AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280011318.01

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MsG0280011318.01.T03 AT4G09920 27.935 247 127 9 12 248 2 207 5.40e-12 66.2
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MsG0280011318.01.T08 AT3G26922 26.984 252 165 8 4 250 6 243 4.40e-11 63.5
MsG0280011318.01.T08 AT3G26922 26.984 252 165 8 4 250 6 243 4.40e-11 63.5
MsG0280011318.01.T08 AT1G16930 30.588 170 104 4 10 173 13 174 4.65e-11 64.3
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MsG0280011318.01.T08 AT1G16930 30.588 170 104 4 10 173 13 174 4.65e-11 64.3
MsG0280011318.01.T08 AT5G53840 28.652 178 110 6 2 173 8 174 7.67e-11 63.5
MsG0280011318.01.T08 AT5G18780 34.783 138 86 3 8 142 7 143 9.13e-11 63.2
MsG0280011318.01.T08 AT5G18780 34.783 138 86 3 8 142 7 143 9.13e-11 63.2

Find 102 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 728 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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ACCATTATCGGAACCTATTT+TGG 0.124957 2:-82359940 MsG0280011318.01.T01:CDS
CTACTTGCTAGACTTATTTA+TGG 0.150160 2:-82349936 MsG0280011318.01.T01:three_prime_UTR
CCAAAGATTGATCCATCTTT+TGG 0.211511 2:+82360500 None:intergenic
TGTGGTCCTAAGACCATTAT+TGG 0.229420 2:-82353436 MsG0280011318.01.T01:intron
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ATATCCAAGTAACGTGTTAC+TGG 0.356591 2:-82353298 MsG0280011318.01.T01:intron
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CATTGACAGTTGTATTGTTC+AGG 0.365319 2:-82353519 MsG0280011318.01.T01:intron
GTATCTGACCAAACAATATA+TGG 0.367103 2:+82360190 None:intergenic
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ATATAGCTCGAGTCCAAAAT+AGG 0.372153 2:+82359927 None:intergenic
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TCCTTTCATCGCAGTGATGA+TGG 0.413408 2:-82360108 MsG0280011318.01.T01:CDS
CAACATGTTATATGTCGAAA+AGG 0.417252 2:+82353553 None:intergenic
GAAATACATTATCAGAAGAT+TGG 0.426385 2:-82357544 MsG0280011318.01.T01:intron
AAGATACATTATCAGAAGAT+TGG 0.426795 2:-82350015 MsG0280011318.01.T01:three_prime_UTR
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AAAGCAAAGGTTTGAAGACT+TGG 0.430440 2:+82353385 None:intergenic
AAAGCAAAGGTTTGAAGACT+TGG 0.430440 2:+82359901 None:intergenic
CATCGTCAATTCTACTCAAC+TGG 0.430574 2:-82359771 MsG0280011318.01.T01:CDS
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CTCAACTGGTTGGTTGAGCT+TGG 0.448797 2:-82359757 MsG0280011318.01.T01:intron
AGTTCCAGTAACACATTACA+TGG 0.450042 2:+82359809 None:intergenic
ATAATCATTTGGAATAGGCT+TGG 0.461556 2:+82360333 None:intergenic
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CGGTGAACACAAGAAGATGT+TGG 0.485611 2:-82357588 MsG0280011318.01.T01:intron
AAAGACAAGCTGGTTAATGC+TGG 0.490306 2:+82360141 None:intergenic
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GGTGAACACAAGAAGATGTT+GGG 0.524795 2:-82357587 MsG0280011318.01.T01:intron
AACATCGAATCATTCTCTCT+TGG 0.530271 2:-82359733 MsG0280011318.01.T01:intron
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GATCCTATAACATTCTCACT+TGG 0.570010 2:-82357438 MsG0280011318.01.T01:intron
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TTACTGGAACTCGAAGGCAA+AGG 0.659849 2:-82353282 MsG0280011318.01.T01:intron
