AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038113.01


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MsG0780038113.01.T01 AT4G15280 30.992 484 292 17 4 460 34 502 2.00e-58 201
MsG0780038113.01.T01 AT1G05675 30.738 488 275 13 1 462 1 451 6.27e-58 198
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MsG0780038113.01.T01 AT2G15480 29.273 509 291 18 3 465 7 492 1.47e-52 184
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MsG0780038113.01.T01 AT2G31750 30.042 476 260 16 17 461 19 452 5.47e-47 169
MsG0780038113.01.T01 AT3G53160 36.000 275 143 6 207 460 217 479 1.04e-46 169
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MsG0780038113.01.T01 AT5G12890 30.364 494 287 20 2 458 3 476 2.12e-43 159
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MsG0780038113.01.T01 AT4G15490 29.870 385 228 12 97 460 100 463 2.45e-43 159
MsG0780038113.01.T01 AT4G34135 26.797 459 275 14 4 425 9 443 3.66e-43 159
MsG0780038113.01.T01 AT4G34138 37.358 265 127 9 207 452 223 467 3.74e-43 159
MsG0780038113.01.T01 AT5G59590 28.782 476 293 18 1 460 1 446 3.90e-43 158
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MsG0780038113.01.T01 AT5G05890 33.333 261 147 6 207 460 209 449 6.08e-35 135
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MsG0780038113.01.T01 AT5G37950 31.673 281 168 8 103 378 77 338 4.24e-28 114
MsG0780038113.01.T01 AT3G22250 32.365 241 118 10 229 443 240 461 1.17e-26 112
MsG0780038113.01.T01 AT1G64910 25.219 456 285 12 1 439 1 417 1.38e-26 112
MsG0780038113.01.T01 AT4G27570 31.739 230 142 3 206 433 201 417 8.45e-25 107
MsG0780038113.01.T01 AT4G27560 24.091 440 297 13 4 433 5 417 1.16e-23 103
MsG0780038113.01.T01 AT5G53990 28.016 257 165 5 190 439 174 417 1.35e-22 100
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MsG0780038113.01.T01 AT5G54060 25.532 470 294 16 7 452 14 451 4.31e-22 99.0
MsG0780038113.01.T01 AT1G64920 24.026 462 291 16 1 441 1 423 8.04e-21 95.1
MsG0780038113.01.T01 AT2G22930 21.860 430 304 8 1 426 1 402 5.46e-20 92.4
MsG0780038113.01.T01 AT3G29630 23.904 456 294 17 1 439 1 420 5.57e-20 92.4
MsG0780038113.01.T01 AT4G09500 23.503 451 297 14 1 439 1 415 1.87e-19 90.9
MsG0780038113.01.T01 AT3G29630 30.851 188 115 4 255 439 219 394 1.71e-18 87.8
MsG0780038113.01.T01 AT4G09500 29.775 178 113 2 262 439 225 390 4.82e-18 86.7
MsG0780038113.01.T01 AT4G34135 23.952 334 213 12 3 305 8 331 2.23e-13 71.6

Find 88 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 121 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATGAGATTGGTAAGGTAGTT+AGG 0.229876 7:+40510771 MsG0780038113.01.T01:CDS
GGAACTTGGTCAACGTTTAT+AGG 0.230057 7:-40509738 None:intergenic
GACACAAACAAAACTGATTT+AGG 0.252177 7:-40510317 None:intergenic
TTTCGATTTCGATCGAATAT+TGG 0.265486 7:+40510083 MsG0780038113.01.T01:CDS
