AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006581.01

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MsG0280006581.01.T01 AT5G07280 38.032 376 214 8 408 771 821 1189 8.86e-68 245
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MsG0280006581.01.T01 AT5G38560 34.772 394 227 9 406 773 227 616 1.60e-63 226
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MsG0280006581.01.T01 AT5G03140 36.533 375 193 9 411 774 310 650 1.08e-61 221
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MsG0280006581.01.T01 AT5G60300 34.474 380 212 7 411 789 284 627 1.97e-56 207
MsG0280006581.01.T01 AT2G01950 39.867 301 163 3 489 771 826 1126 2.06e-56 211
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MsG0280006581.01.T01 AT5G18910 36.082 291 179 4 489 778 180 464 2.96e-55 199
MsG0280006581.01.T01 AT1G66910 33.493 418 235 11 403 810 271 655 3.55e-55 202
MsG0280006581.01.T01 AT1G66920 33.661 407 229 11 410 807 240 614 3.57e-55 201
MsG0280006581.01.T01 AT5G37450 39.000 300 173 4 489 784 619 912 3.94e-55 206
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MsG0280006581.01.T01 AT1G07570 39.934 303 160 8 486 771 53 350 3.99e-55 196
MsG0280006581.01.T01 AT1G29750 54.054 185 81 3 485 666 663 846 4.01e-55 205
MsG0280006581.01.T01 AT1G66910 36.712 365 206 11 458 810 307 658 4.01e-55 202
MsG0280006581.01.T01 AT5G37450 39.000 300 173 4 489 784 595 888 4.40e-55 206
MsG0280006581.01.T01 AT1G07570 40.000 300 158 8 489 771 67 361 4.45e-55 196
MsG0280006581.01.T01 AT5G59260 33.978 362 203 6 417 776 302 629 4.52e-55 202
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MsG0280006581.01.T01 AT2G05940 39.322 295 163 8 488 772 77 365 5.45e-55 197
MsG0280006581.01.T01 AT5G35580 39.597 298 162 8 490 772 60 354 5.51e-55 198
MsG0280006581.01.T01 AT5G37450 39.000 300 173 4 489 784 643 936 5.58e-55 206
MsG0280006581.01.T01 AT2G17220 36.741 313 176 6 475 771 60 366 5.91e-55 196
MsG0280006581.01.T01 AT5G35580 39.286 308 167 9 482 772 62 366 6.00e-55 198
MsG0280006581.01.T01 AT5G60320 37.771 323 185 6 460 781 316 623 6.07e-55 202
MsG0280006581.01.T01 AT1G66920 34.000 400 223 11 417 807 239 606 6.35e-55 200
MsG0280006581.01.T01 AT5G56790 37.543 293 179 4 489 779 378 668 8.10e-55 201
MsG0280006581.01.T01 AT3G45430 39.735 302 175 5 489 789 332 627 1.08e-54 201
MsG0280006581.01.T01 AT3G45430 39.735 302 175 5 489 789 332 627 1.08e-54 201
MsG0280006581.01.T01 AT3G45430 39.735 302 175 5 489 789 332 627 1.08e-54 201
MsG0280006581.01.T01 AT2G39660 35.650 331 194 6 489 801 55 384 1.60e-54 194
MsG0280006581.01.T01 AT4G39400 38.796 299 173 4 480 771 860 1155 2.88e-54 204
MsG0280006581.01.T01 AT1G70110 39.661 295 171 6 489 780 332 622 3.57e-54 199
MsG0280006581.01.T01 AT5G01020 39.456 294 162 8 488 771 59 346 5.41e-54 193
MsG0280006581.01.T01 AT2G02220 39.068 279 167 3 496 772 729 1006 6.61e-54 202
MsG0280006581.01.T01 AT2G02800 36.624 314 169 9 486 779 68 371 7.48e-54 193
MsG0280006581.01.T01 AT2G02800 36.624 314 169 9 486 779 68 371 7.48e-54 193
MsG0280006581.01.T01 AT1G34300 30.297 505 295 18 290 775 294 760 1.01e-53 201
MsG0280006581.01.T01 AT1G16150 33.787 367 222 5 416 777 350 700 1.37e-53 199
MsG0280006581.01.T01 AT2G01820 33.511 376 225 9 423 775 494 867 1.46e-53 201
MsG0280006581.01.T01 AT1G78530 34.444 360 202 10 420 771 11 344 1.94e-53 189
MsG0280006581.01.T01 AT1G31420 34.656 378 212 11 411 781 233 582 2.17e-53 196
MsG0280006581.01.T01 AT1G51890 34.309 376 216 9 404 772 216 567 3.58e-53 195
MsG0280006581.01.T01 AT3G05140 38.732 284 168 4 489 771 131 409 3.67e-53 192
MsG0280006581.01.T01 AT2G28930 38.047 297 168 6 489 771 57 351 3.78e-53 191
MsG0280006581.01.T01 AT5G38280 37.539 317 183 10 477 784 308 618 4.23e-53 196
MsG0280006581.01.T01 AT2G28930 38.047 297 168 6 489 771 60 354 4.62e-53 190
MsG0280006581.01.T01 AT1G14370 36.624 314 178 9 486 783 71 379 4.86e-53 191
MsG0280006581.01.T01 AT5G38280 37.539 317 183 10 477 784 308 618 6.24e-53 196
MsG0280006581.01.T01 AT1G67720 36.280 328 200 4 445 771 557 876 7.28e-53 199
MsG0280006581.01.T01 AT2G28930 38.047 297 168 6 489 771 68 362 8.88e-53 190
MsG0280006581.01.T01 AT2G28590 38.926 298 168 7 489 777 86 378 9.27e-53 190
MsG0280006581.01.T01 AT3G45410 37.462 331 187 8 460 785 310 625 1.00e-52 195
MsG0280006581.01.T01 AT1G16120 34.174 357 214 5 416 767 355 695 1.17e-52 196
MsG0280006581.01.T01 AT4G29050 39.865 296 169 7 489 779 332 623 1.19e-52 195
MsG0280006581.01.T01 AT3G05140 38.732 284 168 4 489 771 179 457 1.25e-52 192
MsG0280006581.01.T01 AT2G35620 39.130 276 162 5 507 781 310 580 1.33e-52 193
MsG0280006581.01.T01 AT2G35620 39.130 276 162 5 507 781 310 580 1.33e-52 193
MsG0280006581.01.T01 AT2G35620 39.130 276 162 5 507 781 310 580 1.33e-52 193
MsG0280006581.01.T01 AT2G35620 39.130 276 162 5 507 781 310 580 1.33e-52 193
MsG0280006581.01.T01 AT1G79620 32.181 376 215 9 405 768 558 905 1.40e-52 198
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MsG0280006581.01.T01 AT4G29050 39.865 296 169 7 489 779 346 637 1.45e-52 195
MsG0280006581.01.T01 AT3G59700 37.627 295 176 6 489 779 326 616 1.51e-52 194
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MsG0280006581.01.T01 AT1G78530 38.163 283 152 6 420 701 11 271 1.98e-52 184
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MsG0280006581.01.T01 AT2G43690 37.884 293 176 5 489 779 289 577 3.47e-52 193
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MsG0280006581.01.T01 AT1G31420 34.656 378 213 11 411 781 233 583 3.79e-52 192
MsG0280006581.01.T01 AT5G62710 31.525 387 234 8 399 777 225 588 4.16e-52 192
MsG0280006581.01.T01 AT2G39360 35.196 358 211 9 414 764 408 751 4.18e-52 196
MsG0280006581.01.T01 AT3G28690 36.304 303 173 7 485 772 59 356 4.26e-52 188
