AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036105.01

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MsG0780036105.01.T01 AT1G62950 27.007 274 145 8 283 503 59 330 2.91e-11 68.2
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MsG0780036105.01.T01 AT5G51350 31.395 344 233 2 45 387 213 554 6.30e-43 169
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MsG0780036105.01.T01 AT1G12460 34.012 344 201 3 45 363 127 469 7.78e-40 159
MsG0780036105.01.T01 AT1G12460 33.688 282 184 1 33 314 191 469 2.21e-36 148
MsG0780036105.01.T01 AT2G15080 36.680 518 256 8 55 505 110 622 1.27e-71 256
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MsG0780036105.01.T01 AT3G11010 33.699 365 206 8 96 435 406 759 1.88e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT3G11010 30.263 380 190 8 43 351 397 772 2.21e-32 135
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MsG0780036105.01.T01 AT4G04220 32.696 523 259 13 48 483 217 733 3.08e-47 182
MsG0780036105.01.T01 AT4G04220 35.236 403 241 8 45 435 337 731 2.93e-46 179
MsG0780036105.01.T01 AT4G04220 40.984 122 55 4 27 138 629 743 7.59e-12 69.7
MsG0780036105.01.T01 AT5G10290 28.022 546 309 14 348 866 72 560 1.31e-51 192
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MsG0780036105.01.T01 AT5G63710 47.561 82 43 0 47 128 71 152 6.77e-11 66.6
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MsG0780036105.01.T01 AT4G04570 33.623 345 208 7 529 866 280 610 1.09e-46 178
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MsG0780036105.01.T01 AT1G07390 42.017 119 62 2 30 148 829 940 1.38e-15 82.0
MsG0780036105.01.T01 AT1G07390 29.663 445 245 16 123 503 119 559 7.22e-14 76.6
MsG0780036105.01.T01 AT1G10620 35.714 294 169 6 593 873 360 646 1.82e-46 178
MsG0780036105.01.T01 AT1G16130 36.559 279 168 3 595 867 408 683 1.89e-46 179
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MsG0780036105.01.T01 AT1G29740 34.599 237 152 2 103 338 96 330 9.26e-28 121
MsG0780036105.01.T01 AT1G29740 36.017 236 130 2 44 259 133 367 2.20e-24 110
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MsG0780036105.01.T01 AT2G19210 31.929 451 255 18 445 866 415 842 4.24e-44 172
MsG0780036105.01.T01 AT2G25220 35.880 301 178 6 589 879 134 429 4.41e-44 166
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MsG0780036105.01.T01 AT4G32300 33.754 317 192 6 591 897 483 791 4.89e-44 172
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MsG0780036105.01.T01 AT1G56120 31.686 344 190 8 71 383 88 417 2.74e-30 129
MsG0780036105.01.T01 AT1G56120 31.447 318 180 7 78 387 66 353 4.36e-30 129
MsG0780036105.01.T01 AT1G56120 31.773 299 175 6 188 484 85 356 1.57e-28 124
MsG0780036105.01.T01 AT1G56120 29.389 262 169 6 251 507 61 311 1.23e-17 89.0
MsG0780036105.01.T01 AT4G11480 32.993 294 178 5 599 880 320 606 5.31e-44 170
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MsG0780036105.01.T01 AT1G56130 33.880 183 115 4 61 242 2 179 1.04e-16 85.5
MsG0780036105.01.T01 AT1G56130 33.158 190 124 2 95 284 10 196 3.46e-16 84.0
MsG0780036105.01.T01 AT1G56130 30.612 196 120 3 42 223 29 222 2.38e-13 74.7
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MsG0780036105.01.T01 AT2G27060 31.797 434 269 13 86 503 5 427 9.05e-40 159
MsG0780036105.01.T01 AT2G27060 33.096 281 155 7 45 298 161 435 5.87e-25 112
MsG0780036105.01.T01 AT2G27060 27.673 318 182 15 578 868 619 915 1.98e-17 88.2
MsG0780036105.01.T01 AT4G23280 32.787 305 186 6 589 880 326 624 1.33e-42 166
MsG0780036105.01.T01 AT1G67720 27.429 525 299 15 364 866 408 872 1.34e-42 168
MsG0780036105.01.T01 AT1G77280 34.385 317 186 6 593 895 394 702 1.34e-42 167
MsG0780036105.01.T01 AT1G77280 34.385 317 186 6 593 895 394 702 1.34e-42 167
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MsG0780036105.01.T01 AT1G61490 32.609 276 170 4 596 861 483 752 1.69e-42 167
MsG0780036105.01.T01 AT1G61490 32.609 276 170 4 596 861 483 752 1.69e-42 167
MsG0780036105.01.T01 AT1G61490 32.609 276 170 4 596 861 483 752 1.69e-42 167
MsG0780036105.01.T01 AT1G61490 32.609 276 170 4 596 861 483 752 1.69e-42 167
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MsG0780036105.01.T01 AT2G28250 33.639 327 183 11 577 876 178 497 1.64e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT2G28250 33.639 327 183 11 577 876 178 497 1.64e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT2G28250 33.639 327 183 11 577 876 178 497 1.64e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT2G28250 33.639 327 183 11 577 876 178 497 1.64e-41 161
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MsG0780036105.01.T01 AT3G08870 34.437 302 181 7 575 866 338 632 1.66e-41 163
MsG0780036105.01.T01 AT4G23310 32.450 302 191 5 589 880 452 750 1.68e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT5G56890 36.054 294 169 5 590 870 710 997 1.68e-41 165
