AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280007408.01

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MsG0280007408.01.T01 AT3G59350 45.373 335 169 6 342 667 94 423 9.32e-82 265
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MsG0280007408.01.T01 AT1G34110 31.034 609 351 13 83 652 474 1052 1.61e-69 246
MsG0280007408.01.T01 AT1G34110 36.301 146 89 2 110 251 453 598 6.51e-12 69.7
MsG0280007408.01.T01 AT1G34110 31.250 192 104 3 85 248 308 499 4.46e-11 67.0
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MsG0280007408.01.T01 AT4G32000 43.686 293 160 3 361 653 117 404 3.33e-69 232
MsG0280007408.01.T01 AT1G23540 44.257 296 151 5 360 649 357 644 3.53e-69 240
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MsG0280007408.01.T01 AT5G18500 43.750 288 158 3 362 649 154 437 4.20e-69 234
MsG0280007408.01.T01 AT5G18500 43.750 288 158 3 362 649 154 437 4.20e-69 234
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MsG0280007408.01.T01 AT5G18500 43.750 288 158 3 362 649 154 437 4.20e-69 234
MsG0280007408.01.T01 AT3G28690 41.638 293 156 3 367 649 68 355 4.97e-69 232
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MsG0280007408.01.T01 AT1G68690 36.944 360 210 7 298 652 305 652 1.69e-68 238
MsG0280007408.01.T01 AT3G20530 46.502 243 126 3 354 594 62 302 2.76e-68 226
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MsG0280007408.01.T01 AT2G42960 43.945 289 156 5 362 649 171 454 2.44e-67 229
MsG0280007408.01.T01 AT2G42960 43.945 289 156 5 362 649 171 454 2.44e-67 229
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MsG0280007408.01.T01 AT2G01820 28.093 687 391 19 84 674 209 888 4.32e-67 238
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MsG0280007408.01.T01 AT5G65700 27.753 227 119 6 62 251 47 265 2.47e-12 70.9
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MsG0280007408.01.T01 AT3G24240 29.384 211 133 4 66 265 207 412 7.54e-11 66.2
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MsG0280007408.01.T01 AT1G73080 35.862 145 89 2 105 245 191 335 3.28e-12 70.5
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MsG0280007408.01.T01 AT1G61590 38.333 300 173 4 362 654 87 381 4.06e-65 221
MsG0280007408.01.T01 AT5G56790 41.522 289 162 5 362 649 378 660 5.06e-65 228
MsG0280007408.01.T01 AT5G03320 39.542 306 171 5 362 657 69 370 9.46e-65 220
MsG0280007408.01.T01 AT5G03320 39.542 306 171 5 362 657 69 370 9.46e-65 220
MsG0280007408.01.T01 AT3G56370 30.448 647 411 16 30 654 323 952 1.04e-64 231
MsG0280007408.01.T01 AT3G56370 31.330 233 146 8 27 247 7 237 1.17e-14 78.6
MsG0280007408.01.T01 AT3G56370 33.333 192 96 4 90 252 123 311 1.21e-13 75.1
MsG0280007408.01.T01 AT3G56370 29.630 216 127 6 32 242 157 352 7.58e-13 72.8
MsG0280007408.01.T01 AT3G55450 39.875 321 175 6 352 660 39 353 1.06e-64 219
MsG0280007408.01.T01 AT2G47060 48.333 240 118 2 424 658 2 240 1.37e-64 214
MsG0280007408.01.T01 AT5G02290 38.700 323 176 6 343 652 40 353 1.51e-64 219
MsG0280007408.01.T01 AT5G02290 38.700 323 176 6 343 652 40 353 1.51e-64 219
MsG0280007408.01.T01 AT2G45340 28.832 659 386 18 62 652 44 687 1.68e-64 226
MsG0280007408.01.T01 AT1G01540 39.583 288 170 3 362 649 142 425 1.81e-64 221
MsG0280007408.01.T01 AT3G09830 38.562 306 174 4 362 657 72 373 1.81e-64 219
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MsG0280007408.01.T01 AT3G09830 38.562 306 174 4 362 657 72 373 1.81e-64 219
MsG0280007408.01.T01 AT1G48210 45.267 243 125 2 356 593 50 289 2.20e-64 216
MsG0280007408.01.T01 AT1G48210 45.267 243 125 2 356 593 50 289 2.20e-64 216
MsG0280007408.01.T01 AT1G48210 45.267 243 125 2 356 593 50 289 2.20e-64 216
MsG0280007408.01.T01 AT4G01330 39.931 288 169 3 362 649 150 433 2.63e-64 220
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MsG0280007408.01.T01 AT1G31420 30.339 590 337 15 65 649 54 574 8.56e-64 222
MsG0280007408.01.T01 AT1G31420 30.339 590 336 15 65 649 54 573 9.88e-64 222
MsG0280007408.01.T01 AT2G47060 47.325 243 122 2 421 658 18 259 1.08e-63 213
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MsG0280007408.01.T01 AT2G28250 39.677 310 174 6 362 661 198 504 1.08e-63 221
MsG0280007408.01.T01 AT2G28250 39.677 310 174 6 362 661 198 504 1.08e-63 221
MsG0280007408.01.T01 AT2G28250 39.677 310 174 6 362 661 198 504 1.08e-63 221
MsG0280007408.01.T01 AT2G28250 39.677 310 174 6 362 661 198 504 1.08e-63 221
MsG0280007408.01.T01 AT5G38560 39.414 307 173 5 347 649 317 614 1.51e-63 224
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MsG0280007408.01.T01 AT5G10290 31.200 500 329 8 155 649 75 564 1.86e-63 222
MsG0280007408.01.T01 AT3G62220 47.863 234 116 2 421 649 20 252 3.07e-63 211
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MsG0280007408.01.T01 AT1G55610 32.364 275 128 14 8 242 12 268 3.98e-16 83.2
MsG0280007408.01.T01 AT4G28650 30.070 572 360 13 90 649 433 976 5.66e-63 227
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MsG0280007408.01.T01 AT2G28930 36.716 335 183 5 361 672 67 395 7.20e-63 215
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MsG0280007408.01.T01 AT2G07180 36.119 335 179 6 326 652 63 370 7.55e-63 216
MsG0280007408.01.T01 AT5G11020 38.924 316 176 5 339 653 54 353 7.75e-63 214
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MsG0280007408.01.T01 AT3G13690 39.672 305 174 6 349 649 383 681 2.76e-62 221
MsG0280007408.01.T01 AT3G13690 39.672 305 174 6 349 649 383 681 2.76e-62 221
MsG0280007408.01.T01 AT3G18810 42.088 297 161 6 357 649 320 609 3.20e-62 220
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MsG0280007408.01.T01 AT2G18470 40.741 297 159 7 360 649 270 556 1.38e-61 217
MsG0280007408.01.T01 AT2G20850 42.384 302 155 7 243 537 353 642 1.60e-61 218
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MsG0280007408.01.T01 AT1G55200 39.016 305 176 6 349 649 351 649 2.14e-61 218
MsG0280007408.01.T01 AT1G55200 39.016 305 176 6 349 649 351 649 2.14e-61 218
MsG0280007408.01.T01 AT1G24030 44.304 237 125 4 359 591 47 280 2.74e-61 207
