AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035779.01

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MsG0680035779.01.T01 AT2G33170 33.645 214 115 3 3 190 491 703 6.60e-18 88.6
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MsG0680035779.01.T01 AT3G49670 33.333 369 238 4 65 425 80 448 1.10e-45 174
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MsG0680035779.01.T01 AT5G65240 29.255 376 227 9 253 605 72 431 3.16e-30 126
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MsG0680035779.01.T01 AT2G35620 40.625 128 62 1 478 605 334 447 3.55e-24 107
MsG0680035779.01.T01 AT2G35620 40.625 128 62 1 478 605 334 447 3.55e-24 107
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MsG0680035779.01.T01 AT1G12460 32.500 120 77 1 486 605 493 608 1.21e-14 77.8
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MsG0680035779.01.T01 AT5G01950 28.214 280 190 7 76 347 76 352 3.80e-19 92.0
MsG0680035779.01.T01 AT5G01950 29.213 178 97 3 279 427 112 289 3.14e-13 73.2
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MsG0680035779.01.T01 AT5G01950 44.000 125 52 4 486 605 664 775 2.24e-21 99.8
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MsG0680035779.01.T01 AT2G42960 43.802 121 55 3 486 605 221 329 3.63e-23 103
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MsG0680035779.01.T01 AT1G56720 40.833 120 60 1 486 605 217 325 3.99e-23 103
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MsG0680035779.01.T01 AT2G18470 40.000 120 59 1 486 605 322 428 7.68e-23 103
MsG0680035779.01.T01 AT1G61500 40.833 120 59 1 486 605 529 636 8.06e-23 103
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MsG0680035779.01.T01 AT1G51830 39.695 131 67 1 475 605 413 531 3.03e-22 102
MsG0680035779.01.T01 AT2G14510 29.231 325 180 6 309 605 405 707 3.06e-22 102
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MsG0680035779.01.T01 AT1G51890 41.176 119 58 1 487 605 336 442 3.21e-22 101
MsG0680035779.01.T01 AT2G14510 29.231 325 180 6 309 605 413 715 3.25e-22 102
MsG0680035779.01.T01 AT1G51830 39.695 131 67 1 475 605 420 538 3.27e-22 101
MsG0680035779.01.T01 AT1G56130 44.444 117 52 1 489 605 587 690 3.30e-22 102
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MsG0680035779.01.T01 AT2G13790 35.556 135 83 3 106 239 79 210 3.14e-12 70.1
MsG0680035779.01.T01 AT2G13790 39.831 118 68 2 327 441 87 204 1.30e-11 68.2
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MsG0680035779.01.T01 AT4G23270 39.310 145 73 2 464 605 339 471 1.34e-21 99.8
MsG0680035779.01.T01 AT1G29720 40.336 119 58 1 487 605 712 817 1.63e-21 100
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MsG0680035779.01.T01 AT2G19780 31.878 229 123 4 4 228 132 331 6.09e-20 92.8
MsG0680035779.01.T01 AT2G19780 27.907 215 147 5 217 425 105 317 2.03e-14 75.9
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MsG0680035779.01.T01 AT5G37450 43.333 120 55 1 486 605 645 751 2.07e-21 99.8
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MsG0680035779.01.T01 AT1G34210 35.714 112 71 1 106 216 76 187 1.10e-11 68.2
