AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044636.01


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MsG0880044636.01.T01 AT1G61420 44.886 528 260 11 238 756 152 657 1.80e-139 426
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MsG0880044636.01.T01 AT4G03230 54.047 383 155 6 369 731 525 906 1.78e-130 411
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MsG0880044636.01.T01 AT4G03230 36.025 161 94 2 69 229 62 213 2.28e-26 116
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MsG0880044636.01.T01 AT3G16030 36.667 150 81 2 69 207 55 201 2.11e-21 100
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MsG0880044636.01.T01 AT2G18470 38.644 295 173 5 432 722 272 562 9.73e-59 211
MsG0880044636.01.T01 AT5G03140 35.890 365 211 8 368 724 306 655 1.25e-58 212
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MsG0880044636.01.T01 AT2G35620 33.333 387 237 7 342 727 216 582 3.44e-55 200
MsG0880044636.01.T01 AT2G35620 33.333 387 237 7 342 727 216 582 3.44e-55 200
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MsG0880044636.01.T01 AT1G78530 39.568 278 161 4 441 716 72 344 6.46e-55 193
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MsG0880044636.01.T01 AT5G11020 35.328 351 210 7 374 713 25 369 1.88e-54 193
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MsG0880044636.01.T01 AT5G11020 35.328 351 210 7 374 713 63 407 2.35e-54 194
MsG0880044636.01.T01 AT4G39400 40.273 293 171 3 427 716 864 1155 2.51e-54 203
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MsG0880044636.01.T01 AT1G55610 39.322 295 174 2 427 716 840 1134 7.28e-54 202
MsG0880044636.01.T01 AT5G38280 36.747 332 191 9 417 736 302 626 7.51e-54 197
MsG0880044636.01.T01 AT1G14370 35.817 349 189 10 429 752 71 409 9.15e-54 192
MsG0880044636.01.T01 AT5G38280 36.747 332 191 9 417 736 302 626 9.51e-54 197
MsG0880044636.01.T01 AT1G52540 38.144 291 176 3 431 720 24 311 1.11e-53 189
MsG0880044636.01.T01 AT3G55450 37.421 318 181 6 432 733 49 364 1.14e-53 191
MsG0880044636.01.T01 AT1G71830 37.612 335 185 7 395 719 259 579 1.18e-53 196
MsG0880044636.01.T01 AT5G01020 39.414 307 165 9 431 723 59 358 1.34e-53 191
MsG0880044636.01.T01 AT5G60280 40.206 291 166 6 440 728 335 619 1.40e-53 197
MsG0880044636.01.T01 AT5G37450 36.364 341 203 5 377 713 542 872 1.47e-53 200
MsG0880044636.01.T01 AT5G37450 36.364 341 203 5 377 713 566 896 1.77e-53 200
MsG0880044636.01.T01 AT5G37450 36.364 341 203 5 377 713 590 920 2.54e-53 199
MsG0880044636.01.T01 AT4G13190 39.689 257 154 1 466 721 5 261 3.22e-53 186
MsG0880044636.01.T01 AT5G42440 33.994 353 214 9 376 716 7 352 3.61e-53 188
MsG0880044636.01.T01 AT3G59750 38.095 294 177 4 432 723 291 581 3.61e-53 195
MsG0880044636.01.T01 AT1G52540 38.144 291 176 3 431 720 27 314 3.63e-53 188
MsG0880044636.01.T01 AT3G01300 38.514 296 168 5 432 716 124 416 4.02e-53 192
MsG0880044636.01.T01 AT3G55450 37.421 318 181 6 432 733 86 401 4.58e-53 190
MsG0880044636.01.T01 AT1G69790 38.796 299 167 5 429 716 58 351 5.10e-53 188
MsG0880044636.01.T01 AT3G59740 38.047 297 176 5 432 723 321 614 5.86e-53 195
MsG0880044636.01.T01 AT1G69790 38.796 299 167 5 429 716 69 362 6.52e-53 188
MsG0880044636.01.T01 AT3G15890 33.621 348 209 7 423 756 15 354 6.54e-53 187
MsG0880044636.01.T01 AT2G01950 37.908 306 172 4 428 716 822 1126 6.72e-53 199
MsG0880044636.01.T01 AT1G66920 34.973 366 206 11 379 730 239 586 6.98e-53 194
MsG0880044636.01.T01 AT4G00340 31.911 492 271 14 238 716 298 738 9.16e-53 196
MsG0880044636.01.T01 AT4G00340 33.333 177 102 6 60 235 41 202 8.33e-15 79.0
MsG0880044636.01.T01 AT1G79620 33.247 388 224 12 341 713 538 905 1.18e-52 197
MsG0880044636.01.T01 AT2G13800 38.562 306 175 6 424 719 133 435 1.67e-52 190
MsG0880044636.01.T01 AT2G13800 38.562 306 175 6 424 719 133 435 1.67e-52 190
MsG0880044636.01.T01 AT1G79620 33.247 388 224 12 341 713 564 931 1.69e-52 197
MsG0880044636.01.T01 AT5G53890 33.989 356 221 6 367 713 672 1022 1.82e-52 197
MsG0880044636.01.T01 AT1G76360 38.907 311 175 7 429 727 148 455 1.86e-52 190
MsG0880044636.01.T01 AT4G34500 37.075 294 180 4 437 727 138 429 1.88e-52 189
MsG0880044636.01.T01 AT1G67720 39.116 294 167 4 431 716 587 876 2.52e-52 196
MsG0880044636.01.T01 AT5G55830 33.509 379 233 8 354 726 285 650 3.23e-52 193
MsG0880044636.01.T01 AT4G04960 35.860 343 203 9 387 719 288 623 3.73e-52 193
MsG0880044636.01.T01 AT2G39360 39.223 283 169 3 432 713 475 755 5.55e-52 194
MsG0880044636.01.T01 AT5G15730 36.713 286 164 6 429 712 101 371 5.72e-52 187
MsG0880044636.01.T01 AT5G15730 36.713 286 164 6 429 712 101 371 5.72e-52 187
MsG0880044636.01.T01 AT2G43700 34.561 353 211 8 374 723 253 588 6.63e-52 191
MsG0880044636.01.T01 AT2G43700 34.561 353 211 8 374 723 253 588 6.63e-52 191
MsG0880044636.01.T01 AT2G43700 34.561 353 211 8 374 723 253 588 6.63e-52 191
MsG0880044636.01.T01 AT2G43700 34.561 353 211 8 374 723 253 588 6.63e-52 191
MsG0880044636.01.T01 AT5G48740 34.060 367 220 7 362 722 533 883 6.94e-52 195
MsG0880044636.01.T01 AT1G16130 33.815 346 218 5 377 716 346 686 8.13e-52 193
MsG0880044636.01.T01 AT5G35960 39.576 283 162 7 431 712 121 395 8.74e-52 186
MsG0880044636.01.T01 AT5G35960 38.966 290 168 7 431 719 121 402 1.07e-51 186
MsG0880044636.01.T01 AT5G39000 41.135 282 159 5 437 713 511 790 1.22e-51 194
MsG0880044636.01.T01 AT4G32000 35.294 340 207 4 375 713 69 396 1.23e-51 186
MsG0880044636.01.T01 AT3G05140 38.889 306 176 8 426 727 123 421 1.39e-51 187
MsG0880044636.01.T01 AT2G43700 34.561 353 211 8 374 723 277 612 1.39e-51 191
MsG0880044636.01.T01 AT4G11900 37.954 303 163 9 238 530 336 623 1.44e-51 190
MsG0880044636.01.T01 AT4G11900 33.155 187 90 7 72 231 65 243 3.03e-15 80.1
MsG0880044636.01.T01 AT4G11900 37.954 303 163 9 238 530 336 623 1.44e-51 190
MsG0880044636.01.T01 AT4G11900 33.155 187 90 7 72 231 65 243 3.03e-15 80.1
MsG0880044636.01.T01 AT2G25220 32.808 381 236 6 349 713 37 413 1.46e-51 186
MsG0880044636.01.T01 AT1G06840 33.889 360 210 8 363 713 551 891 1.65e-51 194
MsG0880044636.01.T01 AT1G66980 37.101 345 186 11 396 730 754 1077 1.71e-51 194
MsG0880044636.01.T01 AT5G03320 36.688 308 184 3 420 717 57 363 1.73e-51 185
