AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180006181.01

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MsG0180006181.01.T01 AT5G38280 59.227 233 84 3 212 443 309 531 4.50e-90 293
MsG0180006181.01.T01 AT1G66910 51.087 276 120 5 173 443 282 547 2.01e-89 291
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MsG0180006181.01.T01 AT5G38240 53.030 264 95 4 183 443 291 528 4.82e-88 287
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MsG0180006181.01.T01 AT1G66930 48.185 303 135 8 181 480 506 789 9.29e-83 278
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MsG0180006181.01.T01 AT5G24080 47.748 222 110 4 227 447 390 606 4.14e-60 214
MsG0180006181.01.T01 AT5G24080 47.748 222 110 4 227 447 517 733 1.38e-59 214
MsG0180006181.01.T01 AT1G34300 41.975 243 136 2 205 447 449 686 1.95e-59 213
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MsG0180006181.01.T01 AT1G16670 43.243 222 120 4 230 448 29 247 4.95e-53 187
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MsG0180006181.01.T01 AT1G56130 42.742 248 125 7 205 447 660 895 2.00e-52 195
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MsG0180006181.01.T01 AT1G11330 35.693 339 195 10 144 467 415 745 2.25e-51 191
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MsG0180006181.01.T01 AT4G23270 41.564 243 130 5 229 468 313 546 2.98e-51 187
MsG0180006181.01.T01 AT4G23270 41.564 243 130 5 229 468 313 546 3.45e-51 187
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MsG0180006181.01.T01 AT4G23320 38.376 271 152 6 206 470 147 408 5.07e-51 184
MsG0180006181.01.T01 AT3G26940 45.249 221 108 8 230 444 62 275 6.03e-51 182
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MsG0180006181.01.T01 AT1G61370 43.568 241 125 7 230 465 338 572 1.45e-48 180
MsG0180006181.01.T01 AT5G38560 44.643 224 112 6 230 448 327 543 1.53e-48 181
MsG0180006181.01.T01 AT4G04490 45.070 213 109 5 241 450 341 548 1.64e-48 180
MsG0180006181.01.T01 AT1G26150 42.324 241 121 7 230 465 418 645 1.82e-48 181
MsG0180006181.01.T01 AT3G18810 45.575 226 109 8 230 450 325 541 2.13e-48 181
MsG0180006181.01.T01 AT1G70740 44.118 204 103 5 245 445 55 250 2.31e-48 175
MsG0180006181.01.T01 AT3G24540 37.500 296 151 10 165 448 112 385 2.81e-48 176
MsG0180006181.01.T01 AT4G11460 40.496 242 138 4 229 467 333 571 3.33e-48 180
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MsG0180006181.01.T01 AT4G04540 40.000 245 136 5 207 445 315 554 3.65e-48 178
MsG0180006181.01.T01 AT4G02630 43.946 223 114 6 230 447 150 366 3.68e-48 176
MsG0180006181.01.T01 AT1G49730 36.268 284 170 5 169 447 254 531 4.13e-48 179
MsG0180006181.01.T01 AT1G01540 44.889 225 112 6 228 447 140 357 4.28e-48 173
MsG0180006181.01.T01 AT4G38830 41.991 231 123 6 241 468 345 567 4.51e-48 179
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MsG0180006181.01.T01 AT1G61430 40.433 277 145 8 208 471 425 694 4.73e-48 180
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MsG0180006181.01.T01 AT1G61360 39.700 267 147 7 184 444 359 617 1.20e-46 176
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MsG0180006181.01.T01 AT4G00960 39.815 216 120 6 232 442 46 256 1.67e-46 166
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MsG0180006181.01.T01 AT4G11900 47.248 218 99 8 234 444 460 668 2.06e-46 176
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MsG0180006181.01.T01 AT4G23160 40.909 242 127 7 232 467 349 580 2.58e-46 174
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MsG0180006181.01.T01 AT1G61490 45.982 224 101 7 230 444 452 664 3.12e-46 175
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MsG0180006181.01.T01 AT5G56890 37.282 287 161 9 228 507 709 983 4.04e-46 176
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MsG0180006181.01.T01 AT1G68690 43.750 224 111 8 230 448 365 578 4.24e-46 174
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MsG0180006181.01.T01 AT2G28250 37.276 279 152 9 229 494 197 465 5.09e-45 169
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MsG0180006181.01.T01 AT2G28250 37.276 279 152 9 229 494 197 465 5.09e-45 169
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MsG0180006181.01.T01 AT1G56720 40.889 225 121 7 230 449 167 384 7.25e-45 167
MsG0180006181.01.T01 AT1G56720 40.889 225 121 7 230 449 167 384 7.25e-45 167
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MsG0180006181.01.T01 AT5G59670 39.819 221 127 3 221 440 545 760 7.28e-45 172
MsG0180006181.01.T01 AT5G65240 41.518 224 122 5 228 447 270 488 7.40e-45 169
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MsG0180006181.01.T01 AT4G04960 37.319 276 158 9 182 449 286 554 1.66e-44 167
MsG0180006181.01.T01 AT5G65600 33.876 307 180 9 173 470 288 580 1.82e-44 169
MsG0180006181.01.T01 AT5G60080 42.424 231 118 8 246 465 79 305 1.84e-44 163
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MsG0180006181.01.T01 AT1G53420 34.954 329 189 11 168 491 557 865 1.91e-44 171
MsG0180006181.01.T01 AT3G46330 43.304 224 116 6 228 447 530 746 2.32e-44 170
MsG0180006181.01.T01 AT5G18910 40.693 231 121 7 228 452 178 398 2.42e-44 166
MsG0180006181.01.T01 AT5G10530 32.099 324 200 8 152 469 249 558 2.61e-44 168
MsG0180006181.01.T01 AT4G27290 43.842 203 108 3 244 445 469 666 2.77e-44 169
MsG0180006181.01.T01 AT2G42960 38.828 273 145 10 230 495 171 428 2.97e-44 165
MsG0180006181.01.T01 AT2G42960 38.828 273 145 10 230 495 171 428 2.97e-44 165
MsG0180006181.01.T01 AT2G42960 38.828 273 145 10 230 495 171 428 2.97e-44 165
MsG0180006181.01.T01 AT2G42960 38.828 273 145 10 230 495 171 428 2.97e-44 165
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MsG0180006181.01.T01 AT2G28970 39.908 218 121 4 229 443 468 678 3.20e-42 163
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MsG0180006181.01.T01 AT4G29180 37.931 232 124 3 228 445 552 777 3.22e-42 164
MsG0180006181.01.T01 AT4G29050 37.079 267 140 11 184 444 313 557 3.26e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT1G07650 38.306 248 139 7 203 445 429 667 3.37e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT3G59350 37.945 253 140 9 231 474 60 304 3.53e-42 156
MsG0180006181.01.T01 AT5G53890 39.149 235 133 7 228 459 740 967 3.55e-42 164
MsG0180006181.01.T01 AT4G29180 37.931 232 124 3 228 445 555 780 3.56e-42 164
MsG0180006181.01.T01 AT3G46370 37.358 265 155 7 203 463 449 706 3.63e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT3G46370 37.358 265 155 7 203 463 449 706 3.63e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT5G57670 40.455 220 119 5 230 444 255 467 3.69e-42 161
MsG0180006181.01.T01 AT1G66150 37.083 240 136 8 231 464 577 807 3.74e-42 164
MsG0180006181.01.T01 AT2G04300 35.926 270 153 7 203 463 502 760 4.03e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT3G53380 35.231 281 155 9 227 489 361 632 4.44e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT2G28960 37.302 252 135 7 204 443 532 772 4.44e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT3G25560 35.769 260 151 6 228 483 298 545 4.45e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT1G07650 38.306 248 139 7 203 445 648 886 4.50e-42 164
MsG0180006181.01.T01 AT5G03140 32.903 310 181 9 166 468 310 599 4.52e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT1G07650 38.306 248 139 7 203 445 642 880 4.55e-42 164
MsG0180006181.01.T01 AT5G56790 40.506 237 124 9 227 456 375 601 4.56e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT1G51810 37.815 238 140 4 228 463 438 669 4.69e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT4G23300 38.525 244 141 5 229 468 340 578 4.71e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT3G25560 35.769 260 151 6 228 483 298 545 4.96e-42 161