MsG0780036105.01.T01 AT5G49290 32.584 534 295 13 51 525 115 642 1.68e-41 165
MsG0780036105.01.T01 AT5G49290 32.366 448 260 12 30 445 386 822 3.69e-35 145
MsG0780036105.01.T01 AT5G49290 28.171 607 301 16 45 524 182 780 9.37e-35 143
MsG0780036105.01.T01 AT5G49290 33.531 507 277 18 49 515 334 820 9.59e-34 140
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MsG0780036105.01.T01 AT4G23310 32.450 302 191 5 589 880 492 790 1.76e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT2G23200 36.268 284 170 8 590 866 475 754 1.77e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT2G19230 30.958 449 254 16 445 866 416 835 1.82e-41 165
MsG0780036105.01.T01 AT3G19300 34.242 330 189 11 578 896 307 619 1.92e-41 162
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MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 32.227 512 259 15 49 482 378 879 8.53e-41 162
MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 34.801 477 283 20 45 504 178 643 1.06e-37 153
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MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 34.551 301 170 10 201 481 110 403 8.21e-20 95.9
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MsG0780036105.01.T01 AT1G61430 31.973 294 181 6 596 877 459 745 1.94e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT1G61430 31.973 294 181 6 596 877 459 745 1.94e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 30.293 581 256 12 47 482 260 836 2.05e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 32.783 424 238 10 45 435 426 835 2.24e-41 164
MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 34.534 472 266 19 45 504 160 600 1.14e-39 159
MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 31.818 462 232 11 51 436 215 669 4.40e-37 151
MsG0780036105.01.T01 AT2G25470 34.768 302 179 9 201 486 92 391 1.17e-22 105
MsG0780036105.01.T01 AT2G25220 36.900 271 155 5 598 856 92 358 2.18e-41 156
MsG0780036105.01.T01 AT5G63940 34.602 289 157 8 593 863 352 626 2.21e-41 163
MsG0780036105.01.T01 AT5G15730 32.491 277 175 7 593 868 106 371 2.29e-41 158
MsG0780036105.01.T01 AT1G52290 31.164 292 180 6 593 870 133 417 2.46e-41 159
MsG0780036105.01.T01 AT4G28670 31.922 307 186 7 577 868 305 603 2.57e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT1G61380 29.752 363 227 9 534 884 279 625 2.61e-41 162
MsG0780036105.01.T01 AT1G61430 31.973 294 181 6 596 877 482 768 2.75e-41 163
MsG0780036105.01.T01 AT4G02410 29.888 358 210 9 540 877 302 638 2.89e-41 162
MsG0780036105.01.T01 AT3G20820 37.891 256 155 3 44 296 89 343 2.92e-41 155
MsG0780036105.01.T01 AT3G20820 36.694 248 154 3 189 435 90 335 2.86e-38 147
MsG0780036105.01.T01 AT3G20820 34.783 253 162 3 141 392 90 340 3.55e-34 135
MsG0780036105.01.T01 AT3G20820 36.929 241 144 5 244 481 100 335 8.59e-31 125
MsG0780036105.01.T01 AT3G20820 36.889 225 135 5 284 503 89 311 2.28e-30 124
MsG0780036105.01.T01 AT5G15730 32.491 277 177 6 593 868 106 373 2.96e-41 157
MsG0780036105.01.T01 AT5G15730 32.491 277 177 6 593 868 106 373 2.96e-41 157
MsG0780036105.01.T01 AT4G02420 32.154 311 186 7 591 884 338 640 3.21e-41 162
MsG0780036105.01.T01 AT1G70530 36.777 242 146 4 567 804 284 522 3.36e-41 160
MsG0780036105.01.T01 AT1G11330 32.986 288 159 5 539 804 447 722 3.76e-41 163
MsG0780036105.01.T01 AT3G09010 34.437 302 180 7 577 868 21 314 3.85e-41 156
MsG0780036105.01.T01 AT4G23220 30.814 344 213 9 533 866 276 604 3.93e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT1G11050 37.241 290 165 9 534 811 223 507 3.96e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT1G61380 29.752 363 227 9 534 884 426 772 4.07e-41 163
MsG0780036105.01.T01 AT1G70530 31.287 342 210 8 567 890 284 618 4.62e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT2G25220 36.396 283 161 6 589 856 129 407 4.83e-41 157
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MsG0780036105.01.T01 AT4G23270 32.509 283 174 5 609 880 332 608 5.66e-41 161
MsG0780036105.01.T01 AT1G11330 38.462 208 123 2 599 804 520 724 5.76e-41 162
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MsG0780036105.01.T01 AT4G23270 32.509 283 174 5 609 880 332 608 6.84e-41 160
MsG0780036105.01.T01 AT5G40380 36.882 263 161 3 542 802 253 512 7.06e-41 159
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MsG0780036105.01.T01 AT1G11330 38.462 208 123 2 599 804 520 724 1.04e-40 162
MsG0780036105.01.T01 AT1G25390 32.934 334 205 8 546 866 233 560 1.10e-40 160
MsG0780036105.01.T01 AT1G25390 32.934 334 205 8 546 866 233 560 1.10e-40 160
MsG0780036105.01.T01 AT1G11280 30.945 307 199 5 596 893 508 810 1.12e-40 162
MsG0780036105.01.T01 AT1G11280 30.945 307 199 5 596 893 486 788 1.14e-40 161
MsG0780036105.01.T01 AT1G11280 30.945 307 199 5 596 893 498 800 1.15e-40 162
