AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013083.01

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MsG0380013083.01.T01 AT5G61990 30.879 421 276 4 19 437 331 738 1.45e-54 204
MsG0380013083.01.T01 AT5G61990 30.570 386 253 2 3 384 381 755 4.34e-52 197
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MsG0380013083.01.T01 AT5G61990 24.098 776 488 16 19 776 261 953 1.90e-47 182
MsG0380013083.01.T01 AT5G61990 28.267 329 191 4 14 298 641 968 2.62e-35 145
MsG0380013083.01.T01 AT5G61990 22.727 660 397 16 179 762 101 723 2.35e-19 94.0
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MsG0380013083.01.T01 AT1G12300 29.950 404 270 3 12 413 240 632 2.35e-53 196
MsG0380013083.01.T01 AT1G12300 30.808 396 263 2 52 447 70 454 5.69e-52 192
MsG0380013083.01.T01 AT1G12300 30.714 280 194 0 9 288 342 621 2.12e-40 158
MsG0380013083.01.T01 AT2G32630 36.667 330 209 0 11 340 270 599 2.64e-63 224
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MsG0380013083.01.T01 AT3G22470 31.295 278 191 0 11 288 326 603 2.06e-42 164
MsG0380013083.01.T01 AT3G22470 30.114 176 123 0 12 187 432 607 9.47e-22 100
MsG0380013083.01.T01 AT3G22470 26.512 215 144 7 558 762 271 481 6.27e-11 66.6
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MsG0380013083.01.T01 AT2G39230 27.857 420 288 5 30 447 305 711 1.60e-46 179
MsG0380013083.01.T01 AT2G39230 29.503 322 226 1 15 335 534 855 5.70e-40 159
MsG0380013083.01.T01 AT2G39230 29.643 280 196 1 14 292 568 847 1.60e-38 154
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MsG0380013083.01.T01 AT1G74580 28.148 405 280 1 37 441 78 471 1.43e-41 163
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MsG0380013083.01.T01 AT1G64100 28.017 464 289 6 18 477 89 511 6.24e-48 181
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MsG0380013083.01.T01 AT1G09680 27.241 290 200 3 174 463 239 517 1.74e-33 137
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MsG0380013083.01.T01 AT3G08820 23.404 282 204 3 13 294 159 428 3.68e-16 83.6
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MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 31.212 330 212 3 61 390 1 315 2.70e-50 180
MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 29.845 258 181 0 14 271 55 312 1.06e-42 158
MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 30.851 282 180 3 166 447 1 267 2.44e-38 145
MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 31.674 221 151 0 12 232 88 308 3.89e-37 142
MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 29.843 191 134 0 14 204 125 315 2.68e-26 110
MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 30.189 159 111 0 11 169 157 315 1.86e-25 108
MsG0380013083.01.T01 AT1G63230 36.471 85 54 0 18 102 234 318 3.16e-11 65.9
MsG0380013083.01.T01 AT5G41170 29.854 412 275 2 16 424 53 453 1.74e-56 202
MsG0380013083.01.T01 AT5G41170 28.472 432 285 3 39 457 31 451 1.15e-45 171
MsG0380013083.01.T01 AT5G41170 29.412 289 201 1 9 294 186 474 1.21e-39 154
MsG0380013083.01.T01 AT2G44880 38.462 260 153 4 554 809 261 517 2.26e-56 203
MsG0380013083.01.T01 AT2G44880 23.333 420 257 11 19 404 29 417 9.02e-22 100
MsG0380013083.01.T01 AT2G44880 24.809 262 183 5 11 271 187 435 3.20e-17 86.3
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MsG0380013083.01.T01 AT2G03880 24.147 381 249 10 30 405 91 436 3.89e-25 111
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MsG0380013083.01.T01 AT1G33350 29.284 461 278 13 359 809 86 508 3.25e-55 199
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MsG0380013083.01.T01 AT4G04370 21.698 424 261 11 30 395 174 584 2.53e-15 80.9
MsG0380013083.01.T01 AT4G04370 20.323 310 232 4 21 330 67 361 6.77e-12 69.7
MsG0380013083.01.T01 AT5G50990 37.838 259 153 5 554 808 152 406 4.54e-55 199
MsG0380013083.01.T01 AT5G50990 21.973 223 165 4 34 254 128 343 2.21e-12 70.9
MsG0380013083.01.T01 AT1G13410 40.000 260 152 2 554 809 175 434 4.61e-55 197
MsG0380013083.01.T01 AT1G13410 28.146 302 179 9 114 412 37 303 1.46e-19 93.2
MsG0380013083.01.T01 AT1G13410 25.369 339 219 12 14 344 42 354 2.65e-18 89.4
MsG0380013083.01.T01 AT3G23330 38.202 267 148 3 556 806 223 488 5.55e-55 200
MsG0380013083.01.T01 AT3G23330 24.251 367 252 6 22 387 56 397 2.53e-21 99.8
MsG0380013083.01.T01 AT3G23330 24.453 274 186 3 134 405 90 344 4.60e-19 92.4
MsG0380013083.01.T01 AT3G23330 24.561 228 160 6 531 750 91 314 4.34e-16 82.8
MsG0380013083.01.T01 AT3G23330 23.790 248 177 5 18 264 186 422 1.66e-11 68.2
MsG0380013083.01.T01 AT1G20230 26.644 593 373 12 242 809 78 633 6.33e-55 203
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MsG0380013083.01.T01 AT1G13630 26.253 419 269 5 53 439 171 581 1.09e-40 161
MsG0380013083.01.T01 AT1G13630 25.382 327 232 1 14 328 412 738 6.54e-36 146
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MsG0380013083.01.T01 AT1G13630 24.915 293 208 1 12 292 445 737 2.44e-28 122
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MsG0380013083.01.T01 AT1G13630 30.964 394 270 2 14 405 318 711 4.32e-54 201
MsG0380013083.01.T01 AT1G13630 27.354 446 287 5 29 437 263 708 2.58e-49 187
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MsG0380013083.01.T01 AT1G13630 25.382 327 232 1 14 328 446 772 6.45e-36 146
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MsG0380013083.01.T01 AT1G25360 22.553 470 281 15 18 445 206 634 3.20e-18 90.1
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MsG0380013083.01.T01 AT5G04810 26.106 452 308 2 14 450 323 763 1.11e-47 182
MsG0380013083.01.T01 AT5G04810 26.893 383 269 1 23 405 402 773 5.54e-44 171
MsG0380013083.01.T01 AT5G04810 30.400 250 174 0 15 264 534 783 6.07e-38 152
MsG0380013083.01.T01 AT5G04810 27.875 287 207 0 14 300 498 784 1.93e-34 141
MsG0380013083.01.T01 AT5G04810 24.688 320 224 2 103 416 307 615 1.80e-27 119
MsG0380013083.01.T01 AT5G04810 26.667 180 97 2 12 156 601 780 4.82e-14 76.6
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MsG0380013083.01.T01 AT2G36980 38.462 260 151 4 558 809 328 586 2.34e-42 164
MsG0380013083.01.T01 AT2G36980 23.620 453 272 13 5 451 9 393 1.33e-20 97.4
MsG0380013083.01.T01 AT2G36980 27.966 236 126 8 561 758 64 293 1.91e-11 68.2
MsG0380013083.01.T01 AT4G20770 35.200 250 160 2 554 802 506 754 3.26e-42 165
MsG0380013083.01.T01 AT4G20770 22.441 508 286 13 288 766 18 446 1.33e-13 75.1
MsG0380013083.01.T01 AT4G19220 33.597 253 160 4 563 809 694 944 3.52e-42 166
MsG0380013083.01.T01 AT4G19220 26.667 210 147 5 554 762 587 790 3.58e-13 73.9
MsG0380013083.01.T01 AT1G03560 27.184 412 288 2 28 438 145 545 3.95e-42 164
MsG0380013083.01.T01 AT1G03560 27.105 380 267 1 15 394 167 536 1.04e-37 150
MsG0380013083.01.T01 AT1G03560 29.641 334 233 2 13 345 305 637 3.24e-35 143
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MsG0380013083.01.T01 AT1G03560 26.154 325 238 2 14 337 271 594 2.11e-31 131
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MsG0380013083.01.T01 AT2G18940 28.947 114 81 0 11 124 677 790 3.72e-12 70.5
MsG0380013083.01.T01 AT5G28460 26.738 374 261 4 14 385 384 746 5.13e-41 162
MsG0380013083.01.T01 AT5G28460 29.082 392 261 5 15 399 309 690 4.14e-40 159
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MsG0380013083.01.T01 AT5G28460 27.729 339 243 2 14 351 420 757 6.70e-36 146
MsG0380013083.01.T01 AT5G28460 27.295 403 257 11 52 437 134 517 1.87e-24 110
MsG0380013083.01.T01 AT1G77360 29.283 321 219 3 16 330 142 460 6.51e-41 157
MsG0380013083.01.T01 AT1G77360 24.044 366 264 3 62 427 90 441 4.53e-33 134
MsG0380013083.01.T01 AT1G77360 27.917 240 172 1 12 251 213 451 5.37e-26 113
MsG0380013083.01.T01 AT1G77360 26.000 250 172 3 196 445 119 355 3.79e-21 98.2
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MsG0380013083.01.T01 AT5G13270 27.461 193 135 5 558 748 175 364 8.33e-12 69.3
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MsG0380013083.01.T01 AT5G66500 23.404 235 144 6 570 773 87 316 3.02e-11 67.4
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MsG0380013083.01.T01 AT4G26800 29.021 286 203 0 19 304 67 352 3.92e-38 146
MsG0380013083.01.T01 AT4G26800 28.854 253 163 2 198 447 1 239 3.86e-25 108
MsG0380013083.01.T01 AT2G46050 33.471 242 160 1 558 799 333 573 1.53e-39 155
MsG0380013083.01.T01 AT2G46050 30.189 212 133 7 561 767 239 440 2.20e-19 93.2
MsG0380013083.01.T01 AT2G46050 23.058 399 266 11 15 405 86 451 3.21e-17 86.7
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MsG0380013083.01.T01 AT5G50280 26.253 419 292 6 34 448 272 677 2.11e-32 135
MsG0380013083.01.T01 AT5G50280 26.855 283 197 3 22 297 401 680 4.37e-30 127
MsG0380013083.01.T01 AT5G50280 24.590 183 138 0 14 196 499 681 3.30e-12 70.9
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MsG0380013083.01.T01 AT2G41720 21.366 454 324 4 22 445 129 579 2.28e-28 122
