AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280009112.01

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MsG0280009112.01.T01 AT1G56145 35.115 393 220 8 8 396 602 963 9.25e-63 219
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MsG0280009112.01.T01 AT1G53430 34.750 400 231 10 4 397 574 949 1.51e-62 219
MsG0280009112.01.T01 AT5G38280 37.309 327 182 8 92 412 320 629 1.74e-62 214
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MsG0280009112.01.T01 AT5G38280 38.226 327 179 9 92 412 320 629 2.30e-62 214
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MsG0280009112.01.T01 AT1G66980 39.048 315 163 8 93 398 824 1118 4.31e-62 218
MsG0280009112.01.T01 AT1G67000 36.341 399 222 13 25 412 487 864 4.61e-62 216
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MsG0280009112.01.T01 AT1G66980 39.048 315 163 8 93 398 778 1072 4.86e-62 218
MsG0280009112.01.T01 AT1G10620 41.060 302 162 7 93 391 358 646 4.97e-62 214
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MsG0280009112.01.T01 AT5G38240 31.905 420 235 11 23 437 203 576 1.27e-61 210
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MsG0280009112.01.T01 AT4G00970 37.047 359 195 13 42 390 283 620 1.48e-60 209
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23200 36.134 357 188 12 54 399 295 622 1.59e-59 206
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MsG0280009112.01.T01 AT2G13800 40.850 306 158 8 92 390 145 434 2.38e-59 202
MsG0280009112.01.T01 AT2G13790 41.503 306 156 8 92 390 281 570 2.58e-59 205
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MsG0280009112.01.T01 AT1G68690 34.257 397 216 10 37 402 281 663 3.12e-59 206
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MsG0280009112.01.T01 AT2G13800 40.850 306 158 8 92 390 262 551 2.64e-58 202
MsG0280009112.01.T01 AT1G07650 34.466 412 226 14 36 441 620 993 3.51e-58 206
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MsG0280009112.01.T01 AT1G56130 36.813 364 193 11 36 396 641 970 3.82e-58 206
MsG0280009112.01.T01 AT1G07650 34.466 412 226 14 36 441 626 999 3.84e-58 206
MsG0280009112.01.T01 AT1G68690 34.828 379 202 10 37 384 281 645 4.02e-58 202
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23320 33.957 374 204 10 39 399 126 469 1.71e-57 197
MsG0280009112.01.T01 AT4G32710 35.509 383 220 9 69 437 353 722 1.80e-57 202
MsG0280009112.01.T01 AT4G02010 38.339 313 172 10 91 396 365 663 1.91e-57 201
MsG0280009112.01.T01 AT4G01330 38.206 301 168 7 93 390 150 435 1.93e-57 196
MsG0280009112.01.T01 AT4G32000 36.677 319 183 8 88 403 155 457 2.02e-57 196
MsG0280009112.01.T01 AT4G23320 33.957 374 204 10 39 399 147 490 2.17e-57 197
MsG0280009112.01.T01 AT3G18810 40.777 309 166 8 91 396 323 617 3.85e-57 200
MsG0280009112.01.T01 AT4G27290 36.528 386 201 13 7 385 432 780 4.18e-57 202
MsG0280009112.01.T01 AT1G29730 37.987 308 171 7 93 396 628 919 5.49e-57 202
MsG0280009112.01.T01 AT4G01330 37.874 301 169 6 93 390 150 435 6.59e-57 195
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MsG0280009112.01.T01 AT2G18470 37.621 311 171 8 91 395 270 563 7.19e-57 198
MsG0280009112.01.T01 AT2G18470 37.621 311 171 8 91 395 270 563 7.19e-57 198
MsG0280009112.01.T01 AT5G39030 37.778 315 175 8 93 402 488 786 7.39e-57 201
MsG0280009112.01.T01 AT1G70520 37.812 320 170 10 92 398 312 615 7.42e-57 199
MsG0280009112.01.T01 AT4G34440 38.390 323 181 9 91 409 298 606 7.50e-57 199
MsG0280009112.01.T01 AT4G34440 38.390 323 181 9 91 409 298 606 7.50e-57 199
MsG0280009112.01.T01 AT4G01330 37.874 301 169 6 93 390 150 435 8.20e-57 195
MsG0280009112.01.T01 AT3G09010 38.462 299 165 8 93 388 34 316 8.81e-57 192
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MsG0280009112.01.T01 AT5G39030 37.778 315 175 8 93 402 482 780 1.01e-56 201
MsG0280009112.01.T01 AT4G23230 35.311 354 189 11 42 388 288 608 1.22e-56 197
MsG0280009112.01.T01 AT5G65240 39.297 313 170 8 84 390 262 560 1.35e-56 197
MsG0280009112.01.T01 AT4G23140 33.668 398 215 14 45 428 302 664 1.45e-56 198
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MsG0280009112.01.T01 AT5G65700 40.210 286 149 7 107 388 698 965 3.18e-56 201
