AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039131.01

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MsG0780039131.01.T01 AT2G24130 24.549 554 334 18 221 759 86 570 9.19e-13 73.2
MsG0780039131.01.T01 AT2G24130 28.545 536 308 14 487 982 77 577 4.37e-33 139
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MsG0780039131.01.T01 AT1G71390 25.132 756 414 33 61 757 46 708 1.20e-15 82.4
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MsG0780039131.01.T01 AT5G06940 25.937 347 238 5 634 979 73 401 4.22e-19 94.0
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MsG0780039131.01.T01 AT3G20820 25.962 208 121 4 755 961 90 265 6.48e-14 75.1
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MsG0780039131.01.T01 AT1G33600 27.778 288 194 5 695 982 81 354 2.97e-17 86.7
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MsG0780039131.01.T01 AT1G56145 25.260 289 204 3 686 974 89 365 9.64e-14 76.6
MsG0780039131.01.T01 AT1G53440 26.236 263 178 5 667 929 114 360 1.01e-13 76.6
MsG0780039131.01.T01 AT1G53440 27.211 294 192 6 703 993 100 374 6.38e-11 67.4
MsG0780039131.01.T01 AT5G06870 28.620 297 149 11 717 989 72 329 1.16e-13 73.9
MsG0780039131.01.T01 AT1G31420 39.823 113 67 1 878 990 105 216 1.19e-13 75.9
MsG0780039131.01.T01 AT1G31420 39.823 113 67 1 878 990 105 216 1.19e-13 75.9
MsG0780039131.01.T01 AT1G31420 39.823 113 67 1 878 990 105 216 1.23e-13 75.5
MsG0780039131.01.T01 AT2G45340 27.347 245 118 4 738 982 65 249 1.43e-13 75.5
MsG0780039131.01.T01 AT2G45340 32.857 140 88 3 675 814 102 235 7.89e-12 70.1
MsG0780039131.01.T01 AT1G49750 26.087 253 147 6 701 953 209 421 1.56e-13 75.1
MsG0780039131.01.T01 AT1G49750 23.913 230 138 5 735 961 211 406 1.34e-11 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT1G49750 25.463 216 146 4 766 979 198 400 7.85e-11 66.2
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 34.247 146 87 1 693 829 46 191 1.67e-13 75.5
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 35.398 113 68 2 878 990 112 219 1.51e-11 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 33.333 123 72 3 667 787 83 197 3.15e-11 67.8
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 34.247 146 87 1 693 829 46 191 1.69e-13 75.5
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 35.398 113 68 2 878 990 112 219 1.42e-11 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 33.333 123 72 3 667 787 83 197 3.15e-11 68.2
MsG0780039131.01.T01 AT2G15880 25.110 227 154 3 738 961 103 316 1.88e-13 75.5
MsG0780039131.01.T01 AT2G15880 23.922 255 156 4 703 957 120 336 8.76e-13 73.2
MsG0780039131.01.T01 AT3G17640 28.352 261 164 7 703 962 78 316 2.71e-13 73.6
MsG0780039131.01.T01 AT1G56145 26.103 272 189 3 703 974 3 262 3.82e-13 74.3
MsG0780039131.01.T01 AT5G58300 41.818 110 57 3 876 985 141 243 5.39e-13 73.6
MsG0780039131.01.T01 AT5G58300 41.818 110 57 3 876 985 141 243 5.39e-13 73.6
MsG0780039131.01.T01 AT5G58300 41.818 110 57 3 876 985 141 243 5.39e-13 73.6
MsG0780039131.01.T01 AT4G06744 28.856 201 126 5 766 961 117 305 6.29e-13 72.4
MsG0780039131.01.T01 AT1G60800 35.211 142 82 4 870 1011 97 228 6.31e-13 73.6
MsG0780039131.01.T01 AT1G78980 29.557 203 107 4 743 945 68 234 6.81e-13 73.6
MsG0780039131.01.T01 AT1G78980 28.342 187 98 3 793 979 70 220 1.06e-12 72.8
MsG0780039131.01.T01 AT4G33970 25.714 245 166 3 738 979 129 360 7.68e-13 73.2
MsG0780039131.01.T01 AT1G60800 35.211 142 82 4 870 1011 30 161 8.01e-13 72.8
MsG0780039131.01.T01 AT4G28380 26.147 218 146 3 742 956 113 318 8.67e-13 72.0
MsG0780039131.01.T01 AT5G48380 35.965 114 71 2 873 985 102 214 1.31e-12 72.4
MsG0780039131.01.T01 AT5G16590 30.201 149 95 3 693 840 65 205 1.49e-12 72.4
MsG0780039131.01.T01 AT5G37450 32.086 187 86 7 750 930 1 152 1.52e-12 72.4
MsG0780039131.01.T01 AT2G23950 43.478 92 48 1 693 784 100 187 1.54e-12 72.0
MsG0780039131.01.T01 AT2G23950 33.913 115 71 2 876 990 103 212 1.75e-11 68.6
MsG0780039131.01.T01 AT3G59510 25.407 307 206 7 679 982 83 369 1.63e-12 71.2
MsG0780039131.01.T01 AT2G23950 43.478 92 48 1 693 784 100 187 1.76e-12 72.0
MsG0780039131.01.T01 AT2G23950 33.913 115 71 2 876 990 103 212 2.59e-11 68.2
MsG0780039131.01.T01 AT5G62710 34.848 132 85 1 878 1009 99 229 1.91e-12 72.0
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MsG0780039131.01.T01 AT5G62710 34.848 132 85 1 878 1009 65 195 2.44e-12 71.2
MsG0780039131.01.T01 AT5G65830 31.098 164 105 3 826 985 63 222 3.15e-12 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT4G30520 43.478 92 48 1 693 784 103 190 3.24e-12 71.2
MsG0780039131.01.T01 AT4G30520 35.652 115 69 2 876 990 106 215 1.66e-11 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT5G21090 36.207 116 73 1 870 985 93 207 3.49e-12 67.4
MsG0780039131.01.T01 AT5G21090 28.859 149 100 2 657 805 62 204 9.29e-11 63.5
MsG0780039131.01.T01 AT5G45770 27.155 232 146 5 613 835 68 285 4.22e-12 70.1
MsG0780039131.01.T01 AT5G45770 31.333 150 93 3 811 960 167 306 9.50e-12 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT5G16000 44.828 87 44 1 698 784 112 194 4.92e-12 70.5
MsG0780039131.01.T01 AT5G16000 37.168 113 66 2 878 990 112 219 3.51e-11 67.8
MsG0780039131.01.T01 AT3G03770 31.169 231 144 6 705 935 119 334 6.88e-12 70.5
MsG0780039131.01.T01 AT3G03770 31.169 231 144 6 705 935 119 334 6.88e-12 70.5
MsG0780039131.01.T01 AT3G03770 31.169 231 144 6 705 935 119 334 6.88e-12 70.5
MsG0780039131.01.T01 AT1G49490 29.167 216 143 3 742 957 130 335 7.79e-12 70.1
MsG0780039131.01.T01 AT2G15300 28.182 220 117 5 696 914 81 260 8.36e-12 70.1
MsG0780039131.01.T01 AT1G49490 29.167 216 143 3 742 957 135 340 9.03e-12 70.1
MsG0780039131.01.T01 AT3G25560 33.333 147 88 2 693 829 46 192 1.14e-11 69.3
MsG0780039131.01.T01 AT5G49780 24.895 237 139 3 703 933 77 280 1.31e-11 69.7
MsG0780039131.01.T01 AT5G49780 24.895 237 139 3 703 933 77 280 1.42e-11 69.3
MsG0780039131.01.T01 AT3G19020 23.922 255 156 4 703 957 132 348 2.17e-11 68.9
MsG0780039131.01.T01 AT5G67200 37.190 121 71 3 870 989 119 235 2.31e-11 68.6
MsG0780039131.01.T01 AT5G20690 34.559 136 82 3 696 829 76 206 2.76e-11 68.2
MsG0780039131.01.T01 AT2G16250 33.333 147 89 4 693 837 250 389 2.89e-11 68.2
MsG0780039131.01.T01 AT2G16250 33.333 147 89 4 693 837 250 389 3.02e-11 68.2
MsG0780039131.01.T01 AT5G53320 35.593 118 67 3 866 981 109 219 3.09e-11 67.8
MsG0780039131.01.T01 AT3G19020 23.922 255 156 4 703 957 132 348 3.30e-11 68.2
MsG0780039131.01.T01 AT4G33430 32.919 161 97 4 630 790 38 187 4.22e-11 67.4
MsG0780039131.01.T01 AT2G01820 29.435 248 148 9 693 933 67 294 4.77e-11 67.8
MsG0780039131.01.T01 AT2G26730 33.333 135 65 3 876 989 96 226 5.19e-11 67.4
MsG0780039131.01.T01 AT5G05160 41.593 113 53 4 878 985 129 233 6.87e-11 67.0
MsG0780039131.01.T01 AT1G54470 29.779 272 136 11 54 319 146 368 7.74e-11 66.2
MsG0780039131.01.T01 AT5G63710 32.231 121 55 2 870 990 80 173 8.93e-11 66.2
