AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039017.01

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MsG0780039017.01.T01 AT3G53700 27.424 361 259 3 201 560 285 643 5.19e-42 165
MsG0780039017.01.T01 AT3G53700 24.644 491 338 10 241 727 184 646 5.57e-40 159
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MsG0780039017.01.T01 AT1G62914 29.932 294 197 2 216 505 223 511 1.10e-37 149
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MsG0780039017.01.T01 AT1G62914 24.174 484 325 11 284 759 46 495 4.25e-28 120
MsG0780039017.01.T01 AT1G09680 28.097 331 237 1 241 571 235 564 2.45e-44 170
MsG0780039017.01.T01 AT1G09680 28.000 325 233 1 247 571 171 494 2.11e-39 155
MsG0780039017.01.T01 AT1G09680 28.958 259 179 2 215 471 314 569 2.47e-26 115
MsG0780039017.01.T01 AT1G09680 25.597 293 212 3 173 465 309 595 5.14e-23 105
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MsG0780039017.01.T01 AT4G16390 24.024 333 237 3 252 569 132 463 3.93e-24 108
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MsG0780039017.01.T01 AT4G18840 25.762 361 214 8 248 571 71 414 2.48e-26 115
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MsG0780039017.01.T01 AT5G25630 23.381 278 193 4 252 525 266 527 1.22e-15 81.6
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MsG0780039017.01.T01 AT3G09650 22.691 379 235 8 248 570 155 531 3.75e-19 93.2
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MsG0780039017.01.T01 AT4G22760 20.964 415 263 12 204 581 132 518 2.97e-15 80.5
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MsG0780039017.01.T01 AT1G03540 22.911 371 235 8 248 583 130 484 4.90e-22 102
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MsG0780039017.01.T01 AT2G15980 24.252 301 197 6 226 502 177 470 6.80e-17 85.1
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MsG0780039017.01.T01 AT5G14820 25.000 260 184 3 233 486 313 567 8.46e-22 101
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MsG0780039017.01.T01 AT2G33680 21.667 600 313 20 241 746 44 580 7.13e-21 98.6
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MsG0780039017.01.T01 AT3G46610 24.380 242 176 1 302 536 401 642 7.50e-21 98.6
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MsG0780039017.01.T01 AT1G04840 22.494 449 303 10 247 693 92 497 9.90e-21 98.2
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MsG0780039017.01.T01 AT1G33350 22.968 283 199 7 281 557 161 430 4.29e-12 70.1
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MsG0780039017.01.T01 AT5G10690 25.098 255 174 7 280 518 76 329 3.79e-13 73.6
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MsG0780039017.01.T01 AT1G03510 23.718 312 226 5 249 559 117 417 1.45e-16 83.6
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Find 203 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GCAGCTGCTGGTGGTGCTGC+TGG 0.271236 7:-56858740 MsG0780039017.01.T01:CDS
CACTAAAGGTGAAATGTTTC+AGG 0.273239 7:-56857469 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGGGAGATTAATCTTGCTTT+AGG 0.286035 7:-56858302 MsG0780039017.01.T01:CDS
CATTTCCTCATACAGGTTTA+GGG 0.289080 7:+56857758 None:intergenic
TTACCTGCAAGCATTTAAAA+TGG 0.297728 7:+56856987 None:intergenic
GATTCCTACTAGTGTGTTAT+AGG 0.300448 7:+56857704 None:intergenic
GCTCCGCTTGTTTGATAATC+AGG 0.302805 7:-56856811 MsG0780039017.01.T01:CDS
CTTGTGCAATGGTTCATTCA+TGG 0.313963 7:-56856415 MsG0780039017.01.T01:CDS
TCGGCCATGATTAGTGCTTT+TGG 0.314395 7:-56858227 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCATCGCCAACTTTGGAATA+TGG 0.315302 7:-56857255 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGAATTTATGAGAATAATTT+GGG 0.318356 7:-56856139 MsG0780039017.01.T01:CDS
CTGATGCTGTGGATTTGTTC+AGG 0.324454 7:-56858187 MsG0780039017.01.T01:CDS
ATCAGTGAGGGCATTATAAA+AGG 0.324575 7:+56856680 None:intergenic
TGAGAATAATTTGGGAAGAT+TGG 0.326773 7:-56856131 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGCATATTCCTCCACTTTGC+TGG 0.334585 7:-56858690 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTTGTTGCTGCTGCAGCTGC+TGG 0.345112 7:-56858752 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGTGGTGCTGCTGGTGGCAG+GGG 0.345446 7:-56858731 MsG0780039017.01.T01:CDS
GCTGCTGGTGGCAGGGGCAA+TGG 0.345945 7:-56858725 MsG0780039017.01.T01:CDS
ATTGGCACTCTTGGTAGGTT+AGG 0.346431 7:-56858323 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGGTAAGCACAGTAAAATAA+TGG 0.358104 7:-56856221 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGGAGAAGGAACATTGAAAA+AGG 0.363743 7:-56856200 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGAGTTCAAGATGGCAAGAT+TGG 0.364420 7:-56857427 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGGTGGTGCTGCTGGTGGCA+GGG 0.366435 7:-56858732 MsG0780039017.01.T01:CDS
GCTGAAAATGTGACAACATT+TGG 0.368783 7:+56857009 None:intergenic
GCACTATAAGTGACCACATT+TGG 0.372478 7:+56857822 None:intergenic
CGAATGGTCAATTTCTTGCT+TGG 0.372995 7:-56856465 MsG0780039017.01.T01:CDS
GAATTGTACGTTATCACATT+AGG 0.373336 7:+56858140 None:intergenic