MsG0280009112.01.T01 AT5G55830 35.979 378 207 12 42 412 316 665 3.38e-56 197
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MsG0280009112.01.T01 AT4G04540 40.484 289 147 9 101 385 320 587 5.38e-56 196
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23190 34.188 351 196 12 44 388 225 546 5.91e-56 195
MsG0280009112.01.T01 AT4G23130 36.478 318 174 9 92 399 331 630 6.13e-56 196
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MsG0280009112.01.T01 AT4G21410 38.033 305 160 9 94 388 221 506 3.61e-55 192
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23280 36.875 320 170 10 92 399 331 630 1.62e-54 192
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MsG0280009112.01.T01 AT2G35620 39.590 293 157 6 106 397 307 580 2.52e-54 191
MsG0280009112.01.T01 AT2G35620 39.590 293 157 6 106 397 307 580 2.52e-54 191
MsG0280009112.01.T01 AT2G35620 39.590 293 157 6 106 397 307 580 2.52e-54 191
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MsG0280009112.01.T01 AT3G49670 39.931 288 147 8 107 388 694 961 3.18e-54 195
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MsG0280009112.01.T01 AT1G31420 35.912 362 203 10 39 397 248 583 4.24e-54 190
MsG0280009112.01.T01 AT1G67520 33.827 405 222 13 8 390 154 534 4.76e-54 190
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MsG0280009112.01.T01 AT1G67520 33.580 405 223 12 8 390 183 563 6.78e-54 190
MsG0280009112.01.T01 AT1G15530 36.774 310 174 9 90 395 346 637 7.49e-54 191
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MsG0280009112.01.T01 AT5G63710 37.821 312 175 8 84 390 232 529 1.10e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT4G34500 36.545 301 173 7 93 389 133 419 1.13e-53 186
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MsG0280009112.01.T01 AT1G29740 38.667 300 163 7 93 388 665 947 1.79e-53 193
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23270 35.849 318 176 11 92 399 313 612 1.81e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT4G04510 35.211 355 188 10 42 388 288 608 1.88e-53 189
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MsG0280009112.01.T01 AT5G10290 38.339 313 173 8 84 390 268 566 1.97e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT4G04510 35.211 355 188 10 42 388 286 606 2.01e-53 189
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MsG0280009112.01.T01 AT1G29740 38.667 300 163 7 93 388 665 947 2.47e-53 192
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MsG0280009112.01.T01 AT4G03230 38.562 306 163 10 89 388 518 804 2.58e-53 191
MsG0280009112.01.T01 AT4G23270 35.849 318 176 11 92 399 313 612 2.69e-53 189
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MsG0280009112.01.T01 AT4G03230 38.562 306 163 10 89 388 575 861 2.92e-53 192
MsG0280009112.01.T01 AT5G63710 37.821 312 175 8 84 390 268 565 2.99e-53 188
MsG0280009112.01.T01 AT5G59270 31.690 426 238 15 29 446 288 668 3.25e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT5G10530 33.420 383 214 14 41 407 268 625 3.89e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT1G49730 38.889 306 155 11 92 388 346 628 3.93e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT4G03230 38.562 306 163 10 89 388 603 889 3.93e-53 191
MsG0280009112.01.T01 AT5G59270 31.690 426 238 15 29 446 291 671 4.01e-53 189
MsG0280009112.01.T01 AT2G01950 37.898 314 166 8 92 388 825 1126 4.12e-53 192
MsG0280009112.01.T01 AT5G11020 34.072 361 206 13 42 388 7 349 4.18e-53 182
MsG0280009112.01.T01 AT4G21400 35.514 321 172 7 95 388 212 524 4.21e-53 187
MsG0280009112.01.T01 AT4G03230 38.562 306 163 10 89 388 675 961 4.57e-53 192
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MsG0280009112.01.T01 AT2G28970 37.500 320 174 9 73 389 418 714 5.51e-53 189
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MsG0280009112.01.T01 AT1G26970 36.656 311 165 10 93 389 71 363 5.95e-51 177
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MsG0280009112.01.T01 AT3G16030 37.705 305 166 9 93 390 536 823 9.94e-51 184
