AlfalfaGEDB | MsG0680034237.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034237.01

KEGG: -
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PFAM: PF01535 PF13812

Nr:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

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PPI

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MsG0680034237.01.T01	AT2G02150	23.101	316	211	10	158	454	177	479	1.52e-11	67.8
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MsG0680034237.01.T01	AT2G17140	20.527	531	304	18	9	478	81	554	1.18e-11	68.2
MsG0680034237.01.T01	AT5G18475	20.149	268	190	6	166	421	195	450	1.20e-11	67.4
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MsG0680034237.01.T01	AT5G21222	20.611	393	271	14	58	423	338	716	2.78e-11	66.6
MsG0680034237.01.T01	AT5G21222	20.611	393	271	14	58	423	338	716	2.78e-11	66.6
MsG0680034237.01.T01	AT1G19290	23.630	292	182	10	164	435	258	528	3.39e-11	66.6
MsG0680034237.01.T01	AT1G19290	23.630	292	182	10	164	435	258	528	3.39e-11	66.6
MsG0680034237.01.T01	AT3G07290	28.272	191	122	6	249	429	201	386	5.31e-11	65.9
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Find 132 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 172 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
GGAAGAGTTGTACAATATTT+TGG	0.156119	6:+84227285	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGATTCTTATTCGAAGGTTT+TGG	0.195143	6:+84226190	MsG0680034237.01.T01:CDS
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TTGTACAACTCTTCCGTCTT+TGG	0.266601	6:-84227277	None:intergenic
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TGAGTTTGAAAGCATAGAAA+TGG	0.334223	6:-84225875	None:intergenic
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GTATGGAAAGTGTGGGAGTT+TGG	0.364780	6:+84226625	MsG0680034237.01.T01:CDS
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AATGGTTGATCGGGATGTTC+CGG	0.370185	6:+84226340	MsG0680034237.01.T01:CDS
GGGTGTTTGATAGACCTTCT+TGG	0.374203	6:+84226920	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTTGAAATTGATCCAGATAA+TGG	0.374550	6:+84227085	MsG0680034237.01.T01:CDS
AGCCACAGATTGCGCATTAT+GGG	0.380473	6:+84226900	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTAGCTGCTGGTTTGGGTGA+GGG	0.382710	6:+84226440	MsG0680034237.01.T01:CDS
TAAGGGGAATAAGCCGAATC+AGG	0.390480	6:+84226472	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTGTGGTTACTAATTCGTTT+AGG	0.391262	6:-84225776	None:intergenic
CAAAAGTCTTATAAGATTCC+AGG	0.401216	6:+84227193	MsG0680034237.01.T01:CDS
GATCCAGATAATGGAGGTTA+TGG	0.410241	6:+84227094	MsG0680034237.01.T01:CDS
AGTGAAGATTTGAGAGATTG+AGG	0.413419	6:-84225911	None:intergenic
GATTAGGTTGTTTAGAGAAA+TGG	0.419482	6:+84226415	MsG0680034237.01.T01:CDS
ACCTTCTTGGTCGGGCGGGT+CGG	0.425370	6:+84226933	MsG0680034237.01.T01:CDS
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CTGCTGGTTTGGGTGAGGGA+GGG	0.429186	6:+84226444	MsG0680034237.01.T01:CDS
CAATCACACTTAACAACACT+TGG	0.439241	6:+84225840	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTTAGCTGCTGGTTTGGGTG+AGG	0.439697	6:+84226439	MsG0680034237.01.T01:CDS
GGATGTTGAGATGGGATTGA+AGG	0.440847	6:+84226307	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGTTTATAGACATGGGTTTG+TGG	0.441047	6:+84226568	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGGTTTAAGGGATGCACATA+AGG	0.446941	6:+84226214	MsG0680034237.01.T01:CDS
CAAACAACCGTAACCTGATT+CGG	0.447376	6:-84226485	None:intergenic
GTATGCTTCAGCTTGGGAAA+TGG	0.448899	6:+84226534	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTTTCTGGGTATTTGAGAGT+GGG	0.450734	6:+84226284	MsG0680034237.01.T01:CDS
GAGTTTGAAAGCATAGAAAT+GGG	0.451514	6:-84225874	None:intergenic
GTGCTTTCGGCTTGTGGTCA+TGG	0.452346	6:+84226509	MsG0680034237.01.T01:CDS
