AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046411.01

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MsG0880046411.01.T01 AT1G06700 37.543 293 174 5 105 388 55 347 8.73e-61 201
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MsG0880046411.01.T01 AT4G34440 38.762 307 178 6 91 391 286 588 4.20e-60 206
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MsG0880046411.01.T01 AT1G48210 36.184 304 184 6 110 405 60 361 5.09e-58 194
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MsG0880046411.01.T01 AT4G05200 33.687 377 230 11 27 396 283 646 5.30e-57 199
MsG0880046411.01.T01 AT3G59350 36.824 296 177 6 103 388 112 407 5.46e-57 193
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MsG0880046411.01.T01 AT3G59420 36.056 355 212 8 47 391 440 789 5.69e-57 201
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MsG0880046411.01.T01 AT5G01950 37.716 289 168 4 106 388 614 896 7.84e-57 201
MsG0880046411.01.T01 AT4G02420 40.141 284 162 7 116 394 348 628 8.05e-57 197
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MsG0880046411.01.T01 AT3G46370 39.146 281 165 4 106 384 477 753 1.27e-56 199
MsG0880046411.01.T01 AT2G14440 36.467 351 200 8 43 389 503 834 1.35e-56 199
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MsG0880046411.01.T01 AT4G04540 36.806 288 176 4 111 396 317 600 1.60e-56 196
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MsG0880046411.01.T01 AT4G23260 36.644 292 175 6 117 400 327 616 3.76e-56 196
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MsG0880046411.01.T01 AT3G17410 35.948 306 186 6 108 405 59 362 3.12e-55 186
MsG0880046411.01.T01 AT3G23750 39.655 290 164 6 117 397 577 864 3.14e-55 196
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MsG0880046411.01.T01 AT2G43700 32.447 376 227 8 23 394 236 588 4.62e-55 192
MsG0880046411.01.T01 AT2G43700 32.447 376 227 8 23 394 236 588 4.62e-55 192
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MsG0880046411.01.T01 AT2G28590 41.880 234 133 3 106 336 86 319 5.34e-55 185
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MsG0880046411.01.T01 AT4G21410 31.135 379 247 5 26 396 269 641 7.11e-55 192
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MsG0880046411.01.T01 AT1G67520 36.426 291 177 4 106 390 484 772 7.72e-55 194
MsG0880046411.01.T01 AT3G51740 32.117 411 239 12 4 389 412 807 8.27e-55 194
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MsG0880046411.01.T01 AT5G16900 39.792 289 168 4 107 393 564 848 8.94e-55 194
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MsG0880046411.01.T01 AT3G53590 32.021 381 236 6 23 394 534 900 9.78e-55 195
MsG0880046411.01.T01 AT5G56460 37.942 311 170 9 92 388 56 357 1.08e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT1G67520 36.426 291 177 4 106 390 491 779 1.09e-54 194
MsG0880046411.01.T01 AT3G16030 38.321 274 165 3 118 387 527 800 1.09e-54 194
MsG0880046411.01.T01 AT1G29730 38.214 280 162 4 118 391 673 947 1.16e-54 195
MsG0880046411.01.T01 AT5G15080 37.162 296 171 5 106 388 130 423 1.31e-54 188
MsG0880046411.01.T01 AT3G16030 38.043 276 167 3 116 387 546 821 1.40e-54 194
MsG0880046411.01.T01 AT1G72180 40.127 314 169 10 93 397 663 966 1.50e-54 194
