AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040410.01

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MsG0780040410.01.T01 AT1G62670 24.272 206 156 0 142 347 59 264 3.93e-15 77.4
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MsG0780040410.01.T01 AT5G41170 30.422 332 227 2 7 335 26 356 3.13e-45 161
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MsG0780040410.01.T01 AT5G41170 28.873 284 201 1 54 337 3 285 9.39e-41 149
MsG0780040410.01.T01 AT5G41170 25.402 311 231 1 25 335 9 318 3.10e-37 140
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MsG0780040410.01.T01 AT1G06580 26.966 356 257 2 3 358 23 375 1.23e-39 145
MsG0780040410.01.T01 AT1G06580 28.947 266 188 1 54 319 4 268 8.16e-38 140
MsG0780040410.01.T01 AT1G06580 26.953 256 148 5 14 232 139 392 1.66e-21 95.5
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MsG0780040410.01.T01 AT2G31400 26.000 200 145 3 133 330 237 435 1.95e-12 69.3
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MsG0780040410.01.T01 AT1G52620 27.236 246 128 3 57 252 519 763 3.97e-22 99.0
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MsG0780040410.01.T01 AT1G19290 26.708 322 230 4 24 342 121 439 9.26e-29 119
MsG0780040410.01.T01 AT1G19290 25.312 320 238 1 18 337 256 574 4.38e-28 117
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MsG0780040410.01.T01 AT1G18900 23.390 295 200 4 30 306 290 576 7.99e-20 92.0
MsG0780040410.01.T01 AT1G18900 26.087 345 248 5 1 342 341 681 2.14e-32 129
MsG0780040410.01.T01 AT1G18900 23.390 295 200 4 30 306 290 576 7.99e-20 92.0
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MsG0780040410.01.T01 AT1G79540 24.254 268 201 2 79 345 113 379 2.09e-19 90.9
MsG0780040410.01.T01 AT1G79540 23.263 331 217 5 4 298 424 753 4.40e-16 80.5
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MsG0780040410.01.T01 AT1G08610 24.126 286 216 1 60 345 106 390 7.78e-25 106
MsG0780040410.01.T01 AT1G08610 23.669 338 257 1 3 340 119 455 5.61e-24 104
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MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 27.653 311 219 4 49 354 125 434 1.01e-27 115
MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 24.399 291 213 3 13 303 267 550 6.36e-24 104
MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 25.610 328 240 2 4 330 532 856 5.05e-23 102
MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 28.708 209 148 1 55 263 652 859 5.69e-23 101
MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 25.668 374 232 8 1 335 460 826 2.45e-21 96.7
MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 23.565 331 197 8 13 301 302 618 1.02e-16 82.8
MsG0780040410.01.T01 AT5G57250 22.910 323 242 4 18 338 407 724 2.13e-15 78.6
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MsG0780040410.01.T01 AT4G01030 26.101 318 213 10 23 335 291 591 5.78e-18 86.3
MsG0780040410.01.T01 AT4G01030 25.481 208 149 3 4 211 307 508 2.99e-13 72.0
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MsG0780040410.01.T01 AT1G51965 27.863 262 182 2 65 320 382 642 8.80e-25 107
MsG0780040410.01.T01 AT1G51965 20.912 373 260 3 3 342 253 623 2.45e-17 84.3
MsG0780040410.01.T01 AT1G51965 22.767 347 247 6 38 375 151 485 6.47e-13 70.9
MsG0780040410.01.T01 AT1G02420 27.126 247 172 4 53 296 172 413 5.99e-25 106
MsG0780040410.01.T01 AT1G02420 29.121 182 114 5 4 177 196 370 1.50e-16 81.6
MsG0780040410.01.T01 AT1G02420 28.249 177 126 1 14 190 237 412 5.98e-14 73.6
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MsG0780040410.01.T01 AT1G05600 22.699 326 243 5 1 318 165 489 2.73e-22 99.0
MsG0780040410.01.T01 AT1G05600 20.308 389 267 6 2 347 95 483 1.44e-21 96.7
