AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039508.01


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MsG0780039508.01.T01 AT1G13100 30.248 443 280 9 43 470 37 465 8.23e-60 205
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MsG0780039508.01.T01 AT3G20120 33.067 375 233 9 129 496 1 364 2.53e-57 195
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MsG0780039508.01.T01 AT3G20080 29.351 385 252 7 129 504 1 374 1.48e-45 164
MsG0780039508.01.T01 AT3G20080 29.351 385 252 7 129 504 1 374 1.48e-45 164
MsG0780039508.01.T01 AT3G20080 29.351 385 252 7 129 504 1 374 1.48e-45 164
MsG0780039508.01.T01 AT2G12190 28.144 501 317 16 26 500 24 507 4.31e-45 166
MsG0780039508.01.T01 AT5G61320 26.739 460 296 11 55 501 55 486 2.78e-43 160
MsG0780039508.01.T01 AT4G20240 25.926 405 286 6 28 428 27 421 1.19e-42 157
MsG0780039508.01.T01 AT1G16410 24.897 486 341 10 6 470 16 498 1.08e-40 154
MsG0780039508.01.T01 AT4G13310 27.248 367 255 7 34 396 32 390 1.66e-39 147
MsG0780039508.01.T01 AT1G64900 28.125 480 309 14 41 500 38 501 1.14e-37 145
MsG0780039508.01.T01 AT3G20935 36.792 212 123 4 299 504 130 336 3.18e-37 140
MsG0780039508.01.T01 AT5G35917 25.602 457 273 13 34 469 42 452 5.08e-37 143
MsG0780039508.01.T01 AT1G16400 24.449 499 334 11 3 470 11 497 2.03e-36 142
MsG0780039508.01.T01 AT4G20240 26.525 377 262 6 28 401 27 391 5.40e-34 132
MsG0780039508.01.T01 AT3G53290 28.307 378 238 7 126 497 50 400 1.26e-33 132
MsG0780039508.01.T01 AT5G24960 27.441 379 265 5 25 400 23 394 6.39e-33 130
MsG0780039508.01.T01 AT3G53305 43.704 135 71 1 353 487 187 316 7.42e-26 108
MsG0780039508.01.T01 AT3G61035 30.741 270 162 10 43 305 51 302 9.71e-26 108
MsG0780039508.01.T01 AT1G16410 24.257 404 283 10 6 391 16 414 9.85e-26 109
MsG0780039508.01.T01 AT2G25160 25.450 389 269 12 1 374 1 383 4.37e-25 107
MsG0780039508.01.T01 AT1G31800 25.000 460 301 18 65 500 139 578 9.86e-25 108
MsG0780039508.01.T01 AT3G25180 27.960 397 256 13 3 382 5 388 6.36e-24 104
MsG0780039508.01.T01 AT2G44890 22.247 454 317 13 42 472 42 482 1.20e-23 104
MsG0780039508.01.T01 AT2G45510 25.479 365 246 10 126 472 126 482 6.34e-23 102
MsG0780039508.01.T01 AT3G53130 25.416 421 277 16 58 459 101 503 4.50e-22 99.8
MsG0780039508.01.T01 AT4G15110 25.435 460 264 17 65 467 110 547 6.10e-22 99.8
MsG0780039508.01.T01 AT1G11680 23.975 488 310 15 4 470 11 458 1.83e-21 97.8
MsG0780039508.01.T01 AT3G26125 23.577 369 249 9 126 466 138 501 3.63e-21 97.1
MsG0780039508.01.T01 AT2G44890 22.517 453 299 15 42 472 42 464 4.93e-20 93.6
MsG0780039508.01.T01 AT3G14680 23.833 407 280 11 73 470 100 485 1.96e-19 91.7
MsG0780039508.01.T01 AT3G14620 25.943 424 265 15 65 470 96 488 3.14e-19 90.9
MsG0780039508.01.T01 AT1G63710 21.947 524 352 15 1 489 1 502 4.42e-19 90.5
MsG0780039508.01.T01 AT3G14630 24.038 416 288 12 63 470 86 481 4.54e-19 90.5
MsG0780039508.01.T01 AT5G38450 24.606 508 330 13 6 475 2 494 4.88e-19 90.5
MsG0780039508.01.T01 AT3G14630 23.981 417 289 12 63 471 141 537 6.07e-19 90.5
MsG0780039508.01.T01 AT1G24540 22.004 459 318 13 37 466 42 489 6.48e-19 90.1
MsG0780039508.01.T01 AT2G23180 24.936 389 234 15 126 477 125 492 9.84e-19 89.7
MsG0780039508.01.T01 AT1G19630 22.524 515 338 19 1 497 1 472 1.75e-18 88.6
MsG0780039508.01.T01 AT3G14660 24.631 406 278 11 73 470 100 485 2.62e-18 88.2
MsG0780039508.01.T01 AT3G14690 23.810 420 290 11 60 470 122 520 4.25e-18 87.8
MsG0780039508.01.T01 AT3G13730 24.638 483 300 18 33 492 50 491 4.84e-18 87.4
MsG0780039508.01.T01 AT3G14690 24.038 416 286 11 60 466 87 481 5.72e-18 87.0
MsG0780039508.01.T01 AT3G14650 24.816 407 276 12 73 470 100 485 6.66e-18 87.0
