AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014144.01


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MsG0380014144.01.T01 AT4G04570 53.933 267 121 2 378 642 122 388 5.61e-86 278
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MsG0380014144.01.T01 AT4G00960 62.441 213 78 1 426 636 44 256 2.42e-84 269
MsG0380014144.01.T01 AT1G70520 42.175 377 201 6 384 747 273 645 6.60e-84 280
MsG0380014144.01.T01 AT4G00970 52.431 288 119 3 376 654 284 562 8.92e-84 277
MsG0380014144.01.T01 AT4G00340 29.129 769 436 22 23 710 20 760 1.30e-83 283
MsG0380014144.01.T01 AT4G23280 43.570 381 144 7 394 754 287 616 3.62e-81 271
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MsG0380014144.01.T01 AT1G29750 40.698 344 196 6 382 722 626 964 3.95e-67 240
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MsG0380014144.01.T01 AT3G24790 42.321 293 160 6 423 709 50 339 7.81e-61 210
MsG0380014144.01.T01 AT4G34440 40.199 301 157 6 424 712 298 587 1.62e-60 216
MsG0380014144.01.T01 AT4G34440 40.199 301 157 6 424 712 298 587 1.62e-60 216
MsG0380014144.01.T01 AT4G01330 37.082 329 200 5 426 749 150 476 1.79e-60 212
MsG0380014144.01.T01 AT4G01330 36.890 328 201 5 426 749 150 475 2.99e-60 211
MsG0380014144.01.T01 AT5G13160 42.955 291 161 5 423 709 71 360 5.34e-60 210
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MsG0380014144.01.T01 AT5G18610 41.284 327 180 7 394 709 32 357 6.50e-60 211
MsG0380014144.01.T01 AT5G18610 41.284 327 180 7 394 709 32 357 6.50e-60 211
MsG0380014144.01.T01 AT1G07870 41.121 321 173 9 423 729 88 406 8.37e-60 211
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MsG0380014144.01.T01 AT4G01330 38.488 291 175 4 426 714 150 438 2.56e-59 208
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MsG0380014144.01.T01 AT4G13190 39.262 298 178 3 415 709 48 345 2.60e-58 203
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MsG0380014144.01.T01 AT2G05940 39.262 298 169 6 425 713 74 368 1.18e-53 192
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MsG0380014144.01.T01 AT5G01550 34.722 360 202 8 373 716 314 656 1.58e-53 197
MsG0380014144.01.T01 AT2G28930 38.944 303 170 6 426 715 68 368 2.01e-53 191
MsG0380014144.01.T01 AT1G31420 39.716 282 163 6 444 724 312 587 2.03e-53 195
MsG0380014144.01.T01 AT1G31420 39.716 282 163 6 444 724 312 587 2.03e-53 195
MsG0380014144.01.T01 AT5G56790 38.356 292 175 5 426 715 378 666 2.47e-53 196
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MsG0380014144.01.T01 AT3G45430 35.088 342 210 5 378 716 287 619 2.62e-53 196
MsG0380014144.01.T01 AT3G55450 37.061 313 178 7 426 721 49 359 2.91e-53 189
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MsG0380014144.01.T01 AT1G79680 36.893 309 193 2 421 728 416 723 5.95e-53 196
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MsG0380014144.01.T01 AT5G24080 34.441 331 213 3 381 710 475 802 1.02e-52 197
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MsG0380014144.01.T01 AT5G60300 35.398 339 207 6 381 716 290 619 1.88e-52 194
MsG0380014144.01.T01 AT5G02070 36.283 339 193 7 386 706 307 640 1.89e-52 193
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MsG0380014144.01.T01 AT3G05140 39.057 297 173 5 426 720 179 469 2.72e-52 190
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MsG0380014144.01.T01 AT5G15730 36.585 287 167 6 426 710 104 377 4.32e-52 187
MsG0380014144.01.T01 AT5G60300 35.398 339 207 6 381 716 290 619 4.67e-52 194
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MsG0380014144.01.T01 AT1G48210 36.014 286 176 2 431 710 61 345 9.83e-52 184
MsG0380014144.01.T01 AT1G48210 36.014 286 176 2 431 710 61 345 9.83e-52 184
MsG0380014144.01.T01 AT2G13790 38.567 293 175 5 426 714 282 573 1.10e-51 191
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MsG0380014144.01.T01 AT2G35620 39.362 282 163 6 444 724 310 584 1.44e-51 189
MsG0380014144.01.T01 AT2G35620 39.362 282 163 6 444 724 310 584 1.44e-51 189
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MsG0380014144.01.T01 AT3G62220 37.413 286 172 2 431 710 62 346 3.68e-51 182
MsG0380014144.01.T01 AT1G21210 28.824 510 327 8 227 717 196 688 3.91e-51 191
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MsG0380014144.01.T01 AT1G25390 34.293 382 218 10 364 721 219 591 4.86e-51 189
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MsG0380014144.01.T01 AT3G08870 36.562 320 186 6 411 720 356 668 9.36e-51 189
MsG0380014144.01.T01 AT5G37450 35.849 371 215 8 364 721 552 912 9.72e-51 192
MsG0380014144.01.T01 AT3G59700 35.647 317 194 4 408 716 302 616 1.28e-50 188
MsG0380014144.01.T01 AT5G61350 36.735 294 180 2 422 710 509 801 1.62e-50 190
MsG0380014144.01.T01 AT3G46290 37.895 285 172 5 428 710 475 756 1.92e-50 190
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MsG0380014144.01.T01 AT3G02130 34.756 328 204 4 385 710 808 1127 2.42e-50 191