MsG0880046411.01.T01 AT2G43230 36.149 296 179 6 103 388 95 390 1.57e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT4G32000 34.648 355 215 8 41 387 55 400 1.62e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT1G11340 33.048 351 217 7 48 387 442 785 1.82e-54 193
MsG0880046411.01.T01 AT1G21240 34.278 388 230 11 17 388 308 686 1.88e-54 192
MsG0880046411.01.T01 AT4G04500 30.871 379 218 9 37 397 280 632 1.93e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT4G32000 34.085 355 216 7 41 387 55 399 1.99e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT2G17220 37.288 295 172 7 106 388 75 368 2.12e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT2G17220 37.288 295 172 7 106 388 74 367 2.14e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT4G23740 32.090 402 236 10 18 389 213 607 2.25e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT4G23740 32.090 402 236 10 18 389 213 607 2.25e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT1G14370 36.364 297 174 6 106 389 74 368 2.34e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT1G07570 33.714 350 211 8 60 389 15 363 2.42e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT4G04960 37.942 311 170 10 104 404 335 632 2.63e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT1G70130 36.486 296 183 5 102 394 318 611 2.70e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT2G43230 36.149 296 179 6 103 388 129 424 2.77e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT1G51860 34.167 360 224 7 34 387 500 852 2.79e-54 193
MsG0880046411.01.T01 AT3G45420 33.136 338 205 6 60 396 308 625 2.88e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT4G29450 39.716 282 153 6 123 389 571 850 3.16e-54 193
MsG0880046411.01.T01 AT1G72540 37.543 293 171 6 106 388 72 362 3.28e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT1G51800 38.983 295 167 7 121 407 589 878 3.75e-54 193
MsG0880046411.01.T01 AT4G23250 36.177 293 175 7 117 400 358 647 3.75e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT5G40380 34.254 362 209 8 47 397 256 599 3.91e-54 190
MsG0880046411.01.T01 AT1G51890 33.908 348 218 7 48 389 227 568 4.01e-54 189
MsG0880046411.01.T01 AT4G26540 35.185 324 190 7 79 389 724 1040 4.10e-54 194
MsG0880046411.01.T01 AT2G28970 39.636 275 162 3 121 393 447 719 4.34e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT1G66880 39.189 296 165 9 100 387 330 618 4.34e-54 190
MsG0880046411.01.T01 AT1G16120 32.782 363 233 4 38 394 349 706 4.57e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT1G61610 35.621 306 191 6 103 404 509 812 4.79e-54 192
MsG0880046411.01.T01 AT1G49730 34.286 385 190 10 32 402 237 572 4.88e-54 189
MsG0880046411.01.T01 AT4G23310 32.647 340 214 6 60 387 404 740 5.05e-54 192
MsG0880046411.01.T01 AT3G05140 34.971 346 201 10 67 394 80 419 5.29e-54 186
MsG0880046411.01.T01 AT4G23250 36.177 293 175 7 117 400 353 642 5.96e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT2G28970 38.909 275 164 3 121 393 482 754 6.02e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT4G38830 34.839 310 193 5 104 405 330 638 7.31e-54 189
MsG0880046411.01.T01 AT1G07570 34.675 323 196 7 81 389 31 352 7.76e-54 184
MsG0880046411.01.T01 AT1G07570 34.675 323 196 7 81 389 31 352 7.76e-54 184
MsG0880046411.01.T01 AT1G07570 34.675 323 196 7 81 389 31 352 7.76e-54 184
MsG0880046411.01.T01 AT5G15730 36.330 267 156 5 123 387 119 373 8.03e-54 185
