AlfalfaGEDB | MsG0680034722.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034722.01

KEGG: -
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PFAM: PF01582

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

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PPI

Gene1	Gene2	Type

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Find 45 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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	ACGTACGACATCACAATAAC+AGG	+	Chr6:93427652-93427671	MsG0680034722.01.T01:CDS	40.0%
	AGTTGAGAGCAGCATCATAA+TGG	-	Chr6:93424849-93424868	None:intergenic	40.0%
	AGTTGTGTATTGGAGGTTGT+GGG	-	Chr6:93425483-93425502	None:intergenic	40.0%
	ATAGACTGTGTTACCAACCA+TGG	+	Chr6:93425131-93425150	MsG0680034722.01.T01:intron	40.0%
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	CGACATCACAATAACAGGTA+TGG	+	Chr6:93427657-93427676	MsG0680034722.01.T01:CDS	40.0%
	GAAGCTGAAACCATATGAGA+AGG	-	Chr6:93427334-93427353	None:intergenic	40.0%
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	TCCTCTTCTTCCTTCTCATA+TGG	+	Chr6:93427321-93427340	MsG0680034722.01.T01:CDS	40.0%
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!	AACGGTTTGGGAAATATGGA+AGG	-	Chr6:93425275-93425294	None:intergenic	40.0%
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	AAAGTGACGGTGGGAGAAAA+AGG	+	Chr6:93426077-93426096	MsG0680034722.01.T01:intron	45.0%
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	TGAGAGCAGCATCATAATGG+AGG	-	Chr6:93424846-93424865	None:intergenic	45.0%
	TGGAAGGATATTGGAGGAAG+AGG	+	Chr6:93427199-93427218	MsG0680034722.01.T01:CDS	45.0%
	TTATGCCACAAAGAGGACAC+TGG	+	Chr6:93425607-93425626	MsG0680034722.01.T01:intron	45.0%
	TTGTGATGTCGTACGTCAGA+AGG	-	Chr6:93427648-93427667	None:intergenic	45.0%
!	TCATAATGGAGGCAGAGACT+AGG	-	Chr6:93424835-93424854	None:intergenic	45.0%
!!	GCAGGTGGTGGACAAAATTA+AGG	-	Chr6:93425209-93425228	None:intergenic	45.0%
!!	TAGGACCCTCTGCTTTTACT+TGG	-	Chr6:93426674-93426693	None:intergenic	45.0%
!!	TCAAGAGCATTGAAGACTCG+AGG	+	Chr6:93427496-93427515	MsG0680034722.01.T01:CDS	45.0%
!!!	ATTTTTTTATAAAAATTAAG+GGG	+	Chr6:93426786-93426805	MsG0680034722.01.T01:intron	5.0%
	AAGTGCTCCTGTCGATCTTC+AGG	-	Chr6:93425635-93425654	None:intergenic	50.0%
	ACTGGTACCTGAAGATCGAC+AGG	+	Chr6:93425625-93425644	MsG0680034722.01.T01:intron	50.0%
	AGGTACCAGTGTCCTCTTTG+TGG	-	Chr6:93425615-93425634	None:intergenic	50.0%
	CAAGGGAATCCGAACCTTCA+TGG	+	Chr6:93427428-93427447	MsG0680034722.01.T01:CDS	50.0%
	CCGAACCTTCATGGATGACA+AGG	+	Chr6:93427437-93427456	MsG0680034722.01.T01:CDS	50.0%
	CGACAGTGGAAGGATATTGG+AGG	+	Chr6:93427193-93427212	MsG0680034722.01.T01:intron	50.0%
	CTTGACGTCTGTTTCGTGAC+AGG	-	Chr6:93425558-93425577	None:intergenic	50.0%
	GACGTCCTTATGCCACAAAG+AGG	+	Chr6:93425600-93425619	MsG0680034722.01.T01:intron	50.0%
	GCATAAGGACGTCCCTTTGA+AGG	-	Chr6:93425593-93425612	None:intergenic	50.0%
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	TTGTTCTATTCCGCAGGTGG+TGG	-	Chr6:93425221-93425240	None:intergenic	50.0%
!	CTAGGAAGGCCCTTTTGATG+TGG	-	Chr6:93424980-93424999	None:intergenic	50.0%
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!	TTCGTTTCCCTTTGGTGGCT+CGG	-	Chr6:93425078-93425097	None:intergenic	50.0%
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	GCTGAAACCGAGCCACCAAA+GGG	+	Chr6:93425068-93425087	MsG0680034722.01.T01:intron	55.0%
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	TGCTGAAACCGAGCCACCAA+AGG	+	Chr6:93425067-93425086	MsG0680034722.01.T01:intron	55.0%
!	CAATGGGAAGCGTGGCAATG+CGG	+	Chr6:93424622-93424641	MsG0680034722.01.T01:intron	55.0%
	CCGTCACACTCGGAGCCAAT+GGG	+	Chr6:93424606-93424625	MsG0680034722.01.T01:CDS	60.0%
	CGAACACACCCCGTCACACT+CGG	+	Chr6:93424596-93424615	MsG0680034722.01.T01:CDS	60.0%
	CGCATTGCCACGCTTCCCAT+TGG	-	Chr6:93424624-93424643	None:intergenic	60.0%
	GACACTCGATCCGGCTTCAC+CGG	+	Chr6:93427381-93427400	MsG0680034722.01.T01:CDS	60.0%
	GGTGAAGCCGGATCGAGTGT+CGG	-	Chr6:93427382-93427401	None:intergenic	60.0%
!!	AGGGGTACCGACACTCGATC+CGG	+	Chr6:93427372-93427391	MsG0680034722.01.T01:CDS	60.0%
!!	CATTGGCTCCGAGTGTGACG+GGG	-	Chr6:93424607-93424626	None:intergenic	60.0%
!!	CCATTGGCTCCGAGTGTGAC+GGG	-	Chr6:93424608-93424627	None:intergenic	60.0%
!!	CCCATTGGCTCCGAGTGTGA+CGG	-	Chr6:93424609-93424628	None:intergenic	60.0%
	CCCGTCACACTCGGAGCCAA+TGG	+	Chr6:93424605-93424624	MsG0680034722.01.T01:CDS	65.0%
	CTCGGAGCCAATGGGAAGCG+TGG	+	Chr6:93424614-93424633	MsG0680034722.01.T01:intron	65.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr6	gene	93424587	93427764	93424587	ID=MsG0680034722.01;Name=MsG0680034722.01
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Gene Sequence