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MsG0280009112.01.T01 AT1G11410 33.596 381 219 12 32 397 447 808 1.38e-50 184
MsG0280009112.01.T01 AT1G11410 33.596 381 219 12 32 397 416 777 1.59e-50 183
MsG0280009112.01.T01 AT4G23250 34.675 323 173 11 92 399 346 645 1.61e-50 182
MsG0280009112.01.T01 AT5G01540 35.376 359 193 10 43 396 319 643 1.62e-50 182
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23310 35.197 304 172 8 92 388 495 780 2.02e-50 183
MsG0280009112.01.T01 AT1G16130 33.803 355 213 8 41 389 349 687 2.22e-50 182
MsG0280009112.01.T01 AT1G11300 33.889 360 201 11 51 397 433 768 2.27e-50 183
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MsG0280009112.01.T01 AT1G51890 33.521 355 202 10 40 385 442 771 2.62e-50 182
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MsG0280009112.01.T01 AT1G51940 37.134 307 170 10 90 385 326 620 3.57e-50 181
MsG0280009112.01.T01 AT1G51890 33.521 355 202 10 40 385 506 835 3.63e-50 182
MsG0280009112.01.T01 AT1G65790 31.043 422 238 13 37 432 436 830 4.45e-50 182
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MsG0280009112.01.T01 AT4G29050 33.143 350 201 10 46 390 311 632 6.41e-50 180
MsG0280009112.01.T01 AT5G01560 34.473 351 194 11 43 389 315 633 7.28e-50 180
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MsG0280009112.01.T01 AT1G25390 32.869 359 214 11 39 390 228 566 7.93e-50 179
MsG0280009112.01.T01 AT3G45410 37.829 304 164 10 90 388 327 610 8.03e-50 180
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MsG0280009112.01.T01 AT4G23250 33.148 359 185 12 56 399 322 640 1.05e-49 182
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MsG0280009112.01.T01 AT4G11900 37.329 292 163 7 101 388 464 739 1.47e-49 180
MsG0280009112.01.T01 AT1G34110 36.610 295 155 8 106 388 775 1049 1.50e-49 181
MsG0280009112.01.T01 AT5G16900 36.066 305 173 7 92 393 376 661 1.64e-49 179
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MsG0280009112.01.T01 AT1G70450 36.964 303 174 8 91 389 35 324 4.73e-49 172
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MsG0280009112.01.T01 AT2G33170 33.981 309 177 7 92 388 806 1099 5.62e-49 180
MsG0280009112.01.T01 AT4G29180 32.635 334 190 7 74 389 535 851 5.86e-49 179
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MsG0280009112.01.T01 AT2G42960 36.570 309 174 8 93 398 171 460 5.94e-49 174
MsG0280009112.01.T01 AT2G42960 36.570 309 174 8 93 398 171 460 5.94e-49 174
MsG0280009112.01.T01 AT4G29180 32.635 334 190 7 74 389 533 849 6.29e-49 179
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MsG0280009112.01.T01 AT4G04570 39.068 279 146 10 40 310 123 385 8.06e-49 172
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MsG0280009112.01.T01 AT1G07570 35.671 328 182 11 93 406 56 368 8.79e-49 172
MsG0280009112.01.T01 AT5G59260 32.619 420 226 17 37 446 302 674 8.83e-49 177
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MsG0280009112.01.T01 AT1G69790 35.256 312 167 12 93 389 72 363 2.27e-48 170
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MsG0280009112.01.T01 AT5G15730 32.787 305 176 8 86 388 98 375 2.32e-48 171
MsG0280009112.01.T01 AT3G59350 37.954 303 173 8 96 393 62 354 3.05e-48 169
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MsG0280009112.01.T01 AT5G01020 36.039 308 169 10 93 389 57 347 3.73e-48 170
MsG0280009112.01.T01 AT4G32000 33.542 319 172 9 88 403 113 394 3.90e-48 170
MsG0280009112.01.T01 AT2G47060 38.926 298 169 7 95 389 63 350 3.99e-48 169
MsG0280009112.01.T01 AT2G47060 38.926 298 169 7 95 389 63 350 3.99e-48 169
MsG0280009112.01.T01 AT3G08870 34.936 312 178 7 90 396 374 665 4.39e-48 176
MsG0280009112.01.T01 AT2G37710 33.696 368 208 12 35 396 289 626 4.45e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT2G14510 32.676 355 192 12 42 389 526 840 4.71e-48 177
MsG0280009112.01.T01 AT5G02070 35.621 306 176 7 93 389 351 644 4.94e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT3G08870 34.936 312 178 7 90 396 353 644 4.99e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT5G15730 32.899 307 171 9 86 388 98 373 5.10e-48 171
