AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003620.01

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MsG0180003620.01.T01 AT1G51820 35.324 586 323 14 3 563 324 878 2.60e-98 319
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MsG0180003620.01.T01 AT1G31420 32.743 565 301 13 32 535 31 577 3.50e-81 266
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MsG0180003620.01.T01 AT3G24540 40.909 352 182 7 193 535 126 460 5.95e-80 260
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MsG0180003620.01.T01 AT2G23450 41.595 351 191 7 187 532 280 621 5.73e-73 247
MsG0180003620.01.T01 AT1G23540 44.483 290 150 5 249 531 359 644 6.37e-73 248
MsG0180003620.01.T01 AT1G07870 42.157 306 171 5 228 528 70 374 6.79e-73 239
MsG0180003620.01.T01 AT3G46410 43.816 283 133 6 258 538 2 260 8.33e-73 235
MsG0180003620.01.T01 AT1G10620 45.051 293 144 6 249 531 358 643 1.01e-72 247
MsG0180003620.01.T01 AT3G24790 45.704 291 152 5 246 531 32 321 1.31e-72 237
MsG0180003620.01.T01 AT5G37450 41.284 327 168 7 223 542 601 910 1.45e-72 251
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MsG0180003620.01.T01 AT5G37450 41.284 327 168 7 223 542 577 886 1.56e-72 250
MsG0180003620.01.T01 AT5G62710 31.216 551 310 15 46 535 10 552 1.82e-72 243
MsG0180003620.01.T01 AT1G70460 45.051 293 144 7 249 531 341 626 2.13e-72 246
MsG0180003620.01.T01 AT5G37450 41.284 327 168 7 223 542 625 934 2.47e-72 250
MsG0180003620.01.T01 AT3G24790 45.704 291 152 5 246 531 50 339 2.60e-72 237
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MsG0180003620.01.T01 AT5G01950 44.516 310 150 6 249 545 614 914 1.64e-71 248
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MsG0180003620.01.T01 AT1G68690 35.101 396 207 9 173 532 269 650 6.93e-69 236
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MsG0180003620.01.T01 AT1G07570 42.617 298 155 6 249 532 56 351 1.37e-68 228
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MsG0180003620.01.T01 AT3G53590 38.718 390 212 9 162 542 530 901 9.82e-68 237
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MsG0180003620.01.T01 AT2G25220 39.936 313 179 6 229 538 122 428 1.26e-67 226
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MsG0180003620.01.T01 AT1G56720 39.731 297 172 3 240 532 158 451 2.65e-67 227
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MsG0180003620.01.T01 AT3G59350 41.156 294 163 5 248 532 115 407 1.29e-64 218
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MsG0180003620.01.T01 AT1G24030 37.500 344 188 12 208 532 5 340 1.67e-63 213
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MsG0180003620.01.T01 AT1G26150 38.994 318 157 6 193 476 330 644 1.96e-63 220
MsG0180003620.01.T01 AT1G53430 36.464 362 206 5 197 549 617 963 2.13e-63 226
MsG0180003620.01.T01 AT4G23240 38.487 304 183 3 235 535 2 304 2.17e-63 213
MsG0180003620.01.T01 AT1G06700 40.273 293 165 5 249 532 56 347 2.22e-63 213
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MsG0180003620.01.T01 AT4G22130 29.443 557 288 16 74 531 119 669 2.32e-63 221
MsG0180003620.01.T01 AT4G23190 35.673 342 205 5 192 528 212 543 2.39e-63 219
MsG0180003620.01.T01 AT4G23190 35.673 342 205 5 192 528 212 543 2.39e-63 219
MsG0180003620.01.T01 AT1G66880 38.006 321 189 5 225 541 314 628 2.88e-63 220
MsG0180003620.01.T01 AT2G43230 41.497 294 162 5 248 532 132 424 3.16e-63 214
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MsG0180003620.01.T01 AT1G61490 37.186 398 219 11 183 562 393 777 3.33e-63 222
MsG0180003620.01.T01 AT5G49780 38.196 377 191 9 193 535 562 930 3.36e-63 224
MsG0180003620.01.T01 AT5G35580 41.333 300 157 8 247 533 62 355 3.38e-63 216
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MsG0180003620.01.T01 AT1G61490 37.186 398 219 11 183 562 419 803 5.12e-63 222
MsG0180003620.01.T01 AT1G61490 37.186 398 219 11 183 562 419 803 5.12e-63 222
MsG0180003620.01.T01 AT1G61490 37.186 398 219 11 183 562 419 803 5.12e-63 222
MsG0180003620.01.T01 AT2G18470 47.280 239 114 4 248 481 271 502 5.24e-63 217
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MsG0180003620.01.T01 AT4G23280 40.845 284 164 3 249 529 332 614 7.14e-63 219
MsG0180003620.01.T01 AT4G23270 40.000 290 170 3 249 535 314 602 7.98e-63 219
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MsG0180003620.01.T01 AT4G23320 37.092 337 196 5 194 527 128 451 8.03e-63 215
MsG0180003620.01.T01 AT5G49760 41.611 298 158 6 246 535 616 905 8.37e-63 223
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MsG0180003620.01.T01 AT1G61420 35.971 417 234 12 164 562 407 808 8.80e-63 221
MsG0180003620.01.T01 AT1G61420 36.211 417 231 13 164 562 407 806 9.49e-63 221
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MsG0180003620.01.T01 AT2G05940 39.933 298 164 7 247 533 73 366 1.11e-62 214
MsG0180003620.01.T01 AT4G23320 37.092 337 196 5 194 527 149 472 1.20e-62 215
MsG0180003620.01.T01 AT3G02810 41.463 287 160 5 249 528 52 337 1.39e-62 216
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MsG0180003620.01.T01 AT3G09830 39.735 302 163 8 249 535 72 369 2.33e-62 212
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MsG0180003620.01.T01 AT1G61360 35.949 395 229 11 187 565 342 728 3.15e-61 216
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MsG0180003620.01.T01 AT5G18500 37.417 302 185 3 242 540 147 447 3.39e-61 210
MsG0180003620.01.T01 AT5G18500 37.417 302 185 3 242 540 147 447 3.39e-61 210
MsG0180003620.01.T01 AT5G18500 37.417 302 185 3 242 540 147 447 3.39e-61 210
MsG0180003620.01.T01 AT5G18500 37.417 302 185 3 242 540 147 447 3.39e-61 210
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MsG0180003620.01.T01 AT1G61430 38.953 344 187 9 235 562 443 779 1.31e-60 215
MsG0180003620.01.T01 AT4G20140 32.994 491 280 19 75 523 744 1227 1.35e-60 218
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MsG0180003620.01.T01 AT1G55200 39.298 285 165 5 249 529 367 647 1.83e-60 213
MsG0180003620.01.T01 AT1G55200 39.298 285 165 5 249 529 367 647 1.83e-60 213
MsG0180003620.01.T01 AT5G48380 31.376 545 284 18 63 536 65 590 1.89e-60 212
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MsG0180003620.01.T01 AT4G23290 39.583 288 170 3 249 533 351 637 2.64e-60 213
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MsG0180003620.01.T01 AT1G48210 38.983 295 170 5 253 539 60 352 2.91e-60 204
