AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015572.01


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MsG0380015572.01.T01 AT5G54590 32.685 257 141 4 278 502 120 376 9.95e-33 130
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MsG0380015572.01.T01 AT3G45430 31.136 273 143 5 278 509 351 619 2.29e-28 120
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MsG0380015572.01.T01 AT1G56720 32.609 276 139 10 278 509 186 458 4.22e-27 115
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MsG0380015572.01.T01 AT1G11330 28.710 310 172 6 234 502 492 793 2.39e-26 114
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MsG0380015572.01.T01 AT3G45440 28.897 263 150 4 284 509 355 617 5.10e-26 113
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MsG0380015572.01.T01 AT2G17220 29.856 278 140 8 278 503 94 368 6.19e-26 110
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MsG0380015572.01.T01 AT1G56130 32.707 266 138 9 278 504 502 765 6.51e-26 113
MsG0380015572.01.T01 AT3G45440 28.897 263 150 4 284 509 408 670 6.67e-26 113
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MsG0380015572.01.T01 AT2G28930 27.566 341 178 7 278 553 76 412 7.36e-26 110
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MsG0380015572.01.T01 AT1G09440 32.463 268 137 8 278 503 164 429 8.71e-26 111
MsG0380015572.01.T01 AT4G23140 31.206 282 147 5 278 512 358 639 9.99e-26 112
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MsG0380015572.01.T01 AT1G07650 28.832 274 154 5 278 510 659 932 1.54e-25 112
MsG0380015572.01.T01 AT1G07650 28.832 274 154 5 278 510 691 964 1.60e-25 112
MsG0380015572.01.T01 AT1G10620 29.104 268 148 4 278 503 377 644 1.63e-25 111
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MsG0380015572.01.T01 AT5G10290 31.734 271 140 8 278 504 297 566 2.11e-25 111
MsG0380015572.01.T01 AT4G23150 30.357 280 154 6 274 512 339 618 2.34e-25 111
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MsG0380015572.01.T01 AT2G07180 30.545 275 139 7 278 503 97 368 2.41e-25 109
MsG0380015572.01.T01 AT4G23260 31.295 278 147 6 278 511 346 623 2.85e-25 110
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MsG0380015572.01.T01 AT1G55610 32.222 270 139 6 278 503 866 1135 3.52e-25 111
MsG0380015572.01.T01 AT4G23250 31.399 293 154 7 265 511 352 643 3.95e-25 110
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MsG0380015572.01.T01 AT4G23250 31.293 294 155 7 264 511 346 638 4.08e-25 110
MsG0380015572.01.T01 AT3G45330 30.325 277 150 6 274 510 351 624 4.89e-25 110
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MsG0380015572.01.T01 AT1G61500 28.470 281 161 4 278 518 503 783 1.21e-24 109
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MsG0380015572.01.T01 AT1G61490 29.433 282 153 7 278 516 497 775 1.40e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT1G61490 29.433 282 153 7 278 516 497 775 1.40e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT1G61490 29.433 282 153 7 278 516 497 775 1.40e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT1G70740 27.178 287 124 6 278 502 69 332 1.42e-24 107
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MsG0380015572.01.T01 AT1G61490 29.433 282 153 7 278 516 471 749 1.47e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT4G23310 29.323 266 147 5 278 502 475 740 1.52e-24 108
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MsG0380015572.01.T01 AT5G01950 31.203 266 141 9 278 503 633 896 1.73e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT5G01950 31.203 266 141 9 278 503 633 896 1.73e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT5G01950 31.203 266 141 9 278 503 633 896 1.73e-24 108
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MsG0380015572.01.T01 AT3G46330 30.651 261 142 5 278 499 549 809 2.35e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT1G61420 28.525 305 177 5 271 535 497 800 2.54e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT1G61420 28.525 305 177 5 271 535 497 800 2.54e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT2G02800 27.193 342 144 10 278 547 90 398 2.60e-24 106
MsG0380015572.01.T01 AT2G02800 27.193 342 144 10 278 547 90 398 2.60e-24 106
MsG0380015572.01.T01 AT5G38560 44.715 123 62 2 267 383 330 452 2.61e-24 107
MsG0380015572.01.T01 AT1G79620 29.153 295 163 6 254 503 616 909 2.72e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT1G61420 28.525 305 177 5 271 535 495 798 2.77e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT5G65240 30.627 271 143 7 278 504 291 560 2.78e-24 107
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MsG0380015572.01.T01 AT2G42960 48.649 111 54 1 278 385 190 300 2.95e-24 106
MsG0380015572.01.T01 AT2G42960 48.649 111 54 1 278 385 190 300 2.95e-24 106
MsG0380015572.01.T01 AT2G42960 48.649 111 54 1 278 385 190 300 2.95e-24 106
MsG0380015572.01.T01 AT3G46760 27.719 285 131 4 278 510 57 318 2.96e-24 104
MsG0380015572.01.T01 AT1G79620 29.153 295 163 6 254 503 642 935 3.08e-24 108
MsG0380015572.01.T01 AT4G13190 29.893 281 143 9 278 507 78 355 3.26e-24 105
MsG0380015572.01.T01 AT1G68690 29.818 275 136 6 278 503 384 650 3.32e-24 107
MsG0380015572.01.T01 AT1G68690 29.818 275 136 6 278 503 384 650 3.32e-24 107
MsG0380015572.01.T01 AT1G68690 29.818 275 136 6 278 503 384 650 3.32e-24 107
MsG0380015572.01.T01 AT1G70520 30.169 295 157 9 264 509 317 611 3.79e-24 107
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MsG0380015572.01.T01 AT5G59260 28.148 270 156 6 278 509 362 631 4.09e-24 107
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MsG0380015572.01.T01 AT1G34210 33.210 271 136 7 278 504 312 581 6.28e-24 106
MsG0380015572.01.T01 AT1G01540 45.045 111 58 1 278 385 161 271 7.21e-24 104
