AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039507.01


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MsG0780039507.01.T01 AT3G48300 26.392 485 291 10 24 463 21 484 4.76e-53 186
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MsG0780039507.01.T01 AT3G20080 25.720 486 303 9 21 458 29 504 3.19e-37 143
MsG0780039507.01.T01 AT1G01190 23.983 467 286 11 25 441 69 516 3.64e-37 143
MsG0780039507.01.T01 AT2G27000 26.535 456 266 13 55 457 61 500 1.43e-36 141
MsG0780039507.01.T01 AT3G10570 25.330 454 272 11 51 451 63 502 2.20e-36 140
MsG0780039507.01.T01 AT1G79370 25.641 507 302 14 1 434 1 505 2.34e-36 141
MsG0780039507.01.T01 AT3G32047 25.376 465 258 11 54 457 63 499 3.02e-36 140
MsG0780039507.01.T01 AT1G11600 24.950 497 298 13 26 462 27 508 4.58e-36 140
MsG0780039507.01.T01 AT1G13100 25.843 445 262 11 43 433 37 467 5.33e-36 139
MsG0780039507.01.T01 AT5G35715 23.557 433 270 8 69 450 1 423 8.25e-36 138
MsG0780039507.01.T01 AT4G15330 26.494 502 292 18 1 447 6 485 9.37e-36 139
MsG0780039507.01.T01 AT1G50520 23.620 453 281 11 56 457 66 504 1.53e-35 139
MsG0780039507.01.T01 AT3G20120 27.105 380 210 11 129 457 1 364 4.21e-35 134
MsG0780039507.01.T01 AT3G20120 27.105 380 210 11 129 457 1 364 4.21e-35 134
MsG0780039507.01.T01 AT3G20120 27.105 380 210 11 129 457 1 364 4.21e-35 134
MsG0780039507.01.T01 AT3G20960 27.366 391 222 9 116 457 21 398 6.31e-35 135
MsG0780039507.01.T01 AT5G47990 23.568 454 280 11 55 457 64 501 1.07e-34 136
MsG0780039507.01.T01 AT3G20100 24.454 458 277 12 43 447 50 491 1.52e-34 135
MsG0780039507.01.T01 AT2G25160 25.490 510 307 14 1 449 1 498 6.66e-34 134
MsG0780039507.01.T01 AT1G58260 22.112 502 302 10 5 434 9 493 1.34e-33 133
MsG0780039507.01.T01 AT5G25900 24.746 493 285 15 17 449 27 493 2.80e-33 132
MsG0780039507.01.T01 AT1G13080 24.722 360 218 6 138 450 17 370 3.78e-33 129
MsG0780039507.01.T01 AT5G24960 26.012 346 240 8 25 365 23 357 5.05e-33 129
MsG0780039507.01.T01 AT2G27010 26.049 453 252 15 55 456 57 477 9.27e-33 130
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MsG0780039507.01.T01 AT3G26180 29.804 255 128 6 241 450 106 354 1.41e-31 124
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MsG0780039507.01.T01 AT2G22330 22.840 486 309 9 6 432 27 505 7.68e-31 125
MsG0780039507.01.T01 AT2G22330 23.108 489 304 11 6 432 50 528 8.91e-31 125
MsG0780039507.01.T01 AT5G36220 27.070 314 167 9 178 450 43 335 1.46e-30 121
MsG0780039507.01.T01 AT2G05180 27.596 337 232 6 55 388 63 390 2.31e-30 122
MsG0780039507.01.T01 AT4G39950 24.490 490 297 12 6 433 26 504 2.43e-30 124
MsG0780039507.01.T01 AT4G39950 24.490 490 297 12 6 433 66 544 4.59e-30 123
MsG0780039507.01.T01 AT1G16410 22.020 495 324 9 3 437 12 504 1.82e-28 118
MsG0780039507.01.T01 AT3G20090 25.798 376 221 9 129 457 1 365 2.61e-28 116
MsG0780039507.01.T01 AT2G25160 27.295 403 272 11 1 389 1 396 3.35e-28 116
