT+AGG 0.436679 6:-42615151 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTGGGAGAAACATCGAGAAT+TGG 0.439050 6:-42614518 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCGAGAATTGGCGGAACGAT+TGG 0.443320 6:-42614506 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATATCAGCTAATTCCTTCAA+TGG 0.447182 6:+42613123 None:intergenic
ATACTACCAAATCAGTTAAA+GGG 0.447652 6:-42613323 MsG0680032489.01.T03:CDS
CACAAGCATCTCTCCTTGTT+CGG 0.449346 6:+42613638 None:intergenic
ATCTTGTTAGGTTGAGAGGT+TGG 0.453363 6:-42614901 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCTGCATAGCTGAAAATCCT+TGG 0.453540 6:+42615118 None:intergenic
ATTTCACTATGTTGTACCTA+TGG 0.453866 6:+42613517 None:intergenic
CTCACAATTTGTCTCATGCT+TGG 0.455592 6:+42613012 None:intergenic
TCTTTATTTACATGAAGAAT+GGG 0.457176 6:-42613478 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTTGAGGCCTAATATGAAAT+GGG 0.460462 6:-42614198 MsG0680032489.01.T03:CDS
AGAGGATGAGATAGAAATGA+AGG 0.460740 6:+42614131 None:intergenic
AAATGTTGTTTATCAGAGAA+AGG 0.467928 6:-42614986 MsG0680032489.01.T03:CDS
ACATGAAGAACAAGGAAAGT+AGG 0.471136 6:-42612960 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCAAACTATGTTACAGCTGC+AGG 0.474918 6:-42614005 MsG0680032489.01.T03:CDS
CGCGGATGGTGCACCGAACA+AGG 0.477250 6:-42613651 MsG0680032489.01.T03:CDS
CACTTCATGATCCAAATTTG+AGG 0.481028 6:-42614214 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTATGTAGCTCAAGATGGTT+GGG 0.485372 6:-42615265 MsG0680032489.01.T03:CDS
GAAGACAAAGAGATATAAAG+AGG 0.488623 6:+42614113 None:intergenic
TTAGCTGATATAAGACTGAA+TGG 0.492869 6:-42613111 MsG0680032489.01.T03:CDS
CATGAAGAACAAGGAAAGTA+GGG 0.494716 6:-42612959 MsG0680032489.01.T03:CDS
TGAGAAAGAATTGATAAGGT+TGG 0.497248 6:-42613079 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTCTGCTACCCTTCTCGACT+CGG 0.497810 6:+42613830 None:intergenic
AGAGCAAAACTACTAAGTCT+TGG 0.500336 6:+42613393 None:intergenic
GAAGAACAAGTTCTAGGAAG+TGG 0.500595 6:-42615067 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATAATGAGAAAGAATTGATA+AGG 0.502828 6:-42613083 MsG0680032489.01.T03:CDS
AGGGTAGCAGAACTTGACTT+TGG 0.503503 6:-42613819 MsG0680032489.01.T03:CDS
TGTCCTCCACCACAAGCCCT+TGG 0.503523 6:+42615325 None:intergenic
TTTGCCAAGTGATGGAACTT+TGG 0.505541 6:-42615017 MsG0680032489.01.T03:CDS
GATACAAGGTTACAGAAAGA+TGG 0.509544 6:-42614290 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTGGTGCTTGAAATTGTTAG+TGG 0.509959 6:-42613222 MsG0680032489.01.T03:CDS
GCTTGTGGTTTATGATTACT+CGG 0.509983 6:-42613622 MsG0680032489.01.T03:CDS
CGGTCCTCGAATGGCACCAT+AGG 0.510069 6:-42613533 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCTCTTGGAGTTTCAACCAC+AGG 0.512645 6:+42613894 None:intergenic
ATCTAGGAAAGCTTCGACAT+CGG 0.512780 6:-42613689 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTCTAGAAGCAGCTGATACA+AGG 0.513177 6:-42614304 MsG0680032489.01.T03:CDS
TAGCACAAGTGGCACGATCT+CGG 0.515093 6:-42614066 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAGAATCTTGTTAGGTTGAG+AGG 0.515805 6:-42614905 MsG0680032489.01.T03:CDS
GATAGAAATGAAGGAAGTGA+AGG 0.522596 6:+42614140 None:intergenic
TGAAATTGTTAGTGGAATGA+TGG 0.523384 6:-42613214 MsG0680032489.01.T03:CDS
