AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001540.01

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MsG0180001540.01.T01 AT2G36980 21.205 415 229 11 31 382 44 423 1.14e-16 83.6
MsG0180001540.01.T01 AT2G36980 23.939 330 216 10 238 551 2 312 1.12e-13 74.3
MsG0180001540.01.T01 AT1G11290 28.376 659 384 10 41 614 75 730 8.19e-99 320
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MsG0180001540.01.T01 AT4G39530 27.181 298 170 6 188 443 76 368 1.07e-28 122
MsG0180001540.01.T01 AT4G39530 22.193 374 199 9 25 306 375 748 9.78e-18 87.8
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MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 49 709 4.90e-96 310
MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 49 709 4.90e-96 310
MsG0180001540.01.T01 AT1G13410 35.613 424 270 3 174 596 42 463 9.05e-96 302
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MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 113 773 1.25e-95 311
MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 113 773 1.25e-95 311
MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 113 773 1.25e-95 311
MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 104 764 1.32e-95 310
MsG0180001540.01.T01 AT2G33680 30.104 671 362 11 35 608 124 784 2.08e-95 310
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MsG0180001540.01.T01 AT5G37570 27.434 226 142 7 47 250 281 506 6.98e-15 78.2
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MsG0180001540.01.T01 AT2G20540 26.050 357 233 11 11 346 124 470 8.38e-27 115
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MsG0180001540.01.T01 AT1G05750 34.232 482 281 8 122 594 29 483 7.56e-90 287
MsG0180001540.01.T01 AT1G05750 28.212 397 217 10 42 377 43 432 5.26e-30 124
MsG0180001540.01.T01 AT1G05750 25.556 360 213 9 95 402 33 389 7.70e-30 124
MsG0180001540.01.T01 AT1G05750 28.479 309 189 9 39 321 144 446 4.33e-21 97.4
MsG0180001540.01.T01 AT3G15930 32.007 578 324 10 49 585 82 631 8.40e-90 293
MsG0180001540.01.T01 AT3G15930 25.152 330 223 11 39 350 275 598 5.62e-22 100
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MsG0180001540.01.T01 AT3G53360 27.690 632 367 9 39 583 106 734 1.19e-89 294
MsG0180001540.01.T01 AT3G53360 22.479 605 396 16 17 554 5 603 2.47e-39 154
MsG0180001540.01.T01 AT3G24000 33.481 451 256 6 174 585 79 524 1.34e-89 291
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MsG0180001540.01.T01 AT3G24000 25.723 346 199 8 39 330 99 440 5.05e-25 110
MsG0180001540.01.T01 AT3G24000 24.242 297 181 9 20 301 180 447 1.40e-15 80.9
MsG0180001540.01.T01 AT3G24000 27.419 186 115 5 323 500 63 236 3.12e-14 76.3
MsG0180001540.01.T01 AT3G13770 32.008 528 310 8 119 600 10 534 4.63e-89 289
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MsG0180001540.01.T01 AT2G22410 26.482 253 180 4 265 515 99 347 3.67e-22 101
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MsG0180001540.01.T01 AT5G44230 24.501 351 212 9 39 371 188 503 5.61e-24 107
MsG0180001540.01.T01 AT5G44230 26.377 345 202 15 32 337 243 574 3.94e-16 82.4
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MsG0180001540.01.T01 AT3G49170 22.887 485 280 13 48 442 216 696 1.24e-32 134
MsG0180001540.01.T01 AT3G49170 24.603 378 196 7 43 331 313 690 1.63e-27 118
MsG0180001540.01.T01 AT3G49170 28.095 210 134 5 39 231 443 652 1.45e-17 87.4
MsG0180001540.01.T01 AT3G49170 24.615 195 143 4 310 501 51 244 4.95e-12 69.7
MsG0180001540.01.T01 AT5G65570 31.362 558 320 11 99 604 100 646 2.34e-84 279
MsG0180001540.01.T01 AT5G65570 23.918 439 245 10 49 401 113 548 3.87e-25 111
MsG0180001540.01.T01 AT2G40720 31.942 551 319 8 100 601 309 852 4.81e-84 281
MsG0180001540.01.T01 AT2G40720 26.446 605 336 16 49 552 109 705 2.09e-39 155
MsG0180001540.01.T01 AT2G40720 22.796 465 321 14 65 499 94 550 8.46e-26 113
MsG0180001540.01.T01 AT2G40720 25.507 345 193 12 295 590 35 364 1.85e-13 74.3
MsG0180001540.01.T01 AT5G48910 32.231 484 286 9 148 599 78 551 5.30e-84 276
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MsG0180001540.01.T01 AT5G48910 24.390 410 225 11 51 402 75 457 6.78e-29 122
MsG0180001540.01.T01 AT5G48910 27.055 292 166 6 261 507 67 356 8.01e-27 115
MsG0180001540.01.T01 AT5G48910 25.589 297 170 7 39 284 212 508 1.05e-20 97.1
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MsG0180001540.01.T01 AT1G74630 21.569 306 173 5 266 508 67 368 5.10e-13 72.4
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MsG0180001540.01.T01 AT3G22150 28.615 657 368 13 21 581 132 783 3.56e-82 275
MsG0180001540.01.T01 AT3G22150 23.346 544 321 18 21 519 22 514 3.67e-31 130
MsG0180001540.01.T01 AT3G22150 20.309 453 306 14 167 597 46 465 1.15e-15 81.3
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MsG0180001540.01.T01 AT4G18840 26.513 347 235 6 88 420 165 505 4.47e-35 140
MsG0180001540.01.T01 AT4G18840 28.000 350 226 9 39 369 179 521 7.22e-34 136
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MsG0180001540.01.T01 AT3G04750 24.514 257 171 9 46 282 282 535 3.76e-16 82.4
MsG0180001540.01.T01 AT3G04750 30.000 170 109 6 268 435 83 244 5.55e-12 69.3
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MsG0180001540.01.T01 AT1G56570 30.093 535 320 10 95 579 42 572 1.35e-80 266
MsG0180001540.01.T01 AT1G56570 23.545 378 199 12 48 338 58 432 1.96e-26 114
MsG0180001540.01.T01 AT1G56570 25.000 276 144 10 33 250 246 516 1.15e-15 80.9
MsG0180001540.01.T01 AT1G56570 30.093 535 320 10 95 579 42 572 1.35e-80 266
MsG0180001540.01.T01 AT1G56570 23.545 378 199 12 48 338 58 432 1.96e-26 114
MsG0180001540.01.T01 AT1G56570 25.000 276 144 10 33 250 246 516 1.15e-15 80.9
MsG0180001540.01.T01 AT3G08820 29.887 532 313 8 120 599 67 590 7.00e-80 266
MsG0180001540.01.T01 AT4G20770 27.787 601 361 10 30 569 178 766 8.32e-80 268
MsG0180001540.01.T01 AT4G20770 24.096 581 325 15 30 508 36 602 4.61e-48 180
MsG0180001540.01.T01 AT3G26782 30.483 538 310 10 120 598 31 563 2.86e-79 264
MsG0180001540.01.T01 AT3G26782 23.590 390 174 9 63 362 108 463 1.14e-19 93.6
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MsG0180001540.01.T01 AT1G33350 25.705 319 192 8 98 403 161 447 1.96e-24 108
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MsG0180001540.01.T01 AT2G42920 29.060 351 217 9 49 374 137 480 1.92e-33 135