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MsG0680035779.01.T01 AT5G15730 38.333 120 62 1 486 605 152 259 3.56e-21 97.1
MsG0680035779.01.T01 AT1G51805 42.017 119 57 1 487 605 592 698 3.59e-21 99.0
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MsG0680035779.01.T01 AT4G00960 38.333 120 62 1 488 607 96 203 3.91e-21 94.4
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MsG0680035779.01.T01 AT1G61490 38.333 120 62 1 486 605 528 635 3.96e-21 98.6

Find 96 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 132 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GTCTTTATGAACAACTTATC+AGG 0.334630 6:+112141088 MsG0680035779.01.T01:CDS
CACCTTCAATTTACTCAACT+TGG 0.338780 6:-112140702 None:intergenic
ATTTCACAAAACGGGTTGAC+TGG 0.342401 6:+112140803 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTAGAAGAATGTTGCTTTCG+AGG 0.348601 6:+112140861 MsG0680035779.01.T01:CDS
AGATCGAGAACTGTGATTCT+TGG 0.348619 6:-112141863 None:intergenic
TTCCATGATATTACATCAAA+TGG 0.349962 6:-112141707 None:intergenic
ACCATATCTCCCATTGATTC+AGG 0.351637 6:-112140761 None:intergenic
CTATCATCCAATCGTTTAAC+AGG 0.358891 6:+112141884 MsG0680035779.01.T01:CDS
ACTTTGGAGAGCTGAAAATT+TGG 0.367983 6:+112141433 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTCATCATGTCATTCTTGAT+TGG 0.375693 6:+112142533 MsG0680035779.01.T01:CDS
GCCTGAATCAATGGGAGATA+TGG 0.375866 6:+112140760 MsG0680035779.01.T01:CDS
TGGAAATTGTAGTAGCTTGT+TGG 0.375879 6:+112141364 MsG0680035779.01.T01:CDS
CCAGAGAATTTGTGCTATCA+TGG 0.386526 6:+112141281 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTGCAAGTTTGTCTGTTTGA+TGG 0.394924 6:+112140584 MsG0680035779.01.T01:CDS
TGCAGCTTTCCAAAATCATC+TGG 0.398102 6:-112140974 None:intergenic
GTAAAATTCCTAGTGGACTT+TGG 0.406907 6:+112141417 MsG0680035779.01.T01:CDS
TACTTTGATTGTAATCTTGG+TGG 0.421501 6:+112142057 MsG0680035779.01.T01:CDS
GGAACATTCCCGGATGAGAT+TGG 0.426209 6:+112140605 MsG0680035779.01.T01:CDS
ATTTGGATATTTCACAAAAC+GGG 0.426613 6:+112140795 MsG0680035779.01.T01:CDS
TCTGTTTGATGGAACATTCC+CGG 0.426706 6:+112140595 MsG0680035779.01.T01:CDS
GGTAAATAACCGATTGAAGC+TGG 0.434745 6:-112141779 None:intergenic
TTCCATTTGATGTAATATCA+TGG 0.438169 6:+112141705 MsG0680035779.01.T01:CDS
GTGATTCTTGGAGCTATAGA+AGG 0.439143 6:-112141851 None:intergenic
GCCAAATCTCCAATCTCATC+CGG 0.439928 6:-112140614 None:intergenic
TTAAAATATTGAGCAGCATT+CGG 0.442489 6:+112142365 MsG0680035779.01.T01:CDS
TGGTGAAATGCCTGAATCAA+TGG 0.442942 6:+112140751 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTTGCTTTCACTTTGAGTGT+TGG 0.448808 6:-112142017 None:intergenic
AACTCTTCCTGTTAAACGAT+TGG 0.448986 6:-112141891 None:intergenic
TTCACATCTCTATGAACAAC+AGG 0.453215 6:-112142625 None:intergenic
TTTGAGTGAAGTCCAAAATC+AGG 0.454052 6:-112141212 None:intergenic
GGGAGATATGGTTTCTTTGG+AGG 0.454641 6:+112140772 MsG0680035779.01.T01:CDS
GACCAAGTTGAGTAAATTGA+AGG 0.464468 6:+112140700 MsG0680035779.01.T01:CDS
TGAAGTGATGTTATCTCTTG+TGG 0.468782 6:-112141635 None:intergenic
CCATGATAGCACAAATTCTC+TGG 0.473494 6:-112141281 None:intergenic
GTTGGAATTAGAATTGCATA+AGG 0.473811 6:-112141999 None:intergenic
GTCCAAGAAGATACTCCAAT+TGG 0.473935 6:-112141563 None:intergenic
