AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480023733.01

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MsG0480023733.01.T01 AT1G18160 36.071 280 171 5 112 388 694 968 4.96e-51 185
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MsG0480023733.01.T01 AT2G42640 35.401 274 164 7 123 394 518 780 4.57e-48 175
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MsG0480023733.01.T01 AT3G06630 39.535 215 120 5 133 343 434 642 3.38e-47 171
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MsG0480023733.01.T01 AT1G16270 37.546 269 154 7 129 387 862 1126 4.66e-47 173
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MsG0480023733.01.T01 AT1G08720 37.751 249 147 5 125 370 661 904 6.69e-45 167
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MsG0480023733.01.T01 AT3G58760 34.601 263 144 9 146 388 234 488 1.97e-35 137
MsG0480023733.01.T01 AT5G54590 36.916 214 123 4 129 336 107 314 6.92e-35 134
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MsG0480023733.01.T01 AT5G54590 36.916 214 123 4 129 336 107 314 6.92e-35 134
MsG0480023733.01.T01 AT4G08500 32.016 253 162 6 136 384 336 582 7.82e-35 136
MsG0480023733.01.T01 AT5G58520 29.057 265 172 6 125 383 340 594 1.10e-34 135
MsG0480023733.01.T01 AT3G59110 28.125 384 222 13 55 391 89 465 3.43e-34 133
MsG0480023733.01.T01 AT5G07140 30.545 275 175 6 119 387 313 577 7.62e-34 133
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MsG0480023733.01.T01 AT3G06030 31.915 282 176 9 114 384 49 325 2.01e-33 132
MsG0480023733.01.T01 AT1G54960 30.739 257 168 6 136 384 71 325 2.04e-33 132
MsG0480023733.01.T01 AT1G54960 30.739 257 168 6 136 384 71 325 2.04e-33 132
MsG0480023733.01.T01 AT3G06630 37.838 185 105 5 133 313 434 612 3.27e-33 132
MsG0480023733.01.T01 AT5G62710 31.488 289 167 9 130 396 275 554 7.59e-33 130
MsG0480023733.01.T01 AT1G53570 30.435 253 168 5 136 384 217 465 7.99e-33 130
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MsG0480023733.01.T01 AT2G35620 31.034 290 164 11 130 396 301 577 6.72e-31 125
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MsG0480023733.01.T01 AT4G23230 31.597 288 164 10 132 394 336 615 3.90e-29 120
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MsG0480023733.01.T01 AT4G04490 34.597 211 122 8 128 329 335 538 5.47e-29 119
MsG0480023733.01.T01 AT4G23250 31.046 306 176 13 116 394 336 633 5.57e-29 120
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MsG0480023733.01.T01 AT1G50240 32.836 201 123 5 137 333 10 202 5.95e-29 120
MsG0480023733.01.T01 AT5G16500 30.061 326 167 11 122 404 63 370 5.96e-29 119
MsG0480023733.01.T01 AT1G30270 29.119 261 168 8 132 384 30 281 6.28e-29 118
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MsG0480023733.01.T01 AT3G07980 30.400 250 166 5 132 378 19 263 8.20e-29 119
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MsG0480023733.01.T01 AT3G24540 34.300 207 124 5 132 332 182 382 2.78e-27 113
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MsG0480023733.01.T01 AT1G09440 27.005 374 233 11 52 391 65 432 2.78e-27 113
MsG0480023733.01.T01 AT4G01330 28.671 286 175 8 139 401 168 447 2.83e-27 113
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MsG0480023733.01.T01 AT4G01330 28.881 277 168 8 139 392 168 438 3.15e-27 113
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MsG0480023733.01.T01 AT4G12020 29.134 254 165 7 136 384 1554 1797 3.21e-27 115
MsG0480023733.01.T01 AT1G29720 29.329 283 160 10 139 394 679 948 3.23e-27 115
MsG0480023733.01.T01 AT1G69220 29.644 253 158 8 141 384 230 471 3.53e-27 114
MsG0480023733.01.T01 AT4G12020 29.134 254 165 7 136 384 1621 1864 3.58e-27 115
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MsG0480023733.01.T01 AT3G09830 30.072 276 166 6 139 387 90 365 2.26e-26 110
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MsG0480023733.01.T01 AT1G34110 26.812 276 173 7 138 387 777 1049 3.63e-26 112
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MsG0480023733.01.T01 AT3G24790 29.897 291 172 8 123 387 37 321 4.02e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT3G24550 31.944 216 135 4 123 332 270 479 4.08e-26 111
MsG0480023733.01.T01 AT1G49100 28.364 275 170 7 134 387 582 850 4.11e-26 111
MsG0480023733.01.T01 AT5G66850 29.020 255 162 7 136 378 349 596 4.20e-26 111
MsG0480023733.01.T01 AT4G00960 31.280 211 129 5 140 340 63 267 4.42e-26 106
MsG0480023733.01.T01 AT4G34500 27.211 294 185 9 122 391 134 422 4.81e-26 109
MsG0480023733.01.T01 AT1G53420 29.964 277 165 8 139 392 630 900 5.08e-26 111
MsG0480023733.01.T01 AT3G17420 30.175 285 160 10 139 395 160 433 5.38e-26 109
MsG0480023733.01.T01 AT2G45490 28.692 237 155 7 124 356 15 241 5.70e-26 106
MsG0480023733.01.T01 AT4G23320 34.914 232 117 10 117 329 165 381 5.74e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT4G23320 34.914 232 117 10 117 329 165 381 5.74e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT1G06700 33.962 212 119 6 139 335 74 279 5.85e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G06700 33.962 212 119 6 139 335 74 279 5.85e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G06700 33.962 212 119 6 139 335 74 279 5.85e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT3G45420 31.604 212 132 5 140 345 357 561 6.20e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT5G25110 30.702 228 145 7 114 335 25 245 6.27e-26 109
MsG0480023733.01.T01 AT2G30730 33.014 209 119 6 139 332 63 265 6.61e-26 107
MsG0480023733.01.T01 AT3G49670 32.719 217 133 5 125 332 680 892 7.05e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT5G07280 35.149 202 117 6 139 332 923 1118 7.15e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT4G32830 32.407 216 133 6 124 336 24 229 7.49e-26 106
MsG0480023733.01.T01 AT4G23320 34.914 232 117 10 117 329 186 402 7.63e-26 109
MsG0480023733.01.T01 AT2G23200 27.972 286 177 9 140 402 495 774 8.69e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT1G70520 30.000 320 178 15 104 391 300 605 8.84e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT4G32000 29.021 286 176 8 136 399 175 455 8.91e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT4G32000 29.021 286 176 8 136 399 133 413 8.99e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT4G32000 29.021 286 176 8 136 399 132 412 9.15e-26 108
MsG0480023733.01.T01 AT2G30730 33.014 209 119 6 139 332 53 255 9.18e-26 107