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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TCAAATAGGAAAACATCCAA+AGG + Chr2:82352711-82352730 None:intergenic 30.0%
TCCAAAATAGGTTCCAATAA+TGG + Chr2:82357065-82357084 None:intergenic 30.0%
TCTGGTTACCATATATTGTT+TGG - Chr2:82350287-82350306 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
TGAAACAGATAGCAATACTT+TGG + Chr2:82353668-82353687 None:intergenic 30.0%
TGAATTACATCGAACTAAAG+GGG + Chr2:82358345-82358364 None:intergenic 30.0%
TGTGTTTATTAGTTGAAAGG+AGG + Chr2:82355151-82355170 None:intergenic 30.0%
TTAACGTCTCTTAATCTTTC+TGG - Chr2:82350269-82350288 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
TTGAACAATTCTACTTCTTG+AGG + Chr2:82353899-82353918 None:intergenic 30.0%
TTGACATCCTACGTTTATAA+AGG - Chr2:82351024-82351043 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
TTTATCTAACAACTGACCTA+TGG - Chr2:82354241-82354260 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
TTTATTGATCGTTGGCAATT+TGG - Chr2:82352064-82352083 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! AAAGTACTTTAAAGACAAGC+TGG + Chr2:82350357-82350376 None:intergenic 30.0%
! AAGTTGATCTTACACTAGAA+AGG - Chr2:82352516-82352535 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! AATAAAAAAAATGATGGGGG+GGG + Chr2:82355306-82355325 None:intergenic 30.0%
! ACCATTATTGGAACCTATTT+TGG - Chr2:82357061-82357080 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! ACTTCAAGTTAAACAAAGAC+GGG + Chr2:82357439-82357458 None:intergenic 30.0%
! AGACTTATGGAACTTAGTTT+TGG - Chr2:82360589-82360608 MsG0280011318.01.T01:CDS 30.0%
! ATAAAGTTATGGGGAGATTT+TGG + Chr2:82351355-82351374 None:intergenic 30.0%
! ATAATCATTTGGAATAGGCT+TGG + Chr2:82350155-82350174 None:intergenic 30.0%
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! GACTTCAAGTTAAACAAAGA+CGG + Chr2:82357440-82357459 None:intergenic 30.0%
! GCAAATTTTATGGCATGTTA+TGG + Chr2:82354452-82354471 None:intergenic 30.0%
! GCTGGCAAATTCAAAAATTT+TGG + Chr2:82350329-82350348 None:intergenic 30.0%
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! TACATTTTCCAAAATGGCTT+GGG + Chr2:82359954-82359973 None:intergenic 30.0%
! TATAAACTTTGGAAGAAGAC+TGG - Chr2:82357979-82357998 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! TATTACCCTCTTGAGTTTTT+CGG - Chr2:82351213-82351232 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! TCTAATTGGTTTCTTTATGG+GGG + Chr2:82352283-82352302 None:intergenic 30.0%
! TGAAAAGCAAAAACGGTTTT+TGG + Chr2:82356282-82356301 None:intergenic 30.0%
! TGTTGACTACTCATATTACT+TGG - Chr2:82350127-82350146 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! TTATTGAAGATGTTGACTGA+AGG - Chr2:82351658-82351677 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! TTCATTTTACTTGTGTTGGA+CGG - Chr2:82358905-82358924 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
! TTCTTGCTTGCAAAAAGTTT+TGG + Chr2:82350626-82350645 None:intergenic 30.0%
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! TTTACGTTACCTCTATTTTG+CGG + Chr2:82358130-82358149 None:intergenic 30.0%
! TTTTGGGCTTCATATTTTTC+CGG - Chr2:82359771-82359790 MsG0280011318.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGTCTAACACAAGACAT+GGG + Chr2:82359240-82359259 None:intergenic 30.0%
!! AAACCTAGATTTGGAGTTTT+CGG + Chr2:82356192-82356211 None:intergenic 30.0%
