AlfalfaGEDB | MsG0280006933.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006933.01

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MsG0280006933.01.T01	AT5G18390	22.383	277	206	2	157	424	152	428	5.97e-18	87.0
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Find 111 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 143 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
GATCAGTATGTTCTATTAAA+TGG	0.169510	2:-8104514	MsG0280006933.01.T01:CDS
GCATGGAATGCGTTGATTTC+TGG	0.182261	2:-8104647	MsG0280006933.01.T01:CDS
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CATGGCTACATATGCTTGTT+TGG	0.245956	2:-8104738	MsG0280006933.01.T01:CDS
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AGAATACATTCCAACAAGTT+TGG	0.316909	2:+8105246	None:intergenic
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TTTCGGGAGATGCTAGTTTC+GGG	0.330056	2:-8104584	MsG0280006933.01.T01:CDS
CATTAATGAAAGAATGTTAT+GGG	0.333413	2:-8104172	MsG0280006933.01.T01:CDS
CATGGGATGATTTGTGAAAT+GGG	0.337899	2:-8104992	MsG0280006933.01.T01:CDS
GGTATAATGCAAAGTCATTA+GGG	0.339057	2:+8105368	None:intergenic
CATGTAAAAGTAATTTCATT+TGG	0.340693	2:+8104251	None:intergenic
CATTTGTATCAAACCCCTTC+CGG	0.342097	2:+8104465	None:intergenic
GCTGCTATAGTTACTTGATT+AGG	0.343149	2:+8104554	None:intergenic
GCGAAACATTTACGGTGTTT+CGG	0.343508	2:-8104601	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCAAATCAGCGAAACATTTA+CGG	0.345485	2:-8104609	MsG0280006933.01.T01:CDS
AGGTATAATGCAAAGTCATT+AGG	0.350468	2:+8105367	None:intergenic
GTTTCGGGAGATGCTAGTTT+CGG	0.350475	2:-8104585	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATCAGTATGTTCTATTAAAT+GGG	0.357144	2:-8104513	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTTCGATTAATGCGCAATAA+AGG	0.363624	2:-8105097	MsG0280006933.01.T01:CDS
ACATTAATGAAAGAATGTTA+TGG	0.367164	2:-8104173	MsG0280006933.01.T01:CDS
GGAGATAGCAGGAAAGCTTT+TGG	0.369635	2:-8104716	MsG0280006933.01.T01:CDS
GTTGTTTGAGAGGATGAAAA+TGG	0.392238	2:-8104798	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGGCTACATATGCTTGTTT+GGG	0.394974	2:-8104737	MsG0280006933.01.T01:CDS
TATGCTTGTAGGGTGTTTGA+TGG	0.395521	2:-8104902	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTTATGCAGCTGAAGGTGAT+TGG	0.395838	2:-8103911	MsG0280006933.01.T01:CDS
CGTGGACGTCAATGATTTGT+GGG	0.399811	2:-8104856	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCATGGGATGATTTGTGAAA+TGG	0.414501	2:-8104993	MsG0280006933.01.T01:CDS
TGTGAATGTTATGAAACAAA+AGG	0.416573	2:+8105197	None:intergenic
CATGCAATGTTACTCACAAC+TGG	0.417574	2:-8105298	MsG0280006933.01.T01:CDS
GGGAAGAGGTTGGGAATGTA+AGG	0.418404	2:-8103890	MsG0280006933.01.T01:CDS
GAAGGTGATTGGGAAGAGGT+TGG	0.442334	2:-8103900	MsG0280006933.01.T01:CDS
CAAGTCACAGAGTCAATTGC+TGG	0.442736	2:-8104050	MsG0280006933.01.T01:CDS
AATCCATGGCAGAAGAGATA+TGG	0.444753	2:-8104006	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATTGACTCTGTGACTTGTAT+TGG	0.445022	2:+8104056	None:intergenic