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MsG0280006581.01.T01 AT2G43690 37.884 293 176 5 489 779 325 613 6.90e-52 193
MsG0280006581.01.T01 AT1G66150 32.653 392 225 12 415 773 482 867 7.68e-52 196
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MsG0280006581.01.T01 AT2G43700 36.770 291 173 6 489 774 300 584 8.77e-52 192
MsG0280006581.01.T01 AT2G43700 36.770 291 173 6 489 774 300 584 8.77e-52 192
MsG0280006581.01.T01 AT2G43700 36.770 291 173 6 489 774 300 584 8.77e-52 192
MsG0280006581.01.T01 AT1G24650 33.846 390 228 12 393 764 439 816 8.97e-52 195
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MsG0280006581.01.T01 AT5G38250 37.110 353 195 9 467 806 278 616 1.31e-51 191
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MsG0280006581.01.T01 AT2G07180 36.624 314 175 9 479 773 61 369 1.32e-51 187
MsG0280006581.01.T01 AT2G18890 38.966 290 153 9 489 763 56 336 1.45e-51 184
MsG0280006581.01.T01 AT3G28690 36.304 303 173 7 485 772 110 407 1.50e-51 188
MsG0280006581.01.T01 AT5G61350 31.224 474 289 11 328 768 328 797 1.54e-51 194
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MsG0280006581.01.T01 AT1G16260 35.889 287 180 3 488 772 377 661 1.79e-51 192
MsG0280006581.01.T01 AT2G43700 36.770 291 173 6 489 774 324 608 1.82e-51 191
MsG0280006581.01.T01 AT4G17660 37.217 309 177 7 475 771 65 368 1.98e-51 185

Find 147 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 258 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CATCACCACTGATGGCATTA+TGG 0.202922 2:-3678966 None:intergenic
ATGAATCTGAGACAAAATTT+TGG 0.225318 2:-3679197 None:intergenic
CAGTGCAAGAACAATCTTTA+AGG 0.237850 2:-3676371 None:intergenic
AAACCCTGTTCTTCATCTTT+TGG 0.244094 2:+3675607 MsG0280006581.01.T01:CDS
AATCCAAAGATATCAGATTT+TGG 0.247655 2:+3678291 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACCTTTGTTCTGTGACTATT+AGG 0.252442 2:+3679380 MsG0280006581.01.T01:three_prime_UTR
CGAAATCTTGTACGGCTCTT+TGG 0.258174 2:+3677921 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATACCAAAATCTGATATCTT+TGG 0.264234 2:-3678294 None:intergenic
GATTCAAGATGGTGGAAAAT+TGG 0.276237 2:+3675523 MsG0280006581.01.T01:CDS
GAGATAAGATGAAGTAGATT+TGG 0.293324 2:-3675274 None:intergenic
TTACATGTCCAAGGAGATTT+AGG 0.297491 2:-3678608 None:intergenic
GAGGCTTTGGAACTGTTTAC+AGG 0.300004 2:+3677619 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCATGGAATGGTCAATCTTT+TGG 0.307438 2:+3675890 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCAACACAACCACTTCAAAA+TGG 0.309925 2:+3675405 MsG0280006581.01.T01:CDS
GTCACAGTTACAATAATAAA+TGG 0.321215 2:+3679106 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACCATATAGGATTATCTGTT+TGG 0.323022 2:-3675556 None:intergenic
TATCCACCCATTGCATATTC+AGG 0.331655 2:-3678492 None:intergenic
CAAAATGGTACTTAGGTATA+TGG 0.334286 2:+3675420 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTGTTCCACAAGTAAATATC+TGG 0.351842 2:-3675842 None:intergenic
AAAACAACAGTAACTATATA+TGG 0.352069 2:+3675666 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTCCTGATAAAATATTTGTT+TGG 0.355296 2:+3675453 MsG0280006581.01.T01:CDS
GAAGCTGACAGAGGATCTTC+TGG 0.360877 2:+3677165 MsG0280006581.01.T01:CDS
GTTTGATTTGATGACCATAT+AGG 0.366376 2:-3675569 None:intergenic
AAACTTGGAGAAGGAGGCTT+TGG 0.366609 2:+3677606 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATCACCACTGATGGCATTAT+GGG 0.376590 2:-3678965 None:intergenic
ACCCCTCTTGAAAATTCTAA+TGG 0.378794 2:+3675491 MsG0280006581.01.T01:CDS
CAAAGAGTTGCAAGCTAGAT+TGG 0.390259 2:+3678145 MsG0280006581.01.T01:CDS
AGGGTTTGTAACAGAGGAAA+TGG 0.392624 2:-3675591 None:intergenic
TCTAGTACAATGAGAATTGT+TGG 0.393621 2:+3678348 MsG0280006581.01.T01:CDS
AGGACAAAACCAGGGTGCTT+TGG 0.404889 2:-3679022 None:intergenic
TCATCCAAAAGATGAAGAAC+AGG 0.405011 2:-3675611 None:intergenic
AAATAACTATCTCCAGTTGA+TGG 0.409064 2:-3675797 None:intergenic
ACCAAACAGATAATCCTATA+TGG 0.409317 2:+3675555 MsG0280006581.01.T01:CDS
GAAGCTTATTATTATCCTGC+AGG 0.419209 2:+3675974 MsG0280006581.01.T01:CDS
GGGTGTTTAGAACTGGTTCA+TGG 0.420494 2:+3675873 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGAATGCAGGAATGATTGC+TGG 0.422742 2:+3677198 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTCTCTTTAGCTAATAAACT+TGG 0.425913 2:+3677591 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCCTGATAAAATATTTGTTT+GGG 0.426447 2:+3675454 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGAGATTGTGATGCAGTTA+AGG 0.427276 2:-3675330 None:intergenic
CAACAAAGGGTGTTTAGAAC+TGG 0.428275 2:+3675866 MsG0280006581.01.T01:CDS
CCAACTGATACTTTGTTACC+AGG 0.429140 2:+3675704 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATTATAGTCTTGTTGATATG+AGG 0.429739 2:+3676445 MsG0280006581.01.T01:CDS
AATCAAGATGATCCATCAAC+TGG 0.433883 2:+3675785 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATATGATCACTCCCAAAATC+AGG 0.445784 2:-3677242 None:intergenic
TTTGTCCTTGGAAGGAATCC+AGG 0.451930 2:+3679037 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATGAGGCAGTTTACTGAAGC+TGG 0.460599 2:+3676462 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCGAGATTCGAGTAACTTCA+TGG 0.463733 2:+3675759 MsG0280006581.01.T01:CDS
TGGTTGCTGCATTGAGAAAG+AGG 0.463962 2:+3677941 MsG0280006581.01.T01:CDS
TATTTCAGTCTTGATTATCA+TGG 0.466233 2:+3675815 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTCAATTTACACTTCAGTAA+AGG 0.467591 2:-3679286 None:intergenic
AGATTAGCAGCTTCTGATGT+AGG 0.469365 2:+3676501 MsG0280006581.01.T01:CDS
TGTGAATTCGACCGGTTCAA+TGG 0.470697 2:+3676027 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAACCAGGGTGCTTTGGTTG+TGG 0.472867 2:-3679016 None:intergenic
TGCATAACGTTCCATTGAAC+CGG 0.472877 2:-3676038 None:intergenic
