AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008426.01

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MsG0280008426.01.T01 AT5G09950 26.937 271 178 7 5 273 470 722 4.02e-14 75.1
MsG0280008426.01.T01 AT5G09950 43.936 437 225 8 7 438 574 995 1.69e-115 361
MsG0280008426.01.T01 AT5G09950 26.937 271 178 7 5 273 470 722 4.02e-14 75.1
MsG0280008426.01.T01 AT3G02010 40.878 433 240 3 7 438 408 825 9.53e-115 355
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MsG0280008426.01.T01 AT4G14850 25.168 298 192 10 4 294 162 435 1.29e-18 89.0
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MsG0280008426.01.T01 AT3G56550 38.688 442 249 5 1 438 158 581 1.06e-107 330
MsG0280008426.01.T01 AT3G56550 25.703 249 166 6 4 250 58 289 6.29e-19 89.7
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MsG0280008426.01.T01 AT2G01510 39.130 437 249 4 4 438 163 584 1.63e-105 325
MsG0280008426.01.T01 AT2G01510 26.421 299 196 7 1 295 59 337 7.68e-18 86.3
MsG0280008426.01.T01 AT3G14330 39.450 436 248 3 4 438 290 710 4.86e-105 327
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MsG0280008426.01.T01 AT3G22690 31.492 181 102 5 4 180 188 350 1.95e-19 91.7
MsG0280008426.01.T01 AT3G22690 28.767 219 122 6 19 236 102 287 1.88e-16 82.4
MsG0280008426.01.T01 AT5G50390 37.130 439 257 4 4 438 278 701 1.66e-99 312
MsG0280008426.01.T01 AT5G50390 26.829 246 163 4 4 249 177 405 8.78e-19 89.4
MsG0280008426.01.T01 AT1G18485 38.568 433 250 4 7 438 553 970 1.72e-99 318
MsG0280008426.01.T01 AT1G18485 26.357 258 156 7 4 250 139 373 2.68e-17 85.1
MsG0280008426.01.T01 AT1G18485 25.203 246 167 5 4 249 449 677 4.63e-17 84.3
MsG0280008426.01.T01 AT1G18485 27.411 197 119 5 4 198 346 520 1.18e-14 77.0
MsG0280008426.01.T01 AT1G16480 38.851 435 251 3 4 438 518 937 1.79e-98 315
MsG0280008426.01.T01 AT1G16480 27.519 258 153 9 1 249 413 645 7.16e-20 93.2
MsG0280008426.01.T01 AT1G16480 22.581 310 217 7 1 309 8 295 2.15e-17 85.5
MsG0280008426.01.T01 AT1G16480 25.714 245 164 5 7 250 318 545 5.03e-15 78.2
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MsG0280008426.01.T01 AT4G14050 34.507 142 85 4 55 194 41 176 3.07e-16 81.3
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MsG0280008426.01.T01 AT1G62670 28.369 282 180 8 13 287 253 519 8.98e-20 92.4
MsG0280008426.01.T01 AT1G62670 24.590 244 165 5 13 251 148 377 2.68e-11 66.2
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MsG0280008426.01.T01 AT1G18900 26.484 219 155 3 29 242 399 616 8.62e-17 83.6
MsG0280008426.01.T01 AT1G18900 26.484 219 155 3 29 242 399 616 8.98e-17 83.6
MsG0280008426.01.T01 AT1G62930 28.226 248 169 5 47 287 273 518 1.56e-16 82.4
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MsG0280008426.01.T01 AT1G06710 24.045 445 258 17 14 395 481 908 1.77e-12 70.1
MsG0280008426.01.T01 AT1G06710 26.457 223 148 3 9 229 632 840 2.76e-13 72.8
MsG0280008426.01.T01 AT1G06710 24.045 445 258 17 14 395 481 908 1.77e-12 70.1
MsG0280008426.01.T01 AT2G35130 23.214 336 227 11 47 368 269 587 3.36e-13 72.0
MsG0280008426.01.T01 AT2G35130 25.847 236 149 6 7 233 273 491 6.85e-12 67.8
MsG0280008426.01.T01 AT2G35130 23.577 246 175 6 47 283 244 485 3.56e-13 72.0
MsG0280008426.01.T01 AT2G35130 25.847 236 149 6 7 233 248 466 6.65e-12 67.8