GAGAATCTATCGCGCAGTGC+AGG 0.523415 6:+42613726 None:intergenic
TAGGAACGATTATCAATGTT+CGG 0.524187 6:-42613553 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATTCGCAGAATTCAAGCTCT+AGG 0.526877 6:-42612898 MsG0680032489.01.T03:CDS
GCCTAATATGAAATGGGTTG+TGG 0.527225 6:-42614192 MsG0680032489.01.T03:CDS
TGTACCTATGGTGCCATTCG+AGG 0.527493 6:+42613529 None:intergenic
GTTATGTAGCTCAAGATGGT+TGG 0.529279 6:-42615266 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATAAAGAACTGCAGAAGCAA+GGG 0.538772 6:+42613494 None:intergenic
AAGATTCTTGTGTCGAAGAT+CGG 0.539683 6:+42614919 None:intergenic
ACTATAAACATCGGCTGCCG+AGG 0.541286 6:+42613254 None:intergenic
TTAAGTCCAAAGTTTCTCCA+AGG 0.544308 6:-42615342 MsG0680032489.01.T03:CDS
GTAACTTCTCCGAGTCGAGA+AGG 0.551458 6:-42613839 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAAGTTTCTCCAAGGGCTTG+TGG 0.551605 6:-42615334 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCTTCACCAAAAGAACCTCT+TGG 0.552586 6:+42613175 None:intergenic
AATAAAGAACTGCAGAAGCA+AGG 0.553315 6:+42613493 None:intergenic
GCAAGTTATGTAGCTCAAGA+TGG 0.556600 6:-42615270 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATTTGGTTCAGCTTCGCGGA+TGG 0.559179 6:-42613665 MsG0680032489.01.T03:CDS
TAAGTCCAAAGTTTCTCCAA+GGG 0.559971 6:-42615341 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATCAATGTTCGGTCCTCGAA+TGG 0.560431 6:-42613542 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATAGATTCTCAAACGAACTC+AGG 0.566422 6:-42613713 MsG0680032489.01.T03:CDS
TGTTAGTGGAATGATGGCAG+TGG 0.568860 6:-42613208 MsG0680032489.01.T03:CDS
GCAAAGATTATGGAGTTGCA+TGG 0.569468 6:+42615450 None:intergenic
AACAAATTCATAACAAAGGT+AGG 0.573034 6:-42613572 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTCAAGAATCACAGCTGAAG+AGG 0.575021 6:+42613428 None:intergenic
GCAACCAAAGTTCCATCACT+TGG 0.583179 6:+42615013 None:intergenic
GTTTCTCCAAGGGCTTGTGG+TGG 0.591554 6:-42615331 MsG0680032489.01.T03:CDS
TAACTTCTCCGAGTCGAGAA+GGG 0.594218 6:-42613838 MsG0680032489.01.T03:CDS
GGAGAAACATCGAGAATTGG+CGG 0.596306 6:-42614515 MsG0680032489.01.T03:CDS
TCGCCGGAATATGTTGACTC+AGG 0.597073 6:-42613285 MsG0680032489.01.T03:CDS
TAGGTGATTTCGGCATGGCA+AGG 0.597592 6:-42614634 MsG0680032489.01.T03:CDS
CCTCTTTGTCCCCAACCAAG+TGG 0.598769 6:+42614779 None:intergenic
ATAAACATCGGCTGCCGAGG+TGG 0.602727 6:+42613257 None:intergenic
AAAGAATTTACAAACATAGG+GGG 0.603215 6:-42615234 MsG0680032489.01.T03:CDS
TAGTATCATTGACTACATGA+TGG 0.606004 6:+42613340 None:intergenic
CCACTTGGTTGGGGACAAAG+AGG 0.607298 6:-42614779 MsG0680032489.01.T03:CDS
ACTAGGACTAGTAGCACAAG+TGG 0.616209 6:-42614077 MsG0680032489.01.T03:CDS
CTAGTCCTAGTAGTTTCAGA+AGG 0.618043 6:+42614089 None:intergenic
CTTGTGTCGAAGATCGGCCA+CGG 0.621278 6:+42614925 None:intergenic
TGCTTGAAATTGTATCTGGA+AGG 0.621411 6:-42614406 MsG0680032489.01.T03:CDS
GAACAAGTTCTAGGAAGTGG+AGG 0.625876 6:-42615064 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAAAGAATTTACAAACATAG+GGG 0.632056 6:-42615235 MsG0680032489.01.T03:CDS
ACTCGGTCAAGGCTTCGGTT+AGG 0.632710 6:+42614836 None:intergenic
CACACCAAAACTATAAACAT+CGG 0.633854 6:+42613245 None:intergenic
AGATAGGAAGAGACAATCCA+AGG 0.633857 6:-42615135 MsG0680032489.01.T03:CDS
