AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036134.01

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MsG0780036134.01.T01 AT5G20480 28.526 624 384 14 33 610 28 635 2.23e-48 187
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MsG0780036134.01.T01 AT2G24130 31.435 474 269 16 274 701 84 547 1.08e-36 150
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MsG0780036134.01.T01 AT3G56370 27.013 559 301 12 267 805 67 538 3.83e-31 132
MsG0780036134.01.T01 AT3G56370 28.909 339 194 10 532 866 67 362 1.04e-23 108
MsG0780036134.01.T01 AT2G24130 30.085 585 322 10 298 873 71 577 1.26e-48 187
MsG0780036134.01.T01 AT2G24130 32.844 545 303 19 70 583 51 563 2.17e-38 155
MsG0780036134.01.T01 AT2G24130 31.435 474 269 16 274 701 69 532 1.22e-36 150
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MsG0780036134.01.T01 AT4G28490 32.270 564 350 17 63 606 42 593 3.67e-39 158
MsG0780036134.01.T01 AT4G28490 32.271 502 293 14 401 874 126 608 5.77e-39 157
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MsG0780036134.01.T01 AT5G10020 29.711 589 328 25 34 584 24 564 9.67e-29 124
MsG0780036134.01.T01 AT5G10020 29.114 316 183 12 559 868 75 355 6.31e-15 80.1
MsG0780036134.01.T01 AT4G20940 27.337 567 315 12 315 854 76 572 1.78e-39 159
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MsG0780036134.01.T01 AT5G14210 28.247 308 167 8 358 665 110 363 8.33e-14 76.3
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MsG0780036134.01.T01 AT2G27060 25.773 388 253 12 90 453 28 404 5.89e-14 77.0
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MsG0780036134.01.T01 AT4G39270 28.405 257 137 3 200 455 128 338 4.64e-16 83.2
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MsG0780036134.01.T01 AT4G13340 25.207 242 150 3 363 578 112 348 2.07e-13 75.1
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MsG0780036134.01.T01 AT4G30520 43.299 97 55 0 757 853 95 191 2.20e-15 81.3
MsG0780036134.01.T01 AT4G30520 40.385 104 61 1 545 648 88 190 5.78e-11 67.0
MsG0780036134.01.T01 AT4G30520 42.045 88 51 0 765 852 79 166 6.46e-11 66.6
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MsG0780036134.01.T01 AT1G27180 28.710 411 242 18 117 515 825 1196 8.76e-13 73.2
MsG0780036134.01.T01 AT1G27180 26.509 464 278 14 138 560 704 1145 2.73e-12 71.6
MsG0780036134.01.T01 AT1G27180 28.710 411 242 18 117 515 825 1196 8.76e-13 73.2
MsG0780036134.01.T01 AT1G27180 26.509 464 278 14 138 560 704 1145 2.73e-12 71.6
MsG0780036134.01.T01 AT5G65240 43.119 109 60 1 773 881 98 204 9.36e-13 72.8
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MsG0780036134.01.T01 AT3G49750 34.868 152 86 3 701 849 42 183 1.00e-12 68.2
MsG0780036134.01.T01 AT5G65240 43.119 109 60 1 773 881 98 204 1.02e-12 72.4
MsG0780036134.01.T01 AT3G24660 33.553 152 97 2 521 669 110 260 1.03e-12 72.8
MsG0780036134.01.T01 AT3G25560 34.752 141 63 2 765 880 83 219 1.12e-12 72.4
MsG0780036134.01.T01 AT4G03010 26.642 274 170 10 570 825 85 345 1.35e-12 71.2
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MsG0780036134.01.T01 AT4G03010 28.205 273 140 7 361 633 93 309 5.50e-12 69.3
MsG0780036134.01.T01 AT5G53320 36.842 114 68 2 759 872 110 219 1.40e-12 72.0
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MsG0780036134.01.T01 AT5G05850 30.802 237 134 7 214 449 219 426 1.81e-12 71.2
MsG0780036134.01.T01 AT2G26730 34.161 161 78 3 276 435 73 206 2.44e-12 71.2
MsG0780036134.01.T01 AT2G26730 34.091 176 89 5 739 890 65 237 1.27e-11 68.9
MsG0780036134.01.T01 AT1G56130 28.044 271 135 8 369 635 2 216 2.85e-12 71.2
MsG0780036134.01.T01 AT1G56130 29.557 203 138 2 276 478 3 200 7.16e-12 70.1
MsG0780036134.01.T01 AT1G78980 38.462 104 60 1 768 867 119 222 3.00e-12 71.2
MsG0780036134.01.T01 AT1G78980 29.310 232 138 7 489 704 7 228 4.42e-12 70.5
MsG0780036134.01.T01 AT5G35390 39.516 124 66 4 761 880 116 234 3.25e-12 70.9
MsG0780036134.01.T01 AT3G25670 29.670 273 167 9 615 878 147 403 6.37e-12 69.7
MsG0780036134.01.T01 AT3G25670 28.428 299 176 11 385 675 110 378 5.39e-11 66.6
MsG0780036134.01.T01 AT3G25670 28.440 218 150 5 301 516 147 360 6.04e-11 66.6
MsG0780036134.01.T01 AT3G25670 27.027 333 166 10 218 498 107 414 9.01e-11 65.9
MsG0780036134.01.T01 AT4G29240 29.714 175 102 4 683 853 137 294 6.53e-12 68.9
MsG0780036134.01.T01 AT4G29240 29.348 184 104 4 534 698 138 314 6.28e-11 65.9
MsG0780036134.01.T01 AT5G45770 29.609 179 122 2 289 465 167 343 7.21e-12 68.9
MsG0780036134.01.T01 AT5G45770 37.405 131 73 3 744 867 175 303 8.60e-12 68.9
MsG0780036134.01.T01 AT5G45770 31.737 167 108 3 506 669 140 303 2.82e-11 67.4
MsG0780036134.01.T01 AT2G35620 32.000 150 78 1 764 889 74 223 7.39e-12 69.7
MsG0780036134.01.T01 AT2G35620 32.000 150 78 1 764 889 74 223 7.39e-12 69.7
MsG0780036134.01.T01 AT2G35620 32.000 150 78 1 764 889 74 223 7.39e-12 69.7
MsG0780036134.01.T01 AT2G35620 32.000 150 78 1 764 889 74 223 7.39e-12 69.7
MsG0780036134.01.T01 AT2G07040 41.129 124 64 4 761 880 106 224 1.03e-11 69.3
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MsG0780036134.01.T01 AT5G17680 27.576 330 183 13 139 434 720 1027 1.84e-11 68.9
MsG0780036134.01.T01 AT5G17680 24.466 421 227 10 182 569 628 990 2.77e-11 68.6
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MsG0780036134.01.T01 AT3G25510 27.097 310 210 3 135 444 459 752 3.74e-11 67.8
MsG0780036134.01.T01 AT5G20690 31.333 150 100 3 485 633 71 218 3.35e-11 67.8
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MsG0780036134.01.T01 AT3G03770 29.316 307 187 10 60 354 43 331 4.60e-11 67.4