AACTTTACATCCATTAAGTA+AGG	0.454342	6:-84227020	None:intergenic
GGCTGCAAATTCCGCCAAAT+CGG	0.455334	6:-84227053	None:intergenic
CCAATAAAAGTTACCTCATC+GGG	0.458262	6:-84226794	None:intergenic
CATGGTTATGTTTATAGACA+TGG	0.458846	6:+84226560	MsG0680034237.01.T01:CDS
GCAGTGAAGAGGTAGATATT+GGG	0.461148	6:-84225966	None:intergenic
GCTTGGAATGCGGTGATTAG+TGG	0.463507	6:+84226362	MsG0680034237.01.T01:CDS
TCGATATGGACCGATGTAAA+GGG	0.465357	6:+84226666	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATAAGATTCCAGGATGTAGC+TGG	0.466790	6:+84227203	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTCGATATGGACCGATGTAA+AGG	0.466904	6:+84226665	MsG0680034237.01.T01:CDS
CGAGGCGATGGATGTTGTAA+AGG	0.467098	6:+84226961	MsG0680034237.01.T01:CDS
GAACCCCAAACTACTTCATC+AGG	0.470458	6:-84226998	None:intergenic
TTTGATAGACCTTCTTGGTC+GGG	0.472139	6:+84226925	MsG0680034237.01.T01:CDS
ACCTCAATCCAGCTACATCC+TGG	0.474065	6:-84227211	None:intergenic
TTGTTGAATGCTTGTACTCA+TGG	0.486308	6:+84226818	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTGAAGATTTGAGAGATTGA+GGG	0.487695	6:-84225910	None:intergenic
GTTTGATAGACCTTCTTGGT+CGG	0.489628	6:+84226924	MsG0680034237.01.T01:CDS
GGTTTCTGGGTATTTGAGAG+TGG	0.492839	6:+84226283	MsG0680034237.01.T01:CDS
TCCAGGATGTAGCTGGATTG+AGG	0.495493	6:+84227210	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTTTGTGTGCTTTCGGCTTG+TGG	0.499718	6:+84226503	MsG0680034237.01.T01:CDS
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GCTGCTGGTTTGGGTGAGGG+AGG	0.501514	6:+84226443	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATTAGTGGGTGTACTCAGAA+TGG	0.501964	6:+84226377	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTTTGTGTCGAATGCGCTTG+TGG	0.507101	6:+84226598	MsG0680034237.01.T01:CDS
CAGCTTGGGAAATGGATACA+TGG	0.509000	6:+84226542	MsG0680034237.01.T01:CDS
GAATAAGCCGAATCAGGTTA+CGG	0.512014	6:+84226478	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTCTGGGTATTTGAGAGTGG+GGG	0.512223	6:+84226286	MsG0680034237.01.T01:CDS
AATGCGCTTGTGGATATGTA+TGG	0.512357	6:+84226608	MsG0680034237.01.T01:CDS
GCTTGTTGATTCTTATTCGA+AGG	0.512411	6:+84226184	MsG0680034237.01.T01:CDS
AGATGATGGTTAAGGAGTAT+GGG	0.518044	6:+84226873	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTTCTGGGTATTTGAGAGTG+GGG	0.522222	6:+84226285	MsG0680034237.01.T01:CDS
CCCAATAAAAGTTACCTCAT+CGG	0.524195	6:-84226795	None:intergenic
GAGTTTGGAGCTGGCGAGGA+AGG	0.524570	6:+84226640	MsG0680034237.01.T01:CDS
TATATGGTCAACTAGGAAAG+TGG	0.533392	6:+84227134	MsG0680034237.01.T01:CDS
CATGGTGGTATGCTTCAGCT+TGG	0.533735	6:+84226527	MsG0680034237.01.T01:CDS
AAGATGTTGGAGTGTGGTGG+TGG	0.535921	6:+84226764	MsG0680034237.01.T01:CDS
TCATGGCCGTACCGATTTGG+CGG	0.535928	6:+84227042	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATGGTGGTATGCTTCAGCTT+GGG	0.538065	6:+84226528	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATTAATTGTTATGCATTGCA+TGG	0.538208	6:+84226710	MsG0680034237.01.T01:CDS
GGGTCGGTTTGACGAGGCGA+TGG	0.540035	6:+84226949	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTGATCGGGATGTTCCGGCT+TGG	0.541002	6:+84226345	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTAGTGGGTGTACTCAGAAT+GGG	0.545093	6:+84226378	MsG0680034237.01.T01:CDS
GAGAAGATGTTGGAGTGTGG+TGG	0.546721	6:+84226761	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATAGACCTTCTTGGTCGGGC+GGG	0.548409	6:+84226929	MsG0680034237.01.T01:CDS
CCTAATATTACTATTGACCA+TGG	0.548508	6:-84226042	None:intergenic
ATGGTTATGTTTATAGACAT+GGG	0.550418	6:+84226561	MsG0680034237.01.T01:CDS
AGATGAAAATGCAGTGATGA+TGG	0.554711	6:-84225988	None:intergenic
TGCTTGTACTCATGGTGGAT+TGG	0.561558	6:+84226826	MsG0680034237.01.T01:CDS
CATGGTGGATTGGTCGAACA+AGG	0.563498	6:+84226836	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTTGAGAAGATGTTGGAGTG+TGG	0.564918	6:+84226758	MsG0680034237.01.T01:CDS