!! AACTGTGTTTTATTGATCGT+TGG - Chr2:82352056-82352075 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! AGTTTGAATTAACTTGTAGC+TGG - Chr2:82358694-82358713 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! ATATGTGTTTTATTGATCGC+TGG - Chr2:82359624-82359643 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! ATCTGCTTTGATTTTCTGTT+TGG - Chr2:82351613-82351632 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! CTAGTAACACTACTTTGTTT+TGG + Chr2:82354190-82354209 None:intergenic 30.0%
!! CTTAGTTCGTAATTTGTTGA+AGG - Chr2:82350892-82350911 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! GTCTTGTTTGAGTTTGTTTA+AGG - Chr2:82352773-82352792 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! TAATTTGAGTCCCTTTTTCA+AGG - Chr2:82351912-82351931 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! TGATGTTGACTCATATTACT+TGG - Chr2:82356633-82356652 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!! TTAAACAAGAGGTTGTTTCT+AGG - Chr2:82358263-82358282 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!!! AACGGTTTTTGGTTTTAACA+AGG + Chr2:82356271-82356290 None:intergenic 30.0%
!!! AATTTGAGTCCCTTTTTCAA+GGG - Chr2:82351913-82351932 MsG0280011318.01.T01:intron 30.0%
!!! ACGGTTTTTGGTTTTAACAA+GGG + Chr2:82356270-82356289 None:intergenic 30.0%
!!! GCAAAAAGTTTTGGAGTATA+AGG + Chr2:82350617-82350636 None:intergenic 30.0%
!!! GCAGGCAAATTCAAATTTTT+TGG + Chr2:82356850-82356869 None:intergenic 30.0%
!!! GTGTTTTTTCAATTGAAACC+AGG - Chr2:82360375-82360394 MsG0280011318.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTAAAGTAAGGGTTTCGT+AGG + Chr2:82352034-82352053 None:intergenic 30.0%
AAAGCAAAGGTTTGAAGACT+TGG + Chr2:82350587-82350606 None:intergenic 35.0%
AACAGATAGCAATACTTTGG+TGG + Chr2:82353665-82353684 None:intergenic 35.0%
AACATCGAATCATTCTCTCT+TGG - Chr2:82350752-82350771 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
AATGTACTGTAAAGACAAGC+TGG + Chr2:82356878-82356897 None:intergenic 35.0%
AGAACGGTTAGAAATAGAGA+TGG + Chr2:82351869-82351888 None:intergenic 35.0%
AGCAAAAATAGACACTTCAG+AGG - Chr2:82354600-82354619 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
AGCCAAAATTGAGATGGTTT+AGG + Chr2:82355033-82355052 None:intergenic 35.0%
AGGAAAGAACCTAAGCAATA+AGG + Chr2:82357388-82357407 None:intergenic 35.0%
AGTTCCAGTAACACATTACA+TGG + Chr2:82350679-82350698 None:intergenic 35.0%
ATAAGGACCAGTAAAAGCAA+AGG + Chr2:82350600-82350619 None:intergenic 35.0%
ATAGTGATTCTTCTTAGTGG+CGG + Chr2:82355061-82355080 None:intergenic 35.0%
ATATAGCTCGAGTCCAAAAT+AGG + Chr2:82350561-82350580 None:intergenic 35.0%
ATATCCAAGTAACGTGTTAC+TGG - Chr2:82357187-82357206 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
ATGTGTTAAGAGCAATTTGC+AGG + Chr2:82351754-82351773 None:intergenic 35.0%
ATTAGCATATGAATCGGTGA+TGG - Chr2:82353174-82353193 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
ATTCTACTTCTTGAGGATGA+AGG + Chr2:82353892-82353911 None:intergenic 35.0%
ATTGTACTTTGTCAGAGAGA+AGG - Chr2:82358518-82358537 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CAAAATTGAGATGGTTTAGG+CGG + Chr2:82355030-82355049 None:intergenic 35.0%
CAAACTTAAATAGGAGGGTT+TGG + Chr2:82359979-82359998 None:intergenic 35.0%
