AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035716.01

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MsG0680035716.01.T01 AT1G57650 30.502 518 308 14 287 782 20 507 1.06e-36 149
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MsG0680035716.01.T01 AT5G43730 29.502 261 158 9 196 442 154 402 3.12e-14 77.8
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MsG0680035716.01.T01 AT1G10920 26.706 337 170 13 172 467 24 324 5.56e-14 77.0
MsG0680035716.01.T01 AT1G58400 23.785 576 309 26 194 716 163 661 8.26e-14 76.6
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MsG0680035716.01.T01 AT5G43470 23.876 356 213 10 132 452 101 433 2.98e-13 74.7
MsG0680035716.01.T01 AT5G43470 23.876 356 213 10 132 452 101 433 2.98e-13 74.7
MsG0680035716.01.T01 AT5G44920 33.333 150 89 3 22 162 13 160 4.59e-13 70.9
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MsG0680035716.01.T01 AT5G43740 27.113 284 180 11 172 442 132 401 6.63e-13 73.6
MsG0680035716.01.T01 AT1G15890 27.668 253 167 6 196 439 156 401 9.10e-13 73.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G12220 25.290 518 311 23 215 708 174 639 1.25e-12 72.8
MsG0680035716.01.T01 AT1G12220 25.290 518 311 23 215 708 174 639 1.25e-12 72.8
MsG0680035716.01.T01 AT1G12220 27.953 254 158 8 215 452 53 297 1.60e-12 72.4
MsG0680035716.01.T01 AT1G61300 24.408 422 244 17 215 589 59 452 1.64e-12 72.4
MsG0680035716.01.T01 AT1G50180 26.471 306 183 13 191 469 160 450 1.70e-12 72.4
MsG0680035716.01.T01 AT5G48620 22.771 628 356 24 123 656 85 677 1.94e-12 72.0
MsG0680035716.01.T01 AT5G48620 22.771 628 356 24 123 656 85 677 1.94e-12 72.0
MsG0680035716.01.T01 AT5G48620 22.771 628 356 24 123 656 85 677 1.94e-12 72.0
MsG0680035716.01.T01 AT5G48620 22.771 628 356 24 123 656 85 677 1.94e-12 72.0
MsG0680035716.01.T01 AT5G48620 22.771 628 356 24 123 656 85 677 1.94e-12 72.0
MsG0680035716.01.T01 AT5G48620 22.771 628 356 24 123 656 85 677 1.94e-12 72.0
MsG0680035716.01.T01 AT1G61190 24.800 500 300 22 192 644 151 621 3.14e-12 71.6
MsG0680035716.01.T01 AT1G59780 26.000 300 161 8 188 452 148 421 3.16e-12 71.6
MsG0680035716.01.T01 AT1G59780 26.000 300 161 8 188 452 153 426 3.49e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G61300 24.048 420 231 16 215 570 59 454 3.53e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G61190 24.800 500 300 22 192 644 151 621 4.02e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G61190 24.800 500 300 22 192 644 151 621 4.02e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G58848 24.248 565 315 24 194 706 162 665 4.64e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G59218 24.248 565 315 24 194 706 162 665 4.64e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G59218 24.248 565 315 24 194 706 162 665 4.64e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G59218 24.248 565 315 24 194 706 162 665 4.64e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G58848 24.248 565 315 24 194 706 162 665 4.64e-12 71.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G61105 34.615 104 64 1 18 121 27 126 4.92e-12 66.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G15890 27.778 234 156 5 215 439 12 241 5.31e-12 70.5
MsG0680035716.01.T01 AT1G12280 24.279 416 255 14 191 563 153 551 1.40e-11 69.3
MsG0680035716.01.T01 AT1G51480 27.329 483 296 22 215 658 171 637 1.47e-11 69.3
MsG0680035716.01.T01 AT1G61190 25.166 302 187 11 192 471 151 435 1.67e-11 68.9
MsG0680035716.01.T01 AT5G44920 36.508 126 73 3 22 142 13 136 1.92e-11 65.9
MsG0680035716.01.T01 AT4G23510 28.342 187 119 4 11 184 1 185 2.54e-11 68.2
MsG0680035716.01.T01 AT4G23510 28.342 187 119 4 11 184 1 185 2.92e-11 68.2
MsG0680035716.01.T01 AT4G23510 28.342 187 119 4 11 184 1 185 3.15e-11 67.8
MsG0680035716.01.T01 AT4G26090 23.762 707 437 30 220 844 178 864 3.25e-11 68.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G58807 27.491 291 161 12 194 452 162 434 3.61e-11 68.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G59124 27.491 291 161 12 194 452 162 434 3.61e-11 68.2
MsG0680035716.01.T01 AT1G58807 27.148 291 162 12 194 452 162 434 4.30e-11 67.8
MsG0680035716.01.T01 AT1G59124 27.148 291 162 12 194 452 162 434 4.30e-11 67.8
MsG0680035716.01.T01 AT1G61310 23.529 510 309 21 215 691 172 633 4.81e-11 67.8
MsG0680035716.01.T01 AT3G50950 23.551 276 183 10 195 452 160 425 8.62e-11 66.6
MsG0680035716.01.T01 AT3G50950 23.551 276 183 10 195 452 160 425 8.62e-11 66.6

Find 182 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 247 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CACTCCCTCTCACCCAATTT+TGG 0.144927 6:+111167653 None:intergenic
TATGAGTAATTATCAAAATT+TGG 0.155289 6:-111169275 MsG0680035716.01.T01:CDS
CAAACTTAAATATTTAAATT+TGG 0.173681 6:-111167813 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCGCTAGAAAGCTTAAATTT+AGG 0.182248 6:-111167878 MsG0680035716.01.T01:CDS
ACCCTTGCTATGACTTTATA+TGG 0.191504 6:-111169706 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCTGCCCAATTTGAGAAAAT+TGG 0.193531 6:-111168299 MsG0680035716.01.T01:CDS
GGCTCAGAAGTGCAAAATTT+TGG 0.207352 6:-111167132 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTAGAAAAGATAATAGATTT+TGG 0.226170 6:-111168256 MsG0680035716.01.T01:CDS
CATAAACATTCAATTGAATT+AGG 0.230653 6:+111167902 None:intergenic
CTTATTTGTTTCCATCCTTA+TGG 0.251613 6:-111168024 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAATTTAACCACTCAAGATT+TGG 0.254301 6:+111168226 None:intergenic
CGCTAGAAAGCTTAAATTTA+GGG 0.256943 6:-111167877 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATGTTAACTTCAATTCTTGT+AGG 0.263168 6:+111167177 None:intergenic
CAACTTGGTATTTCACTTCC+TGG 0.263321 6:+111167545 None:intergenic
ATAAGCATTACTAATCATTC+AGG 0.265531 6:-111168944 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATTTGTGGAATGGGCGGAAT+AGG 0.266357 6:-111169736 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCAAACAATAATGAATATAT+TGG 0.274805 6:-111169869 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATGGATGAAACAATTCATTA+TGG 0.280107 6:-111167609 MsG0680035716.01.T01:CDS