MsG0780039508.01.T01 AT5G35920 35.714 112 70 1 360 469 6 117 6.72e-18 81.3
MsG0780039508.01.T01 AT1G13150 24.044 366 243 11 126 466 131 486 1.03e-17 86.3
MsG0780039508.01.T01 AT1G47620 27.500 240 153 9 258 477 257 495 1.40e-17 85.9
MsG0780039508.01.T01 AT4G39510 29.880 251 163 7 255 497 255 500 1.69e-17 85.5
MsG0780039508.01.T01 AT5G02900 25.974 385 247 14 126 497 115 474 1.94e-17 85.5
MsG0780039508.01.T01 AT3G14640 23.342 407 284 10 73 470 100 487 2.95e-17 85.1
MsG0780039508.01.T01 AT3G14640 23.342 407 284 10 73 470 122 509 3.26e-17 84.7
MsG0780039508.01.T01 AT1G13140 24.044 366 243 13 126 466 138 493 3.67e-17 84.7
MsG0780039508.01.T01 AT3G14660 25.714 315 214 8 161 470 40 339 3.74e-17 83.6
MsG0780039508.01.T01 AT4G00360 21.748 515 341 17 1 477 1 491 4.11e-17 84.7
MsG0780039508.01.T01 AT2G46960 23.261 460 310 16 54 495 83 517 4.21e-17 84.3
MsG0780039508.01.T01 AT5G52400 29.218 243 156 7 240 475 264 497 6.63e-17 84.0
MsG0780039508.01.T01 AT2G46960 27.200 250 171 7 253 495 156 401 7.22e-17 83.2
MsG0780039508.01.T01 AT2G46950 23.333 480 336 14 17 487 107 563 9.53e-17 83.6
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MsG0780039508.01.T01 AT1G57750 23.352 364 256 12 126 477 124 476 9.83e-17 83.2
MsG0780039508.01.T01 AT4G27710 22.868 516 344 14 6 487 15 510 1.27e-16 83.2
MsG0780039508.01.T01 AT3G13730 25.219 456 279 17 33 467 50 464 1.40e-16 82.8
MsG0780039508.01.T01 AT4G39490 24.444 270 167 9 236 477 236 496 4.11e-16 81.3
MsG0780039508.01.T01 AT1G01600 26.667 270 183 7 222 477 225 493 6.38e-16 80.9
MsG0780039508.01.T01 AT1G65340 28.729 181 120 5 301 477 308 483 9.88e-16 80.1
MsG0780039508.01.T01 AT5G52320 24.444 315 203 12 181 475 181 480 1.01e-15 80.1
MsG0780039508.01.T01 AT5G52320 24.444 315 203 12 181 475 181 480 1.05e-15 80.1
MsG0780039508.01.T01 AT2G26710 22.595 447 301 12 40 471 73 489 1.18e-15 80.1
MsG0780039508.01.T01 AT1G34540 23.362 458 302 16 37 466 30 466 1.70e-15 79.3
MsG0780039508.01.T01 AT1G13090 26.768 198 142 2 33 229 27 222 2.63e-15 77.0
MsG0780039508.01.T01 AT1G69500 22.265 521 324 17 5 470 2 496 3.17e-15 78.6
MsG0780039508.01.T01 AT1G13140 22.563 359 231 9 126 466 138 467 4.58e-15 78.2
MsG0780039508.01.T01 AT3G14610 25.726 241 174 4 232 470 248 485 4.58e-15 78.2
MsG0780039508.01.T01 AT5G58860 25.506 247 163 6 265 497 264 503 9.59e-15 77.0
MsG0780039508.01.T01 AT5G23190 19.914 467 321 15 50 477 68 520 2.06e-14 76.3
MsG0780039508.01.T01 AT4G19230 23.493 481 296 18 8 468 6 434 3.53e-14 75.1
MsG0780039508.01.T01 AT3G50660 28.700 223 139 5 265 472 272 489 5.93e-14 74.7
MsG0780039508.01.T01 AT5G24900 29.586 169 116 3 303 470 217 383 7.28e-14 73.9
MsG0780039508.01.T01 AT3G19270 26.022 269 181 9 210 470 182 440 8.94e-14 73.9
MsG0780039508.01.T01 AT5G24900 21.256 414 308 7 65 470 97 500 1.05e-13 73.9
MsG0780039508.01.T01 AT4G32170 22.343 367 262 10 126 476 123 482 1.12e-13 73.9
MsG0780039508.01.T01 AT1G55940 22.449 490 321 20 5 472 17 469 1.31e-13 73.6
MsG0780039508.01.T01 AT5G63450 20.248 484 348 13 5 467 64 530 1.57e-13 73.6
MsG0780039508.01.T01 AT5G63450 20.248 484 348 13 5 467 6 472 1.69e-13 73.2
MsG0780039508.01.T01 AT3G01900 22.944 462 304 15 29 467 28 460 2.11e-13 72.8
MsG0780039508.01.T01 AT2G21910 26.432 227 161 5 257 477 260 486 6.06e-13 71.6
MsG0780039508.01.T01 AT1G55940 22.521 484 316 20 5 466 17 463 8.23e-13 70.9
MsG0780039508.01.T01 AT2G26170 24.885 217 157 5 254 466 274 488 8.54e-13 70.9
MsG0780039508.01.T01 AT2G45970 28.796 191 122 3 301 477 300 490 1.40e-12 70.5
MsG0780039508.01.T01 AT5G05690 26.842 190 132 4 291 476 263 449 1.61e-12 70.1
MsG0780039508.01.T01 AT5G24910 28.902 173 114 4 302 470 338 505 1.78e-12 70.1
