AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039085.01

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MsG0780039085.01.T01 AT3G11080 26.426 526 262 16 375 883 431 848 4.64e-21 100
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MsG0780039085.01.T01 AT5G07180 26.503 449 257 12 384 806 144 545 1.08e-17 89.4
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MsG0780039085.01.T01 AT2G26330 28.738 515 247 17 514 974 91 539 1.25e-31 134
MsG0780039085.01.T01 AT2G26330 32.609 368 209 8 718 1054 94 453 8.32e-30 128
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MsG0780039085.01.T01 AT1G17250 24.217 607 334 21 514 1045 119 674 4.72e-14 77.4
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MsG0780039085.01.T01 AT1G53420 30.196 255 148 6 722 974 69 295 3.90e-20 97.4
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MsG0780039085.01.T01 AT5G49750 32.022 178 111 4 727 895 182 358 2.41e-12 71.2
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MsG0780039085.01.T01 AT3G25560 33.121 157 99 3 770 922 86 240 4.54e-12 70.9
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MsG0780039085.01.T01 AT3G25560 33.121 157 99 3 770 922 86 240 4.94e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT3G57830 35.246 122 78 1 770 890 73 194 4.97e-12 70.1
MsG0780039085.01.T01 AT2G02780 30.392 204 137 3 784 985 100 300 5.36e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT2G02780 32.402 179 117 2 701 879 116 290 4.78e-11 67.4
MsG0780039085.01.T01 AT4G23740 35.294 136 86 2 752 886 80 214 5.65e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT4G23740 35.294 136 86 2 752 886 80 214 5.65e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT2G42290 39.048 105 63 1 775 878 77 181 5.66e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT1G53730 34.247 146 91 3 734 879 90 230 6.18e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT1G53730 34.247 146 91 3 734 879 90 230 6.29e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT3G19020 29.319 191 126 4 692 878 170 355 6.97e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT3G19020 27.778 306 163 12 676 977 103 354 2.05e-11 68.9
MsG0780039085.01.T01 AT5G21090 32.743 113 76 0 772 884 77 189 7.12e-12 66.6
MsG0780039085.01.T01 AT5G21090 33.577 137 85 3 672 808 55 185 4.31e-11 64.3
MsG0780039085.01.T01 AT5G49780 28.832 274 155 7 633 871 81 349 7.28e-12 70.5
MsG0780039085.01.T01 AT2G02780 30.392 204 137 3 784 985 100 300 7.60e-12 70.1
MsG0780039085.01.T01 AT2G02780 31.217 189 126 2 691 879 106 290 4.85e-11 67.4
MsG0780039085.01.T01 AT2G02780 30.392 204 137 3 784 985 100 300 8.65e-12 69.7
MsG0780039085.01.T01 AT2G02780 31.217 189 126 2 691 879 106 290 5.94e-11 67.0
MsG0780039085.01.T01 AT5G49780 28.832 274 155 7 633 871 81 349 8.77e-12 70.1
MsG0780039085.01.T01 AT5G58300 35.616 146 90 2 740 885 87 228 1.04e-11 69.7
MsG0780039085.01.T01 AT5G58300 35.616 146 90 2 740 885 87 228 1.04e-11 69.7
MsG0780039085.01.T01 AT5G58300 35.616 146 90 2 740 885 87 228 1.04e-11 69.7
MsG0780039085.01.T01 AT4G06744 24.272 309 190 10 600 880 59 351 1.20e-11 68.6
MsG0780039085.01.T01 AT4G06744 26.291 213 144 6 770 977 103 307 1.43e-11 68.2
MsG0780039085.01.T01 AT3G43740 45.455 88 47 1 720 807 128 214 1.39e-11 66.2
MsG0780039085.01.T01 AT1G31420 32.812 128 81 2 757 879 61 188 1.51e-11 68.9
MsG0780039085.01.T01 AT1G31420 32.812 128 81 2 757 879 61 188 1.51e-11 68.9
MsG0780039085.01.T01 AT1G31420 32.812 128 81 2 757 879 61 188 1.52e-11 68.9
MsG0780039085.01.T01 AT1G56130 29.630 216 112 3 715 917 43 231 1.88e-11 68.9
MsG0780039085.01.T01 AT1G63430 33.884 121 78 1 755 875 61 179 1.94e-11 68.6
MsG0780039085.01.T01 AT1G54470 30.698 215 118 8 211 398 158 368 2.11e-11 68.2
MsG0780039085.01.T01 AT1G63430 33.884 121 78 1 755 875 61 179 2.17e-11 68.6
MsG0780039085.01.T01 AT1G63430 33.884 121 78 1 755 875 61 179 2.17e-11 68.6
MsG0780039085.01.T01 AT5G16590 30.921 152 99 3 742 892 65 211 3.52e-11 67.8
MsG0780039085.01.T01 AT5G35390 34.286 140 85 4 741 878 74 208 3.77e-11 67.8
MsG0780039085.01.T01 AT1G34210 35.593 118 73 1 772 886 79 196 4.65e-11 67.4
MsG0780039085.01.T01 AT1G34210 35.766 137 82 3 672 808 57 187 7.78e-11 66.6
MsG0780039085.01.T01 AT1G34210 35.593 118 73 1 772 886 79 196 4.65e-11 67.4
MsG0780039085.01.T01 AT1G34210 35.766 137 82 3 672 808 57 187 7.78e-11 66.6
MsG0780039085.01.T01 AT4G34220 31.100 209 115 5 770 977 84 264 5.59e-11 67.4
MsG0780039085.01.T01 AT4G34220 30.631 222 143 8 659 879 51 262 9.66e-11 66.6
MsG0780039085.01.T01 AT5G06870 31.873 251 137 10 728 974 82 302 6.11e-11 65.5
MsG0780039085.01.T01 AT5G24100 32.800 125 81 2 755 878 64 186 6.12e-11 67.0
MsG0780039085.01.T01 AT5G24100 33.094 139 91 2 740 878 72 208 7.52e-11 66.6
MsG0780039085.01.T01 AT3G14350 31.579 152 98 4 727 878 45 190 6.65e-11 67.0
MsG0780039085.01.T01 AT3G14350 31.579 152 98 4 727 878 82 227 6.71e-11 67.0
MsG0780039085.01.T01 AT5G16000 36.111 108 69 0 774 881 90 197 6.98e-11 67.0
MsG0780039085.01.T01 AT3G14350 31.579 152 98 4 727 878 82 227 7.37e-11 67.0
MsG0780039085.01.T01 AT1G11130 32.609 138 90 2 740 877 69 203 9.02e-11 66.6
MsG0780039085.01.T01 AT1G14390 35.762 151 69 3 728 878 144 266 9.77e-11 66.6

Find 225 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 617 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCCGACCTTAAGTTCATTTA+TGG 0.094911 7:-57665908 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAGCACTTCCAATTGAAATT+TGG 0.097977 7:+57665832 None:intergenic
GCTTTGGTATATTACCTTTA+AGG 0.098859 7:+57664838 None:intergenic
TTGGATGGTAATAGCCTTTC+TGG 0.118184 7:-57665284 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTTACTGAAAATCACTTTAT+TGG 0.139133 7:-57666034 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCTATCTTACAACGAATTTC+AGG 0.152807 7:-57666107 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGTTCGGAATTGTTCCTTTA+TGG 0.153987 7:-57665654 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGCAATATCAGTGTCATTTA+AGG 0.165778 7:+57667313 None:intergenic
GATGCCAAGGTTCAATAATA+TGG 0.174866 7:+57668183 None:intergenic
TTGAAAGGTAATCACCTTAA+AGG 0.176831 7:-57664852 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGATCCTTCAAAATGATTAT+TGG 0.186260 7:+57665136 None:intergenic
AATCACTTTATTGGAAATAT+TGG 0.187277 7:-57666025 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGATCTTTCACAAAATAATT+TGG 0.193291 7:-57665072 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTTGAGCTCTTTACAAGAAT+TGG 0.232962 7:-57665456 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTGCTGAGGTCTAGTGTTAC+TGG 0.247667 7:+57664945 None:intergenic
TTATCTCAAAATAAGTTAAA+TGG 0.283495 7:-57664567 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAAGAAACGTATGGTCGATA+TGG 0.291378 7:-57664672 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCAAGTTCTGCCAACTCTAA+TGG 0.300128 7:+57665110 None:intergenic
ATAAGAATCCAGATGCATTA+AGG 0.304209 7:-57664719 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTCATCAAAGTTGCTGCATC+TGG 0.305186 7:-57667712 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAGAATTGTGTGAATGAAAC+AGG 0.310200 7:+57665938 None:intergenic
GATTGGTAAAGAAGAAAGTT+TGG 0.313245 7:+57665770 None:intergenic
AGCACTTCCAATTGAAATTT+GGG 0.313566 7:+57665833 None:intergenic
CTTAAGTTCATTTATGGTAA+TGG 0.318458 7:-57665902 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTCGATTTCGTTGTTCATAA+AGG 0.320241 7:-57666688 MsG0780039085.01.T01:intron
ATGAAACAGGGAATTCAAAT+TGG 0.322020 7:+57665951 None:intergenic
TACCAGCTTTCTATCTTGTT+TGG 0.323389 7:-57667903 MsG0780039085.01.T01:CDS
AATTTATCCCTTAATGCATC+TGG 0.324348 7:+57664711 None:intergenic
CATTATTCAAACCATCATTA+TGG 0.324365 7:+57667927 None:intergenic
TTAAGTTCATTTATGGTAAT+GGG 0.324827 7:-57665901 MsG0780039085.01.T01:CDS
GATGAGTTAAAGAAGTTAAC+GGG 0.328834 7:+57665254 None:intergenic
CTCAAGTAGCTTAGCTCATA+AGG 0.334284 7:+57665473 None:intergenic
AACATCCTTATTTATATGTC+TGG 0.339323 7:-57664597 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGGGGACAACTATGGCCTTT+GGG 0.347377 7:-57672989 MsG0780039085.01.T01:CDS
ACCTTGGCATCTTAACTATT+CGG 0.348447 7:-57668171 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCCTCTGGAGCACTTATTGT+TGG 0.352655 7:-57665303 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTTCGGAATTGTTCCTTTAT+GGG 0.353673 7:-57665653 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATGTCTAGATATAGCAAGTT+TGG 0.355425 7:+57665524 None:intergenic