MsG0780036105.01.T01 AT5G01540 33.138 341 193 9 538 866 314 631 1.15e-40 160
MsG0780036105.01.T01 AT1G24030 33.448 290 161 8 595 863 68 346 1.17e-40 154
MsG0780036105.01.T01 AT1G78530 38.813 219 127 4 590 807 62 274 1.30e-40 151
MsG0780036105.01.T01 AT1G70520 34.615 286 172 6 593 866 315 597 1.31e-40 160
MsG0780036105.01.T01 AT1G61430 37.441 211 125 3 596 803 482 688 1.32e-40 160

Find 153 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 189 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GTTAATTGATCAAAGTTAAA+TGG 0.174186 7:+2666042 None:intergenic
CGTATAACTATGTCATTATT+TGG 0.194445 7:+2664134 None:intergenic
CTATCTCACAATAGCCTTAA+TGG 0.206392 7:-2665709 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGTGAAATCCCTTCTTATAT+TGG 0.244104 7:-2665541 MsG0780036105.01.T01:CDS
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ATTGTATAAAACTGACAATT+TGG 0.278133 7:+2665403 None:intergenic
AAATAGAAAGGTTTCCATTA+AGG 0.280541 7:+2665695 None:intergenic
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG 0.287784 7:-2664620 MsG0780036105.01.T01:CDS
AAAAGGGTTAACACTATTAA+AGG 0.292606 7:-2664800 MsG0780036105.01.T01:CDS
TAGAATCAACTCTTGCAAAT+TGG 0.299839 7:+2666020 None:intergenic
GTGAGGTTTGTAAGGGATAT+AGG 0.300381 7:+2666114 None:intergenic
CTCAGTCACAACCTCATTAA+TGG 0.301165 7:-2665562 MsG0780036105.01.T01:CDS
GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG 0.306100 7:+2666762 None:intergenic
ATATCTCACAACGACCTTAT+AGG 0.312097 7:-2666360 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGTTCCATTTCTCTTGAGTT+GGG 0.314362 7:-2666339 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTTCATATCTTCATCATGAT+TGG 0.315165 7:-2664763 MsG0780036105.01.T01:CDS
TCCAGCAACTATAGTTTGAT+TGG 0.321431 7:+2664628 None:intergenic
GGTTCCATTCCTCATGAGTT+GGG 0.337259 7:-2666195 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGGACTATACCAAAAGAAAT+TGG 0.343185 7:-2666771 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGGAAATCTCAAACAATTAC+AGG 0.343340 7:-2666391 MsG0780036105.01.T01:CDS
GAACATTTCATACAATTGTT+TGG 0.353968 7:-2665437 MsG0780036105.01.T01:CDS
TATAACCTTCAAAGTAGTTA+TGG 0.354002 7:+2665923 None:intergenic
ATCTCTCATAACGACCTTAT+AGG 0.360971 7:-2666216 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGCAGAGTTTGCATATACTA+TGG 0.364759 7:-2664309 MsG0780036105.01.T01:intron
TAATAGAGAGAGATTTGTTA+AGG 0.364992 7:+2665963 None:intergenic
GTTGCCTTAAAGAAACTTCA+TGG 0.373707 7:-2665028 MsG0780036105.01.T01:CDS
TCCAATCAAACTATAGTTGC+TGG 0.377046 7:-2664629 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATTTCCCATAACTACTTTGA+AGG 0.381014 7:-2665928 MsG0780036105.01.T01:CDS
CACTTAACCAATTCCAGCCT+TGG 0.384985 7:-2665354 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG 0.385025 7:+2664050 None:intergenic
TTAATTGATCAAAGTTAAAT+GGG 0.386535 7:+2666043 None:intergenic
GTAACTTTGTGAGGTTTGTA+AGG 0.388353 7:+2666106 None:intergenic
CAGCCTACTGTTTCTGACTT+TGG 0.388578 7:-2664680 MsG0780036105.01.T01:CDS
AGGTGAGATACCTTCTTCAT+TGG 0.391640 7:-2666412 MsG0780036105.01.T01:CDS
AGACTAGGACTAGAAGAATA+AGG 0.396275 7:+2665275 None:intergenic
CAAGAGAAATGGAACCTATA+AGG 0.399096 7:+2666346 None:intergenic
TTGTCTGACAATAATCTTCA+AGG 0.405339 7:-2666576 MsG0780036105.01.T01:CDS
GATACATCTCGATGCACTAT+TGG 0.407190 7:+2664734 None:intergenic
GTTCCATTCCTCTTGAGTTA+GGG 0.408487 7:-2665759 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATTATAAGATAGATCTAATC+TGG 0.410110 7:+2666155 None:intergenic
CTTATTTGCAGTATGATTGT+GGG 0.410166 7:-2667053 None:intergenic
AGGTTCCATTTCTCTTGAGT+TGG 0.412690 7:-2666340 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG 0.414248 7:-2665088 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGTGACATCTCAACTTCAAA+TGG 0.418068 7:-2667012 MsG0780036105.01.T01:CDS
TCAGTTGAACTATACCTAGA+AGG 0.418097 7:-2666792 MsG0780036105.01.T01:intron
CATGAGGAATGGAACCTATA+AGG 0.427944 7:+2666202 None:intergenic
ATCTCTAACAACAACATTGA+AGG 0.428532 7:-2666504 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTGATATTTCCTAGTGAAGA+AGG 0.429418 7:+2666546 None:intergenic
ATAACCTTCAAAGTAGTTAT+GGG 0.429447 7:+2665924 None:intergenic
GGTGAGATACCTTCTTCATT+GGG 0.431196 7:-2666411 MsG0780036105.01.T01:CDS
GAACCCCAACTCAAGAGAAA+TGG 0.435118 7:+2666335 None:intergenic
CGTACCGATGAGTAAATTAT+GGG 0.441096 7:+2665633 None:intergenic
AAGTGTGATGTATATAGTTT+TGG 0.441933 7:-2664275 MsG0780036105.01.T01:CDS
GTAATTGTTTGAGATTTCCT+AGG 0.444352 7:+2665815 None:intergenic
CATAGGCATTACAGACAGAT+TGG 0.444360 7:+2665467 None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGA+AGG 0.447978 7:+2666618 None:intergenic
TGGAATTCAAGTGGAGGAAA+AGG 0.450033 7:-2664817 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTCATGAACCCCAACTCAAA+AGG 0.452209 7:+2666474 None:intergenic