MsG0280009112.01.T01 AT1G21230 30.380 395 249 10 41 430 343 716 5.12e-48 176
MsG0280009112.01.T01 AT1G51830 34.122 296 175 7 92 385 375 652 5.14e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT1G51860 36.824 296 166 8 92 385 573 849 5.41e-48 176
MsG0280009112.01.T01 AT2G14510 32.676 355 192 12 42 389 518 832 5.64e-48 176
MsG0280009112.01.T01 AT4G04540 44.393 214 107 6 101 310 349 554 5.68e-48 173
MsG0280009112.01.T01 AT1G51830 34.122 296 175 7 92 385 382 659 5.78e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT3G59350 37.954 303 173 8 96 393 119 411 6.19e-48 170
MsG0280009112.01.T01 AT1G18390 31.398 379 223 10 25 388 260 616 6.51e-48 174
MsG0280009112.01.T01 AT2G29000 35.331 317 174 7 92 395 554 852 6.63e-48 176
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
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MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G30740 37.458 299 172 8 96 389 62 350 6.74e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT3G02130 34.700 317 175 10 88 398 842 1132 6.74e-48 177
MsG0280009112.01.T01 AT3G02130 34.700 317 175 10 88 398 859 1149 6.80e-48 177
MsG0280009112.01.T01 AT1G72300 35.135 296 174 6 97 389 795 1075 7.51e-48 177
MsG0280009112.01.T01 AT3G17410 38.436 307 172 8 86 389 54 346 7.91e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT3G17410 38.436 307 172 8 86 389 54 346 7.91e-48 168
MsG0280009112.01.T01 AT5G02800 37.908 306 169 10 89 388 57 347 7.95e-48 169
MsG0280009112.01.T01 AT5G37450 35.331 317 171 9 93 398 416 709 9.20e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT1G19390 35.000 300 177 6 93 389 439 723 9.51e-48 175
MsG0280009112.01.T01 AT5G62230 33.148 359 204 14 39 388 535 866 9.91e-48 176
MsG0280009112.01.T01 AT3G62220 38.384 297 170 7 96 389 60 346 1.04e-47 168
MsG0280009112.01.T01 AT3G62220 38.384 297 170 7 96 389 60 346 1.04e-47 168
MsG0280009112.01.T01 AT2G28990 34.568 324 186 9 69 389 547 847 1.13e-47 176
MsG0280009112.01.T01 AT2G28990 34.568 324 186 9 69 389 547 847 1.13e-47 176
MsG0280009112.01.T01 AT2G37050 32.222 360 229 7 39 396 538 884 1.16e-47 176
MsG0280009112.01.T01 AT5G62230 33.148 359 204 14 39 388 583 914 1.21e-47 176
MsG0280009112.01.T01 AT1G48210 36.027 297 177 7 96 389 59 345 1.25e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT1G48210 36.027 297 177 7 96 389 59 345 1.25e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT1G48210 36.027 297 177 7 96 389 59 345 1.25e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT1G48210 36.027 297 177 7 96 389 59 345 1.25e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT1G51820 31.909 351 216 9 40 385 250 582 1.25e-47 173
MsG0280009112.01.T01 AT3G59350 37.954 303 173 8 96 393 104 396 1.31e-47 169
MsG0280009112.01.T01 AT3G59350 37.954 303 173 8 96 393 104 396 1.31e-47 169
MsG0280009112.01.T01 AT4G23300 31.546 317 190 8 92 399 340 638 1.36e-47 173
MsG0280009112.01.T01 AT5G56890 37.417 302 170 10 93 389 711 998 1.52e-47 176
MsG0280009112.01.T01 AT4G23190 36.397 272 145 9 44 310 303 551 1.61e-47 172
MsG0280009112.01.T01 AT4G00960 36.719 256 137 6 138 390 5 238 1.68e-47 165
MsG0280009112.01.T01 AT3G24790 36.545 301 172 9 93 388 35 321 1.86e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT4G29450 33.439 314 174 8 92 389 555 849 1.98e-47 175
MsG0280009112.01.T01 AT5G02290 34.295 312 176 11 92 389 55 351 2.01e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT5G02290 34.295 312 176 11 92 389 55 351 2.01e-47 167
MsG0280009112.01.T01 AT1G79680 34.667 300 178 6 93 389 421 705 2.04e-47 174
MsG0280009112.01.T01 AT1G06840 36.392 316 164 10 85 389 606 895 2.10e-47 175
MsG0280009112.01.T01 AT5G48380 34.967 306 183 8 91 388 289 586 2.44e-47 172

Find 80 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 154 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATTGATTTATGTTGCTTTA+TGG 0.159064 2:+45542023 MsG0280009112.01.T01:CDS
CGAGCACTTGTTTCGGATTT+CGG 0.192355 2:+45541680 MsG0280009112.01.T01:CDS
GATGGATTTCAATCACTTAT+TGG 0.240842 2:+45541245 MsG0280009112.01.T01:CDS
GCCAAGGTTGAGGCCTAGTA+TGG 0.283860 2:+45542060 MsG0280009112.01.T01:CDS