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MsG0780036134.01.T01 AT3G03770 29.316 307 187 10 60 354 43 331 4.60e-11 67.4
MsG0780036134.01.T01 AT1G49490 27.132 258 137 7 198 454 136 343 4.65e-11 67.4
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MsG0780036134.01.T01 AT1G49490 27.132 258 137 7 198 454 131 338 4.89e-11 67.4
MsG0780036134.01.T01 AT4G34220 29.012 162 70 1 764 880 128 289 4.89e-11 67.4
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MsG0780036134.01.T01 AT2G13800 37.600 125 55 1 768 869 75 199 5.27e-11 67.0
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MsG0780036134.01.T01 AT5G44510 26.503 366 220 9 83 445 632 951 5.33e-11 67.4
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MsG0780036134.01.T01 AT5G59660 50.000 84 34 2 519 602 342 417 7.98e-11 66.6
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MsG0780036134.01.T01 AT3G57830 28.079 203 109 6 765 930 94 296 7.21e-11 66.6
MsG0780036134.01.T01 AT3G57830 28.079 203 109 6 765 930 94 296 7.21e-11 66.6
MsG0780036134.01.T01 AT1G63430 37.500 104 61 1 773 872 103 206 7.21e-11 66.6
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MsG0780036134.01.T01 AT1G63430 37.500 104 61 1 773 872 103 206 7.80e-11 66.6
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MsG0780036134.01.T01 AT2G02780 32.394 213 137 5 269 478 105 313 8.31e-11 66.2
MsG0780036134.01.T01 AT2G02780 32.394 213 137 5 269 478 105 313 8.34e-11 66.6
MsG0780036134.01.T01 AT2G13800 50.617 81 39 1 789 869 3 82 9.80e-11 65.9
MsG0780036134.01.T01 AT2G13800 50.617 81 39 1 789 869 3 82 9.80e-11 65.9

Find 192 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 206 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GCAACCTACCTTTGAGATTT+TGG 0.096854 7:-3238869 None:intergenic
TCTTCCAAAATTGAGATATT+TGG 0.120566 7:+3238833 MsG0780036134.01.T01:CDS
AAATCCAAATATCTCAATTT+TGG 0.133978 7:-3238837 None:intergenic
AACTCGGATATAACAAATTT+AGG 0.149260 7:+3239069 MsG0780036134.01.T01:CDS
CCGATTTCACCTCCTGAAAT+TGG 0.198819 7:-3238621 None:intergenic
GTGCAGAAAATAGCAATTTA+AGG 0.202222 7:+3239285 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTGGTATCTCTCCACTTATT+TGG 0.221130 7:-3240420 None:intergenic
ACAATTGGCTTCATGCAATT+TGG 0.225941 7:+3239580 MsG0780036134.01.T01:CDS
CAGTGGCATCAAGTCCTATT+TGG 0.241114 7:-3238917 None:intergenic
TCTTTCACAATGTCAAATAA+AGG 0.256407 7:+3240331 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCAAAGATATGTTTCCATTC+TGG 0.290905 7:+3240029 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCCAAGATTGTCCTTTCTGC+TGG 0.293199 7:-3240291 None:intergenic
CTAGAAATTCTGATGCTAAA+AGG 0.298358 7:+3239854 MsG0780036134.01.T01:CDS
AAGATCAATGATGTGAAGTT+TGG 0.300081 7:-3240152 None:intergenic
TTAGTTTGGTGAGATTTGTT+AGG 0.304389 7:-3239109 None:intergenic
TCTAATGCACTCACCCAAAT+AGG 0.309956 7:+3238903 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTGATGCCACTGGCTTCTA+TGG 0.311883 7:+3238927 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTCGAACATAATAGCCTTCA+TGG 0.313669 7:+3239359 MsG0780036134.01.T01:CDS
ACTCGGATATAACAAATTTA+GGG 0.317422 7:+3239070 MsG0780036134.01.T01:CDS
GATTGTTGAATGACACATTA+AGG 0.319461 7:-3240618 None:intergenic
CTTTCACAATGTCAAATAAA+GGG 0.320842 7:+3240332 MsG0780036134.01.T01:CDS
ATGCAAGAAATTAGTGCTTA+AGG 0.332041 7:-3239429 None:intergenic
CCAATCCTAGGGCACTTTAT+TGG 0.336159 7:-3240109 None:intergenic
GCATCAGAATTTCTAGAGAT+TGG 0.336925 7:-3239847 None:intergenic
ACATATCTTTGATATTGTTA+TGG 0.341907 7:-3240018 None:intergenic
AGATTTGTTAGGGATGTAGA+AGG 0.344104 7:-3239098 None:intergenic
ATCCCATGAGCAACAATCTA+TGG 0.344625 7:-3238307 None:intergenic
TTGTCGAATAACATCCTTAC+TGG 0.346082 7:+3240481 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTCTTTAGACTTGAGAATCT+TGG 0.347778 7:+3239398 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCAAGTCTAAAGAAAGACTT+TGG 0.351102 7:-3239389 None:intergenic
CCAATTTCAGGAGGTGAAAT+CGG 0.353536 7:+3238621 MsG0780036134.01.T01:CDS
TATGTAGGTGGTCTTGTTGC+TGG 0.354038 7:+3240853 MsG0780036134.01.T01:CDS
CACATTAAGGAACTCCAAAA+AGG 0.362241 7:-3240605 None:intergenic
AATCTTTCTTTGAATTTGAC+TGG 0.365929 7:+3240812 MsG0780036134.01.T01:CDS
GATCTATCTGAAGTGAATAT+TGG 0.367656 7:+3239212 MsG0780036134.01.T01:CDS
TGGAATTTCTCCGAAAAGTT+TGG 0.367995 7:-3238538 None:intergenic
CTGAGGTTTGCGAAAGATAA+TGG 0.382649 7:-3239245 None:intergenic
TGCAGAAAATAGCAATTTAA+GGG 0.385073 7:+3239286 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTTCTTTCAACAATCTGTC+AGG 0.385552 7:+3240553 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTCGCTACCTAGATGGTTA+TGG 0.386463 7:+3239672 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTAGTAGCAGCATGCTCTA+TGG 0.388803 7:+3238375 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTGCGTGGCAACGAATTTCA+TGG 0.390496 7:+3240085 MsG0780036134.01.T01:CDS
GACTGGAAAGTAAGTCTGAT+TGG 0.393512 7:+3240829 MsG0780036134.01.T01:CDS
GAAAGCTCGCCTATCCTAGA+TGG 0.394411 7:-3238486 None:intergenic
GTGGCATTGGGAATCACTTT+CGG 0.396415 7:+3240877 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTTCTTTCAATAAGTTCTC+TGG 0.398036 7:+3240172 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTATAAATGTGAGCTGAGTT+AGG 0.399948 7:-3239046 None:intergenic
CTAAAAGGAAACAATTTATC+TGG 0.400589 7:+3239869 MsG0780036134.01.T01:CDS
CGAAAAGTTTGGTACAAGAA+AGG 0.402128 7:-3238527 None:intergenic
TTTCAAGATAATTCATTTGA+GGG 0.404880 7:+3240679 MsG0780036134.01.T01:CDS
