AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039135.01

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MsG0780039135.01.T01 AT4G20140 28.975 849 492 33 47 855 58 835 1.33e-42 170
MsG0780039135.01.T01 AT4G20140 28.571 413 229 7 683 1039 66 468 1.02e-24 112
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MsG0780039135.01.T01 AT1G12460 27.778 414 271 12 298 705 78 469 2.92e-12 71.6
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MsG0780039135.01.T01 AT1G62950 28.814 354 185 12 221 520 81 421 1.91e-11 68.9
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MsG0780039135.01.T01 AT5G61240 33.333 213 126 7 313 518 99 302 1.68e-11 67.4
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MsG0780039135.01.T01 AT1G56130 31.658 199 101 5 628 795 32 226 2.77e-11 68.6
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MsG0780039135.01.T01 AT2G15880 30.682 176 97 4 846 1021 166 316 1.16e-14 79.3
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MsG0780039135.01.T01 AT5G65830 37.778 135 80 1 933 1063 106 240 1.25e-14 76.3
MsG0780039135.01.T01 AT5G49750 25.532 329 180 7 700 1017 159 433 1.69e-14 78.2
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MsG0780039135.01.T01 AT3G49750 41.111 90 53 0 933 1022 99 188 5.21e-11 63.5
MsG0780039135.01.T01 AT4G18760 37.857 140 75 2 665 804 195 322 5.92e-11 66.6
MsG0780039135.01.T01 AT1G64210 41.667 96 56 0 925 1020 82 177 6.09e-11 67.0
MsG0780039135.01.T01 AT1G56130 33.333 177 111 2 622 795 3 175 6.19e-11 67.4
MsG0780039135.01.T01 AT1G67720 36.190 105 62 1 636 740 414 513 6.62e-11 67.4
MsG0780039135.01.T01 AT2G13800 37.383 107 66 1 690 795 72 178 6.65e-11 67.0
MsG0780039135.01.T01 AT2G13800 37.383 107 66 1 690 795 72 178 6.65e-11 67.0
MsG0780039135.01.T01 AT2G13790 32.847 137 84 3 690 824 77 207 6.71e-11 67.0
MsG0780039135.01.T01 AT1G60630 34.146 123 78 2 928 1050 106 225 9.90e-11 66.6

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATGAATTGTCCTTTCCTTTC+AGG 0.103036 7:+58449818 None:intergenic
AGCACTTGCAATTGAAATTT+TGG 0.113789 7:+58451279 None:intergenic
CTTGAGCTCTTTAAGGGTTT+TGG 0.153216 7:-58450902 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTCTGTACATCAATCCTTAT+TGG 0.175330 7:-58449589 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTTCCGTGGTTTAAGTAATT+TGG 0.178996 7:-58451884 MsG0780039135.01.T01:CDS
TAAGCCACTTGAGCTCTTTA+AGG 0.179224 7:-58450909 MsG0780039135.01.T01:CDS
CCATCTCCAGATAAGTTATT+TGG 0.183758 7:+58450847 None:intergenic
CTTACTGATAATCACTTTAT+TGG 0.185349 7:-58451480 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGGGTGGAAATAGCCTTTC+TGG 0.197453 7:-58450793 MsG0780039135.01.T01:CDS
AATCACTTTATTGGTAATAT+TGG 0.200673 7:-58451471 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGAGAGAAAACAAGTTTAA+AGG 0.208179 7:-58452230 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGTAAGATAATGAAATTAAT+TGG 0.211259 7:+58454539 None:intergenic
TATTGGTAAAGAATAAAATT+TGG 0.219097 7:+58451216 None:intergenic
ACCTGCTACATTCTCCAATT+TGG 0.230050 7:-58449963 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTTCAAACAATTTGAACTTA+TGG 0.231038 7:-58453340 MsG0780039135.01.T01:CDS
TCTATCAGGAAATGAATTTA+TGG 0.236021 7:-58451553 MsG0780039135.01.T01:CDS
CACTTAGCTGAGGAGGAATT+TGG 0.239091 7:+58449897 None:intergenic
TGATACTATATAAGTTAAAA+AGG 0.257122 7:+58450755 None:intergenic
GCAAATGTGTATAATAGATT+TGG 0.259434 7:-58450169 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAAAATTGTGTGAAAGAAAT+AGG 0.272803 7:+58451384 None:intergenic
TTGGATATTCTTGCATTAGA+TGG 0.278815 7:-58452320 MsG0780039135.01.T01:CDS
TAAGAGGAGGGTTCCCAAAT+TGG 0.283699 7:-58451158 MsG0780039135.01.T01:CDS
ACTCTCTACTTGTACCAAAT+TGG 0.284169 7:+58449949 None:intergenic
TTATCTCATAATAAGTTAAA+TGG 0.285779 7:-58450064 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAACTTAAGGTTTGAATGAT+TGG 0.286017 7:+58451362 None:intergenic
TGACCCTTCTAAATGATTAC+TGG 0.289969 7:+58450645 None:intergenic
TACCGGCTTTCCCATCTATT+AGG 0.303575 7:-58452262 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGGGGAAATACCTAGATGTT+TGG 0.303667 7:-58450257 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAAATACCAAATAACTTATC+TGG 0.304870 7:-58450853 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTAGATGGGAATATGATAAA+TGG 0.312514 7:-58452305 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAAGTAAGATTCCTAATAGA+TGG 0.315184 7:+58452251 None:intergenic
CTAATATATCTAAATATCTT+AGG 0.316299 7:+58450302 None:intergenic
ATGTCCAGTAATCATTTAGA+AGG 0.321762 7:-58450649 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTAATTTGTTGTTGCTCAAA+TGG 0.324773 7:+58450515 None:intergenic
TTGTGCAGGGTTGAACAATT+TGG 0.329213 7:-58454105 MsG0780039135.01.T01:intron
AGTATTCTTATTTATATGTC+TGG 0.335143 7:-58450094 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGACTTGAGTGATAATGATT+TGG 0.338055 7:-58454075 MsG0780039135.01.T01:CDS
CACATTTGCGTTATTAAGTA+AGG 0.351643 7:+58450183 None:intergenic
TGTTGCTCTGAATTTCAGTT+TGG 0.355886 7:-58454411 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTTATATAGTATCAAAGGTT+TGG 0.358929 7:-58450746 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGAGAGAAAACAAGTTTAAA+GGG 0.360971 7:-58452229 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAGTTTAAAGGGACAATTCT+TGG 0.360980 7:-58452218 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAGAAATAGGAAATTCAAAA+TGG 0.364854 7:+58451397 None:intergenic
CAGCTCAATATTTCCCAACT+TGG 0.365593 7:-58450983 MsG0780039135.01.T01:CDS
CATTGCCGTAGATGAACTTA+AGG 0.366937 7:+58451349 None:intergenic
AACCATGCTTGCCTCCAATA+AGG 0.374367 7:+58449575 None:intergenic
CTTAGGAGGCATAATTGCTT+TGG 0.374856 7:+58450319 None:intergenic
CATGACATCCCTTCGGACTT+TGG 0.378958 7:-58451505 MsG0780039135.01.T01:CDS
AGTGTCATTGAAGTTGTTCC+AGG 0.382566 7:+58453591 None:intergenic
GGGTGGATCACTTAACTATT+CGG 0.383840 7:-58454279 MsG0780039135.01.T01:CDS
CACACTCAACTTTGAAAACA+TGG 0.389053 7:-58451305 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAGCCACTTGAGCTCTTTAA+GGG 0.391833 7:-58450908 MsG0780039135.01.T01:CDS
GTGGCACACAACAATTTATC+TGG 0.392683 7:-58449848 MsG0780039135.01.T01:CDS
GGGGAAATACCTAGATGTTT+GGG 0.393850 7:-58450256 MsG0780039135.01.T01:CDS
