AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029798.01


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MsG0580029798.01.T01 AT5G01810 36.330 267 156 7 91 352 12 269 7.53e-42 159
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MsG0580029798.01.T01 AT3G61960 33.840 263 170 4 567 827 10 270 7.39e-38 151
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MsG0580029798.01.T01 AT4G33950 35.985 264 157 7 567 825 21 277 2.30e-37 144
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MsG0580029798.01.T01 AT1G60940 35.985 264 157 7 91 349 4 260 5.65e-37 143
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MsG0580029798.01.T01 AT1G78290 34.328 268 156 9 91 349 4 260 4.56e-36 140
MsG0580029798.01.T01 AT1G78290 34.082 267 158 9 567 825 4 260 2.99e-35 137
MsG0580029798.01.T01 AT3G50500 34.545 275 166 9 567 834 23 290 8.60e-36 140
MsG0580029798.01.T01 AT3G50500 35.227 264 159 7 91 349 23 279 3.09e-35 138
MsG0580029798.01.T01 AT3G50500 34.752 282 163 12 567 834 23 297 2.08e-35 139
MsG0580029798.01.T01 AT3G50500 35.424 271 156 10 91 349 23 286 7.60e-35 137
MsG0580029798.01.T01 AT2G45490 31.950 241 155 5 91 330 22 254 2.57e-35 135
MsG0580029798.01.T01 AT2G45490 32.365 241 154 5 567 806 22 254 3.78e-35 135
MsG0580029798.01.T01 AT5G01820 35.206 267 159 7 91 352 22 279 4.29e-35 139
MsG0580029798.01.T01 AT5G01820 34.962 266 159 7 567 827 22 278 1.82e-34 138
MsG0580029798.01.T01 AT3G53930 31.250 272 175 6 567 833 20 284 5.23e-35 143
MsG0580029798.01.T01 AT3G53930 30.189 265 176 5 91 351 20 279 4.57e-34 140
MsG0580029798.01.T01 AT1G10940 34.926 272 157 8 91 349 4 268 5.85e-35 137
MsG0580029798.01.T01 AT1G10940 35.531 273 154 10 567 825 4 268 1.03e-34 137
MsG0580029798.01.T01 AT3G53930 31.250 272 175 6 567 833 20 284 6.16e-35 143
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MsG0580029798.01.T01 AT5G66880 34.470 264 161 6 91 349 22 278 4.24e-34 135
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MsG0580029798.01.T01 AT4G33080 27.331 311 164 8 573 827 100 404 7.32e-26 113
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MsG0580029798.01.T01 AT5G63370 26.398 322 182 14 551 827 150 461 2.04e-13 74.3
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MsG0580029798.01.T01 AT3G61160 30.047 213 122 8 97 295 108 307 2.20e-14 76.3
MsG0580029798.01.T01 AT3G61160 29.630 216 119 10 573 771 108 307 2.16e-12 70.1
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MsG0580029798.01.T01 AT1G16270 27.160 243 158 8 537 767 837 1072 2.86e-13 74.7

Find 156 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 378 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGCAGACATGTTGGTGTTTC+TGG 0.063588 5:+102121363 MsG0580029798.01.T01:CDS
CATAGACATGTTGGTGTTTC+TGG 0.098123 5:+102116244 MsG0580029798.01.T01:CDS
CCGAATATTGTTGAGTTTAA+AGG 0.118920 5:+102116652 MsG0580029798.01.T01:CDS
CCTTTAAACTCGACAATATT+TGG 0.136146 5:-102121753 None:intergenic
CCAAATATTGTCGAGTTTAA+AGG 0.142769 5:+102121753 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTTCTGGTGTGCCTCCATTT+TGG 0.171725 5:+102122562 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATATTGTATGTCTTACTTTC+TGG 0.184977 5:+102122546 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTCTTTATATCTTCTTTATC+AGG 0.186977 5:-102121696 None:intergenic
TACACACTTGGTAAGGAATT+AGG 0.198116 5:+102121576 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAAGTTCTACGTCGTAAATA+TGG 0.214304 5:+102122492 MsG0580029798.01.T01:CDS
CGCTCTGAATTGCTTCATTC+TGG 0.215699 5:-102118725 None:intergenic
TACACACTTGGGAAAGAATT+AGG 0.234729 5:+102116475 MsG0580029798.01.T01:CDS
CAATCACATATGAGGAATTA+AGG 0.245780 5:+102119294 MsG0580029798.01.T01:CDS
TATTGTCTTTATCAAAATAT+TGG 0.249186 5:-102119564 None:intergenic
GGGTGGTTGTTTGAGTAAAA+AGG 0.253611 5:+102116207 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTATTTGATCTTTGAACATT+TGG 0.265927 5:-102116409 None:intergenic
GAGCATGTTTGTTTGGTAAT+TGG 0.268578 5:-102121476 None:intergenic
ACTATCAAGGCCACTGATTT+CGG 0.278358 5:+102116895 MsG0580029798.01.T01:CDS
ACACACTTGGTAAGGAATTA+GGG 0.303933 5:+102121577 MsG0580029798.01.T01:CDS
GGGCATGTTTGTTTGGTAAT+TGG 0.307384 5:-102116375 None:intergenic
GGCCACTGATTTCGGTTTAT+CGG 0.315178 5:+102122004 MsG0580029798.01.T01:CDS
TCAGATACAAACACAATTCT+AGG 0.315313 5:+102121525 MsG0580029798.01.T01:CDS
GCTATCAAGGCCACTGATTT+CGG 0.317116 5:+102121996 MsG0580029798.01.T01:CDS
CCTTTAAACTCAACAATATT+CGG 0.319456 5:-102116652 None:intergenic
GAATTAGGAAGAGGACAATT+TGG 0.322188 5:+102116490 MsG0580029798.01.T01:CDS
GATCTTTGAACATTTGGTTT+TGG 0.323486 5:-102116403 None:intergenic
TTTGTGGTGTGCCTCCATTT+TGG 0.325098 5:+102118167 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAATTCAGTTCATGTTGTTA+TGG 0.327026 5:+102116690 MsG0580029798.01.T01:CDS
TCAAATACAAACACAATTCT+TGG 0.331740 5:+102116424 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATATTGAGCTGAATCTCTTC+TGG 0.336958 5:-102123132 None:intergenic
AGCGGAAGTGCGGCAGCTTA+TGG 0.344504 5:+102119352 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAAAGGACTGCACTATCTAT+TGG 0.354434 5:-102123110 None:intergenic
GGACTTGGGGCATGTTTGTT+TGG 0.359986 5:-102116382 None:intergenic
