AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036720.01

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MsG0780036720.01.T01 AT1G06140 27.778 378 265 5 82 453 154 529 5.48e-40 156
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MsG0780036720.01.T01 AT3G16610 28.970 466 296 5 1 463 99 532 2.54e-56 206
MsG0780036720.01.T01 AT3G16610 34.127 126 79 1 8 129 411 536 5.88e-14 76.3
MsG0780036720.01.T01 AT1G25360 30.806 633 367 7 273 835 79 710 3.95e-104 340
MsG0780036720.01.T01 AT1G25360 26.954 627 365 12 1 542 1 619 3.62e-66 236
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MsG0780036720.01.T01 AT5G44230 25.339 442 242 12 59 453 4 404 6.86e-28 119
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MsG0780036720.01.T01 AT5G15300 31.154 520 311 6 293 805 65 544 1.21e-86 286
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MsG0780036720.01.T01 AT5G15300 25.722 381 234 8 361 732 30 370 1.52e-29 124
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MsG0780036720.01.T01 AT1G10330 26.144 306 210 4 7 301 87 387 1.62e-23 105
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MsG0780036720.01.T01 AT1G10330 22.449 343 219 5 202 502 49 386 2.55e-19 92.4
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MsG0780036720.01.T01 AT4G20090 20.166 362 275 6 405 754 186 545 9.20e-15 79.0
MsG0780036720.01.T01 AT4G20090 19.355 434 295 7 288 705 172 566 6.13e-14 76.3
MsG0780036720.01.T01 AT1G09820 18.208 346 269 4 374 705 222 567 1.79e-14 77.8
MsG0780036720.01.T01 AT1G09820 20.914 569 347 20 326 839 69 589 2.69e-13 73.9
MsG0780036720.01.T01 AT1G09820 20.401 299 224 4 374 659 295 592 3.05e-11 67.4
MsG0780036720.01.T01 AT5G61400 19.941 341 260 6 358 686 252 591 3.79e-14 77.0
MsG0780036720.01.T01 AT5G61400 21.448 359 254 7 203 541 268 618 1.49e-11 68.6
MsG0780036720.01.T01 AT1G64583 21.289 357 233 5 365 709 141 461 6.53e-14 75.9
MsG0780036720.01.T01 AT1G64583 20.413 436 276 9 128 554 71 444 4.08e-12 70.1
MsG0780036720.01.T01 AT1G64583 22.932 266 173 6 31 264 71 336 9.31e-11 65.9
MsG0780036720.01.T01 AT5G38730 23.158 285 190 9 478 741 135 411 6.82e-14 75.9
MsG0780036720.01.T01 AT5G38730 20.552 326 244 6 286 601 221 541 5.93e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT1G64583 21.289 357 233 5 365 709 166 486 8.21e-14 75.5
MsG0780036720.01.T01 AT1G64583 20.168 476 307 10 90 554 56 469 7.78e-13 72.4
MsG0780036720.01.T01 AT1G64583 22.222 288 192 6 9 264 74 361 1.74e-11 68.2
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.942 586 405 13 187 739 42 590 9.97e-14 75.5
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.280 558 396 9 72 600 94 620 5.56e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.942 586 405 13 187 739 79 627 1.10e-13 75.5
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.280 558 396 9 72 600 131 657 6.79e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT5G28370 22.500 400 260 11 323 705 347 713 1.11e-13 75.5
MsG0780036720.01.T01 AT4G30825 17.823 634 461 11 78 652 250 882 1.21e-13 75.5
MsG0780036720.01.T01 AT5G28460 22.500 400 260 11 323 705 347 713 1.23e-13 75.5
MsG0780036720.01.T01 AT3G16710 18.135 386 299 6 323 694 66 448 1.34e-13 74.3
MsG0780036720.01.T01 AT4G11690 20.365 329 226 3 408 732 270 566 1.82e-13 74.7
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 19.007 584 407 12 187 739 212 760 2.13e-13 74.7
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.280 558 396 9 72 600 264 790 6.81e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 19.007 584 407 12 187 739 170 718 2.16e-13 74.7
MsG0780036720.01.T01 AT3G61520 22.306 399 262 10 323 705 347 713 2.16e-13 74.7
MsG0780036720.01.T01 AT4G11690 20.365 329 226 3 408 732 243 539 2.28e-13 74.3
MsG0780036720.01.T01 AT1G03560 24.837 306 182 8 410 705 191 458 2.33e-13 74.3
MsG0780036720.01.T01 AT1G03560 20.345 290 217 4 269 549 226 510 1.71e-11 68.6
MsG0780036720.01.T01 AT5G50280 20.652 368 243 8 399 718 266 632 2.34e-13 74.7
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 19.007 584 407 12 187 739 204 752 2.39e-13 74.7
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.280 558 396 9 72 600 256 782 7.64e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 19.007 584 407 12 187 739 217 765 3.20e-13 74.3
MsG0780036720.01.T01 AT1G13630 18.280 558 396 9 72 600 269 795 9.94e-11 66.2
MsG0780036720.01.T01 AT5G18950 21.448 373 254 10 357 701 119 480 3.65e-13 73.2
MsG0780036720.01.T01 AT5G25630 19.797 394 294 6 278 650 49 441 3.89e-13 73.6
MsG0780036720.01.T01 AT5G25630 20.104 383 284 6 289 650 9 390 5.41e-13 72.8
MsG0780036720.01.T01 AT4G26680 19.692 325 242 6 426 732 181 504 6.35e-13 72.8
MsG0780036720.01.T01 AT4G26680 19.692 325 242 6 426 732 181 504 6.35e-13 72.8
MsG0780036720.01.T01 AT4G16390 23.810 252 179 5 9 248 109 359 6.58e-13 73.2
MsG0780036720.01.T01 AT4G16390 20.849 259 162 3 483 698 182 440 1.92e-11 68.2
MsG0780036720.01.T01 AT2G17670 20.418 431 303 9 294 703 18 429 7.10e-13 72.4
MsG0780036720.01.T01 AT5G46100 26.423 246 171 5 512 748 91 335 8.08e-13 72.0
MsG0780036720.01.T01 AT3G16010 19.080 435 299 7 273 690 232 630 1.00e-12 72.4
MsG0780036720.01.T01 AT3G16010 29.747 158 86 3 607 761 232 367 1.43e-11 68.6
MsG0780036720.01.T01 AT5G16420 20.000 300 232 3 410 702 195 493 1.08e-12 72.0
MsG0780036720.01.T01 AT5G16420 20.000 300 232 3 410 702 195 493 1.08e-12 72.0
MsG0780036720.01.T01 AT5G16420 20.000 300 232 3 410 702 195 493 1.08e-12 72.0
MsG0780036720.01.T01 AT5G16420 20.000 300 232 3 410 702 195 493 1.08e-12 72.0
MsG0780036720.01.T01 AT1G79540 20.047 424 300 6 255 666 179 575 1.17e-12 72.4
MsG0780036720.01.T01 AT1G79540 21.370 365 261 10 357 705 115 469 1.30e-11 68.9
MsG0780036720.01.T01 AT5G27270 19.476 611 392 14 60 595 452 1037 1.98e-12 71.6
MsG0780036720.01.T01 AT5G27270 19.226 801 539 18 37 772 184 941 3.01e-12 71.2
