AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005686.01

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MsG0180005686.01.T01 AT4G23180 46.809 611 293 7 35 627 43 639 0.0 561
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MsG0180005686.01.T01 AT4G23130 46.777 605 285 7 45 625 43 634 0.0 535
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MsG0180005686.01.T01 AT4G23270 44.268 628 326 9 11 627 4 618 0.0 531
MsG0180005686.01.T01 AT4G23160 45.425 612 305 8 33 625 47 648 0.0 531
MsG0180005686.01.T01 AT4G23270 44.268 628 326 9 11 627 4 618 0.0 530
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MsG0180005686.01.T01 AT4G23280 43.436 617 311 9 36 627 33 636 5.07e-174 511
MsG0180005686.01.T01 AT4G11530 44.674 629 301 8 42 633 32 650 7.12e-174 511
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MsG0180005686.01.T01 AT4G23180 47.201 536 251 7 35 552 43 564 1.64e-164 484
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MsG0180005686.01.T01 AT4G21230 43.279 610 308 10 42 635 41 628 5.67e-164 485
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MsG0180005686.01.T01 AT4G23190 43.826 575 285 10 96 640 11 577 7.13e-164 483
MsG0180005686.01.T01 AT4G23200 42.056 642 344 10 16 636 3 637 3.98e-162 481
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MsG0180005686.01.T01 AT4G23320 50.211 474 216 10 185 653 40 498 2.58e-154 455
MsG0180005686.01.T01 AT4G23320 50.211 474 216 10 185 653 61 519 4.06e-154 456
MsG0180005686.01.T01 AT4G23250 42.770 657 315 14 10 625 8 644 4.90e-153 459
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MsG0180005686.01.T01 AT4G03230 50.262 382 168 4 266 625 527 908 1.16e-117 374
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MsG0180005686.01.T01 AT1G11330 49.593 369 168 2 275 625 445 813 4.94e-117 370
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MsG0180005686.01.T01 AT1G56120 40.936 342 193 6 267 608 481 813 8.32e-77 263
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MsG0180005686.01.T01 AT1G53420 39.895 381 215 8 255 630 546 917 9.02e-76 261
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MsG0180005686.01.T01 AT1G07650 40.571 350 196 4 281 622 407 752 5.39e-75 257
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MsG0180005686.01.T01 AT1G29740 47.902 286 144 4 324 607 665 947 3.29e-74 258
MsG0180005686.01.T01 AT1G61860 42.587 317 171 5 301 607 44 359 4.28e-74 244
MsG0180005686.01.T01 AT1G07650 36.000 450 257 6 195 622 499 939 4.36e-74 257
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MsG0180005686.01.T01 AT1G07650 40.571 350 196 4 281 622 626 971 1.97e-73 256
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MsG0180005686.01.T01 AT4G11900 49.789 237 106 2 279 502 467 703 4.34e-70 241
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MsG0180005686.01.T01 AT3G45430 39.306 346 192 8 276 617 288 619 4.60e-69 238
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MsG0180005686.01.T01 AT1G55200 40.070 287 169 3 324 609 367 651 2.57e-67 233
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MsG0180005686.01.T01 AT2G18470 39.216 306 177 5 312 613 263 563 6.57e-67 231
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MsG0180005686.01.T01 AT1G68690 40.656 305 163 6 318 613 360 655 8.75e-66 230
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MsG0180005686.01.T01 AT3G13690 37.952 332 185 5 324 647 399 717 1.52e-65 230
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MsG0180005686.01.T01 AT5G18610 37.273 330 200 4 299 621 42 371 5.73e-65 223
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MsG0180005686.01.T01 AT1G70110 38.924 316 187 4 297 611 308 618 5.62e-64 224
MsG0180005686.01.T01 AT3G59750 36.735 343 207 4 272 611 243 578 6.13e-64 223
