AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013810.01

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MsG0380013810.01.T01 AT2G33170 30.894 492 294 14 192 661 263 730 2.37e-44 172
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MsG0380013810.01.T01 AT1G34110 32.727 385 241 9 157 530 283 660 2.38e-25 113
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MsG0380013810.01.T01 AT1G73066 31.900 279 166 5 380 635 102 379 6.31e-26 113
MsG0380013810.01.T01 AT1G73066 29.302 215 119 4 444 656 73 256 1.31e-16 84.3
MsG0380013810.01.T01 AT1G17750 30.703 697 350 27 38 654 66 709 4.05e-44 172
MsG0380013810.01.T01 AT1G17750 29.557 609 346 14 107 634 14 620 7.60e-44 171
MsG0380013810.01.T01 AT1G17750 36.913 149 78 4 548 689 79 218 1.28e-11 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT4G20270 28.067 652 380 16 36 672 64 641 4.80e-44 171
MsG0380013810.01.T01 AT4G20270 29.167 288 152 6 391 634 57 336 1.30e-21 101
MsG0380013810.01.T01 AT5G01890 27.624 543 304 10 169 677 103 590 5.04e-44 171
MsG0380013810.01.T01 AT5G01890 28.885 547 307 17 18 522 31 537 1.37e-32 135
MsG0380013810.01.T01 AT5G01890 34.167 240 148 3 398 634 70 302 2.78e-24 109
MsG0380013810.01.T01 AT3G24240 31.881 505 297 13 142 634 86 555 6.20e-44 171
MsG0380013810.01.T01 AT3G24240 29.920 498 272 15 180 664 272 705 3.88e-35 144
MsG0380013810.01.T01 AT3G24240 30.053 376 226 12 284 645 74 426 2.99e-25 112
MsG0380013810.01.T01 AT3G24240 28.195 266 178 4 403 662 112 370 4.33e-21 99.4
MsG0380013810.01.T01 AT3G24240 28.537 410 224 13 60 461 327 675 3.59e-18 90.1
MsG0380013810.01.T01 AT5G51350 29.175 521 283 13 173 662 117 582 7.86e-44 170
MsG0380013810.01.T01 AT5G51350 27.303 608 352 18 1 586 15 554 4.27e-34 140
MsG0380013810.01.T01 AT5G51350 32.459 305 176 8 347 636 99 388 2.33e-27 119
MsG0380013810.01.T01 AT5G51350 26.570 414 259 9 254 655 100 480 9.28e-23 104
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MsG0380013810.01.T01 AT3G13380 27.739 566 355 16 170 713 264 797 1.73e-43 170
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MsG0380013810.01.T01 AT3G13380 29.651 516 278 18 169 661 93 546 2.20e-26 116
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MsG0380013810.01.T01 AT5G56040 28.536 403 220 9 244 636 84 428 2.05e-26 116
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MsG0380013810.01.T01 AT2G24130 28.278 633 338 17 34 656 67 593 4.24e-43 168
MsG0380013810.01.T01 AT5G63930 27.563 751 423 22 36 711 59 763 4.37e-43 169
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MsG0380013810.01.T01 AT5G56040 28.536 403 220 9 244 636 84 428 1.51e-26 117
MsG0380013810.01.T01 AT1G28440 29.964 554 337 14 153 671 79 616 6.60e-43 168
MsG0380013810.01.T01 AT1G28440 28.931 477 268 14 180 634 58 485 2.19e-35 144
MsG0380013810.01.T01 AT1G28440 29.541 545 299 15 36 507 48 580 5.78e-30 127
MsG0380013810.01.T01 AT1G28440 29.749 279 168 4 401 675 65 319 2.82e-23 106
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MsG0380013810.01.T01 AT3G23010 29.160 583 363 17 157 704 19 586 3.44e-42 162
MsG0380013810.01.T01 AT3G23010 28.851 409 248 11 236 634 1 376 4.70e-32 132
MsG0380013810.01.T01 AT3G23010 26.340 429 250 14 41 461 147 517 4.04e-16 82.8
MsG0380013810.01.T01 AT3G23010 26.477 457 286 12 65 485 77 519 6.99e-15 79.0
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MsG0380013810.01.T01 AT2G25470 29.532 491 276 15 53 514 269 718 5.40e-26 114
MsG0380013810.01.T01 AT2G25470 25.887 479 243 16 226 645 137 562 2.44e-11 67.8
MsG0380013810.01.T01 AT5G65710 27.176 655 375 22 33 666 56 629 6.97e-42 165
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MsG0380013810.01.T01 AT4G13820 27.327 505 274 19 187 634 113 581 1.21e-23 107
MsG0380013810.01.T01 AT4G13820 26.608 451 237 16 62 430 280 718 3.10e-11 67.4
MsG0380013810.01.T01 AT4G13820 26.577 222 131 2 466 687 108 297 4.08e-11 67.0
MsG0380013810.01.T01 AT5G48940 29.924 528 302 13 154 646 102 596 1.67e-41 164
MsG0380013810.01.T01 AT5G48940 29.191 507 318 14 177 664 222 706 2.38e-38 154
MsG0380013810.01.T01 AT5G48940 29.493 434 261 9 224 635 99 509 8.10e-35 143
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MsG0380013810.01.T01 AT3G56370 28.470 562 324 13 36 594 57 543 2.49e-36 147
MsG0380013810.01.T01 AT1G73080 30.372 484 292 13 180 654 289 736 3.06e-41 163
MsG0380013810.01.T01 AT1G73080 26.215 679 357 20 31 634 59 668 1.01e-31 133
MsG0380013810.01.T01 AT1G73080 30.543 442 236 16 231 661 75 456 2.38e-24 110
MsG0380013810.01.T01 AT5G25930 28.471 569 298 14 173 682 103 621 3.80e-41 162
MsG0380013810.01.T01 AT5G25930 27.474 586 330 19 14 519 26 596 2.95e-31 131
MsG0380013810.01.T01 AT5G25930 30.903 288 179 6 359 634 92 371 1.10e-30 130
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MsG0380013810.01.T01 AT4G13810 25.482 467 243 16 53 508 70 442 9.05e-16 81.6
MsG0380013810.01.T01 AT1G74360 28.833 711 390 27 12 653 39 702 6.32e-41 162
MsG0380013810.01.T01 AT1G74360 29.070 258 155 9 420 672 87 321 8.30e-11 66.2
MsG0380013810.01.T01 AT3G47110 29.741 696 358 16 1 656 27 631 1.18e-40 161
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MsG0380013810.01.T01 AT5G65700 29.047 661 350 22 29 661 50 619 1.95e-40 160