TTGCTCCTCCTATCATCCTT+GGG 0.360152 7:-57673008 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTAATTTGTTGTTTCTCAAA+TGG 0.360411 7:+57665006 None:intergenic
TTGGGGACAACTATGGCCTT+TGG 0.361193 7:-57672990 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAACTTAAGGTCGGAATGAT+TGG 0.367597 7:+57665916 None:intergenic
TATTGCTCTGAATTCCCAAT+TGG 0.371437 7:-57668318 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATCATCCTTGGGGACAACTA+TGG 0.377780 7:-57672997 MsG0780039085.01.T01:CDS
CATTACCATAAATGAACTTA+AGG 0.379033 7:+57665903 None:intergenic
AAGACATAGCATTTCCCAAT+TGG 0.380411 7:+57668303 None:intergenic
ATGGGATCGAAGTTTGAGTT+TGG 0.381032 7:+57668202 None:intergenic
TATGAGTTTGGTGACTCTTC+CGG 0.381623 7:+57670725 None:intergenic
CAACACTAGATCTTGTAAAC+TGG 0.383176 7:+57666988 None:intergenic
CTCATCAAACATCTACCATT+TGG 0.384197 7:-57665237 MsG0780039085.01.T01:CDS
CAATTCCAGACATATAAATA+AGG 0.385346 7:+57664592 None:intergenic
TAAGTGGAGAGTTTCCAAAT+TGG 0.387058 7:-57665712 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTTAGGACGCATAATTGCTT+TGG 0.388961 7:+57664822 None:intergenic
GTCAAGTTTCCAAGCTCATA+TGG 0.389624 7:+57664537 None:intergenic
GTTTCTAACAATGCAATAAC+AGG 0.389639 7:-57665581 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGCAACAATGAAATAACAAA+TGG 0.392083 7:-57664927 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTAAGTTACAACAACTTGAA+TGG 0.394894 7:-57666896 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATGGGTTCCCAAATTTCAAT+TGG 0.399526 7:-57665840 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTAGTATATTTAAATCTGTT+AGG 0.400731 7:+57664805 None:intergenic
ACTCTTGACCTGTCATATAC+TGG 0.401361 7:-57670636 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTGGTCTATGCTTAAGAAGT+TGG 0.404338 7:-57666140 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAATGTTCAATCCTGTATAA+TGG 0.404361 7:+57664880 None:intergenic
CTTTCTAATAATAAATTATC+CGG 0.405631 7:-57665431 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTTGCTCCTCCTATCATCCT+TGG 0.407859 7:-57673009 MsG0780039085.01.T01:CDS
GATATTGCATCTGCTCTTAG+TGG 0.408670 7:-57667299 MsG0780039085.01.T01:CDS
TAAGAATCCAGATGCATTAA+GGG 0.411381 7:-57664718 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTAGGTCCATAGCCGGGTTC+AGG 0.412609 7:+57670702 None:intergenic
AGTGATGTCAACCTTATGTT+TGG 0.415930 7:-57670519 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAACTTTATTTGCCTGGCAT+TGG 0.416483 7:-57667615 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTGAAAGATCTAGATAAGTA+AGG 0.419382 7:+57665084 None:intergenic
GTTTGGAAGTGGAATGGAAT+TGG 0.421142 7:+57665787 None:intergenic
CTGAAGGAACTTTATTTGCC+TGG 0.425969 7:-57667621 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGCTTTCTATCTTGTTTGGA+TGG 0.426147 7:-57667899 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAGAAACGTATGGTCGATAT+GGG 0.426286 7:-57664671 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTGATGAGTTCGTGTACAAT+TGG 0.427887 7:+57670608 None:intergenic
ATAAGTAATAACAAATTCAT+TGG 0.428227 7:-57665212 MsG0780039085.01.T01:CDS
CATGACATCACTTCAGACTT+TGG 0.429838 7:-57666059 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAATGGAAATGCTTGTTGTT+CGG 0.435938 7:-57665670 MsG0780039085.01.T01:CDS
TAAGGTGATTACCTTTCAAA+AGG 0.437487 7:+57664856 None:intergenic
TCTGCCCAAGACGTAGTATA+AGG 0.438864 7:+57670771 None:intergenic
CTTGAAATCCTTGACATCTC+CGG 0.438990 7:-57667341 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGTGTCATTTAAGGTGTTCC+CGG 0.440155 7:+57667322 None:intergenic
GATGTAAAACTTGCAAGATT+AGG 0.441002 7:+57666001 None:intergenic
TGATGAGTTAAAGAAGTTAA+CGG 0.441315 7:+57665253 None:intergenic
TAGTTGTCCCCAAGGATGAT+AGG 0.442558 7:+57673000 None:intergenic
TTATTTGCCTGGCATTGGAT+TGG 0.442844 7:-57667610 MsG0780039085.01.T01:CDS
GCCGGGTTCAGGTATGAGTT+TGG 0.445106 7:+57670713 None:intergenic
TGCTGAGGTCTAGTGTTACT+GGG 0.446689 7:+57664946 None:intergenic
ATTGCTCTGAATTCCCAATT+GGG 0.450704 7:-57668317 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGACATAGCATTTCCCAATT+GGG 0.452689 7:+57668304 None:intergenic
GGAGTCTTACCTGGAGGCTA+TGG 0.453570 7:-57672956 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTGATCAGTTCTTATACAAT+CGG 0.458192 7:+57668094 None:intergenic
ATACATGACCTCCATTATAC+AGG 0.458239 7:-57664891 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAGAGTCTTCAAATCTTTGA+AGG 0.458640 7:+57670653 None:intergenic
ATATTCCTTATACTACGTCT+TGG 0.460858 7:-57670776 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGGGGAAATACCTAGTTGCT+TGG 0.466670 7:-57664760 MsG0780039085.01.T01:CDS
GGAGAAAAGTTTACAAAAGA+AGG 0.467130 7:+57665038 None:intergenic
TAAAGAAGAAAGTTTGGAAG+TGG 0.467555 7:+57665776 None:intergenic
ATGCCAAGGTTCAATAATAT+GGG 0.470226 7:+57668184 None:intergenic
TCTGGATTCTTATTCTCAAA+CGG 0.473022 7:+57664729 None:intergenic
CCACAGACGTCAAATTAGAT+TGG 0.475073 7:+57665753 None:intergenic
TTGTTATTTCATTGTTGCTG+AGG 0.476157 7:+57664931 None:intergenic
CAACAAAATTATTATAAGAA+AGG 0.477942 7:+57664781 None:intergenic
GAGATGGAAATCTCCCATAA+AGG 0.479904 7:+57665640 None:intergenic
TTGAAATCCTTGACATCTCC+GGG 0.480901 7:-57667340 MsG0780039085.01.T01:CDS
GGGGAAATACCTAGTTGCTT+GGG 0.480961 7:-57664759 MsG0780039085.01.T01:CDS
CACACTTAACTACGAAAACA+TGG 0.481143 7:-57665859 MsG0780039085.01.T01:CDS
TATTCCTTATACTACGTCTT+GGG 0.486345 7:-57670775 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGTTATTACTTATGTCCAAA+TGG 0.490134 7:+57665222 None:intergenic
TCAAGTTTCCAAGCTCATAT+GGG 0.491083 7:+57664538 None:intergenic
CATCATTATGGCTCAAGTCT+AGG 0.492073 7:+57667939 None:intergenic
TCTTTGTGAGGCCGTGGAAG+AGG 0.493346 7:-57672932 MsG0780039085.01.T01:CDS
GGGATGACGTCGTATCGAAC+AGG 0.496122 7:+57667840 None:intergenic
CTTTCACAAAATAATTTGGT+GGG 0.500222 7:-57665068 MsG0780039085.01.T01:CDS
TAATGTGTTGTGAAGGGTGT+TGG 0.500423 7:-57668359 MsG0780039085.01.T01:intron
GCATTAAGGGATAAATTCAA+TGG 0.500621 7:-57664705 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGAAATCCTGCCATCACTCA+TGG 0.501148 7:-57667655 MsG0780039085.01.T01:CDS
CCAATCTAATTTGACGTCTG+TGG 0.503682 7:-57665753 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCAGAGTAGTTGAGCTGCCT+AGG 0.506595 7:+57670684 None:intergenic
ACTATGGCCTTTGGGCAGTA+AGG 0.507937 7:-57672981 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTGGAGTTCAGATTCATCAA+TGG 0.508365 7:+57670453 None:intergenic
GAGACGTGGAAGACCACTTA+GGG 0.508543 7:+57666931 None:intergenic
CAATCGGCTGATAAGTTACA+TGG 0.514044 7:+57665401 None:intergenic
GATCCCATATTATTGAACCT+TGG 0.514609 7:-57668187 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTGGAGCACTTATTGTTGGA+TGG 0.516596 7:-57665299 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGGCCTTTGGGCAGTAAGGA+TGG 0.518679 7:-57672977 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTCATACCTGAACCCGGCTA+TGG 0.520452 7:-57670708 MsG0780039085.01.T01:CDS
GGAAGTATCCCATATGAGCT+TGG 0.520835 7:-57664546 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTATCTTACAACGAATTTCA+GGG 0.521490 7:-57666106 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAGCTGCCTAGGTCCATAGC+CGG 0.523780 7:+57670695 None:intergenic
AATATTATTTCATCCCTAAG+TGG 0.523857 7:-57666944 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTGACGTCTGTGGATTTCAC+TGG 0.524731 7:-57665743 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGTTTCTCAAATGGATAAAG+AGG 0.525205 7:+57665015 None:intergenic
TTCACTGGTTGTAAACTAAG+TGG 0.525233 7:-57665728 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAGAAAGTTTGGAAGTGGAA+TGG 0.526199 7:+57665781 None:intergenic
TGCTGAGACGAGGACGAGAT+GGG 0.526963 7:+57665618 None:intergenic
ATGCTGAGACGAGGACGAGA+TGG 0.529848 7:+57665617 None:intergenic
TTTACAAGATCTAGTGTTGA+GGG 0.529849 7:-57666984 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGAGACGTGGAAGACCACTT+AGG 0.532045 7:+57666930 None:intergenic
GACGAGGACGAGATGGGAGA+TGG 0.537572 7:+57665624 None:intergenic
TCTTTCACAAAATAATTTGG+TGG 0.538632 7:-57665069 MsG0780039085.01.T01:CDS
GACATACTATGAATTGATCT+CGG 0.540431 7:+57667230 None:intergenic
AATTGGGAAATGCTATGTCT+TGG 0.540776 7:-57668301 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATGTCTAGAAATGCAATTCA+CGG 0.541907 7:-57665503 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCGATGTAGGATAGCAAAGT+CGG 0.543565 7:+57668708 None:intergenic