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MsG0180005686.01.T01 AT4G01330 38.966 290 165 5 324 607 150 433 1.06e-63 219
MsG0180005686.01.T01 AT2G20300 40.550 291 167 3 324 613 337 622 1.19e-63 224
MsG0180005686.01.T01 AT4G01330 38.966 290 165 5 324 607 150 433 1.33e-63 218
MsG0180005686.01.T01 AT5G56790 40.136 294 173 3 324 616 378 669 1.46e-63 223
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MsG0180005686.01.T01 AT1G79620 39.373 287 161 6 324 604 652 931 9.78e-59 214
MsG0180005686.01.T01 AT1G52290 41.784 213 122 2 324 536 131 341 9.89e-59 202
MsG0180005686.01.T01 AT1G72540 36.949 295 176 5 324 610 72 364 1.01e-58 204
MsG0180005686.01.T01 AT1G79620 39.373 287 161 6 324 604 626 905 1.01e-58 213
MsG0180005686.01.T01 AT4G02010 31.442 423 264 10 250 652 281 697 1.04e-58 211
MsG0180005686.01.T01 AT3G01300 37.162 296 173 4 323 607 123 416 1.14e-58 205
MsG0180005686.01.T01 AT2G05940 35.647 317 194 4 310 618 61 375 1.15e-58 204
MsG0180005686.01.T01 AT2G39360 35.312 337 204 3 281 604 420 755 1.20e-58 212
MsG0180005686.01.T01 AT1G70450 38.462 299 173 6 318 609 31 325 1.62e-58 202
MsG0180005686.01.T01 AT5G18910 36.552 290 166 5 324 607 180 457 1.84e-58 205
MsG0180005686.01.T01 AT3G46760 37.415 294 171 5 324 615 38 320 1.97e-58 200
MsG0180005686.01.T01 AT5G60320 37.415 294 178 4 324 617 336 623 2.08e-58 209
MsG0180005686.01.T01 AT5G01020 33.518 361 212 7 319 656 52 407 5.08e-58 201
MsG0180005686.01.T01 AT2G39660 36.977 311 177 5 324 619 55 361 6.18e-58 201
MsG0180005686.01.T01 AT4G18250 35.813 363 204 12 276 625 305 651 1.29e-57 207
MsG0180005686.01.T01 AT2G28930 36.335 322 184 6 304 610 39 354 1.36e-57 200
MsG0180005686.01.T01 AT4G13190 44.144 222 122 2 317 536 52 273 1.51e-57 196
MsG0180005686.01.T01 AT2G28930 36.335 322 184 6 304 610 42 357 1.51e-57 200
MsG0180005686.01.T01 AT2G28930 36.335 322 184 6 304 610 50 365 1.53e-57 201
MsG0180005686.01.T01 AT5G61350 37.979 287 170 3 324 604 513 797 1.65e-57 209
MsG0180005686.01.T01 AT5G48740 35.714 336 208 5 277 607 545 877 1.74e-57 209
MsG0180005686.01.T01 AT1G61590 36.364 319 186 8 304 610 66 379 2.06e-57 200
MsG0180005686.01.T01 AT5G16000 34.270 356 208 7 266 607 240 583 2.24e-57 205
MsG0180005686.01.T01 AT4G32000 37.762 286 173 3 324 607 160 442 2.68e-57 201
MsG0180005686.01.T01 AT5G60280 39.456 294 168 8 324 615 327 612 3.25e-57 205
MsG0180005686.01.T01 AT1G66910 32.697 419 254 11 212 622 235 633 4.23e-57 205
MsG0180005686.01.T01 AT5G35580 36.741 313 188 4 306 610 46 356 7.05e-57 201
MsG0180005686.01.T01 AT2G26290 34.304 309 193 4 310 610 62 368 7.73e-57 199
MsG0180005686.01.T01 AT5G35580 36.741 313 188 4 306 610 58 368 8.66e-57 201
MsG0180005686.01.T01 AT5G16500 38.176 296 173 5 324 612 62 354 9.72e-57 203
MsG0180005686.01.T01 AT3G55450 36.190 315 179 6 324 620 86 396 1.03e-56 198
MsG0180005686.01.T01 AT4G00340 39.731 297 157 9 324 607 451 738 1.14e-56 206
MsG0180005686.01.T01 AT4G00340 39.731 297 157 9 324 607 472 759 1.25e-56 206
MsG0180005686.01.T01 AT3G55450 36.190 315 179 6 324 620 49 359 1.25e-56 197
MsG0180005686.01.T01 AT3G09830 36.789 299 177 4 323 610 71 368 1.35e-56 198
MsG0180005686.01.T01 AT3G09830 36.789 299 177 4 323 610 71 368 1.35e-56 198
MsG0180005686.01.T01 AT3G09830 36.789 299 177 4 323 610 71 368 1.35e-56 198
MsG0180005686.01.T01 AT3G05140 38.235 306 182 5 324 628 131 430 1.42e-56 199
MsG0180005686.01.T01 AT4G30520 37.176 347 192 10 274 607 239 572 1.45e-56 203
MsG0180005686.01.T01 AT1G69790 36.877 301 169 5 324 610 61 354 1.46e-56 196
MsG0180005686.01.T01 AT5G59700 33.151 365 217 6 258 604 394 749 1.48e-56 206
MsG0180005686.01.T01 AT1G69790 36.877 301 169 5 324 610 72 365 1.80e-56 196
MsG0180005686.01.T01 AT2G25220 36.364 308 185 4 301 607 70 367 2.18e-56 196
MsG0180005686.01.T01 AT2G25220 36.364 308 185 4 301 607 119 416 2.23e-56 197
MsG0180005686.01.T01 AT2G25220 36.364 308 185 4 301 607 124 421 2.57e-56 197