MsG0380013810.01.T01 AT1G72180 29.379 531 288 15 177 670 117 597 5.76e-40 159
MsG0380013810.01.T01 AT1G72180 30.454 463 271 12 184 634 76 499 1.94e-38 154
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MsG0380013810.01.T01 AT5G63930 28.152 579 342 18 66 636 20 532 1.35e-34 142
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MsG0380013810.01.T01 AT5G62230 29.791 527 306 9 159 655 72 564 5.77e-39 155
MsG0380013810.01.T01 AT5G62230 30.725 524 276 16 34 507 57 543 1.90e-32 135
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MsG0380013810.01.T01 AT5G49290 28.302 583 375 18 77 634 48 612 6.85e-22 101
MsG0380013810.01.T01 AT5G49290 25.870 460 284 14 208 636 112 545 1.37e-14 78.2
MsG0380013810.01.T01 AT1G75820 28.182 550 322 15 128 654 114 613 8.49e-39 155
MsG0380013810.01.T01 AT1G75820 29.389 262 151 4 401 634 75 330 1.81e-18 90.9
MsG0380013810.01.T01 AT1G65380 27.365 687 394 21 11 654 31 655 1.01e-38 154
MsG0380013810.01.T01 AT5G62230 28.685 502 296 7 159 655 72 516 1.15e-38 154
MsG0380013810.01.T01 AT5G62230 31.828 487 271 19 34 507 57 495 2.18e-31 132
MsG0380013810.01.T01 AT5G07180 28.000 525 316 9 160 655 75 566 2.08e-38 154
MsG0380013810.01.T01 AT5G07180 28.952 525 284 16 34 507 59 545 1.40e-31 132
MsG0380013810.01.T01 AT5G07180 28.656 506 296 10 179 655 1 470 3.91e-38 153
MsG0380013810.01.T01 AT5G61480 28.421 570 341 16 172 695 120 668 6.07e-38 152
MsG0380013810.01.T01 AT5G61480 27.911 541 319 14 36 522 69 592 6.22e-35 143
MsG0380013810.01.T01 AT5G61480 28.728 456 275 10 204 645 78 497 4.56e-32 134
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MsG0380013810.01.T01 AT4G28490 28.194 454 286 13 65 512 173 592 1.23e-20 97.8
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MsG0380013810.01.T01 AT5G23400 29.921 508 312 18 180 666 105 589 1.58e-37 149
MsG0380013810.01.T01 AT2G33080 29.362 705 368 28 7 632 36 689 1.19e-37 150
MsG0380013810.01.T01 AT2G33080 41.111 90 52 1 548 637 128 216 1.38e-11 68.6
MsG0380013810.01.T01 AT2G41820 29.264 516 300 19 166 666 56 521 1.08e-36 148
MsG0380013810.01.T01 AT2G41820 28.416 461 278 13 34 462 49 489 1.71e-26 116
MsG0380013810.01.T01 AT5G10020 28.437 531 301 18 181 696 98 564 3.97e-36 147
MsG0380013810.01.T01 AT5G10020 30.074 542 271 25 5 486 17 510 7.30e-26 114
MsG0380013810.01.T01 AT5G10020 41.000 100 54 2 549 643 78 177 3.24e-11 67.4
MsG0380013810.01.T01 AT1G09970 27.390 544 308 16 199 661 60 597 8.01e-36 146
MsG0380013810.01.T01 AT1G09970 27.390 544 308 16 199 661 60 597 8.24e-36 146
MsG0380013810.01.T01 AT5G10020 29.338 559 339 21 155 696 93 612 1.03e-35 145
MsG0380013810.01.T01 AT5G10020 28.472 576 284 23 5 486 17 558 1.18e-24 110
MsG0380013810.01.T01 AT5G10020 41.000 100 54 2 549 643 78 177 3.59e-11 67.4
MsG0380013810.01.T01 AT1G62950 28.976 459 263 10 217 658 83 495 1.66e-35 145
MsG0380013810.01.T01 AT1G62950 26.482 506 251 20 14 461 32 474 9.06e-15 79.0
MsG0380013810.01.T01 AT1G34420 30.303 495 269 12 181 668 180 605 2.18e-35 144
MsG0380013810.01.T01 AT1G34420 30.244 410 225 8 229 634 105 457 6.60e-27 117
MsG0380013810.01.T01 AT4G26540 27.971 547 302 16 177 642 112 647 2.85e-35 144
MsG0380013810.01.T01 AT4G26540 27.395 668 409 22 12 634 26 662 9.80e-32 133
MsG0380013810.01.T01 AT3G12610 31.894 301 169 4 363 658 99 368 7.25e-35 137
MsG0380013810.01.T01 AT3G12610 28.280 343 198 11 10 337 27 336 6.06e-18 87.0
MsG0380013810.01.T01 AT3G12610 28.523 298 130 8 218 507 122 344 7.90e-18 86.7
MsG0380013810.01.T01 AT3G12610 29.119 261 133 9 180 437 133 344 1.29e-15 79.7
MsG0380013810.01.T01 AT2G15042 28.415 366 238 9 363 722 66 413 1.12e-34 137
MsG0380013810.01.T01 AT2G15042 28.713 303 163 9 238 515 60 334 4.64e-17 84.7
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MsG0380013810.01.T01 AT1G12460 29.052 327 185 6 365 680 82 372 1.39e-29 125
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MsG0380013810.01.T01 AT1G33600 26.840 462 270 16 10 438 28 454 6.95e-19 90.9
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MsG0380013810.01.T01 AT4G39270 33.600 125 77 1 510 634 97 215 3.07e-12 70.9
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MsG0380013810.01.T01 AT5G49780 29.321 324 183 11 148 454 55 349 1.26e-12 72.0
MsG0380013810.01.T01 AT4G28380 30.126 239 156 5 374 608 89 320 4.72e-19 90.5
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MsG0380013810.01.T01 AT4G37250 40.833 120 65 3 170 289 79 192 3.09e-12 70.9
MsG0380013810.01.T01 AT2G15320 27.863 262 153 6 378 634 79 309 5.41e-19 90.1
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MsG0380013810.01.T01 AT1G56120 30.841 321 163 12 212 489 104 408 1.84e-13 74.7
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MsG0380013810.01.T01 AT4G34220 40.777 103 60 1 545 646 103 205 3.86e-13 73.6
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MsG0380013810.01.T01 AT5G65830 34.146 164 85 4 548 703 107 255 3.94e-16 80.1
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MsG0380013810.01.T01 AT1G12040 28.520 277 142 8 243 513 111 337 2.66e-13 73.9
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MsG0380013810.01.T01 AT3G03770 30.208 288 170 7 367 634 59 335 6.58e-14 76.3
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MsG0380013810.01.T01 AT5G58300 31.754 211 100 6 481 684 103 276 2.35e-13 73.9
