AlfalfaGEDB | MsG0380012030.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012030.01

KEGG: K13457
GO: GO:0043531
PFAM: PF00931

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Trembl:

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TFs/TRs:

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Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

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PPI

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TCTTCCGCAACTTCCTCCAA+TGG	0.595780	3:+9797620	None:intergenic
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AAATTCTTCAAAGAGTCTAG+TGG	0.622785	3:+9796642	None:intergenic
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AGATGCGTGCAACAACAACA+TGG	0.648471	3:-9796888	MsG0380012030.01.T01:CDS
TTGAGAACTCTAAGATTCGG+TGG	0.649189	3:+9796759	None:intergenic
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CRISPR-GE

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	ACCTTATCCGAGAGCTCAAA+AGG	-	Chr3:9798364-9798383	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
	AGATCCAACTCCTTCAGCTT+CGG	+	Chr3:9798762-9798781	None:intergenic	45.0%
	AGATGCGTGCAACAACAACA+TGG	-	Chr3:9798414-9798433	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
	AGCAGGAAACGTTTGGAGAA+AGG	+	Chr3:9796570-9796589	None:intergenic	45.0%
	AGTCAAAACATGGGTGAAGC+AGG	-	Chr3:9796451-9796470	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
	ATGAAATAGGGAGCCATTCG+AGG	+	Chr3:9796752-9796771	None:intergenic	45.0%
	ATTCGAGGGTCACCAATTCT+AGG	+	Chr3:9796737-9796756	None:intergenic	45.0%
	CACCTTTCTCCACTCAAACA+TGG	+	Chr3:9797455-9797474	None:intergenic	45.0%
	CTGAGGACTACACCATCAAT+CGG	-	Chr3:9797602-9797621	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
	CTGGCATTTCAGCAAATCCA+AGG	+	Chr3:9798920-9798939	None:intergenic	45.0%
	GAATGAGGAGACAAGACCAT+TGG	-	Chr3:9797666-9797685	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
	GACTCAGGTTCAAGTACCTT+AGG	+	Chr3:9798080-9798099	None:intergenic	45.0%
	TCAGGTTCAAGTACCTTAGG+AGG	+	Chr3:9798077-9798096	None:intergenic	45.0%
	TCCAAAGGGTTTGCAGAAGA+TGG	-	Chr3:9797039-9797058	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
	TCCATCTTCTGCAAACCCTT+TGG	+	Chr3:9797043-9797062	None:intergenic	45.0%
	TCCCTCATAGTGTAGGATTG+AGG	+	Chr3:9796968-9796987	None:intergenic	45.0%
	TCTGGTACAACCTTCAACTG+AGG	+	Chr3:9798867-9798886	None:intergenic	45.0%
	TGAAAGAGCGGCAATCAAAG+TGG	+	Chr3:9796937-9796956	None:intergenic	45.0%
	TGAAATAGGGAGCCATTCGA+GGG	+	Chr3:9796751-9796770	None:intergenic	45.0%
	TGGTGCATTCCATCTTTCTC+AGG	+	Chr3:9798966-9798985	None:intergenic	45.0%
	TTGGTTTCTGTGGTAGGCAT+GGG	-	Chr3:9796854-9796873	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
!	ACCTTTTGAGCTCTCGGATA+AGG	+	Chr3:9798368-9798387	None:intergenic	45.0%
!	GTCACCAATTCTAGGAGCTT+TGG	+	Chr3:9796729-9796748	None:intergenic	45.0%
!	GTGTCAACCTTTTGAGCTCT+CGG	+	Chr3:9798374-9798393	None:intergenic	45.0%
!	TAGAATTGGTGACCCTCGAA+TGG	-	Chr3:9796736-9796755	MsG0380012030.01.T01:CDS	45.0%
!	TCTGTTGGACACTGTTTTCC+TGG	+	Chr3:9797337-9797356	None:intergenic	45.0%
!	TTGTGGGATGATGCCTTTTC+TGG	-	Chr3:9798705-9798724	MsG0380012030.01.T01:intron	45.0%
!!	AGAACTCTAAGATTCGGTGG+TGG	+	Chr3:9798543-9798562	None:intergenic	45.0%
	AAAATGTGGAGGGCTACCAC+TGG	-	Chr3:9797387-9797406	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	ACAAGGGCTGCTGACGATAA+AGG	-	Chr3:9796410-9796429	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	ACAGTGTCCAACAGACCTTG+AGG	-	Chr3:9797342-9797361	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	ACGGTACTTCCGAGATCCAT+TGG	-	Chr3:9798111-9798130	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	AGTGGATCAGAAAGCTACCG+AGG	-	Chr3:9796701-9796720	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	ATAGCAAGCATGCGCCACAA+TGG	-	Chr3:9796522-9796541	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	CCAATAGCCACAATAGCCAG+TGG	+	Chr3:9797406-9797425	None:intergenic	50.0%
