AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039096.01

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MsG0780039096.01.T01 AT1G08590 31.041 509 305 11 228 710 92 580 1.34e-42 169
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MsG0780039096.01.T01 AT2G24130 31.667 360 203 8 521 864 88 420 5.34e-27 119
MsG0780039096.01.T01 AT2G24130 27.307 531 296 16 146 633 88 571 4.56e-25 112
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MsG0780039096.01.T01 AT1G35710 30.690 290 154 6 591 869 82 335 1.66e-19 95.1
MsG0780039096.01.T01 AT3G05360 29.429 683 374 22 239 885 113 723 3.15e-40 160
MsG0780039096.01.T01 AT3G05360 24.818 822 432 26 9 797 19 687 1.34e-33 139
MsG0780039096.01.T01 AT3G05360 25.862 406 200 12 502 844 2 369 5.37e-16 83.6
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MsG0780039096.01.T01 AT3G28890 28.830 607 315 15 215 797 96 609 1.07e-37 152
MsG0780039096.01.T01 AT3G28890 29.260 581 328 18 37 579 74 609 1.50e-36 148
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MsG0780039096.01.T01 AT3G19700 26.915 483 328 12 164 640 125 588 4.03e-25 113
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MsG0780039096.01.T01 AT3G23010 28.909 339 194 8 547 850 5 331 2.14e-21 99.8
MsG0780039096.01.T01 AT3G23010 26.208 538 282 16 247 711 6 501 8.95e-21 97.8
MsG0780039096.01.T01 AT3G23010 25.862 522 304 19 173 649 6 489 4.93e-16 82.8
MsG0780039096.01.T01 AT3G23010 24.714 437 270 12 146 572 123 510 3.37e-12 70.5
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MsG0780039096.01.T01 AT3G14840 28.371 356 180 12 214 568 113 394 6.29e-12 70.5
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MsG0780039096.01.T01 AT1G56120 27.473 364 174 9 468 825 78 357 3.16e-19 94.0
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MsG0780039096.01.T01 AT4G37250 27.987 318 121 9 560 874 64 276 8.86e-14 76.3
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MsG0780039096.01.T01 AT2G15880 28.646 192 123 4 662 846 132 316 1.00e-13 75.9
MsG0780039096.01.T01 AT2G15880 27.189 217 139 6 441 651 185 388 7.20e-12 70.1
MsG0780039096.01.T01 AT2G15880 22.826 276 159 5 521 795 115 337 6.01e-11 67.0
MsG0780039096.01.T01 AT2G15880 26.009 223 149 8 491 710 113 322 8.69e-11 66.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G56130 27.305 282 167 9 516 793 1 248 1.02e-13 76.3
MsG0780039096.01.T01 AT1G56130 26.786 280 145 7 572 847 9 232 2.27e-13 75.1
MsG0780039096.01.T01 AT1G56130 28.452 239 157 5 467 703 4 230 6.37e-13 73.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G56130 32.161 199 100 4 454 621 32 226 1.04e-12 72.8
MsG0780039096.01.T01 AT3G25560 30.435 184 121 4 748 930 97 274 1.07e-13 75.9
MsG0780039096.01.T01 AT3G25560 36.129 155 94 3 499 651 90 241 1.46e-12 72.0
MsG0780039096.01.T01 AT3G24660 35.762 151 90 3 461 608 122 268 1.37e-13 75.5
MsG0780039096.01.T01 AT4G29240 28.413 271 133 9 655 905 130 359 2.36e-13 73.6
MsG0780039096.01.T01 AT5G05160 27.481 262 115 7 664 924 100 287 2.59e-13 74.3
MsG0780039096.01.T01 AT5G49780 25.385 260 127 5 457 706 60 262 4.15e-13 74.3
MsG0780039096.01.T01 AT5G49780 25.385 260 127 5 457 706 60 262 4.22e-13 74.3
MsG0780039096.01.T01 AT3G19320 30.802 237 139 9 626 848 211 436 4.74e-13 73.2
MsG0780039096.01.T01 AT3G19320 27.933 179 121 3 438 616 226 396 1.63e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT5G24100 36.567 134 76 3 479 612 90 214 4.87e-13 73.6
MsG0780039096.01.T01 AT4G33430 37.500 128 74 2 428 555 60 181 5.18e-13 73.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G68400 39.552 134 55 4 761 872 96 225 5.27e-13 73.6
MsG0780039096.01.T01 AT3G49750 36.792 106 67 0 741 846 82 187 5.42e-13 68.9
MsG0780039096.01.T01 AT3G49750 38.095 126 73 2 735 857 54 177 5.57e-11 63.2
MsG0780039096.01.T01 AT1G28340 34.400 125 81 1 753 876 418 542 5.70e-13 73.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G48480 36.095 169 92 5 435 594 61 222 7.81e-13 73.2
MsG0780039096.01.T01 AT5G20690 36.111 144 85 3 481 622 91 229 7.92e-13 72.8
MsG0780039096.01.T01 AT5G48380 37.719 114 69 2 758 870 102 214 8.68e-13 72.8
MsG0780039096.01.T01 AT1G27190 38.281 128 76 1 463 590 73 197 1.06e-12 72.4
MsG0780039096.01.T01 AT3G50230 37.324 142 81 3 463 603 75 209 1.25e-12 72.4
MsG0780039096.01.T01 AT3G50230 36.220 127 78 2 755 881 121 244 4.69e-12 70.5
MsG0780039096.01.T01 AT3G50230 37.324 142 81 3 463 603 87 221 1.36e-12 72.4
MsG0780039096.01.T01 AT3G50230 36.220 127 78 2 755 881 133 256 4.22e-12 70.5
MsG0780039096.01.T01 AT2G42290 33.803 142 85 2 515 652 68 204 1.38e-12 72.0
MsG0780039096.01.T01 AT2G42290 38.889 144 74 6 498 638 79 211 4.41e-11 67.4
MsG0780039096.01.T01 AT1G69990 37.705 122 73 1 463 584 66 184 2.07e-12 71.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G69990 37.719 114 67 2 758 870 91 201 1.72e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G69990 40.870 115 63 2 491 604 70 180 6.49e-11 66.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G78980 30.921 152 95 3 437 588 93 234 2.32e-12 71.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G78980 33.117 154 90 4 450 603 85 225 4.31e-11 67.4
MsG0780039096.01.T01 AT5G06870 26.957 345 161 12 538 875 70 330 2.51e-12 69.7
MsG0780039096.01.T01 AT2G26730 36.875 160 89 3 483 634 63 218 2.61e-12 71.2
MsG0780039096.01.T01 AT2G26730 34.000 150 74 3 761 889 96 241 1.14e-11 69.3
MsG0780039096.01.T01 AT2G26730 33.333 165 99 4 448 609 78 234 4.40e-11 67.4
MsG0780039096.01.T01 AT5G63710 33.588 131 60 3 753 883 114 217 2.76e-12 71.2
MsG0780039096.01.T01 AT5G63710 33.588 131 60 3 753 883 78 181 2.76e-12 71.2
MsG0780039096.01.T01 AT5G63710 33.588 131 60 3 753 883 78 181 2.76e-12 71.2
MsG0780039096.01.T01 AT5G63710 33.588 131 60 3 753 883 113 216 2.90e-12 71.2
MsG0780039096.01.T01 AT3G08680 38.281 128 59 2 761 870 97 222 3.72e-12 70.9
MsG0780039096.01.T01 AT3G08680 38.281 128 59 2 761 870 97 222 3.72e-12 70.9
MsG0780039096.01.T01 AT1G11130 31.429 140 90 1 463 602 70 203 5.11e-12 70.5
MsG0780039096.01.T01 AT1G56130 33.333 174 88 3 472 621 6 175 5.31e-12 70.5
MsG0780039096.01.T01 AT1G14390 34.524 168 101 3 459 626 153 311 5.43e-12 70.5
MsG0780039096.01.T01 AT5G67200 38.525 122 68 2 482 603 93 207 8.07e-12 69.7
MsG0780039096.01.T01 AT1G10850 33.846 130 80 3 753 882 115 238 1.00e-11 69.3
MsG0780039096.01.T01 AT4G06744 29.143 175 116 5 539 709 119 289 1.10e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT5G65240 35.780 109 67 1 766 874 98 203 1.27e-11 68.9
