AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039960.01

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MsG0780039960.01.T01 AT5G10290 33.402 485 255 16 363 795 98 566 1.88e-61 219
MsG0780039960.01.T01 AT4G28650 28.517 782 467 25 73 793 226 976 8.46e-61 224
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MsG0780039960.01.T01 AT5G65240 33.190 464 264 16 361 795 114 560 1.63e-60 218
MsG0780039960.01.T01 AT4G23240 40.260 308 165 8 509 806 15 313 1.98e-60 209
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MsG0780039960.01.T01 AT1G51850 33.115 459 260 16 361 790 404 844 1.58e-56 210
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MsG0780039960.01.T01 AT1G12460 26.966 890 522 34 8 794 10 874 3.18e-56 209
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MsG0780039960.01.T01 AT1G34210 39.057 297 168 8 507 795 290 581 2.17e-53 197
MsG0780039960.01.T01 AT3G16030 39.423 312 174 8 507 809 512 817 2.82e-53 200
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MsG0780039960.01.T01 AT1G07560 32.171 516 284 21 309 794 358 837 3.08e-53 200
MsG0780039960.01.T01 AT3G16030 39.423 312 174 8 507 809 389 694 3.24e-53 198
MsG0780039960.01.T01 AT1G61500 41.060 302 157 11 515 806 489 779 3.55e-53 199
MsG0780039960.01.T01 AT1G61500 41.060 302 157 11 515 806 484 774 3.75e-53 199
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MsG0780039960.01.T01 AT1G65800 34.054 370 221 8 454 806 448 811 9.23e-53 198
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MsG0780039960.01.T01 AT1G61360 35.734 361 203 14 462 808 359 704 4.21e-50 189
MsG0780039960.01.T01 AT3G09010 37.966 295 168 10 507 794 31 317 4.35e-50 182
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MsG0780039960.01.T01 AT4G03230 36.127 346 190 11 486 814 552 883 4.81e-50 191
MsG0780039960.01.T01 AT1G70520 37.618 319 182 10 510 817 313 625 4.89e-50 187
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MsG0780039960.01.T01 AT4G03230 36.391 338 200 9 486 814 652 983 4.93e-50 191
MsG0780039960.01.T01 AT1G12460 29.600 625 372 23 218 794 131 735 5.19e-50 189
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MsG0780039960.01.T01 AT1G08590 27.040 821 438 31 64 793 250 1000 5.45e-50 191
MsG0780039960.01.T01 AT1G08590 25.806 403 260 13 48 424 65 454 2.21e-21 100
MsG0780039960.01.T01 AT1G08590 24.648 284 168 8 57 295 267 549 4.53e-12 70.5
MsG0780039960.01.T01 AT4G04570 46.117 206 104 4 521 724 185 385 5.61e-50 182
MsG0780039960.01.T01 AT1G61360 35.734 361 203 14 462 808 440 785 6.24e-50 189
MsG0780039960.01.T01 AT1G61400 39.130 299 167 9 515 806 493 783 6.98e-50 189
MsG0780039960.01.T01 AT4G04500 34.146 369 206 12 459 813 297 642 8.05e-50 187
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MsG0780039960.01.T01 AT1G61400 38.562 306 167 10 515 806 493 791 1.10e-49 189
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MsG0780039960.01.T01 AT2G18470 39.000 300 156 9 510 795 272 558 1.25e-49 186
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MsG0780039960.01.T01 AT4G01330 35.811 296 174 9 508 795 148 435 2.28e-46 172
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MsG0780039960.01.T01 AT1G31420 30.769 130 85 3 49 175 62 189 2.79e-11 67.8
MsG0780039960.01.T01 AT3G45410 34.056 323 180 12 508 816 323 626 3.01e-46 177
MsG0780039960.01.T01 AT5G15080 32.626 377 207 12 499 856 119 467 3.60e-46 173
MsG0780039960.01.T01 AT1G52290 33.791 364 210 14 451 795 68 419 3.62e-46 173
MsG0780039960.01.T01 AT1G11410 40.753 292 158 7 521 806 409 691 3.97e-46 177
MsG0780039960.01.T01 AT4G29180 27.273 583 340 16 239 794 326 851 4.01e-46 179
MsG0780039960.01.T01 AT2G24230 25.236 848 477 31 48 794 54 845 4.42e-46 178
MsG0780039960.01.T01 AT3G18810 38.926 298 155 11 512 795 327 611 4.53e-46 177
MsG0780039960.01.T01 AT3G28450 30.316 475 279 15 361 802 129 584 5.11e-46 175
MsG0780039960.01.T01 AT4G01330 35.811 296 174 9 508 795 148 435 5.66e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT5G02800 35.202 321 187 11 508 814 59 372 5.69e-46 169
MsG0780039960.01.T01 AT4G01330 35.811 296 174 9 508 795 148 435 5.82e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT3G58690 37.319 276 160 8 526 793 93 363 5.99e-46 170
MsG0780039960.01.T01 AT1G78530 36.691 278 160 8 523 794 78 345 6.17e-46 169
MsG0780039960.01.T01 AT1G11410 38.961 308 173 7 521 822 500 798 6.26e-46 177
MsG0780039960.01.T01 AT4G02420 31.269 323 201 10 481 795 314 623 6.37e-46 176
MsG0780039960.01.T01 AT2G42960 37.333 300 154 11 519 802 180 461 6.89e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT2G42960 37.333 300 154 11 519 802 180 461 6.89e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT2G42960 37.333 300 154 11 519 802 180 461 6.89e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT2G42960 37.333 300 154 11 519 802 180 461 6.89e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT5G59270 35.570 298 170 11 508 795 338 623 7.42e-46 176
MsG0780039960.01.T01 AT5G59270 35.570 298 170 11 508 795 335 620 7.52e-46 176
MsG0780039960.01.T01 AT1G11410 38.961 308 173 7 521 822 531 829 8.82e-46 177
MsG0780039960.01.T01 AT3G59110 35.238 315 170 11 519 817 187 483 9.01e-46 172
MsG0780039960.01.T01 AT1G11410 40.753 292 158 7 521 806 524 806 9.13e-46 177
MsG0780039960.01.T01 AT1G23540 36.842 304 168 10 509 799 358 650 1.03e-45 176
MsG0780039960.01.T01 AT5G59270 35.570 298 170 11 508 795 354 639 1.16e-45 175
MsG0780039960.01.T01 AT5G03140 34.416 308 181 10 508 804 360 657 1.20e-45 176
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MsG0780039960.01.T01 AT1G68690 36.278 317 161 12 499 794 354 650 1.24e-45 175
MsG0780039960.01.T01 AT1G68690 36.278 317 161 12 499 794 354 650 1.24e-45 175
MsG0780039960.01.T01 AT1G69990 29.661 472 271 14 361 794 116 564 1.42e-45 173
MsG0780039960.01.T01 AT4G13190 35.235 298 180 8 504 793 53 345 1.43e-45 169
MsG0780039960.01.T01 AT1G49730 36.972 284 167 7 448 726 255 531 1.50e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT1G11050 35.144 313 176 9 514 806 287 592 1.62e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT4G28350 34.535 333 182 13 481 797 312 624 1.65e-45 175