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG 0.454703 7:-2665097 MsG0780036105.01.T01:CDS
TCTTATTTGCAGTATGATTG+TGG 0.454951 7:-2667054 None:intergenic
ATCTATCAATACATTGAGAA+AGG 0.456316 7:-2664878 MsG0780036105.01.T01:CDS
TAATCATTATCTACTTTCCA+TGG 0.460161 7:-2665587 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATCTCACACAACAACATTCA+AGG 0.465186 7:-2665781 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATAGGCATTACAGACAGATT+GGG 0.466797 7:+2665468 None:intergenic
AGGTTCCATTCCTCATGAGT+TGG 0.467855 7:-2666196 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTGAGGAACCCCAACACAAA+AGG 0.469631 7:+2665898 None:intergenic
TAAAACTGACAATTTGGAAT+GGG 0.475883 7:+2665409 None:intergenic
CAAATCAAGATGAGTGAGCT+TGG 0.476622 7:+2666596 None:intergenic
TTGAGATTTCCCAATGAAGA+AGG 0.481985 7:+2666402 None:intergenic
CTGAAACTCTCATCAAAAGC+TGG 0.482228 7:+2664989 None:intergenic
CTTTAGTCGGAAGGCACCCT+GGG 0.483234 7:-2664235 MsG0780036105.01.T01:CDS
GTGATGACCAAGGCTGGAAT+TGG 0.486245 7:+2665347 None:intergenic
GCAAATGCTATATTGAATAG+TGG 0.491443 7:-2666987 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGTGAGATACCTTGTTCCCT+AGG 0.492434 7:-2665832 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGTGAGATACCTTGTTCCCT+AGG 0.492434 7:-2666267 MsG0780036105.01.T01:CDS
TCAATGTAGCCAATATAAGA+AGG 0.499191 7:+2665532 None:intergenic
ACTATGTCATTATTTGGAAG+TGG 0.499298 7:+2664140 None:intergenic
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG 0.499919 7:+2664645 None:intergenic
TTAAGCAATAATAATCTCAC+TGG 0.504110 7:-2665499 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGCACTGAAATTTCACTCAA+AGG 0.510871 7:+2663993 None:intergenic
ACTTTAGTCGGAAGGCACCC+TGG 0.515061 7:-2664236 MsG0780036105.01.T01:CDS
TATTGTGTGATGACCAAGGC+TGG 0.515222 7:+2665341 None:intergenic
GTTCCATTTCTCTTGAGTTG+GGG 0.517324 7:-2666338 MsG0780036105.01.T01:CDS
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.524718 7:-2665853 MsG0780036105.01.T01:CDS
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.524718 7:-2666288 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATATGAGAAGTGAGAAGACT+AGG 0.526156 7:+2665260 None:intergenic
AAGGGATTTCACCATTAATG+AGG 0.526645 7:+2665551 None:intergenic
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.526656 7:-2666432 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG 0.527441 7:-2665433 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG 0.528233 7:+2664062 None:intergenic
CAAGGTATTGTAACTTTGTG+AGG 0.530287 7:+2666097 None:intergenic
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.531538 7:-2666648 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGGTGGAACACTTCTGCTGT+AGG 0.531583 7:-2666963 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATTTCCCATAATTTACTCAT+CGG 0.532338 7:-2665637 MsG0780036105.01.T01:CDS
AGTAGTTATGGGAAATGTCA+AGG 0.535232 7:+2665935 None:intergenic
ACTATTGGATATATTGCTCC+TGG 0.538272 7:-2664605 MsG0780036105.01.T01:intron
GTTCCATTCCTCATGAGTTG+GGG 0.538380 7:-2666194 MsG0780036105.01.T01:CDS
TAACTTTGTGAGGTTTGTAA+GGG 0.544185 7:+2666107 None:intergenic
AAGGCAACAACCTTGCCACT+TGG 0.546601 7:+2665043 None:intergenic
TTTAGATTTCCTAGGGAACA+AGG 0.546857 7:+2666258 None:intergenic
TAAAATTGTTAGAGATGTCA+AGG 0.550162 7:+2666079 None:intergenic
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG 0.550477 7:-2665434 MsG0780036105.01.T01:CDS
CACTTGAAACTTTAGTCGGA+AGG 0.554463 7:-2664244 MsG0780036105.01.T01:CDS
TAATTGTTTGAGATTTCCTA+GGG 0.556298 7:+2665816 None:intergenic
TTGAGATTTCCTAGGGAACA+AGG 0.556440 7:+2665823 None:intergenic
AATTGGAAAGGTTCCACCGA+TGG 0.556469 7:+2665987 None:intergenic
ATAAAACTGACAATTTGGAA+TGG 0.557751 7:+2665408 None:intergenic
ATTTGTTAAGGAAATTGGAA+AGG 0.558924 7:+2665975 None:intergenic
GTAAATTATGGGAAATGTCA+AGG 0.561020 7:+2665644 None:intergenic
CAGTTGAACTATACCTAGAA+GGG 0.561127 7:-2666791 MsG0780036105.01.T01:CDS
AATTCTACTAAGAAGTCGCA+TGG 0.565992 7:-2665220 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGAATTCAAGTGGAGGAAAA+GGG 0.567360 7:-2664816 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATTCTAACTAACAATTCCAT+CGG 0.569629 7:-2666003 MsG0780036105.01.T01:CDS
GAACCCCAACTCATGAGGAA+TGG 0.571420 7:+2666191 None:intergenic
AGGACTAGAAGAATAAGGAC+AGG 0.574501 7:+2665280 None:intergenic
GGTCATATACCTTCTTCACT+AGG 0.576732 7:-2666555 MsG0780036105.01.T01:CDS
GAACCCTAACTCAAGAGGAA+TGG 0.577427 7:+2665756 None:intergenic
CAATGTAGCCAATATAAGAA+GGG 0.578673 7:+2665533 None:intergenic
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG 0.578977 7:-2665103 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTCAAGAACCCCAACTCATG+AGG 0.579089 7:+2666186 None:intergenic
TTCAGGAACCCTAACTCAAG+AGG 0.579642 7:+2665751 None:intergenic
AGTGATGACAATAAATCCCC+AGG 0.580045 7:+2664218 None:intergenic
