AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035806.01

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MsG0680035806.01.T01 AT4G13340 46.197 355 168 6 397 751 60 391 7.37e-93 307
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MsG0680035806.01.T01 AT3G11010 28.279 244 161 4 461 696 568 805 3.34e-16 83.6
MsG0680035806.01.T01 AT3G11010 31.053 190 128 2 500 688 441 628 3.43e-16 83.6
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MsG0680035806.01.T01 AT1G33590 34.416 154 98 3 445 595 197 350 1.70e-12 71.2
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MsG0680035806.01.T01 AT1G79620 33.645 214 131 6 485 688 75 287 1.04e-18 92.0
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MsG0680035806.01.T01 AT1G75640 28.194 227 160 3 464 688 391 616 1.36e-20 98.2
MsG0680035806.01.T01 AT1G75640 31.707 246 161 4 433 672 476 720 5.16e-18 89.7
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MsG0680035806.01.T01 AT1G79620 33.645 214 131 6 485 688 75 287 2.09e-18 90.5
MsG0680035806.01.T01 AT5G63930 31.687 243 163 3 448 688 22 263 8.45e-24 108
MsG0680035806.01.T01 AT5G63930 32.218 239 158 4 453 688 387 624 1.90e-22 103
MsG0680035806.01.T01 AT5G63930 32.609 230 152 3 461 688 179 407 4.69e-22 102
MsG0680035806.01.T01 AT5G63930 30.800 250 148 3 464 688 254 503 4.07e-21 99.8
MsG0680035806.01.T01 AT5G63930 34.254 181 114 4 512 689 14 192 2.19e-18 90.9
MsG0680035806.01.T01 AT5G61240 26.966 267 188 4 425 687 42 305 8.88e-24 103
MsG0680035806.01.T01 AT5G61240 32.161 199 129 4 495 688 85 282 1.77e-19 90.9
MsG0680035806.01.T01 AT1G79620 31.227 269 161 7 429 686 53 308 1.13e-23 107
MsG0680035806.01.T01 AT1G79620 33.645 214 131 6 485 688 75 287 3.03e-18 90.1
MsG0680035806.01.T01 AT3G11080 29.052 327 188 7 423 706 73 398 1.19e-23 107
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MsG0680035806.01.T01 AT4G34220 30.741 270 173 9 411 675 33 293 1.48e-22 103
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MsG0680035806.01.T01 AT3G11010 31.053 190 128 2 500 688 480 667 2.07e-16 84.3
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MsG0680035806.01.T01 AT5G37450 28.571 182 126 3 464 643 154 333 1.77e-12 71.6
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MsG0680035806.01.T01 AT4G04220 28.929 280 146 5 461 688 132 410 6.62e-14 76.3
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MsG0680035806.01.T01 AT4G28490 30.522 249 163 5 445 688 341 584 7.81e-17 85.9
MsG0680035806.01.T01 AT4G28490 32.593 270 152 6 471 711 319 587 8.55e-15 79.3
MsG0680035806.01.T01 AT4G28490 28.340 247 145 4 441 686 385 600 7.90e-13 72.8
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MsG0680035806.01.T01 AT3G47580 27.778 252 170 7 447 688 127 376 2.90e-14 77.4
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MsG0680035806.01.T01 AT2G25470 31.100 209 132 4 477 680 118 319 2.29e-11 68.2
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MsG0680035806.01.T01 AT2G02220 25.773 291 162 7 449 688 67 354 2.87e-14 77.4
MsG0680035806.01.T01 AT2G02220 30.303 198 124 6 473 661 306 498 2.07e-11 68.2
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MsG0680035806.01.T01 AT2G24230 26.295 251 134 6 464 666 144 391 1.04e-13 75.5
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MsG0680035806.01.T01 AT3G03770 29.344 259 171 6 471 723 117 369 9.43e-15 79.0
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MsG0680035806.01.T01 AT2G23950 32.394 142 82 3 422 549 47 188 1.13e-11 68.6
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MsG0680035806.01.T01 AT3G42880 31.016 187 101 5 488 671 71 232 2.44e-11 67.8
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MsG0680035806.01.T01 AT5G58300 34.483 145 87 4 500 643 105 242 3.47e-11 67.4
MsG0680035806.01.T01 AT1G78980 29.348 184 99 5 508 689 69 223 3.53e-11 67.4
MsG0680035806.01.T01 AT4G18640 26.601 203 125 4 410 609 31 212 5.70e-11 66.6
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MsG0680035806.01.T01 AT4G18760 35.583 163 101 4 506 666 164 324 6.47e-11 65.9
MsG0680035806.01.T01 AT5G10290 28.125 160 90 5 397 551 23 162 7.24e-11 66.2
MsG0680035806.01.T01 AT5G10290 28.125 160 90 5 397 551 23 162 7.24e-11 66.2
MsG0680035806.01.T01 AT4G31250 30.000 190 93 6 438 625 66 217 7.69e-11 66.2
MsG0680035806.01.T01 AT4G03390 30.612 196 95 8 426 594 50 231 7.84e-11 66.2
MsG0680035806.01.T01 AT4G03390 30.612 196 95 8 426 594 50 231 7.84e-11 66.2

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TTGGCTCATAATCAGCTTTC+TGG 0.149661 6:-112560749 MsG0680035806.01.T01:CDS
CAAGAATCTAGTATCTTTAA+AGG 0.171294 6:+112561451 None:intergenic
ACAAGATCTTTGAATGTTTC+AGG 0.172752 6:+112561220 None:intergenic
TGTTGGAGGTGGAGTTGTTT+GGG 0.193386 6:-112561587 MsG0680035806.01.T01:CDS
ATTCATAGGACTTTGGATTT+TGG 0.219537 6:+112561542 None:intergenic
CTAAGTAATAACCAACTTTC+AGG 0.227071 6:-112561178 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTCTGTGCAAATCCTGAAAA+TGG 0.227900 6:-112561394 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTTTAAAGATACTAGATTCT+TGG 0.235357 6:-112561450 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTCTCATTTACTTGGATATT+AGG 0.240123 6:-112561123 MsG0680035806.01.T01:CDS
TATCCATTTGCGGTTGAAAT+AGG 0.248902 6:-112568619 MsG0680035806.01.T01:CDS
CATAAAATCTAACAGGAATT+TGG 0.272289 6:+112568296 None:intergenic
CCAGGTTATGTTGTACCTTA+TGG 0.272786 6:+112568336 None:intergenic
GTCGTTGATTGGATAACTTT+TGG 0.275477 6:+112568985 None:intergenic
ATCTTCATTGAACCTGGTTT+TGG 0.286040 6:+112567547 None:intergenic
GTGTTGGAGGTGGAGTTGTT+TGG 0.286532 6:-112561588 MsG0680035806.01.T01:CDS
ACAACATAACCTGGGTTAAC+TGG 0.288544 6:-112568327 MsG0680035806.01.T01:CDS
AAGGACTCCTGCTTTATATT+CGG 0.293495 6:+112568423 None:intergenic
GGAAATATTCCAGCTAGTTT+TGG 0.297812 6:-112560947 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTTCTGAATAATCAGTTAAC+TGG 0.317884 6:-112560893 MsG0680035806.01.T01:CDS
AGATAACCACCTTTCTTCAT+AGG 0.318811 6:+112567887 None:intergenic
GTTGGAGGTGGAGTTGTTTG+GGG 0.320356 6:-112561586 MsG0680035806.01.T01:CDS
GAAGGTTTGGTATGATCATT+TGG 0.320549 6:+112568748 None:intergenic
AATCTGTTCTTTGAGGAGTT+TGG 0.325656 6:-112560711 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTTTGATGTTGGAGATTCAT+AGG 0.331095 6:+112561528 None:intergenic
TGTAAACATGATAATGTATC+AGG 0.338881 6:+112560791 None:intergenic