TGGTTGAGATGCATCAATTA+TGG 0.373512 7:+56857275 None:intergenic
GACCTCCTGCCAGAAAATTC+AGG 0.375752 7:+56858644 None:intergenic
ATCTTCCAAGAGGTTGGCCT+TGG 0.376026 7:+56857782 None:intergenic
TACATATGAACATAAGTTAT+GGG 0.376541 7:-56858480 MsG0780039017.01.T01:CDS
CATCTCTTTGAATACCCTTC+TGG 0.378161 7:+56857863 None:intergenic
AGATGTCGTCGAAGAGAGTT+TGG 0.384228 7:-56857845 MsG0780039017.01.T01:CDS
TAAGGCAGGCCAAATTGATT+TGG 0.386084 7:-56857886 MsG0780039017.01.T01:CDS
GAGTAGTTTGGTGGAGGGGT+TGG 0.387497 7:+56858962 None:intergenic
TCATTGACGCTGGGGCGAAA+GGG 0.390807 7:-56858115 MsG0780039017.01.T01:CDS
CTGAACAAATCCACAGCATC+AGG 0.394503 7:+56858188 None:intergenic
ATTCGCCTTTCCACACATTT+CGG 0.397854 7:+56856483 None:intergenic
TATGTTGCTTATAGCAATGA+TGG 0.401814 7:-56857334 MsG0780039017.01.T01:CDS
TCGTCTCCTATGCTTATTGA+TGG 0.404205 7:-56857189 MsG0780039017.01.T01:CDS
GCACTGTGAGCATGTTTGTT+TGG 0.406403 7:+56858575 None:intergenic
CAAAATGGGAGGGTTGATAA+AGG 0.412260 7:-56858365 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTTGAAAGAGCTAGACTTGA+AGG 0.412708 7:-56858275 MsG0780039017.01.T01:CDS
TCTAGGAGCAGCAGGGAGTA+AGG 0.416560 7:+56858940 None:intergenic
GAGTTGAACGTGACCACATT+TGG 0.417693 7:+56857297 None:intergenic
GGAGCTTCATTTCCTCATAC+AGG 0.418356 7:+56857751 None:intergenic
TCAGAGACGCGGAGCTGAAA+TGG 0.422776 7:-56856525 MsG0780039017.01.T01:intron
CCTTTCTGTTTGCGCATCGA+AGG 0.423272 7:-56858006 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTGGCACTCTTGGTAGGTTA+GGG 0.424388 7:-56858322 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGTTCAGGTCCATGAGTAGC+TGG 0.425595 7:-56858172 MsG0780039017.01.T01:CDS
CATCAGGGAAGCGCCCATTT+CGG 0.426659 7:+56858204 None:intergenic
TTACATATGAACATAAGTTA+TGG 0.428430 7:-56858481 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGGGTTACAGAGAACAAATA+TGG 0.428758 7:-56856761 MsG0780039017.01.T01:CDS
ATCGAAGGGCATGTGGGAAA+TGG 0.430341 7:-56857991 MsG0780039017.01.T01:CDS
ATCTCAACCATCGCCAACTT+TGG 0.433764 7:-56857262 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGAAGTTAGAAGACTGTTTG+AGG 0.436301 7:-56857553 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCTTTAGCTGTTGCTGAAGT+AGG 0.436358 7:-56858788 MsG0780039017.01.T01:CDS
GCTGCTGGTGGTGCTGCTGG+TGG 0.438276 7:-56858737 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTGTTTGATAATCAGGTGTA+TGG 0.439886 7:-56856804 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTTGCTGCTGCAGCTGCTGG+TGG 0.440534 7:-56858749 MsG0780039017.01.T01:CDS
TCAGCATGTCTAGGAGCAGC+AGG 0.441756 7:+56858932 None:intergenic
GCTATTGAAACACTCCTTAA+CGG 0.442394 7:-56856178 MsG0780039017.01.T01:CDS
TACGCGGCCAAGATACATTC+TGG 0.442938 7:-56858614 MsG0780039017.01.T01:CDS
CTATGCCAAGGCCAACCTCT+TGG 0.447898 7:-56857787 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGTAAGCACAGTAAAATAAT+GGG 0.454249 7:-56856220 MsG0780039017.01.T01:CDS
TAAGGAGTAGTTTGGTGGAG+GGG 0.454956 7:+56858958 None:intergenic
ATCATTGACGCTGGGGCGAA+AGG 0.458673 7:-56858116 MsG0780039017.01.T01:CDS
TAGGGCATCTTCCAAGAGGT+TGG 0.459897 7:+56857776 None:intergenic
TTAACTCCATATTCCAAAGT+TGG 0.461250 7:+56857249 None:intergenic
GCAGGGAGTAAGGAGTAGTT+TGG 0.464247 7:+56858950 None:intergenic
TCATTATGTCGAAACAAAAT+GGG 0.464595 7:-56858379 MsG0780039017.01.T01:CDS
AAGACTGTTTGAGGAGATGA+AGG 0.468514 7:-56857544 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCCGGACAAAAGAGCATTGT+AGG 0.468764 7:+56857599 None:intergenic
TAGAACGTTTATGAGTACTA+TGG 0.471327 7:+56858861 None:intergenic
AGTGCTATGATTGGCACTCT+TGG 0.472598 7:-56858332 MsG0780039017.01.T01:CDS
GCTCGAACATCTTCAAAATC+CGG 0.475411 7:+56857139 None:intergenic
TTGTGGTGCTGCTTGTGCAA+TGG 0.477215 7:-56856426 MsG0780039017.01.T01:CDS
CTTAGCTTTCTGTTCAAAGC+TGG 0.479374 7:-56858536 MsG0780039017.01.T01:CDS
CGTAACCAATGGACTGTTGA+TGG 0.480343 7:-56856781 MsG0780039017.01.T01:CDS
TATGCTGTGGCACTTTGGTC+AGG 0.483371 7:-56856658 MsG0780039017.01.T01:intron
ATTTGGGAAGATTGGTCTCA+TGG 0.487013 7:-56856123 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGCACTAATCATGGCCGAAA+AGG 0.488580 7:+56858232 None:intergenic
AGTAAGGAGTAGTTTGGTGG+AGG 0.489908 7:+56858956 None:intergenic
CCTACTTCAGCAACAGCTAA+AGG 0.490606 7:+56858788 None:intergenic
GCTGAAATGGTTGTAATTGA+AGG 0.491512 7:-56856512 MsG0780039017.01.T01:CDS
CGGCATTCCAGAATGTATCT+TGG 0.493806 7:+56858607 None:intergenic
CTTTCTGTTTGCGCATCGAA+GGG 0.495145 7:-56858005 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTCAAAATCCGGTCCTCCCC+CGG 0.495220 7:+56857150 None:intergenic
GAATTGTAAGTAAGCCGATC+TGG 0.496260 7:+56858032 None:intergenic
AGAGCTAGACTTGAAGGGTA+TGG 0.497971 7:-56858269 MsG0780039017.01.T01:CDS
CGTCTCCTATGCTTATTGAT+GGG 0.500220 7:-56857188 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGAAGGAAGGAAATCAAGAT+TGG 0.501244 7:-56858669 MsG0780039017.01.T01:CDS
AAGTTAGTTAGTGCTATGAT+TGG 0.505557 7:-56858341 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGGAGTAAGGAGTAGTTTGG+TGG 0.506229 7:+56858953 None:intergenic