MsG0880044636.01.T01 AT5G03320 36.688 308 184 3 420 717 57 363 1.73e-51 185
MsG0880044636.01.T01 AT2G13800 38.562 306 175 6 424 719 250 552 1.77e-51 189
MsG0880044636.01.T01 AT2G13800 38.562 306 175 6 424 719 250 552 1.77e-51 189
MsG0880044636.01.T01 AT1G66980 37.101 345 186 11 396 730 771 1094 2.21e-51 194
MsG0880044636.01.T01 AT4G17660 38.462 312 165 9 423 718 70 370 2.26e-51 184
MsG0880044636.01.T01 AT1G35710 38.754 289 157 5 432 712 839 1115 2.28e-51 194

Find 145 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 378 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCTTTGGTTTGGTGATCTTT+TGG 0.160548 8:+46054625 MsG0880044636.01.T01:CDS
CTCCAATTTCGAGGCGATTT+TGG 0.180445 8:-46054377 None:intergenic
AATCACAGCTACAATCTTAT+TGG 0.181476 8:+46056742 MsG0880044636.01.T01:CDS
CCATTCCTTATCTCCGATTC+AGG 0.230069 8:-46054015 None:intergenic
CAAACCGCTATGTAGGAATT+TGG 0.236838 8:+46053587 MsG0880044636.01.T01:CDS
CTCCAAAATCGCCTCGAAAT+TGG 0.238317 8:+46054375 MsG0880044636.01.T01:CDS
TCTTCAGGTCAAATGACTTA+TGG 0.263212 8:+46053973 MsG0880044636.01.T01:CDS
TATCCCATCGATCGCATATT+CGG 0.268214 8:-46056632 None:intergenic
AAACTTGGTGAAGGTGGTTT+TGG 0.288442 8:+46055826 MsG0880044636.01.T01:CDS
TCGATATGGTTCAAGGAAAA+TGG 0.289756 8:+46055304 MsG0880044636.01.T01:CDS
ATAAAATTCCATACCTGTTT+CGG 0.296349 8:-46054702 None:intergenic
AGGAACCTAGTTAAGGTTCT+TGG 0.300190 8:+46056084 MsG0880044636.01.T01:CDS
AGATACTTCATTTGTTGAAT+AGG 0.309769 8:-46057084 None:intergenic
GTTAAGAAGATAGGCTCTTT+TGG 0.314641 8:-46057032 None:intergenic
GCGAAACGAATACCATTAAA+AGG 0.314994 8:-46054063 None:intergenic
TGAAATGAAACAAGAAGATT+TGG 0.316209 8:+46055741 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTATTGTTAGAGATTATAAA+TGG 0.320161 8:+46056691 MsG0880044636.01.T01:CDS
AATAACAGAGGCAAGTCTTT+GGG 0.325936 8:+46051540 MsG0880044636.01.T01:CDS
TAGGTTCCTATGTTGGAGTT+TGG 0.327130 8:-46056070 None:intergenic
ATTGTAGCTGTGATTTGAAT+AGG 0.329204 8:-46056734 None:intergenic
ACCTAACAAGCGGTCTTAAT+AGG 0.337402 8:+46053917 MsG0880044636.01.T01:CDS
TAGCCAGACCAGAGGTTGTT+TGG 0.342339 8:+46051617 MsG0880044636.01.T01:CDS
AACTGGGATGACCCTTCTTC+AGG 0.347904 8:+46053958 MsG0880044636.01.T01:CDS
GTCATAGTTGGTCTGTCATT+TGG 0.353399 8:-46056966 None:intergenic
TCAATGTGTGAGTGTTTAAC+TGG 0.354659 8:+46054347 MsG0880044636.01.T01:CDS
TATACGCGGTTCAACATTAT+AGG 0.355636 8:+46056319 MsG0880044636.01.T01:CDS
GCTATATACATCAGATTTGA+TGG 0.356938 8:-46056659 None:intergenic
ATGCCGGATTTGTCACTGAT+TGG 0.360814 8:-46053661 None:intergenic
TTCACCAGGACTCTAGATTA+AGG 0.361606 8:+46056368 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTCCAACCAAGCTTCATTCC+TGG 0.363401 8:-46053895 None:intergenic
AACTTCATAGCAAGGCTCTT+AGG 0.368393 8:+46053778 MsG0880044636.01.T01:CDS
GCCTATTAAGACCGCTTGTT+AGG 0.369825 8:-46053918 None:intergenic
ATGGAAGTGGTTGCATCCTT+TGG 0.370539 8:+46054609 MsG0880044636.01.T01:CDS
CAATAACAGAGGCAAGTCTT+TGG 0.375904 8:+46051539 MsG0880044636.01.T01:CDS
TCCATACCTGTTTCGGAGAC+AGG 0.376374 8:-46054695 None:intergenic
ATCCCATCGATCGCATATTC+GGG 0.379767 8:-46056631 None:intergenic
TTCCAGACACAAAGCAATCT+TGG 0.385368 8:+46054495 MsG0880044636.01.T01:CDS
GAACTTCCTTTGTTTGACTT+TGG 0.386652 8:+46055763 MsG0880044636.01.T01:CDS
GAGCCTTGCTATGAAGTTTG+AGG 0.388846 8:-46053773 None:intergenic
ATCCAAGATTGCTTTGTGTC+TGG 0.398407 8:-46054497 None:intergenic
AACACTAACATCCTTGGAAA+TGG 0.401721 8:+46054590 MsG0880044636.01.T01:CDS
GTCATTTGAGAAGTCATTAG+TGG 0.405623 8:-46055800 None:intergenic
CCTACTGATACAATTCTTCC+AGG 0.409393 8:+46053877 MsG0880044636.01.T01:CDS
AGATCCCCTGTCTCCGAAAC+AGG 0.415187 8:+46054689 MsG0880044636.01.T01:CDS
AAATCTGATGTATATAGCTT+TGG 0.418777 8:+46056664 MsG0880044636.01.T01:CDS
ACTGCTATATCTTGTCCATC+TGG 0.419542 8:-46055982 None:intergenic
ATCACAGCTACAATCTTATT+GGG 0.419718 8:+46056743 MsG0880044636.01.T01:CDS
ACAAACAAAGGCGGGTTACT+TGG 0.420937 8:+46051677 MsG0880044636.01.T01:CDS
GTGTTAAGATGCATTCATAT+TGG 0.425143 8:+46056921 MsG0880044636.01.T01:CDS
ATGTAATCAATCAAAGTAAT+CGG 0.429335 8:-46051649 None:intergenic
GAAATTGGAGTGAAAAGAAC+TGG 0.432556 8:+46054390 MsG0880044636.01.T01:CDS
TATTCATCAGTTAAGAAGAT+AGG 0.435122 8:-46057041 None:intergenic
GAAGTTTGAGGTTGAAGGTT+TGG 0.436705 8:-46053761 None:intergenic
TTTGTTCCAAACTCCAACAT+AGG 0.440299 8:+46056064 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTCTCAAATGACAACAAACT+TGG 0.446577 8:+46055811 MsG0880044636.01.T01:CDS
TATAGATCTTGTCCAGCATC+TGG 0.446948 8:-46054662 None:intergenic
AGTGGTTGCATCCTTTGGTT+TGG 0.447609 8:+46054614 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTCCAGGAATGAAGCTTGGT+TGG 0.452170 8:+46053893 MsG0880044636.01.T01:CDS
AAAACCAACTCCAAATTAAG+AGG 0.452629 8:+46055401 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTTGCAACATTGATGATGTC+TGG 0.456687 8:+46051589 MsG0880044636.01.T01:CDS
CATGACACTTGAGAAATGTA+AGG 0.458421 8:+46054529 MsG0880044636.01.T01:CDS
GCGACTCAAGGAAATCGATA+TGG 0.459948 8:+46055290 MsG0880044636.01.T01:CDS
ATAGCAAGGCTCTTAGGTAC+TGG 0.474793 8:+46053784 MsG0880044636.01.T01:CDS
AAGGAAATCGATATGGTTCA+AGG 0.475808 8:+46055297 MsG0880044636.01.T01:CDS
GCTATGAAGTTTGAGGTTGA+AGG 0.477271 8:-46053766 None:intergenic
TGTTGTAGGCATGGAGATTG+TGG 0.477712 8:+46056832 MsG0880044636.01.T01:intron
ATTACCTCTTAATTTGGAGT+TGG 0.478525 8:-46055405 None:intergenic
AATTCCTACATAGCGGTTTG+TGG 0.480939 8:-46053584 None:intergenic
AGAAATGTAAGGGTAAATGT+TGG 0.485017 8:+46054540 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTTGGATACTTGTTTGGAAG+AGG 0.486084 8:+46056878 MsG0880044636.01.T01:CDS
TTTGTTTACGCTCAATATGC+CGG 0.487262 8:-46053677 None:intergenic
CCAACATAGGAACCTAGTTA+AGG 0.490671 8:+46056077 MsG0880044636.01.T01:CDS
GGCGGGTTACTTGGAGCTCC+AGG 0.491306 8:+46051686 MsG0880044636.01.T01:CDS
TATGCAAACACTAACATCCT+TGG 0.492671 8:+46054584 MsG0880044636.01.T01:CDS
GCTCTTAGGTACTGGAAACT+TGG 0.493117 8:+46053792 MsG0880044636.01.T01:CDS
GGAAACACAAGTAGAGTTGT+TGG 0.493509 8:+46056499 MsG0880044636.01.T01:CDS
GAGTCGCAGCTACTTTATCT+CGG 0.494898 8:-46055274 None:intergenic
ATTCCAAACAACCTCTGGTC+TGG 0.497478 8:-46051620 None:intergenic