TTGGTAATAAGTTTACATTT+GGG	0.449852	2:-8105069	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGCGCAATAAAGGTCTTGT+TGG	0.449990	2:-8105088	MsG0280006933.01.T01:CDS
GAAGTGTTGATTATGCTTGT+AGG	0.454257	2:-8104913	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAATGGGGAAGAGAAGTTCA+TGG	0.454575	2:-8104497	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTTAATTGAGATGAAAATGT+TGG	0.458415	2:+8105397	None:intergenic
TTATGCAGCTGAAGGTGATT+GGG	0.459491	2:-8103910	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGGTGATTGGGAAGAGGTT+GGG	0.464248	2:-8103899	MsG0280006933.01.T01:CDS
TGAAGGGAAGGAAGAGAAAG+AGG	0.465705	2:-8103796	MsG0280006933.01.T01:CDS
GCATTCCATGCAACCACGTC+AGG	0.468224	2:+8104659	None:intergenic
CTCTGTGACTTGTATTGGCA+TGG	0.474207	2:+8104061	None:intergenic
AGAAGCGTATGAGTTTATAA+AGG	0.478836	2:-8104084	MsG0280006933.01.T01:CDS
CAGTTGTGAGTAACATTGCA+TGG	0.485843	2:+8105299	None:intergenic
ATAAGTTGCCTGGTTCTAGT+TGG	0.488183	2:-8103842	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTGTAATGTGGGGAGGATTG+AGG	0.489423	2:-8104831	MsG0280006933.01.T01:CDS
GTTGTAAGAATGTTGCATCA+TGG	0.495859	2:-8104361	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGAAAGGGAGACAGGTTCA+TGG	0.496239	2:-8105010	MsG0280006933.01.T01:CDS
GTTGATCTCTTATGTCGGTC+AGG	0.497825	2:-8104116	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGCCATGTGAGATTCTTGA+AGG	0.498247	2:-8103813	MsG0280006933.01.T01:CDS
GAAAGAGGTGACTGTTGGCT+TGG	0.499657	2:-8103781	MsG0280006933.01.T01:CDS
AATGGTTTGATAGATATGTA+TGG	0.499957	2:-8104944	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGTGTTGATTATGCTTGTA+GGG	0.500970	2:-8104912	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAAATGCAGTCAAAAGGATC+TGG	0.501537	2:-8103957	MsG0280006933.01.T01:CDS
GTGAATGTTATGAAACAAAA+GGG	0.502296	2:+8105198	None:intergenic
ATTGCATGGATTTGTTTGCC+TGG	0.504171	2:+8105313	None:intergenic
ATAATGAAAATGCAGTCAAA+AGG	0.508591	2:-8103963	MsG0280006933.01.T01:CDS
GGATGTGAAGAAAGGGAGAC+AGG	0.510959	2:-8105017	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGTTCATGGATTTATATGC+CGG	0.511795	2:-8104484	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCAAATATTTATGCAGCTGA+AGG	0.521204	2:-8103918	MsG0280006933.01.T01:CDS
GTTTAATGGATGTGAAGAAA+GGG	0.521468	2:-8105024	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGCTTGTTTGGGAGATAGC+AGG	0.523519	2:-8104727	MsG0280006933.01.T01:CDS
TAGCCATATCTCTTCTGCCA+TGG	0.526242	2:+8104003	None:intergenic
CTAAATGGGTGCAAAATCCA+TGG	0.527144	2:-8104020	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGCGTTGGTGTTGTTTGAG+AGG	0.529044	2:-8104808	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAGAGATATGGCTAAACTGA+TGG	0.530198	2:-8103994	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCGTGGACGTCAATGATTTG+TGG	0.532720	2:-8104857	MsG0280006933.01.T01:CDS
AGAAATGTCAATAAGTTGCC+TGG	0.533319	2:-8103852	MsG0280006933.01.T01:CDS
GAATGTAAGGAAGGTGATGA+AGG	0.535764	2:-8103877	MsG0280006933.01.T01:CDS
ACATTCCACGTAAAATCGTT+CGG	0.536414	2:+8104764	None:intergenic
