AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035359.01

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MsG0680035359.01.T01 AT1G07650 34.872 390 222 9 518 902 392 754 2.69e-51 194
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MsG0680035359.01.T01 AT1G34210 39.333 300 163 9 600 888 291 582 5.36e-51 190
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MsG0680035359.01.T01 AT1G56145 36.196 326 173 7 135 430 675 995 2.82e-52 199
MsG0680035359.01.T01 AT1G56145 34.225 374 199 11 556 898 638 995 3.51e-49 189
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MsG0680035359.01.T01 AT4G04570 44.215 242 126 5 578 816 150 385 1.24e-50 184
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MsG0680035359.01.T01 AT1G61490 37.987 308 182 6 602 905 452 754 3.88e-50 190
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MsG0680035359.01.T01 AT1G65790 39.604 303 165 10 144 436 516 810 2.16e-50 192
MsG0680035359.01.T01 AT1G65790 37.261 314 180 8 611 912 516 824 1.28e-49 189
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MsG0680035359.01.T01 AT2G13800 37.500 296 171 8 133 419 144 434 3.19e-48 179
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MsG0680035359.01.T01 AT1G67520 35.230 369 209 12 562 909 228 587 1.26e-48 183
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MsG0680035359.01.T01 AT1G09440 37.241 290 171 7 135 418 145 429 1.62e-48 179
MsG0680035359.01.T01 AT3G53810 37.463 339 187 12 571 896 304 630 1.18e-48 184
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MsG0680035359.01.T01 AT4G05200 39.016 305 170 9 601 897 334 630 6.68e-48 182
MsG0680035359.01.T01 AT1G29740 40.468 299 155 9 599 885 660 947 1.23e-48 187
MsG0680035359.01.T01 AT1G29740 38.644 295 165 9 132 417 660 947 4.23e-44 173
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MsG0680035359.01.T01 AT5G01550 34.219 301 183 8 601 894 366 658 1.99e-42 166
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MsG0680035359.01.T01 AT5G38560 35.987 314 169 8 593 887 316 616 1.63e-45 175
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MsG0680035359.01.T01 AT3G58690 36.027 297 169 8 602 885 75 363 7.81e-44 164
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MsG0680035359.01.T01 AT1G11410 38.462 338 177 11 112 435 464 784 5.36e-44 172
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MsG0680035359.01.T01 AT1G11410 38.462 338 177 11 112 435 495 815 9.14e-44 171
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MsG0680035359.01.T01 AT5G63710 38.047 297 166 9 600 886 240 528 1.26e-41 162
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MsG0680035359.01.T01 AT1G51880 37.884 293 165 7 599 885 579 860 1.07e-42 168
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MsG0680035359.01.T01 AT3G46330 35.849 318 183 8 572 882 530 833 6.50e-43 169
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MsG0680035359.01.T01 AT3G13690 36.667 300 165 12 602 889 399 685 6.58e-41 162
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MsG0680035359.01.T01 AT5G59270 35.235 298 169 9 600 886 338 622 2.83e-44 171
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MsG0680035359.01.T01 AT3G21340 36.111 288 170 6 600 882 580 858 2.18e-40 161
MsG0680035359.01.T01 AT5G03140 34.078 358 197 13 85 427 324 657 2.09e-44 172
MsG0680035359.01.T01 AT5G03140 35.179 307 179 7 600 895 360 657 1.28e-41 164
MsG0680035359.01.T01 AT1G61610 43.182 220 118 4 602 818 513 728 2.14e-44 172
MsG0680035359.01.T01 AT1G61610 42.793 222 120 4 135 353 513 730 3.79e-44 172
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MsG0680035359.01.T01 AT2G18470 40.000 235 131 6 135 366 272 499 8.75e-41 158
MsG0680035359.01.T01 AT5G01540 33.714 350 202 9 86 426 316 644 3.50e-43 168
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MsG0680035359.01.T01 AT5G15730 32.653 294 168 8 601 885 103 375 4.77e-39 151
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MsG0680035359.01.T01 AT4G29180 34.076 314 176 8 595 886 547 851 1.04e-42 169
MsG0680035359.01.T01 AT4G29180 37.339 233 127 3 132 350 554 781 4.73e-40 160
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MsG0680035359.01.T01 AT5G60300 32.353 306 189 7 134 431 331 626 1.73e-37 151
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MsG0680035359.01.T01 AT3G46370 35.962 317 179 10 577 882 450 753 6.48e-41 162
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MsG0680035359.01.T01 AT2G47060 33.993 303 185 5 604 896 63 360 2.42e-39 150
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MsG0680035359.01.T01 AT3G46340 34.602 289 175 8 132 414 572 852 9.11e-42 166
MsG0680035359.01.T01 AT3G46340 36.986 292 165 9 599 882 572 852 2.25e-41 164
MsG0680035359.01.T01 AT4G29450 34.185 313 176 9 595 886 546 849 9.24e-42 165
MsG0680035359.01.T01 AT4G29450 33.442 308 173 9 132 418 553 849 4.12e-40 160
MsG0680035359.01.T01 AT1G07870 33.562 292 184 6 133 417 89 377 1.04e-41 161
MsG0680035359.01.T01 AT1G07870 34.062 320 180 8 600 902 89 394 1.07e-39 155
MsG0680035359.01.T01 AT3G25490 36.301 292 174 7 133 418 94 379 1.28e-41 159
MsG0680035359.01.T01 AT3G25490 32.948 346 202 11 562 886 43 379 6.21e-39 150
MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 36.162 271 162 6 151 418 310 572 1.29e-41 162
MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 31.534 352 215 11 549 889 239 575 1.67e-36 146
MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 36.162 271 162 6 151 418 310 572 1.29e-41 162
MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 31.534 352 215 11 549 889 239 575 1.67e-36 146
MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 36.162 271 162 6 151 418 310 572 1.29e-41 162
MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 31.534 352 215 11 549 889 239 575 1.67e-36 146
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MsG0680035359.01.T01 AT2G35620 31.534 352 215 11 549 889 239 575 1.67e-36 146
MsG0680035359.01.T01 AT2G47060 31.325 332 186 5 137 428 63 392 1.41e-41 157
MsG0680035359.01.T01 AT2G47060 31.532 333 185 6 604 896 63 392 2.01e-38 148
MsG0680035359.01.T01 AT1G06840 35.227 352 193 11 548 887 568 896 1.57e-41 165
MsG0680035359.01.T01 AT1G06840 30.751 426 245 14 5 418 508 895 1.19e-36 149
MsG0680035359.01.T01 AT3G59420 33.333 384 219 14 553 907 433 808 1.60e-41 165
MsG0680035359.01.T01 AT3G59420 30.749 374 242 9 61 424 426 792 4.93e-40 160
MsG0680035359.01.T01 AT1G52540 35.254 295 174 9 602 888 25 310 1.74e-41 156
MsG0680035359.01.T01 AT1G52540 34.202 307 184 8 135 431 25 323 5.36e-39 149

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGATACTACATGTAAAATTT+TGG 0.138360 6:+103214230 MsG0680035359.01.T01:CDS