MsG0880046411.01.T01 AT4G23310 32.647 340 214 6 60 387 444 780 8.21e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT1G29720 37.050 278 171 3 116 391 671 946 8.40e-54 192
MsG0880046411.01.T01 AT4G00340 34.667 375 200 10 35 388 410 760 8.46e-54 191
MsG0880046411.01.T01 AT1G61370 36.429 280 176 2 121 398 353 632 1.10e-53 189
MsG0880046411.01.T01 AT4G23240 33.333 309 200 5 93 396 3 310 1.19e-53 182
MsG0880046411.01.T01 AT5G06740 34.203 345 205 9 64 398 286 618 1.23e-53 189
MsG0880046411.01.T01 AT4G31110 37.415 294 177 4 106 394 419 710 1.32e-53 190
MsG0880046411.01.T01 AT3G46355 38.603 272 144 5 124 393 9 259 1.34e-53 180
MsG0880046411.01.T01 AT3G05140 34.971 346 201 10 67 394 128 467 1.37e-53 186
MsG0880046411.01.T01 AT1G29740 39.179 268 156 4 124 387 683 947 1.43e-53 192

Find 102 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 132 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCTCCTTATCTATGATTATT+TGG 0.140572 8:+73098386 MsG0880046411.01.T01:CDS
TGCTGGCACATTTGGCTATT+TGG 0.152782 8:+73098754 MsG0880046411.01.T01:CDS
TGAAAGGGAACTAGAGATTT+TGG 0.165691 8:+73098302 MsG0880046411.01.T01:CDS
TACTTGAAGGCTGTGCTAAT+TGG 0.171809 8:+73097861 MsG0880046411.01.T01:CDS
TGAAACTCTTGAAGTAATTT+TGG 0.182786 8:+73099204 MsG0880046411.01.T01:CDS
TTGCATATGAATAGGTTTAT+TGG 0.218234 8:+73097591 None:intergenic
GAGCCTCACATCTCTGATTT+TGG 0.250658 8:+73098683 MsG0880046411.01.T01:CDS
CCTCGGTTCTGCCCGGGGTT+TGG 0.304578 8:+73098580 MsG0880046411.01.T01:CDS
ACTTGAAGGCTGTGCTAATT+GGG 0.304691 8:+73097862 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATTGGGGCAGTGGCAACTTT+GGG 0.322517 8:+73097879 MsG0880046411.01.T01:CDS
GAGCATCAAGCACATAAATT+TGG 0.327527 8:+73098326 MsG0880046411.01.T01:CDS
ACTGTGGTTGCTGGCACATT+TGG 0.333279 8:+73098746 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATAGTAGGGTCAGGTGGATT+TGG 0.339856 8:+73098192 MsG0880046411.01.T01:CDS
CTGAACGACAACCCTTGAAT+TGG 0.345190 8:+73098537 MsG0880046411.01.T01:CDS
AATTGGGGCAGTGGCAACTT+TGG 0.348180 8:+73097878 MsG0880046411.01.T01:CDS
CTATTACTCGAACTTGTAAC+CGG 0.362109 8:+73098965 MsG0880046411.01.T01:CDS
TCATAACCCTTTCATTACTC+TGG 0.384802 8:+73097913 MsG0880046411.01.T01:CDS
TAAGTGCATTGCATATGAAT+AGG 0.388408 8:+73097583 None:intergenic
ACTGCAGGCTTCCTTCTTCA+AGG 0.388747 8:+73098364 MsG0880046411.01.T01:CDS
GAATCAAGTATTGCAGTTAC+TGG 0.398638 8:+73099276 MsG0880046411.01.T01:CDS
AGGTTTAAATGTTGTTGGTT+GGG 0.405590 8:+73099021 MsG0880046411.01.T01:CDS
CCCATTCGGATCACTCATAA+TGG 0.411005 8:+73099341 MsG0880046411.01.T01:CDS
TTCACAATCACATTACTTGA+AGG 0.414937 8:+73097848 MsG0880046411.01.T01:CDS
GATCAGATCCTTCGCGGCTT+CGG 0.418635 8:-73098272 None:intergenic
CATGTTACCACTGTGGTTGC+TGG 0.422327 8:+73098737 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATCTGAAATCATTGAAAAGC+TGG 0.435062 8:+73098149 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATCTATGATTATTTGGCCTT+AGG 0.436191 8:+73098393 MsG0880046411.01.T01:CDS
TAGTCGATCGTTCCAATTCA+AGG 0.436489 8:-73098549 None:intergenic
CAAAGAAGGAAAGAGCTGTT+AGG 0.445103 8:+73097949 MsG0880046411.01.T01:CDS
GAGGTTTAAATGTTGTTGGT+TGG 0.446604 8:+73099020 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATGATTTCAGATGACGTGTA+TGG 0.446755 8:-73098138 None:intergenic
CTTGACGAAGAGGATATAGT+AGG 0.460281 8:+73098177 MsG0880046411.01.T01:CDS
AAGAGAGGTTTAAATGTTGT+TGG 0.461128 8:+73099016 MsG0880046411.01.T01:CDS