AAGAAGTGACAATCCTGAAT+CGG 0.500175 8:+46054002 MsG0880044636.01.T01:CDS
GAGAAAGACCATAGTGATCA+TGG 0.501210 8:+46053826 MsG0880044636.01.T01:CDS
GAAATGTAAGGGTAAATGTT+GGG 0.509509 8:+46054541 MsG0880044636.01.T01:CDS
TGAAGTATCTATGACAATGT+TGG 0.510495 8:+46057097 MsG0880044636.01.T01:CDS
AGTAAAAGCCATGATCACTA+TGG 0.510576 8:-46053834 None:intergenic
AATCCAATCAGTGACAAATC+CGG 0.511250 8:+46053658 MsG0880044636.01.T01:CDS
TGTGGAGGTGATCAGATTCA+AGG 0.511636 8:+46056478 MsG0880044636.01.T01:CDS
ATTCTTCCAGGAATGAAGCT+TGG 0.513302 8:+46053889 MsG0880044636.01.T01:CDS
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TTGAGAGAATTACCAGATGC+TGG 0.518279 8:+46054650 MsG0880044636.01.T01:CDS
TAGAGTCCTGGTGAAGGTAA+AGG 0.519903 8:-46056360 None:intergenic
CCTTAACTAGGTTCCTATGT+TGG 0.520303 8:-46056077 None:intergenic
AACATCCTTGGAAATGGAAG+TGG 0.523213 8:+46054596 MsG0880044636.01.T01:CDS
CCATACCTGTTTCGGAGACA+GGG 0.526604 8:-46054694 None:intergenic
ACAATCCTGAATCGGAGATA+AGG 0.526768 8:+46054010 MsG0880044636.01.T01:CDS
TAAGTCATTTGACCTGAAGA+AGG 0.528682 8:-46053970 None:intergenic
TTGGATACTTGTTTGGAAGA+GGG 0.532141 8:+46056879 MsG0880044636.01.T01:CDS
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TTAATAGGCAACTAACAGCT+TGG 0.539913 8:+46053932 MsG0880044636.01.T01:CDS
GTAGAATTCCAAACAACCTC+TGG 0.542533 8:-46051625 None:intergenic
ACTGATTGGATTGTCGCGAT+TGG 0.545504 8:-46053647 None:intergenic
TGCAACCACTTCCATTTCCA+AGG 0.549425 8:-46054601 None:intergenic
AAGCATCACAATTAATGAAG+TGG 0.549739 8:-46055345 None:intergenic
ACAAGCACAGATGTCATAGT+TGG 0.549942 8:-46056978 None:intergenic
TTCGTTGATTCCTTGAGTAG+AGG 0.550932 8:-46056022 None:intergenic
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TTCAAGGAAAATGGTAATTG+TGG 0.555298 8:+46055313 MsG0880044636.01.T01:CDS
TAGCGGTTTGTGGAACTACC+AGG 0.555497 8:-46053574 None:intergenic
AGTTCCACAAACCGCTATGT+AGG 0.559145 8:+46053580 MsG0880044636.01.T01:CDS
GAGACTACGCAAATAACTAC+AGG 0.565261 8:-46051566 None:intergenic
GACAACAAACTTGGTGAAGG+TGG 0.565866 8:+46055820 MsG0880044636.01.T01:CDS
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ACTTAACCTACCTTATACAC+AGG 0.578491 8:-46055850 None:intergenic
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AGTTAAACACTCACACATTG+AGG 0.579576 8:-46054345 None:intergenic
TTCGGCCTAGCTCGAATGTG+TGG 0.580923 8:+46056460 MsG0880044636.01.T01:CDS
CACCTCCACACATTCGAGCT+AGG 0.582036 8:-46056465 None:intergenic
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TGATCCTTAATCTAGAGTCC+TGG 0.596049 8:-46056372 None:intergenic
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TTAATCTAGAGTCCTGGTGA+AGG 0.605906 8:-46056366 None:intergenic
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CATACCTGTTTCGGAGACAG+GGG 0.661385 8:-46054693 None:intergenic
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AATCAACGAATTTAAGAACG+AGG 0.692272 8:+46056035 MsG0880044636.01.T01:CDS
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CTTGGTTGGAACCTAACAAG+CGG 0.707164 8:+46053907 MsG0880044636.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! AAGAAAAATTGTTAATAATA+TGG + Chr8:46052857-46052876 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
!! TAATAATAATAAAAGTTACA+AGG + Chr8:46052952-46052971 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
!!! AATTAATATAAGGATAATTT+TGG + Chr8:46052992-46053011 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
!!! ATAAAAAAGTATATATTTAC+GGG - Chr8:46054869-46054888 None:intergenic 10.0%
!!! ATTACAAATGTAATTTTTTA+AGG + Chr8:46055951-46055970 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
!!! GTAATATTTTTTTTAAGTTA+TGG - Chr8:46054982-46055001 None:intergenic 10.0%
!!! TATTTAACATGATTTTAATT+TGG + Chr8:46055571-46055590 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
!!! TGAGATTTTAAATTAATATA+AGG + Chr8:46052982-46053001 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
!!! TTACAAATGTAATTTTTTAA+GGG + Chr8:46055952-46055971 MsG0880044636.01.T01:intron 10.0%
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!! AAGTAAAAAAATTATTGTTG+TGG - Chr8:46054779-46054798 None:intergenic 15.0%
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!!! ATAACAAATGTATTAATTTG+AGG - Chr8:46056588-46056607 None:intergenic 15.0%
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!!! TAAAAAAGTATATATTTACG+GGG - Chr8:46054868-46054887 None:intergenic 15.0%
!!! TCCTTATTTAATTAAGTTTA+AGG - Chr8:46052723-46052742 None:intergenic 15.0%
!!! TCTAATCTTTTATTTTATAG+AGG + Chr8:46055684-46055703 MsG0880044636.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTACTATTATTAGGTTAT+AGG - Chr8:46052910-46052929 None:intergenic 15.0%
!! AAAAAACATGATAGATAGAA+TGG - Chr8:46053431-46053450 None:intergenic 20.0%
!! ACTAAGTTTAAATATGCTTT+AGG + Chr8:46054752-46054771 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
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!! ATTCTTTGTCTTTGTATTAT+TGG + Chr8:46052172-46052191 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
!! CCCTTAAACTTAATTAAATA+AGG + Chr8:46052719-46052738 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
!! GATGATGAATTAAAAAAGTT+AGG - Chr8:46055924-46055943 None:intergenic 20.0%
!! GTAAAAATTACCTCTTAATT+TGG - Chr8:46055414-46055433 None:intergenic 20.0%
!! GTTCTTAATAACACAAAAAA+TGG + Chr8:46053405-46053424 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
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!! TATGTTAAAACCATGAAAAA+CGG + Chr8:46053293-46053312 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
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!!! ATGATAGTTATTTTTCCTTT+TGG + Chr8:46051747-46051766 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
!!! CAAAAAATAATAAAGTACCA+AGG - Chr8:46051719-46051738 None:intergenic 20.0%
!!! GAAAGTAATGATTGATTTTT+GGG - Chr8:46054171-46054190 None:intergenic 20.0%
!!! GATTTTTAATTTGAAGTGTT+TGG - Chr8:46053075-46053094 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTTTTGCTTTTGGATAT+TGG - Chr8:46055081-46055100 None:intergenic 20.0%