GCAACAATGAAATAACAAAT+GGG 0.545703 7:-57664926 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCTGAGTCCAATCCAATGCC+AGG 0.546697 7:+57667603 None:intergenic
AGGATCTATTCCATTAGAGT+TGG 0.547755 7:-57665120 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCTTCAAATCTTTGAAGGTG+AGG 0.549209 7:+57670658 None:intergenic
TAAGTTACATGGTATTCCTC+CGG 0.551496 7:+57665412 None:intergenic
GAATCTGAGACAGCTCCAAT+CGG 0.552007 7:+57665385 None:intergenic
GTTTCTCAAATGGATAAAGA+GGG 0.553034 7:+57665016 None:intergenic
TGGATATTCCAGTATATGAC+AGG 0.553781 7:+57670628 None:intergenic
CGATGTAGGATAGCAAAGTC+GGG 0.554468 7:+57668709 None:intergenic
CTAGACTTGAGCCATAATGA+TGG 0.555650 7:-57667938 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGGTGTTCCCGGAGATGTCA+AGG 0.556264 7:+57667333 None:intergenic
CATGGGATTCAGATCTCTGA+AGG 0.557803 7:-57667637 MsG0780039085.01.T01:CDS
CTATGCTTAAGAAGTTGGAA+AGG 0.558126 7:-57666135 MsG0780039085.01.T01:CDS
GAGTTTGGCCACTCTTCCAG+TGG 0.558188 7:+57668217 None:intergenic
TTCGATACGACGTCATCCCA+AGG 0.560342 7:-57667836 MsG0780039085.01.T01:intron
AGTAAGGATGGAGTCTTACC+TGG 0.561309 7:-57672965 MsG0780039085.01.T01:CDS
GCAGTACGATGAGGCGTGGT+CGG 0.562617 7:-57670484 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCCGAATAGTTAAGATGCCA+AGG 0.564842 7:+57668170 None:intergenic
ACTGATTGTTGTCAATGGTA+TGG 0.565411 7:-57668257 MsG0780039085.01.T01:CDS
CATGTAACTTATCAGCCGAT+TGG 0.565890 7:-57665400 MsG0780039085.01.T01:CDS
TATGGATCTTTGTGAGGCCG+TGG 0.569170 7:-57672938 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTGTAGTGTTGCCAAACATA+AGG 0.572109 7:+57670508 None:intergenic
AATTGTACACGAACTCATCA+AGG 0.572578 7:-57670606 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGAATCCCATGAGTGATGGC+AGG 0.573655 7:+57667649 None:intergenic
CACAAAGATCCATAGCCTCC+AGG 0.574608 7:+57672947 None:intergenic
CTGACACTGATTGTTGTCAA+TGG 0.575259 7:-57668262 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATCCAAACAAGATAGAAAGC+TGG 0.575740 7:+57667901 None:intergenic
CAGAGAATCACGAATTTGCA+TGG 0.576694 7:-57667015 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGCTGCCTAGGTCCATAGCC+GGG 0.576863 7:+57670696 None:intergenic
GAAATCCTGCCATCACTCAT+GGG 0.582439 7:-57667654 MsG0780039085.01.T01:CDS
GATTGTATAAGAACTGATCA+AGG 0.582498 7:-57668092 MsG0780039085.01.T01:intron
GTTGAGTGTAACACCACCAC+TGG 0.585260 7:-57668233 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATCTCGTCCTCGTCTCAGCA+TGG 0.586538 7:-57665615 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTATGTTTGGCAACACTACA+CGG 0.587662 7:-57670506 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAATTTAAACTCTTGAGCAA+AGG 0.589773 7:+57667272 None:intergenic
ACCATAAATGAACTTAAGGT+CGG 0.591281 7:+57665907 None:intergenic
AATTGTTGTAACCTATGTGA+AGG 0.591787 7:+57667685 None:intergenic
TATGCTTAAGAAGTTGGAAA+GGG 0.591788 7:-57666134 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTTGGCCACTCTTCCAGTGG+TGG 0.594419 7:+57668220 None:intergenic
TAACACCACCACTGGAAGAG+TGG 0.594613 7:-57668225 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCTAATAATAAATTATCCGG+AGG 0.602826 7:-57665428 MsG0780039085.01.T01:CDS
GTTTACAAGATCTAGTGTTG+AGG 0.603121 7:-57666985 MsG0780039085.01.T01:CDS
TCGTAGTTAAGTGTGAGTCA+AGG 0.603438 7:+57665867 None:intergenic
CTGAACCCGGCTATGGACCT+AGG 0.603680 7:-57670701 MsG0780039085.01.T01:CDS
GATCTGAATCCCATGAGTGA+TGG 0.603926 7:+57667645 None:intergenic
AAAATGAGTCGGAACAGCGA+CGG 0.605382 7:-57670564 MsG0780039085.01.T01:CDS
AATGGATCGCTAGATATCAC+CGG 0.607661 7:-57666878 MsG0780039085.01.T01:intron
TAACGGGGATGTTACCAGAA+AGG 0.611916 7:+57665270 None:intergenic
ACCAAACTCATACCTGAACC+CGG 0.619213 7:-57670714 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAAGGCCATAGTTGTCCCCA+AGG 0.620851 7:+57672992 None:intergenic
TAAAATCGCAATCAAAATCG+AGG 0.622057 7:+57668737 None:intergenic
AACTTCATAATCCTCTTCCA+CGG 0.622830 7:+57672921 None:intergenic
TTGATGAATCTGAACTCCAA+AGG 0.625085 7:-57670450 MsG0780039085.01.T01:intron
TATCTTACAACGAATTTCAG+GGG 0.626741 7:-57666105 MsG0780039085.01.T01:CDS
TGCTCCTCCTATCATCCTTG+GGG 0.627113 7:-57673007 MsG0780039085.01.T01:CDS
GGAGGCTATGGATCTTTGTG+AGG 0.639025 7:-57672944 MsG0780039085.01.T01:CDS
ATGAGTTAAAGAAGTTAACG+GGG 0.641656 7:+57665255 None:intergenic
TCCAACAATAAGTGCTCCAG+AGG 0.645020 7:+57665302 None:intergenic
TTTCTCAAATGGATAAAGAG+GGG 0.645261 7:+57665017 None:intergenic
TTGACAACAATCAGTGTCAG+TGG 0.647392 7:+57668265 None:intergenic
TCAATTGTCTTCGATAACTG+AGG 0.647575 7:-57665810 MsG0780039085.01.T01:CDS
TATGACGATGAAGAAACGTA+TGG 0.651603 7:-57664681 MsG0780039085.01.T01:CDS
ACTAACGGTAACATCACCAC+CGG 0.652420 7:-57670744 MsG0780039085.01.T01:CDS
TTGTCCCCAAGGATGATAGG+AGG 0.654130 7:+57673003 None:intergenic
ACTCCATCCTTACTGCCCAA+AGG 0.656131 7:+57672974 None:intergenic
AAGTCAAGAGATTTGAGACG+TGG 0.660772 7:+57666917 None:intergenic
TGTTCAATCCTGTATAATGG+AGG 0.662903 7:+57664883 None:intergenic
TCTTGGGCAGACTACACTAA+CGG 0.663522 7:-57670759 MsG0780039085.01.T01:CDS
ACTAGATCTTGTAAACTGGA+CGG 0.664436 7:+57666992 None:intergenic
ACTTCTACCATGCTGAGACG+AGG 0.668158 7:+57665608 None:intergenic
GAGTTTGGTGACTCTTCCGG+TGG 0.669610 7:+57670728 None:intergenic
GCTGAGGTCTAGTGTTACTG+GGG 0.670615 7:+57664947 None:intergenic
CACTACACGGCAGTACGATG+AGG 0.671605 7:-57670493 MsG0780039085.01.T01:CDS
CATCTGGAGATCCTTCACAT+AGG 0.675670 7:-57667696 MsG0780039085.01.T01:CDS
CACGGCAGTACGATGAGGCG+TGG 0.676406 7:-57670488 MsG0780039085.01.T01:CDS
ACACTTAACTACGAAAACAT+GGG 0.678167 7:-57665858 MsG0780039085.01.T01:CDS
AGAATTGTGTGAATGAAACA+GGG 0.689620 7:+57665939 None:intergenic
AGAAACGTATGGTCGATATG+GGG 0.698116 7:-57664670 MsG0780039085.01.T01:CDS
AAGGATGGAGTCTTACCTGG+AGG 0.724423 7:-57672962 MsG0780039085.01.T01:CDS
ACAACAATCAGTGTCAGTGG+TGG 0.740083 7:+57668268 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTAAAAAAAAAAAAAAAATA+AGG - Chr7:57667522-57667541 MsG0780039085.01.T01:intron 0.0%
!! AATAAAATAGTTTAAATGAA+AGG - Chr7:57666056-57666075 MsG0780039085.01.T01:CDS 10.0%
!! AGAATTTAAAAAAAAAAACT+GGG - Chr7:57668246-57668265 MsG0780039085.01.T01:CDS 10.0%
!! ATTAAAAAAATTATTTAGTG+TGG + Chr7:57667708-57667727 None:intergenic 10.0%
!! TTAAAAAAATTATTTAGTGT+GGG + Chr7:57667707-57667726 None:intergenic 10.0%
!!! AAAAAAAAACATAATTTTCT+CGG - Chr7:57664906-57664925 MsG0780039085.01.T01:CDS 10.0%
!!! ATCAAAAATAAATTCATTTT+TGG + Chr7:57669550-57669569 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTAACATTATTTTTGTTT+TGG - Chr7:57668797-57668816 MsG0780039085.01.T01:intron 10.0%
!!! ATTTGATCTATTTTTAAAAA+AGG + Chr7:57664688-57664707 None:intergenic 10.0%
!!! TTTCTTATAATAATTTTGTT+GGG - Chr7:57672784-57672803 MsG0780039085.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTGATCTATTTTTAAAAAA+GGG + Chr7:57664687-57664706 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTATTTACATATTATTCA+GGG - Chr7:57669584-57669603 MsG0780039085.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTTATTTACATATTATTC+AGG - Chr7:57669583-57669602 MsG0780039085.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTTTAAAAATAGATCAAA+TGG - Chr7:57664687-57664706 MsG0780039085.01.T01:CDS 10.0%
!! AAAATACATATACATAAATG+TGG + Chr7:57668727-57668746 None:intergenic 15.0%
!! AAATACATATACATAAATGT+GGG + Chr7:57668726-57668745 None:intergenic 15.0%
!! AAATTAAAACCCATTAAAAT+AGG + Chr7:57666004-57666023 None:intergenic 15.0%
!! AAATTATTATTGAATGAATC+AGG - Chr7:57667195-57667214 MsG0780039085.01.T01:intron 15.0%
!! AAATTCAGCATAAAATTATT+TGG + Chr7:57667426-57667445 None:intergenic 15.0%
!! AATATAGAAAAAGTTGTTTA+AGG - Chr7:57665886-57665905 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAAGTAATAACAAATTCAT+TGG - Chr7:57672351-57672370 MsG0780039085.01.T01:intron 15.0%
!! ATATAGAAAAAGTTGTTTAA+GGG - Chr7:57665887-57665906 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!! CAACAAAATTATTATAAGAA+AGG + Chr7:57672785-57672804 None:intergenic 15.0%
!! CTTTCTAATAATAAATTATC+CGG - Chr7:57672132-57672151 MsG0780039085.01.T01:intron 15.0%
!! GAGAATTTAAAAAAAAAAAC+TGG - Chr7:57668245-57668264 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAAAAAATTATTTAGTGTG+GGG + Chr7:57667706-57667725 None:intergenic 15.0%
!! TAAAACAAAGTCAAAATTAA+GGG - Chr7:57665835-57665854 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAATTCAAAATCAAAACAT+GGG - Chr7:57668349-57668368 MsG0780039085.01.T01:intron 15.0%