MsG0180003620.01.T01 AT1G48210 38.983 295 170 5 253 539 60 352 2.91e-60 204
MsG0180003620.01.T01 AT1G48210 38.983 295 170 5 253 539 60 352 2.91e-60 204
MsG0180003620.01.T01 AT5G03320 38.870 301 167 8 249 535 69 366 2.98e-60 206
MsG0180003620.01.T01 AT5G03320 38.870 301 167 8 249 535 69 366 2.98e-60 206
MsG0180003620.01.T01 AT4G11470 36.095 338 196 6 202 534 292 614 3.01e-60 212
MsG0180003620.01.T01 AT4G23310 40.493 284 165 3 249 529 456 738 3.48e-60 214
MsG0180003620.01.T01 AT4G11470 36.095 338 196 6 202 534 297 619 3.68e-60 212
MsG0180003620.01.T01 AT5G56460 38.486 317 177 9 238 540 53 365 3.82e-60 206
MsG0180003620.01.T01 AT3G49670 30.206 533 319 15 79 574 485 1001 4.07e-60 216
MsG0180003620.01.T01 AT5G62230 32.311 489 278 12 81 529 437 912 4.17e-60 216
MsG0180003620.01.T01 AT5G62230 42.453 106 54 4 61 165 231 330 2.06e-11 67.8
MsG0180003620.01.T01 AT1G78530 41.697 271 149 4 265 532 81 345 4.20e-60 204
MsG0180003620.01.T01 AT4G31100 38.689 305 184 2 230 532 414 717 4.52e-60 214
MsG0180003620.01.T01 AT2G11520 39.721 287 165 5 250 531 214 497 4.59e-60 208
MsG0180003620.01.T01 AT4G23310 40.493 284 165 3 249 529 496 778 4.90e-60 214
MsG0180003620.01.T01 AT1G70740 38.380 284 167 4 248 527 49 328 6.23e-60 205
MsG0180003620.01.T01 AT1G72180 32.475 505 286 15 79 534 463 961 6.32e-60 215
MsG0180003620.01.T01 AT1G61400 35.661 401 223 10 186 562 432 821 6.37e-60 214
MsG0180003620.01.T01 AT4G23180 36.923 325 183 7 211 528 307 616 6.54e-60 211
MsG0180003620.01.T01 AT3G21630 37.741 363 191 12 192 528 234 587 7.17e-60 210
MsG0180003620.01.T01 AT4G04490 43.624 298 156 8 234 528 315 603 7.43e-60 211
MsG0180003620.01.T01 AT4G34500 39.085 284 168 3 249 528 133 415 8.27e-60 205
MsG0180003620.01.T01 AT5G06740 35.505 307 184 5 236 529 299 604 8.51e-60 211
MsG0180003620.01.T01 AT5G49660 33.063 493 278 15 76 534 462 936 8.71e-60 215
MsG0180003620.01.T01 AT4G23210 38.790 281 167 3 249 528 348 624 1.03e-59 211
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MsG0180003620.01.T01 AT5G06740 35.505 307 184 5 236 529 311 616 1.23e-59 210
MsG0180003620.01.T01 AT1G61390 35.294 391 231 9 188 562 278 662 1.42e-59 210
MsG0180003620.01.T01 AT2G18890 40.678 295 154 8 248 532 55 338 1.60e-59 203
MsG0180003620.01.T01 AT3G23750 41.727 278 154 6 258 528 575 851 1.90e-59 213
MsG0180003620.01.T01 AT4G00340 39.274 303 172 6 239 532 461 760 2.15e-59 212
MsG0180003620.01.T01 AT4G00340 39.274 303 172 6 239 532 440 739 2.21e-59 212
MsG0180003620.01.T01 AT2G28590 43.922 255 138 4 228 478 65 318 2.30e-59 201
MsG0180003620.01.T01 AT2G18890 41.034 290 150 8 248 527 55 333 2.57e-59 201
MsG0180003620.01.T01 AT1G11350 37.465 355 208 7 185 528 429 780 2.61e-59 212
MsG0180003620.01.T01 AT4G21410 35.530 349 204 9 192 527 162 502 3.30e-59 207
MsG0180003620.01.T01 AT1G61380 34.107 431 251 14 152 577 247 649 3.43e-59 209
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MsG0180003620.01.T02 AT2G37050 71.111 360 100 3 17 374 18 375 0.0 530
MsG0180003620.01.T02 AT2G37050 71.111 360 100 3 17 374 18 375 0.0 529
MsG0180003620.01.T02 AT2G37050 71.111 360 100 3 17 374 18 375 0.0 529
MsG0180003620.01.T02 AT1G67720 50.824 364 175 3 4 365 3 364 2.74e-116 360
MsG0180003620.01.T02 AT1G51860 29.973 377 215 12 4 361 6 352 4.39e-39 149
MsG0180003620.01.T02 AT2G19230 31.148 366 214 14 10 360 14 356 6.09e-39 149
MsG0180003620.01.T02 AT2G19230 31.148 366 214 14 10 360 14 356 6.76e-39 148
MsG0180003620.01.T02 AT1G05700 30.790 367 223 11 4 361 8 352 6.10e-38 145
MsG0180003620.01.T02 AT1G05700 30.518 367 224 10 4 361 8 352 6.14e-38 145
MsG0180003620.01.T02 AT1G51880 29.319 382 219 13 4 366 25 374 1.72e-37 144
MsG0180003620.01.T02 AT1G51880 29.091 385 222 13 1 366 4 356 2.00e-37 144
MsG0180003620.01.T02 AT1G51880 29.319 382 219 13 4 366 25 374 2.12e-37 144
MsG0180003620.01.T02 AT2G28990 32.123 358 196 15 26 366 24 351 9.39e-37 142
MsG0180003620.01.T02 AT2G28990 32.123 358 196 15 26 366 24 351 9.39e-37 142
MsG0180003620.01.T02 AT1G51790 30.846 402 211 18 8 381 8 370 1.16e-35 139
MsG0180003620.01.T02 AT1G51790 30.846 402 211 18 8 381 8 370 1.16e-35 139
MsG0180003620.01.T02 AT2G14510 31.436 369 212 12 11 361 7 352 1.19e-35 139
MsG0180003620.01.T02 AT1G51790 31.266 403 208 20 8 381 8 370 1.30e-35 139
MsG0180003620.01.T02 AT2G14510 31.436 369 212 12 11 361 15 360 1.31e-35 139
MsG0180003620.01.T02 AT5G59680 31.165 369 201 13 19 366 20 356 1.74e-35 138
MsG0180003620.01.T02 AT1G51805 31.989 372 212 15 1 360 1 343 2.66e-35 138
MsG0180003620.01.T02 AT1G07550 29.443 377 214 12 5 361 7 351 5.16e-35 137
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MsG0180003620.01.T02 AT3G46330 30.504 377 221 12 5 366 8 358 2.64e-34 135
MsG0180003620.01.T02 AT4G29990 30.084 359 208 15 26 366 26 359 3.21e-34 134
MsG0180003620.01.T02 AT5G59670 30.199 351 213 12 22 361 22 351 3.44e-34 134
MsG0180003620.01.T02 AT5G59670 30.199 351 213 12 22 361 22 351 3.44e-34 134
MsG0180003620.01.T02 AT2G29000 30.220 364 224 14 5 361 7 347 5.42e-34 134
MsG0180003620.01.T02 AT3G46400 32.231 363 182 16 26 361 27 352 5.78e-34 134
MsG0180003620.01.T02 AT5G59650 31.714 350 197 14 27 361 29 351 1.26e-33 133
MsG0180003620.01.T02 AT5G59650 31.714 350 197 14 27 361 29 351 1.51e-33 132
MsG0180003620.01.T02 AT1G51910 28.982 383 226 15 1 366 4 357 1.53e-33 132
MsG0180003620.01.T02 AT1G51800 30.729 384 201 14 7 361 3 350 1.67e-33 132
MsG0180003620.01.T02 AT3G46340 28.866 388 207 14 5 360 3 353 3.10e-33 132
MsG0180003620.01.T02 AT2G19190 31.661 319 181 13 5 303 3 304 5.15e-33 131
MsG0180003620.01.T02 AT2G19210 29.275 386 217 16 4 366 12 364 1.02e-32 130
MsG0180003620.01.T02 AT2G28960 31.383 376 208 15 22 381 24 365 2.62e-32 129
MsG0180003620.01.T02 AT1G51890 28.954 373 226 14 9 366 4 352 3.03e-32 129
MsG0180003620.01.T02 AT1G51890 28.954 373 226 14 9 366 4 352 3.95e-32 128
MsG0180003620.01.T02 AT1G51890 28.954 373 226 14 9 366 4 352 4.01e-32 128
MsG0180003620.01.T02 AT1G51820 32.063 315 183 12 1 306 1 293 8.11e-32 127
MsG0180003620.01.T02 AT1G49100 29.659 381 231 13 1 366 1 359 1.11e-31 127
MsG0180003620.01.T02 AT3G46420 31.302 361 196 15 26 366 28 356 1.27e-31 127
MsG0180003620.01.T02 AT4G29450 33.221 298 167 10 73 361 83 357 2.40e-31 126
MsG0180003620.01.T02 AT1G51850 30.599 317 183 13 1 305 1 292 4.03e-31 125
MsG0180003620.01.T02 AT1G07560 32.571 350 195 17 26 360 29 352 4.19e-31 125