!!! TCTGTAATATTTTTTGCTTT+TGG - Chr8:46055088-46055107 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTGTTGTTTTGTATATTA+CGG + Chr8:46054896-46054915 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAAAGTAATGATTGATTTT+TGG - Chr8:46054172-46054191 None:intergenic 20.0%
!!! TTATTGTTTTTGATTGTTGT+AGG + Chr8:46056818-46056837 MsG0880044636.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGGTTCAATTTTTAGAAA+GGG - Chr8:46053057-46053076 None:intergenic 20.0%
! AAATCTGATGTATATAGCTT+TGG + Chr8:46056664-46056683 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTAAGTGTTTGTAATTTG+TGG + Chr8:46052012-46052031 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
! AAGTATCCAAAAATTCCATT+GGG - Chr8:46056869-46056888 None:intergenic 25.0%
! AGTCCAAAAATATCTGATTT+CGG + Chr8:46056442-46056461 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAAATTCCATACCTGTTT+CGG - Chr8:46054705-46054724 None:intergenic 25.0%
! ATTATACCAAAGTCAAACAA+AGG - Chr8:46055772-46055791 None:intergenic 25.0%
! CATAAAATTTCAAAGTGTGA+AGG + Chr8:46054472-46054491 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
! TAACTGATGTTTCAATTTGT+CGG - Chr8:46055161-46055180 None:intergenic 25.0%
! TATTCATCAGTTAAGAAGAT+AGG - Chr8:46057044-46057063 None:intergenic 25.0%
! TCAAAATCGACATAGAATAA+TGG - Chr8:46054114-46054133 None:intergenic 25.0%
! TGAAATGAAACAAGAAGATT+TGG + Chr8:46055741-46055760 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
! TGTAGAGAGAAAAATAAAGA+TGG + Chr8:46054446-46054465 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATGTTTGGTTAATCAAA+AGG - Chr8:46051897-46051916 None:intergenic 25.0%
! TTCTTCTAAATATATCCGTT+TGG - Chr8:46053138-46053157 None:intergenic 25.0%
! TTGAAGATAACACATTAAGT+AGG - Chr8:46053376-46053395 None:intergenic 25.0%
!! AAAAGGATGAGAGATTTTAA+TGG - Chr8:46051880-46051899 None:intergenic 25.0%
!! AAAGAAGTCTAAGCTTTTAT+TGG - Chr8:46056157-46056176 None:intergenic 25.0%
!! AAGAAGTCTAAGCTTTTATT+GGG - Chr8:46056156-46056175 None:intergenic 25.0%
!! AGACAAAGAATTTTGTTCTT+TGG - Chr8:46052163-46052182 None:intergenic 25.0%
!! AGATACTTCATTTGTTGAAT+AGG - Chr8:46057087-46057106 None:intergenic 25.0%
!! ATTACATTTTGCACAAACAA+AGG + Chr8:46051665-46051684 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACATGCAACTTGTTATTTTA+AGG + Chr8:46055875-46055894 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
!!! AGAGATTATTTTAACATCAG+AGG + Chr8:46052434-46052453 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
!!! CACAACCTAAAATTTTAATC+CGG - Chr8:46051817-46051836 None:intergenic 25.0%
!!! CATCCATTTTTTATTCTCTT+CGG - Chr8:46054244-46054263 None:intergenic 25.0%
!!! CATTTGTTATTTTCTTTCAG+TGG + Chr8:46056598-46056617 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
!!! GGAATAATGGATTAGTAATA+GGG + Chr8:46052798-46052817 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTTGGTTCAATTTTTAGAA+AGG - Chr8:46053058-46053077 None:intergenic 25.0%
!!! TATTCATCACGTTTTTTTGT+TGG + Chr8:46055372-46055391 MsG0880044636.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGGAATAATGGATTAGTAAT+AGG + Chr8:46052797-46052816 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCAAAATAGTTTGTTGAAC+AGG + Chr8:46053221-46053240 MsG0880044636.01.T01:intron 25.0%
AAAACCAACTCCAAATTAAG+AGG + Chr8:46055401-46055420 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
AAGCATCACAATTAATGAAG+TGG - Chr8:46055348-46055367 None:intergenic 30.0%
AATCAACGAATTTAAGAACG+AGG + Chr8:46056035-46056054 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
AATCACAGCTACAATCTTAT+TGG + Chr8:46056742-46056761 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
AGAAATGTAAGGGTAAATGT+TGG + Chr8:46054540-46054559 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
AGTGTATACTTCATTTCATG+TGG + Chr8:46052089-46052108 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
ATATTGAGCGTAAACAAAGA+AGG + Chr8:46053682-46053701 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
ATCAACAAAGTGCACAATTA+CGG + Chr8:46052465-46052484 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
ATCACAGCTACAATCTTATT+GGG + Chr8:46056743-46056762 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
ATGACACTTGAGAAATGTAA+GGG + Chr8:46054530-46054549 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTAGCTGTGATTTGAAT+AGG - Chr8:46056737-46056756 None:intergenic 30.0%
ATTTATAGACGCAATAACAG+AGG + Chr8:46051528-46051547 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
CAAGTATCCAAAAATTCCAT+TGG - Chr8:46056870-46056889 None:intergenic 30.0%
CCCTATAAAAACAGTTGTTT+GGG + Chr8:46053621-46053640 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
GAAATGTAAGGGTAAATGTT+GGG + Chr8:46054541-46054560 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
GCTATATACATCAGATTTGA+TGG - Chr8:46056662-46056681 None:intergenic 30.0%
GTGCATAGCTAGTATTATAT+AGG + Chr8:46055647-46055666 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
GTGTTAAGATGCATTCATAT+TGG + Chr8:46056921-46056940 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
TATACTTCATTTCATGTGGA+TGG + Chr8:46052093-46052112 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
TCCCTATAAAAACAGTTGTT+TGG + Chr8:46053620-46053639 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAGGAAAATGGTAATTG+TGG + Chr8:46055313-46055332 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
TTCTCAAATGACAACAAACT+TGG + Chr8:46055811-46055830 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
TTGAAAACTAGCTGTATGTT+TGG - Chr8:46051909-46051928 None:intergenic 30.0%
! AATTTGATTGAAGCATCAGT+TGG + Chr8:46051979-46051998 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
! AGCTTAGACTTCTTTCTTTT+TGG + Chr8:46056162-46056181 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAGTTTCAGAGGAAATTT+TGG - Chr8:46053479-46053498 None:intergenic 30.0%
! ATTACCTCTTAATTTGGAGT+TGG - Chr8:46055408-46055427 None:intergenic 30.0%
! ATTTTCTTTCAGTGGCTATA+TGG + Chr8:46056606-46056625 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
! CTGTTCCGGATTAAAATTTT+AGG + Chr8:46051809-46051828 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
! TGAAGTATCTATGACAATGT+TGG + Chr8:46057097-46057116 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTAACATCAGAGGCTATT+TGG + Chr8:46052442-46052461 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