TGACTCAGGCGAAGCCACCT+CGG 0.644772 6:-42613271 MsG0680032489.01.T03:CDS
TAAGTTAGGTGATTTCGGCA+TGG 0.645004 6:-42614639 MsG0680032489.01.T03:CDS
CTTCAACAAATTCATAACAA+AGG 0.648574 6:-42613576 MsG0680032489.01.T03:CDS
TTCTTGTCAAGAAATGAGCA+TGG 0.653627 6:-42613363 MsG0680032489.01.T03:CDS
CTTAGCTGAATTAAACGCCG+TGG 0.659995 6:-42614942 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAGAATTTACAAACATAGGG+GGG 0.672804 6:-42615233 MsG0680032489.01.T03:CDS
TGTAGCTCAAGATGGTTGGG+AGG 0.675561 6:-42615262 MsG0680032489.01.T03:CDS
AAACATGACAATTGTCGTCG+AGG 0.679499 6:+42613778 None:intergenic
GTGATTTCGGCATGGCAAGG+TGG 0.680005 6:-42614631 MsG0680032489.01.T03:CDS
AGTGGATTTCAGGTACCAAG+AGG 0.684593 6:-42613190 MsG0680032489.01.T03:CDS
ATTACTCAACATGAAGAACA+AGG 0.684860 6:-42612968 MsG0680032489.01.T03:CDS
CGAACAAGGAGAGATGCTTG+TGG 0.704565 6:-42613637 MsG0680032489.01.T03:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAGAATTTACAAACATA+GGG - Chr6:42613100-42613119 MsG0680032489.01.T03:CDS 15.0%
!!! ATAAAATCATTTTGATTGAT+TGG - Chr6:42613981-42614000 MsG0680032489.01.T03:CDS 15.0%
!! AAAAGAATTTACAAACATAG+GGG - Chr6:42613101-42613120 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
!! AGAATTGATCATTTCAAATT+GGG - Chr6:42613800-42613819 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
!! ATAATGAGAAAGAATTGATA+AGG - Chr6:42615253-42615272 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
!! CAAAAAGAATTTACAAACAT+AGG - Chr6:42613099-42613118 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
!! TAGAATTGATCATTTCAAAT+TGG - Chr6:42613799-42613818 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
!!! ATCAAAATGATTTTATCATC+AGG + Chr6:42613977-42613996 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTTATTTACATGAAGAAT+GGG - Chr6:42614858-42614877 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
!!! TTCTTTATTTACATGAAGAA+TGG - Chr6:42614857-42614876 MsG0680032489.01.T03:CDS 20.0%
! AAAGAATTTACAAACATAGG+GGG - Chr6:42613102-42613121 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
! AACAAATTCATAACAAAGGT+AGG - Chr6:42614764-42614783 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
! ATACTACCAAATCAGTTAAA+GGG - Chr6:42615013-42615032 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
! CTTCAACAAATTCATAACAA+AGG - Chr6:42614760-42614779 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
! GTAAAACAATGCAAAGATTA+TGG + Chr6:42612899-42612918 None:intergenic 25.0%
! TCTTTGTATGAAATTTCTCT+TGG + Chr6:42614460-42614479 None:intergenic 25.0%
!! AAATCAGTTAAAGGGATTTT+CGG - Chr6:42615021-42615040 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
!! AAATGTTGTTTATCAGAGAA+AGG - Chr6:42613350-42613369 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
!!! ATTGTTTTACCACAAAATTC+GGG - Chr6:42612909-42612928 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
!!! CATTGTTTTACCACAAAATT+CGG - Chr6:42612908-42612927 MsG0680032489.01.T03:CDS 25.0%
AAAGCTAAATACATCGCATT+TGG + Chr6:42613900-42613919 None:intergenic 30.0%
AACAAAAAAACAGTGGAATC+AGG - Chr6:42614377-42614396 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
AAGAATTTACAAACATAGGG+GGG - Chr6:42613103-42613122 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
