AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880043062.01

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MsG0880043062.01.T01 AT5G65700 28.625 807 484 27 91 854 231 988 9.57e-65 235
MsG0880043062.01.T01 AT5G65700 29.017 417 246 15 56 438 48 448 1.24e-21 101
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MsG0880043062.01.T01 AT4G00340 43.894 303 146 12 545 833 469 761 2.20e-64 232
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MsG0880043062.01.T01 AT1G56120 37.958 382 187 17 476 844 629 973 1.17e-61 226
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MsG0880043062.01.T01 AT1G56120 29.225 284 167 10 68 325 70 345 4.40e-11 67.4
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MsG0880043062.01.T01 AT2G33170 25.700 393 232 7 71 438 153 510 2.13e-19 94.4
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MsG0880043062.01.T01 AT4G23130 39.528 339 180 11 522 848 306 631 1.30e-58 213
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MsG0880043062.01.T01 AT4G20140 29.111 371 214 13 76 438 192 521 2.88e-18 90.9
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MsG0880043062.01.T01 AT1G17750 29.582 311 190 11 169 455 73 378 1.27e-15 82.4
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MsG0880043062.01.T01 AT4G23320 39.169 337 179 10 518 842 146 468 8.82e-58 207
MsG0880043062.01.T01 AT1G17230 29.028 720 424 26 71 730 279 971 1.02e-57 214
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MsG0880043062.01.T01 AT5G56040 27.114 402 221 16 56 448 50 388 5.42e-16 83.6
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MsG0880043062.01.T01 AT1G34210 39.333 300 163 9 545 833 290 581 3.20e-54 199
MsG0880043062.01.T01 AT5G20480 28.769 796 429 31 75 764 169 932 3.33e-54 204
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MsG0880043062.01.T01 AT5G20480 28.769 796 429 31 75 764 169 932 3.33e-54 204
MsG0880043062.01.T01 AT5G20480 25.649 308 162 10 13 308 3 255 2.67e-12 71.2
MsG0880043062.01.T01 AT4G23290 37.758 339 186 11 526 853 333 657 3.80e-54 200
MsG0880043062.01.T01 AT4G23190 38.141 312 172 8 548 847 260 562 4.60e-54 198
MsG0880043062.01.T01 AT4G23190 38.141 312 172 8 548 847 260 562 4.60e-54 198
MsG0880043062.01.T01 AT2G14440 32.272 471 265 16 374 836 413 837 4.67e-54 202
MsG0880043062.01.T01 AT1G70740 35.103 339 189 12 522 844 25 348 7.26e-54 193
MsG0880043062.01.T01 AT4G23260 37.107 318 187 7 537 847 316 627 8.20e-54 199
MsG0880043062.01.T01 AT1G51805 32.096 458 282 12 378 828 384 819 8.81e-54 202
MsG0880043062.01.T01 AT4G23250 37.421 318 186 7 537 847 331 642 9.46e-54 202
MsG0880043062.01.T01 AT1G51805 32.096 458 282 12 378 828 408 843 1.09e-53 202
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MsG0880043062.01.T01 AT2G24130 28.673 422 262 15 65 465 69 472 3.95e-17 87.0
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MsG0880043062.01.T01 AT3G46330 33.991 456 255 14 388 837 427 842 1.48e-53 201
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MsG0880043062.01.T01 AT1G51830 31.770 469 286 12 378 837 225 668 1.61e-53 199
MsG0880043062.01.T01 AT4G23260 37.662 308 179 7 547 847 315 616 1.69e-53 197
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MsG0880043062.01.T01 AT5G44700 26.884 398 264 13 65 451 178 559 1.88e-16 85.1
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MsG0880043062.01.T01 AT4G21400 31.306 444 241 16 465 870 147 564 1.29e-51 191
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MsG0880043062.01.T01 AT4G03230 39.117 317 180 8 535 844 565 875 1.32e-51 196
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MsG0880043062.01.T01 AT1G61430 37.231 325 186 11 528 844 435 749 1.81e-51 194
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MsG0880043062.01.T01 AT1G56145 26.648 349 213 14 65 380 84 422 5.44e-12 70.5
MsG0880043062.01.T01 AT5G62710 30.290 482 286 16 385 837 94 554 7.71e-51 188
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MsG0880043062.01.T01 AT1G67720 29.012 486 303 12 374 836 415 881 9.07e-51 193
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MsG0880043062.01.T01 AT5G38560 38.514 296 162 10 548 831 327 614 9.28e-51 190
MsG0880043062.01.T01 AT4G21400 31.306 444 241 16 465 870 248 665 1.02e-50 190
MsG0880043062.01.T01 AT2G18890 37.966 295 167 7 546 833 54 339 1.10e-50 183
MsG0880043062.01.T01 AT1G11330 40.000 295 157 9 477 762 442 725 1.11e-50 191
MsG0880043062.01.T01 AT4G11900 34.383 413 224 16 449 844 438 820 1.23e-50 192
MsG0880043062.01.T01 AT4G32710 37.538 333 189 9 513 833 342 667 1.24e-50 191
MsG0880043062.01.T01 AT4G23220 36.728 324 191 9 547 863 324 640 1.32e-50 189
MsG0880043062.01.T01 AT3G55550 34.746 354 211 13 499 844 289 630 1.34e-50 190
MsG0880043062.01.T01 AT5G56890 38.235 306 172 11 536 832 701 998 1.50e-50 193
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MsG0880043062.01.T01 AT1G29750 26.715 277 162 6 183 455 96 335 5.28e-12 70.5
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MsG0880043062.01.T01 AT2G18470 38.127 299 160 11 548 833 272 558 2.99e-48 182
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MsG0880043062.01.T01 AT1G34420 28.767 438 237 16 65 455 69 478 1.40e-18 91.7
MsG0880043062.01.T01 AT1G51800 30.917 469 292 15 374 832 409 855 9.55e-48 184
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MsG0880043062.01.T01 AT1G29740 36.585 328 177 12 552 864 669 980 2.25e-47 183
MsG0880043062.01.T01 AT3G53810 33.856 319 180 12 533 835 320 623 2.49e-47 180
MsG0880043062.01.T01 AT1G29740 36.585 328 177 12 552 864 669 980 2.52e-47 183
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MsG0880043062.01.T01 AT2G28590 34.513 339 202 11 501 831 46 372 6.98e-47 174
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MsG0880043062.01.T01 AT1G31420 29.814 483 295 17 377 841 126 582 6.85e-46 174
