AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene44536

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CTGTTATTTGCTGGCCTTCT+TGG 0.200864 8.1:+26450218 MS.gene44536:CDS
AATGGTCCAATAGGATAAAT+TGG 0.254130 8.1:-26440932 None:intergenic
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AGAGATTGAGAGGTGTATTA+GGG 0.299822 8.1:+26450333 MS.gene44536:CDS
TGCTTATTGAGAATGTATTT+AGG 0.322936 8.1:+26450263 MS.gene44536:CDS
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TCAATAAGCATAGCATTTGT+TGG 0.353428 8.1:-26450250 None:intergenic
TGTCAATCCATTTGTTCCTT+GGG 0.356147 8.1:+26431721 MS.gene44536:CDS
CATGCGGTTGCGAGCTTCTT+CGG 0.357380 8.1:-26431510 None:intergenic
GGCGAGGTTGGTAATGAGAT+TGG 0.357652 8.1:-26431672 None:intergenic
CATGGACACCCTTTGAAATA+AGG 0.367004 8.1:-26431472 None:intergenic
TTGAGAATGTATTTAGGAAT+GGG 0.374928 8.1:+26450269 MS.gene44536:CDS
CAATGACTTGTTTCCCAAGT+TGG 0.378161 8.1:+26431838 MS.gene44536:CDS
CTGGTGTGCCTGTTATTTGC+TGG 0.378196 8.1:+26450209 MS.gene44536:CDS
GGTGAAACCAATGGTCCAAT+AGG 0.382155 8.1:-26440941 None:intergenic
ACCCTTTGAAATAAGGCGTT+TGG 0.382210 8.1:-26431465 None:intergenic
CTGAAGATTCATGTATAGAT+TGG 0.382643 8.1:+26441017 MS.gene44536:CDS
ACCAGGGTTACCAATGTTAG+AGG 0.383373 8.1:+26440752 MS.gene44536:intron
GGTAATTGCACCTTCTCATT+GGG 0.385333 8.1:-26431866 None:intergenic
TGGTAATTGCACCTTCTCAT+TGG 0.387300 8.1:-26431867 None:intergenic
CAAGAAGGCCAGCAAATAAC+AGG 0.391510 8.1:-26450217 None:intergenic
GAGGTGTATTAGGGATGTTA+TGG 0.394320 8.1:+26450342 MS.gene44536:CDS
TCGGTTATTTATATATCCTT+TGG 0.401112 8.1:+26441061 MS.gene44536:CDS
CTCATTGGGATCATCCAACT+TGG 0.409877 8.1:-26431852 None:intergenic
ATATAAATAACCGATGAATT+CGG 0.417382 8.1:-26441052 None:intergenic
TTAACCTTGGGGTCATCAGC+TGG 0.418449 8.1:-26450604 None:intergenic
TTATAATGAAGAGGACTAGA+AGG 0.420442 8.1:-26440800 None:intergenic
AATTTATCCTATTGGACCAT+TGG 0.420979 8.1:+26440934 MS.gene44536:CDS
AAACCCCATGTGCATTGCTT+TGG 0.423000 8.1:+26431768 MS.gene44536:CDS
ATACTTGAGACAATGATAAC+TGG 0.424056 8.1:+26450190 MS.gene44536:CDS
AGGGTTGATGTGGCCTTGTA+AGG 0.427654 8.1:-26431429 None:intergenic
AATGTTGAGCTTCAGATTGA+TGG 0.428801 8.1:+26450535 MS.gene44536:CDS
CGCCAAACGCCTTATTTCAA+AGG 0.432949 8.1:+26431463 MS.gene44536:CDS
AAAGTGAATTATGGGGAAGA+TGG 0.433068 8.1:+26450295 MS.gene44536:CDS
ATTGACAATTGCACATGAAA+AGG 0.433422 8.1:-26431705 None:intergenic
AGCTTTGGATAAAGTAGAAT+GGG 0.439057 8.1:+26440847 MS.gene44536:CDS
TTTGATAATTCATTATTAGC+TGG 0.440958 8.1:-26441171 None:intergenic
ATGGGGTGAAAGTGAATTAT+GGG 0.441233 8.1:+26450287 MS.gene44536:CDS
AAAGCTTTCTGCAATTCCCT+TGG 0.443776 8.1:-26450499 None:intergenic
TAAAATTCTCGTGGTGTCAA+TGG 0.444217 8.1:+26431406 MS.gene44536:CDS
ATTGAGAATGTATTTAGGAA+TGG 0.444416 8.1:+26450268 MS.gene44536:CDS
AATGAGAAGGTGCAATTACC+AGG 0.448206 8.1:+26431869 MS.gene44536:CDS
TCAATAGCCCAAGGAACAAA+TGG 0.448398 8.1:-26431728 None:intergenic