	CCAGGTACCTCTTTGACTCA+AGG	+	Chr3:9797099-9797118	None:intergenic	50.0%
	CCTCAAGGATGCTGACACAA+GGG	-	Chr3:9796394-9796413	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	CTGGCTATTGTGGCTATTGG+TGG	-	Chr3:9797406-9797425	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	GACATCTCCTCAAGGTCTGT+TGG	+	Chr3:9797352-9797371	None:intergenic	50.0%
	GAGTATCCAAGCCTTCCTCA+AGG	-	Chr3:9796379-9796398	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	GGAAGGCTTGGATACTCTCA+AGG	+	Chr3:9796376-9796395	None:intergenic	50.0%
	GGCTCCAAAGCTCCTAGAAT+TGG	-	Chr3:9796722-9796741	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	GTTTCCGAAGCTGAAGGAGT+TGG	-	Chr3:9798755-9798774	MsG0380012030.01.T01:intron	50.0%
	TCCTCAAGGATGCTGACACA+AGG	-	Chr3:9796393-9796412	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	TCTTCCGCAACTTCCTCCAA+TGG	+	Chr3:9797685-9797704	None:intergenic	50.0%
	TGAGGAGACAAGACCATTGG+AGG	-	Chr3:9797669-9797688	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	TGGAGACAATCAGCGTACGT+TGG	-	Chr3:9796835-9796854	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
	TGTGTCAGCATCCTTGAGGA+AGG	+	Chr3:9796393-9796412	None:intergenic	50.0%
!	CCACTGGCTATTGTGGCTAT+TGG	-	Chr3:9797403-9797422	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
!	GTTGGTTTCTGTGGTAGGCA+TGG	-	Chr3:9796853-9796872	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
!	TTGGTTAGTCGTTTGGTCGG+TGG	-	Chr3:9796815-9796834	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
!!	CCTTGAGTCAAAGAGGTACC+TGG	-	Chr3:9797096-9797115	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
!!	CGATTGATGGTGTAGTCCTC+AGG	+	Chr3:9797604-9797623	None:intergenic	50.0%
!!	CGTACGTTGGTTTCTGTGGT+AGG	-	Chr3:9796848-9796867	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
!!	TCAGCGTACGTTGGTTTCTG+TGG	-	Chr3:9796844-9796863	MsG0380012030.01.T01:CDS	50.0%
!!	TTCTAGGAGCTTTGGAGCCT+CGG	+	Chr3:9796721-9796740	None:intergenic	50.0%
	AGGAGGGTTTCCGAAGCTGA+AGG	-	Chr3:9798749-9798768	MsG0380012030.01.T01:intron	55.0%
	AGGGCTGCTGACGATAAAGG+AGG	-	Chr3:9796413-9796432	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	CAGCATCCTTGAGGAAGGCT+TGG	+	Chr3:9796388-9796407	None:intergenic	55.0%
	CCACAATGGATCGACGCTTC+GGG	-	Chr3:9796536-9796555	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	CCCTTGTGTCAGCATCCTTG+AGG	+	Chr3:9796397-9796416	None:intergenic	55.0%
	GAGACTTACTCGGCAGTGGA+TGG	-	Chr3:9797627-9797646	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	GCCACAATGGATCGACGCTT+CGG	-	Chr3:9796535-9796554	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	GCTGCTGACGATAAAGGAGG+AGG	-	Chr3:9796416-9796435	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	GGAAGAGACTTACTCGGCAG+TGG	-	Chr3:9797623-9797642	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	GTTTCTGTGGTAGGCATGGG+AGG	-	Chr3:9796857-9796876	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
!	AGGGCTACCACTGGCTATTG+TGG	-	Chr3:9797396-9797415	MsG0380012030.01.T01:CDS	55.0%
	ACTCGGCAGTGGATGGCAGA+AGG	-	Chr3:9797634-9797653	MsG0380012030.01.T01:CDS	60.0%
	CTCGGCAGTGGATGGCAGAA+GGG	-	Chr3:9797635-9797654	MsG0380012030.01.T01:CDS	60.0%
	GTGGTAGGCATGGGAGGACT+CGG	-	Chr3:9796863-9796882	MsG0380012030.01.T01:CDS	60.0%
!!	CCCGAAGCGTCGATCCATTG+TGG	+	Chr3:9796539-9796558	None:intergenic	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr3	gene	9796239	9799085	9796239	ID=MsG0380012030.01;Name=MsG0380012030.01
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Gene Sequence