GGTTTAATGGATGTGAAGAA+AGG	0.540697	2:-8105025	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGGTTTGATAGATATGTAT+GGG	0.550360	2:-8104943	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTATTCCTGACGTGGTTGCA+TGG	0.554279	2:-8104664	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGGATTTATATGCCGGAAG+GGG	0.559689	2:-8104478	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATTGTGATTAAGACATGTGT+TGG	0.562540	2:-8105046	MsG0280006933.01.T01:CDS
CATGGATTTATATGCCGGAA+GGG	0.562718	2:-8104479	MsG0280006933.01.T01:CDS
GGGGAGGATTGAGGAAGCGT+TGG	0.565208	2:-8104822	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATCGATATGTATTCCAAGTG+TGG	0.566945	2:-8104422	MsG0280006933.01.T01:CDS
AGAAAGGGAGACAGGTTCAT+GGG	0.567394	2:-8105009	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGTGAGATTCTTGAAGGGA+AGG	0.568255	2:-8103808	MsG0280006933.01.T01:CDS
AGAGGTTGGGAATGTAAGGA+AGG	0.574172	2:-8103886	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCGATATGTATTCCAAGTGT+GGG	0.575484	2:-8104421	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATAGATATGTATGGGAAATG+TGG	0.577283	2:-8104935	MsG0280006933.01.T01:CDS
AATGCAATGATTGATTGCTA+TGG	0.577311	2:-8104338	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTCCCTTCAAGAATCTCACA+TGG	0.579103	2:+8103810	None:intergenic
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GAAGAGAAAGAGGTGACTGT+TGG	0.582873	2:-8103786	MsG0280006933.01.T01:CDS
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TTTGAGAGGATGAAAATGGA+AGG	0.585365	2:-8104794	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGCAATGATTGATTGCTAT+GGG	0.589257	2:-8104337	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCATGGATTTATATGCCGGA+AGG	0.594187	2:-8104480	MsG0280006933.01.T01:CDS
AAATCAAAAGCCTTAAAACC+AGG	0.610523	2:-8105331	MsG0280006933.01.T01:CDS
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AGCTGAAGGTGATTGGGAAG+AGG	0.631936	2:-8103904	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGCAGCCATAGCGGTTCAG+TGG	0.633762	2:-8104216	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATGCAGTCAAAAGGATCTGG+CGG	0.634348	2:-8103954	MsG0280006933.01.T01:CDS
TTATGGGGTTGAGATACGTA+AGG	0.636309	2:-8104156	MsG0280006933.01.T01:CDS
AGCCATGTGAGATTCTTGAA+GGG	0.638773	2:-8103812	MsG0280006933.01.T01:CDS
CTGTGAGAGATGTTGCGTCG+TGG	0.641447	2:-8104874	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATTGATTGCTATGGGAAGTG+TGG	0.642520	2:-8104329	MsG0280006933.01.T01:CDS
CTTTCAGCATGCAGCCATAG+CGG	0.645743	2:-8104224	MsG0280006933.01.T01:CDS
TCAGTATGTTCTATTAAATG+GGG	0.645980	2:-8104512	MsG0280006933.01.T01:CDS
ATTAATGAAAGAATGTTATG+GGG	0.647218	2:-8104171	MsG0280006933.01.T01:CDS
GTATAATGCAAAGTCATTAG+GGG	0.710617	2:+8105369	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!!	TTGATTTTAAACATTTTTGT+AGG	+	Chr2:8103835-8103854	None:intergenic	15.0%
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!!	ATCAGTATGTTCTATTAAAT+GGG	-	Chr2:8104666-8104685	MsG0280006933.01.T01:CDS	20.0%
!!	ATTAATGAAAGAATGTTATG+GGG	-	Chr2:8105008-8105027	MsG0280006933.01.T01:CDS	20.0%
!!	CAATTAAATGCAAAAACATT+TGG	+	Chr2:8104010-8104029	None:intergenic	20.0%