CAGATATAATCTGTTCTTTG+AGG 0.346467 6:-112560718 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTGACAAATATGTCGTTGAT+TGG 0.351891 6:+112568974 None:intergenic
CTTCCACATCAATGGAGTTC+TGG 0.358944 6:-112568676 MsG0680035806.01.T01:CDS
GCTACAACAAAAGCTGGTTT+TGG 0.363456 6:-112561640 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTTGTTAATGCAACATTATA+CGG 0.372573 6:-112567833 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTGAAAGTTGGTTATTACTT+AGG 0.377555 6:+112561179 None:intergenic
TCTACTTCAGTAGTTCTTGC+TGG 0.382041 6:-112561352 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTTGTACAAGTGTTCCTTGA+AGG 0.384838 6:+112561308 None:intergenic
CTCAACAACAATGAGTTTGA+AGG 0.390131 6:-112561037 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTGATTCCAACATGACCCTT+TGG 0.390378 6:+112568892 None:intergenic
AGAAAATTTGTATTCAATGT+AGG 0.398338 6:-112568513 MsG0680035806.01.T01:CDS
TATGCCAAGTCTCATTTACT+TGG 0.399370 6:-112561131 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGTGAATTACCTAAGTTTGT+AGG 0.402394 6:+112561007 None:intergenic
TGGGAAGAGCAATGGTTGTT+GGG 0.402652 6:-112568571 MsG0680035806.01.T01:CDS
TCAAGTACATAAAATCTAAC+AGG 0.403408 6:+112568289 None:intergenic
ATGAAACTTACATTCATCAT+TGG 0.406395 6:-112568819 MsG0680035806.01.T01:CDS
ACACCAAAGCCTCTTGTTTG+TGG 0.410175 6:-112560509 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTGGAGGTGGAGTTGTTTGG+GGG 0.410348 6:-112561585 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGTTTATCTGCAACTTCTCC+AGG 0.413583 6:+112568934 None:intergenic
GTGGGAAGAGCAATGGTTGT+TGG 0.417695 6:-112568572 MsG0680035806.01.T01:CDS
AATGATCATACCAAACCTTC+TGG 0.417734 6:-112568745 MsG0680035806.01.T01:CDS
AAGAATCTAGTATCTTTAAA+GGG 0.418108 6:+112561452 None:intergenic
CTAAACCATGCAAACCTTCA+AGG 0.418566 6:-112561322 MsG0680035806.01.T01:CDS
AAAACTTCCTTATCCATTTG+CGG 0.420579 6:-112568629 MsG0680035806.01.T01:CDS
AATGAGGAAGGTTACCTTGT+TGG 0.421335 6:-112567586 MsG0680035806.01.T01:CDS
AATGAGATCGCCAGAAGGTT+TGG 0.425456 6:+112568735 None:intergenic
CACCCTTCTGTAATATCTGT+AGG 0.427117 6:+112568592 None:intergenic
AAAGAGTTTGAAGTGGGGCC+TGG 0.427873 6:-112568952 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGAAATAATCCACGATTGTC+AGG 0.427943 6:-112568236 MsG0680035806.01.T01:intron
AGGACTCCTGCTTTATATTC+GGG 0.428084 6:+112568424 None:intergenic
TTACCTATTTCAACCGCAAA+TGG 0.432015 6:+112568616 None:intergenic
TGTGAGTTTCAATTCATTGA+TGG 0.433524 6:-112560822 MsG0680035806.01.T01:CDS
ATTAGGTTTAACTCTTTCTC+AGG 0.434563 6:-112561106 MsG0680035806.01.T01:CDS
CCTGGGATCATAGAACATTC+AGG 0.440179 6:+112560560 None:intergenic
CTCATTTACAAAAGAAATGA+TGG 0.441578 6:-112568718 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTCAATAGTAACAGATTCAC+TGG 0.441733 6:-112561250 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTTGGTGTTGGTGGAAGTGT+TGG 0.445234 6:-112561622 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGTACTTGACGCCACTGATC+GGG 0.453237 6:-112568275 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGTACATCGACACCAACATA+TGG 0.455168 6:-112567628 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTTGGAGATTCATAGGACTT+TGG 0.455655 6:+112561535 None:intergenic
GATGTAACAGTTGGATTCCA+TGG 0.457028 6:-112568457 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGTGTAGGTGTAGGTGTTGG+AGG 0.457669 6:-112561601 MsG0680035806.01.T01:CDS
ATTTCAACCGCAAATGGATA+AGG 0.457788 6:+112568622 None:intergenic
GAACCACAAACAAGAGGCTT+TGG 0.458676 6:+112560506 None:intergenic
CCATAAGGTACAACATAACC+TGG 0.464523 6:-112568336 MsG0680035806.01.T01:CDS
GCTGATTCCATCTTTGATGT+TGG 0.475688 6:+112561517 None:intergenic
ACGGTATTCTTCCACATCAA+TGG 0.480376 6:-112568684 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTAGGTGTAGGTGTTGGAGG+TGG 0.482088 6:-112561598 MsG0680035806.01.T01:CDS
AAGATACTAGATTCTTGGAA+TGG 0.488703 6:-112561445 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGAATCTCCAACATCAAAGA+TGG 0.488760 6:-112561524 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGTGAAATACCTACAAACTT+AGG 0.489186 6:-112561016 MsG0680035806.01.T01:CDS
TCGACACCAACATATGGAAC+GGG 0.489311 6:-112567622 MsG0680035806.01.T01:CDS
CATTTAGCTACAACAAAAGC+TGG 0.489911 6:-112561646 MsG0680035806.01.T01:intron
GCAATGGTTGTTGGGTGTGC+TGG 0.490250 6:-112568563 MsG0680035806.01.T01:CDS
GCCTCTGGTCATGCGCATGC+AGG 0.491818 6:-112567857 MsG0680035806.01.T01:CDS
GATAACCACCTTTCTTCATA+GGG 0.493488 6:+112567888 None:intergenic
TTTCACTTAATTGTATTCCT+GGG 0.495322 6:-112560604 MsG0680035806.01.T01:CDS
CAACATAACCTGGGTTAACT+GGG 0.495662 6:-112568326 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTTTCAGTGCAAAATGAGAA+AGG 0.499339 6:-112568386 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTTATACAGTTCTTCAAGCA+TGG 0.503186 6:-112561495 MsG0680035806.01.T01:CDS
ACTGATCGGGTAACAACAAA+TGG 0.504986 6:-112568262 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTTATGGCAAGATTTCTCCT+TGG 0.506832 6:+112568352 None:intergenic
TATAATATTGAATTTCCAAA+GGG 0.507078 6:-112568907 MsG0680035806.01.T01:CDS
CCCATGAAACCAAAACTAGC+TGG 0.514157 6:+112560938 None:intergenic
TTTCAGTGCAAAATGAGAAA+GGG 0.515398 6:-112568385 MsG0680035806.01.T01:CDS
CAAACAAGAGGCTTTGGTGT+TGG 0.517103 6:+112560512 None:intergenic
GGTCTTTGCATGTTCCTCCC+AGG 0.518074 6:+112560587 None:intergenic
ATCATAGAACATTCAGGTTG+AGG 0.520208 6:+112560566 None:intergenic
TATGGAACGGGAAAAGAAGC+AGG 0.524457 6:-112567610 MsG0680035806.01.T01:CDS
ATCTAACAGGAATTTGGTGT+TGG 0.524581 6:+112568302 None:intergenic
CATTAATTAATTAGGATGGA+AGG 0.525593 6:-112567657 MsG0680035806.01.T01:intron
ATGTACTTGACGCCACTGAT+CGG 0.529556 6:-112568276 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGAAGTGTTGGTGTAGGTGT+AGG 0.529661 6:-112561610 MsG0680035806.01.T01:CDS
TCGTCAATCTTCATTGAACC+TGG 0.530173 6:+112567541 None:intergenic
GTGTTCCTTGAAGGTTTGCA+TGG 0.533208 6:+112561317 None:intergenic
CAAGGAGAAATCTTGCCATA+AGG 0.533285 6:-112568351 MsG0680035806.01.T01:CDS
GCTAAGTTGATCACAGAAGC+TGG 0.534362 6:+112560986 None:intergenic
GAATATAGAAGTGCTTAACT+TGG 0.535224 6:-112560768 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGGAAAAGAAGCAGGGAATG+AGG 0.536610 6:-112567602 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGTTATCTTATCTACGCCTC+TGG 0.536953 6:-112567872 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTGTCAAAAGAGTTTGAAGT+GGG 0.539713 6:-112568958 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTGAGTTTCAATTCATTGAT+GGG 0.539989 6:-112560821 MsG0680035806.01.T01:CDS