MsG0780039508.01.T01 AT2G32440 21.429 476 312 16 17 467 20 458 2.63e-12 69.3
MsG0780039508.01.T01 AT2G32440 21.429 476 312 16 17 467 20 458 2.63e-12 69.3
MsG0780039508.01.T01 AT1G58265 35.644 101 58 3 390 483 9 109 7.35e-12 63.9
MsG0780039508.01.T01 AT4G20235 31.061 132 73 3 341 468 211 328 1.33e-11 66.2
MsG0780039508.01.T01 AT5G45340 26.160 237 150 9 246 475 226 444 1.43e-11 67.0
MsG0780039508.01.T01 AT1G57750 23.270 318 222 11 126 432 124 430 9.35e-11 64.3

Find 91 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 139 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTTCAGGCATGAACATATT+TGG 0.126014 7:-65034189 None:intergenic
AAGAGTTTGGAAACATTATT+TGG 0.148742 7:+65033158 MsG0780039508.01.T01:CDS
TGAGATGTTGCATCTGTTTC+TGG 0.159699 7:+65033429 MsG0780039508.01.T01:CDS
ACAAAAGTTGCAAGAATTAA+TGG 0.170134 7:+65033000 MsG0780039508.01.T01:CDS
AGGACTTGTTTGGCTAGTTT+TGG 0.195421 7:-65032797 None:intergenic
ATGAATATGGAAGAGCAATT+TGG 0.227590 7:+65034387 MsG0780039508.01.T01:CDS
ACATAAATTCTTCATGTAAT+TGG 0.239465 7:-65033272 None:intergenic
CACTTTGTTCTCTATAGATT+TGG 0.255206 7:+65033108 MsG0780039508.01.T01:CDS
GGATAGAAATCTGAAATATT+AGG 0.259972 7:-65033205 None:intergenic
GGAGTGTGACATTAATTATA+AGG 0.261221 7:+65034218 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATGGATTATGTGAAAGAAAA+AGG 0.263642 7:+65033019 MsG0780039508.01.T01:CDS
GATGAAATTGTGAACATATT+AGG 0.267744 7:+65034090 MsG0780039508.01.T01:CDS
CTTCTCAATAACTACAATAT+TGG 0.289160 7:+65033379 MsG0780039508.01.T01:CDS
GATGAAAAGTCTAAAGAGTT+TGG 0.313340 7:+65033145 MsG0780039508.01.T01:CDS
ACAAAACTCTCAAACATCTA+TGG 0.317360 7:+65032722 MsG0780039508.01.T01:CDS
TCCATTCAAAGTTGCGTAGA+AGG 0.327684 7:-65034335 None:intergenic
CCTATGATGGGAAGTGGCTT+TGG 0.333426 7:-65032659 None:intergenic
CAGGATTGCCATTGGCTCAT+AGG 0.335339 7:+65034289 MsG0780039508.01.T01:CDS
CCCTTCTACGCAACTTTGAA+TGG 0.341574 7:+65034334 MsG0780039508.01.T01:CDS
TTCTAAGATGTTTCCTATGA+TGG 0.351202 7:-65032672 None:intergenic
CACAATTTCATCACATTTGT+GGG 0.356238 7:-65034079 None:intergenic
TGTTAGGATTTATTTGTTGC+CGG 0.358322 7:+65033850 MsG0780039508.01.T01:intron
TTGTTCTATTAGAGAAGATT+TGG 0.367014 7:-65032832 None:intergenic
AGAGTTTGGAAACATTATTT+GGG 0.373757 7:+65033159 MsG0780039508.01.T01:CDS
TGAATATGGAAGAGCAATTT+GGG 0.375572 7:+65034388 MsG0780039508.01.T01:CDS
CCTTGATGATGTGTCAATTC+CGG 0.381920 7:-65033869 None:intergenic
AAGGACGATTGAGTGGATTA+TGG 0.395379 7:+65033888 MsG0780039508.01.T01:CDS
CTATGAGCCAATGGCAATCC+TGG 0.397888 7:-65034288 None:intergenic
CCAAAGCCACTTCCCATCAT+AGG 0.398216 7:+65032659 MsG0780039508.01.T01:CDS
AAAGCTAGAAGACATGAATA+TGG 0.398898 7:+65034374 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATTACAAACCTCATCAGCTT+TGG 0.406492 7:-65033341 None:intergenic
TGGGAAGAGACCCAACCGTT+TGG 0.407099 7:+65034160 MsG0780039508.01.T01:CDS
GGATCGAAGGGACGAAGAAT+TGG 0.417332 7:-65033226 None:intergenic
CGCAACTTTGAATGGACACT+TGG 0.428234 7:+65034342 MsG0780039508.01.T01:CDS
GTTTCTTCCACGGTGTTGAC+AGG 0.434934 7:-65032910 None:intergenic
GAGTGTGACATTAATTATAA+GGG 0.435068 7:+65034219 MsG0780039508.01.T01:CDS
GGGAAGAGACCCAACCGTTT+GGG 0.435226 7:+65034161 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATGGGAAGTGGCTTTGGCCC+TGG 0.440845 7:-65032653 None:intergenic
AAACATTATTTGGGGTATCA+TGG 0.441591 7:+65033168 MsG0780039508.01.T01:CDS
TCACAATTTCATCACATTTG+TGG 0.447884 7:-65034080 None:intergenic
AGGATTGCCATTGGCTCATA+GGG 0.449542 7:+65034290 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATCTTTGCCTGCACACCTTG+TGG 0.451753 7:-65033247 None:intergenic