MsG0280008426.01.T01 AT2G35130 23.577 246 175 6 47 283 247 488 3.84e-13 71.6
MsG0280008426.01.T01 AT2G35130 25.847 236 149 6 7 233 251 469 6.22e-12 68.2
MsG0280008426.01.T01 AT1G63070 25.210 238 158 5 13 244 247 470 4.78e-13 71.6
MsG0280008426.01.T01 AT2G01740 23.488 281 189 6 11 284 124 385 5.37e-13 71.2
MsG0280008426.01.T01 AT2G01740 23.810 252 174 6 14 263 196 431 5.77e-11 65.1
MsG0280008426.01.T01 AT1G63150 27.230 213 146 4 48 256 277 484 7.66e-13 70.9
MsG0280008426.01.T01 AT1G63150 25.347 288 162 9 13 295 150 389 8.19e-11 64.7
MsG0280008426.01.T01 AT1G63150 27.230 213 146 4 48 256 277 484 7.66e-13 70.9
MsG0280008426.01.T01 AT1G63150 25.347 288 162 9 13 295 150 389 8.19e-11 64.7
MsG0280008426.01.T01 AT1G74850 25.000 264 185 8 48 301 124 384 1.04e-12 70.9
MsG0280008426.01.T01 AT1G73710 29.139 151 104 2 47 195 603 752 1.18e-12 70.5
MsG0280008426.01.T01 AT1G64580 24.885 217 147 3 15 229 218 420 1.23e-12 70.1
MsG0280008426.01.T01 AT3G06920 24.201 219 149 3 13 229 214 417 2.03e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT3G06920 24.201 219 149 3 13 229 214 417 2.03e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT1G77150 54.348 46 21 0 193 238 2 47 2.11e-12 62.8
MsG0280008426.01.T01 AT3G06920 24.201 219 149 3 13 229 200 403 2.26e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 26.894 264 145 10 47 301 628 852 2.58e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 25.410 244 157 3 13 232 258 500 1.91e-11 66.6
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 26.894 264 145 10 47 301 628 852 2.58e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 25.410 244 157 3 13 232 258 500 1.91e-11 66.6
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 26.894 264 145 10 47 301 628 852 2.58e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 25.410 244 157 3 13 232 258 500 1.91e-11 66.6
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 26.894 264 145 10 47 301 628 852 2.58e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 25.410 244 157 3 13 232 258 500 1.91e-11 66.6
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 26.894 264 145 10 47 301 628 852 2.58e-12 69.7
MsG0280008426.01.T01 AT5G14770 25.410 244 157 3 13 232 258 500 1.91e-11 66.6
MsG0280008426.01.T01 AT5G65560 27.542 236 162 5 47 275 376 609 3.76e-12 68.9
MsG0280008426.01.T01 AT5G65560 25.094 267 187 5 32 286 186 451 7.79e-12 68.2
MsG0280008426.01.T01 AT5G65560 27.542 236 162 5 47 275 376 609 3.76e-12 68.9
MsG0280008426.01.T01 AT5G65560 25.094 267 187 5 32 286 186 451 7.79e-12 68.2
MsG0280008426.01.T01 AT5G65560 27.542 236 162 5 47 275 376 609 3.76e-12 68.9
MsG0280008426.01.T01 AT5G65560 25.094 267 187 5 32 286 186 451 7.79e-12 68.2
MsG0280008426.01.T01 AT1G12300 25.506 247 165 5 1 242 248 480 3.89e-12 68.6
MsG0280008426.01.T01 AT1G09680 22.857 350 228 9 4 338 259 581 4.08e-12 68.6
MsG0280008426.01.T01 AT4G01400 29.688 192 126 5 115 299 206 395 4.55e-12 68.2
MsG0280008426.01.T01 AT3G22470 23.232 297 202 8 13 300 137 416 7.59e-12 67.8
MsG0280008426.01.T01 AT5G16640 27.273 275 162 9 6 265 172 423 7.63e-12 67.4
MsG0280008426.01.T01 AT4G34830 23.950 238 164 6 13 245 569 794 8.93e-12 67.8
MsG0280008426.01.T01 AT1G12620 23.404 235 161 4 13 242 139 359 1.35e-11 67.0