MsG0180001540.01.T01 AT2G42920 26.712 292 184 8 39 305 196 482 5.96e-22 100
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MsG0180001540.01.T01 AT3G63370 27.690 632 366 10 39 583 221 848 2.15e-75 259
MsG0180001540.01.T01 AT3G63370 24.340 530 311 18 46 506 59 567 1.05e-31 132
MsG0180001540.01.T01 AT3G62890 35.121 373 235 4 226 593 101 471 2.61e-75 251
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MsG0180001540.01.T01 AT2G46050 23.906 297 198 9 47 320 288 579 1.42e-14 77.4
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MsG0180001540.01.T01 AT3G14330 24.621 264 178 5 39 281 275 538 2.81e-16 83.2
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MsG0180001540.01.T01 AT1G04840 24.933 373 243 11 1 344 122 486 3.99e-26 114
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MsG0180001540.01.T01 AT5G08490 28.405 602 384 10 31 600 259 845 4.89e-74 254
MsG0180001540.01.T01 AT5G08490 20.976 615 351 16 18 505 41 647 1.82e-29 124
MsG0180001540.01.T01 AT5G08490 22.610 544 325 14 71 557 61 565 6.51e-28 120
MsG0180001540.01.T01 AT5G08490 28.405 602 384 10 31 600 259 845 4.89e-74 254
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MsG0180001540.01.T01 AT1G03540 27.861 603 357 13 28 566 19 607 7.50e-74 248
MsG0180001540.01.T01 AT3G05240 31.923 520 305 12 82 566 57 562 7.99e-74 247
MsG0180001540.01.T01 AT3G05240 28.571 252 167 6 265 508 53 299 2.92e-23 104
MsG0180001540.01.T01 AT3G05240 24.646 353 223 6 7 327 124 465 7.19e-23 103
MsG0180001540.01.T01 AT3G05240 27.155 232 120 5 49 231 265 496 3.62e-17 85.5
MsG0180001540.01.T01 AT4G21065 30.067 449 266 8 210 614 72 516 1.03e-73 248
MsG0180001540.01.T01 AT4G21065 24.650 357 214 9 117 422 72 424 2.19e-26 114
MsG0180001540.01.T01 AT4G21065 26.908 249 131 6 49 248 170 416 3.70e-18 88.6
MsG0180001540.01.T01 AT4G14050 31.663 439 256 8 169 599 61 463 1.78e-73 246
MsG0180001540.01.T01 AT4G14050 27.193 342 193 9 49 335 66 406 4.62e-31 128
MsG0180001540.01.T01 AT4G14050 25.886 367 188 10 99 452 88 383 1.65e-27 117
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MsG0180001540.01.T01 AT5G40405 28.105 306 204 9 135 429 149 449 4.61e-25 110
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MsG0180001540.01.T01 AT4G19220 27.697 621 351 9 39 567 330 944 3.69e-73 253
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MsG0180001540.01.T01 AT1G69350 24.138 551 355 16 31 557 26 537 5.18e-40 156
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MsG0180001540.01.T01 AT4G21065 24.806 258 151 5 205 422 37 291 1.31e-22 101
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MsG0180001540.01.T01 AT1G74600 24.266 511 295 16 56 505 51 530 1.05e-34 141
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MsG0180001540.01.T01 AT1G50270 28.037 214 134 8 314 519 98 299 4.41e-11 66.2
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MsG0180001540.01.T01 AT1G28690 29.654 462 296 9 108 564 79 516 4.50e-70 236
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MsG0180001540.01.T01 AT1G14470 30.374 428 247 11 120 506 62 479 2.34e-54 194
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MsG0180001540.01.T01 AT5G50390 30.426 493 292 8 144 588 102 591 1.91e-67 233
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MsG0180001540.01.T01 AT3G50420 26.203 187 127 6 257 434 26 210 4.01e-13 73.2
MsG0180001540.01.T01 AT5G42450 32.632 380 236 5 207 581 43 407 5.36e-65 220
MsG0180001540.01.T01 AT5G42450 27.148 291 167 11 51 298 43 331 7.33e-16 80.9
MsG0180001540.01.T01 AT1G09190 30.769 455 279 10 117 565 55 479 5.60e-65 221
MsG0180001540.01.T01 AT1G09190 25.161 310 190 5 103 402 142 419 1.07e-26 114
MsG0180001540.01.T01 AT1G09190 28.261 276 146 7 49 273 151 425 1.74e-23 104
MsG0180001540.01.T01 AT1G09190 29.839 248 124 7 39 236 172 419 8.84e-21 96.3
MsG0180001540.01.T01 AT4G15720 29.386 456 275 6 190 600 63 516 7.49e-65 224
MsG0180001540.01.T01 AT4G15720 30.303 297 154 7 104 348 70 365 2.94e-28 120
MsG0180001540.01.T01 AT4G15720 26.149 348 187 9 5 282 19 366 1.40e-21 99.8
MsG0180001540.01.T01 AT2G17210 26.480 642 371 15 49 599 96 727 2.00e-64 226
MsG0180001540.01.T01 AT2G17210 21.637 342 182 8 38 293 286 627 1.20e-22 103
MsG0180001540.01.T01 AT2G17210 26.022 269 186 9 235 500 65 323 2.21e-16 83.6
MsG0180001540.01.T01 AT1G71420 28.780 549 327 12 82 574 79 619 2.72e-64 225
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MsG0180001540.01.T01 AT3G56550 28.637 433 280 6 169 583 48 469 2.42e-61 214
MsG0180001540.01.T01 AT3G56550 24.304 395 273 11 82 456 55 443 3.23e-25 110
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MsG0180001540.01.T01 AT5G50990 32.402 358 236 3 257 613 102 454 1.27e-60 211
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MsG0180001540.01.T01 AT1G64310 22.356 416 235 15 47 391 153 551 7.94e-18 87.4
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MsG0180001540.01.T01 AT1G22830 25.182 548 320 9 97 558 118 661 1.50e-56 203
MsG0180001540.01.T01 AT1G26900 26.953 512 303 11 114 568 75 572 2.98e-56 200
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MsG0180001540.01.T01 AT1G59720 27.953 254 158 6 98 330 186 435 1.59e-17 87.0
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MsG0180001540.01.T01 AT1G59720 23.750 240 131 5 49 236 200 439 1.73e-13 73.9
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MsG0180001540.01.T01 AT5G66500 25.076 331 204 9 84 370 105 435 2.13e-23 104
MsG0180001540.01.T01 AT3G26630 30.591 389 238 7 104 488 58 418 7.52e-55 193
MsG0180001540.01.T01 AT3G26630 27.492 331 212 5 31 339 48 372 3.44e-28 118
MsG0180001540.01.T01 AT4G14170 29.257 417 250 6 190 565 65 477 1.80e-52 187
MsG0180001540.01.T01 AT4G14170 24.010 404 235 13 98 442 66 456 7.39e-21 96.7
MsG0180001540.01.T01 AT4G14170 23.934 305 199 8 95 377 166 459 3.94e-17 85.1
MsG0180001540.01.T01 AT1G71460 30.254 433 246 9 97 478 248 675 2.09e-52 191
MsG0180001540.01.T01 AT1G71460 27.494 411 244 7 95 454 143 550 1.49e-36 145
MsG0180001540.01.T01 AT1G71460 25.692 253 181 5 259 508 152 400 1.45e-18 90.1
MsG0180001540.01.T01 AT1G71460 22.300 426 209 6 49 352 263 688 5.33e-17 85.5
MsG0180001540.01.T01 AT1G71460 25.854 205 139 6 301 500 93 289 5.96e-12 69.3
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MsG0180001540.01.T01 AT3G58590 23.177 384 245 5 96 433 47 426 7.57e-33 135
