AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039966.01


Find 357 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 811 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 71182724 71196941 71182724 ID=MsG0780039966.01;Name=MsG0780039966.01
Chr7 mRNA 71182724 71196941 71182724 ID=MsG0780039966.01.T01;Parent=MsG0780039966.01;Name=MsG0780039966.01.T01;_AED=0.44;_eAED=0.44;_QI=0|0|0|0.7|1|1|10|0|1844
Chr7 exon 71196275 71196941 71196275 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13694;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71192316 71193483 71192316 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13693;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71189018 71189517 71189018 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13692;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71187191 71188206 71187191 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13691;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71186265 71186370 71186265 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13690;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71185033 71185878 71185033 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13689;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71184547 71184579 71184547 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13688;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71183732 71184419 71183732 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13687;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71183414 71183648 71183414 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13686;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 exon 71182724 71182999 71182724 ID=MsG0780039966.01.T01:exon:13685;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71196275 71196941 71196275 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71192316 71193483 71192316 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71189018 71189517 71189018 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71187191 71188206 71187191 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71186265 71186370 71186265 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71185033 71185878 71185033 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71184547 71184579 71184547 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71183732 71184419 71183732 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71183414 71183648 71183414 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Chr7 CDS 71182724 71182999 71182724 ID=MsG0780039966.01.T01:cds;Parent=MsG0780039966.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039966.01.T01

