AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036302.01

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MsG0780036302.01.T01 AT3G56550 25.418 299 215 3 138 430 110 406 1.58e-17 87.0
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MsG0780036302.01.T01 AT3G01580 29.062 437 265 7 191 585 13 446 6.52e-53 193
MsG0780036302.01.T01 AT3G01580 24.100 361 221 8 142 459 176 526 4.49e-20 95.1
MsG0780036302.01.T01 AT3G21470 32.549 510 271 8 204 643 12 518 1.49e-84 275
MsG0780036302.01.T01 AT3G21470 28.514 249 166 4 191 431 227 471 2.51e-16 82.8
MsG0780036302.01.T01 AT3G14730 31.667 540 317 6 149 645 80 610 2.60e-84 278
MsG0780036302.01.T01 AT3G14730 28.169 426 244 12 145 521 176 588 4.51e-34 138
MsG0780036302.01.T01 AT4G21300 32.030 537 316 8 150 646 260 787 2.61e-84 283
MsG0780036302.01.T01 AT4G21300 26.908 498 277 15 143 581 48 517 1.51e-35 144
MsG0780036302.01.T01 AT4G21300 22.646 393 249 6 136 481 341 725 2.71e-26 115
MsG0780036302.01.T01 AT4G21300 29.864 221 139 3 113 333 433 637 1.52e-21 100
MsG0780036302.01.T01 AT4G21300 24.412 340 209 7 222 514 13 351 1.78e-20 96.7
MsG0780036302.01.T01 AT4G21300 26.523 279 169 6 369 614 106 381 7.15e-15 79.0
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MsG0780036302.01.T01 AT1G74600 25.280 447 282 8 191 597 304 738 6.46e-37 148
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MsG0780036302.01.T01 AT3G23330 32.584 267 165 5 326 585 56 314 6.06e-32 131
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MsG0780036302.01.T01 AT3G23330 26.730 318 207 6 149 455 153 455 9.72e-25 109
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MsG0780036302.01.T01 AT2G36980 25.138 362 214 10 149 466 73 421 1.94e-19 92.4
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MsG0780036302.01.T01 AT1G77170 25.602 332 199 5 190 477 71 398 4.20e-28 118
MsG0780036302.01.T01 AT1G77170 22.822 241 178 6 348 586 67 301 6.61e-17 84.3
MsG0780036302.01.T01 AT1G77170 23.715 253 175 5 191 430 171 418 5.05e-14 75.5
MsG0780036302.01.T01 AT4G14050 29.901 505 313 6 144 646 18 483 9.51e-78 259
MsG0780036302.01.T01 AT2G02980 40.968 310 182 1 340 649 169 477 1.62e-77 259
MsG0780036302.01.T01 AT2G02980 26.963 382 225 6 144 481 41 412 5.71e-40 155
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MsG0780036302.01.T01 AT2G36980 26.087 437 239 7 191 585 14 408 7.43e-39 152
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MsG0780036302.01.T01 AT1G69350 30.707 495 301 5 191 646 256 747 3.75e-71 246
MsG0780036302.01.T01 AT1G69350 26.203 561 333 11 144 631 13 565 3.25e-47 178
MsG0780036302.01.T01 AT1G69350 23.784 555 337 10 112 591 82 625 1.03e-43 168
MsG0780036302.01.T01 AT3G02330 30.099 505 299 7 151 646 389 848 4.25e-71 248
MsG0780036302.01.T01 AT3G02330 27.639 521 295 12 145 600 64 567 7.87e-46 175
MsG0780036302.01.T01 AT3G02330 28.615 325 197 4 241 564 51 341 3.69e-33 136
MsG0780036302.01.T01 AT4G08210 30.444 496 299 6 177 629 178 670 4.27e-71 243
MsG0780036302.01.T01 AT4G08210 27.044 477 293 14 145 614 21 449 9.70e-35 140
MsG0780036302.01.T01 AT4G08210 25.714 280 184 5 144 412 357 623 5.48e-23 104
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MsG0780036302.01.T01 AT4G20770 29.331 508 334 8 149 645 269 762 9.05e-63 223
MsG0780036302.01.T01 AT4G20770 26.351 444 302 11 150 578 159 592 3.71e-45 172
MsG0780036302.01.T01 AT4G20770 24.729 461 256 10 256 633 24 476 4.11e-32 133
MsG0780036302.01.T01 AT5G52630 38.291 316 193 2 334 649 150 463 3.92e-62 217
MsG0780036302.01.T01 AT5G52630 22.043 372 241 4 150 481 36 398 2.84e-28 120
MsG0780036302.01.T01 AT5G52630 24.000 250 187 3 339 588 54 300 1.32e-15 80.9
MsG0780036302.01.T01 AT5G52630 21.835 316 226 6 149 456 136 438 5.20e-13 72.4
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MsG0780036302.01.T01 AT1G14470 31.662 379 219 6 169 545 196 536 1.63e-52 189
MsG0780036302.01.T01 AT5G66500 27.481 524 328 8 167 644 13 530 1.98e-61 214
MsG0780036302.01.T01 AT5G66500 24.516 310 191 12 141 429 197 484 9.16e-11 65.1
MsG0780036302.01.T01 AT4G19220 28.571 504 312 7 187 646 444 943 2.16e-61 221
MsG0780036302.01.T01 AT4G19220 23.393 560 329 14 172 639 213 764 7.42e-36 145
MsG0780036302.01.T01 AT4G19220 30.081 246 166 3 333 573 120 364 8.56e-18 88.2
MsG0780036302.01.T01 AT5G42450 32.764 351 211 7 320 646 43 392 2.99e-61 211
MsG0780036302.01.T01 AT5G03800 27.923 573 328 14 150 645 202 766 2.29e-60 217
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MsG0780036302.01.T01 AT1G06580 21.935 310 225 6 303 597 7 314 1.63e-12 70.1
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MsG0780036302.01.T01 AT3G09650 22.671 322 212 9 297 601 445 746 7.49e-12 69.3
MsG0780036302.01.T01 AT4G19890 22.977 383 256 10 264 620 313 682 8.59e-12 68.9