GTAGTTATGGGAAATGTCAA+GGG 0.590352 7:+2665936 None:intergenic
AGCATATGGAAGTGTTTACA+AGG 0.595999 7:-2665074 MsG0780036105.01.T01:CDS
CATTAATGAGGTTGTGACTG+AGG 0.609216 7:+2665563 None:intergenic
TGAAATGTTCACATACGCAT+AGG 0.609665 7:+2665450 None:intergenic
ACTTCATGGTTATGAAGCAG+AGG 0.609892 7:-2665014 MsG0780036105.01.T01:CDS
GAGGTTGTGACTGAGGTCCA+TGG 0.611508 7:+2665570 None:intergenic
TAGAAGCTGTGGAATTCAAG+TGG 0.611946 7:-2664826 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATTGATCAAAGTTAAATGGG+AGG 0.612590 7:+2666046 None:intergenic
TTTAGCAAACATAATTCAGG+AGG 0.617072 7:+2666690 None:intergenic
GTGCCAAAGTCAGAAACAGT+AGG 0.617636 7:+2664677 None:intergenic
CTAACTAACAATTCCATCGG+TGG 0.618090 7:-2666000 MsG0780036105.01.T01:CDS
TAGGCATTACAGACAGATTG+GGG 0.628520 7:+2665469 None:intergenic
GTGGCACTTGAAACTTTAGT+CGG 0.639782 7:-2664248 MsG0780036105.01.T01:CDS
GGCACAATTACCAAGTGGCA+AGG 0.640449 7:-2665053 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATGCTATATTGAATAGTGGA+TGG 0.651288 7:-2666983 MsG0780036105.01.T01:CDS
GTATGATGATGTAGAAGCTG+TGG 0.653898 7:-2664837 MsG0780036105.01.T01:CDS
TAAGCATGCAAATGCTACCA+CGG 0.657247 7:+2664094 None:intergenic
GTGATGACAATAAATCCCCA+GGG 0.663800 7:+2664219 None:intergenic
CTATATTGAATAGTGGATGG+TGG 0.665439 7:-2666980 MsG0780036105.01.T01:CDS
TGACACAATTCATGTTGCCG+TGG 0.667742 7:-2664111 MsG0780036105.01.T01:CDS
ATATCTTGCTAAACTCTGAG+TGG 0.676612 7:-2664703 MsG0780036105.01.T01:CDS
TACAAGGCACAATTACCAAG+TGG 0.677587 7:-2665058 MsG0780036105.01.T01:CDS
TATTTGGAAGTGGAAGACGC+TGG 0.703453 7:+2664150 None:intergenic
AAGCTGTGGAATTCAAGTGG+AGG 0.705127 7:-2664823 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTTAGTCGGAAGGCACCCTG+GGG 0.734476 7:-2664234 MsG0780036105.01.T01:CDS
TTGAAGTTGAGATGTCACAG+TGG 0.779927 7:+2667016 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATGATTAAATGAAAAAAAAT+TGG + Chr7:2665382-2665401 None:intergenic 10.0%
!! ATATCAATTATTAATTTACC+AGG + Chr7:2666398-2666417 None:intergenic 15.0%
!! TTAAATGAAAAAAAATTGGA+AGG + Chr7:2665378-2665397 None:intergenic 15.0%
!! TTAATTGATCAAAGTTAAAT+GGG + Chr7:2664942-2664961 None:intergenic 15.0%
!!! GTCTTATATTAAATTTTCTT+TGG - Chr7:2666618-2666637 MsG0780036105.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTATAAGATAGATCTAATC+TGG + Chr7:2664830-2664849 None:intergenic 20.0%
!! ATTGTATAAAACTGACAATT+TGG + Chr7:2665582-2665601 None:intergenic 20.0%
!! GATTTGAAAGAAAAATAGAA+AGG + Chr7:2665302-2665321 None:intergenic 20.0%
!! GTTAATTGATCAAAGTTAAA+TGG + Chr7:2664943-2664962 None:intergenic 20.0%
!!! ATCTCTAACAATTTTATCAA+TGG - Chr7:2664910-2664929 MsG0780036105.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAATTGTTTTAGATTTCCTA+GGG + Chr7:2664734-2664753 None:intergenic 20.0%
!!! TTGTCTAACAATTTTCTTAA+AGG - Chr7:2664262-2664281 MsG0780036105.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTGTATATGGAATTTTGAT+GGG - Chr7:2665817-2665836 MsG0780036105.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTATATGGAATTTTGA+TGG - Chr7:2665816-2665835 MsG0780036105.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTTAGCAAACATAATTC+AGG + Chr7:2664298-2664317 None:intergenic 20.0%
! AAAAGGGTTAACACTATTAA+AGG - Chr7:2666182-2666201 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! AAACATATTGTGAAGCTTTA+TGG - Chr7:2666050-2666069 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! AAATAGAAAGGTTTCCATTA+AGG + Chr7:2665290-2665309 None:intergenic 25.0%
! ATAAAACTGACAATTTGGAA+TGG + Chr7:2665577-2665596 None:intergenic 25.0%
! ATAACCATGAAGTTTCTTTA+AGG + Chr7:2665961-2665980 None:intergenic 25.0%
! ATAACCTTCAAAGTAGTTAT+GGG + Chr7:2665061-2665080 None:intergenic 25.0%
! ATCTATCAATACATTGAGAA+AGG - Chr7:2666104-2666123 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCTAACTAACAATTCCAT+CGG - Chr7:2664979-2664998 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG - Chr7:2665549-2665568 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTCCCATAATTTACTCAT+CGG - Chr7:2665345-2665364 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! CGTATAACTATGTCATTATT+TGG + Chr7:2666851-2666870 None:intergenic 25.0%
! CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG - Chr7:2664334-2664353 MsG0780036105.01.T01:intron 25.0%
! GAACATTTCATACAATTGTT+TGG - Chr7:2665545-2665564 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAATTGTTAGAGATGTCA+AGG + Chr7:2664906-2664925 None:intergenic 25.0%
! TAATCATTATCTACTTTCCA+TGG - Chr7:2665395-2665414 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! TATAACCTTCAAAGTAGTTA+TGG + Chr7:2665062-2665081 None:intergenic 25.0%
