AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280011454.01

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MsG0280011454.01.T01 AT1G48210 41.275 298 163 4 113 399 52 348 5.03e-68 220
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MsG0280011454.01.T01 AT3G09830 37.569 362 204 5 59 404 19 374 7.62e-68 221
MsG0280011454.01.T01 AT3G09830 37.569 362 204 5 59 404 19 374 7.62e-68 221
MsG0280011454.01.T01 AT2G17220 40.000 300 160 6 113 395 71 367 8.96e-68 221
MsG0280011454.01.T01 AT2G17220 40.000 300 160 6 113 395 70 366 9.10e-68 221
MsG0280011454.01.T01 AT3G26940 38.095 336 190 7 72 395 22 351 1.29e-67 221
MsG0280011454.01.T01 AT1G68690 37.297 370 203 8 46 391 281 645 1.33e-67 227
MsG0280011454.01.T01 AT3G59350 42.574 303 160 4 122 411 64 365 1.65e-67 219
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MsG0280011454.01.T01 AT5G35580 43.813 299 149 7 112 395 71 365 2.27e-67 223
MsG0280011454.01.T01 AT4G02010 41.297 293 163 4 112 395 363 655 2.42e-67 228
MsG0280011454.01.T01 AT5G56460 40.604 298 159 5 117 398 64 359 3.12e-67 219
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MsG0280011454.01.T01 AT5G16500 38.312 308 181 5 97 395 42 349 5.33e-67 225
MsG0280011454.01.T01 AT3G59350 42.574 303 160 4 122 411 121 422 5.65e-67 219
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MsG0280011454.01.T01 AT2G07180 40.134 299 164 5 113 398 74 370 6.07e-67 220
MsG0280011454.01.T01 AT3G24550 39.175 291 168 5 113 395 264 553 6.37e-67 225
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MsG0280011454.01.T01 AT5G48740 37.845 399 204 13 14 403 522 885 1.34e-66 228
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MsG0280011454.01.T01 AT2G43230 42.268 291 154 4 122 399 138 427 1.26e-63 211
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MsG0280011454.01.T01 AT2G30730 40.636 283 154 4 126 395 54 335 2.70e-63 207
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MsG0280011454.01.T01 AT3G25490 38.542 288 171 3 116 398 95 381 8.37e-61 203
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MsG0280011454.01.T01 AT1G79680 36.283 339 194 7 61 391 376 700 1.81e-60 209
MsG0280011454.01.T01 AT4G23220 37.979 287 169 5 117 396 325 609 2.23e-60 207
MsG0280011454.01.T01 AT4G34440 37.671 292 166 6 115 395 298 584 3.40e-60 207
MsG0280011454.01.T01 AT4G34440 37.671 292 166 6 115 395 298 584 3.40e-60 207
MsG0280011454.01.T01 AT4G21390 35.655 359 213 8 45 392 445 796 4.15e-60 209
MsG0280011454.01.T01 AT3G13380 41.837 294 159 7 119 402 848 1139 6.00e-60 211
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MsG0280011454.01.T01 AT1G72300 38.516 283 166 5 119 395 794 1074 2.44e-57 203
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MsG0280011454.01.T01 AT4G23320 35.315 286 177 4 117 395 171 455 4.32e-57 196
MsG0280011454.01.T01 AT5G28680 32.804 378 237 8 30 395 419 791 4.35e-57 201
MsG0280011454.01.T01 AT5G28680 32.804 378 237 8 30 395 419 791 4.35e-57 201
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MsG0280011454.01.T01 AT5G63930 38.699 292 163 6 117 396 792 1079 2.34e-56 201
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MsG0280011454.01.T01 AT4G00330 36.749 283 164 5 117 386 107 387 9.39e-56 189