!! TAATTAATCAAATACTCATT+TGG - Chr7:57668279-57668298 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!! TAATTTATTTACCTTATCAA+AGG + Chr7:57666572-57666591 None:intergenic 15.0%
!! TACATTTCAACAAATAAAAA+AGG + Chr7:57671343-57671362 None:intergenic 15.0%
!! TATATGTTATAAATTGCATA+TGG + Chr7:57668778-57668797 None:intergenic 15.0%
!! TATCAATATTATATATGAAG+TGG + Chr7:57665953-57665972 None:intergenic 15.0%
!! TTATCTCAAAATAAGTTAAA+TGG - Chr7:57672996-57673015 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATAAAGTAATTTTCGAAATT+CGG - Chr7:57667896-57667915 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTATGTATATGTATTTTG+TGG - Chr7:57668728-57668747 MsG0780039085.01.T01:CDS 15.0%
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!!! GAAATTTAAAATAAACATGT+AGG + Chr7:57668099-57668118 None:intergenic 15.0%
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! TGATGAGTTAAAGAAGTTAA+CGG + Chr7:57672313-57672332 None:intergenic 25.0%
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! TGTTATTACTTATGTCCAAA+TGG + Chr7:57672344-57672363 None:intergenic 25.0%
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! TTATTAACATTTGCCTGAAT+CGG - Chr7:57670098-57670117 MsG0780039085.01.T01:intron 25.0%
! TTATTATTACATACCACTAC+CGG - Chr7:57670148-57670167 MsG0780039085.01.T01:intron 25.0%
! TTCAATCATGGAAAATTCTA+TGG - Chr7:57667331-57667350 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATCAGTTCTTATACAAT+CGG + Chr7:57669472-57669491 None:intergenic 25.0%
!! AACATCCTTATTTATATGTC+TGG - Chr7:57672966-57672985 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGTCCAATAATCATTTTGA+AGG - Chr7:57672423-57672442 MsG0780039085.01.T01:intron 25.0%
!! CAGAAAAGTTTTTCTTGTTA+CGG - Chr7:57664939-57664958 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!! CGAATTGAAGAAAAAAGTAT+TGG - Chr7:57668211-57668230 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!! CTGTTTTCTAATAACCAATT+TGG + Chr7:57671868-57671887 None:intergenic 25.0%
!! GATTTGAAGTTACAATTAGA+AGG - Chr7:57670931-57670950 MsG0780039085.01.T01:intron 25.0%
!! TCGATTTACGATTTTTCTAT+TGG - Chr7:57671201-57671220 MsG0780039085.01.T01:intron 25.0%
!! TTTAAGGTTAAAGTTAACAG+AGG - Chr7:57664773-57664792 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACCTACACTGTTTTTTATT+TGG + Chr7:57672389-57672408 None:intergenic 25.0%
!!! AGTGAAGGAATGAAATTTTT+TGG + Chr7:57668700-57668719 None:intergenic 25.0%
!!! ATATTTGGTTTGGATGTATT+TGG + Chr7:57671162-57671181 None:intergenic 25.0%
!!! ATCTTTTTTTTCAATTCGAC+TGG + Chr7:57667478-57667497 None:intergenic 25.0%
!!! ATTACTTTTACGCAAAACAA+CGG + Chr7:57666365-57666384 None:intergenic 25.0%
!!! ATTGCCATTTTCTACTTAAA+TGG - Chr7:57667270-57667289 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
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!!! GGCATATTTCCTATTTTAAT+GGG - Chr7:57665992-57666011 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAAACATCACTTTTTTACCT+TGG + Chr7:57665610-57665629 None:intergenic 25.0%
!!! TATTTTAGTGGTTATTTCCA+AGG - Chr7:57665590-57665609 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGGCATATTTCCTATTTTAA+TGG - Chr7:57665991-57666010 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGGTCTTTTTTAGATCAAT+TGG + Chr7:57668121-57668140 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTTTTTCTTTTTTGACG+AGG + Chr7:57665118-57665137 None:intergenic 25.0%
!!! TTTGTTTTGATACATATTCC+CGG - Chr7:57665339-57665358 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTACTCTGTTCTTGAA+AGG - Chr7:57670750-57670769 MsG0780039085.01.T01:CDS 25.0%
AAAAAGATGAAGAGCTTAGT+AGG - Chr7:57669146-57669165 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
AAAAATAAGGCATGACAATG+GGG - Chr7:57667535-57667554 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
AAAATCGCAATCAAAATCGA+AGG + Chr7:57668828-57668847 None:intergenic 30.0%
AAAATTATTTAGTGTGGGGA+CGG + Chr7:57667702-57667721 None:intergenic 30.0%
AACCAAAACGATATTTGGTT+TGG + Chr7:57671172-57671191 None:intergenic 30.0%
AAGAGTCTTCAAATCTTTGA+AGG + Chr7:57666913-57666932 None:intergenic 30.0%
AAGCACTTCCAATTGAAATT+TGG + Chr7:57671734-57671753 None:intergenic 30.0%
AATTGTTGTAACCTATGTGA+AGG + Chr7:57669881-57669900 None:intergenic 30.0%
AATTTATCCCTTAATGCATC+TGG + Chr7:57672855-57672874 None:intergenic 30.0%
ACACTTAACTACGAAAACAT+GGG - Chr7:57671705-57671724 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
ACATCAAGGTTATCAAAATC+GGG + Chr7:57668972-57668991 None:intergenic 30.0%
ACCATAAATGAACTTAAGGT+CGG + Chr7:57671659-57671678 None:intergenic 30.0%
AGAAAATCCTTACAAAAAGC+AGG + Chr7:57665069-57665088 None:intergenic 30.0%
AGAATTGTGTGAATGAAACA+GGG + Chr7:57671627-57671646 None:intergenic 30.0%
AGCACTTCCAATTGAAATTT+GGG + Chr7:57671733-57671752 None:intergenic 30.0%
AGCCAAATAAAAAACAGTGT+AGG - Chr7:57672384-57672403 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
AGGAATATCATCCTATGAAA+AGG + Chr7:57666775-57666794 None:intergenic 30.0%
AGGAATATCATCCTTTGATA+AGG - Chr7:57666558-57666577 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
ATAAAGTGGCCTATCTAAAT+CGG - Chr7:57665005-57665024 MsG0780039085.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGAATCCAGATGCATTA+AGG - Chr7:57672844-57672863 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
ATAGATAAAAACATGACACG+TGG + Chr7:57667240-57667259 None:intergenic 30.0%
ATATTCCTTATACTACGTCT+TGG - Chr7:57666787-57666806 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
ATCCAAACCAAAACGATATT+TGG + Chr7:57671177-57671196 None:intergenic 30.0%
ATGAAACAGGGAATTCAAAT+TGG + Chr7:57671615-57671634 None:intergenic 30.0%
ATGAGTTAAAGAAGTTAACG+GGG + Chr7:57672311-57672330 None:intergenic 30.0%
ATGCATTACAACATTTATCC+AGG + Chr7:57667756-57667775 None:intergenic 30.0%
ATGCCAAGGTTCAATAATAT+GGG + Chr7:57669382-57669401 None:intergenic 30.0%
ATGTCTAGAAATGCAATTCA+CGG - Chr7:57672060-57672079 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
ATGTCTAGATATAGCAAGTT+TGG + Chr7:57672042-57672061 None:intergenic 30.0%
CACATCAAGGTTATCAAAAT+CGG + Chr7:57668973-57668992 None:intergenic 30.0%
CATACGAAGTAAAAATGAGT+CGG - Chr7:57666988-57667007 MsG0780039085.01.T01:CDS 30.0%
CTATCTTACAACGAATTTCA+GGG - Chr7:57671457-57671476 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
CTCTCCATTTAAGTAGAAAA+TGG + Chr7:57667277-57667296 None:intergenic 30.0%
GAATGTTCAATCCTGTATAA+TGG + Chr7:57672686-57672705 None:intergenic 30.0%
GACATACTATGAATTGATCT+CGG + Chr7:57670336-57670355 None:intergenic 30.0%
GATATATTAATTGAACGTGC+AGG - Chr7:57670177-57670196 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
GATGAGTTAAAGAAGTTAAC+GGG + Chr7:57672312-57672331 None:intergenic 30.0%
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GATTGGTAAAGAAGAAAGTT+TGG + Chr7:57671796-57671815 None:intergenic 30.0%
GATTGTATAAGAACTGATCA+AGG - Chr7:57669471-57669490 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
GCATTAAGGGATAAATTCAA+TGG - Chr7:57672858-57672877 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
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GGAGAAAAGTTTACAAAAGA+AGG + Chr7:57672528-57672547 None:intergenic 30.0%
GTGAAAGATCTAGATAAGTA+AGG + Chr7:57672482-57672501 None:intergenic 30.0%
GTTGCTCCTTTAAATATCAA+TGG - Chr7:57667823-57667842 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
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! TATGAAGTGGATAGAGATTT+TGG + Chr7:57665940-57665959 None:intergenic 30.0%
! TCATTTGGTTCAAATTAGTG+AGG - Chr7:57668294-57668313 MsG0780039085.01.T01:CDS 30.0%
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! TTGAACATTCTCCTTTTGAA+AGG - Chr7:57672696-57672715 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
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! TTTTTCTTGCACTAAGCTAA+TGG + Chr7:57669033-57669052 None:intergenic 30.0%
!! AAATGGAAATGCTTGTTGTT+CGG - Chr7:57671893-57671912 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
!! AAATTTAAAACCACCGATTC+AGG + Chr7:57670114-57670133 None:intergenic 30.0%
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!! ATAGGATTTTGCCTGTTTTT+GGG + Chr7:57668522-57668541 None:intergenic 30.0%
!! CAACAGATCATTTTTCATAC+TGG - Chr7:57671404-57671423 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