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MsG0380015572.01.T01 AT1G26150 46.729 107 56 1 278 383 437 543 1.29e-23 105
MsG0380015572.01.T01 AT1G01540 45.045 111 58 1 278 385 161 271 1.32e-23 104
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MsG0380015572.01.T01 AT1G61480 28.315 279 160 4 278 516 503 781 1.68e-23 105
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MsG0380015572.01.T01 AT2G28990 29.924 264 147 6 278 503 584 847 1.89e-23 105
MsG0380015572.01.T01 AT1G29730 47.748 111 56 1 278 386 647 757 2.12e-23 105
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MsG0380015572.01.T01 AT1G61590 27.941 272 150 7 278 503 106 377 3.10e-23 102
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MsG0380015572.01.T01 AT3G25560 31.086 267 142 7 278 504 320 584 5.61e-23 103
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MsG0380015572.01.T01 AT4G23290 28.947 304 161 8 278 535 370 664 6.71e-23 103
MsG0380015572.01.T01 AT4G23280 29.316 307 130 8 278 520 349 632 7.22e-23 103
MsG0380015572.01.T01 AT5G38240 31.707 287 134 9 278 513 342 617 7.30e-23 103
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MsG0380015572.01.T01 AT4G11900 28.571 280 160 6 278 517 475 754 8.19e-23 103
MsG0380015572.01.T01 AT4G23280 29.316 307 130 8 278 520 351 634 8.43e-23 103
MsG0380015572.01.T01 AT3G24550 29.348 276 147 7 278 508 287 559 9.68e-23 103
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MsG0380015572.01.T01 AT5G38280 29.167 288 125 9 278 504 338 607 1.31e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT4G29050 30.576 278 142 10 278 509 351 623 1.39e-22 102
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MsG0380015572.01.T01 AT4G04500 27.660 282 156 6 278 511 352 633 1.40e-22 102
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MsG0380015572.01.T01 AT2G18470 47.664 107 55 1 278 383 291 397 1.46e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT2G18470 47.664 107 55 1 278 383 291 397 1.46e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT1G51880 31.159 276 149 7 278 514 573 846 1.56e-22 102
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MsG0380015572.01.T01 AT4G01330 44.144 111 59 1 278 385 169 279 1.79e-22 101
MsG0380015572.01.T01 AT5G37450 48.148 108 55 1 278 384 435 542 1.81e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT1G51880 30.182 275 153 5 278 514 599 872 1.82e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT1G52540 28.947 266 146 7 278 502 44 307 1.83e-22 99.4
MsG0380015572.01.T01 AT1G51880 31.159 276 149 7 278 514 591 864 1.84e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT4G21410 28.274 336 169 11 227 511 327 641 1.86e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT2G28970 29.924 264 147 6 278 503 451 714 2.03e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT4G20450 29.242 277 155 7 268 503 585 861 2.06e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT1G74490 30.216 278 149 10 278 512 98 373 2.08e-22 100
MsG0380015572.01.T01 AT5G56890 31.852 270 139 8 278 503 730 998 2.10e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT2G28970 29.924 264 147 6 278 503 486 749 2.16e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT3G09010 47.706 109 54 1 278 383 53 161 2.30e-22 99.8
MsG0380015572.01.T01 AT4G01330 44.144 111 59 1 278 385 169 279 2.37e-22 100
MsG0380015572.01.T01 AT5G37450 48.148 108 55 1 278 384 638 745 2.49e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT5G37450 48.148 108 55 1 278 384 614 721 2.51e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT5G37450 48.148 108 55 1 278 384 662 769 2.67e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT5G61350 28.148 270 150 5 278 503 532 801 2.70e-22 102
MsG0380015572.01.T01 AT3G02810 27.726 321 163 9 245 511 51 356 2.80e-22 101
MsG0380015572.01.T01 AT4G38830 28.963 328 168 11 234 511 316 628 2.94e-22 101
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MsG0380015572.01.T01 AT5G06740 44.144 111 58 2 278 385 349 458 1.04e-20 96.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G28680 27.925 265 152 6 278 503 528 792 1.05e-20 97.1
MsG0380015572.01.T01 AT5G28680 27.925 265 152 6 278 503 528 792 1.05e-20 97.1
MsG0380015572.01.T01 AT5G65530 25.632 277 159 6 278 512 151 422 1.06e-20 95.5
MsG0380015572.01.T01 AT1G70250 28.315 279 140 8 278 504 466 736 1.12e-20 97.1
MsG0380015572.01.T01 AT3G26700 30.855 269 138 8 278 503 86 349 1.12e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G26700 30.855 269 138 8 278 503 86 349 1.12e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G26700 30.855 269 138 8 278 503 86 349 1.12e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT4G17660 41.379 116 58 2 278 383 98 213 1.14e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT2G28590 45.946 111 54 3 278 383 105 214 1.23e-20 93.6
MsG0380015572.01.T01 AT1G11280 28.520 277 156 8 278 512 522 798 1.25e-20 96.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G46290 27.925 265 152 6 278 503 492 756 1.27e-20 96.7
MsG0380015572.01.T01 AT1G11280 28.520 277 156 8 278 512 510 786 1.28e-20 96.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G01560 28.467 274 152 7 278 510 370 640 1.29e-20 96.7
MsG0380015572.01.T01 AT4G13190 28.077 260 140 6 295 507 7 266 1.37e-20 93.2
MsG0380015572.01.T01 AT5G47070 40.678 118 58 3 278 383 93 210 1.42e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT4G00960 40.541 111 64 1 278 386 63 173 1.47e-20 92.4
MsG0380015572.01.T01 AT2G48010 30.627 271 141 9 278 503 290 558 1.55e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT1G21590 27.723 303 172 7 252 508 345 646 1.64e-20 96.3
MsG0380015572.01.T01 AT5G62710 30.712 267 142 8 278 503 285 549 1.65e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT3G13690 44.860 107 58 1 278 383 418 524 1.65e-20 96.3