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MsG0880043062.01.T01 AT1G68690 36.570 309 171 12 537 832 354 650 4.85e-45 174
MsG0880043062.01.T01 AT3G24790 34.769 325 191 11 515 831 28 339 4.96e-45 167
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MsG0880043062.01.T01 AT2G28590 38.662 269 149 9 501 764 46 303 6.54e-45 165
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MsG0880043062.01.T01 AT2G35620 29.749 558 336 21 307 841 56 580 7.38e-45 171
MsG0880043062.01.T01 AT2G35620 29.749 558 336 21 307 841 56 580 7.38e-45 171
MsG0880043062.01.T01 AT4G01330 36.364 297 171 11 546 833 148 435 7.72e-45 168
MsG0880043062.01.T01 AT1G61430 42.324 241 126 8 528 761 458 692 7.91e-45 173
MsG0880043062.01.T01 AT1G68690 37.500 304 165 12 537 827 354 645 8.84e-45 172
MsG0880043062.01.T01 AT3G47110 27.425 835 499 28 66 831 216 1012 9.27e-45 175
MsG0880043062.01.T01 AT5G56040 27.959 676 380 27 80 730 342 935 1.13e-44 174
MsG0880043062.01.T01 AT5G56040 27.114 402 221 16 56 448 50 388 1.26e-15 82.0
MsG0880043062.01.T01 AT1G52290 38.235 238 132 7 548 779 131 359 1.37e-44 166
MsG0880043062.01.T01 AT1G11340 33.095 420 255 12 350 762 384 784 1.42e-44 173
MsG0880043062.01.T01 AT1G69790 34.304 309 174 10 542 832 55 352 1.43e-44 166
MsG0880043062.01.T01 AT4G21390 44.762 210 107 5 557 762 526 730 1.47e-44 173
MsG0880043062.01.T01 AT4G29450 30.022 463 267 12 392 837 432 854 1.47e-44 174
MsG0880043062.01.T01 AT3G46330 38.255 298 169 9 546 837 530 818 1.50e-44 174
MsG0880043062.01.T01 AT5G48380 28.067 481 305 17 375 833 127 588 1.55e-44 171
MsG0880043062.01.T01 AT5G56790 37.124 299 161 12 548 833 378 662 1.59e-44 172
MsG0880043062.01.T01 AT1G61440 36.593 317 161 9 559 844 484 791 1.63e-44 173
MsG0880043062.01.T01 AT1G31420 29.607 483 297 17 377 841 126 583 2.28e-44 170
MsG0880043062.01.T01 AT1G31420 29.607 483 297 17 377 841 126 583 2.28e-44 170

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CTTGACCTTGGATGAAAATT+TGG 0.075944 8:-18349909 None:intergenic
TCCTGATGCTATTTGTAATT+TGG 0.117945 8:+18350972 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTCAAAATATTTGAAGCTTT+TGG 0.132846 8:+18349620 MsG0880043062.01.T01:CDS
CCTCGTTTGTTGTTAATTAA+AGG 0.160322 8:+18349647 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATTAGACTCTCTTGGATTAT+AGG 0.162246 8:+18350043 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTTAGGGAATTTGACATTAA+AGG 0.170953 8:+18349733 MsG0880043062.01.T01:CDS
GTTGACTAAACTTGATAAAT+TGG 0.177991 8:-18349777 None:intergenic
AAGATTGTGAGCATTAATTT+AGG 0.181354 8:+18349716 MsG0880043062.01.T01:CDS
GTTTCCAATAATAATCTTTC+AGG 0.196429 8:+18349878 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTTTCCTGATTGGATTTATA+AGG 0.213334 8:+18351356 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTGTCCTGAAAGATTATTAT+TGG 0.215479 8:-18349882 None:intergenic
TGTGAACATCGTCTCACTTT+TGG 0.232830 8:+18350864 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACTTTCCCGAAGATCCATTT+TGG 0.233624 8:-18350580 None:intergenic
CTTCATCCAAAAGAATGTTT+TGG 0.238381 8:-18351095 None:intergenic
GAGCAATGCCAATTGCTATT+TGG 0.252653 8:-18351011 None:intergenic
CTCATGGTTGGTCTATCTAA+TGG 0.258831 8:-18351486 None:intergenic
CTCGTTTGTTGTTAATTAAA+GGG 0.268248 8:+18349648 MsG0880043062.01.T01:CDS
CAAACCCCAAAACATTCTTT+TGG 0.272263 8:+18351089 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTAGGGAATTTGACATTAAA+GGG 0.279479 8:+18349734 MsG0880043062.01.T01:CDS
AATATTTCTCAACAACAATT+AGG 0.279727 8:+18349965 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAACAATACTATCCTTTCTT+TGG 0.280381 8:-18351161 None:intergenic
CTCCTTGACCTAATTTATCT+TGG 0.280992 8:-18350714 None:intergenic
GAATTCTTCTCCATTTCCTT+TGG 0.298371 8:-18350806 None:intergenic
ACTGTATACATCAGACTTAT+AGG 0.303072 8:-18351256 None:intergenic
GACGATCCAAAGCAAAATTC+TGG 0.305054 8:-18349008 None:intergenic
CTGAAATGTTCTTTCCTGAT+TGG 0.307891 8:+18351346 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACACTTGATTCGTACCTTAT+CGG 0.311324 8:-18349684 None:intergenic
TATCACCAAAATGGATCTTC+GGG 0.324900 8:+18350575 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTGGTCCTTGAAGAAAATTC+TGG 0.332323 8:-18349502 None:intergenic
CTTGAAGCTACAAATATAAT+AGG 0.333005 8:+18349131 MsG0880043062.01.T01:CDS
GATAGTATTGTTTCTATGAT+TGG 0.333052 8:+18351171 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATCAAACAAATGAATGGAAT+TGG 0.334727 8:-18349396 None:intergenic
AATTCATTCCAAGATAAATT+AGG 0.341525 8:+18350706 MsG0880043062.01.T01:CDS
GAAATTATCCAATGATCCTT+TGG 0.343816 8:-18350932 None:intergenic
GTACAATTGCTTCACTGGTT+TGG 0.344410 8:+18349430 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTTTCACACAACAACATTAG+TGG 0.344588 8:+18349206 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGGATATATAGTGGGCTTAC+GGG 0.353086 8:+18349287 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTGCCACGACTCGACTATAT+TGG 0.354996 8:-18348812 None:intergenic
ATTGTTGTTGAGAAATATTT+AGG 0.359298 8:-18349961 None:intergenic
AAATTAGGTCAAGGAGGATA+TGG 0.363645 8:+18350721 MsG0880043062.01.T01:CDS
AGATTGTGAGCATTAATTTA+GGG 0.363896 8:+18349717 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACAAGAGGCAATGCTTTGTT+TGG 0.363901 8:+18349938 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAGATCGATGTTAGTTAGAT+TGG 0.363902 8:-18348892 None:intergenic
TGAACCTGTCAAATTATTGT+TGG 0.368428 8:-18349810 None:intergenic
GGAGAATATAAGAAAGGCTT+TGG 0.369273 8:-18351558 None:intergenic
CAACTCTTATTAGACTCTCT+TGG 0.373880 8:+18350035 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTGACCTTGGATGAAAATTT+GGG 0.375707 8:-18349908 None:intergenic
TAGACCAGCCAGAGGGAGTT+GGG 0.378282 8:-18348752 None:intergenic