MsG0780036720.01.T01 AT5G27270 19.476 611 392 14 60 595 247 832 3.64e-12 70.9
MsG0780036720.01.T01 AT5G27270 19.476 611 392 14 60 595 247 832 3.64e-12 70.9
MsG0780036720.01.T01 AT3G53170 23.143 350 219 11 303 638 127 440 4.66e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT5G40400 20.531 414 308 12 309 705 170 579 5.85e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT3G53170 23.077 351 220 11 302 638 176 490 6.03e-12 69.3
MsG0780036720.01.T01 AT3G53170 23.077 351 220 11 302 638 176 490 6.03e-12 69.3
MsG0780036720.01.T01 AT5G65820 19.322 295 226 5 420 705 197 488 6.50e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT5G40400 20.531 414 308 12 309 705 241 650 6.72e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT5G24830 20.210 381 280 8 286 647 174 549 7.14e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT1G52620 17.591 523 393 10 190 686 158 668 7.66e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT5G18390 21.667 300 223 7 412 701 152 449 7.67e-12 68.9
MsG0780036720.01.T01 AT1G79490 20.635 252 195 2 507 754 278 528 8.08e-12 69.7
MsG0780036720.01.T01 AT2G19280 22.535 355 261 8 428 771 293 644 8.95e-12 69.3
MsG0780036720.01.T01 AT2G19280 22.535 355 261 8 428 771 293 644 8.95e-12 69.3
MsG0780036720.01.T01 AT2G19280 22.535 355 261 8 428 771 293 644 8.95e-12 69.3
MsG0780036720.01.T01 AT2G19280 22.535 355 261 8 428 771 293 644 8.95e-12 69.3
MsG0780036720.01.T01 AT2G26790 21.108 379 265 9 379 730 392 763 2.32e-11 68.2
MsG0780036720.01.T01 AT2G26790 21.108 379 265 9 379 730 392 763 2.32e-11 68.2
MsG0780036720.01.T01 AT3G46610 20.635 504 323 18 151 580 138 638 3.18e-11 67.4
MsG0780036720.01.T01 AT3G46610 20.635 504 323 18 151 580 138 638 3.18e-11 67.4
MsG0780036720.01.T01 AT1G63230 20.652 184 138 2 374 549 75 258 3.75e-11 65.9
MsG0780036720.01.T01 AT1G63230 20.833 288 203 5 432 705 1 277 6.52e-11 65.1
MsG0780036720.01.T01 AT4G39620 23.315 356 218 8 316 652 108 427 4.86e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT4G39620 23.315 356 218 8 316 652 108 427 5.70e-11 66.6
MsG0780036720.01.T01 AT1G19520 26.471 204 140 3 545 741 387 587 8.57e-11 66.2

Find 189 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 214 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TATGCTCTAAAGACTAATTT+TGG 0.136956 7:-12439160 MsG0780036720.01.T01:CDS
TCATGGAACACTATGATATT+TGG 0.186246 7:-12439730 MsG0780036720.01.T01:CDS
TCTCGACATTTGTGCAAATT+TGG 0.186791 7:-12438306 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATTCACTAAGATGAGATTAT+TGG 0.188687 7:-12439575 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTCAGCTATCAAAGGCTATT+TGG 0.212543 7:-12438900 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAACACACTGAATTCCTTTC+CGG 0.249299 7:+12439352 None:intergenic
AATTCAAACGCTGCCTAAAA+TGG 0.267564 7:-12437379 MsG0780036720.01.T01:exon
AGAAGGAAACCATCGATTTC+AGG 0.269544 7:+12437477 None:intergenic
GTTCATTTGGTTTGAGGAAA+TGG 0.274498 7:+12439966 None:intergenic
TCTTGGAATTCAATCATTTC+AGG 0.282759 7:-12438425 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTCAATGCTTCGGTCAACTA+TGG 0.299775 7:-12438660 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTTTCTTTGTTGGGTTCATT+TGG 0.325688 7:+12439953 None:intergenic
TTGAAGCTGATGATGTTATA+TGG 0.328724 7:-12437830 MsG0780036720.01.T01:CDS
CCTCAGAGCTTGTGCGCATA+TGG 0.329511 7:-12438003 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAACATTTGCTAGTGCGTTT+AGG 0.330027 7:-12439231 MsG0780036720.01.T01:CDS
AAGAGCGAACAACTGTTTCT+TGG 0.333339 7:-12438442 MsG0780036720.01.T01:CDS
CATGCTTTCAATAAGCTCTA+AGG 0.333480 7:+12437857 None:intergenic
GCCAGGATGTAGCTGGATTC+AGG 0.338504 7:-12437613 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGCGATTGCCGAGTAGGGTT+GGG 0.339599 7:+12439049 None:intergenic
AGACTATGGTTTAGGACTTC+AGG 0.340514 7:-12439494 MsG0780036720.01.T01:CDS
GGTATTGAAGACTATGGTTT+AGG 0.345883 7:-12439502 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATGGGTTTGGATGGTTTATC+TGG 0.349696 7:-12437177 MsG0780036720.01.T01:exon
GAACCTGATGATTATACTTT+CGG 0.351051 7:-12438638 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATTTGATGGCATGGAAATAA+AGG 0.357792 7:-12438759 MsG0780036720.01.T01:CDS
CGTAGTGACTTTGCATTTCC+CGG 0.357809 7:+12437952 None:intergenic
GGAAAGAAAGCTTTGAACTA+TGG 0.359618 7:-12438593 MsG0780036720.01.T01:CDS
GGATTATCTGCATTTGAGTT+AGG 0.360904 7:-12439199 MsG0780036720.01.T01:CDS
GCCGTGCATATCCAACAATA+AGG 0.378287 7:+12439020 None:intergenic
AAAATGTTAGTTTCTTTGTT+GGG 0.378392 7:+12439944 None:intergenic
GAAAATGTTAGTTTCTTTGT+TGG 0.382052 7:+12439943 None:intergenic
ATTCTGAGTAATCAAGAATC+TGG 0.382531 7:+12437255 None:intergenic
CAAAACCAGTTACTGTCATC+TGG 0.384939 7:+12439860 None:intergenic
TGATATATCTCCTCAGATCT+TGG 0.387062 7:+12437546 None:intergenic
TGTTGGGTTCATTTGGTTTG+AGG 0.388551 7:+12439960 None:intergenic
TCGCATAATGCCCTTATTGT+TGG 0.390875 7:-12439031 MsG0780036720.01.T01:CDS
AATCTTAAAGCTATAAATCC+TGG 0.393894 7:-12439898 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACAAAGGGCTACATTACTTC+CGG 0.395191 7:-12437971 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTTGCAATACATATCAATAA+TGG 0.400867 7:+12438508 None:intergenic
CTATTCAGTACAAGGCAATC+TGG 0.405051 7:+12437317 None:intergenic
CGCTGCCTAAAATGGCATAA+TGG 0.409308 7:-12437371 MsG0780036720.01.T01:exon
CTCAAAGGGATGTTATTTCA+TGG 0.409801 7:-12439747 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGCAAAATGTGGAGCATTGA+TGG 0.414346 7:-12438795 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTAGGGTGTACCGATGGGTT+TGG 0.417196 7:-12437190 MsG0780036720.01.T01:exon
AGATGCAATTAAATTATTTG+AGG 0.418039 7:-12438075 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTTGGATACGATAATATAGT+AGG 0.419276 7:-12439142 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTCGCTCTTCCAATCTCTCA+TGG 0.423647 7:+12438456 None:intergenic