MsG0780039131.01.T01 AT5G63710 32.231 121 55 2 870 990 80 173 8.93e-11 66.2
MsG0780039131.01.T01 AT2G42290 27.461 193 109 1 728 920 52 213 9.10e-11 66.6
MsG0780039131.01.T01 AT5G63710 32.231 121 55 2 870 990 116 209 9.55e-11 66.2

Find 207 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 552 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGCAATTGCAAATGAAATT+TGG 0.097977 7:+58415814 None:intergenic
TTGGATGGAAATAGCCTTTC+TGG 0.157444 7:-58415330 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATAAATTGTCCCTTCCTTTC+AGG 0.174768 7:+58414619 None:intergenic
TGAGATTTGGAAGACGATTT+AGG 0.185878 7:+58418880 None:intergenic
TCCATCTACATTCTCCAATT+TGG 0.192778 7:-58414764 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTATGCAGGGTTAAACTATT+TGG 0.205245 7:-58421300 MsG0780039131.01.T01:intron
TTAGATTGCAATATGATAAA+TGG 0.211748 7:-58418610 MsG0780039131.01.T01:CDS
CATGACATCGCTTCGGAAAT+TGG 0.211805 7:-58416041 MsG0780039131.01.T01:CDS
GAAAAGTGTGTGAGTGAAAT+AGG 0.214766 7:+58415920 None:intergenic
ATGAAATCCTGCCTTCATTA+AGG 0.216079 7:-58420958 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGAGATATAAAGAGTTTAA+AGG 0.226822 7:-58418487 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATCACTTTGTTGGAAATAT+TGG 0.242983 7:-58416007 MsG0780039131.01.T01:CDS
CAGAGTTGGCAGAACTTAAA+AGG 0.244331 7:-58415152 MsG0780039131.01.T01:CDS
TCAAGAACATTGCAACTTCT+TGG 0.255931 7:+58414541 None:intergenic
CTCAAGACCTTATATTTAAG+AGG 0.265941 7:-58419581 MsG0780039131.01.T01:CDS
AAAAGAAGATATGTATATTA+TGG 0.270053 7:-58414976 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTATCTCACAATAAACTAAA+TGG 0.276455 7:-58414865 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTATGAATAAACAATCCTTT+TGG 0.278595 7:-58422067 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATATCAGACAATCATGGATT+TGG 0.280162 7:-58418975 MsG0780039131.01.T01:intron
TCAAACCTTAAGTTCATCTA+TGG 0.295663 7:-58415890 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTCTGACCCAATCAATCTTA+TGG 0.298292 7:-58421496 MsG0780039131.01.T01:CDS
GTTGCACACAACAATTTATC+TGG 0.303504 7:-58414649 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTATTTGGAAGTTCTTGATT+TGG 0.303873 7:-58421285 MsG0780039131.01.T01:CDS
ACTCTCTACCTGTACCAAAT+TGG 0.305302 7:+58414750 None:intergenic
AACCCACTTAAAATATTTAG+AGG 0.307926 7:-58415445 MsG0780039131.01.T01:CDS
CCATCCATGTTTAAACCATT+TGG 0.308064 7:+58414499 None:intergenic
GGATGCTAGATAAGTTAAAA+AGG 0.310681 7:+58415292 None:intergenic
TATTGCTATGAATTCCCATT+TGG 0.310798 7:-58421648 MsG0780039131.01.T01:CDS
TATATCAAAGCTAAGGTCTT+TGG 0.311202 7:-58419675 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATGTTCTTCTTTATATGTC+TGG 0.313686 7:-58414895 MsG0780039131.01.T01:CDS
AAAGTAAGATTCCTAATAGA+TGG 0.315184 7:+58418556 None:intergenic
AGCAATTGCAAATGAAATTT+GGG 0.318188 7:+58415815 None:intergenic
TTCATCAAAGTTGCTGCATC+TGG 0.318998 7:-58421014 MsG0780039131.01.T01:CDS
AGATCCTTCAAAATGAATAT+TGG 0.324479 7:+58415182 None:intergenic
CTTATCTAGCATCCAATGTT+TGG 0.325489 7:-58415283 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGGAAACTTGACAAGAATTC+AGG 0.336268 7:-58414824 MsG0780039131.01.T01:CDS
GAGATTTGGAAGACGATTTA+GGG 0.337166 7:+58418881 None:intergenic
CTAAAGTCTCTATCGTTAAC+TGG 0.337698 7:-58421203 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTAATTATAATCACTTTGT+TGG 0.338867 7:-58416016 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATTCATCCCTCTTAAATATA+AGG 0.342014 7:+58419574 None:intergenic
TATTTGGAAGTTCTTGATTT+GGG 0.342573 7:-58421284 MsG0780039131.01.T01:CDS
TCAAACTTGTACCCACCTAT+AGG 0.343523 7:-58421530 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGAGATATAAAGAGTTTAAA+GGG 0.343906 7:-58418486 MsG0780039131.01.T01:CDS
GGTGGGTACAAGTTTGAGTT+TGG 0.344123 7:+58421536 None:intergenic
CTCTATCGTTAACTGGAAAC+TGG 0.349003 7:-58421196 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATGCAGCAATGTTGGGTAAC+TGG 0.351393 7:-58416301 MsG0780039131.01.T01:CDS
CCAATACAATTTGACTTATG+TGG 0.354542 7:-58415735 MsG0780039131.01.T01:CDS
GTCAACAAATTTAAGCAGAT+TGG 0.357551 7:-58418644 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGCGGGCTTTCCCATCTATT+AGG 0.360509 7:-58418567 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTTCCCAGTGAAATCATTGT+AGG 0.364593 7:+58414789 None:intergenic
CAATGAATGAACTTGTAAAC+TGG 0.370419 7:+58418938 None:intergenic
CATTACCATAGATGAACTTA+AGG 0.376066 7:+58415885 None:intergenic
AATGTGGACTATATTTCATT+TGG 0.377612 7:+58415223 None:intergenic
TAATCTTGAATACTTAGCTT+TGG 0.382008 7:-58416395 MsG0780039131.01.T01:CDS
CAAACTTGTACCCACCTATA+GGG 0.384825 7:-58421529 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTAAGTTCATCTATGGTAA+TGG 0.384932 7:-58415884 MsG0780039131.01.T01:CDS
CAACGTACCATAAGATTGAT+TGG 0.385693 7:+58421489 None:intergenic
GATATAACGTGATTCCAAAA+AGG 0.387575 7:-58418531 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGGATATTTCAGCATTTGAT+AGG 0.388409 7:+58421415 None:intergenic
CTTTCTTTCAACATGTTAAG+AGG 0.388434 7:-58414721 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTAAAATAATTACCTCCAAT+TGG 0.389700 7:+58416271 None:intergenic
CCATCTCCAGAAAAGTTATA+TGG 0.392176 7:+58415384 None:intergenic
TTAAGTTACAACAACTTGAA+TGG 0.394894 7:-58418846 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATTGCTATGAATTCCCATTT+GGG 0.395106 7:-58421647 MsG0780039131.01.T01:CDS
GACATTGCATCTGCTCTTAG+TGG 0.395282 7:-58420717 MsG0780039131.01.T01:CDS
TACTTCAAGTGATGTGTTGT+GGG 0.398688 7:-58421700 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATGAAATATAGTCCACATT+TGG 0.402770 7:-58415220 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTTCTGAAAATAATTTGTC+AGG 0.405422 7:-58415114 MsG0780039131.01.T01:intron
AAGTCAAGAGATCTGAGATT+TGG 0.406414 7:+58418867 None:intergenic
TTAAGTTCATCTATGGTAAT+GGG 0.406927 7:-58415883 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTCATGTTTCGTAAGAGAA+TGG 0.407873 7:+58421763 None:intergenic
ACCAAATTGGAGAATGTAGA+TGG 0.409664 7:+58414763 None:intergenic
TTCTTTGAAGTACGTGTTGT+TGG 0.409950 7:-58415349 MsG0780039131.01.T01:CDS
GCTACATAGTATTTCCCAAA+TGG 0.410807 7:+58421633 None:intergenic
GGACTATATTTCATTTGGCT+TGG 0.412469 7:+58415228 None:intergenic
TGAAATCCTGCCTTCATTAA+GGG 0.417191 7:-58420957 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTGAGTTTAAGTGTGAAAAC+TGG 0.417487 7:-58413636 MsG0780039131.01.T01:CDS
GGAAGAGTTAATGAATTTGC+GGG 0.417630 7:-58416088 MsG0780039131.01.T01:CDS
GTATTCAACAACGCAATAAC+AGG 0.424200 7:-58415564 MsG0780039131.01.T01:CDS
GATGGGGACGGGATGGAAGA+TGG 0.424347 7:+58415607 None:intergenic
TAGATCAGTAGTGGTGCAAT+TGG 0.428465 7:+58421395 None:intergenic
TTAAACTCTTGAGGAAAGAA+AGG 0.430881 7:+58420694 None:intergenic
GTATTTGAGTGAGATTGAAT+TGG 0.433574 7:-58420912 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATTGCACCACTACTGATCT+AGG 0.434236 7:-58421393 MsG0780039131.01.T01:intron