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MsG0380013083.01.T01 AT1G64310 23.605 466 308 10 15 445 55 507 3.80e-22 102
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MsG0380013083.01.T01 AT4G25270 23.607 305 217 5 34 338 126 414 5.16e-20 95.1
MsG0380013083.01.T01 AT4G25270 22.727 308 207 6 96 403 122 398 1.78e-14 77.4
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MsG0380013083.01.T01 AT1G74900 27.564 312 212 4 61 371 117 415 7.47e-31 127
MsG0380013083.01.T01 AT1G74900 26.829 328 226 4 103 429 124 438 7.60e-31 127
MsG0380013083.01.T01 AT1G74900 27.500 280 168 2 14 258 140 419 5.15e-30 124
MsG0380013083.01.T01 AT1G74900 27.363 201 137 1 14 205 244 444 2.36e-17 86.3
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 28.115 313 215 2 21 331 285 589 3.39e-34 139
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 25.070 355 259 4 14 361 204 558 7.03e-29 123
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.141 411 301 4 33 437 153 550 4.35e-27 117
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.969 357 260 3 96 448 146 491 1.65e-23 106
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.518 506 294 14 201 694 146 570 1.92e-21 99.8
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 25.714 245 153 6 230 445 139 383 8.99e-15 78.6
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.684 190 145 0 14 203 383 572 1.19e-14 78.2
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.936 218 168 0 19 236 353 570 2.73e-14 77.0
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 28.115 313 215 2 21 331 282 586 3.48e-34 139
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 25.284 352 259 3 14 361 204 555 1.03e-30 128
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.549 408 300 4 33 437 153 547 2.13e-28 121
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.446 354 259 2 96 448 146 488 6.00e-25 110
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.658 503 294 13 201 694 146 567 3.33e-23 105
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.684 190 145 0 14 203 380 569 1.32e-14 78.2
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.936 218 168 0 19 236 350 567 2.93e-14 77.0
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 28.115 313 215 2 21 331 307 611 3.93e-34 139
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 25.070 355 259 4 14 361 226 580 6.89e-29 123
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.141 411 301 4 33 437 175 572 5.15e-27 117
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.099 355 258 3 98 448 170 513 1.83e-23 106
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.518 506 294 14 201 694 168 592 2.43e-21 99.8
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 25.714 245 153 6 230 445 161 405 9.38e-15 78.6
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 23.684 190 145 0 14 203 405 594 1.43e-14 78.2
MsG0380013083.01.T01 AT2G35130 22.936 218 168 0 19 236 375 592 2.94e-14 77.0
MsG0380013083.01.T01 AT2G17525 25.721 416 255 5 21 399 203 601 5.37e-34 139
MsG0380013083.01.T01 AT2G17525 24.279 416 294 5 22 434 134 531 1.11e-30 129
MsG0380013083.01.T01 AT2G17525 26.287 369 245 7 3 348 235 599 8.16e-30 126
MsG0380013083.01.T01 AT2G17525 26.768 396 237 9 30 387 71 451 3.32e-27 118
MsG0380013083.01.T01 AT1G43980 30.208 288 188 5 533 809 308 593 8.80e-34 138
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 27.348 362 249 5 17 377 100 448 1.88e-33 135
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 24.113 282 212 2 12 292 164 444 7.77e-29 121
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 25.641 390 270 5 13 394 19 396 1.07e-27 118
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 26.733 303 209 5 136 437 79 369 2.04e-27 117
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 25.571 219 162 1 14 232 237 454 1.24e-18 90.1
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 24.737 190 142 1 9 198 267 455 2.33e-14 77.0
MsG0380013083.01.T01 AT2G17670 26.510 298 213 4 3 294 52 349 1.88e-33 132
MsG0380013083.01.T01 AT2G17670 29.461 241 156 6 138 375 120 349 1.37e-28 118
MsG0380013083.01.T01 AT2G17670 23.144 229 162 4 212 437 124 341 2.81e-11 66.2
MsG0380013083.01.T01 AT1G71060 27.414 321 224 2 16 330 172 489 2.77e-33 135
MsG0380013083.01.T01 AT1G71060 22.000 350 257 3 57 405 114 448 3.14e-23 104
MsG0380013083.01.T01 AT1G71060 23.346 257 185 2 181 437 134 378 1.00e-13 75.1
MsG0380013083.01.T01 AT1G71060 25.654 191 139 1 13 203 315 502 2.34e-11 67.4
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 27.119 354 244 5 22 374 1 341 2.96e-33 132
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 24.113 282 212 2 12 292 60 340 3.58e-29 120
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 28.800 250 165 5 189 437 28 265 9.60e-28 116
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 29.032 279 185 3 117 394 26 292 3.33e-27 114
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 25.571 219 162 1 14 232 133 350 9.07e-19 89.4
MsG0380013083.01.T01 AT1G53330 24.737 190 142 1 9 198 163 351 1.67e-14 76.6
MsG0380013083.01.T01 AT2G15690 33.171 205 133 3 565 767 234 436 5.93e-33 135
MsG0380013083.01.T01 AT5G08490 20.624 834 533 23 14 809 35 777 8.20e-33 136
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 28.146 302 211 3 12 310 161 459 2.02e-32 132
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 25.817 306 221 2 38 340 152 454 4.69e-26 113
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 31.937 191 130 0 21 211 275 465 5.22e-24 107
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 25.228 329 228 5 143 467 152 466 9.34e-20 94.0
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 28.146 302 211 3 12 310 161 459 2.02e-32 132
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 25.817 306 221 2 38 340 152 454 4.69e-26 113
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 31.937 191 130 0 21 211 275 465 5.22e-24 107
MsG0380013083.01.T01 AT3G60050 25.228 329 228 5 143 467 152 466 9.34e-20 94.0
MsG0380013083.01.T01 AT4G34830 22.826 368 271 2 33 398 465 821 3.11e-32 135
MsG0380013083.01.T01 AT4G34830 23.919 347 224 3 15 321 482 828 5.84e-27 118
MsG0380013083.01.T01 AT4G34830 22.364 313 188 7 14 322 623 884 3.72e-14 77.4
MsG0380013083.01.T01 AT4G34830 22.770 426 251 16 56 415 389 802 1.82e-13 75.1
MsG0380013083.01.T01 AT5G62370 24.000 450 309 4 5 451 532 951 3.35e-32 135
MsG0380013083.01.T01 AT5G62370 24.941 421 292 8 12 426 559 961 9.04e-32 134
MsG0380013083.01.T01 AT5G62370 26.238 404 273 7 14 413 321 703 1.30e-28 124
MsG0380013083.01.T01 AT5G62370 22.503 751 528 21 5 732 242 961 4.87e-28 122
MsG0380013083.01.T01 AT5G62370 21.758 694 481 14 40 726 65 703 1.24e-24 110
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 26.911 327 235 4 14 337 169 494 4.11e-32 132
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 25.407 307 216 5 100 404 185 480 2.98e-24 108
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 26.224 286 191 4 107 387 157 427 5.53e-22 100
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 25.753 365 218 11 21 385 42 353 1.82e-20 96.3
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 26.911 327 235 4 14 337 169 494 4.11e-32 132
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 25.407 307 216 5 100 404 185 480 2.98e-24 108
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 26.224 286 191 4 107 387 157 427 5.53e-22 100
MsG0380013083.01.T01 AT3G04130 25.753 365 218 11 21 385 42 353 1.82e-20 96.3
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 30.282 284 192 2 11 291 162 442 5.33e-32 130
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 26.263 297 215 1 3 295 115 411 9.14e-31 127
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 23.955 359 237 3 7 329 52 410 4.08e-29 122
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 26.087 322 224 4 89 410 68 375 2.25e-26 114
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 25.989 354 251 1 50 403 61 403 1.85e-25 111
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 23.664 262 195 1 11 272 197 453 3.43e-19 92.0
MsG0380013083.01.T01 AT1G07740 24.735 283 202 2 155 437 61 332 2.88e-15 79.7
MsG0380013083.01.T01 AT4G01400 30.909 220 152 0 13 232 168 387 6.39e-32 130
MsG0380013083.01.T01 AT4G01400 26.899 316 229 2 37 351 121 435 1.09e-27 117
MsG0380013083.01.T01 AT4G01400 26.214 206 152 0 12 217 237 442 1.25e-20 96.3
MsG0380013083.01.T01 AT4G01400 23.077 286 191 5 180 461 89 349 2.52e-15 80.1
MsG0380013083.01.T01 AT5G11310 21.921 479 348 7 5 471 71 535 1.21e-31 131
MsG0380013083.01.T01 AT2G17210 30.000 240 163 4 565 800 445 683 1.27e-31 132
MsG0380013083.01.T01 AT2G17210 22.414 406 276 12 6 405 186 558 1.11e-15 82.0
MsG0380013083.01.T01 AT2G17210 22.249 418 266 11 15 386 262 666 1.23e-15 81.6