ATATTTGGACACCCTGTGTA+AGG 0.508019 7:-56857904 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTAAGGAGTAGTTTGGTGGA+GGG 0.508291 7:+56858957 None:intergenic
GTTCAATGAAATCATGCGTA+TGG 0.510251 7:-56856721 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTAGGAATCTACGCGAAGCT+CGG 0.510999 7:-56857690 MsG0780039017.01.T01:CDS
ACTGATATGCTGTGGCACTT+TGG 0.515757 7:-56856663 MsG0780039017.01.T01:CDS
AAGGTGAACCCATGCCGTTA+AGG 0.516446 7:+56856164 None:intergenic
GTGTCCTATAACACACTAGT+AGG 0.517471 7:-56857708 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCTCCACTTTGCTGGAAGGA+AGG 0.521129 7:-56858682 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTTCAGGTCCATGAGTAGCT+GGG 0.522519 7:-56858171 MsG0780039017.01.T01:CDS
CTTATAGCAATGATGGAGAA+AGG 0.526682 7:-56857327 MsG0780039017.01.T01:CDS
GCCAAATTGATTTGGCCAGA+AGG 0.528041 7:-56857878 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCAAATTGATTTGGCCAGAA+GGG 0.530494 7:-56857877 MsG0780039017.01.T01:CDS
TACAACTCCCCAGCTACTCA+TGG 0.531220 7:+56858163 None:intergenic
CAATTTGGCCTGCCTTACAC+AGG 0.531408 7:+56857892 None:intergenic
ACTGCATGGCTGACACAACC+TGG 0.531506 7:-56856090 MsG0780039017.01.T01:CDS
TAAAAGGCAGACGAAGTTGA+AGG 0.532758 7:+56856696 None:intergenic
CATGCCATGCTTGCCATACC+CGG 0.533123 7:+56857581 None:intergenic
TGTTTGTTTGGAGTCACCCT+CGG 0.534188 7:+56858587 None:intergenic
CTATGATTGGCACTCTTGGT+AGG 0.534679 7:-56858328 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTGTTATAAGTAAACACATC+GGG 0.536480 7:+56857927 None:intergenic
GTCTCCTATGCTTATTGATG+GGG 0.536739 7:-56857187 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTGGACACCCTGTGTAAGGC+AGG 0.537912 7:-56857900 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGATGCCCTAAACCTGTATG+AGG 0.538753 7:-56857763 MsG0780039017.01.T01:CDS
TCGGCCAAAAGCACTAATCA+TGG 0.541479 7:+56858223 None:intergenic
ACAATTCAATCATTGACGCT+GGG 0.542537 7:-56858124 MsG0780039017.01.T01:CDS
TATTCCTCCACTTTGCTGGA+AGG 0.543957 7:-56858686 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGAAACACTCCTTAACGGCA+TGG 0.544406 7:-56856173 MsG0780039017.01.T01:CDS
CATTGACGCTGGGGCGAAAG+GGG 0.546544 7:-56858114 MsG0780039017.01.T01:CDS
TCACAGTGCTGCGGCTGACG+AGG 0.548183 7:-56858561 MsG0780039017.01.T01:CDS
TACAATTCAATCATTGACGC+TGG 0.551293 7:-56858125 MsG0780039017.01.T01:CDS
ATGATCGATATGTACACTAA+AGG 0.552565 7:-56857483 MsG0780039017.01.T01:CDS
GATCCTTACTTCACAAACAT+AGG 0.554228 7:+56856350 None:intergenic
TTCAGGTCCATGAGTAGCTG+GGG 0.555746 7:-56858170 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGGGCGCTTCCCTGATGCTG+TGG 0.556692 7:-56858198 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTGTCCGGGTATGGCAAGCA+TGG 0.562253 7:-56857585 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCTTCCTTCCAGCAAAGTGG+AGG 0.564825 7:+56858682 None:intergenic
CTGAAATGGTTGTAATTGAA+GGG 0.565604 7:-56856511 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGCAGCAACAACACTTCCAT+TGG 0.566294 7:+56858763 None:intergenic
ATGGAGAAGTGCTGACTGCA+TGG 0.567107 7:-56856104 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGTCACTTATAGTGCAATGA+TGG 0.568496 7:-56857814 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCATATTCCAAAGTTGGCGA+TGG 0.570685 7:+56857255 None:intergenic
CACAGTAAAATAATGGGAGA+AGG 0.571635 7:-56856214 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCAACGGCATAATGCCAGAT+CGG 0.572820 7:-56858046 MsG0780039017.01.T01:CDS
CCTTCGATGCGCAAACAGAA+AGG 0.574233 7:+56858006 None:intergenic
GATCTGCATCTGATGTCTTG+TGG 0.574762 7:-56856443 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTTGCGCATCGAAGGGCATG+TGG 0.576722 7:-56857998 MsG0780039017.01.T01:CDS
CAGATAAAGAAGAATAGAAG+TGG 0.577265 7:-56857093 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTTCCTTCCTTCCAGCAAAG+TGG 0.580938 7:+56858679 None:intergenic
ACTTATAGTGCAATGATGGA+TGG 0.582167 7:-56857810 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTGAAAGAGCTAGACTTGAA+GGG 0.582690 7:-56858274 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTAACCCATCAACAGTCCAT+TGG 0.583881 7:+56856776 None:intergenic
CCGATCTGGCATTATGCCGT+TGG 0.584083 7:+56858046 None:intergenic
ACAAGCGAATTGAAAACTCC+AGG 0.584621 7:+56856072 None:intergenic
TATTGAGACGTGCAAAGAGA+TGG 0.585285 7:-56857652 MsG0780039017.01.T01:CDS
GAAACACTCCTTAACGGCAT+GGG 0.585472 7:-56856172 MsG0780039017.01.T01:CDS
CAGGTGTATGGCGTAACCAA+TGG 0.585578 7:-56856792 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGAAATGTTTCAGGAAGCGA+TGG 0.586072 7:-56857460 MsG0780039017.01.T01:CDS
GATTTCATTGAACAGAGTCT+CGG 0.590820 7:+56856731 None:intergenic
TTATTCTCATAAATTCTGAA+AGG 0.593975 7:+56856145 None:intergenic
TTATGTCGAAACAAAATGGG+AGG 0.594963 7:-56858376 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGTTTGAGGAGATGAAGGCT+CGG 0.599404 7:-56857539 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTTGCTGAAGTAGGTGCCAA+TGG 0.601689 7:-56858779 MsG0780039017.01.T01:CDS