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MsG0380013810.01.T01 AT5G48380 36.752 117 73 1 546 661 101 217 2.52e-12 70.9
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MsG0380013810.01.T01 AT5G45800 29.851 201 120 7 393 585 52 239 1.22e-11 68.6
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MsG0380013810.01.T01 AT1G71830 36.792 106 67 0 550 655 98 203 5.52e-12 69.7
MsG0380013810.01.T01 AT1G71830 38.596 114 66 3 180 292 67 177 7.48e-11 65.9
MsG0380013810.01.T01 AT3G02880 30.159 189 91 5 408 589 49 203 5.83e-12 69.7
MsG0380013810.01.T01 AT2G23950 29.221 154 98 3 548 699 101 245 6.60e-12 69.3
MsG0380013810.01.T01 AT2G23950 38.835 103 61 1 407 507 85 187 5.64e-11 66.2
MsG0380013810.01.T01 AT4G23740 34.899 149 93 3 160 307 70 215 6.79e-12 69.3
MsG0380013810.01.T01 AT4G23740 34.899 149 93 3 160 307 70 215 6.79e-12 69.3
MsG0380013810.01.T01 AT2G23950 28.488 172 110 4 548 714 101 264 7.62e-12 69.3
MsG0380013810.01.T01 AT2G23950 38.462 104 62 1 406 507 84 187 6.64e-11 66.2
MsG0380013810.01.T01 AT5G63710 34.677 124 78 2 549 671 96 217 8.60e-12 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT5G63710 34.677 124 78 2 549 671 61 182 8.61e-12 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT5G63710 34.677 124 78 2 549 671 61 182 8.61e-12 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT4G30520 39.423 104 61 1 406 507 87 190 8.90e-12 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT4G30520 34.862 109 63 2 548 654 104 206 3.05e-11 67.4
MsG0380013810.01.T01 AT5G63710 34.677 124 78 2 549 671 97 218 1.01e-11 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT5G43020 30.319 188 101 6 517 676 70 255 1.06e-11 68.9
MsG0380013810.01.T01 AT5G16000 29.609 179 103 5 548 714 108 275 1.16e-11 68.6
MsG0380013810.01.T01 AT5G16000 36.893 103 63 1 408 508 93 195 5.06e-11 66.6
MsG0380013810.01.T01 AT3G43740 35.385 130 78 4 184 313 72 195 1.18e-11 65.5
MsG0380013810.01.T01 AT2G13800 36.792 106 66 1 545 650 94 198 1.36e-11 68.6
MsG0380013810.01.T01 AT2G13800 36.792 106 66 1 545 650 94 198 1.36e-11 68.6
MsG0380013810.01.T01 AT5G24100 39.175 97 57 1 413 507 90 186 1.47e-11 68.2
MsG0380013810.01.T01 AT5G49780 27.317 205 103 5 403 607 1 159 1.90e-11 68.2
MsG0380013810.01.T01 AT1G56130 27.869 244 153 3 241 483 9 230 1.93e-11 68.2
MsG0380013810.01.T01 AT1G56130 25.316 237 144 3 400 634 3 208 4.42e-11 67.0
MsG0380013810.01.T01 AT1G34210 37.736 106 66 0 550 655 101 206 2.60e-11 67.4
MsG0380013810.01.T01 AT1G34210 37.736 106 66 0 550 655 101 206 2.60e-11 67.4
MsG0380013810.01.T01 AT5G21090 33.577 137 85 4 184 320 72 202 2.76e-11 64.3
MsG0380013810.01.T01 AT5G53320 33.083 133 67 2 548 660 93 223 3.67e-11 67.0
MsG0380013810.01.T01 AT3G25560 30.460 174 111 7 548 716 108 276 3.93e-11 67.0
MsG0380013810.01.T01 AT3G17840 33.918 171 95 6 495 662 75 230 4.19e-11 67.0
MsG0380013810.01.T01 AT4G33430 35.922 103 66 0 545 647 92 194 5.85e-11 66.2
MsG0380013810.01.T01 AT1G72460 30.939 181 102 7 486 659 61 225 6.89e-11 66.2
MsG0380013810.01.T01 AT1G14390 28.636 220 120 4 418 634 105 290 8.46e-11 65.9

Find 142 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 164 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGGATTTGCAGCAGGTTTC+TGG -0.003578 3:+46009667 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAGGCCCAAACTTTCCATTT+TGG 0.176045 3:+46008536 MsG0380013810.01.T01:CDS
AATAATCCCTTCAAATTTAT+TGG 0.179664 3:-46009013 None:intergenic
CTTGCACATAACAAACTTTC+TGG 0.204586 3:+46009078 MsG0380013810.01.T01:CDS
GCGGTTCTTTGTTTCTTATT+AGG 0.218979 3:+46009697 MsG0380013810.01.T01:CDS
TATATCCAAAATGGAAAGTT+TGG 0.224833 3:-46008541 None:intergenic
TTTGATGCATCAAGTTATAT+TGG 0.243752 3:+46009513 MsG0380013810.01.T01:CDS
CCAATCTAAACTAGAGAGTT+TGG 0.287356 3:-46008419 None:intergenic
TTCTGTGTATATATCCAAAA+TGG 0.290500 3:-46008550 None:intergenic
GCATACTTTAGGTTTATATA+TGG 0.292107 3:+46009732 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAATTGTTCCGAGTTATCTT+TGG 0.296773 3:+46008714 MsG0380013810.01.T01:CDS
TAAATGTTATTCTTTCTATA+AGG 0.310118 3:-46008639 None:intergenic
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG 0.310778 3:-46008471 None:intergenic
TCTCACCTATCTTCAGCTTC+AGG 0.312334 3:+46008213 MsG0380013810.01.T01:CDS
CTTTGAAGTTGAGTTCCTAT+TGG 0.316367 3:-46009489 None:intergenic
CTCAAAGCTAATTCTGTAGA+TGG 0.322378 3:+46007752 MsG0380013810.01.T01:CDS
ACTCGGAACAATTTAGTGTT+AGG 0.324745 3:-46008705 None:intergenic
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG 0.334977 3:-46008096 None:intergenic
TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG 0.336058 3:+46008467 MsG0380013810.01.T01:CDS
CAAGCTCTATGTTACTTTGA+TGG 0.341862 3:+46009764 MsG0380013810.01.T01:CDS
AGATGGGCAACTCAATGTTT+TGG 0.343851 3:+46007769 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTGATGCATCAAGTTATATT+GGG 0.344292 3:+46009514 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATAAAAGAATCATTGTATCT+AGG 0.346819 3:+46009636 MsG0380013810.01.T01:CDS
AATGGAGGCATGCATACTTT+AGG 0.349410 3:+46009721 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTTGAAGTTGAGTTCCTATT+GGG 0.355124 3:-46009488 None:intergenic