TTATCACCAAAATGGATCTT+CGG 0.379850 8:+18350574 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATAAGGGTGTTAAGGCGAAT+TGG 0.385617 8:+18349537 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAATTATCCAATGATCCTTT+GGG 0.395713 8:-18350931 None:intergenic
CTTCAGTACAATTGCTTCAC+TGG 0.401600 8:+18349425 MsG0880043062.01.T01:CDS
AATGTCCGGCTAAACACTTC+TGG 0.407666 8:-18351222 None:intergenic
GGGGATATATAGTGGGCTTA+CGG 0.408468 8:+18349286 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGCCTAAAGAGATGTTCTTC+AGG 0.411282 8:-18349481 None:intergenic
GAAAATAGTTCACTGAAATC+AGG 0.411903 8:-18348942 None:intergenic
TCGCTTGAAACGGTGTATCT+TGG 0.414244 8:+18348963 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATTGGCACACGAGGAACTAT+TGG 0.415405 8:+18351189 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAGAAAGGCTTTGGAGGATA+AGG 0.416949 8:-18351549 None:intergenic
CACTGCTACTTGACGACCAT+CGG 0.417481 8:-18350767 None:intergenic
TAAGGGTGTTAAGGCGAATT+GGG 0.418434 8:+18349538 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTCAGAGGAAGAAAATGATA+TGG 0.418585 8:+18351419 MsG0880043062.01.T01:CDS
TATACAAAGTTATAATTTGT+CGG 0.418972 8:+18350639 MsG0880043062.01.T01:CDS
GAAGTGTTTAGCCGGACATT+TGG 0.420074 8:+18351225 MsG0880043062.01.T01:CDS
GATAATTTCATCTTTAAAAG+TGG 0.433978 8:+18350946 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGAACTCTGCCGCTGTCTCT+TGG 0.435193 8:+18349227 MsG0880043062.01.T01:CDS
TCTATTACTTTACTCATGGT+TGG 0.436558 8:-18351498 None:intergenic
GGCTTCGGTATAACTTGCTC+GGG 0.436839 8:+18349354 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATGCTATTTGTAATTTGGAT+TGG 0.437181 8:+18350977 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACCAATACCTGTGTTTCATA+AGG 0.437920 8:+18349520 MsG0880043062.01.T01:CDS
AGATTACTATGGTTAGTCTA+TGG 0.439122 8:+18351448 MsG0880043062.01.T01:CDS
TGGCTTCGGTATAACTTGCT+CGG 0.443621 8:+18349353 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATAAACGAGTCCAAAGGAAA+TGG 0.446701 8:+18350796 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATTCATGCCCAAAGGATCAT+TGG 0.448715 8:+18350924 MsG0880043062.01.T01:CDS
TCTTGTCACAGGTGTGGCTT+CGG 0.449860 8:+18349339 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTTTCCAACAATAATTTGAC+AGG 0.452203 8:+18349806 MsG0880043062.01.T01:CDS
TGACCCCAACTCCCTCTGGC+TGG 0.456148 8:+18348748 MsG0880043062.01.T01:CDS
TCAAGTTATTGCTAAGATTG+AGG 0.457611 8:-18349046 None:intergenic
ACATTATACCAAATAGCAAT+TGG 0.460926 8:+18351003 MsG0880043062.01.T01:CDS
GTCCATGAGGTTCTTGTCAC+AGG 0.461593 8:+18349328 MsG0880043062.01.T01:CDS
CCCTTATGAAACACAGGTAT+TGG 0.462806 8:-18349521 None:intergenic
AAAGCAAAATTCTGGAATAG+AGG 0.465527 8:-18349000 None:intergenic
AATGACCAGGGGATATATAG+TGG 0.466503 8:+18349278 MsG0880043062.01.T01:CDS
TATGGTAAGAAAGATTACTA+TGG 0.471532 8:+18351437 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTCATTGTTAATGTTAGTGT+TGG 0.471714 8:+18348666 MsG0880043062.01.T01:CDS
TCTTGTAATTAGCTTGACCT+TGG 0.472320 8:-18349921 None:intergenic
GCATTGACCCCAACTCCCTC+TGG 0.472468 8:+18348744 MsG0880043062.01.T01:CDS
AATCTGTAGTAAGGTACTTA+CGG 0.472717 8:+18349252 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTGAAGATCAAACAAATGAA+TGG 0.473026 8:-18349402 None:intergenic
AAGTCTGATGTATACAGTTA+TGG 0.477827 8:+18351261 MsG0880043062.01.T01:CDS
TGAATGGAATTGGACATGTC+AGG 0.479119 8:-18349386 None:intergenic
TGCCATCAGAAATGTTTGAC+TGG 0.480429 8:+18349159 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGGACATCCTTGTTTAGTGT+TGG 0.485840 8:+18350502 MsG0880043062.01.T01:intron
CATTTCTATTACTTTACTCA+TGG 0.489371 8:-18351502 None:intergenic
TCCAAATTACAAATAGCATC+AGG 0.492301 8:-18350973 None:intergenic
GTACTTACGGCTCAATGACC+AGG 0.492417 8:+18349265 MsG0880043062.01.T01:CDS
CCAATACCTGTGTTTCATAA+GGG 0.495659 8:+18349521 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACTGCTACTTGACGACCATC+GGG 0.496951 8:-18350766 None:intergenic
AGCCTGAAGAACATCTCTTT+AGG 0.497017 8:+18349479 MsG0880043062.01.T01:CDS
AGATCCTTATAAATCCAATC+AGG 0.497115 8:-18351360 None:intergenic
GAATTGGACATGTCAGGGAT+TGG 0.499318 8:-18349380 None:intergenic
GAATATAAGAAAGGCTTTGG+AGG 0.499674 8:-18351555 None:intergenic
AGGAAACTCCACCAAATGTC+CGG 0.503302 8:-18351236 None:intergenic
GGCTCAAATATGCCAAAGAA+AGG 0.504947 8:+18351149 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACAAAACTCATTACTGCGAA+TGG 0.509231 8:+18348775 MsG0880043062.01.T01:CDS
GTGTTTAGCCGGACATTTGG+TGG 0.512560 8:+18351228 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTTGATAAATTGGAAAATGC+AGG 0.514299 8:-18349767 None:intergenic
GTTTGTAATGATGACATTTG+AGG 0.514399 8:-18351579 None:intergenic
ATGTTAATCATAGAAATGAT+TGG 0.516573 8:+18351285 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTGGTTTCCGAACTTGCATA+CGG 0.517803 8:+18349178 MsG0880043062.01.T01:CDS
TGTGTTTCATAAGGGTGTTA+AGG 0.518027 8:+18349529 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTCTTGGAAAATCTGTAGTA+AGG 0.519519 8:+18349243 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATTTGAGGAGAATATAAGAA+AGG 0.522666 8:-18351564 None:intergenic
GAACAATGCTTGTACCGATA+AGG 0.532304 8:+18349670 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTCCAAGATAAATTAGGTCA+AGG 0.535922 8:+18350712 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTAGACCAGCCAGAGGGAGT+TGG 0.539376 8:-18348753 None:intergenic
ATTGGAAAATGCAGGAGAGA+TGG 0.547408 8:-18349759 None:intergenic
ATTTGTAGCTTCAAGATCGA+GGG 0.549292 8:-18349123 None:intergenic
GTGAGAACGGAGATATAGTG+AGG 0.552398 8:-18348870 None:intergenic
GAATGGAATTGGACATGTCA+GGG 0.558586 8:-18349385 None:intergenic
GTACCAACGAGTGAACTTGA+TGG 0.565013 8:-18348843 None:intergenic
TAACATTAACAATGAACAAG+AGG 0.565060 8:-18348659 None:intergenic
TGAGGTTCTTGTCACAGGTG+TGG 0.567582 8:+18349333 MsG0880043062.01.T01:CDS
GTTAGTTAGATTGGTGAGAA+CGG 0.568059 8:-18348883 None:intergenic
TTGAGCAAAATCGTGACTTG+AGG 0.570203 8:-18349602 None:intergenic