CAGGAGGTCAACGCGGTACG+CGG 0.602960 7:-56858630 MsG0780039017.01.T01:CDS
TATGATGAAATGATAGCCAA+CGG 0.606536 7:-56858062 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGACGCCGAAATGTGTGGAA+AGG 0.607515 7:-56856488 MsG0780039017.01.T01:CDS
AAGGGAGACGCCGAAATGTG+TGG 0.607661 7:-56856493 MsG0780039017.01.T01:CDS
TATTGAGTGAAATGCACCAC+AGG 0.608800 7:-56857959 MsG0780039017.01.T01:CDS
TAAAGGTGCAGAGTGTGAGT+TGG 0.609746 7:+56858805 None:intergenic
CTCTATCAAGACAAACAGAT+CGG 0.610820 7:+56857730 None:intergenic
CAGCATGTCTAGGAGCAGCA+GGG 0.613056 7:+56858933 None:intergenic
ACCGTTGGTCTTCATCGTCT+AGG 0.614345 7:-56858835 MsG0780039017.01.T01:CDS
GAAGAGAGTTTGGCCAAATG+TGG 0.616037 7:-56857835 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGCAAAGAGATGGAAAGAAG+TGG 0.618011 7:-56857642 MsG0780039017.01.T01:CDS
AAAGCCCCATCAATAAGCAT+AGG 0.632516 7:+56857183 None:intergenic
ACACCTGATTATCAAACAAG+CGG 0.633065 7:+56856808 None:intergenic
TGGCACTCTTGGTAGGTTAG+GGG 0.634687 7:-56858321 MsG0780039017.01.T01:CDS
GTGCCACAGCATATCAGTGA+GGG 0.634708 7:+56856668 None:intergenic
GTAACCAATGGACTGTTGAT+GGG 0.634765 7:-56856780 MsG0780039017.01.T01:CDS
GAAATGTGTGGAAAGGCGAA+TGG 0.634942 7:-56856481 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGATACATTCTGGAATGCCG+AGG 0.637670 7:-56858604 MsG0780039017.01.T01:CDS
AAGACAAACAGTGCATATTG+TGG 0.638168 7:-56857065 MsG0780039017.01.T01:CDS
GAAAGGAATAAAGCCAAATG+TGG 0.641924 7:-56857310 MsG0780039017.01.T01:CDS
TATGTCGAAACAAAATGGGA+GGG 0.643664 7:-56858375 MsG0780039017.01.T01:CDS
AATTTGGCCTGCCTTACACA+GGG 0.644541 7:+56857893 None:intergenic
TTGCGCATCGAAGGGCATGT+GGG 0.648600 7:-56857997 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGTTTATAGAGAGTTCAAGA+TGG 0.649322 7:-56857436 MsG0780039017.01.T01:CDS
TGTGTTATAAGTAAACACAT+CGG 0.654472 7:+56857926 None:intergenic
ATAAACGTTCTAGAGACCGT+TGG 0.656702 7:-56858850 MsG0780039017.01.T01:CDS
GGTTTAGGGCATCTTCCAAG+AGG 0.661178 7:+56857772 None:intergenic
GATACATTCTGGAATGCCGA+GGG 0.664045 7:-56858603 MsG0780039017.01.T01:CDS
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TGAACAAATCCACAGCATCA+GGG 0.673747 7:+56858189 None:intergenic
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CATCGGGAACAATACGCCTG+TGG 0.701348 7:+56857943 None:intergenic
CAAACATGCTCACAGTGCTG+CGG 0.703611 7:-56858570 MsG0780039017.01.T01:CDS
ATGCCCTCACTGATATGCTG+TGG 0.706724 7:-56856671 MsG0780039017.01.T01:CDS
TTTCTGGCAGGAGGTCAACG+CGG 0.711932 7:-56858637 MsG0780039017.01.T01:CDS
AATGATGGATGGCTATGCCA+AGG 0.731798 7:-56857799 MsG0780039017.01.T01:CDS
AGTGCCACAGCATATCAGTG+AGG 0.733716 7:+56856667 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! TTTTATTGTTTTCATTTAAT+TGG - Chr7:56858727-56858746 MsG0780039017.01.T01:CDS 10.0%
!! AGAATTTATGAGAATAATTT+GGG - Chr7:56858898-56858917 MsG0780039017.01.T01:CDS 15.0%
!! GAAAACAATAAAAAATTCAT+AGG + Chr7:56858720-56858739 None:intergenic 15.0%
!! CAAATTATATGGTTTGAAAA+TGG + Chr7:56858148-56858167 None:intergenic 20.0%
!! CAGAATTTATGAGAATAATT+TGG - Chr7:56858897-56858916 MsG0780039017.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTTACTTATAACACATATT+TGG - Chr7:56857118-56857137 MsG0780039017.01.T01:CDS 20.0%
!! TACATATGAACATAAGTTAT+GGG - Chr7:56856557-56856576 MsG0780039017.01.T01:intron 20.0%
!! TCAAAATGGATCAAATTATA+TGG + Chr7:56858159-56858178 None:intergenic 20.0%
!! TTACATATGAACATAAGTTA+TGG - Chr7:56856556-56856575 MsG0780039017.01.T01:intron 20.0%
!! TTATTCTCATAAATTCTGAA+AGG + Chr7:56858895-56858914 None:intergenic 20.0%
! ATAGATACACTATGCAAAAA+CGG - Chr7:56857662-56857681 MsG0780039017.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAACTAGCAAATTACTAA+TGG + Chr7:56858417-56858436 None:intergenic 25.0%
! TCATTATGTCGAAACAAAAT+GGG - Chr7:56856658-56856677 MsG0780039017.01.T01:intron 25.0%
! TGTGTTATAAGTAAACACAT+CGG + Chr7:56857114-56857133 None:intergenic 25.0%
! TTCATTATGTCGAAACAAAA+TGG - Chr7:56856657-56856676 MsG0780039017.01.T01:intron 25.0%
!!! GTCTACTATTTTGTTGATTT+TGG + Chr7:56856149-56856168 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGTTGTAGCATTTTAAC+TGG - Chr7:56858790-56858809 MsG0780039017.01.T01:CDS 25.0%
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GAATTGTACGTTATCACATT+AGG + Chr7:56856900-56856919 None:intergenic 30.0%
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GTGTTATAAGTAAACACATC+GGG + Chr7:56857113-56857132 None:intergenic 30.0%
TAGAACGTTTATGAGTACTA+TGG + Chr7:56856179-56856198 None:intergenic 30.0%
TATGATGAAATGATAGCCAA+CGG - Chr7:56856975-56856994 MsG0780039017.01.T01:intron 30.0%
TGAGAATAATTTGGGAAGAT+TGG - Chr7:56858906-56858925 MsG0780039017.01.T01:CDS 30.0%
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TTAACTCCATATTCCAAAGT+TGG + Chr7:56857791-56857810 None:intergenic 30.0%
TTACCTGCAAGCATTTAAAA+TGG + Chr7:56858053-56858072 None:intergenic 30.0%
! TATGTTGCTTATAGCAATGA+TGG - Chr7:56857703-56857722 MsG0780039017.01.T01:CDS 30.0%
! TTATGATTTTCAGCATGTCT+AGG + Chr7:56856117-56856136 None:intergenic 30.0%