AATTGTTGATCATAGGTTAA+TGG 0.318991 2:+45541967 MsG0280009112.01.T01:CDS
GCTGTGATCCTTGCAGTATT+TGG 0.331940 2:+45541065 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTCGGTCTTGCAAAGCTAAC+TGG 0.348563 2:+45541698 MsG0280009112.01.T01:CDS
CAAATGGATCATTAGATTGT+TGG 0.354688 2:+45541477 MsG0280009112.01.T01:CDS
AAAACTGATGTATATAGTTA+TGG 0.360935 2:+45541809 MsG0280009112.01.T01:CDS
CAAACGCAGAAGGAGAATAT+TGG 0.375717 2:+45541112 MsG0280009112.01.T01:CDS
TCATGGAAATTGTTGATCAT+AGG 0.379717 2:+45541960 MsG0280009112.01.T01:CDS
AAGAGGAACAAGAGGTTATA+TGG 0.381755 2:+45541751 MsG0280009112.01.T01:CDS
TGGAAGAGGTTCTTCGGCTT+CGG 0.384831 2:+45541265 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTCTTCCTCATCTGTGGCGC+TGG 0.386545 2:+45541038 MsG0280009112.01.T01:CDS
TCATTGTATCTGAACTTTGT+TGG 0.388765 2:-45541206 None:intergenic
ATGAAAAGGACAAATCAAAA+AGG 0.388918 2:+45541885 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTTTATGATTATATATCAAA+TGG 0.400843 2:+45541461 MsG0280009112.01.T01:CDS
AGTTTCTTAAGAAAAGTTGC+AGG 0.427036 2:+45541179 MsG0280009112.01.T01:CDS
AAACTGATGTATATAGTTAT+GGG 0.430760 2:+45541810 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTAATTCTTCTTCAGCTCCT+AGG 0.450213 2:+45541432 MsG0280009112.01.T01:CDS
ACTTATTGGAAGAGGTTCTT+CGG 0.451749 2:+45541259 MsG0280009112.01.T01:CDS
AAAGCCAGAAAATATTCTCT+TGG 0.452095 2:+45541646 MsG0280009112.01.T01:CDS
TATCTTGTTAAAGCTTTCAA+AGG 0.468992 2:+45541013 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTTGCAATTGACGTTGCTAA+AGG 0.469470 2:+45541572 MsG0280009112.01.T01:CDS
CAAGCGGTGTCTACGATAAG+AGG 0.477242 2:+45541734 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTTCAATCACTTATTGGAAG+AGG 0.482831 2:+45541251 MsG0280009112.01.T01:CDS
TCAACCACTCTACCCATACT+AGG 0.507090 2:-45542073 None:intergenic
TTCACCACGATTGCAGATCA+AGG 0.510593 2:+45541606 MsG0280009112.01.T01:CDS
AGAATTGATGCAGAAGAAAG+AGG 0.512959 2:+45541332 MsG0280009112.01.T01:CDS
AGTGAAACAAGGGAAAATCA+TGG 0.532784 2:+45541943 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTTTCTTAAGAAAAGTTGCA+GGG 0.533411 2:+45541180 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTCAAAGGAATTCTCAACGA+TGG 0.537837 2:+45541290 MsG0280009112.01.T01:CDS
TCGCAAAGGCGTCCACATCC+TGG 0.539269 2:+45541518 MsG0280009112.01.T01:CDS
AAGGCTTTCTTCCTCATCTG+TGG 0.542883 2:+45541032 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTGTTTAGTTGAAGATGAAA+AGG 0.546362 2:+45541871 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTGAGAGTGGATGAGCCACC+AGG 0.546609 2:+45542112 MsG0280009112.01.T01:CDS
CAACGCCAGCGCCACAGATG+AGG 0.549773 2:-45541043 None:intergenic
GAGGTTATATGGCACCTGAA+TGG 0.554945 2:+45541762 MsG0280009112.01.T01:CDS
ATGTGGTGGTGTTGATGAGA+GGG 0.559841 2:+45541991 MsG0280009112.01.T01:CDS
GACAAGCATCCACCAGGATG+TGG 0.566527 2:-45541530 None:intergenic
AATTCTCAACGATGGAACTT+CGG 0.566583 2:+45541298 MsG0280009112.01.T01:CDS
AGAGTGGTTGATATGCTTGA+AGG 0.569951 2:+45542085 MsG0280009112.01.T01:CDS
TCCCGAAAAGGGATTCGCAA+AGG 0.572829 2:+45541504 MsG0280009112.01.T01:CDS
TGCAAGAAAAGCCAAGGTTG+AGG 0.577713 2:+45542050 MsG0280009112.01.T01:CDS
ACAAGAATCATTCTTGTACC+TGG 0.580730 2:-45542130 None:intergenic
TGATGTATATAGTTATGGGA+TGG 0.580878 2:+45541814 MsG0280009112.01.T01:CDS
GAATCACAGTTGAAATCAGA+AGG 0.581735 2:+45541134 MsG0280009112.01.T01:CDS
GATGCTTGTCGTGGAACTTG+AGG 0.583798 2:+45541543 MsG0280009112.01.T01:CDS
GAGCTTGAGGAAGCAACGGA+TGG 0.586087 2:+45541227 MsG0280009112.01.T01:CDS
GTTCAGATACAATGAGCTTG+AGG 0.588658 2:+45541214 MsG0280009112.01.T01:CDS
GAGGCCTAGTATGGGTAGAG+TGG 0.592790 2:+45542069 MsG0280009112.01.T01:CDS
GCTTGAAGGGCGTGTGAGAG+TGG 0.593371 2:+45542099 MsG0280009112.01.T01:CDS
CCCATACTAGGCCTCAACCT+TGG 0.593444 2:-45542061 None:intergenic
GAGTGGTTGATATGCTTGAA+GGG 0.597195 2:+45542086 MsG0280009112.01.T01:CDS
CTAGACATAGTGTCCAACCT+TGG 0.599542 2:-45542184 None:intergenic
TTCCACGACAAGCATCCACC+AGG 0.601813 2:-45541536 None:intergenic
TAATCATAAACAAGGTACCT+AGG 0.602436 2:-45541449 None:intergenic