CAATGTTAAGATGGAGAAAA+TGG 0.287198 6:-111168813 MsG0680035716.01.T01:intron
TATCCATAGGTGACTTGATT+TGG 0.288339 6:+111167310 None:intergenic
AGATCTTCATTGAGAATTAC+TGG 0.293097 6:+111167341 None:intergenic
CAAATTTAAATATTTAAGTT+TGG 0.295972 6:+111167814 None:intergenic
ACATGTTGAAGCCATAGTTT+TGG 0.298512 6:-111168679 MsG0680035716.01.T01:CDS
GAGATGAATGATTCTTGTTC+TGG 0.310433 6:+111167077 None:intergenic
GACATTCAAATTGTTATTCC+AGG 0.316045 6:-111167563 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTTGATGGTGTTCGTGCTAT+TGG 0.319941 6:-111169760 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTGATATTGTCATGCCAAAT+AGG 0.332354 6:+111167476 None:intergenic
GAGCATATATTGAAAGAGTA+TGG 0.333378 6:-111169388 MsG0680035716.01.T01:CDS
CACTAAATTGATGAGATATC+TGG 0.349497 6:+111169683 None:intergenic
GATGACACTAATCTTCAAAA+AGG 0.350875 6:-111170517 MsG0680035716.01.T01:CDS
AATTTAACCACTCAAGATTT+GGG 0.354214 6:+111168227 None:intergenic
CCACATTATCAAGAATTAGA+AGG 0.359589 6:+111169494 None:intergenic
TGATCCATTCTTAAACGCTT+TGG 0.359769 6:+111168048 None:intergenic
TTTGGAACATTGCAAGTTGT+TGG 0.364378 6:-111167795 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGTGGATTTCATGCTGATAT+TGG 0.365713 6:-111168995 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCTGAATAAGCTAGTGGATA+TGG 0.365782 6:+111170695 None:intergenic
ACATCCATGACACCATTATC+AGG 0.367795 6:+111169133 None:intergenic
GAAGCAACATTAAAGAACTA+TGG 0.371045 6:-111168452 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATTTGTTTGAAAGACTCAAT+AGG 0.382561 6:+111168562 None:intergenic
AGCATACCCAACAGCATATT+CGG 0.383464 6:-111168109 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCTTACATCATCTATAAAAC+AGG 0.385169 6:+111169657 None:intergenic
AAACGGGTGGGGAGTATCTC+TGG 0.387635 6:-111170214 MsG0680035716.01.T01:CDS
GATTAAAATGCATTCTTTGT+TGG 0.393104 6:-111168921 MsG0680035716.01.T01:CDS
ACAAAATAACGTGTGAGATT+CGG 0.395720 6:+111169327 None:intergenic
CCGCTAGCAATTAAAGTATT+GGG 0.397872 6:-111169220 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGTGTTTCAAAAGATTTAGT+TGG 0.405057 6:-111169832 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCGTTGGGATGAAAATTTGA+TGG 0.413470 6:+111168498 None:intergenic
TAATATTAATTTCAACATGT+TGG 0.415610 6:-111167711 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTTCTTAGAAGTCCAATTGT+TGG 0.418036 6:+111168172 None:intergenic
ACCGCTAGCAATTAAAGTAT+TGG 0.419575 6:-111169221 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATCAATTCTACAAGTTCGTT+GGG 0.427518 6:+111168483 None:intergenic
AAAATCCGGTTTGGGTATAG+AGG 0.427554 6:-111167237 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTTGTGGAATGGGCGGAATA+GGG 0.430379 6:-111169735 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTGGAGTTGGATCCAACAAT+TGG 0.438549 6:-111168184 MsG0680035716.01.T01:CDS
ACAAATTAAGATATGTTGAC+TGG 0.441298 6:-111168545 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTGTTTCAAAAGATTTAGTT+GGG 0.443329 6:-111169831 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTCTGATTGTTGATCCAACT+TGG 0.443481 6:+111167530 None:intergenic
TTGTGCAATCGAAGGATCTC+AGG 0.444485 6:-111170470 MsG0680035716.01.T01:CDS
AATTTGAATGTCTTTAAAGT+AGG 0.444751 6:+111167574 None:intergenic
GATCAATTCTACAAGTTCGT+TGG 0.447538 6:+111168482 None:intergenic
AACAAATATGTGTGTCTTGT+GGG 0.447593 6:+111167992 None:intergenic
GATGAATCATGAAAATTCCT+TGG 0.447908 6:-111167153 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTTGATGCCCTTGAAACAAA+AGG 0.451002 6:-111170556 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTATAGAGGTGAAGAGTTGC+GGG 0.452377 6:-111167223 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTTGAGTGGTTAAATTTGAA+AGG 0.454865 6:-111168220 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCTTGTTCTGGTTGCAGTTG+TGG 0.459959 6:+111167089 None:intergenic
TTGAGAGAAAGTCCTGATAA+TGG 0.460461 6:-111169145 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTTCGTGCTATTGGAATTTG+TGG 0.460600 6:-111169751 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAATTCATCAATCTCCTCTC+GGG 0.460962 6:+111167277 None:intergenic
CTATGCCGACAGTTTGAAGT+AGG 0.461240 6:+111169587 None:intergenic
GATGTGTTTGTCACCTTTAG+CGG 0.464469 6:-111170613 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGTCTTTAAAGTAGGATTGT+GGG 0.466108 6:+111167582 None:intergenic
TCAACATGTTGGAAATTGAC+TGG 0.470779 6:-111167700 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGAAGAGTTGCGGGTACAGT+TGG 0.473191 6:-111167214 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCGAGTATCTTCACCGCTAA+AGG 0.474853 6:+111170600 None:intergenic
GGAAATTGACTGGATTAGAT+TGG 0.475177 6:-111167690 MsG0680035716.01.T01:CDS
GAGATACTAGATTATGCTAA+AGG 0.480503 6:-111169247 MsG0680035716.01.T01:CDS
TAAATTCATCAATCTCCTCT+CGG 0.484433 6:+111167276 None:intergenic
ATGTCTTTAAAGTAGGATTG+TGG 0.486769 6:+111167581 None:intergenic
GGTGGGGAGTATCTCTGGTT+GGG 0.486999 6:-111170209 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGTAACGATTGCATATTTGA+TGG 0.489676 6:+111169560 None:intergenic
AAGAATCGTTGGAATATCTC+AGG 0.490113 6:-111168588 MsG0680035716.01.T01:CDS
TAAGCATTACTAATCATTCA+GGG 0.490593 6:-111168943 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAATAGCTGTGCATCGTGAA+TGG 0.491713 6:-111169450 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTTCACCTCTATACCCAAAC+CGG 0.493103 6:+111167232 None:intergenic
CGACCAAATCAAGTCACCTA+TGG 0.497344 6:-111167313 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGCTATTGGAATTTGTGGAA+TGG 0.498234 6:-111169746 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCTATTGGAATTTGTGGAAT+GGG 0.499278 6:-111169745 MsG0680035716.01.T01:CDS
TAAGTTTGGAAAGCTTCCTC+AGG 0.499853 6:+111167828 None:intergenic
GAGGGAAGCTCTAAAACGGG+TGG 0.502224 6:-111170227 MsG0680035716.01.T01:CDS