AAAGAGTTATGTGAAGCAAT+TGG 0.466964 7:+65033952 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATTAGTCAATGTGTGGGCCA+TGG 0.490293 7:+65034140 MsG0780039508.01.T01:CDS
GAACTTATTCCCTTTGGGGC+AGG 0.499593 7:+65034252 MsG0780039508.01.T01:CDS
CTTCGATCCACAAGGTGTGC+AGG 0.500938 7:+65033240 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATCATAAATTCTCAATGGTA+TGG 0.502007 7:+65032882 MsG0780039508.01.T01:CDS
CCAATCATGACCCTAAAACT+AGG 0.505572 7:+65032746 MsG0780039508.01.T01:CDS
AACGGTTGGGTCTCTTCCCA+TGG 0.509255 7:-65034157 None:intergenic
TCTAAGATGTTTCCTATGAT+GGG 0.511254 7:-65032671 None:intergenic
ATGTTTCCTATGATGGGAAG+TGG 0.514559 7:-65032665 None:intergenic
AAATCACTAGTAGAAGTGTT+TGG 0.516316 7:-65032556 None:intergenic
TAGGGTTGTGCATTTGATTG+TGG 0.524449 7:+65034308 MsG0780039508.01.T01:CDS
TTAGTCAATGTGTGGGCCAT+GGG 0.527998 7:+65034141 MsG0780039508.01.T01:CDS
TTTCTTCCACGGTGTTGACA+GGG 0.533460 7:-65032909 None:intergenic
TTTGAATGGACACTTGGTGA+TGG 0.536826 7:+65034348 MsG0780039508.01.T01:CDS
CACAAATATTAGTCAATGTG+TGG 0.538325 7:+65034133 MsG0780039508.01.T01:CDS
CAACACCGTGGAAGAAACTT+AGG 0.541547 7:+65032915 MsG0780039508.01.T01:CDS
CTGCACACCTTGTGGATCGA+AGG 0.542061 7:-65033239 None:intergenic
GGAAGTGGCTTTGGCCCTGG+TGG 0.543838 7:-65032650 None:intergenic
CATCATCAAGGACGATTGAG+TGG 0.545992 7:+65033881 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATAGGAAACATCTTAGAACT+TGG 0.546652 7:+65032677 MsG0780039508.01.T01:CDS
AATTTGTCCAGGATTGCCAT+TGG 0.548406 7:+65034281 MsG0780039508.01.T01:CDS
TGAGCATCATAAATTCTCAA+TGG 0.551225 7:+65032877 MsG0780039508.01.T01:CDS
AAGAGCTTCCAAAGCTGATG+AGG 0.551873 7:+65033333 MsG0780039508.01.T01:CDS
AATTTGGGTTGACATTAAAG+AGG 0.554686 7:+65034403 MsG0780039508.01.T01:CDS
AAGTGTTTGAGATTGAATCA+AGG 0.554922 7:-65033090 None:intergenic
TAGAATGCTTGCACACAAAG+AGG 0.567553 7:-65032579 None:intergenic
TGGGGTATCATGGAAGAAGC+TGG 0.569364 7:+65033178 MsG0780039508.01.T01:CDS
GCAGGCAAAAGAATTTGTCC+AGG 0.572738 7:+65034270 MsG0780039508.01.T01:CDS
TAGCTTGAACTCGAAGAGGT+TGG 0.573885 7:-65034428 None:intergenic
ATTTGGGTTGACATTAAAGA+GGG 0.578037 7:+65034404 MsG0780039508.01.T01:CDS
TGCACACCTTGTGGATCGAA+GGG 0.578921 7:-65033238 None:intergenic
GGATGAAATAGCTACAAAGC+TGG 0.579972 7:-65034456 None:intergenic
CCATTCAAAGTTGCGTAGAA+GGG 0.581407 7:-65034334 None:intergenic
TGCACAACCCTATGAGCCAA+TGG 0.593958 7:-65034297 None:intergenic
CGGTTGTGAAGGAAACTCTA+CGG 0.607171 7:+65034028 MsG0780039508.01.T01:CDS
ACAAATATTAGTCAATGTGT+GGG 0.617427 7:+65034134 MsG0780039508.01.T01:CDS
TCAGTTGCATAACTAGCATG+TGG 0.621891 7:-65032857 None:intergenic
CTTCGTCCCTTCGATCCACA+AGG 0.627131 7:+65033232 MsG0780039508.01.T01:CDS
GAGTTTGGAAACATTATTTG+GGG 0.631466 7:+65033160 MsG0780039508.01.T01:CDS
ACAATTTCATCACATTTGTG+GGG 0.636020 7:-65034078 None:intergenic
ACTCTCCTAAGTTTCTTCCA+CGG 0.638651 7:-65032920 None:intergenic
AATTCTACAAAACTTCCACC+AGG 0.640538 7:+65032635 MsG0780039508.01.T01:CDS
CCGGAATTGACACATCATCA+AGG 0.640757 7:+65033869 MsG0780039508.01.T01:CDS
CAGTTGCATAACTAGCATGT+GGG 0.649336 7:-65032856 None:intergenic
GAAATAGCTTGAACTCGAAG+AGG 0.650311 7:-65034432 None:intergenic
TTCTTCCACGGTGTTGACAG+GGG 0.653740 7:-65032908 None:intergenic
CAATATTGGAGAAACTACAT+CGG 0.662749 7:+65033393 MsG0780039508.01.T01:CDS
GGCTTCCCCTGTCAACACCG+TGG 0.682218 7:+65032903 MsG0780039508.01.T01:CDS
ATTCTACAAAACTTCCACCA+GGG 0.728357 7:+65032636 MsG0780039508.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAATAGTAATTAATCAT+TGG - Chr7:65033469-65033488 None:intergenic 10.0%
!! ATTTAATTGAATTTGGAAAT+TGG + Chr7:65033822-65033841 MsG0780039508.01.T01:intron 15.0%