AGATCCAACTGAACCTATTA+AGG 0.300727 7:+40510016 MsG0780038113.01.T01:CDS
AATTGAAGAAGGTGCTATAA+AGG 0.307381 7:+40510178 MsG0780038113.01.T01:CDS
CAAGTGAATGAGTTAGCTTA+TGG 0.311139 7:+40510371 MsG0780038113.01.T01:CDS
ACACAGCCAGGAACCTTAAT+AGG 0.338363 7:-40510029 None:intergenic
TGAGTGGTAAGAAATTTCTT+TGG 0.340550 7:+40510402 MsG0780038113.01.T01:CDS
AGGATTAGTTGTACCTTGTT+GGG 0.346515 7:+40510538 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATCCCTTGTTCAGCAAATAA+TGG 0.351012 7:-40510671 None:intergenic
TAAGGTAGTTAGGGAATTGA+TGG 0.353077 7:+40510781 MsG0780038113.01.T01:CDS
TAATGATGCTATTAATGAAA+TGG 0.355426 7:+40510859 MsG0780038113.01.T01:CDS
TGTCAGAAGTGGTTGCTATC+TGG 0.361176 7:+40510900 MsG0780038113.01.T01:CDS
AATAATGGCCATGCAATTAC+AGG 0.367881 7:-40510656 None:intergenic
GCTAATGCTACTTACTTTGT+TGG 0.377517 7:+40510449 MsG0780038113.01.T01:CDS
TGTTCAAGTACTTGAATTTG+TGG 0.385453 7:-40510563 None:intergenic
AAGGATTAGTTGTACCTTGT+TGG 0.406258 7:+40510537 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATTGAAGAAGGTGCTATAAA+GGG 0.406981 7:+40510179 MsG0780038113.01.T01:CDS
GTACTTGAAAGTGTTGTCTA+TGG 0.410784 7:+40510629 MsG0780038113.01.T01:CDS
CAAGGCGTTTGGAGAATTCA+AGG 0.413161 7:-40509596 None:intergenic
ACTGAACCTATTAAGGTTCC+TGG 0.414633 7:+40510023 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATGGAGATTAACAAGGCGTT+TGG 0.415933 7:-40509607 None:intergenic
TGAGATTGGTAAGGTAGTTA+GGG 0.419369 7:+40510772 MsG0780038113.01.T01:CDS
GTACTTGAACATAGTTCAAC+TGG 0.427079 7:+40510575 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATGAGGTAAAATGTTTAACT+TGG 0.434683 7:+40510279 MsG0780038113.01.T01:CDS
AACCCACCCTCATTAGCATT+TGG 0.435647 7:-40510737 None:intergenic
ACATGCATCATCCCTTCAAT+TGG 0.437004 7:+40509645 MsG0780038113.01.T01:CDS
AAGTGAATGAGTTAGCTTAT+GGG 0.440175 7:+40510372 MsG0780038113.01.T01:CDS
AGAATTCAAGGATTGGTACT+AGG 0.451629 7:-40509584 None:intergenic
ATAATTCAAAAGGTGTCAAT+TGG 0.455764 7:+40510248 MsG0780038113.01.T01:CDS
GGAAGATCCTTAAGATGAAA+AGG 0.459468 7:-40510053 None:intergenic
AACTTTGGATCTAGAACATA+AGG 0.468717 7:-40509838 None:intergenic
AGCAACTACAGCAACAACTT+TGG 0.470745 7:-40509853 None:intergenic
TGGCCATTATTTGCTGAACA+AGG 0.471010 7:+40510668 MsG0780038113.01.T01:CDS
AATGATGCTATTAATGAAAT+GGG 0.471815 7:+40510860 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATATCTTCCACAAGCTGCTA+TGG 0.492833 7:+40509935 MsG0780038113.01.T01:CDS
TGGTGGAAGTGTTTGAAGGT+AGG 0.503826 7:-40509691 None:intergenic
ATAGTAGTTGTTCCAAGTGC+AGG 0.510415 7:+40509552 MsG0780038113.01.T01:CDS
GATCGAAATCGAAAAGGAAG+AGG 0.517451 7:-40510074 None:intergenic
TGAAATGGGATCATCTACTA+AGG 0.518805 7:+40510874 MsG0780038113.01.T01:CDS
TGAAAGAGATGAGATTGGTA+AGG 0.519485 7:+40510763 MsG0780038113.01.T01:CDS