GTGTCAGGTTGTAGGATAAA+TGG 0.394874 7:-58451775 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTAAGTTGCAACAACTTGAA+TGG 0.394894 7:-58453098 MsG0780039135.01.T01:CDS
CAAATGTGTATAATAGATTT+GGG 0.395185 7:-58450168 MsG0780039135.01.T01:CDS
GGAATATTGAAGTTTGAGTT+TGG 0.395212 7:+58454310 None:intergenic
TGAAGTTATTACCTTTCATA+AGG 0.396140 7:+58450353 None:intergenic
CCTCAAGAGTTTAAATTTAG+CGG 0.397973 7:-58453536 MsG0780039135.01.T01:CDS
CGCTAAATTTAAACTCTTGA+GGG 0.401239 7:+58453537 None:intergenic
ACTCTCGACCTATCAAGTTC+TGG 0.402796 7:-58454230 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGAATATTCCAGAACTTGAT+AGG 0.405886 7:+58454222 None:intergenic
CTTTCACAAAACAAATTGTC+AGG 0.405897 7:-58450577 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGGAAGAGTTAGATCTATC+AGG 0.406585 7:-58451567 MsG0780039135.01.T01:CDS
CATGGGATTCAAATCTTTGA+AGG 0.407279 7:-58453785 MsG0780039135.01.T01:CDS
CCATTTGAGTGGCATTGGAT+TGG 0.407718 7:-58453758 MsG0780039135.01.T01:CDS
TAAAGAATAAAATTTGGAAA+TGG 0.411117 7:+58451222 None:intergenic
ATTTGATGAAAGCAGTTATG+AGG 0.411725 7:-58449792 MsG0780039135.01.T01:CDS
GATATTGCATCTGCTCTTAG+TGG 0.414112 7:-58453568 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGAGATCCTTGACATCTCC+TGG 0.414397 7:-58453609 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAAATTCTGTCTTGTGTGGA+TGG 0.415044 7:-58454053 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATTCAATAATGAAGTTACTT+TGG 0.417624 7:-58449415 MsG0780039135.01.T01:three_prime_UTR
CATTTGACACAGTTGTTGTT+GGG 0.419403 7:-58450811 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAACTCCATTTGAGTGGCAT+TGG 0.426744 7:-58453763 MsG0780039135.01.T01:CDS
AACTTCAATATTCCAATACT+AGG 0.431875 7:-58454301 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGATATTTCATTGTTGCTA+AGG 0.434750 7:+58450428 None:intergenic
TACTCTATGACTTCATTTCA+CGG 0.437441 7:-58453993 MsG0780039135.01.T01:intron
CTATCAGGAAATGAATTTAT+GGG 0.437878 7:-58451552 MsG0780039135.01.T01:CDS
CAGAGAATCAAAGATTTGTA+TGG 0.439887 7:-58453217 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTAAACTCTTGAGGGAAGAA+AGG 0.445109 7:+58453545 None:intergenic
TCATCCTTGTCCAAGCCATC+TGG 0.447201 7:+58449698 None:intergenic
TGTTCAATGGGAATATAAAT+CGG 0.447445 7:-58450474 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGTAACAATTACCTCCAAT+TGG 0.448214 7:+58451745 None:intergenic
AGGATGAAGAAGATAATAGT+TGG 0.449602 7:-58449682 MsG0780039135.01.T01:CDS
CCACAAAAGTTAGACTGTAT+TGG 0.451233 7:+58451199 None:intergenic
CCAATCCAATGCCACTCAAA+TGG 0.452241 7:+58453758 None:intergenic
TCATTTGACACAGTTGTTGT+TGG 0.453120 7:-58450812 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTGTCTGATAATGAATTGTC+TGG 0.458175 7:-58450877 MsG0780039135.01.T01:CDS
TCTACTATGCTATTATTGTA+TGG 0.462047 7:-58454601 None:intergenic
GTAGCTGGTGTTTGTCCGCC+TGG 0.462297 7:+58449725 None:intergenic
CCGCTAAATTTAAACTCTTG+AGG 0.463524 7:+58453536 None:intergenic
ATGTTTAGATGAACCAAGTT+GGG 0.465571 7:+58450970 None:intergenic
CAATAAAATTATTGTAAGAA+AGG 0.465581 7:+58450278 None:intergenic
GTTGAATGCAACACCACAAC+AGG 0.467158 7:-58454341 MsG0780039135.01.T01:CDS
AGCAACAATGAAATATCAAA+TGG 0.468803 7:-58450424 MsG0780039135.01.T01:CDS
ACTTCAATATTCCAATACTA+GGG 0.471553 7:-58454300 MsG0780039135.01.T01:CDS
AGCTACATTACCAGATGGCT+TGG 0.471660 7:-58449708 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATAAATGGTACCCTTCCAAT+TGG 0.472493 7:-58451760 MsG0780039135.01.T01:CDS
AATGGATCGCTTGATATTAG+TGG 0.473414 7:-58453080 MsG0780039135.01.T01:intron
ATTTGGAAATGGAATGGACT+TGG 0.476779 7:+58451233 None:intergenic
TGGATATTCTTGCATTAGAT+GGG 0.477865 7:-58452319 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGACTGGTTGGAATCTAAG+AGG 0.478133 7:-58451174 MsG0780039135.01.T01:CDS
CAATCTACAAGAGTGGTTAC+CGG 0.481125 7:-58452279 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGTCAACATGACATCCCTT+CGG 0.483597 7:-58451512 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATTAGTATGTGTGTTTCTGT+TGG 0.489126 7:-58454480 MsG0780039135.01.T01:CDS
AATAAAATTTGGAAATGGAA+TGG 0.489899 7:+58451227 None:intergenic
CATGTTTAGATGAACCAAGT+TGG 0.491828 7:+58450969 None:intergenic
AGATTGGTCTAAGCTTAAGT+TGG 0.492339 7:-58451586 MsG0780039135.01.T01:CDS
GCAGAAGTGTTTATAAAAGA+AGG 0.492494 7:+58450547 None:intergenic
CCAAATAACTTATCTGGAGA+TGG 0.495224 7:-58450847 MsG0780039135.01.T01:CDS
GGACACATAGTTAGTTCAAA+GGG 0.496724 7:-58454580 MsG0780039135.01.T01:five_prime_UTR
TAATTTGGAATACTTAGCAT+TGG 0.498057 7:-58451869 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTTGGTGACTCTTCCTGTTG+TGG 0.500248 7:+58454328 None:intergenic
AACAATTACCTCCAATTGGA+AGG 0.502400 7:+58451749 None:intergenic
GAGTGGCATTGGATTGGACT+CGG 0.504952 7:-58453752 MsG0780039135.01.T01:CDS
GTGCCACACTGAATACTTCA+AGG 0.505071 7:+58449864 None:intergenic
TCAAAGTTGAGTGTGAATCA+AGG 0.508201 7:+58451313 None:intergenic
TTGAACTTTCTCCTTATGAA+AGG 0.511147 7:-58450364 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTTAACTTATATAGTATCAA+AGG 0.511237 7:-58450751 MsG0780039135.01.T01:CDS
GGATGAAGAAGATAATAGTT+GGG 0.511946 7:-58449681 MsG0780039135.01.T01:CDS
GTCCTTGACATAGGTAAGAA+TGG 0.512182 7:-58453838 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATCCTTATTGGAGGCAAGCA+TGG 0.514608 7:-58449577 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAAGGGACAATTCTTGGTGG+AGG 0.515124 7:-58452212 MsG0780039135.01.T01:intron
TCAAGTTCTGCAACCTCGGA+TGG 0.522240 7:+58450619 None:intergenic
TGTACATCAATCCTTATTGG+AGG 0.523413 7:-58449586 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATGTTCAAGTTCTGCAACCT+CGG 0.524478 7:+58450615 None:intergenic
AAGCCATCTGGTAATGTAGC+TGG 0.525040 7:+58449710 None:intergenic
GTCAAGTTTCCTAGCTCAGA+TGG 0.525119 7:+58450034 None:intergenic
TGAAATCCTACCATCACTCA+TGG 0.525225 7:-58453803 MsG0780039135.01.T01:CDS
TCAAACCTTAAGTTCATCTA+CGG 0.525887 7:-58451354 MsG0780039135.01.T01:CDS
ACCAAATTGGAGAATGTAGC+AGG 0.526601 7:+58449962 None:intergenic
GGCATACACATCAATACTGC+TGG 0.527497 7:-58449624 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATGAAAGGTAATAACTTCAC+AGG 0.528964 7:-58450349 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTCTAAATGATTACTGGACA+TGG 0.529350 7:+58450651 None:intergenic
GGATTGATGTACAGAACAGT+TGG 0.531369 7:+58449596 None:intergenic