MsG0380014144.01.T01 AT3G59740 34.648 355 207 6 408 751 297 637 2.45e-50 187
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MsG0380014144.01.T01 AT3G46330 36.086 327 195 5 386 710 523 837 3.51e-50 189
MsG0380014144.01.T01 AT5G53890 36.792 318 189 4 396 711 720 1027 3.66e-50 190
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MsG0380014144.01.T01 AT5G54590 38.028 284 166 5 426 709 103 376 4.05e-50 182
MsG0380014144.01.T01 AT5G54590 38.028 284 166 5 426 709 103 376 4.05e-50 182
MsG0380014144.01.T01 AT5G03320 37.288 295 173 4 426 709 69 362 4.47e-50 181
MsG0380014144.01.T01 AT5G03320 37.288 295 173 4 426 709 69 362 4.47e-50 181
MsG0380014144.01.T01 AT1G34210 38.514 296 171 6 426 714 293 584 4.81e-50 186
MsG0380014144.01.T01 AT1G34210 38.514 296 171 6 426 714 293 584 4.81e-50 186
MsG0380014144.01.T01 AT3G46400 30.608 477 286 12 258 710 391 846 6.03e-50 189
MsG0380014144.01.T01 AT1G78530 33.799 358 190 9 381 714 15 349 6.09e-50 179
MsG0380014144.01.T01 AT2G11520 37.979 287 161 7 428 705 215 493 6.39e-50 183

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sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGAGGAACTTGAAGCTTTC+TGG 0.130424 3:-50334624 MsG0380014144.01.T01:CDS
TGGTTTAGCCAGATCATTTA+TGG 0.193864 3:-50333666 MsG0380014144.01.T01:CDS
CGCCAAAATTTCAATCAAAA+TGG 0.197269 3:-50335137 MsG0380014144.01.T01:CDS
CGTAATCTTGTAAAACTTCT+TGG 0.197809 3:-50334041 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATCCCAAAGATATCAGATTT+TGG 0.219640 3:-50333686 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTTCTCTATCAGAAACAAAT+TGG 0.220978 3:-50334285 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAACGTTTGGAAATTATTAA+TGG 0.229418 3:-50333806 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGTCGGATTGGACACAAAAT+TGG 0.238225 3:-50335272 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAACCAAAATCTGATATCTT+TGG 0.254460 3:+50333683 None:intergenic
AAATTGGGAGAAGGTGGTTT+TGG 0.270492 3:-50334269 MsG0380014144.01.T01:CDS
CCTTCCAAGCATTCACATAT+TGG 0.273760 3:+50335165 None:intergenic
GGAACTCTTGTTATTGTTGA+TGG 0.284661 3:-50335786 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATAGTGCAGTTGTTGGATTC+AGG 0.299792 3:-50335711 MsG0380014144.01.T01:CDS
TACGCCAATACTTCGGTATA+TGG 0.306591 3:-50335902 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCCCACAATTCTTGATGAAT+TGG 0.308035 3:+50335740 None:intergenic
AGCTTCAATCTCATTGTTAG+AGG 0.311546 3:-50332960 MsG0380014144.01.T01:CDS
TATCCATGCACAGCATATTC+TGG 0.318379 3:+50333484 None:intergenic
TCTTATTATTTCTGAACATA+TGG 0.318696 3:+50333168 None:intergenic
CCTGGTGACACATTGCTTGC+TGG 0.320829 3:-50335618 MsG0380014144.01.T01:CDS
CATGGAATGGATATGAGTTT+TGG 0.323065 3:-50335431 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAATCTAGTAATAATGAAAT+TGG 0.328045 3:+50335332 None:intergenic
AACCAAAATCTGATATCTTT+GGG 0.339557 3:+50333684 None:intergenic
CATATAGATATCTCACTTCT+TGG 0.354855 3:-50335563 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGGGTTATTGCATTCATTAT+AGG 0.355974 3:-50334591 MsG0380014144.01.T01:CDS
TACAACAGAAAGCAGAAAAT+AGG 0.366179 3:-50333120 MsG0380014144.01.T01:CDS
TTGTACAGGCGTATTTCTAT+TGG 0.378794 3:+50335842 None:intergenic
AGAGGAACTTGAAGCTTTCT+GGG 0.393921 3:-50334623 MsG0380014144.01.T01:CDS
ACTTGATTGGACTAAACGTT+TGG 0.399030 3:-50333819 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGTTTAGCCAGATCATTTAT+GGG 0.404306 3:-50333665 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTCCCAACACCAAGTGAACC+TGG 0.411006 3:-50333052 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGGACTAACCGTTCTCGTAT+TGG 0.414853 3:-50334571 MsG0380014144.01.T01:CDS
TTCGTAGTGTAGAATCTTGA+TGG 0.415082 3:+50333759 None:intergenic
AAAATATTCCTAGGGCATAA+TGG 0.417154 3:-50334165 MsG0380014144.01.T01:intron
GGAGGACCAGATAATGCCTT+TGG 0.421652 3:+50335761 None:intergenic
CAAGAAGTGAGATATCTATA+TGG 0.428532 3:+50335564 None:intergenic
TGCGAAGCAAGTTACTTGAT+TGG 0.429487 3:-50333832 MsG0380014144.01.T01:CDS
ACCCAGGTTCACTTGGTGTT+GGG 0.431277 3:+50333050 None:intergenic
ATGTCAGCTATTAACTCCTT+TGG 0.431909 3:+50333205 None:intergenic
ATTTCCAATATGTGAATGCT+TGG 0.432878 3:-50335169 MsG0380014144.01.T01:CDS
AATTATTAATGGTATTGCTC+GGG 0.436138 3:-50333795 MsG0380014144.01.T01:CDS
GCCTCTTAACAGCGATCTCT+TGG 0.441944 3:+50334135 None:intergenic
CACAATTCTTGATGAATTGG+AGG 0.442476 3:+50335743 None:intergenic
CCTCAACAGGTTATTGCAAA+GGG 0.444189 3:-50335480 MsG0380014144.01.T01:CDS
AATGCTGAAACTCAATGGTC+AGG 0.447113 3:-50335808 MsG0380014144.01.T01:CDS
TAAGAGGCTTTCTAAAACAT+CGG 0.447241 3:-50334120 MsG0380014144.01.T01:CDS
GATACACTTGTTTCCAGAGC+TGG 0.448623 3:-50335963 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAAATCAATAGTGCAGTTGT+TGG 0.452273 3:-50335718 MsG0380014144.01.T01:CDS
TTCTCTATCAGAAACAAATT+GGG 0.454719 3:-50334284 MsG0380014144.01.T01:CDS
TACCAAGATGCCGACGTGTC+TGG 0.455250 3:+50335021 None:intergenic