GATCTGATCAAGTGTTTGAA+AGG 0.465121 8:+73098286 MsG0880046411.01.T01:CDS
CATAACCCTTTCATTACTCT+GGG 0.466495 8:+73097914 MsG0880046411.01.T01:CDS
GGTTCGTTCGTCGTCAAAGA+AGG 0.467481 8:+73097935 MsG0880046411.01.T01:CDS
AAACCTCTCTTTACAAAGGA+AGG 0.468653 8:-73099004 None:intergenic
AAGTCAGATGTATATAGCTT+TGG 0.479769 8:+73098938 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATTGGCAATTTAGATCTTTG+TGG 0.481979 8:+73097609 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATTGTTGAAAGAAAACAGAT+TGG 0.483210 8:+73099144 MsG0880046411.01.T01:CDS
GATAACCCTCGGTTCTGCCC+GGG 0.490571 8:+73098574 MsG0880046411.01.T01:CDS
TCGAACTTGTAACCGGGAAA+AGG 0.492470 8:+73098972 MsG0880046411.01.T01:CDS
AGATAACCCTCGGTTCTGCC+CGG 0.492825 8:+73098573 MsG0880046411.01.T01:CDS
CACAATCATTCATCACCATT+CGG 0.497905 8:-73098224 None:intergenic
AGGCCAAATAATCATAGATA+AGG 0.498266 8:-73098389 None:intergenic
ACACTTGATCAGATCCTTCG+CGG 0.506987 8:-73098278 None:intergenic
ATCTGATCAAGTGTTTGAAA+GGG 0.515555 8:+73098287 MsG0880046411.01.T01:CDS
GCTAAACTTATTACCTTCCA+TGG 0.516224 8:+73098108 MsG0880046411.01.T01:CDS
ACATTTGGCTATTTGGCACC+AGG 0.520985 8:+73098761 MsG0880046411.01.T01:CDS
GAAGAGGATATAGTAGGGTC+AGG 0.523294 8:+73098183 MsG0880046411.01.T01:CDS
TCGATCATCTGCATTTGAAT+CGG 0.525425 8:-73099245 None:intergenic
CCATTATGAGTGATCCGAAT+GGG 0.526633 8:-73099341 None:intergenic
GATCCTTCCTTTGTAAAGAG+AGG 0.530253 8:+73099001 MsG0880046411.01.T01:CDS
AGTCGATCGTTCCAATTCAA+GGG 0.538034 8:-73098548 None:intergenic
ACATCGCTCTTACTTGCTGA+TGG 0.538129 8:-73098002 None:intergenic
CATCCTTCTTAATGAAAACA+TGG 0.539230 8:+73098661 MsG0880046411.01.T01:CDS
TCAGCATGTGGTATCACCAC+AGG 0.542284 8:-73097672 None:intergenic
GCAATTTAGATCTTTGTGGA+AGG 0.555937 8:+73097613 MsG0880046411.01.T01:CDS
GGCTGTGCTAATTGGGGCAG+TGG 0.557741 8:+73097869 MsG0880046411.01.T01:CDS
CCAAACCCCGGGCAGAACCG+AGG 0.561138 8:-73098580 None:intergenic
CGAATTGACCGAAGCCGCGA+AGG 0.562875 8:+73098264 MsG0880046411.01.T01:CDS
TAGATAAGGAGCCTTGAAGA+AGG 0.563540 8:-73098375 None:intergenic
TAAACCTACGCGGTTACTGC+AGG 0.566200 8:+73098349 MsG0880046411.01.T01:CDS
CTTGAAGGCTGTGCTAATTG+GGG 0.572918 8:+73097863 MsG0880046411.01.T01:CDS
GAGATCATCTAAGCTTCCTA+AGG 0.576356 8:-73098409 None:intergenic
AAGCCATGTCGAACATCACT+CGG 0.578517 8:+73097645 MsG0880046411.01.T01:CDS
GCTTCATCACTTTCAGCATG+TGG 0.581611 8:-73097684 None:intergenic
ACGAACCCAGAGTAATGAAA+GGG 0.582895 8:-73097919 None:intergenic
ATAACCCTCGGTTCTGCCCG+GGG 0.584948 8:+73098575 MsG0880046411.01.T01:CDS
CAACCAGAGTATCTACAAAG+TGG 0.588834 8:+73098902 MsG0880046411.01.T01:intron
GAGGATATAGTAGGGTCAGG+TGG 0.595731 8:+73098186 MsG0880046411.01.T01:CDS
TTGACGAAGAGGATATAGTA+GGG 0.597584 8:+73098178 MsG0880046411.01.T01:CDS
TGGGACTCGTAAAATTCACT+TGG 0.599771 8:-73099322 None:intergenic
AACGAACCCAGAGTAATGAA+AGG 0.600217 8:-73097920 None:intergenic
ATTTAAACCTCTCTTTACAA+AGG 0.600475 8:-73099008 None:intergenic
TTTACAAAGGAAGGATCTGT+AGG 0.602463 8:-73098995 None:intergenic
AACCAGAGTATCTACAAAGT+GGG 0.605358 8:+73098903 MsG0880046411.01.T01:intron
GCTGGAGTCTCTTGACGAAG+AGG 0.609050 8:+73098167 MsG0880046411.01.T01:CDS
CAAACCCCGGGCAGAACCGA+GGG 0.613022 8:-73098579 None:intergenic
AGCTTAGATGATCTCTTGCA+CGG 0.613535 8:+73098417 MsG0880046411.01.T01:CDS
GTATGGCATATCGCCATGGA+AGG 0.614158 8:-73098121 None:intergenic