MsG0380015572.01.T01 AT3G13690 44.860 107 58 1 278 383 418 524 1.65e-20 96.3
MsG0380015572.01.T01 AT3G13690 44.860 107 58 1 278 383 418 524 1.65e-20 96.3
MsG0380015572.01.T01 AT4G00960 27.419 248 131 7 307 511 5 246 1.79e-20 92.4
MsG0380015572.01.T01 AT5G62710 30.712 267 142 8 278 503 319 583 1.85e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT5G13160 45.045 111 55 3 278 383 93 202 1.94e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G61480 28.674 279 148 8 278 507 726 1002 2.06e-20 96.3
MsG0380015572.01.T01 AT1G51800 28.846 260 146 7 278 499 593 851 2.11e-20 96.3
MsG0380015572.01.T01 AT2G28590 45.946 111 54 3 278 383 105 214 2.36e-20 94.4
MsG0380015572.01.T01 AT1G21590 28.676 272 152 6 278 508 416 686 2.42e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT3G16030 28.674 279 155 8 278 512 534 812 2.42e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT4G03390 27.083 288 121 7 278 499 492 756 2.48e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT4G03390 27.083 288 121 7 278 499 492 756 2.48e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT5G01950 43.519 108 60 1 278 384 633 740 2.48e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT3G55450 38.710 124 62 2 278 387 68 191 2.52e-20 93.6
MsG0380015572.01.T01 AT1G11303 26.740 273 166 5 278 516 516 788 2.67e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT4G29990 28.723 282 159 7 263 503 563 843 2.78e-20 95.9
MsG0380015572.01.T01 AT1G24030 43.363 113 60 2 278 386 69 181 3.05e-20 90.9
MsG0380015572.01.T01 AT4G00970 42.342 111 62 1 278 386 351 461 3.11e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G16030 28.674 279 155 8 278 512 555 833 3.13e-20 95.5
MsG0380015572.01.T01 AT3G02880 27.667 300 122 11 278 509 352 624 3.21e-20 95.1
MsG0380015572.01.T01 AT1G07570 29.921 254 91 7 314 503 5 235 3.24e-20 91.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G59700 26.846 298 168 8 278 531 345 636 3.41e-20 95.1
MsG0380015572.01.T01 AT1G61440 43.243 111 61 1 278 386 490 600 3.51e-20 95.1
MsG0380015572.01.T01 AT3G55450 38.710 124 62 2 278 387 105 228 3.72e-20 93.6
MsG0380015572.01.T01 AT1G24030 43.363 113 60 2 278 386 69 181 4.18e-20 91.3
MsG0380015572.01.T01 AT3G16030 28.996 269 149 7 278 504 411 679 4.93e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT2G23950 44.860 107 57 2 278 383 306 411 4.94e-20 94.0
MsG0380015572.01.T01 AT4G13190 44.144 111 56 3 278 383 78 187 4.98e-20 91.3
MsG0380015572.01.T01 AT4G04490 27.941 272 157 6 278 511 347 617 5.00e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G46370 29.885 261 143 6 278 499 494 753 5.52e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G46370 29.885 261 143 6 278 499 494 753 5.52e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G38990 40.310 129 67 3 268 386 517 645 5.82e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT1G66920 28.676 272 145 7 278 504 314 581 5.93e-20 94.4
MsG0380015572.01.T01 AT5G59670 27.170 265 153 5 278 503 571 834 5.97e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G59670 27.170 265 153 5 278 503 571 834 5.97e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G39000 40.310 129 67 3 268 386 510 638 6.16e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT3G04690 44.545 110 60 1 278 386 524 633 6.31e-20 94.7
MsG0380015572.01.T01 AT5G55830 41.441 111 60 2 278 383 372 482 6.48e-20 94.4
MsG0380015572.01.T01 AT4G21410 38.272 162 84 4 227 386 327 474 6.76e-20 93.6
MsG0380015572.01.T01 AT4G20270 46.789 109 55 2 278 383 717 825 7.10e-20 94.4
MsG0380015572.01.T01 AT1G66920 28.676 272 145 7 278 504 306 573 7.14e-20 94.0
MsG0380015572.01.T01 AT2G29220 27.667 300 137 7 265 510 346 619 7.30e-20 94.0
MsG0380015572.01.T01 AT1G24030 43.363 113 60 2 278 386 15 127 7.33e-20 90.9
MsG0380015572.01.T01 AT1G51810 28.788 264 150 5 278 503 457 720 7.68e-20 94.0
MsG0380015572.01.T01 AT1G17230 28.839 267 148 6 278 502 806 1072 7.70e-20 94.4
MsG0380015572.01.T01 AT1G17230 28.839 267 148 6 278 502 806 1072 8.08e-20 94.4
MsG0380015572.01.T01 AT4G23180 45.045 111 59 1 278 386 355 465 8.13e-20 93.2
MsG0380015572.01.T01 AT1G61400 43.243 111 61 1 278 386 507 617 8.23e-20 94.0
MsG0380015572.01.T01 AT5G24100 25.517 290 124 8 278 503 348 609 8.39e-20 93.6
MsG0380015572.01.T01 AT1G51910 30.797 276 149 8 268 503 567 840 9.40e-20 94.0
MsG0380015572.01.T01 AT4G11900 43.243 111 61 1 278 386 475 585 1.03e-19 93.6
MsG0380015572.01.T01 AT1G24030 43.363 113 60 2 278 386 69 181 1.04e-19 91.7
MsG0380015572.01.T01 AT2G04300 27.308 260 151 6 278 499 589 848 1.05e-19 94.0

Find 112 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 214 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCGCCGAGATTGCTGTTAT+TGG 0.160771 3:+72016180 MsG0380015572.01.T01:CDS
CAATTTCGCGACGCGAAAAT+TGG 0.195860 3:-72015238 None:intergenic
TGACTGACTATGATTATTAT+TGG 0.237800 3:-72015523 None:intergenic
AAAACTGATGTATATAGTTT+TGG 0.289749 3:+72016590 MsG0380015572.01.T01:CDS
AAAAGCTACTAATAGTAAAT+TGG 0.295747 3:-72015272 None:intergenic
TTGAATTTCTTGAGGTTCTA+TGG 0.318744 3:+72016968 MsG0380015572.01.T01:CDS
CCTATTCTTCCACAAGCTAA+TGG 0.323408 3:-72015348 None:intergenic
ATTCGGTGGACATCCGGTTT+TGG 0.327131 3:+72016311 MsG0380015572.01.T01:CDS
CCATTAGCTTGTGGAAGAAT+AGG 0.330048 3:+72015348 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACAAAAGAGTTACATGGATT+TGG 0.330869 3:+72016781 MsG0380015572.01.T01:CDS
TGGAATGGTGCTTCTTGAAT+TGG 0.342828 3:+72016610 MsG0380015572.01.T01:CDS
AACAACAGCAGTGGTAATAA+TGG 0.347803 3:+72016692 MsG0380015572.01.T01:CDS
ATTAACAGAATTCACTATCT+TGG 0.351103 3:-72017121 None:intergenic
TGCATTTCTAATGCATATAG+TGG 0.362551 3:-72016755 None:intergenic