MsG0480023733.01.T01 AT4G29050 27.027 259 153 7 123 371 348 580 9.74e-26 110
MsG0480023733.01.T01 AT4G21390 34.673 199 116 6 139 329 535 727 1.01e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT3G23750 32.283 254 156 7 85 329 533 779 1.02e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT2G28970 34.483 203 119 5 134 328 445 641 1.03e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT2G26290 27.385 325 196 8 101 391 51 369 1.04e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT4G00330 29.167 240 156 6 134 362 118 354 1.08e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT4G00330 29.167 240 156 6 134 362 118 354 1.08e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G72180 29.861 288 173 9 129 391 679 962 1.14e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT4G29050 27.027 259 153 7 123 371 334 566 1.17e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT4G21390 34.673 199 116 6 139 329 535 727 1.22e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT2G28940 29.814 322 179 12 106 387 73 387 1.29e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT2G28970 34.483 203 119 5 134 328 480 676 1.38e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT5G65700 32.258 217 134 5 125 332 684 896 1.39e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT5G65700 32.258 217 134 5 125 332 684 896 1.39e-25 110
MsG0480023733.01.T01 AT3G07070 28.916 332 189 10 93 387 32 353 1.49e-25 107
MsG0480023733.01.T01 AT3G14350 27.444 266 166 6 139 382 388 648 1.51e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT1G66460 32.051 234 127 8 122 334 145 367 1.62e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G66460 32.051 234 127 8 122 334 118 340 1.63e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT3G14350 27.444 266 166 6 139 382 425 685 1.68e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT5G42440 32.549 255 156 8 93 339 41 287 1.74e-25 107
MsG0480023733.01.T01 AT1G35710 27.799 259 167 7 142 383 860 1115 1.80e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT1G56120 27.986 293 184 7 131 403 542 827 1.86e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT4G00960 29.856 278 161 9 139 389 62 332 2.02e-25 107
MsG0480023733.01.T01 AT1G56140 28.070 285 178 7 139 403 699 976 2.04e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT1G51850 33.990 203 120 5 134 328 579 775 2.06e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT1G51850 33.990 203 120 5 134 328 559 755 2.07e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT3G13690 31.679 262 155 9 139 392 417 662 2.12e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT3G13690 31.679 262 155 9 139 392 417 662 2.12e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT3G13690 31.679 262 155 9 139 392 417 662 2.12e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT3G09010 32.653 196 118 5 142 329 55 244 2.24e-25 105
MsG0480023733.01.T01 AT2G33580 33.333 192 109 4 145 329 380 559 2.34e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G18390 28.322 286 175 8 122 383 327 606 2.40e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G52290 32.569 218 132 5 121 332 134 342 2.63e-25 106
MsG0480023733.01.T01 AT2G19190 29.694 229 146 4 134 356 575 794 2.65e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT2G01820 30.903 288 157 13 139 393 591 869 2.75e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT2G19210 31.188 202 127 4 134 329 577 772 2.76e-25 108
MsG0480023733.01.T01 AT1G56120 27.986 293 184 7 131 403 708 993 2.83e-25 109
MsG0480023733.01.T01 AT1G56120 27.986 293 184 7 131 403 690 975 2.84e-25 108

Find 159 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 296 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAAACATAGACTGGAAAATA+TGG 0.203734 4:-89131017 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
ACCTATGAAACGAACAATAT+TGG 0.222824 4:+89133294 None:intergenic
GTTATTCTTGTTGAGATCTA+TGG 0.240924 4:+89133843 None:intergenic
CCCAATATTGTTCGTTTCAT+AGG 0.257770 4:-89133295 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGAGGGGAACTGATCGGTTT+TGG 0.275204 4:+89133191 None:intergenic
TGATTTGAGGAAGCTAAATA+TGG 0.275402 4:-89133485 MsG0480023733.01.T01:CDS
ATAGCTTTGGGATTGTTCTC+TGG 0.279954 4:-89131346 MsG0480023733.01.T01:CDS
CTTGGGGTTGGATGGCTGTC+AGG 0.314717 4:-89130708 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
AACACTGTCGATTGACATAT+TGG 0.323931 4:+89133768 None:intergenic
TTGTTGTTGTGTGGCTTCTT+TGG 0.326378 4:-89134867 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR
GAACAATATTGGGATGCTTC+AGG 0.338891 4:+89133305 None:intergenic
CCTATGAAACGAACAATATT+GGG 0.350356 4:+89133295 None:intergenic
AAACAATCATTGGGCAAGAT+TGG 0.355736 4:+89131242 None:intergenic
AGGGATATTGACATTCTCTT+GGG 0.356134 4:-89130725 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
AAAGTGGATGTATATAGCTT+TGG 0.363857 4:-89131359 MsG0480023733.01.T01:CDS
TCAATCAAAATTGCTGACTT+TGG 0.379506 4:-89133055 MsG0480023733.01.T01:CDS
CTTCAGTTTGCACCTCAATC+CGG 0.386198 4:+89133026 None:intergenic
TAGCTTTGGGATTGTTCTCT+GGG 0.391334 4:-89131345 MsG0480023733.01.T01:CDS
AAGTGGATGTATATAGCTTT+GGG 0.395342 4:-89131358 MsG0480023733.01.T01:CDS
CAGAAACCAAATAAATAAAA+AGG 0.396275 4:+89130901 None:intergenic
ATTACAAATTACAAAAGAAA+AGG 0.396430 4:-89130623 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
TGCACCACACCATAGGTTTA+CGG 0.400377 4:+89133266 None:intergenic
GAGAACAGGCAAACAATCAT+TGG 0.411058 4:+89131232 None:intergenic
TATTGACATTCTCTTGGGGT+TGG 0.412225 4:-89130720 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
CAGGATCACTCCGCCGTCAT+TGG 0.412741 4:+89131068 None:intergenic
TGCACACAGTGCCAATCGTC+GGG 0.413887 4:-89133608 MsG0480023733.01.T01:CDS
TACTAATTCAAAAGACGGTT+CGG 0.415320 4:+89130874 None:intergenic
TTATTCTTGTTGAGATCTAT+GGG 0.415873 4:+89133844 None:intergenic
GCAAATGGTGGCCTAACATC+GGG 0.416586 4:+89131176 None:intergenic
CAACGGTATGTTCCAGTCTC+AGG 0.417218 4:+89132995 None:intergenic
ACTAGCTGTCAAACAAGCTT+TGG 0.427075 4:-89133167 MsG0480023733.01.T01:CDS
GATGGAACAACAATTTCAAC+AGG 0.427437 4:-89133347 MsG0480023733.01.T01:CDS
ATCACTCCGCCGTCATTGGT+TGG 0.427900 4:+89131072 None:intergenic
GATGATCCAACATGCGGGTA+TGG 0.428789 4:+89133668 None:intergenic
CAGGGATATTGACATTCTCT+TGG 0.429471 4:-89130726 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
TACATCAAAGGCTCAGTTGA+TGG 0.432172 4:-89133365 MsG0480023733.01.T01:CDS