ATCGAAGTTGCTACATCTTG+AGG 0.532010 7:-58453860 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTTAAGTTCATCTACGGCAA+TGG 0.532363 7:-58451348 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAAAGTTCAAGCTGGTATAA+CGG 0.534397 7:+58450377 None:intergenic
ATAGACTACCTTGTATATGA+AGG 0.535366 7:+58453728 None:intergenic
ACTGGATCCTCATTATCAAA+AGG 0.538091 7:+58450226 None:intergenic
CATCTTGAGGTCCTTGACAT+AGG 0.543115 7:-58453847 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGGACACATAGTTAGTTCAA+AGG 0.543119 7:-58454581 MsG0780039135.01.T01:five_prime_UTR
AGTGGAAGACCACTTAGGTA+TGG 0.544133 7:+58453137 None:intergenic
AAGTGATCCACCCCTAGTAT+TGG 0.546147 7:+58454289 None:intergenic
CTCAAGTGGCTTAGCTCATG+AGG 0.548888 7:+58450919 None:intergenic
GGTAGCATCCCATCTGAGCT+AGG 0.550605 7:-58450043 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTTAAAGGGACAATTCTTGG+TGG 0.551814 7:-58452215 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAAAGAACTTGTAAGCTGAA+TGG 0.552925 7:+58453194 None:intergenic
AATGGTACCCTTCCAATTGG+AGG 0.555703 7:-58451757 MsG0780039135.01.T01:intron
ATGTCGAGATGAGGATGAGA+TGG 0.556119 7:+58451063 None:intergenic
AAGTAAGATTCCTAATAGAT+GGG 0.556171 7:+58452252 None:intergenic
AATTGTACAAGAACTCATCA+AGG 0.556219 7:-58454200 MsG0780039135.01.T01:intron
GCTAAGGTCTAGAGTCACTA+GGG 0.560695 7:+58450444 None:intergenic
ATAAGTAATAATAATTTCAC+CGG 0.560816 7:-58450721 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATTCCAAATTACTTAAACCA+CGG 0.561230 7:+58451881 None:intergenic
TTCCTAATAGATGGGAAAGC+CGG 0.561233 7:+58452260 None:intergenic
AATTTGAACTTATGGCCCCT+AGG 0.561792 7:-58453332 MsG0780039135.01.T01:intron
TTTGATGAAAGCAGTTATGA+GGG 0.563150 7:-58449791 MsG0780039135.01.T01:CDS
TCAAGTTTCCTAGCTCAGAT+GGG 0.563533 7:+58450035 None:intergenic
GTCAATCCACTTAGCTGAGG+AGG 0.565241 7:+58449890 None:intergenic
CAATATTCCAATACTAGGGG+TGG 0.565850 7:-58454296 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAGTCAAGAGATGTGAGAAG+TGG 0.567988 7:+58453119 None:intergenic
CATAGAGTACATATCAGCTA+AGG 0.571431 7:+58454007 None:intergenic
CTTTCTTTCAACATGTTGAG+TGG 0.573854 7:-58449920 MsG0780039135.01.T01:CDS
AAACCCTTAAAGAGCTCAAG+TGG 0.573952 7:+58450905 None:intergenic
ACGGATTGTTGTGAATGGTA+TGG 0.577286 7:-58454365 MsG0780039135.01.T01:CDS
ACACTCAACTTTGAAAACAT+GGG 0.582098 7:-58451304 MsG0780039135.01.T01:CDS
CATAAGGAGAAAGTTCAAGC+TGG 0.586312 7:+58450369 None:intergenic
TCAAGATGTAGCAACTTCGA+TGG 0.587175 7:+58453862 None:intergenic
TTGAAGGAACTCCATTTGAG+TGG 0.587462 7:-58453769 MsG0780039135.01.T01:CDS
CAGTAAGTGCCAAAGTCCGA+AGG 0.587754 7:+58451496 None:intergenic
CAAATTCCTCCTCAGCTAAG+TGG 0.588822 7:-58449896 MsG0780039135.01.T01:CDS
AATTGTTTGAAGATAAGTCA+AGG 0.589732 7:+58453351 None:intergenic
TATCAGGAAATGAATTTATG+GGG 0.589950 7:-58451551 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGAATCCCATGAGTGATGGT+AGG 0.590116 7:+58453797 None:intergenic
TTTGGAAATTCTGTCTTGTG+TGG 0.593686 7:-58454057 MsG0780039135.01.T01:CDS
TATCTGGTGCAACACCTGAA+AGG 0.595433 7:-58449832 MsG0780039135.01.T01:CDS
GTCATGTTGACAAAAGATGA+GGG 0.597331 7:+58451522 None:intergenic
AATTGATTTCATAGTAAGTG+TGG 0.598827 7:+58453510 None:intergenic
ATATATCTAAATATCTTAGG+AGG 0.599082 7:+58450305 None:intergenic
CACCATTCTTACCTATGTCA+AGG 0.600481 7:+58453836 None:intergenic
CAAGTGAAGTAAAACTTGCA+AGG 0.600535 7:+58451442 None:intergenic
AGAAGGGTCAATTCCATCCG+AGG 0.602048 7:-58450632 MsG0780039135.01.T01:CDS
TTGACACAGTTGTTGTTGGG+TGG 0.603154 7:-58450808 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATATGACGGATTGTTGTGAA+TGG 0.605776 7:-58454370 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTGGTTGGAATCTAAGAGGA+GGG 0.607226 7:-58451170 MsG0780039135.01.T01:CDS
AGTTGTTCCAGGAGATGTCA+AGG 0.609120 7:+58453602 None:intergenic
ATCTCATCCTCATCTCGACA+TGG 0.609656 7:-58451061 MsG0780039135.01.T01:CDS
GACTCGGACCTTCATATACA+AGG 0.611111 7:-58453736 MsG0780039135.01.T01:intron
GATTTGAATCCCATGAGTGA+TGG 0.611288 7:+58453793 None:intergenic
TACTTGGGATGCTACCAGAA+AGG 0.612115 7:+58450779 None:intergenic
GAAATCCTACCATCACTCAT+GGG 0.614081 7:-58453802 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGCTAAGGTCTAGAGTCACT+AGG 0.616269 7:+58450443 None:intergenic
TGAGAAGTGGAAGACCACTT+AGG 0.616483 7:+58453132 None:intergenic
TGATATGACTGCTAATATGA+CGG 0.617827 7:-58454384 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGTCATGTTGACAAAAGATG+AGG 0.622107 7:+58451521 None:intergenic
ATTTCAACCATGTCGAGATG+AGG 0.623386 7:+58451054 None:intergenic
TGCCACACTGAATACTTCAA+GGG 0.624094 7:+58449865 None:intergenic
ACTGGTTGGAATCTAAGAGG+AGG 0.629617 7:-58451171 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGTCCAGTAATCATTTAGAA+GGG 0.634470 7:-58450648 MsG0780039135.01.T01:CDS
ATGGAAGCAATCTACAAGAG+TGG 0.634928 7:-58452286 MsG0780039135.01.T01:CDS
AGTAAGTGCCAAAGTCCGAA+GGG 0.635023 7:+58451497 None:intergenic
ATTACCAGATGGCTTGGACA+AGG 0.635601 7:-58449702 MsG0780039135.01.T01:CDS
ACAATTACCTCCAATTGGAA+GGG 0.636855 7:+58451750 None:intergenic
ATGCCACCACAAAGCTAACA+CGG 0.637772 7:+58449642 None:intergenic
GCTCATGAGGAATTGAACCA+TGG 0.641214 7:+58450932 None:intergenic
TTTCCGTGTTAGCTTTGTGG+TGG 0.644362 7:-58449645 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTTCAATATTCCAATACTAG+GGG 0.651496 7:-58454299 MsG0780039135.01.T01:CDS
GGTGCAACACCTGAAAGGAA+AGG 0.652096 7:-58449827 MsG0780039135.01.T01:CDS
GTGGAAATGTATTACATGTG+AGG 0.655248 7:-58449480 MsG0780039135.01.T01:three_prime_UTR
ACACCAGCTACATTACCAGA+TGG 0.662565 7:-58449713 MsG0780039135.01.T01:CDS
GAGGTCAATCCACTTAGCTG+AGG 0.672732 7:+58449887 None:intergenic
CACACTGAATACTTCAAGGG+AGG 0.679540 7:+58449868 None:intergenic
GAGGGTAATCAATTTCTCTG+TGG 0.679643 7:-58449773 MsG0780039135.01.T01:CDS
TGCTAGATATATCAAAACTG+AGG 0.686622 7:-58453385 MsG0780039135.01.T01:intron
TCATGTTGACAAAAGATGAG+GGG 0.689555 7:+58451523 None:intergenic
CTCCCTTGAAGTATTCAGTG+TGG 0.704965 7:-58449867 MsG0780039135.01.T01:CDS
CTAAGGTCTAGAGTCACTAG+GGG 0.726522 7:+58450445 None:intergenic
AGTTCAAGCTGGTATAACGG+AGG 0.727477 7:+58450380 None:intergenic
GAATTGCTACTACTTCATCG+AGG 0.777352 7:-58449528 MsG0780039135.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACAAAAAAAAAAAAAAAGAT+TGG - Chr7:58450939-58450958 MsG0780039135.01.T01:CDS 10.0%