MsG0280008426.01.T01 AT4G11690 23.485 264 184 6 3 257 101 355 1.38e-11 67.0
MsG0280008426.01.T01 AT5G28460 26.070 257 167 8 3 252 429 669 1.51e-11 67.0
MsG0280008426.01.T01 AT3G60050 33.577 137 86 4 103 236 328 462 1.90e-11 66.2
MsG0280008426.01.T01 AT3G60050 33.577 137 86 4 103 236 328 462 1.90e-11 66.2
MsG0280008426.01.T01 AT5G28370 26.070 257 167 8 3 252 429 669 1.96e-11 66.6
MsG0280008426.01.T01 AT5G42310 23.824 319 211 7 13 318 266 565 2.36e-11 66.2
MsG0280008426.01.T01 AT5G61990 24.055 291 194 7 5 284 581 855 2.60e-11 66.2
MsG0280008426.01.T01 AT3G61520 26.070 257 167 8 3 252 429 669 2.87e-11 66.2
MsG0280008426.01.T01 AT3G22470 23.592 284 191 7 13 287 137 403 3.05e-11 65.9
MsG0280008426.01.T01 AT3G53700 25.328 229 139 6 14 232 398 604 3.52e-11 65.9
MsG0280008426.01.T01 AT2G41720 23.846 260 189 5 47 298 161 419 3.58e-11 65.9
MsG0280008426.01.T01 AT2G41720 24.255 235 128 6 13 244 422 609 6.91e-11 65.1
MsG0280008426.01.T01 AT1G06580 24.242 297 181 6 47 301 62 356 3.76e-11 65.5
MsG0280008426.01.T01 AT2G41720 23.846 260 189 5 47 298 161 419 3.96e-11 65.9
MsG0280008426.01.T01 AT2G41720 24.255 235 128 6 13 244 422 609 8.33e-11 64.7
MsG0280008426.01.T01 AT2G41720 23.846 260 189 5 47 298 29 287 4.72e-11 65.5
MsG0280008426.01.T01 AT2G41720 24.255 235 128 6 13 244 290 477 8.50e-11 64.7
MsG0280008426.01.T01 AT2G02150 24.390 246 159 4 9 229 325 568 5.20e-11 65.5
MsG0280008426.01.T01 AT2G02150 24.390 246 159 4 9 229 325 568 5.20e-11 65.5
MsG0280008426.01.T01 AT1G12700 21.176 255 182 4 14 263 312 552 5.41e-11 65.1
MsG0280008426.01.T01 AT1G12700 21.176 255 182 4 14 263 312 552 5.41e-11 65.1
MsG0280008426.01.T01 AT1G12700 21.176 255 182 4 14 263 296 536 6.63e-11 64.7
MsG0280008426.01.T01 AT1G79540 26.957 230 149 6 14 239 266 480 9.14e-11 64.7

Find 76 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 95 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTATAGAAAGATGAAGTTTA+AGG 0.171888 2:+31653709 MsG0280008426.01.T01:CDS
AAATATATTTCCTTTGAAAA+TGG 0.173396 2:-31654223 None:intergenic
TGGTTGTTTGATTGATCTTT+TGG 0.233260 2:+31653865 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATTAGTGCTTGTTCGAATTT+AGG 0.235226 2:+31653458 MsG0280008426.01.T01:CDS
ACATAGTTTCCACTAGTTTC+TGG 0.241915 2:-31654043 None:intergenic
GCAAGAATTCACGGTAATTT+AGG 0.244153 2:+31653980 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCGAATTAGTGAACCTGATT+TGG 0.291232 2:+31653274 MsG0280008426.01.T01:CDS
CACCCCATGAACCTCCTTCA+TGG 0.298687 2:-31653822 None:intergenic
GGAATAAGATTAAGATGAAT+AGG 0.305179 2:+31653522 MsG0280008426.01.T01:CDS
GTTGCTCTTGTCTAGATTAC+TGG 0.311954 2:+31654539 MsG0280008426.01.T01:CDS
TTTAGCTTAGTGGAGATAAA+TGG 0.320285 2:+31654163 MsG0280008426.01.T01:CDS
GGGTCGAGCAGGGAGATTAA+AGG 0.330907 2:+31653886 MsG0280008426.01.T01:CDS
TATAGTAGAATTGAAGAATA+TGG 0.339768 2:+31654262 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATAAAATGTCTGAGAATGAT+AGG 0.342503 2:+31653615 MsG0280008426.01.T01:CDS
TATAGAAAGATGAAGTTTAA+GGG 0.344663 2:+31653710 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATATGCAAGTTACGAAAATA+AGG 0.347270 2:+31653408 MsG0280008426.01.T01:CDS
GCAACAATTGTAACTTCATT+AGG 0.352281 2:-31653431 None:intergenic