MsG0780039096.01.T01 AT5G65240 35.780 109 67 1 766 874 98 203 1.36e-11 68.9
MsG0780039096.01.T01 AT1G11130 33.333 129 80 1 474 602 3 125 1.42e-11 68.9
MsG0780039096.01.T01 AT3G13065 30.000 140 92 1 463 602 72 205 1.65e-11 68.9
MsG0780039096.01.T01 AT1G63430 33.562 146 85 3 499 632 78 223 1.69e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT2G13800 38.060 134 73 4 422 555 59 182 1.83e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT2G13800 38.060 134 73 4 422 555 59 182 1.83e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G63430 33.562 146 85 3 499 632 78 223 2.01e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT1G63430 33.562 146 85 3 499 632 78 223 2.01e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT5G58300 39.850 133 65 5 761 885 141 266 2.07e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT5G58300 39.850 133 65 5 761 885 141 266 2.07e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT5G58300 39.850 133 65 5 761 885 141 266 2.07e-11 68.6
MsG0780039096.01.T01 AT2G35620 39.669 121 72 1 763 883 104 223 2.47e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT2G35620 39.669 121 72 1 763 883 104 223 2.47e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT2G35620 39.669 121 72 1 763 883 104 223 2.47e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT2G35620 39.669 121 72 1 763 883 104 223 2.47e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT3G19020 28.507 221 128 7 626 842 154 348 2.65e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT3G19020 28.507 221 128 7 626 842 154 348 2.91e-11 68.2
MsG0780039096.01.T01 AT1G60630 34.028 144 93 2 512 654 84 226 3.94e-11 67.4
MsG0780039096.01.T01 AT1G60630 33.333 123 79 2 753 875 106 225 7.76e-11 66.6
MsG0780039096.01.T01 AT4G18760 36.913 149 82 2 482 630 186 322 4.39e-11 66.6
MsG0780039096.01.T01 AT5G06820 32.895 152 91 3 437 588 96 236 4.45e-11 67.4
MsG0780039096.01.T01 AT2G23300 31.765 170 68 5 761 884 128 295 5.39e-11 67.0
MsG0780039096.01.T01 AT1G49490 30.097 206 118 5 662 842 131 335 6.20e-11 67.0
MsG0780039096.01.T01 AT1G49490 30.097 206 118 5 662 842 136 340 6.77e-11 67.0
MsG0780039096.01.T01 AT5G43020 36.508 126 73 2 478 603 92 210 9.06e-11 66.2

Find 194 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 287 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGCACTTGCAATTGAAATT+TGG 0.134562 7:+57893030 None:intergenic
TTGGGTGGGAATAGCCTTTC+TGG 0.150877 7:-57892545 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTACTGATAATCACTTTAT+TGG 0.185349 7:-57893232 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTAAGCTCTTTAGAGGTTT+TGG 0.191688 7:-57892654 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATATTCTATGAAGTGATTTA+TGG 0.202274 7:-57891948 MsG0780039096.01.T01:CDS
AATCACTTTATTGGTAATAT+TGG 0.203206 7:-57893223 MsG0780039096.01.T01:CDS
TCCTATACATCAATCCTTAT+TGG 0.219621 7:-57891344 MsG0780039096.01.T01:CDS
CACTTAGTTGAGGAGGAATT+TGG 0.220712 7:+57891652 None:intergenic
CCATCTCCAGATAAGTTATT+TGG 0.222701 7:+57892599 None:intergenic
ATGTTTAGATGAACCAAATT+TGG 0.225055 7:+57892722 None:intergenic
CTAAATTGTCCTTTCCATTC+AGG 0.232820 7:+57891573 None:intergenic
TTGAGATATAACGAGTTTAA+AGG 0.238142 7:-57893532 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTCAGAATTGTTCCTTTGT+AGG 0.249539 7:-57892851 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTAGATTGGAATAGGATAAA+TGG 0.260465 7:-57893607 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTAAATAACATCGAATGTT+TGG 0.272360 7:-57892498 MsG0780039096.01.T01:CDS
ACTCTCAACTTGTACCAAAT+TGG 0.273766 7:+57891704 None:intergenic
TGGGGAAATACCTAAATGTT+TGG 0.277812 7:-57892009 MsG0780039096.01.T01:CDS
GGAACTATATATAACAGATT+TGG 0.278589 7:-57891921 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTATCTCATAATAAGTTAAA+TGG 0.285779 7:-57891819 MsG0780039096.01.T01:CDS
GAACTTAAGGTTTGAATGAT+TGG 0.286017 7:+57893114 None:intergenic
AGCACTTGCAATTGAAATTT+GGG 0.291401 7:+57893031 None:intergenic
TTCATCAAAGTTGCTGCATT+TGG 0.294487 7:-57894579 MsG0780039096.01.T01:CDS
TCAAACCTTAAGTTCATCTA+TGG 0.295663 7:-57893106 MsG0780039096.01.T01:CDS
TACCGGCTTTCCCATCTATT+AGG 0.303575 7:-57893564 MsG0780039096.01.T01:CDS
GAAATACCAAATAACTTATC+TGG 0.304870 7:-57892605 MsG0780039096.01.T01:CDS
TGGATATTCTTGATTTAGAT+TGG 0.309408 7:-57893621 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTAATTTGTTGTTGCTCAAA+TGG 0.324773 7:+57892267 None:intergenic
AAGCCACTTAAGCTCTTTAG+AGG 0.326335 7:-57892660 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATGACATAGGGAATTCAAAT+TGG 0.328840 7:+57893149 None:intergenic
TATCAGCATTCTGTCTTGTT+TGG 0.333685 7:-57894764 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAATTAAGATTCCTAATAGA+TGG 0.337115 7:+57893553 None:intergenic
TACTAGATCACTTAACTATT+CGG 0.341935 7:-57895003 MsG0780039096.01.T01:CDS
TAAGCGGAGAGTTTCCAAAT+TGG 0.344677 7:-57892910 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGATCAGTTCTTGTACAAT+TGG 0.349274 7:+57894926 None:intergenic
AGATCCTTCAAGATGATTAC+TGG 0.353036 7:+57892397 None:intergenic
CCAATACAATTTGACTTATG+TGG 0.354542 7:-57892951 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATAAGTAATAATAATTTCAT+TGG 0.355540 7:-57892473 MsG0780039096.01.T01:CDS
ACAAATCTTATTTATATGTC+TGG 0.360156 7:-57891849 MsG0780039096.01.T01:CDS
GAACTATATATAACAGATTT+GGG 0.362299 7:-57891920 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTAGCTGGCATAATTGCTT+TGG 0.366593 7:+57892071 None:intergenic
TCATAGAATATTCTTCCATC+TGG 0.367223 7:+57891960 None:intergenic
TCCAATAAGGATTGATGTAT+AGG 0.370759 7:+57891343 None:intergenic
TGAGATATAACGAGTTTAAA+GGG 0.373837 7:-57893531 MsG0780039096.01.T01:CDS
AACCATGCTTGCCTCCAATA+AGG 0.374367 7:+57891330 None:intergenic
GAGTTTAAAGGGACAATTCT+TGG 0.375816 7:-57893520 MsG0780039096.01.T01:CDS
CATTACCATAGATGAACTTA+AGG 0.376066 7:+57893101 None:intergenic
CATGACATCCCTTCGGACTT+TGG 0.376518 7:-57893257 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTAAGTTCATCTATGGTAA+TGG 0.384932 7:-57893100 MsG0780039096.01.T01:CDS
CATTTGACATATTTGTTGTT+GGG 0.385515 7:-57892563 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTGGCATACAACAATTTATC+TGG 0.386264 7:-57891603 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAGAAATATGAAACGTTTAG+TGG 0.388006 7:-57895216 MsG0780039096.01.T01:exon
TTCTTGATTTAGATTGGAAT+AGG 0.398348 7:-57893615 MsG0780039096.01.T01:CDS
TGAAGTTATTACCTTTCATA+AGG 0.398623 7:+57892105 None:intergenic