!! TAATATGTAAATGAAAATTA+TGG + Chr7:58449833-58449852 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTTAAAAACTAACATTAT+AGG + Chr7:58451907-58451926 None:intergenic 10.0%
!!! TATTACAATATCAATAATTT+TGG + Chr7:58451934-58451953 None:intergenic 10.0%
!!! TCTTTTTTTTTTTTTTTGTA+AGG + Chr7:58450938-58450957 None:intergenic 10.0%
!!! TTTCTTACAATAATTTTATT+GGG - Chr7:58453682-58453701 MsG0780039135.01.T01:intron 10.0%
!! AAAAGAATGTGTAATTTAAT+TGG + Chr7:58451850-58451869 None:intergenic 15.0%
!! AAATAGTGTTTAAGAAATAA+TGG - Chr7:58451419-58451438 MsG0780039135.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATCAAATTACTATATTTC+TGG - Chr7:58452000-58452019 MsG0780039135.01.T01:intron 15.0%
!! ATAAGTAATAATAATTTCAC+CGG - Chr7:58453237-58453256 MsG0780039135.01.T01:intron 15.0%
!! CAATAAAATTATTGTAAGAA+AGG + Chr7:58453683-58453702 None:intergenic 15.0%
!! CTAATATATCTAAATATCTT+AGG + Chr7:58453659-58453678 None:intergenic 15.0%
!! TAAAGAATAAAATTTGGAAA+TGG + Chr7:58452739-58452758 None:intergenic 15.0%
!! TATTGGTAAAGAATAAAATT+TGG + Chr7:58452745-58452764 None:intergenic 15.0%
!! TGATACTATATAAGTTAAAA+AGG + Chr7:58453206-58453225 None:intergenic 15.0%
!! TGTAAGATAATGAAATTAAT+TGG + Chr7:58449422-58449441 None:intergenic 15.0%
!! TTATCTCATAATAAGTTAAA+TGG - Chr7:58453894-58453913 MsG0780039135.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTAAAAATTATTGATTGTC+TGG + Chr7:58449996-58450015 None:intergenic 15.0%
!!! CTTTCTTACAATAATTTTAT+TGG - Chr7:58453681-58453700 MsG0780039135.01.T01:intron 15.0%
!!! TCAATAATTTTTAATTGCTT+CGG - Chr7:58450001-58450020 MsG0780039135.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTCTTACAATAATTTTATTG+GGG - Chr7:58453683-58453702 MsG0780039135.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTAACTTATATAGTATCAA+AGG - Chr7:58453207-58453226 MsG0780039135.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAAGAAATTAAAAACCCT+AGG + Chr7:58452281-58452300 None:intergenic 20.0%
!! AAAAGAAATTAAAAACCCTA+GGG + Chr7:58452280-58452299 None:intergenic 20.0%
!! AAGAAATAGGAAATTCAAAA+TGG + Chr7:58452564-58452583 None:intergenic 20.0%
!! AATAAAATTTGGAAATGGAA+TGG + Chr7:58452734-58452753 None:intergenic 20.0%
!! AATATATTAATTGAACGTGT+AGG - Chr7:58450303-58450322 MsG0780039135.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAGTTAAAAAGGTTACTT+GGG + Chr7:58453197-58453216 None:intergenic 20.0%
!! ATATATCTAAATATCTTAGG+AGG + Chr7:58453656-58453675 None:intergenic 20.0%
!! ATTAGAAAACAACACAAAAA+TGG - Chr7:58452825-58452844 MsG0780039135.01.T01:intron 20.0%
!! ATTCAATAATGAAGTTACTT+TGG - Chr7:58454543-58454562 MsG0780039135.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!! CAAATGTGTATAATAGATTT+GGG - Chr7:58453790-58453809 MsG0780039135.01.T01:CDS 20.0%
!! GTCATGAATTAAAACATATT+TGG + Chr7:58451480-58451499 None:intergenic 20.0%
!! TATAAGTTAAAAAGGTTACT+TGG + Chr7:58453198-58453217 None:intergenic 20.0%
!!! AAATATCTCTTTTTTTCTAG+TGG + Chr7:58451163-58451182 None:intergenic 20.0%
!!! AAGGGTTTTCTTTATTTAAA+CGG - Chr7:58449396-58449415 MsG0780039135.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! AATCACTTTATTGGTAATAT+TGG - Chr7:58452487-58452506 MsG0780039135.01.T01:intron 20.0%
!!! AATGAGTTTTTCAAAAGTAT+CGG - Chr7:58452132-58452151 MsG0780039135.01.T01:intron 20.0%
!!! AGTATTCTTATTTATATGTC+TGG - Chr7:58453864-58453883 MsG0780039135.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTGTGTACTATTTTTTATT+TGG + Chr7:58453275-58453294 None:intergenic 20.0%
!!! GTACTATTTTTTATTTGGTT+TGG + Chr7:58453270-58453289 None:intergenic 20.0%
!!! GTTTTTGTTTGAAAATCATA+TGG - Chr7:58450522-58450541 MsG0780039135.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTACAAGTTATTTTATTAG+TGG - Chr7:58454459-58454478 MsG0780039135.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTCAAACAATTTTTTAACT+GGG - Chr7:58453967-58453986 MsG0780039135.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTTTCTAATAACCAATTT+GGG + Chr7:58452816-58452835 None:intergenic 20.0%
!!! TTGTCAAACAATTTTTTAAC+TGG - Chr7:58453966-58453985 MsG0780039135.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGTTTTCTAATAACCAATT+TGG + Chr7:58452817-58452836 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTATCCGATTAAAACAAT+TGG - Chr7:58451581-58451600 MsG0780039135.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGAAAAACTCATTTTCT+AGG + Chr7:58452128-58452147 None:intergenic 20.0%
! AAAGTAAGATTCCTAATAGA+TGG + Chr7:58451710-58451729 None:intergenic 25.0%
! AACTTCAATATTCCAATACT+AGG - Chr7:58449657-58449676 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! AAGATGAAAATCTCCAAAAA+AGG + Chr7:58452875-58452894 None:intergenic 25.0%
! AAGTAAGATTCCTAATAGAT+GGG + Chr7:58451709-58451728 None:intergenic 25.0%
! AATTGTTTGAAGATAAGTCA+AGG + Chr7:58450610-58450629 None:intergenic 25.0%
! ACTTCAATATTCCAATACTA+GGG - Chr7:58449658-58449677 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! AGCAACAATGAAATATCAAA+TGG - Chr7:58453534-58453553 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAAAATTTCACCCAAACA+GGG + Chr7:58452336-58452355 None:intergenic 25.0%
! ATAAAGATGTACATGATTAG+AGG + Chr7:58450549-58450568 None:intergenic 25.0%
! ATTCCAAATTACTTAAACCA+CGG + Chr7:58452080-58452099 None:intergenic 25.0%
! CATTTACATATTATTGTGCA+GGG - Chr7:58449840-58449859 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! CTATCAGGAAATGAATTTAT+GGG - Chr7:58452406-58452425 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! CTTACTGATAATCACTTTAT+TGG - Chr7:58452478-58452497 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! CTTATATAGTATCAAAGGTT+TGG - Chr7:58453212-58453231 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! CTTCAAACAATTTGAACTTA+TGG - Chr7:58450618-58450637 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! GAAAATTGTGTGAAAGAAAT+AGG + Chr7:58452577-58452596 None:intergenic 25.0%
! GAAATACCAAATAACTTATC+TGG - Chr7:58453105-58453124 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! GCAAATGTGTATAATAGATT+TGG - Chr7:58453789-58453808 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! GTCAAAAAATTTAAGCAGAT+TGG - Chr7:58451619-58451638 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TATCAGGAAATGAATTTATG+GGG - Chr7:58452407-58452426 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TATCCAAAAACATGTTCAAT+GGG - Chr7:58453472-58453491 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TCATTTACATATTATTGTGC+AGG - Chr7:58449839-58449858 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