GCTAATGAAGAGATAACTAA+TGG 0.473933 2:+3676399 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGAGGTTGTCAACAAGCTC+TGG 0.474043 2:+3677843 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTTGTGGAGATACAAGGGTT+TGG 0.474334 2:-3675361 None:intergenic
GCAGCTATTGTGCTTAGTAT+TGG 0.475599 2:-3675920 None:intergenic
ATGAAGATAAAGTAACCCTT+TGG 0.479818 2:-3678199 None:intergenic
TGATAAAATATTTGTTTGGG+TGG 0.481402 2:+3675457 MsG0280006581.01.T01:CDS
CACCAAATAAAATAGAATCT+AGG 0.484283 2:-3678001 None:intergenic
GAACAAGAGTATGACATTGT+TGG 0.484980 2:+3676332 MsG0280006581.01.T01:CDS
GAGATAACTAATGGTGGGAC+AGG 0.494285 2:+3676408 MsG0280006581.01.T01:CDS
GAACAGGGTAGGTTAGTAGA+TGG 0.494395 2:+3677804 MsG0280006581.01.T01:intron
TGGAGATACAAGGGTTTGGT+TGG 0.494897 2:-3675357 None:intergenic
TTAACTGCATCACAATCTCT+TGG 0.499053 2:+3675332 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCAGATGACCTAAATCTCCT+TGG 0.501201 2:+3678600 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATTAGGTGTAAGTACCTCTC+TGG 0.501350 2:-3677317 None:intergenic
TACCAGGGATGAAACTTGGT+TGG 0.502224 2:+3675720 MsG0280006581.01.T01:CDS
CATATGATACTGAACCTCAT+TGG 0.502298 2:-3678168 None:intergenic
ATAAGTGGAATGAAGAATAG+AGG 0.502594 2:+3678567 MsG0280006581.01.T01:CDS
GTGGGACAGGTTGTGTTATG+TGG 0.503343 2:+3676421 MsG0280006581.01.T01:CDS
GCTAATAAACTTGGAGAAGG+AGG 0.506553 2:+3677600 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACCTCTTCACAGCAATGTCC+TGG 0.510451 2:-3677827 None:intergenic
TGTGATAGGCATGGAGGCTA+TGG 0.514047 2:+3678822 MsG0280006581.01.T01:intron
TTGTTACCAGGGATGAAACT+TGG 0.516339 2:+3675716 MsG0280006581.01.T01:CDS
CATTGTTGGAATGTGAAAAC+AGG 0.518409 2:+3676346 MsG0280006581.01.T01:CDS
CAAGATTTAGAATCATCCAT+AGG 0.519038 2:+3678229 MsG0280006581.01.T01:CDS
TATCAAGAATCAAAGGCAAT+GGG 0.524533 2:+3676197 MsG0280006581.01.T01:CDS
CTTGTGGAACAAGCAACAAA+GGG 0.528957 2:+3675853 MsG0280006581.01.T01:CDS
AGACTTGTTGTGAATTCGAC+CGG 0.529951 2:+3676019 MsG0280006581.01.T01:CDS
GGGTAGGTTAGTAGATGGCC+AGG 0.530944 2:+3677809 MsG0280006581.01.T01:intron
TTCCAACCAAGTTTCATCCC+TGG 0.532619 2:-3675722 None:intergenic
TTTAGAACTGGTTCATGGAA+TGG 0.534160 2:+3675878 MsG0280006581.01.T01:CDS
TGCTTGCCTTGAGATCCCTA+TGG 0.541564 2:-3678245 None:intergenic
GAATCTCGACGCCAGTGTCA+AGG 0.544752 2:-3675745 None:intergenic
ACCACTTCAAAATGGTACTT+AGG 0.545870 2:+3675413 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATTCACCTGGATTCCTTCCA+AGG 0.546339 2:-3679042 None:intergenic
GTTATAAGATGCATACATGT+TGG 0.546731 2:+3678908 MsG0280006581.01.T01:CDS
GCAGAGAATATTCAGATGAC+AGG 0.548026 2:+3677505 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTCCTTCCAAGGACAAAACC+AGG 0.548756 2:-3679031 None:intergenic
GCATGGAGGCTATGGAATGA+AGG 0.549602 2:+3678830 MsG0280006581.01.T01:CDS
CTCGTGCTAGAAATCATAAG+TGG 0.549697 2:+3678552 MsG0280006581.01.T01:CDS
AATCATCCATAGGGATCTCA+AGG 0.553484 2:+3678239 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGATTTAGAATCATCCATA+GGG 0.555996 2:+3678230 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTAGCTAATAAACTTGGAGA+AGG 0.556151 2:+3677597 MsG0280006581.01.T01:CDS
GTGTTCCAGATATTTACTTG+TGG 0.559414 2:+3675837 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAACCAGGTAATTCTGATAG+AGG 0.561185 2:+3677444 MsG0280006581.01.T01:intron
AAGCTTATTATTATCCTGCA+GGG 0.561256 2:+3675975 MsG0280006581.01.T01:CDS
CCTGGTAACAAAGTATCAGT+TGG 0.561834 2:-3675704 None:intergenic
TTCAACATCATCACCACTGA+TGG 0.563831 2:-3678974 None:intergenic
ATATCAAGAATCAAAGGCAA+TGG 0.565406 2:+3676196 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACTTGTGGAACAAGCAACAA+AGG 0.567441 2:+3675852 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATCATATGTGGAATAGCCAA+AGG 0.569063 2:+3678183 MsG0280006581.01.T01:CDS
CTGATAGAGGTCAGAAAACA+CGG 0.573227 2:+3677457 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTCAACATCGAAATCTTGTA+CGG 0.575447 2:+3677913 MsG0280006581.01.T01:CDS
AATGAAGAGATAACTAATGG+TGG 0.575513 2:+3676402 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGTTTATTAGCTAAAGAGA+AGG 0.583592 2:-3677589 None:intergenic
AAATGTAGAATTCAAGAATG+AGG 0.585141 2:+3677872 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATGGAATGAAGGAAATGCAA+TGG 0.585667 2:+3678841 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATGAGGTTCAGTATCATATG+TGG 0.586553 2:+3678171 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTAGACTGTAACAACCCTGC+AGG 0.590144 2:-3675989 None:intergenic
TACAATAATAAATGGCAGGT+AGG 0.590262 2:+3679114 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATGTCTCCTGAATATGCAAT+GGG 0.590584 2:+3678486 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACTCTCAAGATTCAAGATGG+TGG 0.592016 2:+3675515 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATTCAAACAGTGGCAACTCA+AGG 0.593923 2:-3677539 None:intergenic
CAGTTACAATAATAAATGGC+AGG 0.600775 2:+3679110 MsG0280006581.01.T01:CDS
GGAACTCTCAAGATTCAAGA+TGG 0.603044 2:+3675512 MsG0280006581.01.T01:CDS
AGGCTTTGGAACTGTTTACA+GGG 0.603506 2:+3677620 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGGTTGTCTTACATTCCAT+AGG 0.603858 2:-3679362 None:intergenic
GCAAGCTAGATTGGCCAATG+AGG 0.605557 2:+3678154 MsG0280006581.01.T01:CDS
CTTGGTTGGAACCTTGACAC+TGG 0.608063 2:+3675734 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTGTCAACAAGCTCTGGACA+AGG 0.608306 2:+3677849 MsG0280006581.01.T01:CDS
AAGAACAGGGTTTGTAACAG+AGG 0.610086 2:-3675597 None:intergenic
ATGAAGAGATAACTAATGGT+GGG 0.610270 2:+3676403 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCATATGTGGAATAGCCAAA+GGG 0.610880 2:+3678184 MsG0280006581.01.T01:CDS
ATATTCAGATGACAGGAACA+TGG 0.612749 2:+3677512 MsG0280006581.01.T01:CDS
GATTTGATATCAAGAATCAA+AGG 0.619833 2:+3676190 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTGTAGCATCTGATATGACA+TGG 0.623292 2:-3677563 None:intergenic