MsG0180005686.01.T01 AT4G32710 39.161 286 159 5 252 535 317 589 3.07e-56 204
MsG0180005686.01.T01 AT3G05140 38.235 306 182 5 324 628 179 478 3.52e-56 199
MsG0180005686.01.T01 AT5G54590 36.513 304 180 5 307 610 89 379 3.74e-56 197
MsG0180005686.01.T01 AT5G54590 36.513 304 180 5 307 610 89 379 3.74e-56 197
MsG0180005686.01.T01 AT5G54590 36.513 304 180 5 307 610 89 379 3.74e-56 197
MsG0180005686.01.T01 AT2G35620 33.419 389 236 11 242 619 206 582 4.01e-56 201
MsG0180005686.01.T01 AT2G35620 33.419 389 236 11 242 619 206 582 4.01e-56 201
MsG0180005686.01.T01 AT2G35620 33.419 389 236 11 242 619 206 582 4.01e-56 201
MsG0180005686.01.T01 AT2G35620 33.419 389 236 11 242 619 206 582 4.01e-56 201
MsG0180005686.01.T01 AT5G01950 37.584 298 162 5 324 610 529 813 4.03e-56 205
MsG0180005686.01.T01 AT2G37050 36.158 354 202 10 267 603 526 872 4.31e-56 206
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MsG0180005686.01.T01 AT5G01950 37.584 298 162 5 324 610 614 898 8.15e-56 205
MsG0180005686.01.T01 AT5G01950 37.584 298 162 5 324 610 614 898 8.15e-56 205
MsG0180005686.01.T01 AT1G66920 33.333 363 224 6 269 622 233 586 8.99e-56 200
MsG0180005686.01.T01 AT5G54380 39.362 282 168 3 324 604 498 777 9.04e-56 204
MsG0180005686.01.T01 AT1G66920 36.424 302 187 3 323 622 296 594 9.20e-56 200
MsG0180005686.01.T01 AT5G02290 36.538 312 179 6 316 612 48 355 1.18e-55 194
MsG0180005686.01.T01 AT5G02290 36.538 312 179 6 316 612 48 355 1.18e-55 194
MsG0180005686.01.T01 AT2G07180 34.639 332 207 4 324 647 78 407 1.29e-55 196
MsG0180005686.01.T01 AT2G07180 34.639 332 207 4 324 647 78 407 1.29e-55 196
MsG0180005686.01.T01 AT5G35960 34.347 329 192 6 298 614 90 406 1.36e-55 195
MsG0180005686.01.T01 AT1G16130 37.857 280 173 1 324 603 404 682 1.68e-55 202
MsG0180005686.01.T01 AT1G66910 32.388 423 253 11 212 622 235 636 1.76e-55 201
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MsG0180005686.01.T01 AT3G45440 38.413 315 187 5 301 615 310 617 1.93e-55 200
MsG0180005686.01.T01 AT3G45440 38.413 315 187 5 301 615 310 617 1.93e-55 200
MsG0180005686.01.T01 AT3G62220 39.576 283 162 3 332 607 65 345 2.08e-55 193
MsG0180005686.01.T01 AT3G62220 39.576 283 162 3 332 607 65 345 2.08e-55 193
MsG0180005686.01.T01 AT1G30570 38.542 288 176 1 323 610 507 793 2.28e-55 202
MsG0180005686.01.T01 AT1G31420 39.100 289 164 8 335 619 305 585 2.57e-55 199

Find 122 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 235 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAATAAGATTCTTGCATAAT+TGG 0.151448 1:-94919500 None:intergenic
TTTCTCAAATTTAGATTATA+TGG 0.152950 1:+94919993 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR
TGCTCCTTGGCCAGAAGTTT+TGG 0.196026 1:-94918385 None:intergenic
AGTCTTGATCACTTCCTATT+TGG 0.206727 1:+94918531 MsG0180005686.01.T01:CDS
CAGATTCATCTTCATGAAAA+TGG 0.218912 1:+94916933 MsG0180005686.01.T01:CDS
CCACTGGCTGCTGTTTATTA+TGG 0.232893 1:+94917983 MsG0180005686.01.T01:CDS
CAAGCTGCACTTTCTCTTGA+TGG 0.234581 1:+94917063 MsG0180005686.01.T01:CDS
GAACGGTATAGTATCATAAA+AGG 0.253782 1:+94918685 MsG0180005686.01.T01:CDS
AGAAATTTAGTGAGGTTAAT+AGG 0.257742 1:+94918453 MsG0180005686.01.T01:CDS
GATTGCCATCATTGTTGTTT+TGG 0.290396 1:+94917936 MsG0180005686.01.T01:CDS
TAAATTTCTGTGTTGAAGTT+TGG 0.293051 1:-94918439 None:intergenic
TGTCCATGCATTGCATATTC+TGG 0.295040 1:-94919192 None:intergenic
AGAGAAAGTGCAGCTTGTTT+TGG 0.302631 1:-94917057 None:intergenic
CCCATTGTTGGTCTATCATC+TGG 0.314182 1:-94919578 None:intergenic
TGCTGTTTGGTGTGAATGTT+TGG 0.343123 1:-94916660 None:intergenic
TCAATAATGTCATACCAAAT+AGG 0.352712 1:-94918545 None:intergenic
TTGGCTGTGGTTCTGTCCAC+TGG 0.360713 1:+94917967 MsG0180005686.01.T01:CDS
AATGATTCAAACAAAGTCTA+TGG 0.363110 1:+94916769 MsG0180005686.01.T01:CDS
GCTGGACATGAATCATATTC+AGG 0.371452 1:+94919704 MsG0180005686.01.T01:CDS