TATTCGCAGGAAAAGTATAT+CGG 0.362743 5:+102118041 MsG0580029798.01.T01:intron
GAAGCTGTGATACGTTTCTT+TGG 0.364708 5:-102118406 None:intergenic
CTTTGTACTGAGAATTCAAC+TGG 0.366055 5:+102116523 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAATTTCTTGTTGTCTAGTA+AGG 0.366128 5:+102116861 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAATTTCTTGTTGTCTAGTA+AGG 0.366128 5:+102121962 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAAAGGACTGCACTGTCTAT+TGG 0.369619 5:-102118703 None:intergenic
GAAGTTCTACGTCGTAAATA+CGG 0.370171 5:+102118097 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTACAAATCCAACTGTTAAA+AGG 0.370384 5:+102121502 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTCAACATGACCTTGCAATA+TGG 0.374433 5:-102118311 None:intergenic
ATGGGAAGGAAGTAGATATA+TGG 0.375344 5:+102122511 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATTCGCAGGAAAGGTATATC+AGG 0.376035 5:+102122437 MsG0580029798.01.T01:intron
TATTTACGACGTAGAACTTC+TGG 0.380113 5:-102122489 None:intergenic
TATTTACGACGTAGAACTTC+TGG 0.380450 5:-102118094 None:intergenic
TTTGCACTGTTTGATATGAT+TGG 0.388837 5:-102122750 None:intergenic
CTTTGTACTAAGAATTCAAC+TGG 0.392440 5:+102121624 MsG0580029798.01.T01:CDS
TAAATATAGGCTGATGTAGA+TGG 0.393117 5:+102119454 MsG0580029798.01.T01:intron
GGCCACTGATTTCGGCTTGT+CGG 0.395648 5:+102116903 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATCACAGCTTCTCAGGTTCT+AGG 0.396124 5:+102122816 MsG0580029798.01.T01:CDS
ACGGGAAGGAAATAGATATA+TGG 0.400635 5:+102118116 MsG0580029798.01.T01:CDS
TCTTTCACTATATTTCCCTT+TGG 0.401820 5:-102121853 None:intergenic
TCTATCTTCAATCACATATG+AGG 0.402914 5:+102123156 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATCACAGCTTCACAGGTTCT+AGG 0.404126 5:+102118418 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAATTAGGGAGAGGACGATT+TGG 0.409127 5:+102121591 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATTGGTAAGGTTGTTGAAAA+GGG 0.411007 5:-102121458 None:intergenic
AAGGTATATCAGGATATAAC+TGG 0.414175 5:+102122447 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATCTATTATTAGAGCATCCT+TGG 0.418911 5:+102123057 MsG0580029798.01.T01:intron
GAAGTAGATATATGGAGTGC+AGG 0.421490 5:+102122519 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATATTGTACATCTTACTTTG+TGG 0.427299 5:+102118151 MsG0580029798.01.T01:CDS
AATTGGTAAGGTTGTTGAAA+AGG 0.440127 5:-102121459 None:intergenic
TAAACATTGCCTTCAAACCT+TGG 0.440948 5:-102119244 None:intergenic
GTACTTGGAGCATGTTTGTT+TGG 0.441038 5:-102121483 None:intergenic
CAAACGTATCACAGCTTCTC+AGG 0.442546 5:+102122809 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTAACAGTTGGATTTGTACT+TGG 0.443186 5:-102121498 None:intergenic
TAGGCTGATGTAGATGGAAA+TGG 0.445841 5:+102119460 MsG0580029798.01.T01:intron
GAAGCTGTGATACGTTTGTT+TGG 0.448622 5:-102122804 None:intergenic
AATCACATATGAGGAATTGT+TGG 0.449473 5:+102123165 MsG0580029798.01.T01:CDS
TGAGTTTAAAGGTGCTTATG+AGG 0.450815 5:+102116663 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAATTCAGTTCATGTTGTAA+TGG 0.450877 5:+102121791 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTAGCACTGTTTGATATGCT+TGG 0.460307 5:-102118352 None:intergenic
TGTTTGTTTGGTAATTGGTA+AGG 0.462847 5:-102116370 None:intergenic
GGATGATAAGGCAGCTATCA+AGG 0.462872 5:+102121983 MsG0580029798.01.T01:CDS
AATCACATATGAGGAATTAA+GGG 0.464140 5:+102119295 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTGCTAAGGATCTTGTTAGT+AGG 0.465906 5:+102118368 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAAATAGATATATGGAGTGC+AGG 0.468637 5:+102118124 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTTGTCTAGTAAGGATGATA+AGG 0.471884 5:+102116870 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTTGTCTAGTAAGGATGATA+AGG 0.471884 5:+102121971 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAAGTATATCGGGATATAGT+TGG 0.472066 5:+102118052 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATTGGTAAGGTTGTTGAGAA+GGG 0.474944 5:-102116357 None:intergenic
CATCCTTGGCTTAAAGAAGA+TGG 0.480537 5:+102123071 MsG0580029798.01.T01:CDS
ACTTGTTCTAGAGACGGAAA+AGG 0.483143 5:+102118276 MsG0580029798.01.T01:intron
GTGAAACAAATTTACACACT+TGG 0.483273 5:+102116463 MsG0580029798.01.T01:CDS
AGAAGAGATCCAAGGTTTGA+AGG 0.485295 5:+102119235 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATGTATTATTAGATCATCCT+TGG 0.491923 5:+102118650 MsG0580029798.01.T01:intron
CTGATAAAGAAGATATAAAG+AGG 0.492908 5:+102116596 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTTGTTATGGAACTTTGTGC+TGG 0.493417 5:+102116703 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAGTTCTACGTCGTAAATAC+GGG 0.496475 5:+102118098 MsG0580029798.01.T01:CDS
TAAAGAAGGTGGAAATGCTT+CGG 0.500184 5:+102118675 MsG0580029798.01.T01:CDS
GCAAATTTACACACTTGGTA+AGG 0.500565 5:+102121569 MsG0580029798.01.T01:CDS
TCGATACGATTATTGCCAAA+GGG 0.505306 5:+102121838 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTGGTAAGGTTGTTGAGAAG+GGG 0.507940 5:-102116356 None:intergenic
AAGTTCTACGTCGTAAATAT+GGG 0.510678 5:+102122493 MsG0580029798.01.T01:CDS
TGAAACAAATTTACACACTT+GGG 0.516319 5:+102116464 MsG0580029798.01.T01:CDS
GATCATCCTTGGCTTAAAGA+AGG 0.516684 5:+102118661 MsG0580029798.01.T01:intron