CATGCCCAGATGACAGTAAC+TGG 0.425315 7:-12439865 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGGGCATGAGCTTGTTTCCC+AGG 0.425619 7:+12439880 None:intergenic
AGTTATGTTAAAAGAAGGTA+TGG 0.427637 7:-12439266 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGCTAATTCTTTATTGCAGT+TGG 0.427941 7:-12437751 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGTACTGGTATTGAAGACTA+TGG 0.429311 7:-12439508 MsG0780036720.01.T01:CDS
GATTGCCTTGTACTGAATAG+TGG 0.439288 7:-12437314 MsG0780036720.01.T01:exon
CATGGAAGAGTTATTAAGTC+TGG 0.443277 7:-12438560 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAAAGGGCTACATTACTTCC+GGG 0.443986 7:-12437970 MsG0780036720.01.T01:CDS
GAAGCTTGTTTGATATTTGA+TGG 0.447558 7:-12438773 MsG0780036720.01.T01:CDS
GAGGTACATGCGTTTCTTGT+TGG 0.450462 7:-12437582 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTCGACGAAATTAGTCTGTC+TGG 0.451575 7:-12438938 MsG0780036720.01.T01:CDS
AAGAGTTATTAAGTCTGGTA+TGG 0.451800 7:-12438555 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGTCCTGTTATTTGCAAAAC+GGG 0.451853 7:-12439621 MsG0780036720.01.T01:CDS
CATTGTCTTGCGATTAAGAT+GGG 0.453950 7:-12439469 MsG0780036720.01.T01:CDS
CGAAATGATCGGTTTATTGA+GGG 0.457232 7:-12439304 MsG0780036720.01.T01:CDS
AGAAAAGATCCATGAGAGAT+TGG 0.459509 7:-12438465 MsG0780036720.01.T01:CDS
TATAAAGTTATGTTAAAAGA+AGG 0.460559 7:-12439271 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTTGATAGTGATGTGGTAAC+GGG 0.460694 7:-12439445 MsG0780036720.01.T01:CDS
TACTTTCGGCAGTGTTGTAA+AGG 0.467266 7:-12438624 MsG0780036720.01.T01:CDS
TCATCATCATCCCTGCAGAT+TGG 0.470063 7:-12437131 MsG0780036720.01.T01:exon
AGAGTTATTAAGTCTGGTAT+GGG 0.473786 7:-12438554 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTGGCATACGTGAAGTTGTC+AGG 0.475553 7:+12438332 None:intergenic
CCGTGCATATCCAACAATAA+GGG 0.476786 7:+12439021 None:intergenic
AGAAGGAGCCAGGATGTAGC+TGG 0.479331 7:-12437620 MsG0780036720.01.T01:CDS
CATGAAATAACATCCCTTTG+AGG 0.480658 7:+12439748 None:intergenic
CACGAAACAACATCTCGTTC+CGG 0.481096 7:+12439655 None:intergenic
TGTTGGAGTGCTGTAATTGC+AGG 0.482443 7:-12439334 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTGCCGAAAGTATAATCATC+AGG 0.484509 7:+12438635 None:intergenic
GTAGATCTACTTGGTAGGTC+AGG 0.486925 7:-12437894 MsG0780036720.01.T01:CDS
GCGATTGCCGAGTAGGGTTG+GGG 0.488427 7:+12439050 None:intergenic
TCGAAATGATCGGTTTATTG+AGG 0.489429 7:-12439305 MsG0780036720.01.T01:CDS
TCTTGCATGGTAGATCTACT+TGG 0.489791 7:-12437903 MsG0780036720.01.T01:CDS
GCATTATGCGATTGCCGAGT+AGG 0.491058 7:+12439043 None:intergenic
GAAAGCTTTGAACTATGGTA+TGG 0.494326 7:-12438588 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTCAGAGCTTGTGCGCATAT+GGG 0.495078 7:-12438002 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATTGCTCTAAACCAATCTGC+AGG 0.496253 7:+12437120 None:intergenic
TCATTGTCTTGCGATTAAGA+TGG 0.499211 7:-12439470 MsG0780036720.01.T01:CDS
GAACTCGGAAAACAGATTCA+TGG 0.500298 7:-12438275 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACCTGAATCCAGCTACATCC+TGG 0.500842 7:+12437612 None:intergenic
TTGTCCTGTTATTTGCAAAA+CGG 0.502041 7:-12439622 MsG0780036720.01.T01:CDS
AGTCTGGTATGGGGTTAGAC+TGG 0.504039 7:-12438544 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATGCGATTGCCGAGTAGGGT+TGG 0.504197 7:+12439048 None:intergenic
GTTTGAGAAGGCACCTAAGC+GGG 0.504246 7:-12438153 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTCAAAGTGTGGAAATATGC+AGG 0.504737 7:-12438189 MsG0780036720.01.T01:CDS
GAAGAATTATAAGTTAAAGA+AGG 0.507879 7:-12437637 MsG0780036720.01.T01:CDS
TAACTCAAATGCAGATAATC+CGG 0.508827 7:+12439201 None:intergenic
ATCTTAAAGCTATAAATCCT+GGG 0.511039 7:-12439897 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTTCTACTTCCTCATCAAGA+AGG 0.511476 7:+12437460 None:intergenic
TTGGAAGGTATTCAACTGCA+TGG 0.512449 7:-12438881 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTTATATGGAGAACTTTACT+TGG 0.512606 7:-12437816 MsG0780036720.01.T01:CDS
GATGTAGCTGGATTCAGGTA+AGG 0.514556 7:-12437608 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAGGCTATGTTCGAAATGAT+CGG 0.514945 7:-12439315 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGCAAGAATAATGTTCCACT+TGG 0.516887 7:+12437919 None:intergenic
ATAACATCATCAGCTTCAAA+AGG 0.517966 7:+12437834 None:intergenic
ACTATGATATTTGGTTATGC+TGG 0.518391 7:-12439721 MsG0780036720.01.T01:CDS
CATTATGCGATTGCCGAGTA+GGG 0.519940 7:+12439044 None:intergenic
TGTTCGATAAAATGCCTCAA+AGG 0.520162 7:-12439762 MsG0780036720.01.T01:CDS
TATATGGAACCGCAGGAATG+TGG 0.521265 7:-12437689 MsG0780036720.01.T01:CDS
TATTTGGTTATGCTGGTGTT+GGG 0.522747 7:-12439714 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTTATGTTAAAAGAAGGTAT+GGG 0.523409 7:-12439265 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTAAGCGGGATTATGTGACT+TGG 0.524977 7:-12438139 MsG0780036720.01.T01:CDS
GGATATGCACGGCAAGATCA+AGG 0.525212 7:-12439010 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATGGGGTTAGACTGGTTTGT+CGG 0.525976 7:-12438536 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAAGTCACATAATCCCGCTT+AGG 0.526173 7:+12438140 None:intergenic
GCATATGCATACCATGGACT+TGG 0.526639 7:-12438101 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTGTTTGATATTTGATGGCA+TGG 0.527829 7:-12438768 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTTCGATAAAATGCCTCAAA+GGG 0.528193 7:-12439761 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATATTTGGTTATGCTGGTGT+TGG 0.528513 7:-12439715 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTATGCATATGCACAAATCA+TGG 0.530878 7:+12438112 None:intergenic
CGATGGTTTCCTTCTTGATG+AGG 0.531999 7:-12437469 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACACATTCCCCAACCCTACT+CGG 0.532982 7:-12439057 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTATGCTGGTGTTGGGAACA+TGG 0.537377 7:-12439707 MsG0780036720.01.T01:CDS
AAATAAAGGATGCTGTGTCT+TGG 0.539413 7:-12438745 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTGGTATTTGCAAGTTGCAA+GGG 0.540227 7:-12437797 MsG0780036720.01.T01:CDS