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!! TGCAATATCAGTGTCATTTA+AGG + Chr7:57670253-57670272 None:intergenic 30.0%
!! TTGTTATTTCATTGTTGCTG+AGG + Chr7:57672635-57672654 None:intergenic 30.0%
!!! AACCAAATATCGTTTTGGTT+TGG - Chr7:57671172-57671191 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
!!! AATCTATCCTGCTTTTTGTA+AGG - Chr7:57665059-57665078 MsG0780039085.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATGAAATTTTTTGGCCTTC+GGG + Chr7:57668692-57668711 None:intergenic 30.0%
!!! ACACTGTTTTTTATTTGGCT+TGG + Chr7:57672384-57672403 None:intergenic 30.0%
!!! ACTTTTTTCTTCAATTCGAG+TGG + Chr7:57668209-57668228 None:intergenic 30.0%
!!! AGGATTTTGATGGATTTTGA+AGG - Chr7:57668580-57668599 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
!!! ATCCCTACCAATTATTTTAG+TGG - Chr7:57665578-57665597 MsG0780039085.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTAGTAGGTGTGTTTTTTA+TGG - Chr7:57669160-57669179 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
!!! GAATGAAATTTTTTGGCCTT+CGG + Chr7:57668693-57668712 None:intergenic 30.0%
!!! GTGGTTTTAAATTTTCTCGT+AGG - Chr7:57670120-57670139 MsG0780039085.01.T01:intron 30.0%
AAAAAACTCCACTTTACACG+AGG + Chr7:57671380-57671399 None:intergenic 35.0%
AAACCTGTTCAAATTGGGTT+TGG - Chr7:57668034-57668053 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
AAAGGAGCAACTAAATCGAT+TGG + Chr7:57667814-57667833 None:intergenic 35.0%
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AACGGGTCATAGATTCAAAT+CGG + Chr7:57668660-57668679 None:intergenic 35.0%
AACTTCATAATCCTCTTCCA+CGG + Chr7:57664645-57664664 None:intergenic 35.0%
AAGAAACGTATGGTCGATAT+GGG - Chr7:57672892-57672911 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
AAGAAAGTTTGGAAGTGGAA+TGG + Chr7:57671785-57671804 None:intergenic 35.0%
AAGACATAGCATTTCCCAAT+TGG + Chr7:57669263-57669282 None:intergenic 35.0%
AAGCTAATGGGAAGTTAAAG+TGG + Chr7:57669020-57669039 None:intergenic 35.0%
AATTGGGAAATGCTATGTCT+TGG - Chr7:57669262-57669281 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
AATTGTACACGAACTCATCA+AGG - Chr7:57666957-57666976 MsG0780039085.01.T01:CDS 35.0%
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ACCTTGGCATCTTAACTATT+CGG - Chr7:57669392-57669411 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
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ACTGATTGTTGTCAATGGTA+TGG - Chr7:57669306-57669325 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
AGACATAGCATTTCCCAATT+GGG + Chr7:57669262-57669281 None:intergenic 35.0%
AGGAAATATGCCACTATAGT+AGG + Chr7:57665984-57666003 None:intergenic 35.0%
AGGATCTATTCCATTAGAGT+TGG - Chr7:57672443-57672462 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
AGTGATGTCAACCTTATGTT+TGG - Chr7:57667044-57667063 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
ATACATGACCTCCATTATAC+AGG - Chr7:57672672-57672691 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
ATACCCAAACCTAGTCAAAA+CGG - Chr7:57668008-57668027 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
ATATGTGTACGTCTCAGATT+AGG + Chr7:57671248-57671267 None:intergenic 35.0%
ATCACAAAGTAACTTCCTTG+AGG - Chr7:57665383-57665402 MsG0780039085.01.T01:CDS 35.0%
ATCCAAACAAGATAGAAAGC+TGG + Chr7:57669665-57669684 None:intergenic 35.0%
ATGGGTTCCCAAATTTCAAT+TGG - Chr7:57671723-57671742 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
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CAACACTAGATCTTGTAAAC+TGG + Chr7:57670578-57670597 None:intergenic 35.0%
CACACTTAACTACGAAAACA+TGG - Chr7:57671704-57671723 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
CACACTTGTGACATTATAGT+TGG + Chr7:57666671-57666690 None:intergenic 35.0%
CAGCATTTCCTTTCAAATGT+GGG - Chr7:57668408-57668427 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
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CTATGCTTAAGAAGTTGGAA+AGG - Chr7:57671428-57671447 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
CTCATCAAACATCTACCATT+TGG - Chr7:57672326-57672345 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
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GACTTTACTTCAAGTCGAAA+GGG + Chr7:57668950-57668969 None:intergenic 35.0%
GAGAATTGTGTGAATGAAAC+AGG + Chr7:57671628-57671647 None:intergenic 35.0%
GATCCCATATTATTGAACCT+TGG - Chr7:57669376-57669395 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
GATGCCAAGGTTCAATAATA+TGG + Chr7:57669383-57669402 None:intergenic 35.0%
GCATTACAACATTTATCCAG+GGG + Chr7:57667754-57667773 None:intergenic 35.0%
GGACTAAAAATCGACAACAT+AGG + Chr7:57672243-57672262 None:intergenic 35.0%
GTCATGTTGACAAAAAACGA+GGG + Chr7:57671490-57671509 None:intergenic 35.0%
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TAAGTTACATGGTATTCCTC+CGG + Chr7:57672154-57672173 None:intergenic 35.0%
TACCAGCTTTCTATCTTGTT+TGG - Chr7:57669660-57669679 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TAGTACAGGTTAATACTCAC+CGG + Chr7:57670707-57670726 None:intergenic 35.0%
TATGACGATGAAGAAACGTA+TGG - Chr7:57672882-57672901 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
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TCAAGTTTCCAAGCTCATAT+GGG + Chr7:57673028-57673047 None:intergenic 35.0%
TCAATTGTCTTCGATAACTG+AGG - Chr7:57671753-57671772 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TCAGCATTTCCTTTCAAATG+TGG - Chr7:57668407-57668426 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TCATGTTGACAAAAAACGAG+GGG + Chr7:57671489-57671508 None:intergenic 35.0%
TCCGACCTTAAGTTCATTTA+TGG - Chr7:57671655-57671674 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TCTCATTCGGAAAAGAGATA+CGG - Chr7:57665483-57665502 MsG0780039085.01.T01:CDS 35.0%
TGAAATCCATTCAAAATCGC+AGG - Chr7:57668560-57668579 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TGATTAACGGAGCATAAATG+GGG - Chr7:57664803-57664822 MsG0780039085.01.T01:CDS 35.0%
TGGATATTCCAGTATATGAC+AGG + Chr7:57666938-57666957 None:intergenic 35.0%
TGTCATGTTGACAAAAAACG+AGG + Chr7:57671491-57671510 None:intergenic 35.0%
TGTTCAATCCTGTATAATGG+AGG + Chr7:57672683-57672702 None:intergenic 35.0%
TGTTCGGAATTGTTCCTTTA+TGG - Chr7:57671909-57671928 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TGTTCGTTCTATTCTATTCG+TGG + Chr7:57666230-57666249 None:intergenic 35.0%
TTAACCTTAAATGTCTACGG+TGG + Chr7:57664764-57664783 None:intergenic 35.0%
TTATGTTTGGCAACACTACA+CGG - Chr7:57667057-57667076 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TTCTATGTAATTGCAGTTGC+CGG + Chr7:57665361-57665380 None:intergenic 35.0%
TTGATGAATCTGAACTCCAA+AGG - Chr7:57667113-57667132 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
TTGATGAGTTCGTGTACAAT+TGG + Chr7:57666958-57666977 None:intergenic 35.0%
TTGGAGTTCAGATTCATCAA+TGG + Chr7:57667113-57667132 None:intergenic 35.0%
! AGCTTTCTATCTTGTTTGGA+TGG - Chr7:57669664-57669683 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! ATAAGGGTCAATTTTTGACC+TGG - Chr7:57668621-57668640 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! ATTGCTCTGAATTCCCAATT+GGG - Chr7:57669246-57669265 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! CAAAATCCTGCGATTTTGAA+TGG + Chr7:57668569-57668588 None:intergenic 35.0%
! GACTTTTGTAGAATCGATGT+AGG + Chr7:57668871-57668890 None:intergenic 35.0%
! GATAGGATTTTGCCTGTTTT+TGG + Chr7:57668523-57668542 None:intergenic 35.0%
! GATTTTACTACCTTTGTCTC+GGG - Chr7:57666601-57666620 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! GTAATTTTCGAAATTCGGGA+AGG - Chr7:57667901-57667920 MsG0780039085.01.T01:CDS 35.0%
! GTCGATTTCGTTGTTCATAA+AGG - Chr7:57670875-57670894 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! TATTGCTCTGAATTCCCAAT+TGG - Chr7:57669245-57669264 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! TCAAAATCGCAGGATTTTGA+TGG - Chr7:57668570-57668589 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! TCTTCAAATCTTTGAAGGTG+AGG + Chr7:57666908-57666927 None:intergenic 35.0%
! TTCACTGGTTGTAAACTAAG+TGG - Chr7:57671835-57671854 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCCCCGATTTCAAAACA+CGG + Chr7:57667980-57667999 None:intergenic 35.0%
!! ACGTTTTGTTGCAAGACAAT+GGG + Chr7:57669119-57669138 None:intergenic 35.0%
!! AGTCGGGTTTTTGATAACAA+TGG + Chr7:57668434-57668453 None:intergenic 35.0%
!! ATGCTAGAGGAGCTTATTTT+TGG - Chr7:57666449-57666468 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
!! CGATTTTGATAACCTTGATG+TGG - Chr7:57668971-57668990 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