CTTAAAGTTGCAATGGTTTC+AGG 0.153378 6:-103220361 None:intergenic
TGTCCAAAGATTTCAGATTT+TGG 0.158334 6:+103214769 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTGAAAGTGGTTTGGATAAA+AGG 0.180829 6:+103213041 MsG0680035359.01.T01:CDS
GAATGACCATTGTTGGTTTA+TGG 0.204649 6:+103215091 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGTCCAAAGATCTCAGATTT+TGG 0.209832 6:+103220511 MsG0680035359.01.T01:CDS
CTCAAAGATGCAATGGTTTC+AGG 0.210366 6:-103214619 None:intergenic
GTTAATGTTGTTACCCTTCT+TGG 0.212674 6:+103214511 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGACAAATTTATTTACAATA+AGG 0.249709 6:+103214594 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGACAAATATATTTACAATA+AGG 0.252319 6:+103220336 MsG0680035359.01.T01:CDS
AACCATTGCAACTTTAAGTT+TGG 0.267238 6:+103220366 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTTAATGTCGTCACCCTTCT+TGG 0.289521 6:+103220253 MsG0680035359.01.T01:CDS
GATATAAAGGATAATGATTA+TGG 0.311366 6:+103212998 MsG0680035359.01.T01:CDS
TATTATGATGATTGTTTAGA+TGG 0.315274 6:+103218736 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGTCCAAAATCTGAAATCTT+TGG 0.316100 6:-103214772 None:intergenic
GAAGTATGGAATAGACAATT+TGG 0.326135 6:+103214871 MsG0680035359.01.T01:CDS
GAAGTGTGTAATAGGCATTT+TGG 0.328473 6:+103220613 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTTGAGCTGGAAATGGAAAT+TGG 0.328831 6:+103213533 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGGAAATTGGAAATCATTCT+AGG 0.332709 6:+103213546 MsG0680035359.01.T01:CDS
TAGCTCCAGAAGTGTGTAAT+AGG 0.334963 6:+103220605 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTATATGAATTTATGTCTAA+TGG 0.336383 6:+103214565 MsG0680035359.01.T01:CDS
GACAAATTTATTTACAATAA+GGG 0.337425 6:+103214595 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGCTTATTGTATATCCAATC+TGG 0.341219 6:-103215003 None:intergenic
TCAACTACTTTACTCATTGT+AGG 0.343746 6:-103220886 None:intergenic
AAATGCCTATTACACACTTC+TGG 0.348283 6:-103220610 None:intergenic
TCAATCACTCTACTCATTGT+AGG 0.348673 6:-103215141 None:intergenic
TGAAAGTGGTTTGGATAAAA+GGG 0.353523 6:+103213042 MsG0680035359.01.T01:CDS
GGAAAAGAAACCAAAGGTTT+TGG 0.356003 6:-103215201 None:intergenic
AAGTCTGATGTTTATAGTTA+TGG 0.356517 6:+103214907 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTAAAAGAGGTTTGAATAAC+GGG 0.361276 6:+103218599 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTGAGATATACTTTCCTCAT+TGG 0.364710 6:+103220734 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGTCCAAAATCTGAGATCTT+TGG 0.364787 6:-103220514 None:intergenic
GACAAATATATTTACAATAA+GGG 0.366442 6:+103220337 MsG0680035359.01.T01:CDS
AAGTCTGATGTTTACAGTTA+TGG 0.368936 6:+103220649 MsG0680035359.01.T01:CDS
AATTGTCTATTCCATACTTC+AGG 0.371534 6:-103214868 None:intergenic
TGAAATGTTGGAAGGTAGTA+TGG 0.372141 6:+103215161 MsG0680035359.01.T01:CDS
GATATGTGGCTCCTGAAGTA+TGG 0.382446 6:+103214857 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTGAAGAAGGAGATTGTAGA+TGG 0.384457 6:+103218671 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGAAATACCACCAAAACCTT+TGG 0.386679 6:+103215191 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTATGTCAAAATGTAAAATC+CGG 0.389010 6:-103214714 None:intergenic
CCTTTATATCTGTTCCTACA+TGG 0.389378 6:-103212985 None:intergenic
CTCATTGTAGGTCTATCATT+TGG 0.394718 6:-103215129 None:intergenic
CCATGTAGGAACAGATATAA+AGG 0.395806 6:+103212985 MsG0680035359.01.T01:CDS
ATCGTAATTTGTTGTGTTAG+AGG 0.399248 6:+103219941 MsG0680035359.01.T01:CDS
GCAAAAGGAATGACCATTGT+TGG 0.409203 6:+103215084 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTGAATGCATCAAAAGGAAA+TGG 0.412265 6:+103214442 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTGAATGCATCAAAAGGAAA+TGG 0.412265 6:+103220184 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGATGAATGTGTAAAGTGTT+TGG 0.413290 6:+103218645 MsG0680035359.01.T01:CDS
CTCATTGTAGGTCTGCCATT+AGG 0.414536 6:-103220874 None:intergenic
CTTAAAAGAGGTTTGAATAA+CGG 0.414992 6:+103218598 MsG0680035359.01.T01:CDS
AACCATTGCATCTTTGAGTT+GGG 0.417275 6:+103214624 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGATGATCTTGAAAGTGGTT+TGG 0.420117 6:+103213033 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGGAATGATGCTTCTTGAAA+TGG 0.422623 6:+103214927 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGAGATATACTTTCCTCATT+GGG 0.426141 6:+103220735 MsG0680035359.01.T01:CDS
CAAAATTAAACTTGGTCAAG+GGG 0.432228 6:+103214360 MsG0680035359.01.T01:CDS
CTCTTGCAATTATTTAACTC+TGG 0.436580 6:-103218502 None:intergenic
CAAAATTAAACTTGGTCAAG+GGG 0.440262 6:+103220102 MsG0680035359.01.T01:CDS
TACAAAGGAAAGTTATTCAA+TGG 0.440442 6:+103214397 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTAATGGATTTGAAGAATCA+AGG 0.440727 6:+103212938 None:intergenic
GGAGACGAAAGTAATGGTTT+TGG 0.445344 6:-103220946 None:intergenic
ATCATAATCTGTTGTTATAG+AGG 0.446163 6:+103214199 MsG0680035359.01.T01:CDS
CAAAGGGATAGCTCGAGGTT+TGG 0.447158 6:+103214666 MsG0680035359.01.T01:CDS
GACATTGATGAACTTAAAAG+AGG 0.449319 6:+103218586 MsG0680035359.01.T01:CDS
TACAAAGGAAAGTTATTGAA+TGG 0.452813 6:+103220139 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGGTTTGAATAACGGGTTTG+AGG 0.453245 6:+103218606 MsG0680035359.01.T01:CDS
AAACCATTGCATCTTTGAGT+TGG 0.461773 6:+103214623 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGTATTCAAACATTTCCTAA+TGG 0.463571 6:+103220859 MsG0680035359.01.T01:CDS
GATGAATGTGTAAAGTGTTT+GGG 0.464618 6:+103218646 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTCAAAATTAAACTTGGTCA+AGG 0.464835 6:+103214358 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTCAAAATTAAACTTGGTCA+AGG 0.464835 6:+103220100 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGAAGTTGACATTAATTCGT+TGG 0.465908 6:+103220915 MsG0680035359.01.T01:CDS
GAAGAAAATGAGATTGCAAA+AGG 0.468996 6:+103215069 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGGAATGATGCTATTAGAAA+TGG 0.472714 6:+103220669 MsG0680035359.01.T01:CDS
AACTCATTCAAAATTAAACT+TGG 0.473814 6:+103214352 MsG0680035359.01.T01:CDS
AACTCATTCAAAATTAAACT+TGG 0.473814 6:+103220094 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTAAGCAGTTGAGCTGGAAA+TGG 0.477384 6:+103213526 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGGTTTGGAGTATTTGCATA+GGG 0.477632 6:+103214681 MsG0680035359.01.T01:CDS
GGATGACCATTGTGGGTTTG+TGG 0.479663 6:+103220836 MsG0680035359.01.T01:CDS
GCAAAGAGGATGACCATTGT+GGG 0.483031 6:+103220829 MsG0680035359.01.T01:CDS
AAGTGTTTGGGAAGTGAAGA+AGG 0.483107 6:+103218658 MsG0680035359.01.T01:CDS
CAACTGCTTACCTGCGATAG+AGG 0.483982 6:-103213514 None:intergenic
GAGTAGAGTGATTGAAATGT+TGG 0.491283 6:+103215149 MsG0680035359.01.T01:CDS