CAAGCGACGTTTCGACAACC+GGG	0.565193	6:-84226166	None:intergenic
GCTAATATATATGGTCAACT+AGG	0.566619	6:+84227127	MsG0680034237.01.T01:CDS
CTTGGAATGCGGTGATTAGT+GGG	0.570275	6:+84226363	MsG0680034237.01.T01:CDS
CTAAACAACCTAATCCCCTC+CGG	0.570959	6:-84226407	None:intergenic
TGGAGGTTATGGTACAATGT+TGG	0.579205	6:+84227105	MsG0680034237.01.T01:CDS
GGATTGGTCGAACAAGGTTG+TGG	0.580210	6:+84226842	MsG0680034237.01.T01:CDS
TAGGAAAGTGGGATGAAATG+AGG	0.580871	6:+84227146	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTGGATATGTATGGAAAGTG+TGG	0.582072	6:+84226617	MsG0680034237.01.T01:CDS
GTGGGAGTTTGGAGCTGGCG+AGG	0.583348	6:+84226636	MsG0680034237.01.T01:CDS
TCGGGCGGGTCGGTTTGACG+AGG	0.583401	6:+84226943	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATATGGTCAACTAGGAAAGT+GGG	0.584910	6:+84227135	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTTACTGATTTCAACACATG+GGG	0.585736	6:-84226083	None:intergenic
TTAATTGTTATGCATTGCAT+GGG	0.587873	6:+84226711	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGTTGAAATCAGTAAAAGAA+CGG	0.588198	6:+84226090	MsG0680034237.01.T01:CDS
ACCGACCCGCCCGACCAAGA+AGG	0.589485	6:-84226934	None:intergenic
TTGAATGCTTGTACTCATGG+TGG	0.592057	6:+84226821	MsG0680034237.01.T01:CDS
CATGCCCAGATTGTGAAAAG+TGG	0.592867	6:+84226131	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGGATATGTATGGAAAGTGT+GGG	0.593323	6:+84226618	MsG0680034237.01.T01:CDS
CACCCATAATGCGCAATCTG+TGG	0.595360	6:-84226902	None:intergenic
GATAGACCTTCTTGGTCGGG+CGG	0.597593	6:+84226928	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTTCAAACTCTTCAAAACCA+TGG	0.601369	6:+84226025	MsG0680034237.01.T01:CDS
CAAATTCCGCCAAATCGGTA+CGG	0.611558	6:-84227048	None:intergenic
GGATGTTCCGGCTTGGAATG+CGG	0.613621	6:+84226352	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGATCAATCTAATCCAAAGA+CGG	0.620346	6:+84227264	MsG0680034237.01.T01:CDS
CTAATCACCGCATTCCAAGC+CGG	0.622147	6:-84226359	None:intergenic
GAAATTGATCCAGATAATGG+AGG	0.636805	6:+84227088	MsG0680034237.01.T01:CDS
AGATATTGGGAGAATGAATG+TGG	0.643129	6:-84225953	None:intergenic
TGTTGTAAAGGGAATGAGCA+TGG	0.645254	6:+84226973	MsG0680034237.01.T01:CDS
ATGAAGTCAACCCTTTACAT+CGG	0.645726	6:-84226676	None:intergenic
AAAGTGTGGGAGTTTGGAGC+TGG	0.646751	6:+84226631	MsG0680034237.01.T01:CDS
GAACCTGATGAAGTAGTTTG+GGG	0.647107	6:+84226995	MsG0680034237.01.T01:CDS
GAAATGTGAGGATGCGATTG+CGG	0.661251	6:+84226733	MsG0680034237.01.T01:CDS
CAGTGATGATGGCAGTGAAG+AGG	0.673447	6:-84225977	None:intergenic
CTTTCGGCTTGTGGTCATGG+TGG	0.685717	6:+84226512	MsG0680034237.01.T01:CDS
GGGATGAAATGAGGAATGTG+TGG	0.698064	6:+84227155	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGCATTGCATGGGAAATGTG+AGG	0.713675	6:+84226721	MsG0680034237.01.T01:CDS
AATGTCTGAGAGAAATGTTG+TGG	0.717730	6:+84226247	MsG0680034237.01.T01:CDS
TGGTGGCGTGAGACCCGATG+AGG	0.722066	6:+84226781	MsG0680034237.01.T01:CDS
TTACTGATTTCAACACATGG+GGG	0.726873	6:-84226082	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!!	ATCAATTTCAACTAACTTTT+TGG	-	Chr6:84227077-84227096	None:intergenic	20.0%
!	AACTTTACATCCATTAAGTA+AGG	-	Chr6:84227023-84227042	None:intergenic	25.0%
!	ATGGTTATGTTTATAGACAT+GGG	+	Chr6:84226561-84226580	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!	ATTAATTGTTATGCATTGCA+TGG	+	Chr6:84226710-84226729	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!	TGTTGAAATCAGTAAAAGAA+CGG	+	Chr6:84226090-84226109	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!	TTAATTGTTATGCATTGCAT+GGG	+	Chr6:84226711-84226730	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!!	ACAATGTTGGCTAATATATA+TGG	+	Chr6:84227118-84227137	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!!	ATTGAAGGTTTTTGATGAAA+TGG	+	Chr6:84226322-84226341	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!!	TGGGGGTATATAAAATTATT+AGG	-	Chr6:84226068-84226087	None:intergenic	25.0%