TCATTTGACATATTTGTTGT+TGG 0.400056 7:-57892564 MsG0780039096.01.T01:CDS
GGGGAAATACCTAAATGTTT+GGG 0.400673 7:-57892008 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGCAATTCGGTTTCATTTCA+CGG 0.404003 7:-57894700 MsG0780039096.01.T01:intron
CTTTCACAAAACAATTTGTC+AGG 0.405897 7:-57892329 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTAAGTTCATCTATGGTAAT+GGG 0.406927 7:-57893099 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTAAGTGGCTTAGCTCATA+AGG 0.408685 7:+57892671 None:intergenic
TTCTCTTAAATCTCTGTCGT+TGG 0.409639 7:-57894731 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAGCTCTTATTGCTCTGTCT+TGG 0.411304 7:-57895118 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGGAAGAGTTAGATCTATC+AGG 0.415643 7:-57893319 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGCTCTTATTGCTCTGTCTT+GGG 0.417234 7:-57895117 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGCATTCTGTCTTGTTTGGA+TGG 0.418247 7:-57894760 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGTCTTCAATTCTTTGAAGA+TGG 0.422518 7:+57894974 None:intergenic
GTATCTTACAACACAATAAC+AGG 0.430109 7:-57892779 MsG0780039096.01.T01:CDS
CCAAATAACTTATCTGGAGA+TGG 0.433259 7:-57892599 MsG0780039096.01.T01:CDS
GAGGGTAATCAATTTCTTTG+TGG 0.434740 7:-57891528 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGATATTTCATTGTTGCTA+AGG 0.434750 7:+57892180 None:intergenic
ATGTCCAGTAATCATCTTGA+AGG 0.438300 7:-57892401 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATTCAATAATGAAGCCACTT+TGG 0.453938 7:-57891172 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR
ATGAAAGGTAATAACTTCAC+TGG 0.455570 7:-57892101 MsG0780039096.01.T01:CDS
GGCCTACACATCAATATTGT+TGG 0.456033 7:-57891379 MsG0780039096.01.T01:CDS
GAGGAGGATGGGATGGAAGA+TGG 0.457840 7:+57892822 None:intergenic
CTGTCTGATAATGAATTGTC+TGG 0.458175 7:-57892629 MsG0780039096.01.T01:CDS
CCACATAAGTCAAATTGTAT+TGG 0.460498 7:+57892951 None:intergenic
GTAGCTGGTGTTTGTCCGCC+TGG 0.462297 7:+57891480 None:intergenic
CAATAAAATTATTGTGAGAA+AGG 0.462475 7:+57892030 None:intergenic
GCAGAAGAGTTTACAAAAGA+AGG 0.467130 7:+57892299 None:intergenic
CTTGAGTCATAATTATATGT+TGG 0.467445 7:-57894794 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGCAACAATGAAATATCAAA+TGG 0.468803 7:-57892176 MsG0780039096.01.T01:CDS
CGGATGGAGATGATGATACT+TGG 0.470653 7:-57891437 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATCAAAGTTGCTGCATTTGG+AGG 0.470758 7:-57894576 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTATTTGAATGACATTGGAT+TGG 0.471957 7:-57894477 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAACCTCTAAAGAGCTTAAG+TGG 0.473597 7:+57892657 None:intergenic
TGATGTATTGTGAAGGGTGT+TGG 0.474953 7:-57895154 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGAAATTTCTCCTTATGAA+AGG 0.476051 7:-57892116 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTTGGCTGATATCAGCAATT+CGG 0.476756 7:-57894713 MsG0780039096.01.T01:CDS
CAATCTACAAGAGTGGTTAC+CGG 0.481125 7:-57893581 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGTGAACATGACATCCCTT+CGG 0.481158 7:-57893264 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATCCCATCCTCCTCTCAACT+TGG 0.481840 7:-57892813 MsG0780039096.01.T01:CDS
CCATCCGTGTTCAAGCCATC+TGG 0.485431 7:+57891453 None:intergenic
TCTATCAGGCAATGAATTTG+TGG 0.485653 7:-57893305 MsG0780039096.01.T01:CDS
GAACTGTATTTGAATGACAT+TGG 0.489290 7:-57894482 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTTGCTCAAATGGATAAATC+TGG 0.492332 7:+57892277 None:intergenic
AGATTGGTCTAAGCTTAAGT+TGG 0.492339 7:-57893338 MsG0780039096.01.T01:CDS
CAAATAACTTATCTGGAGAT+GGG 0.494804 7:-57892598 MsG0780039096.01.T01:CDS
TCTGGATACTCATTCTCAAA+AGG 0.498497 7:+57891978 None:intergenic
TCAATTTCTGCAACCTCTGA+CGG 0.498961 7:+57892371 None:intergenic
AAGCCATCTGGTAATGTAGC+TGG 0.504707 7:+57891465 None:intergenic
GTCAAGTTTCCTAGCTCAGA+TGG 0.505770 7:+57891789 None:intergenic
GAAAATTGTGTGAATGACAT+AGG 0.508552 7:+57893136 None:intergenic
CACACACAACTATGAAAACA+TGG 0.511806 7:-57893057 MsG0780039096.01.T01:CDS
TACAGCCTACCTTGTATATG+AGG 0.513790 7:+57894446 None:intergenic
ATCCTTATTGGAGGCAAGCA+TGG 0.514608 7:-57891332 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTATCAGGCAATGAATTTGT+GGG 0.514906 7:-57893304 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATGAAATCCTACCATCACTT+GGG 0.515599 7:-57894523 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATGTCTATAAATGCAATTCA+CGG 0.515975 7:-57892701 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTATATCTAAATATCTTAGC+TGG 0.516844 7:+57892057 None:intergenic
TCAGAGGTTGCAGAAATTGA+AGG 0.516867 7:-57892368 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGACTTATGTGGATTTCAC+TGG 0.517809 7:-57892941 MsG0780039096.01.T01:CDS
TATCTGGTGCAACACCTGAA+TGG 0.525037 7:-57891587 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAGAAAGTTTGGAAGTGGAA+TGG 0.526199 7:+57892979 None:intergenic
TGACATATTTGTTGTTGGGT+GGG 0.530196 7:-57892559 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTTGAATGCAACACCACCAC+TGG 0.531121 7:-57895059 MsG0780039096.01.T01:CDS
ACAGTACTGATTGTTGTGAA+TGG 0.539227 7:-57895088 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATTTGATGAAAGCAGCTATG+AGG 0.540118 7:-57891547 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGAAATATGAAACGTTTAGT+GGG 0.542712 7:-57895215 MsG0780039096.01.T01:exon
TATACATCAATCCTTATTGG+AGG 0.543864 7:-57891341 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTTGATGAAAGCAGCTATGA+GGG 0.545511 7:-57891546 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATAGTTAAGTGATCTAGTAT+TGG 0.546519 7:+57895007 None:intergenic
GAATTTCTACTACTTCATTG+AGG 0.546536 7:-57891283 MsG0780039096.01.T01:CDS
GGTAGCATCCCATCTGAGCT+AGG 0.550605 7:-57891798 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAAGGGACAATTCTTGGTGG+AGG 0.551217 7:-57893514 MsG0780039096.01.T01:intron
CAGACAATTCATTATCAGAC+AGG 0.553801 7:+57892630 None:intergenic
TGGATATGTCAGTAAATGAC+AGG 0.555405 7:+57894946 None:intergenic
AATTAAGATTCCTAATAGAT+GGG 0.555761 7:+57893554 None:intergenic
AATTGTACAAGAACTGATCA+AGG 0.555909 7:-57894924 MsG0780039096.01.T01:intron
TTGACATATTTGTTGTTGGG+TGG 0.558780 7:-57892560 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTCCTAATAGATGGGAAAGC+CGG 0.561233 7:+57893562 None:intergenic
TTGCCAAGTTGAGAGGAGGA+TGG 0.563895 7:+57892810 None:intergenic
TCAATTGTTGCCAAGTTGAG+AGG 0.567505 7:+57892803 None:intergenic
TCAAGTTTCCTAGCTCAGAT+GGG 0.568736 7:+57891790 None:intergenic