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MsG0280007408.01.T01 AT1G72540 38.225 293 173 3 362 649 72 361 4.76e-61 211
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MsG0280007408.01.T01 AT1G74360 29.887 532 304 15 184 658 575 1094 7.13e-61 221
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MsG0280007408.01.T01 AT4G35600 34.921 315 188 5 362 666 75 382 9.23e-61 209
MsG0280007408.01.T01 AT3G02130 32.192 584 364 15 82 652 582 1146 9.25e-61 221
MsG0280007408.01.T01 AT1G28440 28.904 602 337 18 105 649 392 959 1.17e-60 220
MsG0280007408.01.T01 AT1G28440 28.980 245 117 7 62 251 37 279 1.12e-13 75.5
MsG0280007408.01.T01 AT1G28440 36.025 161 100 2 85 242 253 413 1.19e-12 72.0
MsG0280007408.01.T01 AT1G28440 34.965 143 87 3 111 248 350 491 5.17e-11 66.6
MsG0280007408.01.T01 AT3G02130 32.192 584 364 15 82 652 565 1129 1.32e-60 220
MsG0280007408.01.T01 AT1G48480 29.421 639 350 19 65 652 54 642 1.55e-60 215
MsG0280007408.01.T01 AT2G26330 29.982 567 356 14 89 649 383 914 2.20e-60 219
MsG0280007408.01.T01 AT2G26330 33.333 183 112 4 77 251 58 238 5.71e-17 85.9
MsG0280007408.01.T01 AT2G26330 35.329 167 101 4 105 265 160 325 1.19e-15 81.6
MsG0280007408.01.T01 AT2G26330 30.058 173 118 2 82 251 209 381 3.61e-13 73.6
MsG0280007408.01.T01 AT1G21590 36.364 319 196 3 352 667 347 661 2.35e-60 216
MsG0280007408.01.T01 AT1G21590 36.364 319 196 3 352 667 387 701 3.00e-60 216
MsG0280007408.01.T01 AT2G39660 38.742 302 172 3 361 652 54 352 3.53e-60 207
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MsG0280007408.01.T01 AT1G17750 30.456 614 365 15 83 652 481 1076 6.33e-60 218
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MsG0280007408.01.T01 AT1G07570 36.615 325 190 5 335 649 32 350 1.76e-59 206
MsG0280007408.01.T01 AT1G07570 36.615 325 190 5 335 649 32 350 1.76e-59 206
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MsG0280007408.01.T01 AT5G58300 30.065 612 365 17 76 667 76 644 3.18e-58 208
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MsG0280007408.01.T01 AT5G58300 30.065 612 365 17 76 667 76 644 3.18e-58 208
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MsG0280007408.01.T01 AT2G35620 30.233 645 340 21 29 649 13 571 2.47e-57 204
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MsG0280007408.01.T01 AT5G54590 34.903 361 209 9 312 664 49 391 4.14e-56 197
MsG0280007408.01.T01 AT5G35960 38.194 288 168 5 362 649 122 399 4.20e-56 197
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MsG0280007408.01.T01 AT2G37050 28.800 500 317 13 184 666 419 896 7.85e-56 205
MsG0280007408.01.T01 AT1G29730 38.235 306 174 7 350 649 615 911 8.63e-56 206
MsG0280007408.01.T01 AT1G29730 28.309 272 154 10 7 252 13 269 7.21e-13 72.8
MsG0280007408.01.T01 AT5G16000 30.814 516 325 10 142 649 92 583 8.69e-56 201
MsG0280007408.01.T01 AT5G16000 33.333 156 98 4 45 196 41 194 5.95e-14 75.9
MsG0280007408.01.T01 AT4G26540 31.034 609 373 20 90 676 483 1066 8.79e-56 206
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MsG0280007408.01.T01 AT1G07650 36.119 335 203 7 351 683 628 953 1.09e-55 205
MsG0280007408.01.T01 AT2G28940 43.373 249 135 4 410 653 25 272 1.18e-55 193
MsG0280007408.01.T01 AT2G42290 29.326 682 390 23 21 652 6 645 1.18e-55 201
MsG0280007408.01.T01 AT1G07650 36.119 335 203 7 351 683 660 985 1.22e-55 205
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MsG0280007408.01.T01 AT4G35030 36.620 284 176 3 367 649 97 377 5.75e-55 194
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MsG0280007408.01.T01 AT4G13190 48.205 195 101 0 455 649 4 198 1.47e-54 187
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MsG0280007408.01.T01 AT1G61420 39.456 294 162 7 362 649 484 767 2.82e-53 197
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MsG0280007408.01.T01 AT4G23130 35.714 294 180 5 359 649 329 616 4.61e-53 194
MsG0280007408.01.T01 AT5G49770 38.636 308 177 6 352 653 610 911 5.06e-53 197
MsG0280007408.01.T01 AT5G49770 32.420 219 113 5 39 247 25 218 2.01e-17 87.4
MsG0280007408.01.T01 AT2G01210 27.645 709 366 24 57 652 37 711 5.41e-53 195
MsG0280007408.01.T01 AT1G56130 39.000 300 176 5 362 661 483 775 5.53e-53 196
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MsG0280007408.01.T01 AT1G56130 29.897 194 102 4 96 255 58 251 4.99e-12 70.1
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MsG0280007408.01.T01 AT4G23270 36.149 296 176 6 359 649 311 598 7.53e-53 193
MsG0280007408.01.T01 AT4G23230 37.102 283 174 3 367 649 330 608 7.67e-53 193
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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ATGTCCATGGCCTCATGGTC+TGG 0.285603 2:-15022313 None:intergenic
GACATTGGAGGTCGAAATTC+GGG 0.294672 2:-15022199 None:intergenic
ACAAATATCTTGAATATGTT+TGG 0.305789 2:-15022466 None:intergenic
AACGAGCAAGCGTCGTTAAA+AGG 0.305833 2:+15022254 MsG0280007408.01.T01:CDS
GAGAGAACAAGGAAATTAAA+AGG 0.307906 2:-15016862 MsG0280007409.01.T01:intron
TAAAAGGTTACCTTCCCATT+TGG 0.316226 2:-15020371 None:intergenic
GGACATTGGAGGTCGAAATT+CGG 0.321418 2:-15022200 None:intergenic
CGTTCTTGTTGGTTTGCCTT+TGG 0.330155 2:+15019391 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGAAGTGAAAAGACAAGAAA+AGG 0.336064 2:-15017085 MsG0280007409.01.T01:intron
CCAAGTGATGAATCTGGTTT+TGG 0.336370 2:+15022280 MsG0280007408.01.T01:CDS
AAAAGGTTACCTTCCCATTT+GGG 0.337601 2:-15020370 None:intergenic
ATTTATGAATATATTGGAAA+TGG 0.340490 2:+15020636 MsG0280007408.01.T01:CDS
ACTCCTGATAATGCAAATTC+AGG 0.353253 2:-15021294 None:intergenic
TGTCCATGGCCTCATGGTCT+GGG 0.358457 2:-15022312 None:intergenic
CCGAACGTTGTTACACTTGC+TGG 0.361154 2:+15020582 MsG0280007408.01.T01:CDS
ACTCAGATGGTCGGTTCATT+TGG 0.363941 2:+15021261 MsG0280007408.01.T01:CDS
CTTGCAAGAAATAACTTAAC+TGG 0.364283 2:+15018644 MsG0280007408.01.T01:CDS
CGCTTGCTCGTTGCACTAAC+CGG 0.365885 2:-15022243 None:intergenic
AAAAGCGATGTTTACAGCTT+TGG 0.367787 2:+15021327 MsG0280007408.01.T01:CDS
CCAACCTGTCGCTCAGTGTT+TGG 0.368396 2:-15021127 None:intergenic