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MsG0280011454.01.T01 AT1G51880 33.699 365 201 11 47 402 535 867 3.22e-55 196
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MsG0280011454.01.T01 AT1G66460 36.257 342 186 10 73 395 83 411 3.87e-55 189
MsG0280011454.01.T01 AT1G67520 35.811 296 175 6 109 392 266 558 3.89e-55 192
MsG0280011454.01.T01 AT1G67520 35.811 296 175 6 109 392 266 558 3.89e-55 192
MsG0280011454.01.T01 AT5G42440 38.908 293 164 9 113 395 65 352 4.12e-55 186
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MsG0280011454.01.T01 AT3G13690 38.462 286 168 5 116 395 398 681 5.41e-55 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61380 35.862 290 179 4 112 395 471 759 5.47e-55 195
MsG0280011454.01.T01 AT4G04570 42.723 213 116 2 117 323 336 548 5.66e-55 191
MsG0280011454.01.T01 AT1G11300 33.511 376 213 10 33 395 422 773 5.83e-55 195
MsG0280011454.01.T01 AT4G30520 36.042 283 170 5 117 392 291 569 5.84e-55 192
MsG0280011454.01.T01 AT4G11460 34.416 308 179 7 105 395 320 621 5.89e-55 193
MsG0280011454.01.T01 AT4G23300 33.750 320 193 6 117 419 341 658 8.05e-55 192
MsG0280011454.01.T01 AT1G61390 36.486 296 179 5 112 401 335 627 8.06e-55 192
MsG0280011454.01.T01 AT1G51805 33.889 360 215 7 43 395 479 822 8.06e-55 195
MsG0280011454.01.T01 AT5G45780 35.473 296 183 5 117 405 288 582 8.07e-55 192
MsG0280011454.01.T01 AT4G23250 35.540 287 167 5 117 391 342 622 8.15e-55 196
MsG0280011454.01.T01 AT1G66460 36.283 339 184 10 73 392 110 435 9.69e-55 189
MsG0280011454.01.T01 AT2G23450 35.549 346 200 9 91 416 307 649 1.17e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT2G23450 35.549 346 200 9 91 416 307 649 1.17e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT1G51805 33.889 360 215 7 43 395 503 846 1.22e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61490 35.417 288 179 3 114 395 449 735 1.25e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61490 35.417 288 179 3 114 395 449 735 1.25e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT3G25560 34.965 286 175 5 117 395 300 581 1.39e-54 191
MsG0280011454.01.T01 AT3G25560 34.965 286 175 5 117 395 301 582 1.51e-54 191
MsG0280011454.01.T01 AT5G01950 36.949 295 167 5 112 395 524 810 1.55e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61490 35.417 288 179 3 114 395 475 761 1.56e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61490 35.417 288 179 3 114 395 475 761 1.56e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61490 35.417 288 179 3 114 395 475 761 1.56e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT1G61490 35.417 288 179 3 114 395 475 761 1.56e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT4G04490 35.855 304 182 7 98 395 310 606 1.57e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT5G62710 34.444 360 205 11 43 391 205 544 1.61e-54 190
MsG0280011454.01.T01 AT1G29740 37.063 286 170 6 117 395 665 947 1.62e-54 195
MsG0280011454.01.T01 AT1G65790 33.420 383 236 8 27 392 411 791 1.64e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT3G25560 34.965 286 175 5 117 395 300 581 2.08e-54 191
MsG0280011454.01.T01 AT5G06740 32.603 365 205 10 55 402 278 618 2.21e-54 191