ATCCAAACTTAAAGTTGCAA+TGG 0.495228 6:-103220368 None:intergenic
TCAAAATTAAACTTGGTCAA+GGG 0.500999 6:+103214359 MsG0680035359.01.T01:CDS
TCAAAATTAAACTTGGTCAA+GGG 0.500999 6:+103220101 MsG0680035359.01.T01:CDS
TCAATGGCCATCACTATGTC+AGG 0.504792 6:-103215048 None:intergenic
TTCCTCATTGGGTATACAGT+AGG 0.511227 6:+103220746 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGAGGAATCTGTTAGAGCAT+TGG 0.513913 6:-103213496 None:intergenic
TATGTCAAAATGTAAAATCC+GGG 0.514666 6:-103214713 None:intergenic
ATATTTGTCAAGAGAACCAT+TGG 0.519268 6:-103220323 None:intergenic
CTTCAAAACAAAATCCAAGA+AGG 0.520710 6:-103214525 None:intergenic
TCATCTAAAAGAATGTTATG+TGG 0.525274 6:-103214739 None:intergenic
TCGGATCAAAGAGGGACAAT+GGG 0.525499 6:+103220577 MsG0680035359.01.T01:CDS
TATTGTAAATAAATTTGTCA+AGG 0.525991 6:-103214591 None:intergenic
CAAACCTCGAGCTATCCCTT+TGG 0.528872 6:-103214665 None:intergenic
ATTGTAAATAAATTTGTCAA+GGG 0.531340 6:-103214590 None:intergenic
GTTTGGATAAAAGGGGTTTG+AGG 0.532733 6:+103213050 MsG0680035359.01.T01:CDS
CTTCAAAACAAAATCCAAGA+AGG 0.535513 6:-103220267 None:intergenic
GTATACAGTAGGCTTGAACT+TGG 0.535679 6:+103220757 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTATATGAGTTTATGTCCAA+TGG 0.536833 6:+103220307 MsG0680035359.01.T01:CDS
ATTTGTATCAAATTGCCAAA+GGG 0.538129 6:+103214650 MsG0680035359.01.T01:CDS
ATCCCAACTCAAAGATGCAA+TGG 0.539923 6:-103214626 None:intergenic
GATATACAATAAGCTAGAAA+CGG 0.542646 6:+103215011 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGACAGCATTGTTTCAATGT+CGG 0.545913 6:+103220558 MsG0680035359.01.T01:CDS
GACATGTTCAAGTCGCAGTA+GGG 0.546295 6:+103218524 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGACATGTTCAAGTCGCAGT+AGG 0.551546 6:+103218523 MsG0680035359.01.T01:CDS
GTCGGATCAAAGAGGGACAA+TGG 0.553003 6:+103220576 MsG0680035359.01.T01:CDS
AATGATGCTATTAGAAATGG+TGG 0.553663 6:+103220672 MsG0680035359.01.T01:CDS
GAGCTTGATGATCTTGAAAG+TGG 0.554353 6:+103213028 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGCATAGGGGATGTAACACC+CGG 0.558285 6:+103214695 MsG0680035359.01.T01:CDS
GAAAGTGGTTTGGATAAAAG+GGG 0.558606 6:+103213043 MsG0680035359.01.T01:CDS
GACTCAGATACCGATCTAGT+AGG 0.561680 6:-103220967 None:intergenic
AAACAATGCTGTCTTTCTTG+TGG 0.562101 6:-103220549 None:intergenic
GACATATTCAAGTTCCATGT+AGG 0.566036 6:+103212971 MsG0680035359.01.T01:CDS
TCGCAGGTAAGCAGTTGAGC+TGG 0.567565 6:+103213520 MsG0680035359.01.T01:CDS
AATATGCATCAAATTGCGAA+AGG 0.568110 6:+103220391 MsG0680035359.01.T01:CDS
GAGGTTTGGAGTATTTGCAT+AGG 0.570365 6:+103214680 MsG0680035359.01.T01:CDS
TTTCAATGTCGGATCAAAGA+GGG 0.571873 6:+103220569 MsG0680035359.01.T01:CDS
AGAGTGATTGAAATGTTGGA+AGG 0.573237 6:+103215153 MsG0680035359.01.T01:CDS
TCATCTAAAAGAATGTTATG+TGG 0.574794 6:-103220481 None:intergenic
ATATGCATCAAATTGCGAAA+GGG 0.574938 6:+103220392 MsG0680035359.01.T01:CDS
TGCTATTAGAAATGGTGGGT+GGG 0.574989 6:+103220677 MsG0680035359.01.T01:CDS
CTAACAGATTCCTCTATCGC+AGG 0.578114 6:+103213504 MsG0680035359.01.T01:CDS
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ACAATCATCATAATAGCAAG+AGG 0.583444 6:-103218728 None:intergenic
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CRISPR-GE

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! GCAAAACTACAAAAAGATAA+CGG - Chr6:103213671-103213690 None:intergenic 25.0%
! GTTATATATGCAATTAGTTC+TGG + Chr6:103218927-103218946 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
! TACAAAGGAAAGTTATTCAA+TGG + Chr6:103214397-103214416 MsG0680035359.01.T01:CDS 25.0%
! TACAAAGGAAAGTTATTGAA+TGG + Chr6:103220139-103220158 MsG0680035359.01.T01:CDS 25.0%
! TACTAATAAACTTTGATGTG+TGG + Chr6:103217500-103217519 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
! TATGTCAAAATGTAAAATCC+GGG - Chr6:103214716-103214735 None:intergenic 25.0%
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!! AAGATTTTGAATGCATCAAA+AGG + Chr6:103214436-103214455 MsG0680035359.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTCTTATTATGTGCTGA+TGG - Chr6:103214124-103214143 None:intergenic 25.0%
!! CGATACTACATGTAAAATTT+TGG + Chr6:103214230-103214249 MsG0680035359.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAATTTGGGACAATTTACT+TGG - Chr6:103217135-103217154 None:intergenic 25.0%
!! TTCTTTTACAAGCAAACTAT+CGG + Chr6:103213958-103213977 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!! TTGACAAAAGTACAAAAGTA+AGG + Chr6:103219053-103219072 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGAGTTTTATACTTGTGTT+AGG + Chr6:103216966-103216985 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!!! AATTTTAAGACATCAATCAG+TGG + Chr6:103216608-103216627 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!!! AGAATGATAGTGTATAGTTT+TGG - Chr6:103219628-103219647 None:intergenic 25.0%
!!! ATAGTTTGCTTGTAAAAGAA+GGG - Chr6:103213958-103213977 None:intergenic 25.0%
!!! CATATACTAGAGCTTTTTTA+CGG - Chr6:103220294-103220313 None:intergenic 25.0%
!!! GAAGCATTTTTAAAAGATCA+TGG + Chr6:103220022-103220041 MsG0680035359.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTTGTTCATTTTTTAGAG+TGG + Chr6:103217806-103217825 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAGGTTTTTAACTTGTTCA+TGG + Chr6:103216096-103216115 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTAGAGTGGAAATTTAGT+GGG + Chr6:103217818-103217837 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTAGAGTGGAAATTTAG+TGG + Chr6:103217817-103217836 MsG0680035359.01.T01:intron 25.0%
AAAATTAAACTTGGTCAAGG+GGG + Chr6:103214361-103214380 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
AAATACCAATGTGATCTATG+TGG + Chr6:103215388-103215407 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
AACTGTTATCCTTCCTTATT+AGG + Chr6:103219592-103219611 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
AACTTGACTTCTATGTTACT+TGG + Chr6:103216684-103216703 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
AAGGAAGTTGAAAACAATAG+AGG + Chr6:103217193-103217212 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
AAGTCTGATGTTTACAGTTA+TGG + Chr6:103220649-103220668 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
AATAGCAGGTATATTCACTA+AGG - Chr6:103215795-103215814 None:intergenic 30.0%
AATATGCATCAAATTGCGAA+AGG + Chr6:103220391-103220410 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
AATCGCTTAAGCCTAATTAT+TGG + Chr6:103217746-103217765 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
AATGAACAAAACGTGACAAA+CGG - Chr6:103217798-103217817 None:intergenic 30.0%
AATGATGCTATTAGAAATGG+TGG + Chr6:103220672-103220691 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
AATTGTCTATTCCATACTTC+AGG - Chr6:103214871-103214890 None:intergenic 30.0%