AATGGCATGGACAAACATAT+TGG 0.366889 3:+72015082 MsG0380015572.01.T01:CDS
CTCTCTTGCCATTCCAAAAC+CGG 0.375969 3:-72016324 None:intergenic
GTTGAAGAATTACAAGCTAA+TGG 0.376797 3:-72015501 None:intergenic
ACTGCCACAATAGTCTTATC+AGG 0.379305 3:-72016114 None:intergenic
CCTAACATGGTTACAGTTGT+TGG 0.380097 3:+72016899 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACCTTCACCTCCATTACTAA+TGG 0.388857 3:-72015737 None:intergenic
TTGGCTGATCCAAGGTTAGA+AGG 0.394576 3:+72016800 MsG0380015572.01.T01:CDS
AACATATTGGAAAATTTCAA+TGG 0.396271 3:+72015095 MsG0380015572.01.T01:CDS
TCAAATTTCCATGTTGCATC+GGG 0.398454 3:+72015435 MsG0380015572.01.T01:CDS
AATTTAAAGCAGGAATTTGT+TGG 0.400227 3:+72015303 MsG0380015572.01.T01:CDS
TCACTAGATCGGAACCTATT+CGG 0.401607 3:+72016294 MsG0380015572.01.T01:CDS
AATTTGTATAGAAATTCTTC+AGG 0.407980 3:+72015682 MsG0380015572.01.T01:intron
ATAATCAACATTGGAATTCA+AGG 0.412688 3:+72016144 MsG0380015572.01.T01:CDS
TATGTAATTGAAAATGAGTT+AGG 0.414454 3:+72015712 MsG0380015572.01.T01:CDS
GAACCTATTCGGTGGACATC+CGG 0.417412 3:+72016305 MsG0380015572.01.T01:CDS
AAACCGGATGTCCACCGAAT+AGG 0.428814 3:-72016308 None:intergenic
CGTGGTTGTGTTCCGAACGA+TGG 0.431898 3:+72015465 MsG0380015572.01.T01:CDS
CTTCTGATGCAATACTTCAA+TGG 0.440089 3:+72015064 MsG0380015572.01.T01:CDS
CTGATAGGATCTGGTGCATT+CGG 0.440334 3:+72016069 MsG0380015572.01.T01:intron
GTGGTTGTGTTCCGAACGAT+GGG 0.441366 3:+72015466 MsG0380015572.01.T01:CDS
TTCAAATTTCCATGTTGCAT+CGG 0.458444 3:+72015434 MsG0380015572.01.T01:CDS
TTCAGGAACAAATTTAAAGC+AGG 0.461471 3:+72015293 MsG0380015572.01.T01:CDS
CAAGTTCATGTATATCAAGT+TGG 0.464435 3:+72015204 MsG0380015572.01.T01:CDS
GATTCAACCCGCTTCGTTAG+CGG 0.466797 3:+72017064 MsG0380015572.01.T01:CDS
AGAAAATCCGCTAACGAAGC+GGG 0.466914 3:-72017071 None:intergenic
TCATCAAACTCATCAACAAC+AGG 0.477248 3:+72016719 MsG0380015572.01.T01:CDS
CCAACAACTGTAACCATGTT+AGG 0.477702 3:-72016899 None:intergenic
CAAGTCCGCGCGCTGTTCCA+AGG 0.484692 3:-72016359 None:intergenic
GTAACACGTCCTTCTAACCT+TGG 0.487306 3:-72016809 None:intergenic
GTGCTTCTTGAATTGGTTAG+TGG 0.487720 3:+72016617 MsG0380015572.01.T01:CDS
GACAGTTAGTTTCACTGTAT+CGG 0.488798 3:-72014783 None:intergenic
TACATGGCAGTAAACACAAC+AGG 0.488968 3:+72015156 MsG0380015572.01.T01:CDS
GGAATTTGACAACCATCATC+TGG 0.493163 3:-72015327 None:intergenic
AAGAAAATCCGCTAACGAAG+CGG 0.494469 3:-72017072 None:intergenic
GTGTTACTTGATCAATCCAA+TGG 0.508304 3:+72014908 MsG0380015572.01.T01:CDS
GATGCAACATGGAAATTTGA+AGG 0.512667 3:-72015432 None:intergenic
TTTGAAGGACAAGAACAAAC+AGG 0.514130 3:-72015417 None:intergenic
TCCATCCTAGGTTGTGGCAA+TGG 0.515686 3:-72016941 None:intergenic
AAGCTTTCACTCACTGAGAT+GGG 0.517323 3:+72014878 MsG0380015572.01.T01:CDS
AAGTCCGCGCGCTGTTCCAA+GGG 0.519025 3:-72016358 None:intergenic
AAAGCTTTCACTCACTGAGA+TGG 0.521134 3:+72014877 MsG0380015572.01.T01:CDS
GTTGCATCGGGTAATCTTCG+TGG 0.522625 3:+72015447 MsG0380015572.01.T01:CDS
AAATTCAAAGACTCCATCCT+AGG 0.524774 3:-72016953 None:intergenic
TGTCAAATTCCATTAGCTTG+TGG 0.526420 3:+72015339 MsG0380015572.01.T01:CDS
ATATCTTCACAACAAATCTC+AGG 0.527088 3:+72017097 MsG0380015572.01.T01:CDS
TCTTGAGGTTCTATGGTCGT+AGG 0.529180 3:+72016975 MsG0380015572.01.T01:CDS
GGTTACAGTTGTTGGAATGT+TGG 0.530929 3:+72016907 MsG0380015572.01.T01:CDS
GAATTTGTTGGACCAGATGA+TGG 0.531131 3:+72015315 MsG0380015572.01.T01:CDS
TCCATTGCCACAACCTAGGA+TGG 0.535515 3:+72016940 MsG0380015572.01.T01:CDS
GTTAACTTAGTTAGACTCAA+AGG 0.536619 3:+72016216 MsG0380015572.01.T01:CDS
GTTTCCAATAACAGCAATCT+CGG 0.536833 3:-72016184 None:intergenic
TCCATTAGTAATGGAGGTGA+AGG 0.540766 3:+72015736 MsG0380015572.01.T01:CDS
GTTAAGAAAATAATCAACAT+TGG 0.548849 3:+72016135 MsG0380015572.01.T01:CDS
TGGAGTCTTTGAATTTCTTG+AGG 0.556640 3:+72016960 MsG0380015572.01.T01:CDS
AAAGACTCCATCCTAGGTTG+TGG 0.558148 3:-72016947 None:intergenic
AAAGTACGAGACCCATCGTT+CGG 0.558820 3:-72015477 None:intergenic
TTCTTGAATTGGTTAGTGGA+AGG 0.561813 3:+72016621 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACATGGATTTGGCTGATCCA+AGG 0.562609 3:+72016792 MsG0380015572.01.T01:CDS
GAGAGGTGTGATGTTGCCCT+TGG 0.565604 3:+72016342 MsG0380015572.01.T01:CDS
AAATGATGATGTTGAATACA+TGG 0.567348 3:+72015140 MsG0380015572.01.T01:CDS
TTAAGGTAATTATACCGTCA+TGG 0.567573 3:-72013938 None:intergenic
GAGTTAGGATCCATTAGTAA+TGG 0.569115 3:+72015727 MsG0380015572.01.T01:CDS
GTCGCGAAATTGGCTTCCGA+TGG 0.569820 3:+72015249 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACAGTTGTTGGAATGTTGGA+AGG 0.571321 3:+72016911 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACGTGTTACAATAGATGAAG+TGG 0.571809 3:+72016823 MsG0380015572.01.T01:CDS
TGTACTCGTACACCAACATT+CGG 0.572638 3:-72016260 None:intergenic
TGAACCGCGGTTCACTAGAT+CGG 0.577028 3:+72016283 MsG0380015572.01.T01:CDS
TGTACTTGTGATTTAAGTGG+TGG 0.585299 3:-72014854 None:intergenic
GCATGAACAAAAGAGTTACA+TGG 0.587904 3:+72016775 MsG0380015572.01.T01:CDS
TGAATATAGGCTATGGTGTG+AGG 0.591138 3:+72015568 MsG0380015572.01.T01:CDS
TAATCAACATTGGAATTCAA+GGG 0.593783 3:+72016145 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACAGTGAAACTAACTGTCGA+AGG 0.605487 3:+72014788 MsG0380015572.01.T01:CDS
GAACTCCATTGCCACAACCT+AGG 0.609371 3:+72016936 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACTAATAGTAAATTGGCCAT+CGG 0.614868 3:-72015265 None:intergenic
TCCATCACTTAGGCCTAACA+TGG 0.621974 3:+72016886 MsG0380015572.01.T01:CDS
TTAGGATCCATTAGTAATGG+AGG 0.626978 3:+72015730 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACCATGTTAGGCCTAAGTGA+TGG 0.628311 3:-72016887 None:intergenic
GTTGCCCTTGGAACAGCGCG+CGG 0.628637 3:+72016354 MsG0380015572.01.T01:CDS
TCAAAGGGGACACCGAATGT+TGG 0.629415 3:+72016248 MsG0380015572.01.T01:CDS