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MsG0780040410.01.T01 AT3G49240 24.104 307 213 7 21 311 128 430 1.02e-16 82.4
MsG0780040410.01.T01 AT3G49240 21.508 358 234 8 18 330 160 515 1.86e-15 78.6
MsG0780040410.01.T01 AT4G16835 24.818 274 196 4 25 297 251 515 1.06e-16 82.4
MsG0780040410.01.T01 AT4G16835 20.996 281 171 6 56 303 122 384 2.83e-14 75.1
MsG0780040410.01.T01 AT4G16835 24.111 253 176 5 20 272 152 388 2.83e-14 75.1
MsG0780040410.01.T01 AT4G16835 24.211 285 168 10 57 335 60 302 2.88e-13 72.0
MsG0780040410.01.T01 AT4G02750 24.675 308 179 7 47 318 270 560 1.22e-16 82.4
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MsG0780040410.01.T01 AT1G09190 24.306 288 192 8 16 299 102 367 2.50e-16 80.9
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MsG0780040410.01.T01 AT3G46610 25.628 199 147 1 43 241 443 640 3.15e-14 74.7
MsG0780040410.01.T01 AT3G46610 31.884 138 93 1 7 144 477 613 2.77e-11 65.9
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MsG0780040410.01.T01 AT1G05750 25.899 278 182 9 72 342 50 310 5.97e-13 70.5
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MsG0780040410.01.T01 AT5G03560 27.673 159 112 2 5 163 182 337 3.78e-11 64.7
MsG0780040410.01.T01 AT5G03560 29.078 141 97 2 135 273 203 342 9.97e-14 72.4
MsG0780040410.01.T01 AT5G03560 27.673 159 112 2 5 163 182 337 3.78e-11 64.7
MsG0780040410.01.T01 AT1G28690 21.790 257 191 4 43 298 258 505 1.10e-13 72.8
MsG0780040410.01.T01 AT1G28690 24.272 309 209 8 43 342 85 377 5.08e-13 70.9
MsG0780040410.01.T01 AT5G48910 27.957 186 125 2 93 278 208 384 1.18e-13 73.2
MsG0780040410.01.T01 AT1G71420 23.200 250 178 6 4 252 316 552 1.62e-13 72.8
MsG0780040410.01.T01 AT3G25210 24.000 200 116 2 42 241 207 370 1.66e-13 71.6
MsG0780040410.01.T01 AT3G25210 28.859 149 106 0 185 333 209 357 1.27e-12 68.9
MsG0780040410.01.T01 AT3G25210 21.481 270 202 3 39 298 88 357 2.65e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT5G02830 21.555 283 169 8 49 281 400 679 1.74e-13 72.8
MsG0780040410.01.T01 AT5G02830 22.148 298 199 8 30 303 305 593 1.14e-11 67.0
MsG0780040410.01.T01 AT3G49740 22.603 292 212 6 5 293 371 651 1.94e-13 72.4
MsG0780040410.01.T01 AT5G13770 25.595 168 123 2 42 209 372 537 2.14e-13 72.0
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MsG0780040410.01.T01 AT1G06143 24.231 260 184 6 40 297 270 518 5.77e-12 67.8
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MsG0780040410.01.T01 AT3G22150 24.623 199 142 4 60 255 488 681 1.55e-11 66.6
MsG0780040410.01.T01 AT2G03380 21.591 352 197 8 45 325 229 572 5.39e-13 70.9
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MsG0780040410.01.T01 AT3G60040 33.898 118 77 1 38 155 704 820 2.19e-11 66.2
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MsG0780040410.01.T01 AT2G44880 21.805 266 187 6 65 325 192 441 1.62e-12 69.3
MsG0780040410.01.T01 AT5G60960 23.571 280 202 6 5 274 192 469 1.63e-12 69.3
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MsG0780040410.01.T01 AT2G44880 21.805 266 187 6 65 325 190 439 1.70e-12 69.3
MsG0780040410.01.T01 AT2G44880 21.805 266 187 6 65 325 194 443 1.73e-12 69.3
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MsG0780040410.01.T01 AT3G22690 22.333 300 212 7 45 335 51 338 4.63e-11 65.1
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MsG0780040410.01.T01 AT1G68930 20.884 249 181 6 51 295 298 534 3.03e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT1G03540 22.619 252 183 3 91 342 227 466 1.63e-11 66.2
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MsG0780040410.01.T01 AT4G18840 23.292 322 187 8 51 332 168 469 1.81e-11 66.2
MsG0780040410.01.T01 AT4G18840 23.292 322 187 8 51 332 168 469 1.81e-11 66.2
MsG0780040410.01.T01 AT1G53600 21.887 265 188 6 27 286 411 661 2.00e-11 66.2