!! GGAATTTTTGGATACTTGTT+TGG + Chr8:46056872-46056891 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
!! GTCTCTGTTTTTCTTAACAT+TGG + Chr8:46055461-46055480 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
!! GTTCAATTTTTAGAAAGGGA+GGG - Chr8:46053053-46053072 None:intergenic 30.0%
!! TTCAATTTTTAGAAAGGGAG+GGG - Chr8:46053052-46053071 None:intergenic 30.0%
!! TTTTTGCTTTTGGATATTGG+TGG - Chr8:46055078-46055097 None:intergenic 30.0%
!!! AAGTTTTAGATTGGTATACG+CGG + Chr8:46056305-46056324 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACAGCTAGTTTTCAATCTAT+TGG + Chr8:46051914-46051933 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
!!! ACCCAAACAACTGTTTTTAT+AGG - Chr8:46053625-46053644 None:intergenic 30.0%
!!! AGGAGCAAGGTTTTAAATAA+TGG - Chr8:46053356-46053375 None:intergenic 30.0%
!!! CCCAAACAACTGTTTTTATA+GGG - Chr8:46053624-46053643 None:intergenic 30.0%
!!! CTCGAAGTAAAGTTTTAGAT+TGG + Chr8:46056296-46056315 MsG0880044636.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTAATGATTGATTTTTGGGT+TGG - Chr8:46054167-46054186 None:intergenic 30.0%
!!! TGTCGATTTTGAGTACAAAA+AGG + Chr8:46054122-46054141 MsG0880044636.01.T01:intron 30.0%
AAAAGCCAAGAACCTTAACT+AGG - Chr8:46056092-46056111 None:intergenic 35.0%
AACACTAACATCCTTGGAAA+TGG + Chr8:46054590-46054609 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
AACTAACAGCTTGGAAAAAC+TGG + Chr8:46053941-46053960 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGTGACAATCCTGAAT+CGG + Chr8:46054002-46054021 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAAATCGATATGGTTCA+AGG + Chr8:46055297-46055316 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
AAGTACCAAGGTAATTTACC+TGG - Chr8:46051707-46051726 None:intergenic 35.0%
AAGTCATTTGACCTGAAGAA+GGG - Chr8:46053972-46053991 None:intergenic 35.0%
AATAACAGAGGCAAGTCTTT+GGG + Chr8:46051540-46051559 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
AATCCAATCAGTGACAAATC+CGG + Chr8:46053658-46053677 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
ACTAACAGCTTGGAAAAACT+GGG + Chr8:46053942-46053961 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
ACTATTATCCCTGATACGTT+TGG + Chr8:46052557-46052576 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
ACTTAACCTACCTTATACAC+AGG - Chr8:46055853-46055872 None:intergenic 35.0%
AGTAAAAGCCATGATCACTA+TGG - Chr8:46053837-46053856 None:intergenic 35.0%
AGTTAAACACTCACACATTG+AGG - Chr8:46054348-46054367 None:intergenic 35.0%
ATCAGGGATAATAGTCACTT+TGG - Chr8:46052552-46052571 None:intergenic 35.0%
CAATGTAGACGATGGAATAA+TGG + Chr8:46052785-46052804 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
CAATTTCTTCCACTTCATGA+TGG + Chr8:46053508-46053527 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
CATGACACTTGAGAAATGTA+AGG + Chr8:46054529-46054548 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
CGAAAATGACCATGATCAAA+AGG - Chr8:46053323-46053342 None:intergenic 35.0%
CGTTATGATATCAGTTTCAG+AGG - Chr8:46053488-46053507 None:intergenic 35.0%
CTTGTTCTTCTCAGCAAAAA+TGG + Chr8:46053709-46053728 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
GAAATTGGAGTGAAAAGAAC+TGG + Chr8:46054390-46054409 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
GATGTGTGCATAATGAAACT+TGG + Chr8:46054420-46054439 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
GCGAAACGAATACCATTAAA+AGG - Chr8:46054066-46054085 None:intergenic 35.0%
GGTCCGAAGAGAATAAAAAA+TGG + Chr8:46054238-46054257 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
GTCATTTGAGAAGTCATTAG+TGG - Chr8:46055803-46055822 None:intergenic 35.0%
GTTGAAGAGAAGAAACTGTT+TGG - Chr8:46054209-46054228 None:intergenic 35.0%
GTTGTATTTGAATGTTCCGA+GGG + Chr8:46054263-46054282 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
TAACAACACAATGTAGACGA+TGG + Chr8:46052777-46052796 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
TAACACATTAAGTAGGAGCA+AGG - Chr8:46053369-46053388 None:intergenic 35.0%
TAAGTCATTTGACCTGAAGA+AGG - Chr8:46053973-46053992 None:intergenic 35.0%
TACAATCGATGTAGTTCGTT+GGG + Chr8:46054300-46054319 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
TACCATTAAAAGGTCCACTT+CGG - Chr8:46054056-46054075 None:intergenic 35.0%
TATACGCGGTTCAACATTAT+AGG + Chr8:46056319-46056338 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TATGCAAACACTAACATCCT+TGG + Chr8:46054584-46054603 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TCAATGTGTGAGTGTTTAAC+TGG + Chr8:46054347-46054366 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAAACTCTCAAACCAAA+CGG + Chr8:46053120-46053139 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
TCGATATGGTTCAAGGAAAA+TGG + Chr8:46055304-46055323 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCAGGTCAAATGACTTA+TGG + Chr8:46053973-46053992 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TGAACCAAATTCCTACATAG+CGG - Chr8:46053594-46053613 None:intergenic 35.0%
TGTTGTATTTGAATGTTCCG+AGG + Chr8:46054262-46054281 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
TTAATAGGCAACTAACAGCT+TGG + Chr8:46053932-46053951 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TTGGATACTTGTTTGGAAGA+GGG + Chr8:46056879-46056898 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGATACTTGTTTGGAAG+AGG + Chr8:46056878-46056897 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTCTCAACTCTCAAACA+TGG - Chr8:46055627-46055646 None:intergenic 35.0%
TTTGTTCCAAACTCCAACAT+AGG + Chr8:46056064-46056083 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTTTACGCTCAATATGC+CGG - Chr8:46053680-46053699 None:intergenic 35.0%
! AAAAGTGTGTTTGGTTCACA+AGG + Chr8:46052660-46052679 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
! AAAGTGTGTTTGGTTCACAA+GGG + Chr8:46052661-46052680 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
! AATGACAACAAACTTGGTGA+AGG + Chr8:46055817-46055836 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
! ACATTTTGCACAAACAAAGG+CGG + Chr8:46051668-46051687 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
! AGGCCGAAATCAGATATTTT+TGG - Chr8:46056448-46056467 None:intergenic 35.0%
! AGTTTCAGAGGAAATTTTGG+TGG - Chr8:46053476-46053495 None:intergenic 35.0%