ACATACAGGCTTGTAAGATT+TGG 0.374774 2:-15018508 MsG0280007409.01.T01:intron
GGCTCTCTTAGCGTTCTTGT+TGG 0.376417 2:+15019380 MsG0280007408.01.T01:CDS
TATCATTGCCCTCTGCGTTC+AGG 0.377982 2:+15021653 MsG0280007408.01.T01:CDS
GAGTGAAACCATGGCAGAAA+TGG 0.379667 2:-15018681 MsG0280007409.01.T01:intron
CTCTCTGGTTTAGGACTCCA+TGG 0.384472 2:+15018283 MsG0280007408.01.T01:CDS
GGAGGTCGAAATTCGGGTTC+CGG 0.391671 2:-15022193 None:intergenic
TTGACAAGGCATCTATATCA+TGG 0.404225 2:-15021569 None:intergenic
TTAGGACTCCATGGGACTCT+TGG 0.406293 2:+15018292 MsG0280007408.01.T01:CDS
AAGCGTGACAACGACTTTGC+AGG 0.406749 2:-15021624 None:intergenic
AATAATCCAACTGAACTAAC+TGG 0.407629 2:+15018071 MsG0280007408.01.T01:CDS
TCACACACCATCAAATACTT+TGG 0.415147 2:+15022507 MsG0280007408.01.T01:three_prime_UTR
ATGGTTGATCCTTGTTTGAA+TGG 0.421620 2:+15021594 MsG0280007408.01.T01:CDS
TAAAGCTTTACTGCTATCTT+CGG 0.423051 2:-15020685 None:intergenic
TTCCAACCAGTTAGTTCAGT+TGG 0.435976 2:-15018077 MsG0280007409.01.T01:intron
AAGATATTTGTAATTAGTGT+TGG 0.436083 2:+15022478 MsG0280007408.01.T01:three_prime_UTR
ATTGCAAAGAATAATTTCAA+TGG 0.445399 2:+15019498 MsG0280007408.01.T01:CDS
TACAAGGCTGAATTCCCAAA+TGG 0.445785 2:+15020356 MsG0280007408.01.T01:CDS
GATGACCATCAGAGAACGTC+AGG 0.446630 2:+15019798 MsG0280007408.01.T01:CDS
TTCTCTTGGTCGAGTTTACA+AGG 0.448068 2:+15020340 MsG0280007408.01.T01:CDS
GCATAGCTCTTGGCACAGCC+CGG 0.453258 2:+15020727 MsG0280007408.01.T01:CDS
GCTTGCACCACCTCGGACAT+TGG 0.458371 2:-15022214 None:intergenic
CGCTAAGAGAGCCAGTCAAT+TGG 0.462477 2:-15019370 MsG0280007409.01.T01:intron
AGTAATCCTCACTCCGGGTC+TGG 0.462516 2:+15019735 MsG0280007408.01.T01:CDS
CCAGCAAGTGTAACAACGTT+CGG 0.463226 2:-15020582 None:intergenic
CAGCTTTGGCGTGGTTATGT+TGG 0.464073 2:+15021341 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATTATTGGTGAAGGTTCTCT+TGG 0.466008 2:+15020326 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGAGAGATAGATTCGAAGCT+TGG 0.467533 2:-15016901 MsG0280007409.01.T01:intron
TCCTCAAATGCAAGAGCAAA+GGG 0.469585 2:+15020127 MsG0280007408.01.T01:CDS
GTGATCCATGTGGAGATTCA+TGG 0.470721 2:+15018111 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGATTTGGTGGCAACTGATA+AGG 0.473690 2:-15018493 MsG0280007409.01.T01:intron
TCCGTATTCCATTTCTGCCA+TGG 0.473752 2:+15018673 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGGAGACCAAGTGATGAATC+TGG 0.474992 2:+15022274 MsG0280007408.01.T01:CDS
GACACCAAACACTGAGCGAC+AGG 0.477140 2:+15021123 MsG0280007408.01.T01:CDS
CAGCTAAGCCACAGTCAGAC+AGG 0.477171 2:-15021096 None:intergenic
GATTCCGTCGAAGGAGGTGC+AGG 0.482862 2:-15019681 MsG0280007409.01.T01:intron
GAAGTGAAAAGACAAGAAAA+GGG 0.486246 2:-15017084 MsG0280007409.01.T01:intron
TACAGGCTTGTAAGATTTGG+TGG 0.488566 2:-15018505 MsG0280007409.01.T01:intron
ACAAGGCTGAATTCCCAAAT+GGG 0.488738 2:+15020357 MsG0280007408.01.T01:CDS
CAAATACAAACCAGATATGA+TGG 0.491757 2:+15019639 MsG0280007408.01.T01:intron
CAAGAATTTATTATTGGTGA+AGG 0.494378 2:+15020317 MsG0280007408.01.T01:CDS
CCAAAACCAGATTCATCACT+TGG 0.496487 2:-15022280 None:intergenic
GAGTTTATTCAGATCGTGAC+TGG 0.497011 2:-15016958 MsG0280007409.01.T01:intron
GAAGAAAACAAGAGAGGACA+AGG 0.502311 2:-15016998 MsG0280007409.01.T01:intron
TGTTACAGTTCAAGCTCTTG+AGG 0.502692 2:+15018031 MsG0280007408.01.T01:intron
TGAAGCTATTTGTTGCACTC+TGG 0.502800 2:-15020292 None:intergenic
TAATGAAGAGAGAGAGAACA+AGG 0.504686 2:-15016873 MsG0280007409.01.T01:intron
CAGTTAAGTTATTTCTTGCA+AGG 0.505475 2:-15018643 MsG0280007409.01.T01:intron
AATGCACTCTCTTTGCCAAT+CGG 0.506485 2:+15018820 MsG0280007408.01.T01:CDS
TTATTGATAGATTTAAGCTC+AGG 0.510072 2:-15019531 MsG0280007409.01.T01:intron
CATAGCTCTTGGCACAGCCC+GGG 0.513147 2:+15020728 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATTCATAAATTAGAAGCCTC+TGG 0.517721 2:-15020623 None:intergenic
TTGCAGAAGAACCAATTGAC+TGG 0.518056 2:+15019359 MsG0280007408.01.T01:CDS
AACATACAGAGAAGAGAGAC+TGG 0.523051 2:-15019256 MsG0280007409.01.T01:intron
ACAGCTTTCTGAGTGACATA+AGG 0.523277 2:-15018330 MsG0280007409.01.T01:intron
TATCTTACAGGGTATCAAGA+TGG 0.524840 2:-15018864 MsG0280007409.01.T01:intron
AAAGTGGTGAAGCTATTATT+CGG 0.524991 2:+15022391 MsG0280007408.01.T01:three_prime_UTR
GCTCGTGTACGCATAGCTCT+TGG 0.525147 2:+15020717 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATCCAACTGAACTAACTGGT+TGG 0.529289 2:+15018075 MsG0280007408.01.T01:CDS
TTCATGTGAGAAAGAGGGAG+AGG 0.530723 2:-15017054 MsG0280007409.01.T01:intron
GTCCGAGGTGGTGCAAGCAT+TGG 0.531029 2:+15022219 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATGATACTTACTCTAAGGCC+CGG 0.531154 2:-15020746 None:intergenic
GGTTCATTCATGTGAGAAAG+AGG 0.531444 2:-15017060 MsG0280007409.01.T01:intron
CAGAAAATGTGACGATGGAT+AGG 0.534042 2:+15020195 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGGTGGTGCAAGCATTGGTC+CGG 0.534245 2:+15022224 MsG0280007408.01.T01:CDS
CGCAGCACTGTCTTTACAAG+AGG 0.535013 2:+15020512 MsG0280007408.01.T01:CDS
ACTGATAAGGAATTTGATCA+TGG 0.536554 2:-15018480 MsG0280007409.01.T01:intron
ATGATATGTCCATGGCCTCA+TGG 0.536921 2:-15022318 None:intergenic
ACCATGGCAGAAATGGAATA+CGG 0.537161 2:-15018674 MsG0280007409.01.T01:intron
ATCTTACAGGGTATCAAGAT+GGG 0.539998 2:-15018863 MsG0280007409.01.T01:intron
CTGGTCGGAAGCCACTTGAC+AGG 0.540126 2:+15021373 MsG0280007408.01.T01:CDS
ACAGGTATCTTCAACTCAGA+TGG 0.543216 2:+15021248 MsG0280007408.01.T01:intron
CATGTGGAGATTCATGGAAA+GGG 0.543605 2:+15018117 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATAGCAGTAAAGCTTTACCT+TGG 0.544149 2:+15020691 MsG0280007408.01.T01:CDS
GATAGGATGCCTATGAAAAG+TGG 0.545698 2:+15020212 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGCGTGACAACGACTTTGCA+GGG 0.547419 2:-15021623 None:intergenic
CCATGTGGAGATTCATGGAA+AGG 0.547466 2:+15018116 MsG0280007408.01.T01:CDS
CTCCTCAAATGCAAGAGCAA+AGG 0.547841 2:+15020126 MsG0280007408.01.T01:CDS
GATGGAAGTTCTATCGATGA+TGG 0.549101 2:+15019657 MsG0280007408.01.T01:CDS
TGCACCACCTCGGACATTGG+AGG 0.549443 2:-15022211 None:intergenic