!!! AATTTATGTGATATTTTTGA+TGG + Chr7:65033286-65033305 MsG0780039508.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATAAATTCTTCATGTAAT+TGG - Chr7:65033275-65033294 None:intergenic 20.0%
!! AGGACAAATTTAATTGAATT+TGG + Chr7:65033815-65033834 MsG0780039508.01.T01:intron 20.0%
!! ATTCAATTAAATTTGTCCTA+CGG - Chr7:65033814-65033833 None:intergenic 20.0%
!! TTATCTCTTAACGTTTAAAT+AGG - Chr7:65033623-65033642 None:intergenic 20.0%
! AAGAGTTTGGAAACATTATT+TGG + Chr7:65033158-65033177 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAAAGTTGCAAGAATTAA+TGG + Chr7:65033000-65033019 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAATATTAGTCAATGTGT+GGG + Chr7:65034134-65034153 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! AGAGTTTGGAAACATTATTT+GGG + Chr7:65033159-65033178 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! ATCATAAATTCTCAATGGTA+TGG + Chr7:65032882-65032901 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! CTTCTCAATAACTACAATAT+TGG + Chr7:65033379-65033398 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTGTGACATTAATTATAA+GGG + Chr7:65034219-65034238 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! GATGAAATTGTGAACATATT+AGG + Chr7:65034090-65034109 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTTCTATTAGAGAAGATT+TGG - Chr7:65032835-65032854 None:intergenic 25.0%
!! AAAGGTGAAGTTTTTGATAT+TGG + Chr7:65033046-65033065 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTTTGAACTTATTCCCTT+TGG + Chr7:65034246-65034265 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTAATATTTGTGCACTTTT+TGG - Chr7:65034126-65034145 None:intergenic 25.0%
!! ATGGATTATGTGAAAGAAAA+AGG + Chr7:65033019-65033038 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTGAACTTATTCCCTTT+GGG + Chr7:65034247-65034266 MsG0780039508.01.T01:CDS 25.0%
!! GGATAGAAATCTGAAATATT+AGG - Chr7:65033208-65033227 None:intergenic 25.0%
!! TTAATTCTTGCAACTTTTGT+TGG - Chr7:65033000-65033019 None:intergenic 25.0%
!! TTTGTTGAATCAAGCATTTT+TGG - Chr7:65032968-65032987 None:intergenic 25.0%
!!! ACCAATTTTTTTGTTTGTCT+AGG - Chr7:65033665-65033684 None:intergenic 25.0%
!!! AGATTTGGTAATTTTCTTGA+AGG - Chr7:65032820-65032839 None:intergenic 25.0%
!!! CCAATTTTTTTGTTTGTCTA+GGG - Chr7:65033664-65033683 None:intergenic 25.0%
!!! GTTTTGTAGAATTTTGAGTT+TGG - Chr7:65032628-65032647 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTATTGTTCCTAGTTTTA+GGG - Chr7:65032759-65032778 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTTATTGTTCCTAGTTTT+AGG - Chr7:65032760-65032779 None:intergenic 25.0%
AAAGAGTTATGTGAAGCAAT+TGG + Chr7:65033952-65033971 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
AAAGCTAGAAGACATGAATA+TGG + Chr7:65034374-65034393 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
AAGCGACGTATAATTTAGAA+CGG - Chr7:65033533-65033552 None:intergenic 30.0%
ACAAAACTCTCAAACATCTA+TGG + Chr7:65032722-65032741 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
ACAATTTCATCACATTTGTG+GGG - Chr7:65034081-65034100 None:intergenic 30.0%
ATAGGAAACATCTTAGAACT+TGG + Chr7:65032677-65032696 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATATGGAAGAGCAATT+TGG + Chr7:65034387-65034406 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
CAATATTGGAGAAACTACAT+CGG + Chr7:65033393-65033412 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
CACAAATATTAGTCAATGTG+TGG + Chr7:65034133-65034152 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
CACAATTTCATCACATTTGT+GGG - Chr7:65034082-65034101 None:intergenic 30.0%
CACTTTGTTCTCTATAGATT+TGG + Chr7:65033108-65033127 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
CCCTAGACAAACAAAAAAAT+TGG + Chr7:65033661-65033680 MsG0780039508.01.T01:intron 30.0%