ATTGATCGCCGCACAGGCCT+TGG 0.406007 7:-3240705 None:intergenic
GTTATCCTAAAATTTCATCT+TGG 0.406907 7:+3238277 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTTCAATGAATTTACTATGA+AGG 0.407275 7:+3239148 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTTAGATTTGTGAGTGTGTT+TGG 0.407290 7:-3238744 None:intergenic
TAGACACAAGTAGCTTAGTT+TGG 0.408221 7:-3239123 None:intergenic
CTTTCATCTTGATGACACTT+TGG 0.409822 7:-3238189 None:intergenic
TGACACTTTGGTTGAACTAA+AGG 0.412348 7:-3238177 None:intergenic
AGAACACAAATCATGTCATT+AGG 0.412923 7:+3238346 MsG0780036134.01.T01:CDS
ACTTTCGGCCCGCAGGTACT+TGG 0.414160 7:+3240892 MsG0780036134.01.T01:CDS
TATACCTGAGTTGAAGGTAT+TGG 0.416797 7:+3240060 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTGTTGCTGGAGTGGCATT+GGG 0.417462 7:+3240865 MsG0780036134.01.T01:CDS
AACTGCTGATTCTGCGGTAT+AGG 0.418220 7:-3240649 None:intergenic
GAGCATTGGTCAACTGTAGA+AGG 0.419639 7:+3239975 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCTTGTTGCTGGAGTGGCAT+TGG 0.421969 7:+3240864 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGTGGCATCAAGTCCTATTT+GGG 0.431251 7:-3238916 None:intergenic
GAGGTTCAAGTATGCTAAAT+CGG 0.433313 7:-3239339 None:intergenic
TTACTATGAAGGCAATCTCT+TGG 0.434295 7:+3239159 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGTCCTATTCCTTCTTCACT+TGG 0.436385 7:+3239020 MsG0780036134.01.T01:CDS
AAGAAAGATCCAATGCTTCA+AGG 0.436474 7:-3240537 None:intergenic
AACTTGTTGTCACTTGATCT+AGG 0.436851 7:+3238582 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTTACAATTGTGAATTGTA+TGG 0.437551 7:+3238786 MsG0780036134.01.T01:CDS
GCTTTCAAACCTTGAAGCAT+TGG 0.437812 7:+3240528 MsG0780036134.01.T01:CDS
TAGTTTGGTGAGATTTGTTA+GGG 0.440668 7:-3239108 None:intergenic
TTCAATTCGCCTATCACTCT+TGG 0.446473 7:-3240439 None:intergenic
CTAAGATCTCTTATAAATGT+TGG 0.447043 7:-3239611 None:intergenic
TTGGTTGCTTGAAATATCAA+TGG 0.448238 7:-3240401 None:intergenic
CCTTAAATTGTAACAAGGCA+TGG 0.452385 7:-3238212 None:intergenic
GAGTGATTTGAGATTGCATA+TGG 0.452878 7:-3239759 None:intergenic
CCAATAAAGTGCCCTAGGAT+TGG 0.454324 7:+3240109 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGAGAGATACCAAGAGTGAT+AGG 0.454932 7:+3240430 MsG0780036134.01.T01:CDS
CCCAGCAGAAAGGACAATCT+TGG 0.458500 7:+3240290 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTTTAGAAATGATTCAGAAC+TGG 0.459112 7:+3240203 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTTAGGTTCATTATCCAAGA+TGG 0.459327 7:-3239317 None:intergenic
GGCAACATACCAACTTCCTT+AGG 0.463112 7:+3240502 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTATAACTTCGCTACCTAGA+TGG 0.464344 7:+3239666 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTTTCCCACGGTTCATTGAC+AGG 0.466402 7:+3239722 MsG0780036134.01.T01:CDS
ACTGGAAAGTAAGTCTGATT+GGG 0.468823 7:+3240830 MsG0780036134.01.T01:CDS
CAGTTCTGAATCATTTCTAA+AGG 0.469574 7:-3240202 None:intergenic
GTAAATATTGCAGCTGGCTG+AGG 0.472561 7:-3239262 None:intergenic
CATGTCATGTTTCCAATCCT+AGG 0.473573 7:-3240121 None:intergenic
GAAAGCTTCCCTAAGGAAGT+TGG 0.474420 7:-3240511 None:intergenic
AAGGTAGGTTGCCAGAGTTT+CGG 0.474470 7:+3238880 MsG0780036134.01.T01:CDS
AATACTCTCGAATCCCATCT+AGG 0.474663 7:+3238472 MsG0780036134.01.T01:CDS
CAACCATAGATTGTTGCTCA+TGG 0.476979 7:+3238304 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGATATGTTTCCATTCTGGC+TGG 0.477707 7:+3240033 MsG0780036134.01.T01:CDS
CCAAGATTGTCCTTTCTGCT+GGG 0.477869 7:-3240290 None:intergenic
CTGCACGTAAATATTGCAGC+TGG 0.481009 7:-3239268 None:intergenic
TTAAGCACTAATTTCTTGCA+TGG 0.481053 7:+3239431 MsG0780036134.01.T01:CDS
TAAGGGGTGAAATTCCATCT+TGG 0.483705 7:+3239303 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTAAGTCTGATTGGGTATGT+AGG 0.487069 7:+3240838 MsG0780036134.01.T01:CDS
ATAAGAGATCTTAGAGATCT+CGG 0.490577 7:+3239620 MsG0780036134.01.T01:CDS
ATTTCAAGCAACCAAATAAG+TGG 0.490672 7:+3240409 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCAAGTATGCTAAATCGGTT+AGG 0.491532 7:-3239334 None:intergenic
TTGCCAAGTGAAGAAGGAAT+AGG 0.493550 7:-3239023 None:intergenic
AAGTTGGTATGTTGCCAGTA+AGG 0.493827 7:-3240495 None:intergenic
ATTTCAAGATAATTCATTTG+AGG 0.495797 7:+3240678 MsG0780036134.01.T01:CDS
CATGAAGGCTATTATGTTCG+AGG 0.499342 7:-3239358 None:intergenic
CAAGTCTAAAGAAAGACTTT+GGG 0.499435 7:-3239388 None:intergenic
CTACAGTTGACCAATGCTCT+TGG 0.500032 7:-3239971 None:intergenic
TTCAACAAATTGTCATTGCT+CGG 0.501465 7:+3239512 MsG0780036134.01.T01:CDS
AAGAGTGATAGGCGAATTGA+AGG 0.501494 7:+3240441 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGGAGCTATACCTGAGTTGA+AGG 0.508826 7:+3240054 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGCAATCTCTTGGATAGGTA+AGG 0.511768 7:+3239169 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTCTTCCGTGCCCAGCAGAA+AGG 0.512003 7:+3240280 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTGTCATTCAACAATCTCTC+AGG 0.512806 7:+3240625 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCTCAGCAACAATAATCTGC+AGG 0.517008 7:+3239940 MsG0780036134.01.T01:CDS
TGGAAAAGAACAAAGAAGAA+AGG 0.518953 7:-3238137 None:intergenic
GCAACATACCAACTTCCTTA+GGG 0.525020 7:+3240503 MsG0780036134.01.T01:CDS
AAACTAAGCTACTTGTGTCT+AGG 0.525735 7:+3239125 MsG0780036134.01.T01:CDS
ATTGTCCTTTCTGCTGGGCA+CGG 0.528141 7:-3240285 None:intergenic
AACCATAGATTGTTGCTCAT+GGG 0.529883 7:+3238305 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCGACAATTGATCGCCGCAC+AGG 0.529909 7:-3240711 None:intergenic
GGGAATCACTTTCGGCCCGC+AGG 0.530898 7:+3240885 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTACTGTAATTGACTTGTGT+TGG 0.533512 7:-3240242 None:intergenic