GGTGGAGGGAAGCTCTAAAA+CGG 0.503643 6:-111170231 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATGTAGAACACTTGTGGAGT+TGG 0.507120 6:-111168197 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGCTCATCCTCAAGAATCGT+TGG 0.508184 6:-111168599 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTCAGATGGTGTCAAGGTGG+AGG 0.508376 6:-111170246 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAGATATGTGAATGCATTGA+GGG 0.510057 6:-111170385 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATTCAATTGAATTAGGAACT+TGG 0.510316 6:+111167909 None:intergenic
TGTTCCAAAGCGTTTAAGAA+TGG 0.513090 6:-111168052 MsG0680035716.01.T01:CDS
GACAATATCAATGATACCAT+TGG 0.515738 6:-111167464 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAAATTTATAGATTATATGA+TGG 0.518505 6:-111169634 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGTGGATCAAGTTGAACAGT+TGG 0.520421 6:-111169476 MsG0680035716.01.T01:CDS
ACGTAGGTTACGTCATGAAA+AGG 0.524663 6:-111169518 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTAAGACCGAATATGCTGTT+GGG 0.525878 6:+111168103 None:intergenic
ACAACTCTACAATGTTAAGA+TGG 0.527476 6:-111168822 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCGATTGCACAAAGAAGCTC+AGG 0.528132 6:+111170481 None:intergenic
CTCATCTCCTTCCCGCATAG+TGG 0.532020 6:+111167745 None:intergenic
GAAGAGTTGCGGGTACAGTT+GGG 0.534520 6:-111167213 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTAAGATATGTTGACTGGGA+TGG 0.536169 6:-111168540 MsG0680035716.01.T01:CDS
GGTATAGAGGTGAAGAGTTG+CGG 0.539307 6:-111167224 MsG0680035716.01.T01:CDS
GAGCTTCTTTGTGCAATCGA+AGG 0.542385 6:-111170478 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG 0.543077 6:-111170335 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTGTCCAAAATTGGGTGAGA+GGG 0.544465 6:-111167657 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAAATTTGATGGCAAATACA+TGG 0.546267 6:+111168509 None:intergenic
GGCCATATAAAGTCATAGCA+AGG 0.546635 6:+111169704 None:intergenic
GAAGATATGTGAATGCATTG+AGG 0.548292 6:-111170386 MsG0680035716.01.T01:CDS
CATCGTGAATGGTTAGGAGC+GGG 0.550562 6:-111169439 MsG0680035716.01.T01:CDS
CCTTCTAATTCTTGATAATG+TGG 0.551075 6:-111169494 MsG0680035716.01.T01:CDS
CATTCTTTGTTGGAAGAGCT+AGG 0.552300 6:-111168911 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTGGTCGTAATGTGACTGAA+TGG 0.553787 6:-111169186 MsG0680035716.01.T01:CDS
CAAATTAAGATATGTTGACT+GGG 0.557322 6:-111168544 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCCTTCTCCTACCACTATGC+GGG 0.558112 6:-111167756 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTGGAGGGAAGCTCTAAAAC+GGG 0.559429 6:-111170230 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCTAAGACCGAATATGCTGT+TGG 0.560659 6:+111168102 None:intergenic
TGTGGGAGCTGAAAACCATA+AGG 0.561147 6:+111168009 None:intergenic
CACATTATCAAGAATTAGAA+GGG 0.566678 6:+111169495 None:intergenic
GTATGCAAAGCAGATCCATA+TGG 0.567532 6:+111167393 None:intergenic
GCTGTGCATCGTGAATGGTT+AGG 0.567552 6:-111169445 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTAGAAAGCTTAAATTTAGG+GGG 0.567900 6:-111167875 MsG0680035716.01.T01:CDS
CAGGAAGTGAAATACCAAGT+TGG 0.572057 6:-111167544 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTGGATCAACAATCAGAGCA+TGG 0.572665 6:-111167525 MsG0680035716.01.T01:CDS
GATCTGCTTTGCATACCTCA+TGG 0.575172 6:-111167386 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAACAAATATGTGTGTCTTG+TGG 0.575853 6:+111167991 None:intergenic
GAAAGGATGTAGAACACTTG+TGG 0.576195 6:-111168203 MsG0680035716.01.T01:CDS
CTTGAATATCTAAATATGCA+TGG 0.583238 6:-111168076 MsG0680035716.01.T01:CDS
TATCCACTAGCTTATTCAGA+TGG 0.583451 6:-111170692 MsG0680035716.01.T01:exon
TTGGAAAGCTTCCTCAGGCT+AGG 0.585608 6:+111167833 None:intergenic
GGAGCTGAAAACCATAAGGA+TGG 0.586193 6:+111168013 None:intergenic
CAAGAATCATTCATCTCACA+AGG 0.588514 6:-111167071 MsG0680035716.01.T01:CDS
GAGAGTTCCCAAATCTTGAG+TGG 0.589274 6:-111168234 MsG0680035716.01.T01:CDS
ACTGTCCAAAATTGGGTGAG+AGG 0.591797 6:-111167658 MsG0680035716.01.T01:CDS
AGATATTCCAACGATTCTTG+AGG 0.592867 6:+111168592 None:intergenic
TAGCCATCTGAATAAGCTAG+TGG 0.597248 6:+111170689 None:intergenic
TTTGATGGCAAATACATGGA+AGG 0.598028 6:+111168513 None:intergenic
TCAGATGGTGTCAAGGTGGA+GGG 0.599147 6:-111170245 MsG0680035716.01.T01:CDS
AAGTCCTGATAATGGTGTCA+TGG 0.600017 6:-111169137 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGGATCAACAATCAGAGCAT+GGG 0.600572 6:-111167524 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCTAGAAAGCTTAAATTTAG+GGG 0.602194 6:-111167876 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCTCCTTCCCGCATAGTGGT+AGG 0.603715 6:+111167749 None:intergenic
AGGGAAGCTCTAAAACGGGT+GGG 0.605535 6:-111170226 MsG0680035716.01.T01:CDS
TAGCATATCACCTCAACGTG+GGG 0.605986 6:-111167420 MsG0680035716.01.T01:CDS
CCCAATACTTTAATTGCTAG+CGG 0.606016 6:+111169220 None:intergenic
TCCCGCATAGTGGTAGGAGA+AGG 0.606444 6:+111167755 None:intergenic
AATTCATCAATCTCCTCTCG+GGG 0.613467 6:+111167278 None:intergenic
GATTCGGCCTGATTCAAAAG+TGG 0.616572 6:+111169343 None:intergenic
GGGTGGGGAGTATCTCTGGT+TGG 0.616699 6:-111170210 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTCTTGCAAGCACCACGTTG+AGG 0.617444 6:+111170414 None:intergenic
AACTTGTAGAATTGATCTTG+AGG 0.617631 6:-111168476 MsG0680035716.01.T01:CDS
GAGGGAGTGTTGCTATAGCA+TGG 0.620027 6:-111167639 MsG0680035716.01.T01:CDS
TGATAACATACCTCTGCTTG+CGG 0.621442 6:+111167009 None:intergenic
CAAACAATCTAAGCTATGCA+AGG 0.621639 6:+111167964 None:intergenic
TGCACAACATACAAAGCCAA+TGG 0.627282 6:+111167448 None:intergenic
TTCCTTCTCCTACCACTATG+CGG 0.631357 6:-111167757 MsG0680035716.01.T01:CDS
CAAATCCTACTTCAAACTGT+CGG 0.632548 6:-111169592 MsG0680035716.01.T01:CDS
GGGAAGCTCTAAAACGGGTG+GGG 0.635993 6:-111170225 MsG0680035716.01.T01:CDS
TATATTGAAAGAGTATGGAG+TGG 0.639698 6:-111169383 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCCATATAAAGTCATAGCAA+GGG 0.642452 6:+111169705 None:intergenic
AAGACACTCAGATGGTGTCA+AGG 0.642858 6:-111170252 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCTGAGGTTCGAAAACAAAG+TGG 0.644305 6:-111170319 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTGTGACGCTACCTAGCCTG+AGG 0.644776 6:-111167844 MsG0680035716.01.T01:CDS