ATTACAAAATCCGAGTAGTT+AGG 0.436385 7:+58421462 None:intergenic
GCAATCTACGAGAGTGGTTG+CGG 0.445065 7:-58418585 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTCATGTTTCGTAAGAGAAT+GGG 0.446740 7:+58421764 None:intergenic
CTTGAGATACTTGACATCTC+AGG 0.447071 7:-58420759 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGTCCTACAATGATTTCAC+TGG 0.449058 7:-58414793 MsG0780039131.01.T01:CDS
GTAACTGGTACCCTTCCAAT+TGG 0.449477 7:-58416286 MsG0780039131.01.T01:CDS
TATTGGTAAAGAAGAAAACT+TGG 0.454631 7:+58415752 None:intergenic
AATAATTACCTCCAATTGGA+AGG 0.455461 7:+58416275 None:intergenic
GTTGAATGCAACACTACAAC+TGG 0.457663 7:-58421567 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTTGTCTATGCAGCAATGTT+GGG 0.458101 7:-58416308 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGGGAAATACTATGTAGCT+TGG 0.458231 7:-58421629 MsG0780039131.01.T01:CDS
AAATAATGTTGTTACTCAAA+CGG 0.459868 7:+58418907 None:intergenic
CCACATAAGTCAAATTGTAT+TGG 0.460498 7:+58415735 None:intergenic
CAATCTACGAGAGTGGTTGC+GGG 0.462448 7:-58418584 MsG0780039131.01.T01:CDS
TACAAGATACCATATGCAAT+TGG 0.463042 7:+58413602 None:intergenic
AAGGGGATTCACGTCTTTGA+AGG 0.465578 7:-58420939 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTTAAGTGGGTTAGCTCACA+TGG 0.467948 7:+58415456 None:intergenic
AAAAGTGTGTGAGTGAAATA+GGG 0.471144 7:+58415921 None:intergenic
ACTTGGAAGTGGGATGGACT+TGG 0.474692 7:+58415769 None:intergenic
GAACTTAAGGTTTGAATGAT+CGG 0.476653 7:+58415898 None:intergenic
AGAAACAAACACATCCCTAT+AGG 0.476700 7:+58421515 None:intergenic
GAAATTGCTACATTACCAAA+TGG 0.480598 7:-58414514 MsG0780039131.01.T01:CDS
AGAGTTCATCCAATTGCATA+TGG 0.481126 7:-58413611 MsG0780039131.01.T01:CDS
GTTTCGTAAGAGAATGGGAT+TGG 0.481674 7:+58421769 None:intergenic
TGGATGGAGATGATGATAGT+TGG 0.484239 7:-58414483 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGGGAAATACTATGTAGCTT+GGG 0.485007 7:-58421628 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATGTTTACCATGTTGAGAT+GGG 0.485982 7:+58415590 None:intergenic
CTCTTAACATGTTGAAAGAA+AGG 0.488503 7:+58414722 None:intergenic
CAATGTTTACCATGTTGAGA+TGG 0.489197 7:+58415589 None:intergenic
CCAAATGGTTTAAACATGGA+TGG 0.489899 7:-58414499 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTACATAGTATTTCCCAAAT+GGG 0.492175 7:+58421634 None:intergenic
TGGAAGAGTTAATGAATTTG+CGG 0.492293 7:-58416089 MsG0780039131.01.T01:CDS
TACATTCTCCAATTTGGTAC+AGG 0.493173 7:-58414758 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGCAAACATGACATCGCTT+CGG 0.493235 7:-58416048 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATGGATCACTAGATATTAG+TGG 0.498565 7:-58418828 MsG0780039131.01.T01:intron
GTGCAACGTTGAATACTTCA+AGG 0.499481 7:+58414665 None:intergenic
ATTATCTCCCTTCACCCAAA+AGG 0.499539 7:+58422052 None:intergenic
CTACTTCAAGTGATGTGTTG+TGG 0.500297 7:-58421701 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTGAATACTTAGCTTTGGA+CGG 0.501046 7:-58416391 MsG0780039131.01.T01:CDS
TAAAGAAGAAAACTTGGAAG+TGG 0.503291 7:+58415758 None:intergenic
AATTACATTTGGCTTCGCTA+TGG 0.509000 7:+58421150 None:intergenic
AGGATCTATTTCATCAGAGT+TGG 0.511131 7:-58415166 MsG0780039131.01.T01:CDS
GGATGGAGATGATGATAGTT+GGG 0.516515 7:-58414482 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGACTTATGTGGATTTCAC+TGG 0.517809 7:-58415725 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTGTAAATTTAAACTCTTG+AGG 0.517909 7:+58420685 None:intergenic
GGAAGTATTCCATCTGAGCT+TGG 0.518353 7:-58414844 MsG0780039131.01.T01:CDS
TATAACTTATGTCCAAACAT+TGG 0.519314 7:+58415271 None:intergenic
TGTCATGTTTGCAAAAGATA+AGG 0.527004 7:+58416057 None:intergenic
ATCTCAGGGAACAACTTCAA+TGG 0.528389 7:-58420744 MsG0780039131.01.T01:CDS
CACACTCAGCTATGAAAACA+TGG 0.530256 7:-58415841 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTAACGCTGATTGTTGTGAA+TGG 0.531343 7:-58421596 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTCACTGGTTGTAGACTAAG+TGG 0.533039 7:-58415710 MsG0780039131.01.T01:intron
GAAATCCTGCCTTCATTAAG+GGG 0.533601 7:-58420956 MsG0780039131.01.T01:CDS
AACGTACCATAAGATTGATT+GGG 0.534179 7:+58421490 None:intergenic
TGGCGCAACACCTGAAAGGA+AGG 0.537399 7:-58414629 MsG0780039131.01.T01:CDS
TACCATGTTGAGATGGGGAC+GGG 0.544100 7:+58415596 None:intergenic
TTGAAGTACGTGTTGTTGGA+TGG 0.547455 7:-58415345 MsG0780039131.01.T01:CDS
CAAGTGAAATAAAACTTGCA+AGG 0.548274 7:+58415978 None:intergenic
TGAATCCCCTTAATGAAGGC+AGG 0.550467 7:+58420951 None:intergenic
ATAAGTTATAATAACTTCAT+CGG 0.555253 7:-58415258 MsG0780039131.01.T01:CDS
ACATTGCAACTTCTTGGCAG+TGG 0.555747 7:+58414547 None:intergenic
AAGTAAGATTCCTAATAGAT+GGG 0.556171 7:+58418557 None:intergenic
GACGTGAATCCCCTTAATGA+AGG 0.557764 7:+58420947 None:intergenic
CAGTGTCATTGAAGTTGTTG+TGG 0.558815 7:+58419636 None:intergenic
AGTGTCATTGAAGTTGTTGT+GGG 0.559434 7:+58419637 None:intergenic
ATCAAAGTTGCTGCATCTGG+AGG 0.562214 7:-58421011 MsG0780039131.01.T01:CDS
GTCAAGTTTCCAAGCTCAGA+TGG 0.562417 7:+58414835 None:intergenic
ATCATGGATTTGGATTTGCA+TGG 0.562788 7:-58418965 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGCTAGATATATCAAAGCTA+AGG 0.563913 7:-58419682 MsG0780039131.01.T01:intron
AAGAAAACTTGGAAGTGGGA+TGG 0.564745 7:+58415763 None:intergenic
TAACGCTGATTGTTGTGAAT+GGG 0.566269 7:-58421595 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATGTCTAGAAATGCAATCCA+TGG 0.568406 7:-58415486 MsG0780039131.01.T01:CDS
AACAAACACATCCCTATAGG+TGG 0.568546 7:+58421518 None:intergenic
AAAGAAGAAAACTTGGAAGT+GGG 0.568583 7:+58415759 None:intergenic
TCAAGACCTTATATTTAAGA+GGG 0.568986 7:-58419580 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGAGATACTTGACATCTCA+GGG 0.569267 7:-58420758 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATTGAAAGCTCAACCAAATG+TGG 0.575239 7:+58415207 None:intergenic
ATAGTTCGACATACTATGCA+TGG 0.581120 7:+58419538 None:intergenic
AAATATAAGGTCTTGAGTGA+AGG 0.583784 7:+58419587 None:intergenic
GAAATAAAACTTGCAAGGGT+AGG 0.584512 7:+58415983 None:intergenic
AATTGTTTACACTTACGTCA+AGG 0.586601 7:+58420987 None:intergenic
ATGTTGAGATGGGGACGGGA+TGG 0.587428 7:+58415600 None:intergenic
ACTGGTACCCTTCCAATTGG+AGG 0.588440 7:-58416283 MsG0780039131.01.T01:intron
ATTACCAAATGGTTTAAACA+TGG 0.595854 7:-58414503 MsG0780039131.01.T01:CDS
CTTCAAGTGATGTGTTGTGG+GGG 0.597650 7:-58421698 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGTCCTACAATGATTTCACT+GGG 0.599044 7:-58414792 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTGCAACTTCTTGGCAGTGG+TGG 0.600631 7:+58414550 None:intergenic
AGATTTGGAAGACGATTTAG+GGG 0.600715 7:+58418882 None:intergenic
ATAATTACCTCCAATTGGAA+GGG 0.601547 7:+58416276 None:intergenic
TTGGGTGAAGGGAGATAATG+TGG 0.601639 7:-58422048 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATCGTTTCGATAATGCTAT+CGG 0.601791 7:-58421257 MsG0780039131.01.T01:CDS
AACATGAAGAGCTTAGTAGT+TGG 0.603608 7:-58421749 MsG0780039131.01.T01:CDS
AAGTGAAATAAAACTTGCAA+GGG 0.603965 7:+58415979 None:intergenic