CAAATATGTGTAGGTAACCT+TGG - Chr2:82357696-82357715 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CAAGGAACATATATGTTTGC+AGG - Chr2:82352345-82352364 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CACCGGTAATCATATCAAAA+AGG - Chr2:82355941-82355960 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CATGTCTTGTGTTAGACAAA+AGG - Chr2:82359239-82359258 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CATTATCTTCCTGATTGCTT+AGG - Chr2:82350862-82350881 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CATTGACAGTTGTATAGTTC+AGG - Chr2:82350448-82350467 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CATTGACAGTTGTATTGTTC+AGG - Chr2:82356966-82356985 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CATTGGGAAAATTTATGCAC+AGG + Chr2:82358835-82358854 None:intergenic 35.0%
CCAAAAGATGGATCAATCTT+TGG - Chr2:82349985-82350004 MsG0280011318.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
CGAAAGGACTCAACATTAAT+TGG + Chr2:82359481-82359500 None:intergenic 35.0%
CTAAATTTGAAAGTTGTGGC+AGG + Chr2:82358013-82358032 None:intergenic 35.0%
CTAAGTTCCATAAGTCTACA+TGG + Chr2:82360586-82360605 None:intergenic 35.0%
CTTACAATTCCGCAAAATAG+AGG - Chr2:82358118-82358137 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CTTAGTTCGCGATTTATTGA+AGG - Chr2:82357406-82357425 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
CTTCAATAAATCGCGAACTA+AGG + Chr2:82357408-82357427 None:intergenic 35.0%
CTTGATGTTATATGCATGAC+TGG - Chr2:82355462-82355481 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
GAAATCAAGCTTGATTAGGA+GGG + Chr2:82352412-82352431 None:intergenic 35.0%
GAAGACTTAGAATGGTGTTT+GGG - Chr2:82359577-82359596 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
GAAGATAGCCAAAATTGAGA+TGG + Chr2:82355039-82355058 None:intergenic 35.0%
GAAGGAAATCAAGCTTGATT+AGG + Chr2:82352416-82352435 None:intergenic 35.0%
GAATTACATCGAACTAAAGG+GGG + Chr2:82358344-82358363 None:intergenic 35.0%
GAATTCGTTGAAACTTTCGT+CGG + Chr2:82350054-82350073 None:intergenic 35.0%
GAGAGTTAGAACCATTCATA+TGG + Chr2:82359459-82359478 None:intergenic 35.0%
GAGCAATTTGCAAGTAACAT+AGG + Chr2:82359325-82359344 None:intergenic 35.0%
GATCCTATAACATTCTCACT+TGG - Chr2:82353047-82353066 MsG0280011318.01.T01:CDS 35.0%
GCTTGGTATTTGATATGCAA+AGG + Chr2:82350484-82350503 None:intergenic 35.0%
GGAAAGGTAATACAAGTTCT+TGG - Chr2:82352814-82352833 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
GGACAAAATGCAAGTTTGAA+CGG + Chr2:82349967-82349986 None:intergenic 35.0%
GGACAATGCATATATATGCA+AGG + Chr2:82355713-82355732 None:intergenic 35.0%
GGTACCTCATGAAAAATATG+GGG - Chr2:82353476-82353495 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
GGTGAAATGATACTGCTATT+TGG - Chr2:82358940-82358959 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
GTACCTCATGAAAAATATGG+GGG - Chr2:82353477-82353496 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
GTATCAGTTTACTCATTTGG+CGG + Chr2:82354369-82354388 None:intergenic 35.0%
GTATCGGACCAAACAATATA+TGG + Chr2:82356804-82356823 None:intergenic 35.0%
GTGGGAAACATAAACAAAGA+AGG + Chr2:82351111-82351130 None:intergenic 35.0%
TAACATCAAGTCTAGACTGT+CGG + Chr2:82355452-82355471 None:intergenic 35.0%
TACGATACGATATGGTACAA+CGG - Chr2:82353282-82353301 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TACTTTGTGCTTGGACTATA+TGG + Chr2:82354304-82354323 None:intergenic 35.0%