CAAGTGAAGTAAGTCTAGCA+AGG 0.572474 7:+57893194 None:intergenic
AAGTTGAGAGGAGGATGGGA+TGG 0.573765 7:+57892815 None:intergenic
CTTTCTTTCAACATGTTGAG+TGG 0.573854 7:-57891675 MsG0780039096.01.T01:CDS
TGAAGGATCTATTCCGTCAG+AGG 0.574980 7:-57892384 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTCAATCCACTTAGTTGAGG+AGG 0.575310 7:+57891645 None:intergenic
TTTCATACACTAAACCAAAG+TGG 0.575469 7:+57891158 None:intergenic
CCAGATGGCTTGAACACGGA+TGG 0.579014 7:-57891453 MsG0780039096.01.T01:CDS
TCAATTGTCTTCAACAACAA+AGG 0.580232 7:-57893008 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTTGAGAATGAGTATCCAGA+TGG 0.581205 7:-57891975 MsG0780039096.01.T01:CDS
TACCAACAATATTGATGTGT+AGG 0.581717 7:+57891377 None:intergenic
TTTAAAGGGACAATTCTTGG+TGG 0.582579 7:-57893517 MsG0780039096.01.T01:CDS
GACTCAGATCCTCATATACA+AGG 0.584781 7:-57894455 MsG0780039096.01.T01:intron
AAGTGAAGTAAGTCTAGCAA+GGG 0.585251 7:+57893195 None:intergenic
TATGAAGTGATTTATGGTGA+AGG 0.585509 7:-57891942 MsG0780039096.01.T01:CDS
CAGTAAGTGCCAAAGTCCGA+AGG 0.587754 7:+57893248 None:intergenic
GAAGTAAGTCTAGCAAGGGT+AGG 0.588428 7:+57893199 None:intergenic
TCATAGTTGTGTGTGAGTCA+AGG 0.590228 7:+57893065 None:intergenic
CAAATTCCTCCTCAACTAAG+TGG 0.592077 7:-57891651 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAATAACTTATCTGGAGATG+GGG 0.592131 7:-57892597 MsG0780039096.01.T01:CDS
AAAATTGTGTGAATGACATA+GGG 0.595109 7:+57893137 None:intergenic
TGAAAGGTAATAACTTCACT+GGG 0.595842 7:-57892100 MsG0780039096.01.T01:CDS
GTCATGTTCACAAAAGATGA+GGG 0.597331 7:+57893274 None:intergenic
TGTACCAAATTGGAAAATGT+AGG 0.597589 7:+57891714 None:intergenic
GCACTTGCAATTGAAATTTG+GGG 0.602151 7:+57893032 None:intergenic
AATGAAATCCTACCATCACT+TGG 0.603795 7:-57894524 MsG0780039096.01.T01:CDS
ACCAAATTGGAAAATGTAGG+TGG 0.604513 7:+57891717 None:intergenic
TGTCATGTTCACAAAAGATG+AGG 0.607437 7:+57893273 None:intergenic
CATAAGGAGAAATTTCAAGT+CGG 0.609751 7:+57892121 None:intergenic
AAGATGGAAATTTCCTACAA+AGG 0.609950 7:+57892838 None:intergenic
TACTTGGGATGCTACCAGAA+AGG 0.612115 7:+57892531 None:intergenic
TGCCAAGTTGAGAGGAGGAT+GGG 0.622892 7:+57892811 None:intergenic
CACACTGAATACTGCAAGGG+AGG 0.626796 7:+57891623 None:intergenic
TGAAATCCTACCATCACTTG+GGG 0.627075 7:-57894522 MsG0780039096.01.T01:CDS
CTTGAAGTGATGTATTGTGA+AGG 0.627096 7:-57895161 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATTGTTGCCAAGTTGAGAGG+AGG 0.630373 7:+57892806 None:intergenic
AAGGTCTAGAGTCACTAGGA+GGG 0.633650 7:+57892199 None:intergenic
TATCAGGCAATGAATTTGTG+GGG 0.634761 7:-57893303 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATGGAAGCAATCTACAAGAG+TGG 0.634928 7:-57893588 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGTAAGTGCCAAAGTCCGAA+GGG 0.635023 7:+57893249 None:intergenic
CTCCCTTGCAGTATTCAGTG+TGG 0.644326 7:-57891622 MsG0780039096.01.T01:CDS
ATGCCACACTGAATACTGCA+AGG 0.645701 7:+57891619 None:intergenic
TTCACTGGTTGTAAACTAAG+CGG 0.649497 7:-57892926 MsG0780039096.01.T01:CDS
AATTGTTGTAACGTATGTCG+AGG 0.653278 7:+57894552 None:intergenic
TAAGGTCTAGAGTCACTAGG+AGG 0.653314 7:+57892198 None:intergenic
ATTACCAGATGGCTTGAACA+CGG 0.654522 7:-57891457 MsG0780039096.01.T01:CDS
GGTGCAACACCTGAATGGAA+AGG 0.655266 7:-57891582 MsG0780039096.01.T01:CDS
ACACCAGCTACATTACCAGA+TGG 0.662565 7:-57891468 MsG0780039096.01.T01:CDS
GGATGGAGATGATGATACTT+GGG 0.668305 7:-57891436 MsG0780039096.01.T01:CDS
TTGAAGTGATGTATTGTGAA+GGG 0.673396 7:-57895160 MsG0780039096.01.T01:CDS
AATAACTTATCTGGAGATGG+GGG 0.674169 7:-57892596 MsG0780039096.01.T01:CDS
TGCCACACTGAATACTGCAA+GGG 0.678020 7:+57891620 None:intergenic
TGCTAAGGTCTAGAGTCACT+AGG 0.678594 7:+57892195 None:intergenic
GTGGAAATGTATTACATGTG+AGG 0.682471 7:-57891235 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR
GAGGTCAATCCACTTAGTTG+AGG 0.686016 7:+57891642 None:intergenic
TCATGTTCACAAAAGATGAG+GGG 0.689555 7:+57893275 None:intergenic
ATTTCAAGTCGGTATAACTG+AGG 0.691331 7:+57892132 None:intergenic
ACTGATTGTTGTGAATGGAA+AGG 0.697132 7:-57895083 MsG0780039096.01.T01:CDS
ACACACAACTATGAAAACAT+GGG 0.697733 7:-57893056 MsG0780039096.01.T01:CDS
TGGAGATGATGATACTTGGG+TGG 0.700151 7:-57891433 MsG0780039096.01.T01:CDS
AGGCCACAACAAAAGTCACA+CGG 0.706331 7:+57891397 None:intergenic
GAAATCCTACCATCACTTGG+GGG 0.723144 7:-57894521 MsG0780039096.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAAGTAATAATAATTTCAT+TGG - Chr7:57893898-57893917 MsG0780039096.01.T01:intron 10.0%
!! TAATATGTAAATGAAAATTA+TGG + Chr7:57891519-57891538 None:intergenic 10.0%
!!! TATTAAAATATCTTTTTTTC+TGG + Chr7:57892271-57892290 None:intergenic 10.0%
!! AAAAAGAAATTAAAAACCTT+AGG + Chr7:57892940-57892959 None:intergenic 15.0%
!! ATCAAGAAAAAAAAAAAGAT+TGG - Chr7:57892060-57892079 MsG0780039096.01.T01:CDS 15.0%
!! GTCATAAATTAAAACATATT+TGG + Chr7:57892591-57892610 None:intergenic 15.0%
!! TTATCTCATAATAAGTTAAA+TGG - Chr7:57894552-57894571 MsG0780039096.01.T01:CDS 15.0%
!!! TCTTTTTTTTTTTCTTGATA+AGG + Chr7:57892059-57892078 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCTCACAATAATTTTATT+GGG - Chr7:57894343-57894362 MsG0780039096.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTACTCTATTCTATAAA+GGG - Chr7:57892163-57892182 MsG0780039096.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTTACTCTATTCTATAA+AGG - Chr7:57892162-57892181 MsG0780039096.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATTAAGATTCCTAATAGA+TGG + Chr7:57892821-57892840 None:intergenic 20.0%
!! AATTAAGATTCCTAATAGAT+GGG + Chr7:57892820-57892839 None:intergenic 20.0%
!! ATAAAAATTTCACCTAAACA+GGG + Chr7:57892997-57893016 None:intergenic 20.0%
!! ATATTCTATGAAGTGATTTA+TGG - Chr7:57894423-57894442 MsG0780039096.01.T01:intron 20.0%
!! ATTAGAAAACAACACAAAAA+TGG - Chr7:57893486-57893505 MsG0780039096.01.T01:intron 20.0%
!! CAATAAAATTATTGTGAGAA+AGG + Chr7:57894344-57894363 None:intergenic 20.0%
!! GAAATTAAGAAAACTAAAAC+TGG + Chr7:57891707-57891726 None:intergenic 20.0%
!! GAACTATATATAACAGATTT+GGG - Chr7:57894451-57894470 MsG0780039096.01.T01:intron 20.0%
!! TATTGGTAAAAAAGAAAGTT+TGG + Chr7:57893406-57893425 None:intergenic 20.0%
!! TTAAGTAAAAAAGGTTACTT+GGG + Chr7:57893858-57893877 None:intergenic 20.0%
!! TTTAAATTGAATTACTACTC+TGG - Chr7:57892480-57892499 MsG0780039096.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTAAGTAAAAAAGGTTACT+TGG + Chr7:57893859-57893878 None:intergenic 20.0%