GGTGTACCGATGGGTTTGGA+TGG 0.540527 7:-12437186 MsG0780036720.01.T01:exon
AGTGCGTTTAGGTCGTGTGC+CGG 0.542145 7:-12439220 MsG0780036720.01.T01:CDS
CCCTTATTGTTGGATATGCA+CGG 0.544688 7:-12439021 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTTGGTATTTGCAAGTTGCA+AGG 0.547320 7:-12437798 MsG0780036720.01.T01:CDS
AGTGTTGTAAAGGCGTGTGC+AGG 0.548233 7:-12438614 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAGACTTAATAACTCTTCCA+TGG 0.548286 7:+12438561 None:intergenic
AAATACCAGTCATATTGAGC+AGG 0.550003 7:+12437212 None:intergenic
TGCGTTTCTTGTTGGAGACA+AGG 0.552191 7:-12437574 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATATGGAACCGCAGGAATGT+GGG 0.552439 7:-12437688 MsG0780036720.01.T01:CDS
CGTAAGCAGAAGAATCTTGA+GGG 0.552870 7:+12437727 None:intergenic
GCAAGAATAATGTTCCACTT+GGG 0.553834 7:+12437920 None:intergenic
TATAAGTTAAAGAAGGAGCC+AGG 0.555174 7:-12437630 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGAGTCCTGCTCAATATGAC+TGG 0.556487 7:-12437217 MsG0780036720.01.T01:exon
TTGCATCTTCTCCAAGTCCA+TGG 0.558124 7:+12438090 None:intergenic
TTAGACATGTATGCAAAATG+TGG 0.558193 7:-12438806 MsG0780036720.01.T01:CDS
TCAACAAACTCATGTACTTG+TGG 0.558316 7:-12437526 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTCTCGTGTAATGTTTGAGA+AGG 0.558531 7:-12438165 MsG0780036720.01.T01:CDS
AGTGGAACATTATTCTTGCA+TGG 0.564614 7:-12437916 MsG0780036720.01.T01:CDS
AAAACCAGTTACTGTCATCT+GGG 0.566099 7:+12439861 None:intergenic
GAAATGGAATGAATTGCATA+AGG 0.566454 7:+12439982 None:intergenic
AACCGCAGGAATGTGGGGCG+AGG 0.568823 7:-12437682 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAGAATGGTTGATGCTCGAA+AGG 0.571165 7:-12439086 MsG0780036720.01.T01:CDS
CGGGAAATGCAAAGTCACTA+CGG 0.572100 7:-12437951 MsG0780036720.01.T01:CDS
GCTATCAAAGGCTATTTGGA+AGG 0.572607 7:-12438896 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTCGATATGTATTCAAAGTG+TGG 0.577391 7:-12438200 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATGTAGCTGGATTCAGGTAA+GGG 0.579972 7:-12437607 MsG0780036720.01.T01:CDS
CGGAAAGGAATTCAGTGTGT+TGG 0.580043 7:-12439351 MsG0780036720.01.T01:CDS
AACTATGGTATGGAGGTCCA+TGG 0.580138 7:-12438578 MsG0780036720.01.T01:CDS
CGGAACGAGATGTTGTTTCG+TGG 0.580736 7:-12439654 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTGGATTCAGGTAAGGGACG+AGG 0.583578 7:-12437601 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACTGCATGTTCAGCTATCAA+AGG 0.584221 7:-12438908 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGTTTCAAATACTGAGAATG+AGG 0.586317 7:-12437279 MsG0780036720.01.T01:exon
CAAGAATAATGTTCCACTTG+GGG 0.587693 7:+12437921 None:intergenic
TCGAATGTATATGGAACCGC+AGG 0.589069 7:-12437696 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTATGTTAAAAGAAGGTATG+GGG 0.593732 7:-12439264 MsG0780036720.01.T01:CDS
ATTGATATGTATTGCAAGTG+TGG 0.596286 7:-12438503 MsG0780036720.01.T01:CDS
GCATGGTAGATCTACTTGGT+AGG 0.600957 7:-12437899 MsG0780036720.01.T01:CDS
TCAAGCCACTATTCAGTACA+AGG 0.603706 7:+12437309 None:intergenic
AATTTGGCTACTGTCGAACT+CGG 0.606816 7:-12438290 MsG0780036720.01.T01:CDS
GCATAATGGAGAATTCGAGC+AGG 0.609846 7:-12437357 MsG0780036720.01.T01:exon
GGATATGTTCCTGAAATCGA+TGG 0.611173 7:-12437486 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACGTAAGCAGAAGAATCTTG+AGG 0.616265 7:+12437726 None:intergenic
GAAATGATCGGTTTATTGAG+GGG 0.617058 7:-12439303 MsG0780036720.01.T01:CDS
GGATTCTCTTCAGAGAAGCA+AGG 0.627320 7:-12438404 MsG0780036720.01.T01:CDS
AGCTTTGAACTATGGTATGG+AGG 0.630480 7:-12438585 MsG0780036720.01.T01:CDS
TATGGAACCGCAGGAATGTG+GGG 0.631792 7:-12437687 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAAGGCACATCCAAGATCTG+AGG 0.633308 7:-12437556 MsG0780036720.01.T01:CDS
TACTTGTGGATGAGATGAAG+TGG 0.642252 7:-12437512 MsG0780036720.01.T01:CDS
TTGCAAGTGTGGAATGCTAG+TGG 0.643559 7:-12438492 MsG0780036720.01.T01:CDS
AACCTCGCCCCACATTCCTG+CGG 0.643677 7:+12437680 None:intergenic
TTGCTCTAAACCAATCTGCA+GGG 0.646702 7:+12437121 None:intergenic
ATGGAATGAATTGCATAAGG+TGG 0.648193 7:+12439985 None:intergenic
GAGTTATTAAGTCTGGTATG+GGG 0.651166 7:-12438553 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTATGCTAAGTGTGACAGAA+TGG 0.651817 7:-12439101 MsG0780036720.01.T01:CDS
TATGTTAAAAGAAGGTATGG+GGG 0.652519 7:-12439263 MsG0780036720.01.T01:CDS
CCATATGCGCACAAGCTCTG+AGG 0.664805 7:+12438003 None:intergenic
TGCACAAATGTCGAGAACTG+TGG 0.667722 7:+12438313 None:intergenic
ATTTGTGCATATGCATACCA+TGG 0.673816 7:-12438107 MsG0780036720.01.T01:CDS
GATAAACCATCCAAACCCAT+CGG 0.674353 7:+12437180 None:intergenic
GAAGAACAAGATTCTTACGA+GGG 0.674495 7:-12437441 MsG0780036720.01.T01:CDS
CATGGATTAGCAGTGAAATG+TGG 0.676910 7:-12438863 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACATTATCTCACACTACACG+CGG 0.710412 7:+12437409 None:intergenic
AGAAGAACAAGATTCTTACG+AGG 0.719654 7:-12437442 MsG0780036720.01.T01:CDS
GTGGATGAGATGAAGTGGGA+CGG 0.723035 7:-12437507 MsG0780036720.01.T01:CDS
TGTTTGAGAAGGCACCTAAG+CGG 0.731832 7:-12438154 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAAGTTGCAAGGGAATGTTG+AGG 0.738773 7:-12437787 MsG0780036720.01.T01:CDS
CTACGGTTTAGATCCCCAAG+TGG 0.741776 7:-12437934 MsG0780036720.01.T01:CDS
ACTTGTGGATGAGATGAAGT+GGG 0.742539 7:-12437511 MsG0780036720.01.T01:CDS
CAAGTGTGGAATGCTAGTGG+AGG 0.743165 7:-12438489 MsG0780036720.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TATAAAGTTATGTTAAAAGA+AGG - Chr7:12437814-12437833 MsG0780036720.01.T01:CDS 15.0%
!! AGATGCAATTAAATTATTTG+AGG - Chr7:12439010-12439029 MsG0780036720.01.T01:CDS 20.0%
!! GAAATAAAAATCGTATGATT+TGG + Chr7:12439059-12439078 None:intergenic 20.0%
!! GAAGAATTATAAGTTAAAGA+AGG - Chr7:12439448-12439467 MsG0780036720.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAATGTTAGTTTCTTTGTT+GGG + Chr7:12437144-12437163 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTAAGATTTGAACATTTT+TGG + Chr7:12437177-12437196 None:intergenic 20.0%