GAAGATTACCCGATGCAACA+TGG 0.630238 3:-72015443 None:intergenic
TGAGTCTAACTAAGTTAACA+TGG 0.632315 3:-72016212 None:intergenic
ACTACCTGATAAGACTATTG+TGG 0.637108 3:+72016110 MsG0380015572.01.T01:CDS
TGGATTGATCAAGTAACACA+AGG 0.637891 3:-72014904 None:intergenic
GATGCAATACTTCAATGGCA+TGG 0.643911 3:+72015069 MsG0380015572.01.T01:CDS
CAGTGAAACTAACTGTCGAA+GGG 0.646197 3:+72014789 MsG0380015572.01.T01:CDS
CTAGATCGGAACCTATTCGG+TGG 0.649309 3:+72016297 MsG0380015572.01.T01:CDS
ATAGCAGAAGAGAATGAGCA+TGG 0.657425 3:+72017016 MsG0380015572.01.T01:CDS
GTTGTTGGAATGTTGGAAGG+TGG 0.659443 3:+72016914 MsG0380015572.01.T01:CDS
GATGATCATAACAACAGCAG+TGG 0.660910 3:+72016683 MsG0380015572.01.T01:CDS
GCATTCGGCGTAGTGTACAA+AGG 0.665413 3:+72016084 MsG0380015572.01.T01:CDS
GGTTCACAGCGTAACCATGA+CGG 0.677696 3:+72013924 MsG0380015572.01.T01:CDS
TCAACATTGGAATTCAAGGG+AGG 0.678920 3:+72016148 MsG0380015572.01.T01:CDS
TTCATGAAGATCCATCACTT+AGG 0.685424 3:+72016876 MsG0380015572.01.T01:CDS
AGAATGAGCATGGTTCTGTG+AGG 0.734257 3:+72017026 MsG0380015572.01.T01:CDS
GGACTTGCTTATCTTCACAG+TGG 0.741485 3:+72016375 MsG0380015572.01.T01:CDS
ACGAAGCGGGTTGAATCACG+CGG 0.749524 3:-72017058 None:intergenic
GGTTCCGATCTAGTGAACCG+CGG 0.778807 3:-72016287 None:intergenic
GTGTACGAGTACATGAACCG+CGG 0.796526 3:+72016270 MsG0380015572.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TAATCACTAAATATTAATAA+TGG + Chr3:72014280-72014299 MsG0380015572.01.T01:intron 10.0%
!! ATTACAATATTTGACAAAAA+TGG + Chr3:72014812-72014831 MsG0380015572.01.T01:CDS 15.0%
!! CAATAATATAAAAATCTTTG+TGG - Chr3:72014245-72014264 None:intergenic 15.0%
!! GTATAATTACCTTAATTTAA+AGG + Chr3:72013946-72013965 MsG0380015572.01.T01:intron 15.0%
!!! AAAATTTATGATTAGTTTCA+TGG - Chr3:72014509-72014528 None:intergenic 15.0%
!!! TTGTACTTTTTACAATATAA+AGG + Chr3:72013903-72013922 MsG0380015572.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAAAGAAAAAAGTGGAAT+TGG - Chr3:72014428-72014447 None:intergenic 20.0%
!! AAAAGCTACTAATAGTAAAT+TGG - Chr3:72015275-72015294 None:intergenic 20.0%
!! AACATATTGGAAAATTTCAA+TGG + Chr3:72015095-72015114 MsG0380015572.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTTGTATAGAAATTCTTC+AGG + Chr3:72015682-72015701 MsG0380015572.01.T01:intron 20.0%
!! ACAAAAATGGAAATTCTAAA+TGG + Chr3:72014825-72014844 MsG0380015572.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATAGAAGTAGTAAACAAA+AGG - Chr3:72014546-72014565 None:intergenic 20.0%
!! ATTGAGAAAAAAGAAAAAAG+TGG - Chr3:72014434-72014453 None:intergenic 20.0%
!! GTTAAGAAAATAATCAACAT+TGG + Chr3:72016135-72016154 MsG0380015572.01.T01:CDS 20.0%
!! TATGTAATTGAAAATGAGTT+AGG + Chr3:72015712-72015731 MsG0380015572.01.T01:CDS 20.0%
!! TGAACAAAATTCTCAAAAAA+TGG + Chr3:72015806-72015825 MsG0380015572.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAACTGATGTATATAGTTT+TGG + Chr3:72016590-72016609 MsG0380015572.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTGTTTCATTTTTGAATAT+AGG + Chr3:72015555-72015574 MsG0380015572.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTGTTCATTTTCAATATCA+TGG - Chr3:72015794-72015813 None:intergenic 20.0%
! AAAAAACAAGAGGTGAAATT+AGG + Chr3:72015924-72015943 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
! AAAAACAAGAGGTGAAATTA+GGG + Chr3:72015925-72015944 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
! AGTAAACAAAAGGAAAATAG+CGG - Chr3:72014536-72014555 None:intergenic 25.0%
! ATAATCAACATTGGAATTCA+AGG + Chr3:72016144-72016163 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
! TAATCAACATTGGAATTCAA+GGG + Chr3:72016145-72016164 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
! TGACTGACTATGATTATTAT+TGG - Chr3:72015526-72015545 None:intergenic 25.0%
! TTATTCTGATCCATTATGTT+TGG + Chr3:72015605-72015624 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
! TTCAATAGTCACTCAAATAT+AGG + Chr3:72014366-72014385 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAATGGATTTCCTGTTAT+TGG + Chr3:72015821-72015840 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
!! AAATGATGATGTTGAATACA+TGG + Chr3:72015140-72015159 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTTAAAGCAGGAATTTGT+TGG + Chr3:72015303-72015322 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTACTATTAGTAGCTTTTC+AGG + Chr3:72015276-72015295 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTGTACTTGTGATTTAAG+TGG - Chr3:72014860-72014879 None:intergenic 25.0%
!!! CTCTTGTTTTTTTTCTTATG+TGG + Chr3:72015884-72015903 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
!!! TCATTTTTGAATATAGGCTA+TGG + Chr3:72015561-72015580 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCGGCTTTATTTTATCATAA+AGG + Chr3:72014158-72014177 MsG0380015572.01.T01:intron 25.0%
!!! TGATGTATATAGTTTTGGAA+TGG + Chr3:72016595-72016614 MsG0380015572.01.T01:CDS 25.0%
ACAAAAGAGTTACATGGATT+TGG + Chr3:72016781-72016800 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
ACTAATAGTAAATTGGCCAT+CGG - Chr3:72015268-72015287 None:intergenic 30.0%
ATATCTTCACAACAAATCTC+AGG + Chr3:72017097-72017116 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
ATGATCTGAAAATGTGTAAG+CGG - Chr3:72014569-72014588 None:intergenic 30.0%
CAAATATAGGTAGCAGAAAA+TGG + Chr3:72014379-72014398 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
CAAGTTCATGTATATCAAGT+TGG + Chr3:72015204-72015223 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
CATATTCCAATTGATTACGA+AGG - Chr3:72014309-72014328 None:intergenic 30.0%
CCTTCTTCTATCTAACAAAT+TGG - Chr3:72014335-72014354 None:intergenic 30.0%
CTTCGTAATCAATTGGAATA+TGG + Chr3:72014307-72014326 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
GTTAACTTAGTTAGACTCAA+AGG + Chr3:72016216-72016235 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
GTTGAAGAATTACAAGCTAA+TGG - Chr3:72015504-72015523 None:intergenic 30.0%