MsG0280011454.01.T01 AT1G11300 36.644 292 171 5 110 395 475 758 2.27e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT5G62710 34.444 360 205 11 43 391 239 578 2.41e-54 190
MsG0280011454.01.T01 AT1G29740 37.063 286 170 6 117 395 665 947 2.51e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT5G06740 32.603 365 205 10 55 402 290 630 2.58e-54 191
MsG0280011454.01.T01 AT5G65240 35.540 287 177 4 117 395 272 558 2.64e-54 190
MsG0280011454.01.T01 AT3G04690 35.806 310 189 6 94 395 480 787 2.75e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT3G14350 40.278 288 131 5 112 390 402 657 3.00e-54 191
MsG0280011454.01.T01 AT1G67520 35.906 298 172 7 109 392 431 723 3.05e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT5G01950 36.949 295 167 5 112 395 609 895 3.11e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT5G01950 36.949 295 167 5 112 395 609 895 3.11e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT5G01950 36.949 295 167 5 112 395 609 895 3.11e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT5G01950 36.949 295 167 5 112 395 609 895 3.11e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT4G35030 41.026 234 132 3 167 395 4 236 3.20e-54 182
MsG0280011454.01.T01 AT5G63710 36.237 287 174 6 117 395 242 527 3.24e-54 189
MsG0280011454.01.T01 AT5G63710 36.237 287 174 6 117 395 242 527 3.24e-54 189
MsG0280011454.01.T01 AT2G39360 33.058 363 217 6 47 395 408 758 3.25e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT2G18470 41.525 236 131 5 115 345 270 503 3.45e-54 188
MsG0280011454.01.T01 AT1G49100 35.314 303 181 6 106 402 564 857 3.62e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT1G61390 36.486 296 179 5 112 401 503 795 3.82e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT1G29730 36.140 285 175 4 117 395 628 911 4.24e-54 194
MsG0280011454.01.T01 AT5G65240 35.540 287 177 4 117 395 272 558 4.31e-54 190
MsG0280011454.01.T01 AT1G61440 34.122 296 188 3 114 403 463 757 4.55e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT5G63710 36.237 287 174 6 117 395 277 562 4.66e-54 190
MsG0280011454.01.T01 AT1G67520 35.836 293 171 6 112 392 486 773 4.73e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT1G61440 34.122 296 188 3 114 403 468 762 4.75e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT5G07180 36.770 291 174 4 114 399 540 825 4.76e-54 193
MsG0280011454.01.T01 AT1G67520 35.906 298 172 7 109 392 474 766 5.20e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT4G35030 41.379 232 128 3 117 340 92 323 5.83e-54 182
MsG0280011454.01.T01 AT1G61430 34.122 296 188 3 114 403 474 768 5.86e-54 192
MsG0280011454.01.T01 AT5G63710 36.237 287 174 6 117 395 278 563 5.93e-54 189
MsG0280011454.01.T01 AT1G61430 34.122 296 188 3 114 403 451 745 5.98e-54 192

Find 99 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 194 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCTTCAAATCCATTGTATTT+TGG 0.145465 2:-84229054 None:intergenic
GTGATTCAGCTATCAGATTT+TGG 0.201177 2:+84228516 MsG0280011454.01.T01:intron
GTATTTATTCCATTTCATTT+TGG 0.215089 2:+84229639 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR
GAAATCTTCCAATGTTCTTC+TGG 0.226262 2:+84228393 MsG0280011454.01.T01:CDS
GCTTTGTTACATTACATAAA+AGG 0.238253 2:-84229614 None:intergenic