MsG0780039507.01.T01 AT3G25180 26.735 389 256 9 3 375 5 380 9.09e-28 114
MsG0780039507.01.T01 AT5G35917 24.146 439 271 16 34 434 42 456 1.25e-27 115
MsG0780039507.01.T01 AT3G61035 30.769 273 160 10 43 307 51 302 2.23e-27 112
MsG0780039507.01.T01 AT1G16410 24.552 391 279 8 3 379 12 400 3.63e-27 113
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MsG0780039507.01.T01 AT3G20080 30.736 231 109 6 274 458 142 367 4.51e-25 106
MsG0780039507.01.T01 AT3G20080 30.736 231 109 6 274 458 142 367 4.51e-25 106
MsG0780039507.01.T01 AT3G20080 30.736 231 109 6 274 458 142 367 4.51e-25 106
MsG0780039507.01.T01 AT3G20080 30.736 231 109 6 274 458 142 367 4.51e-25 106
MsG0780039507.01.T01 AT4G15330 23.896 498 282 16 1 447 6 457 8.32e-24 104
MsG0780039507.01.T01 AT1G64900 22.976 457 286 11 58 461 58 501 1.95e-22 100
MsG0780039507.01.T01 AT3G20935 30.392 204 90 5 301 457 130 328 3.30e-22 97.8
MsG0780039507.01.T01 AT2G44890 24.675 385 216 13 105 433 116 482 2.38e-21 97.1
MsG0780039507.01.T01 AT1G13090 26.768 198 142 2 33 229 27 222 1.21e-16 80.9
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MsG0780039507.01.T01 AT1G63710 21.723 534 322 15 1 464 1 508 5.29e-15 77.8
MsG0780039507.01.T01 AT3G61035 34.328 134 80 4 176 305 59 188 1.03e-14 73.6
MsG0780039507.01.T01 AT3G61035 34.328 134 80 4 176 305 59 188 1.03e-14 73.6
MsG0780039507.01.T01 AT2G23180 23.704 405 223 15 125 461 124 510 1.30e-14 76.3
MsG0780039507.01.T01 AT3G61035 34.328 134 80 4 176 305 59 188 2.08e-14 73.6
MsG0780039507.01.T01 AT3G53290 22.857 350 244 9 117 444 41 386 5.39e-13 70.9

Find 80 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 121 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GTGGAAGTTTAGTAGAATTT+TGG 0.143501 7:-65026285 None:intergenic
CTTAATAGCAACAATATTAT+TGG 0.167963 7:+65027039 MsG0780039507.01.T01:CDS
GAAGAGATTCAATCATCTTT+AGG 0.188348 7:-65027772 None:intergenic
AAGAGTTTGAGAACATTATT+TGG 0.205202 7:+65026812 MsG0780039507.01.T01:CDS
TGCTTGTAAGTAAGGTAATT+TGG 0.227274 7:-65027364 None:intergenic
GGAGTGTGACATTAAGTATA+TGG 0.237315 7:+65027574 MsG0780039507.01.T01:intron
AAGAGATTCAATCATCTTTA+GGG 0.254276 7:-65027771 None:intergenic
TCCATTCAAATTTGCGTAGA+AGG 0.255524 7:-65027691 None:intergenic
TCCTTCATATTCATGTCTTC+TGG 0.257227 7:-65027734 None:intergenic
CACAGTTTCATCACATTTAT+GGG 0.269999 7:-65027436 None:intergenic
CAGTTCTATTAGAGAAGATT+TGG 0.274940 7:-65026486 None:intergenic
CATTTATGGGGCAACAATAA+TGG 0.300074 7:-65027423 None:intergenic
ATGAATATGAAGGAGCAATT+TGG 0.310197 7:+65027743 MsG0780039507.01.T01:CDS
TGTTAGGATTTGTTCGTTGC+TGG 0.311131 7:+65027207 MsG0780039507.01.T01:intron
ACAAAACTCTCACAAAACTA+TGG 0.338700 7:+65026376 MsG0780039507.01.T01:CDS
TTCTAAGATGTTTCCTATGA+TGG 0.351202 7:-65026326 None:intergenic
TTCACAACTGCTTGTAAGTA+AGG 0.357144 7:-65027372 None:intergenic
GGAAAGAAATCTGAAACATT+AGG 0.379151 7:-65026859 None:intergenic