TGATGATAACATGCCAAGGT+TGG 0.604151 2:+45542171 MsG0280009112.01.T01:CDS
AACAGTAGTAGCAAAAGAGT+AGG 0.608755 2:-45542242 None:intergenic
CAATGAGCTTGAGGAAGCAA+CGG 0.613045 2:+45541223 MsG0280009112.01.T01:CDS
CCAAGGTTGAGGCCTAGTAT+GGG 0.614601 2:+45542061 MsG0280009112.01.T01:CDS
ATCCTGGTGGATGCTTGTCG+TGG 0.616166 2:+45541534 MsG0280009112.01.T01:CDS
GATCATAGGTTAATGGAATG+TGG 0.619949 2:+45541974 MsG0280009112.01.T01:CDS
GCTTAATCTACAAACGCAGA+AGG 0.623533 2:+45541102 MsG0280009112.01.T01:CDS
AAACAAAACCAAATACTGCA+AGG 0.630788 2:-45541073 None:intergenic
TATAATTGCTGCTATATCAG+TGG 0.631355 2:+45540959 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTGGACACTATGTCTAGTCA+AGG 0.632958 2:+45542190 MsG0280009112.01.T01:CDS
AATGTGGTGGTGTTGATGAG+AGG 0.635793 2:+45541990 MsG0280009112.01.T01:CDS
TGGTGGTGTTGATGAGAGGG+AGG 0.642475 2:+45541994 MsG0280009112.01.T01:CDS
CAAAGGCGTCCACATCCTGG+TGG 0.656709 2:+45541521 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTTCTTAAGAAAAGTTGCAG+GGG 0.665003 2:+45541181 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTGATATATAATCATAAACA+AGG 0.668071 2:-45541457 None:intergenic
TCAAGGAACACAAAGCAATG+TGG 0.669513 2:+45542207 MsG0280009112.01.T01:CDS
AGAATCATTCTTGTACCTGG+TGG 0.669782 2:-45542127 None:intergenic
TCTACGATAAGAGGAACAAG+AGG 0.672983 2:+45541743 MsG0280009112.01.T01:CDS
TGGTAAAGACGAAAGTCAAG+CGG 0.686043 2:+45541718 MsG0280009112.01.T01:CDS
TTGATGATGATAACATGCCA+AGG 0.697765 2:+45542167 MsG0280009112.01.T01:CDS
GGTGTGTGCAAGAAAAGCCA+AGG 0.708770 2:+45542044 MsG0280009112.01.T01:CDS
AGATCCTTGATCTGCAATCG+TGG 0.714143 2:-45541610 None:intergenic
CATAGGTTAATGGAATGTGG+TGG 0.730965 2:+45541977 MsG0280009112.01.T01:CDS

CRISPR-GE

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!! GTTTATGATTATATATCAAA+TGG + Chr2:45541461-45541480 MsG0280009112.01.T01:CDS 15.0%
!! TAAGTTATTATATATTAGCT+GGG + Chr2:45543023-45543042 MsG0280009112.01.T01:intron 15.0%
!! TTAAGTTATTATATATTAGC+TGG + Chr2:45543022-45543041 MsG0280009112.01.T01:intron 15.0%
!! TTGATATATAATCATAAACA+AGG - Chr2:45541460-45541479 None:intergenic 15.0%
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!! AAACTGATGTATATAGTTAT+GGG + Chr2:45541810-45541829 MsG0280009112.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAACAATAACAAGAGAAAA+GGG - Chr2:45542512-45542531 None:intergenic 20.0%
!! TAAACTAATTTCATTTGGTT+TGG - Chr2:45543350-45543369 None:intergenic 20.0%
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!! TATGAATATTATGTCAGTAT+TGG + Chr2:45543081-45543100 MsG0280009112.01.T01:intron 20.0%
!!! AAACTAATTTCATTTGGTTT+GGG - Chr2:45543349-45543368 None:intergenic 20.0%
!!! AATTGATTTATGTTGCTTTA+TGG + Chr2:45542023-45542042 MsG0280009112.01.T01:CDS 20.0%
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!!! ATCAAATAAACTTGCTTAAA+AGG - Chr2:45542473-45542492 None:intergenic 20.0%
!!! TTATTTTTTGAAGAAGAAAG+AGG + Chr2:45542658-45542677 MsG0280009112.01.T01:intron 20.0%
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! ATCAATTGTGTCAAGTATTA+TGG - Chr2:45542813-45542832 None:intergenic 25.0%
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! CATAACAATAACAAGAGAAA+AGG - Chr2:45542513-45542532 None:intergenic 25.0%
! CATCAATTGATCATATAAGA+TGG - Chr2:45542947-45542966 None:intergenic 25.0%
! GCAGAATCAAATAAATAACA+TGG - Chr2:45542312-45542331 None:intergenic 25.0%
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! TATTAAGTGCAAATGGTTTA+TGG + Chr2:45543247-45543266 MsG0280009112.01.T01:intron 25.0%
! TTAAGCTCAAAATTATGCAT+TGG - Chr2:45542849-45542868 None:intergenic 25.0%
!! AATTTAGTTCAGACAATTAG+TGG + Chr2:45542560-45542579 MsG0280009112.01.T01:intron 25.0%
!! TAGTCATTAGTTTCTATACT+AGG + Chr2:45542277-45542296 MsG0280009112.01.T01:intron 25.0%
!!! ATGGTTTTATTAGAGATTGT+TGG + Chr2:45541833-45541852 MsG0280009112.01.T01:CDS 25.0%
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!!! TGTAGTTGAAGATTTTTTGT+TGG + Chr2:45542982-45543001 MsG0280009112.01.T01:intron 25.0%
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AAACAAAACCAAATACTGCA+AGG - Chr2:45541076-45541095 None:intergenic 30.0%
