AlfalfaGEDB | MS.gene49696

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene49696

KEGG: K20093
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Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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Protein Kinases:

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Co-expression Network:

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PPI:

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Gene1	Gene2	Type
No data available in table

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Showing 1 to 10 of 117 entries

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Query id	Subject id	identity %	alignment length	mismatches	gap openings	q. start	q. end	s. start	s. end	e-value	bit score
MS.gene49696.t1	AT5G63950	69.399	732	215	6	389	1116	353	1079	0.0	1027
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MS.gene49696.t1	AT5G63950	67.350	732	213	7	389	1116	353	1062	0.0	985
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MS.gene49696.t1	AT2G18760	34.974	569	284	9	409	941	381	899	3.78e-97	342
MS.gene49696.t1	AT2G18760	31.485	505	264	12	1163	1618	366	837	3.36e-60	228
MS.gene49696.t1	AT2G18760	34.974	569	284	9	409	941	381	899	3.78e-97	342
MS.gene49696.t1	AT2G18760	31.485	505	264	12	1163	1618	366	837	3.36e-60	228

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Find 338 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
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AAAATACCAAGTCCTTAGGT+GGG	0.616674	4.4:-8146945	MS.gene49696:CDS
AAAATATCTATGCCCCTTTA+AGG	0.111253	4.4:+8160736	None:intergenic
AAAGACAGAGCCAGTTCAGG+AGG	0.565843	4.4:-8152456	MS.gene49696:CDS
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AAAGTCCGTGGAACCTCCTT+TGG	0.357550	4.4:+8162220	None:intergenic
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AAATGATTCGGATCTGGTGT+TGG	0.534372	4.4:-8149093	MS.gene49696:CDS

Showing 1 to 10 of 338 entries

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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