CCAAACTCTCTAGTTTAGAT+TGG 0.358025 3:+46008419 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTGTCTTGCAACTCCTTCTC+AGG 0.358620 3:+46008796 MsG0380013810.01.T01:CDS
AGAGGAGCTCCGCATAGTTT+AGG 0.358998 3:-46009540 None:intergenic
CTGGCTATTGGTGATATGTT+TGG 0.363006 3:-46008763 None:intergenic
TGGATTTGCAGCAGGTTTCT+GGG 0.365964 3:+46009668 MsG0380013810.01.T01:CDS
GATTGGAGGCATGACAAATA+TGG 0.372572 3:+46009353 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG 0.372808 3:+46009268 MsG0380013810.01.T01:CDS
AGGTCAATAGTTCGCCTATC+CGG 0.373603 3:-46009222 None:intergenic
TCCTTAACTGATCTATCTAT+TGG 0.375251 3:+46008355 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG 0.376326 3:+46008468 MsG0380013810.01.T01:CDS
GTTGGTTATCAAAGAGATAA+AGG 0.377343 3:-46008294 None:intergenic
CCATCCTCATTCTCTGTAGA+TGG 0.380459 3:-46009606 None:intergenic
ATACACATATTCTTGACCTT+TGG 0.381169 3:-46009190 None:intergenic
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+TGG 0.385297 3:-46008331 None:intergenic
GCAAGACAAATCAACATAAC+TGG 0.388137 3:-46008782 None:intergenic
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG 0.391292 3:-46007648 None:intergenic
TTCACCTCTCATTTACCAAA+TGG 0.394132 3:+46008169 MsG0380013810.01.T01:CDS
GACACTGTTAACCTTCAAAC+AGG 0.397535 3:+46007637 MsG0380013810.01.T01:CDS
CTTTGTTTCTTATTAGGAAA+TGG 0.397925 3:+46009703 MsG0380013810.01.T01:CDS
GCCAATAGATAGATCAGTTA+AGG 0.404466 3:-46008356 None:intergenic
TTCACATGGATAATCTTGAT+TGG 0.406399 3:+46007948 MsG0380013810.01.T01:CDS
ACTTGAGTTTCTCAGTTACT+TGG 0.406475 3:+46007820 MsG0380013810.01.T01:CDS
CAGGATCAATTCCGCATAGT+TGG 0.410974 3:+46008815 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTATCTCACAATAGTTTCAA+TGG 0.416574 3:+46009315 MsG0380013810.01.T01:CDS
CTATTAGAATTACATTTGCT+TGG 0.417282 3:+46008067 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATCGAACGCGGGAATTTCAT+TGG 0.419820 3:+46008594 MsG0380013810.01.T01:CDS
TGGCTATTGGTGATATGTTT+GGG 0.421958 3:-46008762 None:intergenic
CTGTGGAATAATAAGCTGTC+TGG 0.423181 3:+46008868 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTTAAGAGAGCCATGCTTTG+AGG 0.425287 3:-46009417 None:intergenic
CTGAAGATAGGTGAGATCTT+TGG 0.429466 3:-46008206 None:intergenic
AAATCAACATAACTGGCTAT+TGG 0.430780 3:-46008775 None:intergenic
TAAAAGAATCATTGTATCTA+GGG 0.433975 3:+46009637 MsG0380013810.01.T01:CDS
TAGTTTGATTGATCTTCATA+AGG 0.436927 3:+46008006 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTTGATGGAAGAATCCCAAT+AGG 0.437419 3:+46009474 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTGAGAGCCAATAAATTTGA+AGG 0.446217 3:+46009006 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATATCCAAAATGGAAAGTTT+GGG 0.447483 3:-46008540 None:intergenic
TCACCTCTCATTTACCAAAT+GGG 0.449389 3:+46008170 MsG0380013810.01.T01:CDS
GTCATGCCTCCAATCGTCTT+CGG 0.449529 3:-46009345 None:intergenic
ACAATTGCAGACCATGAACT+TGG 0.449690 3:+46008921 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATTGGCTCTAATAATTTCTC+TGG 0.450199 3:+46008373 MsG0380013810.01.T01:CDS
GTTATGGTACAATTATTAAG+AGG 0.450758 3:-46009558 None:intergenic
GCTTCCCTGAAGCTGAAGAT+AGG 0.451997 3:-46008218 None:intergenic
GTCAAGGTAGACAAGTTTAG+AGG 0.452365 3:-46007906 None:intergenic
TCAGTTACTTGGATTTGAGC+TGG 0.454562 3:+46007831 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTGGATCACAATAATTTCAC+AGG 0.455612 3:+46008733 MsG0380013810.01.T01:CDS
GTCCACTGTGACAACATTAC+CGG 0.460392 3:+46007710 MsG0380013810.01.T01:CDS
GACAGGTGAGAGAGTTGAAA+AGG 0.460491 3:-46008496 None:intergenic
CACTTCTCCAGTCAACTGAT+TGG 0.461260 3:-46009250 None:intergenic
CAGTCAACTGATTGGCTGAA+AGG 0.467788 3:-46009242 None:intergenic
ATGTGTGATGTTATGTTGAA+TGG 0.477091 3:-46007882 None:intergenic
TGTCTACAACTTGACTCATA+TGG 0.478287 3:+46009116 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATGGGAGTTGGATTTGCAGC+AGG 0.480408 3:+46009660 MsG0380013810.01.T01:CDS
CTCACCTATCTTCAGCTTCA+GGG 0.485987 3:+46008214 MsG0380013810.01.T01:CDS
GGTCAATAGTTCGCCTATCC+GGG 0.493394 3:-46009221 None:intergenic
ATCTTCATAAGGAAACCAAC+TGG 0.493484 3:+46008017 MsG0380013810.01.T01:CDS
CAGACAGCTTATTATTCCAC+AGG 0.494898 3:-46008867 None:intergenic
CTCTTTGATAACCAACTACA+AGG 0.495708 3:+46008301 MsG0380013810.01.T01:CDS
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG 0.498997 3:-46008259 None:intergenic
GATTTGTATTACTCAATGAC+AGG 0.500365 3:-46008513 None:intergenic
CTTTCAGCCAATCAGTTGAC+TGG 0.501674 3:+46009243 MsG0380013810.01.T01:CDS
TATGAAGATCAATCAAACTA+AGG 0.509660 3:-46008003 None:intergenic
ATGGAATTGATCCTTGTAGT+TGG 0.515022 3:-46008312 None:intergenic
GGAACAATTCCGAAGACGAT+TGG 0.516124 3:+46009336 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTTAGGTTTATATATGGAGT+GGG 0.518372 3:+46009738 MsG0380013810.01.T01:CDS
TCATTGAGTAATACAAATCA+AGG 0.523989 3:+46008517 MsG0380013810.01.T01:CDS
GGATTTGCAGCAGGTTTCTG+GGG 0.524214 3:+46009669 MsG0380013810.01.T01:CDS
AGAATCATTGTATCTAGGGA+TGG 0.526159 3:+46009641 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATAGATCAGTTAAGGATGAG+AGG 0.533669 3:-46008348 None:intergenic
TTTGGTAAATAAATCAATTG+TGG 0.544070 3:-46009172 None:intergenic
TTGTATCTAGGGATGGGAGT+TGG 0.548440 3:+46009648 MsG0380013810.01.T01:CDS
CAGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG 0.552191 3:-46009077 None:intergenic