TTATCAGATTCACGAGGTGG+AGG 0.550452 2:-15019711 MsG0280007409.01.T01:intron
CCGAGCAATCACTTGTGAGG+TGG 0.554007 2:+15021532 MsG0280007408.01.T01:CDS
TTTAGTATGTGAACCAGACC+CGG 0.555310 2:-15019748 MsG0280007409.01.T01:intron
AGATCGTGACTGGTTGTACA+AGG 0.555638 2:-15016948 MsG0280007409.01.T01:intron
GACCAATGCTTGCACCACCT+CGG 0.559532 2:-15022221 None:intergenic
CGAGCAATCACTTGTGAGGT+GGG 0.564354 2:+15021533 MsG0280007408.01.T01:CDS
GACCCCAGACCATGAGGCCA+TGG 0.565317 2:+15022309 MsG0280007408.01.T01:CDS
TTGATAGATTTAAGCTCAGG+AGG 0.567397 2:-15019528 MsG0280007409.01.T01:intron
TCAGTGTTAGCAAGAGAAAG+AGG 0.569830 2:-15017174 MsG0280007409.01.T01:intron
TGGCCCTGCACCTCCTTCGA+CGG 0.570223 2:+15019677 MsG0280007408.01.T01:CDS
GATAAAAGTAATCCTCACTC+CGG 0.570263 2:+15019729 MsG0280007408.01.T01:CDS
CTGGACAGTGTAGCAAATGA+AGG 0.572492 2:-15019237 MsG0280007409.01.T01:intron
TGTGTATGATGTGGAAGTGA+TGG 0.574799 2:-15020258 None:intergenic
GTCCATGGCCTCATGGTCTG+GGG 0.575927 2:-15022311 None:intergenic
AGGTTTGAGATCTGTAATAA+CGG 0.576046 2:-15020162 None:intergenic
AAATTTCTATGTACAACAGA+GGG 0.579453 2:-15021031 None:intergenic
GGTGAAGTAGATTCCGTCGA+AGG 0.583506 2:-15019690 MsG0280007409.01.T01:intron
ATAAAAGTAATCCTCACTCC+GGG 0.583661 2:+15019730 MsG0280007408.01.T01:CDS
TTTCACTTCTCAAACTACAA+TGG 0.584538 2:+15017098 MsG0280007408.01.T01:CDS
CATTTAAAATGATATGTCCA+TGG 0.587442 2:-15022326 None:intergenic
TTTCTAATATGTCACGCTTG+CGG 0.589242 2:+15020556 MsG0280007408.01.T01:CDS
GAAGAAGAAGAAAACAAGAG+AGG 0.591356 2:-15017004 MsG0280007409.01.T01:intron
GTGGATCTGTAAAGCAGATG+AGG 0.592527 2:+15020231 MsG0280007408.01.T01:CDS
GCAAGTATCCAAGAGTCCCA+TGG 0.593347 2:-15018300 MsG0280007409.01.T01:intron
CATATAAGTGAGTGAAACCA+TGG 0.594180 2:-15018690 MsG0280007409.01.T01:intron
TGATACTTACTCTAAGGCCC+GGG 0.595127 2:-15020745 None:intergenic
GGCTGAATTCCCAAATGGGA+AGG 0.597470 2:+15020361 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATGGAAAGGGATAACTTGTG+AGG 0.598813 2:+15018130 MsG0280007408.01.T01:CDS
CCACCTCACAAGTGATTGCT+CGG 0.600422 2:-15021532 None:intergenic
AATCCTCACCTGTCTGACTG+TGG 0.601870 2:+15021088 MsG0280007408.01.T01:CDS
GAGAAAGAGGAAAAGCAGCA+AGG 0.601974 2:-15017161 MsG0280007409.01.T01:intron
AAAAGGTCATACCATCAGTA+GGG 0.603662 2:-15017197 MsG0280007409.01.T01:intron
TGGAAAGGGATAACTTGTGA+GGG 0.606980 2:+15018131 MsG0280007408.01.T01:CDS
GTGTATGATGTGGAAGTGAT+GGG 0.609602 2:-15020257 None:intergenic
TCTCTGGTTTAGGACTCCAT+GGG 0.614693 2:+15018284 MsG0280007408.01.T01:CDS
CAATACGCTCACCTGTCAAG+TGG 0.614878 2:-15021384 None:intergenic
GGGTACATGCCATTCAAACA+AGG 0.619111 2:-15021603 None:intergenic
GCTAACACTGACCCTACTGA+TGG 0.620078 2:+15017186 MsG0280007408.01.T01:CDS
TGTGAACCAGACCCGGAGTG+AGG 0.622587 2:-15019741 MsG0280007409.01.T01:intron
CCTTTCCATGAATCTCCACA+TGG 0.623052 2:-15018116 MsG0280007409.01.T01:intron
GAAGTAGATTCCGTCGAAGG+AGG 0.626588 2:-15019687 MsG0280007409.01.T01:intron
ATGCGTACACGAGCATTCCA+AGG 0.627106 2:-15020708 None:intergenic
AGAACTTACAAAGTATCCAA+AGG 0.627413 2:-15019407 MsG0280007409.01.T01:CDS
GAAATTTCTATGTACAACAG+AGG 0.632664 2:-15021032 None:intergenic
CGAAGCAACTGTGTATGATG+TGG 0.640047 2:-15020267 None:intergenic
ATGCAAGAAGAAGAGAAACA+TGG 0.640900 2:-15017026 MsG0280007409.01.T01:intron
TCCTGCAGAAAATGTGACGA+TGG 0.642657 2:+15020190 MsG0280007408.01.T01:CDS
CGATGTTTACAGCTTTGGCG+TGG 0.645503 2:+15021332 MsG0280007408.01.T01:CDS
AAGCCACAGTCAGACAGGTG+AGG 0.647295 2:-15021091 None:intergenic
GTATCTTCAACTCAGATGGT+CGG 0.648881 2:+15021252 MsG0280007408.01.T01:CDS
GTTCATTCATGTGAGAAAGA+GGG 0.649220 2:-15017059 MsG0280007409.01.T01:intron
GCTGGATATTGTGCAGAACA+TGG 0.651866 2:+15020600 MsG0280007408.01.T01:CDS
GACAGTGTAGCAAATGAAGG+TGG 0.652997 2:-15019234 MsG0280007409.01.T01:intron
ATTCCGTCGAAGGAGGTGCA+GGG 0.654103 2:-15019680 MsG0280007409.01.T01:intron
AGCAAATATATTACTCGACG+AGG 0.654119 2:+15021060 MsG0280007408.01.T01:CDS
GAGCCGAGCAATCACTTGTG+AGG 0.662147 2:+15021529 MsG0280007408.01.T01:CDS
GACCATCAGAGAACGTCAGG+GGG 0.668336 2:+15019801 MsG0280007408.01.T01:CDS
GTGAAAAGACAAGAAAAGGG+TGG 0.669973 2:-15017081 MsG0280007409.01.T01:intron
GGTTCACATACTAAAAGACA+TGG 0.673422 2:+15019756 MsG0280007408.01.T01:CDS
CTAACTGGTTGGAAAATTGG+TGG 0.673680 2:+15018086 MsG0280007408.01.T01:CDS
AGTGTGTGTTGTGTTGAGTG+TGG 0.675645 2:-15016827 MsG0280007409.01.T01:intron
ATTTCGACCTCCAATGTCCG+AGG 0.678820 2:+15022204 MsG0280007408.01.T01:CDS
ATGACCATCAGAGAACGTCA+GGG 0.680343 2:+15019799 MsG0280007408.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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ATAAAAGTAATCCTCACTCC+GGG + Chr2:15019730-15019749 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
ATAGCAGTAAAGCTTTACCT+TGG + Chr2:15020691-15020710 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
ATGCAAGAAGAAGAGAAACA+TGG - Chr2:15017029-15017048 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
ATTATTGGTGAAGGTTCTCT+TGG + Chr2:15020326-15020345 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
CACGCTAAATCAAGAAACTT+GGG - Chr2:15020936-15020955 None:intergenic 35.0%
CATATAAGTGAGTGAAACCA+TGG - Chr2:15018693-15018712 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
CCAAAAAGTCAAAGCTTAGA+GGG - Chr2:15019436-15019455 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
CCCTGCATCATTGAATATTA+AGG - Chr2:15019182-15019201 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
CTCTCTGTCTCTTTCTTTAA+TGG + Chr2:15016920-15016939 MsG0280007408.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
CTTGTGCATGTATTGAATCA+CGG - Chr2:15020862-15020881 None:intergenic 35.0%
GAACAAGTAAAGGGTCATAA+TGG - Chr2:15017303-15017322 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
GAACTAACTGGTTGGAAAAT+TGG + Chr2:15018083-15018102 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
GAAGAAGAAGAAAACAAGAG+AGG - Chr2:15017007-15017026 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
GATAAAAGTAATCCTCACTC+CGG + Chr2:15019729-15019748 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