!!! AATCACTTTATTGGTAATAT+TGG - Chr7:57893148-57893167 MsG0780039096.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACAAATCTTATTTATATGTC+TGG - Chr7:57894522-57894541 MsG0780039096.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGCTTGAACTATTTTTTATT+TGG + Chr7:57893936-57893955 None:intergenic 20.0%
!!! CGATGTTATTTAAGTAAAAA+AGG + Chr7:57893867-57893886 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTCTCACAATAATTTTAT+TGG - Chr7:57894342-57894361 MsG0780039096.01.T01:intron 20.0%
!!! TAATTTATTGCTACTTAGAT+TGG - Chr7:57892028-57892047 MsG0780039096.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTACAAGTTTTTTTAATAG+TGG - Chr7:57895117-57895136 MsG0780039096.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCTCACAATAATTTTATTG+GGG - Chr7:57894344-57894363 MsG0780039096.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGTTTTCTAATAACCAATT+TGG + Chr7:57893478-57893497 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTATCCGATTAAAACAAT+TGG - Chr7:57892692-57892711 MsG0780039096.01.T01:CDS 20.0%
! AAAATTGTGTGAATGACATA+GGG + Chr7:57893237-57893256 None:intergenic 25.0%
! AAGAAATATGAAACGTTTAG+TGG - Chr7:57891155-57891174 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! AGAAATATGAAACGTTTAGT+GGG - Chr7:57891156-57891175 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! AGCAACAATGAAATATCAAA+TGG - Chr7:57894195-57894214 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! ATAGTTAAGTGATCTAGTAT+TGG + Chr7:57891367-57891386 None:intergenic 25.0%
! ATGTCTATAAATGCAATTCA+CGG - Chr7:57893670-57893689 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! ATGTTTAGATGAACCAAATT+TGG + Chr7:57893652-57893671 None:intergenic 25.0%
! CAATACCCAATAAAATTCAA+AGG + Chr7:57892508-57892527 None:intergenic 25.0%
! CATTATTTATTAAACACTCC+AGG + Chr7:57892535-57892554 None:intergenic 25.0%
! CTTAAATAACATCGAATGTT+TGG - Chr7:57893873-57893892 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! CTTACTGATAATCACTTTAT+TGG - Chr7:57893139-57893158 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! CTTGAGTCATAATTATATGT+TGG - Chr7:57891577-57891596 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! GAAATACCAAATAACTTATC+TGG - Chr7:57893766-57893785 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! GACAATTCATAATATATGCA+AGG - Chr7:57892224-57892243 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! GATAAAAATTTCACCTAAAC+AGG + Chr7:57892998-57893017 None:intergenic 25.0%
! GGAACTATATATAACAGATT+TGG - Chr7:57894450-57894469 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! GTATATCTAAATATCTTAGC+TGG + Chr7:57894317-57894336 None:intergenic 25.0%
! GTCAAAAAATTTAAGCAGAT+TGG - Chr7:57892730-57892749 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAAAAGAAAGTTTGGAAG+TGG + Chr7:57893400-57893419 None:intergenic 25.0%
! TAAAAATTTCACCTAAACAG+GGG + Chr7:57892996-57893015 None:intergenic 25.0%
! TACTAGATCACTTAACTATT+CGG - Chr7:57891368-57891387 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TATCGAAAAACATGTTTAGT+GGG - Chr7:57894133-57894152 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! TGAAGTTATTACCTTTCATA+AGG + Chr7:57894269-57894288 None:intergenic 25.0%
! TGAGATATAACGAGTTTAAA+GGG - Chr7:57892840-57892859 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TGGATATTCTTGATTTAGAT+TGG - Chr7:57892750-57892769 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAGTTCATCTATGGTAAT+GGG - Chr7:57893272-57893291 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGATTGGAATAGGATAAA+TGG - Chr7:57892764-57892783 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCGAAAAACATGTTTAG+TGG - Chr7:57894132-57894151 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! TTCTTGATTTAGATTGGAAT+AGG - Chr7:57892756-57892775 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAAATTTCTCCTTATGAA+AGG - Chr7:57894255-57894274 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
! TTGAGATATAACGAGTTTAA+AGG - Chr7:57892839-57892858 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATATTTCATTGTTGCTA+AGG + Chr7:57894194-57894213 None:intergenic 25.0%
!! CAGTTCAATTTTTCCAAATT+TGG - Chr7:57893636-57893655 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
!! CTGGAGTGTTTAATAAATAA+TGG - Chr7:57892533-57892552 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTGAATATCTCAATTTTGA+AGG - Chr7:57893196-57893215 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATGCAGTGTTGAAAAATT+TGG - Chr7:57891544-57891563 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGGTTTTACTATATAGGAT+TGG - Chr7:57895058-57895077 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATTTGACATATTTGTTGTT+GGG - Chr7:57893808-57893827 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
!!! CGAACTTTTATTTTTCAGAT+TGG - Chr7:57893017-57893036 MsG0780039096.01.T01:CDS 25.0%
!!! CGTAATCCAATTGTTTTAAT+CGG + Chr7:57892701-57892720 None:intergenic 25.0%
!!! GAACTATTTTTTATTTGGCT+TGG + Chr7:57893931-57893950 None:intergenic 25.0%
!!! TCATTTGACATATTTGTTGT+TGG - Chr7:57893807-57893826 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAATTTGTTGTTGCTCAAA+TGG + Chr7:57894107-57894126 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTCCAACAATTTTTTTAC+CGG - Chr7:57894624-57894643 MsG0780039096.01.T01:intron 25.0%
AAAAATTTCACCTAAACAGG+GGG + Chr7:57892995-57893014 None:intergenic 30.0%
AAATAACTTATCTGGAGATG+GGG - Chr7:57893774-57893793 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
AAGATGGAAATTTCCTACAA+AGG + Chr7:57893536-57893555 None:intergenic 30.0%
AAGCACTTGCAATTGAAATT+TGG + Chr7:57893344-57893363 None:intergenic 30.0%
AATTGTACAAGAACTGATCA+AGG - Chr7:57891447-57891466 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
ACAACGGATAAATAGAAGAA+TGG + Chr7:57892357-57892376 None:intergenic 30.0%
ACACACAACTATGAAAACAT+GGG - Chr7:57893315-57893334 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
ACATTATGAATCACAACCTA+AGG - Chr7:57892921-57892940 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
AGCACTTGCAATTGAAATTT+GGG + Chr7:57893343-57893362 None:intergenic 30.0%
ATGAAAGGTAATAACTTCAC+TGG - Chr7:57894270-57894289 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
ATGACATAGGGAATTCAAAT+TGG + Chr7:57893225-57893244 None:intergenic 30.0%
ATTCAATAATGAAGCCACTT+TGG - Chr7:57895199-57895218 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
CAAAACTGTCTGAAAATCTA+TGG + Chr7:57891764-57891783 None:intergenic 30.0%
CAAATAACTTATCTGGAGAT+GGG - Chr7:57893773-57893792 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
CATTACCATAGATGAACTTA+AGG + Chr7:57893273-57893292 None:intergenic 30.0%
