AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene043886

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Find 109 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GTTTCTGCTGCGGCGCTCCA+TGG 0.290932 5.3:-51322255 MS.gene043886:CDS
GTTCAATATCTGAAGGAAAT+TGG 0.300864 5.3:-51323601 MS.gene043886:intron
CCGCTGAGCAAAACTATTAT+CGG 0.336092 5.3:-51335074 MS.gene043886:CDS
TGCTCACGGTTCAGAGAATA+TGG 0.339296 5.3:-51331503 MS.gene043886:CDS
GAAGAGGACTCAGTCAAATT+AGG 0.341774 5.3:-51322228 MS.gene043886:CDS
CCAGCAGCATTCCCACCTTC+TGG 0.357293 5.3:+51329525 None:intergenic
TTTCTGCTGCGGCGCTCCAT+GGG 0.358875 5.3:-51322254 MS.gene043886:CDS
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CGAAATCTGAATGGAATTCT+CGG 0.363658 5.3:+51335381 None:intergenic
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GAACTGGTAGGCGTGGATTC+AGG 0.369088 5.3:-51329564 MS.gene043886:intron
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GTAATGCATGTTGATGTAAA+TGG 0.411283 5.3:+51330126 None:intergenic
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TGCATGATGGACAAACTGTT+CGG 0.427134 5.3:+51330285 None:intergenic
TGAAATTTCCTCTTTGCTGA+TGG 0.429325 5.3:+51331843 None:intergenic
GTTTGTATATTAGGTTTGTT+CGG 0.430394 5.3:-51335441 MS.gene043886:intron
CTAAATACTTGCAGCTGTCC+TGG 0.432436 5.3:+51325374 None:intergenic
AAGTAATTTACCTGCTGGTA+TGG 0.451989 5.3:+51329934 None:intergenic
TGGGCTCTACGAACCGGGTC+GGG 0.459147 5.3:-51322358 MS.gene043886:CDS
GAACAGTTTGTCCATCATGC+AGG 0.459284 5.3:-51330283 MS.gene043886:CDS
GGACAGCTGCAAGTATTTAG+AGG 0.469086 5.3:-51325371 MS.gene043886:CDS
TGCATTACTTGTAAAGGATC+TGG 0.469733 5.3:-51330111 MS.gene043886:CDS
GCATGATGGACAAACTGTTC+GGG 0.472832 5.3:+51330286 None:intergenic
CTGAGTCCTCTTCTTCCCCA+TGG 0.475489 5.3:+51322238 None:intergenic
TGTACAAAATACCCATGCTT+TGG 0.488581 5.3:+51325238 None:intergenic
TGTCCTGGTTGAACACCCTT+AGG 0.491247 5.3:+51325389 None:intergenic
CATTCCCACCTTCTGGCACA+TGG 0.494951 5.3:+51329532 None:intergenic
CGACCGGCGCCCCTGCATGA+TGG 0.501134 5.3:+51330272 None:intergenic
CTGTATCAAACCAGATGGAC+GGG 0.502009 5.3:-51330327 MS.gene043886:intron
ATGATCTACCTTGTCATACT+CGG 0.503787 5.3:+51331642 None:intergenic
GGTGGGAATGCTGCTGGAAG+TGG 0.504234 5.3:-51329519 MS.gene043886:CDS
GAGGATCTGGGGTTATTGAA+GGG 0.505403 5.3:-51329976 MS.gene043886:CDS
ATGCCTTCTTTATCTCATCC+TGG 0.506095 5.3:+51335025 None:intergenic
TATAAGAGAAGATGTAATCA+AGG 0.513043 5.3:-51322298 MS.gene043886:CDS
TAAACATAACGAAATCTGAA+TGG 0.515429 5.3:+51335372 None:intergenic
TCAACATGCATTACTTGTAA+AGG 0.518023 5.3:-51330117 MS.gene043886:CDS
TATTCTTATTTGCATCTGGA+TGG 0.518251 5.3:+51331868 None:intergenic
CTCGTTGAAATAGGTGGATG+AGG 0.521698 5.3:-51328309 MS.gene043886:intron
GGTTATTGAAGGGATTAAAG+AGG 0.530183 5.3:-51329966 MS.gene043886:CDS
TCAGTTCTCTTCAAATATAG+AGG 0.530674 5.3:-51331292 MS.gene043886:intron
TTACTCACCACAATTATCAC+AGG 0.531813 5.3:+51331108 None:intergenic
TGTCCATCATGCAGGGGCGC+CGG 0.536077 5.3:-51330275 MS.gene043886:CDS
CGTGCTGGGCTCTACGAACC+GGG 0.536842 5.3:-51322363 MS.gene043886:CDS
TATGATTCCTCAGATACCTA+AGG 0.539447 5.3:-51325405 MS.gene043886:intron
GGCGCTCCATGGGGAAGAAG+AGG 0.543075 5.3:-51322244 MS.gene043886:CDS
CCAGAAGGTGGGAATGCTGC+TGG 0.543160 5.3:-51329525 MS.gene043886:CDS
TGTTGCTGAAAATGCTAGCC+AGG 0.546404 5.3:-51335043 MS.gene043886:CDS
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AACAGTTTGTCCATCATGCA+GGG 0.547169 5.3:-51330282 MS.gene043886:CDS
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GCTGGAAGTGGTGGTCGACA+TGG 0.548526 5.3:-51329507 MS.gene043886:CDS
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TTCCAATGCACTTACTCGAC+CGG 0.555054 5.3:+51330256 None:intergenic
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
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