MsG0180001540.01.T01 AT3G58590 28.571 336 197 5 203 500 61 391 9.15e-29 122
MsG0180001540.01.T01 AT5G43790 28.176 433 260 7 148 563 59 457 3.27e-52 186
MsG0180001540.01.T01 AT5G43790 25.417 240 129 8 49 239 164 402 2.21e-16 82.4
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MsG0180001540.01.T01 AT5G43790 26.066 211 137 7 135 328 156 364 6.78e-14 74.7
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MsG0180001540.01.T01 AT1G63150 22.490 498 345 14 97 561 82 571 1.37e-26 115
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MsG0180001540.01.T01 AT1G64100 26.460 291 189 7 13 279 344 633 1.15e-27 118
MsG0180001540.01.T01 AT1G64100 23.297 455 270 9 128 508 175 624 7.33e-26 113
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MsG0180001540.01.T01 AT2G02150 21.847 444 280 13 94 507 258 664 1.45e-23 106
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MsG0180001540.01.T01 AT5G64320 26.562 192 122 5 39 211 533 724 2.19e-13 73.9
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MsG0180001540.01.T01 AT1G62680 28.324 346 204 12 9 311 153 497 1.57e-35 141
MsG0180001540.01.T01 AT1G62680 25.627 359 236 11 95 425 152 507 7.47e-35 139
MsG0180001540.01.T01 AT1G62680 21.696 401 276 12 82 449 66 461 2.21e-23 104
MsG0180001540.01.T01 AT3G22470 26.905 420 253 13 63 437 137 547 2.32e-35 141
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MsG0180001540.01.T01 AT5G41170 23.393 389 244 12 188 557 39 392 5.27e-16 81.3
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MsG0180001540.01.T01 AT5G09950 26.289 388 199 8 39 339 353 740 2.07e-26 115
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MsG0180001540.01.T01 AT1G06580 23.889 360 222 12 3 318 41 392 6.04e-24 104
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MsG0180001540.01.T01 AT4G20090 21.971 487 327 16 102 545 81 557 3.99e-20 95.1
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MsG0180001540.01.T01 AT2G41720 20.166 362 256 10 98 430 258 615 2.59e-14 76.6
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MsG0180001540.01.T01 AT1G55890 22.255 337 232 9 9 317 54 388 4.76e-14 74.7
MsG0180001540.01.T01 AT2G17670 22.388 268 172 9 42 277 166 429 5.50e-17 84.3
MsG0180001540.01.T01 AT1G63630 23.737 198 132 5 39 217 65 262 7.19e-17 81.6
MsG0180001540.01.T01 AT1G63630 22.407 241 172 5 190 416 25 264 6.94e-16 78.6
MsG0180001540.01.T01 AT3G18110 22.449 343 233 10 65 379 296 633 1.86e-16 84.3
MsG0180001540.01.T01 AT3G18110 24.444 315 218 10 210 505 174 487 1.23e-15 81.6
MsG0180001540.01.T01 AT3G18110 22.884 319 222 8 132 426 228 546 3.67e-15 80.1
MsG0180001540.01.T01 AT3G18110 21.206 481 332 18 50 488 656 1131 9.48e-12 68.9
MsG0180001540.01.T01 AT5G27270 22.368 456 274 17 47 462 409 824 1.92e-16 84.0
MsG0180001540.01.T01 AT5G27270 22.368 456 274 17 47 462 409 824 1.92e-16 84.0
MsG0180001540.01.T01 AT5G18475 21.498 307 186 9 39 317 200 479 2.17e-16 82.8
MsG0180001540.01.T01 AT5G18475 22.846 267 191 5 256 510 199 462 4.14e-14 75.5
MsG0180001540.01.T01 AT5G18475 22.222 234 157 8 39 248 272 504 6.18e-12 68.9
MsG0180001540.01.T01 AT5G18475 21.451 317 225 8 156 451 158 471 1.25e-11 67.8
MsG0180001540.01.T01 AT5G27270 22.368 456 274 17 47 462 614 1029 2.43e-16 83.6
MsG0180001540.01.T01 AT2G34370 23.810 273 185 7 254 521 53 307 5.47e-16 81.3
MsG0180001540.01.T01 AT5G43820 23.770 244 153 9 92 309 184 420 7.38e-16 81.3
MsG0180001540.01.T01 AT1G79080 19.420 448 327 14 102 517 110 555 8.00e-16 81.3
MsG0180001540.01.T01 AT3G09650 27.234 235 133 11 65 266 413 642 8.21e-16 81.6
MsG0180001540.01.T01 AT3G09650 20.374 481 287 14 91 482 233 706 3.01e-15 79.7
MsG0180001540.01.T01 AT3G09650 24.016 254 148 10 9 220 412 662 6.35e-11 65.9
MsG0180001540.01.T01 AT3G22670 25.101 247 154 8 44 263 212 454 9.73e-16 80.9
MsG0180001540.01.T01 AT5G62370 23.620 326 200 12 41 327 588 903 1.18e-15 81.3
MsG0180001540.01.T01 AT5G62370 23.483 379 253 14 99 447 482 853 5.64e-14 75.9
MsG0180001540.01.T01 AT4G20740 20.339 472 340 12 126 566 260 726 1.20e-15 81.3
MsG0180001540.01.T01 AT5G46680 22.525 404 271 13 128 500 47 439 2.81e-15 79.3
MsG0180001540.01.T01 AT5G46680 22.254 355 197 10 39 320 52 400 1.61e-14 76.6
MsG0180001540.01.T01 AT5G46680 20.506 356 242 11 29 350 112 460 1.42e-11 67.4
MsG0180001540.01.T01 AT1G71060 23.774 265 178 7 39 279 201 465 3.02e-15 79.3

Find 138 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 246 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTGAACGAGATACTTGTTTA+TGG 0.168910 1:-22953324 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTTAATAAAATGCAAGAATT+AGG 0.203994 1:-22952278 MsG0180001540.01.T01:CDS
CATATTTGAAACTAATAAAT+AGG 0.299213 1:+22951929 None:intergenic
TCGTGGAATACAATGGTTAC+AGG 0.308312 1:-22952746 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGGCTGCTTCTTTAAGCCTT+TGG 0.309666 1:+22951851 None:intergenic
GCCTATGCACACCATGGATA+TGG 0.314001 1:-22952320 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGATGGATTTGTTGTCCTTC+AGG 0.321128 1:+22952500 None:intergenic
TTCAGAGCGGGGACTTGAAT+AGG 0.323570 1:-22952718 MsG0180001540.01.T01:CDS
TCAAATATGTATGCTTCTCT+TGG 0.336279 1:-22951915 MsG0180001540.01.T01:CDS
AACAAAATGCAAGCTATTGA+TGG 0.340908 1:-22952587 MsG0180001540.01.T01:CDS
CAATTCGTAATGTGGTTTCT+TGG 0.342569 1:-22952856 MsG0180001540.01.T01:CDS
AGAGGTGCCATTGTCTGTTT+GGG 0.352006 1:-22952048 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGGAGAGGAATGTGGTTTCT+TGG 0.356688 1:-22953042 MsG0180001540.01.T01:CDS
AAGAGGTGCCATTGTCTGTT+TGG 0.359172 1:-22952049 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGGAGAAAAGTGTCATTGTT+TGG 0.359191 1:-22953228 MsG0180001540.01.T01:CDS
CATGTCAGTTGATGACTTAT+TGG 0.361323 1:-22951700 MsG0180001540.01.T01:CDS
GTGCACGGGAATGCTGATAT+TGG 0.361703 1:-22952002 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTTAGGTGCTTGTAGTGATT+TGG 0.363843 1:-22952531 MsG0180001540.01.T01:CDS
CTTCTCTTACTTGTATATAT+CGG 0.365539 1:+22952153 None:intergenic
TCTTGGAATGCGATGATTGC+GGG 0.375367 1:-22952839 MsG0180001540.01.T01:CDS
AGCGTTTCATTTCTGAAGTA+AGG 0.379937 1:+22953419 None:intergenic
CAAGAAACCACATTACGAAT+TGG 0.382443 1:+22952857 None:intergenic
TCGTGGACTACTATGGTTGC+GGG 0.383516 1:-22952932 MsG0180001540.01.T01:CDS
GTTTGGGGTGCACTCCTAGC+TGG 0.385710 1:-22952032 MsG0180001540.01.T01:CDS