TACTTGGAATGCTACCAGAA+AGG 0.604631 7:+58415316 None:intergenic
TATCTGGCGCAACACCTGAA+AGG 0.609466 7:-58414633 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTCAAGTGATGTGTTGTGGG+GGG 0.611491 7:-58421697 MsG0780039131.01.T01:CDS
GACTCAGATCTTCATATACA+AGG 0.612568 7:-58420890 MsG0780039131.01.T01:intron
ACTTCAAGTGATGTGTTGTG+GGG 0.615799 7:-58421699 MsG0780039131.01.T01:CDS
ACGTTGGCAGCCTAACTACT+CGG 0.622922 7:-58421472 MsG0780039131.01.T01:CDS
TTACCATGTTGAGATGGGGA+CGG 0.624411 7:+58415595 None:intergenic
GTGAAGGGAGATAATGTGGA+AGG 0.624985 7:-58422044 MsG0780039131.01.T01:CDS
CAATCAATCTTATGGTACGT+TGG 0.625910 7:-58421488 MsG0780039131.01.T01:CDS
GAAATAACCTAGATCAGTAG+TGG 0.626545 7:+58421386 None:intergenic
AGTTGTTGTGGGAAATGTCA+AGG 0.629588 7:+58419648 None:intergenic
TTTGATGAAAGCAGCTACGA+GGG 0.631447 7:-58414592 MsG0780039131.01.T01:CDS
AATGCAACACTACAACTGGA+AGG 0.632807 7:-58421563 MsG0780039131.01.T01:CDS
GAATGAACTTGTAAACTGGA+CGG 0.633109 7:+58418942 None:intergenic
GGATTAAGAGATCGATTCAA+CGG 0.634363 7:-58415009 MsG0780039131.01.T01:CDS
GGCGCAACACCTGAAAGGAA+GGG 0.635212 7:-58414628 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATCCCGTCCCCATCTCAACA+TGG 0.637671 7:-58415598 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATGGAAGCAATCTACGAGAG+TGG 0.638499 7:-58418591 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATGTTTACCATGTTGAGATG+GGG 0.638643 7:+58415591 None:intergenic
AAAAGGACAATTCTTGAGGG+AGG 0.645838 7:-58418514 MsG0780039131.01.T01:CDS
ACAAACACATCCCTATAGGT+GGG 0.645843 7:+58421519 None:intergenic
TGCAACGTTGAATACTTCAA+GGG 0.649264 7:+58414666 None:intergenic
ATCTTGTATCTGCATCAACA+AGG 0.651930 7:-58413587 MsG0780039131.01.T01:CDS
GCTCACATGGAATTGAACCA+TGG 0.656065 7:+58415469 None:intergenic
ATGCAACACTACAACTGGAA+GGG 0.656095 7:-58421562 MsG0780039131.01.T01:CDS
GAAGAGTTAATGAATTTGCG+GGG 0.664448 7:-58416087 MsG0780039131.01.T01:CDS
TGGAGATGATGATAGTTGGG+TGG 0.669710 7:-58414479 MsG0780039131.01.T01:CDS
ATTTGATGAAAGCAGCTACG+AGG 0.681637 7:-58414593 MsG0780039131.01.T01:CDS
GCTGATTGTTGTGAATGGGA+AGG 0.729940 7:-58421591 MsG0780039131.01.T01:CDS
GAGGGTAATCAATTTCTCTG+CGG 0.738185 7:-58414574 MsG0780039131.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATATATATATATATATAT+AGG - Chr7:58416091-58416110 MsG0780039131.01.T01:CDS 0.0%
!! ATATATATATATATATATAT+AGG + Chr7:58416110-58416091 None:intergenic 0.0%
!! TATATATATATATATATATA+GGG - Chr7:58416090-58416109 MsG0780039131.01.T01:CDS 0.0%
!! TATATATATATATATATATA+GGG + Chr7:58416109-58416090 None:intergenic 0.0%
!! AAAAAGAAAATTAAAAATCT+TGG + Chr7:58419406-58419425 None:intergenic 10.0%
!! AAAAGAAAATTAAAAATCTT+GGG + Chr7:58419405-58419424 None:intergenic 10.0%
!! ATATAAAAATATATGATTAG+AGG + Chr7:58416457-58416476 None:intergenic 10.0%
!!! AATAATGTTATTTTTAACAA+TGG + Chr7:58415504-58415523 None:intergenic 10.0%
!!! AGTTGTTTTAATAATTAAAA+TGG + Chr7:58419363-58419382 None:intergenic 10.0%
!!! TACTTTTTTTTTTTTTGAAT+CGG - Chr7:58414956-58414975 MsG0780039131.01.T01:CDS 10.0%
!! AAAAGAAGATATGTATATTA+TGG - Chr7:58420632-58420651 MsG0780039131.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAGTTTAAGTATTTATTG+AGG + Chr7:58418509-58418528 None:intergenic 15.0%
!! AAAGAAAATTGTATAAACAA+AGG - Chr7:58413616-58413635 MsG0780039131.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAGTTTAAGTATTTATTGA+GGG + Chr7:58418508-58418527 None:intergenic 15.0%
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!! ATAAGTTATAATAACTTCAT+CGG - Chr7:58420350-58420369 MsG0780039131.01.T01:intron 15.0%
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!!! CTTTCTTATAACAGTTTTGT+TGG - Chr7:58420540-58420559 MsG0780039131.01.T01:intron 25.0%
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!!! TTCTTATAACAGTTTTGTTG+GGG - Chr7:58420542-58420561 MsG0780039131.01.T01:intron 25.0%
AAAAACGTCATATTGACACA+TGG - Chr7:58417330-58417349 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AAACACACCTAAAAAGTAAG+TGG - Chr7:58416218-58416237 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AAACGACACTTATTGTGAAA+CGG - Chr7:58418652-58418671 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AAAGAAGAAAACTTGGAAGT+GGG + Chr7:58419852-58419871 None:intergenic 30.0%
AAATATAAGGTCTTGAGTGA+AGG + Chr7:58416024-58416043 None:intergenic 30.0%
AAATCAATATACATGCTCCA+CGG - Chr7:58417979-58417998 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AACACACCTAAAAAGTAAGT+GGG - Chr7:58416219-58416238 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AACGTACCATAAGATTGATT+GGG + Chr7:58414121-58414140 None:intergenic 30.0%
AAGATGAACTTATGGAATCT+AGG - Chr7:58416534-58416553 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AAGATGGAAATCACCTATAA+AGG + Chr7:58419988-58420007 None:intergenic 30.0%
AATAATTACCTCCAATTGGA+AGG + Chr7:58419336-58419355 None:intergenic 30.0%
AATCGTTTCGATAATGCTAT+CGG - Chr7:58414351-58414370 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AATGGATCACTAGATATTAG+TGG - Chr7:58416780-58416799 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AATGTTTACCATGTTGAGAT+GGG + Chr7:58420021-58420040 None:intergenic 30.0%
AATTGTTTACACTTACGTCA+AGG + Chr7:58414624-58414643 None:intergenic 30.0%
AGCAAATTGCAAATTTGAAC+AGG + Chr7:58421719-58421738 None:intergenic 30.0%
AGCATACACATCAATACTAT+TGG - Chr7:58421183-58421202 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
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ATATCAAAACTGAGGACTTT+GGG - Chr7:58416489-58416508 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
ATATCAGACAATCATGGATT+TGG - Chr7:58416633-58416652 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
ATTACAAAATCCGAGTAGTT+AGG + Chr7:58414149-58414168 None:intergenic 30.0%
ATTGCTATGAATTCCCATTT+GGG - Chr7:58413961-58413980 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
ATTTATGTTAGAGCGACATA+CGG - Chr7:58417463-58417482 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
CAAAAATTTCACTAAAACCG+GGG + Chr7:58419459-58419478 None:intergenic 30.0%
CAAGTGAAATAAAACTTGCA+AGG + Chr7:58419633-58419652 None:intergenic 30.0%
CAATGAATGAACTTGTAAAC+TGG + Chr7:58416673-58416692 None:intergenic 30.0%
CACACCTTAATAAAAACTAG+TGG - Chr7:58416365-58416384 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
CATTACCATAGATGAACTTA+AGG + Chr7:58419726-58419745 None:intergenic 30.0%
CCACATAAGTCAAATTGTAT+TGG + Chr7:58419876-58419895 None:intergenic 30.0%
CCATTTCTCATGTTCTTATT+AGG + Chr7:58418829-58418848 None:intergenic 30.0%
CCTAATAAGAACATGAGAAA+TGG - Chr7:58418826-58418845 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
CTACATAGTATTTCCCAAAT+GGG + Chr7:58413977-58413996 None:intergenic 30.0%
CTATTTGGAAGTTCTTGATT+TGG - Chr7:58414323-58414342 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
CTCAAGACCTTATATTTAAG+AGG - Chr7:58416027-58416046 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