GACCTCCACAACACCGCATT+TGG 0.363990 2:-31653944 None:intergenic
CGATGTAGAAGAAGAGGATA+AGG 0.372521 2:+31654315 MsG0280008426.01.T01:CDS
TTTGTTATACTGCAATGATT+GGG 0.375074 2:+31653645 MsG0280008426.01.T01:CDS
ACCACGAAAGTTGCACTATC+AGG 0.378750 2:-31653740 None:intergenic
CAACCATAATGCTCGAGTTT+CGG 0.381022 2:-31653848 None:intergenic
GAACCGAAACTCGAGCATTA+TGG 0.389507 2:+31653845 MsG0280008426.01.T01:CDS
GCATTCCACGTCGCCAAATC+AGG 0.407037 2:-31653287 None:intergenic
ATTCTTATAGCTAAACTTGA+AGG 0.407159 2:-31654397 None:intergenic
GCAATGCATGAGTTTCTTAC+AGG 0.415316 2:+31654187 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCATGGTGTTAACAAGTTGC+CGG 0.417928 2:+31654138 MsG0280008426.01.T01:CDS
CATGTTGGATTAGTGGAAGA+AGG 0.429609 2:+31653782 MsG0280008426.01.T01:CDS
AAATCCATGAAGGAGGTTCA+TGG 0.433907 2:+31653818 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCCTGATAGTGCAACTTTCG+TGG 0.447851 2:+31653739 MsG0280008426.01.T01:CDS
TTATAGTTAGAGATCGAAAT+CGG 0.457753 2:+31654494 MsG0280008426.01.T01:CDS
GTGTTGTGGAGGTCTTTACT+TGG 0.461778 2:+31653953 MsG0280008426.01.T01:CDS
GATTAAGATGAATAGGTTTG+TGG 0.462453 2:+31653529 MsG0280008426.01.T01:CDS
CTTGGTGCGGCAAGAATTCA+CGG 0.462861 2:+31653971 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATTAAGATGAATAGGTTTGT+GGG 0.468754 2:+31653530 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATTCACGGTAATTTAGGTGT+TGG 0.475513 2:+31653986 MsG0280008426.01.T01:CDS
AACACCGCATTTGGTTTCAT+CGG 0.477087 2:-31653935 None:intergenic
TGAATGATGTTAAGAGAGTG+AGG 0.487623 2:+31654101 MsG0280008426.01.T01:CDS
CTATGGCTAATCTTTCACTA+TGG 0.494808 2:-31654354 None:intergenic
TTGTTATACTGCAATGATTG+GGG 0.496750 2:+31653646 MsG0280008426.01.T01:CDS
CATGGTGTTAACAAGTTGCC+GGG 0.498050 2:+31654139 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATATGTATGCTAGTGTTGGC+AGG 0.502678 2:+31654077 MsG0280008426.01.T01:CDS
AATCCATGAAGGAGGTTCAT+GGG 0.503100 2:+31653819 MsG0280008426.01.T01:CDS
TTGTTCACATGTTGGATTAG+TGG 0.505178 2:+31653775 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCTCACAAAGTTAATAGAGT+TGG 0.513580 2:+31654018 MsG0280008426.01.T01:CDS
AGGGAGATTAAAGGAGGCAG+AGG 0.515922 2:+31653895 MsG0280008426.01.T01:CDS
AATTTAGGTGCTGTTAGTCA+AGG 0.542449 2:+31653473 MsG0280008426.01.T01:CDS
GTTGATATGTATTCGAAATG+TGG 0.546183 2:+31653563 MsG0280008426.01.T01:CDS
TAGGTTTGTGGGAACTGCAT+TGG 0.550343 2:+31653541 MsG0280008426.01.T01:CDS
GTAGAAGAAGAGGATAAGGA+AGG 0.554831 2:+31654319 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATGTTGGATTAGTGGAAGAA+GGG 0.559430 2:+31653783 MsG0280008426.01.T01:CDS
TAAAATGTCTGAGAATGATA+GGG 0.564168 2:+31653616 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATACGCCGCTGATATTAGCT+TGG 0.574045 2:-31654461 None:intergenic
TCGAATATGTATGCTAGTGT+TGG 0.575211 2:+31654073 MsG0280008426.01.T01:CDS
TGCTATAAGAGCAAATGCTA+TGG 0.575961 2:-31654371 None:intergenic
TGTTATACTGCAATGATTGG+GGG 0.577311 2:+31653647 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATGTTTGCTTGTTCACATGT+TGG 0.582663 2:+31653767 MsG0280008426.01.T01:CDS
GATTAAAGGAGGCAGAGGAG+TGG 0.591330 2:+31653900 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCTGTTCGATGTAGAAGAAG+AGG 0.596226 2:+31654309 MsG0280008426.01.T01:CDS