GAATTGATGGATGGTGAAGA+AGG 0.520361 7:+40510794 MsG0780038113.01.T01:CDS
TGTTGGTGAAAATGAAATTG+AGG 0.521040 7:+40510466 MsG0780038113.01.T01:CDS
CGTTTGGAGAATTCAAGGAT+TGG 0.521163 7:-40509591 None:intergenic
AGAAGAGAAGAAGAAGCCTA+TGG 0.528287 7:+40510208 MsG0780038113.01.T01:CDS
TGTGGGGCCCATAATTCAAA+AGG 0.531178 7:+40510238 MsG0780038113.01.T01:CDS
AATGCTACTTTGTTGTGTGA+TGG 0.531978 7:+40510695 MsG0780038113.01.T01:CDS
TTGGTTGAAAGAGATGAGAT+TGG 0.532276 7:+40510758 MsG0780038113.01.T01:CDS
AGATGAAAAGGTACACAGCC+AGG 0.533718 7:-40510041 None:intergenic
AAGCCTATGGTTTATCCTGT+GGG 0.536704 7:+40510221 MsG0780038113.01.T01:CDS
GGAACCTTAATAGGTTCAGT+TGG 0.537941 7:-40510020 None:intergenic
TGGTTGGTGGAAGTGTTTGA+AGG 0.540960 7:-40509695 None:intergenic
GAAGTGGTTGCTATCTGGAA+TGG 0.542265 7:+40510905 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATGCATGTGATGTGAAATTG+TGG 0.544513 7:-40509630 None:intergenic
GATGGTGGTGAACCAATTGA+AGG 0.545998 7:-40509657 None:intergenic
AAAATTGATGAAATGGTTGG+TGG 0.548679 7:-40509708 None:intergenic
GGATTAGTTGTACCTTGTTG+GGG 0.558425 7:+40510539 MsG0780038113.01.T01:CDS
AGACCAAATGCTAATGAGGG+TGG 0.565830 7:+40510734 MsG0780038113.01.T01:CDS
GTTGTGTGATGGTGTGAAAG+TGG 0.566398 7:+40510706 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATTCAAGGATTGGTACTAGG+TGG 0.567124 7:-40509581 None:intergenic
TACTAAGGCATTGTCAGAAG+TGG 0.569849 7:+40510889 MsG0780038113.01.T01:CDS
TTTGAGACCAAATGCTAATG+AGG 0.569993 7:+40510730 MsG0780038113.01.T01:CDS
GTCAATTGGTGATGAAAATG+AGG 0.571647 7:+40510262 MsG0780038113.01.T01:CDS
GCTTATGGGTTAGAATTGAG+TGG 0.582251 7:+40510386 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATATTCGATCGAAATCGAAA+AGG 0.584774 7:-40510080 None:intergenic
GAAAGAACCATAGCAGCTTG+TGG 0.585526 7:-40509942 None:intergenic
GAAGCCTATGGTTTATCCTG+TGG 0.586758 7:+40510220 MsG0780038113.01.T01:CDS
GTAGTTAGGGAATTGATGGA+TGG 0.600292 7:+40510785 MsG0780038113.01.T01:CDS
TTGGAGAGAACAAAGGAACA+AGG 0.601399 7:+40510518 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATGGTGTGCCTGTAATTGCA+TGG 0.601498 7:+40510648 MsG0780038113.01.T01:CDS
TTCAAGGATTGGTACTAGGT+GGG 0.601990 7:-40509580 None:intergenic
GGCCATTATTTGCTGAACAA+GGG 0.604204 7:+40510669 MsG0780038113.01.T01:CDS
AAATGCTAATGAGGGTGGGT+TGG 0.614888 7:+40510739 MsG0780038113.01.T01:CDS
TTGAACATAGTTCAACTGGT+GGG 0.618223 7:+40510579 MsG0780038113.01.T01:CDS
ACTTGGTCAACGTTTATAGG+TGG 0.618564 7:-40509735 None:intergenic
AGGTGGGTGAATCCTGCACT+TGG 0.618616 7:-40509564 None:intergenic
TGAATTTGTGGACCCCAACA+AGG 0.627170 7:-40510551 None:intergenic
CTTGAACATAGTTCAACTGG+TGG 0.631647 7:+40510578 MsG0780038113.01.T01:CDS
TTGAGACCAAATGCTAATGA+GGG 0.632377 7:+40510731 MsG0780038113.01.T01:CDS
GTAGCATTAGCAACACCACT+TGG 0.633480 7:-40510437 None:intergenic