>MsG0380012030.01.T01

ATGGCAGAAACTGCAGCGTTATCTGCTTTGCAAGCACTCTGTAACATTTTAGTAGAAGGAGGATGCAGACACATTGTAGAAAATGGAACTTTACTGACAGGGTTTCAGAAAGACTTCATTGACATCAAAGATTACCTTGAGAGTATCCAAGCCTTCCTCAAGGATGCTGACACAAGGGCTGCTGACGATAAAGGAGGAGGAGTCAACGAAAGAGTCAAAACATGGGTGAAGCAGATTGCTTCAAAGATTAAAGACATCAAGGAATCACTTGGTAAAATCAAAGAAAAAAGTGACATGTTTAAGTTTCATTCTGAAAGTGGATCAGAAAGCTACCGAGGCTCCAAAGCTCCTAGAATTGGTGACCCTCGAATGGCTCCCTATTTCATTGAAGAGACCCAAGTTGTAGGGTTTGAATCACCAGCAAATGAATTGGTTAGTCGTTTGGTCGGTGGAGACAATCAGCGTACGTTGGTTTCTGTGGTAGGCATGGGAGGACTCGGAAAAACAACTCTTGCCAAGCATGTTTTTGATAACGATTTGGTGAAAAGCCACTTTGATTGCCGCTCTTTCATAACAGTTCCTCAATCCTACACTATGAGGGAGTTGTTTACAGAAATGATAAAGAAGTTGTGCAAGGACAAGAATGATCCTATTCCAAAGGGTTTGCAGAAGATGGATGACAAAACATTGATTACTCAAGTCAACCAATACCTTGAGTCAAAGAGGTACCTGGTTTTATTTGATGATGTTTGGAAAGAAAATTTTTCTGATGAGATTGATCTTGCTTTAGTTAGTAATAACAAAGGAAGTAGAATCATTGTGACCACTAGAATGATGCATGTAGCTGATTATTTTAAGAAATCTTTTCTTGTTCACGTTCACAAACTACAACCTTTGTCTTCAGAGAAAGCATGGGAATTGTTTTGTAATAAGGCATTCATATTTGAGCCAGGAAAACAGTGTCCAACAGACCTTGAGGAGATGTCCAATGAAATTGTTCAAAAATGTGGAGGGCTACCACTGGCTATTGTGGCTATTGGTGGTCTTTTGTCAACAAAAGATAAAACCATGTTTGAGTGGAGAAAGGTGAGTCAAAATCTAAGGATGGAGTTAGATCGCAACGTGCATTTGACTAGTGTAACAAAGATTTTATCTCTTAGTTATGATGATTTGCCTTACCATTTGAAACCATGCATGCTATATTTTGGTATATATCCTGAGGACTACACCATCAATCGGAAGAGACTTACTCGGCAGTGGATGGCAGAAGGGTTTGTTGTGAATGAGGAGACAAGACCATTGGAGGAAGTTGCGGAAGAGTACCTGACAGAGTTGATACAAAGAAGTTTGGTTAATGTTTCAAGATTCGGATTTGATGGGAAGATAAAAAAATTTCAAGTTCATGATTTGTTGCGTGAAGTGATCCTTAGAAAAATGAAAGATTTAAGTTTTTGTCATTTAATGCATAAAGATGATGAAATAACTAGACGCTTTTCTATAGCAGCCCTGTCCAACAATGACTTGAGAAACAATAGCAACTCAGGAATTCGTGCTATATTTGTCTTTGACAAAGGTGAATTTCCTAAACAGCTCATTGATGGATTATCTGCCAAGTTCAAGCTTTTGAAAGTACTTGATTTTGAGAAGTCTTTGTTGAATTGTATTCCTGATAACTTGGGAAATCTTTTCCTCCTAAGGTACTTGAACCTGAGTCATACAAAAGTTACGGTACTTCCGAGATCCATTGGTAATCTAGTCAACTTAGAAACATTGGATCTAAGGCAAACTAAAGTGCATGAATTACCAAAAGAGATAAACGAGCTCACAAAGCTAAGGCTTCTTCCTGTTTATTATAGAAAATATGAAGGTCATTATTCTATTTTGAACTTTACAGATGGTGTGAAAATGCAAGAGGGTATTGGGTGTTTGACATCTTTACAAAAGCTTTACTTTTTGGAAGCAGATCATCGTGGAATAGACCTTATCCGAGAGCTCAAAAGGTTGACACAGTTAAGGAAGTTAGGCATAAGATGCGTGCAACAACAACATGGAAATGAATTATGCGAAGCAGTACAAGAGATGAAACATCTTGAATCTCTCAACATTACTGTTAAAGACGAGAATGATATCCTTGACTTGGATGTTGTATCAACTCCACCACCGAATCTTAGAGTTCTCAACTTGAAAGGTAGATTAACAAAGTTGCCTGATTGGATTCCAAATCTCCAGTATCTTGTGAAGCTAAGACTTGGTTTATCTAACTTCAATGATGATCCACTAGACTCTTTGAAGAATTTACCTAATTTGTTTAGGCTGAATTTGTGGGATGATGCCTTTTCTGGTGAAAGATTACATTTTCAGAGAGGAGGGTTTCCGAAGCTGAAGGAGTTGGATCTCACAAGATTAAGTAGACTAAGTTCTATATCTATAGACAAAGAAGCTTTAGTTGATCTTGAACATTTCAGGTTTAAAAACAATCCTCAGTTGAAGGTTGTACCAGAAGACCTCCAAAACTTGAAAAACCTTCAATTCCTTGGATTTGCTGAAATGCCAGTTGAACTAGTTGATAGCATTGATCCTGAGAAAGATGGAATGCACCATCGGATTATCAATATTCCCCTTGTACAAATTCGTCAGAATGTAGGATCAAGATTTCATGACTATGAGCTGCACCGCATTCCTACTCAAATCAATGTTTGA