MsG0380013083.01.T01 AT2G17210 26.141 241 145 6 547 755 227 466 3.17e-15 80.5
MsG0380013083.01.T01 AT3G50420 22.074 752 479 20 110 809 27 723 1.32e-31 132
MsG0380013083.01.T01 AT3G50420 23.465 456 300 10 14 457 146 564 1.17e-17 88.2
MsG0380013083.01.T01 AT3G50420 22.362 398 246 7 14 405 248 588 7.53e-16 82.4

Find 185 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 435 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCTCTGCTTGTGCGGATAC+TGG 0.143562 3:-30031270 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGTCATGTGGCGAACCTTAC+TGG 0.187640 3:-30030782 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATTGATGGGTATTGTAAAA+TGG 0.192424 3:-30036307 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCTGAGCATTTAATGGATTA+TGG 0.196585 3:-30035175 MsG0380013083.01.T01:CDS
GCGAAACTGCTTTGTTTATA+TGG 0.208076 3:-30036163 MsG0380013083.01.T01:CDS
CGTTGGTCATACTTTGAAAA+TGG 0.223510 3:+30030923 None:intergenic
GGTGTTGTGTTTAACAATTT+TGG 0.231379 3:-30032545 MsG0380013083.01.T01:CDS
CAAAGTATGACCAACGATTA+TGG 0.240432 3:-30030916 MsG0380013083.01.T01:CDS
AATGTGTTCTGAGCATTTAA+TGG 0.246491 3:-30035182 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCGAAAAGTATAAGGATTAT+AGG 0.281169 3:-30034880 MsG0380013083.01.T01:intron
GAACCAAGAGAGCCTCATTT+TGG 0.283268 3:-30030889 MsG0380013083.01.T01:CDS
CCTAGTCAACACACGATATA+TGG 0.285976 3:+30035240 None:intergenic
TTTAAGTTGATGAGGGAATC+TGG 0.290312 3:-30036363 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCCGAACTGAAGGATGTTTC+TGG 0.294408 3:+30034949 None:intergenic
GATTGCTTTCGAAAAGTATA+AGG 0.308791 3:-30034888 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGGATGTTTCTGGCAGTAAT+TGG 0.312225 3:+30034959 None:intergenic
TTTGTTTATATGGATAAATT+TGG 0.323750 3:-30036153 MsG0380013083.01.T01:CDS
TACTTGTAGTATACTTGTTA+AGG 0.329951 3:-30036007 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTTTATAATTGTTTGATTGA+TGG 0.331904 3:-30036111 MsG0380013083.01.T01:CDS
AAGTCACCAAACATGATAAA+AGG 0.339389 3:-30032566 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGGATAAGAAGATTATTATT+AGG 0.348812 3:-30030633 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCTCTGCTTGTGCGGATACT+GGG 0.349775 3:-30031269 MsG0380013083.01.T01:CDS
CAATGAACGTTACATCGTTC+GGG 0.364235 3:+30030995 None:intergenic
GTCATGTGGCGAACCTTACT+GGG 0.365669 3:-30030781 MsG0380013083.01.T01:CDS
CAATTATAAACATACAAATT+AGG 0.366825 3:+30036123 None:intergenic
ATGTATGCTGCTTTAATTCA+AGG 0.372023 3:-30035448 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACAGTTACTTCTCTGATTGA+TGG 0.374274 3:-30035586 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGAGCTAGCTACCGAAGTTC+GGG 0.378071 3:-30030734 MsG0380013083.01.T01:CDS
GCTTATGTTACTCTCATTGA+TGG 0.380586 3:-30036321 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGAAGCCTATGACTTCATTA+TGG 0.382059 3:-30030827 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATTTCATCAAACACCTTGC+GGG 0.383050 3:+30036479 None:intergenic
GTTCGCCACATGACCGCATT+TGG 0.384506 3:+30030790 None:intergenic
CTTGGACTTCTATGATTGTT+GGG 0.386298 3:-30031083 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTAAGTTGATGAGGGAATCT+GGG 0.388236 3:-30036362 MsG0380013083.01.T01:CDS
GCAGCATACATAACCTCATT+TGG 0.388780 3:+30035460 None:intergenic
CCATATATCGTGTGTTGACT+AGG 0.390378 3:-30035240 MsG0380013083.01.T01:CDS
CAGCCAAAATGAGGCTCTCT+TGG 0.392400 3:+30030886 None:intergenic
TAGAGCTAGCTACCGAAGTT+CGG 0.392444 3:-30030735 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACTTGTAGTATACTTGTTAA+GGG 0.392987 3:-30036006 MsG0380013083.01.T01:CDS
CCAATGAACGTTACATCGTT+CGG 0.393289 3:+30030994 None:intergenic
TGAGGAAGCTAAGGATTTGA+TGG 0.393627 3:-30035962 MsG0380013083.01.T01:CDS
GAAGTAACTGTGACAACATT+TGG 0.400190 3:+30035598 None:intergenic
ATTGATGGGTATTGTAAAAT+GGG 0.404532 3:-30036306 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATAGTGTAAACCACCACATT+AGG 0.409166 3:+30036438 None:intergenic
ATTCAAGGTTTATGTAAAGA+TGG 0.413614 3:-30035433 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACTTGGACTTCTATGATTGT+TGG 0.420093 3:-30031084 MsG0380013083.01.T01:CDS
GACTTCATTATGGAGATGTC+GGG 0.420908 3:-30030817 MsG0380013083.01.T01:CDS
CCGAACGATGTAACGTTCAT+TGG 0.422661 3:-30030994 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATCTCCATAATGAAGTCAT+AGG 0.424247 3:+30030822 None:intergenic
GTAACATAAGCATACAAATT+CGG 0.424865 3:+30036333 None:intergenic
GTGTAAGGTGGGTGATTTGA+AGG 0.426188 3:-30036190 MsG0380013083.01.T01:CDS
AAATTTATAGTGATATGTTA+CGG 0.437889 3:-30036263 MsG0380013083.01.T01:CDS
AATGGATTCATGATTTCGTT+CGG 0.439749 3:-30031230 MsG0380013083.01.T01:CDS
AATGCAATTGCGAGATGAAA+TGG 0.445387 3:-30036058 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATCGACGGGCATTGCAAGGT+TGG 0.449040 3:-30035676 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTCAGCTCAATTGAAGTATG+AGG 0.449748 3:-30030580 None:intergenic
ACCTCTTTGTAAGAGATCAA+TGG 0.451120 3:+30032505 None:intergenic
TTCTTGGAGAAAACTGTAGT+TGG 0.451190 3:-30035523 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTCGCAAAAGTCACAACATC+AGG 0.453678 3:+30036228 None:intergenic
AAACAACATTCATTGACATA+AGG 0.455565 3:+30032452 None:intergenic
AAGTCTTTCCTTCTTTCAAA+AGG 0.458144 3:+30035563 None:intergenic
GTCGTCAAAACAATTTGATC+AGG 0.461530 3:+30031297 None:intergenic
GATTTCGTTCGGCGTAAACA+AGG 0.464665 3:-30031219 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGCTCAGAACACATTCGATC+TGG 0.467018 3:+30035190 None:intergenic
GTCGTGAAAGTCACCACATC+AGG 0.467832 3:+30035703 None:intergenic
TAAGGATTTGATGGAGGAGA+TGG 0.470456 3:-30035953 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTAGAAAATGTGATCACATT+GGG 0.470714 3:+30035808 None:intergenic
TAGACAACTGGCAGGACCTA+TGG 0.472695 3:-30034924 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATATATCGTGTGTTGACTA+GGG 0.476407 3:-30035239 MsG0380013083.01.T01:CDS
TATGGGGTTGTATACAGAAA+TGG 0.476795 3:-30035743 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCGACGGGCATTGCAAGGTT+GGG 0.479801 3:-30035675 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATGTGACTCGGGTAGGTTTG+AGG 0.479861 3:-30035980 MsG0380013083.01.T01:CDS
CTTTGTTTGAAACGGATTTG+AGG 0.482604 3:+30032586 None:intergenic
ATAACATAAAGCACCATGTC+TGG 0.483050 3:+30035355 None:intergenic
AGTGGCTTTCGAACTACATA+AGG 0.483534 3:-30035644 MsG0380013083.01.T01:CDS
CTTCTCTCAGATGGCCGCTT+CGG 0.484433 3:+30030845 None:intergenic
TTAATGGCTTGCAGCCATGC+AGG 0.486441 3:-30030967 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGGGAACATGAAAGCTGCTA+TGG 0.487281 3:-30035761 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTTGTTTGAAACGGATTTGA+GGG 0.491707 3:+30032587 None:intergenic
ACTAGGGTTTACGAAGAGAA+TGG 0.493119 3:-30035223 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTGAAAGAAGGAAAGACTTA+CGG 0.494873 3:-30035559 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATTAAACAGTCTAAAGCTCA+TGG 0.498265 3:-30030604 MsG0380013083.01.T01:CDS
AAAACTGTAGTTGGTTCCCC+TGG 0.498557 3:-30035514 MsG0380013083.01.T01:CDS
CGCCACATGACCGCATTTGG+AGG 0.499879 3:+30030793 None:intergenic
TTTGGTGACTTTGTTTGAAA+CGG 0.501539 3:+30032578 None:intergenic
AACTTGGACCCTGGCTATGT+TGG 0.503329 3:-30030700 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATACTGCAAAATGAGTGATA+TGG 0.504819 3:-30035878 MsG0380013083.01.T01:CDS
AAGGATTTGATGGAGGAGAT+GGG 0.506008 3:-30035952 MsG0380013083.01.T01:CDS
CGGGTTGTGTTCTCCAAATG+AGG 0.507646 3:-30035473 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACACTGTCACCAACATAGCC+AGG 0.508652 3:+30030691 None:intergenic
TTTGATTGATGGTTACTGTA+AGG 0.509848 3:-30036100 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATTGATGGTTACTGTAAGGC+GGG 0.512745 3:-30036096 MsG0380013083.01.T01:CDS
CTTTCACGACTTTGATCGAC+GGG 0.513629 3:-30035690 MsG0380013083.01.T01:CDS
GATCAATGGCCTCCGGAGCT+AGG 0.514530 3:+30032519 None:intergenic
TTTGATCGACGGGCATTGCA+AGG 0.515442 3:-30035680 MsG0380013083.01.T01:CDS
GATGGCCGCTTCGGCATAAG+AGG 0.515941 3:+30030854 None:intergenic
GCTTTATGTTATCATGTTGG+AGG 0.516254 3:-30035344 MsG0380013083.01.T01:CDS
GCCAGAAACATCCTTCAGTT+CGG 0.516837 3:-30034950 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGCTTGCAGCCATGCAGGGT+TGG 0.517253 3:-30030962 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGTTAAGGGTTTATGTGACT+CGG 0.518547 3:-30035992 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGGAACATGAAAGCTGCTAT+GGG 0.521388 3:-30035760 MsG0380013083.01.T01:CDS
TATAGTGATATGTTACGGAA+TGG 0.524314 3:-30036258 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGGGACTCGAAATGGGTGAA+TGG 0.526248 3:-30031248 MsG0380013083.01.T01:CDS
CTCTGCTTGTGCGGATACTG+GGG 0.527610 3:-30031268 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTTATGCGGATAAAGAAATG+TGG 0.529626 3:-30030654 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATGCAGGGTTGGTCGAGGA+AGG 0.533971 3:-30030952 MsG0380013083.01.T01:CDS