! ATACGTTTGGTTCGAGAATT+AGG + Chr8:46052570-46052589 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
! ATGCATCCCAATGGAATTTT+TGG + Chr8:46056860-46056879 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
! CATTTTTGCTGAGAAGAACA+AGG - Chr8:46053711-46053730 None:intergenic 35.0%
! GAACTTCCTTTGTTTGACTT+TGG + Chr8:46055763-46055782 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
! GTGATCATGGCTTTTACTTA+TGG + Chr8:46053839-46053858 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
! GTTAAGAAGATAGGCTCTTT+TGG - Chr8:46057035-46057054 None:intergenic 35.0%
! TTATCTCGGTTTGCTTGATA+GGG - Chr8:46055263-46055282 None:intergenic 35.0%
! TTCTTTTCACTCCAATTTCG+AGG - Chr8:46054389-46054408 None:intergenic 35.0%
! TTTATCTCGGTTTGCTTGAT+AGG - Chr8:46055264-46055283 None:intergenic 35.0%
! TTTGGTTCGAGAATTAGGAA+GGG + Chr8:46052575-46052594 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
!! AGGATGAGAGATTTTAATGG+AGG - Chr8:46051877-46051896 None:intergenic 35.0%
!! GATGAGAGATTTTAATGGAG+GGG - Chr8:46051875-46051894 None:intergenic 35.0%
!! GGATGAGAGATTTTAATGGA+GGG - Chr8:46051876-46051895 None:intergenic 35.0%
!! GGTTCAATTTTTAGAAAGGG+AGG - Chr8:46053054-46053073 None:intergenic 35.0%
!! GTTTTTGATTGTTGTAGGCA+TGG + Chr8:46056823-46056842 MsG0880044636.01.T01:intron 35.0%
!! TTTGCAACATTGATGATGTC+TGG + Chr8:46051589-46051608 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCATCACGTTTTTTTGTTGG+AGG + Chr8:46055375-46055394 MsG0880044636.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTGGTTTGAGAGTTTTGGA+GGG - Chr8:46053120-46053139 None:intergenic 35.0%
AAAAAACACTGTGCGACAAG+CGG - Chr8:46053203-46053222 None:intergenic 40.0%
AACATCCTTGGAAATGGAAG+TGG + Chr8:46054596-46054615 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
AACTTCATAGCAAGGCTCTT+AGG + Chr8:46053778-46053797 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
AATGTGCTTCCATCATGAAG+TGG - Chr8:46053520-46053539 None:intergenic 40.0%
AATTCCTACATAGCGGTTTG+TGG - Chr8:46053587-46053606 None:intergenic 40.0%
ACAAGCACAGATGTCATAGT+TGG - Chr8:46056981-46057000 None:intergenic 40.0%
ACAATCCTGAATCGGAGATA+AGG + Chr8:46054010-46054029 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
ACCTAACAAGCGGTCTTAAT+AGG + Chr8:46053917-46053936 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
ACTGCTATATCTTGTCCATC+TGG - Chr8:46055985-46056004 None:intergenic 40.0%
AGGAACCTAGTTAAGGTTCT+TGG + Chr8:46056084-46056103 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
AGTGAAAAGAACTGGAGTCA+AGG + Chr8:46054398-46054417 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
ATAACAGAGGCAAGTCTTTG+GGG + Chr8:46051541-46051560 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
ATCCAAGATTGCTTTGTGTC+TGG - Chr8:46054500-46054519 None:intergenic 40.0%
ATCTGCGAAATGTACCACTA+CGG - Chr8:46052123-46052142 None:intergenic 40.0%
ATTAGAGAGATGAAGGTGAG+AGG - Chr8:46051852-46051871 None:intergenic 40.0%
ATTATAGGTGGTATCGCTAG+AGG + Chr8:46056334-46056353 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
ATTCTCGAACCAAACGTATC+AGG - Chr8:46052569-46052588 None:intergenic 40.0%
ATTCTTCCAGGAATGAAGCT+TGG + Chr8:46053889-46053908 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
CAAACCGCTATGTAGGAATT+TGG + Chr8:46053587-46053606 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
CAACCTCAAACTTCATAGCA+AGG + Chr8:46053770-46053789 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
CAATAACAGAGGCAAGTCTT+TGG + Chr8:46051539-46051558 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
CCAAAAGATCACCAAACCAA+AGG - Chr8:46054628-46054647 None:intergenic 40.0%
CCAACATAGGAACCTAGTTA+AGG + Chr8:46056077-46056096 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
CCTACTGATACAATTCTTCC+AGG + Chr8:46053877-46053896 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
CCTGAACAATCGACAATCTA+CGG - Chr8:46052041-46052060 None:intergenic 40.0%
CCTGGAAGAATTGTATCAGT+AGG - Chr8:46053880-46053899 None:intergenic 40.0%
CCTTAACTAGGTTCCTATGT+TGG - Chr8:46056080-46056099 None:intergenic 40.0%
CTACAATCGATGTAGTTCGT+TGG + Chr8:46054299-46054318 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
CTGAACAATCGACAATCTAC+GGG - Chr8:46052040-46052059 None:intergenic 40.0%
CTTTCACATACCTCTACTCA+AGG + Chr8:46056012-46056031 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAAGACCATAGTGATCA+TGG + Chr8:46053826-46053845 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
GAGACTACGCAAATAACTAC+AGG - Chr8:46051569-46051588 None:intergenic 40.0%
GCAAAAATGGCACAACTCAT+TGG + Chr8:46053722-46053741 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
GGAAACACAAGTAGAGTTGT+TGG + Chr8:46056499-46056518 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
GTAGAATTCCAAACAACCTC+TGG - Chr8:46051628-46051647 None:intergenic 40.0%
GTGTGCATAATGAAACTTGG+AGG + Chr8:46054423-46054442 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
GTGTTATCTTCAACTTCGTG+TGG + Chr8:46053383-46053402 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
TAGATATCACATTCCTCCCT+CGG - Chr8:46054282-46054301 None:intergenic 40.0%
TAGGTTCCTATGTTGGAGTT+TGG - Chr8:46056073-46056092 None:intergenic 40.0%
TATAGATCTTGTCCAGCATC+TGG - Chr8:46054665-46054684 None:intergenic 40.0%
TATCCCATCGATCGCATATT+CGG - Chr8:46056635-46056654 None:intergenic 40.0%
TATTAGTTCGTGCACTGTTC+CGG + Chr8:46051795-46051814 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
TTCACCAGGACTCTAGATTA+AGG + Chr8:46056368-46056387 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
TTCCAGACACAAAGCAATCT+TGG + Chr8:46054495-46054514 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
TTCTCGAACCAAACGTATCA+GGG - Chr8:46052568-46052587 None:intergenic 40.0%
TTGAACAGGATCACATTCTC+AGG + Chr8:46053235-46053254 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
TTGAGAGAATTACCAGATGC+TGG + Chr8:46054650-46054669 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCTGTGAATGTGTACT+AGG - Chr8:46052533-46052552 None:intergenic 40.0%
TTTGGTCCTGTGTATAAGGT+AGG + Chr8:46055844-46055863 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