! TCTATCAGGAAATGAATTTA+TGG - Chr7:58452405-58452424 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TGAAGTTATTACCTTTCATA+AGG + Chr7:58453608-58453627 None:intergenic 25.0%
! TGAGAGAAAACAAGTTTAAA+GGG - Chr7:58451729-58451748 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TGTTCAATGGGAATATAAAT+CGG - Chr7:58453484-58453503 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TTAGATGGGAATATGATAAA+TGG - Chr7:58451653-58451672 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TTATCCAAAAACATGTTCAA+TGG - Chr7:58453471-58453490 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TTGAGAGAAAACAAGTTTAA+AGG - Chr7:58451728-58451747 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
! TTGATATTTCATTGTTGCTA+AGG + Chr7:58453533-58453552 None:intergenic 25.0%
! TTTCAATTGAATTACTACTC+TGG - Chr7:58451352-58451371 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
!! AACACTTTCCATTTTATAAC+CGG - Chr7:58450267-58450286 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTGATTTCATAGTAAGTG+TGG + Chr7:58450451-58450470 None:intergenic 25.0%
!! CTTGAGTATCTTAATTTTGA+AGG - Chr7:58452535-58452554 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!! TAACTTATTGCTACTTAGAT+TGG - Chr7:58450907-58450926 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
!! TAATTTGGAATACTTAGCAT+TGG - Chr7:58452089-58452108 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!!! AGTTGTTCTTAAAGGTATTT+AGG - Chr7:58451312-58451331 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGAGTTTTTCAAAAGTATC+GGG - Chr7:58452133-58452152 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!!! ATGGTTTTACTATATAGGAT+TGG - Chr7:58454400-58454419 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
!!! CGAACTTTTATTTTTCAGAT+TGG - Chr7:58452356-58452375 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!!! CGTAATCCAATTGTTTTAAT+CGG + Chr7:58451590-58451609 None:intergenic 25.0%
!!! CTTCAAAATTGTTCCTTTTT+TGG - Chr7:58452859-58452878 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!!! GCATTCTTTAAAAGTTTTGT+CGG - Chr7:58452161-58452180 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!!! TAAAATGCCTTTTGATAATG+AGG - Chr7:58453725-58453744 MsG0780039135.01.T01:intron 25.0%
!!! TATTTGGTTTGGAATTTTTC+CGG + Chr7:58453259-58453278 None:intergenic 25.0%
!!! TTAATTTGTTGTTGCTCAAA+TGG + Chr7:58453446-58453465 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTGACTCTATTCTGTAA+AGG - Chr7:58451055-58451074 MsG0780039135.01.T01:CDS 25.0%
AAATGATGACAACAAACCTA+GGG + Chr7:58450645-58450664 None:intergenic 30.0%
AAGTTTAAAGGGACAATTCT+TGG - Chr7:58451740-58451759 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
AATTGTACAAGAACTCATCA+AGG - Chr7:58449758-58449777 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
ACAACGGATAAATAGAAGAA+TGG + Chr7:58451229-58451248 None:intergenic 30.0%
AGGATGAAGAAGATAATAGT+TGG - Chr7:58454276-58454295 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
ATAGACTACCTTGTATATGA+AGG + Chr7:58450233-58450252 None:intergenic 30.0%
ATGAAAGGTAATAACTTCAC+AGG - Chr7:58453609-58453628 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
ATGTCAAAAAATGCAATCCA+TGG - Chr7:58453009-58453028 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
ATGTCCAGTAATCATTTAGA+AGG - Chr7:58453309-58453328 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
ATGTTTAGATGAACCAAGTT+GGG + Chr7:58452991-58453010 None:intergenic 30.0%
ATTTGATGAAAGCAGTTATG+AGG - Chr7:58454166-58454185 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
CACATTTGCGTTATTAAGTA+AGG + Chr7:58453778-58453797 None:intergenic 30.0%
CAGAGAATCAAAGATTTGTA+TGG - Chr7:58450741-58450760 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
CAGTACCCAATAAAATTCAA+AGG + Chr7:58451380-58451399 None:intergenic 30.0%
CCTCAAGAGTTTAAATTTAG+CGG - Chr7:58450422-58450441 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
CGCTAAATTTAAACTCTTGA+GGG + Chr7:58450424-58450443 None:intergenic 30.0%
CTTCAATATTCCAATACTAG+GGG - Chr7:58449659-58449678 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCACAAAACAAATTGTC+AGG - Chr7:58453381-58453400 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
GAACTTAAGGTTTGAATGAT+TGG + Chr7:58452599-58452618 None:intergenic 30.0%
GATAAAAATTTCACCCAAAC+AGG + Chr7:58452337-58452356 None:intergenic 30.0%
GGATGAAGAAGATAATAGTT+GGG - Chr7:58454277-58454296 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TAAAAATTTCACCCAAACAG+GGG + Chr7:58452335-58452354 None:intergenic 30.0%
TACTCTATGACTTCATTTCA+CGG - Chr7:58449965-58449984 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TCAAACCTTAAGTTCATCTA+CGG - Chr7:58452604-58452623 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
TCTTCTATTTATCCGTTGTA+GGG - Chr7:58451230-58451249 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TGAATATTCCAGAACTTGAT+AGG + Chr7:58449739-58449758 None:intergenic 30.0%
TGATATGACTGCTAATATGA+CGG - Chr7:58449574-58449593 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TGCTAGATATATCAAAACTG+AGG - Chr7:58450573-58450592 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TGGATATTCTTGCATTAGAT+GGG - Chr7:58451639-58451658 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
TGTCCAGTAATCATTTAGAA+GGG - Chr7:58453310-58453329 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
TTCTAAATGATTACTGGACA+TGG + Chr7:58453310-58453329 None:intergenic 30.0%
TTCTGTACATCAATCCTTAT+TGG - Chr7:58454369-58454388 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTCTATTTATCCGTTGT+AGG - Chr7:58451229-58451248 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TTGAACTTTCTCCTTATGAA+AGG - Chr7:58453594-58453613 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
TTGGATATTCTTGCATTAGA+TGG - Chr7:58451638-58451657 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
TTGTAACAATTACCTCCAAT+TGG + Chr7:58452216-58452235 None:intergenic 30.0%
TTTCCGTGGTTTAAGTAATT+TGG - Chr7:58452074-58452093 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
TTTGATGAAAGCAGTTATGA+GGG - Chr7:58454167-58454186 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
! AATTTTCTTCCATACCTAAG+TGG - Chr7:58450812-58450831 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