GAAGAACTTATCAGAACTGA+TGG 0.554390 3:+46008837 MsG0380013810.01.T01:CDS
ACAATTGATTTATTTACCAA+AGG 0.555223 3:+46009174 MsG0380013810.01.T01:CDS
TGAGAGCCAATAAATTTGAA+GGG 0.556135 3:+46009007 MsG0380013810.01.T01:CDS
TGGTGAAATTCCTCAAAGCA+TGG 0.556775 3:+46009407 MsG0380013810.01.T01:CDS
TCAAAGCTAATTCTGTAGAT+GGG 0.557828 3:+46007753 MsG0380013810.01.T01:CDS
GAATCATTGTATCTAGGGAT+GGG 0.558971 3:+46009642 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG 0.559127 3:-46008109 None:intergenic
ACAATTCCGAAGACGATTGG+AGG 0.562991 3:+46009339 MsG0380013810.01.T01:CDS
GTTGACTGGAGAAGTGCCAT+TGG 0.566201 3:+46009257 MsG0380013810.01.T01:CDS
CTTTAGGTTTATATATGGAG+TGG 0.567169 3:+46009737 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATTCACTATTTGAAGCCAGT+TGG 0.568295 3:-46008032 None:intergenic
GATTTGCAGCAGGTTTCTGG+GGG 0.570767 3:+46009670 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAGTGTTGTGACATCTCCAC+TGG 0.577872 3:-46008970 None:intergenic
AAAGATTGTTGTGCTTGGGA+TGG 0.578203 3:+46007686 MsG0380013810.01.T01:CDS
GGATCAATTCCATCAACTCT+AGG 0.578729 3:+46008322 MsG0380013810.01.T01:CDS
AACAGGGCATCAATGATATG+TGG 0.585891 3:+46007654 MsG0380013810.01.T01:CDS
GTGATGTTATGTTGAATGGA+TGG 0.587131 3:-46007878 None:intergenic
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG 0.594389 3:+46009706 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAATGTAATTCTAATAGTGA+AGG 0.595489 3:-46008061 None:intergenic
CTTCAGGGAAGCAATATACA+TGG 0.595715 3:+46008229 MsG0380013810.01.T01:CDS
AGGTGAGAGAGTTGAAAAGG+AGG 0.602162 3:-46008493 None:intergenic
ACTGCCATCTACAGAGAATG+AGG 0.602575 3:+46009602 MsG0380013810.01.T01:CDS
GAGAGATTGAATAATTGTCG+TGG 0.603688 3:-46009036 None:intergenic
TTCAAGTTAGAGATGTACAA+TGG 0.609733 3:-46008898 None:intergenic
AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG 0.615335 3:-46008108 None:intergenic
ATGCGGAATTGATCCTGAGA+AGG 0.617005 3:-46008809 None:intergenic
TGGATCACAATAATTTCACA+GGG 0.618711 3:+46008734 MsG0380013810.01.T01:CDS
GATCACAATAATTTCACAGG+GGG 0.618768 3:+46008736 MsG0380013810.01.T01:CDS
CAATTGCAGACCATGAACTT+GGG 0.624877 3:+46008922 MsG0380013810.01.T01:CDS
CCATCTACAGAGAATGAGGA+TGG 0.624895 3:+46009606 MsG0380013810.01.T01:CDS
AAACCCATTTGGTAAATGAG+AGG 0.628216 3:-46008173 None:intergenic
ATTGTGATCCAAAGATAACT+CGG 0.637230 3:-46008722 None:intergenic
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG 0.649017 3:-46009273 None:intergenic
AATTGTGTGATTGCTACACA+TGG 0.657984 3:-46007588 None:intergenic
AACTGATGGTCATGAACCTG+TGG 0.659946 3:+46008851 MsG0380013810.01.T01:CDS
GATAAGTTCTTCCAACTATG+CGG 0.665553 3:-46008826 None:intergenic
TGTATGATGTTGACCCGGAT+AGG 0.669445 3:+46009208 MsG0380013810.01.T01:CDS
TATCTCGACATATCGAACGC+GGG 0.674657 3:+46008583 MsG0380013810.01.T01:CDS
GATGTCACAACACTTAGCAG+TGG 0.695834 3:+46008978 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATTGGGAATCCTAAACTATG+CGG 0.705145 3:+46009531 MsG0380013810.01.T01:CDS
ATATGTGTATGATGTTGACC+CGG 0.712999 3:+46009203 MsG0380013810.01.T01:CDS
TTCCGGTAATGTTGTCACAG+TGG 0.719606 3:-46007712 None:intergenic
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GTCAAGTTGTAGACACAGTG+TGG 0.724383 3:-46009108 None:intergenic
ACACTGTTAACCTTCAAACA+GGG 0.729379 3:+46007638 MsG0380013810.01.T01:CDS
GGATCACAATAATTTCACAG+GGG 0.762104 3:+46008735 MsG0380013810.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! TAAATGTTATTCTTTCTATA+AGG - Chr3:46008642-46008661 None:intergenic 15.0%
!!! CATGTGAATATTATAATTTT+TGG - Chr3:46007936-46007955 None:intergenic 15.0%
!! AAATGTAATTCTAATAGTGA+AGG - Chr3:46008064-46008083 None:intergenic 20.0%
!! AATAATCCCTTCAAATTTAT+TGG - Chr3:46009016-46009035 None:intergenic 20.0%
!! ATAAAAGAATCATTGTATCT+AGG + Chr3:46009636-46009655 MsG0380013810.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAAGAATCATTGTATCTA+GGG + Chr3:46009637-46009656 MsG0380013810.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGGTAAATAAATCAATTG+TGG - Chr3:46009175-46009194 None:intergenic 20.0%
!!! ACAATTGATTTATTTACCAA+AGG + Chr3:46009174-46009193 MsG0380013810.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTCTCTAATAATAAGTTTTT+TGG + Chr3:46009387-46009406 MsG0380013810.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATAATTTTTGGATAAGTCA+AGG - Chr3:46007925-46007944 None:intergenic 20.0%
!!! TTATCTTGCAATAATTTTGA+TGG + Chr3:46009459-46009478 MsG0380013810.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTATTCCAATTTGATT+TGG + Chr3:46008462-46008481 MsG0380013810.01.T01:CDS 20.0%
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! AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG - Chr3:46008111-46008130 None:intergenic 25.0%
! ATATCCAAAATGGAAAGTTT+GGG - Chr3:46008543-46008562 None:intergenic 25.0%
! CTATTAGAATTACATTTGCT+TGG + Chr3:46008067-46008086 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
! GTTATGGTACAATTATTAAG+AGG - Chr3:46009561-46009580 None:intergenic 25.0%
! TAGTTTGATTGATCTTCATA+AGG + Chr3:46008006-46008025 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
! TATATCCAAAATGGAAAGTT+TGG - Chr3:46008544-46008563 None:intergenic 25.0%
! TATGAAGATCAATCAAACTA+AGG - Chr3:46008006-46008025 None:intergenic 25.0%