GATAGAACTTCCATCATATC+TGG - Chr2:15019652-15019671 MsG0280007409.01.T01:CDS 35.0%
GCCTTAATATTCAATGATGC+AGG + Chr2:15019178-15019197 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
GCTTAAATTAGGAACCTGTT+TGG - Chr2:15021868-15021887 None:intergenic 35.0%
GCTTGTTTGTGAACAATGTT+TGG + Chr2:15017339-15017358 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
GGTTCACATACTAAAAGACA+TGG + Chr2:15019756-15019775 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
GTGATCATTCTGTGTTTGAT+TGG + Chr2:15017226-15017245 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
GTTCATTCATGTGAGAAAGA+GGG - Chr2:15017062-15017081 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
GTTGATATGATGTGAGAAGA+GGG + Chr2:15017457-15017476 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
TAAAAGGTTACCTTCCCATT+TGG - Chr2:15020374-15020393 None:intergenic 35.0%
TAATGAAGAGAGAGAGAACA+AGG - Chr2:15016876-15016895 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
TAGTAGCTTATTGAGAATGC+AGG + Chr2:15017807-15017826 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
TCAAACAAACAGTATGAAGG+TGG - Chr2:15020413-15020432 None:intergenic 35.0%
TCACACACCATCAAATACTT+TGG + Chr2:15022507-15022526 MsG0280007408.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TCACGCTAAATCAAGAAACT+TGG - Chr2:15020937-15020956 None:intergenic 35.0%
TCTGTATACGCTATAGAGTA+TGG + Chr2:15019063-15019082 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
TCTGTATCCGAAAGCTAAAA+GGG + Chr2:15019887-15019906 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
TGGGTATGATACTTACTCTA+AGG - Chr2:15020754-15020773 None:intergenic 35.0%
TTAAGTCGATATGATGTGAG+AGG + Chr2:15017894-15017913 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
TTAGCAAAAACTTCTCCGAT+TGG - Chr2:15018838-15018857 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
TTCTGTATCCGAAAGCTAAA+AGG + Chr2:15019886-15019905 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
TTGATAGATTTAAGCTCAGG+AGG - Chr2:15019531-15019550 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
TTTCTAATATGTCACGCTTG+CGG + Chr2:15020556-15020575 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
! AATTCACCATTGATGATTCG+AGG - Chr2:15019952-15019971 None:intergenic 35.0%
! ACCCTTTACTTGTTCAAGTT+TGG + Chr2:15017308-15017327 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
! ACTCACATTGTACTGTTTTG+CGG + Chr2:15018957-15018976 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
! ACTCCTGATAATGCAAATTC+AGG - Chr2:15021297-15021316 None:intergenic 35.0%
! ACTTTAGTTTATAGGGTAGG+TGG - Chr2:15022070-15022089 None:intergenic 35.0%
! AGTCATATGCTTTGTTAACC+AGG + Chr2:15020987-15021006 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
! AGTTGATATGATGTGAGAAG+AGG + Chr2:15017456-15017475 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
! ATCTTACAGGGTATCAAGAT+GGG - Chr2:15018866-15018885 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
! ATGGTTGATCCTTGTTTGAA+TGG + Chr2:15021594-15021613 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
! TAGAGTATGGTCTTGGAAAT+TGG + Chr2:15019076-15019095 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
! TATCTTACAGGGTATCAAGA+TGG - Chr2:15018867-15018886 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
! TTGACAAGGCATCTATATCA+TGG - Chr2:15021572-15021591 None:intergenic 35.0%
!! AGGATCAACCATTTTTGACA+AGG - Chr2:15021586-15021605 None:intergenic 35.0%
!! TGTTGGAACTTTTAACTGGT+CGG + Chr2:15021358-15021377 MsG0280007408.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTTGTTAGTGATCTCTC+TGG + Chr2:15018268-15018287 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
!!! GATTGTTTTAGGTTCAGTGT+TGG + Chr2:15019834-15019853 MsG0280007408.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTCCTTCCCTTTTAGCTTT+CGG - Chr2:15019897-15019916 MsG0280007409.01.T01:intron 35.0%
AACATACAGAGAAGAGAGAC+TGG - Chr2:15019259-15019278 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
AATGCACTCTCTTTGCCAAT+CGG + Chr2:15018820-15018839 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
AATGCATAACTTCAGCAGTG+TGG + Chr2:15019602-15019621 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
ACAAGGCTGAATTCCCAAAT+GGG + Chr2:15020357-15020376 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCTTTCTGAGTGACATA+AGG - Chr2:15018333-15018352 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
ACAGGTATCTTCAACTCAGA+TGG + Chr2:15021248-15021267 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
ACCATGGCAGAAATGGAATA+CGG - Chr2:15018677-15018696 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
AGAGAGATAGATTCGAAGCT+TGG - Chr2:15016904-15016923 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
ATCCAACTGAACTAACTGGT+TGG + Chr2:15018075-15018094 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
CAGAAAATGTGACGATGGAT+AGG + Chr2:15020195-15020214 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
CATGTGGAGATTCATGGAAA+GGG + Chr2:15018117-15018136 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
CCAAAACCAGATTCATCACT+TGG - Chr2:15022283-15022302 None:intergenic 40.0%
CGCTAAATCAAGAAACTTGG+GGG - Chr2:15020934-15020953 None:intergenic 40.0%
CTAACTGGTTGGAAAATTGG+TGG + Chr2:15018086-15018105 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
CTGTGATCACTCTGTTTGAT+TGG + Chr2:15017566-15017585 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
GAAGAAAACAAGAGAGGACA+AGG - Chr2:15017001-15017020 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
GAGCGTATTGTAATACACGA+TGG + Chr2:15021397-15021416 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
GAGTTTATTCAGATCGTGAC+TGG - Chr2:15016961-15016980 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
GATAGGATGCCTATGAAAAG+TGG + Chr2:15020212-15020231 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
GATGGAAGTTCTATCGATGA+TGG + Chr2:15019657-15019676 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
GCCAAAAAGTCAAAGCTTAG+AGG - Chr2:15019437-15019456 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
