AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035526.01

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MsG0680035526.01.T01 AT1G75820 29.740 269 158 5 65 303 164 431 3.40e-15 80.5
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MsG0680035526.01.T01 AT5G62230 28.682 258 157 3 68 298 94 351 4.20e-20 95.9
MsG0680035526.01.T01 AT5G62230 31.837 245 161 4 74 313 76 319 1.39e-18 91.3
MsG0680035526.01.T01 AT5G62230 28.000 250 177 1 52 298 126 375 4.32e-16 83.2
MsG0680035526.01.T01 AT5G62230 26.339 224 150 4 146 362 76 291 1.85e-12 71.6
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MsG0680035526.01.T01 AT5G20480 27.972 286 170 3 52 301 176 461 1.69e-18 90.9
MsG0680035526.01.T01 AT5G20480 26.929 609 357 19 83 636 358 933 5.97e-38 152
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MsG0680035526.01.T01 AT3G46400 28.092 477 283 14 238 700 416 846 6.40e-38 152
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MsG0680035526.01.T01 AT1G31420 33.594 128 85 0 63 190 68 195 3.72e-11 67.0
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MsG0680035526.01.T01 AT1G51890 23.969 509 295 12 208 699 133 566 1.50e-33 137
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MsG0680035526.01.T01 AT5G45780 25.517 435 268 10 218 637 112 505 3.29e-33 136
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MsG0680035526.01.T01 AT5G18610 30.351 313 194 9 407 703 57 361 3.77e-33 134
MsG0680035526.01.T01 AT1G51890 23.969 509 295 12 208 699 405 838 4.07e-33 137
MsG0680035526.01.T01 AT3G21340 24.780 569 355 17 154 699 343 861 4.62e-33 137
MsG0680035526.01.T01 AT5G16500 30.945 307 173 11 419 701 60 351 4.77e-33 135
MsG0680035526.01.T01 AT1G51790 27.222 540 307 23 207 706 410 903 7.18e-33 136
MsG0680035526.01.T01 AT3G20530 27.523 327 212 8 402 711 51 369 7.24e-33 131
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MsG0680035526.01.T01 AT4G05200 27.838 370 210 9 346 696 302 633 1.58e-32 134
MsG0680035526.01.T01 AT1G53420 30.408 319 201 7 402 707 593 903 2.40e-32 135
MsG0680035526.01.T01 AT1G53420 29.630 243 160 4 83 318 77 315 1.94e-17 87.4
MsG0680035526.01.T01 AT1G53420 30.189 159 108 1 147 302 69 227 3.04e-11 67.4
MsG0680035526.01.T01 AT4G34500 27.707 314 201 9 404 700 115 419 2.69e-32 130
MsG0680035526.01.T01 AT1G56720 28.571 294 187 5 421 700 167 451 5.12e-32 130
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MsG0680035526.01.T01 AT1G56720 28.571 294 187 5 421 700 167 451 5.12e-32 130
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MsG0680035526.01.T01 AT5G15730 27.541 305 193 9 420 716 103 387 1.70e-29 122
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MsG0680035526.01.T01 AT3G17420 27.586 290 185 7 421 695 142 421 1.96e-29 122
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MsG0680035526.01.T01 AT5G59670 27.389 314 195 6 419 715 552 849 3.17e-29 125
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MsG0680035526.01.T01 AT1G11300 27.887 355 224 9 351 695 437 769 3.61e-29 124
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MsG0680035526.01.T01 AT2G15080 33.182 220 143 2 88 303 107 326 1.99e-22 103
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MsG0680035526.01.T01 AT1G68690 26.774 310 184 9 347 630 280 572 1.01e-25 113
MsG0680035526.01.T01 AT1G68690 26.774 310 184 9 347 630 280 572 1.01e-25 113
MsG0680035526.01.T01 AT4G04540 27.304 293 181 7 420 696 311 587 1.11e-25 113