CAGGAGGCGTTGGATTTGTT+TGG 0.390126 1:-22953073 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTAGATATCATTGAGGGACT+TGG 0.392749 1:-22952074 MsG0180001540.01.T01:CDS
ACTTGTCTGATTGATCTTTG+TGG 0.393620 1:-22952122 MsG0180001540.01.T01:CDS
TCAGAGCGGGGACTTGAATA+GGG 0.396959 1:-22952717 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGTTGCCCAATTTCCAGATT+CGG 0.397747 1:-22954530 MsG0180001540.01.T01:CDS
GAATGTGGTTTCTTGGAATA+CGG 0.418777 1:-22953035 MsG0180001540.01.T01:CDS
GGATATGGCAATGAAGCAAT+AGG 0.429080 1:-22952305 MsG0180001540.01.T01:CDS
TAAAGCTTCATCCAGCCTTC+CGG 0.429264 1:+22952094 None:intergenic
GTTTGGACGGCGATGGTTAG+TGG 0.436954 1:-22953211 MsG0180001540.01.T01:CDS
AGAAGCAGCCAGGTTGTAGT+TGG 0.446451 1:-22951839 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTCTTGGAATACGGTTATAA+CGG 0.447102 1:-22953026 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGTGGTTTCGTGGACTACTA+TGG 0.448497 1:-22952939 MsG0180001540.01.T01:CDS
TCGTGGAATACGATGATTGA+TGG 0.449657 1:-22953118 MsG0180001540.01.T01:CDS
CAAATATGTATGCTTCTCTT+GGG 0.459098 1:-22951914 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTGTGGTCGTGCCGGAAGGC+TGG 0.461707 1:-22952105 MsG0180001540.01.T01:CDS
TAGGAAGTTGTTTGATAGAC+CGG 0.464450 1:-22953254 MsG0180001540.01.T01:CDS
CACAAAAGAATGTCATTACT+TGG 0.464639 1:-22952670 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGTTTAATGAGATGCCGGTT+AGG 0.465028 1:-22953150 MsG0180001540.01.T01:CDS
CTCACAGCTTGTAGTCATGC+TGG 0.468464 1:-22952221 MsG0180001540.01.T01:CDS
GCCAATGATGTCACTTATGT+TGG 0.470160 1:-22952248 MsG0180001540.01.T01:CDS
TAACGGCATTGGCGCATTGT+GGG 0.470612 1:-22953009 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGGAAGGACGCAGGAGGCGT+TGG 0.471699 1:-22953083 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTCGTGGACTACTATGGTTG+CGG 0.474189 1:-22952933 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATGTTTGATGATGGACTGTC+CGG 0.478862 1:-22952380 MsG0180001540.01.T01:CDS
CACGATATAACATTCCTAAC+CGG 0.480012 1:+22953136 None:intergenic
TGAGATGCGGGAGAGGGATG+TGG 0.481665 1:-22952957 MsG0180001540.01.T01:CDS
GGCACATGGATTTGATAGCT+TGG 0.485340 1:-22952358 MsG0180001540.01.T01:CDS
GGAAAGAAGCTGCCAACGTT+AGG 0.488360 1:-22951887 MsG0180001540.01.T01:CDS
GGTGCTTGTAGTGATTTGGC+AGG 0.495600 1:-22952527 MsG0180001540.01.T01:CDS
GTTGGGTTCGTGCAGGTCAC+AGG 0.498088 1:-22954498 MsG0180001540.01.T01:intron
TTTAAGGGTTGGGTTCGTGC+AGG 0.499277 1:-22954505 MsG0180001540.01.T01:CDS
ACAAAATGCAAGCTATTGAT+GGG 0.501603 1:-22952586 MsG0180001540.01.T01:CDS
CATAAGTGACATCATTGGCT+TGG 0.503736 1:+22952252 None:intergenic
TGCACGGGAATGCTGATATT+GGG 0.508229 1:-22952001 MsG0180001540.01.T01:CDS
GAAGTTGTTTGAGAGAATGC+CGG 0.509027 1:-22952783 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGGGTTATGCGCAGAATGGA+AGG 0.511855 1:-22952820 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTGCTTCATTGCCATATCCA+TGG 0.513071 1:+22952309 None:intergenic
GGATTTGTTTGGTAGAATGC+CGG 0.513213 1:-22953062 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTCTGAAGTAAGGGCAGCAG+TGG 0.516427 1:+22953429 None:intergenic
GGCGCATTGTGGGAGGATTG+AGG 0.518802 1:-22952999 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGATGGACTGTCCGGGCACA+TGG 0.528464 1:-22952372 MsG0180001540.01.T01:CDS
AGCTATCAAATCCATGTGCC+CGG 0.532178 1:+22952361 None:intergenic
CACGAAGGCATATCCCTCTC+CGG 0.533045 1:+22952764 None:intergenic
CGGGAGAGTTGATGATGCGA+GGG 0.537790 1:-22952897 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATTTCAAAGCTATGCAGAGA+AGG 0.538585 1:-22953385 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATTGATGGGTATGCGAGGAA+TGG 0.540089 1:-22953103 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTATGGACTACAATGATAAG+TGG 0.541692 1:-22953307 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTTGGACGGCGATGGTTAGT+GGG 0.543400 1:-22953210 MsG0180001540.01.T01:CDS
GAAGCTTTAGATATCATTGA+GGG 0.545187 1:-22952080 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGTCATTGTTTGGACGGCGA+TGG 0.547341 1:-22953218 MsG0180001540.01.T01:CDS
GTAACGAAAGTTCCAGTGGT+TGG 0.548378 1:+22952557 None:intergenic
ATTGATCTTTGTGGTCGTGC+CGG 0.550288 1:-22952113 MsG0180001540.01.T01:CDS
GAGGTTGTTTAATGAGATGC+CGG 0.550654 1:-22953155 MsG0180001540.01.T01:CDS
CATTGAGGGACTTGGAAAAG+AGG 0.552197 1:-22952066 MsG0180001540.01.T01:CDS
GAATACGGTTATAACGGCAT+TGG 0.552255 1:-22953020 MsG0180001540.01.T01:CDS
TCCAACATAAGTGACATCAT+TGG 0.552840 1:+22952247 None:intergenic
CAAAATCAACGAAGCACGCA+AGG 0.554402 1:-22953362 MsG0180001540.01.T01:CDS
GCAAGGAAGATGTTTGATGA+TGG 0.555608 1:-22952389 MsG0180001540.01.T01:CDS
CTAGCTGGATGTAGTGTGCA+CGG 0.555708 1:-22952017 MsG0180001540.01.T01:CDS
ACTTGGACTGCTATGATGAC+AGG 0.556572 1:-22952653 MsG0180001540.01.T01:CDS
CAAGAAACCACATTCCTCTC+CGG 0.559579 1:+22953043 None:intergenic
ATCTTTGTGGTCGTGCCGGA+AGG 0.560480 1:-22952109 MsG0180001540.01.T01:CDS
GTCGTTTGATTAATGAAGCT+AGG 0.563040 1:-22953273 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATGGGTATGCGAGGAATGGA+AGG 0.563470 1:-22953099 MsG0180001540.01.T01:CDS
TAGGATGCCAATTCGTAATG+TGG 0.563578 1:-22952864 MsG0180001540.01.T01:CDS
GCGTTTCATTTCTGAAGTAA+GGG 0.564289 1:+22953420 None:intergenic
CGTGGAATACGATGATTGAT+GGG 0.564463 1:-22953117 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATTGCGGGTTATGCGCAGAA+TGG 0.565691 1:-22952824 MsG0180001540.01.T01:CDS
TATTAAGATGAATCGAATTG+AGG 0.566172 1:-22953185 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATCTGGAAATTGGGCAACAG+TGG 0.568093 1:+22954534 None:intergenic
GGGAGAGGGATGTGGTTTCG+TGG 0.568838 1:-22952949 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGGCATTGGCGCATTGTGGG+AGG 0.569655 1:-22953006 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATAACGGCATTGGCGCATTG+TGG 0.569749 1:-22953010 MsG0180001540.01.T01:CDS
AAAGGCTTAAAGAAGCAGCC+AGG 0.570040 1:-22951849 MsG0180001540.01.T01:CDS
GAAAAGTGTCATTGTTTGGA+CGG 0.575207 1:-22953224 MsG0180001540.01.T01:CDS
GATGGGTTAAAACCAACCAC+TGG 0.576017 1:-22952569 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGTATGCTTCTCTTGGGATG+AGG 0.579082 1:-22951908 MsG0180001540.01.T01:CDS
TGAAGCTTTAGATATCATTG+AGG 0.584032 1:-22952081 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGGAGAGGGATATGCCTTCG+TGG 0.584678 1:-22952763 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATATCCATGGTGTGCATAGG+CGG 0.589179 1:+22952322 None:intergenic