CTTGGAACAACTACTATGTG+TGG 0.642004 7:-40509546 None:intergenic
GGCCCCACAGGATAAACCAT+AGG 0.667276 7:-40510224 None:intergenic
ATGTGATGTGAAATTGTGGA+TGG 0.670360 7:-40509626 None:intergenic
AGCCTATGGTTTATCCTGTG+GGG 0.680196 7:+40510222 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATGGTGGTGAACCAATTGAA+GGG 0.680736 7:-40509656 None:intergenic
GACCAAATGCTAATGAGGGT+GGG 0.691266 7:+40510735 MsG0780038113.01.T01:CDS
ATTGTGGATGGAGATTAACA+AGG 0.752023 7:-40509614 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAAAATATCATCTTTTTGAT+GGG + Chr7:40510132-40510151 MsG0780038113.01.T01:CDS 15.0%
!! AATGATGCTATTAATGAAAT+GGG + Chr7:40510860-40510879 MsG0780038113.01.T01:CDS 20.0%
!! TAATGATGCTATTAATGAAA+TGG + Chr7:40510859-40510878 MsG0780038113.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAATATCATCTTTTTGATG+GGG + Chr7:40510133-40510152 MsG0780038113.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAAAAATATCATCTTTTTGA+TGG + Chr7:40510131-40510150 MsG0780038113.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCTAGTTCTTGTTTTATATA+AGG - Chr7:40509816-40509835 None:intergenic 20.0%
!!! TTCTTGTTTTATATAAGGTA+AGG - Chr7:40509811-40509830 None:intergenic 20.0%
! AGAAAAATTGATGAAATGGT+TGG - Chr7:40509714-40509733 None:intergenic 25.0%
! ATGAGGTAAAATGTTTAACT+TGG + Chr7:40510279-40510298 MsG0780038113.01.T01:CDS 25.0%
! TGGAAGAAAAATTGATGAAA+TGG - Chr7:40509718-40509737 None:intergenic 25.0%
!! AATTGACACCTTTTGAATTA+TGG - Chr7:40510249-40510268 None:intergenic 25.0%
!! AGTTTTCTTGAAATTGAAGA+AGG + Chr7:40510167-40510186 MsG0780038113.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTGACACCTTTTGAATTAT+GGG - Chr7:40510248-40510267 None:intergenic 25.0%
!!! ATAATTCAAAAGGTGTCAAT+TGG + Chr7:40510248-40510267 MsG0780038113.01.T01:CDS 25.0%
AAAATTGATGAAATGGTTGG+TGG - Chr7:40509711-40509730 None:intergenic 30.0%
ATATTCGATCGAAATCGAAA+AGG - Chr7:40510083-40510102 None:intergenic 30.0%
CACTTGGTAAAAATCTCAAA+GGG - Chr7:40510493-40510512 None:intergenic 30.0%
TGAGTGGTAAGAAATTTCTT+TGG + Chr7:40510402-40510421 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
TGTTCAAGTACTTGAATTTG+TGG - Chr7:40510566-40510585 None:intergenic 30.0%
TTTCGATTTCGATCGAATAT+TGG + Chr7:40510083-40510102 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
! AACTTTGGATCTAGAACATA+AGG - Chr7:40509841-40509860 None:intergenic 30.0%
! AAGTGAATGAGTTAGCTTAT+GGG + Chr7:40510372-40510391 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
! GACACAAACAAAACTGATTT+AGG - Chr7:40510320-40510339 None:intergenic 30.0%
! GTTTTACTGAGAGTGAAATT+TGG - Chr7:40509785-40509804 None:intergenic 30.0%