GGTGTAAGTATGCCAAACCC+CGG 0.614469 8:-73098592 None:intergenic
TGCAATACTTGATTCATCGA+AGG 0.614974 8:-73099268 None:intergenic
GTGTAAGTATGCCAAACCCC+GGG 0.615868 8:-73098591 None:intergenic
ATTGCAGTTACTGGAGCAAG+AGG 0.622828 8:+73099285 MsG0880046411.01.T01:CDS
CAGCATGTGGTATCACCACA+GGG 0.635674 8:-73097671 None:intergenic
TATTACTCGAACTTGTAACC+GGG 0.637780 8:+73098966 MsG0880046411.01.T01:CDS
ATTTGGTACTGTTTACCGAA+TGG 0.637838 8:+73098209 MsG0880046411.01.T01:CDS
ACGTGTATGGCATATCGCCA+TGG 0.638358 8:-73098125 None:intergenic
GCCATTATGAGTGATCCGAA+TGG 0.643121 8:-73099342 None:intergenic
GAAGCCTGCAGTAACCGCGT+AGG 0.655383 8:-73098353 None:intergenic
GATCGACTAAAGATAACCCT+CGG 0.658603 8:+73098563 MsG0880046411.01.T01:CDS
AAAGGGTTATGATAAGTGCA+AGG 0.658970 8:-73097902 None:intergenic
AATCCGAGTGATGTTCGACA+TGG 0.675635 8:-73097648 None:intergenic
CGAATGGTGATGAATGATTG+TGG 0.678474 8:+73098225 MsG0880046411.01.T01:CDS
AACATCACTCGGATTCCCTG+TGG 0.682041 8:+73097656 MsG0880046411.01.T01:CDS
AGACCAAAATCAGAGATGTG+AGG 0.691186 8:-73098686 None:intergenic
TCGTAAAATTCACTTGGACA+AGG 0.697952 8:-73099316 None:intergenic
ATATACATCTGACTTCTCAG+TGG 0.723271 8:-73098930 None:intergenic
ATAAATTTGGTAAACCTACG+CGG 0.725075 8:+73098339 MsG0880046411.01.T01:CDS
AAATGTGCCAGCAACCACAG+TGG 0.758445 8:-73098744 None:intergenic
AGATGCACATGTTACCACTG+TGG 0.842082 8:+73098730 MsG0880046411.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGGAAAATATGATTAATTTA+AGG - Chr8:73098508-73098527 None:intergenic 15.0%
!! GGAAAATATGATTAATTTAA+GGG - Chr8:73098507-73098526 None:intergenic 15.0%
!!! TAAATAATGTACTTAAGTTT+TGG + Chr8:73099097-73099116 MsG0880046411.01.T01:intron 15.0%
!! AAAATTTCACAATGTTACTA+AGG - Chr8:73099074-73099093 None:intergenic 20.0%
!! AAGAAAATGTAATCTAAACA+TGG - Chr8:73097783-73097802 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTACAAAGATCATTGTTT+TGG + Chr8:73098797-73098816 MsG0880046411.01.T01:intron 20.0%
! AAGTCATGTAAGATAGTATT+TGG - Chr8:73097740-73097759 None:intergenic 25.0%
! ATTGTTGAAAGAAAACAGAT+TGG + Chr8:73099144-73099163 MsG0880046411.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTAAACCTCTCTTTACAA+AGG - Chr8:73099011-73099030 None:intergenic 25.0%
! TAAATTAACGAATACATACC+TGG - Chr8:73098782-73098801 None:intergenic 25.0%
!! TGAAACTCTTGAAGTAATTT+TGG + Chr8:73099204-73099223 MsG0880046411.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTGTGAAGATTTTTTTGGA+GGG - Chr8:73097836-73097855 None:intergenic 25.0%
!!! TGTGATTGTGAAGATTTTTT+TGG - Chr8:73097840-73097859 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTCTTCTGCTGTTAAT+GGG - Chr8:73098045-73098064 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTTCTTCTGCTGTTAA+TGG - Chr8:73098046-73098065 None:intergenic 25.0%
AAGAGAGGTTTAAATGTTGT+TGG + Chr8:73099016-73099035 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
AAGTCAGATGTATATAGCTT+TGG + Chr8:73098938-73098957 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
AGGCCAAATAATCATAGATA+AGG - Chr8:73098392-73098411 None:intergenic 30.0%
AGTATTTGGAAATCAATCCA+AGG - Chr8:73097726-73097745 None:intergenic 30.0%
ATAAATTTGGTAAACCTACG+CGG + Chr8:73098339-73098358 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
ATCTGATCAAGTGTTTGAAA+GGG + Chr8:73098287-73098306 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