TTGATCAGAATCAGCTAAAA+GGG 0.492987 6:+112141678 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTCTGGAGAGTTACCTGATG+TGG 0.493776 6:+112140892 MsG0680035779.01.T01:CDS
GATTTGGATATTTCACAAAA+CGG 0.499425 6:+112140794 MsG0680035779.01.T01:CDS
AAAACCGAAGTCTTGATAGA+TGG 0.503222 6:+112142461 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTTAACGCTTCAACCACATC+AGG 0.504520 6:-112140905 None:intergenic
GTTCTACGTTGCCGTTGAGT+TGG 0.506610 6:+112140678 MsG0680035779.01.T01:CDS
ATAAGTCATAATAAGTTCAA+TGG 0.509043 6:+112141467 MsG0680035779.01.T01:CDS
GGAAGTTGACCTATGCTTTG+CGG 0.510890 6:-112141046 None:intergenic
GGAGAAATTCCAGCTTCAAT+CGG 0.515321 6:+112141770 MsG0680035779.01.T01:CDS
AATTAGAATTGCATAAGGTA+AGG 0.517494 6:-112141994 None:intergenic
CTATCAGACAATCAATTCTC+CGG 0.520227 6:+112141821 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTTCACAAAACGGGTTGACT+GGG 0.528419 6:+112140804 MsG0680035779.01.T01:CDS
AGATCAAGAACACTAAGATC+AGG 0.534020 6:-112141800 None:intergenic
GCTTATGAAAATCATCTAAG+TGG 0.537771 6:+112141323 MsG0680035779.01.T01:CDS
GGTGAAATGCCTGAATCAAT+GGG 0.539494 6:+112140752 MsG0680035779.01.T01:CDS
AGTATCTTCTTGGACTAATG+TGG 0.541704 6:+112141571 MsG0680035779.01.T01:CDS
ACCTTAAAATCTATCAGAGA+TGG 0.542216 6:-112141067 None:intergenic
GATATTACATCAAATGGAAG+TGG 0.544102 6:-112141701 None:intergenic
GCAGCCATCTATCAAGACTT+CGG 0.549783 6:-112142465 None:intergenic
ATTCTGCGCAAGATCGATGA+TGG 0.565697 6:-112140933 None:intergenic
TTTGGCGAATCTTGAAACGT+TGG 0.569406 6:+112140631 MsG0680035779.01.T01:CDS
TCAGCTCTCCAAAGTCCACT+AGG 0.575086 6:-112141425 None:intergenic
CTCAACTTGGTCCAACTCAA+CGG 0.575949 6:-112140689 None:intergenic
TATTACAACAAACAGATTCG+AGG 0.579658 6:+112141250 MsG0680035779.01.T01:CDS
ATTACAACAAACAGATTCGA+GGG 0.580179 6:+112141251 MsG0680035779.01.T01:CDS
AGCTATAGAAGGTATTTCGC+CGG 0.585862 6:-112141840 None:intergenic
CATAAGGTAAGGTTCAATGT+TGG 0.586090 6:-112141983 None:intergenic
CCAAATCTCCAATCTCATCC+GGG 0.586773 6:-112140613 None:intergenic
GGAGAGATTCCGCAAAGCAT+AGG 0.590239 6:+112141037 MsG0680035779.01.T01:CDS
AAATTGTAGTAGCTTGTTGG+AGG 0.592718 6:+112141367 MsG0680035779.01.T01:CDS
AAGAGATTGCAAATAGCTAT+CGG 0.601344 6:+112142559 MsG0680035779.01.T01:CDS
ATAGCTATCGGTGTAGCTCA+AGG 0.604441 6:+112142571 MsG0680035779.01.T01:CDS
GAAAGCTGCAAAAGTTAACA+GGG 0.619939 6:+112140987 MsG0680035779.01.T01:CDS
GGTGAGTTACCAGAATCACT+TGG 0.631716 6:+112141344 MsG0680035779.01.T01:CDS
GAGTGAAGTCCAAAATCAGG+AGG 0.654193 6:-112141209 None:intergenic
TTGACCCAAAATCAACTGAG+TGG 0.665803 6:+112141749 MsG0680035779.01.T01:CDS
TTGACTGGGAAAATTCCTAG+TGG 0.688441 6:+112140818 MsG0680035779.01.T01:CDS
ACATCTCTATGAACAACAGG+CGG 0.690380 6:-112142622 None:intergenic
TTCAACATGAACAAACCACT+AGG 0.690716 6:-112140833 None:intergenic
TGAGAAATCATTTCACACCG+AGG 0.699719 6:+112142342 MsG0680035779.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATGACAGAAAATAATATTAT+AGG + Chr6:112142222-112142241 MsG0680035779.01.T01:intron 15.0%
!!! ATAAGCTATAATCAATTTTA+TGG + Chr6:112141533-112141552 MsG0680035779.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAAGTCATAATAAGTTCAA+TGG + Chr6:112141467-112141486 MsG0680035779.01.T01:CDS 20.0%