CTCTTAACATGTTGAAAGAA+AGG + Chr7:58420889-58420908 None:intergenic 30.0%
CTTAAGTTCATCTATGGTAA+TGG - Chr7:58419724-58419743 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
CTTTAATTCTTCTGCAATTC+AGG + Chr7:58421523-58421542 None:intergenic 30.0%
CTTTCTTTCAACATGTTAAG+AGG - Chr7:58420887-58420906 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
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GATATAACGTGATTCCAAAA+AGG - Chr7:58417077-58417096 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
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GTATTTATTGAGGGTAAAGT+TGG + Chr7:58418499-58418518 None:intergenic 30.0%
GTATTTGAGTGAGATTGAAT+TGG - Chr7:58414696-58414715 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
GTCAACAAATTTAAGCAGAT+TGG - Chr7:58416964-58416983 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TAAAGAAGAAAACTTGGAAG+TGG + Chr7:58419853-58419872 None:intergenic 30.0%
TACAAGATACCATATGCAAT+TGG + Chr7:58422009-58422028 None:intergenic 30.0%
TATACATCAATCCTTATTGG+AGG - Chr7:58421221-58421240 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
TATATCAAAACTGAGGACTT+TGG - Chr7:58416488-58416507 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TATATCAAAGCTAAGGTCTT+TGG - Chr7:58415933-58415952 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
TATTGCTATGAATTCCCATT+TGG - Chr7:58413960-58413979 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TCAAACCTTAAGTTCATCTA+TGG - Chr7:58419718-58419737 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TCGGCAAAATTTATTAAGCT+CGG - Chr7:58414975-58414994 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
TGACGCAAGTGAATTTAAAA+TGG - Chr7:58417259-58417278 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TGCTAGATATATCAAAGCTA+AGG - Chr7:58415926-58415945 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAGAGTTAATGAATTTG+CGG - Chr7:58419519-58419538 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TGGATATTTCAGCATTTGAT+AGG + Chr7:58414196-58414215 None:intergenic 30.0%
TGTCATGTTTGCAAAAGATA+AGG + Chr7:58419554-58419573 None:intergenic 30.0%
TTAAAAGACCCTAATGTTTC+TGG - Chr7:58421570-58421589 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
TTAAAAGGCTATCTTGGATA+TGG + Chr7:58415449-58415468 None:intergenic 30.0%
TTAAACTCTTGAGGAAAGAA+AGG + Chr7:58414917-58414936 None:intergenic 30.0%
TTATGCAGGGTTAAACTATT+TGG - Chr7:58414308-58414327 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
TTCATGTTTCGTAAGAGAAT+GGG + Chr7:58413847-58413866 None:intergenic 30.0%
TTGAATGGTAAGAATGTAGA+TGG - Chr7:58418851-58418870 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
TTGTGTTCCATTAGAGTTAT+GGG + Chr7:58417633-58417652 None:intergenic 30.0%
TTTGTGTTGTACATTTGGAA+CGG - Chr7:58418037-58418056 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
! AAAAGTGTGTGAGTGAAATA+GGG + Chr7:58419690-58419709 None:intergenic 30.0%
! AAGAATAAGAGCTTCCATTT+TGG + Chr7:58419956-58419975 None:intergenic 30.0%
! AAGTGACACTCATTTTCAAA+CGG + Chr7:58418408-58418427 None:intergenic 30.0%
! AATTACTATTTTACCTTCGG+CGG + Chr7:58418103-58418122 None:intergenic 30.0%
! ATAATTTGTCAGGTTGTTTG+GGG - Chr7:58420504-58420523 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
! CACACCTTCTAAAAAATAAG+TGG + Chr7:58416285-58416304 None:intergenic 30.0%
! CCAATACAATTTGACTTATG+TGG - Chr7:58419873-58419892 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
! TAAGTGATTAGTCGATTCTT+CGG - Chr7:58415716-58415735 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
! TATATATATAGGGGTTTGCT+AGG + Chr7:58416397-58416416 None:intergenic 30.0%
! TCAGTTTTTGACCATTTGAA+AGG - Chr7:58413662-58413681 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
! TCTGACTTTTTATTGCTCTA+TGG - Chr7:58422052-58422071 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATTTTGTGATATGTGAC+TGG - Chr7:58419060-58419079 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
! TTTTAGCAACATTCACCTTA+AGG - Chr7:58416305-58416324 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAAGTGTCGTTTAAGGTTT+CGG + Chr7:58418645-58418664 None:intergenic 30.0%
!! CAAGCATGGTTTTACTATAT+AGG - Chr7:58421244-58421263 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCAAATTTGCAATTTGCTG+TGG - Chr7:58421720-58421739 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCACAATAAGTGTCGTTTA+AGG + Chr7:58418651-58418670 None:intergenic 30.0%
!!! ACACCCACTAGTTTTTATTA+AGG + Chr7:58416372-58416391 None:intergenic 30.0%
!!! ACACCCACTTATTTTTTAGA+AGG - Chr7:58416278-58416297 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
!!! ACATGAGAAATGGTTTTGAA+TGG - Chr7:58418836-58418855 MsG0780039131.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATACCCTCTAGTTTTTATGT+GGG - Chr7:58416135-58416154 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
!!! TGAGTTTTTCAAAAGTACTG+GGG - Chr7:58419258-58419277 MsG0780039131.01.T01:intron 30.0%
AACAATCGTAAACACCACTT+TGG - Chr7:58415369-58415388 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
AACATGAAGAGCTTAGTAGT+TGG - Chr7:58413859-58413878 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
AACCATGTTTGTTCTACGAA+TGG + Chr7:58415404-58415423 None:intergenic 35.0%
AATGAGCAGACAGATTAGAA+GGG - Chr7:58415622-58415641 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
ACAACAAGTAGAACAAAAGC+AGG - Chr7:58415142-58415161 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
ACACAAAGTAAACTAGCGTT+CGG - Chr7:58415753-58415772 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
ACAGATAAACCTTGTGTTGT+AGG + Chr7:58421852-58421871 None:intergenic 35.0%
ACCAAATTGGAGAATGTAGA+TGG + Chr7:58420848-58420867 None:intergenic 35.0%
ACGAGATTAAAAGGCTATCT+TGG + Chr7:58415455-58415474 None:intergenic 35.0%
ACTCCCACATAAAAACTAGA+GGG + Chr7:58416141-58416160 None:intergenic 35.0%
AGAAACAAACACATCCCTAT+AGG + Chr7:58414096-58414115 None:intergenic 35.0%
AGAATCGATAGGGTTTAAAG+AGG + Chr7:58421757-58421776 None:intergenic 35.0%
AGAGTTCATCCAATTGCATA+TGG - Chr7:58421997-58422016 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
AGATAAACCTTGTGTTGTAG+GGG + Chr7:58421850-58421869 None:intergenic 35.0%
AGATTTGGAAGACGATTTAG+GGG + Chr7:58416729-58416748 None:intergenic 35.0%
AGCATACATTGAGAACCATT+GGG + Chr7:58421629-58421648 None:intergenic 35.0%
AGCTGTTGGAATAGGAATTT+AGG + Chr7:58415109-58415128 None:intergenic 35.0%
AGGATCTATTTCATCAGAGT+TGG - Chr7:58420442-58420461 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
ATAAATTGTCCCTTCCTTTC+AGG + Chr7:58420992-58421011 None:intergenic 35.0%
ATAGTTCGACATACTATGCA+TGG + Chr7:58416073-58416092 None:intergenic 35.0%
ATCATGGATTTGGATTTGCA+TGG - Chr7:58416643-58416662 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
ATCTTGTATCTGCATCAACA+AGG - Chr7:58422021-58422040 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
ATGAAATCCTGCCTTCATTA+AGG - Chr7:58414650-58414669 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