AAGCACGATTGAATGGATTA+TGG 0.394950 7:+65027245 MsG0780039507.01.T01:CDS
GGATCAAAAGGACGAAGAAT+TGG 0.395612 7:-65026880 None:intergenic
CCCTTCTACGCAAATTTGAA+TGG 0.404003 7:+65027690 MsG0780039507.01.T01:CDS
CCATACCCACTTCCCATCAT+AGG 0.411254 7:+65026313 MsG0780039507.01.T01:CDS
AGGTTTGTTTGGCTAGTTGT+GGG 0.416222 7:-65026450 None:intergenic
TGCATAGTCCTATGAGCTAA+TGG 0.418567 7:-65027653 None:intergenic
AGTTCTATTAGAGAAGATTT+GGG 0.422345 7:-65026485 None:intergenic
CAGGGTTGCCATTAGCTCAT+AGG 0.427030 7:+65027645 MsG0780039507.01.T01:CDS
TAGCTTTGTGGAAGAAACTA+AGG 0.431419 7:+65026569 MsG0780039507.01.T01:CDS
CCTATGATGGGAAGTGGGTA+TGG 0.434072 7:-65026313 None:intergenic
GGCTTCCAACATTAGCTTTG+TGG 0.434738 7:+65026557 MsG0780039507.01.T01:CDS
ATGGGAAGTGGGTATGGCCC+TGG 0.441318 7:-65026307 None:intergenic
CAACATCAAGCACGATTGAA+TGG 0.443370 7:+65027238 MsG0780039507.01.T01:CDS
TCAAGCTACTTCATCAGATT+AGG 0.449371 7:+65027799 MsG0780039507.01.T01:CDS
TTGTGGGGATGAAATTACTA+TGG 0.452191 7:-65026434 None:intergenic
TCTAAGAATAAAGACGAGAA+TGG 0.452461 7:-65026248 None:intergenic
ATCTTTGCATGCACACCTTG+TGG 0.470899 7:-65026901 None:intergenic
GATCATGACAAATTCTCAGT+TGG 0.477136 7:+65026532 MsG0780039507.01.T01:CDS
ATCATGACAAATTCTCAGTT+GGG 0.479594 7:+65026533 MsG0780039507.01.T01:CDS
GAGTGTGACATTAAGTATAT+GGG 0.482938 7:+65027575 MsG0780039507.01.T01:intron
TGCACACCTTGTGGATCAAA+AGG 0.490185 7:-65026892 None:intergenic
GAGCTTATACCGTTTGGAGC+AGG 0.500496 7:+65027608 MsG0780039507.01.T01:CDS
ATGTTTCCTATGATGGGAAG+TGG 0.508602 7:-65026319 None:intergenic
GAGCTGGTGGGTGCAACCGA+AGG 0.511233 7:-65027401 None:intergenic
TCTAAGATGTTTCCTATGAT+GGG 0.511254 7:-65026325 None:intergenic
TTCTTCCACAAAGCTAATGT+TGG 0.511647 7:-65026562 None:intergenic
TAATCACTAGTAGAAGTGTT+TGG 0.516316 7:-65026210 None:intergenic
TAGAAGTGTTTGGTAGTCCA+TGG 0.523474 7:-65026200 None:intergenic
GCAGGCAAAAGAATTTGTCC+AGG 0.524639 7:+65027626 MsG0780039507.01.T01:CDS
CCATTCAAATTTGCGTAGAA+GGG 0.524781 7:-65027690 None:intergenic
GAACATTATTTGGAGTTACA+TGG 0.531254 7:+65026822 MsG0780039507.01.T01:CDS
TGGAGTTACATGGAAGCAGC+TGG 0.535235 7:+65026832 MsG0780039507.01.T01:CDS
CAGTTGTGAAGGAAACCCTT+CGG 0.536843 7:+65027385 MsG0780039507.01.T01:CDS
AAGGTTTGTTTGGCTAGTTG+TGG 0.538029 7:-65026451 None:intergenic
CCAATCATGACACTAAAACT+AGG 0.539464 7:+65026400 MsG0780039507.01.T01:CDS
GCCAGAAGACATGAATATGA+AGG 0.546131 7:+65027733 MsG0780039507.01.T01:CDS
ATAGGAAACATCTTAGAACT+TGG 0.546652 7:+65026331 MsG0780039507.01.T01:CDS
TGGGGCAACAATAATGGAGC+TGG 0.551562 7:-65027417 None:intergenic
GGTTTGTTTGGCTAGTTGTG+GGG 0.571840 7:-65026449 None:intergenic
TTTGAATGGAGACTTGCTGA+TGG 0.586669 7:+65027704 MsG0780039507.01.T01:CDS
TTACTTACAAGCAGTTGTGA+AGG 0.591547 7:+65027374 MsG0780039507.01.T01:CDS
GCACACCTCAAAATCAGCAC+TGG 0.592981 7:-65026995 None:intergenic
GGAAGTGGGTATGGCCCTGG+TGG 0.594082 7:-65026304 None:intergenic