GCTTGTTCTGCTCTTCTTGC+TGG 0.266239 2:+84227146 MsG0280011454.01.T01:CDS
TGAAATGAAACGAAATAAAA+TGG 0.266846 2:+84226064 None:intergenic
TCGTTTCGATGAACATTTCC+AGG 0.317220 2:+84227796 MsG0280011454.01.T01:CDS
ATGAAGATGTCGGGAACTTT+AGG 0.320059 2:+84228573 MsG0280011454.01.T01:CDS
GAGTGACCCTCCAAGCTCTA+AGG 0.324488 2:-84229270 None:intergenic
AATATCAATCTCTTGTTTCA+TGG 0.325282 2:+84228882 MsG0280011454.01.T01:CDS
GGATTTGAAGCATTTATATC+AGG 0.339871 2:+84229066 MsG0280011454.01.T01:CDS
CGTCTTTAACTTGGTATATC+CGG 0.351841 2:+84228196 MsG0280011454.01.T01:CDS
TCTTATTGTATATCTTCTTC+CGG 0.359040 2:+84227180 MsG0280011454.01.T01:CDS
GAGGAGTGTTTGTGCTTCAT+TGG 0.363948 2:-84229368 None:intergenic
CTAACAACAGAAAAGAATTA+AGG 0.371724 2:+84226186 MsG0280011454.01.T01:five_prime_UTR
TTCCGGTAAGTAATTCTAGA+AGG 0.389027 2:-84228829 None:intergenic
CATCAATCGCAATTCTTAAC+CGG 0.394860 2:-84228215 None:intergenic
TGCAAGCTGAACCAAGTTAT+AGG 0.399250 2:+84229204 MsG0280011454.01.T01:CDS
GGTAAAAGCAATGGAATTGT+AGG 0.404366 2:+84227230 MsG0280011454.01.T01:CDS
AATTAATGATACAGGAAATC+AGG 0.405785 2:+84227067 MsG0280011454.01.T01:intron
GTCCTTCTAGAATTACTTAC+CGG 0.413988 2:+84228827 MsG0280011454.01.T01:CDS
TTTGGACTTGCTGTAGCATC+TGG 0.415325 2:+84228534 MsG0280011454.01.T01:CDS
TATCGGTTTCTATGAAAGAA+AGG 0.418001 2:+84226120 MsG0280011454.01.T01:five_prime_UTR
TAACCATATGTGTCGGTGTT+GGG 0.427362 2:-84229429 None:intergenic
AAGAGCGATGTCTATGCTTT+CGG 0.435210 2:+84228800 MsG0280011454.01.T01:CDS
ATGAAACAAGAGATTGATAT+TGG 0.435787 2:-84228880 None:intergenic
ATACCCTGTCCAAAATGAAA+TGG 0.438173 2:-84229648 None:intergenic
TCTGCACTCTCTCATCCCTT+TGG 0.441570 2:+84229244 MsG0280011454.01.T01:CDS
ATCCTAGGCTATTGTATTCA+CGG 0.442701 2:+84227996 MsG0280011454.01.T01:CDS
GAACATGTAGAGGCTGCAAA+AGG 0.444416 2:+84227605 MsG0280011454.01.T01:intron
GTACATGGAGAGTGGTTCTC+TGG 0.446188 2:+84228043 MsG0280011454.01.T01:CDS
TGAGTTTGTTGAGCAAGATT+CGG 0.446404 2:+84227955 MsG0280011454.01.T01:CDS
CCTTTGGTACCCTTAGAGCT+TGG 0.449482 2:+84229260 MsG0280011454.01.T01:CDS
TTGGTACCCTTAGAGCTTGG+AGG 0.449956 2:+84229263 MsG0280011454.01.T01:CDS
GTGCCCAACACCGACACATA+TGG 0.458799 2:+84229426 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR
CTGCTTTCTTGACAGCAGCC+TGG 0.459775 2:-84227814 None:intergenic
GATAATATCATGGGAGAGAC+TGG 0.462214 2:+84227752 MsG0280011454.01.T01:CDS
GTTATTAGTGGCCTATAACT+TGG 0.462718 2:-84229215 None:intergenic
TAATGCTGATAGAGAATTTG+AGG 0.463463 2:+84227841 MsG0280011454.01.T01:CDS
CACCGACATGTGCTCGACAC+TGG 0.463603 2:-84229406 None:intergenic
TTGAATAAGAGAATTCTAGT+AGG 0.470282 2:+84227116 MsG0280011454.01.T01:CDS
ATATCAATCTCTTGTTTCAT+GGG 0.471685 2:+84228883 MsG0280011454.01.T01:CDS
AGTAGCCATCTTGTTCTAGA+TGG 0.473283 2:+84229578 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR
TCTATGAACCACAGGAGGAT+TGG 0.473467 2:-84228365 None:intergenic
CTCGTGGATCGTCTTTAACT+TGG 0.474216 2:+84228187 MsG0280011454.01.T01:CDS
ACCGACATGTGCTCGACACT+GGG 0.474703 2:-84229405 None:intergenic
TGCAGAACATCTGTTATTAG+TGG 0.478432 2:-84229227 None:intergenic
TACTCTACAGGTTGCTGCAG+TGG 0.479733 2:+84229169 MsG0280011454.01.T01:intron
TTCTCTTATTCAAATTCTGA+TGG 0.490734 2:-84227106 None:intergenic