ACAATCATCATAATAGCAAG+AGG - Chr6:103218731-103218750 None:intergenic 30.0%
AGAAGTTGACATTAATTCGT+TGG + Chr6:103220915-103220934 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
AGAGAAAACTTGTCACAAAA+CGG - Chr6:103215591-103215610 None:intergenic 30.0%
AGAGAGAAATATAGTAAGGA+AGG + Chr6:103217216-103217235 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
AGCCAAAATAATTCTCATCA+TGG - Chr6:103217866-103217885 None:intergenic 30.0%
AGCTTATTGTATATCCAATC+TGG - Chr6:103215006-103215025 None:intergenic 30.0%
AGTAACATAGAAGTCAAGTT+TGG - Chr6:103216684-103216703 None:intergenic 30.0%
ATAAATGGCAACAATTATGG+CGG - Chr6:103216141-103216160 None:intergenic 30.0%
ATATGCATCAAATTGCGAAA+GGG + Chr6:103220392-103220411 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
ATATTTGTCAAGAGAACCAT+TGG - Chr6:103220326-103220345 None:intergenic 30.0%
ATCAAAAACTCTTACAACTG+CGG + Chr6:103218097-103218116 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
ATCCAAACTTAAAGTTGCAA+TGG - Chr6:103220371-103220390 None:intergenic 30.0%
ATCGCTTAAGCCTAATTATT+GGG + Chr6:103217747-103217766 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
ATCGGTATTAAGTATGTACT+AGG + Chr6:103213976-103213995 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
ATGATCATGAAACCTTGAAT+TGG - Chr6:103216849-103216868 None:intergenic 30.0%
ATGATGCTATTAGAAATGGT+GGG + Chr6:103220673-103220692 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
CAAAATAGAATGCAAGGTTA+CGG + Chr6:103216328-103216347 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
CAAAATTAAACTTGGTCAAG+GGG + Chr6:103214360-103214379 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
CAAGCTTTCTGACTAAATTA+TGG + Chr6:103215545-103215564 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
CATAATTTAGTCAGAAAGCT+TGG - Chr6:103215547-103215566 None:intergenic 30.0%
CTAGAAACAGAAATACGAAT+GGG - Chr6:103213347-103213366 None:intergenic 30.0%
CTATGTTGATCATACAAGTT+TGG + Chr6:103219684-103219703 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
CTCTTGCAATTATTTAACTC+TGG - Chr6:103218505-103218524 None:intergenic 30.0%
CTGAAATGCATAAGTAAAGA+AGG + Chr6:103217174-103217193 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
CTTCAAAACAAAATCCAAGA+AGG - Chr6:103214528-103214547 None:intergenic 30.0%
CTTCTTTACTTATGCATTTC+AGG - Chr6:103217176-103217195 None:intergenic 30.0%
GAAGAAAATGAGATTGCAAA+AGG + Chr6:103215069-103215088 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
GAAGTATGGAATAGACAATT+TGG + Chr6:103214871-103214890 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
GAATAATTGAAATCTGGTTG+AGG - Chr6:103218064-103218083 None:intergenic 30.0%
GACATTGATGAACTTAAAAG+AGG + Chr6:103218586-103218605 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
GAGATAAGAAAACATACTTC+TGG - Chr6:103218797-103218816 None:intergenic 30.0%
GCAGGAGTTTAAATAAATCA+AGG - Chr6:103213308-103213327 None:intergenic 30.0%
GGGAAAATCAAAATCATTCT+AGG + Chr6:103219475-103219494 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
GTATATGAGTTTATGTCCAA+TGG + Chr6:103220307-103220326 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
GTCAAAATGTAAAATTCGAG+TGG - Chr6:103220455-103220474 None:intergenic 30.0%
GTCTAATTTGAGCATATGAT+TGG - Chr6:103219304-103219323 None:intergenic 30.0%
TAAGTAATGAAGGAGATTGT+AGG + Chr6:103213112-103213131 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
TAGAAACAGAAATACGAATG+GGG - Chr6:103213346-103213365 None:intergenic 30.0%
TCAACTACTTTACTCATTGT+AGG - Chr6:103220889-103220908 None:intergenic 30.0%
TCAAGGTTTCATGATCATAT+AGG + Chr6:103216851-103216870 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
TCAAGTTCAACCCAATAATT+AGG - Chr6:103217760-103217779 None:intergenic 30.0%
TCATACCTTTAACTATGTTG+TGG + Chr6:103219527-103219546 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
TCGGTATTAAGTATGTACTA+GGG + Chr6:103213977-103213996 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
TGAGATATACTTTCCTCATT+GGG + Chr6:103220735-103220754 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
TGAGGAATGTTTATGTTGTT+TGG + Chr6:103213089-103213108 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
TGATACTTCAAAGTGATAAG+TGG + Chr6:103217088-103217107 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
TGGAAATTGGAAATCATTCT+AGG + Chr6:103213546-103213565 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
TGGAATGATGCTATTAGAAA+TGG + Chr6:103220669-103220688 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
TGGTGAAGAATTTATTAACG+AGG + Chr6:103220204-103220223 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATGCATCAAAAGGAAA+TGG + Chr6:103214442-103214461 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
TTGGCTAAATAAATTGGGAA+AGG - Chr6:103219285-103219304 None:intergenic 30.0%
! AAACAAACACACAAGTTGAA+GGG + Chr6:103215510-103215529 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! AACCATTGCAACTTTAAGTT+TGG + Chr6:103220366-103220385 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
! AGATGAATGTGTAAAGTGTT+TGG + Chr6:103218645-103218664 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
! AGTCCAAAATCTGAAATCTT+TGG - Chr6:103214775-103214794 None:intergenic 30.0%
! ATTTTGTGAGGATAACAGAA+TGG - Chr6:103218224-103218243 None:intergenic 30.0%
! CAAAACTGCAACACTAATTT+TGG + Chr6:103219140-103219159 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! CAATGTTTTACAGGTTTTAC+AGG + Chr6:103216808-103216827 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! CTTATTGCTTGCAATTGTTT+TGG - Chr6:103217551-103217570 None:intergenic 30.0%
! GATGAATGTGTAAAGTGTTT+GGG + Chr6:103218646-103218665 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
! TAATAGTAGAAAGAGCATAG+AGG - Chr6:103219429-103219448 None:intergenic 30.0%
! TATGTATTAGGAAAGCACAA+AGG + Chr6:103219727-103219746 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! TGAAAGTGGTTTGGATAAAA+GGG + Chr6:103213042-103213061 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
! TGCAATCTCATTTTCTTCAA+TGG - Chr6:103215067-103215086 None:intergenic 30.0%
! TGCCATGATGAGAATTATTT+TGG + Chr6:103217861-103217880 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! TGTCCAAAGATTTCAGATTT+TGG + Chr6:103214769-103214788 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTGTTTGGTAAGTAATGA+AGG + Chr6:103213102-103213121 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! TTATGCACTCAATGTTTTAC+AGG + Chr6:103216799-103216818 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! TTCTCCCTTTTACTATTTTG+TGG + Chr6:103213601-103213620 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