GGTACAATACCAACATCCAT+TGG 0.534660 7:+3238948 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTTAGGTTGCCAAGTGAAGA+AGG 0.536797 7:-3239029 None:intergenic
ATGGACCAATAAAGTGCCCT+AGG 0.542040 7:+3240104 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTCAAATAAAGGGTTAGTGA+TGG 0.542633 7:+3240342 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGAAAGATTCTGAGTCATCA+TGG 0.543829 7:-3240798 None:intergenic
AGGTACTTGGATGGATTCAA+AGG 0.544918 7:+3240905 MsG0780036134.01.T01:CDS
GATTCGAGAATCAGTTACAT+TGG 0.547036 7:-3239549 None:intergenic
TGCTGAGATCAATCATCTGA+AGG 0.547625 7:-3239925 None:intergenic
CAGCTCACATTTATAAAACT+CGG 0.551181 7:+3239053 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGCAATGTTCCTTCATGTCT+AGG 0.551492 7:+3239815 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTATCGTTCAACAATTTAAG+CGG 0.553272 7:+3239794 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTCTCCTGTCAATGAACCGT+GGG 0.554202 7:-3239726 None:intergenic
AAGGTTTGAAAGCTTCCCTA+AGG 0.555034 7:-3240518 None:intergenic
TCGGCCCGCAGGTACTTGGA+TGG 0.555288 7:+3240896 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGTATAGCTCCCAGCCAGAA+TGG 0.555928 7:-3240043 None:intergenic
AGGAAAACATGTAGTGAATG+TGG 0.559578 7:-3238157 None:intergenic
AGTGCATTAGACCGAAACTC+TGG 0.565067 7:-3238891 None:intergenic
AAAGCCAATACCTTCAACTC+AGG 0.565509 7:-3240064 None:intergenic
GGGTCAGTTGCCAAGAGCAT+TGG 0.565519 7:+3239961 MsG0780036134.01.T01:CDS
CAAATAGGACTTGATGCCAC+TGG 0.567687 7:+3238918 MsG0780036134.01.T01:CDS
TAGATCAAGTGACAACAAGT+TGG 0.569391 7:-3238580 None:intergenic
ATGAAGGCAATCTCTTGGAT+AGG 0.569986 7:+3239164 MsG0780036134.01.T01:CDS
GGTTAGTGATGGTTTATGAG+AGG 0.572171 7:+3240353 MsG0780036134.01.T01:CDS
AAAGCTCGCCTATCCTAGAT+GGG 0.575729 7:-3238485 None:intergenic
GATATGTTTCCATTCTGGCT+GGG 0.576331 7:+3240034 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGGTGGTCTTGTTGCTGGAG+TGG 0.577542 7:+3240858 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTAAAGTTACCTAGACATGA+AGG 0.577999 7:-3239824 None:intergenic
ATGTCATGTTTCCAATCCTA+GGG 0.580571 7:-3240120 None:intergenic
GAATCCATCCAAGTACCTGC+GGG 0.583269 7:-3240900 None:intergenic
ACTTTGGGATCTCGCCATGA+AGG 0.585350 7:-3239373 None:intergenic
ATAGATTGTTGCTCATGGGA+TGG 0.585363 7:+3238309 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTTGAGATTGCATATGGACG+AGG 0.585606 7:-3239753 None:intergenic
GCCTTGTTACAATTTAAGGA+AGG 0.589218 7:+3238216 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCTCGAATCCCATCTAGGAT+AGG 0.589261 7:+3238477 MsG0780036134.01.T01:CDS
GATTTGTTAGGGATGTAGAA+GGG 0.589936 7:-3239097 None:intergenic
GATTTGTGTTCTCATCACAC+TGG 0.590861 7:-3238335 None:intergenic
GTAAGTTGAGTCAACTGTTG+AGG 0.592158 7:-3240583 None:intergenic
GGTACTTGGATGGATTCAAA+GGG 0.594535 7:+3240906 MsG0780036134.01.T01:CDS
ATGAAGCCAATTGTAAAACA+TGG 0.596736 7:-3239571 None:intergenic
ATAACCAAAATCTCAAAGGT+AGG 0.597209 7:+3238865 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGAGATAACCAAAATCTCAA+AGG 0.599815 7:+3238861 MsG0780036134.01.T01:CDS
TCGACAAGTTGAGCAAAACA+AGG 0.600723 7:-3240465 None:intergenic
AACAAATTGTCATTGCTCGG+TGG 0.602269 7:+3239515 MsG0780036134.01.T01:CDS
GTCAATTACAGTACGAGCAG+TGG 0.605492 7:+3240251 MsG0780036134.01.T01:CDS
CTCAGCAACAATAATCTGCA+GGG 0.608057 7:+3239941 MsG0780036134.01.T01:CDS
CAAAGCTTAACTGTTTCCCA+CGG 0.610710 7:+3239710 MsG0780036134.01.T01:CDS
AATTCATTTGAGGGTAACCA+AGG 0.613370 7:+3240688 MsG0780036134.01.T01:CDS
ACCTTCCTTAAATTGTAACA+AGG 0.614118 7:-3238217 None:intergenic
TGAATCCATCCAAGTACCTG+CGG 0.628351 7:-3240901 None:intergenic
CTCGGATATAACAAATTTAG+GGG 0.628768 7:+3239071 MsG0780036134.01.T01:CDS
GCTGAGATCAATCATCTGAA+GGG 0.628957 7:-3239924 None:intergenic
GTAGAGAACTGCTGATTCTG+CGG 0.632705 7:-3240655 None:intergenic
CAAGAACTCGAAGGTGCACG+AGG 0.632757 7:-3238428 None:intergenic
ATGGTCATCGACATCGTCAG+AGG 0.636452 7:-3240779 None:intergenic
GCAGAAAATAGCAATTTAAG+GGG 0.641860 7:+3239287 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTTGCTGAACCAATTTCAGG+AGG 0.642512 7:+3238612 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGTCTGATTGGGTATGTAGG+TGG 0.649503 7:+3240841 MsG0780036134.01.T01:CDS
ACATCGTCAGAGGCATAATG+TGG 0.656436 7:-3240769 None:intergenic
CTGCAAGATCAAGAACTCGA+AGG 0.656974 7:-3238437 None:intergenic
AGAAATGTATAGATCACGCA+GGG 0.658833 7:+3240734 MsG0780036134.01.T01:CDS
GAGGGTAACCAAGGCCTGTG+CGG 0.660662 7:+3240697 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTGTATGGTGAATTTCCTGT+CGG 0.665372 7:+3238801 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTTCTCCTGTCAATGAACCG+TGG 0.667132 7:-3239727 None:intergenic
AAGAAATGTATAGATCACGC+AGG 0.678335 7:+3240733 MsG0780036134.01.T01:CDS
TTGAAGGTATTGGCTTTGCG+TGG 0.688722 7:+3240070 MsG0780036134.01.T01:CDS
AGAGTGATAGGCGAATTGAA+GGG 0.689767 7:+3240442 MsG0780036134.01.T01:CDS
TATTGTACCATAGAAGCCAG+TGG 0.710631 7:-3238934 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTTCAAATTGCAATTTTTT+TGG + Chr7:3238999-3239018 MsG0780036134.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATATCTTTGATATTGTTA+TGG - Chr7:3240021-3240040 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCAAGATAATTCATTTG+AGG + Chr7:3240678-3240697 MsG0780036134.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCAAGATAATTCATTTGA+GGG + Chr7:3240679-3240698 MsG0780036134.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCAATGAATTTACTATGA+AGG + Chr7:3239148-3239167 MsG0780036134.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAATCCAAATATCTCAATTT+TGG - Chr7:3238840-3238859 None:intergenic 20.0%