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TTGTGTCAAGTATTATGGAA+CGG - Chr2:45542808-45542827 None:intergenic 30.0%
TTTAAGGAAGCTTGTAGATA+TGG - Chr2:45543123-45543142 None:intergenic 30.0%
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! CTTTTGTCTGATAAGATTGA+AGG - Chr2:45543217-45543236 None:intergenic 30.0%
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AATTCTCAACGATGGAACTT+CGG + Chr2:45541298-45541317 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
ACAAGAATCATTCTTGTACC+TGG - Chr2:45542133-45542152 None:intergenic 35.0%
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CATGCAAAATTAACTTCTCC+AGG + Chr2:45543316-45543335 MsG0280009112.01.T01:intron 35.0%
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GATTACTGAATTCAAGCTCA+AGG - Chr2:45542586-45542605 None:intergenic 35.0%
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TGCACAATTCTAATGGAATC+GGG + Chr2:45542735-45542754 MsG0280009112.01.T01:intron 35.0%
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! CTGGAGAAGTTAATTTTGCA+TGG - Chr2:45543318-45543337 None:intergenic 35.0%
! GTGAATCTTGTGAGACTTTT+CGG + Chr2:45541404-45541423 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
! TGAATCTTGTGAGACTTTTC+GGG + Chr2:45541405-45541424 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTTGGATTTTCCCGAAAA+GGG + Chr2:45541493-45541512 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGCTACTACTGTTTTCTC+TGG + Chr2:45542250-45542269 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
!! ACCTGAATGGCTTTTAGAAA+AGG + Chr2:45541775-45541794 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTGAATGGCTTTTAGAAAA+GGG + Chr2:45541776-45541795 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGATGATGATAACATGCCA+AGG + Chr2:45542167-45542186 MsG0280009112.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAGGATGACACTTTTAAGAC+CGG + Chr2:45542439-45542458 MsG0280009112.01.T01:intron 35.0%
AGAATCATTCTTGTACCTGG+TGG - Chr2:45542130-45542149 None:intergenic 40.0%
CAAACGCAGAAGGAGAATAT+TGG + Chr2:45541112-45541131 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
CAACTGGTTGACAAAAGATC+GGG - Chr2:45543190-45543209 None:intergenic 40.0%
CATAGGTTAATGGAATGTGG+TGG + Chr2:45541977-45541996 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
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GTAATTCTTCTTCAGCTCCT+AGG + Chr2:45541432-45541451 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAGTATTATGGAACGGA+GGG - Chr2:45542804-45542823 None:intergenic 40.0%
GTCTCTTAACGAAACATTGC+TGG + Chr2:45543045-45543064 MsG0280009112.01.T01:intron 40.0%
GTTCAGATACAATGAGCTTG+AGG + Chr2:45541214-45541233 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCAATTGACGTTGCTAA+AGG + Chr2:45541572-45541591 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
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TCTACGATAAGAGGAACAAG+AGG + Chr2:45541743-45541762 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
TGATGATAACATGCCAAGGT+TGG + Chr2:45542171-45542190 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
TGGTAAAGACGAAAGTCAAG+CGG + Chr2:45541718-45541737 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
TGTCAAGTATTATGGAACGG+AGG - Chr2:45542805-45542824 None:intergenic 40.0%
TTGGACACTATGTCTAGTCA+AGG + Chr2:45542190-45542209 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
! AGAGTGGTTGATATGCTTGA+AGG + Chr2:45542085-45542104 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
! GAACGAAAGTAGTACTGAGA+TGG - Chr2:45542702-45542721 None:intergenic 40.0%
! GAGTGGTTGATATGCTTGAA+GGG + Chr2:45542086-45542105 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
!! CCCTTTTCTAAAAGCCATTC+AGG - Chr2:45541779-45541798 None:intergenic 40.0%
!! GACTTTTCGAGCACTTGTTT+CGG + Chr2:45541673-45541692 MsG0280009112.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGGTTTGGGAAGAATTCC+TGG - Chr2:45543337-45543356 None:intergenic 40.0%
AAGGCTTTCTTCCTCATCTG+TGG + Chr2:45541032-45541051 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
AGAAAGAGGTGGAACAAGAG+AGG + Chr2:45542672-45542691 MsG0280009112.01.T01:intron 45.0%