GTCTTTATCAAAATATTGGA+AGG 0.519390 5:-102119560 None:intergenic
GGATGATAAGGCAACTATCA+AGG 0.520419 5:+102116882 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATTCGCAGGAAAAGTATATC+GGG 0.520656 5:+102118042 MsG0580029798.01.T01:intron
AAGTGGTACAATCACATATG+AGG 0.521768 5:+102119286 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTGATAAAGAAGATATAAAG+AGG 0.523652 5:+102121697 MsG0580029798.01.T01:CDS
ACATATGAGGAATTGTTGGC+AGG 0.526412 5:+102123169 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTGAGGCAAATTTACACACT+TGG 0.527699 5:+102121564 MsG0580029798.01.T01:CDS
TGTTTGTTTGGTAATTGGTA+AGG 0.531401 5:-102121471 None:intergenic
TTTCCATCTTCTTTAAGCCA+AGG 0.531789 5:-102123074 None:intergenic
AATTGGTAAGGTTGTTGAGA+AGG 0.532067 5:-102116358 None:intergenic
ACACCAACATGTCTATGATC+TGG 0.534711 5:-102116238 None:intergenic
GTCAATATGACCTTGCAAGA+TGG 0.538341 5:-102122709 None:intergenic
CTTGTTCTAGAGACGGAAAA+GGG 0.539177 5:+102118277 MsG0580029798.01.T01:intron
TTCGATACGATTATTGCCAA+AGG 0.542250 5:+102121837 MsG0580029798.01.T01:CDS
TGAATTGCTTCATTCTGGAA+AGG 0.543379 5:-102118720 None:intergenic
TGATAAAGAAGATATAAAGA+GGG 0.543871 5:+102116597 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTTCCACCTTCTTTAAGCCA+AGG 0.545270 5:-102118667 None:intergenic
CGAGTTTAAAGGTGCGTACG+AGG 0.546313 5:+102121764 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATATTTGATGCCATCTTGCA+AGG 0.553144 5:+102122699 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTGGTAAGGTTGTTGAAAAG+GGG 0.553833 5:-102121457 None:intergenic
GAAACGTATCACAGCTTCAC+AGG 0.555322 5:+102118411 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTTGTAATGGAACTTTGTGC+TGG 0.555730 5:+102121804 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTTTCATCAGAAGAGATCCA+AGG 0.556146 5:+102119227 MsG0580029798.01.T01:CDS
ATATTTGATGCCATATTGCA+AGG 0.559818 5:+102118301 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTGACTTTGAAAGTCTTCCA+TGG 0.561053 5:+102122727 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTGACTTTGAAAGTCGTCCA+TGG 0.567169 5:+102118329 MsG0580029798.01.T01:CDS
CATCCTTGGCTTAAAGAAGG+TGG 0.567193 5:+102118664 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTTGACAGGATTATTGCTAA+GGG 0.571052 5:+102116736 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTTATGGAACTTTGTGCTGG+TGG 0.571434 5:+102116706 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTTGGGAAAGAATTAGGAAG+AGG 0.574151 5:+102116481 MsG0580029798.01.T01:CDS
ACATATGAGGAATTAAGGGC+AGG 0.579759 5:+102119299 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAAGGCAATGTTTACTAACA+TGG 0.588063 5:+102119253 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAGCTGAATCTCTTCTGGAA+AGG 0.588762 5:-102123127 None:intergenic
AGTGACTGGACTAACCTTGA+GGG 0.589950 5:-102118770 None:intergenic
GTAATGGAACTTTGTGCTGG+TGG 0.591980 5:+102121807 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAGCCAGATCATAGACATGT+TGG 0.593534 5:+102116235 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTGTTTGATATGATTGGCCA+TGG 0.597824 5:-102122744 None:intergenic
CATGCAAATCAATTTCAAAG+AGG 0.598413 5:+102116557 MsG0580029798.01.T01:CDS
AGCTTACTGAAGCGGAAGTG+CGG 0.599596 5:+102119342 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAGCATATCAAACAGTGCTA+AGG 0.599621 5:+102118354 MsG0580029798.01.T01:CDS
CGGCTCAAAGCTTACTGAAG+CGG 0.605346 5:+102119334 MsG0580029798.01.T01:CDS
AAGAGATGAGCATCTATACA+AGG 0.607167 5:+102119537 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTGTTTGATATGCTTGGCCA+TGG 0.612605 5:-102118346 None:intergenic
TGATAAAGAAGATATAAAGA+GGG 0.613775 5:+102121698 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTAAACAATTTGAAGATGTG+AGG 0.614626 5:+102121547 MsG0580029798.01.T01:CDS
CCGCAACAATGCACAGACAC+AGG 0.615773 5:+102119509 MsG0580029798.01.T01:CDS
TCTACGTCGTAAATATGGGA+AGG 0.621408 5:+102122497 MsG0580029798.01.T01:CDS
GAACGAGAACGCAGACATGT+TGG 0.625586 5:+102121354 MsG0580029798.01.T01:CDS
CAAATCATGCAGCATATGAG+TGG 0.627264 5:+102121726 MsG0580029798.01.T01:CDS
TTGGCAGGATTACAAAGACT+CGG 0.629095 5:+102123184 MsG0580029798.01.T01:CDS
AACATGGACACTGACAAAAG+TGG 0.632331 5:+102119269 MsG0580029798.01.T01:CDS
AATCATATCAAACAGTGCAA+AGG 0.632904 5:+102122752 MsG0580029798.01.T01:CDS
AGGGCAGGATTGCAAAGACT+CGG 0.639814 5:+102119314 MsG0580029798.01.T01:CDS
CTTGGTAAGGAATTAGGGAG+AGG 0.642309 5:+102121582 MsG0580029798.01.T01:CDS
CAAATCATGCAACATATGAG+TGG 0.644753 5:+102116625 MsG0580029798.01.T01:CDS
GTATAAGCATCTTACTAACA+AGG 0.647267 5:-102122776 None:intergenic
AACCGACAAGCCGAAATCAG+TGG 0.648079 5:-102116905 None:intergenic
CCTGTGTCTGTGCATTGTTG+CGG 0.656937 5:-102119509 None:intergenic
TCTACGTCGTAAATACGGGA+AGG 0.659137 5:+102118102 MsG0580029798.01.T01:CDS
AACCGATAAACCGAAATCAG+TGG 0.666371 5:-102122006 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAGTTATTATAGTATTATT+TGG + Chr5:102116986-102117005 MsG0580029798.01.T01:intron 10.0%
!! AAGTTATTATAGTATTATTT+GGG + Chr5:102116987-102117006 MsG0580029798.01.T01:intron 10.0%
!!! AAAGTTTTAATAATAAAACA+AGG + Chr5:102119714-102119733 MsG0580029798.01.T01:intron 10.0%
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TCAGATACAAACACAATTCT+AGG + Chr5:102121525-102121544 MsG0580029798.01.T01:CDS 30.0%