! TGTTGGTGAAAATGAAATTG+AGG + Chr7:40510466-40510485 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTGAAGAAGGTGCTATAA+AGG + Chr7:40510178-40510197 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGAAGAAGGTGCTATAAA+GGG + Chr7:40510179-40510198 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTTACCAAGTGGGTTTT+TGG + Chr7:40510499-40510518 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!! TGATGTTTTGGATATAGCTA+AGG + Chr7:40509890-40509909 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTTTTGCACATGATGTTT+TGG + Chr7:40509878-40509897 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTTGAGATTTTTACCAAGT+GGG + Chr7:40510492-40510511 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCAGTTTTGTTTGTGTCTTT+TGG + Chr7:40510323-40510342 MsG0780038113.01.T01:CDS 30.0%
AATAATGGCCATGCAATTAC+AGG - Chr7:40510659-40510678 None:intergenic 35.0%
AGATCCAACTGAACCTATTA+AGG + Chr7:40510016-40510035 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
ATCCCTTGTTCAGCAAATAA+TGG - Chr7:40510674-40510693 None:intergenic 35.0%
ATGAGATTGGTAAGGTAGTT+AGG + Chr7:40510771-40510790 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
ATGCATGTGATGTGAAATTG+TGG - Chr7:40509633-40509652 None:intergenic 35.0%
ATGTGATGTGAAATTGTGGA+TGG - Chr7:40509629-40509648 None:intergenic 35.0%
ATTGTGGATGGAGATTAACA+AGG - Chr7:40509617-40509636 None:intergenic 35.0%
CCACTTGGTAAAAATCTCAA+AGG - Chr7:40510494-40510513 None:intergenic 35.0%
GGAAGATCCTTAAGATGAAA+AGG - Chr7:40510056-40510075 None:intergenic 35.0%
GTACTTGAACATAGTTCAAC+TGG + Chr7:40510575-40510594 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TAAGGTAGTTAGGGAATTGA+TGG + Chr7:40510781-40510800 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TGAAAGAGATGAGATTGGTA+AGG + Chr7:40510763-40510782 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TGAAATGGGATCATCTACTA+AGG + Chr7:40510874-40510893 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TGAGATTGGTAAGGTAGTTA+GGG + Chr7:40510772-40510791 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TTGAACATAGTTCAACTGGT+GGG + Chr7:40510579-40510598 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGACCAAATGCTAATGA+GGG + Chr7:40510731-40510750 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTTGAAAGAGATGAGAT+TGG + Chr7:40510758-40510777 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
! AGAATTCAAGGATTGGTACT+AGG - Chr7:40509587-40509606 None:intergenic 35.0%
! CAAGTGAATGAGTTAGCTTA+TGG + Chr7:40510371-40510390 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
! CTGTGTACCTTTTCATCTTA+AGG + Chr7:40510046-40510065 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
! GCTAATGCTACTTACTTTGT+TGG + Chr7:40510449-40510468 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTTGAAGGTAGGATTTTG+AGG - Chr7:40509685-40509704 None:intergenic 35.0%