GAATTTCCAAAGGGTCATGT+TGG 0.540982 6:-112568898 MsG0680035806.01.T01:CDS
AAAGAAGCAGGGAATGAGGA+AGG 0.543201 6:-112567598 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTTGGTGGAAGTGTTGGTGT+AGG 0.543596 6:-112561616 MsG0680035806.01.T01:CDS
ACCCTTCTGTAATATCTGTA+GGG 0.548775 6:+112568593 None:intergenic
AAGGAAAAGAACCTGAAAGT+TGG 0.553202 6:+112561167 None:intergenic
GCAAGCATCCCTATGAAGAA+AGG 0.556587 6:-112567896 MsG0680035806.01.T01:CDS
TAATGCAACATTATACGGAC+AGG 0.556787 6:-112567828 MsG0680035806.01.T01:intron
ATATAATATTGAATTTCCAA+AGG 0.558997 6:-112568908 MsG0680035806.01.T01:CDS
ATCGACACCAACATATGGAA+CGG 0.562833 6:-112567623 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTCTTGTTGAAAAGCTCTTG+AGG 0.566572 6:+112561076 None:intergenic
GTTGGTGTAGGTGTAGGTGT+TGG 0.573403 6:-112561604 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTGACTCCCGAATATAAAGC+AGG 0.575056 6:-112568430 MsG0680035806.01.T01:CDS
CCTGAATGTTCTATGATCCC+AGG 0.575367 6:-112560560 MsG0680035806.01.T01:CDS
TACAGATATTACAGAAGGGT+GGG 0.584845 6:-112568590 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTTCCAGAACTCCATTGATG+TGG 0.585732 6:+112568673 None:intergenic
TTAGCTAATAACAAATTGAG+TGG 0.590992 6:-112560968 MsG0680035806.01.T01:CDS
GACATAGAACCACAAACAAG+AGG 0.591828 6:+112560500 None:intergenic
AACCCTACAGATATTACAGA+AGG 0.591830 6:-112568595 MsG0680035806.01.T01:CDS
TCAAATGTATGTTCATACAA+AGG 0.593183 6:-112561421 MsG0680035806.01.T01:CDS
ATTTGTTGTTACCCGATCAG+TGG 0.595356 6:+112568264 None:intergenic
CACTTAATTGTATTCCTGGG+AGG 0.597238 6:-112560601 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTGTTGGTCCCAGTTAACCC+AGG 0.598269 6:+112568318 None:intergenic
ATATCCAAGTAAATGAGACT+TGG 0.600361 6:+112561127 None:intergenic
TTTGTCAAAAGAGTTTGAAG+TGG 0.604345 6:-112568959 MsG0680035806.01.T01:CDS
AGACAACTTAAGCTACCACC+TGG 0.606401 6:+112560542 None:intergenic
ACCTGCATGCGCATGACCAG+AGG 0.607920 6:+112567856 None:intergenic
CAGAAGGGTGGGAAGAGCAA+TGG 0.608446 6:-112568579 MsG0680035806.01.T01:CDS
GTTGATCTTGTTGATGAACA+TGG 0.608527 6:-112568859 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGCATATACAAAGTAACCAA+AGG 0.610543 6:+112561148 None:intergenic
ATTTACTTACCTGACAATCG+TGG 0.630764 6:+112568227 None:intergenic
TCTGTATGTTATCCAAAACC+AGG 0.633009 6:-112567559 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGAATGTAAGTTTCATGCAA+TGG 0.633055 6:+112568826 None:intergenic
TGGAGGTGGAGTTGTTTGGG+GGG 0.633301 6:-112561584 MsG0680035806.01.T01:CDS
GAAACTTATCTTGGCAACAA+AGG 0.634147 6:+112568404 None:intergenic
GGTTGTATACCAGAAGGAGT+TGG 0.642758 6:-112560872 MsG0680035806.01.T01:CDS
CTACAGATATTACAGAAGGG+TGG 0.645976 6:-112568591 MsG0680035806.01.T01:CDS
AGCATCCCTATGAAGAAAGG+TGG 0.654063 6:-112567893 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTAACTGGTTGTATACCAGA+AGG 0.660025 6:-112560878 MsG0680035806.01.T01:CDS
AATGATGGAACATGCAACAA+CGG 0.661977 6:-112568703 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTGTAAATGAGATCGCCAGA+AGG 0.666079 6:+112568730 None:intergenic
ATGGAACGGGAAAAGAAGCA+GGG 0.669998 6:-112567609 MsG0680035806.01.T01:CDS
CGAGAAACGAGCGTTCTCAG+AGG 0.675189 6:+112560469 None:intergenic
ACCCTACAGATATTACAGAA+GGG 0.684428 6:-112568594 MsG0680035806.01.T01:CDS
GAAAGGGATTTCAAGCACCA+AGG 0.692737 6:-112568369 MsG0680035806.01.T01:CDS
AACATACAGACATTCCAACA+AGG 0.699816 6:+112567572 None:intergenic
CATAAGGTACAACATAACCT+GGG 0.702510 6:-112568335 MsG0680035806.01.T01:CDS
TGTCAAAAGAGTTTGAAGTG+GGG 0.710169 6:-112568957 MsG0680035806.01.T01:CDS
GGTTCAATGAAGATTGACGA+TGG 0.712006 6:-112567538 MsG0680035806.01.T01:intron
GACAACTTAAGCTACCACCT+GGG 0.714305 6:+112560543 None:intergenic
GAATGTTCTATGATCCCAGG+TGG 0.724398 6:-112560557 MsG0680035806.01.T01:CDS
AGTTCTGGAAGTGAAACGCG+AGG 0.739643 6:-112568661 MsG0680035806.01.T01:CDS
TTACTCAGTAACTATCAAGG+AGG 0.744130 6:+112560410 None:intergenic
GTGCTGGTCATTGACACACG+AGG 0.805861 6:-112568547 MsG0680035806.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! TAATGATTTGTTTCTGGATT+TGG - Chr6:112564227-112564246 MsG0680035806.01.T01:intron 25.0%
!!! TATGAGAACTTACTTGTTAT+TGG - Chr6:112562555-112562574 MsG0680035806.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCTAAGGTTGTTTTCTAAA+AGG + Chr6:112567677-112567696 None:intergenic 25.0%
AAAAATGTAAGTGAGTCATG+AGG - Chr6:112566694-112566713 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
AAAACTTCCTTATCCATTTG+CGG - Chr6:112560816-112560835 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
AAAATGTAAGTGAGTCATGA+GGG - Chr6:112566695-112566714 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
AAATCTCTTGAAAAGCAAGT+TGG - Chr6:112564936-112564955 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
AACTTGAAAAATTGGGGATT+TGG - Chr6:112562594-112562613 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
AAGATACTAGATTCTTGGAA+TGG - Chr6:112568000-112568019 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
ACAAGATCTTTGAATGTTTC+AGG + Chr6:112568228-112568247 None:intergenic 30.0%
ATAATTGAAAACAGCTAGCT+TGG + Chr6:112564158-112564177 None:intergenic 30.0%
ATATCCAAGTAAATGAGACT+TGG + Chr6:112568321-112568340 None:intergenic 30.0%
ATGTGAAATAAGGAAGAATG+AGG - Chr6:112562647-112562666 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
ATTAGGTTTAACTCTTTCTC+AGG - Chr6:112568339-112568358 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
ATTATGTCAAGACCAATATG+TGG - Chr6:112561280-112561299 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
CAAAAATTAAGTGAGTCATG+AGG - Chr6:112566630-112566649 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
CAACATCTATACACAACAAA+AGG - Chr6:112567485-112567504 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
CACAAGGATCAAATACATAT+GGG - Chr6:112563253-112563272 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
CAGATATAATCTGTTCTTTG+AGG - Chr6:112568727-112568746 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
CTAAGTAATAACCAACTTTC+AGG - Chr6:112568267-112568286 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
GACAATGCATAATATATGCA+AGG - Chr6:112563617-112563636 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
GTCTCATTTACTTGGATATT+AGG - Chr6:112568322-112568341 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
GTGAGTTTCAATTCATTGAT+GGG - Chr6:112568624-112568643 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