GAGTTTGGAAACATTATTTG+GGG + Chr7:65033160-65033179 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
GATGAAAAGTCTAAAGAGTT+TGG + Chr7:65033145-65033164 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
GGAGTGTGACATTAATTATA+AGG + Chr7:65034218-65034237 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
TCACAATTTCATCACATTTG+TGG - Chr7:65034083-65034102 None:intergenic 30.0%
TGAATATGGAAGAGCAATTT+GGG + Chr7:65034388-65034407 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
TGAGCATCATAAATTCTCAA+TGG + Chr7:65032877-65032896 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
! AAACATTATTTGGGGTATCA+TGG + Chr7:65033168-65033187 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
! AAGTGTTTGAGATTGAATCA+AGG - Chr7:65033093-65033112 None:intergenic 30.0%
! CATATTTGGATTTTCCCAAA+CGG - Chr7:65034178-65034197 None:intergenic 30.0%
! TCTAAGATGTTTCCTATGAT+GGG - Chr7:65032674-65032693 None:intergenic 30.0%
! TGAAGTTTTTGATATTGGTG+AGG + Chr7:65033051-65033070 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTAGGATTTATTTGTTGC+CGG + Chr7:65033850-65033869 MsG0780039508.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGAACTTATTCCCTTTG+GGG + Chr7:65034248-65034267 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
!! AAATCACTAGTAGAAGTGTT+TGG - Chr7:65032559-65032578 None:intergenic 30.0%
!! AATTTGGGTTGACATTAAAG+AGG + Chr7:65034403-65034422 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTGGGTTGACATTAAAGA+GGG + Chr7:65034404-65034423 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTCTTGAAGGACTTGTT+TGG - Chr7:65032810-65032829 None:intergenic 30.0%
!! TTCTAAGATGTTTCCTATGA+TGG - Chr7:65032675-65032694 None:intergenic 30.0%
!! TTGGAAATTGGTGTTTTGTT+AGG + Chr7:65033834-65033853 MsG0780039508.01.T01:intron 30.0%
!!! TAAGTTGCCTTTTTTACAAG+CGG + Chr7:65034008-65034027 MsG0780039508.01.T01:CDS 30.0%
AATTCTACAAAACTTCCACC+AGG + Chr7:65032635-65032654 MsG0780039508.01.T01:CDS 35.0%
ATTACAAACCTCATCAGCTT+TGG - Chr7:65033344-65033363 None:intergenic 35.0%
ATTCTACAAAACTTCCACCA+GGG + Chr7:65032636-65032655 MsG0780039508.01.T01:CDS 35.0%
CATTTGTGGGGTAACAAAAA+TGG - Chr7:65034069-65034088 None:intergenic 35.0%
CTTTCAGGCATGAACATATT+TGG - Chr7:65034192-65034211 None:intergenic 35.0%
GTGAAAGAAAAAGGCAACAA+AGG + Chr7:65033028-65033047 MsG0780039508.01.T01:CDS 35.0%
TCACACTCCAAAAATCTTTC+AGG - Chr7:65034207-65034226 None:intergenic 35.0%
TTCACAACCGCTTGTAAAAA+AGG - Chr7:65034018-65034037 None:intergenic 35.0%
! GACGTATAATTTAGAACGGA+TGG - Chr7:65033529-65033548 None:intergenic 35.0%
! GTTCATGCCTGAAAGATTTT+TGG + Chr7:65034197-65034216 MsG0780039508.01.T01:CDS 35.0%
! GTTCTAAATTATACGTCGCT+TGG + Chr7:65033532-65033551 MsG0780039508.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTTTACAAGCGGTTGTGA+AGG + Chr7:65034017-65034036 MsG0780039508.01.T01:CDS 35.0%
AATTTGTCCAGGATTGCCAT+TGG + Chr7:65034281-65034300 MsG0780039508.01.T01:CDS 40.0%
ACTCTCCTAAGTTTCTTCCA+CGG - Chr7:65032923-65032942 None:intergenic 40.0%
CAGTTGCATAACTAGCATGT+GGG - Chr7:65032859-65032878 None:intergenic 40.0%
CCAATCATGACCCTAAAACT+AGG + Chr7:65032746-65032765 MsG0780039508.01.T01:CDS 40.0%
CCATTCAAAGTTGCGTAGAA+GGG - Chr7:65034337-65034356 None:intergenic 40.0%
GAAATAGCTTGAACTCGAAG+AGG - Chr7:65034435-65034454 None:intergenic 40.0%
TACGGTATTAGCAAAAGGTG+AGG - Chr7:65033796-65033815 None:intergenic 40.0%
TAGAATGCTTGCACACAAAG+AGG - Chr7:65032582-65032601 None:intergenic 40.0%
TAGGGTTGTGCATTTGATTG+TGG + Chr7:65034308-65034327 MsG0780039508.01.T01:CDS 40.0%
TCAGTTGCATAACTAGCATG+TGG - Chr7:65032860-65032879 None:intergenic 40.0%
TCCATTCAAAGTTGCGTAGA+AGG - Chr7:65034338-65034357 None:intergenic 40.0%