MsG0180006181.01.T01 AT1G07650 38.306 248 139 7 203 445 616 854 5.14e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT3G25560 35.769 260 151 6 228 483 299 546 5.16e-42 161
MsG0180006181.01.T01 AT2G04300 35.926 270 153 7 203 463 543 801 5.31e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT2G30730 36.078 255 146 9 231 476 36 282 5.36e-42 155
MsG0180006181.01.T01 AT1G07570 39.574 235 120 9 228 447 54 281 5.54e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT1G07570 39.574 235 120 9 228 447 54 281 5.54e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT1G07570 39.574 235 120 9 228 447 54 281 5.54e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT3G59350 37.945 253 140 9 231 474 117 361 6.64e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT5G16500 34.722 288 174 9 228 510 60 338 6.87e-42 161
MsG0180006181.01.T01 AT4G20450 41.121 214 120 4 228 440 579 787 7.17e-42 163
MsG0180006181.01.T01 AT3G59350 37.945 253 140 9 231 474 102 346 7.25e-42 155
MsG0180006181.01.T01 AT1G07570 39.574 235 120 9 228 447 65 292 8.59e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT4G29450 39.130 230 121 5 228 444 554 777 8.85e-42 162
MsG0180006181.01.T01 AT2G02800 37.768 233 125 7 228 447 69 294 9.47e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT2G02800 37.768 233 125 7 228 447 69 294 9.47e-42 157
MsG0180006181.01.T01 AT1G70520 41.553 219 119 5 230 445 313 525 9.73e-42 160
MsG0180006181.01.T01 AT3G59350 37.945 253 140 9 231 474 102 346 1.03e-41 156
MsG0180006181.01.T01 AT3G59350 37.945 253 140 9 231 474 102 346 1.03e-41 156
MsG0180006181.01.T01 AT3G59740 34.812 293 173 9 197 483 291 571 1.06e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT2G28930 40.000 235 119 9 228 447 55 282 1.16e-41 156
MsG0180006181.01.T01 AT4G28350 33.121 314 171 11 173 477 292 575 1.25e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT2G30730 36.078 255 146 9 231 476 46 292 1.27e-41 154
MsG0180006181.01.T01 AT1G48210 39.819 221 122 7 234 447 60 276 1.31e-41 153
MsG0180006181.01.T01 AT1G48210 39.819 221 122 7 234 447 60 276 1.31e-41 153
MsG0180006181.01.T01 AT1G48210 39.819 221 122 7 234 447 60 276 1.31e-41 153
MsG0180006181.01.T01 AT2G28930 40.000 235 119 9 228 447 58 285 1.37e-41 156
MsG0180006181.01.T01 AT4G02010 33.636 330 188 14 176 491 313 625 1.39e-41 161
MsG0180006181.01.T01 AT1G78530 38.073 218 119 6 233 447 70 274 1.50e-41 152
MsG0180006181.01.T01 AT1G51820 35.145 276 157 8 203 463 267 535 1.56e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT2G14440 34.416 308 176 8 141 443 476 762 1.58e-41 162
MsG0180006181.01.T01 AT1G55200 38.000 250 135 10 213 456 355 590 1.67e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT1G55200 38.000 250 135 10 213 456 355 590 1.67e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT1G55200 38.000 250 135 10 213 456 355 590 1.67e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT1G55200 38.000 250 135 10 213 456 355 590 1.67e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT1G29740 40.991 222 115 7 230 445 665 876 1.90e-41 162
MsG0180006181.01.T01 AT3G17410 36.800 250 143 8 234 476 61 302 2.06e-41 154
MsG0180006181.01.T01 AT3G17410 36.800 250 143 8 234 476 61 302 2.06e-41 154
MsG0180006181.01.T01 AT2G28930 40.000 235 119 9 228 447 66 293 2.09e-41 155
MsG0180006181.01.T01 AT5G60300 35.656 244 142 8 204 444 310 541 2.25e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT5G60300 35.656 244 142 8 204 444 310 541 2.25e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT1G30570 32.390 318 186 9 174 472 437 744 2.25e-41 161
MsG0180006181.01.T01 AT3G45420 37.097 248 142 7 203 447 314 550 2.25e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT4G02410 34.926 272 146 12 180 444 307 554 2.42e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT1G29740 40.455 220 119 6 230 445 665 876 2.53e-41 161
MsG0180006181.01.T01 AT1G11410 35.362 345 191 10 125 445 273 609 2.88e-41 160
MsG0180006181.01.T01 AT5G56460 39.921 253 122 11 230 466 64 302 3.40e-41 155
MsG0180006181.01.T01 AT3G25490 33.333 330 175 13 230 527 96 412 3.76e-41 155

Find 125 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 388 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGATTATTTGTCACCTTAAA+AGG 0.194619 1:-101060256 MsG0180006181.01.T01:CDS
TTCAAACTTTAAGATAAATT+TGG 0.203865 1:-101057273 MsG0180006181.01.T01:CDS
TCTATTAACCAGTCCGAATT+TGG 0.221592 1:-101057335 MsG0180006181.01.T01:CDS
TACATAAATTCAGGTGTTTC+AGG 0.234662 1:-101060317 MsG0180006181.01.T01:intron
TCTCTATAACTATATCTTCT+TGG 0.248469 1:+101060140 None:intergenic
TAGCAATGCCAATTGCAATT+TGG 0.264775 1:+101059793 None:intergenic
TGTCAAAGGTGCGTTGTTTC+TGG 0.267327 1:-101062938 MsG0180006181.01.T01:CDS
CACAGAAGCTCAGAGTTATT+AGG 0.268971 1:-101063309 MsG0180006181.01.T01:CDS
CAAACCTCAAAACATTCTTT+TGG 0.269781 1:-101059715 MsG0180006181.01.T01:CDS
TTGAAATGGACAGGAGATTA+TGG 0.274753 1:-101062965 MsG0180006181.01.T01:intron
ATTCAAGAATACTGTATTTC+AGG 0.295729 1:+101063344 None:intergenic
ATAGTTATAGAGAAATAAAA+AGG 0.341986 1:-101060130 MsG0180006181.01.T01:CDS
AAATTAGGCCAAGGAGGATA+TGG 0.353084 1:-101060086 MsG0180006181.01.T01:CDS
ACAGAAGCTCAGAGTTATTA+GGG 0.356526 1:-101063308 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGTGAATGATGATCCTAATA+TGG 0.362005 1:-101063416 MsG0180006181.01.T01:CDS
TCACATGTGAGTTCCATATT+AGG 0.371665 1:+101063403 None:intergenic
AATTCAGGTGTTTCAGGATC+TGG 0.372721 1:-101060311 MsG0180006181.01.T01:intron
AAAGTAATAAACGAGGTAAA+GGG 0.389721 1:-101060017 MsG0180006181.01.T01:CDS
TCCGGGTAAGTAGCTGTATC+AGG 0.396928 1:+101063095 None:intergenic
AAGAGGAACCATAGGATATA+TGG 0.399896 1:-101059607 MsG0180006181.01.T01:CDS
GAGACATGATGGTATAATAT+TGG 0.402685 1:+101063555 None:intergenic
AGAATTATCCATTGTTAACT+TGG 0.404311 1:+101063369 None:intergenic
AATGCTCTACTATATACTTC+TGG 0.404792 1:+101059582 None:intergenic
AGCCATGATATTGCCAAATT+CGG 0.406026 1:+101057322 None:intergenic
AACTCATTCCGAGATAAATT+AGG 0.407588 1:-101060101 MsG0180006181.01.T01:CDS
ACACAACACTATCCTTCCTT+TGG 0.407624 1:+101059643 None:intergenic
CAAACCTCAAGTATCCGTTC+TGG 0.410193 1:-101063465 MsG0180006181.01.T01:CDS
GAAGTATATAGTAGAGCATT+TGG 0.410888 1:-101059579 MsG0180006181.01.T01:CDS
GAACTGATCCAACGATCCTT+GGG 0.413084 1:+101059872 None:intergenic
CCATTGGAAGCAGAGGCGTT+GGG 0.427225 1:-101057455 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGAAATACAGTATTCTTGAA+TGG 0.429105 1:-101063342 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGAACTGATCCAACGATCCT+TGG 0.429978 1:+101059871 None:intergenic
TTTATTACTTTAACAGCCAC+TGG 0.433130 1:+101060029 None:intergenic
ACTTTGTTCCAAATTGCAAT+TGG 0.436181 1:-101059801 MsG0180006181.01.T01:CDS
GAATTATCCATTGTTAACTT+GGG 0.437888 1:+101063370 None:intergenic
TTCCGATGTTTCTGTAAAGA+TGG 0.439840 1:-101062884 MsG0180006181.01.T01:CDS
CACCTTAAAAGGAGTACATC+TGG 0.443375 1:-101060245 MsG0180006181.01.T01:CDS
ATTGCAATTGGCATTGCTAA+AGG 0.444814 1:-101059789 MsG0180006181.01.T01:CDS
ATTATTTACATACTTGAGGC+TGG 0.446730 1:+101062829 None:intergenic
GCCATTGGAAGCAGAGGCGT+TGG 0.451938 1:-101057456 MsG0180006181.01.T01:CDS
TAAAGTAATAAACGAGGTAA+AGG 0.460988 1:-101060018 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGAAACAGTGGCAGGCTGTT+CGG 0.464929 1:-101057675 MsG0180006181.01.T01:CDS
AAACCTCAAGTATCCGTTCT+GGG 0.466254 1:-101063464 MsG0180006181.01.T01:CDS
GATCAGTTCATTTATAAAAG+TGG 0.467634 1:-101059858 MsG0180006181.01.T01:CDS
CTCCTTGGCCTAATTTATCT+CGG 0.475798 1:+101060093 None:intergenic
AGAACATTGCAATGATGTTA+TGG 0.476172 1:-101057783 MsG0180006181.01.T01:CDS
ACAGCCACTGGACGACCATC+AGG 0.478600 1:+101060041 None:intergenic