TGAATGTAAGTTTCATGCAA+TGG + Chr6:112560622-112560641 None:intergenic 30.0%
TGTGAGTTTCAATTCATTGA+TGG - Chr6:112568623-112568642 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
TTGACAAATATGTCGTTGAT+TGG + Chr6:112560474-112560493 None:intergenic 30.0%
TTTCAGTGCAAAATGAGAAA+GGG - Chr6:112561060-112561079 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTCAAAAGAGTTTGAAG+TGG - Chr6:112560486-112560505 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
! AACTGTTGATGAGGTTATTT+CGG + Chr6:112563939-112563958 None:intergenic 30.0%
! ACATTTTGTTCCATTATGAC+TGG + Chr6:112564503-112564522 None:intergenic 30.0%
! ACTATCTTTTGCTAATCCTT+TGG - Chr6:112565096-112565115 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
! ATTCATAGGACTTTGGATTT+TGG + Chr6:112567906-112567925 None:intergenic 30.0%
! CTCATGACTCACTTAATTTT+TGG + Chr6:112566632-112566651 None:intergenic 30.0%
! CTGAAAGTTGGTTATTACTT+AGG + Chr6:112568269-112568288 None:intergenic 30.0%
! GACCAAAATTTTGTCATAGT+AGG - Chr6:112566527-112566546 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
! GTCTTGAACAATTTTATGGT+AGG + Chr6:112562373-112562392 None:intergenic 30.0%
! GTTGAAGTTATTCCATTTTC+AGG + Chr6:112568066-112568085 None:intergenic 30.0%
! TATAAAAAGGGGTACAACAA+CGG + Chr6:112564093-112564112 None:intergenic 30.0%
! TGTTTAGAGCTGTCAAAAAA+TGG + Chr6:112562960-112562979 None:intergenic 30.0%
! TTGCTAACCCTATTGATTAT+TGG - Chr6:112563329-112563348 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
! TTGTCAAAAGAGTTTGAAGT+GGG - Chr6:112560487-112560506 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGCACTGAAACTTATCT+TGG + Chr6:112561053-112561072 None:intergenic 30.0%
!! AATTTTCAGGGAGATTAAAC+TGG + Chr6:112560963-112560982 None:intergenic 30.0%
!! AGACTTGTCATGTTTTTGTA+AGG - Chr6:112565712-112565731 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
!! ATATATTGATTCTACGGTCA+CGG + Chr6:112561938-112561957 None:intergenic 30.0%
!! GAATATAGAAGTGCTTAACT+TGG - Chr6:112568677-112568696 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
!! GGTTTAGGTTGTTACATTAA+TGG + Chr6:112562091-112562110 None:intergenic 30.0%
!! TCAGTCTAATGATTTGTTTC+TGG - Chr6:112564221-112564240 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
!! TTTGTTTCTGGATTTGGATA+AGG - Chr6:112564233-112564252 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
!!! AAGCTGTTTTTTAGGAATGT+TGG - Chr6:112568810-112568829 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATATGCTTTTGGAGTATTC+AGG - Chr6:112566371-112566390 MsG0680035806.01.T01:intron 30.0%
!!! AGTTGGTCTTTTTACTGAAA+TGG - Chr6:112568590-112568609 MsG0680035806.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGAGATTTTTTTTTGGTGTC+CGG + Chr6:112563658-112563677 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTTCTTGTCAAAGGCA+TGG + Chr6:112566948-112566967 None:intergenic 30.0%
AAACAATGAGAGAGACATCA+AGG + Chr6:112566576-112566595 None:intergenic 35.0%
AAATCTCGAAATTGCAAGAC+TGG + Chr6:112565842-112565861 None:intergenic 35.0%
AAATGAGAAGGAAAGGAAGA+GGG + Chr6:112567422-112567441 None:intergenic 35.0%
AACATACAGACATTCCAACA+AGG + Chr6:112561876-112561895 None:intergenic 35.0%
AACCCTACAGATATTACAGA+AGG - Chr6:112560850-112560869 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
AACGTGACTTAAGTCATACT+GGG - Chr6:112562769-112562788 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
AACTAGTTACTCTTTCTCTG+TGG + Chr6:112565561-112565580 None:intergenic 35.0%
AAGATGTTTGGTTGTTTGGT+TGG + Chr6:112567725-112567744 None:intergenic 35.0%
AAGGAAAAGAACCTGAAAGT+TGG + Chr6:112568281-112568300 None:intergenic 35.0%
AAGGACTCCTGCTTTATATT+CGG + Chr6:112561025-112561044 None:intergenic 35.0%
AATAGGTTGCTGAAATGAGA+AGG + Chr6:112567434-112567453 None:intergenic 35.0%
AATGATCATACCAAACCTTC+TGG - Chr6:112560700-112560719 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
ACCCTACAGATATTACAGAA+GGG - Chr6:112560851-112560870 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
ACCCTTCTGTAATATCTGTA+GGG + Chr6:112560855-112560874 None:intergenic 35.0%
ACTAGTTACTCTTTCTCTGT+GGG + Chr6:112565560-112565579 None:intergenic 35.0%
ACTATAGGATGTGGTTTCTA+AGG + Chr6:112567692-112567711 None:intergenic 35.0%
AGATAACCACCTTTCTTCAT+AGG + Chr6:112561561-112561580 None:intergenic 35.0%
AGCTCATGATGACAAAATTG+AGG + Chr6:112563582-112563601 None:intergenic 35.0%
AGCTGAGAAATGGAAACTAA+AGG - Chr6:112565059-112565078 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
AGTTTGATGTCTATGCTTCA+TGG + Chr6:112562023-112562042 None:intergenic 35.0%
ATCATTAGACTGATCAAGCT+TGG + Chr6:112564214-112564233 None:intergenic 35.0%
ATGCAACAATCCAGTCATAA+TGG - Chr6:112564490-112564509 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
ATTTACTTACCTGACAATCG+TGG + Chr6:112561221-112561240 None:intergenic 35.0%
ATTTCAACCGCAAATGGATA+AGG + Chr6:112560826-112560845 None:intergenic 35.0%
CAAAAAATGGACCGTGTTAA+TGG + Chr6:112562947-112562966 None:intergenic 35.0%
CATAAGGTACAACATAACCT+GGG - Chr6:112561110-112561129 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
CATTTAGCTACAACAAAAGC+TGG - Chr6:112567799-112567818 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
CCACAAGGATCAAATACATA+TGG - Chr6:112563252-112563271 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
CCATATGTATTTGATCCTTG+TGG + Chr6:112563255-112563274 None:intergenic 35.0%
CCTGTCACCAATAATCAATA+GGG + Chr6:112563339-112563358 None:intergenic 35.0%
CGATCCAAAATGTGGAATAA+TGG - Chr6:112562920-112562939 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
CTACAGCGGTTAAAATTCAT+TGG + Chr6:112563967-112563986 None:intergenic 35.0%
CTCAACAACAATGAGTTTGA+AGG - Chr6:112568408-112568427 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
CTCAATAGTAACAGATTCAC+TGG - Chr6:112568195-112568214 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
CTTATACAGTTCTTCAAGCA+TGG - Chr6:112567950-112567969 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
CTTTGATGTTGGAGATTCAT+AGG + Chr6:112567920-112567939 None:intergenic 35.0%
GAAACTTATCTTGGCAACAA+AGG + Chr6:112561044-112561063 None:intergenic 35.0%
GACTGCAAAGATAGTTTGAA+GGG + Chr6:112565124-112565143 None:intergenic 35.0%
GATAACCACCTTTCTTCATA+GGG + Chr6:112561560-112561579 None:intergenic 35.0%
GATACATTGAAGGAGAATTG+TGG - Chr6:112564797-112564816 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
GGAGTAGAGATTAAATCATG+AGG - Chr6:112566157-112566176 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