!!	TTTTTGATGAAATGGTTGAT+CGG	+	Chr6:84226330-84226349	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!!!	AATATTTTGGAAAGTCTGTT+TGG	+	Chr6:84227298-84227317	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
!!!	ATTGATTTTGGTTAAGATTG+TGG	-	Chr6:84225796-84225815	None:intergenic	25.0%
!!!	GTGATTGAAGTTGTTTTAAT+TGG	-	Chr6:84225827-84225846	None:intergenic	25.0%
!!!	TTGGTTTATGTGATTGATTT+TGG	-	Chr6:84225808-84225827	None:intergenic	25.0%
!!!	TTTTACTGATTTCAACACAT+GGG	-	Chr6:84226087-84226106	None:intergenic	25.0%
!!!	TTTTTACTGTTTTGGTTTCT+GGG	+	Chr6:84226270-84226289	MsG0680034237.01.T01:CDS	25.0%
	CATGGTTATGTTTATAGACA+TGG	+	Chr6:84226560-84226579	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
	CCATGGTCAATAGTAATATT+AGG	+	Chr6:84226042-84226061	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
	CCTAATATTACTATTGACCA+TGG	-	Chr6:84226045-84226064	None:intergenic	30.0%
	GCTAATATATATGGTCAACT+AGG	+	Chr6:84227127-84227146	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
	GTTGAAATTGATCCAGATAA+TGG	+	Chr6:84227085-84227104	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
	TGATCAATCTAATCCAAAGA+CGG	+	Chr6:84227264-84227283	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
	TTGTGGTTACTAATTCGTTT+AGG	-	Chr6:84225779-84225798	None:intergenic	30.0%
	TTTCAAACTCTTCAAAACCA+TGG	+	Chr6:84226025-84226044	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	CAAAAGTCTTATAAGATTCC+AGG	+	Chr6:84227193-84227212	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	CTTAATGGATGTAAAGTTCA+TGG	+	Chr6:84227025-84227044	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	GAGTTTGAAAGCATAGAAAT+GGG	-	Chr6:84225877-84225896	None:intergenic	30.0%
!	GATTAGGTTGTTTAGAGAAA+TGG	+	Chr6:84226415-84226434	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	GATTCTTATTCGAAGGTTTT+GGG	+	Chr6:84226191-84226210	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	GGAAGAGTTGTACAATATTT+TGG	+	Chr6:84227285-84227304	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	TGAGTTTGAAAGCATAGAAA+TGG	-	Chr6:84225878-84225897	None:intergenic	30.0%
!	TGATTCTTATTCGAAGGTTT+TGG	+	Chr6:84226190-84226209	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	TGTTGTGGTTTTTACTGTTT+TGG	+	Chr6:84226262-84226281	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!	TTTTGATGAAATGGTTGATC+GGG	+	Chr6:84226331-84226350	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!!	AAAAACCACTTTTCACAATC+TGG	-	Chr6:84226139-84226158	None:intergenic	30.0%
!!	AAAACCACTTTTCACAATCT+GGG	-	Chr6:84226138-84226157	None:intergenic	30.0%
!!	TTTACTGATTTCAACACATG+GGG	-	Chr6:84226086-84226105	None:intergenic	30.0%
!!!	AAGTGGTTTTTTGAATTACC+CGG	+	Chr6:84226148-84226167	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!!!	AGAACGGTTTTTAGTTGATT+TGG	+	Chr6:84226106-84226125	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!!!	CTATTTTGAGATGATGGTTA+AGG	+	Chr6:84226865-84226884	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
!!!	CTTTTACTGATTTCAACACA+TGG	-	Chr6:84226088-84226107	None:intergenic	30.0%
!!!	GTTTTTACTGTTTTGGTTTC+TGG	+	Chr6:84226269-84226288	MsG0680034237.01.T01:CDS	30.0%
	AATGTCTGAGAGAAATGTTG+TGG	+	Chr6:84226247-84226266	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	AGATATTGGGAGAATGAATG+TGG	-	Chr6:84225956-84225975	None:intergenic	35.0%
	AGATGAAAATGCAGTGATGA+TGG	-	Chr6:84225991-84226010	None:intergenic	35.0%
	AGTGAAGATTTGAGAGATTG+AGG	-	Chr6:84225914-84225933	None:intergenic	35.0%
	ATATGGTCAACTAGGAAAGT+GGG	+	Chr6:84227135-84227154	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	ATGAAGTCAACCCTTTACAT+CGG	-	Chr6:84226679-84226698	None:intergenic	35.0%