MsG0780036302.01.T01 AT3G22670 23.565 331 204 10 224 510 133 458 8.76e-12 68.6
MsG0780036302.01.T01 AT5G46100 21.637 342 220 9 250 574 60 370 1.35e-11 67.8
MsG0780036302.01.T01 AT5G42310 21.364 440 246 17 177 562 309 702 3.44e-11 67.0
MsG0780036302.01.T01 AT1G74900 22.472 267 186 6 314 565 136 396 6.97e-11 65.5
MsG0780036302.01.T01 AT3G16890 22.273 220 158 4 298 505 419 637 8.27e-11 65.5
MsG0780036302.01.T01 AT3G29290 23.000 300 209 10 245 524 114 411 8.37e-11 65.5
MsG0780036302.01.T01 AT3G29290 23.000 300 209 10 245 524 114 411 8.37e-11 65.5

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGTCTGCTTGTGCTGATTT+AGG 0.138674 7:-6147425 MsG0780036302.01.T01:CDS
TAAGATTAGTTTCATTAAAT+TGG 0.143648 7:+6149334 None:intergenic
GATTTAGGGGATTTAGAAAA+TGG 0.206045 7:-6147410 MsG0780036302.01.T01:CDS
TAGAACCTAATGCAATTATT+TGG 0.213756 7:-6146947 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGTCTGCTTGTGCTGATTTA+GGG 0.239744 7:-6147424 MsG0780036302.01.T01:CDS
GCTTGGTCTTCACTCATTGC+TGG 0.258270 7:-6147731 MsG0780036302.01.T01:CDS
CGTCGAATTGAAATCCTATA+TGG 0.261909 7:-6149603 MsG0780036302.01.T01:CDS
ACGAGCTATTTCGTTGTATA+AGG 0.272982 7:-6147987 MsG0780036302.01.T01:CDS
CACTTTGACATCATTAGATT+TGG 0.277858 7:+6149236 None:intergenic
AAGAATCACTTGATGTGTTT+TGG 0.280046 7:-6147286 MsG0780036302.01.T01:CDS
CCAACAAATGTAATTTCATT+TGG 0.286164 7:+6147146 None:intergenic
GAAATAGCTCGTAGAGGATT+AGG 0.300266 7:+6147998 None:intergenic
CAAGGTCATGGAGATTAGTA+TGG 0.311392 7:-6147372 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGAAAGTTGAGTACATTGTT+AGG 0.314312 7:-6147350 MsG0780036302.01.T01:CDS
TCGTGGAATGTGATGATTAC+TGG 0.336632 7:-6147638 MsG0780036302.01.T01:CDS
AGTTGGAACGCGTTGATTGC+GGG 0.340672 7:-6147545 MsG0780036302.01.T01:CDS
CTTGCAGCTTGTAAGGTTCA+TGG 0.357990 7:-6146915 MsG0780036302.01.T01:CDS
TCTACAGTCTCTAATGCATT+TGG 0.358243 7:+6149260 None:intergenic
CTCAACAACGTCACCTCATC+CGG 0.359225 7:+6147452 None:intergenic
AATCTGAAACCTTCTCTTGT+TGG 0.364683 7:-6149533 MsG0780036302.01.T01:CDS
GACTCTGCTTGCAGCTTGTA+AGG 0.365701 7:-6146922 MsG0780036302.01.T01:CDS
ACGAAAGCTTCAACAACATT+TGG 0.366470 7:+6149557 None:intergenic
AATTACATTTGTTGGTGTTT+TGG 0.370089 7:-6147138 MsG0780036302.01.T01:CDS
CCAAATGAAATTACATTTGT+TGG 0.376752 7:-6147146 MsG0780036302.01.T01:CDS
CTTCGCGAGGCGAGTGGGAT+GGG 0.382154 7:-6146800 MsG0780036302.01.T01:CDS
AAACATTCTCTTGTTGGTTT+CGG 0.386776 7:-6149497 MsG0780036302.01.T01:intron
GATGTGAAACATTCTCTTGT+TGG 0.387271 7:-6149503 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGAGAAGGTAAGGAAGTTAA+TGG 0.389520 7:-6146775 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATACATAAAGGTGTCTGATT+GGG 0.393406 7:+6148051 None:intergenic
CGTGGAACTCGATCATTGTT+GGG 0.393586 7:-6147238 MsG0780036302.01.T01:CDS
GTCCTCCAAATAATTGCATT+AGG 0.400802 7:+6146942 None:intergenic
CTTGGTCTTCACTCATTGCT+GGG 0.403148 7:-6147730 MsG0780036302.01.T01:CDS
CAAAGCATGGATTTGTTTGA+GGG 0.406896 7:+6148207 None:intergenic
GGTTGTGAGGAATACCCTTT+TGG 0.410231 7:-6147828 MsG0780036302.01.T01:CDS
AATGAAAGCTTTAACCATAT+AGG 0.413323 7:+6149589 None:intergenic
TTGTTCTTAAGGCGTGTACT+AGG 0.414452 7:-6147919 MsG0780036302.01.T01:CDS
AATCATGGCATTATACATAA+AGG 0.415294 7:+6148039 None:intergenic
AACCGCTTCCTTTAAAAGTC+CGG 0.419659 7:+6146992 None:intergenic
AATGCATCGACGTTCTGTTA+AGG 0.420070 7:-6147963 MsG0780036302.01.T01:CDS
CGGTTAAGGATGTTGTTAGT+TGG 0.424189 7:-6147562 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGGATGGGGCTGAGAAGGTA+AGG 0.426723 7:-6146785 MsG0780036302.01.T01:CDS
AACAACAACGTTAACTTCCT+CGG 0.430596 7:-6148166 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGAAATGCCTGAGAGAGATT+TGG 0.433637 7:-6147663 MsG0780036302.01.T01:CDS
CATTAGGCATTGTGGGTGTA+TGG 0.435735 7:-6147033 MsG0780036302.01.T01:CDS
AAATAGCTCGTAGAGGATTA+GGG 0.436004 7:+6147999 None:intergenic
TATACATAAAGGTGTCTGAT+TGG 0.436573 7:+6148050 None:intergenic
TTGGTAGCTTGTAGTCATGC+TGG 0.440899 7:-6147119 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATTTAGGGGATTTAGAAAAT+GGG 0.440980 7:-6147409 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATTGCGGGTTATGTTGTTTG+TGG 0.441686 7:-6147530 MsG0780036302.01.T01:CDS
TTTATGGGTTAATACTGGTT+CGG 0.444270 7:-6147894 MsG0780036302.01.T01:CDS
CATACACCCACAATGCCTAA+TGG 0.453665 7:+6147034 None:intergenic
AATACTGGTTCGGCGGTTCA+TGG 0.458735 7:-6147884 MsG0780036302.01.T01:CDS
AGCCAACCATTAGGCATTGT+GGG 0.458867 7:-6147040 MsG0780036302.01.T01:CDS
CAACTAACAACATCCTTAAC+CGG 0.458929 7:+6147563 None:intergenic
ATGTATAATGCCATGATTCG+AGG 0.459967 7:-6148034 MsG0780036302.01.T01:CDS
TCAAAGCATGGATTTGTTTG+AGG 0.460395 7:+6148206 None:intergenic
ATGCATCGACGTTCTGTTAA+GGG 0.460967 7:-6147962 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGGTTCGGCGGTTCATGGAA+TGG 0.463808 7:-6147879 MsG0780036302.01.T01:CDS