! TTGTTTGATAATCAGGTGTA+TGG - Chr7:56858233-56858252 MsG0780039017.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTTTGGAATATGGAGTTAA+TGG - Chr7:56857791-56857810 MsG0780039017.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAGGAGACGATTTTTCAAT+CGG + Chr7:56857839-56857858 None:intergenic 30.0%
!! TTGCATAGTTCTCTTTTTCA+AGG - Chr7:56858654-56858673 MsG0780039017.01.T01:CDS 30.0%
AAGACAAACAGTGCATATTG+TGG - Chr7:56857972-56857991 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
ACAATTCAATCATTGACGCT+GGG - Chr7:56856913-56856932 MsG0780039017.01.T01:intron 35.0%
ACACCTGATTATCAAACAAG+CGG + Chr7:56858232-56858251 None:intergenic 35.0%
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CACTAAAGGTGAAATGTTTC+AGG - Chr7:56857568-56857587 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
CATTTCCTCATACAGGTTTA+GGG + Chr7:56857282-56857301 None:intergenic 35.0%
CTCTATCAAGACAAACAGAT+CGG + Chr7:56857310-56857329 None:intergenic 35.0%
GAAAGGAATAAAGCCAAATG+TGG - Chr7:56857727-56857746 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
GATCCTTACTTCACAAACAT+AGG + Chr7:56858690-56858709 None:intergenic 35.0%
GATTCCTACTAGTGTGTTAT+AGG + Chr7:56857336-56857355 None:intergenic 35.0%
GATTTCATTGAACAGAGTCT+CGG + Chr7:56858309-56858328 None:intergenic 35.0%
GCTATTGAAACACTCCTTAA+CGG - Chr7:56858859-56858878 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
GCTGAAAATGTGACAACATT+TGG + Chr7:56858031-56858050 None:intergenic 35.0%
GCTGAAATGGTTGTAATTGA+AGG - Chr7:56858525-56858544 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
GGGTAAGCACAGTAAAATAA+TGG - Chr7:56858816-56858835 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
GTAGAGTAAGTTAGCGTATT+TGG + Chr7:56857533-56857552 None:intergenic 35.0%
GTTCAATGAAATCATGCGTA+TGG - Chr7:56858316-56858335 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
TACAATTCAATCATTGACGC+TGG - Chr7:56856912-56856931 MsG0780039017.01.T01:intron 35.0%
TATGTCGAAACAAAATGGGA+GGG - Chr7:56856662-56856681 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
TCATTTCCTCATACAGGTTT+AGG + Chr7:56857283-56857302 None:intergenic 35.0%
TGAAGTTAGAAGACTGTTTG+AGG - Chr7:56857484-56857503 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
TGGGTTACAGAGAACAAATA+TGG - Chr7:56858276-56858295 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
TGGTTGAGATGCATCAATTA+TGG + Chr7:56857765-56857784 None:intergenic 35.0%
TTATGTCGAAACAAAATGGG+AGG - Chr7:56856661-56856680 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAAGAGCTAGACTTGAA+GGG - Chr7:56856763-56856782 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAAGAGCTAGACTTGA+AGG - Chr7:56856762-56856781 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTATAGTGCAATGATGGA+TGG - Chr7:56857227-56857246 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
! CACAGTAAAATAATGGGAGA+AGG - Chr7:56858823-56858842 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
! CTTATAGCAATGATGGAGAA+AGG - Chr7:56857710-56857729 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCACTGTGTATTCCTTTT+CGG - Chr7:56856791-56856810 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCAGTGAGGGCATTATAAA+AGG + Chr7:56858360-56858379 None:intergenic 35.0%
!! TTTTTCAATCGGATGGTCAA+TGG + Chr7:56857828-56857847 None:intergenic 35.0%
!!! TGTTCAGCTCATGCATTTTT+TGG + Chr7:56858003-56858022 None:intergenic 35.0%
!!! TTGTAGCATTTTAACTGGCT+GGG - Chr7:56858795-56858814 MsG0780039017.01.T01:CDS 35.0%
AAAGCCCCATCAATAAGCAT+AGG + Chr7:56857857-56857876 None:intergenic 40.0%
AAGACTGTTTGAGGAGATGA+AGG - Chr7:56857493-56857512 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGCGAATTGAAAACTCC+AGG + Chr7:56858968-56858987 None:intergenic 40.0%
AGAGTTCAAGATGGCAAGAT+TGG - Chr7:56857610-56857629 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
ATATTTGGACACCCTGTGTA+AGG - Chr7:56857133-56857152 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
ATTCGCCTTTCCACACATTT+CGG + Chr7:56858557-56858576 None:intergenic 40.0%
CAATTCAATCATTGACGCTG+GGG - Chr7:56856914-56856933 MsG0780039017.01.T01:intron 40.0%
CATCTCTTTGAATACCCTTC+TGG + Chr7:56857177-56857196 None:intergenic 40.0%
CGAATGGTCAATTTCTTGCT+TGG - Chr7:56858572-56858591 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
CGTCTCCTATGCTTATTGAT+GGG - Chr7:56857849-56857868 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
CTGCCTATGTTTGTGAAGTA+AGG - Chr7:56858684-56858703 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTGCAATGGTTCATTCA+TGG - Chr7:56858622-56858641 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGTAAGTAAGCCGATC+TGG + Chr7:56857008-56857027 None:intergenic 40.0%
GCACTATAAGTGACCACATT+TGG + Chr7:56857218-56857237 None:intergenic 40.0%
GCTCGAACATCTTCAAAATC+CGG + Chr7:56857901-56857920 None:intergenic 40.0%
GGAAGGAAGGAAATCAAGAT+TGG - Chr7:56856368-56856387 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