! TCATTGAGTAATACAAATCA+AGG + Chr3:46008517-46008536 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCTCACAATAGTTTCAA+TGG + Chr3:46009315-46009334 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTGTGTATATATCCAAAA+TGG - Chr3:46008553-46008572 None:intergenic 25.0%
! TTGATGCATCAAGTTATATT+GGG + Chr3:46009514-46009533 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGATGCATCAAGTTATAT+TGG + Chr3:46009513-46009532 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTAAGGTTGAGATATTTTA+AGG - Chr3:46007990-46008009 None:intergenic 25.0%
!! CTTTGTTTCTTATTAGGAAA+TGG + Chr3:46009703-46009722 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
!! GCATACTTTAGGTTTATATA+TGG + Chr3:46009732-46009751 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTAGGTTTATATATGGAGT+GGG + Chr3:46009738-46009757 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGATATTTTAAGGAAGAAAG+TGG - Chr3:46007980-46007999 None:intergenic 25.0%
!!! ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG + Chr3:46008468-46008487 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG + Chr3:46008467-46008486 MsG0380013810.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTAGGATTTTCTTCTGTTA+TGG - Chr3:46009577-46009596 None:intergenic 25.0%
AAATCAACATAACTGGCTAT+TGG - Chr3:46008778-46008797 None:intergenic 30.0%
AAATTGTTCCGAGTTATCTT+TGG + Chr3:46008714-46008733 MsG0380013810.01.T01:CDS 30.0%
ATACACATATTCTTGACCTT+TGG - Chr3:46009193-46009212 None:intergenic 30.0%
ATGTGTGATGTTATGTTGAA+TGG - Chr3:46007885-46007904 None:intergenic 30.0%
ATTGTGATCCAAAGATAACT+CGG - Chr3:46008725-46008744 None:intergenic 30.0%
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GTTGGTTATCAAAGAGATAA+AGG - Chr3:46008297-46008316 None:intergenic 30.0%
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! CTTTAGGTTTATATATGGAG+TGG + Chr3:46009737-46009756 MsG0380013810.01.T01:CDS 30.0%
! TTCAAGTTAGAGATGTACAA+TGG - Chr3:46008901-46008920 None:intergenic 30.0%
! TTGGGAGAAAATGAATTTTC+TGG + Chr3:46008940-46008959 MsG0380013810.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAAGTTGAGTTCCTATT+GGG - Chr3:46009491-46009510 None:intergenic 30.0%
!! ATCAAGTTTTGTAACTCTTC+CGG - Chr3:46007732-46007751 None:intergenic 30.0%
!! ATTGGCTCTAATAATTTCTC+TGG + Chr3:46008373-46008392 MsG0380013810.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAAGGTGTCTCAAATTTTGA+AGG - Chr3:46008279-46008298 None:intergenic 30.0%
AAACCCATTTGGTAAATGAG+AGG - Chr3:46008176-46008195 None:intergenic 35.0%
ACACTGTTAACCTTCAAACA+GGG + Chr3:46007638-46007657 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
ACTCGGAACAATTTAGTGTT+AGG - Chr3:46008708-46008727 None:intergenic 35.0%
ACTTGAGTTTCTCAGTTACT+TGG + Chr3:46007820-46007839 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
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ATAGATCAGTTAAGGATGAG+AGG - Chr3:46008351-46008370 None:intergenic 35.0%
ATATGTGTATGATGTTGACC+CGG + Chr3:46009203-46009222 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
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ATGGAATTGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:46008315-46008334 None:intergenic 35.0%
ATTGGGAATCCTAAACTATG+CGG + Chr3:46009531-46009550 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
CCAATCTAAACTAGAGAGTT+TGG - Chr3:46008422-46008441 None:intergenic 35.0%
CGAAAAAGATTGTTGTGCTT+GGG + Chr3:46007682-46007701 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
CTCAAAGCTAATTCTGTAGA+TGG + Chr3:46007752-46007771 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCACATAACAAACTTTC+TGG + Chr3:46009078-46009097 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG - Chr3:46008474-46008493 None:intergenic 35.0%
GAAGAACTTATCAGAACTGA+TGG + Chr3:46008837-46008856 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
GAATCATTGTATCTAGGGAT+GGG + Chr3:46009642-46009661 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
GAGAGATTGAATAATTGTCG+TGG - Chr3:46009039-46009058 None:intergenic 35.0%
GATAAGTTCTTCCAACTATG+CGG - Chr3:46008829-46008848 None:intergenic 35.0%
GATCACAATAATTTCACAGG+GGG + Chr3:46008736-46008755 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
GCAAGACAAATCAACATAAC+TGG - Chr3:46008785-46008804 None:intergenic 35.0%
GCCAATAGATAGATCAGTTA+AGG - Chr3:46008359-46008378 None:intergenic 35.0%
GGATCACAATAATTTCACAG+GGG + Chr3:46008735-46008754 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
GTGATGTTATGTTGAATGGA+TGG - Chr3:46007881-46007900 None:intergenic 35.0%
TCACCTCTCATTTACCAAAT+GGG + Chr3:46008170-46008189 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
TGTCTACAACTTGACTCATA+TGG + Chr3:46009116-46009135 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
TTCACCTCTCATTTACCAAA+TGG + Chr3:46008169-46008188 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGGAAGAATCCCAAT+AGG + Chr3:46009474-46009493 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG + Chr3:46009268-46009287 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
! ATTCACTATTTGAAGCCAGT+TGG - Chr3:46008035-46008054 None:intergenic 35.0%
! CATGGCTCTCTTAAACTTTT+TGG + Chr3:46009425-46009444 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
! CCAAACTCTCTAGTTTAGAT+TGG + Chr3:46008419-46008438 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