! TTGAAAGTGGTTTGGATAAA+AGG + Chr6:103213041-103213060 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCCTACTAGATCGTTAT+TGG + Chr6:103215218-103215237 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
!! AAGTACTGTGAAATTTTGTG+AGG - Chr6:103218236-103218255 None:intergenic 30.0%
!! AATCATGCTTTTTGTCATGT+TGG + Chr6:103218451-103218470 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTTTAGGTGTAGTATCGA+TGG - Chr6:103219971-103219990 None:intergenic 30.0%
!! ATCGTAATTTGTTGTGTTAG+AGG + Chr6:103219941-103219960 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
!! GATAGTTTGCTTGTAAAAGA+AGG - Chr6:103213959-103213978 None:intergenic 30.0%
!! GATGTTAATATTTGGCTCTT+AGG + Chr6:103217622-103217641 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
!! GTATTCATTTTTGCCACTTA+TGG + Chr6:103216184-103216203 MsG0680035359.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTCTTGGATTTTGTTTTGA+AGG + Chr6:103214526-103214545 MsG0680035359.01.T01:CDS 30.0%
!!! GAGAACAGATATTTTGATCA+AGG - Chr6:103218303-103218322 None:intergenic 30.0%
AAACAATGCTGTCTTTCTTG+TGG - Chr6:103220552-103220571 None:intergenic 35.0%
AAACCATTGCATCTTTGAGT+TGG + Chr6:103214623-103214642 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
AAAGAACTTTGGCTAAACGA+TGG - Chr6:103219195-103219214 None:intergenic 35.0%
AAATGCCTATTACACACTTC+TGG - Chr6:103220613-103220632 None:intergenic 35.0%
AACATCTTGTATCCATTCTG+GGG + Chr6:103218130-103218149 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
AAGAACTTTGGCTAAACGAT+GGG - Chr6:103219194-103219213 None:intergenic 35.0%
AAGAAGATGAGATTGCAAAG+AGG + Chr6:103220815-103220834 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
AAGGTTTCACTACACAGATA+AGG + Chr6:103215919-103215938 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
AATGATGCTTCTTGAAATGG+TGG + Chr6:103214930-103214949 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
AATGCACCATAAACCAACAA+TGG - Chr6:103215100-103215119 None:intergenic 35.0%
ACGAAGAAGAAAAAATGAGG+AGG - Chr6:103217911-103217930 None:intergenic 35.0%
ACTGGTACTTCTTGAATTTG+TGG - Chr6:103216996-103217015 None:intergenic 35.0%
ACTTTCATGTCAAATGCAAG+AGG + Chr6:103214826-103214845 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
AGACAGCATTGTTTCAATGT+CGG + Chr6:103220558-103220577 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTGATTGAAATGTTGGA+AGG + Chr6:103215153-103215172 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTTCACTACACAGATAA+GGG + Chr6:103215920-103215939 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
AGTACCAGTAGTAAGAGTTT+CGG + Chr6:103217007-103217026 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
AGTCTGTAAAACCTGTTTCA+TGG + Chr6:103216742-103216761 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
ATAGGTAGTAAACTCCTAAC+TGG - Chr6:103216250-103216269 None:intergenic 35.0%
ATAGTGATGTTGTTGACAGT+TGG - Chr6:103218373-103218392 None:intergenic 35.0%
ATCAATTGTATCCTCGTTAC+GGG - Chr6:103217456-103217475 None:intergenic 35.0%
ATGAACAAAACGTGACAAAC+GGG - Chr6:103217797-103217816 None:intergenic 35.0%
ATGATGCTTCTTGAAATGGT+GGG + Chr6:103214931-103214950 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
CAACATCTTGTATCCATTCT+GGG + Chr6:103218129-103218148 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
CACTTATGGTAGCAAGATTA+GGG + Chr6:103216198-103216217 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
CATCAATTGTATCCTCGTTA+CGG - Chr6:103217457-103217476 None:intergenic 35.0%
CCATCATAAAAATACCACAG+AGG - Chr6:103218559-103218578 None:intergenic 35.0%
CCATGTAGGAACAGATATAA+AGG + Chr6:103212985-103213004 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
CCTTTATATCTGTTCCTACA+TGG - Chr6:103212988-103213007 None:intergenic 35.0%
CGAAGAAGAAAAAATGAGGA+GGG - Chr6:103217910-103217929 None:intergenic 35.0%
CTAGTAGGAAAAGAAACCAA+AGG - Chr6:103215210-103215229 None:intergenic 35.0%
CTATGTGATGAATCAGTCAA+GGG - Chr6:103217368-103217387 None:intergenic 35.0%
CTCATTGTAGGTCTATCATT+TGG - Chr6:103215132-103215151 None:intergenic 35.0%
CTCTTCATAAAAACAGGTGT+TGG + Chr6:103214145-103214164 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
CTTAAAGTTGCAATGGTTTC+AGG - Chr6:103220364-103220383 None:intergenic 35.0%
CTTATCCACATAGATCACAT+TGG - Chr6:103215396-103215415 None:intergenic 35.0%
CTTTCATGTCAAATGCAAGA+GGG + Chr6:103214827-103214846 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
GAAGAAGAAAAAATGAGGAG+GGG - Chr6:103217909-103217928 None:intergenic 35.0%
GAGGAGAGAGAAATATAGTA+AGG + Chr6:103217212-103217231 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
GAGTAGAGTGATTGAAATGT+TGG + Chr6:103215149-103215168 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
GATTCCAATAACGATCTAGT+AGG - Chr6:103215225-103215244 None:intergenic 35.0%
GCTAGAAACAGAAATACGAA+TGG - Chr6:103213348-103213367 None:intergenic 35.0%
GCTCTTTCTACTATTATCGT+AGG + Chr6:103219433-103219452 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
GGAACGAAGAAGAAAAAATG+AGG - Chr6:103217914-103217933 None:intergenic 35.0%
GGTAACAACATTAACATGTG+AGG - Chr6:103214506-103214525 None:intergenic 35.0%
GGTGAATTATAGTGTGAATG+AGG + Chr6:103213071-103213090 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
GTACTTCTTGAATTTGTGGT+TGG - Chr6:103216992-103217011 None:intergenic 35.0%
GTATGGAATAGACAATTTGG+AGG + Chr6:103214874-103214893 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
GTGAGATATACTTTCCTCAT+TGG + Chr6:103220734-103220753 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
GTTAATGTTGTTACCCTTCT+TGG + Chr6:103214511-103214530 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
GTTACCATTAGATCTTCCTT+TGG + Chr6:103213819-103213838 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
GTTGGAAGATATTGAAACAG+AGG - Chr6:103218355-103218374 None:intergenic 35.0%
TAGGTAGTAAACTCCTAACT+GGG - Chr6:103216249-103216268 None:intergenic 35.0%
TCAATCACTCTACTCATTGT+AGG - Chr6:103215144-103215163 None:intergenic 35.0%
TCTATGTGATGAATCAGTCA+AGG - Chr6:103217369-103217388 None:intergenic 35.0%
TGAAATACCACCAAAACCTT+TGG + Chr6:103215191-103215210 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
TGAAATGTTGGAAGGTAGTA+TGG + Chr6:103215161-103215180 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
TGATCTATGTGGATAAGTGA+AGG + Chr6:103215399-103215418 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
TGATGATCTTGAAAGTGGTT+TGG + Chr6:103213033-103213052 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
TGGAATGATGCTTCTTGAAA+TGG + Chr6:103214927-103214946 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
TGGGCGGAAAAATATTAATG+CGG + Chr6:103220696-103220715 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