! AAGTGTGTTTGGTTCACAAG+GGG + Chr8:46052662-46052681 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
! ACGGTGAGATTTGTTCATCT+TGG + Chr8:46054915-46054934 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
! ACTTCATGATGGAAGCACAT+TGG + Chr8:46053519-46053538 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
! AGAAGATAGGCTCTTTTGGT+TGG - Chr8:46057031-46057050 None:intergenic 40.0%
! CATTTTGCACAAACAAAGGC+GGG + Chr8:46051669-46051688 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGTTTGAGGTTGAAGGTT+TGG - Chr8:46053764-46053783 None:intergenic 40.0%
! GCTATGAAGTTTGAGGTTGA+AGG - Chr8:46053769-46053788 None:intergenic 40.0%
! GTCAATGGAGCATTTGAACT+GGG + Chr8:46053541-46053560 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
! GTCATAGTTGGTCTGTCATT+TGG - Chr8:46056969-46056988 None:intergenic 40.0%
! GTTTGGTTCGAGAATTAGGA+AGG + Chr8:46052574-46052593 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
! TACCGAAGTGGACCTTTTAA+TGG + Chr8:46054051-46054070 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
! TGATCCTTAATCTAGAGTCC+TGG - Chr8:46056375-46056394 None:intergenic 40.0%
! TTAATCTAGAGTCCTGGTGA+AGG - Chr8:46056369-46056388 None:intergenic 40.0%
!! AAAAGGCAGACCGTTTTTCA+TGG - Chr8:46053306-46053325 None:intergenic 40.0%
!! AAACTTGGTGAAGGTGGTTT+TGG + Chr8:46055826-46055845 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGATAGGCTCTTTTGGTTG+GGG - Chr8:46057029-46057048 None:intergenic 40.0%
!! AATTTTTAGAAAGGGAGGGG+AGG - Chr8:46053049-46053068 None:intergenic 40.0%
!! ATTTTTAGAAAGGGAGGGGA+GGG - Chr8:46053048-46053067 None:intergenic 40.0%
!! CATGGTCATTTTCGCTGTAA+GGG + Chr8:46053329-46053348 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
!! GAAGATAGGCTCTTTTGGTT+GGG - Chr8:46057030-46057049 None:intergenic 40.0%
!! TCATGGTCATTTTCGCTGTA+AGG + Chr8:46053328-46053347 MsG0880044636.01.T01:intron 40.0%
!! TTCGTTGATTCCTTGAGTAG+AGG - Chr8:46056025-46056044 None:intergenic 40.0%
!!! CCTTTGGTTTGGTGATCTTT+TGG + Chr8:46054625-46054644 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTGGTTTGAGAGTTTTGG+AGG - Chr8:46053121-46053140 None:intergenic 40.0%
!!! TCCGTTTGGTTTGAGAGTTT+TGG - Chr8:46053124-46053143 None:intergenic 40.0%
!!! TGGTTTTGGTCCTGTGTATA+AGG + Chr8:46055840-46055859 MsG0880044636.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGGTTTGAGAGTTTTGGAG+GGG - Chr8:46053119-46053138 None:intergenic 40.0%
AAAAACACTGTGCGACAAGC+GGG - Chr8:46053202-46053221 None:intergenic 45.0%
ACGAGACTTGTCAAACTACG+AGG + Chr8:46051772-46051791 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
ACGCGGTTCAACATTATAGG+TGG + Chr8:46056322-46056341 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
ACTGATTGGATTGTCGCGAT+TGG - Chr8:46053650-46053669 None:intergenic 45.0%
AGTGGTTGCATCCTTTGGTT+TGG + Chr8:46054614-46054633 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
AGTTCCACAAACCGCTATGT+AGG + Chr8:46053580-46053599 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
ATAGCAAGGCTCTTAGGTAC+TGG + Chr8:46053784-46053803 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
ATCCCATCGATCGCATATTC+GGG - Chr8:46056634-46056653 None:intergenic 45.0%
ATGCCGGATTTGTCACTGAT+TGG - Chr8:46053664-46053683 None:intergenic 45.0%
ATGGAAGTGGTTGCATCCTT+TGG + Chr8:46054609-46054628 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCAAACAACCTCTGGTC+TGG - Chr8:46051623-46051642 None:intergenic 45.0%
CATAGCGAACAAACGTGACA+TGG - Chr8:46053277-46053296 None:intergenic 45.0%
CCATTCCTTATCTCCGATTC+AGG - Chr8:46054018-46054037 None:intergenic 45.0%
CCTGAATCGGAGATAAGGAA+TGG + Chr8:46054015-46054034 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
CTCCAAAATCGCCTCGAAAT+TGG + Chr8:46054375-46054394 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
CTTCTCTTCAACGCTTAACG+TGG + Chr8:46054217-46054236 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
CTTGGTTGGAACCTAACAAG+CGG + Chr8:46053907-46053926 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
GAGCTCCAGGTAAATTACCT+TGG + Chr8:46051699-46051718 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
GATAAAGTAGCTGCGACTCA+AGG + Chr8:46055278-46055297 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
GCCTATTAAGACCGCTTGTT+AGG - Chr8:46053921-46053940 None:intergenic 45.0%
GCGACTCAAGGAAATCGATA+TGG + Chr8:46055290-46055309 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
GTATTTGAATGTTCCGAGGG+AGG + Chr8:46054266-46054285 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
GTCTGTGAATGTGTACTAGG+TGG - Chr8:46052530-46052549 None:intergenic 45.0%
GTGGAAAGAATGCATCCCAA+TGG + Chr8:46056851-46056870 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
GTTCGAGAATTAGGAAGGGA+GGG + Chr8:46052579-46052598 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
TAGAGTCCTGGTGAAGGTAA+AGG - Chr8:46056363-46056382 None:intergenic 45.0%
TCGTCGATGATATACCGAAG+TGG + Chr8:46054039-46054058 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
TGACAAGTCTCGTGACCAAA+AGG - Chr8:46051765-46051784 None:intergenic 45.0%
TGCAACCACTTCCATTTCCA+AGG - Chr8:46054604-46054623 None:intergenic 45.0%
TGTGGAGGTGATCAGATTCA+AGG + Chr8:46056478-46056497 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGTAGGCATGGAGATTG+TGG + Chr8:46056832-46056851 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
TTCCAACCAAGCTTCATTCC+TGG - Chr8:46053898-46053917 None:intergenic 45.0%
TTCCAGGAATGAAGCTTGGT+TGG + Chr8:46053893-46053912 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
TTCGAGAATTAGGAAGGGAG+GGG + Chr8:46052580-46052599 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
! AACGGTCTGCCTTTTGATCA+TGG + Chr8:46053311-46053330 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
! CCGTAGATTGTCGATTGTTC+AGG + Chr8:46052038-46052057 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
! CTCCAATTTCGAGGCGATTT+TGG - Chr8:46054380-46054399 None:intergenic 45.0%
! GACAACAAACTTGGTGAAGG+TGG + Chr8:46055820-46055839 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
! GAGCCTTGCTATGAAGTTTG+AGG - Chr8:46053776-46053795 None:intergenic 45.0%
! GAGTCGCAGCTACTTTATCT+CGG - Chr8:46055277-46055296 None:intergenic 45.0%