GAAGAAATAGCAAAGTTTGA+AGG 0.433517 4:-89133915 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR
AACAATCATTGGGCAAGATT+GGG 0.433766 4:+89131243 None:intergenic
AAGAAGAAGAAGAATAGAAA+AGG 0.434406 4:+89134782 None:intergenic
CATGCGGGTATGGGAATCAT+TGG 0.435655 4:+89133678 None:intergenic
TCACTCCGCCGTCATTGGTT+GGG 0.436095 4:+89131073 None:intergenic
ACATCCACTTTCTGTGTGTA+AGG 0.437574 4:+89131371 None:intergenic
GTCATGATTTCACGGAGAAC+AGG 0.437608 4:+89131218 None:intergenic
ATTGCTACAATTTCAGCAAA+TGG 0.437698 4:+89131161 None:intergenic
GACATTCTCTTGGGGTTGGA+TGG 0.440318 4:-89130716 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
CTTTGGAGTCGCCCGGATTG+AGG 0.441952 4:-89133038 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTGTGTGGCTTCTTTGGTAC+GGG 0.442138 4:-89134861 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR
AACAATATTGGGATGCTTCA+GGG 0.442512 4:+89133306 None:intergenic
TCTACAGAGGTACTTACAAT+GGG 0.448336 4:-89133429 MsG0480023733.01.T01:CDS
GGATGTCGCTATCAAAATCT+TGG 0.451871 4:-89133404 MsG0480023733.01.T01:CDS
CAGTTCGGAAGGCCAGGTTC+AGG 0.453874 4:-89131106 MsG0480023733.01.T01:CDS
ATATGTCAATCGACAGTGTT+GGG 0.455678 4:-89133765 MsG0480023733.01.T01:CDS
AAACATAGACTGGAAAATAT+GGG 0.456088 4:-89131016 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
ATGGCATATGTTCACGGTCT+GGG 0.456155 4:-89133130 MsG0480023733.01.T01:CDS
GAAGGAATGACTCCTGAGAC+TGG 0.456816 4:-89133007 MsG0480023733.01.T01:CDS
GGTGGCCTAACATCGGGGTT+GGG 0.456902 4:+89131182 None:intergenic
CAAGCTTGTGGTAAAAGCCT+TGG 0.457728 4:+89133800 None:intergenic
TTCAGTTTGCACCTCAATCC+GGG 0.463348 4:+89133027 None:intergenic
GTGAAATCATGACTAGGTGC+TGG 0.464996 4:-89131208 MsG0480023733.01.T01:CDS
ACTGCTGTCATGTTCTGAAA+TGG 0.465482 4:+89131302 None:intergenic
GTTCTCTGGGAGCTCATCAC+TGG 0.469108 4:-89131332 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTACAAATTACAAAAGAAAA+GGG 0.469583 4:-89130622 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
GAAAGTTATAAAACATAGAC+TGG 0.470742 4:-89131026 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
GGGATCCCAACCCCGATGTT+AGG 0.474622 4:-89131187 MsG0480023733.01.T01:CDS
GTTGAGATCTATGGGGAACT+TGG 0.477808 4:+89133852 None:intergenic
AAGAGTGGACAATTGATTTG+AGG 0.480318 4:-89133498 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGCAACAGAATAGTTATCAT+TGG 0.483237 4:+89133627 None:intergenic
ACGGTCTGGGATTGATCCAC+AGG 0.486906 4:-89133117 MsG0480023733.01.T01:CDS
GGTTATGCAGCACCTGAACC+TGG 0.488468 4:+89131094 None:intergenic
ACAATTATGTATAGCTTCTG+AGG 0.489265 4:-89130819 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
CAAGAGAATGTCAATATCCC+TGG 0.490780 4:+89130727 None:intergenic
CTTGTTTGACAGCTAGTTTG+AGG 0.491526 4:+89133173 None:intergenic
TTGTTTGACAGCTAGTTTGA+GGG 0.492599 4:+89133174 None:intergenic
TCAACAGGAGGTTATGATGC+TGG 0.496495 4:-89133332 MsG0480023733.01.T01:CDS
AAGCTTGTGGTAAAAGCCTT+GGG 0.498981 4:+89133801 None:intergenic
TGACAACAGTTCGGAAGGCC+AGG 0.499831 4:-89131112 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGCTTTAGCTCAAGCACTGA+TGG 0.500620 4:-89133557 MsG0480023733.01.T01:CDS
TCGATTGATAACAGCAGTGT+TGG 0.501055 4:-89133703 MsG0480023733.01.T01:CDS
ATGATCCAACATGCGGGTAT+GGG 0.501935 4:+89133669 None:intergenic
ATGCTAAGGGTGGATCAGTT+CGG 0.508719 4:-89133231 MsG0480023733.01.T01:CDS
TCAGAACATGACAGCAGTAC+AGG 0.509444 4:-89131297 MsG0480023733.01.T01:CDS
CATGGCATATGTTCACGGTC+TGG 0.510456 4:-89133131 MsG0480023733.01.T01:CDS
GCTTGAAAGTGCCGAGATTG+AGG 0.511702 4:-89131138 MsG0480023733.01.T01:CDS
GTTGTGTGGCTTCTTTGGTA+CGG 0.513935 4:-89134862 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR
CAGGCCTTACACACAGAAAG+TGG 0.523131 4:-89131375 MsG0480023733.01.T01:CDS
AGGTGCATGCCGTAAACCTA+TGG 0.523849 4:-89133275 MsG0480023733.01.T01:CDS
AGAACAGGCAAACAATCATT+GGG 0.525436 4:+89131233 None:intergenic
TCTGTGTGTAAGGCCTGTGT+TGG 0.525639 4:+89131381 None:intergenic
CTCTTTACTAATTCAAAAGA+CGG 0.527078 4:+89130869 None:intergenic
AACAAGCAACGGTGGAGGAT+CGG 0.531804 4:-89133734 MsG0480023733.01.T01:CDS
CTCTACAGAGGTACTTACAA+TGG 0.532724 4:-89133430 MsG0480023733.01.T01:CDS
AGCACCTAGTCATGATTTCA+CGG 0.534035 4:+89131210 None:intergenic
GATTTGAGGAAGCTAAATAT+GGG 0.537670 4:-89133484 MsG0480023733.01.T01:CDS
CGATTGATAACAGCAGTGTT+GGG 0.538887 4:-89133702 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGGTGGCCTAACATCGGGGT+TGG 0.547170 4:+89131181 None:intergenic
TGTTGTCATGACCTCAATCT+CGG 0.550579 4:+89131127 None:intergenic
AGCAAATGGTGGCCTAACAT+CGG 0.552834 4:+89131175 None:intergenic
GACAATAGTTCTCCGACTGA+GGG 0.553217 4:-89133535 MsG0480023733.01.T01:CDS
ACCCGCATGTTGGATCATCA+AGG 0.555445 4:-89133664 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTGAGGTCATGACAACAGTT+CGG 0.556721 4:-89131121 MsG0480023733.01.T01:CDS
TATAGCTTCTGAGGGCAAGA+TGG 0.558486 4:-89130810 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
GGTTGCACTACAACTACCCC+AGG 0.559348 4:-89130745 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
CTAGTTTGAGGGGAACTGAT+CGG 0.559753 4:+89133185 None:intergenic
GGACAATAGTTCTCCGACTG+AGG 0.559865 4:-89133536 MsG0480023733.01.T01:CDS
AGTAACTCTTCCCCGACGAT+TGG 0.561825 4:+89133597 None:intergenic
GAGGAAGCTAAATATGGGTG+AGG 0.562331 4:-89133479 MsG0480023733.01.T01:CDS
CTGCATAACCCAACCAATGA+CGG 0.564619 4:-89131081 MsG0480023733.01.T01:CDS
CGGATTGAGGTGCAAACTGA+AGG 0.565981 4:-89133025 MsG0480023733.01.T01:CDS
AAGAGAATGTCAATATCCCT+GGG 0.566592 4:+89130728 None:intergenic
AGAGGCATGGCATATGTTCA+CGG 0.567632 4:-89133136 MsG0480023733.01.T01:CDS
AACATAGACTGGAAAATATG+GGG 0.569773 4:-89131015 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
GACTGGAACATACCGTTGGA+TGG 0.579378 4:-89132990 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTGCACACAGTGCCAATCGT+CGG 0.581092 4:-89133609 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTGCTGACTTTGGAGTCGCC+CGG 0.581302 4:-89133045 MsG0480023733.01.T01:CDS
CTGAGACTGGAACATACCGT+TGG 0.581845 4:-89132994 MsG0480023733.01.T01:CDS
GGGATATTGACATTCTCTTG+GGG 0.585541 4:-89130724 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
CATTGTTACTGAGTATGCTA+AGG 0.587270 4:-89133245 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGGTACCCTCACCAAGCTTG+TGG 0.587276 4:+89133788 None:intergenic
TGATTCCCATACCCGCATGT+TGG 0.592815 4:-89133674 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTTGGACGTTGCAAGAGGCA+TGG 0.592867 4:-89133149 MsG0480023733.01.T01:CDS