GAAATACAGTATTCTTGAAT+GGG 0.478884 1:-101063341 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGCATCAAGGATGTAGTTCA+AGG 0.479771 1:-101059755 MsG0180006181.01.T01:CDS
CTCACATTATAACAGAAGTC+CGG 0.480118 1:+101063077 None:intergenic
TTATAAAAGCGTTAACTAAG+TGG 0.480605 1:-101057496 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGAAGGTACTCCTCCGCCAT+TGG 0.482801 1:-101057471 MsG0180006181.01.T01:CDS
TTCTGGCGCCATATATCCTA+TGG 0.484680 1:+101059599 None:intergenic
AAATCTGATATATATAGTTA+TGG 0.488656 1:-101059543 MsG0180006181.01.T01:CDS
GGCTGTGCATTTAGCGCGCG+AGG 0.497615 1:-101057701 MsG0180006181.01.T01:CDS
GATAAAAGCGTCGTTGCAGT+TGG 0.504531 1:+101063507 None:intergenic
CCGTTCTGGGGAGGAAATAG+AGG 0.507598 1:-101063451 MsG0180006181.01.T01:CDS
GATAGTGTTGTGTCAATACT+TGG 0.511989 1:-101059633 MsG0180006181.01.T01:CDS
GCCTCTGCTTCCAATGGCGG+AGG 0.517938 1:+101057461 None:intergenic
ATGTTGATTCTTGAAATGAT+TGG 0.519414 1:-101059519 MsG0180006181.01.T01:CDS
ACTTTAAGATAAATTTGGTA+AGG 0.520429 1:-101057268 MsG0180006181.01.T01:CDS
GTCCGAATTTGGCAATATCA+TGG 0.531520 1:-101057324 MsG0180006181.01.T01:CDS
AACGCCTCTGCTTCCAATGG+CGG 0.541125 1:+101057458 None:intergenic
CGTCGTTGCAGTTGGTGTGT+TGG 0.544718 1:+101063515 None:intergenic
CGAGGTTCTGAAACAGTGGC+AGG 0.545839 1:-101057683 MsG0180006181.01.T01:CDS
GAGATTATGGAGAGTGTCAA+AGG 0.547493 1:-101062952 MsG0180006181.01.T01:CDS
AATTATCCATTGTTAACTTG+GGG 0.549882 1:+101063371 None:intergenic
CTGAATTGCGATGTTGTATG+AGG 0.553974 1:+101062860 None:intergenic
AGTAATAAACGAGGTAAAGG+GGG 0.554827 1:-101060015 MsG0180006181.01.T01:CDS
AAGTAATAAACGAGGTAAAG+GGG 0.557569 1:-101060016 MsG0180006181.01.T01:CDS
GTTGTTTCTGGTGGTGCCTG+TGG 0.558535 1:-101062926 MsG0180006181.01.T01:CDS
ATACAACACCATATCCTCCT+TGG 0.561297 1:+101060078 None:intergenic
TCCTGATACAGCTACTTACC+CGG 0.562932 1:-101063096 MsG0180006181.01.T01:CDS
TCCTCCGCCATTGGAAGCAG+AGG 0.563843 1:-101057462 MsG0180006181.01.T01:CDS
GCGTTAACTAAGTGGTATGA+AGG 0.564793 1:-101057488 MsG0180006181.01.T01:CDS
GTGGCGTCGACAAAATGATA+AGG 0.565640 1:-101057755 MsG0180006181.01.T01:CDS
CCTCTATTTCCTCCCCAGAA+CGG 0.571191 1:+101063451 None:intergenic
TCACATTATAACAGAAGTCC+GGG 0.571666 1:+101063078 None:intergenic
ATTCATGCCCCAAGGATCGT+TGG 0.571756 1:-101059880 MsG0180006181.01.T01:CDS
ACTTCCTCCATCGTTCCCAC+AGG 0.572104 1:+101062910 None:intergenic
TCATTCTCACAGAGACATGA+TGG 0.573411 1:+101063544 None:intergenic
GGAAGAAAGAACTATGACAC+TGG 0.574967 1:-101059495 MsG0180006181.01.T01:CDS
GGTGGTGCCTGTGGGAACGA+TGG 0.577502 1:-101062917 MsG0180006181.01.T01:CDS
TTGATTCTTGAAATGATTGG+AGG 0.577751 1:-101059516 MsG0180006181.01.T01:CDS
GCAGGCTGTTCGGAAGAAAA+CGG 0.578752 1:-101057665 MsG0180006181.01.T01:CDS
TTGTTTCTGGTGGTGCCTGT+GGG 0.580460 1:-101062925 MsG0180006181.01.T01:CDS
GTCGACAAAATGATAAGGTG+TGG 0.580596 1:-101057750 MsG0180006181.01.T01:CDS
CGCGCGAGGTTCTGAAACAG+TGG 0.581884 1:-101057687 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGATATTGCCAAATTCGGAC+TGG 0.582245 1:+101057327 None:intergenic
GTGTCAATACTTGGCACAAG+AGG 0.586067 1:-101059624 MsG0180006181.01.T01:CDS
TTCCGAGATAAATTAGGCCA+AGG 0.589809 1:-101060095 MsG0180006181.01.T01:CDS
AGATATGAAAGATGTGCGGC+TGG 0.591240 1:-101057722 MsG0180006181.01.T01:CDS
CTTGGCACAAGAGGAACCAT+AGG 0.594611 1:-101059615 MsG0180006181.01.T01:CDS
CAAAGGTGCGTTGTTTCTGG+TGG 0.595479 1:-101062935 MsG0180006181.01.T01:CDS
CCCAACGCCTCTGCTTCCAA+TGG 0.599578 1:+101057455 None:intergenic
CAATGATGTTATGGTGCTTG+TGG 0.601104 1:-101057774 MsG0180006181.01.T01:CDS
TGAGCTAGATTGCAAGCTAG+TGG 0.602080 1:-101057378 MsG0180006181.01.T01:CDS
GGACTAGAGTACTTGCATCA+AGG 0.603842 1:-101059768 MsG0180006181.01.T01:CDS
CTCAAGTATCCGTTCTGGGG+AGG 0.604276 1:-101063460 MsG0180006181.01.T01:CDS
GCATGAAAACCTCGACATTG+TGG 0.605655 1:+101060183 None:intergenic
GTATATAGTAGAGCATTTGG+TGG 0.607154 1:-101059576 MsG0180006181.01.T01:CDS
GTCCATCTTTACAGAAACAT+CGG 0.608800 1:+101062882 None:intergenic
ACAAAATGATAAGGTGTGGG+AGG 0.613767 1:-101057746 MsG0180006181.01.T01:CDS
TCGACAAAATGATAAGGTGT+GGG 0.614030 1:-101057749 MsG0180006181.01.T01:CDS
CTCCCCAGAACGGATACTTG+AGG 0.618102 1:+101063461 None:intergenic
CAAAATGATAAGGTGTGGGA+GGG 0.620639 1:-101057745 MsG0180006181.01.T01:CDS
CAGTGTCCCCAAGTTAACAA+TGG 0.624760 1:-101063377 MsG0180006181.01.T01:CDS
GGTGCCTGTGGGAACGATGG+AGG 0.625285 1:-101062914 MsG0180006181.01.T01:CDS
ATTAGGGAAGATAGCTCGAG+AGG 0.627264 1:-101063292 MsG0180006181.01.T01:intron
TACAAAGCAAGTTTACCTGA+TGG 0.627303 1:-101060056 MsG0180006181.01.T01:CDS
GGAAATAGAGGAAAGTATTG+CGG 0.629669 1:-101063439 MsG0180006181.01.T01:CDS
ACTTGTTGACCACAATGTCG+AGG 0.640696 1:-101060192 MsG0180006181.01.T01:CDS
ATGTGTATTAGGAATTCTCA+AGG 0.640752 1:-101057524 MsG0180006181.01.T01:CDS
GAAAGAACTATGACACTGGA+GGG 0.641846 1:-101059491 MsG0180006181.01.T01:intron
AACCTCAAGTATCCGTTCTG+GGG 0.642300 1:-101063463 MsG0180006181.01.T01:CDS
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ATATATGAATTCATGCCCCA+AGG 0.646287 1:-101059888 MsG0180006181.01.T01:CDS
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CGAGATAAATTAGGCCAAGG+AGG 0.663042 1:-101060092 MsG0180006181.01.T01:CDS
AACTGATCCAACGATCCTTG+GGG 0.663564 1:+101059873 None:intergenic
TAATATGGAACTCACATGTG+AGG 0.675953 1:-101063401 MsG0180006181.01.T01:CDS
GCAACAGACTGTGACAGATG+CGG 0.684737 1:-101057635 MsG0180006181.01.T01:intron
AGCTGTATCAGGATCAACAA+CGG 0.714396 1:+101063106 None:intergenic
GGCTGTTAAAGTAATAAACG+AGG 0.714785 1:-101060024 MsG0180006181.01.T01:CDS
AGGGAGATATGAAAGATGTG+CGG 0.763847 1:-101057726 MsG0180006181.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTCCTATTAAAATTTAAAT+TGG + Chr1:101058192-101058211 None:intergenic 10.0%
!!! AAATTTTTCTACAATTAATT+AGG + Chr1:101062734-101062753 None:intergenic 10.0%
!!! AATTTTTCTACAATTAATTA+GGG + Chr1:101062733-101062752 None:intergenic 10.0%
!!! AATTTTTTTATTGAAATAGT+CGG + Chr1:101061934-101061953 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTTAAAGTACATAATTTA+AGG - Chr1:101058145-101058164 MsG0180006181.01.T01:intron 10.0%
!! AAATCTGATATATATAGTTA+TGG - Chr1:101061266-101061285 MsG0180006181.01.T01:intron 15.0%
!! AACTATTATAAAATGACAAT+TGG + Chr1:101059250-101059269 None:intergenic 15.0%
!! AATTCTTTAATCTTTATTCT+TGG - Chr1:101061845-101061864 MsG0180006181.01.T01:intron 15.0%
!! ATAGTTATAGAGAAATAAAA+AGG - Chr1:101060679-101060698 MsG0180006181.01.T01:intron 15.0%
!! ATTAATTAAATACAATGTGT+CGG - Chr1:101059489-101059508 MsG0180006181.01.T01:intron 15.0%
!! ATTCTTTAATCTTTATTCTT+GGG - Chr1:101061846-101061865 MsG0180006181.01.T01:intron 15.0%
!! ATTTATCAATTAAATGTGAA+TGG - Chr1:101059890-101059909 MsG0180006181.01.T01:CDS 15.0%
!! CTGATATAATTTAGAAATAT+CGG + Chr1:101060144-101060163 None:intergenic 15.0%
!!! ATATAGAAAAAGCATAAATA+GGG + Chr1:101058020-101058039 None:intergenic 15.0%
!!! GAACCAATTTAAATTTTAAT+AGG - Chr1:101058186-101058205 MsG0180006181.01.T01:intron 15.0%
!!! TTCAAACTTTAAGATAAATT+TGG - Chr1:101063536-101063555 MsG0180006181.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTCATTTTTCAAATAATTGT+TGG + Chr1:101059470-101059489 None:intergenic 15.0%
!! AAATGAGAAAACACTAAAAA+AGG - Chr1:101058340-101058359 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!! AATGAAAATGAAATGTGAAA+AGG + Chr1:101062320-101062339 None:intergenic 20.0%
!! AGAAATAATAAGATCGATAT+AGG + Chr1:101062167-101062186 None:intergenic 20.0%
!! ATGAACATATTATATACCTT+AGG - Chr1:101058380-101058399 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!! CACATTTAATTGATAAATTG+TGG + Chr1:101059888-101059907 None:intergenic 20.0%
!! CGTCATAAAATTTAAACAAA+GGG + Chr1:101057582-101057601 None:intergenic 20.0%