GCTAAATCAAGAAACTTGGG+GGG - Chr2:15020933-15020952 None:intergenic 40.0%
GCTCCTGAATTTGCATTATC+AGG + Chr2:15021291-15021310 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
GGTTCATTCATGTGAGAAAG+AGG - Chr2:15017063-15017082 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
GTATCTTCAACTCAGATGGT+CGG + Chr2:15021252-15021271 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
GTCCGTGTAAAAGGTCATAA+TGG - Chr2:15017643-15017662 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
GTGAAAAGACAAGAAAAGGG+TGG - Chr2:15017084-15017103 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
GTGTATGATGTGGAAGTGAT+GGG - Chr2:15020260-15020279 None:intergenic 40.0%
TAATGTACAAACACGCCCTA+AGG - Chr2:15021754-15021773 None:intergenic 40.0%
TACAAGGCTGAATTCCCAAA+TGG + Chr2:15020356-15020375 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
TACAGGCTTGTAAGATTTGG+TGG - Chr2:15018508-15018527 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
TACATGCACAAGTCTTTCCT+CGG + Chr2:15020870-15020889 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
TACGCTATAGAGTATGGTCT+TGG + Chr2:15019069-15019088 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
TACTGCTATCTTCGGCAAAA+TGG - Chr2:15020680-15020699 None:intergenic 40.0%
TATCCGAAAGCTAAAAGGGA+AGG + Chr2:15019891-15019910 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
TCAGTGTTAGCAAGAGAAAG+AGG - Chr2:15017177-15017196 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
TCCTCAAATGCAAGAGCAAA+GGG + Chr2:15020127-15020146 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
TCGGAGCTTCAACAAAATCA+GGG + Chr2:15020831-15020850 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
TGTGTATGATGTGGAAGTGA+TGG - Chr2:15020261-15020280 None:intergenic 40.0%
TGTTACAGTTCAAGCTCTTG+AGG + Chr2:15018031-15018050 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
TTCCAACCAGTTAGTTCAGT+TGG - Chr2:15018080-15018099 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
TTCGGAGCTTCAACAAAATC+AGG + Chr2:15020830-15020849 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
TTCTCTTGGTCGAGTTTACA+AGG + Chr2:15020340-15020359 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAGAAGAACCAATTGAC+TGG + Chr2:15019359-15019378 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGTATGTGAACCAGACC+CGG - Chr2:15019751-15019770 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
! AAAGTTTTACCTGAACGCAG+AGG - Chr2:15021665-15021684 None:intergenic 40.0%
! AAGGGTGCAAGAACTTCAAA+CGG + Chr2:15019916-15019935 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
! AAGTTTTACCTGAACGCAGA+GGG - Chr2:15021664-15021683 None:intergenic 40.0%
! ATGGAAAGGGATAACTTGTG+AGG + Chr2:15018130-15018149 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTTATCAGATTCACGAGG+TGG - Chr2:15019717-15019736 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
! GCCATTGTAGGGATTGTTTT+AGG + Chr2:15019823-15019842 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
! GTTAGTGATCTCTCTGGTTT+AGG + Chr2:15018274-15018293 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
! TGAAGCTATTTGTTGCACTC+TGG - Chr2:15020295-15020314 None:intergenic 40.0%
! TGAGAAGAGGGTTGAGTTTT+GGG + Chr2:15017469-15017488 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
! TGGAAAGGGATAACTTGTGA+GGG + Chr2:15018131-15018150 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
!! AGATTTGGTGGCAACTGATA+AGG - Chr2:15018496-15018515 MsG0280007409.01.T01:intron 40.0%
!! ATGATACTTACTCTAAGGCC+CGG - Chr2:15020749-15020768 None:intergenic 40.0%
!! CCAAGTGATGAATCTGGTTT+TGG + Chr2:15022280-15022299 MsG0280007408.01.T01:CDS 40.0%
!! CCCTCTAAGCTTTGACTTTT+TGG + Chr2:15019433-15019452 MsG0280007408.01.T01:intron 40.0%
ACCCTTTGCTCTTGCATTTG+AGG - Chr2:15020131-15020150 None:intergenic 45.0%
ACTGGTTGGAAAATTGGTGG+TGG + Chr2:15018089-15018108 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
AGCCAAATTAGATGGGTAGG+TGG - Chr2:15022003-15022022 None:intergenic 45.0%
AGGAGACCAAGTGATGAATC+TGG + Chr2:15022274-15022293 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
AGGGTGCAAGAACTTCAAAC+GGG + Chr2:15019917-15019936 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
AGTGTGTGTTGTGTTGAGTG+TGG - Chr2:15016830-15016849 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
ATGACCATCAGAGAACGTCA+GGG + Chr2:15019799-15019818 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
ATGATATGTCCATGGCCTCA+TGG - Chr2:15022321-15022340 None:intergenic 45.0%
ATGTGCAGTGCAATGCATGA+AGG - Chr2:15021171-15021190 None:intergenic 45.0%
CCAGCAAGTGTAACAACGTT+CGG - Chr2:15020585-15020604 None:intergenic 45.0%
CCATGTGGAGATTCATGGAA+AGG + Chr2:15018116-15018135 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
CCTTTCCATGAATCTCCACA+TGG - Chr2:15018119-15018138 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
CGAAGCAACTGTGTATGATG+TGG - Chr2:15020270-15020289 None:intergenic 45.0%
CTCCTCAAATGCAAGAGCAA+AGG + Chr2:15020126-15020145 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
CTGGACAGTGTAGCAAATGA+AGG - Chr2:15019240-15019259 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
CTTCCTCCTCGAATCATCAA+TGG + Chr2:15019943-15019962 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
GACAGTGTAGCAAATGAAGG+TGG - Chr2:15019237-15019256 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
GACATGCTATTCCATTCGCT+GGG + Chr2:15020902-15020921 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
GACATTGGAGGTCGAAATTC+GGG - Chr2:15022202-15022221 None:intergenic 45.0%
GAGAAAGAGGAAAAGCAGCA+AGG - Chr2:15017164-15017183 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
GAGTGAAACCATGGCAGAAA+TGG - Chr2:15018684-15018703 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
GCATCTATATCATGGAGCTG+CGG - Chr2:15021564-15021583 None:intergenic 45.0%
GCCAAATTAGATGGGTAGGT+GGG - Chr2:15022002-15022021 None:intergenic 45.0%
GCGAATGGAATAGCATGTCA+AGG - Chr2:15020901-15020920 None:intergenic 45.0%
GCTGGATATTGTGCAGAACA+TGG + Chr2:15020600-15020619 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