!! CGATTTTGTGCGATTTTGAT+AGG + Chr7:57668540-57668559 None:intergenic 35.0%
!! CTTGACTTGGTAATCATCTT+TGG + Chr7:57665269-57665288 None:intergenic 35.0%
!! TTTTGACTAGGTTTGGGTAT+GGG + Chr7:57668008-57668027 None:intergenic 35.0%
!!! AGGATTTTGAGACTTAAGTC+GGG + Chr7:57668450-57668469 None:intergenic 35.0%
!!! ATAAGTTTTTTTGCAACCCC+TGG - Chr7:57667735-57667754 MsG0780039085.01.T01:intron 35.0%
!!! CAGGATTTTGAGACTTAAGT+CGG + Chr7:57668451-57668470 None:intergenic 35.0%
!!! CTGTTTTTGGGATTTTGCTA+TGG + Chr7:57668510-57668529 None:intergenic 35.0%
AAATCAAAACATGGGATGGG+AGG - Chr7:57668357-57668376 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
AACAATGGCCCACATTTGAA+AGG + Chr7:57668419-57668438 None:intergenic 40.0%
AATCAAAACATGGGATGGGA+GGG - Chr7:57668358-57668377 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
AATGGATCGCTAGATATCAC+CGG - Chr7:57670685-57670704 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
AATTATGAGAACACACCTGC+AGG + Chr7:57670518-57670537 None:intergenic 40.0%
AATTATTTAGTGTGGGGACG+GGG + Chr7:57667700-57667719 None:intergenic 40.0%
ACAAAGTAACTTCCTTGAGG+TGG - Chr7:57665386-57665405 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
ACAATAAGCCTCGTGTAAAG+TGG - Chr7:57671369-57671388 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
ACACTGATAGAATGATCACG+CGG - Chr7:57670041-57670060 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
ACGCTAATAGGTAGTTCAGT+TGG - Chr7:57670007-57670026 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
ACGGGTCATAGATTCAAATC+GGG + Chr7:57668659-57668678 None:intergenic 40.0%
ACTCTTGACCTGTCATATAC+TGG - Chr7:57666927-57666946 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
AGAAACGTATGGTCGATATG+GGG - Chr7:57672893-57672912 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
AGGGAACGGTTAGATTATAC+AGG + Chr7:57664668-57664687 None:intergenic 40.0%
AGGTAAGCAAGAACGCTAAT+AGG - Chr7:57669995-57670014 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
ATATATCGTGTTACCGGTAG+TGG + Chr7:57670164-57670183 None:intergenic 40.0%
ATCTAAATCGGTTGGGTGTT+GGG - Chr7:57665017-57665036 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
ATCTACTTACAGGTGAGAAG+AGG + Chr7:57665810-57665829 None:intergenic 40.0%
ATGAGAATCGGGTATGAAGA+CGG + Chr7:57667587-57667606 None:intergenic 40.0%
CAATCGGCTGATAAGTTACA+TGG + Chr7:57672165-57672184 None:intergenic 40.0%
CAGAGAATCACGAATTTGCA+TGG - Chr7:57670548-57670567 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
CAGGTAAGCATATGAGAATC+GGG + Chr7:57667598-57667617 None:intergenic 40.0%
CATAAATGTGGGAGAAGTGA+AGG + Chr7:57668715-57668734 None:intergenic 40.0%
CATCATTATGGCTCAAGTCT+AGG + Chr7:57669627-57669646 None:intergenic 40.0%
CATGACATCACTTCAGACTT+TGG - Chr7:57671504-57671523 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CATGTAACTTATCAGCCGAT+TGG - Chr7:57672163-57672182 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CCAAAAACATGTTCGGAGAA+AGG - Chr7:57672589-57672608 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CCAATCTAATTTGACGTCTG+TGG - Chr7:57671810-57671829 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CCACAGACGTCAAATTAGAT+TGG + Chr7:57671813-57671832 None:intergenic 40.0%
CCTTCGGGTATTTATAGAAC+GGG + Chr7:57668677-57668696 None:intergenic 40.0%
CGACTTAAGTCTCAAAATCC+TGG - Chr7:57668449-57668468 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CGATTTCAAAACACGGGTAT+GGG + Chr7:57667973-57667992 None:intergenic 40.0%
CTAGACTTGAGCCATAATGA+TGG - Chr7:57669625-57669644 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CTCAAGTAGCTTAGCTCATA+AGG + Chr7:57672093-57672112 None:intergenic 40.0%
CTGCGAACAATTTGAGCTTA+TGG - Chr7:57670492-57670511 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
CTGGTCTATGCTTAAGAAGT+TGG - Chr7:57671423-57671442 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
CTTGAAATCCTTGACATCTC+CGG - Chr7:57670222-57670241 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
GAACCAAACCCAATTTGAAC+AGG + Chr7:57668040-57668059 None:intergenic 40.0%
GAACTTAAGGTCGGAATGAT+TGG + Chr7:57671650-57671669 None:intergenic 40.0%
GAAGAAACGTATGGTCGATA+TGG - Chr7:57672891-57672910 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
GAGATGGAAATCTCCCATAA+AGG + Chr7:57671926-57671945 None:intergenic 40.0%
GATATTGCATCTGCTCTTAG+TGG - Chr7:57670264-57670283 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
GATTAACGGAGCATAAATGG+GGG - Chr7:57664804-57664823 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
GATTGTGAGAGAGACATATG+AGG - Chr7:57665174-57665193 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
GCCTTCGGGTATTTATAGAA+CGG + Chr7:57668678-57668697 None:intergenic 40.0%
GGACTTTACTTCAAGTCGAA+AGG + Chr7:57668951-57668970 None:intergenic 40.0%
GGGGAAAACCTGTTCAAATT+GGG - Chr7:57668029-57668048 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
GTCAAGTTTCCAAGCTCATA+TGG + Chr7:57673029-57673048 None:intergenic 40.0%
GTGTAGTGTTGCCAAACATA+AGG + Chr7:57667058-57667077 None:intergenic 40.0%
GTTAGGACGCATAATTGCTT+TGG + Chr7:57672744-57672763 None:intergenic 40.0%
GTTTGGAAGTGGAATGGAAT+TGG + Chr7:57671779-57671798 None:intergenic 40.0%
TACCCAAACCTAGTCAAAAC+GGG - Chr7:57668009-57668028 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
TATCTAAATCGGTTGGGTGT+TGG - Chr7:57665016-57665035 MsG0780039085.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGTTCTGCCAACTCTAA+TGG + Chr7:57672456-57672475 None:intergenic 40.0%
TCCGAATAGTTAAGATGCCA+AGG + Chr7:57669396-57669415 None:intergenic 40.0%
TCGAAAGGGAGTAGCAAAAT+CGG + Chr7:57668936-57668955 None:intergenic 40.0%
TCGATGTAGGATAGCAAAGT+CGG + Chr7:57668858-57668877 None:intergenic 40.0%
TCGTAGTTAAGTGTGAGTCA+AGG + Chr7:57671699-57671718 None:intergenic 40.0%
TCTATGTAATTGCAGTTGCC+GGG + Chr7:57665360-57665379 None:intergenic 40.0%
TGAGAAGTGAGAAGAGGAAA+GGG - Chr7:57667136-57667155 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
TTAACATTTGCCTGAATCGG+TGG - Chr7:57670101-57670120 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
TTCATCAAAGTTGCTGCATC+TGG - Chr7:57669851-57669870 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
TTGAAATCCTTGACATCTCC+GGG - Chr7:57670223-57670242 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
TTGACAACAATCAGTGTCAG+TGG + Chr7:57669301-57669320 None:intergenic 40.0%
TTGGATGGTAATAGCCTTTC+TGG - Chr7:57672279-57672298 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
TTTCCCCGATTTCAAAACAC+GGG + Chr7:57667979-57667998 None:intergenic 40.0%
! AACACCCAACCGATTTAGAT+AGG + Chr7:57665017-57665036 None:intergenic 40.0%
! AAGTCAAGAGATTTGAGACG+TGG + Chr7:57670649-57670668 None:intergenic 40.0%
! AGATACTTTGAGAGAGAGTG+AGG - Chr7:57671082-57671101 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
! ATGGGATCGAAGTTTGAGTT+TGG + Chr7:57669364-57669383 None:intergenic 40.0%
! CATTTTTATACCCAACCGCA+TGG + Chr7:57671137-57671156 None:intergenic 40.0%
! CCTTTCTCCGAACATGTTTT+TGG + Chr7:57672592-57672611 None:intergenic 40.0%
! CTGAAGGAACTTTATTTGCC+TGG - Chr7:57669942-57669961 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
! CTGACACTGATTGTTGTCAA+TGG - Chr7:57669301-57669320 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
! GAACTTTATTTGCCTGGCAT+TGG - Chr7:57669948-57669967 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
! GACTTGGTAATCATCTTTGG+TGG + Chr7:57665266-57665285 None:intergenic 40.0%
! TAATGTGTTGTGAAGGGTGT+TGG - Chr7:57669204-57669223 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
! TATGAGTTTGGTGACTCTTC+CGG + Chr7:57666841-57666860 None:intergenic 40.0%
! TTATTTGCCTGGCATTGGAT+TGG - Chr7:57669953-57669972 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
!! AGTGTCATTTAAGGTGTTCC+CGG + Chr7:57670244-57670263 None:intergenic 40.0%
!! CACGTTTTGTTGCAAGACAA+TGG + Chr7:57669120-57669139 None:intergenic 40.0%
!!! ATACCCGTGTTTTGAAATCG+GGG - Chr7:57667973-57667992 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
!!! CATACCCGTGTTTTGAAATC+GGG - Chr7:57667972-57667991 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
!!! CCATACCCGTGTTTTGAAAT+CGG - Chr7:57667971-57667990 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTGTCGATTTTTAGTCCTC+TGG - Chr7:57672245-57672264 MsG0780039085.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTTTGACTAGGTTTGGGTA+TGG + Chr7:57668009-57668028 None:intergenic 40.0%