! AACTCGGATATAACAAATTT+AGG + Chr7:3239069-3239088 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! AATCTTTCTTTGAATTTGAC+TGG + Chr7:3240812-3240831 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! ACTCGGATATAACAAATTTA+GGG + Chr7:3239070-3239089 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! CTAAAAGGAAACAATTTATC+TGG + Chr7:3239869-3239888 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! CTAAGATCTCTTATAAATGT+TGG - Chr7:3239614-3239633 None:intergenic 25.0%
! CTTTACAATTGTGAATTGTA+TGG + Chr7:3238786-3238805 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTCACAATGTCAAATAAA+GGG + Chr7:3240332-3240351 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! GTTATCCTAAAATTTCATCT+TGG + Chr7:3238277-3238296 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTCCAAAATTGAGATATT+TGG + Chr7:3238833-3238852 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTTCACAATGTCAAATAA+AGG + Chr7:3240331-3240350 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! TGCAGAAAATAGCAATTTAA+GGG + Chr7:3239286-3239305 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCGTTCAACAATTTAAG+CGG + Chr7:3239794-3239813 MsG0780036134.01.T01:CDS 25.0%
!! GAATTCCAAGATGAAATTTT+AGG - Chr7:3238285-3238304 None:intergenic 25.0%
!! TAAAGAACTAAGTTTTCCAA+TGG - Chr7:3238967-3238986 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGAGTCATATATGTTTG+AGG - Chr7:3239902-3239921 None:intergenic 25.0%
AAGATCAATGATGTGAAGTT+TGG - Chr7:3240155-3240174 None:intergenic 30.0%
ACCTTCCTTAAATTGTAACA+AGG - Chr7:3238220-3238239 None:intergenic 30.0%
AGAACACAAATCATGTCATT+AGG + Chr7:3238346-3238365 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
AGAGATAACCAAAATCTCAA+AGG + Chr7:3238861-3238880 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
ATAACCAAAATCTCAAAGGT+AGG + Chr7:3238865-3238884 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGAGATCTTAGAGATCT+CGG + Chr7:3239620-3239639 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAGCCAATTGTAAAACA+TGG - Chr7:3239574-3239593 None:intergenic 30.0%
ATGCAAGAAATTAGTGCTTA+AGG - Chr7:3239432-3239451 None:intergenic 30.0%
ATTTCAAGCAACCAAATAAG+TGG + Chr7:3240409-3240428 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
CAAGTCTAAAGAAAGACTTT+GGG - Chr7:3239391-3239410 None:intergenic 30.0%
CAGCTCACATTTATAAAACT+CGG + Chr7:3239053-3239072 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
CTAGAAATTCTGATGCTAAA+AGG + Chr7:3239854-3239873 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
CTCGGATATAACAAATTTAG+GGG + Chr7:3239071-3239090 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCTTTCAATAAGTTCTC+TGG + Chr7:3240172-3240191 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
GATTGTTGAATGACACATTA+AGG - Chr7:3240621-3240640 None:intergenic 30.0%
GCAGAAAATAGCAATTTAAG+GGG + Chr7:3239287-3239306 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
GTGCAGAAAATAGCAATTTA+AGG + Chr7:3239285-3239304 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
TCAAAGATATGTTTCCATTC+TGG + Chr7:3240029-3240048 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
TCAAGTCTAAAGAAAGACTT+TGG - Chr7:3239392-3239411 None:intergenic 30.0%
TGGAAAAGAACAAAGAAGAA+AGG - Chr7:3238140-3238159 None:intergenic 30.0%
TTAAGCACTAATTTCTTGCA+TGG + Chr7:3239431-3239450 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
TTATAAATGTGAGCTGAGTT+AGG - Chr7:3239049-3239068 None:intergenic 30.0%
TTCAACAAATTGTCATTGCT+CGG + Chr7:3239512-3239531 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTTAGACTTGAGAATCT+TGG + Chr7:3239398-3239417 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
TTGGTTGCTTGAAATATCAA+TGG - Chr7:3240404-3240423 None:intergenic 30.0%
! AATTTTGCTGAACCAATTTC+AGG + Chr7:3238609-3238628 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTAGAAATGATTCAGAAC+TGG + Chr7:3240203-3240222 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTCTTGTACCAAACTTTT+CGG + Chr7:3238528-3238547 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
! GATCTATCTGAAGTGAATAT+TGG + Chr7:3239212-3239231 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
! TCGAATCCATGTTTTACAAT+TGG + Chr7:3239565-3239584 MsG0780036134.01.T01:CDS 30.0%
! TTAGTTTGGTGAGATTTGTT+AGG - Chr7:3239112-3239131 None:intergenic 30.0%
!! CAGTTCTGAATCATTTCTAA+AGG - Chr7:3240205-3240224 None:intergenic 30.0%
!! TAGTTTGGTGAGATTTGTTA+GGG - Chr7:3239111-3239130 None:intergenic 30.0%
!!! TTGGATAGTTTTGAAACTTG+TGG - Chr7:3238564-3238583 None:intergenic 30.0%
AAACTAAGCTACTTGTGTCT+AGG + Chr7:3239125-3239144 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
AACCATAGATTGTTGCTCAT+GGG + Chr7:3238305-3238324 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAAGATCCAATGCTTCA+AGG - Chr7:3240540-3240559 None:intergenic 35.0%
AAGAAATGTATAGATCACGC+AGG + Chr7:3240733-3240752 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
AATTCATTTGAGGGTAACCA+AGG + Chr7:3240688-3240707 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
ACTGGAAAGTAAGTCTGATT+GGG + Chr7:3240830-3240849 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAGATTCTGAGTCATCA+TGG - Chr7:3240801-3240820 None:intergenic 35.0%
AGAAATGTATAGATCACGCA+GGG + Chr7:3240734-3240753 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
AGGAAAACATGTAGTGAATG+TGG - Chr7:3238160-3238179 None:intergenic 35.0%
ATGTCATGTTTCCAATCCTA+GGG - Chr7:3240123-3240142 None:intergenic 35.0%