ATTGTATTCACGGTGAATCA+AGG 0.491417 2:+84228006 MsG0280011454.01.T01:CDS
TGGTACCCTTAGAGCTTGGA+GGG 0.496938 2:+84229264 MsG0280011454.01.T01:CDS
CACAAGAACATGAAGATGTC+GGG 0.501613 2:+84228564 MsG0280011454.01.T01:CDS
GTTTCTTGTTTATGAGTACA+TGG 0.503208 2:+84228028 MsG0280011454.01.T01:CDS
CATTACATAAAAGGAACAAA+AGG 0.505755 2:-84229605 None:intergenic
CTCTCCCATGATATTATCTA+CGG 0.506384 2:-84227747 None:intergenic
ATAACAGGATCTAGAATACT+TGG 0.507927 2:-84229031 None:intergenic
AATGCTCAAGCTCAAGCTCC+AGG 0.516178 2:+84226304 MsG0280011454.01.T01:CDS
AACATGTAGAGGCTGCAAAA+GGG 0.530210 2:+84227606 MsG0280011454.01.T01:intron
AGAGGCTGCAAAAGGGGAAA+AGG 0.530613 2:+84227613 MsG0280011454.01.T01:intron
ATCAGAATCCAGAAGAACAT+TGG 0.533902 2:-84228401 None:intergenic
TCTGAGGACATGTTCTGCAT+TGG 0.534165 2:-84228857 None:intergenic
TAAACTTAACTACTCAAGAA+TGG 0.538321 2:+84227658 MsG0280011454.01.T01:CDS
AGTGACCCTCCAAGCTCTAA+GGG 0.547698 2:-84229269 None:intergenic
TTCAAGTCTCTATGAACCAC+AGG 0.548941 2:-84228373 None:intergenic
TATACCATGTGATATGTACT+CGG 0.555707 2:-84228607 None:intergenic
CAGGAGGATTGGAGTGCTCG+TGG 0.560200 2:-84228354 None:intergenic
TTTAGCACTAACAGCGCTTG+AGG 0.563216 2:-84227639 None:intergenic
CTCAGAGTTACAGAACCAAT+CGG 0.563784 2:+84229290 MsG0280011454.01.T01:CDS
AGCTCCACTGGTAAAAGCAA+TGG 0.565148 2:+84227221 MsG0280011454.01.T01:CDS
GTAACCATATGTGTCGGTGT+TGG 0.571530 2:-84229430 None:intergenic
GTTTATGAGTACATGGAGAG+TGG 0.577209 2:+84228035 MsG0280011454.01.T01:CDS
ACACAAGAACATGAAGATGT+CGG 0.578097 2:+84228563 MsG0280011454.01.T01:CDS
TCCTGTTATCCAAAATACAA+TGG 0.578310 2:+84229045 MsG0280011454.01.T01:CDS
ATTTGCATGAAGAATTGTTG+AGG 0.583141 2:-84226284 None:intergenic
ACATGTAGAGGCTGCAAAAG+GGG 0.588880 2:+84227607 MsG0280011454.01.T01:intron
CCAAGCTCTAAGGGTACCAA+AGG 0.593459 2:-84229260 None:intergenic
TCTGTCAGTTAGCTGAGGCA+TGG 0.594166 2:-84228999 None:intergenic
CACCGTGAATACAATAGCCT+AGG 0.597065 2:-84227998 None:intergenic
AATGAAGCACAAACACTCCT+CGG 0.614429 2:+84229370 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR
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TATTGTATATCTTCTTCCGG+CGG 0.615643 2:+84227183 MsG0280011454.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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TAAAAGAAATGTGGTAACCT+TGG + Chr2:84226384-84226403 MsG0280011454.01.T01:intron 30.0%
TAATGCTGATAGAGAATTTG+AGG + Chr2:84227841-84227860 MsG0280011454.01.T01:CDS 30.0%
TATAATCTCATGCACCTAAT+CGG - Chr2:84228671-84228690 None:intergenic 30.0%
TATACCATGTGATATGTACT+CGG - Chr2:84228610-84228629 None:intergenic 30.0%
TCCTGTTATCCAAAATACAA+TGG + Chr2:84229045-84229064 MsG0280011454.01.T01:CDS 30.0%
TTAAGTTCTGCTGTACTTTA+TGG + Chr2:84228946-84228965 MsG0280011454.01.T01:intron 30.0%
TTCAAAGTAACCATATGTGT+CGG - Chr2:84229439-84229458 None:intergenic 30.0%
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! GACGGTGAAAACATTTTATT+TGG - Chr2:84226425-84226444 None:intergenic 30.0%
! GATAATGCAAAATACCGATT+AGG + Chr2:84228654-84228673 MsG0280011454.01.T01:intron 30.0%
! GATGGAATATATCTCGTTTT+TGG + Chr2:84228111-84228130 MsG0280011454.01.T01:intron 30.0%
! GCTTCAAATCCATTGTATTT+TGG - Chr2:84229057-84229076 None:intergenic 30.0%