MsG0780040410.01.T01 AT1G53600 21.887 265 188 6 27 286 411 661 2.00e-11 66.2
MsG0780040410.01.T01 AT3G02330 20.597 335 243 5 25 341 450 779 2.19e-11 66.2
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MsG0780040410.01.T01 AT5G13230 26.148 283 200 3 49 331 238 511 2.34e-11 66.2
MsG0780040410.01.T01 AT3G49170 25.306 245 169 6 57 298 473 706 2.45e-11 65.9
MsG0780040410.01.T01 AT3G08820 24.390 246 170 6 5 247 194 426 2.46e-11 65.9
MsG0780040410.01.T01 AT3G08820 22.063 349 244 8 2 342 89 417 3.81e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT3G08820 19.345 336 256 4 45 374 57 383 5.15e-11 64.7
MsG0780040410.01.T01 AT2G17210 22.124 226 164 5 20 243 412 627 2.57e-11 65.9
MsG0780040410.01.T01 AT4G19191 23.770 244 170 5 45 284 39 270 2.58e-11 65.9
MsG0780040410.01.T01 AT3G48250 29.814 161 111 2 47 206 394 553 2.82e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT4G21065 24.068 295 208 6 6 298 41 321 3.08e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT5G47460 22.727 330 215 6 2 303 104 421 3.24e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT5G39680 23.270 318 201 7 7 291 256 563 3.36e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT3G01580 23.574 263 188 5 27 286 29 281 3.54e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT3G26630 24.519 208 150 3 23 228 216 418 3.76e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT5G15280 24.034 233 173 2 48 279 934 1163 3.99e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT5G52850 27.240 279 154 11 42 295 265 519 4.17e-11 65.5
MsG0780040410.01.T01 AT4G14820 22.179 257 186 5 40 295 264 507 4.34e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT1G77170 26.336 262 173 9 25 279 185 433 4.45e-11 64.7
MsG0780040410.01.T01 AT3G22690 22.333 300 212 7 45 335 51 338 4.56e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT4G21065 24.068 295 208 6 6 298 174 454 4.60e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT2G22070 23.973 292 192 12 22 306 79 347 4.88e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT1G22830 24.000 300 211 6 27 321 153 440 4.98e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT1G22830 24.000 300 211 6 27 321 153 440 4.98e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT1G30610 23.282 262 174 5 53 296 588 840 5.55e-11 65.1
MsG0780040410.01.T01 AT1G13410 23.105 277 188 8 69 342 39 293 6.39e-11 64.3
MsG0780040410.01.T01 AT4G04790 23.171 246 172 4 2 241 250 484 6.65e-11 64.7
MsG0780040410.01.T01 AT5G37570 26.816 179 114 4 65 243 152 313 7.06e-11 64.3
MsG0780040410.01.T01 AT5G37570 26.816 179 114 4 65 243 152 313 7.06e-11 64.3
MsG0780040410.01.T01 AT4G04790 23.171 246 172 4 2 241 387 621 8.43e-11 64.3
MsG0780040410.01.T01 AT5G40410 23.344 317 215 9 23 326 27 328 8.74e-11 63.9
MsG0780040410.01.T01 AT2G29760 22.571 319 227 6 20 331 87 392 8.74e-11 64.3
MsG0780040410.01.T01 AT3G13880 22.519 262 186 4 25 278 216 468 9.61e-11 63.9
MsG0780040410.01.T01 AT4G04790 23.171 246 172 4 2 241 383 617 9.78e-11 63.9

Find 69 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 123 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GACTTATAATGGTTTGATTT+TGG 0.081406 7:-77125026 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTATTTGGAGGTTCTCAATT+TGG 0.170492 7:-77124039 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTTACTTGGTTTGGCTTTAA+AGG 0.191093 7:-77125305 MsG0780040410.01.T01:CDS
ACATATAATACTTTGATTAA+TGG 0.205583 7:-77125130 MsG0780040410.01.T01:CDS
CTTCCCTTGAGTTTCTTATT+TGG 0.214920 7:-77124054 MsG0780040410.01.T01:CDS
GGAGCTTGATAAGGAGAATT+TGG 0.226012 7:-77124957 MsG0780040410.01.T01:CDS
GGAAATTGCATGAAGCTAAT+AGG 0.253585 7:-77125198 MsG0780040410.01.T01:CDS
CATATAATACTTTGATTAAT+GGG 0.261831 7:-77125129 MsG0780040410.01.T01:CDS