MsG0180003620.01.T02 AT5G16900 30.319 376 208 16 11 360 7 354 4.39e-31 125
MsG0180003620.01.T02 AT5G16900 30.319 376 208 16 11 360 7 354 4.50e-31 125
MsG0180003620.01.T02 AT5G16900 30.319 376 208 16 11 360 7 354 4.50e-31 125
MsG0180003620.01.T02 AT4G29180 30.159 378 215 15 5 361 7 356 9.41e-31 124
MsG0180003620.01.T02 AT4G29180 30.159 378 215 15 5 361 7 356 1.02e-30 124
MsG0180003620.01.T02 AT4G29180 30.159 378 215 15 5 361 7 356 1.02e-30 124
MsG0180003620.01.T02 AT1G51870 27.949 390 213 12 7 366 6 357 1.19e-30 124
MsG0180003620.01.T02 AT1G51870 27.949 390 213 12 7 366 6 357 1.49e-30 124
MsG0180003620.01.T02 AT2G14440 29.888 358 197 11 26 361 28 353 3.22e-30 123
MsG0180003620.01.T02 AT3G21340 30.400 375 210 15 6 361 13 355 4.50e-30 122
MsG0180003620.01.T02 AT3G21340 30.400 375 210 15 6 361 13 355 4.84e-30 122
MsG0180003620.01.T02 AT1G51805 29.839 372 196 14 1 360 1 319 6.77e-30 122
MsG0180003620.01.T02 AT2G04300 29.319 382 206 16 6 361 13 356 1.46e-27 115
MsG0180003620.01.T02 AT2G04300 30.275 327 183 13 6 313 13 313 2.82e-27 114
MsG0180003620.01.T02 AT3G46270 30.000 310 194 12 3 303 12 307 2.86e-27 112
MsG0180003620.01.T02 AT3G46270 30.000 310 194 12 3 303 4 299 3.30e-27 112
MsG0180003620.01.T02 AT3G46350 29.464 336 202 16 4 323 7 323 4.17e-27 112
MsG0180003620.01.T02 AT3G46260 28.664 307 196 11 19 316 20 312 5.51e-27 111
MsG0180003620.01.T02 AT1G51850 29.653 317 166 13 1 305 1 272 1.11e-25 109
MsG0180003620.01.T02 AT4G20450 27.670 412 213 18 1 366 4 376 1.40e-25 109
MsG0180003620.01.T02 AT4G20450 27.670 412 213 18 1 366 4 376 1.81e-25 108
MsG0180003620.01.T02 AT1G24485 27.809 356 224 13 13 361 14 343 6.25e-25 105
MsG0180003620.01.T02 AT1G24485 27.913 369 232 14 1 361 1 343 1.09e-24 105
MsG0180003620.01.T02 AT1G24485 27.809 356 224 13 13 361 14 343 1.10e-24 105
MsG0180003620.01.T02 AT1G24485 27.809 356 224 13 13 361 14 343 2.65e-24 105
MsG0180003620.01.T02 AT5G48740 31.461 267 167 10 12 272 6 262 3.88e-24 105
MsG0180003620.01.T02 AT3G19230 34.673 199 119 8 30 220 25 220 6.49e-24 103
MsG0180003620.01.T02 AT3G46370 29.514 288 169 10 82 361 2 263 1.03e-23 103
MsG0180003620.01.T02 AT3G46370 29.514 288 169 10 82 361 2 263 1.03e-23 103
MsG0180003620.01.T02 AT3G46280 28.188 298 189 13 28 316 25 306 2.17e-22 99.0
MsG0180003620.01.T02 AT1G51840 34.975 203 114 8 1 191 8 204 5.35e-22 93.2
MsG0180003620.01.T02 AT1G51840 34.975 203 114 8 1 191 8 204 5.35e-22 93.2
MsG0180003620.01.T02 AT1G51840 34.975 203 114 8 1 191 8 204 5.35e-22 93.2
MsG0180003620.01.T02 AT1G51840 34.975 203 114 8 1 191 8 204 5.35e-22 93.2
MsG0180003620.01.T02 AT1G51840 34.975 203 114 8 1 191 8 204 5.35e-22 93.2
MsG0180003620.01.T02 AT3G05990 28.916 249 146 11 28 263 28 258 1.46e-19 90.5
MsG0180003620.01.T02 AT1G51860 29.958 237 125 7 137 361 1 208 2.76e-17 84.3
MsG0180003620.01.T02 AT1G51810 27.530 247 134 9 127 360 3 217 9.58e-15 76.3
MsG0180003620.01.T02 AT2G28960 28.287 251 143 8 138 381 13 233 3.21e-13 71.6
MsG0180003620.01.T02 AT3G46240 35.433 127 78 4 28 152 6 130 1.92e-12 68.6
MsG0180003620.01.T02 AT1G25570 27.413 259 163 10 30 273 32 280 8.28e-12 67.0

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCCACTACTCTTCAGAAAAT+TGG 0.105147 1:-65313005 MsG0180003620.01.T01:CDS
ATGACCCATTTGACAGAATT+TGG 0.130040 1:-65313790 MsG0180003620.01.T02:CDS
AGAGCTAAGGTTTCAGATTT+TGG 0.137817 1:-65310900 MsG0180003620.01.T01:CDS
AACCAATTGTATGTGATTAT+TGG 0.154003 1:-65311909 MsG0180003620.01.T01:CDS
CCAAAAGAAATGTCGAATTT+TGG 0.172791 1:+65314291 None:intergenic
CCAAAATTCGACATTTCTTT+TGG 0.177530 1:-65314291 MsG0180003620.01.T02:CDS
CTGATGAAATTGGTCTTAAA+TGG 0.179023 1:-65314512 MsG0180003620.01.T02:CDS
CAAAATTTCACTGATGAAAT+TGG 0.195588 1:-65314522 MsG0180003620.01.T02:CDS
CCCGATGATAAAATTTCTTA+TGG 0.223140 1:-65314486 MsG0180003620.01.T02:CDS
AAAATTGGTTCTGGAGGTTT+TGG 0.224144 1:-65311595 MsG0180003620.01.T01:CDS
GGCATCTGAGCGTAGGAAAA+AGG 0.230006 1:+65315169 None:intergenic
TTCCATCAACATGGGTTCTA+TGG 0.235907 1:-65309948 MsG0180003620.01.T01:CDS
CGGGGCCGCCATTCTACTTT+TGG 0.248262 1:-65311877 MsG0180003620.01.T01:CDS
AATTACATTGAAATTATTCT+TGG 0.257905 1:+65312913 None:intergenic
TTTGTGATGTCCTTTAAATT+AGG 0.267418 1:-65313395 MsG0180003620.01.T01:exon
AAGAGTGATATATACAGTTT+TGG 0.281519 1:-65310676 MsG0180003620.01.T01:CDS
ATACTTAGTCCATGCGTTAA+TGG 0.283283 1:+65311146 None:intergenic
TCTTAAAGAGCATAGAAAAT+TGG 0.287855 1:+65309732 None:intergenic
ATTCTTCTTGAACTCATATC+TGG 0.289318 1:-65310649 MsG0180003620.01.T01:CDS
CCATGTTTCTAGCGTAGTTC+GGG 0.289407 1:-65310847 MsG0180003620.01.T01:CDS
TTTGAGTAGAAAGTGAAATA+AGG 0.312038 1:+65311707 None:intergenic
ATTTATGAGTTCATGCATAA+TGG 0.313414 1:-65311277 MsG0180003620.01.T01:CDS
GTTTCTGCGAGGATAAATTT+TGG 0.314877 1:-65314066 MsG0180003620.01.T02:CDS
TGGCTACTATTATATCTTGC+TGG 0.316453 1:-65311857 MsG0180003620.01.T01:CDS
TTTGAGAAGAAAATTGGTTC+TGG 0.321521 1:-65311604 MsG0180003620.01.T01:CDS
AGAAACTTGGTACAGCTTCT+AGG 0.322005 1:-65311331 MsG0180003620.01.T01:CDS
CCCATGTTTCTAGCGTAGTT+CGG 0.324228 1:-65310848 MsG0180003620.01.T01:CDS
TGGAGAAATAAGCAATATTT+CGG 0.340191 1:-65314466 MsG0180003620.01.T02:CDS
TTCACTACTTCTGATATTGA+TGG 0.340697 1:+65310055 None:intergenic
GACCATCATCTTTAGATTCC+AGG 0.354190 1:+65311683 None:intergenic
CTTTCGAAACTCGCTGTTGA+TGG 0.366197 1:-65310876 MsG0180003620.01.T01:CDS
TCGGGGTACAGTAGGATATC+TGG 0.368978 1:-65310829 MsG0180003620.01.T01:CDS
GACTCCCAAATTCTGTCAAA+TGG 0.372665 1:+65313785 None:intergenic
TGTCTATCCAATGCAACAAC+TGG 0.373788 1:-65314174 MsG0180003620.01.T02:CDS
TGACCCATTTGACAGAATTT+GGG 0.378230 1:-65313789 MsG0180003620.01.T02:CDS
ATCCATAGAACCCATGTTGA+TGG 0.380400 1:+65309946 None:intergenic
CGCATGGACTAAGTATCAAT+TGG 0.380996 1:-65311139 MsG0180003620.01.T01:CDS
CCACTACTCTTCAGAAAATT+GGG 0.381830 1:-65313004 MsG0180003620.01.T01:CDS
TCCATGCATCCAGTGAAATC+TGG 0.382263 1:+65312530 None:intergenic
TCCATTGATGTTAGAGGTAA+TGG 0.385159 1:-65313692 MsG0180003620.01.T02:CDS
GTGATTATTGGTTCAGCACT+CGG 0.392483 1:-65311897 MsG0180003620.01.T01:CDS
GGTGGTAACAGTTTGTTGTC+TGG 0.396432 1:-65312733 MsG0180003620.01.T01:intron
TCTTGCTGGTGTATGCATAA+AGG 0.399088 1:-65311843 MsG0180003620.01.T01:CDS
GTATTGCTTCCGCGTCTCAT+TGG 0.400629 1:+65314440 None:intergenic
GCTTACAGTTCCCTCAAATT+CGG 0.400923 1:+65312356 None:intergenic