CAACTGATACTTTGTTACCA+GGG 0.624216 2:+3675705 MsG0280006581.01.T01:CDS
TATGTCTCCTGAATATGCAA+TGG 0.624637 2:+3678485 MsG0280006581.01.T01:CDS
GTTCAATGGAACGTTATGCA+TGG 0.624789 2:+3676041 MsG0280006581.01.T01:CDS
GAAGATGAATCAGATTCACC+TGG 0.625356 2:-3679055 None:intergenic
CATCCAAAAGATGAAGAACA+GGG 0.629774 2:-3675610 None:intergenic
TCAGAAAACACGGTTATCTG+AGG 0.631531 2:+3677467 MsG0280006581.01.T01:CDS
GCCAGGACATTGCTGTGAAG+AGG 0.639351 2:+3677826 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACCTAATAGTCACAGAACAA+AGG 0.645898 2:-3679381 None:intergenic
GCTGACAGAGGATCTTCTGG+TGG 0.648270 2:+3677168 MsG0280006581.01.T01:CDS
ACAAACACACTTCTAGTCTG+TGG 0.649840 2:-3676309 None:intergenic
AAAGTGAATAATAGCCAGAG+AGG 0.655560 2:+3677303 MsG0280006581.01.T01:CDS
TTGCCACAACCAAAGCACCC+TGG 0.664907 2:+3679013 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCTCCTGAATATGCAATGGG+TGG 0.675092 2:+3678489 MsG0280006581.01.T01:CDS
CAGACCCATAATGCCATCAG+TGG 0.684041 2:+3678961 MsG0280006581.01.T01:CDS
TCCTTCCAAGGACAAAACCA+GGG 0.712420 2:-3679030 None:intergenic
ATGACATGGAATTCAAACAG+TGG 0.717268 2:-3677549 None:intergenic
ATGTGTTGTGATAGGCATGG+AGG 0.750473 2:+3678816 MsG0280006581.01.T01:intron

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGATTTATATATTAATAAAG+AGG - Chr2:3678441-3678460 None:intergenic 10.0%
!! AATGCAAAAAAATAAACAAA+GGG - Chr2:3676870-3676889 None:intergenic 15.0%
!! ACTAATGCATATATAAATAA+TGG - Chr2:3677657-3677676 None:intergenic 15.0%
!! ATTAAACAAAATATAGTAGT+TGG - Chr2:3678396-3678415 None:intergenic 15.0%
!! CAAGATATTTATGTTTATTT+GGG + Chr2:3677068-3677087 MsG0280006581.01.T01:intron 15.0%
!! TAATGCAAAAAAATAAACAA+AGG - Chr2:3676871-3676890 None:intergenic 15.0%
!! TTTAAAAAGACAAAAATGAT+TGG + Chr2:3677763-3677782 MsG0280006581.01.T01:intron 15.0%
!!! TTATCTCTATATTTTTTCAA+TGG + Chr2:3675290-3675309 MsG0280006581.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTGTTTTAGTTTTCTATA+TGG + Chr2:3676585-3676604 MsG0280006581.01.T01:intron 15.0%
!! AAAACAACAGTAACTATATA+TGG + Chr2:3675666-3675685 MsG0280006581.01.T01:CDS 20.0%
!! AAGTTAATGAACTCAAATTA+AGG - Chr2:3676990-3677009 None:intergenic 20.0%
!! GCAAGATATTTATGTTTATT+TGG + Chr2:3677067-3677086 MsG0280006581.01.T01:intron 20.0%
!! TATTAATAAAGAGGTCAATT+AGG - Chr2:3678432-3678451 None:intergenic 20.0%
!! TCCTGATAAAATATTTGTTT+GGG + Chr2:3675454-3675473 MsG0280006581.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCCTGATAAAATATTTGTT+TGG + Chr2:3675453-3675472 MsG0280006581.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCTATATGGAATTGTTAT+TGG + Chr2:3676597-3676616 MsG0280006581.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTGAGAAATTTTTCTGAT+GGG + Chr2:3676220-3676239 MsG0280006581.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATTTTTTGTTTGTTCCTA+TGG + Chr2:3679346-3679365 MsG0280006581.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
! AAATGTAGAATTCAAGAATG+AGG + Chr2:3677872-3677891 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTTTATTAGCTAAAGAGA+AGG - Chr2:3677592-3677611 None:intergenic 25.0%
! ATACCAAAATCTGATATCTT+TGG - Chr2:3678297-3678316 None:intergenic 25.0%
! ATATCATCTTGCATTAAGTT+TGG - Chr2:3677111-3677130 None:intergenic 25.0%
! ATTAGATGCATGTGTAAATT+TGG - Chr2:3678661-3678680 None:intergenic 25.0%
! ATTAGCACAAAATGATGTTA+AGG - Chr2:3678778-3678797 None:intergenic 25.0%
! CACCAAATAAAATAGAATCT+AGG - Chr2:3678004-3678023 None:intergenic 25.0%
! GATTTGATATCAAGAATCAA+AGG + Chr2:3676190-3676209 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! GTAGCAAAATAAAATGTTCT+AGG + Chr2:3678746-3678765 MsG0280006581.01.T01:intron 25.0%
! GTCACAGTTACAATAATAAA+TGG + Chr2:3679106-3679125 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! TATTTCAGTCTTGATTATCA+TGG + Chr2:3675815-3675834 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! TCAAAAATTGGAACAAAGTA+TGG + Chr2:3676073-3676092 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! TGATAAAATATTTGTTTGGG+TGG + Chr2:3675457-3675476 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGCACAAAATGATGTTAA+GGG - Chr2:3678777-3678796 None:intergenic 25.0%
! TTCAATTTACACTTCAGTAA+AGG - Chr2:3679289-3679308 None:intergenic 25.0%
! TTCTCTTTAGCTAATAAACT+TGG + Chr2:3677591-3677610 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATGTTTATTTGGGAAGA+AGG + Chr2:3677075-3677094 MsG0280006581.01.T01:intron 25.0%
!! AAATCTGATGTTTTCAGTTT+TGG + Chr2:3678525-3678544 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGATTTAGAATCATCCATA+GGG + Chr2:3678230-3678249 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!! AATCCAAAGATATCAGATTT+TGG + Chr2:3678291-3678310 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!! ACCCAAACAAATATTTTATC+AGG - Chr2:3675458-3675477 None:intergenic 25.0%
!! AGCCTAGATTCTATTTTATT+TGG + Chr2:3677999-3678018 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!! GATTTGAGAAATTTTTCTGA+TGG + Chr2:3676219-3676238 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTAAAAAATTTGGCTAGTT+AGG + Chr2:3676627-3676646 MsG0280006581.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTCTTTCTTCACTACATT+AGG + Chr2:3677364-3677383 MsG0280006581.01.T01:intron 25.0%
!!! ATGAATCTGAGACAAAATTT+TGG - Chr2:3679200-3679219 None:intergenic 25.0%
!!! ATTATAGTCTTGTTGATATG+AGG + Chr2:3676445-3676464 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTGAAGAGTGTTTTTTGTT+AGG + Chr2:3679303-3679322 MsG0280006581.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! TATTCATTTTGAGGAAGAAA+AGG + Chr2:3677262-3677281 MsG0280006581.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCTTTTTTCTCTAAACC+AGG + Chr2:3677429-3677448 MsG0280006581.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCCATTAGAATTTTCAAGA+GGG - Chr2:3675496-3675515 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTCTTGGACACATATT+AGG - Chr2:3678934-3678953 None:intergenic 25.0%