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TTTGGAGAAGATGAGGGATA+TGG 0.269516 7:-77125386 MsG0780040410.01.T01:CDS
TAATGTTTACACGGTTAATA+TGG 0.271429 7:-77125458 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTTGTTAAAATGAAGGAATA+TGG 0.292417 7:-77125595 MsG0780040410.01.T01:CDS
TATTTGGAGGTTCTCAATTT+GGG 0.297169 7:-77124038 MsG0780040410.01.T01:CDS
GTTTCTGCTTATTGTAAGTT+AGG 0.303163 7:-77125433 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTATCTTAAAAGACCGGAAT+TGG 0.306108 7:-77125524 MsG0780040410.01.T01:CDS
TGATAAGGGTTTACTTGGTT+TGG 0.314939 7:-77125314 MsG0780040410.01.T01:CDS
GACTAAGAAAGCTGCTTATA+TGG 0.327206 7:-77124984 MsG0780040410.01.T01:CDS
TGTAAGAATGAAGACTTTGA+TGG 0.333154 7:-77124788 MsG0780040410.01.T01:CDS
ACATTGCTCTCATGAATCTA+AGG 0.344524 7:-77123997 MsG0780040410.01.T01:CDS
GAAATTGCATGAAGCTAATA+GGG 0.346967 7:-77125197 MsG0780040410.01.T01:CDS
ATGGAGCTGTGCAAGTCTTA+AGG 0.348935 7:-77124769 MsG0780040410.01.T01:CDS
AATACTTTGATTAATGGGTT+TGG 0.368685 7:-77125124 MsG0780040410.01.T01:CDS
AAGTTTGTAGTGGACTTTGC+AGG 0.372952 7:-77124700 MsG0780040410.01.T01:CDS
ATCCGAAAAGTATTATCATT+TGG 0.373777 7:+77124827 None:intergenic
ATTTCGGGTTATTGTGATAA+GGG 0.373886 7:-77125328 MsG0780040410.01.T01:CDS
CCCTTGAGTTTCTTATTTGG+AGG 0.376486 7:-77124051 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTGGAGAAGATGAGGGATAT+GGG 0.380056 7:-77125385 MsG0780040410.01.T01:CDS
TATTGTGATAAGGGTTTACT+TGG 0.380404 7:-77125319 MsG0780040410.01.T01:CDS
GAAAGCTGCTTATATGGTTA+AGG 0.388031 7:-77124978 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTGGTTTGGCTTTAAAGGTT+AGG 0.391210 7:-77125300 MsG0780040410.01.T01:CDS
GCACTTGAATCAAGAGATAA+AGG 0.392565 7:-77123959 MsG0780040410.01.T01:CDS
CAAGCTGGTAATAGTGAAAT+GGG 0.396407 7:-77125100 MsG0780040410.01.T01:CDS
GCATTAAAAGTAACAACATT+AGG 0.401392 7:+77125355 None:intergenic
GTATTATATGTCACAACATT+AGG 0.405497 7:+77125142 None:intergenic
GATTTCGGGTTATTGTGATA+AGG 0.410160 7:-77125329 MsG0780040410.01.T01:CDS
AAAGGTTAGGAATTTGATGA+TGG 0.422741 7:-77125287 MsG0780040410.01.T01:CDS
TGGAGCTGTGCAAGTCTTAA+GGG 0.423518 7:-77124768 MsG0780040410.01.T01:CDS
GTGTTAAAAGTAACCACATT+TGG 0.432018 7:+77125247 None:intergenic
TCAAGCTGGTAATAGTGAAA+TGG 0.434496 7:-77125101 MsG0780040410.01.T01:CDS
TCAGATAAAATACTAGAATC+AGG 0.437309 7:+77124722 None:intergenic
ATATTAACCGTGTAAACATT+AGG 0.440476 7:+77125460 None:intergenic
TAAAACGATACAACCAATTC+CGG 0.450845 7:+77125511 None:intergenic
TTGTTTATAGAAGCATGGTT+AGG 0.461037 7:-77124862 MsG0780040410.01.T01:CDS
TATGGTTAAGGAGCTTGATA+AGG 0.463570 7:-77124966 MsG0780040410.01.T01:CDS
GGTAATAGTGAAATGGGGAT+TGG 0.465191 7:-77125094 MsG0780040410.01.T01:CDS
AATGCTTTATCTTAAAAGAC+CGG 0.466765 7:-77125530 MsG0780040410.01.T01:CDS
GTAATAGTGAAATGGGGATT+GGG 0.467105 7:-77125093 MsG0780040410.01.T01:CDS
ATTAATGGGTTTGGTCAAGC+TGG 0.476107 7:-77125115 MsG0780040410.01.T01:CDS
GCATTGCAAGATTCAACAGT+TGG 0.492613 7:+77125565 None:intergenic
ATGAGAGCAATGTCAGGAGT+TGG 0.500360 7:+77124007 None:intergenic
GTAGTGGACTTTGCAGGTGT+GGG 0.500452 7:-77124694 MsG0780040410.01.T01:CDS
TGTAGTGGACTTTGCAGGTG+TGG 0.513803 7:-77124695 MsG0780040410.01.T01:CDS
AAATGGGGTGTTTCCAAATG+TGG 0.516808 7:-77125260 MsG0780040410.01.T01:CDS
AAGGTTAGGAATTTGATGAT+GGG 0.536408 7:-77125286 MsG0780040410.01.T01:CDS
TGAATTGAATAAAGCTAGTG+AGG 0.537450 7:-77125410 MsG0780040410.01.T01:CDS
AGATTCATGAGAGCAATGTC+AGG 0.547754 7:+77124001 None:intergenic
TTGGAGGTTCTCAATTTGGG+TGG 0.554426 7:-77124035 MsG0780040410.01.T01:CDS
GCAAGTCTTAAGGGACATGT+TGG 0.561175 7:-77124759 MsG0780040410.01.T01:CDS
TATTTCACCTAATGTTTACA+CGG 0.565435 7:-77125467 MsG0780040410.01.T01:CDS