ATGTCTAGAAATGCAATCCA+TGG - Chr7:58420122-58420141 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
ATGTTTACCATGTTGAGATG+GGG + Chr7:58420020-58420039 None:intergenic 35.0%
ATTGAAAGCTCAACCAAATG+TGG + Chr7:58420404-58420423 None:intergenic 35.0%
CAAACAGAGACATAGATATG+AGG + Chr7:58419170-58419189 None:intergenic 35.0%
CAACGTACCATAAGATTGAT+TGG + Chr7:58414122-58414141 None:intergenic 35.0%
CAATCAATCTTATGGTACGT+TGG - Chr7:58414120-58414139 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
CAATGTTTACCATGTTGAGA+TGG + Chr7:58420022-58420041 None:intergenic 35.0%
CAGATAAACCTTGTGTTGTA+GGG + Chr7:58421851-58421870 None:intergenic 35.0%
CCAAAAAGGACAATTCTTGA+GGG - Chr7:58417091-58417110 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
CCAAATGGTTTAAACATGGA+TGG - Chr7:58421109-58421128 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
CCATCCATGTTTAAACCATT+TGG + Chr7:58421112-58421131 None:intergenic 35.0%
CCATCTCCAGAAAAGTTATA+TGG + Chr7:58420227-58420246 None:intergenic 35.0%
CGAGAAATACAAGAATCGAT+AGG + Chr7:58421768-58421787 None:intergenic 35.0%
CTAAAGTCTCTATCGTTAAC+TGG - Chr7:58414405-58414424 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
CTGAGTTTAAGTGTGAAAAC+TGG - Chr7:58421972-58421991 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
CTTATCTAGCATCCAATGTT+TGG - Chr7:58420325-58420344 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
CTTCATGTTTCGTAAGAGAA+TGG + Chr7:58413848-58413867 None:intergenic 35.0%
CTTGGATATGGAGTTTAACA+AGG + Chr7:58415437-58415456 None:intergenic 35.0%
GAAATAAAACTTGCAAGGGT+AGG + Chr7:58419628-58419647 None:intergenic 35.0%
GAAATAACCTAGATCAGTAG+TGG + Chr7:58414225-58414244 None:intergenic 35.0%
GAAGAGTTAATGAATTTGCG+GGG - Chr7:58419521-58419540 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
GAAGGTAAGAACATAGATGA+TGG + Chr7:58418242-58418261 None:intergenic 35.0%
GAATGAACTTGTAAACTGGA+CGG + Chr7:58416669-58416688 None:intergenic 35.0%
GACTCAGATCTTCATATACA+AGG - Chr7:58414718-58414737 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
GAGACATAGATATGAGGAAA+AGG + Chr7:58419164-58419183 None:intergenic 35.0%
GAGATTTGGAAGACGATTTA+GGG + Chr7:58416730-58416749 None:intergenic 35.0%
GCAAAAACCCATAACTCTAA+TGG - Chr7:58417623-58417642 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
GCTACATAGTATTTCCCAAA+TGG + Chr7:58413978-58413997 None:intergenic 35.0%
GCTTCAAAAAGTTGTATCAG+TGG + Chr7:58417833-58417852 None:intergenic 35.0%
GGAAGAGTTAATGAATTTGC+GGG - Chr7:58419520-58419539 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
GGACTATATTTCATTTGGCT+TGG + Chr7:58420383-58420402 None:intergenic 35.0%
GGATTGATGTATAGAACAGT+TGG + Chr7:58421214-58421233 None:intergenic 35.0%
GTAGTAGCATAAAGATCTGA+AGG + Chr7:58418260-58418279 None:intergenic 35.0%
GTATTCAACAACGCAATAAC+AGG - Chr7:58420044-58420063 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
GTTGCACACAACAATTTATC+TGG - Chr7:58420959-58420978 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTGTTCCATTAGAGTTA+TGG + Chr7:58417634-58417653 None:intergenic 35.0%
TAAATTCCTATTCCAACAGC+TGG - Chr7:58415108-58415127 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TACATTCTCCAATTTGGTAC+AGG - Chr7:58420850-58420869 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TACTTCAAGTGATGTGTTGT+GGG - Chr7:58413908-58413927 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TAGAAAGAAGATTCTCACGT+TGG - Chr7:58417890-58417909 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TAGTTAGAACGCCTTTCAAA+TGG + Chr7:58413676-58413695 None:intergenic 35.0%
TATCAAAACTGAGGACTTTG+GGG - Chr7:58416490-58416509 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TATTTGGCATACGGTTGTTT+GGG + Chr7:58415544-58415563 None:intergenic 35.0%
TCAAGAACATTGCAACTTCT+TGG + Chr7:58421070-58421089 None:intergenic 35.0%
TCCAAAAAGGACAATTCTTG+AGG - Chr7:58417090-58417109 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TCCATCTACATTCTCCAATT+TGG - Chr7:58420844-58420863 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TCGGCACACAAATTAAGAAA+TGG + Chr7:58418626-58418645 None:intergenic 35.0%
TCTGCACTTCTTTCTGTTAT+AGG + Chr7:58415206-58415225 None:intergenic 35.0%
TGAAATCCTGCCTTCATTAA+GGG - Chr7:58414651-58414670 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
TGAGATTTGGAAGACGATTT+AGG + Chr7:58416731-58416750 None:intergenic 35.0%
TGCAACGTTGAATACTTCAA+GGG + Chr7:58420945-58420964 None:intergenic 35.0%
TGCTTCTGATTTACTGTTTC+TGG + Chr7:58415275-58415294 None:intergenic 35.0%
TGGAAACTTGACAAGAATTC+AGG - Chr7:58420784-58420803 MsG0780039131.01.T01:CDS 35.0%
TGGGAAATACTATGTAGCTT+GGG - Chr7:58413980-58413999 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TGTATGTTAGCAACTCCTAT+AGG + Chr7:58416261-58416280 None:intergenic 35.0%
TGTCCTACAATGATTTCACT+GGG - Chr7:58420816-58420835 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TGTTGGAATAGGAATTTAGG+AGG + Chr7:58415106-58415125 None:intergenic 35.0%
TGTTTACGATTGTTACGAGA+CGG + Chr7:58415363-58415382 None:intergenic 35.0%
TTAAAAATCTTGGGCTATGC+TGG + Chr7:58419396-58419415 None:intergenic 35.0%
TTATTTGGCATACGGTTGTT+TGG + Chr7:58415545-58415564 None:intergenic 35.0%
TTCTGACCCAATCAATCTTA+TGG - Chr7:58414112-58414131 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
TTCTTTCTGTTATAGGACAG+TGG + Chr7:58415199-58415218 None:intergenic 35.0%
TTGACTTATGTGGATTTCAC+TGG - Chr7:58419883-58419902 MsG0780039131.01.T01:intron 35.0%
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ATTATCTCCCTTCACCCAAA+AGG + Chr7:58413559-58413578 None:intergenic 40.0%
ATTTGATGAAAGCAGCTACG+AGG - Chr7:58421015-58421034 MsG0780039131.01.T01:CDS 40.0%
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CAATGAGCAGACAGATTAGA+AGG - Chr7:58415621-58415640 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
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CAGTGGTAAATAACTACCGT+TGG + Chr7:58417429-58417448 None:intergenic 40.0%
CTACTTCAAGTGATGTGTTG+TGG - Chr7:58413907-58413926 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
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CTTCTAATCTGTCTGCTCAT+TGG + Chr7:58415623-58415642 None:intergenic 40.0%
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GACACTTATTGTGAAACGGA+TGG - Chr7:58418656-58418675 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
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GCAAATTTGAACAGGATAGC+TGG + Chr7:58421711-58421730 None:intergenic 40.0%
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GTTGAATGCAACACTACAAC+TGG - Chr7:58414041-58414060 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
GTTTCGTAAGAGAATGGGAT+TGG + Chr7:58413842-58413861 None:intergenic 40.0%
GTTTGTTCTACGAATGGCAT+TGG + Chr7:58415398-58415417 None:intergenic 40.0%
TAAGTGGTGAGTTCCCAAAT+TGG - Chr7:58419914-58419933 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TACCCAGTTGTTTGGGTAAA+AGG - Chr7:58420568-58420587 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TACTTGGAATGCTACCAGAA+AGG + Chr7:58420295-58420314 None:intergenic 40.0%