AAATAACTATCTCCAGTTGA+TGG - Chr2:3675800-3675819 None:intergenic 30.0%
AAATTAAGGACAAATCGTTC+GGG - Chr2:3676976-3676995 None:intergenic 30.0%
AACAAAGGGAATGAGAAAAA+CGG - Chr2:3676856-3676875 None:intergenic 30.0%
AAGCTTATTATTATCCTGCA+GGG + Chr2:3675975-3675994 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
AATGAAGAGATAACTAATGG+TGG + Chr2:3676402-3676421 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAACAGATAATCCTATA+TGG + Chr2:3675555-3675574 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
ACCATATAGGATTATCTGTT+TGG - Chr2:3675559-3675578 None:intergenic 30.0%
AGAAAAACAGAATTGGAATG+TGG + Chr2:3676249-3676268 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
AGCATAGTTAAGAGAACATT+AGG - Chr2:3677337-3677356 None:intergenic 30.0%
ATAAGTGGAATGAAGAATAG+AGG + Chr2:3678567-3678586 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
ATATCAAGAATCAAAGGCAA+TGG + Chr2:3676196-3676215 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAGAGATAACTAATGGT+GGG + Chr2:3676403-3676422 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAGATAAAGTAACCCTT+TGG - Chr2:3678202-3678221 None:intergenic 30.0%
ATTATCCTATGTGTTGTGAT+AGG + Chr2:3678808-3678827 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
CAAAATGGTACTTAGGTATA+TGG + Chr2:3675420-3675439 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
CAAATTAAGGACAAATCGTT+CGG - Chr2:3676977-3676996 None:intergenic 30.0%
CAGTTACAATAATAAATGGC+AGG + Chr2:3679110-3679129 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
CTTCAAAAGATAGTATGCAA+TGG + Chr2:3676672-3676691 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
GAGATAAGATGAAGTAGATT+TGG - Chr2:3675277-3675296 None:intergenic 30.0%
GCTAATGAAGAGATAACTAA+TGG + Chr2:3676399-3676418 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
GCTCTTCAATGTGATAATTA+TGG + Chr2:3676105-3676124 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
GGATCAAGGTGTAAAAAATT+TGG + Chr2:3676618-3676637 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
GTTATAAGATGCATACATGT+TGG + Chr2:3678908-3678927 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TAATTATCACATTGAAGAGC+TGG - Chr2:3676105-3676124 None:intergenic 30.0%
TACAATAATAAATGGCAGGT+AGG + Chr2:3679114-3679133 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TAGCACAAAATGATGTTAAG+GGG - Chr2:3678776-3678795 None:intergenic 30.0%
TATCAAGAATCAAAGGCAAT+GGG + Chr2:3676197-3676216 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TCTAGTACAATGAGAATTGT+TGG + Chr2:3678348-3678367 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TGGATCGAAAACTCAAAAAT+TGG + Chr2:3676061-3676080 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TGTGATAATTATGGAACTTG+TGG + Chr2:3676114-3676133 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
TTAGCTAATAAACTTGGAGA+AGG + Chr2:3677597-3677616 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TTCAACATCGAAATCTTGTA+CGG + Chr2:3677913-3677932 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
TTGCATTATATACCTGACAT+TGG + Chr2:3676883-3676902 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
TTGTTCCACAAGTAAATATC+TGG - Chr2:3675845-3675864 None:intergenic 30.0%
TTTGAGTCACATATACCAAA+AGG - Chr2:3676141-3676160 None:intergenic 30.0%
! AATCATTCCTGCATTCTTTT+TGG - Chr2:3677196-3677215 None:intergenic 30.0%
! ATGGAATTGTTATTGGATCA+AGG + Chr2:3676604-3676623 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
! CAAGATTTAGAATCATCCAT+AGG + Chr2:3678229-3678248 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTTTGATATGATATGCAG+TGG + Chr2:3678459-3678478 MsG0280006581.01.T01:intron 30.0%
! GAGTGATCATATTCATTTTG+AGG + Chr2:3677253-3677272 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
!! ATACTTTTTGTGGAGATACA+AGG - Chr2:3675370-3675389 None:intergenic 30.0%
!! CCACAAAAAGTATTTGAGTT+AGG + Chr2:3675377-3675396 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
!! CCTAACTCAAATACTTTTTG+TGG - Chr2:3675380-3675399 None:intergenic 30.0%
!! GTTCCATTAGAATTTTCAAG+AGG - Chr2:3675497-3675516 None:intergenic 30.0%
!! GTTTGATTTGATGACCATAT+AGG - Chr2:3675572-3675591 None:intergenic 30.0%
!! TACTTTTTGTGGAGATACAA+GGG - Chr2:3675369-3675388 None:intergenic 30.0%
!! TCCATTAGAATTTTCAAGAG+GGG - Chr2:3675495-3675514 None:intergenic 30.0%
!!! GTCTGTCTTCTATTTTTTCT+TGG - Chr2:3678946-3678965 None:intergenic 30.0%
!!! TCTTTTGGATGATGGAAATT+TGG + Chr2:3675622-3675641 MsG0280006581.01.T01:CDS 30.0%
AAACCAGGTAATTCTGATAG+AGG + Chr2:3677444-3677463 MsG0280006581.01.T01:intron 35.0%
AAAGTGAATAATAGCCAGAG+AGG + Chr2:3677303-3677322 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGATTGTGATGCAGTTA+AGG - Chr2:3675333-3675352 None:intergenic 35.0%
AAGGTTGTCTTACATTCCAT+AGG - Chr2:3679365-3679384 None:intergenic 35.0%
AATCAAGATGATCCATCAAC+TGG + Chr2:3675785-3675804 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ACCACTTCAAAATGGTACTT+AGG + Chr2:3675413-3675432 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ACCCCTCTTGAAAATTCTAA+TGG + Chr2:3675491-3675510 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ACCTAATAGTCACAGAACAA+AGG - Chr2:3679384-3679403 None:intergenic 35.0%
ACCTTTGTTCTGTGACTATT+AGG + Chr2:3679380-3679399 MsG0280006581.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
ATAAAGAGGTCAATTAGGCA+TGG - Chr2:3678427-3678446 None:intergenic 35.0%
ATATGATCACTCCCAAAATC+AGG - Chr2:3677245-3677264 None:intergenic 35.0%
ATATTCAGATGACAGGAACA+TGG + Chr2:3677512-3677531 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ATATTTATGCCTATTGCCAC+AGG + Chr2:3676714-3676733 MsG0280006581.01.T01:intron 35.0%