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MsG0680035526.01.T01 AT4G04540 27.304 293 181 7 420 696 340 616 1.46e-25 112
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MsG0680035526.01.T01 AT4G23190 24.259 371 222 8 345 696 213 543 1.50e-25 112
MsG0680035526.01.T01 AT5G35960 27.586 290 185 7 419 696 120 396 1.52e-25 110
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MsG0680035526.01.T01 AT1G79670 28.525 305 172 9 421 700 409 692 2.26e-25 112
MsG0680035526.01.T01 AT4G13190 29.646 226 140 6 416 630 54 271 2.29e-25 107
MsG0680035526.01.T01 AT4G23190 24.259 371 222 8 345 696 291 621 2.35e-25 112
MsG0680035526.01.T01 AT1G61460 26.523 279 176 4 421 691 442 699 2.41e-25 112
MsG0680035526.01.T01 AT1G61390 27.113 284 184 7 421 691 508 781 2.42e-25 112
MsG0680035526.01.T01 AT1G53440 29.568 301 187 7 421 706 655 945 2.47e-25 112
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MsG0680035526.01.T01 AT1G53440 28.659 164 114 1 146 306 93 256 4.57e-12 70.1
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MsG0680035526.01.T01 AT4G11460 26.645 304 190 6 414 696 327 618 2.78e-25 112
MsG0680035526.01.T01 AT1G61390 27.113 284 184 7 421 691 340 613 2.82e-25 112
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MsG0680035526.01.T01 AT1G48210 25.658 304 198 8 416 700 51 345 3.15e-25 108
MsG0680035526.01.T01 AT4G32000 29.352 293 187 6 419 699 116 400 3.43e-25 109
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MsG0680035526.01.T01 AT1G07650 25.926 243 173 4 65 302 110 350 5.76e-11 66.6
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Find 114 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 225 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TATTGTAAGGCATCCGGTTT+TGG 0.289526 6:-107556869 MsG0680035526.01.T01:CDS
AACCAAACTAAGAACCTTTA+GGG 0.289801 6:+107557645 None:intergenic
AATGGTAGAGTTGTTAGATA+TGG 0.295910 6:-107556938 MsG0680035526.01.T01:CDS
ATACCATAGTCACTTAGTTT+TGG 0.304724 6:+107555221 None:intergenic
ATCAAAATTCCAAGTCTATC+AGG 0.323302 6:+107555347 None:intergenic
TTCATGGATAGTGTTTGATT+TGG 0.327226 6:+107557712 None:intergenic
ATCAAACCAATTAGGCATAT+TGG 0.334332 6:+107557462 None:intergenic
TTTAATTTGTCAACATGTAT+TGG 0.346637 6:-107556241 MsG0680035526.01.T01:CDS
TCACCTTTGTCACGTGTAAT+GGG 0.349873 6:+107554536 None:intergenic
TGGTTTACTTCCTTCTTGTT+TGG 0.361778 6:-107556972 MsG0680035526.01.T01:CDS
GATTATCATACTCATCTATC+AGG 0.365594 6:-107555803 MsG0680035526.01.T01:intron
TCAAAGTCTTAAAGCTAAGT+TGG 0.367444 6:-107555951 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTGGTGGAATGCTACCAAAT+AGG 0.369514 6:+107557542 None:intergenic
GCAACATTTCAGCTGTATAA+AGG 0.370666 6:-107556037 MsG0680035526.01.T01:intron
CTTCGTTGCGGTGGAAAACT+TGG 0.377397 6:-107557025 MsG0680035526.01.T01:CDS
TGTGAACCATAGGCATCATT+TGG 0.377986 6:-107553960 MsG0680035526.01.T01:intron
TTCACCTTTGTCACGTGTAA+TGG 0.380537 6:+107554535 None:intergenic
TTATGTGGTGATAAGATCTA+TGG 0.381127 6:-107555996 MsG0680035526.01.T01:CDS
ATTCCAAAACTAAGTGACTA+TGG 0.381336 6:-107555224 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTGAAACCATCAAGTTTCAA+TGG 0.384903 6:-107557745 MsG0680035526.01.T01:CDS
TCTTTCGTCGAATCATCTTA+AGG 0.386842 6:-107557137 MsG0680035526.01.T01:CDS
TGAATCAATTGAGAAATTCA+TGG 0.398356 6:+107557696 None:intergenic
GCAGTACATTTCTTACATAC+TGG 0.409859 6:-107555311 MsG0680035526.01.T01:CDS
CTTTCGTCGAATCATCTTAA+GGG 0.414219 6:-107557136 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTCTGATGAAACACCGGTTG+TGG 0.420130 6:+107556688 None:intergenic