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! GTTTCTTGTTTATGAGTACA+TGG + Chr2:84228028-84228047 MsG0280011454.01.T01:CDS 30.0%
! TATTCCATTTCATTTTGGAC+AGG + Chr2:84229644-84229663 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TCAATTTTCTTTCATTGTGG+TGG + Chr2:84226550-84226569 MsG0280011454.01.T01:intron 30.0%
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!! TATCGGTTTCTATGAAAGAA+AGG + Chr2:84226120-84226139 MsG0280011454.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
!! TCCATTGTATTTTGGATAAC+AGG - Chr2:84229049-84229068 None:intergenic 30.0%
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!!! TACAATTTTGGTTGAGTCTA+TGG + Chr2:84226662-84226681 MsG0280011454.01.T01:intron 30.0%
AAAAACTTAACAAGCTCCAC+TGG + Chr2:84227209-84227228 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
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ACACAAGAACATGAAGATGT+CGG + Chr2:84228563-84228582 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
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ATACCATGTGATATGTACTC+GGG - Chr2:84228609-84228628 None:intergenic 35.0%
ATACCCTGTCCAAAATGAAA+TGG - Chr2:84229651-84229670 None:intergenic 35.0%
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ATCCTAGGCTATTGTATTCA+CGG + Chr2:84227996-84228015 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
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CTCTCCCATGATATTATCTA+CGG - Chr2:84227750-84227769 None:intergenic 35.0%
GAAATCTTCCAATGTTCTTC+TGG + Chr2:84228393-84228412 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAAAGCAATGGAATTGT+AGG + Chr2:84227230-84227249 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
GTCAAAGTATAATCCAACCT+TGG - Chr2:84228434-84228453 None:intergenic 35.0%
GTCTATGGAAAATCATGAAG+TGG + Chr2:84226677-84226696 MsG0280011454.01.T01:intron 35.0%
GTTACAACCTAGTAGTTTGA+CGG - Chr2:84226443-84226462 None:intergenic 35.0%
GTTATTAGTGGCCTATAACT+TGG - Chr2:84229218-84229237 None:intergenic 35.0%
TATTGTATATCTTCTTCCGG+CGG + Chr2:84227183-84227202 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
TGCAGAACATCTGTTATTAG+TGG - Chr2:84229230-84229249 None:intergenic 35.0%
TTCCGGTAAGTAATTCTAGA+AGG - Chr2:84228832-84228851 None:intergenic 35.0%
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! GTGATTCAGCTATCAGATTT+TGG + Chr2:84228516-84228535 MsG0280011454.01.T01:intron 35.0%
! TTGTTAAGTTTTTATGCCGC+CGG - Chr2:84227202-84227221 None:intergenic 35.0%
!! AATTCCATTGCTTTTACCAG+TGG - Chr2:84227228-84227247 None:intergenic 35.0%
!! ATCATCATTTTAGGTCCGTT+TGG + Chr2:84226808-84226827 MsG0280011454.01.T01:intron 35.0%
!! CGTCTTTAACTTGGTATATC+CGG + Chr2:84228196-84228215 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
!! GGATTCTGATTTTAATGCCA+AGG + Chr2:84228414-84228433 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCCTTCTAGAATTACTTAC+CGG + Chr2:84228827-84228846 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTGATTTTAATGCCAAGGT+TGG + Chr2:84228418-84228437 MsG0280011454.01.T01:intron 35.0%
!! TGAGTTTGTTGAGCAAGATT+CGG + Chr2:84227955-84227974 MsG0280011454.01.T01:CDS 35.0%
AACATGTAGAGGCTGCAAAA+GGG + Chr2:84227606-84227625 MsG0280011454.01.T01:intron 40.0%