GTTTGAGAGAATGCCGGAGA+GGG 0.592379 1:-22952777 MsG0180001540.01.T01:CDS
TAGCTGGATGTAGTGTGCAC+GGG 0.594135 1:-22952016 MsG0180001540.01.T01:CDS
TTCTTGGAATGCGATGATTG+CGG 0.596730 1:-22952840 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGTGCACACTACATCCAGCT+AGG 0.604183 1:+22952018 None:intergenic
ACGGGAGAGTTGATGATGCG+AGG 0.604402 1:-22952898 MsG0180001540.01.T01:CDS
GTTGTTTGATAGACCGGATG+CGG 0.607498 1:-22953248 MsG0180001540.01.T01:CDS
GCCATATCCATGGTGTGCAT+AGG 0.608067 1:+22952319 None:intergenic
CATGCTGGTTTATTTGACGA+GGG 0.608198 1:-22952206 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATGGATTTGATAGCTTGGAA+TGG 0.610301 1:-22952353 MsG0180001540.01.T01:CDS
TCTGGAAATTGGGCAACAGT+GGG 0.618341 1:+22954535 None:intergenic
TCATGCTGGTTTATTTGACG+AGG 0.619115 1:-22952207 MsG0180001540.01.T01:CDS
GATTTGGCAGGTCTTCCTGA+AGG 0.620658 1:-22952515 MsG0180001540.01.T01:CDS
AGTGCACCCCAAACAGACAA+TGG 0.627597 1:+22952041 None:intergenic
TATGGACTACAATGATAAGT+GGG 0.629046 1:-22953306 MsG0180001540.01.T01:CDS
GGAGGATTGAGGACGCGAAG+AGG 0.629505 1:-22952988 MsG0180001540.01.T01:CDS
CGATGATTGATGGGTATGCG+AGG 0.629829 1:-22953108 MsG0180001540.01.T01:CDS
TAGAATGCCGGAGAGGAATG+TGG 0.631673 1:-22953050 MsG0180001540.01.T01:CDS
AACTGTAACGAAAGTTCCAG+TGG 0.632322 1:+22952553 None:intergenic
TGCGAGGAATGGAAGGACGC+AGG 0.635521 1:-22953092 MsG0180001540.01.T01:CDS
ATAAACATGTACTCAAAATG+TGG 0.644317 1:-22952425 MsG0180001540.01.T01:CDS
AGGATGAAAATGAAAGCCAA+AGG 0.650052 1:-22951867 MsG0180001540.01.T01:CDS
ACTTCAATCCAACTACAACC+TGG 0.655721 1:+22951831 None:intergenic
CGGTTAGGAATGTTATATCG+TGG 0.657159 1:-22953135 MsG0180001540.01.T01:CDS
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ATTGCCGCCTATGCACACCA+TGG 0.691032 1:-22952326 MsG0180001540.01.T01:CDS
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ATGACAGGATATGTACAACA+TGG 0.704213 1:-22952638 MsG0180001540.01.T01:CDS
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GTAACCATTGTATTCCACGA+AGG 0.744103 1:+22952749 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! ATTCTTGCATTTTATTAAAT+AGG + Chr1:22953945-22953964 None:intergenic 15.0%
!!! CATATTTGAAACTAATAAAT+AGG + Chr1:22954298-22954317 None:intergenic 15.0%
!! AAAAATGTAAATGAAAGAGA+AGG - Chr1:22951852-22951871 MsG0180001540.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAATGTAAATGAAAGAGAA+GGG - Chr1:22951853-22951872 MsG0180001540.01.T01:CDS 20.0%
!! ATACAAAAATGAAGAAGAAT+AGG - Chr1:22954499-22954518 MsG0180001540.01.T01:CDS 20.0%
!! TACAAAAATGAAGAAGAATA+GGG - Chr1:22954500-22954519 MsG0180001540.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAATATTATTTCAATGCAC+TGG - Chr1:22952496-22952515 MsG0180001540.01.T01:CDS 20.0%
!!! GCTAGCTTTATTATTATTTA+GGG + Chr1:22952061-22952080 None:intergenic 20.0%
!!! TCATTTACATTTTTACAGAA+TGG + Chr1:22951846-22951865 None:intergenic 20.0%
!!! TGCTAGCTTTATTATTATTT+AGG + Chr1:22952062-22952081 None:intergenic 20.0%
!!! TTAACTGTATTTTACTCTTT+TGG - Chr1:22952273-22952292 MsG0180001540.01.T01:CDS 20.0%
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! GAGTAAAATACAGTTAAGAA+CGG + Chr1:22952270-22952289 None:intergenic 25.0%
! TATTAAGATGAATCGAATTG+AGG - Chr1:22953039-22953058 MsG0180001540.01.T01:CDS 25.0%
!! CTGTTTTACTAATCATTTGA+TGG + Chr1:22953744-22953763 None:intergenic 25.0%
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!! GCTTCTTCATATTTGAAATT+TGG + Chr1:22952682-22952701 None:intergenic 25.0%
!!! AGCTGATAAAGTTTTGAAAA+TGG - Chr1:22954254-22954273 MsG0180001540.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTCTGAGATTGTTTTGAAA+TGG + Chr1:22952764-22952783 None:intergenic 25.0%
!!! TTCTGAGATTGTTTTGAAAT+GGG + Chr1:22952763-22952782 None:intergenic 25.0%
AAAAACCGAATCTGGAAATT+GGG + Chr1:22951702-22951721 None:intergenic 30.0%
AACAAAATGCAAGCTATTGA+TGG - Chr1:22953637-22953656 MsG0180001540.01.T01:intron 30.0%
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ACAAAATGCAAGCTATTGAT+GGG - Chr1:22953638-22953657 MsG0180001540.01.T01:intron 30.0%
CAAATATGTATGCTTCTCTT+GGG - Chr1:22954310-22954329 MsG0180001540.01.T01:intron 30.0%
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TAAAAACCGAATCTGGAAAT+TGG + Chr1:22951703-22951722 None:intergenic 30.0%
TAAATGAAAGAGAAGGGTTA+AGG - Chr1:22951859-22951878 MsG0180001540.01.T01:CDS 30.0%
TCAAATATGTATGCTTCTCT+TGG - Chr1:22954309-22954328 MsG0180001540.01.T01:intron 30.0%
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TTCTTGGAATACGGTTATAA+CGG - Chr1:22953198-22953217 MsG0180001540.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGTAATGACATTCTTTTG+TGG + Chr1:22953556-22953575 None:intergenic 30.0%
! TATGGACTACAATGATAAGT+GGG - Chr1:22952918-22952937 MsG0180001540.01.T01:CDS 30.0%
! TTATGGACTACAATGATAAG+TGG - Chr1:22952917-22952936 MsG0180001540.01.T01:CDS 30.0%
! TTTCATTTTCATCCTAACGT+TGG + Chr1:22954352-22954371 None:intergenic 30.0%
! TTTTGATGCTCGAAAGAAAA+GGG + Chr1:22952470-22952489 None:intergenic 30.0%
! TTTTTGATGCTCGAAAGAAA+AGG + Chr1:22952471-22952490 None:intergenic 30.0%
!! ATTTCCAGATTCGGTTTTTA+AGG - Chr1:22951703-22951722 MsG0180001540.01.T01:CDS 30.0%
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!! TTTCCAGATTCGGTTTTTAA+GGG - Chr1:22951704-22951723 MsG0180001540.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTATGAGTGATTTTGAGTTT+AGG + Chr1:22952740-22952759 None:intergenic 30.0%
ACTTGTCTGATTGATCTTTG+TGG - Chr1:22954102-22954121 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
AGGATGAAAATGAAAGCCAA+AGG - Chr1:22954357-22954376 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
ATGACAGGATATGTACAACA+TGG - Chr1:22953586-22953605 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
ATTTCAAAGCTATGCAGAGA+AGG - Chr1:22952839-22952858 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAAACCACATTACGAAT+TGG + Chr1:22953370-22953389 None:intergenic 35.0%
CAATTCGTAATGTGGTTTCT+TGG - Chr1:22953368-22953387 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
CACGATATAACATTCCTAAC+CGG + Chr1:22953091-22953110 None:intergenic 35.0%
CAGAGACTAAAAAAAGCTTC+AGG - Chr1:22951798-22951817 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