!! GAAAATAATATTATAGGAAG+TGG + Chr6:112142228-112142247 MsG0680035779.01.T01:intron 20.0%
!! TAATACCGATAAAAAAAATC+CGG - Chr6:112141147-112141166 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTACAGTAATGAGTTTTA+TGG + Chr6:112141395-112141414 MsG0680035779.01.T01:CDS 20.0%
! AATAATATTATAGGAAGTGG+TGG + Chr6:112142231-112142250 MsG0680035779.01.T01:intron 25.0%
! AATTAGAATTGCATAAGGTA+AGG - Chr6:112141997-112142016 None:intergenic 25.0%
! ATTTGGATATTTCACAAAAC+GGG + Chr6:112140795-112140814 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
! GATTTGGATATTTCACAAAA+CGG + Chr6:112140794-112140813 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAATGATTTCTCAAGATT+TGG - Chr6:112142337-112142356 None:intergenic 25.0%
! TTAAAATATTGAGCAGCATT+CGG + Chr6:112142365-112142384 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
! TTCCATGATATTACATCAAA+TGG - Chr6:112141710-112141729 None:intergenic 25.0%
! TTCCATTTGATGTAATATCA+TGG + Chr6:112141705-112141724 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTACTTTGATTGTAATCT+TGG + Chr6:112142054-112142073 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
!! AGCTATAATCAATTTTATGG+TGG + Chr6:112141536-112141555 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTATGGTAAAATTCCTAG+TGG + Chr6:112141410-112141429 MsG0680035779.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATACTTGATGACAAATTTTG+AGG - Chr6:112141500-112141519 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTCCGGATTTTTTTTAT+CGG + Chr6:112141139-112141158 MsG0680035779.01.T01:intron 25.0%
AAGAGATTGCAAATAGCTAT+CGG + Chr6:112142559-112142578 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTAAAATCTATCAGAGA+TGG - Chr6:112141070-112141089 None:intergenic 30.0%
ATAGCTATTTGCAATCTCTT+TGG - Chr6:112142559-112142578 None:intergenic 30.0%
ATGTAGCTGTGAAAAGATTT+GGG + Chr6:112142295-112142314 MsG0680035779.01.T01:intron 30.0%
ATTACAACAAACAGATTCGA+GGG + Chr6:112141251-112141270 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
CTTTACCGTAAAAGAAAACA+AGG + Chr6:112142126-112142145 MsG0680035779.01.T01:intron 30.0%
GATATTACATCAAATGGAAG+TGG - Chr6:112141704-112141723 None:intergenic 30.0%
GCAAGCAAGAATAATCTTAA+TGG + Chr6:112141605-112141624 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
GCTTATGAAAATCATCTAAG+TGG + Chr6:112141323-112141342 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
GTCTTTATGAACAACTTATC+AGG + Chr6:112141088-112141107 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
GTTGGAATTAGAATTGCATA+AGG - Chr6:112142002-112142021 None:intergenic 30.0%
GTTTATAGAGTCACTATTGA+TGG + Chr6:112142264-112142283 MsG0680035779.01.T01:intron 30.0%
TACTTTGATTGTAATCTTGG+TGG + Chr6:112142057-112142076 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
TATGTAGCTGTGAAAAGATT+TGG + Chr6:112142294-112142313 MsG0680035779.01.T01:intron 30.0%
TATTACAACAAACAGATTCG+AGG + Chr6:112141250-112141269 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
TCATGTAAAACACATTTGTC+AGG + Chr6:112141179-112141198 MsG0680035779.01.T01:intron 30.0%