AATGCTAAGTTAGGTGATTT+CGG - Chr6:42613692-42613711 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
AATTTGAAAAATGAGCCACT+TGG - Chr6:42613542-42613561 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
AGGTAAGATTGTTAAAGGTT+TGG - Chr6:42613577-42613596 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
ATATCAGCTAATTCCTTCAA+TGG + Chr6:42615216-42615235 None:intergenic 30.0%
ATTACTCAACATGAAGAACA+AGG - Chr6:42615368-42615387 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
ATTTCACTATGTTGTACCTA+TGG + Chr6:42614822-42614841 None:intergenic 30.0%
CAAAGAGGTAAGATTGTTAA+AGG - Chr6:42613572-42613591 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
CACACCAAAACTATAAACAT+CGG + Chr6:42615094-42615113 None:intergenic 30.0%
GAAAATCCCTTTAACTGATT+TGG + Chr6:42615022-42615041 None:intergenic 30.0%
GAAGACAAAGAGATATAAAG+AGG + Chr6:42614226-42614245 None:intergenic 30.0%
GATAAGAAAAAGACCATTGA+AGG - Chr6:42615200-42615219 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
GATACTACCAAATCAGTTAA+AGG - Chr6:42615012-42615031 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TAGGAACGATTATCAATGTT+CGG - Chr6:42614783-42614802 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TCTCATTACAATGCTAAGTT+AGG - Chr6:42613683-42613702 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TGAAATTGTTAGTGGAATGA+TGG - Chr6:42615122-42615141 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TGAGAAAGAATTGATAAGGT+TGG - Chr6:42615257-42615276 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TTAGCTGATATAAGACTGAA+TGG - Chr6:42615225-42615244 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TTCAATGAAGAACAAGTTCT+AGG - Chr6:42613263-42613282 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
TTCATATTAGGCCTCAAATT+TGG + Chr6:42614136-42614155 None:intergenic 30.0%
! AAATGCGATGTATTTAGCTT+TGG - Chr6:42613899-42613918 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
! ATTATTTCACCCGAATTTTG+TGG + Chr6:42612921-42612940 None:intergenic 30.0%
! ATTTGAGGCCTAATATGAAA+TGG - Chr6:42614137-42614156 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
! CTTTCTTTGAAGATTGTTGT+TGG + Chr6:42612968-42612987 None:intergenic 30.0%
! GAACTTTTCATAGGTTCAAA+TGG - Chr6:42613239-42613258 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
! GATTAAGCTAAGATTTTCAG+CGG + Chr6:42614296-42614315 None:intergenic 30.0%
! TAGTATCATTGACTACATGA+TGG + Chr6:42614999-42615018 None:intergenic 30.0%
! TGTTGTTGGAAATTCTTTTC+AGG + Chr6:42612954-42612973 None:intergenic 30.0%
! TTTGAGGCCTAATATGAAAT+GGG - Chr6:42614138-42614157 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
!! TAAGACTGTTTTTCATGACA+TGG - Chr6:42613157-42613176 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
!! TTGATAAGGTTGGTAAGATT+AGG - Chr6:42615267-42615286 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
!! TTTTGATTGATTGGATCAGA+AGG - Chr6:42613990-42614009 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
!!! ATGTTTTGGTGAAAAGGTTA+GGG - Chr6:42614575-42614594 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
!!! ATTGTCATGTTTTGGTGAAA+AGG - Chr6:42614569-42614588 MsG0680032489.01.T03:CDS 30.0%