! ACAATTGGATTACGTTTTTC+AGG - Chr7:58451596-58451615 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
! ACACTCAACTTTGAAAACAT+GGG - Chr7:58452654-58452673 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
! AGCACTTGCAATTGAAATTT+TGG + Chr7:58452682-58452701 None:intergenic 30.0%
! ATTAGTATGTGTGTTTCTGT+TGG - Chr7:58449478-58449497 MsG0780039135.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! ATTCCCATTGAACATGTTTT+TGG + Chr7:58453478-58453497 None:intergenic 30.0%
! CAATTGGATTACGTTTTTCA+GGG - Chr7:58451597-58451616 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
! GGAATATTGAAGTTTGAGTT+TGG + Chr7:58449651-58449670 None:intergenic 30.0%
! GTCGATTTAGTTGTTCTTAA+AGG - Chr7:58451304-58451323 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
! TGACTTGAGTGATAATGATT+TGG - Chr7:58449883-58449902 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
! TGGCACCTTTGAATTTTATT+GGG - Chr7:58451372-58451391 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
! TTAAGTTGCAACAACTTGAA+TGG - Chr7:58450860-58450879 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
!! CAAGCATGGTTTTACTATAT+AGG - Chr7:58454395-58454414 MsG0780039135.01.T01:CDS 30.0%
!! GCAGAAGTGTTTATAAAAGA+AGG + Chr7:58453414-58453433 None:intergenic 30.0%
!!! TCATCGATTTTTTTTGCAAC+TGG + Chr7:58453753-58453772 None:intergenic 30.0%
!!! TGAGTTTTTCAAAAGTATCG+GGG - Chr7:58452134-58452153 MsG0780039135.01.T01:intron 30.0%
AACAATTACCTCCAATTGGA+AGG + Chr7:58452212-58452231 None:intergenic 35.0%
AATGATGACAACAAACCTAG+GGG + Chr7:58450644-58450663 None:intergenic 35.0%
AATGGATCGCTTGATATTAG+TGG - Chr7:58450878-58450897 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
ACAATTACCTCCAATTGGAA+GGG + Chr7:58452211-58452230 None:intergenic 35.0%
ACATTATGAATCACACCCTA+GGG - Chr7:58452262-58452281 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
ACTCTCTACTTGTACCAAAT+TGG + Chr7:58454012-58454031 None:intergenic 35.0%
ACTGGATCCTCATTATCAAA+AGG + Chr7:58453735-58453754 None:intergenic 35.0%
ATAAATGGTACCCTTCCAAT+TGG - Chr7:58452198-58452217 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
ATGAATTGTCCTTTCCTTTC+AGG + Chr7:58454143-58454162 None:intergenic 35.0%
CAAGTGAAGTAAAACTTGCA+AGG + Chr7:58452519-58452538 None:intergenic 35.0%
CAGAACTGTCTGAAAAACTA+TGG + Chr7:58450067-58450086 None:intergenic 35.0%
CATAGAGTACATATCAGCTA+AGG + Chr7:58449954-58449973 None:intergenic 35.0%
CATGGGATTCAAATCTTTGA+AGG - Chr7:58450173-58450192 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
CATGTTTAGATGAACCAAGT+TGG + Chr7:58452992-58453011 None:intergenic 35.0%
CCAAATAACTTATCTGGAGA+TGG - Chr7:58453111-58453130 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
CCACAAAAGTTAGACTGTAT+TGG + Chr7:58452762-58452781 None:intergenic 35.0%
CCATCTCCAGATAAGTTATT+TGG + Chr7:58453114-58453133 None:intergenic 35.0%
CCGCTAAATTTAAACTCTTG+AGG + Chr7:58450425-58450444 None:intergenic 35.0%
CTGTCTGAAAAACTATGGTT+CGG + Chr7:58450062-58450081 None:intergenic 35.0%
CTTTCTTTCAACATGTTGAG+TGG - Chr7:58454038-58454057 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGAACTTGTAAGCTGAA+TGG + Chr7:58450767-58450786 None:intergenic 35.0%
GAAAGTTCAAGCTGGTATAA+CGG + Chr7:58453584-58453603 None:intergenic 35.0%
GAAATGATGACAACAAACCT+AGG + Chr7:58450646-58450665 None:intergenic 35.0%
GGACACATAGTTAGTTCAAA+GGG - Chr7:58449378-58449397 MsG0780039135.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GTCATGTTGACAAAAGATGA+GGG + Chr7:58452439-58452458 None:intergenic 35.0%
GTGGAAATGTATTACATGTG+AGG - Chr7:58454478-58454497 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
TACATTATGAATCACACCCT+AGG - Chr7:58452261-58452280 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAGTTGAGTGTGAATCA+AGG + Chr7:58452648-58452667 None:intergenic 35.0%
TCATGTTGACAAAAGATGAG+GGG + Chr7:58452438-58452457 None:intergenic 35.0%
TCATTTGACACAGTTGTTGT+TGG - Chr7:58453146-58453165 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
TGACCCTTCTAAATGATTAC+TGG + Chr7:58453316-58453335 None:intergenic 35.0%
TGGACACATAGTTAGTTCAA+AGG - Chr7:58449377-58449396 MsG0780039135.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TGTACATCAATCCTTATTGG+AGG - Chr7:58454372-58454391 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
TGTCATGTTGACAAAAGATG+AGG + Chr7:58452440-58452459 None:intergenic 35.0%
TTAAACTCTTGAGGGAAGAA+AGG + Chr7:58450416-58450435 None:intergenic 35.0%
TTGGAAGAGTTAGATCTATC+AGG - Chr7:58452391-58452410 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
TTTAAAGGGACAATTCTTGG+TGG - Chr7:58451743-58451762 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
TTTGGAAATTCTGTCTTGTG+TGG - Chr7:58449901-58449920 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
! ATTTGGAAATGGAATGGACT+TGG + Chr7:58452728-58452747 None:intergenic 35.0%
! CACACTCAACTTTGAAAACA+TGG - Chr7:58452653-58452672 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
! CACTATTTCTTAAACACTCC+AGG + Chr7:58451407-58451426 None:intergenic 35.0%
! CATTTGACACAGTTGTTGTT+GGG - Chr7:58453147-58453166 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
! CCAATACAGTCTAACTTTTG+TGG - Chr7:58452759-58452778 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
! CTAACTTTTGTGGATTTGAC+TGG - Chr7:58452769-58452788 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
! CTGGCACCTTTGAATTTTAT+TGG - Chr7:58451371-58451390 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
! CTGTCTGATAATGAATTGTC+TGG - Chr7:58453081-58453100 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
! TATATTGTGTTACTGCACAC+CGG + Chr7:58450289-58450308 None:intergenic 35.0%
! TGTTGCTCTGAATTTCAGTT+TGG - Chr7:58449547-58449566 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
!! AGATTGGTCTAAGCTTAAGT+TGG - Chr7:58452372-58452391 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
!! ATATGACGGATTGTTGTGAA+TGG - Chr7:58449588-58449607 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
!! CATAGTTTTTCAGACAGTTC+TGG - Chr7:58450065-58450084 MsG0780039135.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTTTTCGTTTTAGTGGAA+GGG - Chr7:58449498-58449517 MsG0780039135.01.T01:exon 35.0%
!! TTAAAAGTTTTGTCGGTGTC+AGG - Chr7:58452168-58452187 MsG0780039135.01.T01:intron 35.0%
!! TTGGTTTTCGTTTTAGTGGA+AGG - Chr7:58449497-58449516 MsG0780039135.01.T01:exon 35.0%