AAGAGACTGTCCAAAACTTC+TGG 0.381071 1:+94918375 MsG0180005686.01.T01:CDS
TCTGCCAGTGTAACGCTATA+TGG 0.383466 1:+94917120 MsG0180005686.01.T01:CDS
TTCTCAAATTTAGATTATAT+GGG 0.389593 1:+94919994 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR
CACTCTCTGCATAGAGCAAA+TGG 0.390597 1:-94916817 None:intergenic
AACCACAATTCGTAGATTCT+CGG 0.398766 1:+94918638 MsG0180005686.01.T01:intron
GTGAAGAGAGAACGGTGTTA+AGG 0.404960 1:-94916696 None:intergenic
CATCCTTGCCATGCCAAAAT+CGG 0.409774 1:-94918818 None:intergenic
GGTTTCAGGCTTGGAATCAA+TGG 0.409994 1:+94919447 MsG0180005686.01.T01:intron
TTTATGATACTATACCGTTC+AGG 0.413965 1:-94918682 None:intergenic
GGAATCTCAATCTTGTATCT+AGG 0.417454 1:-94916964 None:intergenic
GGATGCAGAAGTTTCTGTTA+TGG 0.430072 1:-94916608 None:intergenic
GGCAGAACGAGAAGAAATTC+AGG 0.436604 1:+94919674 MsG0180005686.01.T01:CDS
ATTGTTGTGGTGGTAGCATA+GGG 0.443206 1:+94917223 MsG0180005686.01.T01:CDS
GTCTCTGAATGCTGATAAAA+CGG 0.444123 1:-94917291 None:intergenic
AATTGGTTTACTTTGTGTCC+AGG 0.450772 1:+94919550 MsG0180005686.01.T01:CDS
GAATGTTTGGTTGGTTGTGC+AGG 0.456336 1:-94916647 None:intergenic
GTAGAAAAGTGTGTGCAAAT+TGG 0.461678 1:+94919533 MsG0180005686.01.T01:CDS
AACTATTCCTTCTCCTCCTC+CGG 0.463506 1:+94919737 MsG0180005686.01.T01:CDS
TGAATCACCATTTCAGATGC+TGG 0.465098 1:+94919475 MsG0180005686.01.T01:CDS
AATGCTGGTTCCATGGGAAA+TGG 0.465811 1:-94919641 None:intergenic
GCTCTATGCAGAGAGTGTAT+TGG 0.468270 1:+94916823 MsG0180005686.01.T01:CDS
GTTTGGTGTGAATGTTTGGT+TGG 0.469483 1:-94916656 None:intergenic
GAAACAACAGTTCCCATTGT+TGG 0.469704 1:-94919590 None:intergenic
TACAAGATTGAGATTCCAAT+GGG 0.469884 1:+94916970 MsG0180005686.01.T01:CDS
ATCACAGCTTCTTTAGAAGA+AGG 0.471350 1:-94916877 None:intergenic
AGCAGCAGCAACAACAACTA+AGG 0.471401 1:+94917317 MsG0180005686.01.T01:CDS
AACAATTAACTTGGCCTGAA+CGG 0.472495 1:+94918668 MsG0180005686.01.T01:CDS
GATTGTTGTGGTGGTAGCAT+AGG 0.474003 1:+94917222 MsG0180005686.01.T01:CDS
ACTTGTCAGCCGGAGATTGT+AGG 0.476725 1:+94917163 MsG0180005686.01.T01:CDS
CTTCTAAAGAAGCTGTGATC+TGG 0.479906 1:+94916881 MsG0180005686.01.T01:CDS
ATTGGATCCAGCATCTGAAA+TGG 0.483974 1:-94919482 None:intergenic
TTAGAAGAAGGACAAGATGA+TGG 0.485139 1:-94916865 None:intergenic
ATGAGACACCACCGGCCACC+GGG 0.485177 1:-94919852 None:intergenic
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GACAACCAAAACAACAATGA+TGG 0.493684 1:-94917941 None:intergenic
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ATGCTTGTATTATACCCCGG+TGG 0.774632 1:+94919837 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR

CRISPR-GE

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!!! TATTACAATTTTTTTTTTGA+AGG + Chr1:94917630-94917649 MsG0180005686.01.T01:intron 10.0%
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! AAGAAGAATTGCAATTGTAA+AGG + Chr1:94917675-94917694 MsG0180005686.01.T01:intron 25.0%
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! AATGATTCAAACAAAGTCTA+TGG + Chr1:94916769-94916788 MsG0180005686.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAATTTAGTGAGGTTAAT+AGG + Chr1:94918453-94918472 MsG0180005686.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAGAATTGCAATTGTAAA+GGG + Chr1:94917676-94917695 MsG0180005686.01.T01:intron 25.0%
! CCCAAAAATGCAAATTAATA+AGG + Chr1:94919390-94919409 MsG0180005686.01.T01:intron 25.0%
! GAATAAGATTCTTGCATAAT+TGG - Chr1:94919503-94919522 None:intergenic 25.0%
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! GTTGAAAAATCTAACATCAT+TGG - Chr1:94916737-94916756 None:intergenic 25.0%
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! TAAGAAGATTTAATTGTGTG+TGG + Chr1:94917858-94917877 MsG0180005686.01.T01:intron 25.0%
! TCAATAATGTCATACCAAAT+AGG - Chr1:94918548-94918567 None:intergenic 25.0%
! TGTGCTTGAATTTAAAAACT+CGG + Chr1:94918148-94918167 MsG0180005686.01.T01:CDS 25.0%