CACATTAAGGAACTCCAAAA+AGG - Chr7:3240608-3240627 None:intergenic 35.0%
CCTTAAATTGTAACAAGGCA+TGG - Chr7:3238215-3238234 None:intergenic 35.0%
CGAAAAGTTTGGTACAAGAA+AGG - Chr7:3238530-3238549 None:intergenic 35.0%
CTAAAGTTACCTAGACATGA+AGG - Chr7:3239827-3239846 None:intergenic 35.0%
CTTTCTTTCAACAATCTGTC+AGG + Chr7:3240553-3240572 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
GAGGTTCAAGTATGCTAAAT+CGG - Chr7:3239342-3239361 None:intergenic 35.0%
GATTCGAGAATCAGTTACAT+TGG - Chr7:3239552-3239571 None:intergenic 35.0%
GCATAATGTGGTGAAAAAGA+AGG - Chr7:3240760-3240779 None:intergenic 35.0%
GTTAGATTTGTGAGTGTGTT+TGG - Chr7:3238747-3238766 None:intergenic 35.0%
GTTAGGTTCATTATCCAAGA+TGG - Chr7:3239320-3239339 None:intergenic 35.0%
TAGACACAAGTAGCTTAGTT+TGG - Chr7:3239126-3239145 None:intergenic 35.0%
TAGATCAAGTGACAACAAGT+TGG - Chr7:3238583-3238602 None:intergenic 35.0%
TCAAGTATGCTAAATCGGTT+AGG - Chr7:3239337-3239356 None:intergenic 35.0%
TGACACTTTGGTTGAACTAA+AGG - Chr7:3238180-3238199 None:intergenic 35.0%
TGGAATTTCTCCGAAAAGTT+TGG - Chr7:3238541-3238560 None:intergenic 35.0%
TTACTATGAAGGCAATCTCT+TGG + Chr7:3239159-3239178 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTATCTCTCCACTTATT+TGG - Chr7:3240423-3240442 None:intergenic 35.0%
TTGTATGGTGAATTTCCTGT+CGG + Chr7:3238801-3238820 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCGAATAACATCCTTAC+TGG + Chr7:3240481-3240500 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
! ACAATTGGCTTCATGCAATT+TGG + Chr7:3239580-3239599 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
! CCATGCCTTGTTACAATTTA+AGG + Chr7:3238212-3238231 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
! CTAAGTTTTCCAATGGATGT+TGG - Chr7:3238960-3238979 None:intergenic 35.0%
! CTTTCATCTTGATGACACTT+TGG - Chr7:3238192-3238211 None:intergenic 35.0%
! GAGTGATTTGAGATTGCATA+TGG - Chr7:3239762-3239781 None:intergenic 35.0%
! GCATCAGAATTTCTAGAGAT+TGG - Chr7:3239850-3239869 None:intergenic 35.0%
! GCCTTGTTACAATTTAAGGA+AGG + Chr7:3238216-3238235 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
! GTCAAATAAAGGGTTAGTGA+TGG + Chr7:3240342-3240361 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTTTCTCCATAACCATCT+AGG - Chr7:3239683-3239702 None:intergenic 35.0%
! TATACCTGAGTTGAAGGTAT+TGG + Chr7:3240060-3240079 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
!! AACTTGTTGTCACTTGATCT+AGG + Chr7:3238582-3238601 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
!! AGATTTGTTAGGGATGTAGA+AGG - Chr7:3239101-3239120 None:intergenic 35.0%
!! GATTTGTTAGGGATGTAGAA+GGG - Chr7:3239100-3239119 None:intergenic 35.0%
!! GTACTGTAATTGACTTGTGT+TGG - Chr7:3240245-3240264 None:intergenic 35.0%
!! GTTGACTCAACTTACCTTTT+TGG + Chr7:3240591-3240610 MsG0780036134.01.T01:CDS 35.0%
!!! GATAGTTTTGAAACTTGTGG+TGG - Chr7:3238561-3238580 None:intergenic 35.0%
AAAGCCAATACCTTCAACTC+AGG - Chr7:3240067-3240086 None:intergenic 40.0%
AACAAATTGTCATTGCTCGG+TGG + Chr7:3239515-3239534 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGTGATAGGCGAATTGA+AGG + Chr7:3240441-3240460 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
AAGGTTTGAAAGCTTCCCTA+AGG - Chr7:3240521-3240540 None:intergenic 40.0%
AATACTCTCGAATCCCATCT+AGG + Chr7:3238472-3238491 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
AGAGTGATAGGCGAATTGAA+GGG + Chr7:3240442-3240461 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
AGATATGTTTCCATTCTGGC+TGG + Chr7:3240033-3240052 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
AGTGGCATCAAGTCCTATTT+GGG - Chr7:3238919-3238938 None:intergenic 40.0%
ATAGATTGTTGCTCATGGGA+TGG + Chr7:3238309-3238328 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
ATCCCATGAGCAACAATCTA+TGG - Chr7:3238310-3238329 None:intergenic 40.0%
ATGAAGGCAATCTCTTGGAT+AGG + Chr7:3239164-3239183 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGCTTAACTGTTTCCCA+CGG + Chr7:3239710-3239729 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
CAACCATAGATTGTTGCTCA+TGG + Chr7:3238304-3238323 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
CATGAAGGCTATTATGTTCG+AGG - Chr7:3239361-3239380 None:intergenic 40.0%
CATGTCATGTTTCCAATCCT+AGG - Chr7:3240124-3240143 None:intergenic 40.0%
CCAATTTCAGGAGGTGAAAT+CGG + Chr7:3238621-3238640 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
CTCAGCAACAATAATCTGCA+GGG + Chr7:3239941-3239960 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
CTCGAACATAATAGCCTTCA+TGG + Chr7:3239359-3239378 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
CTGAGGTTTGCGAAAGATAA+TGG - Chr7:3239248-3239267 None:intergenic 40.0%
GACTGGAAAGTAAGTCTGAT+TGG + Chr7:3240829-3240848 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
GATTTGTGTTCTCATCACAC+TGG - Chr7:3238338-3238357 None:intergenic 40.0%
GCAACATACCAACTTCCTTA+GGG + Chr7:3240503-3240522 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
GCTGAGATCAATCATCTGAA+GGG - Chr7:3239927-3239946 None:intergenic 40.0%
GCTTTCAAACCTTGAAGCAT+TGG + Chr7:3240528-3240547 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGATGAAAAATTCCGAC+AGG - Chr7:3238819-3238838 None:intergenic 40.0%
GGTACAATACCAACATCCAT+TGG + Chr7:3238948-3238967 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
GGTTAGTGATGGTTTATGAG+AGG + Chr7:3240353-3240372 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
GTAAGTCTGATTGGGTATGT+AGG + Chr7:3240838-3240857 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
GTATAACTTCGCTACCTAGA+TGG + Chr7:3239666-3239685 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