GGAAATATATTTGAAGATCG+CGG 0.598645 2:+31654234 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATCTCCACTAAGCTAAAACC+CGG 0.603934 2:-31654157 None:intergenic
TGAAACCAAATGCGGTGTTG+TGG 0.610043 2:+31653939 MsG0280008426.01.T01:CDS
GACAATCCCCACAAACTCGA+AGG 0.612782 2:-31654429 None:intergenic
CATGAAGGAGGTTCATGGGG+TGG 0.617066 2:+31653823 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATCCATGAAGGAGGTTCATG+GGG 0.619172 2:+31653820 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCGAGCAGGGAGATTAAAGG+AGG 0.632668 2:+31653889 MsG0280008426.01.T01:CDS
GTGGAGGTCTTTACTTGGTG+CGG 0.643287 2:+31653958 MsG0280008426.01.T01:CDS
AACCAAATGCGGTGTTGTGG+AGG 0.646719 2:+31653942 MsG0280008426.01.T01:CDS
GTGAACCTGATTTGGCGACG+TGG 0.647610 2:+31653282 MsG0280008426.01.T01:CDS
AATTGAAGAATATGGTCACA+AGG 0.650603 2:+31654270 MsG0280008426.01.T01:CDS
TCACAAGGCAAGAACATCAG+AGG 0.675471 2:+31654285 MsG0280008426.01.T01:CDS
AGGAAGCTGATGAAACATCA+TGG 0.675888 2:+31654121 MsG0280008426.01.T01:CDS
TATGTATGCTAGTGTTGGCA+GGG 0.683060 2:+31654078 MsG0280008426.01.T01:CDS
GAGTTGGAACCAGAAACTAG+TGG 0.687969 2:+31654034 MsG0280008426.01.T01:CDS
ATTTACCAAGCTAATATCAG+CGG 0.695821 2:+31654456 MsG0280008426.01.T01:CDS
TATGCCGATGAAACCAAATG+CGG 0.770723 2:+31653931 MsG0280008426.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAATATATTTCCTTTGAAAA+TGG - Chr2:31654226-31654245 None:intergenic 15.0%
!! TATAGAAAGATGAAGTTTAA+GGG + Chr2:31653710-31653729 MsG0280008426.01.T01:CDS 20.0%
!! TATAGTAGAATTGAAGAATA+TGG + Chr2:31654262-31654281 MsG0280008426.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATAGAAAGATGAAGTTTA+AGG + Chr2:31653709-31653728 MsG0280008426.01.T01:CDS 20.0%
! ATAAAATGTCTGAGAATGAT+AGG + Chr2:31653615-31653634 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
! ATATGCAAGTTACGAAAATA+AGG + Chr2:31653408-31653427 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
! ATTAAGATGAATAGGTTTGT+GGG + Chr2:31653530-31653549 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCTTATAGCTAAACTTGA+AGG - Chr2:31654400-31654419 None:intergenic 25.0%
! GGAATAAGATTAAGATGAAT+AGG + Chr2:31653522-31653541 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAATGTCTGAGAATGATA+GGG + Chr2:31653616-31653635 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
! TTATAGTTAGAGATCGAAAT+CGG + Chr2:31654494-31654513 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGTTATACTGCAATGATT+GGG + Chr2:31653645-31653664 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTGTTATACTGCAATGAT+TGG + Chr2:31653644-31653663 MsG0280008426.01.T01:CDS 25.0%
AATTGAAGAATATGGTCACA+AGG + Chr2:31654270-31654289 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGTGCTTGTTCGAATTT+AGG + Chr2:31653458-31653477 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
ATTTACCAAGCTAATATCAG+CGG + Chr2:31654456-31654475 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
GATTAAGATGAATAGGTTTG+TGG + Chr2:31653529-31653548 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
GCAACAATTGTAACTTCATT+AGG - Chr2:31653434-31653453 None:intergenic 30.0%
GGAAATATATTTGAAGATCG+CGG + Chr2:31654234-31654253 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
GTTGATATGTATTCGAAATG+TGG + Chr2:31653563-31653582 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