TTGCAAACAAGCAACGGTGG+AGG 0.594633 4:-89133739 MsG0480023733.01.T01:CDS
AATCATTGGGCAAGATTGGG+CGG 0.596277 4:+89131246 None:intergenic
GGGAGCTTGCAAACAAGCAA+CGG 0.601003 4:-89133745 MsG0480023733.01.T01:CDS
CAATTATGTATAGCTTCTGA+GGG 0.601905 4:-89130818 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
TGGATCATCAAGGGTTGAAG+AGG 0.604783 4:-89133654 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGAAATCATGACTAGGTGCT+GGG 0.605565 4:-89131207 MsG0480023733.01.T01:CDS
GCCTGAAAACGATACATCAA+AGG 0.606268 4:-89133377 MsG0480023733.01.T01:CDS
CCCTTGATGATCCAACATGC+GGG 0.607951 4:+89133663 None:intergenic
CCCGCATGTTGGATCATCAA+GGG 0.610368 4:-89133663 MsG0480023733.01.T01:CDS
ACCCTTGATGATCCAACATG+CGG 0.618280 4:+89133662 None:intergenic
AATATGTCAATCGACAGTGT+TGG 0.618529 4:-89133766 MsG0480023733.01.T01:CDS
CAAGCTTTGGACGTTGCAAG+AGG 0.618545 4:-89133154 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGTTTGACAGCTAGTTTGAG+GGG 0.622976 4:+89133175 None:intergenic
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TGTGGCTTCTTTGGTACGGG+AGG 0.636413 4:-89134858 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR
TTCAATACTTAAGTCAACAC+AGG 0.636541 4:-89134701 MsG0480023733.01.T01:intron
GTAACAATGCACCACACCAT+AGG 0.639708 4:+89133259 None:intergenic
GCTACAATTTCAGCAAATGG+TGG 0.639717 4:+89131164 None:intergenic
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CAGAGGTACTTACAATGGGG+AGG 0.655354 4:-89133425 MsG0480023733.01.T01:CDS
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AATCTTACGGAGCCATCCAA+CGG 0.659950 4:+89132978 None:intergenic
CGGTCTGGGATTGATCCACA+GGG 0.665585 4:-89133116 MsG0480023733.01.T01:CDS
TGTCAGATTTCAAGTCCCTG+TGG 0.682702 4:+89133101 None:intergenic
ACATAGACTGGAAAATATGG+GGG 0.685834 4:-89131014 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR
ATTGTTACTGAGTATGCTAA+GGG 0.687450 4:-89133244 MsG0480023733.01.T01:CDS
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TATTCTTGTTGAGATCTATG+GGG 0.701663 4:+89133845 None:intergenic
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CAAATGGTGGCCTAACATCG+GGG 0.711880 4:+89131177 None:intergenic
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AGAGAATGTCAATATCCCTG+GGG 0.782232 4:+89130729 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATTTTTTTTTTTTTTTTTA+TGG - Chr4:89131430-89131449 MsG0480023733.01.T01:intron 0.0%
!!! ATTTTATGATAATTAACTTT+TGG - Chr4:89133339-89133358 MsG0480023733.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTTGTAATTTGTAATTAAA+AGG + Chr4:89134867-89134886 None:intergenic 10.0%
!! AACTAAAAATGATTGATTAA+AGG + Chr4:89131085-89131104 None:intergenic 15.0%
!! ACAATAAAATAAGAAAGAAA+AGG + Chr4:89133761-89133780 None:intergenic 15.0%
!! ATATAATAAAACATGACATT+AGG - Chr4:89133555-89133574 MsG0480023733.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTACAAATTACAAAAGAAA+AGG - Chr4:89134871-89134890 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!! TAAACCTGAAATATTATTAT+TGG - Chr4:89131392-89131411 MsG0480023733.01.T01:CDS 15.0%
!! TTACAAATTACAAAAGAAAA+GGG - Chr4:89134872-89134891 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!!! TTTTTTTTACCTTCTTTTTA+GGG - Chr4:89133702-89133721 MsG0480023733.01.T01:CDS 15.0%
!! AAACATTAAAGAGAACAATT+AGG + Chr4:89131165-89131184 None:intergenic 20.0%
!! AAGAAAACAAGATAATCTTA+CGG + Chr4:89132532-89132551 None:intergenic 20.0%
!! ATATGATATACTGTTATGAT+AGG - Chr4:89133117-89133136 MsG0480023733.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGATTGATTAAAGGTAATA+AGG + Chr4:89131077-89131096 None:intergenic 20.0%
!! CAGAAACCAAATAAATAAAA+AGG + Chr4:89134596-89134615 None:intergenic 20.0%
!! GAAGGAAAAAAAAAAGTAAA+AGG + Chr4:89131257-89131276 None:intergenic 20.0%
!! TAACAGTATATCATATAATG+CGG + Chr4:89133113-89133132 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATTTGTTTGATTCACTT+TGG - Chr4:89133581-89133600 MsG0480023733.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTTTTTTTTACCTTCTTTTT+AGG - Chr4:89133701-89133720 MsG0480023733.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCCTTTTCTATTTTATATGA+GGG - Chr4:89131035-89131054 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! TGAAGACCTTTTTATTTATT+TGG - Chr4:89134587-89134606 MsG0480023733.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAGAAAAAATTGATGATGT+TGG - Chr4:89131311-89131330 MsG0480023733.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCCTTTTCTATTTTATATG+AGG - Chr4:89131034-89131053 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!!! TTTTTTTTTTCTTTCTTTCC+AGG - Chr4:89131526-89131545 MsG0480023733.01.T01:intron 20.0%
! AAAACATAGACTGGAAAATA+TGG - Chr4:89134477-89134496 MsG0480023733.01.T01:intron 25.0%
! AAACATAGACTGGAAAATAT+GGG - Chr4:89134478-89134497 MsG0480023733.01.T01:intron 25.0%
! AAGAAGAAGAAGAATAGAAA+AGG + Chr4:89130715-89130734 None:intergenic 25.0%
! AATTAGAAATCCTTTAGATG+AGG + Chr4:89130940-89130959 None:intergenic 25.0%
! ACCCATGATTAAAATATACT+CGG - Chr4:89133878-89133897 MsG0480023733.01.T01:exon 25.0%
! ACCCTCATATAAAATAGAAA+AGG + Chr4:89131039-89131058 None:intergenic 25.0%
! CTCTTTACTAATTCAAAAGA+CGG + Chr4:89134628-89134647 None:intergenic 25.0%
! GAAAGTTATAAAACATAGAC+TGG - Chr4:89134468-89134487 MsG0480023733.01.T01:intron 25.0%
! GCTTCCAATAATAATATTTC+AGG + Chr4:89131399-89131418 None:intergenic 25.0%
! TTATTCTTGTTGAGATCTAT+GGG + Chr4:89131653-89131672 None:intergenic 25.0%
!! ATCAAATCTGAAGCATAAAT+TGG + Chr4:89130911-89130930 None:intergenic 25.0%
!! CTCTTTTCAATTTTCATCAT+CGG - Chr4:89130763-89130782 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!! TCAAATCTGAAGCATAAATT+GGG + Chr4:89130910-89130929 None:intergenic 25.0%
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!!! AAATCTTTTGTTGTGTATGA+AGG - Chr4:89134724-89134743 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!!! AACCGAGTATATTTTAATCA+TGG + Chr4:89133883-89133902 None:intergenic 25.0%
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!!! ACCGAGTATATTTTAATCAT+GGG + Chr4:89133882-89133901 None:intergenic 25.0%
!!! CATGTTTTGGTACTTATTTT+GGG - Chr4:89133151-89133170 MsG0480023733.01.T01:CDS 25.0%
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!!! TCTTTCACTTTTCAGATTTT+AGG - Chr4:89130826-89130845 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! TTTTCCATATGCTTTTTAAC+AGG + Chr4:89134448-89134467 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTTATAGTTGCCATGA+TGG - Chr4:89133216-89133235 MsG0480023733.01.T01:CDS 25.0%