MsG0780039960.01.T01 AT1G52290 35.669 314 177 11 451 751 68 369 1.79e-45 168
MsG0780039960.01.T01 AT1G69270 29.399 449 278 16 367 794 103 533 1.79e-45 172
MsG0780039960.01.T01 AT1G61430 45.540 213 107 5 515 723 459 666 2.42e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT1G68690 37.542 301 147 12 510 789 365 645 2.54e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT1G61430 45.540 213 107 5 515 723 482 689 2.68e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT1G61430 45.540 213 107 5 515 723 482 689 2.68e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT2G32800 35.759 316 171 11 510 795 105 418 2.72e-45 176
MsG0780039960.01.T01 AT2G32800 25.806 310 212 9 499 795 510 814 1.16e-25 114
MsG0780039960.01.T01 AT5G65600 32.474 388 225 14 442 809 276 646 2.85e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT5G65530 35.690 297 170 9 508 795 130 414 2.97e-45 169
MsG0780039960.01.T01 AT4G29180 27.444 583 337 17 239 794 326 849 3.03e-45 176
MsG0780039960.01.T01 AT1G51910 30.556 504 300 18 321 799 367 845 3.07e-45 176
MsG0780039960.01.T01 AT4G29050 35.294 323 187 11 482 795 309 618 3.21e-45 174
MsG0780039960.01.T01 AT1G70530 37.179 312 167 13 510 808 311 606 3.29e-45 173
MsG0780039960.01.T01 AT3G13690 36.246 309 162 14 506 797 395 685 3.94e-45 174

Find 176 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 274 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTGACCTTGGATGGAAATT+TGG 0.061722 7:-71122466 None:intergenic
TTCTAATGCTCTTTGTAATT+TGG 0.127309 7:+71124342 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTGGACCACAATCAATTTAA+AGG 0.150171 7:+71122048 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGCCCTAAAATCTCTGATTT+TGG 0.163039 7:+71124493 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATATAAGAGGCATCCAATTT+TGG 0.209714 7:+71123928 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGGAATAGTGAACGGGTTTA+AGG 0.212086 7:+71121837 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTTCATCCAAAAGAATGTTT+TGG 0.238381 7:-71124465 None:intergenic
TGTGAACATCGTCTCACTTT+TGG 0.244142 7:+71124234 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAGGACCATCTAAAACAATT+TGG 0.250341 7:+71122523 MsG0780039960.01.T01:CDS
AAAACCCCAAAACATTCTTT+TGG 0.267268 7:+71124459 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTCATCGATGGTCTGTCTAA+TGG 0.285601 7:-71124856 None:intergenic
TTGACCTTGGATGGAAATTT+GGG 0.290508 7:-71122465 None:intergenic
CTTCACTTTAATAGCTTAGA+AGG 0.304650 7:+71121976 MsG0780039960.01.T01:CDS
GCATATCCATATTGTTTGAT+TGG 0.329065 7:-71124034 None:intergenic
GGTAAAGTTGTAAGACTCTT+TGG 0.329813 7:-71122393 None:intergenic
CTTTAATAGCTTAGAAGGTT+TGG 0.330627 7:+71121981 MsG0780039960.01.T01:CDS
TAGCTTGACCAACATCTCTT+TGG 0.334126 7:+71122029 MsG0780039960.01.T01:CDS
GCATTGACCCCAACACCTTC+TGG 0.334935 7:+71121295 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAATTTGACATGTTAGGAAT+TGG 0.348942 7:-71121931 None:intergenic
TCTAAAACAATTTGGATTGT+AGG 0.350539 7:+71122531 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTTTCTCACAACAACTTAAG+TGG 0.354679 7:+71121757 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGTTCCCCTTGTGCCAAGTA+TGG 0.356141 7:-71124554 None:intergenic
ACCTTGTGATCCCCAGGTTA+TGG 0.361934 7:+71122143 MsG0780039960.01.T01:CDS
AAATTAGGTCAAGGAGGATA+TGG 0.363645 7:+71124091 MsG0780039960.01.T01:CDS
GGAGAATATAGAAAAGGCTT+TGG 0.368902 7:-71124928 None:intergenic
CATACAAAGTTATAATTTGT+CGG 0.387359 7:+71124009 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGGCCACAACTTGGTTAGAT+TGG 0.388795 7:-71121363 None:intergenic
TAGTTATTTGCAAATATAAG+AGG 0.391714 7:+71123915 MsG0780039960.01.T01:CDS
AACTCATTTCGAGATAAATT+AGG 0.394904 7:+71124076 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTCCGAGGAAGACGCTGATA+TGG 0.395079 7:+71124789 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTGGAATCAATTAAATCCTT+AGG 0.398361 7:-71121640 None:intergenic
ATGTTTGTACTGGCGGGGAC+GGG 0.398968 7:+71122226 MsG0780039960.01.T01:CDS
TAGACCAGCCAGAAGGTGTT+GGG 0.399597 7:-71121303 None:intergenic
GAAGTATTTAGCCGTATGTT+TGG 0.400167 7:+71124595 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGGAAATTTGGGAATTTGTC+CGG 0.402807 7:-71122454 None:intergenic
CTAAGTAATAACTTTGTGAA+TGG 0.403147 7:+71124757 MsG0780039960.01.T01:CDS
TCATCGATGGTCTGTCTAAT+GGG 0.406561 7:-71124855 None:intergenic
GGGTCAATGCTTTCAAAAGT+TGG 0.418815 7:-71121282 None:intergenic
CTGAAATGTACTTTCCAGAT+TGG 0.420852 7:+71124716 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGTTTGTACTGGCGGGGACG+GGG 0.422804 7:+71122227 MsG0780039960.01.T01:CDS
ACAACACTCACTATTGCAAC+TGG 0.425504 7:+71121326 MsG0780039960.01.T01:CDS
GGGGCATTCTTGTTTAGTGT+TGG 0.425797 7:+71123875 MsG0780039960.01.T01:intron
GGAATAGTGAACGGGTTTAA+GGG 0.427193 7:+71121838 MsG0780039960.01.T01:CDS
GACAAGTTCATCTTTAAAAG+TGG 0.427634 7:+71124316 MsG0780039960.01.T01:CDS
TCGGTGCCAATCAAACAATA+TGG 0.429848 7:+71124028 MsG0780039960.01.T01:CDS
CAGAATGGTTCCATAAAATC+AGG 0.432964 7:+71125024 MsG0780039960.01.T01:CDS
AACATACGGCTAAATACTTC+AGG 0.435028 7:-71124592 None:intergenic
GATGTTTGTACTGGCGGGGA+CGG 0.437602 7:+71122225 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTTTGCTTTCAATTCCTACC+AGG 0.438473 7:+71121565 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGATAACTATGGTTAGTCTA+TGG 0.439122 7:+71124818 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGATCATTATAAATCCAATC+TGG 0.442797 7:-71124730 None:intergenic
ACACAATACTATCCTTCCTT+TGG 0.444319 7:-71124531 None:intergenic
TAAAGTAATAAACGAAACTA+AGG 0.444321 7:+71124159 MsG0780039960.01.T01:CDS
CGAGATTCAAGTTATTACTA+AGG 0.444445 7:-71121603 None:intergenic
AGGTTGAGAGTTTGCATCCC+TGG 0.444687 7:-71121583 None:intergenic
TTTCAAGCACAGCCATAACC+TGG 0.448539 7:-71122155 None:intergenic
TATGGTAAGAAAGATAACTA+TGG 0.450038 7:+71124807 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATTTATGAATTCATGCCAAA+TGG 0.451744 7:+71124286 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATGCTCTTTGTAATTTGGAC+TGG 0.452039 7:+71124347 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTTAACAACAACGCGTTCAC+TGG 0.452746 7:+71121907 MsG0780039960.01.T01:CDS
TCCATAAAATCAGGTAAGTT+CGG 0.454985 7:+71125033 MsG0780039960.01.T01:CDS