TCTCACAAAGTTAATAGAGT+TGG + Chr2:31654018-31654037 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTATACTGCAATGATTG+GGG + Chr2:31653646-31653665 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
! AGAGATTTTCAAATCCATGA+AGG + Chr2:31653808-31653827 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
! ATTAAAAACCTTCGAGTTTG+TGG + Chr2:31654421-31654440 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
! GGTTGTTTGATTGATCTTTT+GGG + Chr2:31653866-31653885 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
! TGGTTGTTTGATTGATCTTT+TGG + Chr2:31653865-31653884 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
! TTAAAAACCTTCGAGTTTGT+GGG + Chr2:31654422-31654441 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAGCTTAGTGGAGATAAA+TGG + Chr2:31654163-31654182 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
!! CGGTTTCATCATTTTAAAGA+TGG + Chr2:31654514-31654533 MsG0280008426.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTTGCTTGTTCACATGT+TGG + Chr2:31653767-31653786 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACGGTAATTTAGGTGT+TGG + Chr2:31653986-31654005 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
CTATGGCTAATCTTTCACTA+TGG - Chr2:31654357-31654376 None:intergenic 35.0%
GCAAGAATTCACGGTAATTT+AGG + Chr2:31653980-31653999 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
TCGAATATGTATGCTAGTGT+TGG + Chr2:31654073-31654092 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
TCGAATTAGTGAACCTGATT+TGG + Chr2:31653274-31653293 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
TGAATGATGTTAAGAGAGTG+AGG + Chr2:31654101-31654120 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
TGCTATAAGAGCAAATGCTA+TGG - Chr2:31654374-31654393 None:intergenic 35.0%
TGTTATACTGCAATGATTGG+GGG + Chr2:31653647-31653666 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
! ACATAGTTTCCACTAGTTTC+TGG - Chr2:31654046-31654065 None:intergenic 35.0%
! CAGAACTCATCCATTTTCAA+AGG + Chr2:31654213-31654232 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
! GATTTTCAAATCCATGAAGG+AGG + Chr2:31653811-31653830 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
! TAAAAACCTTCGAGTTTGTG+GGG + Chr2:31654423-31654442 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
! TGCTGTTAGTCAAGGTTTTT+GGG + Chr2:31653481-31653500 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTTCACATGTTGGATTAG+TGG + Chr2:31653775-31653794 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
!! AATTTAGGTGCTGTTAGTCA+AGG + Chr2:31653473-31653492 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGTTGGATTAGTGGAAGAA+GGG + Chr2:31653783-31653802 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
!! GGGTTCATTGTTTTGTGTTA+AGG + Chr2:31653501-31653520 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACGTGGAATGCTATTTTGAA+TGG + Chr2:31653299-31653318 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTTTGCTGTTCATGGTTAT+GGG + Chr2:31653669-31653688 MsG0280008426.01.T01:CDS 35.0%
AAATCCATGAAGGAGGTTCA+TGG + Chr2:31653818-31653837 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
AATCCATGAAGGAGGTTCAT+GGG + Chr2:31653819-31653838 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
AGGAAGCTGATGAAACATCA+TGG + Chr2:31654121-31654140 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