TCCTAGTGCATTTGAAAATT+CGG + Chr6:112141913-112141932 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
TCTCCTGAAAAATTATTCAC+TGG - Chr6:112141022-112141041 None:intergenic 30.0%
TTCATCATGTCATTCTTGAT+TGG + Chr6:112142533-112142552 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
TTGATCAGAATCAGCTAAAA+GGG + Chr6:112141678-112141697 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! AGAAGCTTTTTGAACAATTC+TGG + Chr6:112141944-112141963 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! ATGTATGTCTGCAATCTTTT+TGG + Chr6:112140731-112140750 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! GAAGACAAGTAACATTCTTT+TGG + Chr6:112142645-112142664 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! GGAAAAATACCAGATGATTT+TGG + Chr6:112140965-112140984 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! GTCATCAAGTATTTCACTTT+TGG + Chr6:112141508-112141527 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! TCCATCTCTGATAGATTTTA+AGG + Chr6:112141066-112141085 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
! TTGAATTTTTGCACGAGTTT+TGG + Chr6:112141116-112141135 MsG0680035779.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTATGGTGGAATTCCAAT+TGG + Chr6:112141548-112141567 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATGCAAAAGTTGCTGATTT+TGG + Chr6:112142679-112142698 MsG0680035779.01.T01:CDS 30.0%
AAAACCGAAGTCTTGATAGA+TGG + Chr6:112142461-112142480 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
AACTCTTCCTGTTAAACGAT+TGG - Chr6:112141894-112141913 None:intergenic 35.0%
AATGGGAGATATGGTTTCTT+TGG + Chr6:112140769-112140788 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
AGATCAAGAACACTAAGATC+AGG - Chr6:112141803-112141822 None:intergenic 35.0%
AGTATCTTCTTGGACTAATG+TGG + Chr6:112141571-112141590 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
CACCTTCAATTTACTCAACT+TGG - Chr6:112140705-112140724 None:intergenic 35.0%
CATAAGGTAAGGTTCAATGT+TGG - Chr6:112141986-112142005 None:intergenic 35.0%
CCGTAAAAGAAAACAAGGAT+CGG + Chr6:112142131-112142150 MsG0680035779.01.T01:intron 35.0%
CTACAATTTCCAAGTGATTC+TGG - Chr6:112141356-112141375 None:intergenic 35.0%
CTATCAGACAATCAATTCTC+CGG + Chr6:112141821-112141840 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
CTATCATCCAATCGTTTAAC+AGG + Chr6:112141884-112141903 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATCAGAATCAGCTAAA+AGG + Chr6:112141677-112141696 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGCTGCAAAAGTTAACA+GGG + Chr6:112140987-112141006 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
GACTAATGTGGTTGAGTTTA+TGG + Chr6:112141583-112141602 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGTGATGTTATCTCTTG+TGG - Chr6:112141638-112141657 None:intergenic 35.0%
TTCAACATGAACAAACCACT+AGG - Chr6:112140836-112140855 None:intergenic 35.0%
TTCACATCTCTATGAACAAC+AGG - Chr6:112142628-112142647 None:intergenic 35.0%
TTGCAAGTTTGTCTGTTTGA+TGG + Chr6:112140584-112140603 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAGTGAAGTCCAAAATC+AGG - Chr6:112141215-112141234 None:intergenic 35.0%
TTTGCTTTCACTTTGAGTGT+TGG - Chr6:112142020-112142039 None:intergenic 35.0%