CAATTGATTTGATACGACGT+AGG 0.652087 6:-111169534 MsG0680035716.01.T01:CDS
GACTGAATGGAAGAGTGCAT+TGG 0.655978 6:-111169173 MsG0680035716.01.T01:CDS
GGGAAGGAGATGAGTTCGAA+TGG 0.656789 6:-111167736 MsG0680035716.01.T01:CDS
TCTCCTACCACTATGCGGGA+AGG 0.656885 6:-111167752 MsG0680035716.01.T01:CDS
GTGGTAGGAGAAGGAAGTTG+AGG 0.657925 6:+111167764 None:intergenic
TTAGCATATCACCTCAACGT+GGG 0.661429 6:-111167421 MsG0680035716.01.T01:CDS
GCATCGTGAATGGTTAGGAG+CGG 0.665888 6:-111169440 MsG0680035716.01.T01:CDS
ACACTCAGATGGTGTCAAGG+TGG 0.674710 6:-111170249 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATTGCAACAAGACACTCAGA+TGG 0.677267 6:-111170260 MsG0680035716.01.T01:CDS
AGCATATCACCTCAACGTGG+GGG 0.679631 6:-111167419 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATTGGAATTTGTGGAATGGG+CGG 0.686885 6:-111169742 MsG0680035716.01.T01:CDS
ATTCATCAATCTCCTCTCGG+GGG 0.706638 6:+111167279 None:intergenic
AGAACTATGCTTCCTCAACG+TGG 0.707608 6:-111170426 MsG0680035716.01.T01:CDS
TTTAGCATATCACCTCAACG+TGG 0.745799 6:-111167422 MsG0680035716.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATTTATAGATTATATGA+TGG - Chr6:111168130-111168149 MsG0680035716.01.T01:CDS 10.0%
!! CAAACTTAAATATTTAAATT+TGG - Chr6:111169951-111169970 MsG0680035716.01.T01:intron 10.0%
!! TGATAAATATTAATAATAAG+AGG + Chr6:111169361-111169380 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTTATTGTACAAAATATA+AGG - Chr6:111167618-111167637 MsG0680035716.01.T01:CDS 10.0%
!!! CAAATTTAAATATTTAAGTT+TGG + Chr6:111169953-111169972 None:intergenic 10.0%
!! TAATATTAATTTCAACATGT+TGG - Chr6:111170053-111170072 MsG0680035716.01.T01:intron 15.0%
!! TATGAGTAATTATCAAAATT+TGG - Chr6:111168489-111168508 MsG0680035716.01.T01:CDS 15.0%
!! TCAAACAATAATGAATATAT+TGG - Chr6:111167895-111167914 MsG0680035716.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAAATCAGTTTTAAAAAATC+CGG - Chr6:111170513-111170532 MsG0680035716.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTTAGAATGTTTTTAACA+TGG + Chr6:111168747-111168766 None:intergenic 15.0%
!! AAAAACATTCTAAATTGTTG+TGG - Chr6:111168751-111168770 MsG0680035716.01.T01:intron 20.0%
!! AGGCAAAAAAAATATTAACA+TGG + Chr6:111167757-111167776 None:intergenic 20.0%
!! CATAAACATTCAATTGAATT+AGG + Chr6:111169865-111169884 None:intergenic 20.0%
!! TAATAGAAAAATCTCCTATT+TGG - Chr6:111170274-111170293 MsG0680035716.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTTGAATGTCTTTAAAGT+AGG + Chr6:111170193-111170212 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTTAACTGTCCAAAATT+GGG - Chr6:111170099-111170118 MsG0680035716.01.T01:intron 20.0%
!!! CTAGAAAAGATAATAGATTT+TGG - Chr6:111169508-111169527 MsG0680035716.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTGCAATTAAGTTTTGAT+GGG - Chr6:111168653-111168672 MsG0680035716.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTATTTTTTGCAATGCTTT+AGG - Chr6:111169058-111169077 MsG0680035716.01.T01:CDS 20.0%
! AAATTTAACCACTCAAGATT+TGG + Chr6:111169541-111169560 None:intergenic 25.0%
! AATTTAACCACTCAAGATTT+GGG + Chr6:111169540-111169559 None:intergenic 25.0%
! ACAAATTAAGATATGTTGAC+TGG - Chr6:111169219-111169238 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAGCATTACTAATCATTC+AGG - Chr6:111168820-111168839 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! ATGGATGAAACAATTCATTA+TGG - Chr6:111170155-111170174 MsG0680035716.01.T01:intron 25.0%
! ATGTTAACTTCAATTCTTGT+AGG + Chr6:111170590-111170609 None:intergenic 25.0%
! ATTCAATTGAATTAGGAACT+TGG + Chr6:111169858-111169877 None:intergenic 25.0%
! ATTTGTTTGAAAGACTCAAT+AGG + Chr6:111169205-111169224 None:intergenic 25.0%
! CACATTATCAAGAATTAGAA+GGG + Chr6:111168272-111168291 None:intergenic 25.0%
! CTTGAATATCTAAATATGCA+TGG - Chr6:111169688-111169707 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! GATTAAAATGCATTCTTTGT+TGG - Chr6:111168843-111168862 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! GGATCAACATCATAAAAAAT+AGG + Chr6:111167424-111167443 None:intergenic 25.0%
! GTGTTTCAAAAGATTTAGTT+GGG - Chr6:111167933-111167952 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! TAAGCATTACTAATCATTCA+GGG - Chr6:111168821-111168840 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! TGTACAAAATATAAGGTGAA+GGG - Chr6:111167625-111167644 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! TGTGTTTCAAAAGATTTAGT+TGG - Chr6:111167932-111167951 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTACAAAATATAAGGTGA+AGG - Chr6:111167624-111167643 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAATTTGATGGCAAATACA+TGG + Chr6:111169258-111169277 None:intergenic 25.0%
!! AGATCCAATTTTCTCAAATT+GGG + Chr6:111169472-111169491 None:intergenic 25.0%
!! CAAATTAAGATATGTTGACT+GGG - Chr6:111169220-111169239 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!! GAACAACTTTTTGAATTTTC+AGG - Chr6:111167843-111167862 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGATCCAATTTTCTCAAAT+TGG + Chr6:111169473-111169492 None:intergenic 25.0%
!!! AAAAATGCCTTTTGTTTCAA+GGG + Chr6:111167218-111167237 None:intergenic 25.0%
!!! AAAAGGCATTTTTGTATTTC+GGG - Chr6:111167225-111167244 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAATCATTTGCTTTTGAACT+CGG - Chr6:111167982-111168001 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACATTGTAGAGTTGTTTTT+CGG + Chr6:111168938-111168957 None:intergenic 25.0%
!!! AATAACAACTCTGTTTTTGT+TGG - Chr6:111169425-111169444 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATAGGAAGAACATGTTTTT+TGG + Chr6:111167407-111167426 None:intergenic 25.0%
!!! AGTTTTAAAAAATCCGGTTT+GGG - Chr6:111170519-111170538 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAAGGCATTTTTGTATTT+CGG - Chr6:111167224-111167243 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATTTTTAACTGTCCAAAAT+TGG - Chr6:111170098-111170117 MsG0680035716.01.T01:intron 25.0%
!!! GATATTGCTTGTTTTTTCAA+CGG - Chr6:111168706-111168725 MsG0680035716.01.T01:intron 25.0%