AAAGTGGATGTATATAGCTT+TGG - Chr4:89134135-89134154 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
AACATAGACTGGAAAATATG+GGG - Chr4:89134479-89134498 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
AAGTGGATGTATATAGCTTT+GGG - Chr4:89134136-89134155 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
ACAAATGCGAAATTCATAAC+TGG - Chr4:89134050-89134069 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
ACAATTATGTATAGCTTCTG+AGG - Chr4:89134675-89134694 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
ACCTATGAAACGAACAATAT+TGG + Chr4:89132203-89132222 None:intergenic 30.0%
ACTTGTCACCAAAAATCAAA+AGG + Chr4:89132420-89132439 None:intergenic 30.0%
AGAAAGAAAAGGATAGAAGA+TGG + Chr4:89133750-89133769 None:intergenic 30.0%
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ATTGCTACAATTTCAGCAAA+TGG + Chr4:89134336-89134355 None:intergenic 30.0%
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CAATTATGTATAGCTTCTGA+GGG - Chr4:89134676-89134695 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
CCTATGAAACGAACAATATT+GGG + Chr4:89132202-89132221 None:intergenic 30.0%
GAAGAAATAGCAAAGTTTGA+AGG - Chr4:89131579-89131598 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
GAGTAACTGTAATGATGTTT+AGG - Chr4:89133658-89133677 MsG0480023733.01.T01:CDS 30.0%
GATTTGAGGAAGCTAAATAT+GGG - Chr4:89132010-89132029 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
GTTATTCTTGTTGAGATCTA+TGG + Chr4:89131654-89131673 None:intergenic 30.0%
TAAATCTCCAATTCCTTGTT+AGG - Chr4:89133629-89133648 MsG0480023733.01.T01:CDS 30.0%
TACTAATTCAAAAGACGGTT+CGG + Chr4:89134623-89134642 None:intergenic 30.0%
TATTATGATACATCGTCAAC+TGG + Chr4:89133991-89134010 None:intergenic 30.0%
TATTCTTGTTGAGATCTATG+GGG + Chr4:89131652-89131671 None:intergenic 30.0%
TGATTTGAGGAAGCTAAATA+TGG - Chr4:89132009-89132028 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
TGCAACAGAATAGTTATCAT+TGG + Chr4:89131870-89131889 None:intergenic 30.0%
TTCAATACTTAAGTCAACAC+AGG - Chr4:89130793-89130812 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! ATGTTGCTGAAATCATGTTT+TGG - Chr4:89132597-89132616 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
! TGATCCTGTTAAAAAGCATA+TGG - Chr4:89134441-89134460 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
! TGATTTTCAACCTCATCTAA+AGG - Chr4:89130927-89130946 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TGTTGCTGAAATCATGTTTT+GGG - Chr4:89132598-89132617 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCTGCTATAATCCATCA+TGG + Chr4:89133233-89133252 None:intergenic 30.0%
!! AATTGATTTGATATGCGCTT+TGG - Chr4:89132570-89132589 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
!! CTAAGTGTTGATAACAAACT+AGG - Chr4:89132693-89132712 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
!! TCAATCAAAATTGCTGACTT+TGG - Chr4:89132439-89132458 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
!! TGATGTTGGTTTACTAAAAG+CGG - Chr4:89131325-89131344 MsG0480023733.01.T01:CDS 30.0%
!! TGATTCTTTTTCTGGAAATC+TGG - Chr4:89133281-89133300 MsG0480023733.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTGTTTAACTTTTTACCCT+TGG - Chr4:89133478-89133497 MsG0480023733.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATTGTGCTGCTTTCTTTTT+TGG - Chr4:89132792-89132811 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTTGTTGTTGTTGTTGTG+TGG - Chr4:89130618-89130637 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!!! GGCTCTTTTTTTCAAGAAAT+TGG - Chr4:89133172-89133191 MsG0480023733.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCTGACAACCTTTTGATTTT+TGG - Chr4:89132409-89132428 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTTCTTTCTTTCCAGG+TGG - Chr4:89131529-89131548 MsG0480023733.01.T01:intron 30.0%
AAACAATCATTGGGCAAGAT+TGG + Chr4:89134255-89134274 None:intergenic 35.0%
AACAAACTAGGTCAACATCA+TGG - Chr4:89132705-89132724 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
AACAATATTGGGATGCTTCA+GGG + Chr4:89132191-89132210 None:intergenic 35.0%
AACAATCATTGGGCAAGATT+GGG + Chr4:89134254-89134273 None:intergenic 35.0%
AAGAGAATGTCAATATCCCT+GGG + Chr4:89134769-89134788 None:intergenic 35.0%
AATATGTCAATCGACAGTGT+TGG - Chr4:89131728-89131747 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
ACATAGACTGGAAAATATGG+GGG - Chr4:89134480-89134499 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
AGAACAAAGCCCTAAAAAGA+AGG + Chr4:89133714-89133733 None:intergenic 35.0%
AGAACAGGCAAACAATCATT+GGG + Chr4:89134264-89134283 None:intergenic 35.0%
AGGGATATTGACATTCTCTT+GGG - Chr4:89134769-89134788 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
AGTGTGTATCATTTCTGTTC+AGG + Chr4:89132761-89132780 None:intergenic 35.0%
ATATGTCAATCGACAGTGTT+GGG - Chr4:89131729-89131748 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
ATGATACACACTGCTGAAAT+AGG - Chr4:89132769-89132788 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
CAAAGATAGAAGTCATGTTC+AGG + Chr4:89132841-89132860 None:intergenic 35.0%
CATTGTTACTGAGTATGCTA+AGG - Chr4:89132249-89132268 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
CCAATACGACAATAACTGTT+CGG - Chr4:89133832-89133851 MsG0480023733.01.T01:CDS 35.0%
CCCAATATTGTTCGTTTCAT+AGG - Chr4:89132199-89132218 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
CGAACAGTTATTGTCGTATT+GGG + Chr4:89133834-89133853 None:intergenic 35.0%
CTAAATGCCTAACAAGGAAT+TGG + Chr4:89133639-89133658 None:intergenic 35.0%
GAAATATCCTCTCGAATGAT+AGG - Chr4:89132938-89132957 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
GATGGAACAACAATTTCAAC+AGG - Chr4:89132147-89132166 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
GTTACTCTAAATGCCTAACA+AGG + Chr4:89133645-89133664 None:intergenic 35.0%
TAAAGGTAATAAGGTCGAGT+AGG + Chr4:89131068-89131087 None:intergenic 35.0%
TAACTACCAAAAGCTACCAA+GGG + Chr4:89133497-89133516 None:intergenic 35.0%
TTCTGCGAGTGAAAAAATGT+TGG - Chr4:89131610-89131629 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
TTTAAAGGCAACACATGGTA+AGG + Chr4:89133533-89133552 None:intergenic 35.0%
! AACACTGTCGATTGACATAT+TGG + Chr4:89131729-89131748 None:intergenic 35.0%
! AACTTTTACGATTTCTCCCA+AGG - Chr4:89131677-89131696 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
! ACATCGTCAACTGGATTTTA+GGG + Chr4:89133982-89134001 None:intergenic 35.0%
! CGATAGCTTGATTCTTTTTC+TGG - Chr4:89133273-89133292 MsG0480023733.01.T01:CDS 35.0%