!!! TTGAAGCTTTAGAAATTTTT+CGG - Chr7:12438100-12438119 MsG0780036720.01.T01:CDS 20.0%
! AATCTTAAAGCTATAAATCC+TGG - Chr7:12437187-12437206 MsG0780036720.01.T01:exon 25.0%
! AGTTATGTTAAAAGAAGGTA+TGG - Chr7:12437819-12437838 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTTAAAGCTATAAATCCT+GGG - Chr7:12437188-12437207 MsG0780036720.01.T01:exon 25.0%
! ATTCACTAAGATGAGATTAT+TGG - Chr7:12437510-12437529 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
! CTTGCAATACATATCAATAA+TGG + Chr7:12438580-12438599 None:intergenic 25.0%
! TTTGGATACGATAATATAGT+AGG - Chr7:12437943-12437962 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
!! GAAAATGTTAGTTTCTTTGT+TGG + Chr7:12437145-12437164 None:intergenic 25.0%
!! GTTATGTTAAAAGAAGGTAT+GGG - Chr7:12437820-12437839 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
!! TCAATATGACTGGTATTTTA+GGG - Chr7:12439878-12439897 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATGTTAAAAGAAGGTATG+GGG - Chr7:12437821-12437840 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAACATTTTTTGTGAAATGC+CGG - Chr7:12437714-12437733 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATGCTCTAAAGACTAATTT+TGG - Chr7:12437925-12437944 MsG0780036720.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGAACATTTTTGGAAAATGT+GGG + Chr7:12437167-12437186 None:intergenic 25.0%
!!! TTGAACATTTTTGGAAAATG+TGG + Chr7:12437168-12437187 None:intergenic 25.0%
AAGAGTTATTAAGTCTGGTA+TGG - Chr7:12438530-12438549 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
ACTATGATATTTGGTTATGC+TGG - Chr7:12437364-12437383 MsG0780036720.01.T01:exon 30.0%
AGAGTTATTAAGTCTGGTAT+GGG - Chr7:12438531-12438550 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
ATAACATCATCAGCTTCAAA+AGG + Chr7:12439254-12439273 None:intergenic 30.0%
ATTCTGAGTAATCAAGAATC+TGG + Chr7:12439833-12439852 None:intergenic 30.0%
ATTGATATGTATTGCAAGTG+TGG - Chr7:12438582-12438601 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
GAAATGGAATGAATTGCATA+AGG + Chr7:12437106-12437125 None:intergenic 30.0%
GAACCTGATGATTATACTTT+CGG - Chr7:12438447-12438466 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
GTTATATGGAGAACTTTACT+TGG - Chr7:12439269-12439288 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
TAACTCAAATGCAGATAATC+CGG + Chr7:12437887-12437906 None:intergenic 30.0%
TCATGGAACACTATGATATT+TGG - Chr7:12437355-12437374 MsG0780036720.01.T01:exon 30.0%
TCTTGGAATTCAATCATTTC+AGG - Chr7:12438660-12438679 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
TGCTAATTCTTTATTGCAGT+TGG - Chr7:12439334-12439353 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTCAAATACTGAGAATG+AGG - Chr7:12439806-12439825 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
TTAGACATGTATGCAAAATG+TGG - Chr7:12438279-12438298 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! ACAGTTTGAAACAAAAACAG+TGG + Chr7:12437254-12437273 None:intergenic 30.0%
! ATTTGATGGCATGGAAATAA+AGG - Chr7:12438326-12438345 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! CAGTTTGAAACAAAAACAGT+GGG + Chr7:12437253-12437272 None:intergenic 30.0%
! CTCAATATGACTGGTATTTT+AGG - Chr7:12439877-12439896 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! GAAGCTTGTTTGATATTTGA+TGG - Chr7:12438312-12438331 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! GTTCTTTTGTCGAATGTATA+TGG - Chr7:12439380-12439399 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! TATGTTAAAAGAAGGTATGG+GGG - Chr7:12437822-12437841 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! TTGAAGCTGATGATGTTATA+TGG - Chr7:12439255-12439274 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTCCTGTTATTTGCAAAA+CGG - Chr7:12437463-12437482 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTTTGATATTTGATGGCA+TGG - Chr7:12438317-12438336 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
!! ATATGGGTTTTGTAGACAAA+GGG - Chr7:12439099-12439118 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
!! CACTTTTTGTTTCAATGCTT+CGG - Chr7:12438415-12438434 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTCTCCATTATGCCATTTT+AGG + Chr7:12439722-12439741 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTCTAAGATGCTACAAGT+CGG - Chr7:12438723-12438742 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTGATAGTGATGTGGTAA+CGG - Chr7:12437639-12437658 MsG0780036720.01.T01:CDS 30.0%
AAAACCAGTTACTGTCATCT+GGG + Chr7:12437227-12437246 None:intergenic 35.0%
AAATAAAGGATGCTGTGTCT+TGG - Chr7:12438340-12438359 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
AAATACCAGTCATATTGAGC+AGG + Chr7:12439876-12439895 None:intergenic 35.0%
AATTCAAACGCTGCCTAAAA+TGG - Chr7:12439706-12439725 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAAGATCCATGAGAGAT+TGG - Chr7:12438620-12438639 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGAACAAGATTCTTACG+AGG - Chr7:12439643-12439662 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
AGTGGAACATTATTCTTGCA+TGG - Chr7:12439169-12439188 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
ATATTTGGTTATGCTGGTGT+TGG - Chr7:12437370-12437389 MsG0780036720.01.T01:exon 35.0%
ATTTGTGCATATGCATACCA+TGG - Chr7:12438978-12438997 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAATAATGTTCCACTTG+GGG + Chr7:12439167-12439186 None:intergenic 35.0%
CAGACTTAATAACTCTTCCA+TGG + Chr7:12438527-12438546 None:intergenic 35.0%
CATGAAATAACATCCCTTTG+AGG + Chr7:12437340-12437359 None:intergenic 35.0%
CATGCTTTCAATAAGCTCTA+AGG + Chr7:12439231-12439250 None:intergenic 35.0%
CATGGAAGAGTTATTAAGTC+TGG - Chr7:12438525-12438544 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
CATTGTCTTGCGATTAAGAT+GGG - Chr7:12437616-12437635 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
GAAGAACAAGATTCTTACGA+GGG - Chr7:12439644-12439663 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
GAGTTATTAAGTCTGGTATG+GGG - Chr7:12438532-12438551 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