	CAATCACACTTAACAACACT+TGG	+	Chr6:84225840-84225859	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	CCAATAAAAGTTACCTCATC+GGG	-	Chr6:84226797-84226816	None:intergenic	35.0%
	CCCAATAAAAGTTACCTCAT+CGG	-	Chr6:84226798-84226817	None:intergenic	35.0%
	GTGAAGATTTGAGAGATTGA+GGG	-	Chr6:84225913-84225932	None:intergenic	35.0%
	TATATGGTCAACTAGGAAAG+TGG	+	Chr6:84227134-84227153	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	TGTTTATAGACATGGGTTTG+TGG	+	Chr6:84226568-84226587	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	TTGGAAAGTCTGTTTGGTTA+TGG	+	Chr6:84227304-84227323	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	TTGTTGAATGCTTGTACTCA+TGG	+	Chr6:84226818-84226837	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!	AGATGATGGTTAAGGAGTAT+GGG	+	Chr6:84226873-84226892	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!	CCGATGAGGTAACTTTTATT+GGG	+	Chr6:84226795-84226814	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!	GAAATTGATCCAGATAATGG+AGG	+	Chr6:84227088-84227107	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!	TGGATATGTATGGAAAGTGT+GGG	+	Chr6:84226618-84226637	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!!	GCTTGTTGATTCTTATTCGA+AGG	+	Chr6:84226184-84226203	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!!	TTACTGATTTCAACACATGG+GGG	-	Chr6:84226085-84226104	None:intergenic	35.0%
!!!	TACTCAGAATGGGTTTTTTC+CGG	+	Chr6:84226388-84226407	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TTGTGGCTATTTTGAGATGA+TGG	+	Chr6:84226859-84226878	MsG0680034237.01.T01:CDS	35.0%
	AATGCGCTTGTGGATATGTA+TGG	+	Chr6:84226608-84226627	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	ATAAGATTCCAGGATGTAGC+TGG	+	Chr6:84227203-84227222	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	CAAACAACCGTAACCTGATT+CGG	-	Chr6:84226488-84226507	None:intergenic	40.0%
	GAACCTGATGAAGTAGTTTG+GGG	+	Chr6:84226995-84227014	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	GAATAAGCCGAATCAGGTTA+CGG	+	Chr6:84226478-84226497	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	GCAGTGAAGAGGTAGATATT+GGG	-	Chr6:84225969-84225988	None:intergenic	40.0%
	GGAACCTGATGAAGTAGTTT+GGG	+	Chr6:84226994-84227013	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	GTACCATAACCTCCATTATC+TGG	-	Chr6:84227100-84227119	None:intergenic	40.0%
	GTGGATATGTATGGAAAGTG+TGG	+	Chr6:84226617-84226636	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	GTTTGATAGACCTTCTTGGT+CGG	+	Chr6:84226924-84226943	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TACGGTTGTTTGTGTGCTTT+CGG	+	Chr6:84226496-84226515	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TAGGAAAGTGGGATGAAATG+AGG	+	Chr6:84227146-84227165	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TCGATATGGACCGATGTAAA+GGG	+	Chr6:84226666-84226685	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TGGAACCTGATGAAGTAGTT+TGG	+	Chr6:84226993-84227012	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TGGAGGTTATGGTACAATGT+TGG	+	Chr6:84227105-84227124	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TGGTTTAAGGGATGCACATA+AGG	+	Chr6:84226214-84226233	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TGTTGTAAAGGGAATGAGCA+TGG	+	Chr6:84226973-84226992	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TTCGATATGGACCGATGTAA+AGG	+	Chr6:84226665-84226684	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TTGAATGCTTGTACTCATGG+TGG	+	Chr6:84226821-84226840	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TTGTACAACTCTTCCGTCTT+TGG	-	Chr6:84227280-84227299	None:intergenic	40.0%