AAGATTCTTGTGTCGAAGAT+CGG + Chr6:42613420-42613439 None:intergenic 35.0%
AATAAAGAACTGCAGAAGCA+AGG + Chr6:42614846-42614865 None:intergenic 35.0%
ACAGCTGAACAAAAAAACAG+TGG - Chr6:42614370-42614389 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
ACATGAAGAACAAGGAAAGT+AGG - Chr6:42615376-42615395 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
AGAGCAAAACTACTAAGTCT+TGG + Chr6:42614946-42614965 None:intergenic 35.0%
AGAGGATGAGATAGAAATGA+AGG + Chr6:42614208-42614227 None:intergenic 35.0%
ATAAAGAACTGCAGAAGCAA+GGG + Chr6:42614845-42614864 None:intergenic 35.0%
ATAGATTCTCAAACGAACTC+AGG - Chr6:42614623-42614642 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
CAAATTGTGAGCATTCTTGA+TGG - Chr6:42615336-42615355 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
CACTTCATGATCCAAATTTG+AGG - Chr6:42614122-42614141 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
CATGAAGAACAAGGAAAGTA+GGG - Chr6:42615377-42615396 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
GATACAAGGTTACAGAAAGA+TGG - Chr6:42614046-42614065 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
GATAGAAATGAAGGAAGTGA+AGG + Chr6:42614199-42614218 None:intergenic 35.0%
GCTTGTGGTTTATGATTACT+CGG - Chr6:42614714-42614733 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
GTTGTGCTTGAAATTGTATC+TGG - Chr6:42613926-42613945 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
GTTTCAACCACAGGAAAATT+TGG + Chr6:42614436-42614455 None:intergenic 35.0%
TAAGTCCAAAGTTTCTCCAA+GGG - Chr6:42612995-42613014 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
TCCACAACCCATTTCATATT+AGG + Chr6:42614148-42614167 None:intergenic 35.0%
TGCTTGAAATTGTATCTGGA+AGG - Chr6:42613930-42613949 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
TTAAGTCCAAAGTTTCTCCA+AGG - Chr6:42612994-42613013 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
TTATGTAGCTCAAGATGGTT+GGG - Chr6:42613071-42613090 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
TTCGACACAAGAATCTTGTT+AGG - Chr6:42613423-42613442 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
TTCTTGTCAAGAAATGAGCA+TGG - Chr6:42614973-42614992 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
! AGCTATGCAGAACTTTTCAT+AGG - Chr6:42613230-42613249 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
! TTACAAGCCAAATTTTCCTG+TGG - Chr6:42614426-42614445 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
!! AAGAATCTTGTTAGGTTGAG+AGG - Chr6:42613431-42613450 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
!! ACTGTTTTTCATGACATGGA+TGG - Chr6:42613161-42613180 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
!! GTACAATTTGCTGTCAAGAT+AGG - Chr6:42613185-42613204 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
!!! CATGTTTTGGTGAAAAGGTT+AGG - Chr6:42614574-42614593 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
!!! CGATGTTTATAGTTTTGGTG+TGG - Chr6:42615092-42615111 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
!!! TGTTTATAGTTTTGGTGTGG+TGG - Chr6:42615095-42615114 MsG0680032489.01.T03:CDS 35.0%
AAAAATGAGCCACTTGGTTG+GGG - Chr6:42613548-42613567 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
AAACATGACAATTGTCGTCG+AGG + Chr6:42614561-42614580 None:intergenic 40.0%
