AlfalfaGEDB | MS.gene41273

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene41273

KEGG: K06228
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Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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MS.gene41273.t1	A0A072VHQ1	98.8	1341	16	0	1	1341	1	1341	0.0e+00	2413.6

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TFs/TRs:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Protein Kinases:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Network:

Co-expression Network:

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Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
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PPI:

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Gene1	Gene2	Type
No data available in table

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MS.gene41273.t1	MTR_1g048630	98.807	1341	16	0	1	1341	1	1341	0.0	2734
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MS.gene41273.t1	MTR_1g105290	32.830	265	165	5	6	257	54	318	1.68e-39	157
MS.gene41273.t1	MTR_1g105290	32.830	265	165	5	6	257	54	318	2.65e-39	157

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Query id	Subject id	identity %	alignment length	mismatches	gap openings	q. start	q. end	s. start	s. end	e-value	bit score
MS.gene41273.t1	AT1G50240	63.264	1342	467	13	1	1339	1	1319	0.0	1654
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MS.gene41273.t1	AT3G08720	37.455	275	162	7	4	270	137	409	3.78e-45	171
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MS.gene41273.t1	AT3G08720	37.455	275	162	7	4	270	137	409	3.78e-45	171
MS.gene41273.t1	AT3G08720	37.455	275	162	7	4	270	137	409	3.78e-45	171
MS.gene41273.t1	AT3G08730	36.496	274	164	6	4	269	131	402	2.05e-44	169
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MS.gene41273.t1	AT5G18700	33.028	327	196	7	4	312	1	322	1.92e-43	174
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Find 277 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
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AAATTTGTTGCAAATGGCAG+AGG	0.539743	1.4:+34619727	MS.gene41273:CDS

Showing 1 to 10 of 277 entries

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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chr1.4	gene	34606745	34621184	34606745	ID=MS.gene41273
chr1.4	mRNA	34606745	34621184	34606745	ID=MS.gene41273.t1;Parent=MS.gene41273
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Gene Sequence

>MS.gene41273

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Protein sequence

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