!!	CATGTAAAAGTAATTTCATT+TGG	+	Chr2:8104931-8104950	None:intergenic	20.0%
!!	CATTAATGAAAGAATGTTAT+GGG	-	Chr2:8105007-8105026	MsG0280006933.01.T01:CDS	20.0%
!!	TTTAATTGAGATGAAAATGT+TGG	+	Chr2:8103785-8103804	None:intergenic	20.0%
!!!	CAAATGTTTTTGCATTTAAT+TGG	-	Chr2:8104008-8104027	MsG0280006933.01.T01:CDS	20.0%
!!!	CATTTTCATCTCAATTAAAA+TGG	-	Chr2:8103786-8103805	MsG0280006933.01.T01:CDS	20.0%
!!!	TTGGTAATAAGTTTACATTT+GGG	-	Chr2:8104110-8104129	MsG0280006933.01.T01:CDS	20.0%
!	AATGGTTTGATAGATATGTA+TGG	-	Chr2:8104235-8104254	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!	ATAATGAAAATGCAGTCAAA+AGG	-	Chr2:8105216-8105235	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!	ATGGTTTGATAGATATGTAT+GGG	-	Chr2:8104236-8104255	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!	CGAGTTGTTTAAAAAAATGA+GGG	-	Chr2:8104891-8104910	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!	GATCAGTATGTTCTATTAAA+TGG	-	Chr2:8104665-8104684	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!	GTGAATGTTATGAAACAAAA+GGG	+	Chr2:8103984-8104003	None:intergenic	25.0%
!	TCAGTATGTTCTATTAAATG+GGG	-	Chr2:8104667-8104686	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!	TGTGAATGTTATGAAACAAA+AGG	+	Chr2:8103985-8104004	None:intergenic	25.0%
!	TTTAAAAAAATGAGGGAAGA+AGG	-	Chr2:8104898-8104917	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!!	GCATTTAATTGGATGATTTT+AGG	-	Chr2:8104019-8104038	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!!	TCGAGTTGTTTAAAAAAATG+AGG	-	Chr2:8104890-8104909	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!!!	ATTTTAGGTTTGGTGTATAA+TGG	-	Chr2:8104034-8104053	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!!!	CATTTTTTTAAACAACTCGA+TGG	+	Chr2:8104890-8104909	None:intergenic	25.0%
!!!	GTTGGTAATAAGTTTACATT+TGG	-	Chr2:8104109-8104128	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TAATTGGATGATTTTAGGTT+TGG	-	Chr2:8104024-8104043	MsG0280006933.01.T01:CDS	25.0%
	AAATCAAAAGCCTTAAAACC+AGG	-	Chr2:8103848-8103867	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
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	AGAATACATTCCAACAAGTT+TGG	+	Chr2:8103936-8103955	None:intergenic	30.0%
	AGGTATAATGCAAAGTCATT+AGG	+	Chr2:8103815-8103834	None:intergenic	30.0%
	ATAGATATGTATGGGAAATG+TGG	-	Chr2:8104244-8104263	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
	ATGCAATGATTGATTGCTAT+GGG	-	Chr2:8104842-8104861	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
	ATGGAGAGAATGAAAAAAGA+GGG	-	Chr2:8104490-8104509	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
	ATTGTGATTAAGACATGTGT+TGG	-	Chr2:8104133-8104152	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
	GGTATAATGCAAAGTCATTA+GGG	+	Chr2:8103814-8103833	None:intergenic	30.0%
	GTATAATGCAAAGTCATTAG+GGG	+	Chr2:8103813-8103832	None:intergenic	30.0%
	TATGGAGAGAATGAAAAAAG+AGG	-	Chr2:8104489-8104508	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
	TCAAATATTTATGCAGCTGA+AGG	-	Chr2:8105261-8105280	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