CGAACTACATAAGGAGATGA+TGG 0.534084 3:-30035635 MsG0380013083.01.T01:CDS
GCATGCAGACATGCTGAAGA+TGG 0.535701 3:-30035281 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGACTTCATTATGGAGATGT+CGG 0.540917 3:-30030818 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTTGTCTATCTCCGAACTGA+AGG 0.543335 3:+30034939 None:intergenic
CTTCCTCGACCAACCCTGCA+TGG 0.543742 3:+30030953 None:intergenic
TAATGGCTTGCAGCCATGCA+GGG 0.545224 3:-30030966 MsG0380013083.01.T01:CDS
CGTAGAAAATGTGATCACAT+TGG 0.548302 3:+30035807 None:intergenic
TCCACCATGCAGCCAAAATG+AGG 0.549442 3:+30030877 None:intergenic
AGGGTTTATGTGACTCGGGT+AGG 0.550850 3:-30035987 MsG0380013083.01.T01:CDS
CAGCCATGCAGGGTTGGTCG+AGG 0.553230 3:-30030956 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCGGGATAAGTTGATCAACT+TGG 0.554374 3:-30030716 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGTGCTTTATGTTATCATGT+TGG 0.555378 3:-30035347 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCAGTTCGGAGATAGACAAC+TGG 0.557923 3:-30034936 MsG0380013083.01.T01:CDS
CTTATGTTACTCTCATTGAT+GGG 0.558300 3:-30036320 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGATATGGATGAAGCTGAGA+GGG 0.560016 3:-30036388 MsG0380013083.01.T01:CDS
GATTGATGGTTACTGTAAGG+CGG 0.560657 3:-30036097 MsG0380013083.01.T01:CDS
AAGTTGATCAACTTGGACCC+TGG 0.561685 3:-30030709 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGATATGGAGAAGGCTATTG+AGG 0.562395 3:-30035863 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTTAAGGGTTTATGTGACTC+GGG 0.565186 3:-30035991 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGGTAGGTTTGAGGAAGCTA+AGG 0.565965 3:-30035971 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGTAAGAGATCAATGGCCTC+CGG 0.566369 3:+30032512 None:intergenic
TTCAAAGAAATGAGATGTAG+CGG 0.567499 3:-30035385 MsG0380013083.01.T01:CDS
GAGGTAAAACTGATCATAGC+GGG 0.568249 3:-30035492 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCATTTCATCAAACACCTTG+CGG 0.569517 3:+30036478 None:intergenic
CAAAATGAGTGATATGGAGA+AGG 0.569735 3:-30035872 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTTGATGAAATGATTCAAAG+AGG 0.571470 3:-30036468 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGAAGCTAAGGATTTGATGG+AGG 0.573686 3:-30035959 MsG0380013083.01.T01:CDS
TAAGTTGATGAGGGAATCTG+GGG 0.576422 3:-30036361 MsG0380013083.01.T01:CDS
GAAACAAAGATGTCACGACT+TGG 0.576635 3:-30031101 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGTGTTCACAAATGACTGAA+AGG 0.576663 3:-30035840 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTATGCGGATAAAGAAATGT+GGG 0.576846 3:-30030653 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGCCTCCAAATGCGGTCATG+TGG 0.577829 3:-30030795 MsG0380013083.01.T01:CDS
GACTGCTCTCTCTGCTTGTG+CGG 0.578783 3:-30031277 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGTCATAGGCTTCTCTCAGA+TGG 0.581175 3:+30030836 None:intergenic
GATCAACTTATCCCGAACTT+CGG 0.581989 3:+30030723 None:intergenic
CGAGATGAAATGGAACGGAA+TGG 0.583045 3:-30036048 MsG0380013083.01.T01:CDS
AAGAGGAATTGTACCTAATG+TGG 0.585469 3:-30036451 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATTTCGTTCGGCGTAAACAA+GGG 0.585666 3:-30031218 MsG0380013083.01.T01:CDS
TATACAGAAATGGTTATCAA+AGG 0.586944 3:-30035733 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATTGTTGGGCATGCAGTACA+TGG 0.592177 3:-30031069 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGCTTTGTCGAATATTTATG+CGG 0.592545 3:-30030668 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGATGGTTACTGTAAGGCGG+GGG 0.596578 3:-30036094 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATAAATATGTACGCTAAGTG+TGG 0.599816 3:-30031162 MsG0380013083.01.T01:CDS
CAAAGGTCTTACGCCTGATG+TGG 0.599944 3:-30035716 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGGAATTGTACCTAATGTGG+TGG 0.608135 3:-30036448 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATGCAGACATGCTGAAGAT+GGG 0.608440 3:-30035280 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTCGGAGATAGACAACTGGC+AGG 0.613428 3:-30034932 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATGCAGGGTTGGTCGAGGAA+GGG 0.614688 3:-30030951 MsG0380013083.01.T01:CDS
TGGTTCTATACCATAATCGT+TGG 0.616273 3:+30030906 None:intergenic
GATGTCGGGGCCTCCAAATG+CGG 0.616318 3:-30030803 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATTCGTTAGTCAAATCGAAG+AGG 0.617443 3:-30036617 MsG0380013083.01.T01:intron
TCATGTGGCGAACCTTACTG+GGG 0.622209 3:-30030780 MsG0380013083.01.T01:CDS
TAGCGGTTTCAAACCAGACA+TGG 0.631147 3:-30035368 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTTGATGAGGGAATCTGGGG+TGG 0.631923 3:-30036358 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACATAAGGAGATGATGGACG+CGG 0.634365 3:-30035629 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACTTACAATGTGGTAATCGA+TGG 0.636312 3:-30035901 MsG0380013083.01.T01:CDS
ATCGGGAGTACTCTCTCCAT+AGG 0.637140 3:+30034908 None:intergenic
GCCATTGATCTCTTACAAAG+AGG 0.640123 3:-30032506 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACTTTCACGACTTTGATCGA+CGG 0.640493 3:-30035691 MsG0380013083.01.T01:CDS
ACTGTAGTTGGTTCCCCTGG+AGG 0.644148 3:-30035511 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTGGACCTCTTATGCCGAAG+CGG 0.650639 3:-30030859 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTGGTGATATTGTAAATGCA+AGG 0.650877 3:-30031143 MsG0380013083.01.T01:CDS
CACTGTCACCAACATAGCCA+GGG 0.652366 3:+30030692 None:intergenic
CAAGGTTGGGAACAACAAAG+TGG 0.652412 3:-30035662 MsG0380013083.01.T01:CDS
TCTGCTTGTGCGGATACTGG+GGG 0.653540 3:-30031267 MsG0380013083.01.T01:CDS
GTGATATGGATGAAGCTGAG+AGG 0.657997 3:-30036389 MsG0380013083.01.T01:CDS
TTGATGGTTACTGTAAGGCG+GGG 0.662041 3:-30036095 MsG0380013083.01.T01:CDS
AGGGTTTACGAAGAGAATGG+AGG 0.663157 3:-30035220 MsG0380013083.01.T01:CDS
AATTGCGAGATGAAATGGAA+CGG 0.667691 3:-30036053 MsG0380013083.01.T01:CDS
TAGCTAGCTCTAAATCACCA+TGG 0.678529 3:+30030746 None:intergenic
ACTTCATTATGGAGATGTCG+GGG 0.679384 3:-30030816 MsG0380013083.01.T01:CDS
CATAAGGAGATGATGGACGC+GGG 0.682086 3:-30035628 MsG0380013083.01.T01:CDS
AATGAACGTTACATCGTTCG+GGG 0.683693 3:+30030996 None:intergenic
CATGTGGCGAACCTTACTGG+GGG 0.684880 3:-30030779 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGAACATGAAAGCTGCTATG+GGG 0.716794 3:-30035759 MsG0380013083.01.T01:CDS
GCTGATGCTGATGAACAATG+TGG 0.735005 3:-30031322 MsG0380013083.01.T01:CDS
GGAGGTAAAACTGATCATAG+CGG 0.735536 3:-30035493 MsG0380013083.01.T01:CDS
CTAGCTCTAAATCACCATGG+AGG 0.775076 3:+30030749 None:intergenic
TAATGCTGTGACTTACAATG+TGG 0.778327 3:-30035911 MsG0380013083.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTATTTTTATTTTTTATTTT+TGG + Chr3:30032732-30032751 None:intergenic 0.0%
!! AAAAATAAAAAATCCATTAT+GGG - Chr3:30032744-30032763 MsG0380013083.01.T01:intron 10.0%
!! ATTTAGATAAGATATAATAT+TGG + Chr3:30035224-30035243 None:intergenic 10.0%
!! TAAAAATAAAAAATCCATTA+TGG - Chr3:30032743-30032762 MsG0380013083.01.T01:intron 10.0%
!! TTTAGATAAGATATAATATT+GGG + Chr3:30035223-30035242 None:intergenic 10.0%
!! AAATTTATAGTGATATGTTA+CGG - Chr3:30030953-30030972 MsG0380013083.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGTTATAACACTAATAATA+AGG + Chr3:30032620-30032639 None:intergenic 15.0%
!! AGTTATAACACTAATAATAA+GGG + Chr3:30032619-30032638 None:intergenic 15.0%
!! CAATTATAAACATACAAATT+AGG + Chr3:30031096-30031115 None:intergenic 15.0%
!! TAATTGTGAAATGAAATAAT+GGG - Chr3:30034857-30034876 MsG0380013083.01.T01:intron 15.0%
!! TTAATTGTGAAATGAAATAA+TGG - Chr3:30034856-30034875 MsG0380013083.01.T01:intron 15.0%
!! TTTCAAGAAGATAATTAAAA+AGG + Chr3:30033100-30033119 None:intergenic 15.0%
!! TTTGTTTATATGGATAAATT+TGG - Chr3:30031063-30031082 MsG0380013083.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAATGATTTTTTTAGCAAAA+TGG + Chr3:30034983-30035002 None:intergenic 15.0%
!!! ATTAAGAAAAAAATGGATTT+TGG + Chr3:30035043-30035062 None:intergenic 15.0%
!!! CAACATATAATATTCTTTTT+GGG + Chr3:30035811-30035830 None:intergenic 15.0%
!! AAAAAAAATCCAAAACAAAC+AGG + Chr3:30034883-30034902 None:intergenic 20.0%
!! AAAACAATAGTAAAAAGAGA+TGG - Chr3:30035283-30035302 MsG0380013083.01.T01:CDS 20.0%
!! AAACAGAATTCATTATACAA+CGG + Chr3:30033185-30033204 None:intergenic 20.0%
!! AAATTGAAATAGAAGAGAAT+TGG + Chr3:30032171-30032190 None:intergenic 20.0%
!! AATAACATCTTCAAATGTTA+AGG + Chr3:30033056-30033075 None:intergenic 20.0%
!! CCAAAAAGAATATTATATGT+TGG - Chr3:30035809-30035828 MsG0380013083.01.T01:CDS 20.0%
!! GAAAATCATAAATCGAATAA+AGG - Chr3:30035856-30035875 MsG0380013083.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTTATAATTGTTTGATTGA+TGG - Chr3:30031105-30031124 MsG0380013083.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATGTTGTTTTCAAAAGTAT+TGG - Chr3:30034777-30034796 MsG0380013083.01.T01:intron 20.0%