TGGGGAACCTTCCGAATTTG+AGG 0.412731 1:-65312367 MsG0180003620.01.T01:CDS
AAGTTCTGACGGTACAGTTC+CGG 0.414339 1:+65312102 None:intergenic
CAAATGGATCTCTAACTTAC+CGG 0.415173 1:-65313622 MsG0180003620.01.T02:CDS
TTCCGGATAACATATTGTTC+TGG 0.415705 1:+65312119 None:intergenic
GGAAACAACGGTCTTCATAA+AGG 0.420067 1:-65311945 MsG0180003620.01.T01:CDS
GGAAGGTTCCCCAGAGTGGC+TGG 0.421212 1:+65312377 None:intergenic
AGAGAGGGAAAGTAGCATTT+CGG 0.421628 1:-65310002 MsG0180003620.01.T01:CDS
TGATTATTGGTTCAGCACTC+GGG 0.424750 1:-65311896 MsG0180003620.01.T01:CDS
TTCAACCAAACCGGTCAATC+TGG 0.427488 1:+65312675 None:intergenic
TCATATCTACACTTGAACTT+AGG 0.427871 1:-65314143 MsG0180003620.01.T02:CDS
CATCCAGTGAAATCTGGTAT+TGG 0.428128 1:+65312536 None:intergenic
AAATTCAGGCTAGTACTTCC+AGG 0.428201 1:-65313515 MsG0180003620.01.T01:five_prime_UTR
GTTTACCTGTTCCATGGTCG+TGG 0.432869 1:-65312960 MsG0180003620.01.T01:CDS
ATCCAGTGAAATCTGGTATT+GGG 0.433565 1:+65312537 None:intergenic
AGAAAATTGGGCACAAGAAG+GGG 0.439233 1:-65312992 MsG0180003620.01.T01:CDS
TCTAACTTACCGGTTGAACT+TGG 0.441693 1:-65313612 MsG0180003620.01.T02:CDS
CTTGAACTTAGGCAATTCAA+TGG 0.444242 1:-65314132 MsG0180003620.01.T02:CDS
CAGAAAATTGGGCACAAGAA+GGG 0.445372 1:-65312993 MsG0180003620.01.T01:CDS
GCTGTCTGCATTACTTTCAC+TGG 0.446340 1:+65313656 None:intergenic
AACCAATAATCACATACAAT+TGG 0.447750 1:+65311907 None:intergenic
TATGGTTGCAGATGGCTTGA+TGG 0.449019 1:-65312575 MsG0180003620.01.T01:intron
CTAGGTTATTGTCGAGAAGA+AGG 0.449645 1:-65311313 MsG0180003620.01.T01:CDS
AATGTATCCATTGATGTTAG+AGG 0.450662 1:-65313698 MsG0180003620.01.T02:CDS
ACTTAGGCAATTCAATGGTT+CGG 0.450865 1:-65314127 MsG0180003620.01.T02:CDS
GAGAGAGAGAAGAGGAAGAA+AGG 0.456086 1:+65315214 None:intergenic
GGGGAACCTTCCGAATTTGA+GGG 0.456244 1:-65312366 MsG0180003620.01.T01:CDS
CATCACCAGATTGACCGGTT+TGG 0.458065 1:-65312680 MsG0180003620.01.T01:CDS
GAAATGAATCTCGAAAATTC+AGG 0.461801 1:-65313529 MsG0180003620.01.T02:CDS
TCTGTCTTCAACAGCTACTC+TGG 0.464278 1:-65311966 MsG0180003620.01.T01:intron
TTCACTTTCTACTCAAAACC+TGG 0.465896 1:-65311701 MsG0180003620.01.T01:CDS
AACTTACAGTTCAACCAAAC+CGG 0.468774 1:+65312666 None:intergenic
GTCCAGAACAATATGTTATC+CGG 0.470722 1:-65312121 MsG0180003620.01.T01:CDS
ACTTACCGGTTGAACTTGGA+TGG 0.471141 1:-65313608 MsG0180003620.01.T02:CDS
TTGTCGAAACTTAGTCCAAT+GGG 0.473197 1:-65310590 MsG0180003620.01.T01:intron
TCATACTCTCCACGTAATGC+TGG 0.479158 1:+65310145 None:intergenic
TCCATTACCTCTAACATCAA+TGG 0.481703 1:+65313691 None:intergenic
AAGGAAATTCAAGACGCAAT+TGG 0.481999 1:-65310034 MsG0180003620.01.T01:CDS
ACTCCCAAATTCTGTCAAAT+GGG 0.482834 1:+65313786 None:intergenic
ATTCTGTCAAATGGGTCATC+GGG 0.483211 1:+65313794 None:intergenic
GAAAACCATCCAAGTTCAAC+CGG 0.487689 1:+65313603 None:intergenic
AGGTCTCTATGGATAACTGC+AGG 0.488037 1:+65310957 None:intergenic
GTGGTAACAGTTTGTTGTCT+GGG 0.489919 1:-65312732 MsG0180003620.01.T01:intron
CGGACCCACGACCATGGAAC+AGG 0.491098 1:+65312955 None:intergenic
TTGGACATCACCAGATTGAC+CGG 0.492345 1:-65312685 MsG0180003620.01.T01:CDS
ACAGCCGTAGTAGGTACAAA+TGG 0.493115 1:-65313638 MsG0180003620.01.T02:CDS
GGTGTACTCCCAGCCACTCT+GGG 0.493838 1:-65312386 MsG0180003620.01.T01:CDS
TAGAGTGTCACAAATTTGAC+TGG 0.494035 1:-65309792 MsG0180003620.01.T01:three_prime_UTR
AGGTGTACTCCCAGCCACTC+TGG 0.497895 1:-65312387 MsG0180003620.01.T01:CDS
GCAATATCTAATGACAACTT+TGG 0.499522 1:-65310619 MsG0180003620.01.T01:CDS
CCCGAACTACGCTAGAAACA+TGG 0.500217 1:+65310847 None:intergenic
AAGAAGAAATATCATGATCA+AGG 0.502575 1:-65311819 MsG0180003620.01.T01:intron
CTGTATGCCCATCCAGTGGC+AGG 0.505228 1:+65313581 None:intergenic
CAGAGAGTGATGCTCCAGTC+AGG 0.505443 1:-65314041 MsG0180003620.01.T02:intron
ATCCATGTTTACCTGTTCCA+TGG 0.508382 1:-65312966 MsG0180003620.01.T01:CDS
AATTCTGTCAAATGGGTCAT+CGG 0.514970 1:+65313793 None:intergenic
ACCAGATTTCACTGGATGCA+TGG 0.514992 1:-65312531 MsG0180003620.01.T01:CDS
TTACTAATATCAGCCTGTCC+TGG 0.519009 1:+65313497 None:intergenic
CATGACGGGAGACATTCCTT+TGG 0.519723 1:-65312704 MsG0180003620.01.T01:CDS
AGGGATAGATTGTAAAATCC+TGG 0.524307 1:+65313422 None:intergenic
AGCATTGAGAAGAGGACCCT+TGG 0.525921 1:+65313355 None:intergenic
AATAGTAGCCAAAAGTAGAA+TGG 0.526405 1:+65311869 None:intergenic
AACCTGGAATCTAAAGATGA+TGG 0.526873 1:-65311685 MsG0180003620.01.T01:CDS
GGGTCCTCTTCTCAATGCTA+TGG 0.527008 1:-65313351 MsG0180003620.01.T01:CDS
ATCAATATCAGAAGTAGTGA+AGG 0.528920 1:-65310053 MsG0180003620.01.T01:CDS
TCAGAAAATTGGGCACAAGA+AGG 0.531319 1:-65312994 MsG0180003620.01.T01:CDS
CAGGCTAGTACTTCCAGGAC+AGG 0.531896 1:-65313510 MsG0180003620.01.T01:five_prime_UTR
TACCTTGTTGATGTTGCTGA+TGG 0.532032 1:-65313740 MsG0180003620.01.T02:CDS
TAGGTTATTGTCGAGAAGAA+GGG 0.533410 1:-65311312 MsG0180003620.01.T01:CDS
GTCTATCCAATGCAACAACT+GGG 0.534187 1:-65314173 MsG0180003620.01.T02:CDS
CTTGAGAACAATCAGTTGAC+AGG 0.534542 1:-65312407 MsG0180003620.01.T01:CDS
ATTGTCGAAACTTAGTCCAA+TGG 0.534750 1:-65310591 MsG0180003620.01.T01:CDS
GTAATGCAGACAGCCGTAGT+AGG 0.537294 1:-65313647 MsG0180003620.01.T02:CDS
TGAACCTTTGGCAGAATCCT+CGG 0.537809 1:+65311097 None:intergenic
AGCGTAGTTCGGGGTACAGT+AGG 0.541100 1:-65310837 MsG0180003620.01.T01:CDS
TTTACCTGTTCCATGGTCGT+GGG 0.541373 1:-65312959 MsG0180003620.01.T01:CDS
CACTCACACTATCGTGCAGT+GGG 0.541723 1:+65309875 None:intergenic
AGTTCATTCTTCCATCAACA+TGG 0.543788 1:-65309957 MsG0180003620.01.T01:CDS
TGGCTCCCCAGTTGTTGCAT+TGG 0.544481 1:+65314167 None:intergenic
GCAAAATTGCACATTGAGAG+TGG 0.548674 1:-65310190 MsG0180003620.01.T01:CDS
GAAGGTTCCCCAGAGTGGCT+GGG 0.549495 1:+65312378 None:intergenic
TGACAAGGACATGAGAGCTA+AGG 0.550277 1:-65310913 MsG0180003620.01.T01:CDS
CCTCAGTAGATACCTTGTCC+TGG 0.551902 1:+65314356 None:intergenic
GTCTGCATTACTTTCACTGG+TGG 0.553884 1:+65313659 None:intergenic
TAAAGGACATCACAAAGGGT+AGG 0.557234 1:+65313402 None:intergenic
AGTTCAAGTGTAGATATGAA+TGG 0.557613 1:+65314147 None:intergenic
AGATCCATTTGTACCTACTA+CGG 0.562430 1:+65313634 None:intergenic
TACTATGGGAAACAGAAAGA+TGG 0.563104 1:-65311565 MsG0180003620.01.T01:CDS
AAATATCGTCTTTATGAACC+AGG 0.565234 1:-65313440 MsG0180003620.01.T01:five_prime_UTR
AAAGGACATCACAAAGGGTA+GGG 0.566205 1:+65313403 None:intergenic
GGCCCAATACCAGATTTCAC+TGG 0.567988 1:-65312539 MsG0180003620.01.T01:CDS
GTCAATCTGGTGATGTCCAA+AGG 0.569711 1:+65312688 None:intergenic
TGAGGTGGAGACTTACCATC+AGG 0.569747 1:+65313293 None:intergenic