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!	GTTTAATGGATGTGAAGAAA+GGG	-	Chr2:8104155-8104174	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
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!!	AAGTGTTGATTATGCTTGTA+GGG	-	Chr2:8104267-8104286	MsG0280006933.01.T01:CDS	30.0%
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!!!	TTTTTTAAACAACTCGATGG+AGG	+	Chr2:8104887-8104906	None:intergenic	30.0%
	AAAATGCAGTCAAAAGGATC+TGG	-	Chr2:8105222-8105241	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	AAGAGATATGGCTAAACTGA+TGG	-	Chr2:8105185-8105204	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	ACATTCCACGTAAAATCGTT+CGG	+	Chr2:8104418-8104437	None:intergenic	35.0%
	AGAAATGTCAATAAGTTGCC+TGG	-	Chr2:8105327-8105346	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	ATCGATATGTATTCCAAGTG+TGG	-	Chr2:8104757-8104776	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	ATGGCTACATATGCTTGTTT+GGG	-	Chr2:8104442-8104461	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	GCTGCTATAGTTACTTGATT+AGG	+	Chr2:8104628-8104647	None:intergenic	35.0%
	GTATCGTTGATCTCTTATGT+CGG	-	Chr2:8105058-8105077	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	GTTGTAAGAATGTTGCATCA+TGG	-	Chr2:8104818-8104837	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	GTTGTTTGAGAGGATGAAAA+TGG	-	Chr2:8104381-8104400	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	TCCTTAAGTTCCAAACTTGT+TGG	-	Chr2:8103923-8103942	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	TCGATATGTATTCCAAGTGT+GGG	-	Chr2:8104758-8104777	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
	TTTGAGAGGATGAAAATGGA+AGG	-	Chr2:8104385-8104404	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!	ATCTTTTAAACTCCCACACT+TGG	+	Chr2:8104773-8104792	None:intergenic	35.0%
!	ATTGACTCTGTGACTTGTAT+TGG	+	Chr2:8105126-8105145	None:intergenic	35.0%
!	ATTGCTGGAGCTTTTCTAAA+TGG	-	Chr2:8105144-8105163	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!	CATGGGATGATTTGTGAAAT+GGG	-	Chr2:8104187-8104206	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!	GGTTTAATGGATGTGAAGAA+AGG	-	Chr2:8104154-8104173	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!	TCATGGGATGATTTGTGAAA+TGG	-	Chr2:8104186-8104205	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!	TCCAACAAGTTTGGAACTTA+AGG	+	Chr2:8103927-8103946	None:intergenic	35.0%
!	TTGCTGGAGCTTTTCTAAAT+GGG	-	Chr2:8105145-8105164	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!!	GAAGTGTTGATTATGCTTGT+AGG	-	Chr2:8104266-8104285	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!!	GATTTGTGGGTTTTGTAATG+TGG	-	Chr2:8104336-8104355	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!!	TTTGTGGGTTTTGTAATGTG+GGG	-	Chr2:8104338-8104357	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!!!	AATGATGTTTTGACTGGGAA+TGG	-	Chr2:8104217-8104236	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!!!	ACAAAAGGGTTGCTGATTTT+AGG	+	Chr2:8103970-8103989	None:intergenic	35.0%
!!!	CAGGAAAGCTTTTGGTTTTA+TGG	-	Chr2:8104471-8104490	MsG0280006933.01.T01:CDS	35.0%