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GGGGAGATTAATCTTGCTTT+AGG - Chr7:56856735-56856754 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
GGTCACTTATAGTGCAATGA+TGG - Chr7:56857223-56857242 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
GTCTCCTATGCTTATTGATG+GGG - Chr7:56857850-56857869 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCCTATAACACACTAGT+AGG - Chr7:56857329-56857348 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TAAAAGGCAGACGAAGTTGA+AGG + Chr7:56858344-56858363 None:intergenic 40.0%
TAAGGCAGGCCAAATTGATT+TGG - Chr7:56857151-56857170 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TATTGAGACGTGCAAAGAGA+TGG - Chr7:56857385-56857404 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TATTGAGTGAAATGCACCAC+AGG - Chr7:56857078-56857097 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TCGTCTCCTATGCTTATTGA+TGG - Chr7:56857848-56857867 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATGTTTCAGGAAGCGA+TGG - Chr7:56857577-56857596 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TGAACAAATCCACAGCATCA+GGG + Chr7:56856851-56856870 None:intergenic 40.0%
TGCAAAGAGATGGAAAGAAG+TGG - Chr7:56857395-56857414 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
TGTTATTGACATCAGAGACG+CGG - Chr7:56858501-56858520 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTACAATGCTCTTTTGTC+CGG - Chr7:56857437-56857456 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
! ATTAGTGCTTTTGGCCGAAA+TGG - Chr7:56856819-56856838 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
! CTTAGCTTTCTGTTCAAAGC+TGG - Chr7:56856501-56856520 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
! TTAGTGCTTTTGGCCGAAAT+GGG - Chr7:56856820-56856839 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! AGATTGGCTCCTGAATTTTC+TGG - Chr7:56856384-56856403 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAAACGTTCTAGAGACCGT+TGG - Chr7:56856187-56856206 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTGGGAAGATTGGTCTCA+TGG - Chr7:56858914-56858933 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAATGGGAGGGTTGATAA+AGG - Chr7:56856672-56856691 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! CAGCCATTTTAAATGCTTGC+AGG - Chr7:56858047-56858066 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! CCAAATTGATTTGGCCAGAA+GGG - Chr7:56857160-56857179 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGACGATTTTTCAATCGGA+TGG + Chr7:56857835-56857854 None:intergenic 40.0%
!! GTAACCAATGGACTGTTGAT+GGG - Chr7:56858257-56858276 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTGTAGCATTTTAACTGGC+TGG - Chr7:56858794-56858813 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGTAGCATTTTAACTGGCTG+GGG - Chr7:56858796-56858815 MsG0780039017.01.T01:CDS 40.0%
AATTTGGCCTGCCTTACACA+GGG + Chr7:56857147-56857166 None:intergenic 45.0%
ACTGATATGCTGTGGCACTT+TGG - Chr7:56858374-56858393 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
AGAGCTAGACTTGAAGGGTA+TGG - Chr7:56856768-56856787 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
AGATGCCCTAAACCTGTATG+AGG - Chr7:56857274-56857293 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
AGATGTCGTCGAAGAGAGTT+TGG - Chr7:56857192-56857211 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
AGCACTAATCATGGCCGAAA+AGG + Chr7:56856808-56856827 None:intergenic 45.0%
AGCAGCAACAACACTTCCAT+TGG + Chr7:56856277-56856296 None:intergenic 45.0%
AGTGCTATGATTGGCACTCT+TGG - Chr7:56856705-56856724 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
ATCTCAACCATCGCCAACTT+TGG - Chr7:56857775-56857794 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGCACTCTTGGTAGGTT+AGG - Chr7:56856714-56856733 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
CCATATTCCAAAGTTGGCGA+TGG + Chr7:56857785-56857804 None:intergenic 45.0%
CCCTTCTGGCCAAATCAATT+TGG + Chr7:56857163-56857182 None:intergenic 45.0%
CCTACTTCAGCAACAGCTAA+AGG + Chr7:56856252-56856271 None:intergenic 45.0%
CCTTTAGCTGTTGCTGAAGT+AGG - Chr7:56856249-56856268 MsG0780039017.01.T01:intron 45.0%
CGGCATTCCAGAATGTATCT+TGG + Chr7:56856433-56856452 None:intergenic 45.0%
CTATGATTGGCACTCTTGGT+AGG - Chr7:56856709-56856728 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
CTGAACAAATCCACAGCATC+AGG + Chr7:56856852-56856871 None:intergenic 45.0%
CTTTCTGTTTGCGCATCGAA+GGG - Chr7:56857032-56857051 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
GAAACACTCCTTAACGGCAT+GGG - Chr7:56858865-56858884 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
GAAATGTGTGGAAAGGCGAA+TGG - Chr7:56858556-56858575 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGAGTTTGGCCAAATG+TGG - Chr7:56857202-56857221 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTGAACGTGACCACATT+TGG + Chr7:56857743-56857762 None:intergenic 45.0%
GATCTGCATCTGATGTCTTG+TGG - Chr7:56858594-56858613 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
GCACTGTGAGCATGTTTGTT+TGG + Chr7:56856465-56856484 None:intergenic 45.0%
GGAGCTTCATTTCCTCATAC+AGG + Chr7:56857289-56857308 None:intergenic 45.0%
GTAACCCATCAACAGTCCAT+TGG + Chr7:56858264-56858283 None:intergenic 45.0%