!!! ACTGTTACTTTAAAATTGTT+GGG + Chr3:30032142-30032161 None:intergenic 20.0%
!!! AGGAGAAATATATTTTGATA+TGG - Chr3:30034471-30034490 MsG0380013083.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATCCAAATTTTATGATGA+GGG + Chr3:30035698-30035717 None:intergenic 20.0%
!!! CCAACATATAATATTCTTTT+TGG + Chr3:30035812-30035831 None:intergenic 20.0%
!!! CTATTTCAATTTTCATCATT+TGG - Chr3:30032179-30032198 MsG0380013083.01.T01:intron 20.0%
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!!! GCATTCAAGATAATTTTTAA+GGG + Chr3:30035524-30035543 None:intergenic 20.0%
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!!! TGCATTCAAGATAATTTTTA+AGG + Chr3:30035525-30035544 None:intergenic 20.0%
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!!! TCCATTTTTTTCTTAATGCA+AGG - Chr3:30035046-30035065 MsG0380013083.01.T01:intron 25.0%
AAAGACAGAATTAATGAGAG+GGG - Chr3:30034030-30034049 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
AAGTCACCAAACATGATAAA+AGG - Chr3:30034650-30034669 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
AAGTCTTTCCTTCTTTCAAA+AGG + Chr3:30031656-30031675 None:intergenic 30.0%
ACATAAAAGTTTGCAGTGAT+GGG - Chr3:30033132-30033151 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
AGGTTAAGAATTTGATATGG+CGG + Chr3:30033900-30033919 None:intergenic 30.0%
AGTACCAATCTGTAATGTAA+TGG - Chr3:30032421-30032440 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
ATAAATATGTACGCTAAGTG+TGG - Chr3:30036054-30036073 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
ATACTGCAAAATGAGTGATA+TGG - Chr3:30031338-30031357 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
ATCACGATAATATATCGCAA+CGG - Chr3:30032091-30032110 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
ATTGAACTGTTGTTGTAATC+AGG - Chr3:30030699-30030718 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
CAAAGACAGAATTAATGAGA+GGG - Chr3:30034029-30034048 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
CAATGAATGAAAGATGATAC+GGG + Chr3:30032552-30032571 None:intergenic 30.0%
CAATTTCAGAACAATGACAT+GGG + Chr3:30035366-30035385 None:intergenic 30.0%
CGAAGGTTAAGAATTTGATA+TGG + Chr3:30033903-30033922 None:intergenic 30.0%
CTTATGTTACTCTCATTGAT+GGG - Chr3:30030896-30030915 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
GTAAACTTTACATGTCATGA+AGG - Chr3:30032806-30032825 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
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GTTATTATAAACACTCCACA+CGG + Chr3:30030632-30030651 None:intergenic 30.0%
TAATGCAATAACTATGACTG+TGG - Chr3:30032508-30032527 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
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TCAAAGACAGAATTAATGAG+AGG - Chr3:30034028-30034047 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
TCAAATGAGTGAGAACAAAT+TGG - Chr3:30035432-30035451 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
TCAATTTCAGAACAATGACA+TGG + Chr3:30035367-30035386 None:intergenic 30.0%
TCCATTTACTAAGATTGTGA+TGG - Chr3:30032224-30032243 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
TCTAAAGAATAGAAGAACCT+TGG + Chr3:30035557-30035576 None:intergenic 30.0%
TGCTTTGTCGAATATTTATG+CGG - Chr3:30036548-30036567 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
TGGAATTACTAGTAAAGGAA+TGG + Chr3:30033007-30033026 None:intergenic 30.0%
TTATGCGGATAAAGAAATGT+GGG - Chr3:30036563-30036582 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
TTATTGTGAAACTGAGCTAT+GGG + Chr3:30035466-30035485 None:intergenic 30.0%
TTCAAAGAAATGAGATGTAG+CGG - Chr3:30031831-30031850 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
TTCAGCATACACTTTCAAAA+GGG + Chr3:30035746-30035765 None:intergenic 30.0%
TTGAAAGAAGGAAAGACTTA+CGG - Chr3:30031657-30031676 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
TTGAAATAGAAGAGAATTGG+AGG + Chr3:30032168-30032187 None:intergenic 30.0%
TTGAACTGTTGTTGTAATCA+GGG - Chr3:30030700-30030719 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
TTTATGCGGATAAAGAAATG+TGG - Chr3:30036562-30036581 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! AATGGATTCATGATTTCGTT+CGG - Chr3:30035986-30036005 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
! AATGTGTTCTGAGCATTTAA+TGG - Chr3:30032034-30032053 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! ACAACACCTTTTATCATGTT+TGG + Chr3:30034659-30034678 None:intergenic 30.0%
! AGGATTATAGGTATGTGTTT+TGG - Chr3:30032348-30032367 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! ATTAAACAGTCTAAAGCTCA+TGG - Chr3:30036612-30036631 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! CATTGATGGGTATTGTAAAA+TGG - Chr3:30030909-30030928 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
! GACGGGTATTAAATTTTCAT+TGG + Chr3:30033027-30033046 None:intergenic 30.0%
! GATTGCTTTCGAAAAGTATA+AGG - Chr3:30032328-30032347 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! GTTTTCCTTGAATATAGGAA+TGG + Chr3:30035666-30035685 None:intergenic 30.0%
! TATACTTTTCGAAAGCAATC+GGG + Chr3:30032328-30032347 None:intergenic 30.0%
! TATTCTACACTTTTGCTTCT+TGG - Chr3:30034053-30034072 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! TGGTGATTTTTCTCTTAACA+AGG + Chr3:30035581-30035600 None:intergenic 30.0%
! TTAGTACATTTTGCAATGCA+GGG - Chr3:30033241-30033260 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
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! TTTAGTACATTTTGCAATGC+AGG - Chr3:30033240-30033259 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
! TTTGATTGATGGTTACTGTA+AGG - Chr3:30031116-30031135 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGGTGACTTTGTTTGAAA+CGG + Chr3:30034641-30034660 None:intergenic 30.0%
! TTTGTTAATGCAGGCTTTAA+GGG + Chr3:30035641-30035660 None:intergenic 30.0%
! TTTGTTTGAAACGGATTTGA+GGG + Chr3:30034632-30034651 None:intergenic 30.0%
! TTTTGTTAATGCAGGCTTTA+AGG + Chr3:30035642-30035661 None:intergenic 30.0%
! TTTTTGTAATGAGGGTGATA+TGG - Chr3:30030813-30030832 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
!! AACGTTCATTGGAGTTTTAA+TGG - Chr3:30036233-30036252 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
!! ACATTTTCTACGTTGATTGA+TGG - Chr3:30031420-30031439 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
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!! CATTTTCTACGTTGATTGAT+GGG - Chr3:30031421-30031440 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
!! GGTGTTGTGTTTAACAATTT+TGG - Chr3:30034671-30034690 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
!! TCTGAGCATTTAATGGATTA+TGG - Chr3:30032041-30032060 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
!! TTTGATTTTGTCATGAGTCA+TGG - Chr3:30032572-30032591 MsG0380013083.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACTTTTTGCTTGTGTTGTTT+GGG + Chr3:30033622-30033641 None:intergenic 30.0%
!!! ATCGGTGAATCATTGATTTT+TGG - Chr3:30033305-30033324 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTGATGGGTTTTGCAAAAA+AGG - Chr3:30031435-30031454 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
!!! GGTTTGGTTTTTGTTGTTTA+AGG + Chr3:30035498-30035517 None:intergenic 30.0%
!!! GTATTGGTTTTGTCATTGAA+AGG - Chr3:30034793-30034812 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
!!! TTGATGGGTTTTGCAAAAAA+GGG - Chr3:30031436-30031455 MsG0380013083.01.T01:intron 30.0%
AAAGAGATCATGCACTATTG+TGG - Chr3:30034160-30034179 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
AAATGTTAAGGTGACAAGAC+GGG + Chr3:30033044-30033063 None:intergenic 35.0%
AACTTTCCATGCTCAACATT+AGG - Chr3:30033271-30033290 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
AAGAGGAATTGTACCTAATG+TGG - Chr3:30030765-30030784 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
AAGGGTCAATTGGATAGATT+TGG - Chr3:30032825-30032844 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
AATCAAGCTCATACCCATAA+TGG + Chr3:30032760-30032779 None:intergenic 35.0%
AATGATTCACCGATGAATGA+TGG + Chr3:30033299-30033318 None:intergenic 35.0%
AATGCAATTGCGAGATGAAA+TGG - Chr3:30031158-30031177 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
AATTGCGAGATGAAATGGAA+CGG - Chr3:30031163-30031182 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
ACAAATACTTCCTAAACCCA+AGG + Chr3:30032881-30032900 None:intergenic 35.0%
ACACTTTCAAAAGGGATGTT+TGG + Chr3:30035738-30035757 None:intergenic 35.0%
ACAGTTACTTCTCTGATTGA+TGG - Chr3:30031630-30031649 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
ACCTCTTTGTAAGAGATCAA+TGG + Chr3:30034714-30034733 None:intergenic 35.0%
ACTTACAATGTGGTAATCGA+TGG - Chr3:30031315-30031334 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
ACTTAGGTCAATAAGTGGAT+AGG - Chr3:30034523-30034542 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
ACTTGGACTTCTATGATTGT+TGG - Chr3:30036132-30036151 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGCCTATGACTTCATTA+TGG - Chr3:30036389-30036408 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