ATCATATGTGGAATAGCCAA+AGG + Chr2:3678183-3678202 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ATGACATGGAATTCAAACAG+TGG - Chr2:3677552-3677571 None:intergenic 35.0%
ATGAGGTTCAGTATCATATG+TGG + Chr2:3678171-3678190 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ATGGAAATTGTGTGACATCA+TGG + Chr2:3676691-3676710 MsG0280006581.01.T01:intron 35.0%
ATGGAATGAAGGAAATGCAA+TGG + Chr2:3678841-3678860 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
ATGTCTCCTGAATATGCAAT+GGG + Chr2:3678486-3678505 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
CAACTGATACTTTGTTACCA+GGG + Chr2:3675705-3675724 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGCAAGAACAATCTTTA+AGG - Chr2:3676374-3676393 None:intergenic 35.0%
CATATGATACTGAACCTCAT+TGG - Chr2:3678171-3678190 None:intergenic 35.0%
CATCCAAAAGATGAAGAACA+GGG - Chr2:3675613-3675632 None:intergenic 35.0%
CATTGTTGGAATGTGAAAAC+AGG + Chr2:3676346-3676365 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
GAAGCTTATTATTATCCTGC+AGG + Chr2:3675974-3675993 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
GTGTGTGAGAAAAACAGAAT+TGG + Chr2:3676242-3676261 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
GTGTTCCAGATATTTACTTG+TGG + Chr2:3675837-3675856 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
TATGTCTCCTGAATATGCAA+TGG + Chr2:3678485-3678504 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
TCAACACAACCACTTCAAAA+TGG + Chr2:3675405-3675424 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
TCATATGTGGAATAGCCAAA+GGG + Chr2:3678184-3678203 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
TCATCCAAAAGATGAAGAAC+AGG - Chr2:3675614-3675633 None:intergenic 35.0%
TTAACTGCATCACAATCTCT+TGG + Chr2:3675332-3675351 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
TTACATGTCCAAGGAGATTT+AGG - Chr2:3678611-3678630 None:intergenic 35.0%
TTGAATCATAGCAGACTCAT+TGG - Chr2:3676914-3676933 None:intergenic 35.0%
TTGCAACTCTTTGCTTTATC+TGG - Chr2:3678138-3678157 None:intergenic 35.0%
TTGTAGCATCTGATATGACA+TGG - Chr2:3677566-3677585 None:intergenic 35.0%
! AAACCCTGTTCTTCATCTTT+TGG + Chr2:3675607-3675626 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! AATGAGAAAAACGGAGTGTT+GGG - Chr2:3676847-3676866 None:intergenic 35.0%
! GAACAAGAGTATGACATTGT+TGG + Chr2:3676332-3676351 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! GCTATAGCTATCCTGATTTT+GGG + Chr2:3677231-3677250 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! GGAATTGATTCCTTATACTC+AGG + Chr2:3676648-3676667 MsG0280006581.01.T01:intron 35.0%
! GTTCTTCATCTTTTGGATGA+TGG + Chr2:3675614-3675633 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! TCATGGAATGGTCAATCTTT+TGG + Chr2:3675890-3675909 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! TGCTATAGCTATCCTGATTT+TGG + Chr2:3677230-3677249 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! TTTAGAACTGGTTCATGGAA+TGG + Chr2:3675878-3675897 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGTTTACACCGTAAACT+AGG - Chr2:3678643-3678662 None:intergenic 35.0%
!! ACCTAAGTACCATTTTGAAG+TGG - Chr2:3675417-3675436 None:intergenic 35.0%
!! CTTCTAGTTCAGGAAATCTT+AGG - Chr2:3676758-3676777 None:intergenic 35.0%
!! GATTCAAGATGGTGGAAAAT+TGG + Chr2:3675523-3675542 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGAGGAAGAAAAGGAGA+TGG + Chr2:3677268-3677287 MsG0280006581.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTTTGAAGTCCTGAGTATA+AGG - Chr2:3676661-3676680 None:intergenic 35.0%
AAGAACAGGGTTTGTAACAG+AGG - Chr2:3675600-3675619 None:intergenic 40.0%
AAGAATGCAGGAATGATTGC+TGG + Chr2:3677198-3677217 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
AAGCGAAAACGCCTAGTTTA+CGG + Chr2:3678629-3678648 MsG0280006581.01.T01:intron 40.0%
AATCATCCATAGGGATCTCA+AGG + Chr2:3678239-3678258 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
ACAAACACACTTCTAGTCTG+TGG - Chr2:3676312-3676331 None:intergenic 40.0%
ACACTCCTTGAAACAGAGAT+AGG + Chr2:3676804-3676823 MsG0280006581.01.T01:intron 40.0%
ACTCTCAAGATTCAAGATGG+TGG + Chr2:3675515-3675534 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGTGGAACAAGCAACAA+AGG + Chr2:3675852-3675871 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
AGATTAGCAGCTTCTGATGT+AGG + Chr2:3676501-3676520 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
AGGGTTTGTAACAGAGGAAA+TGG - Chr2:3675594-3675613 None:intergenic 40.0%
ATCACCACTGATGGCATTAT+GGG - Chr2:3678968-3678987 None:intergenic 40.0%
ATTAGGTGTAAGTACCTCTC+TGG - Chr2:3677320-3677339 None:intergenic 40.0%
ATTCAAACAGTGGCAACTCA+AGG - Chr2:3677542-3677561 None:intergenic 40.0%
CAAAGAGTTGCAAGCTAGAT+TGG + Chr2:3678145-3678164 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
CACTCCTTGAAACAGAGATA+GGG + Chr2:3676805-3676824 MsG0280006581.01.T01:intron 40.0%
CCAACTGATACTTTGTTACC+AGG + Chr2:3675704-3675723 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
CTCGTGCTAGAAATCATAAG+TGG + Chr2:3678552-3678571 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
CTGATAGAGGTCAGAAAACA+CGG + Chr2:3677457-3677476 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTGGAACAAGCAACAAA+GGG + Chr2:3675853-3675872 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
GAAGATGAATCAGATTCACC+TGG - Chr2:3679058-3679077 None:intergenic 40.0%
GAATGAGAAAAACGGAGTGT+TGG - Chr2:3676848-3676867 None:intergenic 40.0%
GATTGGATGTAACCATGTGT+CGG + Chr2:3677780-3677799 MsG0280006581.01.T01:intron 40.0%
GCAGAGAATATTCAGATGAC+AGG + Chr2:3677505-3677524 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
GCAGCTATTGTGCTTAGTAT+TGG - Chr2:3675923-3675942 None:intergenic 40.0%
GCTAATAAACTTGGAGAAGG+AGG + Chr2:3677600-3677619 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
GGAACTCTCAAGATTCAAGA+TGG + Chr2:3675512-3675531 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