ATGTGCAATGATTACACAAACTGCAACGAAGCTTTTGACTGTGGAGACAGTGTCACAAACCTCAAGTATCCATTCTGGGGAAAGAACAGAGGAAAGGAGTGTGGTTTTTCTGATCCAAGTATGGAGCTAACGTGCGAAGATGATATCCCAAAGATCACAATCTATTTAGTCAAATACCGTATTCTTGATTGGAACAATGACACACAGACACTCAAAGTGGCTAGGGATGATTACTTTAGTGGTATTTGTTCTGTGAGTGTGAACAGCACATTTGATAACACTTTGTTTCGACGTGAAGTTGATGGTTCTTCTAAATTAAATCTGTTGTACAATTGTGATACAAGTATAGCGGGGGTGTTTAGGACTACCTGCAATACTACTAAAGTTTCCTACACCATTATGGATCCTACTATAGCCTCATGTGCTCCGAGTGTTGTTGTTGAGATTCCGATTTCGATTTTGGGAATCCAAATTACAACTGCCGATGATATAAAAGAAGCATTAGAAGGCGGTTTTGATTTGAAATGGACTCCAGAATATGGAGAGTGCCAGAGGTGCATTGGTTCTCGTGGTGCGTGTGGCAACGATGGAGGAACTGGGTTCAGATGTTTCTGCCAAGATGGAGCTTATACAGATAGATGTGGTTCACGGAAGGCCCCAACCTCAAGTGCTTCCGTTGCTGGATTTGGAGTAACCGTGTTCATTATTATCATGATTAGTCGTCGCCTTAAAAGAGGTACAGGTAGACAACAAATGATTATTGTAAGACAACAACAACAATCAAGTCTTATCCCACAAACTATCTTGAGAGAAAGAATAGAACTTGTTGACAACAATGTGGAGGTTTTCATGCGCAGTCATAATTTATCCATGCCAAGAAGATATAGTTATGCAGAAGTGAAAATGATCACAAACTCATTTCAAGAAAAGTTAGGCCAAGGAGGGTATGGTGTTGTGTACAAAGCAAGTTTATATAATAGTCGTCAAGTGGCAGTGAAAGTAATAAGCGAGACAAAGGGAAATGGAGAAGAATTCATAAATGAAGTTGCTAGCATTAGTAGGACATCACATATGAACATTGTGTCGCTTTTAGGATATTGTTACGAAGTGAACAAAAGAGCACTAATATATGAATTCATGCCCAAAGGATCATTGGATAAGTTCATCTATAAAAGTGAATTTCCTAATGCCATTTGTGATTTTGATTGGAACACTTTGTTCCAAATTGCAATTGGCATTGCTAAAGGTCTAGAGTACTTGCATCAAGGATGTAGTTCAAGGATTCTACATCTTGATATAAAACCTCAAAACATTCTTTTGGATGAAGATTTTTGTCCAAAAATCTCGGATTTTGGACTAGCTAAAATATGCCAAAGGAAGGACAGTATTGTGTCAATATTAGGGACAAGAGGGACTATAGGATACATGGCGCCAGAAATATTTAGTAGAGCGTTTGGTGGAGTTTCATACAGATCTGATGTATATAGTTATGGCATGTTGATTCTTGAAATGATCGGAGGAAGGAAGAACTACGACACTGGAGGGTCATGTAGTTCTGAAATGTACTTTCCAGATTGGATTTATAAGGATCTTGAGCAAGGTAATACTCTTTTAAATTGTTCGACAATCTCGGAGGAAGAAAATGATATGGTCAGAAAGATTACTTTGGTGAGTCTATGGTGCATTCAAACTAAACCATCAGACAGACCACCTATGAATAAAGTAATAGAAATGCTACAAGGACCACTTCATTCAATACCATATCCTCCAAAGCCCGTCTTATATTCACCCGAAAGGCCACAACTACAAGTGTCAGATATGTCTTCATCTGATTTAGACTCAGTTGCCAGAGACGATTACTGGAGTGGTATTTGTGCTGTGAATGTGCGTGACAATACTATGAATGTGGGTGACAATCCTAAGAACAGCACATTCGGTAACACTCTGTTTCAACGTGATGGTTCTTCTCAAGTAACGCTGTTATACGGTTGCGTTGAGAATCAACAGAGTATGGTTTATGGTATTACATGTGGTGATGATACTGATGTTGTGTACACTGTTGCGGATGCAGATTCAGCTTCACCATGTGTTCCAAGTTTTATTATTGTGATTCCGATTATAGGAACCCAAGCTGCGCAAGTTGTAAATAGTACTGGTCTTAACCAAGCATTAAAACACGGTTTTGAGTTGAGATGGACAGGCAATTATGGAGAGTGTCAGAGGTGCGTCGATTCTGGTGGTGTTTGTGGGAATAATGGAGGAACTCAATTCAGATGTTTCTGTAAGGATGGGTCGAATACAACTTCATGCAATTCAGAAAAGGCCACAACCTCAAGCGCGTCAGTTGCTGGATTTGGAGTAACAATGTTCTTTATTATTATGATTAGTTGTTACTTTAAAAAGGGTATAGGCAGACAGCAAATGGCAATTTTCAGGAAAAGAAGGAAACACGTTGACAACAATGTGGAGGTTTTCATGCAAAGTTACAATTTATCGATTGCGAGAAGATACAATTATACAGAAGTAAAAAGGATCACAAATTCATTTCGAGATAAATTAGGTCACGGAGGATATGGTGTTGTGTACAAAGCATGTTTAACGGATGGTCGTCAAGTGGCAGTGAAAGTAATAAACGAGTCAAAAGGAAATGGGGAAGAGTTCATAAATGAAGTTGCTAGCATTAGCAGAACATCACACATGAACATCGTGTCACTTTTAGGTTATTGTTATGAGGTGAATAAAAGAGCGCTAATATATGAATACATGCCCAAAGGATCCCTGGATAAGTTCATCTATAAGAGTGGATTTCCTGACGCTGTTTGTGATTTTGATTGGAACACTTTATTCCAAATTTCAATTGGAATTGCTAGAGGACTAGAGTACTTGCATCAAGGATGTAGTTCAAGGATTTTGCATTTTGATATCAAACCTCAAAACATTCTTTTGGATGAAGACTTTTGTCCAAAAATATCTGATTTTGGACTTGCTAAAATATGTCAAAGGAAGGACAGTACTGTGTCAATATTGGGGACACGAGGAACTATAGGATATATGGCGCCAGAAGTATTTAGTAGAGCATTTGGTGCAGTTTCTTACAAATCTGATGTATATAGTTATGGCATGTTGATTCTTGAAATGATCGGAGGAAGGAAGAACTATGACACTGGAGGGTCATGTACTTCTGAAATGTACTTTCCAGATTGGATTTATAAGGATCTCGAACAAGGTAGCCATACTGTTTTAAATTGTTTGACAATCTCTGAGGAAGAAAATGATATGGTTAGAAAGATTACTATGGTGAGTCTATGGTGCATTCAAACGAATCCATCAGATAGACCTCCAATGAATAAAATGAAATACGCCAAATTACAAACAAATACGGTGACTAAAGTGAATGCCGACAACAATCTGAATAAAATGTTAACACAATTTAGAGGTGGTGAAAAAATGGGCATTGTTGTTCCACTATTACTTCTTTGTTCTAGCGCAAGAATGAAACCTCTGCTTCATCATCCATCTTCTTCGATTATTATTTTCTTTTTCTCCTTCACACTTTTGATGATCTTCATCATCAATATTCCAACGTGTATGTGCGATGATGATGACCAATACGCAAACTGCAACGGCGCTTTTAATTGTGGAAGCAGCATCACGAACATCAAGTATCCATTCTGGGGAGAAAATAGAGTAAAATATTGTGGTGGTGTTTCTTCTGATCCTTATATGGAGCTTACATGCGAAGAAAGTGTTCCAAAGATAACCATCAATGACGTCAAATACCGTATTATTGATTGGAACGATACAATACAGAAACTCACAGTCGCCAGAGACGATTACTGGAGCGGTATTTGTGCTGTGAGTGTGAGTGACAAGCATAATAACAGCACATTTGATAACACTCAGTTTCAACGCGATGGTGATGCTTCTTCTAAAATAAGTCTGTTATACAATTGTGATACAAGTACAATGAATATTTTTAGTACTACATGCGGTAATACTAAAGTTTCCTACACAATTGTGGATCTTGCTTCCGCCTCACTCACATGTACTCCGAGTGTTATTGTCGAGTTTCCAATTTTGGCAGTCCAAGCCGCACAAATTGCAACGCTCAATGATATAAACGAAACATTACAAGAAGGTTTTGATTTGAAATGGACGGGAAATTATGGAGAGTGTCAAAAGTGCGTTGATTCTGATGGTGTATGTGGCAGGAACGATGGAGGAAATGAGTTTAGATGTTTCTGCAAAGATGGATCTCATACAACTTCATGTGCTTCACAAAAGGTCTTAACCTCAAACAATAGTACAAAACGGAACTGGAGTCGTACAATGATAGGTGCTGTTGTTGCTGGATTTGGAGTAACAATTATTATTATGATCAGTTGTTACCTTAATAAGGGTATTGGGAGACCTAATATGAGTATTTTCAGGAAAAGAATAAAAGTTGTTGACCACAATGTAGAAATTTTCATGCAAAGTTATAATTCATCTATGCCAAGAAGATATAGTTATACAGAAGTAAAAAGGATAACAAACTCTTTCCGAGATAAATTAGGCCAAGGAGGATACGGTGTTGTGTATAAAGCAAGTTTAATTGATGGTCGTCAAGTGGCGGTGAAAGTAATAAACCAGTCAAAGGGGAATGGAGAAGAATTCATAAATGAAGTTGCTAGCATTAGTCGAACATCACACATGAACATTGTGTCCCTTTTAGGCTTTTGTTATGAGGTGGACAAAAGAGCACTAATATATGAATTCATGCCCAATGGATCATTGGATAAGTTCATCTATAAAAGCGAATTTCCTAACGCTATTTGTGATTTTGATTGGAACACTTTGTTCCAAATAGCAATTGGCATTGCTAGAGGTCTAGAGTATTTGCATCAAGGATGTAGTTCAAGGATTCTGCATCTTGATATCAAACCTCAAAACATTCTTTTGGATGAAGATTTTTGCCCAAAAATCTCTGATTTTGGACTAGCGAAAATATGCCAAAAGAAGGATAGTATTGTGTCAATATTAGGTTATGGCATGTTGATTCTTGAAATGATCGGAGGAAGGAAGAACTACGACACTGGAGGGTCATGTACCTCTGAAATGTACTTTCCAGATTGGATTTATAAGGATCTTGAGCAAGGGAATACTCTTTTAAATTGTTCCACAATATCGGAGGAAGAAAATGATATGGTCAGAAAGATTACTTTGGTGAGTCTATGGTGCATTCAAACTAAACCATCAGATAGACCACCGATGAATAAACTTCTAATTCTCTCCAAATTTTGGGGGAATGAAGCTGAGGAAGAGGACAACGATGAAGCCATCACATCAACCTTTGAGCAGCATTATCCATGTCAGTCAGAGAGCACTAAGGCAGATAAAAAGCAGAAGAAGCAGGTGAACAAAGTGAAGCCTACTAGCTTCAACTCAGCCGGAATGAGGACCCGTGCTCAAATGGGTACCTCCAAAGTTGCCTCGCCATATACCGAACAGTTGGTTCAAATCTGTGAACCTGGATGTTTAGCTAGTAGATTCTGA

Protein sequence

>MsG0780039966.01.T01

MCNDYTNCNEAFDCGDSVTNLKYPFWGKNRGKECGFSDPSMELTCEDDIPKITIYLVKYRILDWNNDTQTLKVARDDYFSGICSVSVNSTFDNTLFRREVDGSSKLNLLYNCDTSIAGVFRTTCNTTKVSYTIMDPTIASCAPSVVVEIPISILGIQITTADDIKEALEGGFDLKWTPEYGECQRCIGSRGACGNDGGTGFRCFCQDGAYTDRCGSRKAPTSSASVAGFGVTVFIIIMISRRLKRGTGRQQMIIVRQQQQSSLIPQTILRERIELVDNNVEVFMRSHNLSMPRRYSYAEVKMITNSFQEKLGQGGYGVVYKASLYNSRQVAVKVISETKGNGEEFINEVASISRTSHMNIVSLLGYCYEVNKRALIYEFMPKGSLDKFIYKSEFPNAICDFDWNTLFQIAIGIAKGLEYLHQGCSSRILHLDIKPQNILLDEDFCPKISDFGLAKICQRKDSIVSILGTRGTIGYMAPEIFSRAFGGVSYRSDVYSYGMLILEMIGGRKNYDTGGSCSSEMYFPDWIYKDLEQGNTLLNCSTISEEENDMVRKITLVSLWCIQTKPSDRPPMNKVIEMLQGPLHSIPYPPKPVLYSPERPQLQVSDMSSSDLDSVARDDYWSGICAVNVRDNTMNVGDNPKNSTFGNTLFQRDGSSQVTLLYGCVENQQSMVYGITCGDDTDVVYTVADADSASPCVPSFIIVIPIIGTQAAQVVNSTGLNQALKHGFELRWTGNYGECQRCVDSGGVCGNNGGTQFRCFCKDGSNTTSCNSEKATTSSASVAGFGVTMFFIIMISCYFKKGIGRQQMAIFRKRRKHVDNNVEVFMQSYNLSIARRYNYTEVKRITNSFRDKLGHGGYGVVYKACLTDGRQVAVKVINESKGNGEEFINEVASISRTSHMNIVSLLGYCYEVNKRALIYEYMPKGSLDKFIYKSGFPDAVCDFDWNTLFQISIGIARGLEYLHQGCSSRILHFDIKPQNILLDEDFCPKISDFGLAKICQRKDSTVSILGTRGTIGYMAPEVFSRAFGAVSYKSDVYSYGMLILEMIGGRKNYDTGGSCTSEMYFPDWIYKDLEQGSHTVLNCLTISEEENDMVRKITMVSLWCIQTNPSDRPPMNKMKYAKLQTNTVTKVNADNNLNKMLTQFRGGEKMGIVVPLLLLCSSARMKPLLHHPSSSIIIFFFSFTLLMIFIINIPTCMCDDDDQYANCNGAFNCGSSITNIKYPFWGENRVKYCGGVSSDPYMELTCEESVPKITINDVKYRIIDWNDTIQKLTVARDDYWSGICAVSVSDKHNNSTFDNTQFQRDGDASSKISLLYNCDTSTMNIFSTTCGNTKVSYTIVDLASASLTCTPSVIVEFPILAVQAAQIATLNDINETLQEGFDLKWTGNYGECQKCVDSDGVCGRNDGGNEFRCFCKDGSHTTSCASQKVLTSNNSTKRNWSRTMIGAVVAGFGVTIIIMISCYLNKGIGRPNMSIFRKRIKVVDHNVEIFMQSYNSSMPRRYSYTEVKRITNSFRDKLGQGGYGVVYKASLIDGRQVAVKVINQSKGNGEEFINEVASISRTSHMNIVSLLGFCYEVDKRALIYEFMPNGSLDKFIYKSEFPNAICDFDWNTLFQIAIGIARGLEYLHQGCSSRILHLDIKPQNILLDEDFCPKISDFGLAKICQKKDSIVSILGYGMLILEMIGGRKNYDTGGSCTSEMYFPDWIYKDLEQGNTLLNCSTISEEENDMVRKITLVSLWCIQTKPSDRPPMNKLLILSKFWGNEAEEEDNDEAITSTFEQHYPCQSESTKADKKQKKQVNKVKPTSFNSAGMRTRAQMGTSKVASPYTEQLVQICEPGCLASRF*