!!! GGAGTTCAAACTATTTTTTT+GGG - Chr6:111167792-111167811 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTATTGCAATTAAGTTTTGA+TGG - Chr6:111168652-111168671 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGGAGTTCAAACTATTTTTT+TGG - Chr6:111167791-111167810 MsG0680035716.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTATTTCTCCAGATTG+TGG + Chr6:111167869-111167888 None:intergenic 25.0%
AAACAAATATGTGTGTCTTG+TGG + Chr6:111169776-111169795 None:intergenic 30.0%
AACAAATATGTGTGTCTTGT+GGG + Chr6:111169775-111169794 None:intergenic 30.0%
AACTTGTAGAATTGATCTTG+AGG - Chr6:111169288-111169307 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
AAGATATGTGAATGCATTGA+GGG - Chr6:111167379-111167398 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAATAACGTGTGAGATT+CGG + Chr6:111168440-111168459 None:intergenic 30.0%
ACAACTCTACAATGTTAAGA+TGG - Chr6:111168942-111168961 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
ACTCCAAATCTTTGTTCTAA+AGG + Chr6:111167777-111167796 None:intergenic 30.0%
AGAACTATGGAAAAACAAGA+AGG - Chr6:111169325-111169344 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
AGATCTTCATTGAGAATTAC+TGG + Chr6:111170426-111170445 None:intergenic 30.0%
ATCAATTCTACAAGTTCGTT+GGG + Chr6:111169284-111169303 None:intergenic 30.0%
CAATGTTAAGATGGAGAAAA+TGG - Chr6:111168951-111168970 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
CACTAAATTGATGAGATATC+TGG + Chr6:111168084-111168103 None:intergenic 30.0%
CCACATTATCAAGAATTAGA+AGG + Chr6:111168273-111168292 None:intergenic 30.0%
CGCTAGAAAGCTTAAATTTA+GGG - Chr6:111169887-111169906 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
CTAGAAAGCTTAAATTTAGG+GGG - Chr6:111169889-111169908 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
CTTATTTGTTTCCATCCTTA+TGG - Chr6:111169740-111169759 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
CTTCAAAAAGGTGAATTCAT+AGG - Chr6:111167259-111167278 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
CTTGAGTGGTTAAATTTGAA+AGG - Chr6:111169544-111169563 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GAAGCAACATTAAAGAACTA+TGG - Chr6:111169312-111169331 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GACAATATCAATGATACCAT+TGG - Chr6:111170300-111170319 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GAGATACTAGATTATGCTAA+AGG - Chr6:111168517-111168536 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GAGCATATATTGAAAGAGTA+TGG - Chr6:111168376-111168395 MsG0680035716.01.T01:intron 30.0%
GATGAATCATGAAAATTCCT+TGG - Chr6:111170611-111170630 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GATGACACTAATCTTCAAAA+AGG - Chr6:111167247-111167266 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GCTAGAAAGCTTAAATTTAG+GGG - Chr6:111169888-111169907 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
GCTTACATCATCTATAAAAC+AGG + Chr6:111168110-111168129 None:intergenic 30.0%
TAAATTCATCAATCTCCTCT+CGG + Chr6:111170491-111170510 None:intergenic 30.0%
TCGCTAGAAAGCTTAAATTT+AGG - Chr6:111169886-111169905 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
TGTAACGATTGCATATTTGA+TGG + Chr6:111168207-111168226 None:intergenic 30.0%
TTGATATTGTCATGCCAAAT+AGG + Chr6:111170291-111170310 None:intergenic 30.0%
TTTCTTAGAAGTCCAATTGT+TGG + Chr6:111169595-111169614 None:intergenic 30.0%
! ACGTTCTTTTTCCAAAACTA+TGG + Chr6:111169099-111169118 None:intergenic 30.0%
! GACATTCAAATTGTTATTCC+AGG - Chr6:111170201-111170220 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
! TATATTGAAAGAGTATGGAG+TGG - Chr6:111168381-111168400 MsG0680035716.01.T01:intron 30.0%
!! ATGTCTTTAAAGTAGGATTG+TGG + Chr6:111170186-111170205 None:intergenic 30.0%
!! ATTTTCTGGAAATAACCATG+AGG + Chr6:111170396-111170415 None:intergenic 30.0%
!! CAAAAATGCCTTTTGTTTCA+AGG + Chr6:111167219-111167238 None:intergenic 30.0%
!! CCTTCTAATTCTTGATAATG+TGG - Chr6:111168270-111168289 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
!! TGCTATTTGAATTTTTGCTC+TGG + Chr6:111167664-111167683 None:intergenic 30.0%
!! TGTCTTTAAAGTAGGATTGT+GGG + Chr6:111170185-111170204 None:intergenic 30.0%
!! TTGCCTTTAGAACAAAGATT+TGG - Chr6:111167771-111167790 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAGTTTTAAAAAATCCGGTT+TGG - Chr6:111170518-111170537 MsG0680035716.01.T01:CDS 30.0%
!!! GAAAACAGAGATTGTTTTTG+CGG + Chr6:111170733-111170752 None:intergenic 30.0%
AAATTCATCAATCTCCTCTC+GGG + Chr6:111170490-111170509 None:intergenic 35.0%
AAGAATCGTTGGAATATCTC+AGG - Chr6:111169176-111169195 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
ACCGCTAGCAATTAAAGTAT+TGG - Chr6:111168543-111168562 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
AGATATTCCAACGATTCTTG+AGG + Chr6:111169175-111169194 None:intergenic 35.0%
CAAACAATCTAAGCTATGCA+AGG + Chr6:111169803-111169822 None:intergenic 35.0%
CAAATCCTACTTCAAACTGT+CGG - Chr6:111168172-111168191 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAATCATTCATCTCACA+AGG - Chr6:111170693-111170712 MsG0680035716.01.T01:exon 35.0%
CAAGCATAGAGCAAAAAAAG+TGG - Chr6:111168899-111168918 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
CCCAATACTTTAATTGCTAG+CGG + Chr6:111168547-111168566 None:intergenic 35.0%
GAAGATATGTGAATGCATTG+AGG - Chr6:111167378-111167397 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
GAGATGAATGATTCTTGTTC+TGG + Chr6:111170690-111170709 None:intergenic 35.0%
GATCAATTCTACAAGTTCGT+TGG + Chr6:111169285-111169304 None:intergenic 35.0%
GCCATATAAAGTCATAGCAA+GGG + Chr6:111168062-111168081 None:intergenic 35.0%
GCTATTGGAATTTGTGGAAT+GGG - Chr6:111168019-111168038 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
TATCCATAGGTGACTTGATT+TGG + Chr6:111170457-111170476 None:intergenic 35.0%
TCAACATGTTGGAAATTGAC+TGG - Chr6:111170064-111170083 MsG0680035716.01.T01:intron 35.0%
TCGTTGGGATGAAAATTTGA+TGG + Chr6:111169269-111169288 None:intergenic 35.0%
TCTGCCCAATTTGAGAAAAT+TGG - Chr6:111169465-111169484 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
TGATCCATTCTTAAACGCTT+TGG + Chr6:111169719-111169738 None:intergenic 35.0%