GGCATATACAAAGTAACCAA+AGG + Chr6:112568300-112568319 None:intergenic 35.0%
GGTGAAATACCTACAAACTT+AGG - Chr6:112568429-112568448 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAATTACCTAAGTTTGT+AGG + Chr6:112568441-112568460 None:intergenic 35.0%
GTTTCAGTGCAAAATGAGAA+AGG - Chr6:112561059-112561078 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGATGTCTATGCTTCAT+GGG + Chr6:112562022-112562041 None:intergenic 35.0%
TAACGTGACTTAAGTCATAC+TGG - Chr6:112562768-112562787 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
TAATGCAACATTATACGGAC+AGG - Chr6:112561617-112561636 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TACAGATATTACAGAAGGGT+GGG - Chr6:112560855-112560874 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TATCCATTTGCGGTTGAAAT+AGG - Chr6:112560826-112560845 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TATGCCAAGTCTCATTTACT+TGG - Chr6:112568314-112568333 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TATTTGATCCTTGTGGTTGT+TGG + Chr6:112563248-112563267 None:intergenic 35.0%
TCATTGAGAGTTAACTACAG+CGG + Chr6:112563981-112564000 None:intergenic 35.0%
TCCTGTCACCAATAATCAAT+AGG + Chr6:112563340-112563359 None:intergenic 35.0%
TCTGTATGTTATCCAAAACC+AGG - Chr6:112561886-112561905 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
TGAAATAACTTAACTCACGC+TGG - Chr6:112562707-112562726 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
TGAAATAATCCACGATTGTC+AGG - Chr6:112561209-112561228 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TGAATCTCCAACATCAAAGA+TGG - Chr6:112567921-112567940 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TGACTCAACTATGATTACGA+AGG + Chr6:112563058-112563077 None:intergenic 35.0%
TGACTGCAAAGATAGTTTGA+AGG + Chr6:112565125-112565144 None:intergenic 35.0%
TGAGATTAACTCAAATGGCA+AGG + Chr6:112566883-112566902 None:intergenic 35.0%
TGCATATTATATGCGAGTCA+GGG + Chr6:112566856-112566875 None:intergenic 35.0%
TGGAACAAAATGTGAGTGAA+TGG - Chr6:112564510-112564529 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
TTAACTGGTTGTATACCAGA+AGG - Chr6:112568567-112568586 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TTACCTATTTCAACCGCAAA+TGG + Chr6:112560832-112560851 None:intergenic 35.0%
TTCCGTGAGATTAACTCAAA+TGG + Chr6:112566888-112566907 None:intergenic 35.0%
TTCTGTGCAAATCCTGAAAA+TGG - Chr6:112568051-112568070 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
TTCTTGTTGAAAAGCTCTTG+AGG + Chr6:112568372-112568391 None:intergenic 35.0%
TTGCATATTATATGCGAGTC+AGG + Chr6:112566857-112566876 None:intergenic 35.0%
TTGGGTTTGAAAACCTTAGT+AGG - Chr6:112561312-112561331 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGTCTATGCTTCATG+GGG + Chr6:112562021-112562040 None:intergenic 35.0%
! AATCTGTTCTTTGAGGAGTT+TGG - Chr6:112568734-112568753 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
! AATGATGGAACATGCAACAA+CGG - Chr6:112560742-112560761 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
! ATCAATAGGGTTAGCAAGTT+AGG + Chr6:112563326-112563345 None:intergenic 35.0%
! ATCTTCATTGAACCTGGTTT+TGG + Chr6:112561901-112561920 None:intergenic 35.0%
! ATTGTTTGGCTCAAGATGTT+TGG + Chr6:112567737-112567756 None:intergenic 35.0%
! GAAGGTTTGGTATGATCATT+TGG + Chr6:112560700-112560719 None:intergenic 35.0%
! GATTGAGAGTGAGCAATTTT+TGG - Chr6:112562840-112562859 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
! GCCCTACTATGACAAAATTT+TGG + Chr6:112566532-112566551 None:intergenic 35.0%
! GGATTAGCAAAAGATAGTGA+AGG + Chr6:112565094-112565113 None:intergenic 35.0%
! GTGAGTTAAGTTATTTCACG+TGG + Chr6:112562705-112562724 None:intergenic 35.0%
! GTTGATCTTGTTGATGAACA+TGG - Chr6:112560586-112560605 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
! TGCCATTTGAGTTAATCTCA+CGG - Chr6:112566883-112566902 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
! TGGTCCATTATTCCACATTT+TGG + Chr6:112562927-112562946 None:intergenic 35.0%
! TGTCAAAAGAGTTTGAAGTG+GGG - Chr6:112560488-112560507 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGTAGTTAACTGTTGATG+AGG + Chr6:112563948-112563967 None:intergenic 35.0%
!! AGGTTATTTCGGTATTTTCG+TGG + Chr6:112563928-112563947 None:intergenic 35.0%
!! ATCATAGAACATTCAGGTTG+AGG + Chr6:112568882-112568901 None:intergenic 35.0%
!! ATCTAACAGGAATTTGGTGT+TGG + Chr6:112561146-112561165 None:intergenic 35.0%
!! CAAGTCTCATTGACTTATCT+TGG + Chr6:112565699-112565718 None:intergenic 35.0%
!! CAGCTTTTGTTGTAGCTAAA+TGG + Chr6:112567801-112567820 None:intergenic 35.0%
!! GGAAATATTCCAGCTAGTTT+TGG - Chr6:112568498-112568517 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAATAATGGACCATTAACA+CGG - Chr6:112562933-112562952 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
!! GTCGTTGATTGGATAACTTT+TGG + Chr6:112560463-112560482 None:intergenic 35.0%
!!! ACTTTCAGGTTCTTTTCCTT+TGG - Chr6:112568281-112568300 MsG0680035806.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGATTTTTTTTTGGTGTCCG+GGG + Chr6:112563656-112563675 None:intergenic 35.0%
!!! CTTTTGGGTTTTAGATGAAG+TGG - Chr6:112565751-112565770 MsG0680035806.01.T01:intron 35.0%
!!! GAGATTTTTTTTTGGTGTCC+GGG + Chr6:112563657-112563676 None:intergenic 35.0%
!!! TTGCTTTTTGAACGTGGAAA+AGG + Chr6:112561533-112561552 None:intergenic 35.0%
AATGAGAAGGAAAGGAAGAG+GGG + Chr6:112567421-112567440 None:intergenic 40.0%
AATGAGGAAGGTTACCTTGT+TGG - Chr6:112561859-112561878 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
ACAACATAACCTGGGTTAAC+TGG - Chr6:112561118-112561137 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
ACGGTATTCTTCCACATCAA+TGG - Chr6:112560761-112560780 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
ACTGATCGGGTAACAACAAA+TGG - Chr6:112561183-112561202 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
AGGACTCCTGCTTTATATTC+GGG + Chr6:112561024-112561043 None:intergenic 40.0%
ATAAAGCTATAGAGCTGGCA+TGG - Chr6:112565470-112565489 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
ATCGACACCAACATATGGAA+CGG - Chr6:112561822-112561841 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
ATCGGTAATTGCACTATGCA+TGG + Chr6:112567033-112567052 None:intergenic 40.0%
CAACATAACCTGGGTTAACT+GGG - Chr6:112561119-112561138 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
CAAGATTTATCGTGCGCAAA+TGG + Chr6:112563160-112563179 None:intergenic 40.0%
CAAGGAGAAATCTTGCCATA+AGG - Chr6:112561094-112561113 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