TCCAAATCTAACATTTCACT+CGG + Chr5:102120951-102120970 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
TCCTGAGTAATTAATTAGGA+TGG - Chr5:102117655-102117674 None:intergenic 30.0%
TCTATCTTCAATCACATATG+AGG + Chr5:102123156-102123175 MsG0580029798.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTCACTATATTTCCCTT+TGG - Chr5:102121856-102121875 None:intergenic 30.0%
TGATTATTTATTCGCAGGAA+AGG + Chr5:102118033-102118052 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
TTAACAGTTGGATTTGTACT+TGG - Chr5:102121501-102121520 None:intergenic 30.0%
TTGCAACACTACAATGTATT+AGG - Chr5:102117264-102117283 None:intergenic 30.0%
TTTCTGACAGTGAAAATGAA+TGG - Chr5:102117481-102117500 None:intergenic 30.0%
TTTGACAGGATTATTGCTAA+GGG + Chr5:102116736-102116755 MsG0580029798.01.T01:CDS 30.0%
TTTGCACTGTTTGATATGAT+TGG - Chr5:102122753-102122772 None:intergenic 30.0%
! AAAGTTTCAAGTACTTGATG+AGG - Chr5:102118468-102118487 None:intergenic 30.0%
! AATCTATACATGGATTGTCA+TGG - Chr5:102122249-102122268 None:intergenic 30.0%
! AATTTCTACATGGATTGTCA+TGG - Chr5:102117822-102117841 None:intergenic 30.0%
! ATCTATTATTAGAGCATCCT+TGG + Chr5:102123057-102123076 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
! ATTCGCCTAATGTTTCTTTT+AGG + Chr5:102119190-102119209 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
! CAATTTTTATCCGACTCAAA+AGG + Chr5:102120642-102120661 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
! CTAGACAACAAGAAATTTTC+TGG - Chr5:102116859-102116878 None:intergenic 30.0%
! TATTCGCAGGAAAAGTATAT+CGG + Chr5:102118041-102118060 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
! TCTGGTTCATTTAATTAGGA+TGG - Chr5:102122105-102122124 None:intergenic 30.0%
! TGATTTTGTGCTATAAGCAT+GGG + Chr5:102121306-102121325 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
! TGTTTGTTTGGTAATTGGTA+AGG - Chr5:102116373-102116392 None:intergenic 30.0%
! TTGATTTTGTGCTATAAGCA+TGG + Chr5:102121305-102121324 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGACAGGATTATTGCTA+AGG + Chr5:102116735-102116754 MsG0580029798.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTTCTTTAGTTTGTGAGAA+TGG + Chr5:102120358-102120377 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
!! CAAAACTAATCCTTTTGAGT+CGG - Chr5:102120655-102120674 None:intergenic 30.0%
!! CCATTCTGGTTCATTTAATT+AGG - Chr5:102122109-102122128 None:intergenic 30.0%
!! CTTCTTTAGTTTGTGAGAAT+GGG + Chr5:102120359-102120378 MsG0580029798.01.T01:intron 30.0%
!! GATCTTTGAACATTTGGTTT+TGG - Chr5:102116406-102116425 None:intergenic 30.0%
!! GGTTTTTGATTGATTCACAA+AGG - Chr5:102121439-102121458 None:intergenic 30.0%
!!! AGAAGCTTCATTTTTTTCTC+AGG - Chr5:102120841-102120860 None:intergenic 30.0%
!!! GTCTCTAGAACAAGTATTTT+AGG - Chr5:102118271-102118290 None:intergenic 30.0%
!!! TTATCGGTTTTCATTGAAGA+AGG + Chr5:102122020-102122039 MsG0580029798.01.T01:CDS 30.0%
AAACCTCAAATCAGAGATGT+CGG + Chr5:102120016-102120035 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
AACCATTGTACTAAAGGTCA+TGG - Chr5:102117188-102117207 None:intergenic 35.0%
AACCTTAACTCTTGACAAAC+AGG - Chr5:102117103-102117122 None:intergenic 35.0%
AAGAGATGAGCATCTATACA+AGG + Chr5:102119537-102119556 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
AAGCATATCAAACAGTGCTA+AGG + Chr5:102118354-102118373 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
AAGTGGTACAATCACATATG+AGG + Chr5:102119286-102119305 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
AAGTTCTACGTCGTAAATAC+GGG + Chr5:102118098-102118117 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
AATTGGTAAGGTTGTTGAGA+AGG - Chr5:102116361-102116380 None:intergenic 35.0%
ACACACTTGGTAAGGAATTA+GGG + Chr5:102121577-102121596 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
ACCGAGTGAAATGTTAGATT+TGG - Chr5:102120955-102120974 None:intergenic 35.0%
ACCTTAACTCTTGACAAACA+GGG - Chr5:102117102-102117121 None:intergenic 35.0%
ACGGGAAGGAAATAGATATA+TGG + Chr5:102118116-102118135 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
ACTAAAAAAACTTGCCCTCA+AGG + Chr5:102118756-102118775 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
AGTCAAGCTTAGTACATACA+AGG - Chr5:102122639-102122658 None:intergenic 35.0%
ATACTGTTTAGGAGAGCTTA+TGG - Chr5:102119072-102119091 None:intergenic 35.0%
ATATTGAGCTGAATCTCTTC+TGG - Chr5:102123135-102123154 None:intergenic 35.0%
ATATTTGATGCCATCTTGCA+AGG + Chr5:102122699-102122718 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
ATGGGAAGGAAGTAGATATA+TGG + Chr5:102122511-102122530 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
ATTAAAATGCTCAGATTGGG+TGG + Chr5:102120451-102120470 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
ATTGGTAAGGTTGTTGAGAA+GGG - Chr5:102116360-102116379 None:intergenic 35.0%
CAAATCATGCAACATATGAG+TGG + Chr5:102116625-102116644 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
CATAATATATGCAAGGTCTG+GGG + Chr5:102117584-102117603 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
CTAAAAGAAGGACATGTAGT+GGG - Chr5:102117992-102118011 None:intergenic 35.0%
CTACAATGTATTAGGTGCAA+CGG - Chr5:102117256-102117275 None:intergenic 35.0%
CTGCATAACCATTGTACTAA+AGG - Chr5:102117194-102117213 None:intergenic 35.0%