ATTGGCAATTTAGATCTTTG+TGG + Chr8:73097609-73097628 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
CATCCTTCTTAATGAAAACA+TGG + Chr8:73098661-73098680 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
GCTCCTTATCTATGATTATT+TGG + Chr8:73098386-73098405 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
TTCACAATCACATTACTTGA+AGG + Chr8:73097848-73097867 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
! AGGTTTAAATGTTGTTGGTT+GGG + Chr8:73099021-73099040 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTATGATTATTTGGCCTT+AGG + Chr8:73098393-73098412 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTGAAATCATTGAAAAGC+TGG + Chr8:73098149-73098168 MsG0880046411.01.T01:CDS 30.0%
!!! GATTGTGAAGATTTTTTTGG+AGG - Chr8:73097837-73097856 None:intergenic 30.0%
AAACCTCTCTTTACAAAGGA+AGG - Chr8:73099007-73099026 None:intergenic 35.0%
AAAGGGTTATGATAAGTGCA+AGG - Chr8:73097905-73097924 None:intergenic 35.0%
ATATACATCTGACTTCTCAG+TGG - Chr8:73098933-73098952 None:intergenic 35.0%
ATGATTTCAGATGACGTGTA+TGG - Chr8:73098141-73098160 None:intergenic 35.0%
ATTTGGTACTGTTTACCGAA+TGG + Chr8:73098209-73098228 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
CACAATCATTCATCACCATT+CGG - Chr8:73098227-73098246 None:intergenic 35.0%
CATAACCCTTTCATTACTCT+GGG + Chr8:73097914-73097933 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
CTATTACTCGAACTTGTAAC+CGG + Chr8:73098965-73098984 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
GAGCATCAAGCACATAAATT+TGG + Chr8:73098326-73098345 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
GAGGTTTAAATGTTGTTGGT+TGG + Chr8:73099020-73099039 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
GATCTGATCAAGTGTTTGAA+AGG + Chr8:73098286-73098305 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
GCAATTTAGATCTTTGTGGA+AGG + Chr8:73097613-73097632 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
GCTAAACTTATTACCTTCCA+TGG + Chr8:73098108-73098127 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
TATTACTCGAACTTGTAACC+GGG + Chr8:73098966-73098985 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
TCATAACCCTTTCATTACTC+TGG + Chr8:73097913-73097932 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
TCGATCATCTGCATTTGAAT+CGG - Chr8:73099248-73099267 None:intergenic 35.0%
TCGTAAAATTCACTTGGACA+AGG - Chr8:73099319-73099338 None:intergenic 35.0%
TGCAATACTTGATTCATCGA+AGG - Chr8:73099271-73099290 None:intergenic 35.0%
TTAGCACCTGTTAAAAGACA+AGG - Chr8:73098093-73098112 None:intergenic 35.0%
TTGACGAAGAGGATATAGTA+GGG + Chr8:73098178-73098197 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
TTTACAAAGGAAGGATCTGT+AGG - Chr8:73098998-73099017 None:intergenic 35.0%
! AAAGGGAACTAGAGATTTTG+GGG + Chr8:73098304-73098323 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
! AACCAGAGTATCTACAAAGT+GGG + Chr8:73098903-73098922 MsG0880046411.01.T01:intron 35.0%
! GAAAGGGAACTAGAGATTTT+GGG + Chr8:73098303-73098322 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
! GAATCAAGTATTGCAGTTAC+TGG + Chr8:73099276-73099295 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
! GCTCCATGTTTTCATTAAGA+AGG - Chr8:73098667-73098686 None:intergenic 35.0%
! TGAAAGGGAACTAGAGATTT+TGG + Chr8:73098302-73098321 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
! TGAATTTTACGAGTCCCATT+CGG + Chr8:73099327-73099346 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