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CTGAACGAGATACTTGTTTA+TGG - Chr1:22952900-22952919 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
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GAGCAAAAAATGAGTGAAAC+GGG + Chr1:22952322-22952341 None:intergenic 35.0%
GCTTCAGGTATGTATAACAA+TGG - Chr1:22951813-22951832 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
GTCGTTTGATTAATGAAGCT+AGG - Chr1:22952951-22952970 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
GTTAGTGCATGTTTCATGTT+CGG + Chr1:22952401-22952420 None:intergenic 35.0%
TAATGTGTGATAGATGTGAG+TGG + Chr1:22952146-22952165 None:intergenic 35.0%
TAGGAAGTTGTTTGATAGAC+CGG - Chr1:22952970-22952989 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
TCCAACATAAGTGACATCAT+TGG + Chr1:22953980-22953999 None:intergenic 35.0%
TTAGATATCATTGAGGGACT+TGG - Chr1:22954150-22954169 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
TTTAGGTGCTTGTAGTGATT+TGG - Chr1:22953693-22953712 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
! AAATAGGTGTCTGCATTTTC+TGG + Chr1:22954282-22954301 None:intergenic 35.0%
! AGAGGCTTTTTAATGAGATG+CGG - Chr1:22953254-22953273 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGATTTGATAGCTTGGAA+TGG - Chr1:22953871-22953890 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
! GGAACTTTCGTTACAGTTTT+AGG - Chr1:22953676-22953695 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
!! AGATTCGGTTTTTAAGGGTT+GGG - Chr1:22951709-22951728 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
!! AGCGTTTCATTTCTGAAGTA+AGG + Chr1:22952808-22952827 None:intergenic 35.0%
!! ATTTAGGGTTTTGCTAACCA+GGG + Chr1:22952046-22952065 None:intergenic 35.0%
!! CATGTCAGTTGATGACTTAT+TGG - Chr1:22954524-22954543 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
!! GAAAAGTGTCATTGTTTGGA+CGG - Chr1:22953000-22953019 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
!! GCGTTTCATTTCTGAAGTAA+GGG + Chr1:22952807-22952826 None:intergenic 35.0%
!! TATTTAGGGTTTTGCTAACC+AGG + Chr1:22952047-22952066 None:intergenic 35.0%
!! TGATGCATATTCTAGAGTGT+TGG + Chr1:22952651-22952670 None:intergenic 35.0%
!!! ACTCATTTTTTGCTCGGTTT+GGG - Chr1:22952327-22952346 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
!!! CGTTTCACTCATTTTTTGCT+CGG - Chr1:22952321-22952340 MsG0180001540.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTACAGGTTTTATTCAGAG+CGG - Chr1:22953493-22953512 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
!!! TTACAGGTTTTATTCAGAGC+GGG - Chr1:22953494-22953513 MsG0180001540.01.T01:intron 35.0%
AACTGTAACGAAAGTTCCAG+TGG + Chr1:22953674-22953693 None:intergenic 40.0%
ACTTCAATCCAACTACAACC+TGG + Chr1:22954396-22954415 None:intergenic 40.0%
AGACTCACTCACCATAAACT+AGG - Chr1:22952110-22952129 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
CAAAAAATGAGTGAAACGGG+CGG + Chr1:22952319-22952338 None:intergenic 40.0%
CAACCCTTAAAAACCGAATC+TGG + Chr1:22951710-22951729 None:intergenic 40.0%
CATGTTTCATGTTCGGTTTC+AGG + Chr1:22952394-22952413 None:intergenic 40.0%
CGGTTAGGAATGTTATATCG+TGG - Chr1:22953089-22953108 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
CGTGGAATACGATGATTGAT+GGG - Chr1:22953107-22953126 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTTGTTTGAGAGAATGC+CGG - Chr1:22953441-22953460 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
GAATACGGTTATAACGGCAT+TGG - Chr1:22953204-22953223 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
GAGGTTGTTTAATGAGATGC+CGG - Chr1:22953069-22953088 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
GCAAGGAAGATGTTTGATGA+TGG - Chr1:22953835-22953854 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
GCTAACCAGGGAAATTACAA+TGG + Chr1:22952034-22952053 None:intergenic 40.0%
GGATATGGCAATGAAGCAAT+AGG - Chr1:22953919-22953938 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
GTAACCATTGTATTCCACGA+AGG + Chr1:22953478-22953497 None:intergenic 40.0%
TAGGATGCCAATTCGTAATG+TGG - Chr1:22953360-22953379 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
TATGCCTTCGTGGAATACAA+TGG - Chr1:22953471-22953490 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
TCGTGGAATACAATGGTTAC+AGG - Chr1:22953478-22953497 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
TCGTGGAATACGATGATTGA+TGG - Chr1:22953106-22953125 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCAATGAAGGGTTAAAG+CGG + Chr1:22952533-22952552 None:intergenic 40.0%
TGAAAGAGAAGGGTTAAGGA+AGG - Chr1:22951863-22951882 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
TGTGATAGATGTGAGTGGAT+AGG + Chr1:22952141-22952160 None:intergenic 40.0%
TGTTGCCCAATTTCCAGATT+CGG - Chr1:22951694-22951713 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
TTCTTGGAATGCGATGATTG+CGG - Chr1:22953384-22953403 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
TTGCTTCATTGCCATATCCA+TGG + Chr1:22953918-22953937 None:intergenic 40.0%
! ATGCGAGGGAAGTTTTTGAT+AGG - Chr1:22953341-22953360 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
! CATAAGTGACATCATTGGCT+TGG + Chr1:22953975-22953994 None:intergenic 40.0%
! GAGGCTTTTTAATGAGATGC+GGG - Chr1:22953255-22953274 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
! GCCAATGATGTCACTTATGT+TGG - Chr1:22953976-22953995 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
! GGATTTGTTTGGTAGAATGC+CGG - Chr1:22953162-22953181 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGTGATTTTCATGTTGCA+AGG - Chr1:22953818-22953837 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
! TGTTTAATGAGATGCCGGTT+AGG - Chr1:22953074-22953093 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
! TTCGGTTTCAGGTGTAGATA+GGG + Chr1:22952383-22952402 None:intergenic 40.0%
! TTTTAATGAGATGCGGGAGA+GGG - Chr1:22953261-22953280 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTTAATGAGATGCGGGAG+AGG - Chr1:22953260-22953279 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGTTTGATGATGGACTGTC+CGG - Chr1:22953844-22953863 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
!! CAGATTCGGTTTTTAAGGGT+TGG - Chr1:22951708-22951727 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
!! CATGCTGGTTTATTTGACGA+GGG - Chr1:22954018-22954037 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
!! CGGAGAAAAGTGTCATTGTT+TGG - Chr1:22952996-22953015 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
!! TCATGCTGGTTTATTTGACG+AGG - Chr1:22954017-22954036 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