TGCTTCAAACAATCCAGCTC+TGG 0.456389 3:+50335950 None:intergenic
ACAAAATTGAATTGTCTCAA+TGG 0.457234 3:-50335078 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCCTAGGGCATAATGGTAGA+TGG 0.458150 3:-50334158 MsG0380014144.01.T01:intron
GGAACAACAATTATTTATAG+AGG 0.460719 3:-50335459 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAGAGGCTTTCTAAAACATC+GGG 0.472420 3:-50334119 MsG0380014144.01.T01:CDS
TGCCAGACACGTCGGCATCT+TGG 0.474800 3:-50335023 MsG0380014144.01.T01:CDS
TTGGTCTCCCATAAATGATC+TGG 0.475912 3:+50333658 None:intergenic
ATGGCTCCAAAGGCATTATC+TGG 0.476532 3:-50335767 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGAGCTGGATTGTTTGAAGC+AGG 0.479867 3:-50335948 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATAATAAGATTTATTCATGT+GGG 0.482411 3:-50333154 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCCTCAACAGGTTATTGCAA+AGG 0.482662 3:-50335481 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAATTATTAATGGTATTGCT+CGG 0.486817 3:-50333796 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCAACGAGTGGCATTCTATC+GGG 0.488344 3:+50332937 None:intergenic
CCAATATGTGAATGCTTGGA+AGG 0.496655 3:-50335165 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTCCAATTCATCAAGAATTG+TGG 0.500028 3:-50335742 MsG0380014144.01.T01:CDS
TGGGAAAGCTTTGATTATCC+TGG 0.501233 3:-50335636 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATTCATGCCCAACAGAAGCT+TGG 0.501867 3:-50333979 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATTTCACTGGAAGCAGAAGA+AGG 0.502481 3:-50334372 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGATTTGTGCTAGATACATA+TGG 0.502536 3:-50335315 MsG0380014144.01.T01:CDS
GTCGGATTGGACACAAAATT+GGG 0.503554 3:-50335271 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTGAAAAGTAACTTAGTGAC+TGG 0.509995 3:-50335588 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAAGAAATCCAAGCTTCTGT+TGG 0.510016 3:+50333971 None:intergenic
CTACATCATCTAAACCTCCT+TGG 0.511327 3:-50333373 MsG0380014144.01.T01:CDS
GTTATTGTTGATGGCTCCAA+AGG 0.511456 3:-50335777 MsG0380014144.01.T01:CDS
AACCCAGGTTCACTTGGTGT+TGG 0.512545 3:+50333049 None:intergenic
AAGAAATCCAAGCTTCTGTT+GGG 0.512838 3:+50333972 None:intergenic
TATTTGTATTAGCCTCAGCT+TGG 0.513169 3:+50333639 None:intergenic
GCCAAGAGATCGCTGTTAAG+AGG 0.514427 3:-50334136 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATTGGTCTGGCGGGTGTCTG+AGG 0.515526 3:-50335104 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCCAATTCATCAAGAATTGT+GGG 0.516707 3:-50335741 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGTGAACCTGGGTTCTATGC+AGG 0.518247 3:-50333040 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATAGCAATGCTGAAACTCAA+TGG 0.521937 3:-50335813 MsG0380014144.01.T01:CDS
TTGAATTGTCTCAATGGAGA+TGG 0.524314 3:-50335072 MsG0380014144.01.T01:CDS
CAAGACTTTACCTTGTACAC+TGG 0.525554 3:+50334245 None:intergenic
CCCTTTGCAATAACCTGTTG+AGG 0.525695 3:+50335480 None:intergenic
GCTAATACAAATAGAGTGAT+GGG 0.526715 3:-50333629 MsG0380014144.01.T01:CDS
TGGAAGTCATCAGATTGGTC+TGG 0.527710 3:-50335117 MsG0380014144.01.T01:CDS
CAAAATGGAAGTCATCAGAT+TGG 0.530330 3:-50335122 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGAGAAGGAAGATGATGACT+TGG 0.535799 3:-50334351 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGCTAATACAAATAGAGTGA+TGG 0.537178 3:-50333630 MsG0380014144.01.T01:CDS
AATAATAAGATTTATTCATG+TGG 0.538960 3:-50333155 MsG0380014144.01.T01:CDS
TGTACCATATACCGAAGTAT+TGG 0.540021 3:+50335898 None:intergenic
GCAATCCACACAATAGTCCT+TGG 0.542322 3:+50335864 None:intergenic
GCATAGAACCCAGGTTCACT+TGG 0.543084 3:+50333043 None:intergenic
TCATATAGGATTGATACTCA+TGG 0.543580 3:-50335507 MsG0380014144.01.T01:CDS
CATAAACTGATTTGAAGCAA+TGG 0.545169 3:+50335995 None:intergenic
CCAGCAAGCAATGTGTCACC+AGG 0.547748 3:+50335618 None:intergenic
TTATTTATAGAGGAGGGTCA+TGG 0.555286 3:-50335449 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGAGACTATGGATTGAAGAA+AGG 0.556754 3:-50333228 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAAACCACAGATGACATGTT+AGG 0.562151 3:+50333097 None:intergenic
ACAACAATTATTTATAGAGG+AGG 0.565988 3:-50335456 MsG0380014144.01.T01:CDS
GTTGTGCTTGAAATAATTAG+CGG 0.568247 3:-50333424 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGAAACAAATTGGGAGAAGG+TGG 0.569203 3:-50334275 MsG0380014144.01.T01:CDS
GATCCGCTACGCCAATACTT+CGG 0.570487 3:-50335909 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATGCTGAAACTCAATGGTCA+GGG 0.572208 3:-50335807 MsG0380014144.01.T01:CDS
TATGAAAACTCACCTACAGC+AGG 0.576710 3:+50335525 None:intergenic
ATTATTAATGGTATTGCTCG+GGG 0.578531 3:-50333794 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGTCATCAGATTGGTCTGGC+GGG 0.578729 3:-50335113 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTTTCTAAAACATCGGGACA+AGG 0.580181 3:-50334113 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATCAGAAACAAATTGGGAGA+AGG 0.581214 3:-50334278 MsG0380014144.01.T01:CDS