TGCTATTGGAATTTGTGGAA+TGG - Chr6:111168018-111168037 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
TGTGGATTTCATGCTGATAT+TGG - Chr6:111168769-111168788 MsG0680035716.01.T01:intron 35.0%
TTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG - Chr6:111167429-111167448 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGAGAAAGTCCTGATAA+TGG - Chr6:111168619-111168638 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGCCCTTGAAACAAA+AGG - Chr6:111167208-111167227 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! ACATGTTGAAGCCATAGTTT+TGG - Chr6:111169085-111169104 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! ACCCTTGCTATGACTTTATA+TGG - Chr6:111168058-111168077 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! CCGCTAGCAATTAAAGTATT+GGG - Chr6:111168544-111168563 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! GCTCTATGCTTGAATTTTCT+TGG + Chr6:111168891-111168910 None:intergenic 35.0%
! GGAAATTGACTGGATTAGAT+TGG - Chr6:111170074-111170093 MsG0680035716.01.T01:intron 35.0%
! TATCCACTAGCTTATTCAGA+TGG - Chr6:111167072-111167091 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! TCTGAATAAGCTAGTGGATA+TGG + Chr6:111167072-111167091 None:intergenic 35.0%
! TGTTCCAAAGCGTTTAAGAA+TGG - Chr6:111169712-111169731 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! TTAAGATATGTTGACTGGGA+TGG - Chr6:111169224-111169243 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
! TTACTGGAACGAACATTTTC+TGG + Chr6:111170410-111170429 None:intergenic 35.0%
! TTTGATGGCAAATACATGGA+AGG + Chr6:111169254-111169273 None:intergenic 35.0%
! TTTGGAACATTGCAAGTTGT+TGG - Chr6:111169969-111169988 MsG0680035716.01.T01:intron 35.0%
!! CAAAGTTCCACTTTTGAATC+AGG - Chr6:111168414-111168433 MsG0680035716.01.T01:intron 35.0%
!! CAATTGATTTGATACGACGT+AGG - Chr6:111168230-111168249 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGTCTTGTTAGTGTCTTTA+AGG + Chr6:111167709-111167728 None:intergenic 35.0%
!! GTATTGGGCTCATTTTTGTT+TGG - Chr6:111168559-111168578 MsG0680035716.01.T01:CDS 35.0%
AAATAGCTGTGCATCGTGAA+TGG - Chr6:111168314-111168333 MsG0680035716.01.T01:intron 40.0%
AATTCATCAATCTCCTCTCG+GGG + Chr6:111170489-111170508 None:intergenic 40.0%
ACATCCATGACACCATTATC+AGG + Chr6:111168634-111168653 None:intergenic 40.0%
ACGTAGGTTACGTCATGAAA+AGG - Chr6:111168246-111168265 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
AGAGCAAAAAAAGTGGAGCA+GGG - Chr6:111168906-111168925 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
AGCATACCCAACAGCATATT+CGG - Chr6:111169655-111169674 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
ATGTAGAACACTTGTGGAGT+TGG - Chr6:111169567-111169586 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCAACAAGACACTCAGA+TGG - Chr6:111167504-111167523 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGAATTTGTGGAATGGG+CGG - Chr6:111168022-111168041 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
CAACTTGGTATTTCACTTCC+TGG + Chr6:111170222-111170241 None:intergenic 40.0%
CAGGAAGTGAAATACCAAGT+TGG - Chr6:111170220-111170239 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
CATTCTTTGTTGGAAGAGCT+AGG - Chr6:111168853-111168872 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
CTAAGACCGAATATGCTGTT+GGG + Chr6:111169664-111169683 None:intergenic 40.0%
CTCTGATTGTTGATCCAACT+TGG + Chr6:111170237-111170256 None:intergenic 40.0%
GAAAGGATGTAGAACACTTG+TGG - Chr6:111169561-111169580 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
GATGTGTTTGTCACCTTTAG+CGG - Chr6:111167151-111167170 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
GCGTTTGACTATGAGGATTT+AGG + Chr6:111167735-111167754 None:intergenic 40.0%
GGAAAAAGAACGTGAAGAGT+TGG - Chr6:111169106-111169125 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
GGCCATATAAAGTCATAGCA+AGG + Chr6:111168063-111168082 None:intergenic 40.0%
GGGGGAAGTAAATTATCCAT+AGG + Chr6:111170470-111170489 None:intergenic 40.0%
GTATGCAAAGCAGATCCATA+TGG + Chr6:111170374-111170393 None:intergenic 40.0%
TAACATGGCGTTTGACTATG+AGG + Chr6:111167742-111167761 None:intergenic 40.0%
TAAGTTTGGAAAGCTTCCTC+AGG + Chr6:111169939-111169958 None:intergenic 40.0%
TAGAGCAAAAAAAGTGGAGC+AGG - Chr6:111168905-111168924 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
TAGCCATCTGAATAAGCTAG+TGG + Chr6:111167078-111167097 None:intergenic 40.0%
TGCACAACATACAAAGCCAA+TGG + Chr6:111170319-111170338 None:intergenic 40.0%
TGGATCAACAATCAGAGCAT+GGG - Chr6:111170240-111170259 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
TTAGCATATCACCTCAACGT+GGG - Chr6:111170343-111170362 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
TTGGATCAACAATCAGAGCA+TGG - Chr6:111170239-111170258 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCGTAATGTGACTGAA+TGG - Chr6:111168578-111168597 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGCATATCACCTCAACG+TGG - Chr6:111170342-111170361 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
! AATTTTGCACTTCTGAGCCA+AGG + Chr6:111170631-111170650 None:intergenic 40.0%
! GCTATAGCATGGCATTTTCA+TGG - Chr6:111170136-111170155 MsG0680035716.01.T01:intron 40.0%
! GTTCGTGCTATTGGAATTTG+TGG - Chr6:111168013-111168032 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
! TCTGAGGTTCGAAAACAAAG+TGG - Chr6:111167445-111167464 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAATCCGGTTTGGGTATAG+AGG - Chr6:111170527-111170546 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGTCCTGATAATGGTGTCA+TGG - Chr6:111168627-111168646 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTGCTTTTGTGCATCGAG+GGG + Chr6:111168157-111168176 None:intergenic 40.0%
!! GATTTGCTTTTGTGCATCGA+GGG + Chr6:111168158-111168177 None:intergenic 40.0%
!! GGCTCAGAAGTGCAAAATTT+TGG - Chr6:111170632-111170651 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAATTTTCAGGCCACAATC+TGG - Chr6:111167854-111167873 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTGGATCAAGTTGAACAGT+TGG - Chr6:111168288-111168307 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGCTTTTGAACTCGGTTGA+TGG - Chr6:111167989-111168008 MsG0680035716.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTTTGTTTTCGAACCTCAGA+AGG + Chr6:111167445-111167464 None:intergenic 40.0%