TTGAATCAAGAGATAAAGGT+AGG 0.577274 7:-77123955 MsG0780040410.01.T01:CDS
ACCTCCAAATAAGAAACTCA+AGG 0.579404 7:+77124050 None:intergenic
ATCAAGAGATAAAGGTAGGA+AGG 0.583287 7:-77123951 MsG0780040410.01.T01:CDS
TATAGAAGCATGGTTAGGAG+TGG 0.584429 7:-77124857 MsG0780040410.01.T01:CDS
TGAGATGAAGTTGGTTAATG+TGG 0.607897 7:-77125167 MsG0780040410.01.T01:CDS
CCTCCAAATAAGAAACTCAA+GGG 0.613100 7:+77124051 None:intergenic
GCTAAGCGCTTACTGCCACA+AGG 0.637477 7:-77124632 MsG0780040410.01.T01:intron
TTATTGCTGGACAGTGTGTG+AGG 0.642845 7:-77124907 MsG0780040410.01.T01:CDS
GTGGACTTTGCAGGTGTGGG+AGG 0.644929 7:-77124691 MsG0780040410.01.T01:CDS
AAGCTGGTAATAGTGAAATG+GGG 0.711421 7:-77125099 MsG0780040410.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACATATAATACTTTGATTAA+TGG - Chr7:77124441-77124460 MsG0780040410.01.T01:intron 15.0%
!! CATATAATACTTTGATTAAT+GGG - Chr7:77124442-77124461 MsG0780040410.01.T01:intron 15.0%
!!! AATATTTACTGTTTTTCTTT+TGG - Chr7:77125451-77125470 MsG0780040410.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTGTTAAAATGAAGGAATA+TGG - Chr7:77123976-77123995 MsG0780040410.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACTTATAATGGTTTGATTTT+GGG - Chr7:77124546-77124565 MsG0780040410.01.T01:intron 20.0%
!!! ACTTTTAACACTCTTATTAA+TGG - Chr7:77124336-77124355 MsG0780040410.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTAATGGTTTTTGTAAAGA+AGG - Chr7:77124351-77124370 MsG0780040410.01.T01:intron 20.0%
!!! TACTTTTAATGCTTTGATTT+CGG - Chr7:77124227-77124246 MsG0780040410.01.T01:intron 20.0%
!!! TCAAAATTTTACTTTGATGA+AGG - Chr7:77125227-77125246 MsG0780040410.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGATACTTTTGTTAAAATGA+AGG - Chr7:77123969-77123988 MsG0780040410.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAAGTTGTTTAATCCAAAT+AGG + Chr7:77125314-77125333 None:intergenic 20.0%
!!! TTAATGGTTTTTGTAAAGAA+GGG - Chr7:77124352-77124371 MsG0780040410.01.T01:intron 20.0%
! AATGCTTTATCTTAAAAGAC+CGG - Chr7:77124041-77124060 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
! ATATTAACCGTGTAAACATT+AGG + Chr7:77124114-77124133 None:intergenic 25.0%
! GCATTAAAAGTAACAACATT+AGG + Chr7:77124219-77124238 None:intergenic 25.0%
! GTATTATATGTCACAACATT+AGG + Chr7:77124432-77124451 None:intergenic 25.0%
! TAATGTTTACACGGTTAATA+TGG - Chr7:77124113-77124132 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
! TAATTGAGTGCTTATCATAT+GGG - Chr7:77125331-77125350 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
! TATTTCACCTAATGTTTACA+CGG - Chr7:77124104-77124123 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
! TCAGATAAAATACTAGAATC+AGG + Chr7:77124852-77124871 None:intergenic 25.0%
! TTAATTGAGTGCTTATCATA+TGG - Chr7:77125330-77125349 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
!! CTCAAAATATGTATCTTTTG+TGG + Chr7:77125104-77125123 None:intergenic 25.0%
!! GTCCAAATGATAATACTTTT+CGG - Chr7:77124742-77124761 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTGTGTAATGAATTTCCA+TGG - Chr7:77125265-77125284 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATACTTTGATTAATGGGTT+TGG - Chr7:77124447-77124466 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
!!! AATTTGATGATGGGAAAAAA+TGG - Chr7:77124294-77124313 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
!!! ACTTTTAATGCTTTGATTTC+GGG - Chr7:77124228-77124247 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
!!! ATCCGAAAAGTATTATCATT+TGG + Chr7:77124747-77124766 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTGATGATGGGAAAAAAT+GGG - Chr7:77124295-77124314 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTTATCTGAAGTTTGTAG+TGG - Chr7:77124861-77124880 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