AAAGCTTCGACATCGGAATT+TGG - Chr6:42614654-42614673 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
ACAAGGAAAGTAGGGAAGAA+TGG - Chr6:42615385-42615404 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
AGATAGGAAGAGACAATCCA+AGG - Chr6:42613201-42613220 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
AGCTTGCAAAAACCAAGCAA+CGG - Chr6:42613869-42613888 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
ATCTAGGAAAGCTTCGACAT+CGG - Chr6:42614647-42614666 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
ATTCGCAGAATTCAAGCTCT+AGG - Chr6:42615438-42615457 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
CTAGTCCTAGTAGTTTCAGA+AGG + Chr6:42614250-42614269 None:intergenic 40.0%
CTCACAATTTGTCTCATGCT+TGG + Chr6:42615327-42615346 None:intergenic 40.0%
GAAAAATGAGCCACTTGGTT+GGG - Chr6:42613547-42613566 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
GCAAGTTATGTAGCTCAAGA+TGG - Chr6:42613066-42613085 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
GTGGTGCTTGAAATTGTTAG+TGG - Chr6:42615114-42615133 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
GTTATGTAGCTCAAGATGGT+TGG - Chr6:42613070-42613089 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
TAAGTTAGGTGATTTCGGCA+TGG - Chr6:42613697-42613716 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
TCAAACGAACTCAGGAATCT+AGG - Chr6:42614631-42614650 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
TCAAACTATGTTACAGCTGC+AGG - Chr6:42614331-42614350 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
TCTGCATAGCTGAAAATCCT+TGG + Chr6:42613221-42613240 None:intergenic 40.0%
TCTTCACCAAAAGAACCTCT+TGG + Chr6:42615164-42615183 None:intergenic 40.0%
TGAAAAATGAGCCACTTGGT+TGG - Chr6:42613546-42613565 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
TTCAAGAATCACAGCTGAAG+AGG + Chr6:42614911-42614930 None:intergenic 40.0%
TTGGGAGAAACATCGAGAAT+TGG - Chr6:42613818-42613837 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! AGAGGTTCTTTTGGTGAAGA+AGG - Chr6:42615164-42615183 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! ATCAGAAGGCTTTGTGATGA+AGG - Chr6:42614004-42614023 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! CGACGACAATTGTCATGTTT+TGG - Chr6:42614561-42614580 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! GATTTTCGGTTATATGTCGC+CGG - Chr6:42615035-42615054 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! GCAGCCGATGTTTATAGTTT+TGG - Chr6:42615087-42615106 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! TTCTAGAAGCAGCTGATACA+AGG - Chr6:42614032-42614051 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
! TTTGCCAAGTGATGGAACTT+TGG - Chr6:42613319-42613338 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!! AAAGCACTTTTGCCAAGTGA+TGG - Chr6:42613311-42613330 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!! ATCTTGTTAGGTTGAGAGGT+TGG - Chr6:42613435-42613454 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!! CTCATGCTTGGTCTTAATTG+AGG + Chr6:42615315-42615334 None:intergenic 40.0%
!! CTTCACCTTCTGAAACTACT+AGG - Chr6:42614242-42614261 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!! CTTGGTTTTTGCAAGCTTTC+TGG + Chr6:42613866-42613885 None:intergenic 40.0%