CTATGAGCTAATGGCAACCC+TGG 0.599205 7:-65027644 None:intergenic
GGCAACAATAATGGAGCTGG+TGG 0.601366 7:-65027414 None:intergenic
TTGAATGGAGACTTGCTGAT+GGG 0.604376 7:+65027705 MsG0780039507.01.T01:CDS
AGCTGGTGGGTGCAACCGAA+GGG 0.605832 7:-65027400 None:intergenic
TGAATTGAGCCGCAATGAGA+TGG 0.608595 7:+65027074 MsG0780039507.01.T01:CDS
ACAGTTTCATCACATTTATG+GGG 0.611545 7:-65027435 None:intergenic
ATGACAAATTCTCAGTTGGG+TGG 0.619479 7:+65026536 MsG0780039507.01.T01:CDS
TGTTTCCTATGATGGGAAGT+GGG 0.626149 7:-65026318 None:intergenic
GAGAATGGTTGCACACAAAG+AGG 0.632528 7:-65026233 None:intergenic
CAGGCAAAAGAATTTGTCCA+GGG 0.645023 7:+65027627 MsG0780039507.01.T01:CDS
GTTACATGGAAGCAGCTGGT+AGG 0.645262 7:+65026836 MsG0780039507.01.T01:CDS
AATTCTACTAAACTTCCACC+AGG 0.649234 7:+65026289 MsG0780039507.01.T01:CDS
GCAACAATAATGGAGCTGGT+GGG 0.654501 7:-65027413 None:intergenic
CACGATTGAATGGATTATGG+CGG 0.669982 7:+65027248 MsG0780039507.01.T01:CDS
TCAACTGCACTAAGTGCATG+TGG 0.687730 7:-65026511 None:intergenic
AAAGATGCACCATCTCATTG+CGG 0.717333 7:-65027083 None:intergenic
ATTCTACTAAACTTCCACCA+GGG 0.752369 7:+65026290 MsG0780039507.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAGTTAAATTTAATTGAACT+TGG + Chr7:65027172-65027191 MsG0780039507.01.T01:intron 15.0%
!!! GTTCAATTAAATTTAACTTA+TGG - Chr7:65027171-65027190 None:intergenic 15.0%
!! CTTAATAGCAACAATATTAT+TGG + Chr7:65027039-65027058 MsG0780039507.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGTTGTGTGATATTTTTAA+TGG + Chr7:65026940-65026959 MsG0780039507.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACACAACTTTTTTATACAAT+TGG - Chr7:65026929-65026948 None:intergenic 20.0%
!!! TTACTTTTGTTAATTTGTCA+GGG - Chr7:65027287-65027306 None:intergenic 20.0%
! AAGAGATTCAATCATCTTTA+GGG - Chr7:65027774-65027793 None:intergenic 25.0%
! AAGAGTTTGAGAACATTATT+TGG + Chr7:65026812-65026831 MsG0780039507.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAAAGTTGCAAGAATTAT+TGG + Chr7:65026654-65026673 MsG0780039507.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAATATTAGTCAATGTGT+GGG + Chr7:65027491-65027510 MsG0780039507.01.T01:intron 25.0%
! AGTTCTATTAGAGAAGATTT+GGG - Chr7:65026488-65026507 None:intergenic 25.0%
!! ACATATCTGAATTTTCCAAA+TGG - Chr7:65027535-65027554 None:intergenic 25.0%
!! ACTAATATTTGTGCATGTTT+TGG - Chr7:65027483-65027502 None:intergenic 25.0%
!! ATAATTCTTGCAACTTTTGT+TGG - Chr7:65026654-65026673 None:intergenic 25.0%
!! TGGAAGTTTAGTAGAATTTT+GGG - Chr7:65026287-65026306 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTCATGTAAGGTTTGTT+TGG - Chr7:65026464-65026483 None:intergenic 25.0%
!!! CACTTTGTTTTCTATTGATT+TGG + Chr7:65026762-65026781 MsG0780039507.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTACTTTTGTTAATTTGTC+AGG - Chr7:65027288-65027307 None:intergenic 25.0%
!!! TTGGAAATGATGTTTTTGTT+AGG + Chr7:65027191-65027210 MsG0780039507.01.T01:intron 25.0%