! GATGGAAGCACATTGGTCAA+TGG + Chr8:46053526-46053545 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
! GGTCAATGGAGCATTTGAAC+TGG + Chr8:46053540-46053559 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
! TTTAAGGGCACACTACCAGA+TGG + Chr8:46055967-46055986 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
!! ACAAACAAAGGCGGGTTACT+TGG + Chr8:46051677-46051696 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGAATTTTAACGGAGGGGA+GGG + Chr8:46052618-46052637 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
!! AGGGGAGGAATTTTAACGGA+GGG + Chr8:46052613-46052632 MsG0880044636.01.T01:intron 45.0%
!! GCTCTTAGGTACTGGAAACT+TGG + Chr8:46053792-46053811 MsG0880044636.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTTTAGAAAGGGAGGGGAG+GGG - Chr8:46053047-46053066 None:intergenic 45.0%
!!! TTTGAGAGTTTTGGAGGGGA+GGG - Chr8:46053115-46053134 None:intergenic 45.0%
!!! AATAAAAAAGTATATATTTA+CGG - Chr8:46054870-46054889 None:intergenic 5.0%
!!! AATTTTGAAAAAAATATTAA+TGG - Chr8:46055190-46055209 None:intergenic 5.0%
AACTGGGATGACCCTTCTTC+AGG + Chr8:46053958-46053977 MsG0880044636.01.T01:CDS 50.0%
AGAATTAGGAAGGGAGGGGA+GGG + Chr8:46052584-46052603 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
AGGACTCCTTTACCTTCACC+AGG + Chr8:46056354-46056373 MsG0880044636.01.T01:CDS 50.0%
ATGTGGATGGTGTTCCGTAG+TGG + Chr8:46052106-46052125 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
CACCCGAATATGCGATCGAT+GGG + Chr8:46056629-46056648 MsG0880044636.01.T01:CDS 50.0%
CATACCTGTTTCGGAGACAG+GGG - Chr8:46054696-46054715 None:intergenic 50.0%
CCATACCTGTTTCGGAGACA+GGG - Chr8:46054697-46054716 None:intergenic 50.0%
GAACTGGGTTTCTTCAGTCC+TGG + Chr8:46053556-46053575 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
GGAGGGGATTAGAGAGATGA+AGG - Chr8:46051859-46051878 None:intergenic 50.0%
GGTTCGAGAATTAGGAAGGG+AGG + Chr8:46052578-46052597 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
TAGCCAGACCAGAGGTTGTT+TGG + Chr8:46051617-46051636 MsG0880044636.01.T01:CDS 50.0%
TAGCGGTTTGTGGAACTACC+AGG - Chr8:46053577-46053596 None:intergenic 50.0%
TCCATACCTGTTTCGGAGAC+AGG - Chr8:46054698-46054717 None:intergenic 50.0%
! GGGGAGGGGAGGAATTTTAA+CGG + Chr8:46052609-46052628 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
! GTGTTTGGTTCACAAGGGGA+GGG + Chr8:46052666-46052685 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
! TGTGTTTGGTTCACAAGGGG+AGG + Chr8:46052665-46052684 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
! TGTTTGGTTCACAAGGGGAG+GGG + Chr8:46052667-46052686 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
!! ATTTTAACGGAGGGGAGGGT+AGG + Chr8:46052622-46052641 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
!! GAGGAATTTTAACGGAGGGG+AGG + Chr8:46052617-46052636 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
!! GAGGGGAGGAATTTTAACGG+AGG + Chr8:46052612-46052631 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
!! GGGGAGGAATTTTAACGGAG+GGG + Chr8:46052614-46052633 MsG0880044636.01.T01:intron 50.0%
!!! GTTTGAGAGTTTTGGAGGGG+AGG - Chr8:46053116-46053135 None:intergenic 50.0%
!!! TTGAGAGTTTTGGAGGGGAG+GGG - Chr8:46053114-46053133 None:intergenic 50.0%
AGATCCCCTGTCTCCGAAAC+AGG + Chr8:46054689-46054708 MsG0880044636.01.T01:CDS 55.0%
CACCTCCACACATTCGAGCT+AGG - Chr8:46056468-46056487 None:intergenic 55.0%
CCCTGTCTCCGAAACAGGTA+TGG + Chr8:46054694-46054713 MsG0880044636.01.T01:intron 55.0%
GAATTAGGAAGGGAGGGGAG+GGG + Chr8:46052585-46052604 MsG0880044636.01.T01:intron 55.0%
GAGAATTAGGAAGGGAGGGG+AGG + Chr8:46052583-46052602 MsG0880044636.01.T01:intron 55.0%
GCACCCGAATATGCGATCGA+TGG + Chr8:46056628-46056647 MsG0880044636.01.T01:CDS 55.0%
GTTGGGATCTGCGCTATGAC+AGG + Chr8:46054317-46054336 MsG0880044636.01.T01:intron 55.0%
TGGTCAACTAGCCAGACCAG+AGG + Chr8:46051609-46051628 MsG0880044636.01.T01:CDS 55.0%
TTCGGCCTAGCTCGAATGTG+TGG + Chr8:46056460-46056479 MsG0880044636.01.T01:CDS 55.0%
AACACTGTGCGACAAGCGGG+AGG - Chr8:46053199-46053218 None:intergenic 60.0%
GGCCTAGCTCGAATGTGTGG+AGG + Chr8:46056463-46056482 MsG0880044636.01.T01:CDS 60.0%
TAGAAAGGGAGGGGAGGGGT+GGG - Chr8:46053043-46053062 None:intergenic 60.0%
TGGTTCACAAGGGGAGGGGA+GGG + Chr8:46052671-46052690 MsG0880044636.01.T01:intron 60.0%
TTAGAAAGGGAGGGGAGGGG+TGG - Chr8:46053044-46053063 None:intergenic 60.0%
TTGGTTCACAAGGGGAGGGG+AGG + Chr8:46052670-46052689 MsG0880044636.01.T01:intron 60.0%
!!! AGAGTTTTGGAGGGGAGGGG+AGG - Chr8:46053111-46053130 None:intergenic 60.0%
!!! AGTTTTGGAGGGGAGGGGAG+GGG - Chr8:46053109-46053128 None:intergenic 60.0%
!!! GAGTTTTGGAGGGGAGGGGA+GGG - Chr8:46053110-46053129 None:intergenic 60.0%
AGAAAGGGAGGGGAGGGGTG+GGG - Chr8:46053042-46053061 None:intergenic 65.0%
TAGGAAGGGAGGGGAGGGGA+GGG + Chr8:46052589-46052608 MsG0880044636.01.T01:intron 65.0%
TTAGGAAGGGAGGGGAGGGG+AGG + Chr8:46052588-46052607 MsG0880044636.01.T01:intron 65.0%
!! GGCGGGTTACTTGGAGCTCC+AGG + Chr8:46051686-46051705 MsG0880044636.01.T01:CDS 65.0%
AGGAAGGGAGGGGAGGGGAG+GGG + Chr8:46052590-46052609 MsG0880044636.01.T01:intron 70.0%
TTGGAGGGGAGGGGAGGGGA+GGG - Chr8:46053105-46053124 None:intergenic 70.0%
TTTGGAGGGGAGGGGAGGGG+AGG - Chr8:46053106-46053125 None:intergenic 70.0%
AAGGGAGGGGAGGGGAGGGG+AGG + Chr8:46052593-46052612 MsG0880044636.01.T01:intron 75.0%
AAGGGAGGGGAGGGGTGGGG+AGG - Chr8:46053039-46053058 None:intergenic 75.0%
AGGGAGGGGAGGGGAGGGGA+GGG + Chr8:46052594-46052613 MsG0880044636.01.T01:intron 75.0%
AGGGAGGGGAGGGGTGGGGA+GGG - Chr8:46053038-46053057 None:intergenic 75.0%
TGGAGGGGAGGGGAGGGGAG+GGG - Chr8:46053104-46053123 None:intergenic 75.0%
! AGGGGAGGGGAGGGGAGGGG+AGG + Chr8:46052598-46052617 MsG0880044636.01.T01:intron 80.0%
! AGGGGAGGGGAGGGGAGGGG+AGG - Chr8:46052617-46052598 None:intergenic 80.0%
! GGGAGGGGAGGGGAGGGGAG+GGG + Chr8:46052595-46052614 MsG0880044636.01.T01:intron 80.0%
! GGGAGGGGAGGGGAGGGGAG+GGG - Chr8:46052614-46052595 None:intergenic 80.0%
! GGGAGGGGAGGGGTGGGGAG+GGG - Chr8:46053037-46053056 None:intergenic 80.0%
! GGGGAGGGGAGGGGAGGGGA+GGG - Chr8:46052618-46052599 None:intergenic 80.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Protein sequence

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