CTTATTTCCATAAGCTCTCT+AGG - Chr5:102119014-102119033 None:intergenic 35.0%
CTTTGTACTGAGAATTCAAC+TGG + Chr5:102116523-102116542 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GAAACAGCCATGAAAGAATA+CGG + Chr5:102119867-102119886 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
GAAATAGATATATGGAGTGC+AGG + Chr5:102118124-102118143 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGCAATGTTTACTAACA+TGG + Chr5:102119253-102119272 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTTCTACGTCGTAAATA+CGG + Chr5:102118097-102118116 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTTCTACGTCGTAAATA+TGG + Chr5:102118097-102118116 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GAATTAGGAAGAGGACAATT+TGG + Chr5:102116490-102116509 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GCAAATTTACACACTTGGTA+AGG + Chr5:102121569-102121588 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
GCATAATATATGCAAGGTCT+GGG + Chr5:102117583-102117602 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
GCCATCCTAATTAATTACTC+AGG + Chr5:102117651-102117670 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
GGTATACGGATGACAATTAT+TGG - Chr5:102117081-102117100 None:intergenic 35.0%
GGTTGTATAAAACAATGCTG+TGG - Chr5:102120897-102120916 None:intergenic 35.0%
GTATAAAACAATGCTGTGGT+AGG - Chr5:102120893-102120912 None:intergenic 35.0%
GTTATGCAGTGTTATGAACA+TGG + Chr5:102117205-102117224 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
GTTGTCTAGTAAGGATGATA+AGG + Chr5:102116870-102116889 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
TAAACATTGCCTTCAAACCT+TGG - Chr5:102119247-102119266 None:intergenic 35.0%
TAAAGAAGGTGGAAATGCTT+CGG + Chr5:102118675-102118694 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
TAAGGATAATGCAATGACGT+TGG - Chr5:102118575-102118594 None:intergenic 35.0%
TACACACTTGGGAAAGAATT+AGG + Chr5:102116475-102116494 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
TACACACTTGGTAAGGAATT+AGG + Chr5:102121576-102121595 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
TACATTGTAGTGTTGCAATG+TGG + Chr5:102117266-102117285 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
TACCATGACCTTTAGTACAA+TGG + Chr5:102117183-102117202 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
TATTTACGACGTAGAACTTC+TGG - Chr5:102118097-102118116 None:intergenic 35.0%
TCGATACGATTATTGCCAAA+GGG + Chr5:102121838-102121857 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
TCTAAAAGAAGGACATGTAG+TGG - Chr5:102117993-102118012 None:intergenic 35.0%
TCTAGGGAAAAAAGGATTTC+TGG - Chr5:102119748-102119767 None:intergenic 35.0%
TGAGGAAAGGATCAGAATTT+GGG - Chr5:102121056-102121075 None:intergenic 35.0%
TGCATAATATATGCAAGGTC+TGG + Chr5:102117582-102117601 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
TGTATTTCTCTGCAACTGTA+TGG + Chr5:102122275-102122294 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
TTACTGTCAACTGACAACAT+TGG + Chr5:102122963-102122982 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
TTAGCACTGTTTGATATGCT+TGG - Chr5:102118355-102118374 None:intergenic 35.0%
TTCGATACGATTATTGCCAA+AGG + Chr5:102121837-102121856 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAATAGAAGGGTTTCTG+AGG - Chr5:102121074-102121093 None:intergenic 35.0%
TTGGTAAGGTTGTTGAAAAG+GGG - Chr5:102121460-102121479 None:intergenic 35.0%
TTTCCATCTTCTTTAAGCCA+AGG - Chr5:102123077-102123096 None:intergenic 35.0%
! AAAGTTTCAAGTACTTGGTG+AGG - Chr5:102122864-102122883 None:intergenic 35.0%
! ACTACTTGTCTTTTGATCAG+AGG + Chr5:102117901-102117920 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
! ATTCGCAGGAAAAGTATATC+GGG + Chr5:102118042-102118061 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
! GAGCATGTTTGTTTGGTAAT+TGG - Chr5:102121479-102121498 None:intergenic 35.0%
! GGTAAAATCAACTGGTTCAT+CGG + Chr5:102122588-102122607 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
! GTATCTGACCTTTTAACAGT+TGG - Chr5:102121513-102121532 None:intergenic 35.0%
! GTTTAATCCTTTTCACTTGC+TGG - Chr5:102120340-102120359 None:intergenic 35.0%
! TGAATTGCTTCATTCTGGAA+AGG - Chr5:102118723-102118742 None:intergenic 35.0%
! TTGACTTTGAAAGTCTTCCA+TGG + Chr5:102122727-102122746 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATTTTACCTGCCCAAAA+TGG - Chr5:102118184-102118203 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTACAATGATGAGGAG+TGG + Chr5:102120239-102120258 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
!! TGAGTTTAAAGGTGCTTATG+AGG + Chr5:102116663-102116682 MsG0580029798.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTTGAATCTGATTTGCG+AGG - Chr5:102120069-102120088 None:intergenic 35.0%
!!! AACATTTGGTTTTGGACTTG+GGG - Chr5:102116398-102116417 None:intergenic 35.0%
!!! AGCTTCATTTTTTTCTCAGG+TGG - Chr5:102120838-102120857 None:intergenic 35.0%
!!! CTTGTTTTAGAGACGGAAAA+AGG + Chr5:102122675-102122694 MsG0580029798.01.T01:intron 35.0%
!!! GAACATTTGGTTTTGGACTT+GGG - Chr5:102116399-102116418 None:intergenic 35.0%
!!! TGAACATTTGGTTTTGGACT+TGG - Chr5:102116400-102116419 None:intergenic 35.0%
AAATTTGCGCAGCTAGCAAT+CGG - Chr5:102120134-102120153 None:intergenic 40.0%
AACATGGACACTGACAAAAG+TGG + Chr5:102119269-102119288 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