ACCAGTGTGAAAAGTATGCT+TGG 0.581712 3:-50335224 MsG0380014144.01.T01:CDS
TATAGAGGAGGGTCATGGAA+TGG 0.582389 3:-50335444 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATGTTTAGAGTAAGTCGGCA+TGG 0.583785 3:+50336031 None:intergenic
AACATCGGGACAAGGAATTG+AGG 0.584027 3:-50334105 MsG0380014144.01.T01:CDS
GTTATTTGTTGCATTAGTGA+TGG 0.587221 3:+50334307 None:intergenic
CAACAATTATTTATAGAGGA+GGG 0.589405 3:-50335455 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCAGCATATAGAAAGAAGCT+TGG 0.599639 3:-50334543 MsG0380014144.01.T01:intron
AGGAGGTTTAGATGATGTAG+AGG 0.602964 3:+50333376 None:intergenic
CCTCCAGAATATGCTGTGCA+TGG 0.605191 3:-50333487 MsG0380014144.01.T01:CDS
AGCTGACATATCATATGATG+AGG 0.616082 3:-50333191 MsG0380014144.01.T01:CDS
AAGTCATCAGATTGGTCTGG+CGG 0.617696 3:-50335114 MsG0380014144.01.T01:CDS
TATCACCAAGGACTATTGTG+TGG 0.629215 3:-50335869 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTGGAAGCAGAAGAAGGAGA+AGG 0.630386 3:-50334366 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCCGACCATATAAAACGTTG+TGG 0.631455 3:+50335288 None:intergenic
TGCTTGAAATAATTAGCGGT+AGG 0.632204 3:-50333420 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCCCAACACCAAGTGAACCT+GGG 0.633240 3:-50333051 MsG0380014144.01.T01:CDS
TAGGCCTAACATGTCATCTG+TGG 0.637349 3:-50333101 MsG0380014144.01.T01:CDS
CTTCAAAACTTACATAACCA+AGG 0.639424 3:+50333356 None:intergenic
TGACAAGAGCTTGAGCCTTG+AGG 0.643565 3:-50334998 MsG0380014144.01.T01:CDS
ACCTCTCAAGATCCTGCTGT+AGG 0.651790 3:-50335537 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCTCGTCCTGCATAGAACCC+AGG 0.657137 3:+50333034 None:intergenic
ATGGATTGAAGAAAGGCCAA+AGG 0.658531 3:-50333221 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATACCGAAGTATTGGCGTAG+CGG 0.668095 3:+50335906 None:intergenic
GGAGGTTTAGATGATGTAGA+GGG 0.669182 3:+50333377 None:intergenic
CCATGCACAGCATATTCTGG+AGG 0.670990 3:+50333487 None:intergenic
CAAAACTTACATAACCAAGG+AGG 0.671823 3:+50333359 None:intergenic
TTATTAATGGTATTGCTCGG+GGG 0.675346 3:-50333793 MsG0380014144.01.T01:CDS
ACCTACAGCAGGATCTTGAG+AGG 0.679779 3:+50335536 None:intergenic
TGACGTGACCAATACGAGAA+CGG 0.682605 3:+50334563 None:intergenic
GGATTGGACACAAAATTGGG+AGG 0.702376 3:-50335268 MsG0380014144.01.T01:CDS
CATGAAGTTGCCAGACACGT+CGG 0.703601 3:-50335031 MsG0380014144.01.T01:CDS
TCACTTATCAATATCAAACG+TGG 0.711877 3:-50335356 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATTAGCGGTAGGAAGAATCG+CGG 0.722864 3:-50333409 MsG0380014144.01.T01:CDS
TGTGAAAAGTATGCTTGGTG+TGG 0.724829 3:-50335219 MsG0380014144.01.T01:CDS
ATTTATGGGAGACCAAGCTG+AGG 0.738425 3:-50333651 MsG0380014144.01.T01:CDS
GGTACAAGAGCATATCACCA+AGG 0.742464 3:-50335881 MsG0380014144.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAATTGAGATCAATAAAT+TGG + Chr3:50335096-50335115 None:intergenic 15.0%
!! AAAATTGAGATCAATAAATT+GGG + Chr3:50335095-50335114 None:intergenic 15.0%
!! AAATCTAGTAATAATGAAAT+TGG + Chr3:50333685-50333704 None:intergenic 15.0%
!! AATAATAAGATTTATTCATG+TGG - Chr3:50335859-50335878 MsG0380014144.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAATAAGATTTATTCATGT+GGG - Chr3:50335860-50335879 MsG0380014144.01.T01:CDS 15.0%
!!! AGTGAAATAACTTTTTTATA+TGG + Chr3:50334630-50334649 None:intergenic 15.0%
!!! ATATAAAAAAGTTATTTCAC+TGG - Chr3:50334629-50334648 MsG0380014144.01.T01:CDS 15.0%
!! AAACGTTTGGAAATTATTAA+TGG - Chr3:50335208-50335227 MsG0380014144.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATTATTAATGGTATTGCT+CGG - Chr3:50335218-50335237 MsG0380014144.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATTTCCTAAAATATTCCT+AGG - Chr3:50334840-50334859 MsG0380014144.01.T01:intron 20.0%
!! AATTTCCTAAAATATTCCTA+GGG - Chr3:50334841-50334860 MsG0380014144.01.T01:intron 20.0%
!!! AAATCTGATGTTTTTAGTTT+TGG - Chr3:50335563-50335582 MsG0380014144.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACTTATTTTTCTTCAGTTTA+GGG - Chr3:50335423-50335442 MsG0380014144.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTAGTACTTATAGTACT+TGG + Chr3:50334824-50334843 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTATTATTTCTGAACATA+TGG + Chr3:50335849-50335868 None:intergenic 20.0%
!!! TTATTCTTTTTATGATCTGA+GGG + Chr3:50334372-50334391 None:intergenic 20.0%
!!! TTCCATTTTGATTGAAATTT+TGG + Chr3:50333882-50333901 None:intergenic 20.0%
! AAAAATAAGTCGAACTTACT+AGG + Chr3:50335413-50335432 None:intergenic 25.0%
! AAACCAAAATCTGATATCTT+TGG + Chr3:50335334-50335353 None:intergenic 25.0%
! AACCAAAATCTGATATCTTT+GGG + Chr3:50335333-50335352 None:intergenic 25.0%
! AATTATTAATGGTATTGCTC+GGG - Chr3:50335219-50335238 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAAATTGAATTGTCTCAA+TGG - Chr3:50333936-50333955 MsG0380014144.01.T01:intron 25.0%
! ACAACAATTATTTATAGAGG+AGG - Chr3:50333558-50333577 MsG0380014144.01.T01:intron 25.0%