	TTTCTGGGTATTTGAGAGTG+GGG	+	Chr6:84226285-84226304	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TTTGAGAAGATGTTGGAGTG+TGG	+	Chr6:84226758-84226777	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	TTTGATAGACCTTCTTGGTC+GGG	+	Chr6:84226925-84226944	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	ATTAGTGGGTGTACTCAGAA+TGG	+	Chr6:84226377-84226396	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	CCCGATGAGGTAACTTTTAT+TGG	+	Chr6:84226794-84226813	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	GAGATGATGGTTAAGGAGTA+TGG	+	Chr6:84226872-84226891	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	GATGTAAAGGGTTGACTTCA+TGG	+	Chr6:84226678-84226697	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTTCTGGGTATTTGAGAGT+GGG	+	Chr6:84226284-84226303	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTTGGGGTTCCTTACTTAA+TGG	+	Chr6:84227010-84227029	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!	TTAGTGGGTGTACTCAGAAT+GGG	+	Chr6:84226378-84226397	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!	GATCCAGATAATGGAGGTTA+TGG	+	Chr6:84227094-84227113	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!	TGCGGTTTTTGAGAAGATGT+TGG	+	Chr6:84226751-84226770	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!!	AATGGTTTTAGCTGCTGGTT+TGG	+	Chr6:84226433-84226452	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!!	AGAGAAATGGTTTTAGCTGC+TGG	+	Chr6:84226428-84226447	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!!	ATGGTTTTAGCTGCTGGTTT+GGG	+	Chr6:84226434-84226453	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!!	GAAGGTTTTGGGTGGTTTAA+GGG	+	Chr6:84226202-84226221	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
!!!	TCTTATTCGAAGGTTTTGGG+TGG	+	Chr6:84226194-84226213	MsG0680034237.01.T01:CDS	40.0%
	AATGGTTGATCGGGATGTTC+CGG	+	Chr6:84226340-84226359	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	AGCCACAGATTGCGCATTAT+GGG	+	Chr6:84226900-84226919	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	ATGGTGGTATGCTTCAGCTT+GGG	+	Chr6:84226528-84226547	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	CAAATTCCGCCAAATCGGTA+CGG	-	Chr6:84227051-84227070	None:intergenic	45.0%
	CAGCTTGGGAAATGGATACA+TGG	+	Chr6:84226542-84226561	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	CATGCCCAGATTGTGAAAAG+TGG	+	Chr6:84226131-84226150	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	CTAAACAACCTAATCCCCTC+CGG	-	Chr6:84226410-84226429	None:intergenic	45.0%
	CTTGGAATGCGGTGATTAGT+GGG	+	Chr6:84226363-84226382	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	GAAATGTGAGGATGCGATTG+CGG	+	Chr6:84226733-84226752	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	GAACCCCAAACTACTTCATC+AGG	-	Chr6:84227001-84227020	None:intergenic	45.0%
	GAGGCGATGGATGTTGTAAA+GGG	+	Chr6:84226962-84226981	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	GGATGTTGAGATGGGATTGA+AGG	+	Chr6:84226307-84226326	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	GGCAGTGAAGAGGTAGATAT+TGG	-	Chr6:84225970-84225989	None:intergenic	45.0%
	GGGATGAAATGAGGAATGTG+TGG	+	Chr6:84227155-84227174	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	GGGTGTTTGATAGACCTTCT+TGG	+	Chr6:84226920-84226939	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	GTATGCTTCAGCTTGGGAAA+TGG	+	Chr6:84226534-84226553	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	TAAGGGGAATAAGCCGAATC+AGG	+	Chr6:84226472-84226491	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	TGCATTGCATGGGAAATGTG+AGG	+	Chr6:84226721-84226740	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	TTCTGGGTATTTGAGAGTGG+GGG	+	Chr6:84226286-84226305	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!	GGTTTCTGGGTATTTGAGAG+TGG	+	Chr6:84226283-84226302	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!	GTATGGAAAGTGTGGGAGTT+TGG	+	Chr6:84226625-84226644	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!!	TGCTTGTACTCATGGTGGAT+TGG	+	Chr6:84226826-84226845	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!!!	AGAATGGGTTTTTTCCGGAG+GGG	+	Chr6:84226393-84226412	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!!!	CAGAATGGGTTTTTTCCGGA+GGG	+	Chr6:84226392-84226411	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!!!	CGAAGGTTTTGGGTGGTTTA+AGG	+	Chr6:84226201-84226220	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