CACGAAACCAAATCTCTCTC+AGG 0.477037 7:+6147656 None:intergenic
GAAAGTTGAGTACATTGTTA+GGG 0.477858 7:-6147349 MsG0780036302.01.T01:CDS
TAGTTGGAACGCGTTGATTG+CGG 0.488758 7:-6147546 MsG0780036302.01.T01:CDS
TAGATAAAGATGTGATTTCG+TGG 0.492778 7:-6147256 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGTGCATAGTTTGTGACGGT+TGG 0.497531 7:+6148094 None:intergenic
CTGAGATGAACCTCGAATCA+TGG 0.499348 7:+6148024 None:intergenic
ATAAGATTGAGCCAACCATT+AGG 0.500298 7:-6147049 MsG0780036302.01.T01:CDS
CTGAGAGAGATTTGGTTTCG+TGG 0.500425 7:-6147655 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGGTAGCTTGTAGTCATGCT+GGG 0.501064 7:-6147118 MsG0780036302.01.T01:CDS
CGAGTGGGATGGGGCTGAGA+AGG 0.502519 7:-6146790 MsG0780036302.01.T01:CDS
AACCTAATGCAATTATTTGG+AGG 0.504655 7:-6146944 MsG0780036302.01.T01:CDS
GATAGTTATGGTTGAAAATG+TGG 0.506031 7:-6149669 None:intergenic
GCTTCGCGAGGCGAGTGGGA+TGG 0.506767 7:-6146801 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATTGTTGGGATGGCATTACA+TGG 0.506826 7:-6147224 MsG0780036302.01.T01:CDS
ACAATCTCAACCTCACTTGT+GGG 0.508736 7:-6148130 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGCATTACATGGACATGGTA+AGG 0.509313 7:-6147213 MsG0780036302.01.T01:CDS
CGTGGAATGTGATGATTACT+GGG 0.509392 7:-6147637 MsG0780036302.01.T01:CDS
AACAATCTCAACCTCACTTG+TGG 0.513304 7:-6148131 MsG0780036302.01.T01:CDS
TTGACGAGATGTGTAAAGCC+GGG 0.518412 7:-6147481 MsG0780036302.01.T01:CDS
TCGTGGAACTCGATCATTGT+TGG 0.519792 7:-6147239 MsG0780036302.01.T01:CDS
TTCGCGAGGCGAGTGGGATG+GGG 0.521252 7:-6146799 MsG0780036302.01.T01:CDS
AAAAGTACATGCCAAGGTCA+TGG 0.527674 7:-6147384 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGGGAATTTGAGCAAACAGT+TGG 0.528868 7:+6148071 None:intergenic
TGGATTGAGCAAACAAGCGT+TGG 0.529498 7:-6147510 MsG0780036302.01.T01:CDS
GTATGTTAAGCAAGGGGAGA+TGG 0.530916 7:-6147615 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATATGCTTCGCGAGGCGAGT+GGG 0.532337 7:-6146805 MsG0780036302.01.T01:CDS
AATGCATTTGGCTCTAACAA+TGG 0.536969 7:+6149272 None:intergenic
TTTGACGAGATGTGTAAAGC+CGG 0.544782 7:-6147482 MsG0780036302.01.T01:CDS
GTCTGCTTGTGCTGATTTAG+GGG 0.557943 7:-6147423 MsG0780036302.01.T01:CDS
CAAATCTAATGATGTCAAAG+TGG 0.558135 7:-6149235 MsG0780036302.01.T01:CDS
GAACTCGATCATTGTTGGGA+TGG 0.562033 7:-6147234 MsG0780036302.01.T01:CDS
TACATAAAGGTGTCTGATTG+GGG 0.564406 7:+6148052 None:intergenic
CACCCACAATGCCTAATGGT+TGG 0.564604 7:+6147038 None:intergenic
GTACACGCCTTAAGAACAAA+CGG 0.564959 7:+6147923 None:intergenic
CATGCTTTGATGATCATCAA+CGG 0.566209 7:-6148193 MsG0780036302.01.T01:CDS
CATACTAATCTCCATGACCT+TGG 0.578585 7:+6147373 None:intergenic
ATTACTGGGTATGTTAAGCA+AGG 0.579861 7:-6147623 MsG0780036302.01.T01:CDS
TTGGTTCTAATGTGGTTGTG+AGG 0.581541 7:-6147841 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATTGCTGGGTACGCGAAACG+TGG 0.582191 7:-6147716 MsG0780036302.01.T01:CDS
AGATGTGGAGTTGGCAAAAG+TGG 0.583560 7:-6146892 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGTTCATGGAGATGTGGAGT+TGG 0.583749 7:-6146901 MsG0780036302.01.T01:CDS
TATATGCTTCGCGAGGCGAG+TGG 0.584798 7:-6146806 MsG0780036302.01.T01:CDS
ACTTGGGTTTGGTTCTAATG+TGG 0.584968 7:-6147849 MsG0780036302.01.T01:CDS
CGTTGATGATCATCAAAGCA+TGG 0.584985 7:+6148194 None:intergenic
GTGACGGTTGGAGTTGCAGT+GGG 0.586929 7:+6148106 None:intergenic
TCAACAACGTCACCTCATCC+GGG 0.587184 7:+6147453 None:intergenic
GAGCCAACCATTAGGCATTG+TGG 0.588474 7:-6147041 MsG0780036302.01.T01:CDS
TCAACAGAACCAACAAGAGA+AGG 0.598231 7:+6149524 None:intergenic
TTGCTGGGTACGCGAAACGT+GGG 0.602144 7:-6147715 MsG0780036302.01.T01:CDS
AAGGTCATGGAGATTAGTAT+GGG 0.603617 7:-6147371 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGCAACAACATTCATAAGTG+TGG 0.606035 7:+6149293 None:intergenic
AGCGGTGTAACGAAAATTCG+TGG 0.607191 7:-6146747 MsG0780036302.01.T01:CDS
AAGGGGAGATGGAGAGCGCG+AGG 0.612959 7:-6147604 MsG0780036302.01.T01:CDS
AGGAAGTTAATGGATGATAG+CGG 0.621646 7:-6146765 MsG0780036302.01.T01:CDS
ATTGATATGTATGCAAAATG+TGG 0.622121 7:-6147317 MsG0780036302.01.T01:CDS
CACCTCATCCGGGAAAACCC+CGG 0.623035 7:+6147463 None:intergenic
TTACTGGGTATGTTAAGCAA+GGG 0.628711 7:-6147622 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGACGAGATGTGTAAAGCCG+GGG 0.631312 7:-6147480 MsG0780036302.01.T01:CDS
CATGCTGGGAAAATTGATGA+GGG 0.631374 7:-6147104 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGTGACGGTTGGAGTTGCAG+TGG 0.633411 7:+6148105 None:intergenic
TCATGCTGGGAAAATTGATG+AGG 0.634498 7:-6147105 MsG0780036302.01.T01:CDS
TACTGGGTATGTTAAGCAAG+GGG 0.635070 7:-6147621 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGCAGTGGGACCCACAAGTG+AGG 0.635192 7:+6148120 None:intergenic
ATGGGTTAATACTGGTTCGG+CGG 0.643425 7:-6147891 MsG0780036302.01.T01:CDS
TGCTGGGTACGCGAAACGTG+GGG 0.645645 7:-6147714 MsG0780036302.01.T01:CDS