AGCAACGAAATAACAAAGTC+TGG + Chr3:30033590-30033609 None:intergenic 35.0%
AGGGTCAATTGGATAGATTT+GGG - Chr3:30032826-30032845 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
AGTGCATGATCTCTTTATGT+AGG + Chr3:30034156-30034175 None:intergenic 35.0%
ATAGTGTAAACCACCACATT+AGG + Chr3:30030781-30030800 None:intergenic 35.0%
ATCAAATTCTTAACCTTCGG+CGG - Chr3:30033904-30033923 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
ATTCCATATGTGATCACAGT+AGG + Chr3:30030676-30030695 None:intergenic 35.0%
ATTCGTTAGTCAAATCGAAG+AGG - Chr3:30030599-30030618 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
CAAAATGAGTGATATGGAGA+AGG - Chr3:30031344-30031363 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
CAAAGTATGACCAACGATTA+TGG - Chr3:30036300-30036319 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
CAAATGTTAAGGTGACAAGA+CGG + Chr3:30033045-30033064 None:intergenic 35.0%
CAATCTGTAATGTAATGGCT+CGG - Chr3:30032426-30032445 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
CATCTCCATAATGAAGTCAT+AGG + Chr3:30036397-30036416 None:intergenic 35.0%
CATGCCCTCATCATAAAATT+TGG - Chr3:30035691-30035710 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
CATGGTGATAAAGTAGGTAT+TGG + Chr3:30033387-30033406 None:intergenic 35.0%
CATTCATGACACACATGAAA+CGG - Chr3:30035395-30035414 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
CGAATTTGATTGCATGACAA+AGG + Chr3:30033853-30033872 None:intergenic 35.0%
CGTAGAAAATGTGATCACAT+TGG + Chr3:30031412-30031431 None:intergenic 35.0%
CTATCAATGGAGTTGAAAGT+TGG + Chr3:30035601-30035620 None:intergenic 35.0%
CTTCAGCATACACTTTCAAA+AGG + Chr3:30035747-30035766 None:intergenic 35.0%
CTTGGACTTCTATGATTGTT+GGG - Chr3:30036133-30036152 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTAACTGTGACAACATT+TGG + Chr3:30031621-30031640 None:intergenic 35.0%
GACATAAAAGTTTGCAGTGA+TGG - Chr3:30033131-30033150 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
GCCATCACAATCTTAGTAAA+TGG + Chr3:30032228-30032247 None:intergenic 35.0%
GCTTATGTTACTCTCATTGA+TGG - Chr3:30030895-30030914 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
GCTTTATGTTATCATGTTGG+AGG - Chr3:30031872-30031891 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
GGTGCTTTATGTTATCATGT+TGG - Chr3:30031869-30031888 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
GGTTAAGAATTTGATATGGC+GGG + Chr3:30033899-30033918 None:intergenic 35.0%
GTCGTCAAAACAATTTGATC+AGG + Chr3:30035922-30035941 None:intergenic 35.0%
GTGGTGATATTGTAAATGCA+AGG - Chr3:30036073-30036092 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
GTTATTGTGAAACTGAGCTA+TGG + Chr3:30035467-30035486 None:intergenic 35.0%
TAATGCTGTGACTTACAATG+TGG - Chr3:30031305-30031324 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
TAATGTAACTCGATGTCATG+TGG - Chr3:30032699-30032718 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
TATGGGGTTGTATACAGAAA+TGG - Chr3:30031473-30031492 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
TATTGTGAAACTGAGCTATG+GGG + Chr3:30035465-30035484 None:intergenic 35.0%
TCATGCAATCAAATTCGAGT+TGG - Chr3:30033856-30033875 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
TCATTATACAACGGCATTAC+TGG + Chr3:30033176-30033195 None:intergenic 35.0%
TCATTTCATCAAACACCTTG+CGG + Chr3:30030741-30030760 None:intergenic 35.0%
TGACTTCATTATGGAGATGT+CGG - Chr3:30036398-30036417 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
TGGGTATTTCATCAAACACT+TGG + Chr3:30035792-30035811 None:intergenic 35.0%
TGTGTTCACAAATGACTGAA+AGG - Chr3:30031376-30031395 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
TGTTAAGGGTTTATGTGACT+CGG - Chr3:30031224-30031243 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTGGAGAAAACTGTAGT+TGG - Chr3:30031693-30031712 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
! ATAACATAAAGCACCATGTC+TGG + Chr3:30031864-30031883 None:intergenic 35.0%
! ATGTTGGACGTCTTTGATTT+CGG - Chr3:30035825-30035844 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
! CACATAAGCTCCATATGTTT+TGG - Chr3:30033739-30033758 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
! CGTTGGTCATACTTTGAAAA+TGG + Chr3:30036296-30036315 None:intergenic 35.0%
! CTTTGTTTGAAACGGATTTG+AGG + Chr3:30034633-30034652 None:intergenic 35.0%
! GGAATGGTTTTTGTTAATGC+AGG + Chr3:30035650-30035669 None:intergenic 35.0%
! GGATGTTTGGAGTTGAATTA+TGG + Chr3:30035725-30035744 None:intergenic 35.0%
! GTTGATGTTTTGTGTAAGGT+GGG - Chr3:30031015-30031034 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
! TAGTACATTTTGCAATGCAG+GGG - Chr3:30033242-30033261 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
! TATGATCAGTTTTACCTCCA+GGG + Chr3:30031722-30031741 None:intergenic 35.0%
! TGGTTCTATACCATAATCGT+TGG + Chr3:30036313-30036332 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTCATTGAAAGGACCA+GGG - Chr3:30034800-30034819 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! AGTTGATGTTTTGTGTAAGG+TGG - Chr3:30031014-30031033 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGGAAATTTTGACCGACAA+GGG - Chr3:30034490-30034509 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! ATTGATGGCCTTTTGAAAGA+AGG - Chr3:30031645-30031664 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! CACTTTTTGCTTGTGTTGTT+TGG + Chr3:30033623-30033642 None:intergenic 35.0%
!! CAGAAATGCTTTTTATCGTG+AGG - Chr3:30034194-30034213 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! CATATATCGTGTGTTGACTA+GGG - Chr3:30031977-30031996 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! CTTTTGAAAGTGTATGCTGA+AGG - Chr3:30035745-30035764 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!! GCGAAACTGCTTTGTTTATA+TGG - Chr3:30031053-30031072 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!! TATAATAACTTGCTGTCGCA+CGG - Chr3:30030643-30030662 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!! TATGGAAATTTTGACCGACA+AGG - Chr3:30034489-30034508 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! TGAGACTTTTGTTGTATGAC+AGG - Chr3:30034603-30034622 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!! TTAAGTTGATGAGGGAATCT+GGG - Chr3:30030854-30030873 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGGCTCATGTAATTTGCTT+TGG + Chr3:30033942-30033961 None:intergenic 35.0%
!! TTTAAGTTGATGAGGGAATC+TGG - Chr3:30030853-30030872 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!!! AATAATGGGCCTGTTTGTTT+TGG - Chr3:30034871-30034890 MsG0380013083.01.T01:intron 35.0%
!!! AGAGGGTTTTTAAGTTGATG+AGG - Chr3:30030845-30030864 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTTTTGCTTGTGTTGTTTG+GGG + Chr3:30033621-30033640 None:intergenic 35.0%
!!! GAGGGTTTTTAAGTTGATGA+GGG - Chr3:30030846-30030865 MsG0380013083.01.T01:CDS 35.0%
AAGGATTTGATGGAGGAGAT+GGG - Chr3:30031264-30031283 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
AATGAACGTTACATCGTTCG+GGG + Chr3:30036223-30036242 None:intergenic 40.0%
AATTGAGTTCCATCATGCAC+TGG - Chr3:30034109-30034128 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
ACATGTCATGAAGGGTCAAT+TGG - Chr3:30032815-30032834 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
ACTAGGGTTTACGAAGAGAA+TGG - Chr3:30031993-30032012 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
ACTTCATTATGGAGATGTCG+GGG - Chr3:30036400-30036419 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
ACTTTCACGACTTTGATCGA+CGG - Chr3:30031525-30031544 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
AGAATAGAAGAACCTTGGTG+TGG + Chr3:30035552-30035571 None:intergenic 40.0%
AGAGAGAAGTTGTGTATGCT+CGG + Chr3:30034306-30034325 None:intergenic 40.0%
AGGAATTGTACCTAATGTGG+TGG - Chr3:30030768-30030787 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
AGTCTGAACTAATATGGAGC+AGG + Chr3:30033485-30033504 None:intergenic 40.0%
AGTGGCTTTCGAACTACATA+AGG - Chr3:30031572-30031591 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
AGTGTCAAGGTTCTTAGGTA+TGG - Chr3:30032372-30032391 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
ATTTCGTTCGGCGTAAACAA+GGG - Chr3:30035998-30036017 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
CAATGAACGTTACATCGTTC+GGG + Chr3:30036224-30036243 None:intergenic 40.0%
CATTTCATCAAACACCTTGC+GGG + Chr3:30030740-30030759 None:intergenic 40.0%
CCAATGAACGTTACATCGTT+CGG + Chr3:30036225-30036244 None:intergenic 40.0%
CCTACTTTATCACCATGAGT+CGG - Chr3:30033390-30033409 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
CCTAGTCAACACACGATATA+TGG + Chr3:30031979-30031998 None:intergenic 40.0%
CGAACTACATAAGGAGATGA+TGG - Chr3:30031581-30031600 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
CGAGCCATTACATTACAGAT+TGG + Chr3:30032428-30032447 None:intergenic 40.0%
CTCCATATTAGTTCAGACTG+CGG - Chr3:30033486-30033505 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