Protein sequence

>MsG0380012030.01.T01

MAETAALSALQALCNILVEGGCRHIVENGTLLTGFQKDFIDIKDYLESIQAFLKDADTRAADDKGGGVNERVKTWVKQIASKIKDIKESLGKIKEKSDMFKFHSESGSESYRGSKAPRIGDPRMAPYFIEETQVVGFESPANELVSRLVGGDNQRTLVSVVGMGGLGKTTLAKHVFDNDLVKSHFDCRSFITVPQSYTMRELFTEMIKKLCKDKNDPIPKGLQKMDDKTLITQVNQYLESKRYLVLFDDVWKENFSDEIDLALVSNNKGSRIIVTTRMMHVADYFKKSFLVHVHKLQPLSSEKAWELFCNKAFIFEPGKQCPTDLEEMSNEIVQKCGGLPLAIVAIGGLLSTKDKTMFEWRKVSQNLRMELDRNVHLTSVTKILSLSYDDLPYHLKPCMLYFGIYPEDYTINRKRLTRQWMAEGFVVNEETRPLEEVAEEYLTELIQRSLVNVSRFGFDGKIKKFQVHDLLREVILRKMKDLSFCHLMHKDDEITRRFSIAALSNNDLRNNSNSGIRAIFVFDKGEFPKQLIDGLSAKFKLLKVLDFEKSLLNCIPDNLGNLFLLRYLNLSHTKVTVLPRSIGNLVNLETLDLRQTKVHELPKEINELTKLRLLPVYYRKYEGHYSILNFTDGVKMQEGIGCLTSLQKLYFLEADHRGIDLIRELKRLTQLRKLGIRCVQQQHGNELCEAVQEMKHLESLNITVKDENDILDLDVVSTPPPNLRVLNLKGRLTKLPDWIPNLQYLVKLRLGLSNFNDDPLDSLKNLPNLFRLNLWDDAFSGERLHFQRGGFPKLKELDLTRLSRLSSISIDKEALVDLEHFRFKNNPQLKVVPEDLQNLKNLQFLGFAEMPVELVDSIDPEKDGMHHRIINIPLVQIRQNVGSRFHDYELHRIPTQINV*