AAAAAAAGTGGAGCAGGGTG+TGG - Chr6:111168911-111168930 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
ACTGTCCAAAATTGGGTGAG+AGG - Chr6:111170106-111170125 MsG0680035716.01.T01:intron 45.0%
AGAACTATGCTTCCTCAACG+TGG - Chr6:111167338-111167357 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
ATTCATCAATCTCCTCTCGG+GGG + Chr6:111170488-111170507 None:intergenic 45.0%
ATTTGTGGAATGGGCGGAAT+AGG - Chr6:111168028-111168047 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
CGACCAAATCAAGTCACCTA+TGG - Chr6:111170451-111170470 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCCAAAATTGGGTGAGA+GGG - Chr6:111170107-111170126 MsG0680035716.01.T01:intron 45.0%
CTTCACCTCTATACCCAAAC+CGG + Chr6:111170535-111170554 None:intergenic 45.0%
GAGAGTTCCCAAATCTTGAG+TGG - Chr6:111169530-111169549 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
GAGCTTCTTTGTGCAATCGA+AGG - Chr6:111167286-111167305 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
GATAATTTACTTCCCCCGAG+AGG - Chr6:111170473-111170492 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
GATCTGCTTTGCATACCTCA+TGG - Chr6:111170378-111170397 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
GATTCGGCCTGATTCAAAAG+TGG + Chr6:111168424-111168443 None:intergenic 45.0%
GCTAAGACCGAATATGCTGT+TGG + Chr6:111169665-111169684 None:intergenic 45.0%
GGAGCTGAAAACCATAAGGA+TGG + Chr6:111169754-111169773 None:intergenic 45.0%
GGTATAGAGGTGAAGAGTTG+CGG - Chr6:111170540-111170559 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
GTATAGAGGTGAAGAGTTGC+GGG - Chr6:111170541-111170560 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
GTGGAGTTGGATCCAACAAT+TGG - Chr6:111169580-111169599 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
TAGCATATCACCTCAACGTG+GGG - Chr6:111170344-111170363 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
TCGATTGCACAAAGAAGCTC+AGG + Chr6:111167286-111167305 None:intergenic 45.0%
TGCTCATCCTCAAGAATCGT+TGG - Chr6:111169165-111169184 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
TGTGGGAGCTGAAAACCATA+AGG + Chr6:111169758-111169777 None:intergenic 45.0%
TTCCTTCTCCTACCACTATG+CGG - Chr6:111170007-111170026 MsG0680035716.01.T01:intron 45.0%
TTGTGCAATCGAAGGATCTC+AGG - Chr6:111167294-111167313 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
TTTGTGGAATGGGCGGAATA+GGG - Chr6:111168029-111168048 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
! AAGACACTCAGATGGTGTCA+AGG - Chr6:111167512-111167531 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
! CTATGCCGACAGTTTGAAGT+AGG + Chr6:111168180-111168199 None:intergenic 45.0%
! GACTGAATGGAAGAGTGCAT+TGG - Chr6:111168591-111168610 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
! TCTTGTTCTGGTTGCAGTTG+TGG + Chr6:111170678-111170697 None:intergenic 45.0%
!! GGATTTGCTTTTGTGCATCG+AGG + Chr6:111168159-111168178 None:intergenic 45.0%
!! GTTGATGGTGTTCGTGCTAT+TGG - Chr6:111168004-111168023 MsG0680035716.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTATAGTTTAAATAAAAA+TGG + Chr6:111169015-111169034 None:intergenic 5.0%
AGCATATCACCTCAACGTGG+GGG - Chr6:111170345-111170364 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
CATCGTGAATGGTTAGGAGC+GGG - Chr6:111168325-111168344 MsG0680035716.01.T01:intron 50.0%
GAAGAGTTGCGGGTACAGTT+GGG - Chr6:111170551-111170570 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
GCATCGTGAATGGTTAGGAG+CGG - Chr6:111168324-111168343 MsG0680035716.01.T01:intron 50.0%
GCGAGTATCTTCACCGCTAA+AGG + Chr6:111167167-111167186 None:intergenic 50.0%
GCTGTGCATCGTGAATGGTT+AGG - Chr6:111168319-111168338 MsG0680035716.01.T01:intron 50.0%
GGGAAGGAGATGAGTTCGAA+TGG - Chr6:111170028-111170047 MsG0680035716.01.T01:intron 50.0%
GTGGTAGGAGAAGGAAGTTG+AGG + Chr6:111170003-111170022 None:intergenic 50.0%
TCCTTCTCCTACCACTATGC+GGG - Chr6:111170008-111170027 MsG0680035716.01.T01:intron 50.0%
TGAAGAGTTGCGGGTACAGT+TGG - Chr6:111170550-111170569 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
TTCTTGCAAGCACCACGTTG+AGG + Chr6:111167353-111167372 None:intergenic 50.0%
TTGGAAAGCTTCCTCAGGCT+AGG + Chr6:111169934-111169953 None:intergenic 50.0%
! ACACTCAGATGGTGTCAAGG+TGG - Chr6:111167515-111167534 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
! CACTCCCTCTCACCCAATTT+TGG + Chr6:111170114-111170133 None:intergenic 50.0%
! TCAGATGGTGTCAAGGTGGA+GGG - Chr6:111167519-111167538 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGGAAGCTCTAAAACGGGT+GGG - Chr6:111167538-111167557 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGGGAGTGTTGCTATAGCA+TGG - Chr6:111170125-111170144 MsG0680035716.01.T01:intron 50.0%
!! GGTGGAGGGAAGCTCTAAAA+CGG - Chr6:111167533-111167552 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
!! GTGGAGGGAAGCTCTAAAAC+GGG - Chr6:111167534-111167553 MsG0680035716.01.T01:CDS 50.0%
ATATCACCTCAACGTGGGGG+CGG - Chr6:111170348-111170367 MsG0680035716.01.T01:CDS 55.0%
CTCATCTCCTTCCCGCATAG+TGG + Chr6:111170022-111170041 None:intergenic 55.0%
TCCCGCATAGTGGTAGGAGA+AGG + Chr6:111170012-111170031 None:intergenic 55.0%
TCTCCTACCACTATGCGGGA+AGG - Chr6:111170012-111170031 MsG0680035716.01.T01:intron 55.0%
TCTCCTTCCCGCATAGTGGT+AGG + Chr6:111170018-111170037 None:intergenic 55.0%
TTGTGACGCTACCTAGCCTG+AGG - Chr6:111169920-111169939 MsG0680035716.01.T01:intron 55.0%
! CTCAGATGGTGTCAAGGTGG+AGG - Chr6:111167518-111167537 MsG0680035716.01.T01:CDS 55.0%
!! AAACGGGTGGGGAGTATCTC+TGG - Chr6:111167550-111167569 MsG0680035716.01.T01:CDS 55.0%
!! GAGGGAAGCTCTAAAACGGG+TGG - Chr6:111167537-111167556 MsG0680035716.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGAAGCTCTAAAACGGGTG+GGG - Chr6:111167539-111167558 MsG0680035716.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTGGGGAGTATCTCTGGTT+GGG - Chr6:111167555-111167574 MsG0680035716.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGTGGGGAGTATCTCTGGT+TGG - Chr6:111167554-111167573 MsG0680035716.01.T01:CDS 60.0%