ACAAAACTCTCACAAAACTA+TGG + Chr7:65026376-65026395 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
ACAGTTTCATCACATTTATG+GGG - Chr7:65027438-65027457 None:intergenic 30.0%
ATAGGAAACATCTTAGAACT+TGG + Chr7:65026331-65026350 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
ATCATGACAAATTCTCAGTT+GGG + Chr7:65026533-65026552 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATATGAAGGAGCAATT+TGG + Chr7:65027743-65027762 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
CACAAATATTAGTCAATGTG+TGG + Chr7:65027490-65027509 MsG0780039507.01.T01:intron 30.0%
CACAGTTTCATCACATTTAT+GGG - Chr7:65027439-65027458 None:intergenic 30.0%
CAGTTCTATTAGAGAAGATT+TGG - Chr7:65026489-65026508 None:intergenic 30.0%
GAAGAGATTCAATCATCTTT+AGG - Chr7:65027775-65027794 None:intergenic 30.0%
GAGTGTGACATTAAGTATAT+GGG + Chr7:65027575-65027594 MsG0780039507.01.T01:intron 30.0%
GTGAATGAAAAATGCAACAA+AGG + Chr7:65026682-65026701 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
TCACAGTTTCATCACATTTA+TGG - Chr7:65027440-65027459 None:intergenic 30.0%
TCTAAGAATAAAGACGAGAA+TGG - Chr7:65026251-65026270 None:intergenic 30.0%
TGAAAAAGATGAAACAGTTG+AGG + Chr7:65027329-65027348 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
TGCTTGTAAGTAAGGTAATT+TGG - Chr7:65027367-65027386 None:intergenic 30.0%
TTAACTTATGGTAACAGAAG+AGG - Chr7:65027159-65027178 None:intergenic 30.0%
! AAAGGTGAGGTTTTTGATAT+TGG + Chr7:65026700-65026719 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
! AATTTTGAGCTTATACCGTT+TGG + Chr7:65027602-65027621 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTGAATTTTCCAAATGGT+TGG - Chr7:65027531-65027550 None:intergenic 30.0%
! GAACATTATTTGGAGTTACA+TGG + Chr7:65026822-65026841 MsG0780039507.01.T01:CDS 30.0%
! GATTTGGGAATTTTCATGTA+AGG - Chr7:65026473-65026492 None:intergenic 30.0%
! GGAAAGAAATCTGAAACATT+AGG - Chr7:65026862-65026881 None:intergenic 30.0%
! GTGGAAGTTTAGTAGAATTT+TGG - Chr7:65026288-65026307 None:intergenic 30.0%
! GTTTATGCCTGAAAGATTTT+TGG + Chr7:65027553-65027572 MsG0780039507.01.T01:intron 30.0%
! TCTAAGATGTTTCCTATGAT+GGG - Chr7:65026328-65026347 None:intergenic 30.0%
!! TAATCACTAGTAGAAGTGTT+TGG - Chr7:65026213-65026232 None:intergenic 30.0%
!! TTCTAAGATGTTTCCTATGA+TGG - Chr7:65026329-65026348 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTAGTAGAATTTTGGGTT+TGG - Chr7:65026282-65026301 None:intergenic 30.0%
!!! TGTTGCTTTTTCATTGCATA+TGG + Chr7:65027116-65027135 MsG0780039507.01.T01:intron 30.0%
AATTCTACTAAACTTCCACC+AGG + Chr7:65026289-65026308 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGGCAAAAATCCACATA+AGG + Chr7:65026348-65026367 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
ATTCTACTAAACTTCCACCA+GGG + Chr7:65026290-65026309 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
CATTTATGGGGCAACAATAA+TGG - Chr7:65027426-65027445 None:intergenic 35.0%