TTAACTAGTAATTCCTACCA+AGG 0.569751 1:-65311520 MsG0180003620.01.T01:CDS
AGAGCGGCTCATTACCTGAC+TGG 0.571770 1:+65314027 None:intergenic
GAGAAGAAAATTGGTTCTGG+AGG 0.575093 1:-65311601 MsG0180003620.01.T01:CDS
GAGTAGAAAGTGAAATAAGG+TGG 0.577386 1:+65311710 None:intergenic
AATTTAAAGGACATCACAAA+GGG 0.579823 1:+65313398 None:intergenic
AAGGATACATCACAGAAACT+TGG 0.583808 1:-65311344 MsG0180003620.01.T01:CDS
CATGCATAATGGAACTCTCA+AGG 0.584431 1:-65311266 MsG0180003620.01.T01:CDS
ACAGTTCCCTCAAATTCGGA+AGG 0.585431 1:+65312360 None:intergenic
GGATGAATGAGAGAGAGAAG+AGG 0.589302 1:+65315206 None:intergenic
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CRISPR-GE

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TAGAATATGAGGTCACAAAA+TGG + Chr1:65309967-65309986 None:intergenic 30.0%
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TTGGCTATGTAATCAACTTA+AGG + Chr1:65314212-65314231 None:intergenic 30.0%
! AATTGGTATTGAAAGAGAGA+GGG - Chr1:65314950-65314969 MsG0180003620.01.T02:intron 30.0%
! AGAACTTTTGAGCAAAGATT+TGG - Chr1:65312881-65312900 MsG0180003620.01.T01:intron 30.0%
! CCAAAAGAAATGTCGAATTT+TGG + Chr1:65310679-65310698 None:intergenic 30.0%
! CCAAAATTCGACATTTCTTT+TGG - Chr1:65310676-65310695 MsG0180003620.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTGGAAATGGAAAAACAA+AGG + Chr1:65310006-65310025 None:intergenic 30.0%
! CTTTGGAGAACAAAAACAAA+AGG - Chr1:65311832-65311851 MsG0180003620.01.T01:CDS 30.0%
! GAGTGATATATACAGTTTTG+GGG - Chr1:65314293-65314312 MsG0180003620.01.T02:CDS 30.0%
! GCACATGCAAATTTAAAATG+TGG - Chr1:65314534-65314553 MsG0180003620.01.T02:CDS 30.0%
! GTAAAGTTGGTTAGAATATG+AGG + Chr1:65309978-65309997 None:intergenic 30.0%
! TCTTTAAATGGAGGTATGTA+TGG - Chr1:65310189-65310208 MsG0180003620.01.T01:CDS 30.0%
! TGATATTTGCCTTGTTAAAC+AGG - Chr1:65310394-65310413 MsG0180003620.01.T01:intron 30.0%
! TGCAAATTTAAAATGTGGTG+AGG - Chr1:65314539-65314558 MsG0180003620.01.T02:CDS 30.0%
! TTTGAGAAGAAAATTGGTTC+TGG - Chr1:65313363-65313382 MsG0180003620.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTTTCGAGATTCATTTCG+CGG + Chr1:65311437-65311456 None:intergenic 30.0%
!! CTGATGAAATTGGTCTTAAA+TGG - Chr1:65310455-65310474 MsG0180003620.01.T01:intron 30.0%
!!! GGTTTATTTTACATTCTACG+AGG - Chr1:65310861-65310880 MsG0180003620.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTTGGAGTTGTTTACTAT+GGG - Chr1:65313388-65313407 MsG0180003620.01.T01:CDS 30.0%
AACAACAAGGCATGCAAAAA+TGG + Chr1:65309904-65309923 None:intergenic 35.0%
AACCTGGAATCTAAAGATGA+TGG - Chr1:65313282-65313301 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
AACTGGAAACATGGTTCATT+GGG + Chr1:65314653-65314672 None:intergenic 35.0%
AACTTACAGTTCAACCAAAC+CGG + Chr1:65312304-65312323 None:intergenic 35.0%
AAGGAAATTCAAGACGCAAT+TGG - Chr1:65314933-65314952 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
AAGGATACATCACAGAAACT+TGG - Chr1:65313623-65313642 MsG0180003620.01.T02:CDS 35.0%
AATTCTGTCAAATGGGTCAT+CGG + Chr1:65311177-65311196 None:intergenic 35.0%
ACTCCCAAATTCTGTCAAAT+GGG + Chr1:65311184-65311203 None:intergenic 35.0%
ACTTAGGCAATTCAATGGTT+CGG - Chr1:65310840-65310859 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
AGAAATTAAGACTCACCCAT+TGG + Chr1:65314395-65314414 None:intergenic 35.0%
AGAGTGCAAACAAGTACATA+AGG + Chr1:65313230-65313249 None:intergenic 35.0%
AGATCCATTTGTACCTACTA+CGG + Chr1:65311336-65311355 None:intergenic 35.0%
AGGGATAGATTGTAAAATCC+TGG + Chr1:65311548-65311567 None:intergenic 35.0%
AGTCTTCTCGTTTGCAAATT+AGG - Chr1:65310975-65310994 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
AGTTCATTCTTCCATCAACA+TGG - Chr1:65315010-65315029 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
ATAATTGATCCAGCATTACG+TGG - Chr1:65314813-65314832 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
ATACTTAGTCCATGCGTTAA+TGG + Chr1:65313824-65313843 None:intergenic 35.0%
ATCCAGTGAAATCTGGTATT+GGG + Chr1:65312433-65312452 None:intergenic 35.0%
ATGACCCATTTGACAGAATT+TGG - Chr1:65311177-65311196 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
ATTGAGAGTGGAGATATACA+AGG - Chr1:65314789-65314808 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
ATTGTCGAAACTTAGTCCAA+TGG - Chr1:65314376-65314395 MsG0180003620.01.T02:CDS 35.0%
CAAATGGATCTCTAACTTAC+CGG - Chr1:65311345-65311364 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
CAATGCAAGAGAAAACAACA+AGG + Chr1:65309917-65309936 None:intergenic 35.0%
CAATGGAATCATCAATAGCA+AGG + Chr1:65315067-65315086 None:intergenic 35.0%
CCACTACTCTTCAGAAAATT+GGG - Chr1:65311963-65311982 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
CTATGTTAGATCACTGAAAG+TGG + Chr1:65313514-65313533 None:intergenic 35.0%
CTTGAACTTAGGCAATTCAA+TGG - Chr1:65310835-65310854 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
GACTATAAAGCAACATAGAG+CGG + Chr1:65310959-65310978 None:intergenic 35.0%
GAGTAGAAAGTGAAATAAGG+TGG + Chr1:65313260-65313279 None:intergenic 35.0%
GATAGACATACACTAACTGT+AGG + Chr1:65310781-65310800 None:intergenic 35.0%
GTCCAGAACAATATGTTATC+CGG - Chr1:65312846-65312865 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
GTTAATGCTACATGTGTTGA+CGG - Chr1:65314569-65314588 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
GTTCATTCTTCCATCAACAT+GGG - Chr1:65315011-65315030 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
TAAAATGTGTCTTGTGTGAC+AGG - Chr1:65314755-65314774 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
TAACTGGAAACATGGTTCAT+TGG + Chr1:65314654-65314673 None:intergenic 35.0%
TACTATGGGAAACAGAAAGA+TGG - Chr1:65313402-65313421 MsG0180003620.01.T01:exon 35.0%
TAGGTTATTGTCGAGAAGAA+GGG - Chr1:65313655-65313674 MsG0180003620.01.T02:CDS 35.0%
TATCAGTTATGTTGTGTTGC+TGG - Chr1:65312213-65312232 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
TCAATCTTTATGGAAACCAG+TGG + Chr1:65309861-65309880 None:intergenic 35.0%
TCCATTACCTCTAACATCAA+TGG + Chr1:65311279-65311298 None:intergenic 35.0%
TCCATTGATGTTAGAGGTAA+TGG - Chr1:65311275-65311294 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
TGACCCATTTGACAGAATTT+GGG - Chr1:65311178-65311197 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
TGGCTACTATTATATCTTGC+TGG - Chr1:65313110-65313129 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
TGTAACTCGGCAAATTAAGT+CGG + Chr1:65313545-65313564 None:intergenic 35.0%