TGAGATGTTGCATCTGTTTC+TGG + Chr7:65033429-65033448 MsG0780039508.01.T01:CDS 40.0%
TGTCCTACGGTATTAGCAAA+AGG - Chr7:65033801-65033820 None:intergenic 40.0%
! ATGTTTCCTATGATGGGAAG+TGG - Chr7:65032668-65032687 None:intergenic 40.0%
! TCACCTTTTGCTAATACCGT+AGG + Chr7:65033795-65033814 MsG0780039508.01.T01:intron 40.0%
! TTGGATTTTCCCAAACGGTT+GGG - Chr7:65034173-65034192 None:intergenic 40.0%
! TTTGAATGGACACTTGGTGA+TGG + Chr7:65034348-65034367 MsG0780039508.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGGATTTTCCCAAACGGT+TGG - Chr7:65034174-65034193 None:intergenic 40.0%
!! AAGGACGATTGAGTGGATTA+TGG + Chr7:65033888-65033907 MsG0780039508.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTTTTGTGAGTGTCTTGTG+TGG - Chr7:65032710-65032729 None:intergenic 40.0%
!! CATCTGTTTCTGGTTAGTGT+TGG + Chr7:65033439-65033458 MsG0780039508.01.T01:intron 40.0%
!! CCTTGATGATGTGTCAATTC+CGG - Chr7:65033872-65033891 None:intergenic 40.0%
!!! AGGACTTGTTTGGCTAGTTT+TGG - Chr7:65032800-65032819 None:intergenic 40.0%
!!! CCTAGTTTTAGGGTCATGAT+TGG - Chr7:65032749-65032768 None:intergenic 40.0%
!!! GACTTGTTTGGCTAGTTTTG+GGG - Chr7:65032798-65032817 None:intergenic 40.0%
!!! GGACTTGTTTGGCTAGTTTT+GGG - Chr7:65032799-65032818 None:intergenic 40.0%
AAGAGCTTCCAAAGCTGATG+AGG + Chr7:65033333-65033352 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
ATTAGTCAATGTGTGGGCCA+TGG + Chr7:65034140-65034159 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
CAACACCGTGGAAGAAACTT+AGG + Chr7:65032915-65032934 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
CATCATCAAGGACGATTGAG+TGG + Chr7:65033881-65033900 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
CCCTTCTACGCAACTTTGAA+TGG + Chr7:65034334-65034353 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
CCGGAATTGACACATCATCA+AGG + Chr7:65033869-65033888 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
CGCAACTTTGAATGGACACT+TGG + Chr7:65034342-65034361 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
CGGTTGTGAAGGAAACTCTA+CGG + Chr7:65034028-65034047 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
GCAGGCAAAAGAATTTGTCC+AGG + Chr7:65034270-65034289 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
GGTAACAAAAATGGAGCTGG+TGG - Chr7:65034060-65034079 None:intergenic 45.0%
TAGCTTGAACTCGAAGAGGT+TGG - Chr7:65034431-65034450 None:intergenic 45.0%
TGGGGTAACAAAAATGGAGC+TGG - Chr7:65034063-65034082 None:intergenic 45.0%
TTAGTCAATGTGTGGGCCAT+GGG + Chr7:65034141-65034160 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
! AATTCTTTTGCCTGCCCCAA+AGG - Chr7:65034265-65034284 None:intergenic 45.0%
! ATTCTTTTGCCTGCCCCAAA+GGG - Chr7:65034264-65034283 None:intergenic 45.0%
!! AGGATTGCCATTGGCTCATA+GGG + Chr7:65034290-65034309 MsG0780039508.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTCTTCCACGGTGTTGACA+GGG - Chr7:65032912-65032931 None:intergenic 45.0%
!! AAAATAAATAAATTAATCAT+TGG - Chr7:65033493-65033512 None:intergenic 5.0%
ATCTTTGCCTGCACACCTTG+TGG - Chr7:65033250-65033269 None:intergenic 50.0%
CCAAAGCCACTTCCCATCAT+AGG + Chr7:65032659-65032678 MsG0780039508.01.T01:CDS 50.0%
CTATGAGCCAATGGCAATCC+TGG - Chr7:65034291-65034310 None:intergenic 50.0%
GGATCGAAGGGACGAAGAAT+TGG - Chr7:65033229-65033248 None:intergenic 50.0%
TGCACAACCCTATGAGCCAA+TGG - Chr7:65034300-65034319 None:intergenic 50.0%
TGCACACCTTGTGGATCGAA+GGG - Chr7:65033241-65033260 None:intergenic 50.0%
! CCTATGATGGGAAGTGGCTT+TGG - Chr7:65032662-65032681 None:intergenic 50.0%
! TGGGGTATCATGGAAGAAGC+TGG + Chr7:65033178-65033197 MsG0780039508.01.T01:CDS 50.0%
!! CAGGATTGCCATTGGCTCAT+AGG + Chr7:65034289-65034308 MsG0780039508.01.T01:CDS 50.0%