TAAGGGGTGAAATTCCATCT+TGG + Chr7:3239303-3239322 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
TATTGTACCATAGAAGCCAG+TGG - Chr7:3238937-3238956 None:intergenic 40.0%
TCTAATGCACTCACCCAAAT+AGG + Chr7:3238903-3238922 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
TCTCAGCAACAATAATCTGC+AGG + Chr7:3239940-3239959 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
TGCTGAGATCAATCATCTGA+AGG - Chr7:3239928-3239947 None:intergenic 40.0%
TTCAATTCGCCTATCACTCT+TGG - Chr7:3240442-3240461 None:intergenic 40.0%
TTGCCAAGTGAAGAAGGAAT+AGG - Chr7:3239026-3239045 None:intergenic 40.0%
TTTGCTGAACCAATTTCAGG+AGG + Chr7:3238612-3238631 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
! AGGTACTTGGATGGATTCAA+AGG + Chr7:3240905-3240924 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
! GATATGTTTCCATTCTGGCT+GGG + Chr7:3240034-3240053 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
! GGTACTTGGATGGATTCAAA+GGG + Chr7:3240906-3240925 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
! GTAAGTTGAGTCAACTGTTG+AGG - Chr7:3240586-3240605 None:intergenic 40.0%
! GTGTCATTCAACAATCTCTC+AGG + Chr7:3240625-3240644 MsG0780036134.01.T01:CDS 40.0%
! TCGACAAGTTGAGCAAAACA+AGG - Chr7:3240468-3240487 None:intergenic 40.0%
! TTTGAGATTGCATATGGACG+AGG - Chr7:3239756-3239775 None:intergenic 40.0%
!! AAGTTGGTATGTTGCCAGTA+AGG - Chr7:3240498-3240517 None:intergenic 40.0%
!!! GCAACCTACCTTTGAGATTT+TGG - Chr7:3238872-3238891 None:intergenic 40.0%
AAAGCTCGCCTATCCTAGAT+GGG - Chr7:3238488-3238507 None:intergenic 45.0%
AAGGTAGGTTGCCAGAGTTT+CGG + Chr7:3238880-3238899 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
AGTCTGATTGGGTATGTAGG+TGG + Chr7:3240841-3240860 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
AGTGCATTAGACCGAAACTC+TGG - Chr7:3238894-3238913 None:intergenic 45.0%
CAAATAGGACTTGATGCCAC+TGG + Chr7:3238918-3238937 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
CAGTGGCATCAAGTCCTATT+TGG - Chr7:3238920-3238939 None:intergenic 45.0%
CCAAGATTGTCCTTTCTGCT+GGG - Chr7:3240293-3240312 None:intergenic 45.0%
CCGATTTCACCTCCTGAAAT+TGG - Chr7:3238624-3238643 None:intergenic 45.0%
CTACAGTTGACCAATGCTCT+TGG - Chr7:3239974-3239993 None:intergenic 45.0%
CTGCAAGATCAAGAACTCGA+AGG - Chr7:3238440-3238459 None:intergenic 45.0%
CTGCACGTAAATATTGCAGC+TGG - Chr7:3239271-3239290 None:intergenic 45.0%
CTTAGTAGCAGCATGCTCTA+TGG + Chr7:3238375-3238394 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGCTACCTAGATGGTTA+TGG + Chr7:3239672-3239691 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGCTTCCCTAAGGAAGT+TGG - Chr7:3240514-3240533 None:intergenic 45.0%
GGAGAGATACCAAGAGTGAT+AGG + Chr7:3240430-3240449 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
GGCAACATACCAACTTCCTT+AGG + Chr7:3240502-3240521 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
GGCAATCTCTTGGATAGGTA+AGG + Chr7:3239169-3239188 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
GGCAATGTTCCTTCATGTCT+AGG + Chr7:3239815-3239834 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
GGTCCTATTCCTTCTTCACT+TGG + Chr7:3239020-3239039 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
GTAAATATTGCAGCTGGCTG+AGG - Chr7:3239265-3239284 None:intergenic 45.0%
GTCAATTACAGTACGAGCAG+TGG + Chr7:3240251-3240270 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
TCCAAGATTGTCCTTTCTGC+TGG - Chr7:3240294-3240313 None:intergenic 45.0%
TGAATCCATCCAAGTACCTG+CGG - Chr7:3240904-3240923 None:intergenic 45.0%
TTCTCCTGTCAATGAACCGT+GGG - Chr7:3239729-3239748 None:intergenic 45.0%
TTGCGTGGCAACGAATTTCA+TGG + Chr7:3240085-3240104 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTCCTGTCAATGAACCG+TGG - Chr7:3239730-3239749 None:intergenic 45.0%
! ACATCGTCAGAGGCATAATG+TGG - Chr7:3240772-3240791 None:intergenic 45.0%
! ATGGACCAATAAAGTGCCCT+AGG + Chr7:3240104-3240123 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
! CCAATAAAGTGCCCTAGGAT+TGG + Chr7:3240109-3240128 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
! CCAATCCTAGGGCACTTTAT+TGG - Chr7:3240112-3240131 None:intergenic 45.0%
! GTGGCATTGGGAATCACTTT+CGG + Chr7:3240877-3240896 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
! GTTAGGTTGCCAAGTGAAGA+AGG - Chr7:3239032-3239051 None:intergenic 45.0%
! TCTCGAATCCCATCTAGGAT+AGG + Chr7:3238477-3238496 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
!! AACTGCTGATTCTGCGGTAT+AGG - Chr7:3240652-3240671 None:intergenic 45.0%
!! GAGCATTGGTCAACTGTAGA+AGG + Chr7:3239975-3239994 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
!! GTAGAGAACTGCTGATTCTG+CGG - Chr7:3240658-3240677 None:intergenic 45.0%
!! TATGTAGGTGGTCTTGTTGC+TGG + Chr7:3240853-3240872 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGAAGGTATTGGCTTTGCG+TGG + Chr7:3240070-3240089 MsG0780036134.01.T01:CDS 45.0%
ATGGTCATCGACATCGTCAG+AGG - Chr7:3240782-3240801 None:intergenic 50.0%
ATTGTCCTTTCTGCTGGGCA+CGG - Chr7:3240288-3240307 None:intergenic 50.0%
CCCAGCAGAAAGGACAATCT+TGG + Chr7:3240290-3240309 MsG0780036134.01.T01:CDS 50.0%
CTTGTTGCTGGAGTGGCATT+GGG + Chr7:3240865-3240884 MsG0780036134.01.T01:CDS 50.0%
GAAAGCTCGCCTATCCTAGA+TGG - Chr7:3238489-3238508 None:intergenic 50.0%
GAATCCATCCAAGTACCTGC+GGG - Chr7:3240903-3240922 None:intergenic 50.0%
GTTTCCCACGGTTCATTGAC+AGG + Chr7:3239722-3239741 MsG0780036134.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGTTGCTGGAGTGGCAT+TGG + Chr7:3240864-3240883 MsG0780036134.01.T01:CDS 50.0%