!!!	TCAGAATGGGTTTTTTCCGG+AGG	+	Chr6:84226391-84226410	MsG0680034237.01.T01:CDS	45.0%
	AAGATGTTGGAGTGTGGTGG+TGG	+	Chr6:84226764-84226783	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	ACAAGCGACGTTTCGACAAC+CGG	-	Chr6:84226170-84226189	None:intergenic	50.0%
	ACCTCAATCCAGCTACATCC+TGG	-	Chr6:84227214-84227233	None:intergenic	50.0%
	AGAGTGGGGGATGTTGAGAT+GGG	+	Chr6:84226299-84226318	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	CACCCATAATGCGCAATCTG+TGG	-	Chr6:84226905-84226924	None:intergenic	50.0%
	CATGGTGGTATGCTTCAGCT+TGG	+	Chr6:84226527-84226546	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	CGAGGCGATGGATGTTGTAA+AGG	+	Chr6:84226961-84226980	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	CTAATCACCGCATTCCAAGC+CGG	-	Chr6:84226362-84226381	None:intergenic	50.0%
	GAGAAGATGTTGGAGTGTGG+TGG	+	Chr6:84226761-84226780	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	GAGCCACAGATTGCGCATTA+TGG	+	Chr6:84226899-84226918	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	GCTTGGAATGCGGTGATTAG+TGG	+	Chr6:84226362-84226381	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	GGCTGCAAATTCCGCCAAAT+CGG	-	Chr6:84227056-84227075	None:intergenic	50.0%
	GTTTGTGTCGAATGCGCTTG+TGG	+	Chr6:84226598-84226617	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	TCCAGGATGTAGCTGGATTG+AGG	+	Chr6:84227210-84227229	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!	AAAGTGTGGGAGTTTGGAGC+TGG	+	Chr6:84226631-84226650	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!	GGCGAGGAAGGTTTTCGATA+TGG	+	Chr6:84226652-84226671	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!	GTTTGTGTGCTTTCGGCTTG+TGG	+	Chr6:84226503-84226522	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	AGTTCATGGCCGTACCGATT+TGG	+	Chr6:84227039-84227058	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	CAGTGATGATGGCAGTGAAG+AGG	-	Chr6:84225980-84225999	None:intergenic	50.0%
!!	CATGGTGGATTGGTCGAACA+AGG	+	Chr6:84226836-84226855	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGATTGGTCGAACAAGGTTG+TGG	+	Chr6:84226842-84226861	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGTGAGGGAGGGTTTTGTAA+GGG	+	Chr6:84226455-84226474	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	GTGAGGGAGGGTTTTGTAAG+GGG	+	Chr6:84226456-84226475	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	TTAGCTGCTGGTTTGGGTGA+GGG	+	Chr6:84226440-84226459	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!	TTTAGCTGCTGGTTTGGGTG+AGG	+	Chr6:84226439-84226458	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
!!!	GGTTTTTTCCGGAGGGGATT+AGG	+	Chr6:84226399-84226418	MsG0680034237.01.T01:CDS	50.0%
	ATAGACCTTCTTGGTCGGGC+GGG	+	Chr6:84226929-84226948	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
	CAAGCGACGTTTCGACAACC+GGG	-	Chr6:84226169-84226188	None:intergenic	55.0%
	GAGAGTGGGGGATGTTGAGA+TGG	+	Chr6:84226298-84226317	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
	GATAGACCTTCTTGGTCGGG+CGG	+	Chr6:84226928-84226947	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
	TTGATCGGGATGTTCCGGCT+TGG	+	Chr6:84226345-84226364	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
!	CTTTCGGCTTGTGGTCATGG+TGG	+	Chr6:84226512-84226531	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
!	GTGCTTTCGGCTTGTGGTCA+TGG	+	Chr6:84226509-84226528	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