AAGAGCGATGTCTATGCTTT+CGG + Chr2:84228800-84228819 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
AATGAAGCACAAACACTCCT+CGG + Chr2:84229370-84229389 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
ACTACTAGGTTGTAACAACG+TGG + Chr2:84226447-84226466 MsG0280011454.01.T01:intron 40.0%
ATGAAGATGTCGGGAACTTT+AGG + Chr2:84228573-84228592 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
CACAAGAACATGAAGATGTC+GGG + Chr2:84228564-84228583 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
CTCAGAGTTACAGAACCAAT+CGG + Chr2:84229290-84229309 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGCGATTGATGTTGCT+AGG + Chr2:84228223-84228242 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
GATAATATCATGGGAGAGAC+TGG + Chr2:84227752-84227771 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
GTGCTCAAATCTATGAAGCA+CGG - Chr2:84229513-84229532 None:intergenic 40.0%
GTTTATGAGTACATGGAGAG+TGG + Chr2:84228035-84228054 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
TCGTTTCGATGAACATTTCC+AGG + Chr2:84227796-84227815 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
TGACATATTAGGCTCACATG+TGG + Chr2:84228450-84228469 MsG0280011454.01.T01:intron 40.0%
TGCAAGCTGAACCAAGTTAT+AGG + Chr2:84229204-84229223 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
TTCAAGTCTCTATGAACCAC+AGG - Chr2:84228376-84228395 None:intergenic 40.0%
TTTGATCTGTCAGTTAGCTG+AGG - Chr2:84229007-84229026 None:intergenic 40.0%
! AGTAGCCATCTTGTTCTAGA+TGG + Chr2:84229578-84229597 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! GATGACCATCTAGAACAAGA+TGG - Chr2:84229586-84229605 None:intergenic 40.0%
! GTTTTCACCGTCAAACTACT+AGG + Chr2:84226433-84226452 MsG0280011454.01.T01:intron 40.0%
! TAACCATATGTGTCGGTGTT+GGG - Chr2:84229432-84229451 None:intergenic 40.0%
!! TCTCTGGAATCTCAATTGCA+TGG + Chr2:84228059-84228078 MsG0280011454.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACTTTTTTTTCACCGAGCTG+AGG + Chr2:84227532-84227551 MsG0280011454.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTCTGCATTGGTTTTCTTC+CGG - Chr2:84228849-84228868 None:intergenic 40.0%
AAGTCTCTATGAACCACAGG+AGG - Chr2:84228373-84228392 None:intergenic 45.0%
ACATGTAGAGGCTGCAAAAG+GGG + Chr2:84227607-84227626 MsG0280011454.01.T01:intron 45.0%
AGCTCCACTGGTAAAAGCAA+TGG + Chr2:84227221-84227240 MsG0280011454.01.T01:CDS 45.0%
AGTTACAGAACCAATCGGCT+CGG + Chr2:84229295-84229314 MsG0280011454.01.T01:CDS 45.0%
CACCGTGAATACAATAGCCT+AGG - Chr2:84228001-84228020 None:intergenic 45.0%
CTCGTGGATCGTCTTTAACT+TGG + Chr2:84228187-84228206 MsG0280011454.01.T01:CDS 45.0%
GAACATGTAGAGGCTGCAAA+AGG + Chr2:84227605-84227624 MsG0280011454.01.T01:intron 45.0%
GTTAAAGACGATCCACGAGT+AGG - Chr2:84228186-84228205 None:intergenic 45.0%
TCTATGAACCACAGGAGGAT+TGG - Chr2:84228368-84228387 None:intergenic 45.0%
TCTGAGGACATGTTCTGCAT+TGG - Chr2:84228860-84228879 None:intergenic 45.0%
TTGGGGAAACAACAAGAACG+AGG + Chr2:84229702-84229721 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TTTAGCACTAACAGCGCTTG+AGG - Chr2:84227642-84227661 None:intergenic 45.0%
! GTAACCATATGTGTCGGTGT+TGG - Chr2:84229433-84229452 None:intergenic 45.0%
! TGAAGATTTTCCGAGCCGAT+TGG - Chr2:84229308-84229327 None:intergenic 45.0%