GGACATTGGAGGTCGAAATT+CGG - Chr2:15022203-15022222 None:intergenic 45.0%
GGGTACATGCCATTCAAACA+AGG - Chr2:15021606-15021625 None:intergenic 45.0%
GTCTCCTGTCTGACATTACA+CGG + Chr2:15017685-15017704 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
GTGATCCATGTGGAGATTCA+TGG + Chr2:15018111-15018130 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
GTGCATGTATTGAATCACGG+TGG - Chr2:15020859-15020878 None:intergenic 45.0%
GTGGATCTGTAAAGCAGATG+AGG + Chr2:15020231-15020250 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
TCCGTATTCCATTTCTGCCA+TGG + Chr2:15018673-15018692 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGCAGAAAATGTGACGA+TGG + Chr2:15020190-15020209 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
TGACATGCTATTCCATTCGC+TGG + Chr2:15020901-15020920 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
TTATCAGATTCACGAGGTGG+AGG - Chr2:15019714-15019733 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
TTCATGCATTGCACTGCACA+TGG + Chr2:15021170-15021189 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
TTCATGTGAGAAAGAGGGAG+AGG - Chr2:15017057-15017076 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
! AACGAGCAAGCGTCGTTAAA+AGG + Chr2:15022254-15022273 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
! ACTCAGATGGTCGGTTCATT+TGG + Chr2:15021261-15021280 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
! AGATCGTGACTGGTTGTACA+AGG - Chr2:15016951-15016970 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
! ATCGTCACATTTTCTGCAGG+AGG - Chr2:15020191-15020210 None:intergenic 45.0%
! ATTGTACTGTTTTGCGGCCA+TGG + Chr2:15018963-15018982 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
! CATTGATGATTCGAGGAGGA+AGG - Chr2:15019945-15019964 None:intergenic 45.0%
! GAGAAGAGGGTTGAGTTTTG+GGG + Chr2:15017470-15017489 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
! GTGAGAAGAGGGTTGAGTTT+TGG + Chr2:15017468-15017487 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
! TATCACCGGTGTCAATGTGT+TGG + Chr2:15017747-15017766 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
! TCACCATTGATGATTCGAGG+AGG - Chr2:15019949-15019968 None:intergenic 45.0%
! TCCATCGTCACATTTTCTGC+AGG - Chr2:15020194-15020213 None:intergenic 45.0%
! TCTCTGGTTTAGGACTCCAT+GGG + Chr2:15018284-15018303 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAAGAGGGTTGAGTTTTGG+GGG + Chr2:15017471-15017490 MsG0280007408.01.T01:intron 45.0%
!! ATCAGAGGTGTCCGTGTAAA+AGG - Chr2:15017652-15017671 MsG0280007409.01.T01:intron 45.0%
!! CGTTCTTGTTGGTTTGCCTT+TGG + Chr2:15019391-15019410 MsG0280007408.01.T01:CDS 45.0%
!! TGATACTTACTCTAAGGCCC+GGG - Chr2:15020748-15020767 None:intergenic 45.0%
AAGCGTGACAACGACTTTGC+AGG - Chr2:15021627-15021646 None:intergenic 50.0%
AATCCTCACCTGTCTGACTG+TGG + Chr2:15021088-15021107 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
ACAACCACGCCTTTGATCAG+AGG - Chr2:15017667-15017686 MsG0280007409.01.T01:intron 50.0%
ACACGGACACCTCTGATCAA+AGG + Chr2:15017655-15017674 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
ACCTACTGCCTTGGACCTTA+GGG + Chr2:15021736-15021755 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
AGCGTGACAACGACTTTGCA+GGG - Chr2:15021626-15021645 None:intergenic 50.0%
ATGCGTACACGAGCATTCCA+AGG - Chr2:15020711-15020730 None:intergenic 50.0%
ATTGTGCAGAACATGGCCAG+AGG + Chr2:15020607-15020626 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
ATTTCGACCTCCAATGTCCG+AGG + Chr2:15022204-15022223 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
CAATACGCTCACCTGTCAAG+TGG - Chr2:15021387-15021406 None:intergenic 50.0%
CCACCTCACAAGTGATTGCT+CGG - Chr2:15021535-15021554 None:intergenic 50.0%
CCGAACGTTGTTACACTTGC+TGG + Chr2:15020582-15020601 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
CGACACCAACACATTGACAC+CGG - Chr2:15017755-15017774 MsG0280007409.01.T01:intron 50.0%
CGAGCAATCACTTGTGAGGT+GGG + Chr2:15021533-15021552 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
CGCAGCACTGTCTTTACAAG+AGG + Chr2:15020512-15020531 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
CGCTAAGAGAGCCAGTCAAT+TGG - Chr2:15019373-15019392 MsG0280007409.01.T01:CDS 50.0%
GAAGTAGATTCCGTCGAAGG+AGG - Chr2:15019690-15019709 MsG0280007409.01.T01:intron 50.0%
GATGACCATCAGAGAACGTC+AGG + Chr2:15019798-15019817 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
GCAAACTTCGTGCAAGTACC+TGG - Chr2:15021008-15021027 None:intergenic 50.0%
GCAAGTATCCAAGAGTCCCA+TGG - Chr2:15018303-15018322 MsG0280007409.01.T01:intron 50.0%
GCCCACCTACCCATCTAATT+TGG + Chr2:15021998-15022017 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
GCTAACACTGACCCTACTGA+TGG + Chr2:15017186-15017205 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
GGCTCTCTTAGCGTTCTTGT+TGG + Chr2:15019380-15019399 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
GGCTGAATTCCCAAATGGGA+AGG + Chr2:15020361-15020380 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAAGTAGATTCCGTCGA+AGG - Chr2:15019693-15019712 MsG0280007409.01.T01:intron 50.0%
GTCATGTCAGGTGTCTGTGT+CGG + Chr2:15017777-15017796 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
GTGTCCGTGTAATGTCAGAC+AGG - Chr2:15017692-15017711 MsG0280007409.01.T01:intron 50.0%
TACCTACTGCCTTGGACCTT+AGG + Chr2:15021735-15021754 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
TATCATTGCCCTCTGCGTTC+AGG + Chr2:15021653-15021672 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
TGACCATCAGAGAACGTCAG+GGG + Chr2:15019800-15019819 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
TTAGGACTCCATGGGACTCT+TGG + Chr2:15018292-15018311 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
! ACATTTTCTGCAGGAGGACG+AGG - Chr2:15020185-15020204 None:intergenic 50.0%
! CAGCTTTGGCGTGGTTATGT+TGG + Chr2:15021341-15021360 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
! CGATGTTTACAGCTTTGGCG+TGG + Chr2:15021332-15021351 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
! CGGTGTCAATGTGTTGGTGT+CGG + Chr2:15017753-15017772 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