CACCCTTCTGTAATATCTGT+AGG + Chr6:112560856-112560875 None:intergenic 40.0%
CACTTAATTGTATTCCTGGG+AGG - Chr6:112568844-112568863 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
CCAGGTTATGTTGTACCTTA+TGG + Chr6:112561112-112561131 None:intergenic 40.0%
CCATAAGGTACAACATAACC+TGG - Chr6:112561109-112561128 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
CTAAACCATGCAAACCTTCA+AGG - Chr6:112568123-112568142 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
CTACAGATATTACAGAAGGG+TGG - Chr6:112560854-112560873 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
CTTATGGCAAGATTTCTCCT+TGG + Chr6:112561096-112561115 None:intergenic 40.0%
CTTGTACAAGTGTTCCTTGA+AGG + Chr6:112568140-112568159 None:intergenic 40.0%
GAAATGAGAAGGAAAGGAAG+AGG + Chr6:112567423-112567442 None:intergenic 40.0%
GAATTTCCAAAGGGTCATGT+TGG - Chr6:112560547-112560566 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
GAATTTCTCCCTGCAGTTAT+GGG - Chr6:112561964-112561983 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
GACATAGAACCACAAACAAG+AGG + Chr6:112568948-112568967 None:intergenic 40.0%
GATGTAACAGTTGGATTCCA+TGG - Chr6:112560988-112561007 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
GCTCAAGATGTTTGGTTGTT+TGG + Chr6:112567729-112567748 None:intergenic 40.0%
GGGAGATATGCACTTCTATT+TGG - Chr6:112561984-112562003 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
GGGTGTACAAAACAAAGTGA+TGG - Chr6:112567506-112567525 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
GGTTCAATGAAGATTGACGA+TGG - Chr6:112561907-112561926 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
GGTTTGAAAACCTTAGTAGG+AGG - Chr6:112561315-112561334 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
GTAAAAAGACCAACTCCTTC+TGG + Chr6:112568585-112568604 None:intergenic 40.0%
GTATTCCTAAGAAAGGGTAG+TGG - Chr6:112566238-112566257 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
GTGAAGAAGTGAGATATCTG+AGG - Chr6:112566824-112566843 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
GTTGCTGAAATGAGAAGGAA+AGG + Chr6:112567429-112567448 None:intergenic 40.0%
GTTGGAGATTCATAGGACTT+TGG + Chr6:112567913-112567932 None:intergenic 40.0%
GTTGGTTGCTTGGTTACTAT+AGG + Chr6:112567707-112567726 None:intergenic 40.0%
TAAACTCACACACAACTGTG+AGG - Chr6:112565788-112565807 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
TAATGCCACTACCCTTTCTT+AGG + Chr6:112566246-112566265 None:intergenic 40.0%
TACATGACTTAAGTCACGTC+CGG + Chr6:112562738-112562757 None:intergenic 40.0%
TCAAGACCAATATGTGGCTT+GGG - Chr6:112561286-112561305 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
TCATCATGAGCTTAACCAGT+TGG - Chr6:112563590-112563609 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
TCGTCAATCTTCATTGAACC+TGG + Chr6:112561907-112561926 None:intergenic 40.0%
TCTACTTCAGTAGTTCTTGC+TGG - Chr6:112568093-112568112 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
TGAATTTCTCCCTGCAGTTA+TGG - Chr6:112561963-112561982 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
TGCTTGGTTACTATAGGATG+TGG + Chr6:112567701-112567720 None:intergenic 40.0%
TGTACATCGACACCAACATA+TGG - Chr6:112561817-112561836 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
TGTTTATCTGCAACTTCTCC+AGG + Chr6:112560514-112560533 None:intergenic 40.0%
TTCACGTGGTGTGTATGTAA+AGG + Chr6:112562691-112562710 None:intergenic 40.0%
TTGAAGCACGATCCAAAATG+TGG - Chr6:112562912-112562931 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
TTGATTCCAACATGACCCTT+TGG + Chr6:112560556-112560575 None:intergenic 40.0%
TTGGCTCATAATCAGCTTTC+TGG - Chr6:112568696-112568715 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
TTGTAAATGAGATCGCCAGA+AGG + Chr6:112560718-112560737 None:intergenic 40.0%
TTTCAATGAGCCTCCTACTA+AGG + Chr6:112561328-112561347 None:intergenic 40.0%
! ATGAGCTTAACCAGTTGGTA+GGG - Chr6:112563595-112563614 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
! CCCTATTGATTATTGGTGAC+AGG - Chr6:112563336-112563355 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
! GCTGATTCCATCTTTGATGT+TGG + Chr6:112567931-112567950 None:intergenic 40.0%
! TCTTTTCCCGTTCCATATGT+TGG + Chr6:112561832-112561851 None:intergenic 40.0%
!! ATGGATTGGTGAGGTTGATT+TGG + Chr6:112567615-112567634 None:intergenic 40.0%
!! ATTTGTTGTTACCCGATCAG+TGG + Chr6:112561184-112561203 None:intergenic 40.0%
!! CTTCTTCTGAAGTAGTCTAG+TGG - Chr6:112566779-112566798 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
!! GCTACAACAAAAGCTGGTTT+TGG - Chr6:112567805-112567824 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
!! TGATTTGGCTTGAATGTGCT+AGG + Chr6:112567600-112567619 None:intergenic 40.0%
!! TGGATAACTTTTGGAGACTG+TGG + Chr6:112560454-112560473 None:intergenic 40.0%
!! TTGTGATAATGGTTGCCAGA+TGG + Chr6:112565517-112565536 None:intergenic 40.0%
!!! ACAAAAGCTGGTTTTGGTGT+TGG - Chr6:112567811-112567830 MsG0680035806.01.T01:intron 40.0%
!!! CCAGCTAGTTTTGGTTTCAT+GGG - Chr6:112568507-112568526 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCCAGCTAGTTTTGGTTTCA+TGG - Chr6:112568506-112568525 MsG0680035806.01.T01:CDS 40.0%
AAAGAAGCAGGGAATGAGGA+AGG - Chr6:112561847-112561866 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
AAGGTTCAAAGTTCGAACCC+CGG - Chr6:112563636-112563655 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
AATGAGATCGCCAGAAGGTT+TGG + Chr6:112560713-112560732 None:intergenic 45.0%
AGAAAAGATATCGACCCGTG+AGG - Chr6:112564903-112564922 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
AGACAACTTAAGCTACCACC+TGG + Chr6:112568906-112568925 None:intergenic 45.0%
AGAGAGACATCAAGGTCCAA+TGG + Chr6:112566568-112566587 None:intergenic 45.0%
AGATGGTAGCTACTACATCC+TGG + Chr6:112565500-112565519 None:intergenic 45.0%
AGCATCCCTATGAAGAAAGG+TGG - Chr6:112561552-112561571 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
AGGATGTAGTAGCTACCATC+TGG - Chr6:112565499-112565518 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
ATGGAACGGGAAAAGAAGCA+GGG - Chr6:112561836-112561855 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
ATGTACTTGACGCCACTGAT+CGG - Chr6:112561169-112561188 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
CATGAGCTTAACCAGTTGGT+AGG - Chr6:112563594-112563613 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
CCCATGAAACCAAAACTAGC+TGG + Chr6:112568510-112568529 None:intergenic 45.0%
CCTGAATGTTCTATGATCCC+AGG - Chr6:112568885-112568904 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