TAAAAAAATGATCCCACCAA+TGG - Chr3:72015860-72015879 None:intergenic 30.0%
TAAACTCACTCCAAACATAA+TGG - Chr3:72015618-72015637 None:intergenic 30.0%
TACAAAGTCGAAAAAACAAG+AGG + Chr3:72015914-72015933 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
TCCAATTCAAATTTGTCAAC+AGG + Chr3:72015018-72015037 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
TCCTGTTGACAAATTTGAAT+TGG - Chr3:72015022-72015041 None:intergenic 30.0%
TCTAGACAACAAAAATGTTC+CGG - Chr3:72014637-72014656 None:intergenic 30.0%
TGAAGCATGCCTTTAAATTA+AGG - Chr3:72013958-72013977 None:intergenic 30.0%
TGAGTCTAACTAAGTTAACA+TGG - Chr3:72016215-72016234 None:intergenic 30.0%
TGATATTTCAAGACTCTGAT+AGG + Chr3:72016054-72016073 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
TGCATTTCTAATGCATATAG+TGG - Chr3:72016758-72016777 None:intergenic 30.0%
TGTCTAGAAACAAACATTCA+AGG + Chr3:72014649-72014668 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
TTAAAAATGCGACGATTTCT+TGG - Chr3:72014133-72014152 None:intergenic 30.0%
TTAAGGTAATTATACCGTCA+TGG - Chr3:72013941-72013960 None:intergenic 30.0%
TTCAAATTTCCATGTTGCAT+CGG + Chr3:72015434-72015453 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAGTAACTGTTCTTGTT+TGG + Chr3:72015658-72015677 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
TTGAATTTCTTGAGGTTCTA+TGG + Chr3:72016968-72016987 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCCAATAACGATTGTAT+CGG - Chr3:72014962-72014981 None:intergenic 30.0%
! AAACTTGTTTGTTGATTACC+AGG - Chr3:72014689-72014708 None:intergenic 30.0%
! AATTTAAAGGCATGCTTCAA+TGG + Chr3:72013959-72013978 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
! ACAACAGGTTTTTATCTCTT+TGG + Chr3:72015171-72015190 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGCTAAGATATCTGATTT+TGG + Chr3:72016462-72016481 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
! CATAATGACTTTTACATTCC+TGG + Chr3:72015989-72016008 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
! CGTCGCATTTTTAAATAAGT+CGG + Chr3:72014139-72014158 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
! TCAAGTAACTGTTCTTGTTT+GGG + Chr3:72015659-72015678 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
! TTCAGGAACAAATTTAAAGC+AGG + Chr3:72015293-72015312 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
! TTCATGGTGTGATAATTTGT+TGG - Chr3:72014493-72014512 None:intergenic 30.0%
!! CCAATTTGTTAGATAGAAGA+AGG + Chr3:72014332-72014351 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
!! TGATTTTAATGTCTCGGTAT+CGG + Chr3:72013880-72013899 MsG0380015572.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGGTGGGATCATTTTTTTAT+TGG + Chr3:72015861-72015880 MsG0380015572.01.T01:intron 30.0%
AAATTCAAAGACTCCATCCT+AGG - Chr3:72016956-72016975 None:intergenic 35.0%
AACAACAGCAGTGGTAATAA+TGG + Chr3:72016692-72016711 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
AAGAATGAAGTAAACGCAGA+AGG - Chr3:72014001-72014020 None:intergenic 35.0%
AATGGCATGGACAAACATAT+TGG + Chr3:72015082-72015101 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
ACGTGTTACAATAGATGAAG+TGG + Chr3:72016823-72016842 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
ACTACCTGATAAGACTATTG+TGG + Chr3:72016110-72016129 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
AGATATGAGGCAGTGAAATT+CGG - Chr3:72014598-72014617 None:intergenic 35.0%
AGCGATGAATTGAAGATATG+AGG - Chr3:72014611-72014630 None:intergenic 35.0%
ATCAATCCAATGGTTCTCTT+GGG + Chr3:72014918-72014937 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
ATTCCAATTGATTACGAAGG+TGG - Chr3:72014306-72014325 None:intergenic 35.0%
CAATCTCACAACATTCTTCA+GGG + Chr3:72015958-72015977 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
CGTTATTGGACAACGATTAT+CGG + Chr3:72014969-72014988 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
CTTCTGATGCAATACTTCAA+TGG + Chr3:72015064-72015083 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
GAGTTAGGATCCATTAGTAA+TGG + Chr3:72015727-72015746 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
GATGCAACATGGAAATTTGA+AGG - Chr3:72015435-72015454 None:intergenic 35.0%
GCATGAACAAAAGAGTTACA+TGG + Chr3:72016775-72016794 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
GTGAGTTTATCTGATTGTCA+AGG + Chr3:72015629-72015648 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
GTTTCCAATAACAGCAATCT+CGG - Chr3:72016187-72016206 None:intergenic 35.0%
GTTTGATTACGAAGAACTTG+AGG + Chr3:72016024-72016043 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
TCAAATTTCCATGTTGCATC+GGG + Chr3:72015435-72015454 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
TCAATCTCACAACATTCTTC+AGG + Chr3:72015957-72015976 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
TCATCAAACTCATCAACAAC+AGG + Chr3:72016719-72016738 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
TCATGCAGAAGAATATTCTC+TGG - Chr3:72016435-72016454 None:intergenic 35.0%
TGGAGTCTTTGAATTTCTTG+AGG + Chr3:72016960-72016979 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
TGGATTGATCAAGTAACACA+AGG - Chr3:72014907-72014926 None:intergenic 35.0%
TGTACTTGTGATTTAAGTGG+TGG - Chr3:72014857-72014876 None:intergenic 35.0%
TGTGAACAAACAGATTGTTC+TGG - Chr3:72016507-72016526 None:intergenic 35.0%
TGTTTGTTCACAACAATGAG+AGG + Chr3:72016515-72016534 MsG0380015572.01.T01:intron 35.0%
TTAGGATCCATTAGTAATGG+AGG + Chr3:72015730-72015749 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
TTCATGAAGATCCATCACTT+AGG + Chr3:72016876-72016895 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTGAATTGGTTAGTGGA+AGG + Chr3:72016621-72016640 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAGGACAAGAACAAAC+AGG - Chr3:72015420-72015439 None:intergenic 35.0%
! AAACAGATTGTTCTGGACTA+AGG - Chr3:72016500-72016519 None:intergenic 35.0%