!! GAATAAAGTAATAGAAATGT+TGG - Chr1:101061510-101061529 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!! TATAAGAAAAACAAATGAGA+TGG - Chr1:101062753-101062772 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!! TATAATTATAGTGATTGTAG+TGG - Chr1:101062096-101062115 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!! TATATATGTCAAATCCTATA+GGG + Chr1:101058910-101058929 None:intergenic 20.0%
!! TCGTCATAAAATTTAAACAA+AGG + Chr1:101057583-101057602 None:intergenic 20.0%
!! TGAAGAATGCAATAATATAA+AGG - Chr1:101063598-101063617 MsG0180006181.01.T01:CDS 20.0%
!! TGATATTATTTACATACTTG+AGG + Chr1:101057987-101058006 None:intergenic 20.0%
!! TGATATTGTTCTAACATATA+GGG + Chr1:101059017-101059036 None:intergenic 20.0%
!! TTCTTTAATCTTTATTCTTG+GGG - Chr1:101061847-101061866 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!! TTTGGATGAATTTCAAAATT+AGG + Chr1:101059283-101059302 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTTGCTTTGTTATTCTT+TGG + Chr1:101058564-101058583 None:intergenic 20.0%
!!! AATCCAAAATCAGATATTTT+TGG + Chr1:101061134-101061153 None:intergenic 20.0%
!!! AATTAATTAGGGACTTTTAA+GGG + Chr1:101062722-101062741 None:intergenic 20.0%
!!! ACTTTAAGATAAATTTGGTA+AGG - Chr1:101063541-101063560 MsG0180006181.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTAAGTGTTGTAAATAATA+TGG - Chr1:101058113-101058132 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!!! ATCAAATTGTTATTTCATCT+TGG + Chr1:101058422-101058441 None:intergenic 20.0%
!!! ATCCAAAATCAGATATTTTT+GGG + Chr1:101061133-101061152 None:intergenic 20.0%
!!! CATTATATATGTTTTGCAAT+AGG + Chr1:101058536-101058555 None:intergenic 20.0%
!!! CGATATTTCTAAATTATATC+AGG - Chr1:101060142-101060161 MsG0180006181.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATATAGAAAAAGCATAAAT+AGG + Chr1:101058021-101058040 None:intergenic 20.0%
!!! TAATTTGAATTTTTGACTGT+AGG - Chr1:101060318-101060337 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!!! TCAATGCTTTGAAAATATAT+TGG - Chr1:101060013-101060032 MsG0180006181.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCTCATTTTTAGCTAAATTT+GGG + Chr1:101058328-101058347 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTTTCTTTACATAAATTC+AGG - Chr1:101060483-101060502 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAACTAATAATTTGGTTTA+TGG + Chr1:101061989-101062008 None:intergenic 20.0%
!!! TTCTCATTTTTAGCTAAATT+TGG + Chr1:101058329-101058348 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTACATTGCTTAAAAAAG+TGG - Chr1:101058649-101058668 MsG0180006181.01.T01:intron 20.0%
! AAAACTATTAGTTAAGGTGA+AGG - Chr1:101059076-101059095 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! AAAGGAAAAAAACATCCAAA+AGG - Chr1:101058266-101058285 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! AAAGTAATAAACGAGGTAAA+GGG - Chr1:101060792-101060811 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! AAAGTAATAGAAATGTTGGA+AGG - Chr1:101061514-101061533 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! AAATAATGCCATCATAAAGT+GGG + Chr1:101060429-101060448 None:intergenic 25.0%
! AAATAGTCGGAAATAAATAG+AGG + Chr1:101061921-101061940 None:intergenic 25.0%
! AAGGAAAAAAACATCCAAAA+GGG - Chr1:101058267-101058286 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! AAGTAATAGAAATGTTGGAA+GGG - Chr1:101061515-101061534 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! AGAATTATCCATTGTTAACT+TGG + Chr1:101057443-101057462 None:intergenic 25.0%
! ATCTTAACATACAATCTAGA+GGG + Chr1:101061798-101061817 None:intergenic 25.0%
! ATTATGAGATATGCATGTTT+AGG - Chr1:101062341-101062360 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! ATTCAAGAATACTGTATTTC+AGG + Chr1:101057468-101057487 None:intergenic 25.0%
! CTAAAAACAATTTCCAAGAT+AGG + Chr1:101061729-101061748 None:intergenic 25.0%
! CTATATATGTCAAATCCTAT+AGG + Chr1:101058911-101058930 None:intergenic 25.0%
! CTGATATTGTTCTAACATAT+AGG + Chr1:101059018-101059037 None:intergenic 25.0%
! GAAATACAGTATTCTTGAAT+GGG - Chr1:101057468-101057487 MsG0180006181.01.T01:CDS 25.0%
! GAATTATCCATTGTTAACTT+GGG + Chr1:101057442-101057461 None:intergenic 25.0%
! GATCAGTTCATTTATAAAAG+TGG - Chr1:101060951-101060970 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TAAAGTAATAAACGAGGTAA+AGG - Chr1:101060791-101060810 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TAAATAATGCCATCATAAAG+TGG + Chr1:101060430-101060449 None:intergenic 25.0%
! TATCTTAACATACAATCTAG+AGG + Chr1:101061799-101061818 None:intergenic 25.0%
! TATGGTTAGAAAGATTACTT+TGG - Chr1:101061441-101061460 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TCACTTTAACCCAAAAATTA+AGG + Chr1:101058717-101058736 None:intergenic 25.0%
! TCATTGAACTGAACATAAAA+TGG - Chr1:101059388-101059407 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TCTATTACTTTATTCATCTG+TGG + Chr1:101061505-101061524 None:intergenic 25.0%
! TCTCTATAACTATATCTTCT+TGG + Chr1:101060672-101060691 None:intergenic 25.0%
! TGAAATACAGTATTCTTGAA+TGG - Chr1:101057467-101057486 MsG0180006181.01.T01:CDS 25.0%
! TGATTATTTGTCACCTTAAA+AGG - Chr1:101060553-101060572 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TGCAAAACATATATAATGCT+GGG - Chr1:101058538-101058557 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TTGCAAAACATATATAATGC+TGG - Chr1:101058537-101058556 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TTGTATTTATCTCATTCAGT+GGG - Chr1:101061885-101061904 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TTTAATAGGAATGAGTGTAA+TGG - Chr1:101058200-101058219 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
! TTTATCAGAAACAGAAATGT+AGG - Chr1:101059537-101059556 MsG0180006181.01.T01:CDS 25.0%
!! AACATCAACTTCTTAATTTG+TGG + Chr1:101059427-101059446 None:intergenic 25.0%
!! AATATTGATGCAGCAATTTT+CGG - Chr1:101063238-101063257 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
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!! ACACAAGTTAATTTCCATTT+TGG + Chr1:101062019-101062038 None:intergenic 25.0%
!! ATACACATGTAAGAGATTTT+TGG + Chr1:101059301-101059320 None:intergenic 25.0%
!! ATTAATTAGGGACTTTTAAG+GGG + Chr1:101062721-101062740 None:intergenic 25.0%
!! CAATTAATTAGGGACTTTTA+AGG + Chr1:101062723-101062742 None:intergenic 25.0%
!! TACATTGTCTTTTCTATGAA+CGG - Chr1:101061764-101061783 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!! TTTCTATTTTCTCCTATGAT+TGG + Chr1:101062564-101062583 None:intergenic 25.0%
!!! AAGATAGATCATTGTTTTGT+TGG - Chr1:101061813-101061832 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGATGGTTTTGTTTTGAAA+TGG - Chr1:101057830-101057849 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGCATTGATCTATTTATCT+TGG + Chr1:101060002-101060021 None:intergenic 25.0%
!!! AAGCTGTTTGTGATTTTAAT+TGG - Chr1:101060982-101061001 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! ACATTTCTGTTTCTGATAAA+AGG + Chr1:101059537-101059556 None:intergenic 25.0%
!!! ATGTTGATTCTTGAAATGAT+TGG - Chr1:101061290-101061309 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTGTTTTTAGGAAAAACAG+CGG - Chr1:101061738-101061757 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! CTAAGTATTTTAGACTAGTA+TGG + Chr1:101062211-101062230 None:intergenic 25.0%
!!! CTATCTTGGAAATTGTTTTT+AGG - Chr1:101061727-101061746 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTTAACAGATGCTATTTTA+TGG - Chr1:101063376-101063395 MsG0180006181.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATAAAAGCGTTAACTAAG+TGG - Chr1:101063313-101063332 MsG0180006181.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCTCAATTTTTGTTTCAG+AGG - Chr1:101059219-101059238 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTGTTTTGGTATGTGTATT+AGG - Chr1:101063274-101063293 MsG0180006181.01.T01:intron 25.0%