!!	GGATGTTCCGGCTTGGAATG+CGG	+	Chr6:84226352-84226371	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
!!	GGGTGAGGGAGGGTTTTGTA+AGG	+	Chr6:84226454-84226473	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
!!	TCATGGCCGTACCGATTTGG+CGG	+	Chr6:84227042-84227061	MsG0680034237.01.T01:CDS	55.0%
!	GAGTTTGGAGCTGGCGAGGA+AGG	+	Chr6:84226640-84226659	MsG0680034237.01.T01:CDS	60.0%
!!	CTGCTGGTTTGGGTGAGGGA+GGG	+	Chr6:84226444-84226463	MsG0680034237.01.T01:CDS	60.0%
	ACCTTCTTGGTCGGGCGGGT+CGG	+	Chr6:84226933-84226952	MsG0680034237.01.T01:CDS	65.0%
!	GTGGGAGTTTGGAGCTGGCG+AGG	+	Chr6:84226636-84226655	MsG0680034237.01.T01:CDS	65.0%
!	TGGTGGCGTGAGACCCGATG+AGG	+	Chr6:84226781-84226800	MsG0680034237.01.T01:CDS	65.0%
!!	GCTGCTGGTTTGGGTGAGGG+AGG	+	Chr6:84226443-84226462	MsG0680034237.01.T01:CDS	65.0%
!!	GGGTCGGTTTGACGAGGCGA+TGG	+	Chr6:84226949-84226968	MsG0680034237.01.T01:CDS	65.0%
	ACCGACCCGCCCGACCAAGA+AGG	-	Chr6:84226937-84226956	None:intergenic	70.0%
!!	TCGGGCGGGTCGGTTTGACG+AGG	+	Chr6:84226943-84226962	MsG0680034237.01.T01:CDS	70.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr6	gene	84225765	84227351	84225765	ID=MsG0680034237.01;Name=MsG0680034237.01
Chr6	mRNA	84225765	84227351	84225765	ID=MsG0680034237.01.T01;Parent=MsG0680034237.01;Name=MsG0680034237.01.T01;_AED=0.39;_eAED=0.39;_QI=0\|-1\|0\|1\|-1\|1\|1\|0\|528
Chr6	exon	84225765	84227351	84225765	ID=MsG0680034237.01.T01:exon:19370;Parent=MsG0680034237.01.T01
Chr6	CDS	84225765	84227351	84225765	ID=MsG0680034237.01.T01:cds;Parent=MsG0680034237.01.T01

Gene Sequence

>MsG0680034237.01.T01

ATGAAACGAAACCTAAACGAATTAGTAACCACAATCTTAACCAAAATCAATCACATAAACCAATTAAAACAACTTCAATCACACTTAACAACACTTGGTCATTCTCAAACCCATTTCTATGCTTTCAAACTCATTCGTTTTTGTTCCCTCAATCTCTCAAATCTTCACTATGCTCATCAAATCTTCAACCACATTCATTCTCCCAATATCTACCTCTTCACTGCCATCATCACTGCATTTTCATCTCAACAACACACAGCTTTCAAACTCTTCAAAACCATGGTCAATAGTAATATTAGGCCTAATAATTTTATATACCCCCATGTGTTGAAATCAGTAAAAGAACGGTTTTTAGTTGATTTGGTGCATGCCCAGATTGTGAAAAGTGGTTTTTTGAATTACCCGGTTGTCGAAACGTCGCTTGTTGATTCTTATTCGAAGGTTTTGGGTGGTTTAAGGGATGCACATAAGGTGTTTGATGAAATGTCTGAGAGAAATGTTGTGGTTTTTACTGTTTTGGTTTCTGGGTATTTGAGAGTGGGGGATGTTGAGATGGGATTGAAGGTTTTTGATGAAATGGTTGATCGGGATGTTCCGGCTTGGAATGCGGTGATTAGTGGGTGTACTCAGAATGGGTTTTTTCCGGAGGGGATTAGGTTGTTTAGAGAAATGGTTTTAGCTGCTGGTTTGGGTGAGGGAGGGTTTTGTAAGGGGAATAAGCCGAATCAGGTTACGGTTGTTTGTGTGCTTTCGGCTTGTGGTCATGGTGGTATGCTTCAGCTTGGGAAATGGATACATGGTTATGTTTATAGACATGGGTTTGTGGTTGATTCGTTTGTGTCGAATGCGCTTGTGGATATGTATGGAAAGTGTGGGAGTTTGGAGCTGGCGAGGAAGGTTTTCGATATGGACCGATGTAAAGGGTTGACTTCATGGAATTCGATGATTAATTGTTATGCATTGCATGGGAAATGTGAGGATGCGATTGCGGTTTTTGAGAAGATGTTGGAGTGTGGTGGTGGCGTGAGACCCGATGAGGTAACTTTTATTGGGTTGTTGAATGCTTGTACTCATGGTGGATTGGTCGAACAAGGTTGTGGCTATTTTGAGATGATGGTTAAGGAGTATGGGATAGAGCCACAGATTGCGCATTATGGGTGTTTGATAGACCTTCTTGGTCGGGCGGGTCGGTTTGACGAGGCGATGGATGTTGTAAAGGGAATGAGCATGGAACCTGATGAAGTAGTTTGGGGTTCCTTACTTAATGGATGTAAAGTTCATGGCCGTACCGATTTGGCGGAATTTGCAGCCAAAAAGTTAGTTGAAATTGATCCAGATAATGGAGGTTATGGTACAATGTTGGCTAATATATATGGTCAACTAGGAAAGTGGGATGAAATGAGGAATGTGTGGTGCAAATTGAAGCAACAAAAGTCTTATAAGATTCCAGGATGTAGCTGGATTGAGGTTGATGATAAAGTTCATCAATTCTTTTCACTTGATCAATCTAATCCAAAGACGGAAGAGTTGTACAATATTTTGGAAAGTCTGTTTGGTTATGGAAGTGAAGTCGTCGTTGAAATGTAA

Protein sequence

>MsG0680034237.01.T01

MKRNLNELVTTILTKINHINQLKQLQSHLTTLGHSQTHFYAFKLIRFCSLNLSNLHYAHQIFNHIHSPNIYLFTAIITAFSSQQHTAFKLFKTMVNSNIRPNNFIYPHVLKSVKERFLVDLVHAQIVKSGFLNYPVVETSLVDSYSKVLGGLRDAHKVFDEMSERNVVVFTVLVSGYLRVGDVEMGLKVFDEMVDRDVPAWNAVISGCTQNGFFPEGIRLFREMVLAAGLGEGGFCKGNKPNQVTVVCVLSACGHGGMLQLGKWIHGYVYRHGFVVDSFVSNALVDMYGKCGSLELARKVFDMDRCKGLTSWNSMINCYALHGKCEDAIAVFEKMLECGGGVRPDEVTFIGLLNACTHGGLVEQGCGYFEMMVKEYGIEPQIAHYGCLIDLLGRAGRFDEAMDVVKGMSMEPDEVVWGSLLNGCKVHGRTDLAEFAAKKLVEIDPDNGGYGTMLANIYGQLGKWDEMRNVWCKLKQQKSYKIPGCSWIEVDDKVHQFFSLDQSNPKTEELYNILESLFGYGSEVVVEM*