! GACAGTTAGTTTCACTGTAT+CGG - Chr3:72014786-72014805 None:intergenic 35.0%
! TGTCAAATTCCATTAGCTTG+TGG + Chr3:72015339-72015358 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGTTACTTGATCAATCCAA+TGG + Chr3:72014908-72014927 MsG0380015572.01.T01:CDS 35.0%
AAAGCTTTCACTCACTGAGA+TGG + Chr3:72014877-72014896 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
AACTTTCCCAAGAGAACCAT+TGG - Chr3:72014927-72014946 None:intergenic 40.0%
AAGAAAATCCGCTAACGAAG+CGG - Chr3:72017075-72017094 None:intergenic 40.0%
AAGCTTTCACTCACTGAGAT+GGG + Chr3:72014878-72014897 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
AAGGCAGCTATATTCAATCC+TGG + Chr3:72014668-72014687 MsG0380015572.01.T01:intron 40.0%
ACAGTGAAACTAACTGTCGA+AGG + Chr3:72014788-72014807 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
ACAGTTGTTGGAATGTTGGA+AGG + Chr3:72016911-72016930 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
ACCTTCACCTCCATTACTAA+TGG - Chr3:72015740-72015759 None:intergenic 40.0%
ATAGCAGAAGAGAATGAGCA+TGG + Chr3:72017016-72017035 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
ATTAGCACTGCACCAATAAC+AGG - Chr3:72015836-72015855 None:intergenic 40.0%
ATTGGACAACGATTATCGGT+TGG + Chr3:72014973-72014992 MsG0380015572.01.T01:intron 40.0%
CAGTGAAACTAACTGTCGAA+GGG + Chr3:72014789-72014808 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
CCAACAACTGTAACCATGTT+AGG - Chr3:72016902-72016921 None:intergenic 40.0%
CCAACCGATACAATCGTTAT+TGG + Chr3:72014955-72014974 MsG0380015572.01.T01:intron 40.0%
CCTAACATGGTTACAGTTGT+TGG + Chr3:72016899-72016918 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
CCTATTCTTCCACAAGCTAA+TGG - Chr3:72015351-72015370 None:intergenic 40.0%
GATCAATCCAATGGTTCTCT+TGG + Chr3:72014917-72014936 MsG0380015572.01.T01:intron 40.0%
GATGATCATAACAACAGCAG+TGG + Chr3:72016683-72016702 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
GATGCAATACTTCAATGGCA+TGG + Chr3:72015069-72015088 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
GCTGAATTTGTAAGCCATTC+CGG - Chr3:72016560-72016579 None:intergenic 40.0%
GGAATTTGACAACCATCATC+TGG - Chr3:72015330-72015349 None:intergenic 40.0%
GGTTACAGTTGTTGGAATGT+TGG + Chr3:72016907-72016926 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
GTGCTTCTTGAATTGGTTAG+TGG + Chr3:72016617-72016636 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
TACATGGCAGTAAACACAAC+AGG + Chr3:72015156-72015175 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
TCAACATTGGAATTCAAGGG+AGG + Chr3:72016148-72016167 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
TCACTAGATCGGAACCTATT+CGG + Chr3:72016294-72016313 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCAATTCATCGCTACAC+CGG + Chr3:72014615-72014634 MsG0380015572.01.T01:intron 40.0%
TCTTCGTAATCAAACCTCGT+CGG - Chr3:72016019-72016038 None:intergenic 40.0%
TGAATATAGGCTATGGTGTG+AGG + Chr3:72015568-72015587 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
TGGAATGGTGCTTCTTGAAT+TGG + Chr3:72016610-72016629 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
TGTACTCGTACACCAACATT+CGG - Chr3:72016263-72016282 None:intergenic 40.0%
TTCAAGACTCTGATAGGATC+TGG + Chr3:72016060-72016079 MsG0380015572.01.T01:intron 40.0%
! AAAGGCTTTTGTGCTCAAAG+GGG + Chr3:72016234-72016253 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
! ACTGTATCGGAATCTGAGAT+GGG - Chr3:72014773-72014792 None:intergenic 40.0%
! CAAAGGCTTTTGTGCTCAAA+GGG + Chr3:72016233-72016252 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
! CCAATAACGATTGTATCGGT+TGG - Chr3:72014958-72014977 None:intergenic 40.0%
! TCAAAGGCTTTTGTGCTCAA+AGG + Chr3:72016232-72016251 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
! TCCATTAGTAATGGAGGTGA+AGG + Chr3:72015736-72015755 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTGCCACAATAGTCTTATC+AGG - Chr3:72016117-72016136 None:intergenic 40.0%
!! CCATTAGCTTGTGGAAGAAT+AGG + Chr3:72015348-72015367 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
!! GAATTTGTTGGACCAGATGA+TGG + Chr3:72015315-72015334 MsG0380015572.01.T01:CDS 40.0%
AAAGACTCCATCCTAGGTTG+TGG - Chr3:72016950-72016969 None:intergenic 45.0%
AAAGTACGAGACCCATCGTT+CGG - Chr3:72015480-72015499 None:intergenic 45.0%
AACTCGTGGTTATCTTGCTC+CGG + Chr3:72016538-72016557 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
ACAACAATGAGAGGAACTCG+TGG + Chr3:72016524-72016543 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
ACATGGATTTGGCTGATCCA+AGG + Chr3:72016792-72016811 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
ACCATGTTAGGCCTAAGTGA+TGG - Chr3:72016890-72016909 None:intergenic 45.0%
AGAAAATCCGCTAACGAAGC+GGG - Chr3:72017074-72017093 None:intergenic 45.0%
CAATTTCGCGACGCGAAAAT+TGG - Chr3:72015241-72015260 None:intergenic 45.0%
CACAACATTCTTCAGGGACT+TGG + Chr3:72015964-72015983 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
CACTGTATCGGAATCTGAGA+TGG - Chr3:72014774-72014793 None:intergenic 45.0%
CCAAATGATCGTGTTTGACG+CGG - Chr3:72014732-72014751 None:intergenic 45.0%
CTCTCTTGCCATTCCAAAAC+CGG - Chr3:72016327-72016346 None:intergenic 45.0%
CTGATAGGATCTGGTGCATT+CGG + Chr3:72016069-72016088 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
GAAGATTACCCGATGCAACA+TGG - Chr3:72015446-72015465 None:intergenic 45.0%
GCAGTGCTAATACCATTGGT+GGG + Chr3:72015845-72015864 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
GTAACACGTCCTTCTAACCT+TGG - Chr3:72016812-72016831 None:intergenic 45.0%
GTTGTTGGAATGTTGGAAGG+TGG + Chr3:72016914-72016933 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
TCCATCACTTAGGCCTAACA+TGG + Chr3:72016886-72016905 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