!! GAACTTATTCCCTTTGGGGC+AGG + Chr7:65034252-65034271 MsG0780039508.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTTCTTCCACGGTGTTGAC+AGG - Chr7:65032913-65032932 None:intergenic 50.0%
!! TTCTTCCACGGTGTTGACAG+GGG - Chr7:65032911-65032930 None:intergenic 50.0%
AACGGTTGGGTCTCTTCCCA+TGG - Chr7:65034160-65034179 None:intergenic 55.0%
CTGCACACCTTGTGGATCGA+AGG - Chr7:65033242-65033261 None:intergenic 55.0%
CTTCGATCCACAAGGTGTGC+AGG + Chr7:65033240-65033259 MsG0780039508.01.T01:CDS 55.0%
CTTCGTCCCTTCGATCCACA+AGG + Chr7:65033232-65033251 MsG0780039508.01.T01:CDS 55.0%
GGGAAGAGACCCAACCGTTT+GGG + Chr7:65034161-65034180 MsG0780039508.01.T01:CDS 55.0%
TGGGAAGAGACCCAACCGTT+TGG + Chr7:65034160-65034179 MsG0780039508.01.T01:CDS 55.0%
!! ATGGGAAGTGGCTTTGGCCC+TGG - Chr7:65032656-65032675 None:intergenic 60.0%
GGCTTCCCCTGTCAACACCG+TGG + Chr7:65032903-65032922 MsG0780039508.01.T01:CDS 65.0%
!! GGAAGTGGCTTTGGCCCTGG+TGG - Chr7:65032653-65032672 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 65032548 65034467 65032548 ID=MsG0780039508.01;Name=MsG0780039508.01
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Chr7 exon 65032548 65033450 65032548 ID=MsG0780039508.01.T01:exon:10144;Parent=MsG0780039508.01.T01
Chr7 exon 65033856 65034467 65033856 ID=MsG0780039508.01.T01:exon:10145;Parent=MsG0780039508.01.T01
Chr7 CDS 65032548 65033450 65032548 ID=MsG0780039508.01.T01:cds;Parent=MsG0780039508.01.T01
Chr7 CDS 65033856 65034467 65033856 ID=MsG0780039508.01.T01:cds;Parent=MsG0780039508.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039508.01.T01

ATGGAATACCAAACACTTCTACTAGTGATTTCCTCTTTGTGTGCAAGCATTCTAATCTTCATTCTTAGAAAATTAAACCAAACTCAAAATTCTACAAAACTTCCACCAGGGCCAAAGCCACTTCCCATCATAGGAAACATCTTAGAACTTGGCAAAAATCCACACAAGACACTCACAAAACTCTCAAACATCTATGGACCAATCATGACCCTAAAACTAGGAACAATAACAACAATTGTAATCTCTTCCCCAAAACTAGCCAAACAAGTCCTTCAAGAAAATTACCAAATCTTCTCTAATAGAACAATCCCACATGCTAGTTATGCAACTGAGCATCATAAATTCTCAATGGTATGGCTTCCCCTGTCAACACCGTGGAAGAAACTTAGGAGAGTTTGCGCTACAAAAGTACTCTCTCCAAAAATGCTTGATTCAACAAAAATCATTCGCCAACAAAAGTTGCAAGAATTAATGGATTATGTGAAAGAAAAAGGCAACAAAGGTGAAGTTTTTGATATTGGTGAGGCTGTTTTTACAACTGTCCTTGATTCAATCTCAAACACTTTGTTCTCTATAGATTTGGCTCATTTAACACATGATGAAAAGTCTAAAGAGTTTGGAAACATTATTTGGGGTATCATGGAAGAAGCTGGCAAGCCTAATATTTCAGATTTCTATCCAATTCTTCGTCCCTTCGATCCACAAGGTGTGCAGGCAAAGATGACCAATTACATGAAGAATTTATGTGATATTTTTGATGGAATTATTGAAGAAAGAATTTGTTCAAGAGCTTCCAAAGCTGATGAGGTTTGTAATGATGTGTTAGATTCACTTCTCAATAACTACAATATTGGAGAAACTACATCGGAATTGAGTCGCAATGAGATGTTGCATCTGTTTCTGGATTTATTTGTTGCCGGAATTGACACATCATCAAGGACGATTGAGTGGATTATGGCAGAGCTACTATGTAACTCAGACAAATTAAAAAAAGCAAGAAAAGAGTTATGTGAAGCAATTGGTAAAGATGAAACAATTGAAGAATCACATATTTTTAAGTTGCCTTTTTTACAAGCGGTTGTGAAGGAAACTCTACGGTTGCATCCACCAGCTCCATTTTTGTTACCCCACAAATGTGATGAAATTGTGAACATATTAGGTTTCAATGTGCCAAAAAGTGCACAAATATTAGTCAATGTGTGGGCCATGGGAAGAGACCCAACCGTTTGGGAAAATCCAAATATGTTCATGCCTGAAAGATTTTTGGAGTGTGACATTAATTATAAGGGTAATAATTTTGAACTTATTCCCTTTGGGGCAGGCAAAAGAATTTGTCCAGGATTGCCATTGGCTCATAGGGTTGTGCATTTGATTGTGGCATCCCTTCTACGCAACTTTGAATGGACACTTGGTGATGGATTAAAGCTAGAAGACATGAATATGGAAGAGCAATTTGGGTTGACATTAAAGAGGGTCCAACCTCTTCGAGTTCAAGCTATTTCACCAGCTTTGTAG

Protein sequence

>MsG0780039508.01.T01

MEYQTLLLVISSLCASILIFILRKLNQTQNSTKLPPGPKPLPIIGNILELGKNPHKTLTKLSNIYGPIMTLKLGTITTIVISSPKLAKQVLQENYQIFSNRTIPHASYATEHHKFSMVWLPLSTPWKKLRRVCATKVLSPKMLDSTKIIRQQKLQELMDYVKEKGNKGEVFDIGEAVFTTVLDSISNTLFSIDLAHLTHDEKSKEFGNIIWGIMEEAGKPNISDFYPILRPFDPQGVQAKMTNYMKNLCDIFDGIIEERICSRASKADEVCNDVLDSLLNNYNIGETTSELSRNEMLHLFLDLFVAGIDTSSRTIEWIMAELLCNSDKLKKARKELCEAIGKDETIEESHIFKLPFLQAVVKETLRLHPPAPFLLPHKCDEIVNILGFNVPKSAQILVNVWAMGRDPTVWENPNMFMPERFLECDINYKGNNFELIPFGAGKRICPGLPLAHRVVHLIVASLLRNFEWTLGDGLKLEDMNMEEQFGLTLKRVQPLRVQAISPAL*