TAAACCCGTTCACTATTCCT+TGG 0.455203 7:-71121834 None:intergenic
ACGTTGTACCGAATTGCAAT+AGG 0.459281 7:+71124373 MsG0780039960.01.T01:CDS
TATGTTTCATAGAGGTGTTA+AGG 0.462454 7:+71122080 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGCATCAAGGATGTACTTCA+AGG 0.462794 7:+71124419 MsG0780039960.01.T01:CDS
TAACTTGAATCTCGTGCAAT+GGG 0.463273 7:+71121612 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGAGTGGAATTTGACATGTT+AGG 0.464371 7:-71121937 None:intergenic
CCCTAGGAAAATCTGTTGTA+AGG 0.470251 7:+71121794 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTTGGCACAAGGGGAACTAT+AGG 0.474201 7:+71124559 MsG0780039960.01.T01:CDS
CTTGCTAACAATAATTTGAC+CGG 0.474545 7:+71122363 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGAAAAGGCTTTGGAGGGTA+TGG 0.474926 7:-71124919 None:intergenic
GTTTCTAATAATAATCTATC+CGG 0.474963 7:+71122435 MsG0780039960.01.T01:CDS
TATTTGTAGCTTCGAGATCA+AGG 0.476175 7:-71121675 None:intergenic
GCATATGAACTTTGTAATGA+TGG 0.477576 7:-71124958 None:intergenic
ATCAAGGGTATGCATAAACT+TGG 0.477891 7:-71121659 None:intergenic
CTTGTCAAATTAGAAAATGC+TGG 0.479625 7:-71122324 None:intergenic
ACCGCCACTTGACGACCATC+AGG 0.479813 7:-71124136 None:intergenic
AAGTCTGATGTATATAGTTA+TGG 0.480310 7:+71124631 MsG0780039960.01.T01:CDS
CGTGCAATGGGTATTTCCTA+AGG 0.481725 7:+71121624 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAATATAGAAAAGGCTTTGG+AGG 0.482486 7:-71124925 None:intergenic
GATAGTATTGTGTCCATACT+TGG 0.491895 7:+71124541 MsG0780039960.01.T01:CDS
AATAGTGACAACTAAGAGAA+TGG 0.492069 7:-71121224 None:intergenic
AAGACTCTTTGGTAGCGAAC+CGG 0.494424 7:-71122382 None:intergenic
GAGCTATGCCTATTGCAATT+CGG 0.503100 7:-71124381 None:intergenic
TACCATATCAGCGTCTTCCT+CGG 0.508347 7:-71124791 None:intergenic
TGCCATCAGACATGTTCGAT+TGG 0.509813 7:+71121710 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGACCCCAACACCTTCTGGC+TGG 0.509887 7:+71121299 MsG0780039960.01.T01:CDS
AAGGTCAAGTTGATTACGAC+TGG 0.510708 7:+71122480 MsG0780039960.01.T01:CDS
TCAATAACATTACTGCAGAA+TGG 0.512186 7:+71125009 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATAGAGGTGTTAAGGCAACT+TGG 0.516126 7:+71122088 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGAGCTTGATGGGAGCTTGA+TGG 0.516231 7:-71121383 None:intergenic
TCTATTACTTTACTCATCGA+TGG 0.517299 7:-71124868 None:intergenic
GTAATCAACTTGACCTTGGA+TGG 0.521360 7:-71122474 None:intergenic
ACGACGAGAGGAGACATAGA+AGG 0.522283 7:-71121493 None:intergenic
GTATTTAGCCGTATGTTTGG+TGG 0.523839 7:+71124598 MsG0780039960.01.T01:CDS
AATTCCCAAATTTCCATCCA+AGG 0.525495 7:+71122461 MsG0780039960.01.T01:CDS
CACTATTAATGCACAAGAAG+AGG 0.529719 7:+71121240 MsG0780039960.01.T01:CDS
GGAGCTTGATGGCCACAACT+TGG 0.533280 7:-71121372 None:intergenic
CTAGAGAGAGAGAATAATGA+AGG 0.535848 7:-71122009 None:intergenic
TCACTATTCCTTGGTTGTTG+AGG 0.536325 7:-71121825 None:intergenic
ACAACCAAGGAATAGTGAAC+GGG 0.539262 7:+71121830 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGTTGGACCTTGTGATCCCC+AGG 0.540009 7:+71122137 MsG0780039960.01.T01:CDS
AACTTGTCTAGTGAACCATT+TGG 0.540914 7:-71124301 None:intergenic
GGAACACTTCCGCTGTCCCT+AGG 0.543191 7:+71121778 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTAACACCTCTATGAAACAT+AGG 0.546982 7:-71122078 None:intergenic
CTCCACAACAACTCACTCAC+CGG 0.547147 7:+71121463 MsG0780039960.01.T01:CDS
GGAATGATGTTTGTACTGGC+GGG 0.548654 7:+71122220 MsG0780039960.01.T01:CDS
TAGAGGTGTTAAGGCAACTT+GGG 0.551977 7:+71122089 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGTCGTAATCAACTTGACCT+TGG 0.553039 7:-71122478 None:intergenic
ACTCACTATTGCAACTGGAA+TGG 0.554205 7:+71121331 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTAGACCAGCCAGAAGGTGT+TGG 0.554256 7:-71121304 None:intergenic
GAGGGGAATGATGTTTGTAC+TGG 0.555930 7:+71122216 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATAACTTGAATCTCGTGCAA+TGG 0.559279 7:+71121611 MsG0780039960.01.T01:CDS
TACCAGTGAGTGAGCTTGAT+GGG 0.561778 7:-71121393 None:intergenic
CTCCCATCAAGCTCACTCAC+TGG 0.562420 7:+71121391 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTTCGAGATAAATTAGGTCA+AGG 0.564859 7:+71124082 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATAAACGAAACTAAGGGAGA+TGG 0.565777 7:+71124166 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTCAAGCACAGCCATAACCT+GGG 0.565830 7:-71122154 None:intergenic
ACCTGATGGTCGTCAAGTGG+CGG 0.568779 7:+71124135 MsG0780039960.01.T01:CDS
GTACCAGTGAGTGAGCTTGA+TGG 0.570562 7:-71121394 None:intergenic
AGCTCAAATATGCCAAAGGA+AGG 0.572919 7:+71124519 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATTTGTAGCTTCGAGATCAA+GGG 0.574924 7:-71121674 None:intergenic
TTGCCAATCTAACCAAGTTG+TGG 0.575156 7:+71121360 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTTGCTTTCAATTCCTACCA+GGG 0.576843 7:+71121566 MsG0780039960.01.T01:CDS
TACCGGTGAGTGAGTTGTTG+TGG 0.579428 7:-71121465 None:intergenic
TGAGAGTTTGCATCCCTGGT+AGG 0.582371 7:-71121579 None:intergenic
GAGAAACTCCACCAAACATA+CGG 0.587061 7:-71124606 None:intergenic
GGGAATGATGTTTGTACTGG+CGG 0.588048 7:+71122219 MsG0780039960.01.T01:CDS
TAATGCACAAGAAGAGGCAG+AGG 0.588088 7:+71121246 MsG0780039960.01.T01:CDS
TCGGTCCTTTAAATTGATTG+TGG 0.589217 7:-71122053 None:intergenic
CCGATACCTATGTTTCATAG+AGG 0.590996 7:+71122072 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTGAAAGCAAAGATCTGCGA+TGG 0.591145 7:-71121554 None:intergenic
TTGCAAATCAAACAAATGAG+TGG 0.592239 7:-71121953 None:intergenic
GCCATAACCTGGGGATCACA+AGG 0.592265 7:-71122144 None:intergenic
AATATAGAAAAGGCTTTGGA+GGG 0.593673 7:-71124924 None:intergenic
AACCAATCGAACATGTCTGA+TGG 0.594715 7:-71121712 None:intergenic
CATTACATGTCAAAGAGGGA+AGG 0.596873 7:+71122254 MsG0780039960.01.T01:CDS
GACTAGCTCAAATATGCCAA+AGG 0.597520 7:+71124515 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAGAGAGAGAATAATGAAGG+TGG 0.598843 7:-71122006 None:intergenic
CCTCTATGAAACATAGGTAT+CGG 0.600623 7:-71122072 None:intergenic
AACAACCAAGGAATAGTGAA+CGG 0.602869 7:+71121829 MsG0780039960.01.T01:CDS
GTTATTGTGACCAAGGTGCA+CGG 0.607644 7:-71121524 None:intergenic
TTTAGCGGTGAACAATTAAG+GGG 0.610465 7:+71122291 MsG0780039960.01.T01:CDS
ATTGTGGTCCAAAGAGATGT+TGG 0.614893 7:-71122037 None:intergenic