! TACATCGTCAACTGGATTTT+AGG + Chr4:89133983-89134002 None:intergenic 35.0%
! TTGTTTGACAGCTAGTTTGA+GGG + Chr4:89132323-89132342 None:intergenic 35.0%
!! AAGAGTGGACAATTGATTTG+AGG - Chr4:89131996-89132015 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
!! CTTTTGTTGTGTATGAAGGT+TGG - Chr4:89134728-89134747 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
!! GGCTTGAAAATTTTGAAGAG+TGG - Chr4:89131981-89132000 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
!! GTTTGTTGTTTGCTGTAGTA+TGG - Chr4:89132814-89132833 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
!! TCTACAGAGGTACTTACAAT+GGG - Chr4:89132065-89132084 MsG0480023733.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTCTGGAAATCTGGTAGA+AGG - Chr4:89133288-89133307 MsG0480023733.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTACCCTTGGTAGCTTT+TGG - Chr4:89133488-89133507 MsG0480023733.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTGCTTTTAAGACATGTTT+TGG - Chr4:89133138-89133157 MsG0480023733.01.T01:CDS 35.0%
AAGCTTGTGGTAAAAGCCTT+GGG + Chr4:89131696-89131715 None:intergenic 40.0%
ACATCCACTTTCTGTGTGTA+AGG + Chr4:89134126-89134145 None:intergenic 40.0%
ACTAGCTGTCAAACAAGCTT+TGG - Chr4:89132327-89132346 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
AGAAAACTAGAAGACCGTTG+AGG - Chr4:89133247-89133266 MsG0480023733.01.T01:CDS 40.0%
AGAGAATGTCAATATCCCTG+GGG + Chr4:89134768-89134787 None:intergenic 40.0%
AGCACCTAGTCATGATTTCA+CGG + Chr4:89134287-89134306 None:intergenic 40.0%
AGTGAAAAAATGTTGGACGG+TGG - Chr4:89131617-89131636 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
CAAGAGAATGTCAATATCCC+TGG + Chr4:89134770-89134789 None:intergenic 40.0%
CAGGGATATTGACATTCTCT+TGG - Chr4:89134768-89134787 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
CCGAACAGTTATTGTCGTAT+TGG + Chr4:89133835-89133854 None:intergenic 40.0%
CGAATGATAGGCATGTCATA+TGG - Chr4:89132950-89132969 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
CTAACTACCAAAAGCTACCA+AGG + Chr4:89133498-89133517 None:intergenic 40.0%
GAACAATATTGGGATGCTTC+AGG + Chr4:89132192-89132211 None:intergenic 40.0%
GAGAACAGGCAAACAATCAT+TGG + Chr4:89134265-89134284 None:intergenic 40.0%
GATGTTTCTTGATCTGTGCA+GGG - Chr4:89134083-89134102 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
GCCTGAAAACGATACATCAA+AGG - Chr4:89132117-89132136 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
GCGAGTGAAAAAATGTTGGA+CGG - Chr4:89131614-89131633 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
GCTACAATTTCAGCAAATGG+TGG + Chr4:89134333-89134352 None:intergenic 40.0%
GGAACAACAATTTCAACAGG+AGG - Chr4:89132150-89132169 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
GGATGTCGCTATCAAAATCT+TGG - Chr4:89132090-89132109 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
GGCTGTCAGGCTTAAAAATT+CGG - Chr4:89134799-89134818 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
GGGATATTGACATTCTCTTG+GGG - Chr4:89134770-89134789 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TACATCAAAGGCTCAGTTGA+TGG - Chr4:89132129-89132148 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
TATTGACATTCTCTTGGGGT+TGG - Chr4:89134774-89134793 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TCACAAGGAAGCAACTTCAA+AGG + Chr4:89132896-89132915 None:intergenic 40.0%
TCGCTATCAAAATCTTGGAG+AGG - Chr4:89132095-89132114 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
TCTAGCACGGGATTAAATCT+TGG - Chr4:89132916-89132935 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
TGAAATCATGACTAGGTGCT+GGG - Chr4:89134287-89134306 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
TGCAAACTAAACTAACCACC+TGG + Chr4:89131547-89131566 None:intergenic 40.0%
TGTTGTCATGACCTCAATCT+CGG + Chr4:89134370-89134389 None:intergenic 40.0%
TTCTCCGTGAAATCATGACT+AGG - Chr4:89134280-89134299 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
TTGAGGTCATGACAACAGTT+CGG - Chr4:89134373-89134392 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
! CGATTGATAACAGCAGTGTT+GGG - Chr4:89131792-89131811 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
! CTTGTTTGACAGCTAGTTTG+AGG + Chr4:89132324-89132343 None:intergenic 40.0%
! CTTTTGCTCAAGGAGCTTTT+GGG - Chr4:89132038-89132057 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
! GCCTTTGATGTATCGTTTTC+AGG + Chr4:89132121-89132140 None:intergenic 40.0%
! TCGATTGATAACAGCAGTGT+TGG - Chr4:89131791-89131810 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
! TGTTTGACAGCTAGTTTGAG+GGG + Chr4:89132322-89132341 None:intergenic 40.0%
! TTGTTGTTGTGTGGCTTCTT+TGG - Chr4:89130627-89130646 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
!! AAATTTTCAAGCCCCTCAGT+CGG + Chr4:89131974-89131993 None:intergenic 40.0%
!! ACTGCTGTCATGTTCTGAAA+TGG + Chr4:89134195-89134214 None:intergenic 40.0%
!! ATAGCTTTGGGATTGTTCTC+TGG - Chr4:89134148-89134167 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
!! CTACAGAGGTACTTACAATG+GGG - Chr4:89132066-89132085 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
!! CTCTACAGAGGTACTTACAA+TGG - Chr4:89132064-89132083 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
!! CTTGGTAGCTTTTGGTAGTT+AGG - Chr4:89133496-89133515 MsG0480023733.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGCTTTGGGATTGTTCTCT+GGG - Chr4:89134149-89134168 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
!! TTTTACCACAAGCTTGGTGA+GGG - Chr4:89131701-89131720 MsG0480023733.01.T01:intron 40.0%
AATCATTGGGCAAGATTGGG+CGG + Chr4:89134251-89134270 None:intergenic 45.0%
AATCTTACGGAGCCATCCAA+CGG + Chr4:89132519-89132538 None:intergenic 45.0%
ACAATAGTTCTCCGACTGAG+GGG - Chr4:89131960-89131979 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
ACCATTGTGAGGTCTAAGGA+GGG + Chr4:89132990-89133009 None:intergenic 45.0%
AGCAAATGGTGGCCTAACAT+CGG + Chr4:89134322-89134341 None:intergenic 45.0%
ATCCACCATTGTGAGGTCTA+AGG + Chr4:89132994-89133013 None:intergenic 45.0%
ATGATCCAACATGCGGGTAT+GGG + Chr4:89131828-89131847 None:intergenic 45.0%
ATGCTAAGGGTGGATCAGTT+CGG - Chr4:89132263-89132282 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
ATGGCATATGTTCACGGTCT+GGG - Chr4:89132364-89132383 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
ATTGCAGACTGCATACTGAG+AGG + Chr4:89133083-89133102 None:intergenic 45.0%
CAAGCTTGTGGTAAAAGCCT+TGG + Chr4:89131697-89131716 None:intergenic 45.0%