!!! TCTGTTGGTTTTCGTTTTAG+TGG - Chr7:58449493-58449512 MsG0780039135.01.T01:exon 35.0%
AAACCCTTAAAGAGCTCAAG+TGG + Chr7:58453056-58453075 None:intergenic 40.0%
AAGCCACTTGAGCTCTTTAA+GGG - Chr7:58453050-58453069 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
AAGTCAAGAGATGTGAGAAG+TGG + Chr7:58450842-58450861 None:intergenic 40.0%
AATTTGAACTTATGGCCCCT+AGG - Chr7:58450626-58450645 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAATTGGAGAATGTAGC+AGG + Chr7:58453999-58454018 None:intergenic 40.0%
ACCTGCTACATTCTCCAATT+TGG - Chr7:58453995-58454014 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
ATCGAAGTTGCTACATCTTG+AGG - Chr7:58450098-58450117 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAAGCAATCTACAAGAG+TGG - Chr7:58451672-58451691 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
ATTTCAACCATGTCGAGATG+AGG + Chr7:58452907-58452926 None:intergenic 40.0%
CAATATTCCAATACTAGGGG+TGG - Chr7:58449662-58449681 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
CAATCTACAAGAGTGGTTAC+CGG - Chr7:58451679-58451698 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
CACCATTCTTACCTATGTCA+AGG + Chr7:58450125-58450144 None:intergenic 40.0%
CAGCTCAATATTTCCCAACT+TGG - Chr7:58452975-58452994 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
CATAAGGAGAAAGTTCAAGC+TGG + Chr7:58453592-58453611 None:intergenic 40.0%
CATTGCCGTAGATGAACTTA+AGG + Chr7:58452612-58452631 None:intergenic 40.0%
CTTAAGTTCATCTACGGCAA+TGG - Chr7:58452610-58452629 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
GAAATCCTACCATCACTCAT+GGG - Chr7:58450156-58450175 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
GAAATTCTGTCTTGTGTGGA+TGG - Chr7:58449905-58449924 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGCTACTACTTCATCG+AGG - Chr7:58454430-58454449 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
GAGGGTAATCAATTTCTCTG+TGG - Chr7:58454185-58454204 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
GATATTGCATCTGCTCTTAG+TGG - Chr7:58450390-58450409 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
GATTTGAATCCCATGAGTGA+TGG + Chr7:58450168-58450187 None:intergenic 40.0%
GGAAACCTACACACAAAAAG+AGG + Chr7:58452059-58452078 None:intergenic 40.0%
GGATTGATGTACAGAACAGT+TGG + Chr7:58454365-58454384 None:intergenic 40.0%
GGGGAAATACCTAGATGTTT+GGG - Chr7:58453702-58453721 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
GGGTGGATCACTTAACTATT+CGG - Chr7:58449679-58449698 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
GTCCTTGACATAGGTAAGAA+TGG - Chr7:58450120-58450139 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
GTGGCACACAACAATTTATC+TGG - Chr7:58454110-58454129 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
TAAAGTCGACAACCCTACAA+CGG + Chr7:58451245-58451264 None:intergenic 40.0%
TAAGCCACTTGAGCTCTTTA+AGG - Chr7:58453049-58453068 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
TATGACTTCATTTCACGGTG+AGG - Chr7:58449970-58449989 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGATGTAGCAACTTCGA+TGG + Chr7:58450099-58450118 None:intergenic 40.0%
TCAAGTTTCCTAGCTCAGAT+GGG + Chr7:58453926-58453945 None:intergenic 40.0%
TCATCAATATGCCCCTGTTT+GGG - Chr7:58452321-58452340 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATCCTACCATCACTCA+TGG - Chr7:58450155-58450174 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TGACGATTCTCGATTTAAGC+TGG - Chr7:58451272-58451291 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TGAGCTTAGTTCAGCTGATA+GGG - Chr7:58451096-58451115 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TGCCACACTGAATACTTCAA+GGG + Chr7:58454096-58454115 None:intergenic 40.0%
TGGGGAAATACCTAGATGTT+TGG - Chr7:58453701-58453720 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
TTCATCAATATGCCCCTGTT+TGG - Chr7:58452320-58452339 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TTCCTAATAGATGGGAAAGC+CGG + Chr7:58451701-58451720 None:intergenic 40.0%
TTGAAGGAACTCCATTTGAG+TGG - Chr7:58450189-58450208 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCAACATGACATCCCTT+CGG - Chr7:58452446-58452465 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
TTGTGCAGGGTTGAACAATT+TGG - Chr7:58449853-58449872 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
! ACGGATTGTTGTGAATGGTA+TGG - Chr7:58449593-58449612 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
! ACTGCACACCGGTTATAAAA+TGG + Chr7:58450278-58450297 None:intergenic 40.0%
! AGTGTCATTGAAGTTGTTCC+AGG + Chr7:58450370-58450389 None:intergenic 40.0%
! ATGTTCAAGTTCTGCAACCT+CGG + Chr7:58453346-58453365 None:intergenic 40.0%
! CTTAGGAGGCATAATTGCTT+TGG + Chr7:58453642-58453661 None:intergenic 40.0%
! CTTTTGTGGATTTGACTGGT+TGG - Chr7:58452773-58452792 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
! GGCATTTTACCCAAACATCT+AGG + Chr7:58453714-58453733 None:intergenic 40.0%
! GTGTCAGGTTGTAGGATAAA+TGG - Chr7:58452183-58452202 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
! TCATGCCTCTTTTTGTGTGT+AGG - Chr7:58452051-58452070 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
! TTGACTGGTTGGAATCTAAG+AGG - Chr7:58452784-58452803 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
! TTTTTGTGTGTAGGTTTCCG+TGG - Chr7:58452060-58452079 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
!! CTTGAGCTCTTTAAGGGTTT+TGG - Chr7:58453056-58453075 MsG0780039135.01.T01:intron 40.0%
!! TTTATTGGGTACTGAAAGCC+TGG - Chr7:58451386-58451405 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGTTTTCCGTGTTAGCTTTG+TGG - Chr7:58454310-58454329 MsG0780039135.01.T01:CDS 40.0%
AAAGGGACAATTCTTGGTGG+AGG - Chr7:58451746-58451765 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
AACCATGCTTGCCTCCAATA+AGG + Chr7:58454386-58454405 None:intergenic 45.0%
AAGTGATCCACCCCTAGTAT+TGG + Chr7:58449672-58449691 None:intergenic 45.0%
AATGGTACCCTTCCAATTGG+AGG - Chr7:58452201-58452220 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
ACACCAGCTACATTACCAGA+TGG - Chr7:58454245-58454264 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
ACTCTCGACCTATCAAGTTC+TGG - Chr7:58449728-58449747 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
ACTGGTTGGAATCTAAGAGG+AGG - Chr7:58452787-58452806 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