! TTAAGCAATAATAATCTCAC+TGG - Chr7:2665483-2665502 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCATATCTTCATCATGAT+TGG - Chr7:2666219-2666238 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTGTGATGTATATAGTTT+TGG - Chr7:2666707-2666726 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGAATATTCAAAAGTGCA+TGG + Chr7:2666589-2666608 None:intergenic 25.0%
!! ATGAAGTGAGATTTTTATTG+AGG + Chr7:2665104-2665123 None:intergenic 25.0%
!! ATGGAGATATGTTTTGTATA+TGG - Chr7:2665805-2665824 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTGTTAAGGAAATTGGAA+AGG + Chr7:2665010-2665029 None:intergenic 25.0%
!! TAAAACTGACAATTTGGAAT+GGG + Chr7:2665576-2665595 None:intergenic 25.0%
!! TAATTGTTTGAGATTTCCTA+GGG + Chr7:2665169-2665188 None:intergenic 25.0%
!! TTATTCTGAAAGGTTAAAGT+TGG - Chr7:2666557-2666576 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTAATTGTTTTAGATTTCCT+AGG + Chr7:2664735-2664754 None:intergenic 25.0%
!!! TAATAGAGAGAGATTTGTTA+AGG + Chr7:2665022-2665041 None:intergenic 25.0%
!!! TCAGTTTTATACAATGAACA+TGG - Chr7:2665587-2665606 MsG0780036105.01.T01:CDS 25.0%
AACTCAACAAAAACAAAGGA+TGG - Chr7:2665786-2665805 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
ACTATGTCATTATTTGGAAG+TGG + Chr7:2666845-2666864 None:intergenic 30.0%
ATCTCTAACAACAACATTGA+AGG - Chr7:2664478-2664497 MsG0780036105.01.T01:intron 30.0%
ATGCAAAACATGCATATTCA+TGG - Chr7:2666461-2666480 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
ATTGATCAAAGTTAAATGGG+AGG + Chr7:2664939-2664958 None:intergenic 30.0%
ATTTCCCATAACTACTTTGA+AGG - Chr7:2665054-2665073 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
CAATGTAGCCAATATAAGAA+GGG + Chr7:2665452-2665471 None:intergenic 30.0%
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG - Chr7:2665548-2665567 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG + Chr7:2666340-2666359 None:intergenic 30.0%
GCAAATGCTATATTGAATAG+TGG - Chr7:2663995-2664014 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
GTAAATTATGGGAAATGTCA+AGG + Chr7:2665341-2665360 None:intergenic 30.0%
GTATAGTTGCTTATTCTGAA+AGG - Chr7:2666547-2666566 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
TAACTTTGTGAGGTTTGTAA+GGG + Chr7:2664878-2664897 None:intergenic 30.0%
TAGAATCAACTCTTGCAAAT+TGG + Chr7:2664965-2664984 None:intergenic 30.0%
TCAATGTAGCCAATATAAGA+AGG + Chr7:2665453-2665472 None:intergenic 30.0%
TGGAAACTCAACAAAAACAA+AGG - Chr7:2665782-2665801 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
TTGATATTTCCTAGTGAAGA+AGG + Chr7:2664439-2664458 None:intergenic 30.0%
TTGTCTGACAATAATCTTCA+AGG - Chr7:2664406-2664425 MsG0780036105.01.T01:intron 30.0%
TTTAGCAAACATAATTCAGG+AGG + Chr7:2664295-2664314 None:intergenic 30.0%
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG - Chr7:2665879-2665898 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
! AGGTTATATTCCTTTTGTGT+TGG - Chr7:2665074-2665093 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
! ATGCTATATTGAATAGTGGA+TGG - Chr7:2663999-2664018 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
! GGTTATATTCCTTTTGTGTT+GGG - Chr7:2665075-2665094 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
! GTAATTGTTTGAGATTTCCT+AGG + Chr7:2665170-2665189 None:intergenic 30.0%
! GTTATATTCCTTTTGTGTTG+GGG - Chr7:2665076-2665095 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
! TGAACGTGTATGTAATTTGT+CGG + Chr7:2666489-2666508 None:intergenic 30.0%
! TTTTTATTGTGTGATGACCA+AGG + Chr7:2665648-2665667 None:intergenic 30.0%
!! AAGACAAGTTAAGTGTTGAA+AGG + Chr7:2664138-2664157 None:intergenic 30.0%
!! AGGTTATATTCCTTTTGAGT+TGG - Chr7:2664498-2664517 MsG0780036105.01.T01:intron 30.0%
!! GAGAGATTTGTTAAGGAAAT+TGG + Chr7:2665015-2665034 None:intergenic 30.0%
!!! GGTTATATTCCTTTTGAGTT+GGG - Chr7:2664499-2664518 MsG0780036105.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTATATTCCTTTTGAGTTG+GGG - Chr7:2664500-2664519 MsG0780036105.01.T01:intron 30.0%
!!! TGATGTATATAGTTTTGGTG+TGG - Chr7:2666712-2666731 MsG0780036105.01.T01:CDS 30.0%
AAGGGATTTCACCATTAATG+AGG + Chr7:2665434-2665453 None:intergenic 35.0%
AATTCTACTAAGAAGTCGCA+TGG - Chr7:2665762-2665781 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG - Chr7:2666362-2666381 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
ACTATTGGATATATTGCTCC+TGG - Chr7:2666377-2666396 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
AGACTAGGACTAGAAGAATA+AGG + Chr7:2665710-2665729 None:intergenic 35.0%
AGTAGTTATGGGAAATGTCA+AGG + Chr7:2665050-2665069 None:intergenic 35.0%
ATAGGCATTACAGACAGATT+GGG + Chr7:2665517-2665536 None:intergenic 35.0%
ATATCTCACAACGACCTTAT+AGG - Chr7:2664622-2664641 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTTGCTAAACTCTGAG+TGG - Chr7:2666279-2666298 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
ATATGAGAAGTGAGAAGACT+AGG + Chr7:2665725-2665744 None:intergenic 35.0%
ATCTCACACAACAACATTCA+AGG - Chr7:2665201-2665220 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