! CAAAAATGAAGTAAAGTTGA+TGG - Chr3:50334936-50334955 MsG0380014144.01.T01:intron 25.0%
! CAACAATTATTTATAGAGGA+GGG - Chr3:50333559-50333578 MsG0380014144.01.T01:intron 25.0%
! CAGATCATAAAAAGAATAAG+AGG - Chr3:50334373-50334392 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
! GCAAATTTAGATATCAGATA+CGG - Chr3:50334082-50334101 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
! GGAACAACAATTATTTATAG+AGG - Chr3:50333555-50333574 MsG0380014144.01.T01:intron 25.0%
! GGTTGAAAAATCAAATATTG+TGG + Chr3:50334689-50334708 None:intergenic 25.0%
! TAAGTTCAACATTTATGAAG+TGG + Chr3:50335733-50335752 None:intergenic 25.0%
! TTCTCTATCAGAAACAAATT+GGG - Chr3:50334730-50334749 MsG0380014144.01.T01:intron 25.0%
!! ACCAATTTAATTGTTACTTC+AGG - Chr3:50334604-50334623 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAGAAGTTTTACAAGATTA+CGG + Chr3:50334975-50334994 None:intergenic 25.0%
!! CTTATTCTTTTTATGATCTG+AGG + Chr3:50334373-50334392 None:intergenic 25.0%
!! TATTTGCATCTTTTACAACA+AGG + Chr3:50333332-50333351 None:intergenic 25.0%
!!! ACTTTGGTTTGACAATATTT+TGG - Chr3:50334120-50334139 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGCTTGGATTTCTTTATTTT+TGG - Chr3:50335051-50335070 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
!!! GACTTATTTTTCTTCAGTTT+AGG - Chr3:50335422-50335441 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTTATGTTTAGAGTAAGT+CGG + Chr3:50332991-50333010 None:intergenic 25.0%
!!! TGTAAACTTGATGTCATTTT+AGG - Chr3:50335760-50335779 MsG0380014144.01.T01:CDS 25.0%
AAAATATTCCTAGGGCATAA+TGG - Chr3:50334849-50334868 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
AAAATCAATAGTGCAGTTGT+TGG - Chr3:50333296-50333315 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
AATTTAGATATCAGATACGG+TGG - Chr3:50334085-50334104 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
AGATTTGTGCTAGATACATA+TGG - Chr3:50333699-50333718 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
ATCTGTGCAATATATCTAAC+TGG + Chr3:50334242-50334261 None:intergenic 30.0%
ATTATTAATGGTATTGCTCG+GGG - Chr3:50335220-50335239 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
ATTTAGATATCAGATACGGT+GGG - Chr3:50334086-50334105 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCCAATATGTGAATGCT+TGG - Chr3:50333845-50333864 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
CAAGAAGTGAGATATCTATA+TGG + Chr3:50333453-50333472 None:intergenic 30.0%
CATATAGATATCTCACTTCT+TGG - Chr3:50333451-50333470 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
CGCCAAAATTTCAATCAAAA+TGG - Chr3:50333877-50333896 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
CGTAATCTTGTAAAACTTCT+TGG - Chr3:50334973-50334992 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
CTTCAAAACTTACATAACCA+AGG + Chr3:50335661-50335680 None:intergenic 30.0%
CTTCTCTATCAGAAACAAAT+TGG - Chr3:50334729-50334748 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
GAGGACAAGACATTTATATA+CGG - Chr3:50334164-50334183 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
GCCTGAAGTAACAATTAAAT+TGG + Chr3:50334608-50334627 None:intergenic 30.0%
GCTAATACAAATAGAGTGAT+GGG - Chr3:50335385-50335404 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
GGAAAGGAAAAAGATGTAAT+AGG + Chr3:50334221-50334240 None:intergenic 30.0%
GTATATAAATGTCTTGTCCT+CGG + Chr3:50334165-50334184 None:intergenic 30.0%
GTTGTGCTTGAAATAATTAG+CGG - Chr3:50335590-50335609 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
TACAACAGAAAGCAGAAAAT+AGG - Chr3:50335894-50335913 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
TCACTTATCAATATCAAACG+TGG - Chr3:50333658-50333677 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
TCATATAGGATTGATACTCA+TGG - Chr3:50333507-50333526 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
TCCAATTCATCAAGAATTGT+GGG - Chr3:50333273-50333292 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
TGCAATATATCTAACTGGAA+AGG + Chr3:50334237-50334256 None:intergenic 30.0%
TTATAGTACTTGGCGAAAAA+GGG + Chr3:50334814-50334833 None:intergenic 30.0%
TTGAGATCAATAAATTGGGT+TGG + Chr3:50335091-50335110 None:intergenic 30.0%
! ATCCCAAAGATATCAGATTT+TGG - Chr3:50335328-50335347 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
! GTTATTTGTTGCATTAGTGA+TGG + Chr3:50334710-50334729 None:intergenic 30.0%
! TACTTTCTTCTTTTGCTTCA+TGG - Chr3:50332960-50332979 MsG0380014144.01.T01:CDS 30.0%
! TTATGCCCTAGGAATATTTT+AGG + Chr3:50334849-50334868 None:intergenic 30.0%
!! AGTTTTGGCAAAGAATTCAT+AGG - Chr3:50333598-50333617 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
!! ATTGCTATTGAGTTTTGTAC+AGG + Chr3:50333189-50333208 None:intergenic 30.0%
!! CATAAACTGATTTGAAGCAA+TGG + Chr3:50333022-50333041 None:intergenic 30.0%
!! GTTTTGGCAAAGAATTCATA+GGG - Chr3:50333599-50333618 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
!! TAAGAGGCTTTCTAAAACAT+CGG - Chr3:50334894-50334913 MsG0380014144.01.T01:intron 30.0%