AAATTAAGGCATGAGGTTTA+TGG + Chr1:101058703-101058722 None:intergenic 30.0%
AACTCATTCCGAGATAAATT+AGG - Chr1:101060708-101060727 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
AAGTAATAAACGAGGTAAAG+GGG - Chr1:101060793-101060812 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
AATCAGTGATGCAATAAAGA+TGG - Chr1:101057814-101057833 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
AATGCTCTACTATATACTTC+TGG + Chr1:101061230-101061249 None:intergenic 30.0%
AATTAAGGCATGAGGTTTAT+GGG + Chr1:101058702-101058721 None:intergenic 30.0%
ACACAAATTAAGATGAAAGC+TGG - Chr1:101058774-101058793 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
ACTTTGTTCCAAATTGCAAT+TGG - Chr1:101061008-101061027 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
AGAACATTGCAATGATGTTA+TGG - Chr1:101063026-101063045 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
AGACTGATTATGAAAATGGT+TGG - Chr1:101062854-101062873 MsG0180006181.01.T01:CDS 30.0%
ATCATAACCAGAACTGATTA+TGG - Chr1:101062533-101062552 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
ATGCCATTATTACTTGTTTC+GGG + Chr1:101062614-101062633 None:intergenic 30.0%
ATGTGTATTAGGAATTCTCA+AGG - Chr1:101063285-101063304 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
ATTATAAGTGTGAGTTTCAG+TGG + Chr1:101062259-101062278 None:intergenic 30.0%
ATTATTTACATACTTGAGGC+TGG + Chr1:101057983-101058002 None:intergenic 30.0%
ATTTATAAGGATCTTGAGCA+AGG - Chr1:101061374-101061393 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
CAGTTGCTGAACTAATAATT+TGG + Chr1:101061996-101062015 None:intergenic 30.0%
CTTGTATTTATCTCATTCAG+TGG - Chr1:101061884-101061903 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
GAGACATGATGGTATAATAT+TGG + Chr1:101057257-101057276 None:intergenic 30.0%
GATGCCATTATTACTTGTTT+CGG + Chr1:101062615-101062634 None:intergenic 30.0%
GATTAGCAAAAATATGCCAA+AGG - Chr1:101061150-101061169 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
GCATTTAATTGGCAACAATA+GGG + Chr1:101059162-101059181 None:intergenic 30.0%
GCTTGCAAAACTATTAGTTA+AGG - Chr1:101059070-101059089 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
GGAAATAAGAACGTCAAATT+TGG + Chr1:101058515-101058534 None:intergenic 30.0%
GTCTCTTGAAGAAAAATCAA+TGG + Chr1:101060281-101060300 None:intergenic 30.0%
GTTGCCAATTAAATGCATAA+GGG - Chr1:101059166-101059185 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TACATAAATTCAGGTGTTTC+AGG - Chr1:101060492-101060511 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TACATTGCTTAAAAAAGTGG+AGG - Chr1:101058652-101058671 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TATTGTTCTAACATATAGGG+TGG + Chr1:101059014-101059033 None:intergenic 30.0%
TGAATTCGTCTCATACAAAT+TGG + Chr1:101061626-101061645 None:intergenic 30.0%
TGACATTTCAATACTAGCAT+AGG - Chr1:101059858-101059877 MsG0180006181.01.T01:CDS 30.0%
TGCATTTAATTGGCAACAAT+AGG + Chr1:101059163-101059182 None:intergenic 30.0%
TGTGAATGATGATCCTAATA+TGG - Chr1:101057393-101057412 MsG0180006181.01.T01:CDS 30.0%
TGTTGCCAATTAAATGCATA+AGG - Chr1:101059165-101059184 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TTAATCTTTATTCTTGGGGA+GGG - Chr1:101061851-101061870 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TTACAAATTAACCCACAAAG+AGG + Chr1:101058822-101058841 None:intergenic 30.0%
TTCTGTTGTGAATTCAATTC+AGG - Chr1:101062183-101062202 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TTGATTCTTGAAATGATTGG+AGG - Chr1:101061293-101061312 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TTTAATCTTTATTCTTGGGG+AGG - Chr1:101061850-101061869 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
TTTATTACTTTAACAGCCAC+TGG + Chr1:101060783-101060802 None:intergenic 30.0%
! AAACCTCATGCCTTAATTTT+TGG - Chr1:101058704-101058723 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
! AACCTCATGCCTTAATTTTT+GGG - Chr1:101058705-101058724 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
! ACTTTTAGGCTATTGTTATG+AGG - Chr1:101060881-101060900 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
! CAAACCTCAAAACATTCTTT+TGG - Chr1:101061094-101061113 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
! GAAGTATATAGTAGAGCATT+TGG - Chr1:101061230-101061249 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
! GTTAACGTGACTTTGATTTA+CGG - Chr1:101057607-101057626 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
! TCAACATTGCATAGTCATTT+TGG - Chr1:101059790-101059809 MsG0180006181.01.T01:CDS 30.0%
! TCATCCAAAAGAATGTTTTG+AGG + Chr1:101061101-101061120 None:intergenic 30.0%
! TGCCCAAAAATATCTGATTT+TGG - Chr1:101061128-101061147 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!! ATTATGGTTTTGCCAATCAT+AGG - Chr1:101062549-101062568 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!! CTTTGTGGGTTAATTTGTAA+TGG - Chr1:101058822-101058841 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!! GCATTTTTCAGTTATTTTGC+AGG - Chr1:101062984-101063003 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!! TCTTAATTTGTGTTGAGTCA+CGG + Chr1:101058767-101058786 None:intergenic 30.0%
!! TGCATAGTCATTTTGGTATT+AGG - Chr1:101059797-101059816 MsG0180006181.01.T01:CDS 30.0%
!! TGGAAATTAACTTGTGTAAC+TGG - Chr1:101062022-101062041 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTGACTGTAGGTTCAAAA+CGG - Chr1:101060328-101060347 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!!! AGGATGTCATTTTCTTGATA+TGG - Chr1:101059106-101059125 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTTATGGCTTGGTCAAAT+AGG - Chr1:101063390-101063409 MsG0180006181.01.T01:CDS 30.0%
!!! CACATTCATGTTGATTTTGA+TGG + Chr1:101059766-101059785 None:intergenic 30.0%
!!! TGAACAAAGGTGTTTTGTTT+TGG - Chr1:101063261-101063280 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
!!! TTGTTTTTAGGAAAAACAGC+GGG - Chr1:101061739-101061758 MsG0180006181.01.T01:intron 30.0%
AACCCAAAAATTAAGGCATG+AGG + Chr1:101058710-101058729 None:intergenic 35.0%
AAGAGGAAGCTTATTGTGAT+AGG - Chr1:101060351-101060370 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
ACAGAAGCTCAGAGTTATTA+GGG - Chr1:101057501-101057520 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGACACTCATAAAACTG+TGG + Chr1:101062375-101062394 None:intergenic 35.0%
AGATCCTTATAAATCCAGTC+TGG + Chr1:101061368-101061387 None:intergenic 35.0%
AGATTACTTTGGTGAGTCTA+TGG - Chr1:101061452-101061471 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
AGCAAAAATATGCCAAAGGA+AGG - Chr1:101061154-101061173 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
AGCCATGATATTGCCAAATT+CGG + Chr1:101063490-101063509 None:intergenic 35.0%
AGTAATAAACGAGGTAAAGG+GGG - Chr1:101060794-101060813 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
AGTCAACTGTGAAACGTATT+CGG + Chr1:101057658-101057677 None:intergenic 35.0%
ATAAAATGCCAAGTCTCTCA+AGG - Chr1:101061675-101061694 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
ATAGGTTGTGCATTGTTGAA+AGG - Chr1:101059712-101059731 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
ATATATGAATTCATGCCCCA+AGG - Chr1:101060921-101060940 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
ATATCTGACAATTCTAGTGG+TGG + Chr1:101061595-101061614 None:intergenic 35.0%
ATTGCAATTGGCATTGCTAA+AGG - Chr1:101061020-101061039 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
CAAATGTTTGACAATCTCAG+AGG - Chr1:101061408-101061427 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
CAATGCACCAAAATTGTGTA+CGG - Chr1:101062813-101062832 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
CGAGGCTATAAAAACAAGTT+TGG - Chr1:101062894-101062913 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
CTCACATTATAACAGAAGTC+CGG + Chr1:101057735-101057754 None:intergenic 35.0%