ACTCATTACTGCGAATGGAA+CGG 0.570475 8:+18348780 MsG0880043062.01.T01:CDS
TAAGCCCACTATATATCCCC+TGG 0.574276 8:-18349283 None:intergenic
TAGCGCCAGAAGTGTTTAGC+CGG 0.582616 8:+18351217 MsG0880043062.01.T01:CDS
AACCAGTCAAACATTTCTGA+TGG 0.584577 8:-18349161 None:intergenic
ACTGAAATCAGGCAAAGGAC+CGG 0.587393 8:-18348931 None:intergenic
TATTTGTAGCTTCAAGATCG+AGG 0.588692 8:-18349124 None:intergenic
AGAAGAATTCATAAATGAAG+TGG 0.589404 8:+18350819 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATCCTCCACATTGTCGTCAG+TGG 0.591784 8:-18350614 None:intergenic
ATTTCTCAACAACAATTAGG+TGG 0.594104 8:+18349968 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTGAAAACAAAACAGATACA+TGG 0.594971 8:-18348635 None:intergenic
TACCAACGAGTGAACTTGAT+GGG 0.595313 8:-18348842 None:intergenic
ATAACTTGAATCTCTCGCCA+TGG 0.595674 8:+18349060 MsG0880043062.01.T01:CDS
GCTTCGGTATAACTTGCTCG+GGG 0.596105 8:+18349355 MsG0880043062.01.T01:CDS
CCTTTAATTAACAACAAACG+AGG 0.598767 8:-18349647 None:intergenic
TCTCAACAACAATTAGGTGG+AGG 0.599293 8:+18349971 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTTCATAACAATTCACTCAC+CGG 0.600523 8:+18348912 MsG0880043062.01.T01:CDS
TGAGAACGGAGATATAGTGA+GGG 0.603869 8:-18348869 None:intergenic
AAATGACTAGAAAATATCCA+TGG 0.604367 8:-18349077 None:intergenic
AATGCAGCTACTTCTCATGA+TGG 0.605031 8:+18349998 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACAAAGTTATAATTTGTCGG+TGG 0.611273 8:+18350642 MsG0880043062.01.T01:CDS
TATTATTGGAAACATCAAGA+AGG 0.613440 8:-18349868 None:intergenic
TATTGGAAACATCAAGAAGG+AGG 0.614824 8:-18349865 None:intergenic
TAATCATAGAAATGATTGGA+GGG 0.614963 8:+18351289 MsG0880043062.01.T01:CDS
TACAATTCCAACACTAAACA+AGG 0.615260 8:-18350509 None:intergenic
AGACCAGCCAGAGGGAGTTG+GGG 0.615283 8:-18348751 None:intergenic
GGACTAGAATACTTGCATCA+AGG 0.616085 8:+18351036 MsG0880043062.01.T01:CDS
TACTTACGGCTCAATGACCA+GGG 0.616759 8:+18349266 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGATAAGGCACTGACTGAAG+TGG 0.619124 8:-18351534 None:intergenic
CTCCCATCAAGTTCACTCGT+TGG 0.621061 8:+18348840 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGGAGAAAGAATTATGACAC+TGG 0.622431 8:+18351309 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAGGTCAAGCTAATTACAAG+AGG 0.623787 8:+18349923 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATATATGAATTCATGCCCAA+AGG 0.624848 8:+18350916 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATAGCAATTGGCATTGCTCG+AGG 0.628350 8:+18351015 MsG0880043062.01.T01:CDS
GGCAAAGTTGTGAGACTATG+TGG 0.628638 8:-18349836 None:intergenic
TTAATCATAGAAATGATTGG+AGG 0.630597 8:+18351288 MsG0880043062.01.T01:CDS
GAAAGAATTATGACACTGGA+GGG 0.631910 8:+18351313 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATGACCAGGGGATATATAGT+GGG 0.632949 8:+18349279 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAAATAATAAACGAGTCCAA+AGG 0.633398 8:+18350790 MsG0880043062.01.T01:CDS
AGTTCACTGAAATCAGGCAA+AGG 0.635530 8:-18348936 None:intergenic
AACATTAACAATGAACAAGA+GGG 0.643712 8:-18348658 None:intergenic
GTTTCTATGATTGGCACACG+AGG 0.645746 8:+18351180 MsG0880043062.01.T01:CDS
AGAAAGAATTATGACACTGG+AGG 0.646262 8:+18351312 MsG0880043062.01.T01:CDS
GTACGAATCAAGTGTCAAAG+AGG 0.652315 8:+18349692 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTAACACCCTTATGAAACAC+AGG 0.655153 8:-18349527 None:intergenic
GCAGCTACTTCTCATGATGG+AGG 0.655570 8:+18350001 MsG0880043062.01.T01:CDS
CACCTGTGACAAGAACCTCA+TGG 0.658408 8:-18349330 None:intergenic
CAAGATAAATTAGGTCAAGG+AGG 0.659889 8:+18350715 MsG0880043062.01.T01:CDS
AAAGTAATAGAAATGCTACA+AGG 0.661359 8:+18351510 MsG0880043062.01.T01:CDS
TACAAAGCAAGCTTACCCGA+TGG 0.662193 8:+18350751 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACATCAAGAAGGAGGAGTTG+AGG 0.665143 8:-18349857 None:intergenic
ATCTACCACTGACGACAATG+TGG 0.665904 8:+18350609 MsG0880043062.01.T01:CDS
TTGCCAATATAGTCGAGTCG+TGG 0.667018 8:+18348809 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATCGTGACTTGAGGATCACA+AGG 0.667917 8:-18349593 None:intergenic
TACCACTGACGACAATGTGG+AGG 0.671472 8:+18350612 MsG0880043062.01.T01:CDS
GAGAGAATGAACAACGAAGG+CGG 0.677508 8:-18349455 None:intergenic
TTGATGTGATATCGTCCATG+AGG 0.685799 8:+18349315 MsG0880043062.01.T01:CDS
CTAGAGAGAATGAACAACGA+AGG 0.691498 8:-18349458 None:intergenic
CTTCGGTATAACTTGCTCGG+GGG 0.718016 8:+18349356 MsG0880043062.01.T01:CDS
AGATTGTTTAGTAATCTCAG+AGG 0.730586 8:+18351404 MsG0880043062.01.T01:CDS
ACTTACGGCTCAATGACCAG+GGG 0.777935 8:+18349267 MsG0880043062.01.T01:CDS
ATCGAGGGTATGTAGCAACG+AGG 0.779097 8:-18349108 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATTTGTTTAAACATATAAT+TGG - Chr8:18350241-18350260 None:intergenic 10.0%
!!! TTGATTTTGAATAAAATTAT+AGG - Chr8:18350429-18350448 None:intergenic 10.0%
!! ACAAAGATTGAAATATATAA+CGG - Chr8:18350078-18350097 None:intergenic 15.0%
!!! TATACAAAGTTATAATTTGT+CGG + Chr8:18350639-18350658 MsG0880043062.01.T01:CDS 15.0%
!! AATATTTCTCAACAACAATT+AGG + Chr8:18349965-18349984 MsG0880043062.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTCATTCCAAGATAAATT+AGG + Chr8:18350706-18350725 MsG0880043062.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGTTAATCATAGAAATGAT+TGG + Chr8:18351285-18351304 MsG0880043062.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTGTTGTTGAGAAATATTT+AGG - Chr8:18349964-18349983 None:intergenic 20.0%
!!! GATAATTTCATCTTTAAAAG+TGG + Chr8:18350946-18350965 MsG0880043062.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAATAAGAGTTGTTTTAGAA+TGG - Chr8:18350027-18350046 None:intergenic 20.0%
!!! TCAAAATATTTGAAGCTTTT+GGG + Chr8:18349621-18349640 MsG0880043062.01.T01:CDS 20.0%
! AAAATAATAAACGAGTCCAA+AGG + Chr8:18350790-18350809 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! AAACAATACTATCCTTTCTT+TGG - Chr8:18351164-18351183 None:intergenic 25.0%