GTGTCCATACTTGGCACAAG+GGG 0.615986 7:+71124550 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTGTGTCCATACTTGGCACA+AGG 0.619083 7:+71124548 MsG0780039960.01.T01:CDS
AAAGCAAAGATCTGCGATGG+AGG 0.619249 7:-71121551 None:intergenic
AGACATAGAAGGTAAAGTAC+CGG 0.620151 7:-71121482 None:intergenic
ATCTATTGACCACAATGTGG+AGG 0.620486 7:+71123982 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAATGATGTTTGTACTGGCG+GGG 0.621452 7:+71122221 MsG0780039960.01.T01:CDS
GGACTTGAATACTTGCATCA+AGG 0.621981 7:+71124406 MsG0780039960.01.T01:CDS
ACATCAAGAAACTGAAGTTG+AGG 0.622679 7:-71122414 None:intergenic
GTGCTCGAAACCGTGCACCT+TGG 0.623826 7:+71121514 MsG0780039960.01.T01:CDS
AAAGTAATAAACGAAACTAA+GGG 0.625241 7:+71124160 MsG0780039960.01.T01:CDS
GTATGAAAGCCTCCACATTG+TGG 0.632519 7:-71123991 None:intergenic
GTTGTTGTGGAGATCAATGT+AGG 0.635630 7:-71121452 None:intergenic
TACAAAGCAAGTTTACCTGA+TGG 0.635638 7:+71124121 MsG0780039960.01.T01:CDS
GGAAGAAAGAACTATGACAC+AGG 0.637774 7:+71124679 MsG0780039960.01.T01:CDS
TGTGTCCATACTTGGCACAA+GGG 0.641713 7:+71124549 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGACCAGCCAGAAGGTGTTG+GGG 0.643099 7:-71121302 None:intergenic
GCATTCATTACATGTCAAAG+AGG 0.645223 7:+71122249 MsG0780039960.01.T01:CDS
TTTACCTGATGGTCGTCAAG+TGG 0.646936 7:+71124132 MsG0780039960.01.T01:CDS
AAAATCTATTGACCACAATG+TGG 0.648198 7:+71123979 MsG0780039960.01.T01:CDS
CATTCATTACATGTCAAAGA+GGG 0.655454 7:+71122250 MsG0780039960.01.T01:CDS
ACGGTTTCGAGCACGACGAG+AGG 0.657427 7:-71121505 None:intergenic
GGGTATGGCACTGAATCAAG+TGG 0.661306 7:-71124904 None:intergenic
AAAGTAATAGAAATGCTACA+AGG 0.661359 7:+71124880 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAAAGAACTATGACACAGGA+GGG 0.661898 7:+71124683 MsG0780039960.01.T01:CDS
AGAAAGAACTATGACACAGG+AGG 0.662638 7:+71124682 MsG0780039960.01.T01:CDS
CGAGATAAATTAGGTCAAGG+AGG 0.670664 7:+71124085 MsG0780039960.01.T01:CDS
TATTTACGCCTCAACAACCA+AGG 0.674675 7:+71121817 MsG0780039960.01.T01:CDS
GTGTTGTTAGACCAGCCAGA+AGG 0.685742 7:-71121310 None:intergenic
AGGTGAAGTTATTGTGACCA+AGG 0.709043 7:-71121531 None:intergenic
TCAAGCACAGCCATAACCTG+GGG 0.711225 7:-71122153 None:intergenic
ATTGCAATAGGCATAGCTCG+AGG 0.734381 7:+71124385 MsG0780039960.01.T01:CDS
GAATGGTTTAGCAAACTCCG+AGG 0.740859 7:+71124774 MsG0780039960.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AACAATATTGAAATATATAA+TGG - Chr7:71122574-71122593 None:intergenic 10.0%
!! ACAATATTGAAATATATAAT+GGG - Chr7:71122573-71122592 None:intergenic 10.0%
!! TTTCTATTTAAATTCAATTA+TGG + Chr7:71123673-71123692 MsG0780039960.01.T01:intron 10.0%
!! AAAAAAAAAAAAAAGAGTTG+AGG + Chr7:71123117-71123136 MsG0780039960.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAAAAAAAAAAGAGTTGA+GGG + Chr7:71123118-71123137 MsG0780039960.01.T01:intron 15.0%
!!! AAATTAGCTTGTTAATTATT+AGG - Chr7:71122718-71122737 None:intergenic 15.0%
!!! ATGTTAATTTTAGAAATGAT+TGG + Chr7:71124655-71124674 MsG0780039960.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTATTGTTTTTTTCCTT+GGG - Chr7:71123094-71123113 None:intergenic 15.0%
!! AAAACATCTCTTAAAAACAA+AGG + Chr7:71123176-71123195 MsG0780039960.01.T01:intron 20.0%
!! AAAATTCGACAACAATTAAA+TGG - Chr7:71122869-71122888 None:intergenic 20.0%
!! AAAGTAATAAACGAAACTAA+GGG + Chr7:71124160-71124179 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAAACATAAACTGACAAT+AGG - Chr7:71122925-71122944 None:intergenic 20.0%
!! GTTTCTAATAATAATCTATC+CGG + Chr7:71122435-71122454 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAGTAATAAACGAAACTA+AGG + Chr7:71124159-71124178 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!! TAGTTATTTGCAAATATAAG+AGG + Chr7:71123915-71123934 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTAATATGAAGTCTAAAAT+TGG - Chr7:71123350-71123369 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTCTAGAAGAAGAAAAAA+GGG - Chr7:71123737-71123756 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTAGGAGAATATAGAAA+AGG - Chr7:71124937-71124956 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTTGAATATGCTTACAA+AGG - Chr7:71123034-71123053 None:intergenic 20.0%
!!! CATACAAAGTTATAATTTGT+CGG + Chr7:71124009-71124028 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTTTTATTGTTTTTTTCCT+TGG - Chr7:71123095-71123114 None:intergenic 20.0%
!!! TTAATTTTAGAAATGATTGG+TGG + Chr7:71124658-71124677 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCTAAAACATAAATTGTCT+TGG - Chr7:71123518-71123537 None:intergenic 20.0%
!!! TTGAAATTTTCACAACTTTT+GGG + Chr7:71122172-71122191 MsG0780039960.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTTCTTCTTCTAGAAAT+CGG + Chr7:71123737-71123756 MsG0780039960.01.T01:intron 20.0%
! AAAGTAATAGAAATGCTACA+AGG + Chr7:71124880-71124899 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTAAAGAGTCAGACATA+TGG - Chr7:71123589-71123608 None:intergenic 25.0%
! AACTCATTTCGAGATAAATT+AGG + Chr7:71124076-71124095 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTCTGATGTATATAGTTA+TGG + Chr7:71124631-71124650 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! ACATATATGAAGTTTCTCTT+TGG - Chr7:71123285-71123304 None:intergenic 25.0%
! AGATCATTATAAATCCAATC+TGG - Chr7:71124733-71124752 None:intergenic 25.0%
! ATCAAAAGAGAGAGATATAA+GGG + Chr7:71123059-71123078 MsG0780039960.01.T01:intron 25.0%
! ATTTATGAATTCATGCCAAA+TGG + Chr7:71124286-71124305 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! CTAAGTAATAACTTTGTGAA+TGG + Chr7:71124757-71124776 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! GGAAATATTCATATGTACAA+AGG - Chr7:71123614-71123633 None:intergenic 25.0%
! TAATCTTATTCACAGAAGAA+TGG - Chr7:71122811-71122830 None:intergenic 25.0%
! TATCAAAAGAGAGAGATATA+AGG + Chr7:71123058-71123077 MsG0780039960.01.T01:intron 25.0%
! TATGGTAAGAAAGATAACTA+TGG + Chr7:71124807-71124826 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! TGTAATGTTGCTCATTAATT+CGG + Chr7:71122604-71122623 MsG0780039960.01.T01:intron 25.0%
! TTCTAATGCTCTTTGTAATT+TGG + Chr7:71124342-71124361 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGAATCAATTAAATCCTT+AGG - Chr7:71121643-71121662 None:intergenic 25.0%