CCAATCATGACACTAAAACT+AGG + Chr7:65026400-65026419 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
CCATTCAAATTTGCGTAGAA+GGG - Chr7:65027693-65027712 None:intergenic 35.0%
GATCATGACAAATTCTCAGT+TGG + Chr7:65026532-65026551 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
GATGAAACTGTGAGCATATT+AGG + Chr7:65027447-65027466 MsG0780039507.01.T01:intron 35.0%
GGAGTGTGACATTAAGTATA+TGG + Chr7:65027574-65027593 MsG0780039507.01.T01:intron 35.0%
TCACACTCCAAAAATCTTTC+AGG - Chr7:65027563-65027582 None:intergenic 35.0%
TCCATTCAAATTTGCGTAGA+AGG - Chr7:65027694-65027713 None:intergenic 35.0%
TCCTTCATATTCATGTCTTC+TGG - Chr7:65027737-65027756 None:intergenic 35.0%
TGAAAAATGCAACAAAGGTG+AGG + Chr7:65026687-65026706 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
TTACTTACAAGCAGTTGTGA+AGG + Chr7:65027374-65027393 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
TTCACAACTGCTTGTAAGTA+AGG - Chr7:65027375-65027394 None:intergenic 35.0%
TTCTTCCACAAAGCTAATGT+TGG - Chr7:65026565-65026584 None:intergenic 35.0%
TTGTGGGGATGAAATTACTA+TGG - Chr7:65026437-65026456 None:intergenic 35.0%
! AACTCTTGAGACTTTTCATC+AGG - Chr7:65026799-65026818 None:intergenic 35.0%
! TGAGGTTTTTGATATTGGTG+AGG + Chr7:65026705-65026724 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCACGATTGAATGGATTA+TGG + Chr7:65027245-65027264 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
!! TAGCTTTGTGGAAGAAACTA+AGG + Chr7:65026569-65026588 MsG0780039507.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCTAGTTTTAGTGTCATGAT+TGG - Chr7:65026403-65026422 None:intergenic 35.0%
AAAGATGCACCATCTCATTG+CGG - Chr7:65027086-65027105 None:intergenic 40.0%
ATGACAAATTCTCAGTTGGG+TGG + Chr7:65026536-65026555 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
CAACATCAAGCACGATTGAA+TGG + Chr7:65027238-65027257 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
CAGGCAAAAGAATTTGTCCA+GGG + Chr7:65027627-65027646 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
CCCTTCTACGCAAATTTGAA+TGG + Chr7:65027690-65027709 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
GCCAGAAGACATGAATATGA+AGG + Chr7:65027733-65027752 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
GGATCAAAAGGACGAAGAAT+TGG - Chr7:65026883-65026902 None:intergenic 40.0%
TGCATAGTCCTATGAGCTAA+TGG - Chr7:65027656-65027675 None:intergenic 40.0%
! AAGGTTTGTTTGGCTAGTTG+TGG - Chr7:65026454-65026473 None:intergenic 40.0%
! AGGTTTGTTTGGCTAGTTGT+GGG - Chr7:65026453-65026472 None:intergenic 40.0%
! ATGTTTCCTATGATGGGAAG+TGG - Chr7:65026322-65026341 None:intergenic 40.0%
! ATTCTTTTGCCTGCTCCAAA+CGG - Chr7:65027620-65027639 None:intergenic 40.0%
! TGAGATGGTGCATCTTTTTC+TGG + Chr7:65027089-65027108 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTAGGATTTGTTCGTTGC+TGG + Chr7:65027207-65027226 MsG0780039507.01.T01:intron 40.0%
! TGTTTCCTATGATGGGAAGT+GGG - Chr7:65026321-65026340 None:intergenic 40.0%