TCTTGAGGTTCTATGGTCGT+AGG + Chr3:72016975-72016994 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGTGCTAATACCATTGG+TGG + Chr3:72015844-72015863 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
TGGCCACCTTCGTAATCAAT+TGG + Chr3:72014300-72014319 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
TGGTGCAGTGCTAATACCAT+TGG + Chr3:72015841-72015860 MsG0380015572.01.T01:intron 45.0%
TTGGCTGATCCAAGGTTAGA+AGG + Chr3:72016800-72016819 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
! AGAATGAGCATGGTTCTGTG+AGG + Chr3:72017026-72017045 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
! CAATTTTCGCGTCGCGAAAT+TGG + Chr3:72015239-72015258 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
! CTATGGTCGTAGGTTTTCTG+AGG + Chr3:72016985-72017004 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
! GGACTTGCTTATCTTCACAG+TGG + Chr3:72016375-72016394 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
! TTCGCCGAGATTGCTGTTAT+TGG + Chr3:72016180-72016199 MsG0380015572.01.T01:CDS 45.0%
AAACCGGATGTCCACCGAAT+AGG - Chr3:72016311-72016330 None:intergenic 50.0%
ACATTCCTGGTTTACCGACG+AGG + Chr3:72016002-72016021 MsG0380015572.01.T01:intron 50.0%
CAGAAGGATGTGCAGAGACA+TGG - Chr3:72013985-72014004 None:intergenic 50.0%
CCGCGTCAAACACGATCATT+TGG + Chr3:72014729-72014748 MsG0380015572.01.T01:intron 50.0%
CTAGATCGGAACCTATTCGG+TGG + Chr3:72016297-72016316 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GAACTCCATTGCCACAACCT+AGG + Chr3:72016936-72016955 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GATTCAACCCGCTTCGTTAG+CGG + Chr3:72017064-72017083 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GCATTCGGCGTAGTGTACAA+AGG + Chr3:72016084-72016103 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GGAGGTGAAGGTGACATGTT+AGG + Chr3:72015748-72015767 MsG0380015572.01.T01:intron 50.0%
GGTTCACAGCGTAACCATGA+CGG + Chr3:72013924-72013943 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GTGGTTATCTTGCTCCGGAA+TGG + Chr3:72016543-72016562 MsG0380015572.01.T01:intron 50.0%
GTGGTTGTGTTCCGAACGAT+GGG + Chr3:72015466-72015485 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GTGTACGAGTACATGAACCG+CGG + Chr3:72016270-72016289 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
GTTGCATCGGGTAATCTTCG+TGG + Chr3:72015447-72015466 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
TCAAACCTCGTCGGTAAACC+AGG - Chr3:72016010-72016029 None:intergenic 50.0%
TCAAAGGGGACACCGAATGT+TGG + Chr3:72016248-72016267 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
TCCATCCTAGGTTGTGGCAA+TGG - Chr3:72016944-72016963 None:intergenic 50.0%
TCCATTGCCACAACCTAGGA+TGG + Chr3:72016940-72016959 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
TGAACCGCGGTTCACTAGAT+CGG + Chr3:72016283-72016302 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
! GAACCTATTCGGTGGACATC+CGG + Chr3:72016305-72016324 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
! GGCTATGGTGTGAGGTACTT+TGG + Chr3:72015576-72015595 MsG0380015572.01.T01:intron 50.0%
!! ATTCGGTGGACATCCGGTTT+TGG + Chr3:72016311-72016330 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
!!! CGGTTTTGGAATGGCAAGAG+AGG + Chr3:72016325-72016344 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
!!! GTGGACATCCGGTTTTGGAA+TGG + Chr3:72016316-72016335 MsG0380015572.01.T01:CDS 50.0%
CGTGGTTGTGTTCCGAACGA+TGG + Chr3:72015465-72015484 MsG0380015572.01.T01:CDS 55.0%
GGTTCCGATCTAGTGAACCG+CGG - Chr3:72016290-72016309 None:intergenic 55.0%
! AATCTGAGATGGGTGCGTCG+CGG - Chr3:72014763-72014782 None:intergenic 55.0%
! GAGAGGTGTGATGTTGCCCT+TGG + Chr3:72016342-72016361 MsG0380015572.01.T01:CDS 55.0%
! GTCGCGAAATTGGCTTCCGA+TGG + Chr3:72015249-72015268 MsG0380015572.01.T01:CDS 55.0%
!! ACGAAGCGGGTTGAATCACG+CGG - Chr3:72017061-72017080 None:intergenic 55.0%
AAGTCCGCGCGCTGTTCCAA+GGG - Chr3:72016361-72016380 None:intergenic 60.0%
CAAGTCCGCGCGCTGTTCCA+AGG - Chr3:72016362-72016381 None:intergenic 65.0%
GTTGCCCTTGGAACAGCGCG+CGG + Chr3:72016354-72016373 MsG0380015572.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 72013879 72017129 72013879 ID=MsG0380015572.01;Name=MsG0380015572.01
Chr3 mRNA 72013879 72017129 72013879 ID=MsG0380015572.01.T01;Parent=MsG0380015572.01;Name=MsG0380015572.01.T01;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=0|0|0|0.83|1|1|6|0|568
Chr3 exon 72013879 72013945 72013879 ID=MsG0380015572.01.T01:exon:23923;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 exon 72014780 72014929 72014780 ID=MsG0380015572.01.T01:exon:23924;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 exon 72015040 72015589 72015040 ID=MsG0380015572.01.T01:exon:23925;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 exon 72015693 72015757 72015693 ID=MsG0380015572.01.T01:exon:23926;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 exon 72016076 72016399 72016076 ID=MsG0380015572.01.T01:exon:23927;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 exon 72016579 72017129 72016579 ID=MsG0380015572.01.T01:exon:23928;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 CDS 72013879 72013945 72013879 ID=MsG0380015572.01.T01:cds;Parent=MsG0380015572.01.T01
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Chr3 CDS 72015040 72015589 72015040 ID=MsG0380015572.01.T01:cds;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 CDS 72015693 72015757 72015693 ID=MsG0380015572.01.T01:cds;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 CDS 72016076 72016399 72016076 ID=MsG0380015572.01.T01:cds;Parent=MsG0380015572.01.T01
Chr3 CDS 72016579 72017129 72016579 ID=MsG0380015572.01.T01:cds;Parent=MsG0380015572.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380015572.01.T01

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Protein sequence

>MsG0380015572.01.T01

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