!!!	GATTTGTTTGCCTGGTTTTA+AGG	+	Chr2:8103861-8103880	None:intergenic	35.0%
	AAATGGGGAAGAGAAGTTCA+TGG	-	Chr2:8104682-8104701	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	AAGCCATGTGAGATTCTTGA+AGG	-	Chr2:8105366-8105385	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	AATCCATGGCAGAAGAGATA+TGG	-	Chr2:8105173-8105192	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	AGCCATGTGAGATTCTTGAA+GGG	-	Chr2:8105367-8105386	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	ATGGATTTATATGCCGGAAG+GGG	-	Chr2:8104701-8104720	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	ATGTGAGATTCTTGAAGGGA+AGG	-	Chr2:8105371-8105390	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	ATTGATTGCTATGGGAAGTG+TGG	-	Chr2:8104850-8104869	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	CAGTTGTGAGTAACATTGCA+TGG	+	Chr2:8103883-8103902	None:intergenic	40.0%
	CATGCAATGTTACTCACAAC+TGG	-	Chr2:8103881-8103900	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	CATGGATTTATATGCCGGAA+GGG	-	Chr2:8104700-8104719	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	CATGGCTACATATGCTTGTT+TGG	-	Chr2:8104441-8104460	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	CATTTGTATCAAACCCCTTC+CGG	+	Chr2:8104717-8104736	None:intergenic	40.0%
	CGAAACATTTACGGTGTTTC+GGG	-	Chr2:8104579-8104598	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	CTAAATGGGTGCAAAATCCA+TGG	-	Chr2:8105159-8105178	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	GAATGTAAGGAAGGTGATGA+AGG	-	Chr2:8105302-8105321	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	GCGAAACATTTACGGTGTTT+CGG	-	Chr2:8104578-8104597	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	TCATGGATTTATATGCCGGA+AGG	-	Chr2:8104699-8104718	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	TTATGCAGCTGAAGGTGATT+GGG	-	Chr2:8105269-8105288	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	TTATGGGGTTGAGATACGTA+AGG	-	Chr2:8105023-8105042	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
	TTCCCTTCAAGAATCTCACA+TGG	+	Chr2:8105372-8105391	None:intergenic	40.0%
	TTTATGCAGCTGAAGGTGAT+TGG	-	Chr2:8105268-8105287	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
!	ATGCGCAATAAAGGTCTTGT+TGG	-	Chr2:8104091-8104110	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
!	ATTGCATGGATTTGTTTGCC+TGG	+	Chr2:8103869-8103888	None:intergenic	40.0%
!	TATGCTTGTAGGGTGTTTGA+TGG	-	Chr2:8104277-8104296	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
!!	ATAAGTTGCCTGGTTCTAGT+TGG	-	Chr2:8105337-8105356	MsG0280006933.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTTCAAGCCAACTAGAACC+AGG	+	Chr2:8105348-8105367	None:intergenic	40.0%
	AAGAAAGGGAGACAGGTTCA+TGG	-	Chr2:8104169-8104188	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	AAGGTGATTGGGAAGAGGTT+GGG	-	Chr2:8105280-8105299	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	AGAAAGGGAGACAGGTTCAT+GGG	-	Chr2:8104170-8104189	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	AGAGGTTGGGAATGTAAGGA+AGG	-	Chr2:8105293-8105312	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	ATGCAGTCAAAAGGATCTGG+CGG	-	Chr2:8105225-8105244	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	ATGCTTGTTTGGGAGATAGC+AGG	-	Chr2:8104452-8104471	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	CAAGTCACAGAGTCAATTGC+TGG	-	Chr2:8105129-8105148	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	CATAGCGGTTCAGTGGAAAA+AGG	-	Chr2:8104970-8104989	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	GAACATACTGATCCACATGC+AGG	+	Chr2:8104658-8104677	None:intergenic	45.0%
	GAAGAGAAAGAGGTGACTGT+TGG	-	Chr2:8105393-8105412	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	GTTGATCTCTTATGTCGGTC+AGG	-	Chr2:8105063-8105082	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	TAGCCATATCTCTTCTGCCA+TGG	+	Chr2:8105179-8105198	None:intergenic	45.0%
	TCGTGGACGTCAATGATTTG+TGG	-	Chr2:8104322-8104341	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	TGAAGGGAAGGAAGAGAAAG+AGG	-	Chr2:8105383-8105402	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	TTATTCCTGACGTGGTTGCA+TGG	-	Chr2:8104515-8104534	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	TTGTAATGTGGGGAGGATTG+AGG	-	Chr2:8104348-8104367	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!	ATGAGCCGAACGATTTTACG+TGG	-	Chr2:8104410-8104429	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!	CGTGGACGTCAATGATTTGT+GGG	-	Chr2:8104323-8104342	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!	CTCTGTGACTTGTATTGGCA+TGG	+	Chr2:8105121-8105140	None:intergenic	45.0%
!	CTTTTTCCACTGAACCGCTA+TGG	+	Chr2:8104972-8104991	None:intergenic	45.0%
!	GGAGATAGCAGGAAAGCTTT+TGG	-	Chr2:8104463-8104482	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!	GTTTCGGGAGATGCTAGTTT+CGG	-	Chr2:8104594-8104613	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!	TTTCGGGAGATGCTAGTTTC+GGG	-	Chr2:8104595-8104614	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!!	AAGCGTTGGTGTTGTTTGAG+AGG	-	Chr2:8104371-8104390	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!!	GCATGGAATGCGTTGATTTC+TGG	-	Chr2:8104532-8104551	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
!!!	AGAGGGTTTTATTCCTGACG+TGG	-	Chr2:8104507-8104526	MsG0280006933.01.T01:CDS	45.0%
	AGCTGAAGGTGATTGGGAAG+AGG	-	Chr2:8105275-8105294	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
	CTTTCAGCATGCAGCCATAG+CGG	-	Chr2:8104955-8104974	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
	GAAGGTGATTGGGAAGAGGT+TGG	-	Chr2:8105279-8105298	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
	GGATGTGAAGAAAGGGAGAC+AGG	-	Chr2:8104162-8104181	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
	GGGAAGAGGTTGGGAATGTA+AGG	-	Chr2:8105289-8105308	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
!	GAAAGAGGTGACTGTTGGCT+TGG	-	Chr2:8105398-8105417	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
!	TTCGGGAGATGCTAGTTTCG+GGG	-	Chr2:8104596-8104615	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
!!	GTGGGTTTTGTAATGTGGGG+AGG	-	Chr2:8104341-8104360	MsG0280006933.01.T01:CDS	50.0%
	ATGCAGCCATAGCGGTTCAG+TGG	-	Chr2:8104963-8104982	MsG0280006933.01.T01:CDS	55.0%