! TGCTAACCTTGTCTTTTAAC+AGG + Chr8:73098084-73098103 MsG0880046411.01.T01:intron 35.0%
! TTGTCGTTCAGTATTTTCTG+AGG - Chr8:73098528-73098547 None:intergenic 35.0%
!!! TGAAGTAATTTTGGAGCTAG+CGG + Chr8:73099213-73099232 MsG0880046411.01.T01:CDS 35.0%
AACGAACCCAGAGTAATGAA+AGG - Chr8:73097923-73097942 None:intergenic 40.0%
ACGAACCCAGAGTAATGAAA+GGG - Chr8:73097922-73097941 None:intergenic 40.0%
ACTTGAAGGCTGTGCTAATT+GGG + Chr8:73097862-73097881 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
AGACCAAAATCAGAGATGTG+AGG - Chr8:73098689-73098708 None:intergenic 40.0%
AGCTTAGATGATCTCTTGCA+CGG + Chr8:73098417-73098436 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
AGTCGATCGTTCCAATTCAA+GGG - Chr8:73098551-73098570 None:intergenic 40.0%
CAAAGAAGGAAAGAGCTGTT+AGG + Chr8:73097949-73097968 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
CTTGACGAAGAGGATATAGT+AGG + Chr8:73098177-73098196 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
GAGATCATCTAAGCTTCCTA+AGG - Chr8:73098412-73098431 None:intergenic 40.0%
GATCCTTCCTTTGTAAAGAG+AGG + Chr8:73099001-73099020 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
GATCGACTAAAGATAACCCT+CGG + Chr8:73098563-73098582 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
TACTTGAAGGCTGTGCTAAT+TGG + Chr8:73097861-73097880 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
TAGATAAGGAGCCTTGAAGA+AGG - Chr8:73098378-73098397 None:intergenic 40.0%
TAGTCGATCGTTCCAATTCA+AGG - Chr8:73098552-73098571 None:intergenic 40.0%
TGGGACTCGTAAAATTCACT+TGG - Chr8:73099325-73099344 None:intergenic 40.0%
! ATGTCACGATGCACGATTTT+TGG - Chr8:73098629-73098648 None:intergenic 40.0%
! CAACCAGAGTATCTACAAAG+TGG + Chr8:73098902-73098921 MsG0880046411.01.T01:intron 40.0%
! CGAATGGTGATGAATGATTG+TGG + Chr8:73098225-73098244 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
! TGTCACGATGCACGATTTTT+GGG - Chr8:73098628-73098647 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTGGTCTTGCAAAGCTCT+TGG + Chr8:73098700-73098719 MsG0880046411.01.T01:CDS 40.0%
AAGCCATGTCGAACATCACT+CGG + Chr8:73097645-73097664 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
AATCCGAGTGATGTTCGACA+TGG - Chr8:73097651-73097670 None:intergenic 45.0%
ACACTTGATCAGATCCTTCG+CGG - Chr8:73098281-73098300 None:intergenic 45.0%
ACATTTGGCTATTTGGCACC+AGG + Chr8:73098761-73098780 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
AGATGCACATGTTACCACTG+TGG + Chr8:73098730-73098749 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCAGTTACTGGAGCAAG+AGG + Chr8:73099285-73099304 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
CAACCATCTAAGCTGCCTAA+GGG - Chr8:73098479-73098498 None:intergenic 45.0%
CTCCCACTTTGTAGATACTC+TGG - Chr8:73098908-73098927 None:intergenic 45.0%
CTGAACGACAACCCTTGAAT+TGG + Chr8:73098537-73098556 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAAGGCTGTGCTAATTG+GGG + Chr8:73097863-73097882 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGGATATAGTAGGGTC+AGG + Chr8:73098183-73098202 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
GCACTAAACTATGTGCCCTT+AGG + Chr8:73098461-73098480 MsG0880046411.01.T01:intron 45.0%
GCTTCATCACTTTCAGCATG+TGG - Chr8:73097687-73097706 None:intergenic 45.0%
TCAACCATCTAAGCTGCCTA+AGG - Chr8:73098480-73098499 None:intergenic 45.0%