!! CAAGCTCTAAGGGTACCAAA+GGG - Chr2:84229262-84229281 None:intergenic 45.0%
!! GAGGAGTGTTTGTGCTTCAT+TGG - Chr2:84229371-84229390 None:intergenic 45.0%
!! TTTGGACTTGCTGTAGCATC+TGG + Chr2:84228534-84228553 MsG0280011454.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTTTTTTTTTATTTCATTAT+TGG + Chr2:84226351-84226370 MsG0280011454.01.T01:intron 5.0%
AATGCTCAAGCTCAAGCTCC+AGG + Chr2:84226304-84226323 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
ACAATTGTAGGGCCTACTCG+TGG + Chr2:84228171-84228190 MsG0280011454.01.T01:intron 50.0%
AGAGGCTGCAAAAGGGGAAA+AGG + Chr2:84227613-84227632 MsG0280011454.01.T01:intron 50.0%
CCTTTGGTACCCTTAGAGCT+TGG + Chr2:84229260-84229279 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
CTGGGACAATGTCTAATCCG+AGG - Chr2:84229390-84229409 None:intergenic 50.0%
GCACCCGAGTACATATCACA+TGG + Chr2:84228603-84228622 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
GCTTGTTCTGCTCTTCTTGC+TGG + Chr2:84227146-84227165 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
GTACATGGAGAGTGGTTCTC+TGG + Chr2:84228043-84228062 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
TACTCTACAGGTTGCTGCAG+TGG + Chr2:84229169-84229188 MsG0280011454.01.T01:intron 50.0%
TCTGCACTCTCTCATCCCTT+TGG + Chr2:84229244-84229263 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
TCTGTCAGTTAGCTGAGGCA+TGG - Chr2:84229002-84229021 None:intergenic 50.0%
TGACTCGACGTCTCGAACTA+TGG + Chr2:84228700-84228719 MsG0280011454.01.T01:intron 50.0%
TGGTACCCTTAGAGCTTGGA+GGG + Chr2:84229264-84229283 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
TTGGTACCCTTAGAGCTTGG+AGG + Chr2:84229263-84229282 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
! AGTGACCCTCCAAGCTCTAA+GGG - Chr2:84229272-84229291 None:intergenic 50.0%
!! CCAAGCTCTAAGGGTACCAA+AGG - Chr2:84229263-84229282 None:intergenic 50.0%
!! GTCGGGAACTTTAGGATACG+TGG + Chr2:84228581-84228600 MsG0280011454.01.T01:CDS 50.0%
ACCGACATGTGCTCGACACT+GGG - Chr2:84229408-84229427 None:intergenic 55.0%
CTGCTTTCTTGACAGCAGCC+TGG - Chr2:84227817-84227836 None:intergenic 55.0%
GAGTGACCCTCCAAGCTCTA+AGG - Chr2:84229273-84229292 None:intergenic 55.0%
GTGCCCAACACCGACACATA+TGG + Chr2:84229426-84229445 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
! TCCCAGTGTCGAGCACATGT+CGG + Chr2:84229404-84229423 MsG0280011454.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
CACCGACATGTGCTCGACAC+TGG - Chr2:84229409-84229428 None:intergenic 60.0%
CGAGCACTCCAATCCTCCTG+TGG + Chr2:84228357-84228376 MsG0280011454.01.T01:CDS 60.0%
GGAATCTCGGGCTCGAACCA+AGG - Chr2:84226404-84226423 None:intergenic 60.0%
GTGCCTGCATCACCTCAGCT+CGG - Chr2:84227547-84227566 None:intergenic 60.0%
TCACCGAGCTGAGGTGATGC+AGG + Chr2:84227541-84227560 MsG0280011454.01.T01:intron 60.0%
! CAGGAGGATTGGAGTGCTCG+TGG - Chr2:84228357-84228376 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 84226075 84229723 84226075 ID=MsG0280011454.01;Name=MsG0280011454.01
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Chr2 three_prime_UTR 84229332 84229723 84229332 ID=MsG0280011454.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0280011454.01.T01
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Protein sequence

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