TGGTGAAGACTTTATTAACG+AGG + Chr6:103214462-103214481 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
TGTAAAACCTGTTTCATGGT+CGG + Chr6:103216746-103216765 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
TTTCAATGTCGGATCAAAGA+GGG + Chr6:103220569-103220588 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGATCTCAGATTTTGGAC+TGG + Chr6:103220516-103220535 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! AACCATTGCATCTTTGAGTT+GGG + Chr6:103214624-103214643 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! AAGATTAGGGCATCAATTCA+AGG + Chr6:103216211-103216230 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
! ACGTAAAGCTGAGCAAATTT+TGG - Chr6:103216286-103216305 None:intergenic 35.0%
! AGCACACTTTTCGCTATAAA+TGG + Chr6:103213927-103213946 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
! AGGTTTGGAGTATTTGCATA+GGG + Chr6:103214681-103214700 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! AGTCCAAAATCTGAGATCTT+TGG - Chr6:103220517-103220536 None:intergenic 35.0%
! CAAACAAACACACAAGTTGA+AGG + Chr6:103215509-103215528 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
! CCATTTGTTTCTCAAATAGC+AGG - Chr6:103215809-103215828 None:intergenic 35.0%
! CCTGCTATTTGAGAAACAAA+TGG + Chr6:103215806-103215825 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
! CTATTTTCGAATGGTGACAA+TGG + Chr6:103216516-103216535 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
! CTTTTCTTGCCTAATAAGGA+AGG - Chr6:103219604-103219623 None:intergenic 35.0%
! GAAAGTGGTTTGGATAAAAG+GGG + Chr6:103213043-103213062 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGTGTGTAATAGGCATTT+TGG + Chr6:103220613-103220632 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! GACATATTCAAGTTCCATGT+AGG + Chr6:103212971-103212990 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAAAGAAACCAAAGGTTT+TGG - Chr6:103215204-103215223 None:intergenic 35.0%
! TATGGTTGGCTAAAGAAGTT+GGG - Chr6:103213374-103213393 None:intergenic 35.0%
! TCCAATCATTTTATGCCACA+TGG + Chr6:103219088-103219107 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
! TGGTCTTTTCTTGCCTAATA+AGG - Chr6:103219608-103219627 None:intergenic 35.0%
! TGTCCAAAGATCTCAGATTT+TGG + Chr6:103220511-103220530 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAGAAACCAAAGGTTTTGG+TGG - Chr6:103215201-103215220 None:intergenic 35.0%
!! AAGGTTTTGGTGGTATTTCA+AGG - Chr6:103215191-103215210 None:intergenic 35.0%
!! ATATTTGGCTCTTAGGAGAA+AGG + Chr6:103217629-103217648 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
!! CCTCTGTGGTATTTTTATGA+TGG + Chr6:103218556-103218575 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATGACCATTGTTGGTTTA+TGG + Chr6:103215091-103215110 MsG0680035359.01.T01:CDS 35.0%
!! TATTTGGCTCTTAGGAGAAA+GGG + Chr6:103217630-103217649 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTGGTTGAAGTTGAGAGT+GGG - Chr6:103218035-103218054 None:intergenic 35.0%
!!! CTTGCAATTGTTTTGGTCAT+TGG - Chr6:103217544-103217563 None:intergenic 35.0%
!!! GTCTGTTCTTTTGAGTTTGA+TGG - Chr6:103218281-103218300 None:intergenic 35.0%
!!! GTGGGTGAAAATACTGATTT+TGG + Chr6:103215952-103215971 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
!!! TGATTTTGGAACGTCATTTG+CGG + Chr6:103215966-103215985 MsG0680035359.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTTTATGATCAGGCCATG+TGG - Chr6:103219106-103219125 None:intergenic 35.0%
AAACTTTGATGTGTGGAGCA+AGG + Chr6:103217507-103217526 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
AACTTTGATGTGTGGAGCAA+GGG + Chr6:103217508-103217527 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
AAGGTTTGCAACTGCGATTT+AGG - Chr6:103213289-103213308 None:intergenic 40.0%
AAGTGTTTGGGAAGTGAAGA+AGG + Chr6:103218658-103218677 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
AATACACCACAAACCCACAA+TGG - Chr6:103220845-103220864 None:intergenic 40.0%
AATGAAGGAGATTGTAGGTG+TGG + Chr6:103213117-103213136 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
ACAATCAATGTCCACGTGTT+GGG + Chr6:103215880-103215899 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
ACATCCGAAACTCTTACTAC+TGG - Chr6:103217014-103217033 None:intergenic 40.0%
ACTTTCGTCTCCTACTAGAT+CGG + Chr6:103220957-103220976 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
AGAATAATGAAGGAAGGAGC+AGG + Chr6:103217277-103217296 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
AGAGGAATCTGTTAGAGCAT+TGG - Chr6:103213499-103213518 None:intergenic 40.0%
ATCCCAACTCAAAGATGCAA+TGG - Chr6:103214629-103214648 None:intergenic 40.0%
ATTGGTAAGCCATGTGCTTA+AGG - Chr6:103214007-103214026 None:intergenic 40.0%
CAAAATCGTCCTGTTCAATG+TGG + Chr6:103218154-103218173 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
CACAGTTTAATGCTCTGTGA+GGG + Chr6:103216004-103216023 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
CCAACATCTTGTATCCATTC+TGG + Chr6:103218128-103218147 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
CCACTTATGGTAGCAAGATT+AGG + Chr6:103216197-103216216 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
CCAGAATGGATACAAGATGT+TGG - Chr6:103218131-103218150 None:intergenic 40.0%
CCTAATCTTGCTACCATAAG+TGG - Chr6:103216200-103216219 None:intergenic 40.0%
CTAGTAGGAGACGAAAGTAA+TGG - Chr6:103220955-103220974 None:intergenic 40.0%
CTCAAAGATGCAATGGTTTC+AGG - Chr6:103214622-103214641 None:intergenic 40.0%
CTCATTCTAACAACAGGTGT+GGG + Chr6:103219887-103219906 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
CTGGTAATTGTAGCACTTTG+TGG + Chr6:103218946-103218965 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
CTTCGTCTCAAAGTGCAAAA+AGG - Chr6:103215854-103215873 None:intergenic 40.0%
GAATAATGAAGGAAGGAGCA+GGG + Chr6:103217278-103217297 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
GAATGGTAGTATTGTCGTTG+TGG - Chr6:103218207-103218226 None:intergenic 40.0%
GACAATTTACTTGGTTCCCA+AGG - Chr6:103217126-103217145 None:intergenic 40.0%
GCAAAAGGAATGACCATTGT+TGG + Chr6:103215084-103215103 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GCCATGTGGCATAAAATGAT+TGG - Chr6:103219092-103219111 None:intergenic 40.0%
GGAAGATATTGAAACAGAGG+TGG - Chr6:103218352-103218371 None:intergenic 40.0%
GGAGTTTACTACCTATGTCA+TGG + Chr6:103216254-103216273 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
GGATTGATGAGGAAAAGAAG+TGG - Chr6:103218014-103218033 None:intergenic 40.0%
GGGAAGGTGAACTTTAATCT+AGG - Chr6:103217436-103217455 None:intergenic 40.0%