CGATGTTTCTTGATCTGTGC+AGG - Chr4:89134082-89134101 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
CTAGTTTGAGGGGAACTGAT+CGG + Chr4:89132312-89132331 None:intergenic 45.0%
CTGCATAACCCAACCAATGA+CGG - Chr4:89134413-89134432 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
CTTCAGTTTGCACCTCAATC+CGG + Chr4:89132471-89132490 None:intergenic 45.0%
GAATCTTAAGCATGCCCACA+GGG - Chr4:89133363-89133382 MsG0480023733.01.T01:CDS 45.0%
GACAATAGTTCTCCGACTGA+GGG - Chr4:89131959-89131978 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
GAGGAAGCTAAATATGGGTG+AGG - Chr4:89132015-89132034 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
GGAAATCTGGTAGAAGGAAG+TGG - Chr4:89133294-89133313 MsG0480023733.01.T01:CDS 45.0%
GTAACAATGCACCACACCAT+AGG + Chr4:89132238-89132257 None:intergenic 45.0%
GTCATGATTTCACGGAGAAC+AGG + Chr4:89134279-89134298 None:intergenic 45.0%
GTGAAATCATGACTAGGTGC+TGG - Chr4:89134286-89134305 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
GTTACTGAGTATGCTAAGGG+TGG - Chr4:89132253-89132272 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
GTTGAGATCTATGGGGAACT+TGG + Chr4:89131645-89131664 None:intergenic 45.0%
GTTGTGTGGCTTCTTTGGTA+CGG - Chr4:89130632-89130651 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TAATCCCGTGCTAGATCACA+AGG + Chr4:89132911-89132930 None:intergenic 45.0%
TCAACAGGAGGTTATGATGC+TGG - Chr4:89132162-89132181 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
TCAAGCTATCGCAACCTCAA+CGG + Chr4:89133264-89133283 None:intergenic 45.0%
TCAGAACATGACAGCAGTAC+AGG - Chr4:89134197-89134216 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
TGAATCTTAAGCATGCCCAC+AGG - Chr4:89133362-89133381 MsG0480023733.01.T01:CDS 45.0%
TGACATGCCTATCATTCGAG+AGG + Chr4:89132948-89132967 None:intergenic 45.0%
TGCACCACACCATAGGTTTA+CGG + Chr4:89132231-89132250 None:intergenic 45.0%
TGCTTCCTTGTGATCTAGCA+CGG - Chr4:89132903-89132922 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
TGGATCATCAAGGGTTGAAG+AGG - Chr4:89131840-89131859 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
TTCAGTTTGCACCTCAATCC+GGG + Chr4:89132470-89132489 None:intergenic 45.0%
TTGTGTGGCTTCTTTGGTAC+GGG - Chr4:89130633-89130652 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
! ACAAAGCATCCACCATTGTG+AGG + Chr4:89133001-89133020 None:intergenic 45.0%
! ACCCTTGATGATCCAACATG+CGG + Chr4:89131835-89131854 None:intergenic 45.0%
! AGAGGCATGGCATATGTTCA+CGG - Chr4:89132358-89132377 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
! CAAGGCTTTTACCACAAGCT+TGG - Chr4:89131695-89131714 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
! CATACGACGCACGATTTTGA+AGG + Chr4:89131275-89131294 None:intergenic 45.0%
! GCTTTTGCTCAAGGAGCTTT+TGG - Chr4:89132037-89132056 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
! TATAGCTTCTGAGGGCAAGA+TGG - Chr4:89134684-89134703 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
! TGTCAGATTTCAAGTCCCTG+TGG + Chr4:89132396-89132415 None:intergenic 45.0%
!! CTTTTACCACAAGCTTGGTG+AGG - Chr4:89131700-89131719 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
!! GCTTTTGGGAAACTCTACAG+AGG - Chr4:89132052-89132071 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
!! TGCTTTAGCTCAAGCACTGA+TGG - Chr4:89131937-89131956 MsG0480023733.01.T01:intron 45.0%
!! AAAAAAAAAAAACTAAATAA+TGG + Chr4:89133201-89133220 None:intergenic 5.0%
!!! AAAAAATATATATTTTTTGA+TGG - Chr4:89132654-89132673 MsG0480023733.01.T01:intron 5.0%
!!! AAAATATATATTTTTTTCAT+TGG + Chr4:89132650-89132669 None:intergenic 5.0%
!!! AAATATATATTTTTTTCATT+GGG + Chr4:89132649-89132668 None:intergenic 5.0%
!!! TGTTTTATTATATTTTTTAA+AGG + Chr4:89133548-89133567 None:intergenic 5.0%
AACAAGCAACGGTGGAGGAT+CGG - Chr4:89131760-89131779 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
ACCCGCATGTTGGATCATCA+AGG - Chr4:89131830-89131849 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
ACCCTCCTTAGACCTCACAA+TGG - Chr4:89132986-89133005 MsG0480023733.01.T01:CDS 50.0%
AGCTTGCAAACAAGCAACGG+TGG - Chr4:89131752-89131771 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
AGGTGCATGCCGTAAACCTA+TGG - Chr4:89132219-89132238 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
AGTAACTCTTCCCCGACGAT+TGG + Chr4:89131900-89131919 None:intergenic 50.0%
CAAATGGTGGCCTAACATCG+GGG + Chr4:89134320-89134339 None:intergenic 50.0%
CAACGGTATGTTCCAGTCTC+AGG + Chr4:89132502-89132521 None:intergenic 50.0%
CACCATTGTGAGGTCTAAGG+AGG + Chr4:89132991-89133010 None:intergenic 50.0%
CAGGCCTTACACACAGAAAG+TGG - Chr4:89134119-89134138 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CATAACCCAACCAATGACGG+CGG - Chr4:89134416-89134435 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CATGCCGTAAACCTATGGTG+TGG - Chr4:89132224-89132243 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CATGCGGGTATGGGAATCAT+TGG + Chr4:89131819-89131838 None:intergenic 50.0%
CATGGCATATGTTCACGGTC+TGG - Chr4:89132363-89132382 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CCCGCATGTTGGATCATCAA+GGG - Chr4:89131831-89131850 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CGGATTGAGGTGCAAACTGA+AGG - Chr4:89132469-89132488 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CTCCTTAGACCTCACAATGG+TGG - Chr4:89132989-89133008 MsG0480023733.01.T01:CDS 50.0%
CTGAGACTGGAACATACCGT+TGG - Chr4:89132500-89132519 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
CTTAATCCTGCAAGCCCTGT+GGG + Chr4:89133380-89133399 None:intergenic 50.0%
GAAGGAATGACTCCTGAGAC+TGG - Chr4:89132487-89132506 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
GACATTCTCTTGGGGTTGGA+TGG - Chr4:89134778-89134797 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
GACTGGAACATACCGTTGGA+TGG - Chr4:89132504-89132523 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
GATGATCCAACATGCGGGTA+TGG + Chr4:89131829-89131848 None:intergenic 50.0%
GCAAATGGTGGCCTAACATC+GGG + Chr4:89134321-89134340 None:intergenic 50.0%
GCTTCCTTGTGATCTAGCAC+GGG - Chr4:89132904-89132923 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
GGACAATAGTTCTCCGACTG+AGG - Chr4:89131958-89131977 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
GGGAGCTTGCAAACAAGCAA+CGG - Chr4:89131749-89131768 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
GGTCATGACAACAGTTCGGA+AGG - Chr4:89134377-89134396 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
GTTGCACTACAACTACCCCA+GGG - Chr4:89134750-89134769 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