TTCACTTTCTACTCAAAACC+TGG - Chr1:65313266-65313285 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
TTCCGGATAACATATTGTTC+TGG + Chr1:65312851-65312870 None:intergenic 35.0%
TTGTCGAAACTTAGTCCAAT+GGG - Chr1:65314377-65314396 MsG0180003620.01.T02:CDS 35.0%
TTTGTAAGTTTGGATTGTGG+AGG - Chr1:65310418-65310437 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
! AAAAACAGCTGATTCTTCCA+AGG - Chr1:65311595-65311614 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
! AAAACAGCTGATTCTTCCAA+GGG - Chr1:65311596-65311615 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTAGTTTAAGGCCTTACT+CGG + Chr1:65314167-65314186 None:intergenic 35.0%
! AAGTGTGTAGCAGTATTTTC+TGG + Chr1:65310581-65310600 None:intergenic 35.0%
! AGAGCTAAGGTTTCAGATTT+TGG - Chr1:65314067-65314086 MsG0180003620.01.T02:CDS 35.0%
! CAATTGGTATTGAAAGAGAG+AGG - Chr1:65314949-65314968 MsG0180003620.01.T02:intron 35.0%
! GCATATGTTTCTGCAATATC+AGG - Chr1:65311147-65311166 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
! GTGTAACTTTGTTTACATGG+TGG - Chr1:65310127-65310146 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTCTGCGAGGATAAATTT+TGG - Chr1:65310901-65310920 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
! TACATTGCGATCTGAAGTAA+GGG + Chr1:65313934-65313953 None:intergenic 35.0%
! TAGAGTGTCACAAATTTGAC+TGG - Chr1:65315175-65315194 MsG0180003620.01.T02:CDS 35.0%
! TCTTTGCTCAAAAGTTCTGA+CGG + Chr1:65312879-65312898 None:intergenic 35.0%
!! AAAGGTTGTTAAGAGTGCTT+TGG - Chr1:65311815-65311834 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
!! CCAATTTTCTGAAGAGTAGT+GGG + Chr1:65311965-65311984 None:intergenic 35.0%
!! CTATTTTCCACATCGATTGT+AGG + Chr1:65314848-65314867 None:intergenic 35.0%
!! GGTTTTGTAAGTTTGGATTG+TGG - Chr1:65310415-65310434 MsG0180003620.01.T01:intron 35.0%
!!! AAAATTGGTTCTGGAGGTTT+TGG - Chr1:65313372-65313391 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTGTTGTTTTCTCTTGCAT+TGG - Chr1:65309915-65309934 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAAGAATGTTGCTGCTTTTT+AGG + Chr1:65314033-65314052 None:intergenic 35.0%
!!! GGTTTTGGAGTTGTTTACTA+TGG - Chr1:65313387-65313406 MsG0180003620.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAGAGAACTCTTTTTTGCCT+TGG + Chr1:65313467-65313486 None:intergenic 35.0%
!!! TCTCTTTTTTTCTCTTCCAC+TGG - Chr1:65309842-65309861 MsG0180003620.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
AAAGGACATCACAAAGGGTA+GGG + Chr1:65311567-65311586 None:intergenic 40.0%
AAATTCAGGCTAGTACTTCC+AGG - Chr1:65311452-65311471 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
ACAAGGCATGCAAAAATGGT+TGG + Chr1:65309900-65309919 None:intergenic 40.0%
ACTTGTGTTATGGTTGCAGA+TGG - Chr1:65312384-65312403 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
AGAAAATTGGGCACAAGAAG+GGG - Chr1:65311975-65311994 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
AGAAACTTGGTACAGCTTCT+AGG - Chr1:65313636-65313655 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
AGAGAGGGAAAGTAGCATTT+CGG - Chr1:65314965-65314984 MsG0180003620.01.T02:intron 40.0%
AGTAGCCAAAAGTAGAATGG+CGG + Chr1:65313098-65313117 None:intergenic 40.0%
AGTATGACCTACAATCGATG+TGG - Chr1:65314838-65314857 MsG0180003620.01.T02:intron 40.0%
ATCACTCGTGTGCATAGAAT+TGG - Chr1:65312698-65312717 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
ATCCATAGAACCCATGTTGA+TGG + Chr1:65315024-65315043 None:intergenic 40.0%
ATCCATGTTTACCTGTTCCA+TGG - Chr1:65312001-65312020 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
ATCTTGTAATGATTCACCGC+AGG + Chr1:65310217-65310236 None:intergenic 40.0%
ATTCTGTCAAATGGGTCATC+GGG + Chr1:65311176-65311195 None:intergenic 40.0%
CACAAGGTAGCTCAAAATTG+TGG + Chr1:65315134-65315153 None:intergenic 40.0%
CAGAAAATTGGGCACAAGAA+GGG - Chr1:65311974-65311993 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
CAGCAACATTCTTCTTGACA+AGG - Chr1:65314039-65314058 MsG0180003620.01.T02:intron 40.0%
CATCCAGTGAAATCTGGTAT+TGG + Chr1:65312434-65312453 None:intergenic 40.0%
CATGTATGTAGTACTTGGGT+TGG - Chr1:65311904-65311923 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
CCCACTACTCTTCAGAAAAT+TGG - Chr1:65311962-65311981 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
CTAGGTTATTGTCGAGAAGA+AGG - Chr1:65313654-65313673 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
CTTGAGAACAATCAGTTGAC+AGG - Chr1:65312560-65312579 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
CTTGATGGAAATATGCTGAC+AGG - Chr1:65312407-65312426 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
GAAAACCATCCAAGTTCAAC+CGG + Chr1:65311367-65311386 None:intergenic 40.0%
GACCATCATCTTTAGATTCC+AGG + Chr1:65313287-65313306 None:intergenic 40.0%
GACTCCCAAATTCTGTCAAA+TGG + Chr1:65311185-65311204 None:intergenic 40.0%
GCAAAATTGCACATTGAGAG+TGG - Chr1:65314777-65314796 MsG0180003620.01.T02:intron 40.0%
GCTTACAGTTCCCTCAAATT+CGG + Chr1:65312614-65312633 None:intergenic 40.0%
GGAAACAACGGTCTTCATAA+AGG - Chr1:65313022-65313041 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
GGCTGATATTAGTAAAGCAG+TGG - Chr1:65311478-65311497 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
GGTTCATTGGGTTTGATAGA+TGG + Chr1:65314641-65314660 None:intergenic 40.0%
GTAACTCGGCAAATTAAGTC+GGG + Chr1:65313544-65313563 None:intergenic 40.0%
GTAGAGTAAGAGTAACTACC+TGG + Chr1:65309822-65309841 None:intergenic 40.0%
GTCTATCCAATGCAACAACT+GGG - Chr1:65310794-65310813 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
GTTGTCTGGGAAAAACATGA+CGG - Chr1:65312248-65312267 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
GTTGTGCCTAACTTCTTTCA+GGG - Chr1:65313798-65313817 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
TAAAGGACATCACAAAGGGT+AGG + Chr1:65311568-65311587 None:intergenic 40.0%
TAATGGCCCTGAAAGAAGTT+AGG + Chr1:65313807-65313826 None:intergenic 40.0%
TACCTTGTTGATGTTGCTGA+TGG - Chr1:65311227-65311246 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
TCAGAAAATTGGGCACAAGA+AGG - Chr1:65311973-65311992 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
TCTATCCAATGCAACAACTG+GGG - Chr1:65310795-65310814 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
TCTTGCTGGTGTATGCATAA+AGG - Chr1:65313124-65313143 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
TGGTTTCATTCCTGTGATTC+AGG - Chr1:65313587-65313606 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
TGTCTATCCAATGCAACAAC+TGG - Chr1:65310793-65310812 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