TAGATCAGTAGTGGTGCAAT+TGG + Chr7:58414216-58414235 None:intergenic 40.0%
TCAAACTTGTACCCACCTAT+AGG - Chr7:58414078-58414097 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TCTTACATTGCACAAAGACG+TGG + Chr7:58415695-58415714 None:intergenic 40.0%
TGCCATTCGTAGAACAAACA+TGG - Chr7:58415399-58415418 MsG0780039131.01.T01:CDS 40.0%
TGGATGGAGATGATGATAGT+TGG - Chr7:58421125-58421144 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TTAAGATATACGGCTAACCG+TGG - Chr7:58414782-58414801 MsG0780039131.01.T01:CDS 40.0%
TTATCGAGTCTTCTTTGTGC+CGG + Chr7:58415079-58415098 None:intergenic 40.0%
TTCATCAAAGTTGCTGCATC+TGG - Chr7:58414594-58414613 MsG0780039131.01.T01:CDS 40.0%
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TTGGATGGAAATAGCCTTTC+TGG - Chr7:58420278-58420297 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TTGGTCGAAGCTTAAGAAGT+TGG - Chr7:58419499-58419518 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TTGTTTGGGTAAAAGGATCC+AGG - Chr7:58420575-58420594 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
TTTAGTAACAAGGGTGAAGG+AGG + Chr7:58418282-58418301 None:intergenic 40.0%
TTTGATGAAAGCAGCTACGA+GGG - Chr7:58421016-58421035 MsG0780039131.01.T01:CDS 40.0%
! CAGTGTCATTGAAGTTGTTG+TGG + Chr7:58415975-58415994 None:intergenic 40.0%
! CCCTCAAGAATTGTCCTTTT+TGG + Chr7:58417094-58417113 None:intergenic 40.0%
! CGTGTATTGTTAGGCACTTT+TGG + Chr7:58415048-58415067 None:intergenic 40.0%
! CTAACGCTGATTGTTGTGAA+TGG - Chr7:58414012-58414031 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
! GACACTCATTTTCAAACGGA+TGG + Chr7:58418404-58418423 None:intergenic 40.0%
! GATCCTTTTACCCAAACAAC+TGG + Chr7:58420574-58420593 None:intergenic 40.0%
! GTGAAAAAGTCTGAAGTGGA+TGG - Chr7:58417518-58417537 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
! TACTCTTTTTCCTCCTTTGC+CGG + Chr7:58415021-58415040 None:intergenic 40.0%
! TTCACTGGTTGTAGACTAAG+TGG - Chr7:58419898-58419917 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
! TTGAAGTACGTGTTGTTGGA+TGG - Chr7:58420263-58420282 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
! TTTTGTTCCTATCCAGCTGT+TGG + Chr7:58415123-58415142 None:intergenic 40.0%
!! ACGTTAGTGTGTTACTTCCA+CGG + Chr7:58414802-58414821 None:intergenic 40.0%
!! GGTTTTAGTAACAAGGGTGA+AGG + Chr7:58418285-58418304 None:intergenic 40.0%
!! TAGCTTTGAGTCAGTCAAGT+CGG + Chr7:58421682-58421701 None:intergenic 40.0%
!! TGCAATTTGCTGTGGTTGAA+AGG - Chr7:58421728-58421747 MsG0780039131.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTAAGTGGGTTAGCTCACA+TGG + Chr7:58420155-58420174 None:intergenic 40.0%
!!! GGCATTTTGTCTTGTTTGGA+TGG - Chr7:58414372-58414391 MsG0780039131.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTTAACAATGGTGTTGCCG+AGG + Chr7:58415493-58415512 None:intergenic 40.0%
AAAGGGGCTTGAGGCTTATT+TGG + Chr7:58415560-58415579 None:intergenic 45.0%
AACCATGCTTGCCTCCAATA+AGG + Chr7:58421235-58421254 None:intergenic 45.0%
AAGATGCAGGAAAGAGGTTG+AGG + Chr7:58417600-58417619 None:intergenic 45.0%
AAGGGGATTCACGTCTTTGA+AGG - Chr7:58414669-58414688 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
ACATTGCAACTTCTTGGCAG+TGG + Chr7:58421064-58421083 None:intergenic 45.0%
ACATTGCACAAAGACGTGGA+AGG + Chr7:58415691-58415710 None:intergenic 45.0%
ACGGTAGTTAACTACTGCTG+GGG + Chr7:58417371-58417390 None:intergenic 45.0%
ATAACTACCGTTGGATCCAG+CGG + Chr7:58417420-58417439 None:intergenic 45.0%
ATCAAAGTTGCTGCATCTGG+AGG - Chr7:58414597-58414616 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
ATCCTTATTGGAGGCAAGCA+TGG - Chr7:58421230-58421249 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
ATGACTTTCTGTGCCGAAGA+AGG + Chr7:58415791-58415810 None:intergenic 45.0%
ATGCAGCAATGTTGGGTAAC+TGG - Chr7:58419307-58419326 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
ATGGAAGCAATCTACGAGAG+TGG - Chr7:58417017-58417036 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
CATGACATCGCTTCGGAAAT+TGG - Chr7:58419567-58419586 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
CCACTCGAACCAGAAACATT+AGG + Chr7:58421582-58421601 None:intergenic 45.0%
CTAATCTGTCTGCTCATTGG+AGG + Chr7:58415620-58415639 None:intergenic 45.0%
CTTCAAGTGATGTGTTGTGG+GGG - Chr7:58413910-58413929 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
GAACGGTAGTTAACTACTGC+TGG + Chr7:58417373-58417392 None:intergenic 45.0%
GACATACGGCTTGATATGTC+AGG - Chr7:58417477-58417496 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
GACATTGCATCTGCTCTTAG+TGG - Chr7:58414891-58414910 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
GACGTGAATCCCCTTAATGA+AGG + Chr7:58414664-58414683 None:intergenic 45.0%
GCTCACATGGAATTGAACCA+TGG + Chr7:58420142-58420161 None:intergenic 45.0%
GCTGATTGTTGTGAATGGGA+AGG - Chr7:58414017-58414036 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
GGAAAAACCCCTACAACACA+AGG - Chr7:58421840-58421859 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
GGGGAAATACCCAGTTGTTT+GGG - Chr7:58420561-58420580 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
GTAACTGGTACCCTTCCAAT+TGG - Chr7:58419322-58419341 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
GTCAAGTTTCCAAGCTCAGA+TGG + Chr7:58420776-58420795 None:intergenic 45.0%
GTCCACCATATAATCCACCT+CGG - Chr7:58415473-58415492 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
GTGAAGGGAGATAATGTGGA+AGG - Chr7:58413564-58413583 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
TAGTGCAAGGTGCACAATAC+CGG - Chr7:58414999-58415018 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
TATTAAGCTCGGCTAGTGCA+AGG - Chr7:58414986-58415005 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
TCCTATCCAGCTGTTGGAAT+AGG + Chr7:58415117-58415136 None:intergenic 45.0%
TCCTATTCCAACAGCTGGAT+AGG - Chr7:58415113-58415132 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
TCTTGTTCCCAGTCAAGTCA+AGG + Chr7:58416518-58416537 None:intergenic 45.0%
TGAATCCCCTTAATGAAGGC+AGG + Chr7:58414660-58414679 None:intergenic 45.0%
TGCAGAAAGATGCAGGAAAG+AGG + Chr7:58417606-58417625 None:intergenic 45.0%
TGGAGATGATGATAGTTGGG+TGG - Chr7:58421129-58421148 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
TGGGGAAATACCCAGTTGTT+TGG - Chr7:58420560-58420579 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
TTAAAACTGTGCCTGCAAGG+TGG - Chr7:58417949-58417968 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
TTAACTACCGCTGGATCCAA+CGG - Chr7:58417410-58417429 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
TTACCATGTTGAGATGGGGA+CGG + Chr7:58420016-58420035 None:intergenic 45.0%
TTCAAGTGATGTGTTGTGGG+GGG - Chr7:58413911-58413930 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
TTGGGTGAAGGGAGATAATG+TGG - Chr7:58413560-58413579 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
TTTGGGTAAAAGGATCCAGG+AGG - Chr7:58420578-58420597 MsG0780039131.01.T01:intron 45.0%