!! CTTGAAATTTTCACAACTTT+TGG + Chr7:71122171-71122190 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTGATTTTTCATCAATTGA+GGG + Chr7:71122198-71122217 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
!! GATTTCTAGAAGAAGAAAAA+AGG - Chr7:71123738-71123757 None:intergenic 25.0%
!! TCTAAAACAATTTGGATTGT+AGG + Chr7:71122531-71122550 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTTGATTTTTCATCAATTG+AGG + Chr7:71122197-71122216 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCAATTATGGAGCAATTTT+CGG + Chr7:71123685-71123704 MsG0780039960.01.T01:intron 25.0%
!! TTCATCCAAAAGAATGTTTT+GGG - Chr7:71124467-71124486 None:intergenic 25.0%
!! TTGATTTTTCATCAATTGAG+GGG + Chr7:71122199-71122218 MsG0780039960.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAAAAGGGCCTTTAAAATT+TGG - Chr7:71123723-71123742 None:intergenic 25.0%
!!! ACAATCCAAATTGTTTTAGA+TGG - Chr7:71122531-71122550 None:intergenic 25.0%
!!! GTTTTTAAGAGATGTTTTGT+CGG - Chr7:71123174-71123193 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTAAGAGATGTTTTGTC+GGG - Chr7:71123173-71123192 None:intergenic 25.0%
AAAATCTATTGACCACAATG+TGG + Chr7:71123979-71123998 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
AAATACAATACCCGATACAA+TGG - Chr7:71123320-71123339 None:intergenic 30.0%
AATAGTGACAACTAAGAGAA+TGG - Chr7:71121227-71121246 None:intergenic 30.0%
AGAAAAACAGTATGCAAATG+CGG - Chr7:71121739-71121758 None:intergenic 30.0%
ATATGCTTACAAAGGATTTG+TGG - Chr7:71123026-71123045 None:intergenic 30.0%
ATCGAGAATTAAGCAATTCT+AGG + Chr7:71123142-71123161 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
ATTACAAGTACTTTCTGTCT+TGG + Chr7:71123538-71123557 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
CAAAATGATGTTAGAATTGC+TGG + Chr7:71122779-71122798 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
CATTCATTACATGTCAAAGA+GGG + Chr7:71122250-71122269 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
CTACTTAAAATTGGATGTGT+TGG + Chr7:71123472-71123491 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
CTTCACTTTAATAGCTTAGA+AGG + Chr7:71121976-71121995 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
CTTGCTAACAATAATTTGAC+CGG + Chr7:71122363-71122382 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
CTTGTAATATTTGCACTCAT+GGG - Chr7:71123639-71123658 None:intergenic 30.0%
CTTGTCAAATTAGAAAATGC+TGG - Chr7:71122327-71122346 None:intergenic 30.0%
CTTTAATAGCTTAGAAGGTT+TGG + Chr7:71121981-71122000 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
GAATTTGACATGTTAGGAAT+TGG - Chr7:71121934-71121953 None:intergenic 30.0%
GCATATCCATATTGTTTGAT+TGG - Chr7:71124037-71124056 None:intergenic 30.0%
GCATATGAACTTTGTAATGA+TGG - Chr7:71124961-71124980 None:intergenic 30.0%
TATGGTTTGAGAAAATTCGT+CGG - Chr7:71123213-71123232 None:intergenic 30.0%
TCAAAAGAGAGAGATATAAG+GGG + Chr7:71123060-71123079 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
TCAATAACATTACTGCAGAA+TGG + Chr7:71125009-71125028 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
TCCATAAAATCAGGTAAGTT+CGG + Chr7:71125033-71125052 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
TCTATTACTTTACTCATCGA+TGG - Chr7:71124871-71124890 None:intergenic 30.0%
TTAACACCTCTATGAAACAT+AGG - Chr7:71122081-71122100 None:intergenic 30.0%
TTGCAAATCAAACAAATGAG+TGG - Chr7:71121956-71121975 None:intergenic 30.0%
TTGGACCACAATCAATTTAA+AGG + Chr7:71122048-71122067 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
TTTCGAGATAAATTAGGTCA+AGG + Chr7:71124082-71124101 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
! AAAACCCCAAAACATTCTTT+TGG + Chr7:71124459-71124478 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTTTCTCTAACAAATTGC+TGG - Chr7:71124989-71125008 None:intergenic 30.0%
! AGTCCAAAATCAGAGATTTT+AGG - Chr7:71124499-71124518 None:intergenic 30.0%
! ATCCAACTCTTTTCCAAAAT+TGG - Chr7:71123944-71123963 None:intergenic 30.0%
! CGAGATTCAAGTTATTACTA+AGG - Chr7:71121606-71121625 None:intergenic 30.0%
! CTTCATCCAAAAGAATGTTT+TGG - Chr7:71124468-71124487 None:intergenic 30.0%
! CTTTGTAATGATGGCATTTT+AGG - Chr7:71124952-71124971 None:intergenic 30.0%
! GACAAGTTCATCTTTAAAAG+TGG + Chr7:71124316-71124335 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
! GACTTCACTCCAAATTTTAA+AGG + Chr7:71123711-71123730 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
! GTCCAAAATCAGAGATTTTA+GGG - Chr7:71124498-71124517 None:intergenic 30.0%
! TCATCCAAAAGAATGTTTTG+GGG - Chr7:71124466-71124485 None:intergenic 30.0%
! TTTTAGCGGTGAACAATTAA+GGG + Chr7:71122290-71122309 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGTGTTCTCATATTGCA+GGG + Chr7:71123855-71123874 MsG0780039960.01.T01:intron 30.0%
!! AATATAGAAAAGGCTTTGGA+GGG - Chr7:71124927-71124946 None:intergenic 30.0%
!! AGATAACTATGGTTAGTCTA+TGG + Chr7:71124818-71124837 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCCAATTTTGGAAAAGAGT+TGG + Chr7:71123939-71123958 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTAGCGGTGAACAATTA+AGG + Chr7:71122289-71122308 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
!! TATGTTTCATAGAGGTGTTA+AGG + Chr7:71122080-71122099 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTAAGAGATGTTTTGTCG+GGG - Chr7:71123172-71123191 None:intergenic 30.0%
!!! ATATAAGAGGCATCCAATTT+TGG + Chr7:71123928-71123947 MsG0780039960.01.T01:CDS 30.0%
AAATTAGGTCAAGGAGGATA+TGG + Chr7:71124091-71124110 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
AACAACCAAGGAATAGTGAA+CGG + Chr7:71121829-71121848 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
AACATACGGCTAAATACTTC+AGG - Chr7:71124595-71124614 None:intergenic 35.0%
AACTTGTCTAGTGAACCATT+TGG - Chr7:71124304-71124323 None:intergenic 35.0%
AATTCCCAAATTTCCATCCA+AGG + Chr7:71122461-71122480 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
ACACAATACTATCCTTCCTT+TGG - Chr7:71124534-71124553 None:intergenic 35.0%
ACATCAAGAAACTGAAGTTG+AGG - Chr7:71122417-71122436 None:intergenic 35.0%
AGACATAGAAGGTAAAGTAC+CGG - Chr7:71121485-71121504 None:intergenic 35.0%
AGTGTCAATAGACATCAACT+AGG + Chr7:71122985-71123004 MsG0780039960.01.T01:intron 35.0%
ATAAACGAAACTAAGGGAGA+TGG + Chr7:71124166-71124185 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