AAAATGAGTCGGAACAGCGA+CGG - Chr7:57666999-57667018 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
AATAAGGCATGACAATGGGG+CGG - Chr7:57667538-57667557 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
AATTTGAGCTTATGGCCTGC+AGG - Chr7:57670500-57670519 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
ACAACAATCAGTGTCAGTGG+TGG + Chr7:57669298-57669317 None:intergenic 45.0%
ACCAAACTCATACCTGAACC+CGG - Chr7:57666849-57666868 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
ACCCAAACCTAGTCAAAACG+GGG - Chr7:57668010-57668029 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
ACTAACGGTAACATCACCAC+CGG - Chr7:57666819-57666838 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
ACTAGGTTTGGGTATGGGTT+GGG + Chr7:57668003-57668022 None:intergenic 45.0%
AGTAAGGATGGAGTCTTACC+TGG - Chr7:57664598-57664617 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
AGTATCATGCTTCCACTCCA+AGG + Chr7:57665425-57665444 None:intergenic 45.0%
AGTGGCCTATCTAAATCGGT+TGG - Chr7:57665009-57665028 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
ATCAAAACATGGGATGGGAG+GGG - Chr7:57668359-57668378 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
ATCATCCTTGGGGACAACTA+TGG - Chr7:57664566-57664585 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
ATCGGGTCAATTTACGAACC+AGG + Chr7:57668642-57668661 None:intergenic 45.0%
ATTGATTGCCTCATGCACCT+TGG + Chr7:57669747-57669766 None:intergenic 45.0%
CAAAGGTGAGAAGTGAGAAG+AGG - Chr7:57667130-57667149 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
CATCTGGAGATCCTTCACAT+AGG - Chr7:57669867-57669886 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
CATGGGATTCAGATCTCTGA+AGG - Chr7:57669926-57669945 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
CATTGCATATGCCCACATCA+AGG + Chr7:57668986-57669005 None:intergenic 45.0%
CCCGTTCTATAAATACCCGA+AGG - Chr7:57668674-57668693 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
CCGATTTCAAAACACGGGTA+TGG + Chr7:57667974-57667993 None:intergenic 45.0%
CGAAAGGGAGTAGCAAAATC+GGG + Chr7:57668935-57668954 None:intergenic 45.0%
CGATGTAGGATAGCAAAGTC+GGG + Chr7:57668857-57668876 None:intergenic 45.0%
CGGGGAAAACCTGTTCAAAT+TGG - Chr7:57668028-57668047 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
CTCTTCTCACTTCTCACCTT+TGG + Chr7:57667132-57667151 None:intergenic 45.0%
GAAACTGTGTAACCACCTCA+AGG + Chr7:57665401-57665420 None:intergenic 45.0%
GAAATCCTGCCATCACTCAT+GGG - Chr7:57669909-57669928 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
GAGAAGTGAGAAGAGGAAAG+GGG - Chr7:57667137-57667156 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
GATCTGAATCCCATGAGTGA+TGG + Chr7:57669921-57669940 None:intergenic 45.0%
GGGGAAATACCTAGTTGCTT+GGG - Chr7:57672804-57672823 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
GTATCATGCTTCCACTCCAA+GGG + Chr7:57665424-57665443 None:intergenic 45.0%
GTGAGAAGTGAGAAGAGGAA+AGG - Chr7:57667135-57667154 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
GTGGCAATGTCATGTGACAT+TGG - Chr7:57666645-57666664 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
GTGGCCTATCTAAATCGGTT+GGG - Chr7:57665010-57665029 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
GTTACCCTACCCATAAGCAA+GGG - Chr7:57667617-57667636 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TAACGGGGATGTTACCAGAA+AGG + Chr7:57672296-57672315 None:intergenic 45.0%
TACGCAAAGTCGCAAAAACC+AGG + Chr7:57668470-57668489 None:intergenic 45.0%
TAGTTGTCCCCAAGGATGAT+AGG + Chr7:57664566-57664585 None:intergenic 45.0%
TATCATGCTTCCACTCCAAG+GGG + Chr7:57665423-57665442 None:intergenic 45.0%
TCCAACAATAAGTGCTCCAG+AGG + Chr7:57672264-57672283 None:intergenic 45.0%
TCGAAATTCGGGAAGGGTTT+GGG - Chr7:57667908-57667927 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TCTGCCCAAGACGTAGTATA+AGG + Chr7:57666795-57666814 None:intergenic 45.0%
TCTTGGGCAGACTACACTAA+CGG - Chr7:57666804-57666823 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
TGAAATCCTGCCATCACTCA+TGG - Chr7:57669908-57669927 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
TGGACCACCGTAGACATTTA+AGG - Chr7:57664757-57664776 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TGGGGAAATACCTAGTTGCT+TGG - Chr7:57672803-57672822 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
TGTTACCCTACCCATAAGCA+AGG - Chr7:57667616-57667635 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TTACCCTACCCATAAGCAAG+GGG - Chr7:57667618-57667637 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TTATACCCAACCGCATGGTT+TGG + Chr7:57671132-57671151 None:intergenic 45.0%
TTCGAAATTCGGGAAGGGTT+TGG - Chr7:57667907-57667926 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCATCCCCCTTGCTTAT+GGG + Chr7:57667629-57667648 None:intergenic 45.0%
TTGACGTCTGTGGATTTCAC+TGG - Chr7:57671820-57671839 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
TTGATTGCCTCATGCACCTT+GGG + Chr7:57669746-57669765 None:intergenic 45.0%
TTGCTCCTCCTATCATCCTT+GGG - Chr7:57664555-57664574 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTGAGGTCTAGTGTTAC+TGG + Chr7:57672621-57672640 None:intergenic 45.0%
TTGCTTATGGGTAGGGTAAC+AGG + Chr7:57667617-57667636 None:intergenic 45.0%
TTTCTCATCCCCCTTGCTTA+TGG + Chr7:57667630-57667649 None:intergenic 45.0%
! AAATTGGGTTTGGTTCGAGC+GGG - Chr7:57668044-57668063 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
! CAAATTGGGTTTGGTTCGAG+CGG - Chr7:57668043-57668062 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
! CTGGAGCACTTATTGTTGGA+TGG - Chr7:57672264-57672283 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
! GAATCTGAGACAGCTCCAAT+CGG + Chr7:57672181-57672200 None:intergenic 45.0%
! GGCATTTTACCCAAGCAACT+AGG + Chr7:57672816-57672835 None:intergenic 45.0%
! GGTAGCACTTTGGTGACATT+GGG - Chr7:57666622-57666641 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
! GTAGCACTTTGGTGACATTG+GGG - Chr7:57666623-57666642 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
! TGCTGAGGTCTAGTGTTACT+GGG + Chr7:57672620-57672639 None:intergenic 45.0%
!! GGAAGTATCCCATATGAGCT+TGG - Chr7:57673017-57673036 MsG0780039085.01.T01:CDS 45.0%
!! TCCTCTGGAGCACTTATTGT+TGG - Chr7:57672260-57672279 MsG0780039085.01.T01:intron 45.0%
!!! AGGTTTTCCCCGTTTTGACT+AGG + Chr7:57668020-57668039 None:intergenic 45.0%
!!! TCCCCGTTTTGACTAGGTTT+GGG + Chr7:57668014-57668033 None:intergenic 45.0%
!!! TTCCCCGTTTTGACTAGGTT+TGG + Chr7:57668015-57668034 None:intergenic 45.0%
!! TAATATGTAAATAAAAATAA+CGG + Chr7:57669580-57669599 None:intergenic 5.0%
!! TTGAAATTAAAAAATTAATA+AGG - Chr7:57664710-57664729 MsG0780039085.01.T01:CDS 5.0%
!!! ATTAATTTGAATATTTTAAA+TGG - Chr7:57668318-57668337 MsG0780039085.01.T01:CDS 5.0%
AAAGGCCATAGTTGTCCCCA+AGG + Chr7:57664574-57664593 None:intergenic 50.0%
AAGGATGGAGTCTTACCTGG+AGG - Chr7:57664601-57664620 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
AAGGGTTTGGGTATGGGTTC+GGG - Chr7:57667920-57667939 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
AAGTGAGAAGAGGAAAGGGG+CGG - Chr7:57667140-57667159 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
ACCAAACCAAACCATGCGGT+TGG - Chr7:57671123-57671142 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
ACTATGGCCTTTGGGCAGTA+AGG - Chr7:57664582-57664601 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
ACTCCATCCTTACTGCCCAA+AGG + Chr7:57664592-57664611 None:intergenic 50.0%
ACTTCTACCATGCTGAGACG+AGG + Chr7:57671958-57671977 None:intergenic 50.0%
ATAAGGCATGACAATGGGGC+GGG - Chr7:57667539-57667558 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
ATCCCCCTTGCTTATGGGTA+GGG + Chr7:57667624-57667643 None:intergenic 50.0%
ATTCGGGAAGGGTTTGGGTA+TGG - Chr7:57667913-57667932 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
CACAAAGATCCATAGCCTCC+AGG + Chr7:57664619-57664638 None:intergenic 50.0%
CCAAACCAAACCATGCGGTT+GGG - Chr7:57671124-57671143 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
CTTTGTCTCGGGTAGCACTT+TGG - Chr7:57666612-57666631 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
GAAGGGTTTGGGTATGGGTT+CGG - Chr7:57667919-57667938 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
GACAACAAAACCCATACCCG+TGG + Chr7:57668073-57668092 None:intergenic 50.0%
GACTAGGTTTGGGTATGGGT+TGG + Chr7:57668004-57668023 None:intergenic 50.0%
GAGACGTGGAAGACCACTTA+GGG + Chr7:57670635-57670654 None:intergenic 50.0%
GCACTCACTCCTTATGCTAG+AGG - Chr7:57666436-57666455 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