! TTTGAGACCAAATGCTAATG+AGG + Chr7:40510730-40510749 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGGATTAGTTGTACCTTGT+TGG + Chr7:40510537-40510556 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!! AATGCTACTTTGTTGTGTGA+TGG + Chr7:40510695-40510714 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTGCAAGAATTTTAGCATC+TGG - Chr7:40509762-40509781 None:intergenic 35.0%
!! AGGATTAGTTGTACCTTGTT+GGG + Chr7:40510538-40510557 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATTTTAGCATCTGGAACT+TGG - Chr7:40509755-40509774 None:intergenic 35.0%
!! GTACTTGAAAGTGTTGTCTA+TGG + Chr7:40510629-40510648 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCAATTGGTGATGAAAATG+AGG + Chr7:40510262-40510281 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGTTTGTGTCTTTTGGAAG+TGG + Chr7:40510329-40510348 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCTTTGAGATTTTTACCAAG+TGG + Chr7:40510491-40510510 MsG0780038113.01.T01:CDS 35.0%
AAGCCTATGGTTTATCCTGT+GGG + Chr7:40510221-40510240 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
ACATGCATCATCCCTTCAAT+TGG + Chr7:40509645-40509664 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
ACTGAACCTATTAAGGTTCC+TGG + Chr7:40510023-40510042 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGGTCAACGTTTATAGG+TGG - Chr7:40509738-40509757 None:intergenic 40.0%
AGAAGAGAAGAAGAAGCCTA+TGG + Chr7:40510208-40510227 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
AGCAACTACAGCAACAACTT+TGG - Chr7:40509856-40509875 None:intergenic 40.0%
ATAGTAGTTGTTCCAAGTGC+AGG + Chr7:40509552-40509571 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
ATATCTTCCACAAGCTGCTA+TGG + Chr7:40509935-40509954 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
CGTTTGGAGAATTCAAGGAT+TGG - Chr7:40509594-40509613 None:intergenic 40.0%
CTTGAACATAGTTCAACTGG+TGG + Chr7:40510578-40510597 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAACAACTACTATGTG+TGG - Chr7:40509549-40509568 None:intergenic 40.0%
GATCGAAATCGAAAAGGAAG+AGG - Chr7:40510077-40510096 None:intergenic 40.0%
GGAACCTTAATAGGTTCAGT+TGG - Chr7:40510023-40510042 None:intergenic 40.0%
GGAACTTGGTCAACGTTTAT+AGG - Chr7:40509741-40509760 None:intergenic 40.0%
GTAGTTAGGGAATTGATGGA+TGG + Chr7:40510785-40510804 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGAGAACAAAGGAACA+AGG + Chr7:40510518-40510537 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
! ATGGAGATTAACAAGGCGTT+TGG - Chr7:40509610-40509629 None:intergenic 40.0%
! ATGGTGGTGAACCAATTGAA+GGG - Chr7:40509659-40509678 None:intergenic 40.0%
! ATTCAAGGATTGGTACTAGG+TGG - Chr7:40509584-40509603 None:intergenic 40.0%
! GAATTGATGGATGGTGAAGA+AGG + Chr7:40510794-40510813 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
! GGCCATTATTTGCTGAACAA+GGG + Chr7:40510669-40510688 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
! TGGCCATTATTTGCTGAACA+AGG + Chr7:40510668-40510687 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