ATAACTTGAATCTCGTGCAA+TGG + Chr7:71121611-71121630 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTCTTTGTAATTTGGAC+TGG + Chr7:71124347-71124366 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGTAGCTTCGAGATCAA+GGG - Chr7:71121677-71121696 None:intergenic 35.0%
CAAAAGAGAGAGATATAAGG+GGG + Chr7:71123061-71123080 MsG0780039960.01.T01:intron 35.0%
CACTATTAATGCACAAGAAG+AGG + Chr7:71121240-71121259 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
CAGAATGGTTCCATAAAATC+AGG + Chr7:71125024-71125043 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
CCTCTATGAAACATAGGTAT+CGG - Chr7:71122075-71122094 None:intergenic 35.0%
CTAGAGAGAGAGAATAATGA+AGG - Chr7:71122012-71122031 None:intergenic 35.0%
CTGAAATGTACTTTCCAGAT+TGG + Chr7:71124716-71124735 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCTCACAACAACTTAAG+TGG + Chr7:71121757-71121776 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
GATAGTATTGTGTCCATACT+TGG + Chr7:71124541-71124560 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
GCATTCATTACATGTCAAAG+AGG + Chr7:71122249-71122268 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
GCTTGTAATATTTGCACTCA+TGG - Chr7:71123640-71123659 None:intergenic 35.0%
GGAGAATATAGAAAAGGCTT+TGG - Chr7:71124931-71124950 None:intergenic 35.0%
GGTAAAGTTGTAAGACTCTT+TGG - Chr7:71122396-71122415 None:intergenic 35.0%
TAACTTGAATCTCGTGCAAT+GGG + Chr7:71121612-71121631 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
TAATATTTGCACTCATGGGA+TGG - Chr7:71123635-71123654 None:intergenic 35.0%
TACAAAGCAAGTTTACCTGA+TGG + Chr7:71124121-71124140 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
TACAAAGGATTTGTGGTTCT+AGG - Chr7:71123019-71123038 None:intergenic 35.0%
TATTTGTAGCTTCGAGATCA+AGG - Chr7:71121678-71121697 None:intergenic 35.0%
TCGGTCCTTTAAATTGATTG+TGG - Chr7:71122056-71122075 None:intergenic 35.0%
TGAGTGGAATTTGACATGTT+AGG - Chr7:71121940-71121959 None:intergenic 35.0%
TGGAAATTTGGGAATTTGTC+CGG - Chr7:71122457-71122476 None:intergenic 35.0%
TTCTCAAACCATAACATCCT+TGG + Chr7:71123220-71123239 MsG0780039960.01.T01:intron 35.0%
TTGACCTTGGATGGAAATTT+GGG - Chr7:71122468-71122487 None:intergenic 35.0%
TTTAGCGGTGAACAATTAAG+GGG + Chr7:71122291-71122310 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCTTTCAATTCCTACCA+GGG + Chr7:71121566-71121585 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTGTTCTCATATTGCAG+GGG + Chr7:71123856-71123875 MsG0780039960.01.T01:intron 35.0%
! ACAAAGGATTTGTGGTTCTA+GGG - Chr7:71123018-71123037 None:intergenic 35.0%
! ACCTTACAACAGATTTTCCT+AGG - Chr7:71121798-71121817 None:intergenic 35.0%
! ACTTTCTGTCTTGGTTAGTT+TGG + Chr7:71123547-71123566 MsG0780039960.01.T01:intron 35.0%
! ATCAAGGGTATGCATAAACT+TGG - Chr7:71121662-71121681 None:intergenic 35.0%
! ATGAGTGCATTGAGATTTTG+AGG - Chr7:71121424-71121443 None:intergenic 35.0%
! CCTTACAACAGATTTTCCTA+GGG - Chr7:71121797-71121816 None:intergenic 35.0%
! CTTTTGTGTTCTCATATTGC+AGG + Chr7:71123854-71123873 MsG0780039960.01.T01:intron 35.0%
! GAAGTATTTAGCCGTATGTT+TGG + Chr7:71124595-71124614 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
! GAATATAGAAAAGGCTTTGG+AGG - Chr7:71124928-71124947 None:intergenic 35.0%
! GAGGACCATCTAAAACAATT+TGG + Chr7:71122523-71122542 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
! TGAGTGCATTGAGATTTTGA+GGG - Chr7:71121423-71121442 None:intergenic 35.0%
! TGCCCTAAAATCTCTGATTT+TGG + Chr7:71124493-71124512 MsG0780039960.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGTTTCTCTTTGGAGCATT+AGG - Chr7:71123276-71123295 None:intergenic 35.0%
!! AGTTTCTCTTTGGAGCATTA+GGG - Chr7:71123275-71123294 None:intergenic 35.0%
!!! TGTTTTTTTCCTTGGGAACA+GGG - Chr7:71123087-71123106 None:intergenic 35.0%
!!! TTGTTTTTTTCCTTGGGAAC+AGG - Chr7:71123088-71123107 None:intergenic 35.0%
AACCAATCGAACATGTCTGA+TGG - Chr7:71121715-71121734 None:intergenic 40.0%
ACAACACTCACTATTGCAAC+TGG + Chr7:71121326-71121345 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
ACAACCAAGGAATAGTGAAC+GGG + Chr7:71121830-71121849 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
ACGTTGTACCGAATTGCAAT+AGG + Chr7:71124373-71124392 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
ACTCACTATTGCAACTGGAA+TGG + Chr7:71121331-71121350 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
AGAAAGAACTATGACACAGG+AGG + Chr7:71124682-71124701 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
AGCTCAAATATGCCAAAGGA+AGG + Chr7:71124519-71124538 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
AGGTGAAGTTATTGTGACCA+AGG - Chr7:71121534-71121553 None:intergenic 40.0%
AGTCGTAATCAACTTGACCT+TGG - Chr7:71122481-71122500 None:intergenic 40.0%
ATCTATTGACCACAATGTGG+AGG + Chr7:71123982-71124001 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTGGTCCAAAGAGATGT+TGG - Chr7:71122040-71122059 None:intergenic 40.0%
CATTACATGTCAAAGAGGGA+AGG + Chr7:71122254-71122273 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
CCCTAGGAAAATCTGTTGTA+AGG + Chr7:71121794-71121813 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
CCGATACCTATGTTTCATAG+AGG + Chr7:71122072-71122091 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
CGAGATAAATTAGGTCAAGG+AGG + Chr7:71124085-71124104 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
CTTGACCTTGGATGGAAATT+TGG - Chr7:71122469-71122488 None:intergenic 40.0%
CTTTGCTTTCAATTCCTACC+AGG + Chr7:71121565-71121584 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGAACTATGACACAGGA+GGG + Chr7:71124683-71124702 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAACTCCACCAAACATA+CGG - Chr7:71124609-71124628 None:intergenic 40.0%
GAGAGAGAGAATAATGAAGG+TGG - Chr7:71122009-71122028 None:intergenic 40.0%
GAGCTATGCCTATTGCAATT+CGG - Chr7:71124384-71124403 None:intergenic 40.0%
GGAAGAAAGAACTATGACAC+AGG + Chr7:71124679-71124698 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
GGACTTGAATACTTGCATCA+AGG + Chr7:71124406-71124425 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
GGGTCAATGCTTTCAAAAGT+TGG - Chr7:71121285-71121304 None:intergenic 40.0%
GTAATCAACTTGACCTTGGA+TGG - Chr7:71122477-71122496 None:intergenic 40.0%
GTATTTAGCCGTATGTTTGG+TGG + Chr7:71124598-71124617 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTTGTGGAGATCAATGT+AGG - Chr7:71121455-71121474 None:intergenic 40.0%