TAGGTTCCAATAATGGTCTT+AGG + Chr2:82357058-82357077 None:intergenic 35.0%
TATAGGACCAGTAAAAGCAA+AGG + Chr2:82357116-82357135 None:intergenic 35.0%
TATCAGTTTACTCATTTGGC+GGG + Chr2:82354368-82354387 None:intergenic 35.0%
TATGATGTCAACTTTGTCGA+GGG + Chr2:82357531-82357550 None:intergenic 35.0%
TCACCAAGTGAGAATGTTAT+AGG + Chr2:82353053-82353072 None:intergenic 35.0%
TCATCTAAACCTCAAAAGAG+TGG - Chr2:82357485-82357504 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TCATGATTGTGTCTTTCGAA+AGG + Chr2:82354988-82355007 None:intergenic 35.0%
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TCTCTCTTGGTATACTCTTA+AGG - Chr2:82350765-82350784 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TCTTCTGCAAAACCTAGATT+TGG + Chr2:82356201-82356220 None:intergenic 35.0%
TGACATGAAAAGAAGCAAGA+GGG + Chr2:82350245-82350264 None:intergenic 35.0%
TGAGGTTTAGATGAATGCAT+GGG + Chr2:82357479-82357498 None:intergenic 35.0%
TGCATATATATGCAAGGTTC+GGG + Chr2:82355707-82355726 None:intergenic 35.0%
TGCTTCTTATTCCTTCTTAC+TGG - Chr2:82351589-82351608 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TGGTGTGATGCATTGTTAAT+AGG - Chr2:82359687-82359706 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TGTAATATTAGGGGTTTCCT+AGG + Chr2:82354098-82354117 None:intergenic 35.0%
TGTATCGGACCAATTTGTAT+CGG + Chr2:82356820-82356839 None:intergenic 35.0%
TGTGATCCTAAGACCATTAT+CGG - Chr2:82350533-82350552 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTAACACTGACATGTAACCA+CGG + Chr2:82352321-82352340 None:intergenic 35.0%
TTAATGTTGAGTCCTTTCGA+AGG - Chr2:82359482-82359501 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTCAGTCACTCTTTATGCTT+TGG - Chr2:82352213-82352232 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTCTATTTCCCATGATGTCT+TGG - Chr2:82357622-82357641 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTGAGGTTTAGATGAATGCA+TGG + Chr2:82357480-82357499 None:intergenic 35.0%
TTGCAAGTAACATAGGTGAA+TGG + Chr2:82359318-82359337 None:intergenic 35.0%
TTGTATTCAGCTCCTGTTAA+TGG - Chr2:82359172-82359191 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTGTGTATTTGGGTCTCTAT+AGG + Chr2:82355518-82355537 None:intergenic 35.0%
TTGTTTCAGATTCATGGAAG+TGG + Chr2:82354736-82354755 None:intergenic 35.0%
TTGTTTGGTCCGATACAAAT+TGG - Chr2:82356808-82356827 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTTATTGATCGCTGGCAATT+CGG - Chr2:82359632-82359651 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
TTTGTCTAACACAAGACATG+GGG + Chr2:82359239-82359258 None:intergenic 35.0%
TTTGTCTAACACAAGTGCAT+GGG + Chr2:82351528-82351547 None:intergenic 35.0%
! AAGTGTTGTCAAGTGATTGA+AGG + Chr2:82358303-82358322 None:intergenic 35.0%
! AATAGGAGATTAAAAAGCGC+AGG - Chr2:82359704-82359723 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
! AATCAAGGGTACAAAGTATG+AGG - Chr2:82353455-82353474 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
! ACCATTATCGGAACCTATTT+TGG - Chr2:82350545-82350564 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
! ACTTCAAGTTACACAAGGAA+AGG + Chr2:82350925-82350944 None:intergenic 35.0%
! AGCGCATTATTGAAAAGCAT+TGG + Chr2:82358869-82358888 None:intergenic 35.0%
! ATAAAAAAAATGATGGGGGG+GGG + Chr2:82355305-82355324 None:intergenic 35.0%
! ATCCTAGTCGTCTGATTTTT+GGG + Chr2:82355490-82355509 None:intergenic 35.0%