! AAAGACGTGGAAGGTTTGGT+CGG + Chr7:58415682-58415701 None:intergenic 45.0%
! ATTTTTATGGGCCACCTTGC+AGG + Chr7:58417963-58417982 None:intergenic 45.0%
! GGGTTTTTGCAGAAAGATGC+AGG + Chr7:58417613-58417632 None:intergenic 45.0%
! GGTGGGTACAAGTTTGAGTT+TGG + Chr7:58414075-58414094 None:intergenic 45.0%
! GTTTGATGCAGCTGCAGTTT+TGG + Chr7:58415253-58415272 None:intergenic 45.0%
!! AATGGCATTGGCATCCAAAG+TGG + Chr7:58415386-58415405 None:intergenic 45.0%
!! ATTCTTCGGCATCGATGCAA+AGG - Chr7:58415730-58415749 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
!! CCTAATGTTTCTGGTTCGAG+TGG - Chr7:58421579-58421598 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGGAAAGAATGAGTTGGTG+AGG + Chr7:58417581-58417600 None:intergenic 45.0%
!! GGAAGTATTCCATCTGAGCT+TGG - Chr7:58420764-58420783 MsG0780039131.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTTGCCGAGGTGGATTATA+TGG + Chr7:58415481-58415500 None:intergenic 45.0%
!! ATATATATATATATATATAG+GGG + Chr7:58416120-58416101 None:intergenic 5.0%
AACAATACACGGCAGCACAC+CGG - Chr7:58415057-58415076 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
AAGGTGCACAATACCGGCAA+AGG - Chr7:58415005-58415024 MsG0780039131.01.T01:CDS 50.0%
ACGTTGGCAGCCTAACTACT+CGG - Chr7:58414136-58414155 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
ACTGGTACCCTTCCAATTGG+AGG - Chr7:58419325-58419344 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
AGCGGTAGTTAACAGCTGTC+GGG + Chr7:58417402-58417421 None:intergenic 50.0%
CAAGCGGTAGTTAACTACCG+TGG + Chr7:58417999-58418018 None:intergenic 50.0%
CAATCTACGAGAGTGGTTGC+GGG - Chr7:58417024-58417043 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
CAGCGGTAGTTAACAGCTGT+CGG + Chr7:58417403-58417422 None:intergenic 50.0%
CGAGACGGATAGCTGTGTTT+CGG + Chr7:58415348-58415367 None:intergenic 50.0%
CGGCTTGATATGTCAGGTCT+TGG - Chr7:58417483-58417502 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
CGGTAGTTAACTACTGCTGG+GGG + Chr7:58417370-58417389 None:intergenic 50.0%
GAACGGTAGTTAACTACCGC+GGG - Chr7:58418054-58418073 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
GCAATCTACGAGAGTGGTTG+CGG - Chr7:58417023-58417042 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
GCACAAAGACGTGGAAGGTT+TGG + Chr7:58415686-58415705 None:intergenic 50.0%
GCATAATCAGACGCTCCCAA+TGG - Chr7:58421611-58421630 MsG0780039131.01.T01:CDS 50.0%
GGAACGGTAGTTAACTACCG+CGG - Chr7:58418053-58418072 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
GTGTGCTGCCGTGTATTGTT+AGG + Chr7:58415057-58415076 None:intergenic 50.0%
TACCATGTTGAGATGGGGAC+GGG + Chr7:58420015-58420034 None:intergenic 50.0%
TATCTGGCGCAACACCTGAA+AGG - Chr7:58420975-58420994 MsG0780039131.01.T01:CDS 50.0%
TGCGGGCTTTCCCATCTATT+AGG - Chr7:58417041-58417060 MsG0780039131.01.T01:intron 50.0%
TTGCAACTTCTTGGCAGTGG+TGG + Chr7:58421061-58421080 None:intergenic 50.0%
! ACTACTGCTGGGGGCTTTTT+AGG + Chr7:58417361-58417380 None:intergenic 50.0%
! ACTTGGAAGTGGGATGGACT+TGG + Chr7:58419842-58419861 None:intergenic 50.0%
! TGAGTCAGTCAAGTCGGTTC+AGG + Chr7:58421676-58421695 None:intergenic 50.0%
! TTTGGGTCATTTGGAGTGCG+TGG + Chr7:58415527-58415546 None:intergenic 50.0%
!! TAACAATGGTGTTGCCGAGG+TGG + Chr7:58415490-58415509 None:intergenic 50.0%
!! TGCCGAGGTGGATTATATGG+TGG + Chr7:58415478-58415497 None:intergenic 50.0%
!! TTGGGAGCGTCTGATTATGC+AGG + Chr7:58421611-58421630 None:intergenic 50.0%
AAGTGATGTGTTGTGGGGGG+TGG - Chr7:58413914-58413933 MsG0780039131.01.T01:intron 55.0%
ATCCCGTCCCCATCTCAACA+TGG - Chr7:58420010-58420029 MsG0780039131.01.T01:intron 55.0%
ATGTTGAGATGGGGACGGGA+TGG + Chr7:58420011-58420030 None:intergenic 55.0%
CAGCTGTCGGGTTTGCAGAA+CGG + Chr7:58417390-58417409 None:intergenic 55.0%
CGACAGCTGTTAACTACCGC+TGG - Chr7:58417401-58417420 MsG0780039131.01.T01:intron 55.0%
CGGTAGTTAACTACCGCCGA+AGG - Chr7:58418087-58418106 MsG0780039131.01.T01:intron 55.0%
GACGGATAGCTGTGTTTCGG+AGG + Chr7:58415345-58415364 None:intergenic 55.0%
GGATAGCTGTGTTTCGGAGG+TGG + Chr7:58415342-58415361 None:intergenic 55.0%
GGCGCAACACCTGAAAGGAA+GGG - Chr7:58420980-58420999 MsG0780039131.01.T01:CDS 55.0%
GTGCACAATACCGGCAAAGG+AGG - Chr7:58415008-58415027 MsG0780039131.01.T01:CDS 55.0%
TCTGCTGCTGTTCGCTGCTT+GGG + Chr7:58415310-58415329 None:intergenic 55.0%
TGGCGCAACACCTGAAAGGA+AGG - Chr7:58420979-58420998 MsG0780039131.01.T01:CDS 55.0%
TTCTGCTGCTGTTCGCTGCT+TGG + Chr7:58415311-58415330 None:intergenic 55.0%
! TGGGGGTCCTTGACTTGACT+GGG - Chr7:58416508-58416527 MsG0780039131.01.T01:intron 55.0%
! TGTCTGCTCATTGGAGGTGC+TGG + Chr7:58415614-58415633 None:intergenic 55.0%
! TTGGGGGTCCTTGACTTGAC+TGG - Chr7:58416507-58416526 MsG0780039131.01.T01:intron 55.0%
!! GTCTGCTCATTGGAGGTGCT+GGG + Chr7:58415613-58415632 None:intergenic 55.0%
CAGCGAACAGCAGCAGAACC+AGG - Chr7:58415313-58415332 MsG0780039131.01.T01:CDS 60.0%
CGGCGGTAGTTAACTACCGC+TGG + Chr7:58418086-58418105 None:intergenic 60.0%
CTACCGCGGGATCAATCCAG+CGG - Chr7:58418067-58418086 MsG0780039131.01.T01:intron 60.0%
CTACCGCTGGATTGATCCCG+CGG + Chr7:58418073-58418092 None:intergenic 60.0%
GATGGGGACGGGATGGAAGA+TGG + Chr7:58420004-58420023 None:intergenic 60.0%
GTGTTTCGGAGGTGGCAACC+TGG + Chr7:58415334-58415353 None:intergenic 60.0%
TGATGTGTTGTGGGGGGTGG+TGG - Chr7:58413917-58413936 MsG0780039131.01.T01:intron 60.0%
!! GCTCATTGGAGGTGCTGGGA+CGG + Chr7:58415609-58415628 None:intergenic 60.0%
GCTGCTGTTCGCTGCTTGGG+TGG + Chr7:58415307-58415326 None:intergenic 65.0%
!! GTGTTGTGGGGGGTGGTGGA+AGG - Chr7:58413921-58413940 MsG0780039131.01.T01:intron 65.0%
!! TTGGAGGTGCTGGGACGGCT+TGG + Chr7:58415604-58415623 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 58413543 58422087 58413543 ID=MsG0780039131.01;Name=MsG0780039131.01
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Chr7 exon 58422038 58422087 58422038 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15772;Parent=MsG0780039131.01.T01
Chr7 exon 58421394 58421791 58421394 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15771;Parent=MsG0780039131.01.T01
Chr7 exon 58421156 58421314 58421156 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15770;Parent=MsG0780039131.01.T01
Chr7 exon 58420891 58421061 58420891 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15769;Parent=MsG0780039131.01.T01
Chr7 exon 58420682 58420804 58420682 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15768;Parent=MsG0780039131.01.T01
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Chr7 exon 58414462 58415033 58414462 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15761;Parent=MsG0780039131.01.T01
Chr7 exon 58413543 58413665 58413543 ID=MsG0780039131.01.T01:exon:15760;Parent=MsG0780039131.01.T01
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Gene Sequence

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Protein sequence

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