!! GAAGAACAAGTTCTAGGAAG+TGG - Chr6:42613269-42613288 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!! GACTTTGGAACTGCTTATCA+TGG - Chr6:42614532-42614551 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!! GCCTAATATGAAATGGGTTG+TGG - Chr6:42614144-42614163 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
!!! TTGACCGAGTTCTTTTTCGA+CGG - Chr6:42613513-42613532 MsG0680032489.01.T03:CDS 40.0%
AAAGAACTCGGTCAAGGCTT+CGG + Chr6:42613508-42613527 None:intergenic 45.0%
AAAGTTTCTCCAAGGGCTTG+TGG - Chr6:42613002-42613021 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
ACAAGCCCTTGGAGAAACTT+TGG + Chr6:42613003-42613022 None:intergenic 45.0%
AGGGTAGCAGAACTTGACTT+TGG - Chr6:42614517-42614536 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
ATCAATGTTCGGTCCTCGAA+TGG - Chr6:42614794-42614813 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
CACAAGCATCTCTCCTTGTT+CGG + Chr6:42614701-42614720 None:intergenic 45.0%
CATTTGGAAGTTCCGTTGCT+TGG + Chr6:42613884-42613903 None:intergenic 45.0%
CCAACCGTCGAAAAAGAACT+CGG + Chr6:42613520-42613539 None:intergenic 45.0%
CTTAGCTGAATTAAACGCCG+TGG - Chr6:42613394-42613413 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
GCAACCAAAGTTCCATCACT+TGG + Chr6:42613326-42613345 None:intergenic 45.0%
GGAGAAACATCGAGAATTGG+CGG - Chr6:42613821-42613840 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
GTCGAAAAAGAACTCGGTCA+AGG + Chr6:42613514-42613533 None:intergenic 45.0%
TAACTTCTCCGAGTCGAGAA+GGG - Chr6:42614498-42614517 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
TCGCCTGAGTCAACATATTC+CGG + Chr6:42615057-42615076 None:intergenic 45.0%
TCTCTTGGAGTTTCAACCAC+AGG + Chr6:42614445-42614464 None:intergenic 45.0%
TGTTAGTGGAATGATGGCAG+TGG - Chr6:42615128-42615147 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
! AAACATAGGGGGGTGCAAAA+AGG - Chr6:42613113-42613132 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
! ACTAGGACTAGTAGCACAAG+TGG - Chr6:42614259-42614278 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
! AGTGGATTTCAGGTACCAAG+AGG - Chr6:42615146-42615165 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
! CAGGTACCAAGAGGTTCTTT+TGG - Chr6:42615155-42615174 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
! GAATGATGGCAGTGGATTTC+AGG - Chr6:42615136-42615155 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
! GGTTTTTGCAAGCTTTCTGG+TGG + Chr6:42613863-42613882 None:intergenic 45.0%
!! GAACAAGTTCTAGGAAGTGG+AGG - Chr6:42613272-42613291 MsG0680032489.01.T03:CDS 45.0%
CGAACAAGGAGAGATGCTTG+TGG - Chr6:42614699-42614718 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
GTAACTTCTCCGAGTCGAGA+AGG - Chr6:42614497-42614516 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
TAGCACAAGTGGCACGATCT+CGG - Chr6:42614270-42614289 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
TAGGTGATTTCGGCATGGCA+AGG - Chr6:42613702-42613721 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
TCGAGAATTGGCGGAACGAT+TGG - Chr6:42613830-42613849 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
TGTAGCTCAAGATGGTTGGG+AGG - Chr6:42613074-42613093 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
TTCTGCTACCCTTCTCGACT+CGG + Chr6:42614509-42614528 None:intergenic 50.0%