! AAAGTAATAGAAATGCTACA+AGG + Chr8:18351510-18351529 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! AAATGACTAGAAAATATCCA+TGG - Chr8:18349080-18349099 None:intergenic 25.0%
! AAATTATCCAATGATCCTTT+GGG - Chr8:18350934-18350953 None:intergenic 25.0%
! AACATTAACAATGAACAAGA+GGG - Chr8:18348661-18348680 None:intergenic 25.0%
! AAGATTGTGAGCATTAATTT+AGG + Chr8:18349716-18349735 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! ACATTATACCAAATAGCAAT+TGG + Chr8:18351003-18351022 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAGAATTCATAAATGAAG+TGG + Chr8:18350819-18350838 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! AGATTGTGAGCATTAATTTA+GGG + Chr8:18349717-18349736 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! ATCAAACAAATGAATGGAAT+TGG - Chr8:18349399-18349418 None:intergenic 25.0%
! ATTGGAAGAATGAAAAAAGT+TGG - Chr8:18350223-18350242 None:intergenic 25.0%
! ATTTGAGGAGAATATAAGAA+AGG - Chr8:18351567-18351586 None:intergenic 25.0%
! CATTTCTATTACTTTACTCA+TGG - Chr8:18351505-18351524 None:intergenic 25.0%
! CTTGAAGCTACAAATATAAT+AGG + Chr8:18349131-18349150 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! GTTGACTAAACTTGATAAAT+TGG - Chr8:18349780-18349799 None:intergenic 25.0%
! GTTTCCAATAATAATCTTTC+AGG + Chr8:18349878-18349897 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! TAACATTAACAATGAACAAG+AGG - Chr8:18348662-18348681 None:intergenic 25.0%
! TAATCATAGAAATGATTGGA+GGG + Chr8:18351289-18351308 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! TATGATGTTGTTCATTAGTT+TGG + Chr8:18350110-18350129 MsG0880043062.01.T01:intron 25.0%
! TATGGTAAGAAAGATTACTA+TGG + Chr8:18351437-18351456 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! TATTATTGGAAACATCAAGA+AGG - Chr8:18349871-18349890 None:intergenic 25.0%
! TTAATCATAGAAATGATTGG+AGG + Chr8:18351288-18351307 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGGGAATTTGACATTAAA+GGG + Chr8:18349734-18349753 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! TTCATTGTTAATGTTAGTGT+TGG + Chr8:18348666-18348685 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAAAACAAAACAGATACA+TGG - Chr8:18348638-18348657 None:intergenic 25.0%
! TTGTCCTGAAAGATTATTAT+TGG - Chr8:18349885-18349904 None:intergenic 25.0%
! TTTAGGGAATTTGACATTAA+AGG + Chr8:18349733-18349752 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCCTATTTTATCACCAAAA+TGG + Chr8:18350566-18350585 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGCTATTTGTAATTTGGAT+TGG + Chr8:18350977-18350996 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCATCCAAAAGAATGTTTT+GGG - Chr8:18351097-18351116 None:intergenic 25.0%
!!! ATCCATTTTGGTGATAAAAT+AGG - Chr8:18350571-18350590 None:intergenic 25.0%
!!! CTCAAAATATTTGAAGCTTT+TGG + Chr8:18349620-18349639 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTCGTTTGTTGTTAATTAAA+GGG + Chr8:18349648-18349667 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATAGTATTGTTTCTATGAT+TGG + Chr8:18351171-18351190 MsG0880043062.01.T01:CDS 25.0%
AAGATCGATGTTAGTTAGAT+TGG - Chr8:18348895-18348914 None:intergenic 30.0%
AAGTCTGATGTATACAGTTA+TGG + Chr8:18351261-18351280 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
ACTGTATACATCAGACTTAT+AGG - Chr8:18351259-18351278 None:intergenic 30.0%
AGATCCTTATAAATCCAATC+AGG - Chr8:18351363-18351382 None:intergenic 30.0%
AGATTGTTTAGTAATCTCAG+AGG + Chr8:18351404-18351423 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
AGGTTATTAACACTTTCACA+TGG - Chr8:18350136-18350155 None:intergenic 30.0%
ATATATGAATTCATGCCCAA+AGG + Chr8:18350916-18350935 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGACTCTCTTGGATTAT+AGG + Chr8:18350043-18350062 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCTCAACAACAATTAGG+TGG + Chr8:18349968-18349987 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
CAAACATAGGTATAGATGTT+AGG - Chr8:18350156-18350175 None:intergenic 30.0%
CCTTTAATTAACAACAAACG+AGG - Chr8:18349650-18349669 None:intergenic 30.0%
CTGAAGATCAAACAAATGAA+TGG - Chr8:18349405-18349424 None:intergenic 30.0%
CTTGATAAATTGGAAAATGC+AGG - Chr8:18349770-18349789 None:intergenic 30.0%
CTTTCCAACAATAATTTGAC+AGG + Chr8:18349806-18349825 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCCTGATTGGATTTATA+AGG + Chr8:18351356-18351375 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
GAAAATAGTTCACTGAAATC+AGG - Chr8:18348945-18348964 None:intergenic 30.0%
GAAATTATCCAATGATCCTT+TGG - Chr8:18350935-18350954 None:intergenic 30.0%
GTTTGTAATGATGACATTTG+AGG - Chr8:18351582-18351601 None:intergenic 30.0%
TACAATTCCAACACTAAACA+AGG - Chr8:18350512-18350531 None:intergenic 30.0%
TCAAGTTATTGCTAAGATTG+AGG - Chr8:18349049-18349068 None:intergenic 30.0%
TCCAAATTACAAATAGCATC+AGG - Chr8:18350976-18350995 None:intergenic 30.0%
TCTATTACTTTACTCATGGT+TGG - Chr8:18351501-18351520 None:intergenic 30.0%
TGAACCTGTCAAATTATTGT+TGG - Chr8:18349813-18349832 None:intergenic 30.0%
TTATCACCAAAATGGATCTT+CGG + Chr8:18350574-18350593 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
TTCCAAGATAAATTAGGTCA+AGG + Chr8:18350712-18350731 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
TTGACCTTGGATGAAAATTT+GGG - Chr8:18349911-18349930 None:intergenic 30.0%
! AAAAATCTCAGATTTTGGAC+TGG + Chr8:18351128-18351147 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
! AACCATCTCTTTTATGTCAA+GGG + Chr8:18350181-18350200 MsG0880043062.01.T01:intron 30.0%
! AATCTGTAGTAAGGTACTTA+CGG + Chr8:18349252-18349271 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
! ACAAAGTTATAATTTGTCGG+TGG + Chr8:18350642-18350661 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
! CTTCATCCAAAAGAATGTTT+TGG - Chr8:18351098-18351117 None:intergenic 30.0%
! TCATCCAAAAGAATGTTTTG+GGG - Chr8:18351096-18351115 None:intergenic 30.0%
! TCCTGATGCTATTTGTAATT+TGG + Chr8:18350972-18350991 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