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ATGGAATTTCGAACACACCCCGTCACACTCGGAGCCAATGGGAAGCTGGAAGGATATTGGAGGAAGAGGCGGTACAATAATTGTGTGACTGTTCTTGTAATTTTTACAGATCTGATAGTAAACAATACTCCAGACCAAACTCTCATGGCTATGCAATCACCTTCTTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCATATGGTTTCAGCTTCGATGTGTTCATTAGTTTCAGGGGTACCGACACTCGATCCGGCTTCACCGGCAGTCACTATAAAGCACTTTGTGACAAGGGAATCCGAACCTTCATGGATGACAAGGAGCTTCAGAAAGGTGACGAAATCACACCTTCGCTCCTCAAGAGCATTGAAGACTCGAGGATTGTTGTTATTGTATTCTCGAAGAACTATGCTACTTCATCATTTTGTCTGGATGAACTTGTCCACATCATTAACTACTTCAAGGAAAAGAGTCGCCTTGTTCTTCAAGTTTTCTATGATGTGGAACCTTCTGACGTACGACATCACAATAACAGGTATGGTGATGTAATATCCACACTAAACGTATCTAGAAAGTTTAGCGTGTGCATTAGTTTAGTACTGGATACATTAAAATTTACAACATAA

Protein sequence

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