AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar zhongmu-4 / Msa0079730


Find 269 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 1130 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
chr1_2 gene 57695213 57702891 57695213 ID=Msa0079730;Name=Msa0079730
chr1_2 mRNA 57695213 57702891 57695213 ID=Msa0079730-mRNA-1;Parent=Msa0079730;Name=Msa0079730-mRNA-1;_AED=0.08;_eAED=0.08;_QI=18|1|1|1|0.92|0.85|14|451|968
chr1_2 exon 57695213 57695659 57695213 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18333;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57696440 57696862 57696440 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18334;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57697483 57697598 57697483 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18335;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57697806 57698923 57697806 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18336;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57699322 57699362 57699322 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18337;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57700050 57700118 57700050 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18338;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57700411 57700511 57700411 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18339;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57700650 57700728 57700650 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18340;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57700812 57700910 57700812 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18341;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57701095 57701163 57701095 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18342;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57701273 57701322 57701273 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18343;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57701948 57702124 57701948 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18344;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57702277 57702766 57702277 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18345;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 exon 57702795 57702891 57702795 ID=Msa0079730-mRNA-1:exon:18346;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 five_prime_UTR 57695213 57695230 57695213 ID=Msa0079730-mRNA-1:five_prime_utr;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57695231 57695659 57695231 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57696440 57696862 57696440 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57697483 57697598 57697483 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57697806 57698923 57697806 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57699322 57699362 57699322 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57700050 57700118 57700050 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57700411 57700511 57700411 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57700650 57700728 57700650 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57700812 57700910 57700812 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57701095 57701163 57701095 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57701273 57701322 57701273 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57701948 57702124 57701948 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 CDS 57702277 57702412 57702277 ID=Msa0079730-mRNA-1:cds;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 three_prime_UTR 57702413 57702766 57702413 ID=Msa0079730-mRNA-1:three_prime_utr;Parent=Msa0079730-mRNA-1
chr1_2 three_prime_UTR 57702795 57702891 57702795 ID=Msa0079730-mRNA-1:three_prime_utr;Parent=Msa0079730-mRNA-1
Gene Sequence

>Msa0079730

ATGAAGAACATCTTCAAGAAGCTTCATATAGGTGGCAGTAACAACCACGATCCTAATCGATCCAATGATACTCCGCCACGTGTACCATCGCCAACCGATGACGCTCAGAGTTCCGCCGCCGCCGCTTCTACAGTTACTCCTTCTTCGTCTTCGCCGTCCGCGACTGGAGTTGCTGCTGCTGCTTCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTGTCTGCGATGGTTAATCGGCAGGATTTTTTCTCGTCGGAGGAGGAGTTTCAGGTGCAGTTAGCCCTAGCTATCAGTGCTTCCAATTCAGAGTTTCGTGGTGGTGATGATCCGGAGAAGGATCAGATCCATGCGGCGACCATGCTTAGTTTGGGAGGAAATCGAATTGATTCGACACAGAGTAAGGATGATGTGGCAGAGGCGCTTTCCAGGCAGTATTGGGAATACAATGTGCTTGACTATGAAGAGAAAGTAGTAGATGGTTTTTATGATGTATATGGGCTCTCTAATGACCCGGCAATGCAAGGAAAGATGCCATCTCTAGCAGATCTTGAAGCAAACCCAGGTGGTTCTAGCTTTGAAGTGGTCATAGTTAATCGAACAATCGATCCTGCCCTCGAAGAGCTGGTGCAAATTGCACAATGTATATCATTGGACTGCCCTGTCACCGAGATTGGTATTTTGGTACAAAGGCTTGCTGAACTAGTTACTAGCCATATGGGTGGCCCTGTAAAGGATGCTAATATTATATTGGCAAAATGGACTGAAAGAAGTACACAGTTAAGGATGTCTCTTCACACAAGTGTATTACCTCTTGGGTCCTTAGATATTGGGCTCTCTAGGCACCGTGCTTTACTTTTCAAGATATTAGCAGACAACATTAAAGACAACATTAAGATGCCTTGTAGACTGGTTAAAGGTAGTCATTACACTGGTGTTGAGGATGATGCTGTCAACATTATAAAGTTGGAGGATGAAAGGGAGTTTTTAGTTGATCTCATGGCTGCTCCTGGAACACTCATCCCAGCTGATATTTTAAATGCAAAGGATAATGCTTTTAAGCCTTACAACCCCAAGATTGTGCCGAGTTTGCCTTCCAGTGTGGAAACTGAGCTTTCTTACTCAAAACCTATACTACCATCTAATGGTGAAGGCAGTAGTCAAACTTCTGTGATAAAAGGTCATACACCGTCTTGGAATGGAAAATCGTATACCGAGAAGTCAGAGTATATGCCTTCAAACTTTGGTTTGAGCACAGACGCTGCTGTTGGTCCTTCTAAAATTCCCAATAAAGTCAGTCCTAATCAACGGGAAAATTTGCCACCCTCATATGGTAATTCTCTGTACAAAGGTACTCTTGGAATGAATGCAGTTGGTGATGGGACAAGATTGAATGTCAATGTTGTGCCGTATGCACAGAACACCCACAATGACCCTCAGAACCTTTTTGCAGATCTGAACCCTTTCTTGATAAAAGGGACTGGGAAGCCCTCTGTGCATAACAAACCTGTGGAAAATAAACCTCTTGAGTACGGTACAAAAAACAATACCATTTCTGGTCGACCTGTGTCACCATTGATGTGGAAGAATCGGCATGCCTTCAACGAAGTCCCTAGGAAAACTAATCAGAACCCTAATGAATATAAACCTCCTTTATTTGTTTCCAATATTTCTTCCACATCTGGAAATACTGATCTCAGCACTTCCAATTCATCATACAATTCAAATATAAATAATCATATTAGTTCTCAAACTTCGGCACTAATTACTGGTTCAGTCTCTCCAGCTGGTGTAAGTGAACTGAACCGGACTGAGGGTCTCAATGCTGATTTTAAAAGGGGTGGTTTGGGAAGTTCTCAAAATGTCATGCTAGATGCGGTTAACGAACCCGAAAATACCGAGCTCAGACATCATGACAGGAGGAAGTGCACACATGACAGATTCATGGGAAGCAATTTCCAATTGAAAGATTCAGATAGACCTAGCTCTTCAATCGATTCCATTACAAATAGGGCCGATCAAATATTGGACGATGCAGATGTTGGTGAATGTGAGATTCCATGGGAAGATCTGGTTATTGGTGAAAGAATTGGTCTAGGTTCATATGGCGAGGTCTACCGTGCAGACTGGAATGGCACAGAGGTTGCTGTGAAGAAATTTTTGGATCAGGATTTTTCAGGCGCTGCCTTGTCTGAATTCAAAAGAGAAGTACGGATAATGCGTAGGCTGCGTCATCCAAATGTTGTTCTTTTTATGGGTGCTGTCACCCGGCCGCCCAACCTCTCAATCATTTCAGAGTTTCTCCCAAGAGGAAGCTTGTACCGAATTCTTCATCGGCCAAATTGTCAGATCGATGAGAAACAAAGAATAAAAATGGCTCTGGATGTGGCTAGGGGTATGAATTGCTTGCACGCCAGCACACCTACAATTGTTCACCGAGATCTGAAGTCGCCAAATCTTTTAGTTGATAATAATTGGAATGTTAAGGTATGCGATTTTGGGTTGTCAAGATTGAAGCATAACACATTTTTATCGTCCAAATCAACTGCTGGAACGCCGGAATGGATGGCTCCTGAAGTTCTCCGCAATGAGCCTTCAAATGAAAAGTGTGATGTTTATAGTTTCGGTGTTATCCTATGGGAGCTTGCCACTCTTAGGTTGCCATGGAGTGGAATGAATCCTATGCAAGTTGTTGGCGCCGTAGGTTTCCAAAATCGTCGCCTTGAAATTCCTAAGGAACTTGATCCTTTAGTTGCAAGAATAATCTGGGAATGTTGGCAACAGGATCCAAATTTGCGCCCCTCGTTTGCACAGCTCACAGTGGCTCTTAAGCCCTTGCAGCGTCTGGTTATCCCATCTCATCAGGACCAGGTAGCTTCACCTTTGCCTCAGGAGATTTCTGTAAATTCTACCCCATGA