AGATCCTTGATCTGCAATCG+TGG - Chr2:45541613-45541632 None:intergenic 45.0%
CAATGAGCTTGAGGAAGCAA+CGG + Chr2:45541223-45541242 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
CGAGCACTTGTTTCGGATTT+CGG + Chr2:45541680-45541699 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
CTAGACATAGTGTCCAACCT+TGG - Chr2:45542187-45542206 None:intergenic 45.0%
GAAAGAGGTGGAACAAGAGA+GGG + Chr2:45542673-45542692 MsG0280009112.01.T01:intron 45.0%
GAGGTTATATGGCACCTGAA+TGG + Chr2:45541762-45541781 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
GCTGTGATCCTTGCAGTATT+TGG + Chr2:45541065-45541084 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
TCAACCACTCTACCCATACT+AGG - Chr2:45542076-45542095 None:intergenic 45.0%
TGCAAGAAAAGCCAAGGTTG+AGG + Chr2:45542050-45542069 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
TTCACCACGATTGCAGATCA+AGG + Chr2:45541606-45541625 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
TTCGGTCTTGCAAAGCTAAC+TGG + Chr2:45541698-45541717 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
! TCTTCGGCTTCGGTTTTCAA+AGG + Chr2:45541275-45541294 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
!! AATGTGGTGGTGTTGATGAG+AGG + Chr2:45541990-45542009 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGTGGTGGTGTTGATGAGA+GGG + Chr2:45541991-45542010 MsG0280009112.01.T01:CDS 45.0%
!!! ATTTATTTTAATATATATGT+AGG + Chr2:45543384-45543403 MsG0280009112.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTTTTAGTTTTTTA+AGG - Chr2:45543139-45543158 None:intergenic 5.0%
CAAGCGGTGTCTACGATAAG+AGG + Chr2:45541734-45541753 MsG0280009112.01.T01:CDS 50.0%
CCAAGGTTGAGGCCTAGTAT+GGG + Chr2:45542061-45542080 MsG0280009112.01.T01:CDS 50.0%
GATGCTTGTCGTGGAACTTG+AGG + Chr2:45541543-45541562 MsG0280009112.01.T01:CDS 50.0%
GGTGTGTGCAAGAAAAGCCA+AGG + Chr2:45542044-45542063 MsG0280009112.01.T01:CDS 50.0%
TCCCGAAAAGGGATTCGCAA+AGG + Chr2:45541504-45541523 MsG0280009112.01.T01:CDS 50.0%
TGGAAGAGGTTCTTCGGCTT+CGG + Chr2:45541265-45541284 MsG0280009112.01.T01:CDS 50.0%
! CGCCTTTGCGAATCCCTTTT+CGG - Chr2:45541509-45541528 None:intergenic 50.0%
! GCCTTTGCGAATCCCTTTTC+GGG - Chr2:45541508-45541527 None:intergenic 50.0%
CCCATACTAGGCCTCAACCT+TGG - Chr2:45542064-45542083 None:intergenic 55.0%
GACAAGCATCCACCAGGATG+TGG - Chr2:45541533-45541552 None:intergenic 55.0%
GAGCTTGAGGAAGCAACGGA+TGG + Chr2:45541227-45541246 MsG0280009112.01.T01:CDS 55.0%
GAGGCCTAGTATGGGTAGAG+TGG + Chr2:45542069-45542088 MsG0280009112.01.T01:CDS 55.0%
GCCAAGGTTGAGGCCTAGTA+TGG + Chr2:45542060-45542079 MsG0280009112.01.T01:CDS 55.0%
TTCCACGACAAGCATCCACC+AGG - Chr2:45541539-45541558 None:intergenic 55.0%
TTCTTCCTCATCTGTGGCGC+TGG + Chr2:45541038-45541057 MsG0280009112.01.T01:CDS 55.0%
! ATCCTGGTGGATGCTTGTCG+TGG + Chr2:45541534-45541553 MsG0280009112.01.T01:CDS 55.0%
!! TGGTGGTGTTGATGAGAGGG+AGG + Chr2:45541994-45542013 MsG0280009112.01.T01:CDS 55.0%
GTGAGAGTGGATGAGCCACC+AGG + Chr2:45542112-45542131 MsG0280009112.01.T01:CDS 60.0%
! GCTTGAAGGGCGTGTGAGAG+TGG + Chr2:45542099-45542118 MsG0280009112.01.T01:CDS 60.0%
!! CAAAGGCGTCCACATCCTGG+TGG + Chr2:45541521-45541540 MsG0280009112.01.T01:CDS 60.0%
!! TCGCAAAGGCGTCCACATCC+TGG + Chr2:45541518-45541537 MsG0280009112.01.T01:CDS 60.0%
CAACGCCAGCGCCACAGATG+AGG - Chr2:45541046-45541065 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 45540939 45543406 45540939 ID=MsG0280009112.01;Name=MsG0280009112.01
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Chr2 exon 45540939 45542278 45540939 ID=MsG0280009112.01.T01:exon:24004;Parent=MsG0280009112.01.T01
Chr2 exon 45543406 45543406 45543406 ID=MsG0280009112.01.T01:exon:24003;Parent=MsG0280009112.01.T01
Chr2 CDS 45540939 45542278 45540939 ID=MsG0280009112.01.T01:cds;Parent=MsG0280009112.01.T01
Chr2 CDS 45543406 45543406 45543406 ID=MsG0280009112.01.T01:cds;Parent=MsG0280009112.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280009112.01.T01

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Protein sequence

>MsG0280009112.01.T01

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