! CAATTTTTATCACTTCGCGA+TGG - Chr2:82350080-82350099 MsG0280011318.01.T01:CDS 35.0%
! CATTTTCGTTCGTTGTACTT+AGG + Chr2:82356381-82356400 None:intergenic 35.0%
! CCAAAGATTGATCCATCTTT+TGG + Chr2:82349988-82350007 None:intergenic 35.0%
! CTTGCATTTTGTCCAAAAGA+TGG - Chr2:82349973-82349992 MsG0280011318.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! CTTTTGTCTAACACAAGACA+TGG + Chr2:82359241-82359260 None:intergenic 35.0%
! GAGGTACCTCATGAAAAATA+TGG - Chr2:82353474-82353493 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
! GGTTTTGCAGAAGATTTGAA+AGG - Chr2:82356207-82356226 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
! TAGTTGAAAGGAGGAGTTTT+TGG + Chr2:82355142-82355161 None:intergenic 35.0%
! TAGTTTGGTTACTTTGTGCT+TGG + Chr2:82354313-82354332 None:intergenic 35.0%
! TCAAAAAGTCCACTCTTTTG+AGG + Chr2:82357497-82357516 None:intergenic 35.0%
! TCGGTTCATTTTACTTGTGT+TGG - Chr2:82358901-82358920 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
! TCTCCTCCACATTTTCTAAT+TGG + Chr2:82352297-82352316 None:intergenic 35.0%
! TGAGTTTAGCTTAGTTGGTA+GGG + Chr2:82355734-82355753 None:intergenic 35.0%
! TTTTATAGTCAGGGTTTCAG+AGG + Chr2:82359604-82359623 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTCTAACACAAGTGCA+TGG + Chr2:82351529-82351548 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTTCTCATAAGGAGCA+TGG + Chr2:82355230-82355249 None:intergenic 35.0%
!! AACCTAGATTTGGAGTTTTC+GGG + Chr2:82356191-82356210 None:intergenic 35.0%
!! AAGTTGGTCTTACACAAGAA+AGG - Chr2:82360022-82360041 MsG0280011318.01.T01:CDS 35.0%
!! ATACAAGTTCTTGGCCTTAA+TGG - Chr2:82352823-82352842 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
!! CTTCAAACCTTTGCTTTTAC+TGG - Chr2:82350590-82350609 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
!! GATTCATTTGTTTTCCCCTT+TGG - Chr2:82352692-82352711 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
!! GGAAAATTACGTGGATTAGT+TGG + Chr2:82355258-82355277 None:intergenic 35.0%
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!!! AAGTGTCTATTTTTGCTTGG+AGG + Chr2:82354597-82354616 None:intergenic 35.0%
!!! ATGCGCTCATAGTGTTTTTT+CGG - Chr2:82358882-82358901 MsG0280011318.01.T01:intron 35.0%
!!! CTGAAGTGTCTATTTTTGCT+TGG + Chr2:82354600-82354619 None:intergenic 35.0%
AAAAATATGGGGGCTAGGAT+GGG - Chr2:82353487-82353506 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
AAAAGAAGCAAGAGGGAAAG+AGG + Chr2:82350238-82350257 None:intergenic 40.0%
AAACAGCCTCTTGTGTAACA+TGG - Chr2:82357773-82357792 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
AAAGACAAGCTGGTTAATGC+AGG + Chr2:82350347-82350366 None:intergenic 40.0%
AAAGACAAGCTGGTTAATGC+TGG + Chr2:82350347-82350366 None:intergenic 40.0%
AACAAACGACACTGCATAGT+CGG - Chr2:82353558-82353577 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
AACACTTTACTGTTGCTCCA+AGG - Chr2:82358316-82358335 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
AACATCAAGTCTAGACTGTC+GGG + Chr2:82355451-82355470 None:intergenic 40.0%
AACGAACCGAAAAACTCAAG+AGG + Chr2:82351222-82351241 None:intergenic 40.0%
AATTTGAAAGTTGTGGCAGG+AGG + Chr2:82358010-82358029 None:intergenic 40.0%
ACATCACACATAAGAGTGAC+CGG + Chr2:82359793-82359812 None:intergenic 40.0%
ACCATCATCACTACGATGAA+AGG + Chr2:82356902-82356921 None:intergenic 40.0%