AACCGATAAACCGAAATCAG+TGG - Chr5:102122009-102122028 None:intergenic 40.0%
AAGCTATCCTAGAGAGCTTA+TGG + Chr5:102119004-102119023 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
AATCAGTCAAGCCTAGTACA+AGG - Chr5:102118244-102118263 None:intergenic 40.0%
ACACCAACATGTCTATGATC+TGG - Chr5:102116241-102116260 None:intergenic 40.0%
ACATATGAGGAATTAAGGGC+AGG + Chr5:102119299-102119318 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
ACATATGAGGAATTGTTGGC+AGG + Chr5:102123169-102123188 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
ACCCATACCGTATTCTTTCA+TGG - Chr5:102119877-102119896 None:intergenic 40.0%
ACCCTGTTTGTCAAGAGTTA+AGG + Chr5:102117098-102117117 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
AGAAGAGATCCAAGGTTTGA+AGG + Chr5:102119235-102119254 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
AGCCATGAAAGAATACGGTA+TGG + Chr5:102119872-102119891 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
CAAATCATGCAGCATATGAG+TGG + Chr5:102121726-102121745 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
CATCCTTGGCTTAAAGAAGA+TGG + Chr5:102123071-102123090 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
CTAAAGGTCATGGTACAAAG+TGG - Chr5:102117178-102117197 None:intergenic 40.0%
CTAACATTTCACTCGGTTCA+AGG + Chr5:102120958-102120977 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
CTCTTGACAAACAGGGTATA+CGG - Chr5:102117095-102117114 None:intergenic 40.0%
CTGAGGAAAGGATCAGAATT+TGG - Chr5:102121057-102121076 None:intergenic 40.0%
CTTGGGAAAGAATTAGGAAG+AGG + Chr5:102116481-102116500 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCATCAGAAGAGATCCA+AGG + Chr5:102119227-102119246 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGGACTGCACTATCTAT+TGG - Chr5:102123113-102123132 None:intergenic 40.0%
GAAGCTGTGATACGTTTCTT+TGG - Chr5:102118409-102118428 None:intergenic 40.0%
GAAGCTGTGATACGTTTGTT+TGG - Chr5:102122807-102122826 None:intergenic 40.0%
GAAGTAGATATATGGAGTGC+AGG + Chr5:102122519-102122538 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
GATCATCCTTGGCTTAAAGA+AGG + Chr5:102118661-102118680 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
GCCATGAAAGAATACGGTAT+GGG + Chr5:102119873-102119892 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
GGATGATAAGGCAACTATCA+AGG + Chr5:102116882-102116901 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
GGGTGGTTGTTTGAGTAAAA+AGG + Chr5:102116207-102116226 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
GTACTTGGAGCATGTTTGTT+TGG - Chr5:102121486-102121505 None:intergenic 40.0%
GTCAACATGACCTTGCAATA+TGG - Chr5:102118314-102118333 None:intergenic 40.0%
GTCAATATGACCTTGCAAGA+TGG - Chr5:102122712-102122731 None:intergenic 40.0%
GTGAGGCAAATTTACACACT+TGG + Chr5:102121564-102121583 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
GTGCTAAGGATCTTGTTAGT+AGG + Chr5:102118368-102118387 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
GTTCATCGGTGTGTTCATTA+TGG + Chr5:102122602-102122621 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
GTTGTTATGGAACTTTGTGC+TGG + Chr5:102116703-102116722 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
TAGGCTGATGTAGATGGAAA+TGG + Chr5:102119460-102119479 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
TATGGATGTCGTGTGTCATA+TGG - Chr5:102117867-102117886 None:intergenic 40.0%
TCTACGTCGTAAATATGGGA+AGG + Chr5:102122497-102122516 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
TGGATCAAATGGGATAGTGT+AGG + Chr5:102120804-102120823 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
TTGGCAGGATTACAAAGACT+CGG + Chr5:102123184-102123203 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTAAGGTTGTTGAGAAG+GGG - Chr5:102116359-102116378 None:intergenic 40.0%
TTTCCACCTTCTTTAAGCCA+AGG - Chr5:102118670-102118689 None:intergenic 40.0%
TTTGGGCAGGTAAAATCAAC+TGG + Chr5:102118185-102118204 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
! AGAATAGCTTGCCTTGTTGT+TGG - Chr5:102120268-102120287 None:intergenic 40.0%
! ATAGAAGGGTTTCTGAGGAA+AGG - Chr5:102121069-102121088 None:intergenic 40.0%
! ATTCGCAGGAAAGGTATATC+AGG + Chr5:102122437-102122456 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
! ATTTTACCTGCCCAAAATGG+AGG - Chr5:102118181-102118200 None:intergenic 40.0%
! CATAGACATGTTGGTGTTTC+TGG + Chr5:102116244-102116263 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
! CTGTTTGATATGATTGGCCA+TGG - Chr5:102122747-102122766 None:intergenic 40.0%
! GGGCATGTTTGTTTGGTAAT+TGG - Chr5:102116378-102116397 None:intergenic 40.0%
! GTTGTAATGGAACTTTGTGC+TGG + Chr5:102121804-102121823 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
! TTGACTTTGAAAGTCGTCCA+TGG + Chr5:102118329-102118348 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTATCAAGGCCACTGATTT+CGG + Chr5:102116895-102116914 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTTGTTCTAGAGACGGAAA+AGG + Chr5:102118276-102118295 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
!! CTTGTTCTAGAGACGGAAAA+GGG + Chr5:102118277-102118296 MsG0580029798.01.T01:intron 40.0%
!!! TTGTCGGTTTTCATCGAAGA+AGG + Chr5:102116919-102116938 MsG0580029798.01.T01:CDS 40.0%
AATGACAGATTCTGCCGTTC+TGG - Chr5:102117708-102117727 None:intergenic 45.0%