GCAAGAATAATGTTCCACTT+GGG + Chr7:12439168-12439187 None:intergenic 35.0%
GTATGCATATGCACAAATCA+TGG + Chr7:12438976-12438995 None:intergenic 35.0%
GTCGATATGTATTCAAAGTG+TGG - Chr7:12438885-12438904 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
GTTCGATAAAATGCCTCAAA+GGG - Chr7:12437324-12437343 MsG0780036720.01.T01:exon 35.0%
GTTTCTTTGTTGGGTTCATT+TGG + Chr7:12437135-12437154 None:intergenic 35.0%
TATAAGTTAAAGAAGGAGCC+AGG - Chr7:12439455-12439474 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TATTTGGTTATGCTGGTGTT+GGG - Chr7:12437371-12437390 MsG0780036720.01.T01:exon 35.0%
TCAACAAACTCATGTACTTG+TGG - Chr7:12439559-12439578 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TCATTGTCTTGCGATTAAGA+TGG - Chr7:12437615-12437634 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TCTCGACATTTGTGCAAATT+TGG - Chr7:12438779-12438798 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TGATATATCTCCTCAGATCT+TGG + Chr7:12439542-12439561 None:intergenic 35.0%
TGCAAGAATAATGTTCCACT+TGG + Chr7:12439169-12439188 None:intergenic 35.0%
TGTTCGATAAAATGCCTCAA+AGG - Chr7:12437323-12437342 MsG0780036720.01.T01:exon 35.0%
TTCAAAGTGTGGAAATATGC+AGG - Chr7:12438896-12438915 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGCTATCAAAGGCTATT+TGG - Chr7:12438185-12438204 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCGTGTAATGTTTGAGA+AGG - Chr7:12438920-12438939 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTATTTGCAAGTTGCAA+GGG - Chr7:12439288-12439307 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! CGAAATGATCGGTTTATTGA+GGG - Chr7:12437781-12437800 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! GAAATGATCGGTTTATTGAG+GGG - Chr7:12437782-12437801 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! GGATTATCTGCATTTGAGTT+AGG - Chr7:12437886-12437905 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! GGTATTGAAGACTATGGTTT+AGG - Chr7:12437583-12437602 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! TCGAAATGATCGGTTTATTG+AGG - Chr7:12437780-12437799 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! TGTACTGGTATTGAAGACTA+TGG - Chr7:12437577-12437596 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
! TGTCCTGTTATTTGCAAAAC+GGG - Chr7:12437464-12437483 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
!! CATATGGGTTTTGTAGACAA+AGG - Chr7:12439098-12439117 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
!! CTCAAAGGGATGTTATTTCA+TGG - Chr7:12437338-12437357 MsG0780036720.01.T01:exon 35.0%
!! GAAAGCTTTGAACTATGGTA+TGG - Chr7:12438497-12438516 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAAAGAAAGCTTTGAACTA+TGG - Chr7:12438492-12438511 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTCATTTGGTTTGAGGAAA+TGG + Chr7:12437122-12437141 None:intergenic 35.0%
!! TTTGATAGTGATGTGGTAAC+GGG - Chr7:12437640-12437659 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
!!! GCATGATTATGCTACTTTTG+TGG - Chr7:12437540-12437559 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTTTGTGAAATGCCGGAA+AGG - Chr7:12437719-12437738 MsG0780036720.01.T01:CDS 35.0%
AATTTGGCTACTGTCGAACT+CGG - Chr7:12438795-12438814 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
ACAAAGGGCTACATTACTTC+CGG - Chr7:12439114-12439133 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
ACATTATCTCACACTACACG+CGG + Chr7:12439679-12439698 None:intergenic 40.0%
ACGTAAGCAGAAGAATCTTG+AGG + Chr7:12439362-12439381 None:intergenic 40.0%
ACTGCATGTTCAGCTATCAA+AGG - Chr7:12438177-12438196 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGTGGATGAGATGAAGT+GGG - Chr7:12439574-12439593 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
ATGGGTTTGGATGGTTTATC+TGG - Chr7:12439908-12439927 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
ATGTAGCTGGATTCAGGTAA+GGG - Chr7:12439478-12439497 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
CAAAACCAGTTACTGTCATC+TGG + Chr7:12437228-12437247 None:intergenic 40.0%
CAACACACTGAATTCCTTTC+CGG + Chr7:12437736-12437755 None:intergenic 40.0%
CAGGCTATGTTCGAAATGAT+CGG - Chr7:12437770-12437789 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
CCCTTATTGTTGGATATGCA+CGG - Chr7:12438064-12438083 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
CCGTGCATATCCAACAATAA+GGG + Chr7:12438067-12438086 None:intergenic 40.0%
CGTAAGCAGAAGAATCTTGA+GGG + Chr7:12439361-12439380 None:intergenic 40.0%
CTATTCAGTACAAGGCAATC+TGG + Chr7:12439771-12439790 None:intergenic 40.0%
CTTCTACTTCCTCATCAAGA+AGG + Chr7:12439628-12439647 None:intergenic 40.0%
CTTGGTATTTGCAAGTTGCA+AGG - Chr7:12439287-12439306 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
GAACTCGGAAAACAGATTCA+TGG - Chr7:12438810-12438829 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
GATAAACCATCCAAACCCAT+CGG + Chr7:12439908-12439927 None:intergenic 40.0%
GATTGCCTTGTACTGAATAG+TGG - Chr7:12439771-12439790 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
GCTATCAAAGGCTATTTGGA+AGG - Chr7:12438189-12438208 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
GGATATGTTCCTGAAATCGA+TGG - Chr7:12439599-12439618 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
GTATGCTAAGTGTGACAGAA+TGG - Chr7:12437984-12438003 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
TACTTGTGGATGAGATGAAG+TGG - Chr7:12439573-12439592 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
TACTTTCGGCAGTGTTGTAA+AGG - Chr7:12438461-12438480 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGCCACTATTCAGTACA+AGG + Chr7:12439779-12439798 None:intergenic 40.0%
TCGCATAATGCCCTTATTGT+TGG - Chr7:12438054-12438073 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGCATGGTAGATCTACT+TGG - Chr7:12439182-12439201 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
TTCAATGCTTCGGTCAACTA+TGG - Chr7:12438425-12438444 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
! AAGAGCGAACAACTGTTTCT+TGG - Chr7:12438643-12438662 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