!!! GACTTATAATGGTTTGATTT+TGG - Chr7:77124545-77124564 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
!!! GCTGATATTTTGACTTATAA+TGG - Chr7:77124534-77124553 MsG0780040410.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTCTTGTTTATAGAAGCA+TGG - Chr7:77124704-77124723 MsG0780040410.01.T01:CDS 25.0%
AAAGGTTAGGAATTTGATGA+TGG - Chr7:77124284-77124303 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
ACATACTGAAATAACATTCC+TGG + Chr7:77125483-77125502 None:intergenic 30.0%
GAAATTGCATGAAGCTAATA+GGG - Chr7:77124374-77124393 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
GTGTTAAAAGTAACCACATT+TGG + Chr7:77124327-77124346 None:intergenic 30.0%
GTTTCTGCTTATTGTAAGTT+AGG - Chr7:77124138-77124157 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
TAAAACGATACAACCAATTC+CGG + Chr7:77124063-77124082 None:intergenic 30.0%
TACTAGTGGTAATTGAGTAT+GGG - Chr7:77125288-77125307 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
TATTGTGATAAGGGTTTACT+TGG - Chr7:77124252-77124271 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
TATTTGGAGGTTCTCAATTT+GGG - Chr7:77125533-77125552 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
TGAATTGAATAAAGCTAGTG+AGG - Chr7:77124161-77124180 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
TGTAAGAATGAAGACTTTGA+TGG - Chr7:77124783-77124802 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
TTATCTTAAAAGACCGGAAT+TGG - Chr7:77124047-77124066 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
TTATTTGGAGGTTCTCAATT+TGG - Chr7:77125532-77125551 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATCAAGAGATAAAGGT+AGG - Chr7:77125616-77125635 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
! AAGGTTAGGAATTTGATGAT+GGG - Chr7:77124285-77124304 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
! TACAAGCAATTCAACTTGTT+AGG - Chr7:77125004-77125023 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
! TATCGTTTTATCGACAAATG+AGG - Chr7:77124073-77124092 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
! TGATAATACTTTTCGGATGT+TGG - Chr7:77124749-77124768 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTTTATAGAAGCATGGTT+AGG - Chr7:77124709-77124728 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCTTTGTCAAAACCTTG+TGG + Chr7:77124957-77124976 None:intergenic 30.0%
! TTTTTCTTTTGGTATTAGCC+AGG - Chr7:77125462-77125481 MsG0780040410.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTCGGGTTATTGTGATAA+GGG - Chr7:77124243-77124262 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
!! TTTACTTGGTTTGGCTTTAA+AGG - Chr7:77124266-77124285 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
!! TTTGATGATGGGAAAAAATG+GGG - Chr7:77124296-77124315 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTTGGGACTTTGTAAAGA+AGG - Chr7:77124561-77124580 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTGGGACTTTGTAAAGAA+GGG - Chr7:77124562-77124581 MsG0780040410.01.T01:intron 30.0%
AAGCTGGTAATAGTGAAATG+GGG - Chr7:77124472-77124491 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
ACATTGCTCTCATGAATCTA+AGG - Chr7:77125574-77125593 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
ACCTCCAAATAAGAAACTCA+AGG + Chr7:77125524-77125543 None:intergenic 35.0%
ATCAAGAGATAAAGGTAGGA+AGG - Chr7:77125620-77125639 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
ATGAATTTCCATGGTACTAG+TGG - Chr7:77125274-77125293 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
CAAGCTGGTAATAGTGAAAT+GGG - Chr7:77124471-77124490 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
CCTCCAAATAAGAAACTCAA+GGG + Chr7:77125523-77125542 None:intergenic 35.0%
CTTCCCTTGAGTTTCTTATT+TGG - Chr7:77125517-77125536 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGCTGCTTATATGGTTA+AGG - Chr7:77124593-77124612 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