TCGAACTTGTAACCGGGAAA+AGG + Chr8:73098972-73098991 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGGCACATTTGGCTATT+TGG + Chr8:73098754-73098773 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
! ACATCGCTCTTACTTGCTGA+TGG - Chr8:73098005-73098024 None:intergenic 45.0%
! ATAGTAGGGTCAGGTGGATT+TGG + Chr8:73098192-73098211 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
! GAGCCTCACATCTCTGATTT+TGG + Chr8:73098683-73098702 MsG0880046411.01.T01:CDS 45.0%
! GTCACGATGCACGATTTTTG+GGG - Chr8:73098627-73098646 None:intergenic 45.0%
!!! CGATTTTTGGGGAGCATTCA+TGG - Chr8:73098616-73098635 None:intergenic 45.0%
AAATGTGCCAGCAACCACAG+TGG - Chr8:73098747-73098766 None:intergenic 50.0%
AACATCACTCGGATTCCCTG+TGG + Chr8:73097656-73097675 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
AATTGGGGCAGTGGCAACTT+TGG + Chr8:73097878-73097897 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
ACGTGTATGGCATATCGCCA+TGG - Chr8:73098128-73098147 None:intergenic 50.0%
ACTGCAGGCTTCCTTCTTCA+AGG + Chr8:73098364-73098383 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
ACTGTGGTTGCTGGCACATT+TGG + Chr8:73098746-73098765 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
ATTGGGGCAGTGGCAACTTT+GGG + Chr8:73097879-73097898 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
CAGCATGTGGTATCACCACA+GGG - Chr8:73097674-73097693 None:intergenic 50.0%
CATGTTACCACTGTGGTTGC+TGG + Chr8:73098737-73098756 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
CTGCAGGCAAGTCAAATCCT+TGG + Chr8:73097706-73097725 MsG0880046411.01.T01:intron 50.0%
GAGGATATAGTAGGGTCAGG+TGG + Chr8:73098186-73098205 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
GCTGAAAGTGATGAAGCTGC+AGG + Chr8:73097690-73097709 MsG0880046411.01.T01:intron 50.0%
GGTGTAAGTATGCCAAACCC+CGG - Chr8:73098595-73098614 None:intergenic 50.0%
GGTTCGTTCGTCGTCAAAGA+AGG + Chr8:73097935-73097954 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
GTATGGCATATCGCCATGGA+AGG - Chr8:73098124-73098143 None:intergenic 50.0%
GTGTAAGTATGCCAAACCCC+GGG - Chr8:73098594-73098613 None:intergenic 50.0%
TAAACCTACGCGGTTACTGC+AGG + Chr8:73098349-73098368 MsG0880046411.01.T01:CDS 50.0%
TCAGCATGTGGTATCACCAC+AGG - Chr8:73097675-73097694 None:intergenic 50.0%
! AGGATCTGTAGGCCTTTTCC+CGG - Chr8:73098987-73099006 None:intergenic 50.0%
AGATAACCCTCGGTTCTGCC+CGG + Chr8:73098573-73098592 MsG0880046411.01.T01:CDS 55.0%
GATCAGATCCTTCGCGGCTT+CGG - Chr8:73098275-73098294 None:intergenic 55.0%
GCTGGAGTCTCTTGACGAAG+AGG + Chr8:73098167-73098186 MsG0880046411.01.T01:CDS 55.0%
GTGCCCTTAGGCAGCTTAGA+TGG + Chr8:73098473-73098492 MsG0880046411.01.T01:intron 55.0%
ATAACCCTCGGTTCTGCCCG+GGG + Chr8:73098575-73098594 MsG0880046411.01.T01:CDS 60.0%
CGAATTGACCGAAGCCGCGA+AGG + Chr8:73098264-73098283 MsG0880046411.01.T01:CDS 60.0%
GAAGCCTGCAGTAACCGCGT+AGG - Chr8:73098356-73098375 None:intergenic 60.0%
GATAACCCTCGGTTCTGCCC+GGG + Chr8:73098574-73098593 MsG0880046411.01.T01:CDS 60.0%
GGCTGTGCTAATTGGGGCAG+TGG + Chr8:73097869-73097888 MsG0880046411.01.T01:CDS 60.0%
CAAACCCCGGGCAGAACCGA+GGG - Chr8:73098582-73098601 None:intergenic 65.0%
CCAAACCCCGGGCAGAACCG+AGG - Chr8:73098583-73098602 None:intergenic 70.0%
CCTCGGTTCTGCCCGGGGTT+TGG + Chr8:73098580-73098599 MsG0880046411.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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