CCTGGGATCATAGAACATTC+AGG + Chr6:112568888-112568907 None:intergenic 45.0%
CGAGATTTGACAGTTGAGCT+AGG - Chr6:112565854-112565873 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
CTTCCACATCAATGGAGTTC+TGG - Chr6:112560769-112560788 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
CTTCCAGAACTCCATTGATG+TGG + Chr6:112560775-112560794 None:intergenic 45.0%
GAAAAGATATCGACCCGTGA+GGG - Chr6:112564904-112564923 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
GAAAGGGATTTCAAGCACCA+AGG - Chr6:112561076-112561095 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GAACCACAAACAAGAGGCTT+TGG + Chr6:112568942-112568961 None:intergenic 45.0%
GAATGTTCTATGATCCCAGG+TGG - Chr6:112568888-112568907 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GACAACTTAAGCTACCACCT+GGG + Chr6:112568905-112568924 None:intergenic 45.0%
GCAACAATCCAACAACCACA+AGG - Chr6:112563237-112563256 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
GCAAGCATCCCTATGAAGAA+AGG - Chr6:112561549-112561568 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GCATATCTCCCATAACTGCA+GGG + Chr6:112561975-112561994 None:intergenic 45.0%
GCATTGAAGTGAGAGAGTGA+TGG + Chr6:112567634-112567653 None:intergenic 45.0%
GGACGTGACTTAAGTCATGT+AGG - Chr6:112562737-112562756 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
GGTTATCTTATCTACGCCTC+TGG - Chr6:112561573-112561592 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GGTTGTATACCAGAAGGAGT+TGG - Chr6:112568573-112568592 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GTCAAGACCAATATGTGGCT+TGG - Chr6:112561285-112561304 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GTCCAATGGCATAAGCTGTA+TGG + Chr6:112566554-112566573 None:intergenic 45.0%
GTGACTCCCGAATATAAAGC+AGG - Chr6:112561015-112561034 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
GTGTTCCTTGAAGGTTTGCA+TGG + Chr6:112568131-112568150 None:intergenic 45.0%
TACTGGGTATAATGCCTACG+TGG - Chr6:112562785-112562804 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
TATGCATTGTCCCTACCAAC+TGG + Chr6:112563608-112563627 None:intergenic 45.0%
TATGGAACGGGAAAAGAAGC+AGG - Chr6:112561835-112561854 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
TCGACACCAACATATGGAAC+GGG - Chr6:112561823-112561842 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
TGCATATCTCCCATAACTGC+AGG + Chr6:112561976-112561995 None:intergenic 45.0%
TGGGAAGAGCAATGGTTGTT+GGG - Chr6:112560874-112560893 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGGAGGTGGAGTTGTTT+GGG - Chr6:112567858-112567877 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
TTAACTCACGCTGGATGTAC+CGG - Chr6:112562716-112562735 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
TTACTCTTTCTCTGTGGGAC+TGG + Chr6:112565555-112565574 None:intergenic 45.0%
TTAGCAAGTTAGGTGTGGAG+TGG + Chr6:112563316-112563335 None:intergenic 45.0%
! AATATGTGGCTTGGGCGATT+GGG - Chr6:112561294-112561313 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
! ACACCAAAGCCTCTTGTTTG+TGG - Chr6:112568936-112568955 MsG0680035806.01.T01:CDS 45.0%
! ATTTGGCTTCAGCCCAATCT+AGG + Chr6:112563849-112563868 None:intergenic 45.0%
! CAAACAAGAGGCTTTGGTGT+TGG + Chr6:112568936-112568955 None:intergenic 45.0%
! TAGGGTTAGCAAGTTAGGTG+TGG + Chr6:112563321-112563340 None:intergenic 45.0%
! TGGTTGTTTGGTTGGTTGCT+TGG + Chr6:112567717-112567736 None:intergenic 45.0%
!! GAAGTGAGAGAGTGATGGAT+TGG + Chr6:112567629-112567648 None:intergenic 45.0%
!! GATAGTTTGAAGGGTGCCAA+AGG + Chr6:112565115-112565134 None:intergenic 45.0%
!! GCTAAGTTGATCACAGAAGC+TGG + Chr6:112568462-112568481 None:intergenic 45.0%
!! TTTGGTGTTGGTGGAAGTGT+TGG - Chr6:112567823-112567842 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
!!! AAAGCTGGTTTTGGTGTTGG+TGG - Chr6:112567814-112567833 MsG0680035806.01.T01:intron 45.0%
!!! ATTCGGGAGTCACTTTTCCA+TGG + Chr6:112561008-112561027 None:intergenic 45.0%
!!! GGATGCTTGCTTTTTGAACG+TGG + Chr6:112561539-112561558 None:intergenic 45.0%
!! AAATTAAATGTAAATATTAA+GGG + Chr6:112563385-112563404 None:intergenic 5.0%
!! AATATATATGTAAAAAAATT+AGG - Chr6:112564549-112564568 MsG0680035806.01.T01:intron 5.0%
!! ATATATATGTAAAAAAATTA+GGG - Chr6:112564550-112564569 MsG0680035806.01.T01:intron 5.0%
!! CTTAATAAAATAAATTATTT+AGG - Chr6:112562124-112562143 MsG0680035806.01.T01:intron 5.0%
!! TAAATTAAATGTAAATATTA+AGG + Chr6:112563386-112563405 None:intergenic 5.0%
!!! ATTTTTTTACATATATATTA+TGG + Chr6:112564548-112564567 None:intergenic 5.0%
!!! TTTAAATTTTTTATTTTTTG+TGG - Chr6:112561249-112561268 MsG0680035806.01.T01:CDS 5.0%
CAAGACTGGACGTTGTGACT+CGG + Chr6:112565828-112565847 None:intergenic 50.0%
CAATCGCCCAAGCCACATAT+TGG + Chr6:112561295-112561314 None:intergenic 50.0%
CTACGTGACTTAAGCCACGT+AGG + Chr6:112562802-112562821 None:intergenic 50.0%
CTACGTGGCTTAAGTCACGT+AGG - Chr6:112562800-112562819 MsG0680035806.01.T01:intron 50.0%
GGCCATACAGCTTATGCCAT+TGG - Chr6:112566549-112566568 MsG0680035806.01.T01:intron 50.0%
GGGAAAAGAAGCAGGGAATG+AGG - Chr6:112561843-112561862 MsG0680035806.01.T01:intron 50.0%
GTGGGAAGAGCAATGGTTGT+TGG - Chr6:112560873-112560892 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
GTGTTGGAGGTGGAGTTGTT+TGG - Chr6:112567857-112567876 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
GTTGGAGGTGGAGTTGTTTG+GGG - Chr6:112567859-112567878 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
GTTGGTGTAGGTGTAGGTGT+TGG - Chr6:112567841-112567860 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
TAGAGCTGGCATGGATAACC+AGG - Chr6:112565479-112565498 MsG0680035806.01.T01:intron 50.0%
TGTACTTGACGCCACTGATC+GGG - Chr6:112561170-112561189 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
TTGGAGGTGGAGTTGTTTGG+GGG - Chr6:112567860-112567879 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
! AAAGAGTTTGAAGTGGGGCC+TGG - Chr6:112560493-112560512 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
! ATTTTCACCAGCTCCCTCAC+GGG + Chr6:112564920-112564939 None:intergenic 50.0%
! CAATATGTGGCTTGGGCGAT+TGG - Chr6:112561293-112561312 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
! CAGCTAGCTTGGAAGTTCTG+TGG + Chr6:112564147-112564166 None:intergenic 50.0%
! GATTTTCACCAGCTCCCTCA+CGG + Chr6:112564921-112564940 None:intergenic 50.0%
! TTGTGACTCGGATTCGAACC+CGG + Chr6:112565816-112565835 None:intergenic 50.0%
!! AGTTCTGGAAGTGAAACGCG+AGG - Chr6:112560784-112560803 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGAGAGTGATGGATTGGTG+AGG + Chr6:112567624-112567643 None:intergenic 50.0%