TGTTGTGCCTAACTTCTTTC+AGG - Chr1:65313797-65313816 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
TTACTAATATCAGCCTGTCC+TGG + Chr1:65311473-65311492 None:intergenic 40.0%
TTCCATCAACATGGGTTCTA+TGG - Chr1:65315019-65315038 MsG0180003620.01.T02:intron 40.0%
TTCCATCAGCAACATCAACA+AGG + Chr1:65311232-65311251 None:intergenic 40.0%
TTGTCTGGGAAAAACATGAC+GGG - Chr1:65312249-65312268 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
TTTGCAAATTAGGCCCTGTT+TGG - Chr1:65310985-65311004 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
! AACAGCTACTCTGGAAACAA+CGG - Chr1:65313010-65313029 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
! ACTGGACAAAACCCCATTTT+TGG - Chr1:65315193-65315212 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
! AGTAGTTTAAGGCCTTACTC+GGG + Chr1:65314166-65314185 None:intergenic 40.0%
! ATCTCCATAGCATTGAGAAG+AGG + Chr1:65311623-65311642 None:intergenic 40.0%
! CATGCATAATGGAACTCTCA+AGG - Chr1:65313701-65313720 MsG0180003620.01.T02:CDS 40.0%
! CGCATGGACTAAGTATCAAT+TGG - Chr1:65313828-65313847 MsG0180003620.01.T02:intron 40.0%
! CTGAGGGCAACATTTTTGTA+TGG - Chr1:65310628-65310647 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
! GTACATTGCGATCTGAAGTA+AGG + Chr1:65313935-65313954 None:intergenic 40.0%
! TCTAACTTACCGGTTGAACT+TGG - Chr1:65311355-65311374 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTTTTACGAGGCTAAGCT+AGG + Chr1:65312147-65312166 None:intergenic 40.0%
!! CCCAATTTTCTGAAGAGTAG+TGG + Chr1:65311966-65311985 None:intergenic 40.0%
!! GAGAAGAAAATTGGTTCTGG+AGG - Chr1:65313366-65313385 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGATTATTGGTTCAGCACT+CGG - Chr1:65313070-65313089 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
!! GTGGTAACAGTTTGTTGTCT+GGG - Chr1:65312235-65312254 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
!! TATGTAGTACTTGGGTTGGA+TGG - Chr1:65311908-65311927 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATTATTGGTTCAGCACTC+GGG - Chr1:65313071-65313090 MsG0180003620.01.T01:intron 40.0%
!!! CAGTATTTTCTGGAATCAGC+AGG + Chr1:65310571-65310590 None:intergenic 40.0%
!!! GAACTCTTTTTTGCCTTGGT+AGG + Chr1:65313463-65313482 None:intergenic 40.0%
!!! TGCTGCTTTTTAGGTCTCTA+TGG + Chr1:65314024-65314043 None:intergenic 40.0%
!!! TTTCTTTTGGGGCTACTCAT+TGG - Chr1:65310689-65310708 MsG0180003620.01.T01:CDS 40.0%
AAAAATGACGGCTCTCCTGA+TGG - Chr1:65311659-65311678 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
AACTACGCTAGAAACATGGG+AGG + Chr1:65314119-65314138 None:intergenic 45.0%
ACACACTTGATGTTGTCACC+AGG - Chr1:65310593-65310612 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
ACAGCCGTAGTAGGTACAAA+TGG - Chr1:65311329-65311348 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
ACAGTTCCCTCAAATTCGGA+AGG + Chr1:65312610-65312629 None:intergenic 45.0%
ACCAGATTTCACTGGATGCA+TGG - Chr1:65312436-65312455 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
AGAAGAGTCACCTGAATCAC+AGG + Chr1:65313600-65313619 None:intergenic 45.0%
AGGTCTCTATGGATAACTGC+AGG + Chr1:65314013-65314032 None:intergenic 45.0%
CCGAACTACGCTAGAAACAT+GGG + Chr1:65314122-65314141 None:intergenic 45.0%
CTAGGAATGAAGAAGCCAAC+AGG + Chr1:65312129-65312148 None:intergenic 45.0%
CTTTCGAAACTCGCTGTTGA+TGG - Chr1:65314091-65314110 MsG0180003620.01.T02:CDS 45.0%
GAAAATTGGGCACAAGAAGG+GGG - Chr1:65311976-65311995 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
GACCATGGAACAGGTAAACA+TGG + Chr1:65312006-65312025 None:intergenic 45.0%
GAGAGAGAGAAGAGGAAGAA+AGG + Chr1:65309756-65309775 None:intergenic 45.0%
GCATCTGAGCGTAGGAAAAA+GGG + Chr1:65309800-65309819 None:intergenic 45.0%
GCTGTCTGCATTACTTTCAC+TGG + Chr1:65311314-65311333 None:intergenic 45.0%
GCTGTTGATCTGAGCTACAT+CGG + Chr1:65312035-65312054 None:intergenic 45.0%
GGATGAATGAGAGAGAGAAG+AGG + Chr1:65309764-65309783 None:intergenic 45.0%
GGGATTGAGTATCTTCACAC+AGG - Chr1:65313980-65313999 MsG0180003620.01.T02:intron 45.0%
GGTCTCTATGGATAACTGCA+GGG + Chr1:65314012-65314031 None:intergenic 45.0%
GTCTGCATTACTTTCACTGG+TGG + Chr1:65311311-65311330 None:intergenic 45.0%
TATGGTTGCAGATGGCTTGA+TGG - Chr1:65312392-65312411 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
TCATACTCTCCACGTAATGC+TGG + Chr1:65314825-65314844 None:intergenic 45.0%
TCCATGCATCCAGTGAAATC+TGG + Chr1:65312440-65312459 None:intergenic 45.0%
TCTGTCTTCAACAGCTACTC+TGG - Chr1:65313001-65313020 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
TGAACCTTTGGCAGAATCCT+CGG + Chr1:65313873-65313892 None:intergenic 45.0%
TGACAAGGACATGAGAGCTA+AGG - Chr1:65314054-65314073 MsG0180003620.01.T02:CDS 45.0%
TTATCCTCGCAGAAACACTG+AGG + Chr1:65310897-65310916 None:intergenic 45.0%
TTCAACCAAACCGGTCAATC+TGG + Chr1:65312295-65312314 None:intergenic 45.0%
TTCAGGTGACTCTTCTGTCA+AGG - Chr1:65313604-65313623 MsG0180003620.01.T02:CDS 45.0%
TTGATGTTGTCACCAGGACA+AGG - Chr1:65310599-65310618 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
TTGGACATCACCAGATTGAC+CGG - Chr1:65312282-65312301 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
TTTACCTGTTCCATGGTCGT+GGG - Chr1:65312008-65312027 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
! AAGTTCTGACGGTACAGTTC+CGG + Chr1:65312868-65312887 None:intergenic 45.0%
! ACTTACCGGTTGAACTTGGA+TGG - Chr1:65311359-65311378 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
! CAGGACAAGGTATCTACTGA+GGG - Chr1:65310612-65310631 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
! CAGTTATGTTGTGTTGCTGG+TGG - Chr1:65312216-65312235 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
! GTCAATCTGGTGATGTCCAA+AGG + Chr1:65312282-65312301 None:intergenic 45.0%
! TGCGATCTGAAGTAAGGGAA+GGG + Chr1:65313929-65313948 None:intergenic 45.0%
! TTGCGATCTGAAGTAAGGGA+AGG + Chr1:65313930-65313949 None:intergenic 45.0%
! TTTACCTCAGTGTTTCTGCG+AGG - Chr1:65310890-65310909 MsG0180003620.01.T01:CDS 45.0%
!! CATGTTTCTAGCGTAGTTCG+GGG - Chr1:65314121-65314140 MsG0180003620.01.T02:CDS 45.0%
!! CCATGTTTCTAGCGTAGTTC+GGG - Chr1:65314120-65314139 MsG0180003620.01.T02:CDS 45.0%
!! CCCATGTTTCTAGCGTAGTT+CGG - Chr1:65314119-65314138 MsG0180003620.01.T02:CDS 45.0%
!! GATTATTGGTTCAGCACTCG+GGG - Chr1:65313072-65313091 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
!! GGTGGTAACAGTTTGTTGTC+TGG - Chr1:65312234-65312253 MsG0180003620.01.T01:intron 45.0%