! ACTTTGGAGAGCTGAAAATT+TGG + Chr6:112141433-112141452 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
! CTGCCAGTGAATAATTTTTC+AGG + Chr6:112141016-112141035 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
! GACCAAGTTGAGTAAATTGA+AGG + Chr6:112140700-112140719 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
! TATGGTTTCTTTGGAGGATT+TGG + Chr6:112140778-112140797 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
! TGGAAATTGTAGTAGCTTGT+TGG + Chr6:112141364-112141383 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
! TTCCAATTGGAGTATCTTCT+TGG + Chr6:112141561-112141580 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
!! AAATTGTAGTAGCTTGTTGG+AGG + Chr6:112141367-112141386 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
!! AGAGTCACTATTGATGGATT+AGG + Chr6:112142270-112142289 MsG0680035779.01.T01:intron 35.0%
!! ATTATAGGAAGTGGTGGATA+CGG + Chr6:112142237-112142256 MsG0680035779.01.T01:intron 35.0%
!! GTAAAATTCCTAGTGGACTT+TGG + Chr6:112141417-112141436 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAGAAGAATGTTGCTTTCG+AGG + Chr6:112140861-112140880 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCTCCACTCAGTTGATTTT+GGG - Chr6:112141756-112141775 None:intergenic 35.0%
!! TTTCTCCACTCAGTTGATTT+TGG - Chr6:112141757-112141776 None:intergenic 35.0%
!!! CAAAAGTTGCTGATTTTGGT+TGG + Chr6:112142683-112142702 MsG0680035779.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCGATCCTTGTTTTCTTTTA+CGG - Chr6:112142134-112142153 None:intergenic 35.0%
!!! GCTGCTCAATATTTTAACCT+CGG - Chr6:112142362-112142381 None:intergenic 35.0%
AAGGATCGGATAACTCATCA+TGG + Chr6:112142145-112142164 MsG0680035779.01.T01:intron 40.0%
ACATCTCTATGAACAACAGG+CGG - Chr6:112142625-112142644 None:intergenic 40.0%
AGATCGAGAACTGTGATTCT+TGG - Chr6:112141866-112141885 None:intergenic 40.0%
CCAGAGAATTTGTGCTATCA+TGG + Chr6:112141281-112141300 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
CCATGATAGCACAAATTCTC+TGG - Chr6:112141284-112141303 None:intergenic 40.0%
CTTGCGCAGAATAATCTTAC+TGG + Chr6:112140944-112140963 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCGAGGAACAATCTTTC+TGG + Chr6:112140875-112140894 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
GGAAAGCTGCAAAAGTTAAC+AGG + Chr6:112140986-112141005 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
GGAGAAATTCCAGCTTCAAT+CGG + Chr6:112141770-112141789 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
GGTAAATAACCGATTGAAGC+TGG - Chr6:112141782-112141801 None:intergenic 40.0%
GGTGAAATGCCTGAATCAAT+GGG + Chr6:112140752-112140771 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
GTCCAAGAAGATACTCCAAT+TGG - Chr6:112141566-112141585 None:intergenic 40.0%
GTGATTCTTGGAGCTATAGA+AGG - Chr6:112141854-112141873 None:intergenic 40.0%
TATCAATGAAGCCGCTAAGA+CGG - Chr6:112142088-112142107 None:intergenic 40.0%
TCTGTTTGATGGAACATTCC+CGG + Chr6:112140595-112140614 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
TGAGAAATCATTTCACACCG+AGG + Chr6:112142342-112142361 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGCTTTCCAAAATCATC+TGG - Chr6:112140977-112140996 None:intergenic 40.0%