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!!! TTTTCTGAAGATAGCAAAAT+AGG + Chr1:94918218-94918237 MsG0180005686.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTCCTTTTTTTGTCAG+TGG + Chr1:94919159-94919178 MsG0180005686.01.T01:intron 25.0%
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AAAGTTCAATCTCATCTGTT+TGG + Chr1:94918611-94918630 MsG0180005686.01.T01:intron 30.0%
AAATGCAATTGATGTTGCAT+TGG + Chr1:94917787-94917806 MsG0180005686.01.T01:intron 30.0%
AAGCAAAAACAAATAGGGTT+TGG - Chr1:94919341-94919360 None:intergenic 30.0%
AATATGACAATGTTTGACAG+GGG + Chr1:94917891-94917910 MsG0180005686.01.T01:intron 30.0%
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ATACAAGATTGAGATTCCAA+TGG + Chr1:94916969-94916988 MsG0180005686.01.T01:CDS 30.0%
ATGTAACCACTGACAAAAAA+AGG - Chr1:94919168-94919187 None:intergenic 30.0%
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CAATTCCACATGAAAAAGTT+TGG - Chr1:94917481-94917500 None:intergenic 30.0%
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CATTGCTTGGTTTAATATCA+CGG - Chr1:94918765-94918784 None:intergenic 30.0%
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GGAAGCAAAAACAATTAACT+TGG + Chr1:94918659-94918678 MsG0180005686.01.T01:CDS 30.0%
TACAAGATTGAGATTCCAAT+GGG + Chr1:94916970-94916989 MsG0180005686.01.T01:CDS 30.0%
TATTTATGGATGTGATCACA+AGG - Chr1:94917833-94917852 None:intergenic 30.0%
TCAAACCTAACAAAACAACT+TGG - Chr1:94917264-94917283 None:intergenic 30.0%
TCAATATGACAATGTTTGAC+AGG + Chr1:94917889-94917908 MsG0180005686.01.T01:intron 30.0%
TCTTCATGAAAATGGAAACA+TGG + Chr1:94916941-94916960 MsG0180005686.01.T01:CDS 30.0%
TTAATTTATGGTTTCAGGCT+TGG + Chr1:94919438-94919457 MsG0180005686.01.T01:intron 30.0%
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TTTATGATACTATACCGTTC+AGG - Chr1:94918685-94918704 None:intergenic 30.0%
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!!! TGTTGTTTTGGTTGTCATTT+TGG + Chr1:94917948-94917967 MsG0180005686.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGTTTTTAGTTTTGGAGTGA+TGG + Chr1:94919233-94919252 MsG0180005686.01.T01:CDS 30.0%
AAAACCAGATGATCAAACAC+AGG - Chr1:94918092-94918111 None:intergenic 35.0%
AACCACAATTCGTAGATTCT+CGG + Chr1:94918638-94918657 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
AAGATAGCAAAATAGGCAGA+GGG + Chr1:94918225-94918244 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
ACAAGATTGAGATTCCAATG+GGG + Chr1:94916971-94916990 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
AGGACATACAAATAGAGTTG+TGG + Chr1:94918861-94918880 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
AGTATGAAAGACTACTAACG+AGG - Chr1:94919770-94919789 None:intergenic 35.0%
AGTCTTGATCACTTCCTATT+TGG + Chr1:94918531-94918550 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
ATATGACAATGTTTGACAGG+GGG + Chr1:94917892-94917911 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
CATAAGATTAATCCTCGGAT+CGG + Chr1:94917451-94917470 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
CATATTAGTTGGGTCAACTA+AGG + Chr1:94917579-94917598 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
CTTAGTTGACCCAACTAATA+TGG - Chr1:94917581-94917600 None:intergenic 35.0%
CTTCCAACACCATATTAGTT+GGG + Chr1:94917569-94917588 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
GAATTTCCTAAGGATTGTTG+TGG + Chr1:94917210-94917229 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
GACAACCAAAACAACAATGA+TGG - Chr1:94917944-94917963 None:intergenic 35.0%
GGAATCTCAATCTTGTATCT+AGG - Chr1:94916967-94916986 None:intergenic 35.0%
GGACATACAAATAGAGTTGT+GGG + Chr1:94918862-94918881 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
GTAGCTATAGAACAAGTTCA+AGG + Chr1:94918841-94918860 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
GTCTCTGAATGCTGATAAAA+CGG - Chr1:94917294-94917313 None:intergenic 35.0%