!! AAAGAAAAAAAAAAAAAAAA+AGG + Chr1:65312533-65312552 None:intergenic 5.0%
ACACTCACACTATCGTGCAG+TGG + Chr1:65315096-65315115 None:intergenic 50.0%
ATAGCTGTATGCCCATCCAG+TGG + Chr1:65311393-65311412 None:intergenic 50.0%
ATTGCCGAGGATTCTGCCAA+AGG - Chr1:65313866-65313885 MsG0180003620.01.T02:intron 50.0%
CACTCACACTATCGTGCAGT+GGG + Chr1:65315095-65315114 None:intergenic 50.0%
CATCACCAGATTGACCGGTT+TGG - Chr1:65312287-65312306 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
CCCGAACTACGCTAGAAACA+TGG + Chr1:65314123-65314142 None:intergenic 50.0%
CCTCAGTAGATACCTTGTCC+TGG + Chr1:65310614-65310633 None:intergenic 50.0%
CTCGGCAAATTAAGTCGGGA+CGG + Chr1:65313540-65313559 None:intergenic 50.0%
CTTTCAGGGCCATTAACGCA+TGG - Chr1:65313812-65313831 MsG0180003620.01.T02:intron 50.0%
GGATATCTGGATCCCGAGTA+AGG - Chr1:65314151-65314170 MsG0180003620.01.T02:CDS 50.0%
GGCATCTGAGCGTAGGAAAA+AGG + Chr1:65309801-65309820 None:intergenic 50.0%
GGCCCAATACCAGATTTCAC+TGG - Chr1:65312428-65312447 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
GGGGAACCTTCCGAATTTGA+GGG - Chr1:65312601-65312620 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
GGGTCCTCTTCTCAATGCTA+TGG - Chr1:65311616-65311635 MsG0180003620.01.T01:CDS 50.0%
GTAATGCAGACAGCCGTAGT+AGG - Chr1:65311320-65311339 MsG0180003620.01.T01:CDS 50.0%
GTATTGCTTCCGCGTCTCAT+TGG + Chr1:65310530-65310549 None:intergenic 50.0%
GTTTACCTGTTCCATGGTCG+TGG - Chr1:65312007-65312026 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
TCGGGGTACAGTAGGATATC+TGG - Chr1:65314138-65314157 MsG0180003620.01.T02:CDS 50.0%
TGAGGTGGAGACTTACCATC+AGG + Chr1:65311677-65311696 None:intergenic 50.0%
TGGAAAGCGAGAGTCACACA+AGG + Chr1:65315150-65315169 None:intergenic 50.0%
TGGGGAACCTTCCGAATTTG+AGG - Chr1:65312600-65312619 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
TTTCGGTTGCCAATGAGACG+CGG - Chr1:65310518-65310537 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
! AGCATTGAGAAGAGGACCCT+TGG + Chr1:65311615-65311634 None:intergenic 50.0%
! ATGGTTTTCCTGCCACTGGA+TGG - Chr1:65311378-65311397 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
! CATGACGGGAGACATTCCTT+TGG - Chr1:65312263-65312282 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
! CCAGGACAAGGTATCTACTG+AGG - Chr1:65310611-65310630 MsG0180003620.01.T01:CDS 50.0%
! GGAGGTATGTATGGAACCTG+CGG - Chr1:65310198-65310217 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
! TGGTTTTCCTGCCACTGGAT+GGG - Chr1:65311379-65311398 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
! TTGGATGGTTTTCCTGCCAC+TGG - Chr1:65311374-65311393 MsG0180003620.01.T01:intron 50.0%
! TTTTCCTACGCTCAGATGCC+AGG - Chr1:65309801-65309820 MsG0180003620.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
!! ACTTGGGTTGGATGGTTTGC+AGG - Chr1:65311916-65311935 MsG0180003620.01.T01:CDS 50.0%
ACTACCTGGCATCTGAGCGT+AGG + Chr1:65309808-65309827 None:intergenic 55.0%
AGAGCGGCTCATTACCTGAC+TGG + Chr1:65310943-65310962 None:intergenic 55.0%
AGCGTAGTTCGGGGTACAGT+AGG - Chr1:65314130-65314149 MsG0180003620.01.T02:CDS 55.0%
ATTCGGAAGGTTCCCCAGAG+TGG + Chr1:65312597-65312616 None:intergenic 55.0%
CAGAGAGTGATGCTCCAGTC+AGG - Chr1:65310926-65310945 MsG0180003620.01.T01:CDS 55.0%
CAGGCTAGTACTTCCAGGAC+AGG - Chr1:65311457-65311476 MsG0180003620.01.T01:intron 55.0%
TAAGCGACTCGAGATTGCCG+AGG - Chr1:65313853-65313872 MsG0180003620.01.T02:intron 55.0%
TCGTGCAGTGGGTCTAGCAA+TGG + Chr1:65315084-65315103 None:intergenic 55.0%
TGGCTCCCCAGTTGTTGCAT+TGG + Chr1:65310803-65310822 None:intergenic 55.0%
TTGCAGCACACGCACACATG+CGG - Chr1:65314889-65314908 MsG0180003620.01.T02:intron 55.0%
AGGTGTACTCCCAGCCACTC+TGG - Chr1:65312580-65312599 MsG0180003620.01.T01:intron 60.0%
CTACATCGGACCCACGACCA+TGG + Chr1:65312021-65312040 None:intergenic 60.0%
CTGTATGCCCATCCAGTGGC+AGG + Chr1:65311389-65311408 None:intergenic 60.0%
GAAGGTTCCCCAGAGTGGCT+GGG + Chr1:65312592-65312611 None:intergenic 60.0%
GGTGTACTCCCAGCCACTCT+GGG - Chr1:65312581-65312600 MsG0180003620.01.T01:intron 60.0%
GTGTACTCCCAGCCACTCTG+GGG - Chr1:65312582-65312601 MsG0180003620.01.T01:intron 60.0%
! CGGGGCCGCCATTCTACTTT+TGG - Chr1:65313090-65313109 MsG0180003620.01.T01:intron 60.0%
CGGACCCACGACCATGGAAC+AGG + Chr1:65312015-65312034 None:intergenic 65.0%
GGAAGGTTCCCCAGAGTGGC+TGG + Chr1:65312593-65312612 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 65309747 65315242 65309747 ID=MsG0180003620.01;Name=MsG0180003620.01
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Chr1 exon 65309747 65310212 65309747 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50618;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65310591 65310726 65310591 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50617;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65310822 65311008 65310822 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50616;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65311102 65311170 65311102 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50615;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65311254 65311380 65311254 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50614;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65311498 65311733 65311498 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50613;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65311820 65311974 65311820 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50612;Parent=MsG0180003620.01.T01
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Chr1 exon 65312362 65312433 65312362 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50610;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65312518 65312586 65312518 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50609;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65312673 65312744 65312673 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50608;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65312919 65313051 65312919 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50607;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 exon 65313309 65313545 65313309 ID=MsG0180003620.01.T01:exon:50606;Parent=MsG0180003620.01.T01
Chr1 five_prime_UTR 65313412 65313545 65313412 ID=MsG0180003620.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0180003620.01.T01
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