GGGCTAGAATATTTGCATAG+AGG + Chr6:103220424-103220443 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GTATACAGTAGGCTTGAACT+TGG + Chr6:103220757-103220776 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GTGAAGAAGGAGATTGTAGA+TGG + Chr6:103218671-103218690 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GTTATTGAATGGTTGCCATG+TGG + Chr6:103220150-103220169 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGCTGGAAATGGAAAT+TGG + Chr6:103213533-103213552 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCAATGTCGGATCAAAG+AGG + Chr6:103220568-103220587 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
GTTTGGATAAAAGGGGTTTG+AGG + Chr6:103213050-103213069 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
TACGATTCGTCTCCAATTCA+AGG + Chr6:103216834-103216853 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
TAGGGAAAACCTTAAGCACA+TGG + Chr6:103213995-103214014 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
TATTGTCGTTGTGGCAGTTA+AGG - Chr6:103218198-103218217 None:intergenic 40.0%
TCAAAATCTTCACTGCCACA+TGG - Chr6:103220168-103220187 None:intergenic 40.0%
TCTCATTCTAACAACAGGTG+TGG + Chr6:103219886-103219905 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
TGTCACAACATGAAGTTGCA+TGG - Chr6:103219167-103219186 None:intergenic 40.0%
TGTGGCAGTTAAGGTAAAAC+TGG - Chr6:103218189-103218208 None:intergenic 40.0%
TTCCAATCCTAAACCATTCC+AGG - Chr6:103215771-103215790 None:intergenic 40.0%
TTCCTCATTGGGTATACAGT+AGG + Chr6:103220746-103220765 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! ACAGGTTTTACAGACTCTAG+AGG - Chr6:103216738-103216757 None:intergenic 40.0%
! ATCCTGGAATGGTTTAGGAT+TGG + Chr6:103215766-103215785 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
! ATGCTATTAGAAATGGTGGG+TGG + Chr6:103220676-103220695 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! CAGGTTTTACAGACTCTAGA+GGG - Chr6:103216737-103216756 None:intergenic 40.0%
! CTAGCGAGTATTTTCCAGAT+TGG + Chr6:103214989-103215008 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! CTGCGGTTGTTTGTAGTTTT+AGG + Chr6:103216078-103216097 MsG0680035359.01.T01:intron 40.0%
! GAGCTTGATGATCTTGAAAG+TGG + Chr6:103213028-103213047 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! GAGGTTTGGAGTATTTGCAT+AGG + Chr6:103214680-103214699 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGACGAAAGTAATGGTTT+TGG - Chr6:103220949-103220968 None:intergenic 40.0%
! GGTTTGGAGTATTTGCATAG+GGG + Chr6:103214682-103214701 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! GTAGTGATTTGAGACGTGAT+GGG + Chr6:103220779-103220798 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! GTATGGTTGGCTAAAGAAGT+TGG - Chr6:103213375-103213394 None:intergenic 40.0%
! GTGTGTAATAGGCATTTTGG+AGG + Chr6:103220616-103220635 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! GTTAAGGTAAAACTGGTTCC+CGG - Chr6:103218182-103218201 None:intergenic 40.0%
! TAGCTCCAGAAGTGTGTAAT+AGG + Chr6:103220605-103220624 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! TCTTATTATGTGCTGATGGC+AGG - Chr6:103214120-103214139 None:intergenic 40.0%
! TTTGAGACCTGACATAGTGA+TGG + Chr6:103215041-103215060 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGGTGATTGCCATGACAT+AGG - Chr6:103216268-103216287 None:intergenic 40.0%
!! AGGTTTGAATAACGGGTTTG+AGG + Chr6:103218606-103218625 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATTTGGTGTTGTCTACAA+AGG + Chr6:103220124-103220143 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCTATTAGAAATGGTGGGT+GGG + Chr6:103220677-103220696 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
!!! GACGAAAGTAATGGTTTTGG+TGG - Chr6:103220946-103220965 None:intergenic 40.0%
!!! GGTTTTGGTGTTGTGTACAA+AGG + Chr6:103214382-103214401 MsG0680035359.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTGGTTGAAGTTGAGAG+TGG - Chr6:103218036-103218055 None:intergenic 40.0%
!!! TCTGGTTGAGGTTGTTGTTT+TGG - Chr6:103218052-103218071 None:intergenic 40.0%
AAACTTGGTCAAGGGGGATT+TGG + Chr6:103220109-103220128 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
ACACAGATAAGGGCTAATCG+CGG + Chr6:103215930-103215949 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
ACATGTTCAAGTCGCAGTAG+GGG + Chr6:103218525-103218544 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
ACCCAACAATGTATTCTGCC+AGG - Chr6:103213860-103213879 None:intergenic 45.0%
ACCTCATCCTGGAATGGTTT+AGG + Chr6:103215761-103215780 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
ACTAATAGGGAAGCTGCGTA+TGG - Chr6:103213392-103213411 None:intergenic 45.0%
ACTTTGGCTAAACGATGGGT+TGG - Chr6:103219190-103219209 None:intergenic 45.0%
AGACATGTTCAAGTCGCAGT+AGG + Chr6:103218523-103218542 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
AGCCTACTGTATACCCAATG+AGG - Chr6:103220751-103220770 None:intergenic 45.0%
AGGGCATAAGCAAAGGGAAA+TGG - Chr6:103216718-103216737 None:intergenic 45.0%
AGTTGAGAGTGGGATTGATG+AGG - Chr6:103218025-103218044 None:intergenic 45.0%
ATTGTATCCTCGTTACGGGA+AGG - Chr6:103217452-103217471 None:intergenic 45.0%
CAATGGCTATAGACCACAAG+TGG + Chr6:103216533-103216552 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
CCACAGTTTAATGCTCTGTG+AGG + Chr6:103216003-103216022 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
CGTGCCAAAGGAAGATCTAA+TGG - Chr6:103213826-103213845 None:intergenic 45.0%
CTAACAGATTCCTCTATCGC+AGG + Chr6:103213504-103213523 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
CTCATTGTAGGTCTGCCATT+AGG - Chr6:103220877-103220896 None:intergenic 45.0%
CTTATGCATTTCAGGGCAGA+TGG - Chr6:103217168-103217187 None:intergenic 45.0%
GACAATCAATGTCCACGTGT+TGG + Chr6:103215879-103215898 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
GACATGTTCAAGTCGCAGTA+GGG + Chr6:103218524-103218543 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
GACTCAGATACCGATCTAGT+AGG - Chr6:103220970-103220989 None:intergenic 45.0%
GATATGTGGCTCCTGAAGTA+TGG + Chr6:103214857-103214876 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
GCAAAGAGGATGACCATTGT+GGG + Chr6:103220829-103220848 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
GCCTGGCAGAATACATTGTT+GGG + Chr6:103213856-103213875 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
GCGATTTAGGCCGTGATTTA+TGG - Chr6:103213276-103213295 None:intergenic 45.0%
GGCATAAGCAAAGGGAAATG+GGG - Chr6:103216716-103216735 None:intergenic 45.0%
GGGAATAGAACAGTGTTGTG+TGG - Chr6:103218776-103218795 None:intergenic 45.0%
GGGCATAAGCAAAGGGAAAT+GGG - Chr6:103216717-103216736 None:intergenic 45.0%
GGTGACGACATTAACATGTG+AGG - Chr6:103220248-103220267 None:intergenic 45.0%
GTAAGCAGTTGAGCTGGAAA+TGG + Chr6:103213526-103213545 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
GTCAATCATGTCACCCAGTT+AGG + Chr6:103216233-103216252 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
GTTAATGTCGTCACCCTTCT+TGG + Chr6:103220253-103220272 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
TCAAATAGCACACCTCATCC+TGG + Chr6:103215750-103215769 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