ATCTCCACTAAGCTAAAACC+CGG - Chr2:31654160-31654179 None:intergenic 40.0%
CAACCATAATGCTCGAGTTT+CGG - Chr2:31653851-31653870 None:intergenic 40.0%
CGATGTAGAAGAAGAGGATA+AGG + Chr2:31654315-31654334 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
GCAATGCATGAGTTTCTTAC+AGG + Chr2:31654187-31654206 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
GTAGAAGAAGAGGATAAGGA+AGG + Chr2:31654319-31654338 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCTCTTGTCTAGATTAC+TGG + Chr2:31654539-31654558 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
TATGCCGATGAAACCAAATG+CGG + Chr2:31653931-31653950 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
TCTGTTCGATGTAGAAGAAG+AGG + Chr2:31654309-31654328 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
! AACACCGCATTTGGTTTCAT+CGG - Chr2:31653938-31653957 None:intergenic 40.0%
! TCATGGTGTTAACAAGTTGC+CGG + Chr2:31654138-31654157 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
!! ATATGTATGCTAGTGTTGGC+AGG + Chr2:31654077-31654096 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
!! CATGTTGGATTAGTGGAAGA+AGG + Chr2:31653782-31653801 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGCTGTTAGTCAAGGTTTT+TGG + Chr2:31653480-31653499 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
!! TATGTATGCTAGTGTTGGCA+GGG + Chr2:31654078-31654097 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGTTTTGCTGTTCATGGTTA+TGG + Chr2:31653668-31653687 MsG0280008426.01.T01:CDS 40.0%
ACCACGAAAGTTGCACTATC+AGG - Chr2:31653743-31653762 None:intergenic 45.0%
ATACGCCGCTGATATTAGCT+TGG - Chr2:31654464-31654483 None:intergenic 45.0%
ATCCATGAAGGAGGTTCATG+GGG + Chr2:31653820-31653839 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
GAACCGAAACTCGAGCATTA+TGG + Chr2:31653845-31653864 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTGGAACCAGAAACTAG+TGG + Chr2:31654034-31654053 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
GTGTTGTGGAGGTCTTTACT+TGG + Chr2:31653953-31653972 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
TAGGTTTGTGGGAACTGCAT+TGG + Chr2:31653541-31653560 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
TCACAAGGCAAGAACATCAG+AGG + Chr2:31654285-31654304 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
! CATGGTGTTAACAAGTTGCC+GGG + Chr2:31654139-31654158 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
! TCCTGATAGTGCAACTTTCG+TGG + Chr2:31653739-31653758 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
! TGAAACCAAATGCGGTGTTG+TGG + Chr2:31653939-31653958 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTGATCTTTTGGGTCGAGC+AGG + Chr2:31653875-31653894 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGATCTTTTGGGTCGAGCA+GGG + Chr2:31653876-31653895 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATTGGGGGTTTTGCTGTTCA+TGG + Chr2:31653662-31653681 MsG0280008426.01.T01:CDS 45.0%
AGGGAGATTAAAGGAGGCAG+AGG + Chr2:31653895-31653914 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
GACAATCCCCACAAACTCGA+AGG - Chr2:31654432-31654451 None:intergenic 50.0%
GATTAAAGGAGGCAGAGGAG+TGG + Chr2:31653900-31653919 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
TCGAGCAGGGAGATTAAAGG+AGG + Chr2:31653889-31653908 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