TCTTCCAACACCATATTAGT+TGG + Chr1:94917568-94917587 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
TTAGAAGAAGGACAAGATGA+TGG - Chr1:94916868-94916887 None:intergenic 35.0%
! AACAATTAACTTGGCCTGAA+CGG + Chr1:94918668-94918687 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
! AATTGGTTTACTTTGTGTCC+AGG + Chr1:94919550-94919569 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
! ATCACAGCTTCTTTAGAAGA+AGG - Chr1:94916880-94916899 None:intergenic 35.0%
! ATGCCAAAATCGGAGATTTT+TGG - Chr1:94918811-94918830 None:intergenic 35.0%
! GTAGAAAAGTGTGTGCAAAT+TGG + Chr1:94919533-94919552 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
! TCTAACATCATTGGTTACGT+TGG - Chr1:94916728-94916747 None:intergenic 35.0%
! TTTTGAATTCTTCTGCTCCT+TGG - Chr1:94918401-94918420 None:intergenic 35.0%
!! AAAAATCTCCGATTTTGGCA+TGG + Chr1:94918810-94918829 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGAAAAATGCTGGTTCCAT+GGG - Chr1:94919650-94919669 None:intergenic 35.0%
!! GTATCTTTTCTTGGTCTTCA+AGG - Chr1:94918485-94918504 None:intergenic 35.0%
!!! GACATCCAAACTTTTTCATG+TGG + Chr1:94917473-94917492 MsG0180005686.01.T01:intron 35.0%
!!! GATTGCCATCATTGTTGTTT+TGG + Chr1:94917936-94917955 MsG0180005686.01.T01:CDS 35.0%
!!! GCATTTTTGGGGTCTATATA+AGG - Chr1:94919381-94919400 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTTGTGGAAAGTGCTGTT+TGG - Chr1:94916676-94916695 None:intergenic 35.0%
AAGACCATATAGCGTTACAC+TGG - Chr1:94917127-94917146 None:intergenic 40.0%
AAGAGACTGTCCAAAACTTC+TGG + Chr1:94918375-94918394 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
AAGGGTTCATGACTGTGATA+AGG - Chr1:94917745-94917764 None:intergenic 40.0%
AATGCCTGTGTTTGATCATC+TGG + Chr1:94918085-94918104 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
ACCATGCTTGTATTATACCC+CGG + Chr1:94919834-94919853 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AGAAATTCAGGCTATTCAGC+TGG + Chr1:94919686-94919705 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
AGATAGCAAAATAGGCAGAG+GGG + Chr1:94918226-94918245 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
AGCGCGCCAAAATATCTTTA+TGG + Chr1:94917408-94917427 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
ATATGTGAATGAGACACCAC+CGG - Chr1:94919863-94919882 None:intergenic 40.0%
ATCATAAAAGGGATTGCTCG+AGG + Chr1:94918697-94918716 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTCCTCGAGATTATTAG+TGG + Chr1:94919252-94919271 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGATCCAGCATCTGAAA+TGG - Chr1:94919485-94919504 None:intergenic 40.0%
ATTGTTGTGGTGGTAGCATA+GGG + Chr1:94917223-94917242 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
CAAGATTGAGATTCCAATGG+GGG + Chr1:94916972-94916991 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
CCAGATGATAGACCAACAAT+GGG + Chr1:94919578-94919597 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
CCTGCCATAAGATTAATCCT+CGG + Chr1:94917446-94917465 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
CGATCCGAGGATTAATCTTA+TGG - Chr1:94917453-94917472 None:intergenic 40.0%
CGGGTCAAAGATGCTAATTA+TGG - Chr1:94917384-94917403 None:intergenic 40.0%
GAAACAACAGTTCCCATTGT+TGG - Chr1:94919593-94919612 None:intergenic 40.0%
GAAGATAGCAAAATAGGCAG+AGG + Chr1:94918224-94918243 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
GATCCTCTGCAACTAAAGTA+GGG + Chr1:94919061-94919080 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
GCAGGTAACATTGTTGAACA+CGG - Chr1:94916632-94916651 None:intergenic 40.0%
GCTGGACATGAATCATATTC+AGG + Chr1:94919704-94919723 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGAAAGTGAAGAGAGAA+CGG - Chr1:94916707-94916726 None:intergenic 40.0%
GGATGCAGAAGTTTCTGTTA+TGG - Chr1:94916611-94916630 None:intergenic 40.0%
GGGTATAATACAAGCATGGT+TGG - Chr1:94919834-94919853 None:intergenic 40.0%
TATCTATGCGCAAGCATATG+TGG - Chr1:94916503-94916522 None:intergenic 40.0%