!! TGATGGATTTGTTGTCCTTC+AGG + Chr1:22953727-22953746 None:intergenic 40.0%
!!! CACTCATTTTTTGCTCGGTT+TGG - Chr1:22952326-22952345 MsG0180001540.01.T01:CDS 40.0%
!!! TACAGGTTTTATTCAGAGCG+GGG - Chr1:22953495-22953514 MsG0180001540.01.T01:intron 40.0%
AAAGGCTTAAAGAAGCAGCC+AGG - Chr1:22954375-22954394 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
ACTTGGACTGCTATGATGAC+AGG - Chr1:22953571-22953590 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
AGCTATCAAATCCATGTGCC+CGG + Chr1:22953866-22953885 None:intergenic 45.0%
AGGGTTAAGGAAGGAAGAGA+AGG - Chr1:22951872-22951891 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
ATATCCATGGTGTGCATAGG+CGG + Chr1:22953905-22953924 None:intergenic 45.0%
ATCTGGAAATTGGGCAACAG+TGG + Chr1:22951693-22951712 None:intergenic 45.0%
ATTGATCTTTGTGGTCGTGC+CGG - Chr1:22954111-22954130 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
CAAAATCAACGAAGCACGCA+AGG - Chr1:22952862-22952881 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
CAAGAAACCACATTCCTCTC+CGG + Chr1:22953184-22953203 None:intergenic 45.0%
CATTGAGGGACTTGGAAAAG+AGG - Chr1:22954158-22954177 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
GAAGAAGCTATAGTTCGTGC+AGG + Chr1:22952591-22952610 None:intergenic 45.0%
GATAGGAGACGCCTAGTTTA+TGG + Chr1:22952124-22952143 None:intergenic 45.0%
GCAGAATGGAAGGTTTGATG+AGG - Chr1:22953414-22953433 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
GTAACGAAAGTTCCAGTGGT+TGG + Chr1:22953670-22953689 None:intergenic 45.0%
GTTGCGGGTTTGTCGAAAAA+CGG - Chr1:22953307-22953326 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTTTGATAGACCGGATG+CGG - Chr1:22952976-22952995 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
TAAAGCTTCATCCAGCCTTC+CGG + Chr1:22954133-22954152 None:intergenic 45.0%
TCTGGAAATTGGGCAACAGT+GGG + Chr1:22951692-22951711 None:intergenic 45.0%
TCTTGGAATGCGATGATTGC+GGG - Chr1:22953385-22953404 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
TGCAATGCGTCTCCAATGAA+GGG + Chr1:22952542-22952561 None:intergenic 45.0%
TGCACGGGAATGCTGATATT+GGG - Chr1:22954223-22954242 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
TGGCTGCTTCTTTAAGCCTT+TGG + Chr1:22954376-22954395 None:intergenic 45.0%
TGTATGCTTCTCTTGGGATG+AGG - Chr1:22954316-22954335 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
TTGCGGGTTTGTCGAAAAAC+GGG - Chr1:22953308-22953327 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
! ATGACACTTTTCTCCGCATC+CGG + Chr1:22952992-22953011 None:intergenic 45.0%
! ATTGATGGGTATGCGAGGAA+TGG - Chr1:22953121-22953140 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
! GGCACATGGATTTGATAGCT+TGG - Chr1:22953866-22953885 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
! GTTCGGTTTCAGGTGTAGAT+AGG + Chr1:22952384-22952403 None:intergenic 45.0%
! TCGGTTTCAGGTGTAGATAG+GGG + Chr1:22952382-22952401 None:intergenic 45.0%
! TGTGGTTTCGTGGACTACTA+TGG - Chr1:22953285-22953304 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
! TTCGTGGACTACTATGGTTG+CGG - Chr1:22953291-22953310 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGAGGTGCCATTGTCTGTT+TGG - Chr1:22954175-22954194 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
!! AGAGGTGCCATTGTCTGTTT+GGG - Chr1:22954176-22954195 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
!! GATGGGTTAAAACCAACCAC+TGG - Chr1:22953655-22953674 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
!! GTGAAACGGGCGGTTTTATA+CGG + Chr1:22952309-22952328 None:intergenic 45.0%
!! TGAAACGGGCGGTTTTATAC+GGG + Chr1:22952308-22952327 None:intergenic 45.0%
!! TGTTTGATGATGGACTGTCC+GGG - Chr1:22953845-22953864 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
!! TTTTCAGGAGAGCACATACG+TGG - Chr1:22953765-22953784 MsG0180001540.01.T01:intron 45.0%
!!! CATTTTTTGCTCGGTTTGGG+CGG - Chr1:22952330-22952349 MsG0180001540.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTAATAATGATTAATAATT+TGG - Chr1:22951922-22951941 MsG0180001540.01.T01:CDS 5.0%
ACTGCCGGAGTAAGGAAAGA+AGG - Chr1:22952561-22952580 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
AGAAGCAGCCAGGTTGTAGT+TGG - Chr1:22954385-22954404 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
AGGGGTCCAATTGTTTCACG+CGG - Chr1:22952228-22952247 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
AGTGCACCCCAAACAGACAA+TGG + Chr1:22954186-22954205 None:intergenic 50.0%
ATCGAATTGAGGAAGCTGCG+AGG - Chr1:22953050-22953069 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
ATGGGTATGCGAGGAATGGA+AGG - Chr1:22953125-22953144 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
CAATGAAGGGTTAAAGCGGC+AGG + Chr1:22952529-22952548 None:intergenic 50.0%
CGGAGAGGAATGTGGTTTCT+TGG - Chr1:22953182-22953201 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
CGTGAAACAATTGGACCCCT+CGG + Chr1:22952228-22952247 None:intergenic 50.0%
CTAGCTGGATGTAGTGTGCA+CGG - Chr1:22954207-22954226 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
CTCACAGCTTGTAGTCATGC+TGG - Chr1:22954003-22954022 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
GATTTGGCAGGTCTTCCTGA+AGG - Chr1:22953709-22953728 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
GCCATATCCATGGTGTGCAT+AGG + Chr1:22953908-22953927 None:intergenic 50.0%
GCCTATGCACACCATGGATA+TGG - Chr1:22953904-22953923 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
GGAAAGAAGCTGCCAACGTT+AGG - Chr1:22954337-22954356 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
GTGCAATGCGTCTCCAATGA+AGG + Chr1:22952543-22952562 None:intergenic 50.0%
GTGCACGGGAATGCTGATAT+TGG - Chr1:22954222-22954241 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
GTTTGAGAGAATGCCGGAGA+GGG - Chr1:22953447-22953466 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
TAGAATGCCGGAGAGGAATG+TGG - Chr1:22953174-22953193 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
TAGCTGGATGTAGTGTGCAC+GGG - Chr1:22954208-22954227 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
TCAGAGCGGGGACTTGAATA+GGG - Chr1:22953507-22953526 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
TGTCATTGTTTGGACGGCGA+TGG - Chr1:22953006-22953025 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
TGTTTGAGAGAATGCCGGAG+AGG - Chr1:22953446-22953465 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