! TCTATTCCAGAATTTTGCTT+TGG + Chr8:18349002-18349021 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
! TGAACTATTTTCGCTTGAAA+CGG + Chr8:18348953-18348972 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAGCAAAATTCTGGAATAG+AGG - Chr8:18349003-18349022 None:intergenic 30.0%
!! AGATTACTATGGTTAGTCTA+TGG + Chr8:18351448-18351467 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTCCAAAATCTGAGATTTT+TGG - Chr8:18351129-18351148 None:intergenic 30.0%
!! CCTCGTTTGTTGTTAATTAA+AGG + Chr8:18349647-18349666 MsG0880043062.01.T01:CDS 30.0%
!! GTCCAAAATCTGAGATTTTT+GGG - Chr8:18351128-18351147 None:intergenic 30.0%
!!! TACTTTTTTGTTGTCATGCA+GGG + Chr8:18350482-18350501 MsG0880043062.01.T01:intron 30.0%
!!! TTACTTTTTTGTTGTCATGC+AGG + Chr8:18350481-18350500 MsG0880043062.01.T01:intron 30.0%
AAATTAGGTCAAGGAGGATA+TGG + Chr8:18350721-18350740 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
AACCAGTCAAACATTTCTGA+TGG - Chr8:18349164-18349183 None:intergenic 35.0%
AAGGTCAAGCTAATTACAAG+AGG + Chr8:18349923-18349942 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAACTCATTACTGCGAA+TGG + Chr8:18348775-18348794 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
ACCAATACCTGTGTTTCATA+AGG + Chr8:18349520-18349539 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAAACCGTATGCAAGTT+CGG - Chr8:18349188-18349207 None:intergenic 35.0%
AGAAAGAATTATGACACTGG+AGG + Chr8:18351312-18351331 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
AGATGGTTCAAAGCAAACAT+AGG - Chr8:18350169-18350188 None:intergenic 35.0%
ATAAACGAGTCCAAAGGAAA+TGG + Chr8:18350796-18350815 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGTAGCTTCAAGATCGA+GGG - Chr8:18349126-18349145 None:intergenic 35.0%
CAACTCTTATTAGACTCTCT+TGG + Chr8:18350035-18350054 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CAAGATAAATTAGGTCAAGG+AGG + Chr8:18350715-18350734 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CCAATACCTGTGTTTCATAA+GGG + Chr8:18349521-18349540 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CTCAGAGGAAGAAAATGATA+TGG + Chr8:18351419-18351438 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CTCCTTGACCTAATTTATCT+TGG - Chr8:18350717-18350736 None:intergenic 35.0%
CTCTTGGAAAATCTGTAGTA+AGG + Chr8:18349243-18349262 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAATGTTCTTTCCTGAT+TGG + Chr8:18351346-18351365 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CTTCATAACAATTCACTCAC+CGG + Chr8:18348912-18348931 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
CTTGACCTTGGATGAAAATT+TGG - Chr8:18349912-18349931 None:intergenic 35.0%
CTTTCACACAACAACATTAG+TGG + Chr8:18349206-18349225 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGAATTATGACACTGGA+GGG + Chr8:18351313-18351332 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
GAATTCTTCTCCATTTCCTT+TGG - Chr8:18350809-18350828 None:intergenic 35.0%
GGAGAATATAAGAAAGGCTT+TGG - Chr8:18351561-18351580 None:intergenic 35.0%
GTTAGTTAGATTGGTGAGAA+CGG - Chr8:18348886-18348905 None:intergenic 35.0%
TATCACCAAAATGGATCTTC+GGG + Chr8:18350575-18350594 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
TATTGGAAACATCAAGAAGG+AGG - Chr8:18349868-18349887 None:intergenic 35.0%
TATTTGTAGCTTCAAGATCG+AGG - Chr8:18349127-18349146 None:intergenic 35.0%
TTAACACCCTTATGAAACAC+AGG - Chr8:18349530-18349549 None:intergenic 35.0%
TTGGTCCTTGAAGAAAATTC+TGG - Chr8:18349505-18349524 None:intergenic 35.0%
! ACACTTGATTCGTACCTTAT+CGG - Chr8:18349687-18349706 None:intergenic 35.0%
! ACCATCTCTTTTATGTCAAG+GGG + Chr8:18350182-18350201 MsG0880043062.01.T01:intron 35.0%
! ACTTCCCAAATTTTCATCCA+AGG + Chr8:18349904-18349923 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
! CAAACCCCAAAACATTCTTT+TGG + Chr8:18351089-18351108 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
! GAACCATCTCTTTTATGTCA+AGG + Chr8:18350180-18350199 MsG0880043062.01.T01:intron 35.0%
! GAATATAAGAAAGGCTTTGG+AGG - Chr8:18351558-18351577 None:intergenic 35.0%
! TACTTTTGTCGAAGAGATGT+TGG + Chr8:18349569-18349588 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTGTAATTAGCTTGACCT+TGG - Chr8:18349924-18349943 None:intergenic 35.0%
! TGCCCAAAAATCTCAGATTT+TGG + Chr8:18351123-18351142 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGGCCAGAATTTTCTTCA+AGG + Chr8:18349497-18349516 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTGTTTCATAAGGGTGTTA+AGG + Chr8:18349529-18349548 MsG0880043062.01.T01:CDS 35.0%
AATGACCAGGGGATATATAG+TGG + Chr8:18349278-18349297 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
AATGCAGCTACTTCTCATGA+TGG + Chr8:18349998-18350017 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
ACTCATTACTGCGAATGGAA+CGG + Chr8:18348780-18348799 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
AGCCTGAAGAACATCTCTTT+AGG + Chr8:18349479-18349498 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
AGTTCACTGAAATCAGGCAA+AGG - Chr8:18348939-18348958 None:intergenic 40.0%
ATAACTTGAATCTCTCGCCA+TGG + Chr8:18349060-18349079 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
ATGACCAGGGGATATATAGT+GGG + Chr8:18349279-18349298 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
ATTCATGCCCAAAGGATCAT+TGG + Chr8:18350924-18350943 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGAAAATGCAGGAGAGA+TGG - Chr8:18349762-18349781 None:intergenic 40.0%
CCCTTATGAAACACAGGTAT+TGG - Chr8:18349524-18349543 None:intergenic 40.0%
CTAGAGAGAATGAACAACGA+AGG - Chr8:18349461-18349480 None:intergenic 40.0%
CTTCAGTACAATTGCTTCAC+TGG + Chr8:18349425-18349444 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
GAATGGAATTGGACATGTCA+GGG - Chr8:18349388-18349407 None:intergenic 40.0%
GACGATCCAAAGCAAAATTC+TGG - Chr8:18349011-18349030 None:intergenic 40.0%
GGACTAGAATACTTGCATCA+AGG + Chr8:18351036-18351055 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