TATGACAATGTTTGACAGGG+GGG + Chr1:94917893-94917912 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
TATGGTCTCTATATGTGTCG+TGG + Chr1:94916787-94916806 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
TCCAGATGATAGACCAACAA+TGG + Chr1:94919577-94919596 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
TGAATCACCATTTCAGATGC+TGG + Chr1:94919475-94919494 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
TGACCCAACTAATATGGTGT+TGG - Chr1:94917575-94917594 None:intergenic 40.0%
TGAGACGAGAATCTTCATGA+AGG - Chr1:94918732-94918751 None:intergenic 40.0%
TGATCCTCTGCAACTAAAGT+AGG + Chr1:94919060-94919079 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
TGTCCATGCATTGCATATTC+TGG - Chr1:94919195-94919214 None:intergenic 40.0%
TTCCGAGAATCTACGAATTG+TGG - Chr1:94918643-94918662 None:intergenic 40.0%
TTCTACTAGCATAGCCATGA+TGG - Chr1:94919118-94919137 None:intergenic 40.0%
TTTCCTAAGGATTGTTGTGG+TGG + Chr1:94917213-94917232 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTGATATGCCATTTCCCA+TGG + Chr1:94919631-94919650 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
! ATTACGGTTTTCTCTGTGAC+TGG - Chr1:94918034-94918053 None:intergenic 40.0%
! CTTCTAAAGAAGCTGTGATC+TGG + Chr1:94916881-94916900 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
! GAACCAGCATTTTTCATGCA+CGG + Chr1:94919653-94919672 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
! GGTACAACGAGTGTTTGTTA+AGG + Chr1:94916902-94916921 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
! GTCTATCATCTGGATTTTCC+TGG - Chr1:94919571-94919590 None:intergenic 40.0%
!! ACAGCTATTTCTTGTCCACT+AGG - Chr1:94918354-94918373 None:intergenic 40.0%
!! ACTACAATAGCCGATTTTGG+AGG - Chr1:94917509-94917528 None:intergenic 40.0%
!! AGAGAAAGTGCAGCTTGTTT+TGG - Chr1:94917060-94917079 None:intergenic 40.0%
!! CATGAAAAATGCTGGTTCCA+TGG - Chr1:94919651-94919670 None:intergenic 40.0%
!! GAACGGTGTTAAGGTTTTTG+TGG - Chr1:94916690-94916709 None:intergenic 40.0%
!! GTTTGGTGTGAATGTTTGGT+TGG - Chr1:94916659-94916678 None:intergenic 40.0%
!! TGCTGTTTGGTGTGAATGTT+TGG - Chr1:94916663-94916682 None:intergenic 40.0%
!! TTTTAGGGAACTCTTCCTAG+TGG + Chr1:94918336-94918355 MsG0180005686.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTGGTTGTCATTTTGGCTG+TGG + Chr1:94917954-94917973 MsG0180005686.01.T01:CDS 40.0%
AAAATAGGCAGAGGGGGATA+TGG + Chr1:94918233-94918252 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
AACTATTCCTTCTCCTCCTC+CGG + Chr1:94919737-94919756 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
ACCGGGGTATAATACAAGCA+TGG - Chr1:94919838-94919857 None:intergenic 45.0%
AGCAGCAGCAACAACAACTA+AGG + Chr1:94917317-94917336 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
ATGATGGCAATCACAGTCGT+TGG - Chr1:94917928-94917947 None:intergenic 45.0%
ATGCTTGTATTATACCCCGG+TGG + Chr1:94919837-94919856 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CAAGCTGCACTTTCTCTTGA+TGG + Chr1:94917063-94917082 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
CACTCTCTGCATAGAGCAAA+TGG - Chr1:94916820-94916839 None:intergenic 45.0%
CATCCTTGCCATGCCAAAAT+CGG - Chr1:94918821-94918840 None:intergenic 45.0%
CCATAATAAACAGCAGCCAG+TGG - Chr1:94917986-94918005 None:intergenic 45.0%
CCGAGGATTAATCTTATGGC+AGG - Chr1:94917449-94917468 None:intergenic 45.0%
CTACCACCACAACAATCCTT+AGG - Chr1:94917219-94917238 None:intergenic 45.0%
CTACTAACGAGGACATACAC+CGG - Chr1:94919759-94919778 None:intergenic 45.0%
GATAGCAAAATAGGCAGAGG+GGG + Chr1:94918227-94918246 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
GATTGTTGTGGTGGTAGCAT+AGG + Chr1:94917222-94917241 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
GCAGCAGCAACAACAACTAA+GGG + Chr1:94917318-94917337 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
GGCAGAACGAGAAGAAATTC+AGG + Chr1:94919674-94919693 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