CTCAGAGGAAGAAAATGATA+TGG - Chr1:101061423-101061442 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
CTGACCCTTATGCATTTAAT+TGG + Chr1:101059173-101059192 None:intergenic 35.0%
CTTTCCAGACTGGATTTATA+AGG - Chr1:101061361-101061380 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
GACATATCTGACAATTCTAG+TGG + Chr1:101061598-101061617 None:intergenic 35.0%
GAGAAACAAAAAGAACACAC+TGG + Chr1:101059205-101059224 None:intergenic 35.0%
GATAGTGTTGTGTCAATACT+TGG - Chr1:101061176-101061195 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
GGCTGTTAAAGTAATAAACG+AGG - Chr1:101060785-101060804 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
GTAGAGTTTCAGTTGTAGAA+AGG + Chr1:101057636-101057655 None:intergenic 35.0%
GTCCATCTTTACAGAAACAT+CGG + Chr1:101057930-101057949 None:intergenic 35.0%
TAAATGCATAAGGGTCAGAT+AGG - Chr1:101059175-101059194 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TAATATGGAACTCACATGTG+AGG - Chr1:101057408-101057427 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
TACAAAGCAAGTTTACCTGA+TGG - Chr1:101060753-101060772 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TAGCAATGCCAATTGCAATT+TGG + Chr1:101061019-101061038 None:intergenic 35.0%
TATCGGCATATTGTTGAATC+AGG + Chr1:101060127-101060146 None:intergenic 35.0%
TCACATGTGAGTTCCATATT+AGG + Chr1:101057409-101057428 None:intergenic 35.0%
TCACATTATAACAGAAGTCC+GGG + Chr1:101057734-101057753 None:intergenic 35.0%
TCAGTGGTCATGAAACATAT+AGG + Chr1:101062243-101062262 None:intergenic 35.0%
TCGACAAAATGATAAGGTGT+GGG - Chr1:101063060-101063079 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TCGATATAGGAAGACAAAGA+CGG + Chr1:101062154-101062173 None:intergenic 35.0%
TCTATTAACCAGTCCGAATT+TGG - Chr1:101063474-101063493 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
TGATATGGCTCATTTGTAGA+GGG - Chr1:101059121-101059140 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TGATCTCAGACTAATATGTG+CGG + Chr1:101060212-101060231 None:intergenic 35.0%
TGCATACTAAATGTGCTTGA+AGG - Chr1:101059955-101059974 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
TGCCATTATTACTTGTTTCG+GGG + Chr1:101062613-101062632 None:intergenic 35.0%
TGCGAGACTGATTATGAAAA+TGG - Chr1:101062850-101062869 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
TGGGCTATGGGATATAATAA+TGG - Chr1:101062925-101062944 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAATGGACAGGAGATTA+TGG - Chr1:101057844-101057863 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TTGAACACTGTATAAGTGAG+AGG - Chr1:101058675-101058694 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TTGATATGGCTCATTTGTAG+AGG - Chr1:101059120-101059139 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
TTTCCAAGATAGGTTCTTGA+CGG + Chr1:101061719-101061738 None:intergenic 35.0%
TTTCTCATCCCACTTTATGA+TGG - Chr1:101060418-101060437 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
! GTATATAGTAGAGCATTTGG+TGG - Chr1:101061233-101061252 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
! TTCCGATGTTTCTGTAAAGA+TGG - Chr1:101057925-101057944 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
! TTGAGGTCTATGATTGGTTA+TGG + Chr1:101058873-101058892 None:intergenic 35.0%
! TTGATGGTCACTATAGATCA+TGG + Chr1:101060177-101060196 None:intergenic 35.0%
!! CTATTTCTGTTTGTACAGCA+AGG + Chr1:101058943-101058962 None:intergenic 35.0%
!! CTCAATTTTTGTTTCAGAGG+AGG - Chr1:101059222-101059241 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
!! CTTAATTTGTGTTGAGTCAC+GGG + Chr1:101058766-101058785 None:intergenic 35.0%
!! GGAAATAGAGGAAAGTATTG+CGG - Chr1:101057370-101057389 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAACTTGTGTAACTGGTTC+TGG - Chr1:101062028-101062047 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
!!! ACAGATGCTATTTTATGGCT+TGG - Chr1:101063381-101063400 MsG0180006181.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTTTTGTTTTGAAATGGAC+AGG - Chr1:101057835-101057854 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
!!! GTGAACATTGTGTCACTTTT+AGG - Chr1:101060867-101060886 MsG0180006181.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTTTCTCTCTCTCCCTTT+TGG + Chr1:101058284-101058303 None:intergenic 35.0%
AAACAAGTTTGGCAAGTAGC+TGG - Chr1:101062905-101062924 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
AAACCTCAAGTATCCGTTCT+GGG - Chr1:101057345-101057364 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
AAATTAGGCCAAGGAGGATA+TGG - Chr1:101060723-101060742 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
AACAAGTTTGGCAAGTAGCT+GGG - Chr1:101062906-101062925 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
AAGACAACAGACCTCTTTGT+GGG - Chr1:101058808-101058827 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
AATGGTTGGCACGTGTTTAT+TGG - Chr1:101062868-101062887 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
AATTCAGGTGTTTCAGGATC+TGG - Chr1:101060498-101060517 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
ACAAAATGATAAGGTGTGGG+AGG - Chr1:101063063-101063082 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
ACACAACACTATCCTTCCTT+TGG + Chr1:101061169-101061188 None:intergenic 40.0%
AGAAAGAACTATGACACTGG+AGG - Chr1:101061317-101061336 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
AGAAAGTGACAAGTGTGTTG+CGG - Chr1:101058052-101058071 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
AGCTGTATCAGGATCAACAA+CGG + Chr1:101057706-101057725 None:intergenic 40.0%
AGGGAGATATGAAAGATGTG+CGG - Chr1:101063083-101063102 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
AGGGCTATTGAATGTGAAGT+TGG + Chr1:101057563-101057582 None:intergenic 40.0%
ATACAACACCATATCCTCCT+TGG + Chr1:101060734-101060753 None:intergenic 40.0%
ATCCTATAGGGAAACCTATG+AGG + Chr1:101058898-101058917 None:intergenic 40.0%
ATTCCGTCAAGAACCTATCT+TGG - Chr1:101061713-101061732 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
CAAAATGATAAGGTGTGGGA+GGG - Chr1:101063064-101063083 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
CAATGATGTTATGGTGCTTG+TGG - Chr1:101063035-101063054 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
CACAGAAGCTCAGAGTTATT+AGG - Chr1:101057500-101057519 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
CACCCCGAAACAAGTAATAA+TGG - Chr1:101062608-101062627 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
CAGAAATGTACTTTCCAGAC+TGG - Chr1:101061351-101061370 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
CTCCTTGGCCTAATTTATCT+CGG + Chr1:101060719-101060738 None:intergenic 40.0%
CTGAATTGCGATGTTGTATG+AGG + Chr1:101057952-101057971 None:intergenic 40.0%
CTTTACCAAGCTTCTACTGT+AGG - Chr1:101062280-101062299 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
GAAAGAACTATGACACTGGA+GGG - Chr1:101061318-101061337 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
GATTTCAACACTTTGTGCCA+CGG - Chr1:101060069-101060088 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
GCGTTAACTAAGTGGTATGA+AGG - Chr1:101063321-101063340 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGAAAGAACTATGACAC+TGG - Chr1:101061314-101061333 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
GGCAAAACCATAATCAGTTC+TGG + Chr1:101062543-101062562 None:intergenic 40.0%
GTAGGAGTTACATTGCAGTA+TGG - Chr1:101059555-101059574 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
GTCCGAATTTGGCAATATCA+TGG - Chr1:101063485-101063504 MsG0180006181.01.T01:CDS 40.0%
GTCGACAAAATGATAAGGTG+TGG - Chr1:101063059-101063078 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
GTGATGTCAACTCACTTGTA+TGG - Chr1:101058733-101058752 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
GTGCATTCAAACGAAACCAT+CGG - Chr1:101061474-101061493 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
GTTAAGGTGAAGGATTACAG+AGG - Chr1:101059086-101059105 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