AAGCTTTGGATAAAGTAGAA+TGG 0.461316 8.1:+26440846 MS.gene44536:CDS
AAGATCTTTACCTCTAACAT+TGG 0.470709 8.1:-26440762 None:intergenic
TCTCGACACTATCCGAGAAA+AGG 0.472793 8.1:+26431634 MS.gene44536:CDS
GCCAAACGCCTTATTTCAAA+GGG 0.473918 8.1:+26431464 MS.gene44536:CDS
AAGTGAATTATGGGGAAGAT+GGG 0.482857 8.1:+26450296 MS.gene44536:CDS
CTTATAAAACAAGCAACAGC+AGG 0.492860 8.1:-26450148 None:intergenic
TTCTCGGATAGTGTCGAGAA+AGG 0.496669 8.1:-26431630 None:intergenic
TTGAAAGAAACTCAAGGAAG+AGG 0.497371 8.1:+26450082 MS.gene44536:CDS
GGAAGAGATAGTGAAATCAA+TGG 0.509958 8.1:+26440898 MS.gene44536:CDS
GTCTGCAAGAAAAGCATTGG+AGG 0.511128 8.1:+26450414 MS.gene44536:CDS
AGAGTCTGCAAGAAAAGCAT+TGG 0.512702 8.1:+26450411 MS.gene44536:CDS
CGTTTGGCGAAGTTTAACAT+AGG 0.513085 8.1:-26431449 None:intergenic
CAGTGTTGACTTTGACCGCT+CGG 0.517149 8.1:+26431598 MS.gene44536:CDS
GAAGAGGTTTGCTTGTGAAA+TGG 0.518320 8.1:+26450098 MS.gene44536:CDS
ACCTCTAACATTGGTAACCC+TGG 0.521830 8.1:-26431887 None:intergenic
GATTGATGGTGATGAAATTG+AGG 0.527238 8.1:+26450549 MS.gene44536:CDS
ATAAGTTCTTTATAATGAAG+AGG 0.527280 8.1:-26440809 None:intergenic
CTCGACACTATCCGAGAAAA+GGG 0.538187 8.1:+26431635 MS.gene44536:CDS
ATTGAGGGTGATACAATTGA+TGG 0.542835 8.1:+26450565 MS.gene44536:CDS
GTTGGTTGATCAATCCAAGA+AGG 0.545249 8.1:-26450232 None:intergenic
CGGTAGTAGCGATGGTGACA+TGG 0.548242 8.1:-26431490 None:intergenic
TGATAATAAACCGAATTCAT+CGG 0.548836 8.1:+26441042 MS.gene44536:CDS
TGAGAATGTATTTAGGAATG+GGG 0.550234 8.1:+26450270 MS.gene44536:CDS
CAAGTGTAGAAGAGATTGAG+AGG 0.563540 8.1:+26450323 MS.gene44536:CDS
GTTTGGCGAAGTTTAACATA+GGG 0.567192 8.1:-26431448 None:intergenic
GTGGTGTCAATGGCCTTACA+AGG 0.569347 8.1:+26431416 MS.gene44536:CDS
AGCTTCTTCGGTAGTAGCGA+TGG 0.573436 8.1:-26431498 None:intergenic
TCATTGGGATCATCCAACTT+GGG 0.575521 8.1:-26431851 None:intergenic
ATTGCTTTGGATACAAGCCT+CGG 0.577473 8.1:+26431781 MS.gene44536:CDS
GTTATGGAAGGGCCTAATGC+TGG 0.587126 8.1:+26450358 MS.gene44536:CDS
GGTTGGTAATGAGATTGGAA+AGG 0.589004 8.1:-26431667 None:intergenic
TGTATTAGGGATGTTATGGA+AGG 0.595554 8.1:+26450346 MS.gene44536:CDS
AGTTTAACATAGGGTTGATG+TGG 0.601065 8.1:-26431439 None:intergenic
GAATTTGATTCCTGAATCAG+AGG 0.604291 8.1:-26431555 None:intergenic
GCAAGAAAAGCATTGGAGGA+AGG 0.609021 8.1:+26450418 MS.gene44536:CDS
TGTCAGTGTGTTTGAGCATG+CGG 0.613274 8.1:-26431526 None:intergenic
ATTGATGGTGATGAAATTGA+GGG 0.615365 8.1:+26450550 MS.gene44536:CDS
TGTATCCAAAGCAATGCACA+TGG 0.616910 8.1:-26431773 None:intergenic
CTAGAAGGAAGCAACACTGA+AGG 0.617641 8.1:-26440785 None:intergenic
GTTGGATGATCCCAATGAGA+AGG 0.619399 8.1:+26431856 MS.gene44536:CDS
TATCCAAAGCAATGCACATG+GGG 0.619416 8.1:-26431771 None:intergenic
AACAAACATTAAAATTCTCG+TGG 0.624334 8.1:+26431397 MS.gene44536:CDS
AACTCCAGCTGATGACCCCA+AGG 0.631415 8.1:+26450600 MS.gene44536:CDS
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CRISPR-GE

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