GTTCAATGGAACGTTATGCA+TGG + Chr2:3676041-3676060 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
TATCCACCCATTGCATATTC+AGG - Chr2:3678495-3678514 None:intergenic 40.0%
TCAGAAAACACGGTTATCTG+AGG + Chr2:3677467-3677486 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
TCAGATGACCTAAATCTCCT+TGG + Chr2:3678600-3678619 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
TCATTGGAAGATCCAATGTC+AGG - Chr2:3676898-3676917 None:intergenic 40.0%
TCGAGATTCGAGTAACTTCA+TGG + Chr2:3675759-3675778 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
TGACCTCTATCAGAATTACC+TGG - Chr2:3677450-3677469 None:intergenic 40.0%
TGCATAACGTTCCATTGAAC+CGG - Chr2:3676041-3676060 None:intergenic 40.0%
TTCAACATCATCACCACTGA+TGG - Chr2:3678977-3678996 None:intergenic 40.0%
TTGTTACCAGGGATGAAACT+TGG + Chr2:3675716-3675735 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
TTTGTGGAGATACAAGGGTT+TGG - Chr2:3675364-3675383 None:intergenic 40.0%
! ATCTCTGTTTCAAGGAGTGT+TGG - Chr2:3676804-3676823 None:intergenic 40.0%
! CCTGGTAACAAAGTATCAGT+TGG - Chr2:3675707-3675726 None:intergenic 40.0%
! TATGGAACTTGTGGTCCTTT+TGG + Chr2:3676123-3676142 MsG0280006581.01.T01:intron 40.0%
! TGGAATGGTCAATCTTTTGG+TGG + Chr2:3675893-3675912 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTCAGATGAAGCTGACAG+AGG + Chr2:3677156-3677175 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGCTAGATGCTTCTAGTTC+AGG - Chr2:3676768-3676787 None:intergenic 40.0%
!! AGACTTGTTGTGAATTCGAC+CGG + Chr2:3676019-3676038 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
!! AGGCTTTGGAACTGTTTACA+GGG + Chr2:3677620-3677639 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
!! CAACAAAGGGTGTTTAGAAC+TGG + Chr2:3675866-3675885 MsG0280006581.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTTGGAGTTTTGCAGAAG+TGG - Chr2:3675261-3675280 None:intergenic 40.0%
!! TCTCTGTTTCAAGGAGTGTT+GGG - Chr2:3676803-3676822 None:intergenic 40.0%
AAACTTGGAGAAGGAGGCTT+TGG + Chr2:3677606-3677625 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGGTTGTCAACAAGCTC+TGG + Chr2:3677843-3677862 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
ATGAGGCAGTTTACTGAAGC+TGG + Chr2:3676462-3676481 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
ATGTGTTGTGATAGGCATGG+AGG + Chr2:3678816-3678835 MsG0280006581.01.T01:intron 45.0%
ATTCACCTGGATTCCTTCCA+AGG - Chr2:3679045-3679064 None:intergenic 45.0%
CATCACCACTGATGGCATTA+TGG - Chr2:3678969-3678988 None:intergenic 45.0%
CCATGCCTATCACAACACAT+AGG - Chr2:3678816-3678835 None:intergenic 45.0%
CCTATGTGTTGTGATAGGCA+TGG + Chr2:3678813-3678832 MsG0280006581.01.T01:intron 45.0%
CGAAATCTTGTACGGCTCTT+TGG + Chr2:3677921-3677940 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
GAACAGGGTAGGTTAGTAGA+TGG + Chr2:3677804-3677823 MsG0280006581.01.T01:intron 45.0%
TACCAGGGATGAAACTTGGT+TGG + Chr2:3675720-3675739 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
TCCTTCCAAGGACAAAACCA+GGG - Chr2:3679033-3679052 None:intergenic 45.0%
TCTCCTGAATATGCAATGGG+TGG + Chr2:3678489-3678508 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTGCTGCATTGAGAAAG+AGG + Chr2:3677941-3677960 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
TTAGACTGTAACAACCCTGC+AGG - Chr2:3675992-3676011 None:intergenic 45.0%
TTCCAACCAAGTTTCATCCC+TGG - Chr2:3675725-3675744 None:intergenic 45.0%
TTCCTTCCAAGGACAAAACC+AGG - Chr2:3679034-3679053 None:intergenic 45.0%
TTTGTCCTTGGAAGGAATCC+AGG + Chr2:3679037-3679056 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
! CGTTTTCGCTTACATGTCCA+AGG - Chr2:3678620-3678639 None:intergenic 45.0%
! GAGATAACTAATGGTGGGAC+AGG + Chr2:3676408-3676427 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
! GGGTGTTTAGAACTGGTTCA+TGG + Chr2:3675873-3675892 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
! TAACCATGTGTCGGTGAACA+GGG + Chr2:3677789-3677808 MsG0280006581.01.T01:intron 45.0%
! TGGAGATACAAGGGTTTGGT+TGG - Chr2:3675360-3675379 None:intergenic 45.0%
! TGTGAATTCGACCGGTTCAA+TGG + Chr2:3676027-3676046 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGGGAAGAAGGCTGACTT+AGG + Chr2:3677085-3677104 MsG0280006581.01.T01:intron 45.0%
!! GAGGCTTTGGAACTGTTTAC+AGG + Chr2:3677619-3677638 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGTCAACAAGCTCTGGACA+AGG + Chr2:3677849-3677868 MsG0280006581.01.T01:CDS 45.0%
ACCTCTTCACAGCAATGTCC+TGG - Chr2:3677830-3677849 None:intergenic 50.0%
CAGACCCATAATGCCATCAG+TGG + Chr2:3678961-3678980 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
CCAGTATGCAAGTGTGTCAC+AGG + Chr2:3676168-3676187 MsG0280006581.01.T01:intron 50.0%
CCTGTGACACACTTGCATAC+TGG - Chr2:3676171-3676190 None:intergenic 50.0%
CTTGGTTGGAACCTTGACAC+TGG + Chr2:3675734-3675753 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
GAAGCTGACAGAGGATCTTC+TGG + Chr2:3677165-3677184 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
GCATGGAGGCTATGGAATGA+AGG + Chr2:3678830-3678849 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
GGTGGCTCCAAAAAGAATGC+AGG + Chr2:3677186-3677205 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGACAGGTTGTGTTATG+TGG + Chr2:3676421-3676440 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
TCTCGTGCTCGTGTTTGTGT+TGG - Chr2:3677712-3677731 None:intergenic 50.0%
TGCTTGCCTTGAGATCCCTA+TGG - Chr2:3678248-3678267 None:intergenic 50.0%
TGTGATAGGCATGGAGGCTA+TGG + Chr2:3678822-3678841 MsG0280006581.01.T01:intron 50.0%
! AAACCAGGGTGCTTTGGTTG+TGG - Chr2:3679019-3679038 None:intergenic 50.0%
! AGGACAAAACCAGGGTGCTT+TGG - Chr2:3679025-3679044 None:intergenic 50.0%
! GCAAGCTAGATTGGCCAATG+AGG + Chr2:3678154-3678173 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
! GTAACCATGTGTCGGTGAAC+AGG + Chr2:3677788-3677807 MsG0280006581.01.T01:intron 50.0%