GGCTCAAATATGCCAAAGAA+AGG + Chr8:18351149-18351168 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
GGGAGAAAGAATTATGACAC+TGG + Chr8:18351309-18351328 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
GTACGAATCAAGTGTCAAAG+AGG + Chr8:18349692-18349711 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
TACCAACGAGTGAACTTGAT+GGG - Chr8:18348845-18348864 None:intergenic 40.0%
TCCCCTTGACATAAAAGAGA+TGG - Chr8:18350186-18350205 None:intergenic 40.0%
TCTCAACAACAATTAGGTGG+AGG + Chr8:18349971-18349990 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
TGAATGGAATTGGACATGTC+AGG - Chr8:18349389-18349408 None:intergenic 40.0%
TGAGAACGGAGATATAGTGA+GGG - Chr8:18348872-18348891 None:intergenic 40.0%
TGCCATCAGAAATGTTTGAC+TGG + Chr8:18349159-18349178 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
TTGAGCAAAATCGTGACTTG+AGG - Chr8:18349605-18349624 None:intergenic 40.0%
TTGATGTGATATCGTCCATG+AGG + Chr8:18349315-18349334 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
! ACAAGAGGCAATGCTTTGTT+TGG + Chr8:18349938-18349957 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
! ACAGATTTTCCAAGAGACAG+CGG - Chr8:18349239-18349258 None:intergenic 40.0%
! ACTTTCCCGAAGATCCATTT+TGG - Chr8:18350583-18350602 None:intergenic 40.0%
! GAACAATGCTTGTACCGATA+AGG + Chr8:18349670-18349689 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
! GAGCAATGCCAATTGCTATT+TGG - Chr8:18351014-18351033 None:intergenic 40.0%
! GTACAATTGCTTCACTGGTT+TGG + Chr8:18349430-18349449 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGAACATCGTCTCACTTT+TGG + Chr8:18350864-18350883 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGAAAGGCTTTGGAGGATA+AGG - Chr8:18351552-18351571 None:intergenic 40.0%
!! ATAAGGGTGTTAAGGCGAAT+TGG + Chr8:18349537-18349556 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
!! CTCATGGTTGGTCTATCTAA+TGG - Chr8:18351489-18351508 None:intergenic 40.0%
!! GTGAACATCGTCTCACTTTT+GGG + Chr8:18350865-18350884 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
!! TAAGGGTGTTAAGGCGAATT+GGG + Chr8:18349538-18349557 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGCTTTGGATCGTCAGA+AGG + Chr8:18349014-18349033 MsG0880043062.01.T01:CDS 40.0%
AATGTCCGGCTAAACACTTC+TGG - Chr8:18351225-18351244 None:intergenic 45.0%
ACATCAAGAAGGAGGAGTTG+AGG - Chr8:18349860-18349879 None:intergenic 45.0%
ACTGAAATCAGGCAAAGGAC+CGG - Chr8:18348934-18348953 None:intergenic 45.0%
AGGAAACTCCACCAAATGTC+CGG - Chr8:18351239-18351258 None:intergenic 45.0%
ATAGCAATTGGCATTGCTCG+AGG + Chr8:18351015-18351034 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
ATCGTGACTTGAGGATCACA+AGG - Chr8:18349596-18349615 None:intergenic 45.0%
ATCTACCACTGACGACAATG+TGG + Chr8:18350609-18350628 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGCACACGAGGAACTAT+TGG + Chr8:18351189-18351208 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
CTGGTTTCCGAACTTGCATA+CGG + Chr8:18349178-18349197 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
GAATTGGACATGTCAGGGAT+TGG - Chr8:18349383-18349402 None:intergenic 45.0%
GAGAGAATGAACAACGAAGG+CGG - Chr8:18349458-18349477 None:intergenic 45.0%
GGCAAAGTTGTGAGACTATG+TGG - Chr8:18349839-18349858 None:intergenic 45.0%
GGCCTAAAGAGATGTTCTTC+AGG - Chr8:18349484-18349503 None:intergenic 45.0%
GTACCAACGAGTGAACTTGA+TGG - Chr8:18348846-18348865 None:intergenic 45.0%
GTCAAGGGGAAAAGAGATTG+TGG + Chr8:18350196-18350215 MsG0880043062.01.T01:intron 45.0%
GTGAGAACGGAGATATAGTG+AGG - Chr8:18348873-18348892 None:intergenic 45.0%
GTTTCTATGATTGGCACACG+AGG + Chr8:18351180-18351199 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
TAAGCCCACTATATATCCCC+TGG - Chr8:18349286-18349305 None:intergenic 45.0%
TACAAAGCAAGCTTACCCGA+TGG + Chr8:18350751-18350770 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
TACTTACGGCTCAATGACCA+GGG + Chr8:18349266-18349285 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
TCGCTTGAAACGGTGTATCT+TGG + Chr8:18348963-18348982 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
TTGCCAATATAGTCGAGTCG+TGG + Chr8:18348809-18348828 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
TTGCCACGACTCGACTATAT+TGG - Chr8:18348815-18348834 None:intergenic 45.0%
! GAAGTGTTTAGCCGGACATT+TGG + Chr8:18351225-18351244 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
! GGGACATCCTTGTTTAGTGT+TGG + Chr8:18350502-18350521 MsG0880043062.01.T01:intron 45.0%
!! GGGATATATAGTGGGCTTAC+GGG + Chr8:18349287-18349306 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
!! GGGGATATATAGTGGGCTTA+CGG + Chr8:18349286-18349305 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTTTGTTAGACCAGCCAGA+GGG - Chr8:18348762-18348781 None:intergenic 45.0%
!! TGGCTTCGGTATAACTTGCT+CGG + Chr8:18349353-18349372 MsG0880043062.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGTTTTGTTAGACCAGCCAG+AGG - Chr8:18348763-18348782 None:intergenic 45.0%
!! TTATAAAAATGATATATTAT+TGG + Chr8:18350264-18350283 MsG0880043062.01.T01:intron 5.0%
ACTTACGGCTCAATGACCAG+GGG + Chr8:18349267-18349286 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
ATCCTCCACATTGTCGTCAG+TGG - Chr8:18350617-18350636 None:intergenic 50.0%
CACCTGTGACAAGAACCTCA+TGG - Chr8:18349333-18349352 None:intergenic 50.0%
CTCCCATCAAGTTCACTCGT+TGG + Chr8:18348840-18348859 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
GCAGCTACTTCTCATGATGG+AGG + Chr8:18350001-18350020 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
GTACTTACGGCTCAATGACC+AGG + Chr8:18349265-18349284 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
GTCCATGAGGTTCTTGTCAC+AGG + Chr8:18349328-18349347 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
GTGTTTAGCCGGACATTTGG+TGG + Chr8:18351228-18351247 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