!! GGAAGTGTTGGTGTAGGTGT+AGG - Chr6:112567835-112567854 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTGGTGGAAGTGTTGGTGT+AGG - Chr6:112567829-112567848 MsG0680035806.01.T01:CDS 50.0%
ACACACAACTGTGAGGTCCC+GGG - Chr6:112565795-112565814 MsG0680035806.01.T01:intron 55.0%
CACACACAACTGTGAGGTCC+CGG - Chr6:112565794-112565813 MsG0680035806.01.T01:intron 55.0%
CAGAAGGGTGGGAAGAGCAA+TGG - Chr6:112560866-112560885 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
CGAGAAACGAGCGTTCTCAG+AGG + Chr6:112568979-112568998 None:intergenic 55.0%
GCAATGGTTGTTGGGTGTGC+TGG - Chr6:112560882-112560901 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
GGTCTTTGCATGTTCCTCCC+AGG + Chr6:112568861-112568880 None:intergenic 55.0%
TGGAGGTGGAGTTGTTTGGG+GGG - Chr6:112567861-112567880 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
TTGTTTGGGGGGTAGGAGGT+GGG - Chr6:112567872-112567891 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
! GTGCTGGTCATTGACACACG+AGG - Chr6:112560898-112560917 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
! GTGTTGGTCCCAGTTAACCC+AGG + Chr6:112561130-112561149 None:intergenic 55.0%
! TGTGACTCGGATTCGAACCC+GGG + Chr6:112565815-112565834 None:intergenic 55.0%
!! GGTGTAGGTGTAGGTGTTGG+AGG - Chr6:112567844-112567863 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
!! GTAGGTGTAGGTGTTGGAGG+TGG - Chr6:112567847-112567866 MsG0680035806.01.T01:CDS 55.0%
ACCTGCATGCGCATGACCAG+AGG + Chr6:112561592-112561611 None:intergenic 60.0%
ATATCGACCCGTGAGGGAGC+TGG - Chr6:112564910-112564929 MsG0680035806.01.T01:intron 60.0%
GGAGTTGTTTGGGGGGTAGG+AGG - Chr6:112567868-112567887 MsG0680035806.01.T01:CDS 60.0%
GGTGGAGTTGTTTGGGGGGT+AGG - Chr6:112567865-112567884 MsG0680035806.01.T01:CDS 60.0%
GTTGTTTGGGGGGTAGGAGG+TGG - Chr6:112567871-112567890 MsG0680035806.01.T01:CDS 60.0%
GCCTCTGGTCATGCGCATGC+AGG - Chr6:112561588-112561607 MsG0680035806.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 112560424 112569043 112560424 ID=MsG0680035806.01;Name=MsG0680035806.01
Chr6 mRNA 112560424 112569043 112560424 ID=MsG0680035806.01.T01;Parent=MsG0680035806.01;Name=MsG0680035806.01.T01;_AED=0.16;_eAED=0.16;_QI=0|0|0|1|1|1|4|0|771
Chr6 exon 112568237 112569043 112568237 ID=MsG0680035806.01.T01:exon:9612;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 exon 112567829 112567972 112567829 ID=MsG0680035806.01.T01:exon:9611;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 exon 112567539 112567665 112567539 ID=MsG0680035806.01.T01:exon:9610;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 exon 112560424 112561661 112560424 ID=MsG0680035806.01.T01:exon:9609;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 CDS 112568237 112569043 112568237 ID=MsG0680035806.01.T01:cds;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 CDS 112567829 112567972 112567829 ID=MsG0680035806.01.T01:cds;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 CDS 112567539 112567665 112567539 ID=MsG0680035806.01.T01:cds;Parent=MsG0680035806.01.T01
Chr6 CDS 112560424 112561661 112560424 ID=MsG0680035806.01.T01:cds;Parent=MsG0680035806.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035806.01.T01

ATGCTATCAAGCACAACTTATTCACAACCACAGTCTCCAAAAGTTATCCAATCAACGACATATTTGTCAAAAGAGTTTGAAGTGGGGCCTGGAGAAGTTGCAGATAAACAAATATATAATATTGAATTTCCAAAGGGTCATGTTGGAATCAAGAGCTTTGATGTTGATCTTGTTGATGAACATGGAAAATCTGTACCATTGCATGAAACTTACATTCATCATTGGTTTATTTTAAAATATATTATAAAGAAGAATATGTCAGTGTCACAAGATCCAAATGATCATACCAAACCTTCTGGCGATCTCATTTACAAAAGAAATGATGGAACATGCAACAACGGTATTCTTCCACATCAATGGAGTTCTGGAAGTGAAACGCGAGGAACAAGTACAAAACTTCCTTATCCATTTGCGGTTGAAATAGGTAACCCTACAGATATTACAGAAGGGTGGGAAGAGCAATGGTTGTTGGGTGTGCTGGTCATTGACACACGAGGTGCTGAAGATAAGAAAATTTGTATTCAATGTAGGTGTGACCAGTTTAATCTCCCTGAAAATTTTTATGATGTAACAGTTGGATTCCATGGAAAAGTGACTCCCGAATATAAAGCAGGAGTCCTTTGTTGCCAAGATAAGTTTCAGTGCAAAATGAGAAAGGGATTTCAAGCACCAAGGAGAAATCTTGCCATAAGGTACAACATAACCTGGGTTAACTGGGACCAACACCAAATTCCTGTTAGATTTTATGTACTTGACGCCACTGATCGGGTAACAACAAATGGTTCTGAAATAATCCACGATTGTCAGGCAGAGTTTACTATTTCAGAAAATAATAGTACAAACCTTTTCCACGTTCAAAAAGCAAGCATCCCTATGAAGAAAGGTGGTTATCTTATCTACGCCTCTGGTCATGCGCATGCAGGTGTTGTTAATGCAACATTATACGGACAGGATGGAAGGACATTGTGTACATCGACACCAACATATGGAACGGGAAAAGAAGCAGGGAATGAGGAAGGTTACCTTGTTGGAATGTCTGTATGTTATCCAAAACCAGGTTCAATGAAGATTGACGATGCTACAACAAAAGCTGGTTTTGGTGTTGGTGGAAGTGTTGGTGTAGGTGTAGGTGTTGGAGGTGGAGTTGTTTGGGGGGTAGGAGGTGGGAATAGTAACCAAAATCCAAAGTCCTATGAATCTCCAACATCAAAGATGGAATCAGCTTATACAGTTCTTCAAGCATGGAAATCTGCAATCACTGATGACCCTTTAAAGATACTAGATTCTTGGAATGGTTCAAATGTATGTTCATACAAAGGAATCTTCTGTGCAAATCCTGAAAATGGAATAACTTCAACATCAGCTTCTACTTCAGTAGTTCTTGCTGGAATAGATCTAAACCATGCAAACCTTCAAGGAACACTTGTACAAGAATTATCATTACTCACTGATATGTCACTACTTCATCTCAATAGTAACAGATTCACTGGAACAGTTCCTGAAACATTCAAAGATCTTGTTTCACTTCAAGAGTTAGACCTAAGTAATAACCAACTTTCAGGTTCTTTTCCTTTGGTTACTTTGTATATGCCAAGTCTCATTTACTTGGATATTAGGTTTAACTCTTTCTCAGGTTCATTACCTCAAGAGCTTTTCAACAAGAATCTTGATGCAATATTTCTCAACAACAATGAGTTTGAAGGTGAAATACCTACAAACTTAGGTAATTCACCAGCTTCTGTGATCAACTTAGCTAATAACAAATTGAGTGGAAATATTCCAGCTAGTTTTGGTTTCATGGGATCAAAGATCAAAGAGATTTTGTTTCTGAATAATCAGTTAACTGGTTGTATACCAGAAGGAGTTGGTCTTTTTACTGAAATGGAAGTTCTTGATGTGAGTTTCAATTCATTGATGGGTCATTTACCTGATACATTATCATGTTTACAGAATATAGAAGTGCTTAACTTGGCTCATAATCAGCTTTCTGGAGAGTTATCAGATATAATCTGTTCTTTGAGGAGTTTGGCTAATTTAACTGTTGCTTATAATTTCTTTTCTGGGTTTAGTCAACAATGTTCTAAGCTGTTTTTTAGGAATGTTGGTTTTGATTTTTCACTTAATTGTATTCCTGGGAGGAACATGCAAAGACCTCAACCTGAATGTTCTATGATCCCAGGTGGTAGCTTAAGTTGTCTCAGAATTCCAACACCAAAGCCTCTTGTTTGTGGTTCTATGTCTGTAAGTACCTCTGAGAACGCTCGTTTCTCGTCACAATCACATTCACATTTTTCAAAATCACAATCTCCTCCTTGA
Protein sequence

>MsG0680035806.01.T01

MLSSTTYSQPQSPKVIQSTTYLSKEFEVGPGEVADKQIYNIEFPKGHVGIKSFDVDLVDEHGKSVPLHETYIHHWFILKYIIKKNMSVSQDPNDHTKPSGDLIYKRNDGTCNNGILPHQWSSGSETRGTSTKLPYPFAVEIGNPTDITEGWEEQWLLGVLVIDTRGAEDKKICIQCRCDQFNLPENFYDVTVGFHGKVTPEYKAGVLCCQDKFQCKMRKGFQAPRRNLAIRYNITWVNWDQHQIPVRFYVLDATDRVTTNGSEIIHDCQAEFTISENNSTNLFHVQKASIPMKKGGYLIYASGHAHAGVVNATLYGQDGRTLCTSTPTYGTGKEAGNEEGYLVGMSVCYPKPGSMKIDDATTKAGFGVGGSVGVGVGVGGGVVWGVGGGNSNQNPKSYESPTSKMESAYTVLQAWKSAITDDPLKILDSWNGSNVCSYKGIFCANPENGITSTSASTSVVLAGIDLNHANLQGTLVQELSLLTDMSLLHLNSNRFTGTVPETFKDLVSLQELDLSNNQLSGSFPLVTLYMPSLIYLDIRFNSFSGSLPQELFNKNLDAIFLNNNEFEGEIPTNLGNSPASVINLANNKLSGNIPASFGFMGSKIKEILFLNNQLTGCIPEGVGLFTEMEVLDVSFNSLMGHLPDTLSCLQNIEVLNLAHNQLSGELSDIICSLRSLANLTVAYNFFSGFSQQCSKLFFRNVGFDFSLNCIPGRNMQRPQPECSMIPGGSLSCLRIPTPKPLVCGSMSVSTSENARFSSQSHSHFSKSQSPP*