TAAACCCGTTCACTATTCCT+TGG - Chr7:71121837-71121856 None:intergenic 40.0%
TAGCTTGACCAACATCTCTT+TGG + Chr7:71122029-71122048 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
TATTGCGACCAAGGATGTTA+TGG - Chr7:71123231-71123250 None:intergenic 40.0%
TATTTACGCCTCAACAACCA+AGG + Chr7:71121817-71121836 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
TCACTATTCCTTGGTTGTTG+AGG - Chr7:71121828-71121847 None:intergenic 40.0%
TCATCGATGGTCTGTCTAAT+GGG - Chr7:71124858-71124877 None:intergenic 40.0%
TGACATGCTCACCATTGTAT+CGG + Chr7:71123306-71123325 MsG0780039960.01.T01:intron 40.0%
TGCATCAAGGATGTACTTCA+AGG + Chr7:71124419-71124438 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAAGCAAAGATCTGCGA+TGG - Chr7:71121557-71121576 None:intergenic 40.0%
TTGCCAATCTAACCAAGTTG+TGG + Chr7:71121360-71121379 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! AATGCTTTTCGACAAGATGG+AGG + Chr7:71122504-71122523 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! AGGAATAGTGAACGGGTTTA+AGG + Chr7:71121837-71121856 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! GACTAGCTCAAATATGCCAA+AGG + Chr7:71124515-71124534 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! GCAACGCTGCTACTTAAAAT+TGG + Chr7:71123463-71123482 MsG0780039960.01.T01:intron 40.0%
! GCCGAACTTACCTGATTTTA+TGG - Chr7:71125037-71125056 None:intergenic 40.0%
! GGAAATGCTTTTCGACAAGA+TGG + Chr7:71122501-71122520 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! GGAATAGTGAACGGGTTTAA+GGG + Chr7:71121838-71121857 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! TGAGATTTTTGTCTCAAGCG+TGG + Chr7:71121884-71121903 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGAACATCGTCTCACTTT+TGG + Chr7:71124234-71124253 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGGTCAAGTTGATTACGAC+TGG + Chr7:71122480-71122499 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAGAGGTGTTAAGGCAACT+TGG + Chr7:71122088-71122107 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAGGATTTGTGGTTCTAG+GGG - Chr7:71123017-71123036 None:intergenic 40.0%
!! GTGAACATCGTCTCACTTTT+GGG + Chr7:71124235-71124254 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTTCTCTTTGGAGCATTAG+GGG - Chr7:71123274-71123293 None:intergenic 40.0%
!! TAGAGGTGTTAAGGCAACTT+GGG + Chr7:71122089-71122108 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
!! TCGGTGCCAATCAAACAATA+TGG + Chr7:71124028-71124047 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
!! TTCTGTCTTGGTTAGTTTGG+TGG + Chr7:71123550-71123569 MsG0780039960.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTGTGAGCGTTGATTTTAG+CGG + Chr7:71122276-71122295 MsG0780039960.01.T01:CDS 40.0%
AAAGCAAAGATCTGCGATGG+AGG - Chr7:71121554-71121573 None:intergenic 45.0%
ACATCCTTGGTCGCAATAGA+AGG + Chr7:71123233-71123252 MsG0780039960.01.T01:intron 45.0%
ATTGCAATAGGCATAGCTCG+AGG + Chr7:71124385-71124404 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
CATTCCTTCTATTGCGACCA+AGG - Chr7:71123240-71123259 None:intergenic 45.0%
CGTGCAATGGGTATTTCCTA+AGG + Chr7:71121624-71121643 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
CTCATCGATGGTCTGTCTAA+TGG - Chr7:71124859-71124878 None:intergenic 45.0%
CTTAACAACAACGCGTTCAC+TGG + Chr7:71121907-71121926 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
GAATGGTTTAGCAAACTCCG+AGG + Chr7:71124774-71124793 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
GACATGCTCACCATTGTATC+GGG + Chr7:71123307-71123326 MsG0780039960.01.T01:intron 45.0%
GAGGGGAATGATGTTTGTAC+TGG + Chr7:71122216-71122235 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
GGGAATGATGTTTGTACTGG+CGG + Chr7:71122219-71122238 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
GTATGAAAGCCTCCACATTG+TGG - Chr7:71123994-71124013 None:intergenic 45.0%
GTTATTGTGACCAAGGTGCA+CGG - Chr7:71121527-71121546 None:intergenic 45.0%
TAATGCACAAGAAGAGGCAG+AGG + Chr7:71121246-71121265 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
TACCAGTGAGTGAGCTTGAT+GGG - Chr7:71121396-71121415 None:intergenic 45.0%
TACCATATCAGCGTCTTCCT+CGG - Chr7:71124794-71124813 None:intergenic 45.0%
TGCCATCAGACATGTTCGAT+TGG + Chr7:71121710-71121729 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
TGGCCACAACTTGGTTAGAT+TGG - Chr7:71121366-71121385 None:intergenic 45.0%
TGTGTCCATACTTGGCACAA+GGG + Chr7:71124549-71124568 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
TTCAAGCACAGCCATAACCT+GGG - Chr7:71122157-71122176 None:intergenic 45.0%
TTGTGTCCATACTTGGCACA+AGG + Chr7:71124548-71124567 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
TTTACCTGATGGTCGTCAAG+TGG + Chr7:71124132-71124151 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
TTTCAAGCACAGCCATAACC+TGG - Chr7:71122158-71122177 None:intergenic 45.0%
! ACAGATTTTCCTAGGGACAG+CGG - Chr7:71121790-71121809 None:intergenic 45.0%
! GAATGATGTTTGTACTGGCG+GGG + Chr7:71122221-71122240 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
! GATTTTTGTCGCAGCGATGT+TGG + Chr7:71122120-71122139 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
! GGAATGATGTTTGTACTGGC+GGG + Chr7:71122220-71122239 MsG0780039960.01.T01:CDS 45.0%
! GGGGCATTCTTGTTTAGTGT+TGG + Chr7:71123875-71123894 MsG0780039960.01.T01:intron 45.0%
!! AAGACTCTTTGGTAGCGAAC+CGG - Chr7:71122385-71122404 None:intergenic 45.0%
!! AGAAAAGGCTTTGGAGGGTA+TGG - Chr7:71124922-71124941 None:intergenic 45.0%
ACCTTGTGATCCCCAGGTTA+TGG + Chr7:71122143-71122162 MsG0780039960.01.T01:CDS 50.0%
ACGACGAGAGGAGACATAGA+AGG - Chr7:71121496-71121515 None:intergenic 50.0%
AGGTTGAGAGTTTGCATCCC+TGG - Chr7:71121586-71121605 None:intergenic 50.0%
AGTTCCCCTTGTGCCAAGTA+TGG - Chr7:71124557-71124576 None:intergenic 50.0%
CTCCACAACAACTCACTCAC+CGG + Chr7:71121463-71121482 MsG0780039960.01.T01:CDS 50.0%
CTTGGCACAAGGGGAACTAT+AGG + Chr7:71124559-71124578 MsG0780039960.01.T01:CDS 50.0%
GTACCAGTGAGTGAGCTTGA+TGG - Chr7:71121397-71121416 None:intergenic 50.0%
GTGTCCATACTTGGCACAAG+GGG + Chr7:71124550-71124569 MsG0780039960.01.T01:CDS 50.0%
TACCGGTGAGTGAGTTGTTG+TGG - Chr7:71121468-71121487 None:intergenic 50.0%
TCAAGCACAGCCATAACCTG+GGG - Chr7:71122156-71122175 None:intergenic 50.0%
TGAGAGTTTGCATCCCTGGT+AGG - Chr7:71121582-71121601 None:intergenic 50.0%