TATTCCTCCACTTTGCTGGA+AGG - Chr7:56856351-56856370 MsG0780039017.01.T01:intron 45.0%
TGAAACACTCCTTAACGGCA+TGG - Chr7:56858864-56858883 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
TGCATATTCCTCCACTTTGC+TGG - Chr7:56856347-56856366 MsG0780039017.01.T01:intron 45.0%
TGTTTGAGGAGATGAAGGCT+CGG - Chr7:56857498-56857517 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
TTGCAGCGACTGCATCAAAA+TGG + Chr7:56858173-56858192 None:intergenic 45.0%
TTGGCACTCTTGGTAGGTTA+GGG - Chr7:56856715-56856734 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
TTTCCTTCCTTCCAGCAAAG+TGG + Chr7:56856361-56856380 None:intergenic 45.0%
! AATGCTCTTTTGTCCGGGTA+TGG - Chr7:56857443-56857462 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
! AGTAAGGAGTAGTTTGGTGG+AGG + Chr7:56856084-56856103 None:intergenic 45.0%
! CCTACAATGCTCTTTTGTCC+GGG - Chr7:56857438-56857457 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
! CTGATGCTGTGGATTTGTTC+AGG - Chr7:56856850-56856869 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
! GCTCCGCTTGTTTGATAATC+AGG - Chr7:56858226-56858245 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
! GTAAGGAGTAGTTTGGTGGA+GGG + Chr7:56856083-56856102 None:intergenic 45.0%
! TAAAGGTGCAGAGTGTGAGT+TGG + Chr7:56856235-56856254 None:intergenic 45.0%
! TAAGGAGTAGTTTGGTGGAG+GGG + Chr7:56856082-56856101 None:intergenic 45.0%
! TCGGCCATGATTAGTGCTTT+TGG - Chr7:56856810-56856829 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
! TGGGGCTTTTCAGAATAAGC+CGG - Chr7:56857868-56857887 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTTGTTTGGAGTCACCCT+CGG + Chr7:56856453-56856472 None:intergenic 45.0%
!! AATGATGGATGGCTATGCCA+AGG - Chr7:56857238-56857257 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
!! AGATACATTCTGGAATGCCG+AGG - Chr7:56856433-56856452 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
!! CCATCGCCAACTTTGGAATA+TGG - Chr7:56857782-56857801 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
!! CGTAACCAATGGACTGTTGA+TGG - Chr7:56858256-56858275 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
!! GATACATTCTGGAATGCCGA+GGG - Chr7:56856434-56856453 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
!! GCCAAATTGATTTGGCCAGA+AGG - Chr7:56857159-56857178 MsG0780039017.01.T01:CDS 45.0%
!! TCGGCCAAAAGCACTAATCA+TGG + Chr7:56856817-56856836 None:intergenic 45.0%
AAGGTGAACCCATGCCGTTA+AGG + Chr7:56858876-56858895 None:intergenic 50.0%
AGACGCCGAAATGTGTGGAA+AGG - Chr7:56858549-56858568 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
AGTGCCACAGCATATCAGTG+AGG + Chr7:56858373-56858392 None:intergenic 50.0%
ATGCCCTCACTGATATGCTG+TGG - Chr7:56858366-56858385 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
CAAACATGCTCACAGTGCTG+CGG - Chr7:56856467-56856486 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
CAATTTGGCCTGCCTTACAC+AGG + Chr7:56857148-56857167 None:intergenic 50.0%
CAGGTGTATGGCGTAACCAA+TGG - Chr7:56858245-56858264 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
CCAACGGCATAATGCCAGAT+CGG - Chr7:56856991-56857010 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
CCTTCGATGCGCAAACAGAA+AGG + Chr7:56857034-56857053 None:intergenic 50.0%
CCTTTCTGTTTGCGCATCGA+AGG - Chr7:56857031-56857050 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
GACCTCCTGCCAGAAAATTC+AGG + Chr7:56856396-56856415 None:intergenic 50.0%
GCAGGGAGTAAGGAGTAGTT+TGG + Chr7:56856090-56856109 None:intergenic 50.0%
GCCTAGACGATGAAGACCAA+CGG + Chr7:56856206-56856225 None:intergenic 50.0%
GGGAGTAAGGAGTAGTTTGG+TGG + Chr7:56856087-56856106 None:intergenic 50.0%
GTAGGAATCTACGCGAAGCT+CGG - Chr7:56857347-56857366 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
GTGCCACAGCATATCAGTGA+GGG + Chr7:56858372-56858391 None:intergenic 50.0%
GTTCAGGTCCATGAGTAGCT+GGG - Chr7:56856866-56856885 MsG0780039017.01.T01:intron 50.0%
GTTGCTGAAGTAGGTGCCAA+TGG - Chr7:56856258-56856277 MsG0780039017.01.T01:intron 50.0%
TACAACTCCCCAGCTACTCA+TGG + Chr7:56856877-56856896 None:intergenic 50.0%
TACGCGGCCAAGATACATTC+TGG - Chr7:56856423-56856442 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
TATGCTGTGGCACTTTGGTC+AGG - Chr7:56858379-56858398 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
TGGCACTCTTGGTAGGTTAG+GGG - Chr7:56856716-56856735 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
TGTTCAGGTCCATGAGTAGC+TGG - Chr7:56856865-56856884 MsG0780039017.01.T01:intron 50.0%
TTCAGGTCCATGAGTAGCTG+GGG - Chr7:56856867-56856886 MsG0780039017.01.T01:intron 50.0%
! ATCGAAGGGCATGTGGGAAA+TGG - Chr7:56857046-56857065 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
! GGCTTTTCAGAATAAGCCGG+GGG - Chr7:56857871-56857890 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
! GGGCTTTTCAGAATAAGCCG+GGG - Chr7:56857870-56857889 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
! GGGGCTTTTCAGAATAAGCC+GGG - Chr7:56857869-56857888 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