TACTGAGAGGCTTCAGCTCA+AGG + Chr4:89133070-89133089 None:intergenic 50.0%
TCTGTGTGTAAGGCCTGTGT+TGG + Chr4:89134116-89134135 None:intergenic 50.0%
TCTTAATCCTGCAAGCCCTG+TGG + Chr4:89133381-89133400 None:intergenic 50.0%
TGATTCCCATACCCGCATGT+TGG - Chr4:89131820-89131839 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
TTGCAAACAAGCAACGGTGG+AGG - Chr4:89131755-89131774 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
TTGCACACAGTGCCAATCGT+CGG - Chr4:89131885-89131904 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
TTTGGACGTTGCAAGAGGCA+TGG - Chr4:89132345-89132364 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
! ATGGGTGAGGCTTTTGCTCA+AGG - Chr4:89132028-89132047 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
! CCCTTGATGATCCAACATGC+GGG + Chr4:89131834-89131853 None:intergenic 50.0%
!! AACTGATCGGTTTTGGCGCT+TGG + Chr4:89132299-89132318 None:intergenic 50.0%
!! CAAGCTTTGGACGTTGCAAG+AGG - Chr4:89132340-89132359 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
!! CAGAGGTACTTACAATGGGG+AGG - Chr4:89132069-89132088 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
!! GCTTGAAAGTGCCGAGATTG+AGG - Chr4:89134356-89134375 MsG0480023733.01.T01:intron 50.0%
!! TGAGGGGAACTGATCGGTTT+TGG + Chr4:89132306-89132325 None:intergenic 50.0%
ATCACTCCGCCGTCATTGGT+TGG + Chr4:89134425-89134444 None:intergenic 55.0%
GCAGGGAGATGATCCAACAC+AGG - Chr4:89134100-89134119 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
GCTCAAGGCATGACATACGC+TGG + Chr4:89133055-89133074 None:intergenic 55.0%
GGTTATGCAGCACCTGAACC+TGG + Chr4:89134403-89134422 None:intergenic 55.0%
GGTTGCACTACAACTACCCC+AGG - Chr4:89134749-89134768 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
TGACAACAGTTCGGAAGGCC+AGG - Chr4:89134382-89134401 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
TGCACACAGTGCCAATCGTC+GGG - Chr4:89131886-89131905 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
TGGTACCCTCACCAAGCTTG+TGG + Chr4:89131709-89131728 None:intergenic 55.0%
TGTGGCTTCTTTGGTACGGG+AGG - Chr4:89130636-89130655 MsG0480023733.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
! ACGGTCTGGGATTGATCCAC+AGG - Chr4:89132377-89132396 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
! CGGTCTGGGATTGATCCACA+GGG - Chr4:89132378-89132397 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
! GTTCTCTGGGAGCTCATCAC+TGG - Chr4:89134162-89134181 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
! TCACTCCGCCGTCATTGGTT+GGG + Chr4:89134424-89134443 None:intergenic 55.0%
!! TTGCTGACTTTGGAGTCGCC+CGG - Chr4:89132449-89132468 MsG0480023733.01.T01:intron 55.0%
CAGGATCACTCCGCCGTCAT+TGG + Chr4:89134429-89134448 None:intergenic 60.0%
CAGTTCGGAAGGCCAGGTTC+AGG - Chr4:89134388-89134407 MsG0480023733.01.T01:intron 60.0%
CTTGGGGTTGGATGGCTGTC+AGG - Chr4:89134786-89134805 MsG0480023733.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
GCACACAGTGCCAATCGTCG+GGG - Chr4:89131887-89131906 MsG0480023733.01.T01:intron 60.0%
GGGATCCCAACCCCGATGTT+AGG - Chr4:89134307-89134326 MsG0480023733.01.T01:intron 60.0%
GGTGGCCTAACATCGGGGTT+GGG + Chr4:89134315-89134334 None:intergenic 60.0%
TGGTGGCCTAACATCGGGGT+TGG + Chr4:89134316-89134335 None:intergenic 60.0%
!! CTTTGGAGTCGCCCGGATTG+AGG - Chr4:89132456-89132475 MsG0480023733.01.T01:intron 60.0%
AGCATGCCCACAGGGCTTGC+AGG - Chr4:89133371-89133390 MsG0480023733.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 89130612 89134904 89130612 ID=MsG0480023733.01;Name=MsG0480023733.01
Chr4 mRNA 89130612 89134904 89130612 ID=MsG0480023733.01.T01;Parent=MsG0480023733.01;Name=MsG0480023733.01.T01;_AED=0.41;_eAED=0.41;_QI=281|1|1|1|0.5|0.33|3|461|414
Chr4 exon 89130612 89131412 89130612 ID=MsG0480023733.01.T01:exon:12457;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 exon 89132986 89133968 89132986 ID=MsG0480023733.01.T01:exon:12456;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 exon 89134702 89134904 89134702 ID=MsG0480023733.01.T01:exon:12455;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 five_prime_UTR 89134702 89134904 89134702 ID=MsG0480023733.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 five_prime_UTR 89133891 89133968 89133891 ID=MsG0480023733.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 CDS 89132986 89133890 89132986 ID=MsG0480023733.01.T01:cds;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 CDS 89131073 89131412 89131073 ID=MsG0480023733.01.T01:cds;Parent=MsG0480023733.01.T01
Chr4 three_prime_UTR 89130612 89131072 89130612 ID=MsG0480023733.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0480023733.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480023733.01.T01

ATGTTGGACGGTGGCGCCAAGTTCCCCATAGATCTCAACAAGAATAACAACAACTTTTACGATTTCTCCCAAGGCTTTTACCACAAGCTTGGTGAGGGTACCAATATGTCAATCGACAGTGTTGGGAGCTTGCAAACAAGCAACGGTGGAGGATCGGTTGCAATGTCGATTGATAACAGCAGTGTTGGGTCCAATGATTCCCATACCCGCATGTTGGATCATCAAGGGTTGAAGAGGCGTGCCAATGATAACTATTCTGTTGCACACAGTGCCAATCGTCGGGGAAGAGTTACTCATGCATTGAGTGACGATGCTTTAGCTCAAGCACTGATGGACAATAGTTCTCCGACTGAGGGGCTTGAAAATTTTGAAGAGTGGACAATTGATTTGAGGAAGCTAAATATGGGTGAGGCTTTTGCTCAAGGAGCTTTTGGGAAACTCTACAGAGGTACTTACAATGGGGAGGATGTCGCTATCAAAATCTTGGAGAGGCCTGAAAACGATACATCAAAGGCTCAGTTGATGGAACAACAATTTCAACAGGAGGTTATGATGCTGGCTACCCTGAAGCATCCCAATATTGTTCGTTTCATAGGTGCATGCCGTAAACCTATGGTGTGGTGCATTGTTACTGAGTATGCTAAGGGTGGATCAGTTCGGCAGTTCTTAACCAAGCGCCAAAACCGATCAGTTCCCCTCAAACTAGCTGTCAAACAAGCTTTGGACGTTGCAAGAGGCATGGCATATGTTCACGGTCTGGGATTGATCCACAGGGACTTGAAATCTGACAACCTTTTGATTTTTGGTGACAAGTCAATCAAAATTGCTGACTTTGGAGTCGCCCGGATTGAGGTGCAAACTGAAGGAATGACTCCTGAGACTGGAACATACCGTTGGATGGCTCCGGAGATGATCCAACACAGGCCTTACACACAGAAAGTGGATGTATATAGCTTTGGGATTGTTCTCTGGGAGCTCATCACTGGTATGCTTCCATTTCAGAACATGACAGCAGTACAGGCAGCATTTGCAGTTGTCAACAGAAATGTCCGCCCAATCTTGCCCAATGATTGTTTGCCTGTTCTCCGTGAAATCATGACTAGGTGCTGGGATCCCAACCCCGATGTTAGGCCACCATTTGCTGAAATTGTAGCAATGCTTGAAAGTGCCGAGATTGAGGTCATGACAACAGTTCGGAAGGCCAGGTTCAGGTGCTGCATAACCCAACCAATGACGGCGGAGTGA
Protein sequence

>MsG0480023733.01.T01

MLDGGAKFPIDLNKNNNNFYDFSQGFYHKLGEGTNMSIDSVGSLQTSNGGGSVAMSIDNSSVGSNDSHTRMLDHQGLKRRANDNYSVAHSANRRGRVTHALSDDALAQALMDNSSPTEGLENFEEWTIDLRKLNMGEAFAQGAFGKLYRGTYNGEDVAIKILERPENDTSKAQLMEQQFQQEVMMLATLKHPNIVRFIGACRKPMVWCIVTEYAKGGSVRQFLTKRQNRSVPLKLAVKQALDVARGMAYVHGLGLIHRDLKSDNLLIFGDKSIKIADFGVARIEVQTEGMTPETGTYRWMAPEMIQHRPYTQKVDVYSFGIVLWELITGMLPFQNMTAVQAAFAVVNRNVRPILPNDCLPVLREIMTRCWDPNPDVRPPFAEIVAMLESAEIEVMTTVRKARFRCCITQPMTAE*