! CCAAGCACAACAATCTTTTT+CGG - Chr3:46007684-46007703 None:intergenic 35.0%
! CTCTTTGATAACCAACTACA+AGG + Chr3:46008301-46008320 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
! GCGGTTCTTTGTTTCTTATT+AGG + Chr3:46009697-46009716 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
! TGGCTATTGGTGATATGTTT+GGG - Chr3:46008765-46008784 None:intergenic 35.0%
! TTCATTTTCTCCCAAGTTCA+TGG - Chr3:46008935-46008954 None:intergenic 35.0%
!! ATTTTCTGGAAACATACCAG+TGG + Chr3:46008954-46008973 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
!! CAAGCTCTATGTTACTTTGA+TGG + Chr3:46009764-46009783 MsG0380013810.01.T01:CDS 35.0%
!! CAGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG - Chr3:46009080-46009099 None:intergenic 35.0%
!! CTTTGAAGTTGAGTTCCTAT+TGG - Chr3:46009492-46009511 None:intergenic 35.0%
AAAGATTGTTGTGCTTGGGA+TGG + Chr3:46007686-46007705 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG - Chr3:46009276-46009295 None:intergenic 40.0%
ACAATTGCAGACCATGAACT+TGG + Chr3:46008921-46008940 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
ATATCTCGACATATCGAACG+CGG + Chr3:46008582-46008601 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG - Chr3:46007651-46007670 None:intergenic 40.0%
CAATTGCAGACCATGAACTT+GGG + Chr3:46008922-46008941 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
CAGACAGCTTATTATTCCAC+AGG - Chr3:46008870-46008889 None:intergenic 40.0%
CCGAAAAAGATTGTTGTGCT+TGG + Chr3:46007681-46007700 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
CTGAAGATAGGTGAGATCTT+TGG - Chr3:46008209-46008228 None:intergenic 40.0%
CTGTGGAATAATAAGCTGTC+TGG + Chr3:46008868-46008887 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
CTTCAGGGAAGCAATATACA+TGG + Chr3:46008229-46008248 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
GACACTGTTAACCTTCAAAC+AGG + Chr3:46007637-46007656 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
GGATCAATTCCATCAACTCT+AGG + Chr3:46008322-46008341 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAGGTAGACAAGTTTAG+AGG - Chr3:46007909-46007928 None:intergenic 40.0%
TCAGTTACTTGGATTTGAGC+TGG + Chr3:46007831-46007850 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG - Chr3:46008262-46008281 None:intergenic 40.0%
TGGTGAAATTCCTCAAAGCA+TGG + Chr3:46009407-46009426 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
TTTAAGAGAGCCATGCTTTG+AGG - Chr3:46009420-46009439 None:intergenic 40.0%
! AACAGGGCATCAATGATATG+TGG + Chr3:46007654-46007673 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGCCCAAACTTTCCATTT+TGG + Chr3:46008536-46008555 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
! AATGGAGGCATGCATACTTT+AGG + Chr3:46009721-46009740 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
! AGATGGGCAACTCAATGTTT+TGG + Chr3:46007769-46007788 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
! CTGGCTATTGGTGATATGTT+TGG - Chr3:46008766-46008785 None:intergenic 40.0%
! GATTGGAGGCATGACAAATA+TGG + Chr3:46009353-46009372 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
! GGCTCTCTTAAACTTTTTGG+AGG + Chr3:46009428-46009447 MsG0380013810.01.T01:CDS 40.0%
AACTGATGGTCATGAACCTG+TGG + Chr3:46008851-46008870 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
ACAATTCCGAAGACGATTGG+AGG + Chr3:46009339-46009358 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
ACTGCCATCTACAGAGAATG+AGG + Chr3:46009602-46009621 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCAATAGTTCGCCTATC+CGG - Chr3:46009225-46009244 None:intergenic 45.0%
AGGTGAGAGAGTTGAAAAGG+AGG - Chr3:46008496-46008515 None:intergenic 45.0%
ATCGAACGCGGGAATTTCAT+TGG + Chr3:46008594-46008613 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
ATGCGGAATTGATCCTGAGA+AGG - Chr3:46008812-46008831 None:intergenic 45.0%
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG - Chr3:46008099-46008118 None:intergenic 45.0%
CACTTCTCCAGTCAACTGAT+TGG - Chr3:46009253-46009272 None:intergenic 45.0%
CAGGATCAATTCCGCATAGT+TGG + Chr3:46008815-46008834 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
CCATCCTCATTCTCTGTAGA+TGG - Chr3:46009609-46009628 None:intergenic 45.0%
CCATCTACAGAGAATGAGGA+TGG + Chr3:46009606-46009625 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
CTCACCTATCTTCAGCTTCA+GGG + Chr3:46008214-46008233 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCAGCCAATCAGTTGAC+TGG + Chr3:46009243-46009262 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
GACAGGTGAGAGAGTTGAAA+AGG - Chr3:46008499-46008518 None:intergenic 45.0%
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+TGG - Chr3:46008334-46008353 None:intergenic 45.0%
GATGTCACAACACTTAGCAG+TGG + Chr3:46008978-46008997 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
GGAACAATTCCGAAGACGAT+TGG + Chr3:46009336-46009355 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
GTCCACTGTGACAACATTAC+CGG + Chr3:46007710-46007729 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TATCTCGACATATCGAACGC+GGG + Chr3:46008583-46008602 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TCTCACCTATCTTCAGCTTC+AGG + Chr3:46008213-46008232 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TGGATTTGCAGCAGGTTTCT+GGG + Chr3:46009668-46009687 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TGTATGATGTTGACCCGGAT+AGG + Chr3:46009208-46009227 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TTCCGGTAATGTTGTCACAG+TGG - Chr3:46007715-46007734 None:intergenic 45.0%