! TTCAAGGATTGGTACTAGGT+GGG - Chr7:40509583-40509602 None:intergenic 40.0%
!! AGGTAGGATTTTGAGGAAGA+TGG - Chr7:40509678-40509697 None:intergenic 40.0%
!! GCTTATGGGTTAGAATTGAG+TGG + Chr7:40510386-40510405 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATTAGTTGTACCTTGTTG+GGG + Chr7:40510539-40510558 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
!! TACTAAGGCATTGTCAGAAG+TGG + Chr7:40510889-40510908 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGGATTTTGAGGAAGATGG+TGG - Chr7:40509675-40509694 None:intergenic 40.0%
!! TGGGTTTTTGGAGAGAACAA+AGG + Chr7:40510511-40510530 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGTGTCTTTTGGAAGTGG+TGG + Chr7:40510332-40510351 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGGATTTTGAGATCACCAAG+TGG + Chr7:40510422-40510441 MsG0780038113.01.T01:CDS 40.0%
AAATGCTAATGAGGGTGGGT+TGG + Chr7:40510739-40510758 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
AACCCACCCTCATTAGCATT+TGG - Chr7:40510740-40510759 None:intergenic 45.0%
ACACAGCCAGGAACCTTAAT+AGG - Chr7:40510032-40510051 None:intergenic 45.0%
AGACCAAATGCTAATGAGGG+TGG + Chr7:40510734-40510753 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
AGCCTATGGTTTATCCTGTG+GGG + Chr7:40510222-40510241 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
ATGGTGTGCCTGTAATTGCA+TGG + Chr7:40510648-40510667 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGAACCATAGCAGCTTG+TGG - Chr7:40509945-40509964 None:intergenic 45.0%
GAAGCCTATGGTTTATCCTG+TGG + Chr7:40510220-40510239 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTGGTTGCTATCTGGAA+TGG + Chr7:40510905-40510924 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
GACCAAATGCTAATGAGGGT+GGG + Chr7:40510735-40510754 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
GTAGCATTAGCAACACCACT+TGG - Chr7:40510440-40510459 None:intergenic 45.0%
GTTCTCTCCAAAAACCCACT+TGG - Chr7:40510509-40510528 None:intergenic 45.0%
TGAATTTGTGGACCCCAACA+AGG - Chr7:40510554-40510573 None:intergenic 45.0%
TGTCAGAAGTGGTTGCTATC+TGG + Chr7:40510900-40510919 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
TGTGGGGCCCATAATTCAAA+AGG + Chr7:40510238-40510257 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
! AGATGAAAAGGTACACAGCC+AGG - Chr7:40510044-40510063 None:intergenic 45.0%
! CAAGGCGTTTGGAGAATTCA+AGG - Chr7:40509599-40509618 None:intergenic 45.0%
! GATGGTGGTGAACCAATTGA+AGG - Chr7:40509660-40509679 None:intergenic 45.0%
! GGTTTTTGTCTCACTGTGGT+TGG + Chr7:40510600-40510619 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGTGTGATGGTGTGAAAG+TGG + Chr7:40510706-40510725 MsG0780038113.01.T01:CDS 45.0%
! TTTTGAATTATGGGCCCCAC+AGG - Chr7:40510239-40510258 None:intergenic 45.0%
!! TGGTGGAAGTGTTTGAAGGT+AGG - Chr7:40509694-40509713 None:intergenic 45.0%