GGGATATGGACAAGTCTACA+AGG + Chr1:94918247-94918266 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
GGTTTCAGGCTTGGAATCAA+TGG + Chr1:94919447-94919466 MsG0180005686.01.T01:intron 45.0%
TCGCCAGAATATGCAATGCA+TGG + Chr1:94919189-94919208 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
TCTGCCAGTGTAACGCTATA+TGG + Chr1:94917120-94917139 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
TGCGGTGGTAGAATTTCCTA+AGG + Chr1:94917200-94917219 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
TTGTTGTGGTGGTAGCATAG+GGG + Chr1:94917224-94917243 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
! CCACTGGCTGCTGTTTATTA+TGG + Chr1:94917983-94918002 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
! CCCATTGTTGGTCTATCATC+TGG - Chr1:94919581-94919600 None:intergenic 45.0%
! GAATGTTTGGTTGGTTGTGC+AGG - Chr1:94916650-94916669 None:intergenic 45.0%
! GCTCTATGCAGAGAGTGTAT+TGG + Chr1:94916823-94916842 MsG0180005686.01.T01:CDS 45.0%
! GTGAAGAGAGAACGGTGTTA+AGG - Chr1:94916699-94916718 None:intergenic 45.0%
!! AATGCTGGTTCCATGGGAAA+TGG - Chr1:94919644-94919663 None:intergenic 45.0%
!!! ATATTTTGGCGCGCTTACTC+GGG - Chr1:94917403-94917422 None:intergenic 45.0%
!!! GATATTTTGGCGCGCTTACT+CGG - Chr1:94917404-94917423 None:intergenic 45.0%
!!! TAATCATTTATTTATTATTT+TGG + Chr1:94918956-94918975 MsG0180005686.01.T01:intron 5.0%
AACAAAACAGGGTCCCCCAT+TGG - Chr1:94916988-94917007 None:intergenic 50.0%
AAGTTTGGATGTCCGATCCG+AGG - Chr1:94917466-94917485 None:intergenic 50.0%
ACTTGTCAGCCGGAGATTGT+AGG + Chr1:94917163-94917182 MsG0180005686.01.T01:CDS 50.0%
AGATTGTAGGCGGTGTATCG+AGG + Chr1:94917176-94917195 MsG0180005686.01.T01:CDS 50.0%
CTGCCGTGCATGAAAAATGC+TGG - Chr1:94919659-94919678 None:intergenic 50.0%
CTGTCCAAAACTTCTGGCCA+AGG + Chr1:94918381-94918400 MsG0180005686.01.T01:CDS 50.0%
GATACACCGCCTACAATCTC+CGG - Chr1:94917175-94917194 None:intergenic 50.0%
GGAGGAGAAGGAATAGTTGG+TGG - Chr1:94919735-94919754 None:intergenic 50.0%
GGAGGAGGAGAAGGAATAGT+TGG - Chr1:94919738-94919757 None:intergenic 50.0%
TGGCCCTACTTTAGTTGCAG+AGG - Chr1:94919067-94919086 None:intergenic 50.0%
TTGTATTATACCCCGGTGGC+CGG + Chr1:94919841-94919860 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
! AGTTGTTGTTGCTGCTGCTG+AGG - Chr1:94917316-94917335 None:intergenic 50.0%
! TGCTCCTTGGCCAGAAGTTT+TGG - Chr1:94918388-94918407 None:intergenic 50.0%
!! CGATTTTGGCATGGCAAGGA+TGG + Chr1:94918819-94918838 MsG0180005686.01.T01:CDS 50.0%
!! TCTCCGATTTTGGCATGGCA+AGG + Chr1:94918815-94918834 MsG0180005686.01.T01:CDS 50.0%
ACATACACCGGAGGAGGAGA+AGG - Chr1:94919747-94919766 None:intergenic 55.0%
CAATCTCCGGCTGACAAGTC+CGG - Chr1:94917162-94917181 None:intergenic 55.0%
CTAACGAGGACATACACCGG+AGG - Chr1:94919756-94919775 None:intergenic 55.0%
TAGGCGGTGTATCGAGGATG+CGG + Chr1:94917182-94917201 MsG0180005686.01.T01:CDS 55.0%
TGTCAGCCGGAGATTGTAGG+CGG + Chr1:94917166-94917185 MsG0180005686.01.T01:CDS 55.0%
! TTGGCTGTGGTTCTGTCCAC+TGG + Chr1:94917967-94917986 MsG0180005686.01.T01:CDS 55.0%
AATGAGACACCACCGGCCAC+CGG - Chr1:94919856-94919875 None:intergenic 60.0%
ACGAGGACATACACCGGAGG+AGG - Chr1:94919753-94919772 None:intergenic 60.0%
TATTATACCCCGGTGGCCGG+TGG + Chr1:94919844-94919863 MsG0180005686.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
! TGGTCTTGCTCAGTGCACGC+CGG + Chr1:94917140-94917159 MsG0180005686.01.T01:CDS 60.0%
ATGAGACACCACCGGCCACC+GGG - Chr1:94919855-94919874 None:intergenic 65.0%
GCGGTGTATCGAGGATGCGG+TGG + Chr1:94917185-94917204 MsG0180005686.01.T01:CDS 65.0%
TGCACGCCGGACTTGTCAGC+CGG + Chr1:94917153-94917172 MsG0180005686.01.T01:CDS 65.0%
TGAGACACCACCGGCCACCG+GGG - Chr1:94919854-94919873 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 94916486 94920071 94916486 ID=MsG0180005686.01;Name=MsG0180005686.01
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