TTGTTAAGACAAGATTTCCG+AGG 0.646377 7:+6148149 None:intergenic
TTGGTGTGCATAGTTTGTGA+CGG 0.650062 7:+6148090 None:intergenic
GGGTGTATGGTAGACATGCT+AGG 0.650064 7:-6147020 MsG0780036302.01.T01:CDS
TTGTAAGGTTCATGGAGATG+TGG 0.656711 7:-6146907 MsG0780036302.01.T01:CDS
AGTTCGTTGATAGGAAACAA+AGG 0.658079 7:-6149384 MsG0780036302.01.T01:intron
GTAGACATGCTAGGACGCGC+CGG 0.661890 7:-6147011 MsG0780036302.01.T01:CDS
TCAAACTTATATGCTTCGCG+AGG 0.687978 7:-6146813 MsG0780036302.01.T01:CDS
GGGATGGCATTACATGGACA+TGG 0.695282 7:-6147218 MsG0780036302.01.T01:CDS
GTGGGGATGTGAAAGTTGCG+AGG 0.700017 7:-6147697 MsG0780036302.01.T01:CDS
TACAACGAAATAGCTCGTAG+AGG 0.701642 7:+6147992 None:intergenic
TTAGAACATAGTCACCACTG+TGG 0.823381 7:+6146838 None:intergenic
AGTATGAGAAAAGACCACAG+TGG 0.850764 7:-6146852 MsG0780036302.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTCCATAAAAAGATAATTAA+CGG - Chr7:6147522-6147541 MsG0780036302.01.T01:CDS 15.0%
!!! ACATTTTTAATTAACACAAA+TGG + Chr7:6147935-6147954 None:intergenic 15.0%
!!! TAAGATTAGTTTCATTAAAT+TGG + Chr7:6147050-6147069 None:intergenic 15.0%
!! AAAAGTTAACTTAAATGATG+AGG + Chr7:6147830-6147849 None:intergenic 20.0%
!! AAAGTTAACTTAAATGATGA+GGG + Chr7:6147829-6147848 None:intergenic 20.0%
!! AATTTATTATCGAAGATACA+TGG - Chr7:6146948-6146967 MsG0780036302.01.T01:CDS 20.0%
!! GTATCTTCGATAATAAATTA+AGG + Chr7:6146947-6146966 None:intergenic 20.0%
!!! AACCGTTAATTATCTTTTTA+TGG + Chr7:6147527-6147546 None:intergenic 20.0%
!!! CATCATTTAAGTTAACTTTT+GGG - Chr7:6147830-6147849 MsG0780036302.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTCTACACTTTTTAAGAA+TGG + Chr7:6148061-6148080 None:intergenic 20.0%
!!! TCATCATTTAAGTTAACTTT+TGG - Chr7:6147829-6147848 MsG0780036302.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTATGGAATACTTTTTCTT+TGG + Chr7:6147511-6147530 None:intergenic 20.0%
! AACATGATCAGAAAAAGAAT+AGG - Chr7:6148122-6148141 MsG0780036302.01.T01:CDS 25.0%
! AATCATGGCATTATACATAA+AGG + Chr7:6148345-6148364 None:intergenic 25.0%
! AGAATAGATAACAATCATGT+TGG - Chr7:6147694-6147713 MsG0780036302.01.T01:CDS 25.0%
! ATGGATTTGAAAATATGATC+TGG + Chr7:6147916-6147935 None:intergenic 25.0%
! ATTGATATGTATGCAAAATG+TGG - Chr7:6149064-6149083 MsG0780036302.01.T01:intron 25.0%
! ATTTAGCATGAAAAACCAAA+AGG + Chr7:6148571-6148590 None:intergenic 25.0%
! ATTTAGGGGATTTAGAAAAT+GGG - Chr7:6148972-6148991 MsG0780036302.01.T01:intron 25.0%
! CCAAATGAAATTACATTTGT+TGG - Chr7:6149235-6149254 MsG0780036302.01.T01:CDS 25.0%
! CCAACAAATGTAATTTCATT+TGG + Chr7:6149238-6149257 None:intergenic 25.0%
! TAGAACCTAATGCAATTATT+TGG - Chr7:6149434-6149453 MsG0780036302.01.T01:intron 25.0%
! TTTAGCATGAAAAACCAAAA+GGG + Chr7:6148570-6148589 None:intergenic 25.0%
! TTTGAAGAACTCTTAATAAG+AGG + Chr7:6147623-6147642 None:intergenic 25.0%
!! AATGAAAGCTTTAACCATAT+AGG + Chr7:6146795-6146814 None:intergenic 25.0%
!!! AATTACATTTGTTGGTGTTT+TGG - Chr7:6149243-6149262 MsG0780036302.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACTTTTTGATGATTCTTGTA+AGG - Chr7:6148616-6148635 MsG0780036302.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTTTTGATGATTCTTGTAA+GGG - Chr7:6148617-6148636 MsG0780036302.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTGATGATTCTTGTAAG+GGG - Chr7:6148618-6148637 MsG0780036302.01.T01:intron 25.0%
AACCTAATGCAATTATTTGG+AGG - Chr7:6149437-6149456 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
AAGCACAACAAAGAACAAAA+AGG - Chr7:6147568-6147587 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
AGGATTCCAACAAAAAAACT+TGG + Chr7:6147603-6147622 None:intergenic 30.0%
CAAATCTAATGATGTCAAAG+TGG - Chr7:6147146-6147165 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
CACTAATGTGAAACAAAGTT+TGG - Chr7:6148095-6148114 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
CACTTTGACATCATTAGATT+TGG + Chr7:6147148-6147167 None:intergenic 30.0%
GAAAGTTGAGTACATTGTTA+GGG - Chr7:6149032-6149051 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
GAGAAAAGTTTAATGTGATC+TGG - Chr7:6147272-6147291 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
GATTAATTGAGTTCGTTGAT+AGG - Chr7:6146988-6147007 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
GATTTAGGGGATTTAGAAAA+TGG - Chr7:6148971-6148990 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
TAGATAAAGATGTGATTTCG+TGG - Chr7:6149125-6149144 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
TATTTATACACTAACCTGTC+TGG + Chr7:6147796-6147815 None:intergenic 30.0%
TGAGGTAGAATTATTGAAGT+TGG - Chr7:6147723-6147742 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
TTATTTATGGATCATTGGGA+AGG + Chr7:6147348-6147367 None:intergenic 30.0%
TTTAGTCCTATGTTATGCAT+TGG + Chr7:6147483-6147502 None:intergenic 30.0%
! AAGAATCACTTGATGTGTTT+TGG - Chr7:6149095-6149114 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