! CTCTCTGGTTTAGGACTCCA+TGG + Chr2:15018283-15018302 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
!! ATTGGTGGTGGTGATCCATG+TGG + Chr2:15018101-15018120 MsG0280007408.01.T01:CDS 50.0%
!!! GAAGAGGGTTGAGTTTTGGG+GGG + Chr2:15017472-15017491 MsG0280007408.01.T01:intron 50.0%
AACGTCAGGGGGCCATTGTA+GGG + Chr2:15019812-15019831 MsG0280007408.01.T01:intron 55.0%
AAGCCACAGTCAGACAGGTG+AGG - Chr2:15021094-15021113 None:intergenic 55.0%
AGTAATCCTCACTCCGGGTC+TGG + Chr2:15019735-15019754 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
ATGTCCATGGCCTCATGGTC+TGG - Chr2:15022316-15022335 None:intergenic 55.0%
CAAACACGCCCTAAGGTCCA+AGG - Chr2:15021747-15021766 None:intergenic 55.0%
CAGCTAAGCCACAGTCAGAC+AGG - Chr2:15021099-15021118 None:intergenic 55.0%
CCAAACACTGAGCGACAGGT+TGG + Chr2:15021127-15021146 MsG0280007408.01.T01:intron 55.0%
CCAACCTGTCGCTCAGTGTT+TGG - Chr2:15021130-15021149 None:intergenic 55.0%
CCGAGCAATCACTTGTGAGG+TGG + Chr2:15021532-15021551 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
CGCTTGCTCGTTGCACTAAC+CGG - Chr2:15022246-15022265 None:intergenic 55.0%
GACACCAAACACTGAGCGAC+AGG + Chr2:15021123-15021142 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
GACACCTCTGATCAAAGGCG+TGG + Chr2:15017660-15017679 MsG0280007408.01.T01:intron 55.0%
GACCAATGCTTGCACCACCT+CGG - Chr2:15022224-15022243 None:intergenic 55.0%
GACCATCAGAGAACGTCAGG+GGG + Chr2:15019801-15019820 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
GAGCCGAGCAATCACTTGTG+AGG + Chr2:15021529-15021548 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
GCACAAGTCTTTCCTCGGAG+AGG + Chr2:15020875-15020894 MsG0280007408.01.T01:intron 55.0%
GCTCGTGTACGCATAGCTCT+TGG + Chr2:15020717-15020736 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
TCACAAGACCCCAGACCATG+AGG + Chr2:15022303-15022322 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
TGTCCATGGCCTCATGGTCT+GGG - Chr2:15022315-15022334 None:intergenic 55.0%
! ATTCCGTCGAAGGAGGTGCA+GGG - Chr2:15019683-15019702 MsG0280007409.01.T01:intron 55.0%
! GGAGGTCGAAATTCGGGTTC+CGG - Chr2:15022196-15022215 None:intergenic 55.0%
!! AGGTGGTGCAAGCATTGGTC+CGG + Chr2:15022224-15022243 MsG0280007408.01.T01:CDS 55.0%
!! GTTGGTGTCGGTGTCATGTC+AGG + Chr2:15017765-15017784 MsG0280007408.01.T01:intron 55.0%
AGCATGTCAAGGCCTCTCCG+AGG - Chr2:15020890-15020909 None:intergenic 60.0%
CATAGCTCTTGGCACAGCCC+GGG + Chr2:15020728-15020747 MsG0280007408.01.T01:CDS 60.0%
CTGGTCGGAAGCCACTTGAC+AGG + Chr2:15021373-15021392 MsG0280007408.01.T01:CDS 60.0%
GAACGTCAGGGGGCCATTGT+AGG + Chr2:15019811-15019830 MsG0280007408.01.T01:intron 60.0%
GCATAGCTCTTGGCACAGCC+CGG + Chr2:15020727-15020746 MsG0280007408.01.T01:CDS 60.0%
GCCCTAAGGTCCAAGGCAGT+AGG - Chr2:15021740-15021759 None:intergenic 60.0%
GCTTGCACCACCTCGGACAT+TGG - Chr2:15022217-15022236 None:intergenic 60.0%
GTCCATGGCCTCATGGTCTG+GGG - Chr2:15022314-15022333 None:intergenic 60.0%
GTCCGAGGTGGTGCAAGCAT+TGG + Chr2:15022219-15022238 MsG0280007408.01.T01:CDS 60.0%
TCGACCTCCAATGTCCGAGG+TGG + Chr2:15022207-15022226 MsG0280007408.01.T01:CDS 60.0%
TGCACCACCTCGGACATTGG+AGG - Chr2:15022214-15022233 None:intergenic 60.0%
TGTGAACCAGACCCGGAGTG+AGG - Chr2:15019744-15019763 MsG0280007409.01.T01:intron 60.0%
! GATTCCGTCGAAGGAGGTGC+AGG - Chr2:15019684-15019703 MsG0280007409.01.T01:intron 60.0%
GACCCCAGACCATGAGGCCA+TGG + Chr2:15022309-15022328 MsG0280007408.01.T01:CDS 65.0%
GGCCCCCTGACGTTCTCTGA+TGG - Chr2:15019806-15019825 MsG0280007409.01.T01:intron 65.0%
GGGGGGAAAAGCCCAGCGAA+TGG - Chr2:15020916-15020935 None:intergenic 65.0%
TGGCCCTGCACCTCCTTCGA+CGG + Chr2:15019677-15019696 MsG0280007408.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 15016815 15022556 15016815 ID=MsG0280007408.01;Name=MsG0280007408.01
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Chr2 exon 15016815 15017207 15016815 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3193;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15018039 15018171 15018039 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3194;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15018279 15018350 15018279 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3195;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15018459 15018524 15018459 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3196;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15018640 15018711 15018640 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3197;Parent=MsG0280007408.01.T01
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Chr2 exon 15019355 15019420 15019355 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3200;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15019494 15019559 15019494 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3201;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15019653 15019828 15019653 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3202;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15020123 15020382 15020123 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3203;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15020486 15020757 15020486 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3204;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15021009 15021144 15021009 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3205;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15021252 15021394 15021252 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3206;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15021518 15021674 15021518 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3207;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 exon 15022193 15022556 15022193 ID=MsG0280007408.01.T01:exon:3208;Parent=MsG0280007408.01.T01
Chr2 five_prime_UTR 15016815 15017071 15016815 ID=MsG0280007408.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0280007408.01.T01
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