ATATGGCCGCCCCCACGTTG+AGG + Chr6:111170357-111170376 None:intergenic 65.0%
TCAACGTGGGGGCGGCCATA+TGG - Chr6:111170356-111170375 MsG0680035716.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 111167022 111170764 111167022 ID=MsG0680035716.01;Name=MsG0680035716.01
Chr6 mRNA 111167022 111170764 111167022 ID=MsG0680035716.01.T01;Parent=MsG0680035716.01;Name=MsG0680035716.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.50;_QI=69|0.33|0.25|1|1|0.75|4|0|1059
Chr6 exon 111167022 111168323 111167022 ID=MsG0680035716.01.T01:exon:14908;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 exon 111168440 111168706 111168440 ID=MsG0680035716.01.T01:exon:14907;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 exon 111168814 111169921 111168814 ID=MsG0680035716.01.T01:exon:14906;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 exon 111170196 111170764 111170196 ID=MsG0680035716.01.T01:exon:14905;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 five_prime_UTR 111170696 111170764 111170696 ID=MsG0680035716.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 CDS 111170196 111170695 111170196 ID=MsG0680035716.01.T01:cds;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 CDS 111168814 111169921 111168814 ID=MsG0680035716.01.T01:cds;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 CDS 111168440 111168706 111168440 ID=MsG0680035716.01.T01:cds;Parent=MsG0680035716.01.T01
Chr6 CDS 111167022 111168323 111167022 ID=MsG0680035716.01.T01:cds;Parent=MsG0680035716.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035716.01.T01

ATGGCTAACAGCAGCAATTCTTCTTTAGCTCTTGTGACTTCTTCAAAGAAAAATAATTATGATGTGTTTGTCACCTTTAGCGGTGAAGATACTCGCAACAATTTCACTGATTTTCTTTTTGATGCCCTTGAAACAAAAGGCATTTTTGTATTTCGGGATGACACTAATCTTCAAAAAGGTGAATTCATAGGACCTGAGCTTCTTTGTGCAATCGAAGGATCTCAGGTTTTCGTCGCTATCTTCTCAAAGAACTATGCTTCCTCAACGTGGTGCTTGCAAGAATTAGAGAAGATATGTGAATGCATTGAGGGATCCAAAAAACATGTTCTTCCTATTTTTTATGATGTTGATCCTTCTGAGGTTCGAAAACAAAGTGGAAATTATTGTGAAGCGTTTGTCAAACATGCACAAAGATTGCAACAAGACACTCAGATGGTGTCAAGGTGGAGGGAAGCTCTAAAACGGGTGGGGAGTATCTCTGGTTGGGATCTACGTGATAAGCCACAATCTGGAGAAATAAAAAAGATTGTTCAAACAATAATGAATATATTGGAGTGCAAATCTTCATGTGTTTCAAAAGATTTAGTTGGGATTGATTCTTCTATTAAAGCATTACAAAATCATTTGCTTTTGAACTCGGTTGATGGTGTTCGTGCTATTGGAATTTGTGGAATGGGCGGAATAGGGAAGACAACCCTTGCTATGACTTTATATGGCCAGATATCTCATCAATTTAGTGCATCCTGTTTTATAGATGATGTAAGCAAAATTTATAGATTATATGATGGTCCCCTCGATGCACAAAAGCAAATCCTACTTCAAACTGTCGGCATAGAACACCATCAAATATGCAATCGTTACAGTGCAATTGATTTGATACGACGTAGGTTACGTCATGAAAAGGCCCTTCTAATTCTTGATAATGTGGATCAAGTTGAACAGTTGGAAAAAATAGCTGTGCATCGTGAATGGTTAGGAGCGGGTAGTAGAATCGTTATCATTTCTAGAGATGAGCATATATTGAAAGAGTATGGAGTGGATGTAGTTTACAAAGTTCCACTTTTGAATCAGGCCGAATCTCACACGTTATTTTGTCGAAAAGCTTTCAAAGTTGAGAAAATTATTATGAGTAATTATCAAAATTTGGCAAATGAGATACTAGATTATGCTAAAGGTCTACCGCTAGCAATTAAAGTATTGGGCTCATTTTTGTTTGGTCGTAATGTGACTGAATGGAAGAGTGCATTGGCTAGATTGAGAGAAAGTCCTGATAATGGTGTCATGGATGTATTGCAATTAAGTTTTGATGGGCTAAAGCAAACAGAAAAAGATATATTTCTTGATATTGCTTGTTTTTTCAACGGCAAACTTCAGAAATTCCATGTTAAAAACATTCTAAATTGTTGTGGATTTCATGCTGATATTGGATTAAGAATTCTCACTGATAAATCACTTATAAGCATTACTAATCATTCAGGGATTAAAATGCATTCTTTGTTGGAAGAGCTAGGCAGAAAAATTGTCCAAGAAAATTCAAGCATAGAGCAAAAAAAGTGGAGCAGGGTGTGGTCCGAAAAACAACTCTACAATGTTAAGATGGAGAAAATGGAAAAACATGTTGAAGCCATAGTTTTGGAAAAAGAACGTGAAGAGTTGGACGTTGAACACATTTCAAAAATGAGTAATCTTAGATTGCTCATCCTCAAGAATCGTTGGAATATCTCAGGAAGCCTATTGAGTCTTTCAAACAAATTAAGATATGTTGACTGGGATGGATATCCTTCCATGTATTTGCCATCAAATTTTCATCCCAACGAACTTGTAGAATTGATCTTGAGGAGAAGCAACATTAAAGAACTATGGAAAAACAAGAAGCATCTGCCCAATTTGAGAAAATTGGATCTAAGTGACTCTTGTGAGCTAGAAAAGATAATAGATTTTGGAGAGTTCCCAAATCTTGAGTGGTTAAATTTGAAAGGATGTAGAACACTTGTGGAGTTGGATCCAACAATTGGACTTCTAAGAAAGCTAGTTTACTTGAATTTAAACTATTGCTATAATCTAGTAAGCATACCCAACAGCATATTCGGTCTTAGCTCTCTTGAATATCTAAATATGCATGGCTGTTCCAAAGCGTTTAAGAATGGATCAACTTATTTGTTTCCATCCTTATGGTTTTCAGCTCCCACAAGACACACATATTTGTTTCGATCCTTGCATAGCTTAGATTGTTTGCGTAGAGTTGACATTAGCTTTTGCAATCTAAGCCAAGTTCCTAATTCAATTGAATGTTTATGCTCGCTAGAAAGCTTAAATTTAGGGGGAAACAATTTTGTGACGCTACCTAGCCTGAGGAAGCTTTCCAAACTTAAATATTTAAATTTGGAACATTGCAAGTTGTTGGAATCTTTGCCTCAACTTCCTTCTCCTACCACTATGCGGGAAGGAGATGAGTTCGAATGGTATAATATTAATTTCAACATGTTGGAAATTGACTGGATTAGATTGGTCATTTTTAACTGTCCAAAATTGGGTGAGAGGGAGTGTTGCTATAGCATGGCATTTTCATGGATGAAACAATTCATTATGGCAAACCCACAATCCTACTTTAAAGACATTCAAATTGTTATTCCAGGAAGTGAAATACCAAGTTGGATCAACAATCAGAGCATGGGTGATTCAATACTAATAGAAAAATCTCCTATTTGGCATGACAATATCAATGATACCATTGGCTTTGTATGTTGTGCAGTATTTAGCATATCACCTCAACGTGGGGGCGGCCATATGGATCTGCTTTGCATACCTCATGGTTATTTCCAGAAAATGTTCGTTCCAGTAATTCTCAATGAAGATCTTGTTACGACCAAATCAAGTCACCTATGGATAATTTACTTCCCCCGAGAGGAGATTGATGAATTTAGAAAAATCAGTTTTAAAAAATCCGGTTTGGGTATAGAGGTGAAGAGTTGCGGGTACAGTTGGGTATGTAAACAAGACCTACAAGAATTGAAGTTAACATTGATGAATCATGAAAATTCCTTGGCTCAGAAGTGCAAAATTTTGGCAATTGAAGATGAGACACAACCACAACTGCAACCAGAACAAGAATCATTCATCTCACAAGGCATAGCTACTTCAACCGCAAAAACAATCTCTGTTTTCAACCGCAAGCAG
Protein sequence

>MsG0680035716.01.T01

MANSSNSSLALVTSSKKNNYDVFVTFSGEDTRNNFTDFLFDALETKGIFVFRDDTNLQKGEFIGPELLCAIEGSQVFVAIFSKNYASSTWCLQELEKICECIEGSKKHVLPIFYDVDPSEVRKQSGNYCEAFVKHAQRLQQDTQMVSRWREALKRVGSISGWDLRDKPQSGEIKKIVQTIMNILECKSSCVSKDLVGIDSSIKALQNHLLLNSVDGVRAIGICGMGGIGKTTLAMTLYGQISHQFSASCFIDDVSKIYRLYDGPLDAQKQILLQTVGIEHHQICNRYSAIDLIRRRLRHEKALLILDNVDQVEQLEKIAVHREWLGAGSRIVIISRDEHILKEYGVDVVYKVPLLNQAESHTLFCRKAFKVEKIIMSNYQNLANEILDYAKGLPLAIKVLGSFLFGRNVTEWKSALARLRESPDNGVMDVLQLSFDGLKQTEKDIFLDIACFFNGKLQKFHVKNILNCCGFHADIGLRILTDKSLISITNHSGIKMHSLLEELGRKIVQENSSIEQKKWSRVWSEKQLYNVKMEKMEKHVEAIVLEKEREELDVEHISKMSNLRLLILKNRWNISGSLLSLSNKLRYVDWDGYPSMYLPSNFHPNELVELILRRSNIKELWKNKKHLPNLRKLDLSDSCELEKIIDFGEFPNLEWLNLKGCRTLVELDPTIGLLRKLVYLNLNYCYNLVSIPNSIFGLSSLEYLNMHGCSKAFKNGSTYLFPSLWFSAPTRHTYLFRSLHSLDCLRRVDISFCNLSQVPNSIECLCSLESLNLGGNNFVTLPSLRKLSKLKYLNLEHCKLLESLPQLPSPTTMREGDEFEWYNINFNMLEIDWIRLVIFNCPKLGERECCYSMAFSWMKQFIMANPQSYFKDIQIVIPGSEIPSWINNQSMGDSILIEKSPIWHDNINDTIGFVCCAVFSISPQRGGGHMDLLCIPHGYFQKMFVPVILNEDLVTTKSSHLWIIYFPREEIDEFRKISFKKSGLGIEVKSCGYSWVCKQDLQELKLTLMNHENSLAQKCKILAIEDETQPQLQPEQESFISQGIATSTAKTISVFNRKQ