AGTGACTGGACTAACCTTGA+GGG - Chr5:102118773-102118792 None:intergenic 45.0%
ATCACAGCTTCACAGGTTCT+AGG + Chr5:102118418-102118437 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
ATCACAGCTTCTCAGGTTCT+AGG + Chr5:102122816-102122835 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
CAAACGTATCACAGCTTCTC+AGG + Chr5:102122809-102122828 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
CAATTGCAGTGTTGCGATTG+CGG + Chr5:102117315-102117334 MsG0580029798.01.T01:intron 45.0%
CAGAGATGTCGGATGAAGAT+TGG + Chr5:102120027-102120046 MsG0580029798.01.T01:intron 45.0%
CATCCTTGGCTTAAAGAAGG+TGG + Chr5:102118664-102118683 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
CTGTTTGATATGCTTGGCCA+TGG - Chr5:102118349-102118368 None:intergenic 45.0%
CTTGGTAAGGAATTAGGGAG+AGG + Chr5:102121582-102121601 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
GAAACGTATCACAGCTTCAC+AGG + Chr5:102118411-102118430 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGGACTGCACTGTCTAT+TGG - Chr5:102118706-102118725 None:intergenic 45.0%
GAATTAGGGAGAGGACGATT+TGG + Chr5:102121591-102121610 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
GAGCCAGATCATAGACATGT+TGG + Chr5:102116235-102116254 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
GCTGCATCATGTGATGTAGT+AGG + Chr5:102117347-102117366 MsG0580029798.01.T01:intron 45.0%
GGATGATAAGGCAGCTATCA+AGG + Chr5:102121983-102122002 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
GTACTTGATGAGGCGATAAC+AGG - Chr5:102118458-102118477 None:intergenic 45.0%
GTGTTGCAATGTGGACTCTT+CGG + Chr5:102117275-102117294 MsG0580029798.01.T01:intron 45.0%
GTTATGGAACTTTGTGCTGG+TGG + Chr5:102116706-102116725 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
TAGTGACTGGACTAACCTTG+AGG - Chr5:102118774-102118793 None:intergenic 45.0%
TCTACGTCGTAAATACGGGA+AGG + Chr5:102118102-102118121 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
! ACATGTAGTGGGATAAGGCT+TGG - Chr5:102117981-102118000 None:intergenic 45.0%
! CATCCGACATCTCTGATTTG+AGG - Chr5:102120022-102120041 None:intergenic 45.0%
! CGCTCTGAATTGCTTCATTC+TGG - Chr5:102118728-102118747 None:intergenic 45.0%
! GAAGGACATGTAGTGGGATA+AGG - Chr5:102117986-102118005 None:intergenic 45.0%
! GAGCTGAATCTCTTCTGGAA+AGG - Chr5:102123130-102123149 None:intergenic 45.0%
! GTAATGGAACTTTGTGCTGG+TGG + Chr5:102121807-102121826 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGCTTAGCTCAGTTGGTA+GGG + Chr5:102117555-102117574 MsG0580029798.01.T01:intron 45.0%
! TTCTGGTGTGCCTCCATTTT+GGG + Chr5:102122563-102122582 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTGGTGTGCCTCCATTTT+GGG + Chr5:102118168-102118187 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGTGGTGTGCCTCCATTT+TGG + Chr5:102118167-102118186 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGGTGGTGAACTTTTTGAC+AGG + Chr5:102116722-102116741 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
!! GCTATCAAGGCCACTGATTT+CGG + Chr5:102121996-102122015 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
!! GGCCACTGATTTCGGTTTAT+CGG + Chr5:102122004-102122023 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
!! TCCTTTTCACTTGCTGGTCT+TGG - Chr5:102120334-102120353 None:intergenic 45.0%
!! TTTCTGGTGTGCCTCCATTT+TGG + Chr5:102122562-102122581 MsG0580029798.01.T01:CDS 45.0%
!! AAAAAAAATATATATTAGTA+TGG + Chr5:102117629-102117648 MsG0580029798.01.T01:intron 5.0%
!!! ATATATATTTTTTTTTTTTG+TGG - Chr5:102117624-102117643 None:intergenic 5.0%
AACCGACAAGCCGAAATCAG+TGG - Chr5:102116908-102116927 None:intergenic 50.0%
AGCTTACTGAAGCGGAAGTG+CGG + Chr5:102119342-102119361 MsG0580029798.01.T01:CDS 50.0%
AGGAGTGGAGTCCAACAACA+AGG + Chr5:102120254-102120273 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
AGGGCAGGATTGCAAAGACT+CGG + Chr5:102119314-102119333 MsG0580029798.01.T01:CDS 50.0%
CAGCTAGCAATCGGAGCTAA+TGG - Chr5:102120125-102120144 None:intergenic 50.0%
CCTGTGTCTGTGCATTGTTG+CGG - Chr5:102119512-102119531 None:intergenic 50.0%
CGGCTCAAAGCTTACTGAAG+CGG + Chr5:102119334-102119353 MsG0580029798.01.T01:CDS 50.0%
CTTCGGTGGTCACAGAAACA+CGG + Chr5:102117292-102117311 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
GAACGAGAACGCAGACATGT+TGG + Chr5:102121354-102121373 MsG0580029798.01.T01:CDS 50.0%
GCCAAGACCAGCAAGTGAAA+AGG + Chr5:102120330-102120349 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
GGACTTGGGGCATGTTTGTT+TGG - Chr5:102116385-102116404 None:intergenic 50.0%
GGGTGACGAAGACACAATCA+GGG + Chr5:102119893-102119912 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
GTGAGCTTAGCTCAGTTGGT+AGG + Chr5:102117554-102117573 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
TGGGTGACGAAGACACAATC+AGG + Chr5:102119892-102119911 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
TTGCAATGTGGACTCTTCGG+TGG + Chr5:102117278-102117297 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
! CGAGTTTAAAGGTGCGTACG+AGG + Chr5:102121764-102121783 MsG0580029798.01.T01:CDS 50.0%
! CGCAGACATGTTGGTGTTTC+TGG + Chr5:102121363-102121382 MsG0580029798.01.T01:CDS 50.0%
!! CAGCTTCACAGGTTCTAGGT+AGG + Chr5:102118422-102118441 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
!! CAGCTTCTCAGGTTCTAGGT+AGG + Chr5:102122820-102122839 MsG0580029798.01.T01:intron 50.0%