TAAGACAACAGACCTCTTTG+TGG - Chr1:101058807-101058826 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
TAGTTCAGCAACTGCCAAAA+TGG - Chr1:101062002-101062021 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
TCATAATCAGTCTCGCAATG+AGG + Chr1:101062847-101062866 None:intergenic 40.0%
TCATTCTCACAGAGACATGA+TGG + Chr1:101057268-101057287 None:intergenic 40.0%
TCCCTCAAGTTTCAACTCAT+TGG - Chr1:101058441-101058460 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
TCCTATAGGGAAACCTATGA+GGG + Chr1:101058897-101058916 None:intergenic 40.0%
TGACAGATGCGGTAATACAT+TGG - Chr1:101063185-101063204 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
TGATATTGCCAAATTCGGAC+TGG + Chr1:101063485-101063504 None:intergenic 40.0%
TGCATCAAGGATGTAGTTCA+AGG - Chr1:101061054-101061073 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
TTATTACTTGTTTCGGGGTG+CGG + Chr1:101062608-101062627 None:intergenic 40.0%
TTCCGAGATAAATTAGGCCA+AGG - Chr1:101060714-101060733 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
! CACCTTAAAAGGAGTACATC+TGG - Chr1:101060564-101060583 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
! CAGCAATTTTCGGTGAACAA+AGG - Chr1:101063248-101063267 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
! GAGAGCACGAAAAAGTAGAA+AGG - Chr1:101058248-101058267 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
! GCCAATGAGTTGAAACTTGA+GGG + Chr1:101058445-101058464 None:intergenic 40.0%
! GTCCAGATGTACTCCTTTTA+AGG + Chr1:101060569-101060588 None:intergenic 40.0%
! GTGTCAAGTTGCTATCATAG+AGG - Chr1:101062386-101062405 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
! TGCCAATGAGTTGAAACTTG+AGG + Chr1:101058446-101058465 None:intergenic 40.0%
!! AATTAGGGACTTTTAAGGGG+AGG + Chr1:101062718-101062737 None:intergenic 40.0%
!! ATTAGGGACTTTTAAGGGGA+GGG + Chr1:101062717-101062736 None:intergenic 40.0%
!! GAGATTATGGAGAGTGTCAA+AGG - Chr1:101057857-101057876 MsG0180006181.01.T01:intron 40.0%
AAATGCCAAGTCTCTCAAGG+TGG - Chr1:101061678-101061697 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
AACCTCAAGTATCCGTTCTG+GGG - Chr1:101057346-101057365 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
AACTGATCCAACGATCCTTG+GGG + Chr1:101060939-101060958 None:intergenic 45.0%
AAGGTGTGTTCGACACATGT+GGG + Chr1:101059518-101059537 None:intergenic 45.0%
AATTCTAGTGGTGGCCTTTC+AGG + Chr1:101061586-101061605 None:intergenic 45.0%
ACCAGCTATTGGAGTGACAT+TGG + Chr1:101060095-101060114 None:intergenic 45.0%
ACCCTCATAGGTTTCCCTAT+AGG - Chr1:101058893-101058912 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
AGATATGAAAGATGTGCGGC+TGG - Chr1:101063087-101063106 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
AGCAACCTACAGTAGAAGCT+TGG + Chr1:101062288-101062307 None:intergenic 45.0%
AGTATCACCGTAGCTGCTAT+AGG - Chr1:101059694-101059713 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
ATAAACGAGGTAAAGGGGGA+TGG - Chr1:101060798-101060817 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
ATTAGGGAAGATAGCTCGAG+AGG - Chr1:101057517-101057536 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
CAAACCTCAAGTATCCGTTC+TGG - Chr1:101057344-101057363 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
CACAACTTGGATCTGGCAAT+GGG - Chr1:101057789-101057808 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
CAGTGTCCCCAAGTTAACAA+TGG - Chr1:101057432-101057451 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
CATAGACCTCAAACCCTCAT+AGG - Chr1:101058881-101058900 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
CATTTGACGCAATCTTCCTC+TGG + Chr1:101063217-101063236 None:intergenic 45.0%
CCTTTCAGGAGAACATAGGA+CGG + Chr1:101061572-101061591 None:intergenic 45.0%
CGAGATAAATTAGGCCAAGG+AGG - Chr1:101060717-101060736 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
CTCAGCAGTTACTTAGCCTA+AGG + Chr1:101058399-101058418 None:intergenic 45.0%
CTCATTGGCATGCTCTTTCA+AGG - Chr1:101058456-101058475 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
CTGTAGGTTCAAAACGGAAG+AGG - Chr1:101060334-101060353 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
CTTTCAGGAGAACATAGGAC+GGG + Chr1:101061571-101061590 None:intergenic 45.0%
GAACTGATCCAACGATCCTT+GGG + Chr1:101060940-101060959 None:intergenic 45.0%
GCATGAAAACCTCGACATTG+TGG + Chr1:101060629-101060648 None:intergenic 45.0%
GGATATGGCACCAATGAAAG+CGG + Chr1:101061541-101061560 None:intergenic 45.0%
GGTTTAGCAGAACCAGCTAT+TGG + Chr1:101060106-101060125 None:intergenic 45.0%
GTGTCAATACTTGGCACAAG+AGG - Chr1:101061185-101061204 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
TCCTGATACAGCTACTTACC+CGG - Chr1:101057713-101057732 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
TGAACTGATCCAACGATCCT+TGG + Chr1:101060941-101060960 None:intergenic 45.0%
TGAGCTAGATTGCAAGCTAG+TGG - Chr1:101063431-101063450 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
TGCACAACCTATAGCAGCTA+CGG + Chr1:101059704-101059723 None:intergenic 45.0%
TTCATCTGTGGTCTATCCGA+TGG + Chr1:101061493-101061512 None:intergenic 45.0%
! AAAGGTGTGTTCGACACATG+TGG + Chr1:101059519-101059538 None:intergenic 45.0%
! ACTTGTTGACCACAATGTCG+AGG - Chr1:101060617-101060636 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
! CAGCTAGATTTAGAGTCAGC+AGG - Chr1:101059597-101059616 MsG0180006181.01.T01:CDS 45.0%
! CAGCTGTCCGTACACAATTT+TGG + Chr1:101062823-101062842 None:intergenic 45.0%
! GAGGGTTTGAGGTCTATGAT+TGG + Chr1:101058879-101058898 None:intergenic 45.0%
! GGACTAGAGTACTTGCATCA+AGG - Chr1:101061041-101061060 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
! TGTCAAAGGTGCGTTGTTTC+TGG - Chr1:101057871-101057890 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
!! CACAATTTTGGTGCATTGCG+TGG + Chr1:101062811-101062830 None:intergenic 45.0%
!! GATAAAAGCGTCGTTGCAGT+TGG + Chr1:101057305-101057324 None:intergenic 45.0%
!! GTGGCGTCGACAAAATGATA+AGG - Chr1:101063054-101063073 MsG0180006181.01.T01:intron 45.0%
!! TTAGGGACTTTTAAGGGGAG+GGG + Chr1:101062716-101062735 None:intergenic 45.0%
!!! TGCAGCTCGGGTTTTGAAAT+CGG + Chr1:101057771-101057790 None:intergenic 45.0%
!!! TTATTTATTTTAAACAATAA+AGG - Chr1:101060443-101060462 MsG0180006181.01.T01:intron 5.0%
AAAACCCGAGCTGCACAACT+TGG - Chr1:101057776-101057795 MsG0180006181.01.T01:CDS 50.0%
AATACATTGGCAGCCACCAG+AGG - Chr1:101063198-101063217 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
AGATCCAAGTTGTGCAGCTC+GGG + Chr1:101057783-101057802 None:intergenic 50.0%
AGTGGCACAAGCACAAGAGA+TGG + Chr1:101062692-101062711 None:intergenic 50.0%
ATTCATGCCCCAAGGATCGT+TGG - Chr1:101060929-101060948 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
CAGATCCAAGTTGTGCAGCT+CGG + Chr1:101057784-101057803 None:intergenic 50.0%
CCGTCCTATGTTCTCCTGAA+AGG - Chr1:101061569-101061588 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
CCTCTATTTCCTCCCCAGAA+CGG + Chr1:101057361-101057380 None:intergenic 50.0%
GCAACAGACTGTGACAGATG+CGG - Chr1:101063174-101063193 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
GCACAACTTGGATCTGGCAA+TGG - Chr1:101057788-101057807 MsG0180006181.01.T01:CDS 50.0%
GCAGGCTGTTCGGAAGAAAA+CGG - Chr1:101063144-101063163 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
GCCAATGTCACTCCAATAGC+TGG - Chr1:101060091-101060110 MsG0180006181.01.T01:CDS 50.0%
GCGGCTATTGCACACTTTGA+TGG + Chr1:101060193-101060212 None:intergenic 50.0%
GGGAAACCTATGAGGGTTTG+AGG + Chr1:101058890-101058909 None:intergenic 50.0%
GTGGCCTTTCAGGAGAACAT+AGG + Chr1:101061576-101061595 None:intergenic 50.0%
TATTGGAGTGACATTGGCCG+TGG + Chr1:101060089-101060108 None:intergenic 50.0%
TCCGGGTAAGTAGCTGTATC+AGG + Chr1:101057717-101057736 None:intergenic 50.0%