AAAACCACAGATGACATGTT+AGG + Chr3:50335920-50335939 None:intergenic 35.0%
AAAGAAATCCAAGCTTCTGT+TGG + Chr3:50335046-50335065 None:intergenic 35.0%
AAGAAATCCAAGCTTCTGTT+GGG + Chr3:50335045-50335064 None:intergenic 35.0%
ACTTGATTGGACTAAACGTT+TGG - Chr3:50335195-50335214 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
AGCTGACATATCATATGATG+AGG - Chr3:50335823-50335842 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
AGCTTCAATCTCATTGTTAG+AGG - Chr3:50336054-50336073 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
ATAGCAATGCTGAAACTCAA+TGG - Chr3:50333201-50333220 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGAAACAAATTGGGAGA+AGG - Chr3:50334736-50334755 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
ATGTCAGCTATTAACTCCTT+TGG + Chr3:50335812-50335831 None:intergenic 35.0%
CAAAACTTACATAACCAAGG+AGG + Chr3:50335658-50335677 None:intergenic 35.0%
CAAAATGGAAGTCATCAGAT+TGG - Chr3:50333892-50333911 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
CACAATTCTTGATGAATTGG+AGG + Chr3:50333274-50333293 None:intergenic 35.0%
CTCCAATTCATCAAGAATTG+TGG - Chr3:50333272-50333291 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
CTGAAAAGTAACTTAGTGAC+TGG - Chr3:50333426-50333445 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
CTTATAGTACTTGGCGAAAA+AGG + Chr3:50334815-50334834 None:intergenic 35.0%
GGCTAATACAAATAGAGTGA+TGG - Chr3:50335384-50335403 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
GGGGTTATTGCATTCATTAT+AGG - Chr3:50334423-50334442 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
GGTTTAGCCAGATCATTTAT+GGG - Chr3:50335349-50335368 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
GTTTCTATGAAACATTGCAG+TGG - Chr3:50335497-50335516 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
TATAGTACTTGGCGAAAAAG+GGG + Chr3:50334813-50334832 None:intergenic 35.0%
TCAGCATATAGAAAGAAGCT+TGG - Chr3:50334471-50334490 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
TCCCACAATTCTTGATGAAT+TGG + Chr3:50333277-50333296 None:intergenic 35.0%
TGCTTGAAATAATTAGCGGT+AGG - Chr3:50335594-50335613 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
TGGTTTAGCCAGATCATTTA+TGG - Chr3:50335348-50335367 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
TGTACCATATACCGAAGTAT+TGG + Chr3:50333119-50333138 None:intergenic 35.0%
TTATTAATGGTATTGCTCGG+GGG - Chr3:50335221-50335240 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
TTATTTATAGAGGAGGGTCA+TGG - Chr3:50333565-50333584 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
TTCGTAGTGTAGAATCTTGA+TGG + Chr3:50335258-50335277 None:intergenic 35.0%
TTGAATTGTCTCAATGGAGA+TGG - Chr3:50333942-50333961 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
! AACGTTTTATATGGTCGGAT+TGG - Chr3:50333730-50333749 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
! ACGTTTTCTTACATTCCTCA+AGG + Chr3:50334034-50334053 None:intergenic 35.0%
! CATGGAATGGATATGAGTTT+TGG - Chr3:50333583-50333602 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
! CTGTAGGTGAGTTTTCATAT+AGG - Chr3:50333493-50333512 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
! GAACTCCACAACGTTTTATA+TGG - Chr3:50333721-50333740 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
! TATTTGTATTAGCCTCAGCT+TGG + Chr3:50335378-50335397 None:intergenic 35.0%
! TCCACAACGTTTTATATGGT+CGG - Chr3:50333725-50333744 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
! TGAAGTGGACATTGATTGAT+TGG + Chr3:50335718-50335737 None:intergenic 35.0%
! TTGTACAGGCGTATTTCTAT+TGG + Chr3:50333175-50333194 None:intergenic 35.0%
!! AAGAGGCTTTCTAAAACATC+GGG - Chr3:50334895-50334914 MsG0380014144.01.T01:intron 35.0%
!! GAAGCAGGATTTTTCAACTT+TGG - Chr3:50333081-50333100 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAACTCTTGTTATTGTTGA+TGG - Chr3:50333228-50333247 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
!! TACTTTTCACACTGGTCTAT+AGG + Chr3:50333786-50333805 None:intergenic 35.0%
!!! ACTTGATGTCATTTTAGGCA+TGG - Chr3:50335765-50335784 MsG0380014144.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGGAACTTGAAGCTTTC+TGG - Chr3:50334390-50334409 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
AATGCTGAAACTCAATGGTC+AGG - Chr3:50333206-50333225 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
AGAAACAAATTGGGAGAAGG+TGG - Chr3:50334739-50334758 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
AGAGGAACTTGAAGCTTTCT+GGG - Chr3:50334391-50334410 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGGTTTAGATGATGTAG+AGG + Chr3:50335641-50335660 None:intergenic 40.0%
ATAGTGCAGTTGTTGGATTC+AGG - Chr3:50333303-50333322 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
ATGCTGAAACTCAATGGTCA+GGG - Chr3:50333207-50333226 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCACTGGAAGCAGAAGA+AGG - Chr3:50334642-50334661 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