TACCACTGACGACAATGTGG+AGG + Chr8:18350612-18350631 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGTCACAGGTGTGGCTT+CGG + Chr8:18349339-18349358 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
TGAGGTTCTTGTCACAGGTG+TGG + Chr8:18349333-18349352 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
! ACTGCTACTTGACGACCATC+GGG - Chr8:18350769-18350788 None:intergenic 50.0%
! ATCGAGGGTATGTAGCAACG+AGG - Chr8:18349111-18349130 None:intergenic 50.0%
! CACTGCTACTTGACGACCAT+CGG - Chr8:18350770-18350789 None:intergenic 50.0%
!! CTTCGGTATAACTTGCTCGG+GGG + Chr8:18349356-18349375 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
!! GCTTCGGTATAACTTGCTCG+GGG + Chr8:18349355-18349374 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
!! GGATAAGGCACTGACTGAAG+TGG - Chr8:18351537-18351556 None:intergenic 50.0%
!! GGCTTCGGTATAACTTGCTC+GGG + Chr8:18349354-18349373 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
!! TAGCGCCAGAAGTGTTTAGC+CGG + Chr8:18351217-18351236 MsG0880043062.01.T01:CDS 50.0%
TAGACCAGCCAGAGGGAGTT+GGG - Chr8:18348755-18348774 None:intergenic 55.0%
TTAGACCAGCCAGAGGGAGT+TGG - Chr8:18348756-18348775 None:intergenic 55.0%
AGACCAGCCAGAGGGAGTTG+GGG - Chr8:18348754-18348773 None:intergenic 60.0%
GGAACTCTGCCGCTGTCTCT+TGG + Chr8:18349227-18349246 MsG0880043062.01.T01:CDS 60.0%
! GCATTGACCCCAACTCCCTC+TGG + Chr8:18348744-18348763 MsG0880043062.01.T01:CDS 60.0%
TGACCCCAACTCCCTCTGGC+TGG + Chr8:18348748-18348767 MsG0880043062.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 18348597 18351650 18348597 ID=MsG0880043062.01;Name=MsG0880043062.01
Chr8 mRNA 18348597 18351650 18348597 ID=MsG0880043062.01.T01;Parent=MsG0880043062.01;Name=MsG0880043062.01.T01;_AED=0.42;_eAED=0.42;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|871
Chr8 exon 18348597 18350064 18348597 ID=MsG0880043062.01.T01:exon:3622;Parent=MsG0880043062.01.T01
Chr8 exon 18350503 18351650 18350503 ID=MsG0880043062.01.T01:exon:3623;Parent=MsG0880043062.01.T01
Chr8 CDS 18348597 18350064 18348597 ID=MsG0880043062.01.T01:cds;Parent=MsG0880043062.01.T01
Chr8 CDS 18350503 18351650 18350503 ID=MsG0880043062.01.T01:cds;Parent=MsG0880043062.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880043062.01.T01

TTGTTACATTCAGTTCAATTAAACATGAACACATCAATCCATGTATCTGTTTTGTTTTCAACCCTCTTGTTCATTGTTAATGTTAGTGTTGGTGCTATTATTGATGCAAAATACGAACAGACAGATTACATGTCTGATCTATTGAAAGCATTGACCCCAACTCCCTCTGGCTGGTCTAACAAAACTCATTACTGCGAATGGAACGGCGTTGTTTGCCAATATAGTCGAGTCGTGGCAATTAGTCTCCCATCAAGTTCACTCGTTGGTACACTCCCTCACTATATCTCCGTTCTCACCAATCTAACTAACATCGATCTTCATAACAATTCACTCACCGGTCCTTTGCCTGATTTCAGTGAACTATTTTCGCTTGAAACGGTGTATCTTGGTCACAATAACTTCACCTCTATTCCAGAATTTTGCTTTGGATCGTCAGAAGGTCTGCGAAACCTCAATCTTAGCAATAACTTGAATCTCTCGCCATGGATATTTTCTAGTCATTTAATTGACTCCTCGTTGCTACATACCCTCGATCTTGAAGCTACAAATATAATAGGCTCTTTGCCATCAGAAATGTTTGACTGGTTTCCGAACTTGCATACGGTTTTTCTTTCACACAACAACATTAGTGGAACTCTGCCGCTGTCTCTTGGAAAATCTGTAGTAAGGTACTTACGGCTCAATGACCAGGGGATATATAGTGGGCTTACGGGTACAATTGATGTGATATCGTCCATGAGGTTCTTGTCACAGGTGTGGCTTCGGTATAACTTGCTCGGGGGTCCAATCCCTGACATGTCCAATTCCATTCATTTGTTTGATCTTCAGCTTCAGTACAATTGCTTCACTGGTTTGGTTCCGCCTTCGTTGTTCATTCTCTCTAGCCTGAAGAACATCTCTTTAGGCCAGAATTTTCTTCAAGGACCAATACCTGTGTTTCATAAGGGTGTTAAGGCGAATTGGGAAACAAATTACTTTTGTCGAAGAGATGTTGGACCTTGTGATCCTCAAGTCACGATTTTGCTCAAAATATTTGAAGCTTTTGGGTATCCTCGTTTGTTGTTAATTAAAGGGAACAATGCTTGTACCGATAAGGTACGAATCAAGTGTCAAAGAGGAAAGATTGTGAGCATTAATTTAGGGAATTTGACATTAAAGGGAACCATCTCTCCTGCATTTTCCAATTTATCAAGTTTAGTCAACTTGACTCTTTCCAACAATAATTTGACAGGTTCAATACCACATAGTCTCACAACTTTGCCTCAACTCCTCCTTCTTGATGTTTCCAATAATAATCTTTCAGGACAACTTCCCAAATTTTCATCCAAGGTCAAGCTAATTACAAGAGGCAATGCTTTGTTTGGCCTAAATATTTCTCAACAACAATTAGGTGGAGGACAAAATGCAGCTACTTCTCATGATGGAGGCCATTCTAAAACAACTCTTATTAGACTCTCTTGGATTATAGGGACATCCTTGTTTAGTGTTGGAATTGTAATACTAATTGTGAGTATTTGTAAAAGTAAGAGATATCCTATTTTATCACCAAAATGGATCTTCGGGAAAGTGATAAAATCTACCACTGACGACAATGTGGAGGATTTTATACAAAGTTATAATTTGTCGGTGGCAATTAAGCAATATAGATATTCAGAAGTGAAAAGAATGACAAATTCATTCCAAGATAAATTAGGTCAAGGAGGATATGGTGTTGTGTACAAAGCAAGCTTACCCGATGGTCGTCAAGTAGCAGTGAAAATAATAAACGAGTCCAAAGGAAATGGAGAAGAATTCATAAATGAAGTGGCTAGCATTAGTAGAACGTCACATGTGAACATCGTCTCACTTTTGGGATTTTGTTATGAGAACAAAAGAGCACTAATATATGAATTCATGCCCAAAGGATCATTGGATAATTTCATCTTTAAAAGTGGATTTCCTGATGCTATTTGTAATTTGGATTGGAAAACATTATACCAAATAGCAATTGGCATTGCTCGAGGACTAGAATACTTGCATCAAGGATGTACTTCAAGAATTTTGCATCTTGATATCAAACCCCAAAACATTCTTTTGGATGAAGATTTTTGCCCAAAAATCTCAGATTTTGGACTGGCTCAAATATGCCAAAGAAAGGATAGTATTGTTTCTATGATTGGCACACGAGGAACTATTGGATACATAGCGCCAGAAGTGTTTAGCCGGACATTTGGTGGAGTTTCCTATAAGTCTGATGTATACAGTTATGGTATGTTAATCATAGAAATGATTGGAGGGAGAAAGAATTATGACACTGGAGGGTCATGTACTTCTGAAATGTTCTTTCCTGATTGGATTTATAAGGATCTCGAGCTAAATAATAACAATGTAGATTGTTTAGTAATCTCAGAGGAAGAAAATGATATGGTAAGAAAGATTACTATGGTTAGTCTATGGTGCATTCAAACAAATCCATTAGATAGACCAACCATGAGTAAAGTAATAGAAATGCTACAAGGACCACTTCAGTCAGTGCCTTATCCTCCAAAGCCTTTCTTATATTCTCCTCAAATGTCATCATTACAAACTTCACATGTGTCTTCTAGCAATTTGTTAGAGAAAAACTCAATACCTTAA
Protein sequence

>MsG0880043062.01.T01

LLHSVQLNMNTSIHVSVLFSTLLFIVNVSVGAIIDAKYEQTDYMSDLLKALTPTPSGWSNKTHYCEWNGVVCQYSRVVAISLPSSSLVGTLPHYISVLTNLTNIDLHNNSLTGPLPDFSELFSLETVYLGHNNFTSIPEFCFGSSEGLRNLNLSNNLNLSPWIFSSHLIDSSLLHTLDLEATNIIGSLPSEMFDWFPNLHTVFLSHNNISGTLPLSLGKSVVRYLRLNDQGIYSGLTGTIDVISSMRFLSQVWLRYNLLGGPIPDMSNSIHLFDLQLQYNCFTGLVPPSLFILSSLKNISLGQNFLQGPIPVFHKGVKANWETNYFCRRDVGPCDPQVTILLKIFEAFGYPRLLLIKGNNACTDKVRIKCQRGKIVSINLGNLTLKGTISPAFSNLSSLVNLTLSNNNLTGSIPHSLTTLPQLLLLDVSNNNLSGQLPKFSSKVKLITRGNALFGLNISQQQLGGGQNAATSHDGGHSKTTLIRLSWIIGTSLFSVGIVILIVSICKSKRYPILSPKWIFGKVIKSTTDDNVEDFIQSYNLSVAIKQYRYSEVKRMTNSFQDKLGQGGYGVVYKASLPDGRQVAVKIINESKGNGEEFINEVASISRTSHVNIVSLLGFCYENKRALIYEFMPKGSLDNFIFKSGFPDAICNLDWKTLYQIAIGIARGLEYLHQGCTSRILHLDIKPQNILLDEDFCPKISDFGLAQICQRKDSIVSMIGTRGTIGYIAPEVFSRTFGGVSYKSDVYSYGMLIIEMIGGRKNYDTGGSCTSEMFFPDWIYKDLELNNNNVDCLVISEEENDMVRKITMVSLWCIQTNPLDRPTMSKVIEMLQGPLQSVPYPPKPFLYSPQMSSLQTSHVSSSNLLEKNSIP*