TGTTTGGTAGAATGCCGGAG+AGG - Chr1:22953167-22953186 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
TTCAGAGCGGGGACTTGAAT+AGG - Chr1:22953506-22953525 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
TTTAAGGGTTGGGTTCGTGC+AGG - Chr1:22951719-22951738 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
TTTGGACGGCGATGGTTAGT+GGG - Chr1:22953014-22953033 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
! ATTGCGGGTTATGCGCAGAA+TGG - Chr1:22953400-22953419 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
! CGATGATTGATGGGTATGCG+AGG - Chr1:22953116-22953135 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
! GGTGCTTGTAGTGATTTGGC+AGG - Chr1:22953697-22953716 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
! GTTTCAGGTGTAGATAGGGG+TGG + Chr1:22952379-22952398 None:intergenic 50.0%
! TCGTGGACTACTATGGTTGC+GGG - Chr1:22953292-22953311 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
!! ATAACGGCATTGGCGCATTG+TGG - Chr1:22953214-22953233 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
!! CAGGAGGCGTTGGATTTGTT+TGG - Chr1:22953151-22953170 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
!! CTGCCGCTTTAACCCTTCAT+TGG - Chr1:22952527-22952546 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGGTGCCATTGTCTGTTTG+GGG - Chr1:22954177-22954196 MsG0180001540.01.T01:intron 50.0%
!! GCGGTTTTATACGGGTCATC+AGG + Chr1:22952300-22952319 None:intergenic 50.0%
!! TAACGGCATTGGCGCATTGT+GGG - Chr1:22953215-22953234 MsG0180001540.01.T01:CDS 50.0%
!! TAAGAACGGGTTAGCACGAG+CGG + Chr1:22952256-22952275 None:intergenic 50.0%
!! TTCTGAAGTAAGGGCAGCAG+TGG + Chr1:22952798-22952817 None:intergenic 50.0%
ATCTTTGTGGTCGTGCCGGA+AGG - Chr1:22954115-22954134 MsG0180001540.01.T01:intron 55.0%
ATTGCCGCCTATGCACACCA+TGG - Chr1:22953898-22953917 MsG0180001540.01.T01:intron 55.0%
CCCGCCTTCTTTCCTTACTC+CGG + Chr1:22952568-22952587 None:intergenic 55.0%
CCGGAGTAAGGAAAGAAGGC+GGG - Chr1:22952565-22952584 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
CGAGCGAGTTCAGATACCGA+GGG - Chr1:22952209-22952228 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
CGGGTTATGCGCAGAATGGA+AGG - Chr1:22953404-22953423 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
CGTGCACACTACATCCAGCT+AGG + Chr1:22954209-22954228 None:intergenic 55.0%
GAGCGAGTTCAGATACCGAG+GGG - Chr1:22952210-22952229 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
GCCGGAGTAAGGAAAGAAGG+CGG - Chr1:22952564-22952583 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
GTTTGGACGGCGATGGTTAG+TGG - Chr1:22953013-22953032 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
TCGAGCGAGTTCAGATACCG+AGG - Chr1:22952208-22952227 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
TCGTGCAGGTCACAGGTTAG+CGG - Chr1:22951733-22951752 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
TTGGAGACGCATTGCACTGC+CGG - Chr1:22952546-22952565 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
! CACGAAGGCATATCCCTCTC+CGG + Chr1:22953463-22953482 None:intergenic 55.0%
!! AAGAACGGGTTAGCACGAGC+GGG + Chr1:22952255-22952274 None:intergenic 55.0%
!! ACGGGAGAGTTGATGATGCG+AGG - Chr1:22953326-22953345 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
!! CGGGAGAGTTGATGATGCGA+GGG - Chr1:22953327-22953346 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
!! CTCGGTTTGGGCGGTTATTC+CGG - Chr1:22952339-22952358 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
!! TCGGTTTGGGCGGTTATTCC+GGG - Chr1:22952340-22952359 MsG0180001540.01.T01:CDS 55.0%
ATAGGGGTGGACCAAACCCG+CGG + Chr1:22952366-22952385 None:intergenic 60.0%
CGCATTGCACTGCCGGAGTA+AGG - Chr1:22952553-22952572 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
CGGAGAGGGATATGCCTTCG+TGG - Chr1:22953461-22953480 MsG0180001540.01.T01:intron 60.0%
CGTGCAGGTCACAGGTTAGC+GGG - Chr1:22951734-22951753 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
GAAGGGTTAAAGCGGCAGGC+AGG + Chr1:22952525-22952544 None:intergenic 60.0%
GAGGAATGGAAGGACGCAGG+AGG - Chr1:22953135-22953154 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
GCGGGTCCGCGTGAAACAAT+TGG + Chr1:22952237-22952256 None:intergenic 60.0%
GGAGGATTGAGGACGCGAAG+AGG - Chr1:22953236-22953255 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
GGCGCATTGTGGGAGGATTG+AGG - Chr1:22953225-22953244 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
GGGAGAGGGATGTGGTTTCG+TGG - Chr1:22953275-22953294 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
GTTGGGTTCGTGCAGGTCAC+AGG - Chr1:22951726-22951745 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
TGAGATGCGGGAGAGGGATG+TGG - Chr1:22953267-22953286 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
TGCGAGGAATGGAAGGACGC+AGG - Chr1:22953132-22953151 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
! CAGGTCACAGGTTAGCGGGT+CGG - Chr1:22951738-22951757 MsG0180001540.01.T01:CDS 60.0%
! GTTTGGGGTGCACTCCTAGC+TGG - Chr1:22954192-22954211 MsG0180001540.01.T01:intron 60.0%
!! TGATGGACTGTCCGGGCACA+TGG - Chr1:22953852-22953871 MsG0180001540.01.T01:intron 60.0%
GTTATTCCGGGCCGCGGGTT+TGG - Chr1:22952352-22952371 MsG0180001540.01.T01:CDS 65.0%
TTGTGGTCGTGCCGGAAGGC+TGG - Chr1:22954119-22954138 MsG0180001540.01.T01:intron 65.0%
! TGGAAGGACGCAGGAGGCGT+TGG - Chr1:22953141-22953160 MsG0180001540.01.T01:CDS 65.0%
!! CGGCATTGGCGCATTGTGGG+AGG - Chr1:22953218-22953237 MsG0180001540.01.T01:CDS 65.0%
TGGGCGGTTATTCCGGGCCG+CGG - Chr1:22952346-22952365 MsG0180001540.01.T01:CDS 70.0%
GGGCGGTTATTCCGGGCCGC+GGG - Chr1:22952347-22952366 MsG0180001540.01.T01:CDS 75.0%
GGTGGACCAAACCCGCGGCC+CGG + Chr1:22952361-22952380 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 22951683 22954563 22951683 ID=MsG0180001540.01;Name=MsG0180001540.01
Chr1 mRNA 22951683 22954563 22951683 ID=MsG0180001540.01.T01;Parent=MsG0180001540.01;Name=MsG0180001540.01.T01;_AED=0.16;_eAED=0.38;_QI=0|0|0|0.66|1|1|3|0|615
Chr1 exon 22954499 22954563 22954499 ID=MsG0180001540.01.T01:exon:18084;Parent=MsG0180001540.01.T01
Chr1 exon 22951683 22953465 22951683 ID=MsG0180001540.01.T01:exon:18083;Parent=MsG0180001540.01.T01
Chr1 CDS 22954499 22954563 22954499 ID=MsG0180001540.01.T01:cds;Parent=MsG0180001540.01.T01
Chr1 CDS 22951683 22953465 22951683 ID=MsG0180001540.01.T01:cds;Parent=MsG0180001540.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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