!!! AAGCACCCTGGTTTTGTCCT+TGG + Chr2:3679025-3679044 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
!!! ACCCTGGTTTTGTCCTTGGA+AGG + Chr2:3679029-3679048 MsG0280006581.01.T01:CDS 50.0%
CTACCCTGTTCACCGACACA+TGG - Chr2:3677795-3677814 None:intergenic 55.0%
GAATCTCGACGCCAGTGTCA+AGG - Chr2:3675748-3675767 None:intergenic 55.0%
GCCAGGACATTGCTGTGAAG+AGG + Chr2:3677826-3677845 MsG0280006581.01.T01:CDS 55.0%
GCTGACAGAGGATCTTCTGG+TGG + Chr2:3677168-3677187 MsG0280006581.01.T01:CDS 55.0%
GGCGCCCTATCTCTGTTTCA+AGG - Chr2:3676812-3676831 None:intergenic 55.0%
GGGTAGGTTAGTAGATGGCC+AGG + Chr2:3677809-3677828 MsG0280006581.01.T01:intron 55.0%
TGCGTGAAGCCTGTGGCAAT+AGG - Chr2:3676726-3676745 None:intergenic 55.0%
! CATGTGTCGGTGAACAGGGT+AGG + Chr2:3677793-3677812 MsG0280006581.01.T01:intron 55.0%
! TTGCCACAACCAAAGCACCC+TGG + Chr2:3679013-3679032 MsG0280006581.01.T01:CDS 55.0%
!! AAAAACGGAGTGTTGGGCGC+TGG - Chr2:3676841-3676860 None:intergenic 55.0%
!! AGTGTTGGGCGCTGGACATT+GGG - Chr2:3676833-3676852 None:intergenic 55.0%
CCACAGGCTTCACGCAAGCA+GGG + Chr2:3676730-3676749 MsG0280006581.01.T01:intron 60.0%
!! GAGTGTTGGGCGCTGGACAT+TGG - Chr2:3676834-3676853 None:intergenic 60.0%
CCCTGCTTGCGTGAAGCCTG+TGG - Chr2:3676733-3676752 None:intergenic 65.0%
GCCACAGGCTTCACGCAAGC+AGG + Chr2:3676729-3676748 MsG0280006581.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 3675248 3679450 3675248 ID=MsG0280006581.01;Name=MsG0280006581.01
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Chr2 exon 3675248 3676094 3675248 ID=MsG0280006581.01.T01:exon:807;Parent=MsG0280006581.01.T01
Chr2 exon 3676190 3676526 3676190 ID=MsG0280006581.01.T01:exon:808;Parent=MsG0280006581.01.T01
Chr2 exon 3677149 3677324 3677149 ID=MsG0280006581.01.T01:exon:809;Parent=MsG0280006581.01.T01
Chr2 exon 3677451 3677641 3677451 ID=MsG0280006581.01.T01:exon:810;Parent=MsG0280006581.01.T01
Chr2 exon 3677810 3678020 3677810 ID=MsG0280006581.01.T01:exon:811;Parent=MsG0280006581.01.T01
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Chr2 CDS 3678830 3679135 3678830 ID=MsG0280006581.01.T01:cds;Parent=MsG0280006581.01.T01
Chr2 three_prime_UTR 3679136 3679450 3679136 ID=MsG0280006581.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0280006581.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280006581.01.T01

ATGAAAAGTTCCACTTCTGCAAAACTCCAAATCTACTTCATCTTATCTCTATATTTTTTCAATGGTGTAATCTCTTCTGATACCTTAACTGCATCACAATCTCTTGGTTCCAACCAAACCCTTGTATCTCCACAAAAAGTATTTGAGTTAGGTTTCTTCAACACAACCACTTCAAAATGGTACTTAGGTATATGGTACAAAGATGTTCCTGATAAAATATTTGTTTGGGTGGCAAATAGAGACACCCCTCTTGAAAATTCTAATGGAACTCTCAAGATTCAAGATGGTGGAAAATTGGTTCTTTTCAACCAAACAGATAATCCTATATGGTCATCAAATCAAACCATTTCCTCTGTTACAAACCCTGTTCTTCATCTTTTGGATGATGGAAATTTGGTTCTCAAAGAAGCACAAGAGAAAAACAACAGTAACTATATATGGCAGAGTTTTGATCATCCAACTGATACTTTGTTACCAGGGATGAAACTTGGTTGGAACCTTGACACTGGCGTCGAGATTCGAGTAACTTCATGGAAAAATCAAGATGATCCATCAACTGGAGATAGTTATTTCAGTCTTGATTATCATGGTGTTCCAGATATTTACTTGTGGAACAAGCAACAAAGGGTGTTTAGAACTGGTTCATGGAATGGTCAATCTTTTGGTGGAGTACCAATACTAAGCACAATAGCTGCTCTTAATGATAAAATAGTTGTTGATGAACATGAAGCTTATTATTATCCTGCAGGGTTGTTACAGTCTAATTTATCTAGACTTGTTGTGAATTCGACCGGTTCAATGGAACGTTATGCATGGATCGAAAACTCAAAAATTGGAACAAAGTATGGATTTGATATCAAGAATCAAAGGCAATGGGATTTGAGAAATTTTTCTGATGGGTGTGTGAGAAAAACAGAATTGGAATGTGGCAAAGATAAGTTCTTGCATTTGAAGAATGTGCAATTGCCACAGACTAGAAGTGTGTTTGTGAACAAGAGTATGACATTGTTGGAATGTGAAAACAGGTGCCTTAAAGATTGTTCTTGCACTGCTTATGCTAATGAAGAGATAACTAATGGTGGGACAGGTTGTGTTATGTGGAATTATAGTCTTGTTGATATGAGGCAGTTTACTGAAGCTGGACAAGATATTTTTATCAGATTAGCAGCTTCTGATGTAGGCAACTTCTTCTTTTCAGATGAAGCTGACAGAGGATCTTCTGGTGGCTCCAAAAAGAATGCAGGAATGATTGCTGGAATTACAATTGCTATAGCTATCCTGATTTTGGGAGTGATCATATTCATTTTGAGGAAGAAAAGGAGATGGCAGAGAATACAGAAAGTGAATAATAGCCAGAGAGGTAATTCTGATAGAGGTCAGAAAACACGGTTATCTGAGGCGAAGTTTTCAAATAGCAGAGAATATTCAGATGACAGGAACATGGATGACCTTGAGTTGCCACTGTTTGAATTCCATGTCATATCAGATGCTACAAACTCCTTCTCTTTAGCTAATAAACTTGGAGAAGGAGGCTTTGGAACTGTTTACAGGGGTAGGTTAGTAGATGGCCAGGACATTGCTGTGAAGAGGTTGTCAACAAGCTCTGGACAAGGAAATGTAGAATTCAAGAATGAGGTAAGATCAATTGCGAAGCTTCAACATCGAAATCTTGTACGGCTCTTTGGTTGCTGCATTGAGAAAGAGGAGAAGATGTTGATTTATGAATACTGTGAAAATAACAGCCTAGATTCTATTTTATTTGATAAAGCAAAGAGTTGCAAGCTAGATTGGCCAATGAGGTTCAGTATCATATGTGGAATAGCCAAAGGGTTACTTTATCTTCATCATGACTCAAGATTTAGAATCATCCATAGGGATCTCAAGGCAAGCAATGTTCTACTTGATAAAGAAATGAATCCAAAGATATCAGATTTTGGTATTGCTAGAATTTTTGACAATGATCAAACACATTCTAGTACAATGAGAATTGTTGGAACATATGGATATATGTCTCCTGAATATGCAATGGGTGGATATTTTTCTGCGAAATCTGATGTTTTCAGTTTTGGAGTTCTCGTGCTAGAAATCATAAGTGGAATGAAGAATAGAGGATTTCATCAATCAGATGACCTAAATCTCCTTGGACATGCATGGAGGCTATGGAATGAAGGAAATGCAATGGAACTAATAGATTCATCATATGCAGATTCATATTCAGAATCTGAAGTTATAAGATGCATACATGTTGGCCTAATATGTGTCCAAGAAAAAATAGAAGACAGACCCATAATGCCATCAGTGGTGATGATGTTGAATAGCGAAACATCGTCATTGCCACAACCAAAGCACCCTGGTTTTGTCCTTGGAAGGAATCCAGGTGAATCTGATTCATCTTCAGCTAAACAAGATGACACAATAAACGAAGTCACAGTTACAATAATAAATGGCAGGTAG
Protein sequence

>MsG0280006581.01.T01

MKSSTSAKLQIYFILSLYFFNGVISSDTLTASQSLGSNQTLVSPQKVFELGFFNTTTSKWYLGIWYKDVPDKIFVWVANRDTPLENSNGTLKIQDGGKLVLFNQTDNPIWSSNQTISSVTNPVLHLLDDGNLVLKEAQEKNNSNYIWQSFDHPTDTLLPGMKLGWNLDTGVEIRVTSWKNQDDPSTGDSYFSLDYHGVPDIYLWNKQQRVFRTGSWNGQSFGGVPILSTIAALNDKIVVDEHEAYYYPAGLLQSNLSRLVVNSTGSMERYAWIENSKIGTKYGFDIKNQRQWDLRNFSDGCVRKTELECGKDKFLHLKNVQLPQTRSVFVNKSMTLLECENRCLKDCSCTAYANEEITNGGTGCVMWNYSLVDMRQFTEAGQDIFIRLAASDVGNFFFSDEADRGSSGGSKKNAGMIAGITIAIAILILGVIIFILRKKRRWQRIQKVNNSQRGNSDRGQKTRLSEAKFSNSREYSDDRNMDDLELPLFEFHVISDATNSFSLANKLGEGGFGTVYRGRLVDGQDIAVKRLSTSSGQGNVEFKNEVRSIAKLQHRNLVRLFGCCIEKEEKMLIYEYCENNSLDSILFDKAKSCKLDWPMRFSIICGIAKGLLYLHHDSRFRIIHRDLKASNVLLDKEMNPKISDFGIARIFDNDQTHSSTMRIVGTYGYMSPEYAMGGYFSAKSDVFSFGVLVLEIISGMKNRGFHQSDDLNLLGHAWRLWNEGNAMELIDSSYADSYSESEVIRCIHVGLICVQEKIEDRPIMPSVVMMLNSETSSLPQPKHPGFVLGRNPGESDSSSAKQDDTINEVTVTIINGR*