! ATCACATTAAACTTTTCTCC+TGG + Chr7:6147271-6147290 None:intergenic 30.0%
! TGAAAATATGATCTGGAGTT+TGG + Chr7:6147909-6147928 None:intergenic 30.0%
! TTTATGGGTTAATACTGGTT+CGG - Chr7:6148487-6148506 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
!! AAACATTCTCTTGTTGGTTT+CGG - Chr7:6146884-6146903 MsG0780036302.01.T01:CDS 30.0%
!! ATACATAAAGGTGTCTGATT+GGG + Chr7:6148333-6148352 None:intergenic 30.0%
!! TATACATAAAGGTGTCTGAT+TGG + Chr7:6148334-6148353 None:intergenic 30.0%
!! TTGGTTTTTCATGCTAAATG+TGG - Chr7:6148572-6148591 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTGATGATTCTTGTAAGG+GGG - Chr7:6148619-6148638 MsG0780036302.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTGTTCTTTGTTGTGCTT+AGG + Chr7:6147568-6147587 None:intergenic 30.0%
AAATAGCTCGTAGAGGATTA+GGG + Chr7:6148385-6148404 None:intergenic 35.0%
AACAACAACGTTAACTTCCT+CGG - Chr7:6148215-6148234 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
AAGGTCATGGAGATTAGTAT+GGG - Chr7:6149010-6149029 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
ACGAAAGCTTCAACAACATT+TGG + Chr7:6146827-6146846 None:intergenic 35.0%
ATAAGATTGAGCCAACCATT+AGG - Chr7:6149332-6149351 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
ATGTATAATGCCATGATTCG+AGG - Chr7:6148347-6148366 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
ATTACTGGGTATGTTAAGCA+AGG - Chr7:6148758-6148777 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
CAACTAACAACATCCTTAAC+CGG + Chr7:6148821-6148840 None:intergenic 35.0%
CACATTATCCCAAACTTTCA+TGG + Chr7:6147226-6147245 None:intergenic 35.0%
CGGCTTATTTATGGATCATT+GGG + Chr7:6147352-6147371 None:intergenic 35.0%
CGTCGAATTGAAATCCTATA+TGG - Chr7:6146778-6146797 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
GATGTGAAACATTCTCTTGT+TGG - Chr7:6146878-6146897 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
GGAAAGTTGAGTACATTGTT+AGG - Chr7:6149031-6149050 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
GTCCTCCAAATAATTGCATT+AGG + Chr7:6149442-6149461 None:intergenic 35.0%
TCGGCTTATTTATGGATCAT+TGG + Chr7:6147353-6147372 None:intergenic 35.0%
TCTACAGTCTCTAATGCATT+TGG + Chr7:6147124-6147143 None:intergenic 35.0%
TGACAACACCATGAAAGTTT+GGG - Chr7:6147215-6147234 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
TGAGAAGGTAAGGAAGTTAA+TGG - Chr7:6149606-6149625 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
TTACTGGGTATGTTAAGCAA+GGG - Chr7:6148759-6148778 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
TTATTTGTCCCACATTACTC+AGG - Chr7:6147768-6147787 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
TTGACAACACCATGAAAGTT+TGG - Chr7:6147214-6147233 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTAAGACAAGATTTCCG+AGG + Chr7:6148235-6148254 None:intergenic 35.0%
! AATCTGAAACCTTCTCTTGT+TGG - Chr7:6146848-6146867 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
! ACATTAAACTTTTCTCCTGG+TGG + Chr7:6147268-6147287 None:intergenic 35.0%
! ACGAGCTATTTCGTTGTATA+AGG - Chr7:6148394-6148413 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
! AGGAAGTTAATGGATGATAG+CGG - Chr7:6149616-6149635 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
! AGTTCGTTGATAGGAAACAA+AGG - Chr7:6146997-6147016 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
! CAAAGCATGGATTTGTTTGA+GGG + Chr7:6148177-6148196 None:intergenic 35.0%
! CACTTTTCCGTTTGTTCTTA+AGG - Chr7:6148451-6148470 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
! CATGAAAGTTTGGGATAATG+TGG - Chr7:6147224-6147243 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
! CATGCTTTGATGATCATCAA+CGG - Chr7:6148188-6148207 MsG0780036302.01.T01:CDS 35.0%
! TCAAAGCATGGATTTGTTTG+AGG + Chr7:6148178-6148197 None:intergenic 35.0%
!! AATGCATTTGGCTCTAACAA+TGG + Chr7:6147112-6147131 None:intergenic 35.0%
!! AGGCTTTTATGGGTTAATAC+TGG - Chr7:6148482-6148501 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
!! GGATTTGTTTGAGGGTTTTA+AGG + Chr7:6148169-6148188 None:intergenic 35.0%
!! TACATAAAGGTGTCTGATTG+GGG + Chr7:6148332-6148351 None:intergenic 35.0%
!! TCCTATGTTATGCATTGGTT+GGG + Chr7:6147478-6147497 None:intergenic 35.0%
!!! ATGGAATGGTTTTGAGACTT+GGG - Chr7:6148516-6148535 MsG0780036302.01.T01:intron 35.0%
!!! TGTTTGAGGGTTTTAAGGTT+GGG + Chr7:6148164-6148183 None:intergenic 35.0%
!!! TTGTTTGAGGGTTTTAAGGT+TGG + Chr7:6148165-6148184 None:intergenic 35.0%
AACAATCTCAACCTCACTTG+TGG - Chr7:6148250-6148269 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
ACAATCTCAACCTCACTTGT+GGG - Chr7:6148251-6148270 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
AGTATGAGAAAAGACCACAG+TGG - Chr7:6149529-6149548 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTTGGGATGGCATTACA+TGG - Chr7:6149157-6149176 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