CAAGACTTTACCTTGTACAC+TGG + Chr3:50334772-50334791 None:intergenic 40.0%
CAGTGTACAAGGTAAAGTCT+TGG - Chr3:50334770-50334789 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
CCAATATGTGAATGCTTGGA+AGG - Chr3:50333849-50333868 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
CCTCAACAGGTTATTGCAAA+GGG - Chr3:50333534-50333553 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
CCTTCCAAGCATTCACATAT+TGG + Chr3:50333852-50333871 None:intergenic 40.0%
CTACATCATCTAAACCTCCT+TGG - Chr3:50335641-50335660 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
GGAGGTTTAGATGATGTAGA+GGG + Chr3:50335640-50335659 None:intergenic 40.0%
TACGCCAATACTTCGGTATA+TGG - Chr3:50333112-50333131 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
TATCACCAAGGACTATTGTG+TGG - Chr3:50333145-50333164 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
TATCCATGCACAGCATATTC+TGG + Chr3:50335533-50335552 None:intergenic 40.0%
TATGAAAACTCACCTACAGC+AGG + Chr3:50333492-50333511 None:intergenic 40.0%
TCCGACCATATAAAACGTTG+TGG + Chr3:50333729-50333748 None:intergenic 40.0%
TCCTCAACAGGTTATTGCAA+AGG - Chr3:50333533-50333552 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
TGCGAAGCAAGTTACTTGAT+TGG - Chr3:50335182-50335201 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCTCCCATAAATGATC+TGG + Chr3:50335359-50335378 None:intergenic 40.0%
! AAATTGGGAGAAGGTGGTTT+TGG - Chr3:50334745-50334764 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
! ACCAAGCATACTTTTCACAC+TGG + Chr3:50333794-50333813 None:intergenic 40.0%
! ACCAGTGTGAAAAGTATGCT+TGG - Chr3:50333790-50333809 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
! ATGGATTGAAGAAAGGCCAA+AGG - Chr3:50335793-50335812 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
! ATGTTTAGAGTAAGTCGGCA+TGG + Chr3:50332986-50333005 None:intergenic 40.0%
! CATTTTAGGCATGGAGACTA+TGG - Chr3:50335774-50335793 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
! CGAGAATGACGAGTTTTTGT+GGG - Chr3:50333359-50333378 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
! GGAGACTATGGATTGAAGAA+AGG - Chr3:50335786-50335805 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
! GTCGGATTGGACACAAAATT+GGG - Chr3:50333743-50333762 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
! TACTCATGGTTTTCCTCAAC+AGG - Chr3:50333521-50333540 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
! TGGGAAAGCTTTGATTATCC+TGG - Chr3:50333378-50333397 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGAAAAGTATGCTTGGTG+TGG - Chr3:50333795-50333814 MsG0380014144.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTCTAAAACATCGGGACA+AGG - Chr3:50334901-50334920 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
!! GTTATTGTTGATGGCTCCAA+AGG - Chr3:50333237-50333256 MsG0380014144.01.T01:intron 40.0%
AACATCGGGACAAGGAATTG+AGG - Chr3:50334909-50334928 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
AGGACTAACCGTTCTCGTAT+TGG - Chr3:50334443-50334462 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
ATGAGAAAACATCGAGACCG+AGG - Chr3:50334145-50334164 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
ATTAGCGGTAGGAAGAATCG+CGG - Chr3:50335605-50335624 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
ATTCATGCCCAACAGAAGCT+TGG - Chr3:50335035-50335054 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
ATTTATGGGAGACCAAGCTG+AGG - Chr3:50335363-50335382 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
CCCTTTGCAATAACCTGTTG+AGG + Chr3:50333537-50333556 None:intergenic 45.0%
GATACACTTGTTTCCAGAGC+TGG - Chr3:50333051-50333070 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
GCAATCCACACAATAGTCCT+TGG + Chr3:50333153-50333172 None:intergenic 45.0%
GGAGAAGGAAGATGATGACT+TGG - Chr3:50334663-50334682 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
GGATTGGACACAAAATTGGG+AGG - Chr3:50333746-50333765 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
TAGGCCTAACATGTCATCTG+TGG - Chr3:50335913-50335932 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
TATAGAGGAGGGTCATGGAA+TGG - Chr3:50333570-50333589 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
TCCTAGGGCATAATGGTAGA+TGG - Chr3:50334856-50334875 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
TGACGTGACCAATACGAGAA+CGG + Chr3:50334454-50334473 None:intergenic 45.0%
TGCTTCAAACAATCCAGCTC+TGG + Chr3:50333067-50333086 None:intergenic 45.0%
! AGAGCTGGATTGTTTGAAGC+AGG - Chr3:50333066-50333085 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
! GCGAGAATGACGAGTTTTTG+TGG - Chr3:50333358-50333377 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
! GGTACAAGAGCATATCACCA+AGG - Chr3:50333133-50333152 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
! GGTCGGATTGGACACAAAAT+TGG - Chr3:50333742-50333761 MsG0380014144.01.T01:CDS 45.0%
! TGGAAGTCATCAGATTGGTC+TGG - Chr3:50333897-50333916 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