TGAGCTTGATGGGAGCTTGA+TGG - Chr7:71121386-71121405 None:intergenic 50.0%
! GGGTATGGCACTGAATCAAG+TGG - Chr7:71124907-71124926 None:intergenic 50.0%
! GTGTTGTTAGACCAGCCAGA+AGG - Chr7:71121313-71121332 None:intergenic 50.0%
! TTAGACCAGCCAGAAGGTGT+TGG - Chr7:71121307-71121326 None:intergenic 50.0%
!! TAGACCAGCCAGAAGGTGTT+GGG - Chr7:71121306-71121325 None:intergenic 50.0%
!! TGTGTTGGTGTTGCTTCCAG+CGG + Chr7:71123487-71123506 MsG0780039960.01.T01:intron 50.0%
AATTGTCTTGGAGACGCCGC+TGG - Chr7:71123506-71123525 None:intergenic 55.0%
ACCTGATGGTCGTCAAGTGG+CGG + Chr7:71124135-71124154 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
CTCCCATCAAGCTCACTCAC+TGG + Chr7:71121391-71121410 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
CTCCGAGGAAGACGCTGATA+TGG + Chr7:71124789-71124808 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
GCCATAACCTGGGGATCACA+AGG - Chr7:71122147-71122166 None:intergenic 55.0%
TGTTGGACCTTGTGATCCCC+AGG + Chr7:71122137-71122156 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
! ATGTTTGTACTGGCGGGGAC+GGG + Chr7:71122226-71122245 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
! GATGTTTGTACTGGCGGGGA+CGG + Chr7:71122225-71122244 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
! GCATTGACCCCAACACCTTC+TGG + Chr7:71121295-71121314 MsG0780039960.01.T01:CDS 55.0%
! GGAGCTTGATGGCCACAACT+TGG - Chr7:71121375-71121394 None:intergenic 55.0%
!! AGACCAGCCAGAAGGTGTTG+GGG - Chr7:71121305-71121324 None:intergenic 55.0%
ACCGCCACTTGACGACCATC+AGG - Chr7:71124139-71124158 None:intergenic 60.0%
ACGGTTTCGAGCACGACGAG+AGG - Chr7:71121508-71121527 None:intergenic 60.0%
ATAAGGGGGCCCTGTTCCCA+AGG + Chr7:71123075-71123094 MsG0780039960.01.T01:intron 60.0%
GGAACACTTCCGCTGTCCCT+AGG + Chr7:71121778-71121797 MsG0780039960.01.T01:CDS 60.0%
GTGCTCGAAACCGTGCACCT+TGG + Chr7:71121514-71121533 MsG0780039960.01.T01:CDS 60.0%
TGACCCCAACACCTTCTGGC+TGG + Chr7:71121299-71121318 MsG0780039960.01.T01:CDS 60.0%
! TGTTTGTACTGGCGGGGACG+GGG + Chr7:71122227-71122246 MsG0780039960.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 71121196 71125089 71121196 ID=MsG0780039960.01;Name=MsG0780039960.01
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Chr7 exon 71121196 71122552 71121196 ID=MsG0780039960.01.T01:exon:13641;Parent=MsG0780039960.01.T01
Chr7 exon 71123876 71125089 71123876 ID=MsG0780039960.01.T01:exon:13642;Parent=MsG0780039960.01.T01
Chr7 CDS 71121196 71122552 71121196 ID=MsG0780039960.01.T01:cds;Parent=MsG0780039960.01.T01
Chr7 CDS 71123876 71125089 71123876 ID=MsG0780039960.01.T01:cds;Parent=MsG0780039960.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039960.01.T01

ATGAAGATATCAATGTCATTTTTGTTTTCCATTCTCTTAGTTGTCACTATTAATGCACAAGAAGAGGCAGAGGCAAAATATATGTTCCAACTTTTGAAAGCATTGACCCCAACACCTTCTGGCTGGTCTAACAACACTCACTATTGCAACTGGAATGGCATTGTTTGCCAATCTAACCAAGTTGTGGCCATCAAGCTCCCATCAAGCTCACTCACTGGTACACTCCCTCAAAATCTCAATGCACTCATTAATCTCACCTACATTGATCTCCACAACAACTCACTCACCGGTACTTTACCTTCTATGTCTCCTCTCGTCGTGCTCGAAACCGTGCACCTTGGTCACAATAACTTCACCTCCATCGCAGATCTTTGCTTTCAATTCCTACCAGGGATGCAAACTCTCAACCTTAGTAATAACTTGAATCTCGTGCAATGGGTATTTCCTAAGGATTTAATTGATTCCAAGTTTATGCATACCCTTGATCTCGAAGCTACAAATATCATAGATTCATTGCCATCAGACATGTTCGATTGGTTTCCGCATTTGCATACTGTTTTTCTTTCTCACAACAACTTAAGTGGAACACTTCCGCTGTCCCTAGGAAAATCTGTTGTAAGGTATTTACGCCTCAACAACCAAGGAATAGTGAACGGGTTTAAGGGTACAATTGAAGTGATATCGTCTATGAGATTTTTGTCTCAAGCGTGGCTTAACAACAACGCGTTCACTGGTCCAATTCCTAACATGTCAAATTCCACTCATTTGTTTGATTTGCAACTTCACTTTAATAGCTTAGAAGGTTTGGTTCCACCTTCATTATTCTCTCTCTCTAGCTTGACCAACATCTCTTTGGACCACAATCAATTTAAAGGACCGATACCTATGTTTCATAGAGGTGTTAAGGCAACTTGGGAATCAAATGATTTTTGTCGCAGCGATGTTGGACCTTGTGATCCCCAGGTTATGGCTGTGCTTGAAATTTTCACAACTTTTGGGTATCTTGATTTTTCATCAATTGAGGGGAATGATGTTTGTACTGGCGGGGACGGGGCATTCATTACATGTCAAAGAGGGAAGGTTGTGAGCGTTGATTTTAGCGGTGAACAATTAAGGGGAACTATCTCTCCAGCATTTTCTAATTTGACAAGTTTAGTGAACTTGACTCTTGCTAACAATAATTTGACCGGTTCGCTACCAAAGAGTCTTACAACTTTACCTCAACTTCAGTTTCTTGATGTTTCTAATAATAATCTATCCGGACAAATTCCCAAATTTCCATCCAAGGTCAAGTTGATTACGACTGGAAATGCTTTTCGACAAGATGGAGGACCATCTAAAACAATTTGGATTGTAGGGGCATTCTTGTTTAGTGTTGGATTTGTAATATTTATTGTAGTTATTTGCAAATATAAGAGGCATCCAATTTTGGAAAAGAGTTGGATCTTCAAGAAAACAAAAAAATCTATTGACCACAATGTGGAGGCTTTCATACAAAGTTATAATTTGTCGGTGCCAATCAAACAATATGGATATGCAGAAGTGAAAAGAATGACAAACTCATTTCGAGATAAATTAGGTCAAGGAGGATATGGTGTCGTGTACAAAGCAAGTTTACCTGATGGTCGTCAAGTGGCGGTTAAAGTAATAAACGAAACTAAGGGAGATGGAGAAGAATTCATAAATGAAGTTGCTAGCATTAGTAGAACATCACATGTGAACATCGTCTCACTTTTGGGTTTCTGTTATGAGAACAAAAGAGCACTAATTTATGAATTCATGCCAAATGGTTCACTAGACAAGTTCATCTTTAAAAGTGGATTTTCTAATGCTCTTTGTAATTTGGACTGGAACACGTTGTACCGAATTGCAATAGGCATAGCTCGAGGACTTGAATACTTGCATCAAGGATGTACTTCAAGGATTTTGCATCTTGATATAAAACCCCAAAACATTCTTTTGGATGAAGATTTTTGCCCTAAAATCTCTGATTTTGGACTAGCTCAAATATGCCAAAGGAAGGATAGTATTGTGTCCATACTTGGCACAAGGGGAACTATAGGATACATAGCTCCTGAAGTATTTAGCCGTATGTTTGGTGGAGTTTCTCACAAGTCTGATGTATATAGTTATGGTATGTTAATTTTAGAAATGATTGGTGGAAGAAAGAACTATGACACAGGAGGGTCATGTACTTCTGAAATGTACTTTCCAGATTGGATTTATAATGATCTTGAGCTAAGTAATAACTTTGTGAATGGTTTAGCAAACTCCGAGGAAGACGCTGATATGGTAAGAAAGATAACTATGGTTAGTCTATGGTGCATTCAAACTAACCCATTAGACAGACCATCGATGAGTAAAGTAATAGAAATGCTACAAGGACCACTTGATTCAGTGCCATACCCTCCAAAGCCTTTTCTATATTCTCCTAAAATGCCATCATTACAAAGTTCATATGCGTCTTCCAGCAATTTGTTAGAGAAAAGTTCAATAACATTACTGCAGAATGGTTCCATAAAATCAGGTAAGTTCGGCAATGATATTAGTGAACATGTGATTGTAATTTAA
Protein sequence

>MsG0780039960.01.T01

MKISMSFLFSILLVVTINAQEEAEAKYMFQLLKALTPTPSGWSNNTHYCNWNGIVCQSNQVVAIKLPSSSLTGTLPQNLNALINLTYIDLHNNSLTGTLPSMSPLVVLETVHLGHNNFTSIADLCFQFLPGMQTLNLSNNLNLVQWVFPKDLIDSKFMHTLDLEATNIIDSLPSDMFDWFPHLHTVFLSHNNLSGTLPLSLGKSVVRYLRLNNQGIVNGFKGTIEVISSMRFLSQAWLNNNAFTGPIPNMSNSTHLFDLQLHFNSLEGLVPPSLFSLSSLTNISLDHNQFKGPIPMFHRGVKATWESNDFCRSDVGPCDPQVMAVLEIFTTFGYLDFSSIEGNDVCTGGDGAFITCQRGKVVSVDFSGEQLRGTISPAFSNLTSLVNLTLANNNLTGSLPKSLTTLPQLQFLDVSNNNLSGQIPKFPSKVKLITTGNAFRQDGGPSKTIWIVGAFLFSVGFVIFIVVICKYKRHPILEKSWIFKKTKKSIDHNVEAFIQSYNLSVPIKQYGYAEVKRMTNSFRDKLGQGGYGVVYKASLPDGRQVAVKVINETKGDGEEFINEVASISRTSHVNIVSLLGFCYENKRALIYEFMPNGSLDKFIFKSGFSNALCNLDWNTLYRIAIGIARGLEYLHQGCTSRILHLDIKPQNILLDEDFCPKISDFGLAQICQRKDSIVSILGTRGTIGYIAPEVFSRMFGGVSHKSDVYSYGMLILEMIGGRKNYDTGGSCTSEMYFPDWIYNDLELSNNFVNGLANSEEDADMVRKITMVSLWCIQTNPLDRPSMSKVIEMLQGPLDSVPYPPKPFLYSPKMPSLQSSYASSSNLLEKSSITLLQNGSIKSGKFGNDISEHVIVI*