CAAGGTCATGGAGATTAGTA+TGG - Chr7:6149009-6149028 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
CAATCATGTTGGACACTTTG+AGG - Chr7:6147705-6147724 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
CATACTAATCTCCATGACCT+TGG + Chr7:6149011-6149030 None:intergenic 40.0%
CATGCTGGGAAAATTGATGA+GGG - Chr7:6149277-6149296 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
CGGTTAAGGATGTTGTTAGT+TGG - Chr7:6148819-6148838 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
CGTGGAATGTGATGATTACT+GGG - Chr7:6148744-6148763 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
CTCATAGATTTGTCGTAACG+AGG + Chr7:6147318-6147337 None:intergenic 40.0%
GAAATAGCTCGTAGAGGATT+AGG + Chr7:6148386-6148405 None:intergenic 40.0%
GGCAACAACATTCATAAGTG+TGG + Chr7:6147091-6147110 None:intergenic 40.0%
GTACACGCCTTAAGAACAAA+CGG + Chr7:6148461-6148480 None:intergenic 40.0%
TACAACGAAATAGCTCGTAG+AGG + Chr7:6148392-6148411 None:intergenic 40.0%
TACTGGGTATGTTAAGCAAG+GGG - Chr7:6148760-6148779 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
TCAAACTTATATGCTTCGCG+AGG - Chr7:6149568-6149587 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
TCAACAGAACCAACAAGAGA+AGG + Chr7:6146860-6146879 None:intergenic 40.0%
TCATGCTGGGAAAATTGATG+AGG - Chr7:6149276-6149295 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAACCAATGCATAACAT+AGG - Chr7:6147474-6147493 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
TCGTGGAATGTGATGATTAC+TGG - Chr7:6148743-6148762 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
TGAAATGCCTGAGAGAGATT+TGG - Chr7:6148718-6148737 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
TTAGAACATAGTCACCACTG+TGG + Chr7:6149546-6149565 None:intergenic 40.0%
TTGTAAGGTTCATGGAGATG+TGG - Chr7:6149474-6149493 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
TTGTTCTTAAGGCGTGTACT+AGG - Chr7:6148462-6148481 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
TTTATCTTTCATCCACCACC+AGG - Chr7:6147250-6147269 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
TTTGACGAGATGTGTAAAGC+CGG - Chr7:6148899-6148918 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
! AAAAGTACATGCCAAGGTCA+TGG - Chr7:6148997-6149016 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
! AACCGCTTCCTTTAAAAGTC+CGG + Chr7:6149392-6149411 None:intergenic 40.0%
! AATGCATCGACGTTCTGTTA+AGG - Chr7:6148418-6148437 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
! ATGCATCGACGTTCTGTTAA+GGG - Chr7:6148419-6148438 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
! ATGCATGCATTGTGATTTGG+TGG + Chr7:6147425-6147444 None:intergenic 40.0%
! ATTGCGGGTTATGTTGTTTG+TGG - Chr7:6148851-6148870 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
! GTCCTATGTTATGCATTGGT+TGG + Chr7:6147479-6147498 None:intergenic 40.0%
! TGATCTGGTCGGCTTATTTA+TGG + Chr7:6147361-6147380 None:intergenic 40.0%
! TGGGAAAAAAGTACATGCCA+AGG - Chr7:6148991-6149010 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
! TGTTCTTTGTTGTGCTTAGG+TGG + Chr7:6147565-6147584 None:intergenic 40.0%
! TTAAACTTTTCTCCTGGTGG+TGG + Chr7:6147265-6147284 None:intergenic 40.0%
! TTGGTGTGCATAGTTTGTGA+CGG + Chr7:6148294-6148313 None:intergenic 40.0%
!! ACTTGGGTTTGGTTCTAATG+TGG - Chr7:6148532-6148551 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
!! CGTTGATGATCATCAAAGCA+TGG + Chr7:6148190-6148209 None:intergenic 40.0%
!! GTCTTTTCAAGATGATGCAG+AGG - Chr7:6149200-6149219 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTCTGCTTGTGCTGATTTA+GGG - Chr7:6148957-6148976 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
!! TTGGTTCTAATGTGGTTGTG+AGG - Chr7:6148540-6148559 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
!! TTGTCTGCTTGTGCTGATTT+AGG - Chr7:6148956-6148975 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
!!! ATGGTTTTGAGACTTGGGTT+TGG - Chr7:6148521-6148540 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
!!! CATGGAATGGTTTTGAGACT+TGG - Chr7:6148515-6148534 MsG0780036302.01.T01:intron 40.0%
!!! GACGTGCCAAGTTTTTTTGT+TGG - Chr7:6147594-6147613 MsG0780036302.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTAAGGTTGGGAAGTGT+GGG + Chr7:6148155-6148174 None:intergenic 40.0%
ACATTACTCAGGTTCCAGAC+AGG - Chr7:6147779-6147798 MsG0780036302.01.T01:CDS 45.0%
AGATGTGGAGTTGGCAAAAG+TGG - Chr7:6149489-6149508 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
AGCGGTGTAACGAAAATTCG+TGG - Chr7:6149634-6149653 MsG0780036302.01.T01:CDS 45.0%
CACGAAACCAAATCTCTCTC+AGG + Chr7:6148728-6148747 None:intergenic 45.0%
CATACACCCACAATGCCTAA+TGG + Chr7:6149350-6149369 None:intergenic 45.0%
CGCATGCATGCATTGTGATT+TGG + Chr7:6147428-6147447 None:intergenic 45.0%
CGTGGAACTCGATCATTGTT+GGG - Chr7:6149143-6149162 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
CTGAGATGAACCTCGAATCA+TGG + Chr7:6148360-6148379 None:intergenic 45.0%
CTTAGGTGGATGCAGAAAAG+AGG + Chr7:6147551-6147570 None:intergenic 45.0%