TGGTGAAATGCCTGAATCAA+TGG + Chr6:112140751-112140770 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
TTGACCCAAAATCAACTGAG+TGG + Chr6:112141749-112141768 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
TTGACTGGGAAAATTCCTAG+TGG + Chr6:112140818-112140837 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
TTTAACGCTTCAACCACATC+AGG - Chr6:112140908-112140927 None:intergenic 40.0%
TTTGGCGAATCTTGAAACGT+TGG + Chr6:112140631-112140650 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
! GCCGAATTTTCAAATGCACT+AGG - Chr6:112141917-112141936 None:intergenic 40.0%
!! ACCATATCTCCCATTGATTC+AGG - Chr6:112140764-112140783 None:intergenic 40.0%
!! AGCTATAGAAGGTATTTCGC+CGG - Chr6:112141843-112141862 None:intergenic 40.0%
!! ATTTCACAAAACGGGTTGAC+TGG + Chr6:112140803-112140822 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTCACAAAACGGGTTGACT+GGG + Chr6:112140804-112140823 MsG0680035779.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCTATCGGTGTAGCTCA+AGG + Chr6:112142571-112142590 MsG0680035779.01.T01:CDS 45.0%
ATTCTGCGCAAGATCGATGA+TGG - Chr6:112140936-112140955 None:intergenic 45.0%
CCAAATCTCCAATCTCATCC+GGG - Chr6:112140616-112140635 None:intergenic 45.0%
CTCAACTTGGTCCAACTCAA+CGG - Chr6:112140692-112140711 None:intergenic 45.0%
GAGTGAAGTCCAAAATCAGG+AGG - Chr6:112141212-112141231 None:intergenic 45.0%
GCAGCCATCTATCAAGACTT+CGG - Chr6:112142468-112142487 None:intergenic 45.0%
GCCAAATCTCCAATCTCATC+CGG - Chr6:112140617-112140636 None:intergenic 45.0%
GCCTGAATCAATGGGAGATA+TGG + Chr6:112140760-112140779 MsG0680035779.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGTTGACCTATGCTTTG+CGG - Chr6:112141049-112141068 None:intergenic 45.0%
GGGAGATATGGTTTCTTTGG+AGG + Chr6:112140772-112140791 MsG0680035779.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGTTACCAGAATCACT+TGG + Chr6:112141344-112141363 MsG0680035779.01.T01:CDS 45.0%
! GGTACACTTCCTCCTGATTT+TGG + Chr6:112141200-112141219 MsG0680035779.01.T01:intron 45.0%
! TTCTGGAGAGTTACCTGATG+TGG + Chr6:112140892-112140911 MsG0680035779.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTTGCTGATTTTGGTTGGCT+AGG + Chr6:112142688-112142707 MsG0680035779.01.T01:CDS 45.0%
!!! TGCACGAGTTTTGGTTTCTC+CGG + Chr6:112141125-112141144 MsG0680035779.01.T01:intron 45.0%
CCCGGATGAGATTGGAGATT+TGG + Chr6:112140613-112140632 MsG0680035779.01.T01:CDS 50.0%
GGAACATTCCCGGATGAGAT+TGG + Chr6:112140605-112140624 MsG0680035779.01.T01:CDS 50.0%
GGAGAGATTCCGCAAAGCAT+AGG + Chr6:112141037-112141056 MsG0680035779.01.T01:CDS 50.0%
GTTCTACGTTGCCGTTGAGT+TGG + Chr6:112140678-112140697 MsG0680035779.01.T01:CDS 50.0%
TCAGCTCTCCAAAGTCCACT+AGG - Chr6:112141428-112141447 None:intergenic 50.0%
TGGTGGTAGTTCCGTCTTAG+CGG + Chr6:112142074-112142093 MsG0680035779.01.T01:intron 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 112140551 112142717 112140551 ID=MsG0680035779.01;Name=MsG0680035779.01
Chr6 mRNA 112140551 112142717 112140551 ID=MsG0680035779.01.T01;Parent=MsG0680035779.01;Name=MsG0680035779.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|609
Chr6 exon 112140551 112141109 112140551 ID=MsG0680035779.01.T01:exon:15031;Parent=MsG0680035779.01.T01