CCAACTGAGCTAAGCTCACG+AGG - Chr5:102117553-102117572 None:intergenic 55.0%
CCGCAACAATGCACAGACAC+AGG + Chr5:102119509-102119528 MsG0580029798.01.T01:CDS 55.0%
CCTCGTGAGCTTAGCTCAGT+TGG + Chr5:102117550-102117569 MsG0580029798.01.T01:intron 55.0%
!! CACTTGCTGGTCTTGGCTGT+AGG - Chr5:102120327-102120346 None:intergenic 55.0%
!! GGCCACTGATTTCGGCTTGT+CGG + Chr5:102116903-102116922 MsG0580029798.01.T01:CDS 55.0%
! AGCGGAAGTGCGGCAGCTTA+TGG + Chr5:102119352-102119371 MsG0580029798.01.T01:CDS 60.0%
! GGTGTGCCTCCATTTTGGGC+AGG + Chr5:102118172-102118191 MsG0580029798.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 102116205 102123277 102116205 ID=MsG0580029798.01;Name=MsG0580029798.01
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Chr5 exon 102116205 102116940 102116205 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6946;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102118050 102118193 102118050 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6947;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102118287 102118439 102118287 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6948;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102118662 102118777 102118662 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6949;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102119212 102119379 102119212 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6950;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102119463 102119590 102119463 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6951;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102121323 102122041 102121323 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6952;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 exon 102122445 102122588 102122445 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6953;Parent=MsG0580029798.01.T01
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Chr5 exon 102123069 102123277 102123069 ID=MsG0580029798.01.T01:exon:6955;Parent=MsG0580029798.01.T01
Chr5 CDS 102116205 102116940 102116205 ID=MsG0580029798.01.T01:cds;Parent=MsG0580029798.01.T01
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Chr5 CDS 102123069 102123277 102123069 ID=MsG0580029798.01.T01:cds;Parent=MsG0580029798.01.T01
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>MsG0580029798.01.T01

ATGGGTGGTTGTTTGAGTAAAAAGGAATCAGAGCCAGATCATAGACATGTTGGTGTTTCTGGTATGCACAATCATAATCATAATCACAATCACAATCATAATCATAATCACAATCACAAGAATCATGAACCTTATGTGAATCAATCAAAAACCCCTTCTCAACAACCTTACCAATTACCAAACAAACATGCCCCAAGTCCAAAACCAAATGTTCAAAGATCAAATACAAACACAATTCTTGGTAAACAATTTGAAGATGTGAAACAAATTTACACACTTGGGAAAGAATTAGGAAGAGGACAATTTGGTGTGACTTATCTTTGTACTGAGAATTCAACTGGATTGAAATATGCATGCAAATCAATTTCAAAGAGGAAACTTGTTAGTAAATCTGATAAAGAAGATATAAAGAGGGAGATTCAAATCATGCAACATATGAGTGGACAACCGAATATTGTTGAGTTTAAAGGTGCTTATGAGGATAAAAATTCAGTTCATGTTGTTATGGAACTTTGTGCTGGTGGTGAACTTTTTGACAGGATTATTGCTAAGGGAAAGTATAGTGAAAGAGCTGCAGCTTCAATTTGTAGACAAATTGTTAATGTTGTTCATATTTGTCATTTTATGGGTGTGATGCATAGAGATTTGAAGCCAGAAAATTTCTTGTTGTCTAGTAAGGATGATAAGGCAACTATCAAGGCCACTGATTTCGGCTTGTCGGTTTTCATCGAAGAAGGAAAAGTATATCGGGATATAGTTGGCAGTGCTTATTATGTTGCACCAGAAGTTCTACGTCGTAAATACGGGAAGGAAATAGATATATGGAGTGCAGGAGTTATATTGTACATCTTACTTTGTGGTGTGCCTCCATTTTGGGCAGAGACGGAAAAGGGAATATTTGATGCCATATTGCAAGGTCATGTTGACTTTGAAAGTCGTCCATGGCCAAGCATATCAAACAGTGCTAAGGATCTTGTTAGTAGGATGCTTACACAAGATCCAAAGAAACGTATCACAGCTTCACAGGTTCTAGATCATCCTTGGCTTAAAGAAGGTGGAAATGCTTCGGACAAACCAATAGACAGTGCAGTCCTTTCCAGAATGAAGCAATTCAGAGCGATGAATAAACTAAAAAAACTTGCCCTCAAGGTAATTGCTGAAAATCTTTCATCAGAAGAGATCCAAGGTTTGAAGGCAATGTTTACTAACATGGACACTGACAAAAGTGGTACAATCACATATGAGGAATTAAGGGCAGGATTGCAAAGACTCGGCTCAAAGCTTACTGAAGCGGAAGTGCGGCAGCTTATGGAAGCTGCTGATGTAGATGGAAATGGAACAATTGACTACATAGAATTCATCACCGCAACAATGCACAGACACAGGTTAGAAAGAGATGAGCATCTATACAAGGCCTTCCAATATTTTGATAAAGACAATAGTGGCATGGGTGTTTGTCTGAGTAGAAAAGAATCAGAACGAGAACGCAGACATGTTGGTGTTTCTGGTAAGCACAATCATAATCACAATCACAACAACAATCACAAGAATCATGAACCCTTTGTGAATCAATCAAAAACCCCTTTTCAACAACCTTACCAATTACCAAACAAACATGCTCCAAGTACAAATCCAACTGTTAAAAGGTCAGATACAAACACAATTCTAGGTAAACAATTTGAAGATGTGAGGCAAATTTACACACTTGGTAAGGAATTAGGGAGAGGACGATTTGGCGTGACTTATCTTTGTACTAAGAATTCAACTGGATTGACATATGCTTGCAAATCAATTTCTAAGAGTAATCTTGTTAGTGAACCTGATAAAGAAGATATAAAGAGGGAGATTCAAATCATGCAGCATATGAGTGGACAACCAAATATTGTCGAGTTTAAAGGTGCGTACGAGGATAAAAATTCAGTTCATGTTGTAATGGAACTTTGTGCTGGTGGTGAACTTTTCGATACGATTATTGCCAAAGGGAAATATAGTGAAAGAGCTGCAGCTTCAATTTTTAGACAAATTGTTAATGTTGTTCATATTTGTCATTTTATGGGTGTGATGCATAGAGATTTGAAGCCAGAAAATTTCTTGTTGTCTAGTAAGGATGATAAGGCAGCTATCAAGGCCACTGATTTCGGTTTATCGGTTTTCATTGAAGAAGGAAAGGTATATCAGGATATAACTGGCAGTGCTTATTATGTTGCACCAGAAGTTCTACGTCGTAAATATGGGAAGGAAGTAGATATATGGAGTGCAGGAGTTATATTGTATGTCTTACTTTCTGGTGTGCCTCCATTTTGGGCAGAGACGGAAAAAGGAATATTTGATGCCATCTTGCAAGGTCATATTGACTTTGAAAGTCTTCCATGGCCAATCATATCAAACAGTGCAAAGGACCTTGTTAGTAAGATGCTTATACAAGATCCAAACAAACGTATCACAGCTTCTCAGGTTCTAGAGCATCCTTGGCTTAAAGAAGATGGAAATGCTTTTGATAAACCAATAGATAGTGCAGTCCTTTCCAGAAGAGATTCAGCTCAATATTTCTATCTTCAATCACATATGAGGAATTGTTGGCAGGATTACAAAGACTCGGCTCAATATTTTGATAATAACAATAGTAAGCAAGTATTTCTATCTTCAATTACTATTTCTTCAATATATTAG

Protein sequence

>MsG0580029798.01.T01

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