CTTGCAGCTTGTAAGGTTCA+TGG - Chr7:6149466-6149485 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
GAACTCGATCATTGTTGGGA+TGG - Chr7:6149147-6149166 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
GGCATTACATGGACATGGTA+AGG - Chr7:6149168-6149187 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
GGGGAATTTGAGCAAACAGT+TGG + Chr7:6148313-6148332 None:intergenic 45.0%
GTATGTTAAGCAAGGGGAGA+TGG - Chr7:6148766-6148785 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
GTCATTGCTTTCACGTGATC+TGG + Chr7:6147376-6147395 None:intergenic 45.0%
TCGTGGAACTCGATCATTGT+TGG - Chr7:6149142-6149161 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
TGATTCTTGTAAGGGGGATG+TGG - Chr7:6148625-6148644 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
TGGATTGAGCAAACAAGCGT+TGG - Chr7:6148871-6148890 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
TTGACGAGATGTGTAAAGCC+GGG - Chr7:6148900-6148919 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
TTGCTTTCACGTGATCTGGT+CGG + Chr7:6147372-6147391 None:intergenic 45.0%
! AGCCAACCATTAGGCATTGT+GGG - Chr7:6149341-6149360 MsG0780036302.01.T01:CDS 45.0%
! AGGCGTGTACTAGGCTTTTA+TGG - Chr7:6148471-6148490 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
! CATTAGGCATTGTGGGTGTA+TGG - Chr7:6149348-6149367 MsG0780036302.01.T01:CDS 45.0%
! CTGAGAGAGATTTGGTTTCG+TGG - Chr7:6148726-6148745 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
! CTTGGTCTTCACTCATTGCT+GGG - Chr7:6148651-6148670 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
! GGCGTGTACTAGGCTTTTAT+GGG - Chr7:6148472-6148491 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
! GGTGTTGTCAACTGACTCAA+TGG + Chr7:6147205-6147224 None:intergenic 45.0%
! GGTTGTGAGGAATACCCTTT+TGG - Chr7:6148553-6148572 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
! GTCTGGAACCTGAGTAATGT+GGG + Chr7:6147779-6147798 None:intergenic 45.0%
! TGGTAGCTTGTAGTCATGCT+GGG - Chr7:6149263-6149282 MsG0780036302.01.T01:CDS 45.0%
! TGTCTGGAACCTGAGTAATG+TGG + Chr7:6147780-6147799 None:intergenic 45.0%
! TGTGCATAGTTTGTGACGGT+TGG + Chr7:6148290-6148309 None:intergenic 45.0%
! TTGGTAGCTTGTAGTCATGC+TGG - Chr7:6149262-6149281 MsG0780036302.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGGGTTAATACTGGTTCGG+CGG - Chr7:6148490-6148509 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
!! GATACTTTTTGACGAGGCTC+CGG - Chr7:6148799-6148818 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
!! GTCTGCTTGTGCTGATTTAG+GGG - Chr7:6148958-6148977 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
!! TAGTTGGAACGCGTTGATTG+CGG - Chr7:6148835-6148854 MsG0780036302.01.T01:intron 45.0%
!!! GGTTTTAAGGTTGGGAAGTG+TGG + Chr7:6148156-6148175 None:intergenic 45.0%
CACCCACAATGCCTAATGGT+TGG + Chr7:6149346-6149365 None:intergenic 50.0%
CTCAACAACGTCACCTCATC+CGG + Chr7:6148932-6148951 None:intergenic 50.0%
GACTCTGCTTGCAGCTTGTA+AGG - Chr7:6149459-6149478 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
GCATGCATGCGAACATCTGA+CGG - Chr7:6147437-6147456 MsG0780036302.01.T01:CDS 50.0%
GGGATGGCATTACATGGACA+TGG - Chr7:6149163-6149182 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
GGGTGTATGGTAGACATGCT+AGG - Chr7:6149361-6149380 MsG0780036302.01.T01:CDS 50.0%
GGTTCATGGAGATGTGGAGT+TGG - Chr7:6149480-6149499 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
TCAACAACGTCACCTCATCC+GGG + Chr7:6148931-6148950 None:intergenic 50.0%
TGACGAGATGTGTAAAGCCG+GGG - Chr7:6148901-6148920 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
! GAGCCAACCATTAGGCATTG+TGG - Chr7:6149340-6149359 MsG0780036302.01.T01:CDS 50.0%
! GCTTGGTCTTCACTCATTGC+TGG - Chr7:6148650-6148669 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
! TTTTGACGAGGCTCCGGTTA+AGG - Chr7:6148805-6148824 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
!! AATACTGGTTCGGCGGTTCA+TGG - Chr7:6148497-6148516 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
!! AGTTGGAACGCGTTGATTGC+GGG - Chr7:6148836-6148855 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
!! CGCCGGACTTTTAAAGGAAG+CGG - Chr7:6149387-6149406 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
!! CGCGAGGATACTTTTTGACG+AGG - Chr7:6148793-6148812 MsG0780036302.01.T01:intron 50.0%
ATATGCTTCGCGAGGCGAGT+GGG - Chr7:6149576-6149595 MsG0780036302.01.T01:CDS 55.0%
ATTGCTGGGTACGCGAAACG+TGG - Chr7:6148665-6148684 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
GTAAGGGGGATGTGGTTGCT+TGG - Chr7:6148633-6148652 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
GTGACGGTTGGAGTTGCAGT+GGG + Chr7:6148278-6148297 None:intergenic 55.0%
GTGGGGATGTGAAAGTTGCG+AGG - Chr7:6148684-6148703 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
TATATGCTTCGCGAGGCGAG+TGG - Chr7:6149575-6149594 MsG0780036302.01.T01:CDS 55.0%