Protein sequence

>Msa0079730

MKNIFKKLHIGGSNNHDPNRSNDTPPRVPSPTDDAQSSAAAASTVTPSSSSPSATGVAAAASGGGGGGGLSAMVNRQDFFSSEEEFQVQLALAISASNSEFRGGDDPEKDQIHAATMLSLGGNRIDSTQSKDDVAEALSRQYWEYNVLDYEEKVVDGFYDVYGLSNDPAMQGKMPSLADLEANPGGSSFEVVIVNRTIDPALEELVQIAQCISLDCPVTEIGILVQRLAELVTSHMGGPVKDANIILAKWTERSTQLRMSLHTSVLPLGSLDIGLSRHRALLFKILADNIKDNIKMPCRLVKGSHYTGVEDDAVNIIKLEDEREFLVDLMAAPGTLIPADILNAKDNAFKPYNPKIVPSLPSSVETELSYSKPILPSNGEGSSQTSVIKGHTPSWNGKSYTEKSEYMPSNFGLSTDAAVGPSKIPNKVSPNQRENLPPSYGNSLYKGTLGMNAVGDGTRLNVNVVPYAQNTHNDPQNLFADLNPFLIKGTGKPSVHNKPVENKPLEYGTKNNTISGRPVSPLMWKNRHAFNEVPRKTNQNPNEYKPPLFVSNISSTSGNTDLSTSNSSYNSNINNHISSQTSALITGSVSPAGVSELNRTEGLNADFKRGGLGSSQNVMLDAVNEPENTELRHHDRRKCTHDRFMGSNFQLKDSDRPSSSIDSITNRADQILDDADVGECEIPWEDLVIGERIGLGSYGEVYRADWNGTEVAVKKFLDQDFSGAALSEFKREVRIMRRLRHPNVVLFMGAVTRPPNLSIISEFLPRGSLYRILHRPNCQIDEKQRIKMALDVARGMNCLHASTPTIVHRDLKSPNLLVDNNWNVKVCDFGLSRLKHNTFLSSKSTAGTPEWMAPEVLRNEPSNEKCDVYSFGVILWELATLRLPWSGMNPMQVVGAVGFQNRRLEIPKELDPLVARIIWECWQQDPNLRPSFAQLTVALKPLQRLVIPSHQDQVASPLPQEISVNSTP*