CCACATAAGTCAAATTGTAT+TGG + Chr7:57893423-57893442 None:intergenic 30.0%
CTTAAGTTCATCTATGGTAA+TGG - Chr7:57893271-57893290 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCACAAAACAATTTGTC+AGG - Chr7:57894042-57894061 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
GAAAATTGTGTGAATGACAT+AGG + Chr7:57893238-57893257 None:intergenic 30.0%
GAACTGTATTTGAATGACAT+TGG - Chr7:57891889-57891908 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
GAACTTAAGGTTTGAATGAT+TGG + Chr7:57893260-57893279 None:intergenic 30.0%
GAATTTCTACTACTTCATTG+AGG - Chr7:57895088-57895107 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
GTATCTTACAACACAATAAC+AGG - Chr7:57893592-57893611 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
GTATTTGAATGACATTGGAT+TGG - Chr7:57891894-57891913 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TACCAACAATATTGATGTGT+AGG + Chr7:57894997-57895016 None:intergenic 30.0%
TATACATCAATCCTTATTGG+AGG - Chr7:57895030-57895049 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TATGAAGTGATTTATGGTGA+AGG - Chr7:57894429-57894448 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
TCAAACCTTAAGTTCATCTA+TGG - Chr7:57893265-57893284 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TCAATTGTCTTCAACAACAA+AGG - Chr7:57893363-57893382 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
TCATAGAATATTCTTCCATC+TGG + Chr7:57894414-57894433 None:intergenic 30.0%
TCCAATAAGGATTGATGTAT+AGG + Chr7:57895031-57895050 None:intergenic 30.0%
TCCTATACATCAATCCTTAT+TGG - Chr7:57895027-57895046 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCTATTTATCCGTTGTA+GGG - Chr7:57892358-57892377 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAGGTAATAACTTCACT+GGG - Chr7:57894271-57894290 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
TGTACCAAATTGGAAAATGT+AGG + Chr7:57894660-57894679 None:intergenic 30.0%
TTAAGTGTCAACAACTTGAA+TGG - Chr7:57891981-57892000 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTCTATTTATCCGTTGT+AGG - Chr7:57892357-57892376 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
TTGAAGTGATGTATTGTGAA+GGG - Chr7:57891211-57891230 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TTGAATGCCTAAATACCTTT+AGG + Chr7:57892450-57892469 None:intergenic 30.0%
TTGATCAGTTCTTGTACAAT+TGG + Chr7:57891448-57891467 None:intergenic 30.0%
TTTCATACACTAAACCAAAG+TGG + Chr7:57895216-57895235 None:intergenic 30.0%
TTTCCCGGTAAAAAAATTGT+TGG + Chr7:57894631-57894650 None:intergenic 30.0%
! ACAATTGGATTACGTTTTTC+AGG - Chr7:57892707-57892726 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
! AGTCTTCAATTCTTTGAAGA+TGG + Chr7:57891400-57891419 None:intergenic 30.0%
! CAATTGGATTACGTTTTTCA+GGG - Chr7:57892708-57892727 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
! CATAAGGAGAAATTTCAAGT+CGG + Chr7:57894253-57894272 None:intergenic 30.0%
! CATAGATTTTCAGACAGTTT+TGG - Chr7:57891762-57891781 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
! CCAATACAATTTGACTTATG+TGG - Chr7:57893420-57893439 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
! TGGCACCTTTGAATTTTATT+GGG - Chr7:57892500-57892519 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTTGTTCCTAAAGGTATTT+AGG - Chr7:57892440-57892459 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
!! CAAGCATGGTTTTACTATAT+AGG - Chr7:57895053-57895072 MsG0780039096.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATATCTTTTTTTCTGGTGC+TGG + Chr7:57892265-57892284 None:intergenic 30.0%
!!! ATATCTTTTTTTCTGGTGCT+GGG + Chr7:57892264-57892283 None:intergenic 30.0%
!!! TGTCCAACAATTTTTTTACC+GGG - Chr7:57894625-57894644 MsG0780039096.01.T01:intron 30.0%
AAAATTTCACCTAAACAGGG+GGG + Chr7:57892994-57893013 None:intergenic 35.0%
AAGAAAGTTTGGAAGTGGAA+TGG + Chr7:57893395-57893414 None:intergenic 35.0%
AAGTGAAGTAAGTCTAGCAA+GGG + Chr7:57893179-57893198 None:intergenic 35.0%
AATAACTTATCTGGAGATGG+GGG - Chr7:57893775-57893794 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
AATGAAATCCTACCATCACT+TGG - Chr7:57891847-57891866 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
AATGGATCGCTTGATATTAG+TGG - Chr7:57891999-57892018 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
AATTGTTGTAACGTATGTCG+AGG + Chr7:57891822-57891841 None:intergenic 35.0%
ACCAAATTGGAAAATGTAGG+TGG + Chr7:57894657-57894676 None:intergenic 35.0%
ACTCTCAACTTGTACCAAAT+TGG + Chr7:57894670-57894689 None:intergenic 35.0%
ACTGATTGTTGTGAATGGAA+AGG - Chr7:57891288-57891307 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
AGATCCTTCAAGATGATTAC+TGG + Chr7:57893977-57893996 None:intergenic 35.0%
AGCAATTCGGTTTCATTTCA+CGG - Chr7:57891671-57891690 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAATCCTACCATCACTT+GGG - Chr7:57891848-57891867 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
ATGTCCAGTAATCATCTTGA+AGG - Chr7:57893970-57893989 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
ATTTGATGAAAGCAGCTATG+AGG - Chr7:57894824-57894843 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
CACACACAACTATGAAAACA+TGG - Chr7:57893314-57893333 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
CAGACAATTCATTATCAGAC+AGG + Chr7:57893744-57893763 None:intergenic 35.0%
CCAAATAACTTATCTGGAGA+TGG - Chr7:57893772-57893791 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
CCATCTCCAGATAAGTTATT+TGG + Chr7:57893775-57893794 None:intergenic 35.0%
CTAAATTGTCCTTTCCATTC+AGG + Chr7:57894801-57894820 None:intergenic 35.0%
CTATCAGGCAATGAATTTGT+GGG - Chr7:57893067-57893086 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
CTTCAGAATTGTTCCTTTGT+AGG - Chr7:57893520-57893539 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
CTTGAAGTGATGTATTGTGA+AGG - Chr7:57891210-57891229 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
CTTTCTTTCAACATGTTGAG+TGG - Chr7:57894696-57894715 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
GAGGGTAATCAATTTCTTTG+TGG - Chr7:57894843-57894862 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
GAGTTTAAAGGGACAATTCT+TGG - Chr7:57892851-57892870 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
GCACTTGCAATTGAAATTTG+GGG + Chr7:57893342-57893361 None:intergenic 35.0%
GCAGAAGAGTTTACAAAAGA+AGG + Chr7:57894075-57894094 None:intergenic 35.0%
GGGGAAATACCTAAATGTTT+GGG - Chr7:57894363-57894382 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
GTCATGTTCACAAAAGATGA+GGG + Chr7:57893100-57893119 None:intergenic 35.0%
GTGGAAATGTATTACATGTG+AGG - Chr7:57895136-57895155 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