TGTGACGGTTGGAGTTGCAG+TGG + Chr7:6148279-6148298 None:intergenic 55.0%
TTGCTGGGTACGCGAAACGT+GGG - Chr7:6148666-6148685 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
! AGGACGCGCCGGACTTTTAA+AGG - Chr7:6149381-6149400 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
! GTGTAAAGCCGGGGTTTTCC+CGG - Chr7:6148910-6148929 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
! TGGTTCGGCGGTTCATGGAA+TGG - Chr7:6148502-6148521 MsG0780036302.01.T01:intron 55.0%
CACCTCATCCGGGAAAACCC+CGG + Chr7:6148921-6148940 None:intergenic 60.0%
GGGATGGGGCTGAGAAGGTA+AGG - Chr7:6149596-6149615 MsG0780036302.01.T01:CDS 60.0%
GTAGACATGCTAGGACGCGC+CGG - Chr7:6149370-6149389 MsG0780036302.01.T01:CDS 60.0%
TGCAGTGGGACCCACAAGTG+AGG + Chr7:6148264-6148283 None:intergenic 60.0%
TGCTGGGTACGCGAAACGTG+GGG - Chr7:6148667-6148686 MsG0780036302.01.T01:intron 60.0%
CGAGTGGGATGGGGCTGAGA+AGG - Chr7:6149591-6149610 MsG0780036302.01.T01:CDS 65.0%
CTTCGCGAGGCGAGTGGGAT+GGG - Chr7:6149581-6149600 MsG0780036302.01.T01:CDS 65.0%
TTCGCGAGGCGAGTGGGATG+GGG - Chr7:6149582-6149601 MsG0780036302.01.T01:CDS 65.0%
! AAGGGGAGATGGAGAGCGCG+AGG - Chr7:6148777-6148796 MsG0780036302.01.T01:intron 65.0%
! AGCCGGGGTTTTCCCGGATG+AGG - Chr7:6148916-6148935 MsG0780036302.01.T01:intron 65.0%
GCTTCGCGAGGCGAGTGGGA+TGG - Chr7:6149580-6149599 MsG0780036302.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 6146719 6149684 6146719 ID=MsG0780036302.01;Name=MsG0780036302.01
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Chr7 exon 6149498 6149684 6149498 ID=MsG0780036302.01.T01:exon:3336;Parent=MsG0780036302.01.T01
Chr7 exon 6149195 6149393 6149195 ID=MsG0780036302.01.T01:exon:3335;Parent=MsG0780036302.01.T01
Chr7 exon 6146719 6148282 6146719 ID=MsG0780036302.01.T01:exon:3334;Parent=MsG0780036302.01.T01
Chr7 CDS 6149498 6149684 6149498 ID=MsG0780036302.01.T01:cds;Parent=MsG0780036302.01.T01
Chr7 CDS 6149195 6149393 6149195 ID=MsG0780036302.01.T01:cds;Parent=MsG0780036302.01.T01
Chr7 CDS 6146719 6148282 6146719 ID=MsG0780036302.01.T01:cds;Parent=MsG0780036302.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036302.01.T01

ATGGTTGAAAATGTGGTTAACAATTATGTTGAGTCAAAATCAAGTGATGTCGAGTCTTTCGTCGAATTGAAATCCTATATGGTTAAAGCTTTCATTGATGTAAAACCAAATGTTGTTGAAGCTTTCGTTAATCTGAAACCTTCTCTTGTTGGTTCTGTTGATGTGAAACATTCTCTTGTTGGTTTCGGAAACAAAGGTGTGATTTACTTTTATTATAGAGAAATCCAATTTAATGAAACTAATCTTATTGTGACTGACAGAGATACCACACTTATGAATGTTGTTGCCATTGTTAGAGCCAAATGCATTAGAGACTGTAGAACCAAATCTAATGATGTCAAAGTGGATCTGAAAGATAAAGAAATCAAAGATGTGACATCCATTGACAACATGATCAGAAAAAGAATAGGCTTCAAACCCACACTTCCCAACCTTAAAACCCTCAAACAAATCCATGCTTTGATGATCATCAACGGTTTCAACAACAACGTTAACTTCCTCGGAAATCTTGTCTTAACAATCTCAACCTCACTTGTGGGTCCCACTGCAACTCCAACCGTCACAAACTATGCACACCAACTGTTTGCTCAAATTCCCCAATCAGACACCTTTATGTATAATGCCATGATTCGAGGTTCATCTCAGAGCCCTAATCCTCTACGAGCTATTTCGTTGTATAAGGAAATGCATCGACGTTCTGTTAAGGGTGATAACTACACTTTTCCGTTTGTTCTTAAGGCGTGTACTAGGCTTTTATGGGTTAATACTGGTTCGGCGGTTCATGGAATGGTTTTGAGACTTGGGTTTGGTTCTAATGTGGTTGTGAGGAATACCCTTTTGGTTTTTCATGCTAAATGTGGTGACTTGAACGTTGCAACTTCACTTTTTGATGATTCTTGTAAGGGGGATGTGGTTGCTTGGTCTTCACTCATTGCTGGGTACGCGAAACGTGGGGATGTGAAAGTTGCGAGGAAATTGTTTGATGAAATGCCTGAGAGAGATTTGGTTTCGTGGAATGTGATGATTACTGGGTATGTTAAGCAAGGGGAGATGGAGAGCGCGAGGATACTTTTTGACGAGGCTCCGGTTAAGGATGTTGTTAGTTGGAACGCGTTGATTGCGGGTTATGTTGTTTGTGGATTGAGCAAACAAGCGTTGGACTTGTTTGACGAGATGTGTAAAGCCGGGGTTTTCCCGGATGAGGTGACGTTGTTGAGTTTGTTGTCTGCTTGTGCTGATTTAGGGGATTTAGAAAATGGGAAAAAAGTACATGCCAAGGTCATGGAGATTAGTATGGGAAAGTTGAGTACATTGTTAGGGAATGCTCTTATTGATATGTATGCAAAATGTGGAAACATTAAAGAATCACTTGATGTGTTTTGGTCGATAGTAGATAAAGATGTGATTTCGTGGAACTCGATCATTGTTGGGATGGCATTACATGGACATGGTAAGGAATCGCTTAGTCTTTTCAAGATGATGCAGAGGACTAAGATTTGTCCAAATGAAATTACATTTGTTGGTGTTTTGGTAGCTTGTAGTCATGCTGGGAAAATTGATGAGGGTTATAAATATTTTGATCTTCTGAGTAGTGAGTATAAGATTGAGCCAACCATTAGGCATTGTGGGTGTATGGTAGACATGCTAGGACGCGCCGGACTTTTAAAGGAAGCGGTTAAATTCATCGATTCTATGAAAATAGAACCTAATGCAATTATTTGGAGGACTCTGCTTGCAGCTTGTAAGGTTCATGGAGATGTGGAGTTGGCAAAAGTGGCTAATGAGAAGCTGCTTAGTATGAGAAAAGACCACAGTGGTGACTATGTTCTAATGTCAAACTTATATGCTTCGCGAGGCGAGTGGGATGGGGCTGAGAAGGTAAGGAAGTTAATGGATGATAGCGGTGTAACGAAAATTCGTGGCTCTAGCTTTGTTGAAGCATGTAACTGA
Protein sequence

>MsG0780036302.01.T01

MVENVVNNYVESKSSDVESFVELKSYMVKAFIDVKPNVVEAFVNLKPSLVGSVDVKHSLVGFGNKGVIYFYYREIQFNETNLIVTDRDTTLMNVVAIVRAKCIRDCRTKSNDVKVDLKDKEIKDVTSIDNMIRKRIGFKPTLPNLKTLKQIHALMIINGFNNNVNFLGNLVLTISTSLVGPTATPTVTNYAHQLFAQIPQSDTFMYNAMIRGSSQSPNPLRAISLYKEMHRRSVKGDNYTFPFVLKACTRLLWVNTGSAVHGMVLRLGFGSNVVVRNTLLVFHAKCGDLNVATSLFDDSCKGDVVAWSSLIAGYAKRGDVKVARKLFDEMPERDLVSWNVMITGYVKQGEMESARILFDEAPVKDVVSWNALIAGYVVCGLSKQALDLFDEMCKAGVFPDEVTLLSLLSACADLGDLENGKKVHAKVMEISMGKLSTLLGNALIDMYAKCGNIKESLDVFWSIVDKDVISWNSIIVGMALHGHGKESLSLFKMMQRTKICPNEITFVGVLVACSHAGKIDEGYKYFDLLSSEYKIEPTIRHCGCMVDMLGRAGLLKEAVKFIDSMKIEPNAIIWRTLLAACKVHGDVELAKVANEKLLSMRKDHSGDYVLMSNLYASRGEWDGAEKVRKLMDDSGVTKIRGSSFVEACN*