TCAAATGCAAGAGGGACAGT+CGG + Chr6:103214835-103214854 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
TCAATGGCCATCACTATGTC+AGG - Chr6:103215051-103215070 None:intergenic 45.0%
TCCTAAACCATTCCAGGATG+AGG - Chr6:103215765-103215784 None:intergenic 45.0%
TCGGATCAAAGAGGGACAAT+GGG + Chr6:103220577-103220596 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAAGAGGATGACCATTG+TGG + Chr6:103220828-103220847 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
TGCCTGGCAGAATACATTGT+TGG + Chr6:103213855-103213874 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
TGGCAACAATTATGGCGGTT+TGG - Chr6:103216136-103216155 None:intergenic 45.0%
TTTGTGAAGAGAACAGCGTG+AGG - Chr6:103213222-103213241 None:intergenic 45.0%
! AAACTTGGTCAAGGGGGTTT+TGG + Chr6:103214367-103214386 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
! ACAGAGCATTAAACTGTGGC+AGG - Chr6:103216002-103216021 None:intergenic 45.0%
! ACTCTAGAGGGCATAAGCAA+AGG - Chr6:103216725-103216744 None:intergenic 45.0%
! CAAACACACAAGTTGAAGGG+TGG + Chr6:103215513-103215532 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
! CCTCACAGAGCATTAAACTG+TGG - Chr6:103216006-103216025 None:intergenic 45.0%
! CTCTAGAGGGCATAAGCAAA+GGG - Chr6:103216724-103216743 None:intergenic 45.0%
! GGTAGTGATTTGAGACGTGA+TGG + Chr6:103220778-103220797 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
!! TATTAGAAATGGTGGGTGGG+CGG + Chr6:103220680-103220699 MsG0680035359.01.T01:CDS 45.0%
!!! TGCTCTGTGAGGGTATTTTG+CGG + Chr6:103216014-103216033 MsG0680035359.01.T01:intron 45.0%
AAGAGGGACAGTCGGATATG+TGG + Chr6:103214843-103214862 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
AAGTTCACCTTCCCGTAACG+AGG + Chr6:103217442-103217461 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
ACCTTGAGTGCAATGTCCCA+AGG - Chr6:103216780-103216799 None:intergenic 50.0%
AGATAAGGGCTAATCGCGGT+GGG + Chr6:103215934-103215953 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
AGTGGTGACAGAACGTACCT+TGG + Chr6:103217106-103217125 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
ATAGGGAAGCTGCGTATGGT+TGG - Chr6:103213388-103213407 None:intergenic 50.0%
ATTGCCAAAGGGATAGCTCG+AGG + Chr6:103214661-103214680 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
ATTGCGAAAGGGATTGCTCG+TGG + Chr6:103220403-103220422 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
CAAACCTCGAGCTATCCCTT+TGG - Chr6:103214668-103214687 None:intergenic 50.0%
CAAAGGGATAGCTCGAGGTT+TGG + Chr6:103214666-103214685 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
CAACTGCTTACCTGCGATAG+AGG - Chr6:103213517-103213536 None:intergenic 50.0%
CAAGTGGCTCAAAACAGACG+TGG + Chr6:103216549-103216568 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
CTTGTTCATGGCTTTCGCAG+CGG + Chr6:103216108-103216127 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
GCACTCATGTATCGTGCCAA+AGG - Chr6:103213838-103213857 None:intergenic 50.0%
GGATGACCATTGTGGGTTTG+TGG + Chr6:103220836-103220855 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
GGGAACGATGACTAAAGAGC+AGG - Chr6:103213326-103213345 None:intergenic 50.0%
GGGTTCGCTCATGAAAGACA+AGG + Chr6:103215900-103215919 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
GTAAGCAGTTGAGCTCGCAA+GGG + Chr6:103219455-103219474 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
GTCGGATCAAAGAGGGACAA+TGG + Chr6:103220576-103220595 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
GTGGTGACAGAACGTACCTT+GGG + Chr6:103217107-103217126 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
TAGCACACCTCATCCTGGAA+TGG + Chr6:103215755-103215774 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
TCCTTGGGACATTGCACTCA+AGG + Chr6:103216776-103216795 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
TGAAGAGAACAGCGTGAGGA+CGG - Chr6:103213218-103213237 None:intergenic 50.0%
TGCAATGTCCCAAGGAACTC+AGG - Chr6:103216772-103216791 None:intergenic 50.0%
TGCATAGGGGATGTAACACC+CGG + Chr6:103214695-103214714 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
TTGCGAAAGGGATTGCTCGT+GGG + Chr6:103220404-103220423 MsG0680035359.01.T01:CDS 50.0%
! GGACGATTTTGTCCCCAGAA+TGG - Chr6:103218145-103218164 None:intergenic 50.0%
!! AACCGCTAGAAGAAGTGCCA+CGG + Chr6:103216048-103216067 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
!! CGTCTGTTTTGAGCCACTTG+TGG - Chr6:103216549-103216568 None:intergenic 50.0%
!! GGAGGGGTTGAGTTGAGTTA+TGG - Chr6:103217893-103217912 None:intergenic 50.0%
!!! TCTGTGAGGGTATTTTGCGG+AGG + Chr6:103216017-103216036 MsG0680035359.01.T01:intron 50.0%
ACTCAGGCCGACCATGAAAC+AGG - Chr6:103216756-103216775 None:intergenic 55.0%
ATGGTCGGCCTGAGTTCCTT+GGG + Chr6:103216761-103216780 MsG0680035359.01.T01:intron 55.0%
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TCATGAGCGAACCCAACACG+TGG - Chr6:103215894-103215913 None:intergenic 55.0%
TCGCAGGTAAGCAGTTGAGC+TGG + Chr6:103213520-103213539 MsG0680035359.01.T01:CDS 55.0%
TGGCACGATACATGAGTGCC+TGG + Chr6:103213839-103213858 MsG0680035359.01.T01:intron 55.0%
!! ACCGCTAGAAGAAGTGCCAC+GGG + Chr6:103216049-103216068 MsG0680035359.01.T01:intron 55.0%
ACAACCGCAGATTTCCCCCG+TGG - Chr6:103216068-103216087 None:intergenic 60.0%
AGTGCCACGGGGGAAATCTG+CGG + Chr6:103216061-103216080 MsG0680035359.01.T01:intron 60.0%
CATGGTCGGCCTGAGTTCCT+TGG + Chr6:103216760-103216779 MsG0680035359.01.T01:intron 60.0%
CCCCGTGGCACTTCTTCTAG+CGG - Chr6:103216053-103216072 None:intergenic 60.0%
CGTCCTGTTCAATGTGGCGC+CGG + Chr6:103218160-103218179 MsG0680035359.01.T01:intron 60.0%
GTCCTGTTCAATGTGGCGCC+GGG + Chr6:103218161-103218180 MsG0680035359.01.T01:intron 60.0%
TTCCCGGCGCCACATTGAAC+AGG - Chr6:103218166-103218185 None:intergenic 60.0%
!! CCGCTAGAAGAAGTGCCACG+GGG + Chr6:103216050-103216069 MsG0680035359.01.T01:intron 60.0%
!! CGCTAGAAGAAGTGCCACGG+GGG + Chr6:103216051-103216070 MsG0680035359.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 103212941 103221002 103212941 ID=MsG0680035359.01;Name=MsG0680035359.01
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Chr6 exon 103214128 103215212 103214128 ID=MsG0680035359.01.T01:exon:11048;Parent=MsG0680035359.01.T01
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Chr6 CDS 103214128 103215212 103214128 ID=MsG0680035359.01.T01:cds;Parent=MsG0680035359.01.T01
Chr6 CDS 103218451 103218799 103218451 ID=MsG0680035359.01.T01:cds;Parent=MsG0680035359.01.T01
Chr6 CDS 103219903 103221002 103219903 ID=MsG0680035359.01.T01:cds;Parent=MsG0680035359.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035359.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680035359.01.T01

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