! TTGAGACTTTTCATCAGGTG+TGG - Chr7:65026794-65026813 None:intergenic 40.0%
!! AGTTTTGTGAGTGCCTTATG+TGG - Chr7:65026364-65026383 None:intergenic 40.0%
!! CACGATTGAATGGATTATGG+CGG + Chr7:65027248-65027267 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGAATGGAGACTTGCTGAT+GGG + Chr7:65027705-65027724 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGAATGGAGACTTGCTGA+TGG + Chr7:65027704-65027723 MsG0780039507.01.T01:CDS 40.0%
AATGGTTGGATCTCTTCCCA+TGG - Chr7:65027517-65027536 None:intergenic 45.0%
ATCTTTGCATGCACACCTTG+TGG - Chr7:65026904-65026923 None:intergenic 45.0%
ATTAGTCAATGTGTGGGCCA+TGG + Chr7:65027497-65027516 MsG0780039507.01.T01:intron 45.0%
CAGTTGTGAAGGAAACCCTT+CGG + Chr7:65027385-65027404 MsG0780039507.01.T01:CDS 45.0%
GAGAATGGTTGCACACAAAG+AGG - Chr7:65026236-65026255 None:intergenic 45.0%
GCAGGCAAAAGAATTTGTCC+AGG + Chr7:65027626-65027645 MsG0780039507.01.T01:CDS 45.0%
TCAACTGCACTAAGTGCATG+TGG - Chr7:65026514-65026533 None:intergenic 45.0%
TGAATTGAGCCGCAATGAGA+TGG + Chr7:65027074-65027093 MsG0780039507.01.T01:CDS 45.0%
TGCACACCTTGTGGATCAAA+AGG - Chr7:65026895-65026914 None:intergenic 45.0%
TGGGAAGAGATCCAACCATT+TGG + Chr7:65027517-65027536 MsG0780039507.01.T01:intron 45.0%
TTAGTCAATGTGTGGGCCAT+GGG + Chr7:65027498-65027517 MsG0780039507.01.T01:intron 45.0%
! CTTCGTCCTTTTGATCCACA+AGG + Chr7:65026886-65026905 MsG0780039507.01.T01:CDS 45.0%
! CTTGCAACTTTTGTTGGCGA+AGG - Chr7:65026648-65026667 None:intergenic 45.0%
! GCAACAATAATGGAGCTGGT+GGG - Chr7:65027416-65027435 None:intergenic 45.0%
! GGTTTGTTTGGCTAGTTGTG+GGG - Chr7:65026452-65026471 None:intergenic 45.0%
!! GGCTTCCAACATTAGCTTTG+TGG + Chr7:65026557-65026576 MsG0780039507.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGCTTCCAGTGCTGATTTTG+AGG + Chr7:65026990-65027009 MsG0780039507.01.T01:CDS 45.0%
CAGGGTTGCCATTAGCTCAT+AGG + Chr7:65027645-65027664 MsG0780039507.01.T01:CDS 50.0%
CCATACCCACTTCCCATCAT+AGG + Chr7:65026313-65026332 MsG0780039507.01.T01:CDS 50.0%
CTATGAGCTAATGGCAACCC+TGG - Chr7:65027647-65027666 None:intergenic 50.0%
GCACACCTCAAAATCAGCAC+TGG - Chr7:65026998-65027017 None:intergenic 50.0%
GTTACATGGAAGCAGCTGGT+AGG + Chr7:65026836-65026855 MsG0780039507.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGTTACATGGAAGCAGC+TGG + Chr7:65026832-65026851 MsG0780039507.01.T01:CDS 50.0%
! CCTATGATGGGAAGTGGGTA+TGG - Chr7:65026316-65026335 None:intergenic 50.0%
! GAGCTTATACCGTTTGGAGC+AGG + Chr7:65027608-65027627 MsG0780039507.01.T01:CDS 50.0%
! GGCAACAATAATGGAGCTGG+TGG - Chr7:65027417-65027436 None:intergenic 50.0%
! TGGGGCAACAATAATGGAGC+TGG - Chr7:65027420-65027439 None:intergenic 50.0%
ATGGGAAGTGGGTATGGCCC+TGG - Chr7:65026310-65026329 None:intergenic 60.0%
! AGCTGGTGGGTGCAACCGAA+GGG - Chr7:65027403-65027422 None:intergenic 60.0%
GGAAGTGGGTATGGCCCTGG+TGG - Chr7:65026307-65026326 None:intergenic 65.0%