ACGAACCGAAAAACTCAAGA+GGG + Chr2:82351221-82351240 None:intergenic 40.0%
AGATGGAAGAGCAATGAATG+AGG + Chr2:82351852-82351871 None:intergenic 40.0%
AGCATACGAAACGAAAGTGA+AGG + Chr2:82352434-82352453 None:intergenic 40.0%
AGGAAAGAACCTAAGCAATC+AGG + Chr2:82350874-82350893 None:intergenic 40.0%
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ATTTCTAACCGTTCTCCCTA+CGG - Chr2:82351874-82351893 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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CAAATGTTACGTAGTGCATG+TGG - Chr2:82353686-82353705 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
CAACTAAGCTAAACTCACGA+GGG - Chr2:82355737-82355756 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
CACATATTTAAAGGGCAACC+CGG + Chr2:82357870-82357889 None:intergenic 40.0%
CATCGTCAATTCTACTCAAC+TGG - Chr2:82350714-82350733 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
CATCTTGAATGACACGACAA+GGG - Chr2:82358789-82358808 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
CATGTCAGTGTTAACTGTCA+AGG - Chr2:82352327-82352346 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
CGTACAATACACCAAATGGT+GGG - Chr2:82357804-82357823 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
CGTACAATACACCAAATGGT+GGG + Chr2:82357823-82357804 None:intergenic 40.0%
CTTGAGGATGAAGGTAATGA+GGG + Chr2:82353883-82353902 None:intergenic 40.0%
CTTGGAGGTTATTGCAGAAT+CGG + Chr2:82354582-82354601 None:intergenic 40.0%
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GAAGGCTTAGAATGGTGTTT+GGG - Chr2:82352007-82352026 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
GACAATGGCGAGACATAATA+AGG - Chr2:82349860-82349879 MsG0280011318.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GATGGAAGAGCAATGAATGA+GGG + Chr2:82351851-82351870 None:intergenic 40.0%
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GCACAAAGAAAGATCGAAGA+TGG + Chr2:82359667-82359686 None:intergenic 40.0%
GCCACTAAGAAGAATCACTA+TGG - Chr2:82355060-82355079 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
GCCATAGTGATTCTTCTTAG+TGG + Chr2:82355064-82355083 None:intergenic 40.0%
GCTTGGTACTTGATATGCAA+AGG + Chr2:82357001-82357020 None:intergenic 40.0%
GGAAATCAAGCTTGATTAGG+AGG + Chr2:82352413-82352432 None:intergenic 40.0%
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GTTGTTGTCATGTGACTGAA+AGG - Chr2:82357732-82357751 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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TATGTTTCCCACGATGTCTT+TGG - Chr2:82351119-82351138 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
TATTCCAAGAAGCCTTCGAA+AGG + Chr2:82359497-82359516 None:intergenic 40.0%
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TCTTCGATCTTTCTTTGTGC+TGG - Chr2:82359667-82359686 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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TGTGGTCCTAAGACCATTAT+TGG - Chr2:82357049-82357068 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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TTCGAAGGCTTCTTGGAATA+TGG - Chr2:82359497-82359516 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
TTGATATGATTACCGGTGTC+TGG + Chr2:82355939-82355958 None:intergenic 40.0%
TTGGGAATATGTGGCAGTAA+GGG - Chr2:82351939-82351958 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