Chr6 exon 112141201 112142078 112141201 ID=MsG0680035779.01.T01:exon:15032;Parent=MsG0680035779.01.T01
Chr6 exon 112142325 112142717 112142325 ID=MsG0680035779.01.T01:exon:15033;Parent=MsG0680035779.01.T01
Chr6 CDS 112140551 112141109 112140551 ID=MsG0680035779.01.T01:cds;Parent=MsG0680035779.01.T01
Chr6 CDS 112141201 112142078 112141201 ID=MsG0680035779.01.T01:cds;Parent=MsG0680035779.01.T01
Chr6 CDS 112142325 112142717 112142325 ID=MsG0680035779.01.T01:cds;Parent=MsG0680035779.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035779.01.T01

TATTGGAAGTTGAAGAAACTGAGATTTCTTGCGTTGCAAGTTTGTCTGTTTGATGGAACATTCCCGGATGAGATTGGAGATTTGGCGAATCTTGAAACGTTGGATTTGTCGAACAATTTGTTTAAGAGTTCTACGTTGCCGTTGAGTTGGACCAAGTTGAGTAAATTGAAGGTGTTTTATATGTATGTCTGCAATCTTTTTGGTGAAATGCCTGAATCAATGGGAGATATGGTTTCTTTGGAGGATTTGGATATTTCACAAAACGGGTTGACTGGGAAAATTCCTAGTGGTTTGTTCATGTTGAAGAATCTTAGAAGAATGTTGCTTTCGAGGAACAATCTTTCTGGAGAGTTACCTGATGTGGTTGAAGCGTTAAACTTGACCATCATCGATCTTGCGCAGAATAATCTTACTGGAAAAATACCAGATGATTTTGGAAAGCTGCAAAAGTTAACAGGGTTGTCTCTGCCAGTGAATAATTTTTCAGGAGAGATTCCGCAAAGCATAGGTCAACTTCCATCTCTGATAGATTTTAAGGTCTTTATGAACAACTTATCAGGTACACTTCCTCCTGATTTTGGACTTCACTCAAAGCTAAGAACTTTTCATATTACAACAAACAGATTCGAGGGAAAGTTGCCAGAGAATTTGTGCTATCATGGACAGTTACAAAATTTAACTGCTTATGAAAATCATCTAAGTGGTGAGTTACCAGAATCACTTGGAAATTGTAGTAGCTTGTTGGAGGTGAAAATTTACAGTAATGAGTTTTATGGTAAAATTCCTAGTGGACTTTGGAGAGCTGAAAATTTGGTGTATTTTATGATAAGTCATAATAAGTTCAATGGTGAGCTTCCTCAAAATTTGTCATCAAGTATTTCACTTTTGGATATAAGCTATAATCAATTTTATGGTGGAATTCCAATTGGAGTATCTTCTTGGACTAATGTGGTTGAGTTTATGGCAAGCAAGAATAATCTTAATGGAAGTATTCCACAAGAGATAACATCACTTCATAAGCTACAAACATTGTTGCTTGATCAGAATCAGCTAAAAGGGCCACTTCCATTTGATGTAATATCATGGAATTCATTACTGACACTAAATTTGACCCAAAATCAACTGAGTGGAGAAATTCCAGCTTCAATCGGTTATTTACCTGATCTTAGTGTTCTTGATCTATCAGACAATCAATTCTCCGGCGAAATACCTTCTATAGCTCCAAGAATCACAGTTCTCGATCTATCATCCAATCGTTTAACAGGAAGAGTTCCTAGTGCATTTGAAAATTCGGCATTTGATAGAAGCTTTTTGAACAATTCTGGTTTATGTGCTGATACACCAACATTGAACCTTACCTTATGCAATTCTAATTCCAACACTCAAAGTGAAAGCAAAGATTCATCTTTATCTTCTACTTTGATTGTAATCTTGGTGAAAACTAGACCAAATCTTGAGAAATCATTTCACACCGAGGTTAAAATATTGAGCAGCATTCGGCATAGAAACATTGTGAAGTTGTTATGTTGTATCTCTAACGATGATACAATGCTACTTGTTTACGAGTATGTTGAAAACCGAAGTCTTGATAGATGGCTGCAGAAGAAGAAAACTGTTAAGTCTTCAACTTTGTTGTCAAGATCAGTTCATCATGTCATTCTTGATTGGCCAAAGAGATTGCAAATAGCTATCGGTGTAGCTCAAGGTTTGAGCTACATGCATCATGAATGTTCACCGCCTGTTGTTCATAGAGATGTGAAGACAAGTAACATTCTTTTGGATGCTCAGTTTAATGCAAAAGTTGCTGATTTTGGTTGGCTAGGATGTTGA
Protein sequence

>MsG0680035779.01.T01

YWKLKKLRFLALQVCLFDGTFPDEIGDLANLETLDLSNNLFKSSTLPLSWTKLSKLKVFYMYVCNLFGEMPESMGDMVSLEDLDISQNGLTGKIPSGLFMLKNLRRMLLSRNNLSGELPDVVEALNLTIIDLAQNNLTGKIPDDFGKLQKLTGLSLPVNNFSGEIPQSIGQLPSLIDFKVFMNNLSGTLPPDFGLHSKLRTFHITTNRFEGKLPENLCYHGQLQNLTAYENHLSGELPESLGNCSSLLEVKIYSNEFYGKIPSGLWRAENLVYFMISHNKFNGELPQNLSSSISLLDISYNQFYGGIPIGVSSWTNVVEFMASKNNLNGSIPQEITSLHKLQTLLLDQNQLKGPLPFDVISWNSLLTLNLTQNQLSGEIPASIGYLPDLSVLDLSDNQFSGEIPSIAPRITVLDLSSNRLTGRVPSAFENSAFDRSFLNNSGLCADTPTLNLTLCNSNSNTQSESKDSSLSSTLIVILVKTRPNLEKSFHTEVKILSSIRHRNIVKLLCCISNDDTMLLVYEYVENRSLDRWLQKKKTVKSSTLLSRSVHHVILDWPKRLQIAIGVAQGLSYMHHECSPPVVHRDVKTSNILLDAQFNAKVADFGWLGC*