GCAGACCAAACCAAACCATG+CGG - Chr7:57671119-57671138 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
GCATAAATGGGGGACCGAAA+AGG - Chr7:57664814-57664833 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
GGAGGCTATGGATCTTTGTG+AGG - Chr7:57664619-57664638 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
GTGGTTACACAGTTTCCCCT+TGG - Chr7:57665405-57665424 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
GTTGAGTGTAACACCACCAC+TGG - Chr7:57669330-57669349 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
GTTGCTCCTCCTATCATCCT+TGG - Chr7:57664554-57664573 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TAACACCACCACTGGAAGAG+TGG - Chr7:57669338-57669357 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
TACACAGTTTCCCCTTGGAG+TGG - Chr7:57665410-57665429 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TACCCTACCCATAAGCAAGG+GGG - Chr7:57667619-57667638 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TATGGATCTTTGTGAGGCCG+TGG - Chr7:57664625-57664644 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TCAGAGTAGTTGAGCTGCCT+AGG + Chr7:57666882-57666901 None:intergenic 50.0%
TCTGAGTCCAATCCAATGCC+AGG + Chr7:57669963-57669982 None:intergenic 50.0%
TGAATCCCATGAGTGATGGC+AGG + Chr7:57669917-57669936 None:intergenic 50.0%
TGAGACGTGGAAGACCACTT+AGG + Chr7:57670636-57670655 None:intergenic 50.0%
TGCTCCTCCTATCATCCTTG+GGG - Chr7:57664556-57664575 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TGGGGACAACTATGGCCTTT+GGG - Chr7:57664574-57664593 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TTCGATACGACGTCATCCCA+AGG - Chr7:57669727-57669746 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
TTCGGGAAGGGTTTGGGTAT+GGG - Chr7:57667914-57667933 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TTGGGGACAACTATGGCCTT+TGG - Chr7:57664573-57664592 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
TTGTCCCCAAGGATGATAGG+AGG + Chr7:57664563-57664582 None:intergenic 50.0%
! CAAAGTGCTACCCGAGACAA+AGG + Chr7:57666614-57666633 None:intergenic 50.0%
! GCTGAGGTCTAGTGTTACTG+GGG + Chr7:57672619-57672638 None:intergenic 50.0%
! GGGTAGCACTTTGGTGACAT+TGG - Chr7:57666621-57666640 MsG0780039085.01.T01:intron 50.0%
!! AAATCGGTTGGGTGTTGGGA+GGG - Chr7:57665021-57665040 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
!! GCATGGTTTGGTTTGGTCTG+CGG + Chr7:57671120-57671139 None:intergenic 50.0%
!! TAAATCGGTTGGGTGTTGGG+AGG - Chr7:57665020-57665039 MsG0780039085.01.T01:CDS 50.0%
AACCTCATCCTCGTCCCCAA+CGG - Chr7:57667653-57667672 MsG0780039085.01.T01:CDS 55.0%
ACGGGTATGGGACGAGTAAC+AGG + Chr7:57667961-57667980 None:intergenic 55.0%
ACGTCATCCCAAGGTGCATG+AGG - Chr7:57669736-57669755 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
AGGGTTTGGGTATGGGTTCG+GGG - Chr7:57667921-57667940 MsG0780039085.01.T01:CDS 55.0%
AGGTGTTCCCGGAGATGTCA+AGG + Chr7:57670233-57670252 None:intergenic 55.0%
ATCTCGTCCTCGTCTCAGCA+TGG - Chr7:57671948-57671967 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
ATGCTGAGACGAGGACGAGA+TGG + Chr7:57671949-57671968 None:intergenic 55.0%
ATTTAGTGTGGGGACGGGGA+TGG + Chr7:57667696-57667715 None:intergenic 55.0%
CACTACACGGCAGTACGATG+AGG - Chr7:57667070-57667089 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
CATCCCCCTTGCTTATGGGT+AGG + Chr7:57667625-57667644 None:intergenic 55.0%
CTCATACCTGAACCCGGCTA+TGG - Chr7:57666855-57666874 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
GAGTTTGGCCACTCTTCCAG+TGG + Chr7:57669349-57669368 None:intergenic 55.0%
GCCGGGTTCAGGTATGAGTT+TGG + Chr7:57666853-57666872 None:intergenic 55.0%
GGAGTCTTACCTGGAGGCTA+TGG - Chr7:57664607-57664626 MsG0780039085.01.T01:CDS 55.0%
GGGATGACGTCGTATCGAAC+AGG + Chr7:57669726-57669745 None:intergenic 55.0%
TAAGGCATGACAATGGGGCG+GGG - Chr7:57667540-57667559 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
TCTTTGTGAGGCCGTGGAAG+AGG - Chr7:57664631-57664650 MsG0780039085.01.T01:CDS 55.0%
TGCTGAGACGAGGACGAGAT+GGG + Chr7:57671948-57671967 None:intergenic 55.0%
TGGCCTTTGGGCAGTAAGGA+TGG - Chr7:57664586-57664605 MsG0780039085.01.T01:CDS 55.0%
TGGGATGGGAGGGGCTAATT+TGG - Chr7:57668368-57668387 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
TTTAGTGTGGGGACGGGGAT+GGG + Chr7:57667695-57667714 None:intergenic 55.0%
TTTGGCCACTCTTCCAGTGG+TGG + Chr7:57669346-57669365 None:intergenic 55.0%
TTTGGGTATGGGTTCGGGGT+GGG - Chr7:57667925-57667944 MsG0780039085.01.T01:CDS 55.0%
! GAGTTTGGTGACTCTTCCGG+TGG + Chr7:57666838-57666857 None:intergenic 55.0%
! GCACTTTGGTGACATTGGGG+TGG - Chr7:57666626-57666645 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
! TTGGTTCGAGCGGGTAACCA+CGG - Chr7:57668053-57668072 MsG0780039085.01.T01:intron 55.0%
!! CCCAACCGCATGGTTTGGTT+TGG + Chr7:57671127-57671146 None:intergenic 55.0%
ACCTCATCCTCGTCCCCAAC+GGG - Chr7:57667654-57667673 MsG0780039085.01.T01:CDS 60.0%
AGCTGCCTAGGTCCATAGCC+GGG + Chr7:57666870-57666889 None:intergenic 60.0%
CTAGGTCCATAGCCGGGTTC+AGG + Chr7:57666864-57666883 None:intergenic 60.0%
CTGAACCCGGCTATGGACCT+AGG - Chr7:57666862-57666881 MsG0780039085.01.T01:intron 60.0%
GACGAGGACGAGATGGGAGA+TGG + Chr7:57671942-57671961 None:intergenic 60.0%
GAGCGGGTAACCACGGGTAT+GGG - Chr7:57668060-57668079 MsG0780039085.01.T01:intron 60.0%
GAGCTGCCTAGGTCCATAGC+CGG + Chr7:57666871-57666890 None:intergenic 60.0%
GCAGTACGATGAGGCGTGGT+CGG - Chr7:57667079-57667098 MsG0780039085.01.T01:intron 60.0%
GTTTGGGTATGGGTTCGGGG+TGG - Chr7:57667924-57667943 MsG0780039085.01.T01:CDS 60.0%
TGGGGATACCCGAACCCGTT+GGG + Chr7:57667671-57667690 None:intergenic 60.0%
TGGTTCGAGCGGGTAACCAC+GGG - Chr7:57668054-57668073 MsG0780039085.01.T01:intron 60.0%
TTAGTGTGGGGACGGGGATG+GGG + Chr7:57667694-57667713 None:intergenic 60.0%
! ATCCTCGTCCCCAACGGGTT+CGG - Chr7:57667659-57667678 MsG0780039085.01.T01:CDS 60.0%
ACCCGTTGGGGACGAGGATG+AGG + Chr7:57667658-57667677 None:intergenic 65.0%
CACGGCAGTACGATGAGGCG+TGG - Chr7:57667075-57667094 MsG0780039085.01.T01:intron 65.0%
CATGACAATGGGGCGGGGTG+GGG - Chr7:57667545-57667564 MsG0780039085.01.T01:intron 65.0%
CGAGCGGGTAACCACGGGTA+TGG - Chr7:57668059-57668078 MsG0780039085.01.T01:intron 65.0%
GCATGACAATGGGGCGGGGT+GGG - Chr7:57667544-57667563 MsG0780039085.01.T01:intron 65.0%
GGGGATACCCGAACCCGTTG+GGG + Chr7:57667670-57667689 None:intergenic 65.0%
GTGGGGATACCCGAACCCGT+TGG + Chr7:57667672-57667691 None:intergenic 65.0%
! TCCTCGTCCCCAACGGGTTC+GGG - Chr7:57667660-57667679 MsG0780039085.01.T01:CDS 65.0%
ACAATGGGGCGGGGTGGGGA+CGG - Chr7:57667549-57667568 MsG0780039085.01.T01:intron 70.0%
ACCCGAACCCGTTGGGGACG+AGG + Chr7:57667664-57667683 None:intergenic 70.0%
GGCATGACAATGGGGCGGGG+TGG - Chr7:57667543-57667562 MsG0780039085.01.T01:intron 70.0%
TGTGGGGACGGGGATGGGGT+GGG + Chr7:57667690-57667709 None:intergenic 70.0%
CAATGGGGCGGGGTGGGGAC+GGG - Chr7:57667550-57667569 MsG0780039085.01.T01:intron 75.0%
GTGGGGACGGGGATGGGGTG+GGG + Chr7:57667689-57667708 None:intergenic 75.0%
GTGTGGGGACGGGGATGGGG+TGG + Chr7:57667691-57667710 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 57664527 57673058 57664527 ID=MsG0780039085.01;Name=MsG0780039085.01
Chr7 mRNA 57664527 57673058 57664527 ID=MsG0780039085.01.T01;Parent=MsG0780039085.01;Name=MsG0780039085.01.T01;_AED=0.19;_eAED=0.19;_QI=0|0|0|0.8|1|1|10|0|1054
Chr7 exon 57672918 57673058 57672918 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6460;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57670451 57670802 57670451 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6459;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57668698 57668762 57668698 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6458;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57668093 57668366 57668093 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6457;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57667837 57667980 57667837 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6456;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57667589 57667747 57667589 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6455;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57667237 57667386 57667237 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6454;Parent=MsG0780039085.01.T01
Chr7 exon 57666879 57667034 57666879 ID=MsG0780039085.01.T01:exon:6453;Parent=MsG0780039085.01.T01
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