! GAGCTGGTGGGTGCAACCGA+AGG - Chr7:65027404-65027423 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 65026202 65027820 65026202 ID=MsG0780039507.01;Name=MsG0780039507.01
Chr7 mRNA 65026202 65027820 65026202 ID=MsG0780039507.01.T01;Parent=MsG0780039507.01;Name=MsG0780039507.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.50;_QI=0|0|0|1|0.5|0.33|3|0|464
Chr7 exon 65026202 65027110 65026202 ID=MsG0780039507.01.T01:exon:10141;Parent=MsG0780039507.01.T01
Chr7 exon 65027213 65027455 65027213 ID=MsG0780039507.01.T01:exon:10142;Parent=MsG0780039507.01.T01
Chr7 exon 65027578 65027820 65027578 ID=MsG0780039507.01.T01:exon:10143;Parent=MsG0780039507.01.T01
Chr7 CDS 65026202 65027110 65026202 ID=MsG0780039507.01.T01:cds;Parent=MsG0780039507.01.T01
Chr7 CDS 65027213 65027455 65027213 ID=MsG0780039507.01.T01:cds;Parent=MsG0780039507.01.T01
Chr7 CDS 65027578 65027820 65027578 ID=MsG0780039507.01.T01:cds;Parent=MsG0780039507.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039507.01.T01

ATGGACTACCAAACACTTCTACTAGTGATTACCTCTTTGTGTGCAACCATTCTCGTCTTTATTCTTAGAAAATTAAACCAAACCCAAAATTCTACTAAACTTCCACCAGGGCCATACCCACTTCCCATCATAGGAAACATCTTAGAACTTGGCAAAAATCCACATAAGGCACTCACAAAACTCTCACAAAACTATGGACCAATCATGACACTAAAACTAGGAACAATAACAACCATAGTAATTTCATCCCCACAACTAGCCAAACAAACCTTACATGAAAATTCCCAAATCTTCTCTAATAGAACTGTTCCACATGCACTTAGTGCAGTTGATCATGACAAATTCTCAGTTGGGTGGCTTCCAACATTAGCTTTGTGGAAGAAACTAAGGAAAAGTTGCGCTACAAAAGTATTTTCTACAAAAATGCTTCACTCAACAAATATCCTTCGCCAACAAAAGTTGCAAGAATTATTGGATTATGTGAATGAAAAATGCAACAAAGGTGAGGTTTTTGATATTGGTGAGGCTGTTTTTAACACTGTTTTTAATTCAATTTCAAACACTTTGTTTTCTATTGATTTGGCTAATTCCACACCTGATGAAAAGTCTCAAGAGTTTGAGAACATTATTTGGAGTTACATGGAAGCAGCTGGTAGGCCTAATGTTTCAGATTTCTTTCCAATTCTTCGTCCTTTTGATCCACAAGGTGTGCATGCAAAGATGACCAATTGTATAAAAAAGTTGTGTGATATTTTTAATGGAATTATTGAAGAAAGAATTTGTTCAAGAGCTTCCAGTGCTGATTTTGAGGTGTGCAATGATGTGTTAGATTCACTTCTTAATAGCAACAATATTATTGGAGAAAGCACTTCTGAATTGAGCCGCAATGAGATGGTGCATCTTTTTCTGGATTTGTTCGTTGCTGGTATTGACACAACATCAAGCACGATTGAATGGATTATGGCGGAGCTATTACGTAACCCTGACAAATTAACAAAAGTAAGAAAAGAGTTATGTCAAGCAATTGAAAAAGATGAAACAGTTGAGGAATCAAATATTTCCAAATTACCTTACTTACAAGCAGTTGTGAAGGAAACCCTTCGGTTGCACCCACCAGCTCCATTATTGTTGCCCCATAAATGTGATGAAACTTGTGACATTAAGTATATGGGTAGCAATTTTGAGCTTATACCGTTTGGAGCAGGCAAAAGAATTTGTCCAGGGTTGCCATTAGCTCATAGGACTATGCATTTGATTGTAGCATCCCTTCTACGCAAATTTGAATGGAGACTTGCTGATGGGCTAAAGCCAGAAGACATGAATATGAAGGAGCAATTTGGAATAACCCTAAAGATGATTGAATCTCTTCGAGTTCAAGCTACTTCATCAGATTAG

Protein sequence

>MsG0780039507.01.T01

MDYQTLLLVITSLCATILVFILRKLNQTQNSTKLPPGPYPLPIIGNILELGKNPHKALTKLSQNYGPIMTLKLGTITTIVISSPQLAKQTLHENSQIFSNRTVPHALSAVDHDKFSVGWLPTLALWKKLRKSCATKVFSTKMLHSTNILRQQKLQELLDYVNEKCNKGEVFDIGEAVFNTVFNSISNTLFSIDLANSTPDEKSQEFENIIWSYMEAAGRPNVSDFFPILRPFDPQGVHAKMTNCIKKLCDIFNGIIEERICSRASSADFEVCNDVLDSLLNSNNIIGESTSELSRNEMVHLFLDLFVAGIDTTSSTIEWIMAELLRNPDKLTKVRKELCQAIEKDETVEESNISKLPYLQAVVKETLRLHPPAPLLLPHKCDETCDIKYMGSNFELIPFGAGKRICPGLPLAHRTMHLIVASLLRKFEWRLADGLKPEDMNMKEQFGITLKMIESLRVQATSSD*