TTGTCAGAGAGAAGGTTCTT+AGG - Chr2:82358526-82358545 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
TTTGCAGGTAGACAAACAGA+GGG + Chr2:82351328-82351347 None:intergenic 40.0%
TTTGGGAGGATGATATGTCA+GGG + Chr2:82354798-82354817 None:intergenic 40.0%
! AAGAAGGAAAGAGCATAGAC+AGG - Chr2:82355369-82355388 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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! AATGTGTTACTGGAACTCGA+AGG - Chr2:82350682-82350701 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
! AGGTCAAATCTTTTGGATCG+CGG + Chr2:82354550-82354569 None:intergenic 40.0%
! ATACTTTGAAGGTTGACGAG+AGG - Chr2:82358567-82358586 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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! CGCCTAAACCATCTCAATTT+TGG - Chr2:82355028-82355047 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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! GTCCTTTTTGAACGCAAAAG+AGG - Chr2:82356450-82356469 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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! TAGCCCCCATATTTTTCATG+AGG + Chr2:82353483-82353502 None:intergenic 40.0%
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!!! AAGGAGGAGTTTTTGGCATA+GGG + Chr2:82355135-82355154 None:intergenic 40.0%
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!!! GGTCATTTTTTCCACTTCTC+TGG - Chr2:82356098-82356117 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
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!!! TTGGCTTTTTGTTTTCTCCG+TGG - Chr2:82358959-82358978 MsG0280011318.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTGTTTTGGCGTTACTTCG+TGG + Chr2:82354177-82354196 None:intergenic 40.0%
AATCAGGGAGTAAGAACCGT+AGG + Chr2:82351893-82351912 None:intergenic 45.0%
ACAAACGACACTGCATAGTC+GGG - Chr2:82353559-82353578 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
ACCATCATCACTGCGATGAA+AGG + Chr2:82350381-82350400 None:intergenic 45.0%
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AGGAAAATCTCCCAAGCACA+AGG - Chr2:82354068-82354087 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
AGTAAGAACCGTAGGGAGAA+CGG + Chr2:82351885-82351904 None:intergenic 45.0%
ATATGATTACCGGTGTCTGG+GGG + Chr2:82355936-82355955 None:intergenic 45.0%
ATCAGGGAGTAAGAACCGTA+GGG + Chr2:82351892-82351911 None:intergenic 45.0%
CAAGCTTGATTAGGAGGGTT+TGG + Chr2:82352407-82352426 None:intergenic 45.0%
CAAGGGTTCTTGGGAATATG+TGG - Chr2:82351930-82351949 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
CAATTTGCAGGCAACAAAGG+TGG + Chr2:82351742-82351761 None:intergenic 45.0%
CATAGACAGGTAGAGAGGTT+AGG - Chr2:82355382-82355401 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
CCAACTAAGCTAAACTCACG+AGG - Chr2:82355736-82355755 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
CGGTGAACACAAGAAGATGT+TGG - Chr2:82352897-82352916 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
CTCCCAAAAATCAGACGACT+AGG - Chr2:82355485-82355504 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
CTGGTGTGATGCATTGTAAG+AGG - Chr2:82352118-82352137 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
CTTGGGAATATGTGGCAGTA+AGG - Chr2:82351938-82351957 MsG0280011318.01.T01:intron 45.0%
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