! CTTGGTGCGGCAAGAATTCA+CGG + Chr2:31653971-31653990 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
! GTGGAGGTCTTTACTTGGTG+CGG + Chr2:31653958-31653977 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
!! AACCAAATGCGGTGTTGTGG+AGG + Chr2:31653942-31653961 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
!!! GTTGCCGGGTTTTAGCTTAG+TGG + Chr2:31654153-31654172 MsG0280008426.01.T01:CDS 50.0%
CACCCCATGAACCTCCTTCA+TGG - Chr2:31653825-31653844 None:intergenic 55.0%
CATGAAGGAGGTTCATGGGG+TGG + Chr2:31653823-31653842 MsG0280008426.01.T01:CDS 55.0%
GACCTCCACAACACCGCATT+TGG - Chr2:31653947-31653966 None:intergenic 55.0%
GCATTCCACGTCGCCAAATC+AGG - Chr2:31653290-31653309 None:intergenic 55.0%
GGGTCGAGCAGGGAGATTAA+AGG + Chr2:31653886-31653905 MsG0280008426.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGAACCTGATTTGGCGACG+TGG + Chr2:31653282-31653301 MsG0280008426.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 31653248 31654564 31653248 ID=MsG0280008426.01;Name=MsG0280008426.01
Chr2 mRNA 31653248 31654564 31653248 ID=MsG0280008426.01.T01;Parent=MsG0280008426.01;Name=MsG0280008426.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|438
Chr2 exon 31653248 31654564 31653248 ID=MsG0280008426.01.T01:exon:22485;Parent=MsG0280008426.01.T01
Chr2 CDS 31653248 31654564 31653248 ID=MsG0280008426.01.T01:cds;Parent=MsG0280008426.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280008426.01.T01

ATGCGTGTGTCGAGATATATTTTTGATCGAATTAGTGAACCTGATTTGGCGACGTGGAATGCTATTTTGAATGGTTACGCATGTAGTGCGAGTTATCATAGTTACTCGAATAGTTTCGATGATGCTGATTTTTCGTTAGAAGCGTTGTATTTGTTTCGTGATATGCAAGTTACGAAAATAAGGCCTAATGAAGTTACAATTGTTGCGTTGATTAGTGCTTGTTCGAATTTAGGTGCTGTTAGTCAAGGTTTTTGGGTTCATTGTTTTGTGTTAAGGAATAAGATTAAGATGAATAGGTTTGTGGGAACTGCATTGGTTGATATGTATTCGAAATGTGGATGTTTGAATCTTGCATGTCAAGTGTTCGATAAAATGTCTGAGAATGATAGGGATTCGTTTTGTTATACTGCAATGATTGGGGGTTTTGCTGTTCATGGTTATGGGAATCAAGCACTTGAACTTTATAGAAAGATGAAGTTTAAGGGTTTAGTTCCTGATAGTGCAACTTTCGTGGTTACGATGTTTGCTTGTTCACATGTTGGATTAGTGGAAGAAGGGTTAGAGATTTTCAAATCCATGAAGGAGGTTCATGGGGTGGAACCGAAACTCGAGCATTATGGTTGTTTGATTGATCTTTTGGGTCGAGCAGGGAGATTAAAGGAGGCAGAGGAGTGGTTAGCAGATATGCCGATGAAACCAAATGCGGTGTTGTGGAGGTCTTTACTTGGTGCGGCAAGAATTCACGGTAATTTAGGTGTTGGAGAAGTTGCTCTCACAAAGTTAATAGAGTTGGAACCAGAAACTAGTGGAAACTATGTTCTTTTGTCGAATATGTATGCTAGTGTTGGCAGGGTGAATGATGTTAAGAGAGTGAGGAAGCTGATGAAACATCATGGTGTTAACAAGTTGCCGGGTTTTAGCTTAGTGGAGATAAATGGTGCAATGCATGAGTTTCTTACAGGTGACAGAACTCATCCATTTTCAAAGGAAATATATTTGAAGATCGCGGAGATTTATAGTAGAATTGAAGAATATGGTCACAAGGCAAGAACATCAGAGGTTCTGTTCGATGTAGAAGAAGAGGATAAGGAAGGTGTACTCTCTTACCATAGTGAAAGATTAGCCATAGCATTTGCTCTTATAGCATCTCCTTCAAGTTTAGCTATAAGAATTATTAAAAACCTTCGAGTTTGTGGGGATTGTCATGCATTTACCAAGCTAATATCAGCGGCGTATCATAGAGAAATTATAGTTAGAGATCGAAATCGGTTTCATCATTTTAAAGATGGAAGTTGCTCTTGTCTAGATTACTGGTGA
Protein sequence

>MsG0280008426.01.T01

MRVSRYIFDRISEPDLATWNAILNGYACSASYHSYSNSFDDADFSLEALYLFRDMQVTKIRPNEVTIVALISACSNLGAVSQGFWVHCFVLRNKIKMNRFVGTALVDMYSKCGCLNLACQVFDKMSENDRDSFCYTAMIGGFAVHGYGNQALELYRKMKFKGLVPDSATFVVTMFACSHVGLVEEGLEIFKSMKEVHGVEPKLEHYGCLIDLLGRAGRLKEAEEWLADMPMKPNAVLWRSLLGAARIHGNLGVGEVALTKLIELEPETSGNYVLLSNMYASVGRVNDVKRVRKLMKHHGVNKLPGFSLVEINGAMHEFLTGDRTHPFSKEIYLKIAEIYSRIEEYGHKARTSEVLFDVEEEDKEGVLSYHSERLAIAFALIASPSSLAIRIIKNLRVCGDCHAFTKLISAAYHREIIVRDRNRFHHFKDGSCSCLDYW*