!! AAGTCATCAGATTGGTCTGG+CGG - Chr3:50333900-50333919 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
!! ATACCGAAGTATTGGCGTAG+CGG + Chr3:50333111-50333130 None:intergenic 45.0%
!! ATGGCTCCAAAGGCATTATC+TGG - Chr3:50333247-50333266 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
!!! AAGCTTTCTGGGACTTTTGC+AGG - Chr3:50334402-50334421 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
!!! AGCTTTCTGGGACTTTTGCA+GGG - Chr3:50334403-50334422 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
!!! TGGTTTTGGACCAGTGTACA+AGG - Chr3:50334759-50334778 MsG0380014144.01.T01:intron 45.0%
ACCTACAGCAGGATCTTGAG+AGG + Chr3:50333481-50333500 None:intergenic 50.0%
ACCTCTCAAGATCCTGCTGT+AGG - Chr3:50333477-50333496 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
AGTGAACCTGGGTTCTATGC+AGG - Chr3:50335974-50335993 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
CATGAAGTTGCCAGACACGT+CGG - Chr3:50333983-50334002 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
CCATGCACAGCATATTCTGG+AGG + Chr3:50335530-50335549 None:intergenic 50.0%
CCTCCAGAATATGCTGTGCA+TGG - Chr3:50335527-50335546 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
CGGCTAGCATCTTCAGAACT+TGG - Chr3:50334184-50334203 MsG0380014144.01.T01:intron 50.0%
CTGGAAGCAGAAGAAGGAGA+AGG - Chr3:50334648-50334667 MsG0380014144.01.T01:intron 50.0%
GATATCAGATACGGTGGGAG+TGG - Chr3:50334091-50334110 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
GATCCGCTACGCCAATACTT+CGG - Chr3:50333105-50333124 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
GCATAGAACCCAGGTTCACT+TGG + Chr3:50335974-50335993 None:intergenic 50.0%
GCCAAGAGATCGCTGTTAAG+AGG - Chr3:50334878-50334897 MsG0380014144.01.T01:intron 50.0%
GCCATCTACCATTATGCCCT+AGG + Chr3:50334860-50334879 None:intergenic 50.0%
GCCTCTTAACAGCGATCTCT+TGG + Chr3:50334882-50334901 None:intergenic 50.0%
GGAGGACCAGATAATGCCTT+TGG + Chr3:50333256-50333275 None:intergenic 50.0%
GTGGGAGTGGTTGCTTACTT+TGG - Chr3:50334104-50334123 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
TCCCAACACCAAGTGAACCT+GGG - Chr3:50335963-50335982 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
TGACAAGAGCTTGAGCCTTG+AGG - Chr3:50334016-50334035 MsG0380014144.01.T01:CDS 50.0%
!! AACCCAGGTTCACTTGGTGT+TGG + Chr3:50335968-50335987 None:intergenic 50.0%
!! ACCCAGGTTCACTTGGTGTT+GGG + Chr3:50335967-50335986 None:intergenic 50.0%
!! AGTCATCAGATTGGTCTGGC+GGG - Chr3:50333901-50333920 MsG0380014144.01.T01:intron 50.0%
!!! GCTTTCTGGGACTTTTGCAG+GGG - Chr3:50334404-50334423 MsG0380014144.01.T01:intron 50.0%
CCAGCAAGCAATGTGTCACC+AGG + Chr3:50333399-50333418 None:intergenic 55.0%
CCTGGTGACACATTGCTTGC+TGG - Chr3:50333396-50333415 MsG0380014144.01.T01:CDS 55.0%
CTCCCAACACCAAGTGAACC+TGG - Chr3:50335962-50335981 MsG0380014144.01.T01:CDS 55.0%
TACCAAGATGCCGACGTGTC+TGG + Chr3:50333996-50334015 None:intergenic 55.0%
TCTCGTCCTGCATAGAACCC+AGG + Chr3:50335983-50336002 None:intergenic 55.0%
TGCCAGACACGTCGGCATCT+TGG - Chr3:50333991-50334010 MsG0380014144.01.T01:CDS 60.0%
! ATTGGTCTGGCGGGTGTCTG+AGG - Chr3:50333910-50333929 MsG0380014144.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 50332952 50336084 50332952 ID=MsG0380014144.01;Name=MsG0380014144.01
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Chr3 exon 50334995 50336084 50334995 ID=MsG0380014144.01.T01:exon:9195;Parent=MsG0380014144.01.T01
Chr3 exon 50334544 50334660 50334544 ID=MsG0380014144.01.T01:exon:9194;Parent=MsG0380014144.01.T01
Chr3 exon 50334256 50334410 50334256 ID=MsG0380014144.01.T01:exon:9193;Parent=MsG0380014144.01.T01
Chr3 exon 50333964 50334174 50333964 ID=MsG0380014144.01.T01:exon:9192;Parent=MsG0380014144.01.T01
Chr3 exon 50333623 50333860 50333623 ID=MsG0380014144.01.T01:exon:9191;Parent=MsG0380014144.01.T01
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Chr3 exon 50332952 50333254 50332952 ID=MsG0380014144.01.T01:exon:9189;Parent=MsG0380014144.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0380014144.01.T01

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Protein sequence

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MVFTFFFCFMAMPTYSKHKTFTTIASNQFMQYSDTLVSRAGLFEAGFFNFGDPLRQYFGIWYKSISPRTIVWIANRNTPVQNSIAMLKLNGQGTLVIVDGSKGIIWSSNSSRIVGKSIVQLLDSGNLVVKDANSSSENDEFLWESFDYPGDTLLAGMKLKSNLVTGPYRYLTSWRTSQDPAVGEFSYRIDTHGFPQQVIAKGTTIIYRGGSWNGYEFWQRIHRVLNYSFVITDKEVTYQYQTWTNFIITRFVLDTYGTPQRFIWSDWTQNWEATATRPIDQCEKYAWCGINSNCNINKFPICECLEGFTPKFQSKWKSSDWSGGCLRRTKLNCLNGDGFLKYTNMKLPDTSASWYDKSLSLEEYHKKNKRNLKLSGTFAGVIAFIIGLTVLVLVTSAYRKKLGHIKKLFHWKQKKEKEDDDLATIFDFSTITNATNNFSIRNKLGEGGFGPVYKGIMVDGQEIAVKRLSKTSGQGIEEFKNEVKLMATLQHRNLVKLLGCSIQEDEKMLIYEFMPNRSLDFFIFDAMRSKLLDWTKRLEIINGIARGLLYLHQDSTLRIIHRDLKTSNILLDIDMIPKISDFGLARSFMGDQAEANTNRVMGTYGYMPPEYAVHGYFSIKSDVFSFGVVVLEIISGRKNRGFCDPLHHLNLLGYAWRLWIEERPKELIADISYDEAICSEIIRFIHVGLLCVQQKAENRPNMSSVVFMLKNEKLLPTPSEPGFYAGRDNNTISTASSSKVCSINEASISLLEAR*