! GGTTTAGGGCATCTTCCAAG+AGG + Chr7:56857268-56857287 None:intergenic 50.0%
! TAGGGCATCTTCCAAGAGGT+TGG + Chr7:56857264-56857283 None:intergenic 50.0%
! TTTTCAGAATAAGCCGGGGG+AGG - Chr7:56857874-56857893 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
!! ACCGTTGGTCTTCATCGTCT+AGG - Chr7:56856202-56856221 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
!! ATCTTCCAAGAGGTTGGCCT+TGG + Chr7:56857258-56857277 None:intergenic 50.0%
!! ATGGAGAAGTGCTGACTGCA+TGG - Chr7:56858933-56858952 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
!! CAGCTTGCTGCAGAAAAAGC+TGG - Chr7:56857920-56857939 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
!! CCCGGACAAAAGAGCATTGT+AGG + Chr7:56857441-56857460 None:intergenic 50.0%
!! CTCCTGAATTTTCTGGCAGG+AGG - Chr7:56856391-56856410 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGCTCCTGAATTTTCTGGC+AGG - Chr7:56856388-56856407 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGTGGTGCTGCTTGTGCAA+TGG - Chr7:56858611-56858630 MsG0780039017.01.T01:CDS 50.0%
AAGGGAGACGCCGAAATGTG+TGG - Chr7:56858544-56858563 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
ACTGCATGGCTGACACAACC+TGG - Chr7:56858947-56858966 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
ATCATTGACGCTGGGGCGAA+AGG - Chr7:56856921-56856940 MsG0780039017.01.T01:intron 55.0%
CAGCATGTCTAGGAGCAGCA+GGG + Chr7:56856107-56856126 None:intergenic 55.0%
CATCGGGAACAATACGCCTG+TGG + Chr7:56857097-56857116 None:intergenic 55.0%
CATGCCATGCTTGCCATACC+CGG + Chr7:56857459-56857478 None:intergenic 55.0%
CCGATCTGGCATTATGCCGT+TGG + Chr7:56856994-56857013 None:intergenic 55.0%
CCTCCACTTTGCTGGAAGGA+AGG - Chr7:56856355-56856374 MsG0780039017.01.T01:intron 55.0%
CCTTCCTTCCAGCAAAGTGG+AGG + Chr7:56856358-56856377 None:intergenic 55.0%
CTATGCCAAGGCCAACCTCT+TGG - Chr7:56857250-56857269 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
TCAGAGACGCGGAGCTGAAA+TGG - Chr7:56858512-56858531 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
TCAGCATGTCTAGGAGCAGC+AGG + Chr7:56856108-56856127 None:intergenic 55.0%
TCATTGACGCTGGGGCGAAA+GGG - Chr7:56856922-56856941 MsG0780039017.01.T01:intron 55.0%
TCTAGGAGCAGCAGGGAGTA+AGG + Chr7:56856100-56856119 None:intergenic 55.0%
TTCAAAATCCGGTCCTCCCC+CGG + Chr7:56857890-56857909 None:intergenic 55.0%
TTGGACACCCTGTGTAAGGC+AGG - Chr7:56857137-56857156 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
TTGTCCGGGTATGGCAAGCA+TGG - Chr7:56857452-56857471 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
! GAGTAGTTTGGTGGAGGGGT+TGG + Chr7:56856078-56856097 None:intergenic 55.0%
! TTGCGCATCGAAGGGCATGT+GGG - Chr7:56857040-56857059 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
! TTTCTGGCAGGAGGTCAACG+CGG - Chr7:56856400-56856419 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
! TTTGCGCATCGAAGGGCATG+TGG - Chr7:56857039-56857058 MsG0780039017.01.T01:CDS 55.0%
!! CATCAGGGAAGCGCCCATTT+CGG + Chr7:56856836-56856855 None:intergenic 55.0%
AGAATAAGCCGGGGGAGGAC+CGG - Chr7:56857879-56857898 MsG0780039017.01.T01:CDS 60.0%
CATTGACGCTGGGGCGAAAG+GGG - Chr7:56856923-56856942 MsG0780039017.01.T01:intron 60.0%
GTTGTTGCTGCTGCAGCTGC+TGG - Chr7:56856285-56856304 MsG0780039017.01.T01:intron 60.0%
CAGGAGGTCAACGCGGTACG+CGG - Chr7:56856407-56856426 MsG0780039017.01.T01:CDS 65.0%
GTTGCTGCTGCAGCTGCTGG+TGG - Chr7:56856288-56856307 MsG0780039017.01.T01:intron 65.0%
TCACAGTGCTGCGGCTGACG+AGG - Chr7:56856476-56856495 MsG0780039017.01.T01:CDS 65.0%
TGGGCGCTTCCCTGATGCTG+TGG - Chr7:56856839-56856858 MsG0780039017.01.T01:CDS 65.0%
!! TGGTGGTGCTGCTGGTGGCA+GGG - Chr7:56856305-56856324 MsG0780039017.01.T01:intron 65.0%
GCTGCTGGTGGCAGGGGCAA+TGG - Chr7:56856312-56856331 MsG0780039017.01.T01:intron 70.0%
!! CTGGTGGTGCTGCTGGTGGC+AGG - Chr7:56856304-56856323 MsG0780039017.01.T01:intron 70.0%
!! GCAGCTGCTGGTGGTGCTGC+TGG - Chr7:56856297-56856316 MsG0780039017.01.T01:intron 70.0%
!! GCTGCTGGTGGTGCTGCTGG+TGG - Chr7:56856300-56856319 MsG0780039017.01.T01:intron 70.0%
!! GGTGGTGCTGCTGGTGGCAG+GGG - Chr7:56856306-56856325 MsG0780039017.01.T01:intron 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 56856063 56858996 56856063 ID=MsG0780039017.01;Name=MsG0780039017.01
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Chr7 exon 56856991 56858996 56856991 ID=MsG0780039017.01.T01:exon:8174;Parent=MsG0780039017.01.T01
Chr7 exon 56856659 56856875 56856659 ID=MsG0780039017.01.T01:exon:8173;Parent=MsG0780039017.01.T01
Chr7 exon 56856359 56856543 56856359 ID=MsG0780039017.01.T01:exon:8172;Parent=MsG0780039017.01.T01
Chr7 exon 56856063 56856258 56856063 ID=MsG0780039017.01.T01:exon:8171;Parent=MsG0780039017.01.T01
Chr7 CDS 56856991 56858996 56856991 ID=MsG0780039017.01.T01:cds;Parent=MsG0780039017.01.T01
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Chr7 CDS 56856063 56856258 56856063 ID=MsG0780039017.01.T01:cds;Parent=MsG0780039017.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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