GACTAAGAAAGCTGCTTATA+TGG - Chr7:77124587-77124606 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
GCACTTGAATCAAGAGATAA+AGG - Chr7:77125612-77125631 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
GCAGAAAAAGTAGATGCATT+AGG + Chr7:77124642-77124661 None:intergenic 35.0%
GGAAATTGCATGAAGCTAAT+AGG - Chr7:77124373-77124392 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
GTAATAGTGAAATGGGGATT+GGG - Chr7:77124478-77124497 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
GTACTAGTGGTAATTGAGTA+TGG - Chr7:77125287-77125306 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
GTAGAATAGTAGCAGACTTT+AGG + Chr7:77125206-77125225 None:intergenic 35.0%
TAATTGAGTATGGGCCTATT+TGG - Chr7:77125297-77125316 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
TATGGTTAAGGAGCTTGATA+AGG - Chr7:77124605-77124624 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
TCAAGCTGGTAATAGTGAAA+TGG - Chr7:77124470-77124489 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
TGATAAGGGTTTACTTGGTT+TGG - Chr7:77124257-77124276 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
! ACTATATTTTGTGCATGCTG+CGG + Chr7:77125179-77125198 None:intergenic 35.0%
! CATGAAGCTAATAGGGTTTT+TGG - Chr7:77124381-77124400 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
! GAATAAAGCTAGTGAGGTTT+TGG - Chr7:77124167-77124186 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
! TACTTTTCGGATGTTGGTAT+CGG - Chr7:77124755-77124774 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
! TGAGATGAAGTTGGTTAATG+TGG - Chr7:77124404-77124423 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
!! ACTTTTTCTGCTCTTATTGC+TGG - Chr7:77124651-77124670 MsG0780040410.01.T01:CDS 35.0%
!! GATTTCGGGTTATTGTGATA+AGG - Chr7:77124242-77124261 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
!! TTGGTTTGGCTTTAAAGGTT+AGG - Chr7:77124271-77124290 MsG0780040410.01.T01:intron 35.0%
AGATTCATGAGAGCAATGTC+AGG + Chr7:77125573-77125592 None:intergenic 40.0%
CTCAATTACCACTAGTACCA+TGG + Chr7:77125285-77125304 None:intergenic 40.0%
GCATTGCAAGATTCAACAGT+TGG + Chr7:77124009-77124028 None:intergenic 40.0%
GGAGCTTGATAAGGAGAATT+TGG - Chr7:77124614-77124633 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
GGTAATAGTGAAATGGGGAT+TGG - Chr7:77124477-77124496 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
TTGGAGAAGATGAGGGATAT+GGG - Chr7:77124186-77124205 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
TTTGGAGAAGATGAGGGATA+TGG - Chr7:77124185-77124204 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
! AAATGGGGTGTTTCCAAATG+TGG - Chr7:77124311-77124330 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
! CCAAACTGATAGTGCAGTTA+GGG + Chr7:77125398-77125417 None:intergenic 40.0%
! CCCTTGAGTTTCTTATTTGG+AGG - Chr7:77125520-77125539 MsG0780040410.01.T01:CDS 40.0%
! TATAGAAGCATGGTTAGGAG+TGG - Chr7:77124714-77124733 MsG0780040410.01.T01:CDS 40.0%
! TCCAAACTGATAGTGCAGTT+AGG + Chr7:77125399-77125418 None:intergenic 40.0%
!! AAGTTTGTAGTGGACTTTGC+AGG - Chr7:77124871-77124890 MsG0780040410.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTAATGGGTTTGGTCAAGC+TGG - Chr7:77124456-77124475 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
!!! GGTTTTTGGTGAGATGAAGT+TGG - Chr7:77124395-77124414 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
!!! TGAGGTTTTGGAGAAGATGA+GGG - Chr7:77124179-77124198 MsG0780040410.01.T01:intron 40.0%
ATAGTGCAGTTAGGGCAGTT+TGG + Chr7:77125390-77125409 None:intergenic 45.0%
ATGAGAGCAATGTCAGGAGT+TGG + Chr7:77125567-77125586 None:intergenic 45.0%
ATGGAGCTGTGCAAGTCTTA+AGG - Chr7:77124802-77124821 MsG0780040410.01.T01:CDS 45.0%