ATCTCTCATAACGACCTTAT+AGG - Chr7:2664766-2664785 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG - Chr7:2665885-2665904 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAGAAATGGAACCTATA+AGG + Chr7:2664639-2664658 None:intergenic 35.0%
CAGTTGAACTATACCTAGAA+GGG - Chr7:2664191-2664210 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
GGGAAATCTCAAACAATTAC+AGG - Chr7:2664591-2664610 MsG0780036105.01.T01:intron 35.0%
GGGACTATACCAAAAGAAAT+TGG - Chr7:2664211-2664230 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAAATCCCTTCTTATAT+TGG - Chr7:2665441-2665460 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
GTAACTTTGTGAGGTTTGTA+AGG + Chr7:2664879-2664898 None:intergenic 35.0%
GTAGTTATGGGAAATGTCAA+GGG + Chr7:2665049-2665068 None:intergenic 35.0%
GTTCAACTGAGCTTATAACA+AGG + Chr7:2664180-2664199 None:intergenic 35.0%
GTTGCCTTAAAGAAACTTCA+TGG - Chr7:2665954-2665973 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
TCACTCAAAGGAATGCTTAA+TGG + Chr7:2666980-2666999 None:intergenic 35.0%
TCAGTTGAACTATACCTAGA+AGG - Chr7:2664190-2664209 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
TCCAATCAAACTATAGTTGC+TGG - Chr7:2666353-2666372 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
TCCAGCAACTATAGTTTGAT+TGG + Chr7:2666357-2666376 None:intergenic 35.0%
TGAAATGTTCACATACGCAT+AGG + Chr7:2665535-2665554 None:intergenic 35.0%
TGCACTGAAATTTCACTCAA+AGG + Chr7:2666992-2667011 None:intergenic 35.0%
TGCAGAGTTTGCATATACTA+TGG - Chr7:2666673-2666692 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
TGTGACATCTCAACTTCAAA+TGG - Chr7:2663970-2663989 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGATTTCCCAATGAAGA+AGG + Chr7:2664583-2664602 None:intergenic 35.0%
TTTAGATTTCCTAGGGAACA+AGG + Chr7:2664727-2664746 None:intergenic 35.0%
! CGTACCGATGAGTAAATTAT+GGG + Chr7:2665352-2665371 None:intergenic 35.0%
! CTAATGTAGAGAGACTTTTC+AGG + Chr7:2665251-2665270 None:intergenic 35.0%
! CTATCTCACAATAGCCTTAA+TGG - Chr7:2665273-2665292 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
! GAACGTGTATGTAATTTGTC+GGG + Chr7:2666488-2666507 None:intergenic 35.0%
! GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG + Chr7:2664223-2664242 None:intergenic 35.0%
!! AGCATATGGAAGTGTTTACA+AGG - Chr7:2665908-2665927 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
!! CAAGGTATTGTAACTTTGTG+AGG + Chr7:2664888-2664907 None:intergenic 35.0%
!! CTATATTGAATAGTGGATGG+TGG - Chr7:2664002-2664021 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTGTCACAAAGTTTTGTCA+CGG - Chr7:2666946-2666965 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTATATAGTTTTGGTGTGG+TGG - Chr7:2666715-2666734 MsG0780036105.01.T01:CDS 35.0%
AAGCGATCAACATAGACTCT+TGG - Chr7:2664104-2664123 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
ACTTCATGGTTATGAAGCAG+AGG - Chr7:2665968-2665987 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
AGCGATCAACATAGACTCTT+GGG - Chr7:2664105-2664124 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
AGGACTAGAAGAATAAGGAC+AGG + Chr7:2665705-2665724 None:intergenic 40.0%
AGGTGAGATACCTTCTTCAT+TGG - Chr7:2664570-2664589 MsG0780036105.01.T01:intron 40.0%
AGGTTCCATTTCTCTTGAGT+TGG - Chr7:2664642-2664661 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
AGTGATGACAATAAATCCCC+AGG + Chr7:2666767-2666786 None:intergenic 40.0%
CAAATCAAGATGAGTGAGCT+TGG + Chr7:2664389-2664408 None:intergenic 40.0%
CACTTGAAACTTTAGTCGGA+AGG - Chr7:2666738-2666757 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
CATAGGCATTACAGACAGAT+TGG + Chr7:2665518-2665537 None:intergenic 40.0%
CATGAGGAATGGAACCTATA+AGG + Chr7:2664783-2664802 None:intergenic 40.0%
CATTAATGAGGTTGTGACTG+AGG + Chr7:2665422-2665441 None:intergenic 40.0%
CTAACTAACAATTCCATCGG+TGG - Chr7:2664982-2665001 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
CTCAGTCACAACCTCATTAA+TGG - Chr7:2665420-2665439 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
CTGAAACTCTCATCAAAAGC+TGG + Chr7:2665996-2666015 None:intergenic 40.0%
GATACATCTCGATGCACTAT+TGG + Chr7:2666251-2666270 None:intergenic 40.0%
GGAATTCAAGTGGAGGAAAA+GGG - Chr7:2666166-2666185 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
GGTCATATACCTTCTTCACT+AGG - Chr7:2664427-2664446 MsG0780036105.01.T01:intron 40.0%
GGTGAGATACCTTCTTCATT+GGG - Chr7:2664571-2664590 MsG0780036105.01.T01:intron 40.0%
GGTTCCATTTCTCTTGAGTT+GGG - Chr7:2664643-2664662 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGGTTTGTAAGGGATAT+AGG + Chr7:2664871-2664890 None:intergenic 40.0%
GTGATGACAATAAATCCCCA+GGG + Chr7:2666766-2666785 None:intergenic 40.0%
GTGGCACTTGAAACTTTAGT+CGG - Chr7:2666734-2666753 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
GTTCCATTCCTCTTGAGTTA+GGG - Chr7:2665223-2665242 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