GTGGCATACAACAATTTATC+TGG - Chr7:57894768-57894787 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCTCAAATGGATAAATC+TGG + Chr7:57894097-57894116 None:intergenic 35.0%
TAAGAAAACTAAAACTGGCC+CGG + Chr7:57891702-57891721 None:intergenic 35.0%
TATCAGGCAATGAATTTGTG+GGG - Chr7:57893068-57893087 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
TCATGTTCACAAAAGATGAG+GGG + Chr7:57893099-57893118 None:intergenic 35.0%
TCTATCAGGCAATGAATTTG+TGG - Chr7:57893066-57893085 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
TCTGGATACTCATTCTCAAA+AGG + Chr7:57894396-57894415 None:intergenic 35.0%
TGGATATGTCAGTAAATGAC+AGG + Chr7:57891428-57891447 None:intergenic 35.0%
TGGGGAAATACCTAAATGTT+TGG - Chr7:57894362-57894381 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
TGTCATGTTCACAAAAGATG+AGG + Chr7:57893101-57893120 None:intergenic 35.0%
TTCATCAAAGTTGCTGCATT+TGG - Chr7:57891792-57891811 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCTTAAATCTCTGTCGT+TGG - Chr7:57891640-57891659 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
TTGACTTATGTGGATTTCAC+TGG - Chr7:57893430-57893449 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
TTGGAAGAGTTAGATCTATC+AGG - Chr7:57893052-57893071 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
TTTAAAGGGACAATTCTTGG+TGG - Chr7:57892854-57892873 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAGAATGAGTATCCAGA+TGG - Chr7:57894396-57894415 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
TTTGATGAAAGCAGCTATGA+GGG - Chr7:57894825-57894844 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
! AAACCTCTAAAGAGCTTAAG+TGG + Chr7:57893717-57893736 None:intergenic 35.0%
! AAATGTAGGTGGAATTTTCC+CGG + Chr7:57894646-57894665 None:intergenic 35.0%
! ATTTCAAGTCGGTATAACTG+AGG + Chr7:57894242-57894261 None:intergenic 35.0%
! CTGGCACCTTTGAATTTTAT+TGG - Chr7:57892499-57892518 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
! CTGTCTGATAATGAATTGTC+TGG - Chr7:57893742-57893761 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
! GGCATTTTACCCAAACATTT+AGG + Chr7:57894375-57894394 None:intergenic 35.0%
! GTCGATTTAGTTGTTCCTAA+AGG - Chr7:57892432-57892451 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
! TATCAGCATTCTGTCTTGTT+TGG - Chr7:57891607-57891626 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
! TCCACCTACATTTTCCAATT+TGG - Chr7:57894653-57894672 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
! TTCACTGGTTGTAAACTAAG+CGG - Chr7:57893445-57893464 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
!! ACAGTACTGATTGTTGTGAA+TGG - Chr7:57891283-57891302 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
!! AGATTGGTCTAAGCTTAAGT+TGG - Chr7:57893033-57893052 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTAAGCTCTTTAGAGGTTT+TGG - Chr7:57893717-57893736 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
!! TGACATATTTGTTGTTGGGT+GGG - Chr7:57893812-57893831 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
!! TTGACATATTTGTTGTTGGG+TGG - Chr7:57893811-57893830 MsG0780039096.01.T01:intron 35.0%
!! TTTATTGGGTATTGAAAGCC+TGG - Chr7:57892514-57892533 MsG0780039096.01.T01:CDS 35.0%
!!! TATCTTTTTTTCTGGTGCTG+GGG + Chr7:57892263-57892282 None:intergenic 35.0%
AAGCCACTTAAGCTCTTTAG+AGG - Chr7:57893711-57893730 MsG0780039096.01.T01:intron 40.0%
AAGCTCTTATTGCTCTGTCT+TGG - Chr7:57891253-57891272 MsG0780039096.01.T01:exon 40.0%
AGCTCTTATTGCTCTGTCTT+GGG - Chr7:57891254-57891273 MsG0780039096.01.T01:exon 40.0%
ATCAAAGTTGCTGCATTTGG+AGG - Chr7:57891795-57891814 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAAGCAATCTACAAGAG+TGG - Chr7:57892783-57892802 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
ATTACCAGATGGCTTGAACA+CGG - Chr7:57894914-57894933 MsG0780039096.01.T01:intron 40.0%
CAAATTCCTCCTCAACTAAG+TGG - Chr7:57894720-57894739 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
CAAGTGAAGTAAGTCTAGCA+AGG + Chr7:57893180-57893199 None:intergenic 40.0%
CAATCTACAAGAGTGGTTAC+CGG - Chr7:57892790-57892809 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
CACTTAGTTGAGGAGGAATT+TGG + Chr7:57894722-57894741 None:intergenic 40.0%
CAGATCCTCATATACAAGGT+AGG - Chr7:57891920-57891939 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
CTTAAGTGGCTTAGCTCATA+AGG + Chr7:57893703-57893722 None:intergenic 40.0%
CTTAGCTGGCATAATTGCTT+TGG + Chr7:57894303-57894322 None:intergenic 40.0%
GACTCAGATCCTCATATACA+AGG - Chr7:57891916-57891935 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
GGATGGAGATGATGATACTT+GGG - Chr7:57894935-57894954 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
GGCCTACACATCAATATTGT+TGG - Chr7:57894992-57895011 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
GTTGGCTGATATCAGCAATT+CGG - Chr7:57891658-57891677 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
TAAAGTCGACAACCCTACAA+CGG + Chr7:57892373-57892392 None:intergenic 40.0%
TAAGCGGAGAGTTTCCAAAT+TGG - Chr7:57893461-57893480 MsG0780039096.01.T01:intron 40.0%
TACAGCCTACCTTGTATATG+AGG + Chr7:57891928-57891947 None:intergenic 40.0%
TCAAGTTTCCTAGCTCAGAT+GGG + Chr7:57894584-57894603 None:intergenic 40.0%
TCAATTTCTGCAACCTCTGA+CGG + Chr7:57894003-57894022 None:intergenic 40.0%
TCAGAGGTTGCAGAAATTGA+AGG - Chr7:57894003-57894022 MsG0780039096.01.T01:intron 40.0%
TCATAGTTGTGTGTGAGTCA+AGG + Chr7:57893309-57893328 None:intergenic 40.0%
TGAAATCCTACCATCACTTG+GGG - Chr7:57891849-57891868 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
TTCCTAATAGATGGGAAAGC+CGG + Chr7:57892812-57892831 None:intergenic 40.0%
TTGTGAACATGACATCCCTT+CGG - Chr7:57893107-57893126 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
! GTAGCTTAGTTCAGTTGGTA+GGG - Chr7:57892202-57892221 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
! TCAATTGTTGCCAAGTTGAG+AGG + Chr7:57893571-57893590 None:intergenic 40.0%
! TGATGTATTGTGAAGGGTGT+TGG - Chr7:57891217-57891236 MsG0780039096.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! TTTCCGTGTGACTTTTGTTG+TGG - Chr7:57894971-57894990 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
!! AGCATTCTGTCTTGTTTGGA+TGG - Chr7:57891611-57891630 MsG0780039096.01.T01:CDS 40.0%
AAAGGGACAATTCTTGGTGG+AGG - Chr7:57892857-57892876 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
AACCATGCTTGCCTCCAATA+AGG + Chr7:57895044-57895063 None:intergenic 45.0%
ACACCAGCTACATTACCAGA+TGG - Chr7:57894903-57894922 MsG0780039096.01.T01:intron 45.0%
ACCAACTGAACTAAGCTACG+AGG + Chr7:57892201-57892220 None:intergenic 45.0%