CCCTAACTGCACTATCAGTT+TGG - Chr7:77125395-77125414 MsG0780040410.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGTCTTAAGGGACATGT+TGG - Chr7:77124812-77124831 MsG0780040410.01.T01:CDS 45.0%
TGGAGCTGTGCAAGTCTTAA+GGG - Chr7:77124803-77124822 MsG0780040410.01.T01:CDS 45.0%
TTATTGCTGGACAGTGTGTG+AGG - Chr7:77124664-77124683 MsG0780040410.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAGGTTCTCAATTTGGG+TGG - Chr7:77125536-77125555 MsG0780040410.01.T01:CDS 45.0%
! AATGGGGATTGGGCTTTTTG+AGG - Chr7:77124488-77124507 MsG0780040410.01.T01:intron 45.0%
!! GATTGGGCTTTTTGAGGAGA+TGG - Chr7:77124494-77124513 MsG0780040410.01.T01:intron 45.0%
!!! GTGAGGTTTTGGAGAAGATG+AGG - Chr7:77124178-77124197 MsG0780040410.01.T01:intron 45.0%
GCAGTTAGGGCAGTTTGGAT+TGG + Chr7:77125385-77125404 None:intergenic 50.0%
!! ATGCTGCGGTTTGAGTTGGA+GGG + Chr7:77125165-77125184 None:intergenic 50.0%
!! GTAGTGGACTTTGCAGGTGT+GGG - Chr7:77124877-77124896 MsG0780040410.01.T01:CDS 50.0%
!! TGTAGTGGACTTTGCAGGTG+TGG - Chr7:77124876-77124895 MsG0780040410.01.T01:CDS 50.0%
GCGCAGCAAGCTCAATCAAC+TGG - Chr7:77125136-77125155 MsG0780040410.01.T01:CDS 55.0%
GCTAAGCGCTTACTGCCACA+AGG - Chr7:77124939-77124958 MsG0780040410.01.T01:CDS 55.0%
GTGCATGCTGCGGTTTGAGT+TGG + Chr7:77125169-77125188 None:intergenic 55.0%
!! CATGCTGCGGTTTGAGTTGG+AGG + Chr7:77125166-77125185 None:intergenic 55.0%
GTGGACTTTGCAGGTGTGGG+AGG - Chr7:77124880-77124899 MsG0780040410.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 77123946 77125647 77123946 ID=MsG0780040410.01;Name=MsG0780040410.01
Chr7 mRNA 77123946 77125647 77123946 ID=MsG0780040410.01.T01;Parent=MsG0780040410.01;Name=MsG0780040410.01.T01;_AED=0.42;_eAED=0.50;_QI=0|0|0|1|1|0.5|2|0|392
Chr7 exon 77124633 77125647 77124633 ID=MsG0780040410.01.T01:exon:15256;Parent=MsG0780040410.01.T01
Chr7 exon 77123946 77124109 77123946 ID=MsG0780040410.01.T01:exon:15255;Parent=MsG0780040410.01.T01
Chr7 CDS 77124633 77125647 77124633 ID=MsG0780040410.01.T01:cds;Parent=MsG0780040410.01.T01
Chr7 CDS 77123946 77124109 77123946 ID=MsG0780040410.01.T01:cds;Parent=MsG0780040410.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780040410.01.T01

ATGAATAAGCTGAGAAATGCTACTGATACTTTTGTTAAAATGAAGGAATATGGTTTCTTTCCAACTGTTGAATCTTGCAATGCTTTTATTAGTTCAATGCTTTATCTTAAAAGACCGGAATTGGTTGTATCGTTTTATCGACAAATGAGGAGAAGTCGTATTTCACCTAATGTTTACACGGTTAATATGGCTGTTTCTGCTTATTGTAAGTTAGGTGAATTGAATAAAGCTAGTGAGGTTTTGGAGAAGATGAGGGATATGGGTTTGTATCCTAATGTTGTTACTTTTAATGCTTTGATTTCGGGTTATTGTGATAAGGGTTTACTTGGTTTGGCTTTAAAGGTTAGGAATTTGATGATGGGAAAAAATGGGGTGTTTCCAAATGTGGTTACTTTTAACACTCTTATTAATGGTTTTTGTAAAGAAGGGAAATTGCATGAAGCTAATAGGGTTTTTGGTGAGATGAAGTTGGTTAATGTGGCTCCTAATGTTGTGACATATAATACTTTGATTAATGGGTTTGGTCAAGCTGGTAATAGTGAAATGGGGATTGGGCTTTTTGAGGAGATGGAGAAGAATAAAGTGAAAGCTGATATTTTGACTTATAATGGTTTGATTTTGGGACTTTGTAAAGAAGGGAAGACTAAGAAAGCTGCTTATATGGTTAAGGAGCTTGATAAGGAGAATTTGGTACCTAATGCATCTACTTTTTCTGCTCTTATTGCTGGACAGTGTGTGAGGAACAACTCTGAACGTGCTTTTCTTGTTTATAGAAGCATGGTTAGGAGTGGTTTTAGTCCAAATGATAATACTTTTCGGATGTTGGTATCGGCTTTTTGTAAGAATGAAGACTTTGATGGAGCTGTGCAAGTCTTAAGGGACATGTTGGAAAGATTCATGACTCCTGATTCTAGTATTTTATCTGAAGTTTGTAGTGGACTTTGCAGGTGTGGGAGGAAACAGTTTGCGTTGATGTTGTGTAGTGAGATTGAAGCTAAGCGCTTACTGCCACAAGGAATGTTATTTCAGTATGTAGCTGAGTTCGATGCTTCCCTTGAGTTTCTTATTTGGAGGTTCTCAATTTGGGTGGATAAACCAACTCCTGACATTGCTCTCATGAATCTAAGGAATACAGATGAGCGTGCACTTGAATCAAGAGATAAAGGTAGGAAGGTCTGA
Protein sequence

>MsG0780040410.01.T01

MNKLRNATDTFVKMKEYGFFPTVESCNAFISSMLYLKRPELVVSFYRQMRRSRISPNVYTVNMAVSAYCKLGELNKASEVLEKMRDMGLYPNVVTFNALISGYCDKGLLGLALKVRNLMMGKNGVFPNVVTFNTLINGFCKEGKLHEANRVFGEMKLVNVAPNVVTYNTLINGFGQAGNSEMGIGLFEEMEKNKVKADILTYNGLILGLCKEGKTKKAAYMVKELDKENLVPNASTFSALIAGQCVRNNSERAFLVYRSMVRSGFSPNDNTFRMLVSAFCKNEDFDGAVQVLRDMLERFMTPDSSILSEVCSGLCRCGRKQFALMLCSEIEAKRLLPQGMLFQYVAEFDASLEFLIWRFSIWVDKPTPDIALMNLRNTDERALESRDKGRKV*