	CTGTGAGAGATGTTGCGTCG+TGG	-	Chr2:8104305-8104324	MsG0280006933.01.T01:CDS	55.0%
	GCATTCCATGCAACCACGTC+AGG	+	Chr2:8104523-8104542	None:intergenic	55.0%
	GCAGCACTGCTACCTGCATG+TGG	-	Chr2:8104643-8104662	MsG0280006933.01.T01:CDS	60.0%
!	GGGGAGGATTGAGGAAGCGT+TGG	-	Chr2:8104357-8104376	MsG0280006933.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr2	gene	8103773	8105428	8103773	ID=MsG0280006933.01;Name=MsG0280006933.01
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Chr2	exon	8103773	8105428	8103773	ID=MsG0280006933.01.T01:exon:2370;Parent=MsG0280006933.01.T01
Chr2	CDS	8103773	8105428	8103773	ID=MsG0280006933.01.T01:cds;Parent=MsG0280006933.01.T01

Gene Sequence

>MsG0280006933.01.T01

ATGAAAATTCCAACATTTTCATCTCAATTAAAATGGACCCCTAATGACTTTGCATTATACCTACAAAAATGTTTAAAATCAAAAGCCTTAAAACCAGGCAAACAAATCCATGCAATGTTACTCACAACTGGAACAAACACAAACATCTTATCCTTAAGTTCCAAACTTGTTGGAATGTATTCTAGTTGCACAGACCTAAAATCAGCAACCCTTTTGTTTCATAACATTCACAAACCAAATGTTTTTGCATTTAATTGGATGATTTTAGGTTTGGTGTATAATGGTTACTTTGATAATGCATTGTTTTATTTTCGATTAATGCGCAATAAAGGTCTTGTTGGTAATAAGTTTACATTTGGGATTGTGATTAAGACATGTGTTGGTTTAATGGATGTGAAGAAAGGGAGACAGGTTCATGGGATGATTTGTGAAATGGGTTTGATGAATGATGTTTTGACTGGGAATGGTTTGATAGATATGTATGGGAAATGTGGAAGTGTTGATTATGCTTGTAGGGTGTTTGATGGAATGTCTGTGAGAGATGTTGCGTCGTGGACGTCAATGATTTGTGGGTTTTGTAATGTGGGGAGGATTGAGGAAGCGTTGGTGTTGTTTGAGAGGATGAAAATGGAAGGATATGAGCCGAACGATTTTACGTGGAATGTTATCATGGCTACATATGCTTGTTTGGGAGATAGCAGGAAAGCTTTTGGTTTTATGGAGAGAATGAAAAAAGAGGGTTTTATTCCTGACGTGGTTGCATGGAATGCGTTGATTTCTGGATTTGCACAAAATCATCAAATCAGCGAAACATTTACGGTGTTTCGGGAGATGCTAGTTTCGGGGATTTGTCCTAATCAAGTAACTATAGCAGCACTGCTACCTGCATGTGGATCAGTATGTTCTATTAAATGGGGAAGAGAAGTTCATGGATTTATATGCCGGAAGGGGTTTGATACAAATGTTTTCATTGCAAGTGCTCTTATCGATATGTATTCCAAGTGTGGGAGTTTAAAAGATGCTCGAAATGTATTCGACAAGATTCGTTGTAAGAATGTTGCATCATGGAATGCAATGATTGATTGCTATGGGAAGTGTGGTATGATTGATTCCTCCATCGAGTTGTTTAAAAAAATGAGGGAAGAAGGATTGCAGCCAAATGAAATTACTTTTACATGTATGCTTTCAGCATGCAGCCATAGCGGTTCAGTGGAAAAAGGTTTAGAGATCTTCACATTAATGAAAGAATGTTATGGGGTTGAGATACGTAAGGAGCATTATGCTTGTATCGTTGATCTCTTATGTCGGTCAGGAAAGATAGTAGAAGCGTATGAGTTTATAAAGGCCATGCCAATACAAGTCACAGAGTCAATTGCTGGAGCTTTTCTAAATGGGTGCAAAATCCATGGCAGAAGAGATATGGCTAAACTGATGGAAAAAGAAATAATGAAAATGCAGTCAAAAGGATCTGGCGGCTTTGTTACATTATCAAATATTTATGCAGCTGAAGGTGATTGGGAAGAGGTTGGGAATGTAAGGAAGGTGATGAAGGAGAGAAATGTCAATAAGTTGCCTGGTTCTAGTTGGCTTGAAAAGCCATGTGAGATTCTTGAAGGGAAGGAAGAGAAAGAGGTGACTGTTGGCTTGGATATATGA

Protein sequence

>MsG0280006933.01.T01

MKIPTFSSQLKWTPNDFALYLQKCLKSKALKPGKQIHAMLLTTGTNTNILSLSSKLVGMYSSCTDLKSATLLFHNIHKPNVFAFNWMILGLVYNGYFDNALFYFRLMRNKGLVGNKFTFGIVIKTCVGLMDVKKGRQVHGMICEMGLMNDVLTGNGLIDMYGKCGSVDYACRVFDGMSVRDVASWTSMICGFCNVGRIEEALVLFERMKMEGYEPNDFTWNVIMATYACLGDSRKAFGFMERMKKEGFIPDVVAWNALISGFAQNHQISETFTVFREMLVSGICPNQVTIAALLPACGSVCSIKWGREVHGFICRKGFDTNVFIASALIDMYSKCGSLKDARNVFDKIRCKNVASWNAMIDCYGKCGMIDSSIELFKKMREEGLQPNEITFTCMLSACSHSGSVEKGLEIFTLMKECYGVEIRKEHYACIVDLLCRSGKIVEAYEFIKAMPIQVTESIAGAFLNGCKIHGRRDMAKLMEKEIMKMQSKGSGGFVTLSNIYAAEGDWEEVGNVRKVMKERNVNKLPGSSWLEKPCEILEGKEEKEVTVGLDI*