TGAAACAGTGGCAGGCTGTT+CGG - Chr1:101063134-101063153 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
TTGACGCAATCTTCCTCTGG+TGG + Chr1:101063214-101063233 None:intergenic 50.0%
TTGGCAAGTAGCTGGGCTAT+GGG - Chr1:101062913-101062932 MsG0180006181.01.T01:CDS 50.0%
TTTACCTGATGGTCGTCCAG+TGG - Chr1:101060764-101060783 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
TTTGGCAAGTAGCTGGGCTA+TGG - Chr1:101062912-101062931 MsG0180006181.01.T01:CDS 50.0%
! GCACGTGTTTATTGGTTGCG+AGG - Chr1:101062876-101062895 MsG0180006181.01.T01:CDS 50.0%
!! CAAAGGTGCGTTGTTTCTGG+TGG - Chr1:101057874-101057893 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
!! TAGGGACTTTTAAGGGGAGG+GGG + Chr1:101062715-101062734 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGCATTGCGTGGATTAG+AGG + Chr1:101062803-101062822 None:intergenic 50.0%
!! TTGTTTCTGGTGGTGCCTGT+GGG - Chr1:101057884-101057903 MsG0180006181.01.T01:intron 50.0%
AACGCCTCTGCTTCCAATGG+CGG + Chr1:101063354-101063373 None:intergenic 55.0%
ACTTCCTCCATCGTTCCCAC+AGG + Chr1:101057902-101057921 None:intergenic 55.0%
CGAGCTGCACAACTTGGATC+TGG - Chr1:101057782-101057801 MsG0180006181.01.T01:CDS 55.0%
CTCCCCAGAACGGATACTTG+AGG + Chr1:101057351-101057370 None:intergenic 55.0%
TGCCAAGTCTCTCAAGGTGG+CGG - Chr1:101061681-101061700 MsG0180006181.01.T01:intron 55.0%
! CGTCGTTGCAGTTGGTGTGT+TGG + Chr1:101057297-101057316 None:intergenic 55.0%
! GAACATAGGACGGGCTTTGG+AGG + Chr1:101061562-101061581 None:intergenic 55.0%
! GGAGAACATAGGACGGGCTT+TGG + Chr1:101061565-101061584 None:intergenic 55.0%
! GTTGGAAGGGCCGCTTTCAT+TGG - Chr1:101061528-101061547 MsG0180006181.01.T01:intron 55.0%
!! ACTTTTAAGGGGAGGGGGAG+TGG + Chr1:101062710-101062729 None:intergenic 55.0%
!! AGGACGGGCTTTGGAGGATA+TGG + Chr1:101061556-101061575 None:intergenic 55.0%
!! CCATTGGAAGCAGAGGCGTT+GGG - Chr1:101063354-101063373 MsG0180006181.01.T01:CDS 55.0%
!! CCGTTCTGGGGAGGAAATAG+AGG - Chr1:101057358-101057377 MsG0180006181.01.T01:CDS 55.0%
!! CGAGGTTCTGAAACAGTGGC+AGG - Chr1:101063126-101063145 MsG0180006181.01.T01:intron 55.0%
!! CTCAAGTATCCGTTCTGGGG+AGG - Chr1:101057349-101057368 MsG0180006181.01.T01:CDS 55.0%
!! GTTGTTTCTGGTGGTGCCTG+TGG - Chr1:101057883-101057902 MsG0180006181.01.T01:intron 55.0%
!! TGAAGGTACTCCTCCGCCAT+TGG - Chr1:101063338-101063357 MsG0180006181.01.T01:CDS 55.0%
ACAGCCACTGGACGACCATC+AGG + Chr1:101060771-101060790 None:intergenic 60.0%
CCCAACGCCTCTGCTTCCAA+TGG + Chr1:101063357-101063376 None:intergenic 60.0%
CTCCGCCACCTTGAGAGACT+TGG + Chr1:101061686-101061705 None:intergenic 60.0%
TCCTCCGCCATTGGAAGCAG+AGG - Chr1:101063347-101063366 MsG0180006181.01.T01:CDS 60.0%
! CAAGTCTCTCAAGGTGGCGG+AGG - Chr1:101061684-101061703 MsG0180006181.01.T01:intron 60.0%
! GCCATTGGAAGCAGAGGCGT+TGG - Chr1:101063353-101063372 MsG0180006181.01.T01:CDS 60.0%
!! CGCGCGAGGTTCTGAAACAG+TGG - Chr1:101063122-101063141 MsG0180006181.01.T01:intron 60.0%
GCCTCTGCTTCCAATGGCGG+AGG + Chr1:101063351-101063370 None:intergenic 65.0%
GGCTGTGCATTTAGCGCGCG+AGG - Chr1:101063108-101063127 MsG0180006181.01.T01:CDS 65.0%
GGTGCCTGTGGGAACGATGG+AGG - Chr1:101057895-101057914 MsG0180006181.01.T01:intron 65.0%
GGTGGTGCCTGTGGGAACGA+TGG - Chr1:101057892-101057911 MsG0180006181.01.T01:intron 65.0%
!! GTCTCTCAAGGTGGCGGAGG+TGG - Chr1:101061687-101061706 MsG0180006181.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 101057214 101063617 101057214 ID=MsG0180006181.01;Name=MsG0180006181.01
Chr1 mRNA 101057214 101063617 101057214 ID=MsG0180006181.01.T01;Parent=MsG0180006181.01;Name=MsG0180006181.01.T01;_AED=0.18;_eAED=0.24;_QI=0|0|0|1|1|1|6|0|628
Chr1 exon 101063293 101063617 101063293 ID=MsG0180006181.01.T01:exon:12844;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 exon 101063082 101063137 101063082 ID=MsG0180006181.01.T01:exon:12843;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 exon 101062842 101062974 101062842 ID=MsG0180006181.01.T01:exon:12842;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 exon 101059492 101060326 101059492 ID=MsG0180006181.01.T01:exon:12841;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 exon 101057636 101057825 101057636 ID=MsG0180006181.01.T01:exon:12840;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 exon 101057214 101057561 101057214 ID=MsG0180006181.01.T01:exon:12839;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 CDS 101063293 101063617 101063293 ID=MsG0180006181.01.T01:cds;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 CDS 101063082 101063137 101063082 ID=MsG0180006181.01.T01:cds;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 CDS 101062842 101062974 101062842 ID=MsG0180006181.01.T01:cds;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 CDS 101059492 101060326 101059492 ID=MsG0180006181.01.T01:cds;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 CDS 101057636 101057825 101057636 ID=MsG0180006181.01.T01:cds;Parent=MsG0180006181.01.T01
Chr1 CDS 101057214 101057561 101057214 ID=MsG0180006181.01.T01:cds;Parent=MsG0180006181.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180006181.01.T01

ATGAAGTTGTTTGTTCTAGCACTTTTGATGATCTCAATCACCAATATTATACCATCATGTCTCTGTGAGAATGATGATATCCAACACACCAACTGCAACGACGCTTTTATCTGCGAAAGTAGCAACATCACAAACCTCAAGTATCCGTTCTGGGGAGGAAATAGAGGAAAGTATTGCGGTGTGAATGATGATCCTAATATGGAACTCACATGTGAGGACAGTGTCCCCAAGTTAACAATGGATAATTCTTACCTGAAATACAGTATTCTTGAATGGGACAATTCAACACAGAAGCTCAGAGTTATTAGGGAAGATAGCTCGAGAGTTTTGTACACCGTTGTTGATCCTGATACAGCTACTTACCCGGACTTCTGTTATAATGAGATTATGGAGAGTGTCAAAGGTGCGTTGTTTCTGGTGGTGCCTGTGGGAACGATGGAGGAAGTGAATTCCGATGTTTCTGTAAAGATGGACCTCATACAACATCGCAATTCAGAAAATTCTCCAGCCTCAAGTGTTTCAGGATCTGGAGCAACAGTATTCTTCATTATTCTTATTATTATGATTATTTGTCACCTTAAAAGGAGTACATCTGGACAACAAAGTATTTTCAGAAAGAGAAGAAAACTTGTTGACCACAATGTCGAGGTTTTCATGCAAAGTTATGAATCATCTATGCCAAGAAGATATAGTTATAGAGAAATAAAAAGGATCACAAACTCATTCCGAGATAAATTAGGCCAAGGAGGATATGGTGTTGTATACAAAGCAAGTTTACCTGATGGTCGTCCAGTGGCTGTTAAAGTAATAAACGAGGTAAAGGGGGATGGAGAAGAATTCATAAATGAAGTTGCTAGCATTAGTAGAACATCACACGTGAACATTGTGTCACTTTTAGGCTATTGTTATGAGGTGAACAAAAGAGTACTAATATATGAATTCATGCCCCAAGGATCGTTGGATCAGTTCATTTATAAAAGTGGATTTTCTGAAGCTGTTTGTGATTTTAATTGGAACACTTTGTTCCAAATTGCAATTGGCATTGCTAAAGGACTAGAGTACTTGCATCAAGGATGTAGTTCAAGGATTCTGCATCTTGATATCAAACCTCAAAACATTCTTTTGGATGAAGACTTTTGCCCAAAAATATCTGATTTTGGATTAGCAAAAATATGCCAAAGGAAGGATAGTGTTGTGTCAATACTTGGCACAAGAGGAACCATAGGATATATGGCGCCAGAAGTATATAGTAGAGCATTTGGTGGTGTTTCTTACAAATCTGATATATATAGTTATGGCATGTTGATTCTTGAAATGATTGGAGGAAGAAAGAACTATGACACTGGAGGGTGCTCTAAACAAATGTGTCAGAACATTGCAATGATGTTATGGTGCTTGTGGCGTCGACAAAATGATAAGGTGTGGGAGGGAGATATGAAAGATGTGCGGCTGGCTGTGCATTTAGCGCGCGAGGTTCTGAAACAGTGGCAGGCTGTTCGGAAGAAAACGGTTCAGCAGCAACAGACTGTGACAGATGCGGTGTTTTGTTTTGGTATGTGTATTAGGAATTCTCAAGGTCATTTTATAAAAGCGTTAACTAAGTGGTATGAAGGTACTCCTCCGCCATTGGAAGCAGAGGCGTTGGGTTTAACAGATGCTATTTTATGGCTTGGTCAAATAGGTCTATCAAAAGTGCATATTGAGCTAGATTGCAAGCTAGTGGTTGACAGCATTGTTGAGAGTTCTATTAACCAGTCCGAATTTGGCAATATCATGGCTACTTGTAGAACTTTGTTATATCATTTTTCAAACTTTAAGATAAATTTGGTAAGGAGACAAGCAAATTGTATTTGTATCGAGACTATTGTGAAGAATGCAATAATATAA
Protein sequence

>MsG0180006181.01.T01

MKLFVLALLMISITNIIPSCLCENDDIQHTNCNDAFICESSNITNLKYPFWGGNRGKYCGVNDDPNMELTCEDSVPKLTMDNSYLKYSILEWDNSTQKLRVIREDSSRVLYTVVDPDTATYPDFCYNEIMESVKGALFLVVPVGTMEEVNSDVSVKMDLIQHRNSENSPASSVSGSGATVFFIILIIMIICHLKRSTSGQQSIFRKRRKLVDHNVEVFMQSYESSMPRRYSYREIKRITNSFRDKLGQGGYGVVYKASLPDGRPVAVKVINEVKGDGEEFINEVASISRTSHVNIVSLLGYCYEVNKRVLIYEFMPQGSLDQFIYKSGFSEAVCDFNWNTLFQIAIGIAKGLEYLHQGCSSRILHLDIKPQNILLDEDFCPKISDFGLAKICQRKDSVVSILGTRGTIGYMAPEVYSRAFGGVSYKSDIYSYGMLILEMIGGRKNYDTGGCSKQMCQNIAMMLWCLWRRQNDKVWEGDMKDVRLAVHLAREVLKQWQAVRKKTVQQQQTVTDAVFCFGMCIRNSQGHFIKALTKWYEGTPPPLEAEALGLTDAILWLGQIGLSKVHIELDCKLVVDSIVESSINQSEFGNIMATCRTLLYHFSNFKINLVRRQANCICIETIVKNAII*