CTTAATGCAAGGAACTCAAG+TGG - Chr3:30035057-30035076 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
CTTCACTAACAGTTTCCAGT+CGG - Chr3:30033509-30033528 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
GAAACAAAGATGTCACGACT+TGG - Chr3:30036115-30036134 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
GACTTCATTATGGAGATGTC+GGG - Chr3:30036399-30036418 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
GAGGTAAAACTGATCATAGC+GGG - Chr3:30031724-30031743 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
GATCAACTTATCCCGAACTT+CGG + Chr3:30036496-30036515 None:intergenic 40.0%
GCAGCATACATAACCTCATT+TGG + Chr3:30031759-30031778 None:intergenic 40.0%
GCCATTGATCTCTTACAAAG+AGG - Chr3:30034710-30034729 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
GGAGGTAAAACTGATCATAG+CGG - Chr3:30031723-30031742 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
GTGCATAGAACACAATGACT+TGG - Chr3:30033817-30033836 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
GTGTCAAGGTTCTTAGGTAT+GGG - Chr3:30032373-30032392 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
GTTAAGGGTTTATGTGACTC+GGG - Chr3:30031225-30031244 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
TAAGGATTTGATGGAGGAGA+TGG - Chr3:30031263-30031282 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
TCAGAACAATGACATGGGTT+AGG + Chr3:30035361-30035380 None:intergenic 40.0%
TCGACACTTAGGTCAATAAG+TGG - Chr3:30034518-30034537 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
TCTTTAACACCAGTGCATGA+TGG + Chr3:30034121-30034140 None:intergenic 40.0%
TGAAATTGCAACTCTAGCCT+TGG - Chr3:30032861-30032880 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
TGAGGAAGCTAAGGATTTGA+TGG - Chr3:30031254-30031273 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
TGATATGGAGAAGGCTATTG+AGG - Chr3:30031353-30031372 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
TGATATGGATGAAGCTGAGA+GGG - Chr3:30030828-30030847 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
TTCGCAAAAGTCACAACATC+AGG + Chr3:30030991-30031010 None:intergenic 40.0%
! AGTGCATGATGGAACTCAAT+TGG + Chr3:30034110-30034129 None:intergenic 40.0%
! ATGATCAGTTTTACCTCCAG+GGG + Chr3:30031721-30031740 None:intergenic 40.0%
! ATGCACTGGTGTTAAAGAAG+TGG - Chr3:30034123-30034142 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
! ATGGAACGGAATGGAGTTTT+CGG - Chr3:30031177-30031196 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGATGGTTACTGTAAGGC+GGG - Chr3:30031120-30031139 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
! CATTAGGTGCCATCATTCAT+CGG - Chr3:30033287-30033306 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
! CGGTGCAATCAAACTTTTCT+TGG - Chr3:30031677-30031696 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
! CTATGATCAGTTTTACCTCC+AGG + Chr3:30031723-30031742 None:intergenic 40.0%
! GAAATTGCAACTCTAGCCTT+GGG - Chr3:30032862-30032881 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
! GATTGATGGTTACTGTAAGG+CGG - Chr3:30031119-30031138 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTGTCATTGAAAGGACC+AGG - Chr3:30034799-30034818 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
! TTACCGAGGATTGAAGCATT+TGG + Chr3:30033961-30033980 None:intergenic 40.0%
! TTGAAAGTGTATGCTGAAGG+TGG - Chr3:30035748-30035767 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
!! AACAGCAGTGCTATTTAGAG+AGG + Chr3:30034380-30034399 None:intergenic 40.0%
!! AGGATGTTTCTGGCAGTAAT+TGG + Chr3:30032260-30032279 None:intergenic 40.0%
!! ATAATAACTTGCTGTCGCAC+GGG - Chr3:30030644-30030663 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGCTTTTTATCGTGAGGAG+TGG - Chr3:30034199-30034218 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
!! CCATATATCGTGTGTTGACT+AGG - Chr3:30031976-30031995 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
!! GCAATCAAATTCGAGTTGGA+AGG - Chr3:30033860-30033879 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
!! TAAGTTGATGAGGGAATCTG+GGG - Chr3:30030855-30030874 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGCTAGCTCTAAATCACCA+TGG + Chr3:30036473-30036492 None:intergenic 40.0%
!! TCGGGATAAGTTGATCAACT+TGG - Chr3:30036500-30036519 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
!! TGATTTTAGTAATGCCCGCA+AGG - Chr3:30030723-30030742 MsG0380013083.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGAAATTTTGACCGACAAG+GGG - Chr3:30034491-30034510 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
!!! TATGTGTTTTGGCAGTGTCA+AGG - Chr3:30032359-30032378 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
!!! TCCATATGTTTTGGCTACTG+AGG - Chr3:30033748-30033767 MsG0380013083.01.T01:intron 40.0%
AGCCGCAGTCTGAACTAATA+TGG + Chr3:30033491-30033510 None:intergenic 45.0%
AGGAGTGAAACATGCATGTG+TGG - Chr3:30034543-30034562 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
AGGGAACATGAAAGCTGCTA+TGG - Chr3:30031455-30031474 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
AGGGTTTACGAAGAGAATGG+AGG - Chr3:30031996-30032015 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
AGTCATAGGCTTCTCTCAGA+TGG + Chr3:30036383-30036402 None:intergenic 45.0%
ATCACCATGAGTCGGAAAAG+AGG - Chr3:30033398-30033417 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
ATGGAGGAGATGGGAAAAAC+TGG - Chr3:30031273-30031292 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
ATGGCACCTAATGTTGAGCA+TGG + Chr3:30033280-30033299 None:intergenic 45.0%
ATTGCCACCTCATGTTGTGA+TGG + Chr3:30034234-30034253 None:intergenic 45.0%
ATTGTTGGGCATGCAGTACA+TGG - Chr3:30036147-30036166 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
CAAGGTTGGGAACAACAAAG+TGG - Chr3:30031554-30031573 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
CATGCAGACATGCTGAAGAT+GGG - Chr3:30031936-30031955 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
CCGAACGATGTAACGTTCAT+TGG - Chr3:30036222-30036241 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
CCGACTCATGGTGATAAAGT+AGG + Chr3:30033393-30033412 None:intergenic 45.0%
CGAGATGAAATGGAACGGAA+TGG - Chr3:30031168-30031187 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCACGACTTTGATCGAC+GGG - Chr3:30031526-30031545 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
GAGAGAAGTTGTGTATGCTC+GGG + Chr3:30034305-30034324 None:intergenic 45.0%
GAGCCAAATGCTTCAATCCT+CGG - Chr3:30033955-30033974 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
GATTTCGTTCGGCGTAAACA+AGG - Chr3:30035997-30036016 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
GCCAGAAACATCCTTCAGTT+CGG - Chr3:30032266-30032285 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
GCCTCAGTAGCCAAAACATA+TGG + Chr3:30033752-30033771 None:intergenic 45.0%
GCTGATGCTGATGAACAATG+TGG - Chr3:30035894-30035913 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
GGAACATGAAAGCTGCTATG+GGG - Chr3:30031457-30031476 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
GGAAGCTAAGGATTTGATGG+AGG - Chr3:30031257-30031276 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
GGGAACATGAAAGCTGCTAT+GGG - Chr3:30031456-30031475 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
GTGATATGGATGAAGCTGAG+AGG - Chr3:30030827-30030846 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
GTGTAAGGTGGGTGATTTGA+AGG - Chr3:30031026-30031045 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
GTTGTCTATCTCCGAACTGA+AGG + Chr3:30032280-30032299 None:intergenic 45.0%
TAGAGCTAGCTACCGAAGTT+CGG - Chr3:30036481-30036500 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
TAGCGGTTTCAAACCAGACA+TGG - Chr3:30031848-30031867 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
TCACGAACCATCACAACATG+AGG - Chr3:30034224-30034243 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
TCAGTTCGGAGATAGACAAC+TGG - Chr3:30032280-30032299 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
TCCGAACTGAAGGATGTTTC+TGG + Chr3:30032270-30032289 None:intergenic 45.0%
TCGCCTACTGTGATCACATA+TGG - Chr3:30030670-30030689 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
TGAATGCAACAACCACACCA+AGG - Chr3:30035537-30035556 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
TGCTCAGAACACATTCGATC+TGG + Chr3:30032029-30032048 None:intergenic 45.0%
TGGAGGAGATGGGAAAAACT+GGG - Chr3:30031274-30031293 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
TGTAAGAGATCAATGGCCTC+CGG + Chr3:30034707-30034726 None:intergenic 45.0%
TTGGCAGTGTCAAGGTTCTT+AGG - Chr3:30032367-30032386 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
! AAAACTGTAGTTGGTTCCCC+TGG - Chr3:30031702-30031721 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
! AAGTTGATCAACTTGGACCC+TGG - Chr3:30036507-30036526 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
! ACTAAGATTGTGATGGCGTC+AGG - Chr3:30032231-30032250 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
! GAACCAAGAGAGCCTCATTT+TGG - Chr3:30036327-30036346 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