!! TGGTTGGTGGAAGTGTTTGA+AGG - Chr7:40509698-40509717 None:intergenic 45.0%
!! GGTGGGTTTTTGTCTCACTG+TGG + Chr7:40510596-40510615 MsG0780038113.01.T01:CDS 50.0%
AGGTGGGTGAATCCTGCACT+TGG - Chr7:40509567-40509586 None:intergenic 55.0%
GGCCCCACAGGATAAACCAT+AGG - Chr7:40510227-40510246 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 40509534 40510934 40509534 ID=MsG0780038113.01;Name=MsG0780038113.01
Chr7 mRNA 40509534 40510934 40509534 ID=MsG0780038113.01.T01;Parent=MsG0780038113.01;Name=MsG0780038113.01.T01;_AED=0.06;_eAED=0.06;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|466
Chr7 exon 40509534 40510934 40509534 ID=MsG0780038113.01.T01:exon:12737;Parent=MsG0780038113.01.T01
Chr7 CDS 40509534 40510934 40509534 ID=MsG0780038113.01.T01:cds;Parent=MsG0780038113.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038113.01.T01

ATGGAAGAAAAACCACACATAGTAGTTGTTCCAAGTGCAGGATTCACCCACCTAGTACCAATCCTTGAATTCTCCAAACGCCTTGTTAATCTCCATCCACAATTTCACATCACATGCATCATCCCTTCAATTGGTTCACCACCATCTTCCTCAAAATCCTACCTTCAAACACTTCCACCAACCATTTCATCAATTTTTCTTCCACCTATAAACGTTGACCAAGTTCCAGATGCTAAAATTCTTGCAGTCCAAATTTCACTCTCAGTAAAACACTCCTTACCTTATATAAAACAAGAACTAGAGTCCTTATGTTCTAGATCCAAAGTTGTTGCTGTAGTTGCTGATGTTTTTGCACATGATGTTTTGGATATAGCTAAGGAATTCAATCTCTTGTGTTATATATATCTTCCACAAGCTGCTATGGTTCTTTCTACTTACTTTTATTCATCAAAGTTAGATGATATTCTTTCTGATGTGTCTAGAGATCCAACTGAACCTATTAAGGTTCCTGGCTGTGTACCTTTTCATCTTAAGGATCTTCCTCTTCCTTTTCGATTTCGATCGAATATTGGTTACACAAAATTTCTTGAACGTGCAGAAAAATATCATCTTTTTGATGGGGTTTTTGTTAATAGTTTTCTTGAAATTGAAGAAGGTGCTATAAAGGGTTTGAAAGAAGAGAAGAAGAAGCCTATGGTTTATCCTGTGGGGCCCATAATTCAAAAGGTGTCAATTGGTGATGAAAATGAGGTAAAATGTTTAACTTGGTTAGAAAAACAAGAACCTAAATCAGTTTTGTTTGTGTCTTTTGGAAGTGGTGGAACACTTTCACAAGAGCAAGTGAATGAGTTAGCTTATGGGTTAGAATTGAGTGGTAAGAAATTTCTTTGGATTTTGAGATCACCAAGTGGTGTTGCTAATGCTACTTACTTTGTTGGTGAAAATGAAATTGAGGACCCTTTGAGATTTTTACCAAGTGGGTTTTTGGAGAGAACAAAGGAACAAGGATTAGTTGTACCTTGTTGGGGTCCACAAATTCAAGTACTTGAACATAGTTCAACTGGTGGGTTTTTGTCTCACTGTGGTTGGAATTCAGTACTTGAAAGTGTTGTCTATGGTGTGCCTGTAATTGCATGGCCATTATTTGCTGAACAAGGGATGAATGCTACTTTGTTGTGTGATGGTGTGAAAGTGGCTTTGAGACCAAATGCTAATGAGGGTGGGTTGGTTGAAAGAGATGAGATTGGTAAGGTAGTTAGGGAATTGATGGATGGTGAAGAAGGAGTTGAAATTCGTAAGAGAATTGAATATTTGAAAAATGCTGCTAATGATGCTATTAATGAAATGGGATCATCTACTAAGGCATTGTCAGAAGTGGTTGCTATCTGGAATGGAATTTAG

Protein sequence

>MsG0780038113.01.T01

MEEKPHIVVVPSAGFTHLVPILEFSKRLVNLHPQFHITCIIPSIGSPPSSSKSYLQTLPPTISSIFLPPINVDQVPDAKILAVQISLSVKHSLPYIKQELESLCSRSKVVAVVADVFAHDVLDIAKEFNLLCYIYLPQAAMVLSTYFYSSKLDDILSDVSRDPTEPIKVPGCVPFHLKDLPLPFRFRSNIGYTKFLERAEKYHLFDGVFVNSFLEIEEGAIKGLKEEKKKPMVYPVGPIIQKVSIGDENEVKCLTWLEKQEPKSVLFVSFGSGGTLSQEQVNELAYGLELSGKKFLWILRSPSGVANATYFVGENEIEDPLRFLPSGFLERTKEQGLVVPCWGPQIQVLEHSSTGGFLSHCGWNSVLESVVYGVPVIAWPLFAEQGMNATLLCDGVKVALRPNANEGGLVERDEIGKVVRELMDGEEGVEIRKRIEYLKNAANDAINEMGSSTKALSEVVAIWNGI*