! GGGAGCTATACCTGAGTTGA+AGG + Chr7:3240054-3240073 MsG0780036134.01.T01:CDS 50.0%
!! ACTTTGGGATCTCGCCATGA+AGG - Chr7:3239376-3239395 None:intergenic 50.0%
!! CTTGATGCCACTGGCTTCTA+TGG + Chr7:3238927-3238946 MsG0780036134.01.T01:CDS 50.0%
GGTATAGCTCCCAGCCAGAA+TGG - Chr7:3240046-3240065 None:intergenic 55.0%
TCGACAATTGATCGCCGCAC+AGG - Chr7:3240714-3240733 None:intergenic 55.0%
TTCTTCCGTGCCCAGCAGAA+AGG + Chr7:3240280-3240299 MsG0780036134.01.T01:CDS 55.0%
! CAAGAACTCGAAGGTGCACG+AGG - Chr7:3238431-3238450 None:intergenic 55.0%
! GGGTCAGTTGCCAAGAGCAT+TGG + Chr7:3239961-3239980 MsG0780036134.01.T01:CDS 55.0%
!! AGGTGGTCTTGTTGCTGGAG+TGG + Chr7:3240858-3240877 MsG0780036134.01.T01:CDS 55.0%
ACTTTCGGCCCGCAGGTACT+TGG + Chr7:3240892-3240911 MsG0780036134.01.T01:CDS 60.0%
ATTGATCGCCGCACAGGCCT+TGG - Chr7:3240708-3240727 None:intergenic 60.0%
GAGGGTAACCAAGGCCTGTG+CGG + Chr7:3240697-3240716 MsG0780036134.01.T01:CDS 60.0%
GGGAATCACTTTCGGCCCGC+AGG + Chr7:3240885-3240904 MsG0780036134.01.T01:CDS 65.0%
TCGGCCCGCAGGTACTTGGA+TGG + Chr7:3240896-3240915 MsG0780036134.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 3238102 3240936 3238102 ID=MsG0780036134.01;Name=MsG0780036134.01
Chr7 mRNA 3238102 3240936 3238102 ID=MsG0780036134.01.T01;Parent=MsG0780036134.01;Name=MsG0780036134.01.T01;_AED=0.12;_eAED=0.12;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|944
Chr7 exon 3238102 3240936 3238102 ID=MsG0780036134.01.T01:exon:38527;Parent=MsG0780036134.01.T01
Chr7 CDS 3238102 3240936 3238102 ID=MsG0780036134.01.T01:cds;Parent=MsG0780036134.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036134.01.T01

ATGAAGTCTCATGTGTTATTATTGCAGTTTCTTTTCCTTTCTTCTTTGTTCTTTTCCACATTCACTACATGTTTTCCTTTAGTTCAACCAAAGTGTCATCAAGATGAAAGCCATGCCTTGTTACAATTTAAGGAAGGTTTTGTAATTAGAAAGTTTGCTTCTCACAATTCTCTCAGTTATCCTAAAATTTCATCTTGGAATTCAACCATAGATTGTTGCTCATGGGATGGAATCCAGTGTGATGAGAACACAAATCATGTCATTAGGATTGATCTTAGTAGCAGCATGCTCTATGGTAAAATTCATGCTAATAGCAGTCTCTTTCGCCTCGTGCACCTTCGAGTTCTTGATCTTGCAGATAATGACTTCAAATACTCTCGAATCCCATCTAGGATAGGCGAGCTTTCGCAGATAAAATATTTAAACCTTTCTTGTACCAAACTTTTCGGAGAAATTCCACCACAAGTTTCAAAACTATCCAACTTGTTGTCACTTGATCTAGGCAACAATTTTGCTGAACCAATTTCAGGAGGTGAAATCGGTTTGTTGCAACTCGAATTGTCTAGTCTCAGAAGCATAATTCAAAACTCAACAAAACTTGAGATACTTTATCTTAGTTATGTGACTATTTCATCTACTTTACCAAACACACTCACAAATCTAACTTCGTTGAAAGTACTATCTCTTTACAATTGTGAATTGTATGGTGAATTTCCTGTCGGAATTTTTCATCTTCCAAAATTGAGATATTTGGATTTGAGAGATAACCAAAATCTCAAAGGTAGGTTGCCAGAGTTTCGGTCTAATGCACTCACCCAAATAGGACTTGATGCCACTGGCTTCTATGGTACAATACCAACATCCATTGGAAAACTTAGTTCTTTAAAAGTACTATCAATTTCAAATTGCAATTTTTTTGGTCCTATTCCTTCTTCACTTGGCAACCTAACTCAGCTCACATTTATAAAACTCGGATATAACAAATTTAGGGGAGACCCTTCTACATCCCTAACAAATCTCACCAAACTAAGCTACTTGTGTCTAGGTTTCAATGAATTTACTATGAAGGCAATCTCTTGGATAGGTAAGGTTTCATCGATCACTTACTTAGATCTATCTGAAGTGAATATTGGCAGCGATATACCATTATCTTTCGCAAACCTCAGCCAGCTGCAATATTTACGTGCAGAAAATAGCAATTTAAGGGGTGAAATTCCATCTTGGATAATGAACCTAACCGATTTAGCATACTTGAACCTCGAACATAATAGCCTTCATGGCGAGATCCCAAAGTCTTTCTTTAGACTTGAGAATCTTGGAAGTCTTTCCTTAAGCACTAATTTCTTGCATGGAAAGCTAGATCTTGACATGTTTCTCAAGTTCAAAAAGTTAACTTTTCTAAATTTATCGTTCAACAAATTGTCATTGCTCGGTGGAAAAAGTTCTTCCAATGTAACTGATTCTCGAATCCATGTTTTACAATTGGCTTCATGCAATTTGGTTGAGATTCCAACATTTATAAGAGATCTTAGAGATCTCGGATGTATTATCTTGTCAAACAACAGTATAACTTCGCTACCTAGATGGTTATGGAGAAAAACAAGTCTACAAAGCTTAACTGTTTCCCACGGTTCATTGACAGGAGAAATATCCTCGTCCATATGCAATCTCAAATCACTCATGCATCTTGATTTATCGTTCAACAATTTAAGCGGCAATGTTCCTTCATGTCTAGGTAACTTTAGCCAATCTCTAGAAATTCTGATGCTAAAAGGAAACAATTTATCTGGTCTCATTCCTCAAACATATATGACTCAAAATGCCCTTCAGATGATTGATCTCAGCAACAATAATCTGCAGGGTCAGTTGCCAAGAGCATTGGTCAACTGTAGAAGGCTAGAGTTCTTTGATGTTAGCCATAACAATATCAAAGATATGTTTCCATTCTGGCTGGGAGCTATACCTGAGTTGAAGGTATTGGCTTTGCGTGGCAACGAATTTCATGGACCAATAAAGTGCCCTAGGATTGGAAACATGACATGCTCATTTTCCAAACTTCACATCATTGATCTTTCTTTCAATAAGTTCTCTGGAAGTTTGCCTTTAGAAATGATTCAGAACTGGAAATCAATGAAAGCTTCCAACACAAGTCAATTACAGTACGAGCAGTGGCGACTTTTCTTCCGTGCCCAGCAGAAAGGACAATCTTGGACAGAAACAAACACTTATTCTTTCACAATGTCAAATAAAGGGTTAGTGATGGTTTATGAGAGGCTTCAAGAGTTTTATAAAATGATAGCCATTGATATTTCAAGCAACCAAATAAGTGGAGAGATACCAAGAGTGATAGGCGAATTGAAGGGCCTTGTTTTGCTCAACTTGTCGAATAACATCCTTACTGGCAACATACCAACTTCCTTAGGGAAGCTTTCAAACCTTGAAGCATTGGATCTTTCTTTCAACAATCTGTCAGGAAAGATTCCTCAACAGTTGACTCAACTTACCTTTTTGGAGTTCCTTAATGTGTCATTCAACAATCTCTCAGGTCCTATACCGCAGAATCAGCAGTTCTCTACATTTCAAGATAATTCATTTGAGGGTAACCAAGGCCTGTGCGGCGATCAATTGTCGAAGAAATGTATAGATCACGCAGGGCCTTCTTTTTCACCACATTATGCCTCTGACGATGTCGATGACCATGATGACTCAGAATCTTTCTTTGAATTTGACTGGAAAGTAAGTCTGATTGGGTATGTAGGTGGTCTTGTTGCTGGAGTGGCATTGGGAATCACTTTCGGCCCGCAGGTACTTGGATGGATTCAAAGGGTCTTCTGA
Protein sequence

>MsG0780036134.01.T01

MKSHVLLLQFLFLSSLFFSTFTTCFPLVQPKCHQDESHALLQFKEGFVIRKFASHNSLSYPKISSWNSTIDCCSWDGIQCDENTNHVIRIDLSSSMLYGKIHANSSLFRLVHLRVLDLADNDFKYSRIPSRIGELSQIKYLNLSCTKLFGEIPPQVSKLSNLLSLDLGNNFAEPISGGEIGLLQLELSSLRSIIQNSTKLEILYLSYVTISSTLPNTLTNLTSLKVLSLYNCELYGEFPVGIFHLPKLRYLDLRDNQNLKGRLPEFRSNALTQIGLDATGFYGTIPTSIGKLSSLKVLSISNCNFFGPIPSSLGNLTQLTFIKLGYNKFRGDPSTSLTNLTKLSYLCLGFNEFTMKAISWIGKVSSITYLDLSEVNIGSDIPLSFANLSQLQYLRAENSNLRGEIPSWIMNLTDLAYLNLEHNSLHGEIPKSFFRLENLGSLSLSTNFLHGKLDLDMFLKFKKLTFLNLSFNKLSLLGGKSSSNVTDSRIHVLQLASCNLVEIPTFIRDLRDLGCIILSNNSITSLPRWLWRKTSLQSLTVSHGSLTGEISSSICNLKSLMHLDLSFNNLSGNVPSCLGNFSQSLEILMLKGNNLSGLIPQTYMTQNALQMIDLSNNNLQGQLPRALVNCRRLEFFDVSHNNIKDMFPFWLGAIPELKVLALRGNEFHGPIKCPRIGNMTCSFSKLHIIDLSFNKFSGSLPLEMIQNWKSMKASNTSQLQYEQWRLFFRAQQKGQSWTETNTYSFTMSNKGLVMVYERLQEFYKMIAIDISSNQISGEIPRVIGELKGLVLLNLSNNILTGNIPTSLGKLSNLEALDLSFNNLSGKIPQQLTQLTFLEFLNVSFNNLSGPIPQNQQFSTFQDNSFEGNQGLCGDQLSKKCIDHAGPSFSPHYASDDVDDHDDSESFFEFDWKVSLIGYVGGLVAGVALGITFGPQVLGWIQRVF*