! ACACCCGTTTTGCAAATAAC+AGG + Chr7:12437470-12437489 None:intergenic 40.0%
! AGACTATGGTTTAGGACTTC+AGG - Chr7:12437591-12437610 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGCTCTAAACCAATCTGC+AGG + Chr7:12439968-12439987 None:intergenic 40.0%
! CAACATTTGCTAGTGCGTTT+AGG - Chr7:12437854-12437873 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
! CTGCCGAAAGTATAATCATC+AGG + Chr7:12438453-12438472 None:intergenic 40.0%
! TTCGACGAAATTAGTCTGTC+TGG - Chr7:12438147-12438166 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
! TTGCTCTAAACCAATCTGCA+GGG + Chr7:12439967-12439986 None:intergenic 40.0%
!! AGAAGGAAACCATCGATTTC+AGG + Chr7:12439611-12439630 None:intergenic 40.0%
!! AGCTTTGAACTATGGTATGG+AGG - Chr7:12438500-12438519 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
!! CATGGATTAGCAGTGAAATG+TGG - Chr7:12438222-12438241 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCAAAATGTGGAGCATTGA+TGG - Chr7:12438290-12438309 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTTGGGTTCATTTGGTTTG+AGG + Chr7:12437128-12437147 None:intergenic 40.0%
!! TTGGAAGGTATTCAACTGCA+TGG - Chr7:12438204-12438223 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
!!! GATGGGTTTTGATAGTGATG+TGG - Chr7:12437633-12437652 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTATTTTAGGGTGTACCGAT+GGG - Chr7:12439890-12439909 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTGTTTTGAAAGCGTGTAC+TGG - Chr7:12437562-12437581 MsG0780036720.01.T01:CDS 40.0%
AACTATGGTATGGAGGTCCA+TGG - Chr7:12438507-12438526 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
ATATGGAACCGCAGGAATGT+GGG - Chr7:12439397-12439416 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGGGCTACATTACTTCC+GGG - Chr7:12439115-12439134 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CAAGTCACATAATCCCGCTT+AGG + Chr7:12438948-12438967 None:intergenic 45.0%
CAAGTTGCAAGGGAATGTTG+AGG - Chr7:12439298-12439317 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CACGAAACAACATCTCGTTC+CGG + Chr7:12437433-12437452 None:intergenic 45.0%
CATTATGCGATTGCCGAGTA+GGG + Chr7:12438044-12438063 None:intergenic 45.0%
CGATGGTTTCCTTCTTGATG+AGG - Chr7:12439616-12439635 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CGCTGCCTAAAATGGCATAA+TGG - Chr7:12439714-12439733 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CGGAAAGGAATTCAGTGTGT+TGG - Chr7:12437734-12437753 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CGGGAAATGCAAAGTCACTA+CGG - Chr7:12439134-12439153 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
CGTAGTGACTTTGCATTTCC+CGG + Chr7:12439136-12439155 None:intergenic 45.0%
CTAAGCGGGATTATGTGACT+TGG - Chr7:12438946-12438965 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTACATGCGTTTCTTGT+TGG - Chr7:12439503-12439522 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
GATGTAGCTGGATTCAGGTA+AGG - Chr7:12439477-12439496 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
GCATATGCATACCATGGACT+TGG - Chr7:12438984-12439003 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
GCATGGTAGATCTACTTGGT+AGG - Chr7:12439186-12439205 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
GCCGTGCATATCCAACAATA+AGG + Chr7:12438068-12438087 None:intergenic 45.0%
GGATTCTCTTCAGAGAAGCA+AGG - Chr7:12438681-12438700 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
GTAGATCTACTTGGTAGGTC+AGG - Chr7:12439191-12439210 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
TATATGGAACCGCAGGAATG+TGG - Chr7:12439396-12439415 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
TCATCATCATCCCTGCAGAT+TGG - Chr7:12439954-12439973 MsG0780036720.01.T01:exon 45.0%
TCGAATGTATATGGAACCGC+AGG - Chr7:12439389-12439408 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
TGAGTCCTGCTCAATATGAC+TGG - Chr7:12439868-12439887 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
TGCACAAATGTCGAGAACTG+TGG + Chr7:12438775-12438794 None:intergenic 45.0%
TGCGTTTCTTGTTGGAGACA+AGG - Chr7:12439511-12439530 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
TTCGCTCTTCCAATCTCTCA+TGG + Chr7:12438632-12438651 None:intergenic 45.0%
TTGCAAGTGTGGAATGCTAG+TGG - Chr7:12438593-12438612 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
TTGCATCTTCTCCAAGTCCA+TGG + Chr7:12438998-12439017 None:intergenic 45.0%
! CAGAATGGTTGATGCTCGAA+AGG - Chr7:12437999-12438018 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
! GCATAATGGAGAATTCGAGC+AGG - Chr7:12439728-12439747 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
! TTATGCTGGTGTTGGGAACA+TGG - Chr7:12437378-12437397 MsG0780036720.01.T01:exon 45.0%
! TTGTTCGTTTTGCTCGTGAG+CGG + Chr7:12438379-12438398 None:intergenic 45.0%
!! ATGGGGTTAGACTGGTTTGT+CGG - Chr7:12438549-12438568 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTTTTGTTTGACGCGATGC+CGG - Chr7:12437411-12437430 MsG0780036720.01.T01:exon 45.0%
!! TGTTGGAGTGCTGTAATTGC+AGG - Chr7:12437751-12437770 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTTTGAGAAGGCACCTAAG+CGG - Chr7:12438931-12438950 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGTATTTTAGGGTGTACCGA+TGG - Chr7:12439889-12439908 MsG0780036720.01.T01:CDS 45.0%
ACACATTCCCCAACCCTACT+CGG - Chr7:12438028-12438047 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
ACCTGAATCCAGCTACATCC+TGG + Chr7:12439476-12439495 None:intergenic 50.0%
AGTCTGGTATGGGGTTAGAC+TGG - Chr7:12438541-12438560 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
CAAGGCACATCCAAGATCTG+AGG - Chr7:12439529-12439548 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
CAAGTGTGGAATGCTAGTGG+AGG - Chr7:12438596-12438615 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
CATGCCCAGATGACAGTAAC+TGG - Chr7:12437220-12437239 MsG0780036720.01.T01:exon 50.0%
CTACGGTTTAGATCCCCAAG+TGG - Chr7:12439151-12439170 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