TAAGCATGCAAATGCTACCA+CGG + Chr7:2666891-2666910 None:intergenic 40.0%
TACAAGGCACAATTACCAAG+TGG - Chr7:2665924-2665943 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
TAGAAGCTGTGGAATTCAAG+TGG - Chr7:2666156-2666175 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
TAGGCATTACAGACAGATTG+GGG + Chr7:2665516-2665535 None:intergenic 40.0%
TGGAATTCAAGTGGAGGAAA+AGG - Chr7:2666165-2666184 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG + Chr7:2666935-2666954 None:intergenic 40.0%
TTCATGAACCCCAACTCAAA+AGG + Chr7:2664511-2664530 None:intergenic 40.0%
TTGAAGTTGAGATGTCACAG+TGG + Chr7:2663969-2663988 None:intergenic 40.0%
TTGAGATTTCCTAGGGAACA+AGG + Chr7:2665162-2665181 None:intergenic 40.0%
! CTTTTGGTATAGTCCCTTCT+AGG + Chr7:2664207-2664226 None:intergenic 40.0%
! GCGTACCGATGAGTAAATTA+TGG + Chr7:2665353-2665372 None:intergenic 40.0%
! GTATGATGATGTAGAAGCTG+TGG - Chr7:2666145-2666164 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
! GTTCCATTTCTCTTGAGTTG+GGG - Chr7:2664644-2664663 MsG0780036105.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGAGATTTGCTAGTGAAGA+AGG + Chr7:2664367-2664386 None:intergenic 40.0%
AAGCTGTGGAATTCAAGTGG+AGG - Chr7:2666159-2666178 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
AATTGGAAAGGTTCCACCGA+TGG + Chr7:2664998-2665017 None:intergenic 45.0%
AGGTTCCATTCCTCATGAGT+TGG - Chr7:2664786-2664805 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
CACTTAACCAATTCCAGCCT+TGG - Chr7:2665628-2665647 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
CGATCAACATAGACTCTTGG+GGG - Chr7:2664107-2664126 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
GAACCCCAACTCAAGAGAAA+TGG + Chr7:2664650-2664669 None:intergenic 45.0%
GAACCCTAACTCAAGAGGAA+TGG + Chr7:2665229-2665248 None:intergenic 45.0%
GCGATCAACATAGACTCTTG+GGG - Chr7:2664106-2664125 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCCATTCCTCATGAGTT+GGG - Chr7:2664787-2664806 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCCATTCCTCTTGAGTT+AGG - Chr7:2665222-2665241 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
GTGCCAAAGTCAGAAACAGT+AGG + Chr7:2666308-2666327 None:intergenic 45.0%
GTTCCATTCCTCATGAGTTG+GGG - Chr7:2664788-2664807 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
TATTGTGTGATGACCAAGGC+TGG + Chr7:2665644-2665663 None:intergenic 45.0%
TATTTGGAAGTGGAAGACGC+TGG + Chr7:2666835-2666854 None:intergenic 45.0%
TGACACAATTCATGTTGCCG+TGG - Chr7:2666871-2666890 MsG0780036105.01.T01:intron 45.0%
TTCAAGAACCCCAACTCATG+AGG + Chr7:2664799-2664818 None:intergenic 45.0%
TTCAGGAACCCTAACTCAAG+AGG + Chr7:2665234-2665253 None:intergenic 45.0%
TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG + Chr7:2666923-2666942 None:intergenic 45.0%
TTGAGGAACCCCAACACAAA+AGG + Chr7:2665087-2665106 None:intergenic 45.0%
! GCTATAACTTGCAACGATGC+TGG - Chr7:2664073-2664092 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
! TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG - Chr7:2665894-2665913 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
!! CAGCCTACTGTTTCTGACTT+TGG - Chr7:2666302-2666321 MsG0780036105.01.T01:CDS 45.0%
AAGGCAACAACCTTGCCACT+TGG + Chr7:2665942-2665961 None:intergenic 50.0%
GAACCCCAACTCATGAGGAA+TGG + Chr7:2664794-2664813 None:intergenic 50.0%
GGCACAATTACCAAGTGGCA+AGG - Chr7:2665929-2665948 MsG0780036105.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAGATACCTTGTTCCCT+AGG - Chr7:2664715-2664734 MsG0780036105.01.T01:CDS 50.0%
GTGATGACCAAGGCTGGAAT+TGG + Chr7:2665638-2665657 None:intergenic 50.0%
TGGTGGAACACTTCTGCTGT+AGG - Chr7:2664019-2664038 MsG0780036105.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTTGTGACTGAGGTCCA+TGG + Chr7:2665415-2665434 None:intergenic 55.0%
!! ACTTTAGTCGGAAGGCACCC+TGG - Chr7:2666746-2666765 MsG0780036105.01.T01:CDS 55.0%
!! CTTTAGTCGGAAGGCACCCT+GGG - Chr7:2666747-2666766 MsG0780036105.01.T01:CDS 55.0%
!! TTTAGTCGGAAGGCACCCTG+GGG - Chr7:2666748-2666767 MsG0780036105.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 2663941 2667063 2663941 ID=MsG0780036105.01;Name=MsG0780036105.01
Chr7 mRNA 2663941 2667063 2663941 ID=MsG0780036105.01.T01;Parent=MsG0780036105.01;Name=MsG0780036105.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|903
Chr7 exon 2666943 2667063 2666943 ID=MsG0780036105.01.T01:exon:15762;Parent=MsG0780036105.01.T01
Chr7 exon 2664606 2666810 2664606 ID=MsG0780036105.01.T01:exon:15761;Parent=MsG0780036105.01.T01
Chr7 exon 2663941 2664326 2663941 ID=MsG0780036105.01.T01:exon:15760;Parent=MsG0780036105.01.T01
Chr7 CDS 2666943 2667063 2666943 ID=MsG0780036105.01.T01:cds;Parent=MsG0780036105.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0780036105.01.T01

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Protein sequence

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