! GCAGTGATGGGAAAGTTGAA+TGG - Chr3:30033144-30033163 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
! TGGAACGGAATGGAGTTTTC+GGG - Chr3:30031178-30031197 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
! TTGATGGTTACTGTAAGGCG+GGG - Chr3:30031121-30031140 MsG0380013083.01.T01:CDS 45.0%
!! ACATAAGGAGATGATGGACG+CGG - Chr3:30031587-30031606 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
!! CTAGCTCTAAATCACCATGG+AGG + Chr3:30036470-30036489 None:intergenic 45.0%
!! CTTGTGTTGTTTGGGGCATT+TGG + Chr3:30033614-30033633 None:intergenic 45.0%
!! GGAAATTTTGACCGACAAGG+GGG - Chr3:30034492-30034511 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
!! TGAGCTTGATTTGCTGTGCA+TGG - Chr3:30032769-30032788 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
!! TGATATGGCGGGTGTATAGA+CGG + Chr3:30033888-30033907 None:intergenic 45.0%
!!! CAATTTTGGCTTCCTAGCTC+CGG - Chr3:30034685-30034704 MsG0380013083.01.T01:intron 45.0%
!!! TAATAAAAAAAAAGAATTTT+GGG + Chr3:30032974-30032993 None:intergenic 5.0%
!!! TTAATAAAAAAAAAGAATTT+TGG + Chr3:30032975-30032994 None:intergenic 5.0%
AACTTGGACCCTGGCTATGT+TGG - Chr3:30036516-30036535 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
AATATGGAGCAGGCTGCTAC+AGG + Chr3:30033475-30033494 None:intergenic 50.0%
ACACTGTCACCAACATAGCC+AGG + Chr3:30036528-30036547 None:intergenic 50.0%
AGAGCAACAAGTTGCATCCC+TGG + Chr3:30034820-30034839 None:intergenic 50.0%
AGAGCTAGCTACCGAAGTTC+GGG - Chr3:30036482-30036501 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
CAAAGGTCTTACGCCTGATG+TGG - Chr3:30031500-30031519 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
CAACACTCCAGTGCATCCTT+CGG + Chr3:30033984-30034003 None:intergenic 50.0%
CACTGTCACCAACATAGCCA+GGG + Chr3:30036527-30036546 None:intergenic 50.0%
CAGCCAAAATGAGGCTCTCT+TGG + Chr3:30036333-30036352 None:intergenic 50.0%
CGAACCATCACAACATGAGG+TGG - Chr3:30034227-30034246 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
CGAAGAGGTTTGATTCCGTG+TGG - Chr3:30030614-30030633 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
CGGGTTGTGTTCTCCAAATG+AGG - Chr3:30031743-30031762 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
CTCAAACGTTGTTGTCCGAC+TGG + Chr3:30033527-30033546 None:intergenic 50.0%
CTTCAATCCTCGGTAACCGA+AGG - Chr3:30033965-30033984 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
GATACTGGGGGACTCGAAAT+GGG - Chr3:30035961-30035980 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
GCAGCTGGAAAAATAGCAGC+AGG + Chr3:30033447-30033466 None:intergenic 50.0%
GCATGCAGACATGCTGAAGA+TGG - Chr3:30031935-30031954 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
GGAGGAGATGGGAAAAACTG+GGG - Chr3:30031275-30031294 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
GGGTAGGTTTGAGGAAGCTA+AGG - Chr3:30031245-30031264 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
GTCATGTGGCGAACCTTACT+GGG - Chr3:30036435-30036454 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
GTCGTGAAAGTCACCACATC+AGG + Chr3:30031516-30031535 None:intergenic 50.0%
TAGACAACTGGCAGGACCTA+TGG - Chr3:30032292-30032311 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
TCATGTGGCGAACCTTACTG+GGG - Chr3:30036436-30036455 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
TCCACCATGCAGCCAAAATG+AGG + Chr3:30036342-30036361 None:intergenic 50.0%
TCTCTGCTTGTGCGGATACT+GGG - Chr3:30035947-30035966 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
TGATGGTTACTGTAAGGCGG+GGG - Chr3:30031122-30031141 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
TGCATGTGTGGACTTGATCG+TGG - Chr3:30034555-30034574 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
TTACTGTAAGGCGGGGGATT+TGG - Chr3:30031128-30031147 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
TTCGGAGATAGACAACTGGC+AGG - Chr3:30032284-30032303 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
! AGGGTTTATGTGACTCGGGT+AGG - Chr3:30031229-30031248 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
! ATGTGACTCGGGTAGGTTTG+AGG - Chr3:30031236-30031255 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
! GGAACGGAATGGAGTTTTCG+GGG - Chr3:30031179-30031198 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
! TAATGGCTTGCAGCCATGCA+GGG - Chr3:30036250-30036269 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
! TTAATGGCTTGCAGCCATGC+AGG - Chr3:30036249-30036268 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
! TTTGATCGACGGGCATTGCA+AGG - Chr3:30031536-30031555 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
!! ATCGGGAGTACTCTCTCCAT+AGG + Chr3:30032311-30032330 None:intergenic 50.0%
!! CATAAGGAGATGATGGACGC+GGG - Chr3:30031588-30031607 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
!! GCAACTCTAGCCTTGGGTTT+AGG - Chr3:30032868-30032887 MsG0380013083.01.T01:intron 50.0%
!!! AGAGCCTCATTTTGGCTGCA+TGG - Chr3:30036335-30036354 MsG0380013083.01.T01:CDS 50.0%
AGTGCATCCTTCGGTTACCG+AGG + Chr3:30033975-30033994 None:intergenic 55.0%
CAAGGGGGAGATCGACACTT+AGG - Chr3:30034507-30034526 MsG0380013083.01.T01:intron 55.0%
CATGTGGCGAACCTTACTGG+GGG - Chr3:30036437-30036456 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
CTCTCTGCTTGTGCGGATAC+TGG - Chr3:30035946-30035965 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
CTCTGCTTGTGCGGATACTG+GGG - Chr3:30035948-30035967 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
CTGCTACAGGTTGTAGCAGC+TGG + Chr3:30033462-30033481 None:intergenic 55.0%
CTTCTCTCAGATGGCCGCTT+CGG + Chr3:30036374-30036393 None:intergenic 55.0%
GAAAACAAAGGCTCCGCCGA+AGG + Chr3:30033920-30033939 None:intergenic 55.0%
GACTGCTCTCTCTGCTTGTG+CGG - Chr3:30035939-30035958 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
GGATACTGGGGGACTCGAAA+TGG - Chr3:30035960-30035979 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
GGGGACTCGAAATGGGTGAA+TGG - Chr3:30035968-30035987 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
GGTCATGTGGCGAACCTTAC+TGG - Chr3:30036434-30036453 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
GTGGACCTCTTATGCCGAAG+CGG - Chr3:30036357-30036376 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
GTTCGCCACATGACCGCATT+TGG + Chr3:30036429-30036448 None:intergenic 55.0%
TCGGTAACCGAAGGATGCAC+TGG - Chr3:30033974-30033993 MsG0380013083.01.T01:intron 55.0%
TCTGCTTGTGCGGATACTGG+GGG - Chr3:30035949-30035968 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
! ACTGTAGTTGGTTCCCCTGG+AGG - Chr3:30031705-30031724 MsG0380013083.01.T01:intron 55.0%
! ATCGACGGGCATTGCAAGGT+TGG - Chr3:30031540-30031559 MsG0380013083.01.T01:intron 55.0%
! GACGCCTCTTTTCCGACTCA+TGG + Chr3:30033405-30033424 None:intergenic 55.0%
! GTTGATGAGGGAATCTGGGG+TGG - Chr3:30030858-30030877 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
! TCGACGGGCATTGCAAGGTT+GGG - Chr3:30031541-30031560 MsG0380013083.01.T01:intron 55.0%
!! AGTGTCGATCTCCCCCTTGT+CGG + Chr3:30034506-30034525 None:intergenic 55.0%
!! ATGCAGGGTTGGTCGAGGAA+GGG - Chr3:30036265-30036284 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
!!! GCCTCATTTTGGCTGCATGG+TGG - Chr3:30036338-30036357 MsG0380013083.01.T01:CDS 55.0%
!!! TTTTGGCTTCCTAGCTCCGG+AGG - Chr3:30034688-30034707 MsG0380013083.01.T01:intron 55.0%
CGCCACATGACCGCATTTGG+AGG + Chr3:30036426-30036445 None:intergenic 60.0%
CTTCCTCGACCAACCCTGCA+TGG + Chr3:30036266-30036285 None:intergenic 60.0%
GAGGCTACATGCCCCCAGTA+AGG + Chr3:30036451-30036470 None:intergenic 60.0%
GATCAATGGCCTCCGGAGCT+AGG + Chr3:30034700-30034719 None:intergenic 60.0%
GATGGCCGCTTCGGCATAAG+AGG + Chr3:30036365-30036384 None:intergenic 60.0%
GATGTCGGGGCCTCCAAATG+CGG - Chr3:30036413-30036432 MsG0380013083.01.T01:CDS 60.0%
GGCCTCCAAATGCGGTCATG+TGG - Chr3:30036421-30036440 MsG0380013083.01.T01:CDS 60.0%
!! CATGCAGGGTTGGTCGAGGA+AGG - Chr3:30036264-30036283 MsG0380013083.01.T01:CDS 60.0%
GGCTTGCAGCCATGCAGGGT+TGG - Chr3:30036254-30036273 MsG0380013083.01.T01:CDS 65.0%
! CTGGGGGCATGTAGCCTCCA+TGG - Chr3:30036453-30036472 MsG0380013083.01.T01:CDS 65.0%
!! CAGCCATGCAGGGTTGGTCG+AGG - Chr3:30036260-30036279 MsG0380013083.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 30030582 30036656 30030582 ID=MsG0380013083.01;Name=MsG0380013083.01
Chr3 mRNA 30030582 30036656 30030582 ID=MsG0380013083.01.T01;Parent=MsG0380013083.01;Name=MsG0380013083.01.T01;_AED=0.18;_eAED=0.21;_QI=0|0|0|0.8|1|1|5|0|809
Chr3 exon 30036618 30036656 30036618 ID=MsG0380013083.01.T01:exon:6650;Parent=MsG0380013083.01.T01
Chr3 exon 30035163 30036517 30035163 ID=MsG0380013083.01.T01:exon:6651;Parent=MsG0380013083.01.T01
Chr3 exon 30034881 30034985 30034881 ID=MsG0380013083.01.T01:exon:6652;Parent=MsG0380013083.01.T01
Chr3 exon 30032446 30032613 30032446 ID=MsG0380013083.01.T01:exon:6653;Parent=MsG0380013083.01.T01
Chr3 exon 30030582 30031344 30030582 ID=MsG0380013083.01.T01:exon:6654;Parent=MsG0380013083.01.T01
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