AGCTACATTACCAGATGGCT+TGG - Chr7:58454250-58454269 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
AGTAAGTGCCAAAGTCCGAA+GGG + Chr7:58452464-58452483 None:intergenic 45.0%
AGTGGAAGACCACTTAGGTA+TGG + Chr7:58450824-58450843 None:intergenic 45.0%
AGTTCAAGCTGGTATAACGG+AGG + Chr7:58453581-58453600 None:intergenic 45.0%
AGTTGTTCCAGGAGATGTCA+AGG + Chr7:58450359-58450378 None:intergenic 45.0%
ATCCTTATTGGAGGCAAGCA+TGG - Chr7:58454381-58454400 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
ATCTCATCCTCATCTCGACA+TGG - Chr7:58452897-58452916 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
ATGCCACCACAAAGCTAACA+CGG + Chr7:58454319-58454338 None:intergenic 45.0%
ATGTCGAGATGAGGATGAGA+TGG + Chr7:58452898-58452917 None:intergenic 45.0%
CAAATTCCTCCTCAGCTAAG+TGG - Chr7:58454062-58454081 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
CACACTGAATACTTCAAGGG+AGG + Chr7:58454093-58454112 None:intergenic 45.0%
CACTTAGCTGAGGAGGAATT+TGG + Chr7:58454064-58454083 None:intergenic 45.0%
CATCTTGAGGTCCTTGACAT+AGG - Chr7:58450111-58450130 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
CCAAAAAGTTGCAATCCAGG+CGG - Chr7:58454218-58454237 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
CCAATCCAATGCCACTCAAA+TGG + Chr7:58450203-58450222 None:intergenic 45.0%
CTGCCAAAAAGTTGCAATCC+AGG - Chr7:58454215-58454234 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
CTGGTTGGAATCTAAGAGGA+GGG - Chr7:58452788-58452807 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
GAACTCCATTTGAGTGGCAT+TGG - Chr7:58450195-58450214 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
GACTCGGACCTTCATATACA+AGG - Chr7:58450222-58450241 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
GCTCATGAGGAATTGAACCA+TGG + Chr7:58453029-58453048 None:intergenic 45.0%
GGCATACACATCAATACTGC+TGG - Chr7:58454334-58454353 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
GTCAAGTTTCCTAGCTCAGA+TGG + Chr7:58453927-58453946 None:intergenic 45.0%
GTGAGCTTAGTTCAGCTGAT+AGG - Chr7:58451095-58451114 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
GTGCCACACTGAATACTTCA+AGG + Chr7:58454097-58454116 None:intergenic 45.0%
GTTGAATGCAACACCACAAC+AGG - Chr7:58449617-58449636 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
TAAGAGGAGGGTTCCCAAAT+TGG - Chr7:58452800-58452819 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
TACTTGGGATGCTACCAGAA+AGG + Chr7:58453182-58453201 None:intergenic 45.0%
TATCTGGTGCAACACCTGAA+AGG - Chr7:58454126-58454145 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
TGAATCCCATGAGTGATGGT+AGG + Chr7:58450164-58450183 None:intergenic 45.0%
TGAGAAGTGGAAGACCACTT+AGG + Chr7:58450829-58450848 None:intergenic 45.0%
TTGAGATCCTTGACATCTCC+TGG - Chr7:58450349-58450368 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
TTGGGTGGAAATAGCCTTTC+TGG - Chr7:58453165-58453184 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
! AAGCCATCTGGTAATGTAGC+TGG + Chr7:58454251-58454270 None:intergenic 45.0%
! ATTACCAGATGGCTTGGACA+AGG - Chr7:58454256-58454275 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
! CCATTTGAGTGGCATTGGAT+TGG - Chr7:58450200-58450219 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
! CTAAGGTCTAGAGTCACTAG+GGG + Chr7:58453516-58453535 None:intergenic 45.0%
! CTCCCTTGAAGTATTCAGTG+TGG - Chr7:58454091-58454110 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
! GCTAAGGTCTAGAGTCACTA+GGG + Chr7:58453517-58453536 None:intergenic 45.0%
! TGCTAAGGTCTAGAGTCACT+AGG + Chr7:58453518-58453537 None:intergenic 45.0%
! TTGACACAGTTGTTGTTGGG+TGG - Chr7:58453150-58453169 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGGTGACTCTTCCTGTTG+TGG + Chr7:58449633-58449652 None:intergenic 45.0%
!! GGATTGCAACTTTTTGGCAG+TGG + Chr7:58454215-58454234 None:intergenic 45.0%
!! TACCGGCTTTCCCATCTATT+AGG - Chr7:58451696-58451715 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
!! TCGTTTTAGTGGAAGGGTGT+TGG - Chr7:58449504-58449523 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGCAACTTTTTGGCAGTGG+AGG + Chr7:58454212-58454231 None:intergenic 45.0%
!! TTTCCGTGTTAGCTTTGTGG+TGG - Chr7:58454313-58454332 MsG0780039135.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTTTGTCGGTGTCAGGTTGT+AGG - Chr7:58452175-58452194 MsG0780039135.01.T01:intron 45.0%
!! TTATCATAAATTAAAATAAT+CGG + Chr7:58451536-58451555 None:intergenic 5.0%
AGAAGGGTCAATTCCATCCG+AGG - Chr7:58453326-58453345 MsG0780039135.01.T01:intron 50.0%
CAGTAAGTGCCAAAGTCCGA+AGG + Chr7:58452465-58452484 None:intergenic 50.0%
CATGACATCCCTTCGGACTT+TGG - Chr7:58452453-58452472 MsG0780039135.01.T01:intron 50.0%
CTCAAGTGGCTTAGCTCATG+AGG + Chr7:58453042-58453061 None:intergenic 50.0%
GAGGTCAATCCACTTAGCTG+AGG + Chr7:58454074-58454093 None:intergenic 50.0%
GGTGCAACACCTGAAAGGAA+AGG - Chr7:58454131-58454150 MsG0780039135.01.T01:intron 50.0%
GTCAATCCACTTAGCTGAGG+AGG + Chr7:58454071-58454090 None:intergenic 50.0%
TCAAGTTCTGCAACCTCGGA+TGG + Chr7:58453342-58453361 None:intergenic 50.0%
TCATCCTTGTCCAAGCCATC+TGG + Chr7:58454263-58454282 None:intergenic 50.0%
! CCGCCTGGATTGCAACTTTT+TGG + Chr7:58454221-58454240 None:intergenic 50.0%
! GAGTGGCATTGGATTGGACT+CGG - Chr7:58450206-58450225 MsG0780039135.01.T01:CDS 50.0%
GGTAGCATCCCATCTGAGCT+AGG - Chr7:58453915-58453934 MsG0780039135.01.T01:intron 55.0%
GTAGCTGGTGTTTGTCCGCC+TGG + Chr7:58454236-58454255 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 58449370 58454610 58449370 ID=MsG0780039135.01;Name=MsG0780039135.01
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Chr7 exon 58449370 58451606 58449370 ID=MsG0780039135.01.T01:exon:6739;Parent=MsG0780039135.01.T01
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Chr7 exon 58453081 58453236 58453081 ID=MsG0780039135.01.T01:exon:6736;Parent=MsG0780039135.01.T01
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Chr7 exon 58453994 58454119 58453994 ID=MsG0780039135.01.T01:exon:6732;Parent=MsG0780039135.01.T01
Chr7 exon 58454201 58454610 58454201 ID=MsG0780039135.01.T01:exon:6731;Parent=MsG0780039135.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 58454517 58454610 58454517 ID=MsG0780039135.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780039135.01.T01
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Protein sequence

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