TTGGATTTGCAGCAGGTTTC+TGG + Chr3:46009667-46009686 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TTGTATCTAGGGATGGGAGT+TGG + Chr3:46009648-46009667 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
TTGTCTTGCAACTCCTTCTC+AGG + Chr3:46008796-46008815 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
! AAGTGTTGTGACATCTCCAC+TGG - Chr3:46008973-46008992 None:intergenic 45.0%
! CAGTCAACTGATTGGCTGAA+AGG - Chr3:46009245-46009264 None:intergenic 45.0%
! GTAGATGGCAGTGCAGTTTT+AGG - Chr3:46009594-46009613 None:intergenic 45.0%
! GTCAAGTTGTAGACACAGTG+TGG - Chr3:46009111-46009130 None:intergenic 45.0%
!! GGGCAACTCAATGTTTTGGA+AGG + Chr3:46007773-46007792 MsG0380013810.01.T01:CDS 45.0%
AGAGGAGCTCCGCATAGTTT+AGG - Chr3:46009543-46009562 None:intergenic 50.0%
ATGGGAGTTGGATTTGCAGC+AGG + Chr3:46009660-46009679 MsG0380013810.01.T01:CDS 50.0%
GCTTCCCTGAAGCTGAAGAT+AGG - Chr3:46008221-46008240 None:intergenic 50.0%
GGATTTGCAGCAGGTTTCTG+GGG + Chr3:46009669-46009688 MsG0380013810.01.T01:CDS 50.0%
GGTCAATAGTTCGCCTATCC+GGG - Chr3:46009224-46009243 None:intergenic 50.0%
GTCATGCCTCCAATCGTCTT+CGG - Chr3:46009348-46009367 None:intergenic 50.0%
! GATTTGCAGCAGGTTTCTGG+GGG + Chr3:46009670-46009689 MsG0380013810.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTGACTGGAGAAGTGCCAT+TGG + Chr3:46009257-46009276 MsG0380013810.01.T01:CDS 50.0%
! GCAGGTTTCTGGGGGATTTG+CGG + Chr3:46009678-46009697 MsG0380013810.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 46007590 46009815 46007590 ID=MsG0380013810.01;Name=MsG0380013810.01
Chr3 mRNA 46007590 46009815 46007590 ID=MsG0380013810.01.T01;Parent=MsG0380013810.01;Name=MsG0380013810.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|741
Chr3 exon 46007590 46009815 46007590 ID=MsG0380013810.01.T01:exon:6304;Parent=MsG0380013810.01.T01
Chr3 CDS 46007590 46009815 46007590 ID=MsG0380013810.01.T01:cds;Parent=MsG0380013810.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380013810.01.T01

ATGTGTAGCAATCACACAATTGTTCGATGCAATGAGAAAGATCGAGAGACACTGTTAACCTTCAAACAGGGCATCAATGATATGTGGTTAACCGAAAAAGATTGTTGTGCTTGGGATGGAGTCCACTGTGACAACATTACCGGAAGAGTTACAAAACTTGATCTCAAAGCTAATTCTGTAGATGGGCAACTCAATGTTTTGGAAGGTGAGATGAATCTTTGTATTCTTGAACTTGAGTTTCTCAGTTACTTGGATTTGAGCTGGAATGATTTTGATGTGATAAGAATTCCATCCATTCAACATAACATCACACATTCCTCTAAACTTGTCTACCTTGACTTATCCAAAAATTATAATATTCACATGGATAATCTTGATTGGCTTTCTCCACTTTCTTCCTTAAAATATCTCAACCTTAGTTTGATTGATCTTCATAAGGAAACCAACTGGCTTCAAATAGTGAATACACTTCCTTCACTATTAGAATTACATTTGCTTGGATGTAACCTGAACAACTTCCCATCTGTTGAGTATTTGAATTTGTCTTCAATTGTAACTCTTGATCTTTCTTCAAACAACTTCACCTCTCATTTACCAAATGGGTTTTTTAATCTCACCAAAGATCTCACCTATCTTCAGCTTCAGGGAAGCAATATACATGGTGAGATACCTTCAAGCTTGCTAAACCTTCAAAATTTGAGACACCTTTATCTCTTTGATAACCAACTACAAGGATCAATTCCATCAACTCTAGGAAACCTCTCATCCTTAACTGATCTATCTATTGGCTCTAATAATTTCTCTGGTGAAATTTCAAATTTACATTTTTCCAAACTCTCTAGTTTAGATTGGCTAGACTTGAGTAATTCAAATTTTGTATTCCAATTTGATTTGGATTGGGTTCCTCCTTTTCAACTCTCTCACCTGTCATTGAGTAATACAAATCAAGGCCCAAACTTTCCATTTTGGATATATACACAGAAGTCACTGCAATATCTCGACATATCGAACGCGGGAATTTCATTGGTAGATAGAAATATGTTCTCGAGCCTTATAGAAAGAATAACATTTAGACTTTTTTTGTCAAACAATTCGATTGCTGAAGACATATCTAACCTAACACTAAATTGTTCCGAGTTATCTTTGGATCACAATAATTTCACAGGGGGACTCCCAAACATATCACCAATAGCCAGTTATGTTGATTTGTCTTGCAACTCCTTCTCAGGATCAATTCCGCATAGTTGGAAGAACTTATCAGAACTGATGGTCATGAACCTGTGGAATAATAAGCTGTCTGGAGAACTTCCATTGTACATCTCTAACTTGAAACAATTGCAGACCATGAACTTGGGAGAAAATGAATTTTCTGGAAACATACCAGTGGAGATGTCACAACACTTAGCAGTGGTCATATTGAGAGCCAATAAATTTGAAGGGATTATTCCACGACAATTATTCAATCTCTCTTATTTGTTTCACTTAGACCTTGCACATAACAAACTTTCTGGATCTTTGCCACACTGTGTCTACAACTTGACTCATATGGTTACTTATCATGTAAATAGATTGTCTTATTCTGCCACAATTGATTTATTTACCAAAGGTCAAGAATATGTGTATGATGTTGACCCGGATAGGCGAACTATTGACCTTTCAGCCAATCAGTTGACTGGAGAAGTGCCATTGGAATTGTTTCGGCTTGTTCAAGTTCGATCATTAAACTTATCTCACAATAGTTTCAATGGAACAATTCCGAAGACGATTGGAGGCATGACAAATATGGAATCTCTCGATCTCTCTAATAATAAGTTTTTTGGTGAAATTCCTCAAAGCATGGCTCTCTTAAACTTTTTGGAGGTGTTGAATTTATCTTGCAATAATTTTGATGGAAGAATCCCAATAGGAACTCAACTTCAAAGTTTTGATGCATCAAGTTATATTGGGAATCCTAAACTATGCGGAGCTCCTCTTAATAATTGTACCATAACAGAAGAAAATCCTAAAACTGCACTGCCATCTACAGAGAATGAGGATGGTGCATCTATAAAAGAATCATTGTATCTAGGGATGGGAGTTGGATTTGCAGCAGGTTTCTGGGGGATTTGCGGTTCTTTGTTTCTTATTAGGAAATGGAGGCATGCATACTTTAGGTTTATATATGGAGTGGGTGACAAGCTCTATGTTACTTTGATGGTAAAGTTAAATAGCTTTCGCAGAAATTGA
Protein sequence

>MsG0380013810.01.T01

MCSNHTIVRCNEKDRETLLTFKQGINDMWLTEKDCCAWDGVHCDNITGRVTKLDLKANSVDGQLNVLEGEMNLCILELEFLSYLDLSWNDFDVIRIPSIQHNITHSSKLVYLDLSKNYNIHMDNLDWLSPLSSLKYLNLSLIDLHKETNWLQIVNTLPSLLELHLLGCNLNNFPSVEYLNLSSIVTLDLSSNNFTSHLPNGFFNLTKDLTYLQLQGSNIHGEIPSSLLNLQNLRHLYLFDNQLQGSIPSTLGNLSSLTDLSIGSNNFSGEISNLHFSKLSSLDWLDLSNSNFVFQFDLDWVPPFQLSHLSLSNTNQGPNFPFWIYTQKSLQYLDISNAGISLVDRNMFSSLIERITFRLFLSNNSIAEDISNLTLNCSELSLDHNNFTGGLPNISPIASYVDLSCNSFSGSIPHSWKNLSELMVMNLWNNKLSGELPLYISNLKQLQTMNLGENEFSGNIPVEMSQHLAVVILRANKFEGIIPRQLFNLSYLFHLDLAHNKLSGSLPHCVYNLTHMVTYHVNRLSYSATIDLFTKGQEYVYDVDPDRRTIDLSANQLTGEVPLELFRLVQVRSLNLSHNSFNGTIPKTIGGMTNMESLDLSNNKFFGEIPQSMALLNFLEVLNLSCNNFDGRIPIGTQLQSFDASSYIGNPKLCGAPLNNCTITEENPKTALPSTENEDGASIKESLYLGMGVGFAAGFWGICGSLFLIRKWRHAYFRFIYGVGDKLYVTLMVKLNSFRRN*