! ACTATAAACATCGGCTGCCG+AGG + Chr6:42615085-42615104 None:intergenic 50.0%
! ATTTGGTTCAGCTTCGCGGA+TGG - Chr6:42614671-42614690 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
! CGGAATTTGGTTCAGCTTCG+CGG - Chr6:42614667-42614686 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
!! GTTCTAGGAAGTGGAGGCTT+TGG - Chr6:42613278-42613297 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
!! TCGCCGGAATATGTTGACTC+AGG - Chr6:42615051-42615070 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
!! TGTACCTATGGTGCCATTCG+AGG + Chr6:42614810-42614829 None:intergenic 50.0%
!!! CCGAGTTCTTTTTCGACGGT+TGG - Chr6:42613517-42613536 MsG0680032489.01.T03:CDS 50.0%
ACTCGGTCAAGGCTTCGGTT+AGG + Chr6:42613503-42613522 None:intergenic 55.0%
CCACTTGGTTGGGGACAAAG+AGG - Chr6:42613557-42613576 MsG0680032489.01.T03:CDS 55.0%
CCTCTTTGTCCCCAACCAAG+TGG + Chr6:42613560-42613579 None:intergenic 55.0%
CTTGTGTCGAAGATCGGCCA+CGG + Chr6:42613414-42613433 None:intergenic 55.0%
GAGAATCTATCGCGCAGTGC+AGG + Chr6:42614613-42614632 None:intergenic 55.0%
GTGATTTCGGCATGGCAAGG+TGG - Chr6:42613705-42613724 MsG0680032489.01.T03:CDS 55.0%
GTTTCTCCAAGGGCTTGTGG+TGG - Chr6:42613005-42613024 MsG0680032489.01.T03:CDS 55.0%
! ATAAACATCGGCTGCCGAGG+TGG + Chr6:42615082-42615101 None:intergenic 55.0%
CGGTCCTCGAATGGCACCAT+AGG - Chr6:42614803-42614822 MsG0680032489.01.T03:CDS 60.0%
TCTCCAAGGGCTTGTGGTGG+AGG - Chr6:42613008-42613027 MsG0680032489.01.T03:CDS 60.0%
TGACTCAGGCGAAGCCACCT+CGG - Chr6:42615065-42615084 MsG0680032489.01.T03:CDS 60.0%
TGTCCTCCACCACAAGCCCT+TGG + Chr6:42613014-42613033 None:intergenic 60.0%
CGCGGATGGTGCACCGAACA+AGG - Chr6:42614685-42614704 MsG0680032489.01.T03:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 42612888 42615470 42612888 ID=MsG0680032489.01;Name=MsG0680032489.01
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Gene Sequence

>MsG0680032489.01.T02

ATGGATGGTGTACAATTTGCTGTCAAGATAGGAAGAGACAATCCAAGGATTTTCAGCTATGCAGAACTTTTCATAGGTTCAAATGGTTTCAATGAAGAACAAGTTCTAGGAAGTGGAGGCTTTGGAAAAGTGTACAAAGCACTTTTGCCAAGTGATGGAACTTTGGTTGCTGTGAAATGTTGTTTATCAGAGAAAGGTAAACAATTTGACAAGAGTTTCTTAGCTGAATTAAACGCCGTGGCCGATCTTCGACACAAGAATCTTGTTAGGTTGAGAGGTTGGTGTGTTCATGAAGATCAGTTACATCTTGTTTATGATTACATGCCTAACCGAAGCCTTGACCGAGTTCTTTTTCGACGGTTGGAGAATTTGAAAAATGAGCCACTTGGTTGGGGACAAAGAGGTAAGATTGTTAAAGGTTTGGCTGCTGCATTGTATTATCTGCATGAACAGTTAGAGACTCAAATCATTCATAGAGATGTTAAAACAAGTAATGTTATGCTTGATTCTCATTACAATGCTAAGTTAGGTGATTTCGGCATGGCAAGGTGGTTAGAACATGAACTCAATGATACTACCAAATCAGTTAAAGGGATTTTCGGTTATATGTCGCCGGAATATGTTGACTCAGGCGAAGCCACCTCGGCAGCCGATGTTTATAGTTTTGGTGTGGTGGTGCTTGAAATTGTTAGTGGAATGATGGCAGTGGATTTCAGGTACCAAGAGGTTCTTTTGGTGAAGAAGGTTCATGAATTTGTGATAAGAAAAAGACCATTGAAGGAATTAGCTGATATAAGACTGAATGGAGAGTATAATGAGAAAGAATTGATAAGGTTGGTAAGATTAGGAATTGCATGTACTAGTTGTGATCCTCAATTAAGACCAAGCATGAGACAAATTGTGAGCATTCTTGATGGAAATGACAAATTACTCAACATGAAGAACAAGGAAAGTAGGGAAGAATGGAGAGACAGAAATGCTAGTTCTTTATCAATGATTCGCAGAATTCAAGCTCTAGGAATACAGTAA

>MsG0680032489.01.T05

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>MsG0680032489.01.T04

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Protein sequence

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