CTCAGAGCTTGTGCGCATAT+GGG - Chr7:12439083-12439102 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
GCATTATGCGATTGCCGAGT+AGG + Chr7:12438045-12438064 None:intergenic 50.0%
GGATATGCACGGCAAGATCA+AGG - Chr7:12438075-12438094 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
GTGGATGAGATGAAGTGGGA+CGG - Chr7:12439578-12439597 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
GTGGCATACGTGAAGTTGTC+AGG + Chr7:12438756-12438775 None:intergenic 50.0%
TATGGAACCGCAGGAATGTG+GGG - Chr7:12439398-12439417 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
! AGTGTTGTAAAGGCGTGTGC+AGG - Chr7:12438471-12438490 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
! TTAGGGTGTACCGATGGGTT+TGG - Chr7:12439895-12439914 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
!! CGGAACGAGATGTTGTTTCG+TGG - Chr7:12437431-12437450 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTTGAGAAGGCACCTAAGC+GGG - Chr7:12438932-12438951 MsG0780036720.01.T01:CDS 50.0%
AGAAGGAGCCAGGATGTAGC+TGG - Chr7:12439465-12439484 MsG0780036720.01.T01:CDS 55.0%
AGTGCGTTTAGGTCGTGTGC+CGG - Chr7:12437865-12437884 MsG0780036720.01.T01:CDS 55.0%
ATGCGATTGCCGAGTAGGGT+TGG + Chr7:12438040-12438059 None:intergenic 55.0%
CCATATGCGCACAAGCTCTG+AGG + Chr7:12439085-12439104 None:intergenic 55.0%
CCTCAGAGCTTGTGCGCATA+TGG - Chr7:12439082-12439101 MsG0780036720.01.T01:CDS 55.0%
CTGGATTCAGGTAAGGGACG+AGG - Chr7:12439484-12439503 MsG0780036720.01.T01:CDS 55.0%
GCCAGGATGTAGCTGGATTC+AGG - Chr7:12439472-12439491 MsG0780036720.01.T01:CDS 55.0%
TGCGATTGCCGAGTAGGGTT+GGG + Chr7:12438039-12438058 None:intergenic 55.0%
! GGTGTACCGATGGGTTTGGA+TGG - Chr7:12439899-12439918 MsG0780036720.01.T01:CDS 55.0%
! TGGGCATGAGCTTGTTTCCC+AGG + Chr7:12437208-12437227 None:intergenic 55.0%
AACCTCGCCCCACATTCCTG+CGG + Chr7:12439408-12439427 None:intergenic 60.0%
GCGATTGCCGAGTAGGGTTG+GGG + Chr7:12438038-12438057 None:intergenic 60.0%
AACCGCAGGAATGTGGGGCG+AGG - Chr7:12439403-12439422 MsG0780036720.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 12437103 12440004 12437103 ID=MsG0780036720.01;
Chr7 mRNA 12437103 12440004 12437103 ID=MsG0780036720.01.T01;Parent=MsG0780036720.01
Chr7 exon 12437103 12440004 12437103 ID=MsG0780036720.01.T01.exon;Parent=MsG0780036720.01.T01
Chr7 CDS 12437422 12439971 12437422 ID=MsG0780036720.01.T01.cds;Parent=MsG0780036720.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036720.01.T01

ATGAACCCAACAAAGAAACTAACATTTTCCCACATTTTCCAAAAATGTTCAAATCTTAAAGCTATAAATCCTGGGAAACAAGCTCATGCCCAGATGACAGTAACTGGTTTTGTTCCCACTGTTTTTGTTTCAAACTGTTTGCTTCAGTTTTACTGTAAATGTTCGAAATTGAATTACGCGTTCAATGTGTTCGATAAAATGCCTCAAAGGGATGTTATTTCATGGAACACTATGATATTTGGTTATGCTGGTGTTGGGAACATGGAATTTGCTCAGTTTTTGTTTGACGCGATGCCGGAACGAGATGTTGTTTCGTGGAATTCGATGTTGTCCTGTTATTTGCAAAACGGGTGTCATCGAAAGTCGATTGAAATATTCACTAAGATGAGATTATTGGAAATTCAGCATGATTATGCTACTTTTGTGGTTGTTTTGAAAGCGTGTACTGGTATTGAAGACTATGGTTTAGGACTTCAGGTTCATTGTCTTGCGATTAAGATGGGTTTTGATAGTGATGTGGTAACGGGTACTGCTCTAGTAGATATGTATTCGACGTGTAAGAAACTAGATCATGCTTTTAACATTTTTTGTGAAATGCCGGAAAGGAATTCAGTGTGTTGGAGTGCTGTAATTGCAGGCTATGTTCGAAATGATCGGTTTATTGAGGGGTTAAAATTGTATAAAGTTATGTTAAAAGAAGGTATGGGGGTGAGTCAATCAACATTTGCTAGTGCGTTTAGGTCGTGTGCCGGATTATCTGCATTTGAGTTAGGTACGCAGTTGCATGCTTATGCTCTAAAGACTAATTTTGGATACGATAATATAGTAGGAACTGCTACATTAGACATGTATGCTAAGTGTGACAGAATGGTTGATGCTCGAAAGGTATTTAACACATTCCCCAACCCTACTCGGCAATCGCATAATGCCCTTATTGTTGGATATGCACGGCAAGATCAAGGTCTTGAAGCTTTAGAAATTTTTCGGTCTTTACAGAAGTCTTATCTTGACTTCGACGAAATTAGTCTGTCTGGTGCTTTGACTGCATGTTCAGCTATCAAAGGCTATTTGGAAGGTATTCAACTGCATGGATTAGCAGTGAAATGTGGTTTAGATTTCAATATCTGTGTTGCAAATACTATTTTAGACATGTATGCAAAATGTGGAGCATTGATGGAAGCTTGTTTGATATTTGATGGCATGGAAATAAAGGATGCTGTGTCTTGGAATGCAATCATTGCCGCTCACGAGCAAAACGAACAAGTAGAAGAAACACTTTCACTTTTTGTTTCAATGCTTCGGTCAACTATGGAACCTGATGATTATACTTTCGGCAGTGTTGTAAAGGCGTGTGCAGGAAAGAAAGCTTTGAACTATGGTATGGAGGTCCATGGAAGAGTTATTAAGTCTGGTATGGGGTTAGACTGGTTTGTCGGAAGCGCCATTATTGATATGTATTGCAAGTGTGGAATGCTAGTGGAGGCAGAAAAGATCCATGAGAGATTGGAAGAGCGAACAACTGTTTCTTGGAATTCAATCATTTCAGGATTCTCTTCAGAGAAGCAAGGCGAAAATGCTCTGAGTTATTTTTCTAAGATGCTACAAGTCGGTGTAATACCTGACAACTTCACGTATGCCACAGTTCTCGACATTTGTGCAAATTTGGCTACTGTCGAACTCGGAAAACAGATTCATGGACAAATTTTAAAGCTACAGTTGCATTCAGATGTGTATATAGCTAGTACTATTGTCGATATGTATTCAAAGTGTGGAAATATGCAGGATTCTCGTGTAATGTTTGAGAAGGCACCTAAGCGGGATTATGTGACTTGGAGTGCCATGATTTGTGCATATGCATACCATGGACTTGGAGAAGATGCAATTAAATTATTTGAGGAGATGCAGCTTCATAATGTGAAACCAAATCATACGATTTTTATTTCAGTCCTCAGAGCTTGTGCGCATATGGGTTTTGTAGACAAAGGGCTACATTACTTCCGGGAAATGCAAAGTCACTACGGTTTAGATCCCCAAGTGGAACATTATTCTTGCATGGTAGATCTACTTGGTAGGTCAGGTCAAGTAAACGAAGCCTTAGAGCTTATTGAAAGCATGCCTTTTGAAGCTGATGATGTTATATGGAGAACTTTACTTGGTATTTGCAAGTTGCAAGGGAATGTTGAGGTTGCAGAAAAAGCTGCTAATTCTTTATTGCAGTTGGACCCTCAAGATTCTTCTGCTTACGTTCTTTTGTCGAATGTATATGGAACCGCAGGAATGTGGGGCGAGGTTGCGAAAATAAGAAGTTTAATGAAGAATTATAAGTTAAAGAAGGAGCCAGGATGTAGCTGGATTCAGGTAAGGGACGAGGTACATGCGTTTCTTGTTGGAGACAAGGCACATCCAAGATCTGAGGAGATATATCAACAAACTCATGTACTTGTGGATGAGATGAAGTGGGACGGATATGTTCCTGAAATCGATGGTTTCCTTCTTGATGAGGAAGTAGAAGAACAAGATTCTTACGAGGGACAAAATCACCGCGTGTAG
Protein sequence

>MsG0780036720.01.T01

MNPTKKLTFSHIFQKCSNLKAINPGKQAHAQMTVTGFVPTVFVSNCLLQFYCKCSKLNYAFNVFDKMPQRDVISWNTMIFGYAGVGNMEFAQFLFDAMPERDVVSWNSMLSCYLQNGCHRKSIEIFTKMRLLEIQHDYATFVVVLKACTGIEDYGLGLQVHCLAIKMGFDSDVVTGTALVDMYSTCKKLDHAFNIFCEMPERNSVCWSAVIAGYVRNDRFIEGLKLYKVMLKEGMGVSQSTFASAFRSCAGLSAFELGTQLHAYALKTNFGYDNIVGTATLDMYAKCDRMVDARKVFNTFPNPTRQSHNALIVGYARQDQGLEALEIFRSLQKSYLDFDEISLSGALTACSAIKGYLEGIQLHGLAVKCGLDFNICVANTILDMYAKCGALMEACLIFDGMEIKDAVSWNAIIAAHEQNEQVEETLSLFVSMLRSTMEPDDYTFGSVVKACAGKKALNYGMEVHGRVIKSGMGLDWFVGSAIIDMYCKCGMLVEAEKIHERLEERTTVSWNSIISGFSSEKQGENALSYFSKMLQVGVIPDNFTYATVLDICANLATVELGKQIHGQILKLQLHSDVYIASTIVDMYSKCGNMQDSRVMFEKAPKRDYVTWSAMICAYAYHGLGEDAIKLFEEMQLHNVKPNHTIFISVLRACAHMGFVDKGLHYFREMQSHYGLDPQVEHYSCMVDLLGRSGQVNEALELIESMPFEADDVIWRTLLGICKLQGNVEVAEKAANSLLQLDPQDSSAYVLLSNVYGTAGMWGEVAKIRSLMKNYKLKKEPGCSWIQVRDEVHAFLVGDKAHPRSEEIYQQTHVLVDEMKWDGYVPEIDGFLLDEEVEEQDSYEGQNHRV*