AGGCCACAACAAAAGTCACA+CGG + Chr7:57894977-57894996 None:intergenic 45.0%
AGTAAGTGCCAAAGTCCGAA+GGG + Chr7:57893125-57893144 None:intergenic 45.0%
ATCAATATGCCCCCCTGTTT+AGG - Chr7:57892982-57893001 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
ATCCTTATTGGAGGCAAGCA+TGG - Chr7:57895039-57895058 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
ATGCCACACTGAATACTGCA+AGG + Chr7:57894755-57894774 None:intergenic 45.0%
CCAAAAAGTTGCAATCCAGG+CGG - Chr7:57894876-57894895 MsG0780039096.01.T01:intron 45.0%
CGGATGGAGATGATGATACT+TGG - Chr7:57894934-57894953 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
CGTAGCTTAGTTCAGTTGGT+AGG - Chr7:57892201-57892220 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
CTGCCAAAAAGTTGCAATCC+AGG - Chr7:57894873-57894892 MsG0780039096.01.T01:intron 45.0%
GAAATCCTACCATCACTTGG+GGG - Chr7:57891850-57891869 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTAAGTCTAGCAAGGGT+AGG + Chr7:57893175-57893194 None:intergenic 45.0%
GAGGTCAATCCACTTAGTTG+AGG + Chr7:57894732-57894751 None:intergenic 45.0%
GTCAAGTTTCCTAGCTCAGA+TGG + Chr7:57894585-57894604 None:intergenic 45.0%
GTCAATCCACTTAGTTGAGG+AGG + Chr7:57894729-57894748 None:intergenic 45.0%
TACTTGGGATGCTACCAGAA+AGG + Chr7:57893843-57893862 None:intergenic 45.0%
TATCTGGTGCAACACCTGAA+TGG - Chr7:57894784-57894803 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
TCCTCGTAGCTTAGTTCAGT+TGG - Chr7:57892197-57892216 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGGATCTATTCCGTCAG+AGG - Chr7:57893987-57894006 MsG0780039096.01.T01:intron 45.0%
TGCCACACTGAATACTGCAA+GGG + Chr7:57894754-57894773 None:intergenic 45.0%
TGGAGATGATGATACTTGGG+TGG - Chr7:57894938-57894957 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
TGGGGGATTCACATCTTTGA+AGG - Chr7:57891867-57891886 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
TTCGGTTTCATTTCACGGTG+AGG - Chr7:57891676-57891695 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
! AAGCCATCTGGTAATGTAGC+TGG + Chr7:57894909-57894928 None:intergenic 45.0%
! AAGGTCTAGAGTCACTAGGA+GGG + Chr7:57894175-57894194 None:intergenic 45.0%
! ATTGTTGCCAAGTTGAGAGG+AGG + Chr7:57893568-57893587 None:intergenic 45.0%
! TAAGGTCTAGAGTCACTAGG+AGG + Chr7:57894176-57894195 None:intergenic 45.0%
! TGCTAAGGTCTAGAGTCACT+AGG + Chr7:57894179-57894198 None:intergenic 45.0%
! TTTTGTGACTCTTCCAGTGG+TGG + Chr7:57891328-57891347 None:intergenic 45.0%
!! GAGTTTTGTGACTCTTCCAG+TGG + Chr7:57891331-57891350 None:intergenic 45.0%
!! GGATTGCAACTTTTTGGCAG+TGG + Chr7:57894873-57894892 None:intergenic 45.0%
!! TACCGGCTTTCCCATCTATT+AGG - Chr7:57892807-57892826 MsG0780039096.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGCAACTTTTTGGCAGTGG+AGG + Chr7:57894870-57894889 None:intergenic 45.0%
!! TTATCATAAATTAAAATAAT+CGG + Chr7:57892647-57892666 None:intergenic 5.0%
AAGTTGAGAGGAGGATGGGA+TGG + Chr7:57893559-57893578 None:intergenic 50.0%
ATCCCATCCTCCTCTCAACT+TGG - Chr7:57893558-57893577 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
CACACTGAATACTGCAAGGG+AGG + Chr7:57894751-57894770 None:intergenic 50.0%
CAGTAAGTGCCAAAGTCCGA+AGG + Chr7:57893126-57893145 None:intergenic 50.0%
CATGACATCCCTTCGGACTT+TGG - Chr7:57893114-57893133 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
CTCCCTTGCAGTATTCAGTG+TGG - Chr7:57894749-57894768 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
GATGTGAATCCCCCAAGTGA+TGG + Chr7:57891862-57891881 None:intergenic 50.0%
GGTGCAACACCTGAATGGAA+AGG - Chr7:57894789-57894808 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
GTTGAATGCAACACCACCAC+TGG - Chr7:57891312-57891331 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
GTTTCATTTCACGGTGAGGC+CGG - Chr7:57891680-57891699 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
TGAATCCCCCAAGTGATGGT+AGG + Chr7:57891858-57891877 None:intergenic 50.0%
TTGGGTGGGAATAGCCTTTC+TGG - Chr7:57893826-57893845 MsG0780039096.01.T01:intron 50.0%
TTTCATTTCACGGTGAGGCC+GGG - Chr7:57891681-57891700 MsG0780039096.01.T01:CDS 50.0%
! CCGCCTGGATTGCAACTTTT+TGG + Chr7:57894879-57894898 None:intergenic 50.0%
! TGCCAAGTTGAGAGGAGGAT+GGG + Chr7:57893563-57893582 None:intergenic 50.0%
! TGGTGCTGGGGTTTGAATCT+CGG + Chr7:57892251-57892270 None:intergenic 50.0%
! TTGCCAAGTTGAGAGGAGGA+TGG + Chr7:57893564-57893583 None:intergenic 50.0%
CCAGATGGCTTGAACACGGA+TGG - Chr7:57894918-57894937 MsG0780039096.01.T01:intron 55.0%
CCATCCGTGTTCAAGCCATC+TGG + Chr7:57894921-57894940 None:intergenic 55.0%
GAGGAGGATGGGATGGAAGA+TGG + Chr7:57893552-57893571 None:intergenic 55.0%
GGTAGCATCCCATCTGAGCT+AGG - Chr7:57894573-57894592 MsG0780039096.01.T01:CDS 55.0%
GTAGCTGGTGTTTGTCCGCC+TGG + Chr7:57894894-57894913 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 57891139 57895254 57891139 ID=MsG0780039096.01;Name=MsG0780039096.01
Chr7 mRNA 57891139 57895254 57891139 ID=MsG0780039096.01.T01;Parent=MsG0780039096.01;Name=MsG0780039096.01.T01;_AED=0.15;_eAED=0.15;_QI=23|0.75|1|1|1|1|5|121|955
Chr7 exon 57891139 57893358 57891139 ID=MsG0780039096.01.T01:exon:6592;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 exon 57893515 57893664 57893515 ID=MsG0780039096.01.T01:exon:6591;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 exon 57894456 57894626 57894456 ID=MsG0780039096.01.T01:exon:6590;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 exon 57894701 57894841 57894701 ID=MsG0780039096.01.T01:exon:6589;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 exon 57894925 57895254 57894925 ID=MsG0780039096.01.T01:exon:6588;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 57895232 57895254 57895232 ID=MsG0780039096.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 CDS 57894925 57895231 57894925 ID=MsG0780039096.01.T01:cds;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 CDS 57894701 57894841 57894701 ID=MsG0780039096.01.T01:cds;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 CDS 57894456 57894626 57894456 ID=MsG0780039096.01.T01:cds;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 CDS 57893515 57893664 57893515 ID=MsG0780039096.01.T01:cds;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 CDS 57891260 57893358 57891260 ID=MsG0780039096.01.T01:cds;Parent=MsG0780039096.01.T01
Chr7 three_prime_UTR 57891139 57891259 57891139 ID=MsG0780039096.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0780039096.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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