GGAGAGATACCGAAGAAGTT+TGG 0.422733 6:-107557187 MsG0680035526.01.T01:CDS
GTTCTTAGTTTGGTTTCCTT+AGG 0.425713 6:-107557637 MsG0680035526.01.T01:CDS
CAATTTCATCCATCCAAAAC+CGG 0.439048 6:+107556856 None:intergenic
ATATTGTTGGAATCACTTGT+TGG 0.440120 6:-107554560 MsG0680035526.01.T01:CDS
AACAAAGAATCAAACCAATT+AGG 0.442771 6:+107557454 None:intergenic
TTCAATTCACCAAACTTCTT+CGG 0.443303 6:+107557178 None:intergenic
TGTTTGGTGAATAGTTCTAA+TGG 0.447270 6:-107556956 MsG0680035526.01.T01:CDS
CCTAGTCTTACTACTCTCAA+TGG 0.448849 6:-107557310 MsG0680035526.01.T01:CDS
TGAGTATGATAATCACCATT+TGG 0.463315 6:+107555812 None:intergenic
GCAATCGTCGCTATCATTGT+TGG 0.463633 6:-107556815 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTTAGCAATAACTCGTTCTC+CGG 0.470470 6:-107557208 MsG0680035526.01.T01:CDS
AGAAGATATCGAAAAGTTTG+AGG 0.471072 6:-107555186 MsG0680035526.01.T01:intron
GTTGAAAGGTACCTTTCCTA+TGG 0.481610 6:+107556210 None:intergenic
GCAGAGAGGGTCGTATTGTA+AGG 0.482313 6:-107556882 MsG0680035526.01.T01:CDS
ATTTCTCAAGCAGTGAAGCT+AGG 0.483709 6:-107556328 MsG0680035526.01.T01:CDS
GACAAAGTTGAAAACCCTAA+AGG 0.485758 6:-107557659 MsG0680035526.01.T01:CDS
ATTTCAAGCAACAAGTTAAG+TGG 0.486988 6:-107556992 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTAATGCTCAAATTAGAAGA+TGG 0.488201 6:+107557817 None:intergenic
GATGGATGAAATTGAAGGAA+TGG 0.493710 6:-107556847 MsG0680035526.01.T01:CDS
GTGAGAAGAAATCAAAATCA+TGG 0.495146 6:-107555058 MsG0680035526.01.T01:intron
TTCGATATCTTCTTTGATGA+CGG 0.497051 6:+107555196 None:intergenic
TATAAAGGTAAACTAGAGAA+TGG 0.497371 6:-107556022 MsG0680035526.01.T01:CDS
GGGTCGTATTGTAAGGCATC+CGG 0.500648 6:-107556875 MsG0680035526.01.T01:CDS
AATTGGTTGCTAAAACATCC+TGG 0.500666 6:+107555281 None:intergenic
TTATCACAAAATGAACTCTC+TGG 0.501333 6:-107557340 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTGAATAGAAAATTGTCGAC+AGG 0.501508 6:+107556288 None:intergenic
GTTCAAGATAAATCCACAAC+CGG 0.505160 6:-107556701 MsG0680035526.01.T01:CDS
GCATCATTTGGAGGTCAAGA+TGG 0.505613 6:-107553948 MsG0680035526.01.T01:CDS
ATGGTAGAGTTGTTAGATAT+GGG 0.508565 6:-107556937 MsG0680035526.01.T01:CDS
CATAGAACATCTTCAAATGA+AGG 0.511685 6:+107553816 None:intergenic
CTTAAGTGGCCTGATAGACT+TGG 0.514856 6:-107555356 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTTCTCAAGCAGTGAAGCTA+GGG 0.516809 6:-107556327 MsG0680035526.01.T01:CDS
CGGTGGAAAACTTGGTTATG+TGG 0.521386 6:-107557017 MsG0680035526.01.T01:CDS
CATCGATACAATAACCCAAA+AGG 0.523679 6:+107555891 None:intergenic
TGTATTGGTGATGGCTCCAT+AGG 0.525683 6:-107556226 MsG0680035526.01.T01:CDS
TGAGTCTTGAGCTATACATT+TGG 0.525853 6:+107553848 None:intergenic
GAACCATAGGCATCATTTGG+AGG 0.532381 6:-107553957 MsG0680035526.01.T01:intron
TTTGATGAAGAAAACTAGAA+AGG 0.533725 6:-107556741 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTGTAGTCCAAAGACAAAGA+TGG 0.536948 6:-107554609 MsG0680035526.01.T01:intron
CTAGCAAACAATGTGCTAAG+TGG 0.537984 6:-107557064 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTTGCCGAAATCCGTGGTCA+CGG 0.539756 6:-107557236 MsG0680035526.01.T01:CDS
AAACTTCTTCGGTATCTCTC+CGG 0.555348 6:+107557189 None:intergenic
TTACATACTGGTGTTATACC+AGG 0.563755 6:-107555299 MsG0680035526.01.T01:CDS
CATTGTTGGATTTCTTCTTG+CGG 0.564819 6:-107556801 MsG0680035526.01.T01:CDS
AGATGGAAGAAGAAAGATTG+TGG 0.565623 6:-107553931 MsG0680035526.01.T01:CDS
GAACTATTCACCAAACAAGA+AGG 0.569424 6:+107556962 None:intergenic
TCTTAAGGGTACGCCGCCGT+TGG 0.570288 6:-107557122 MsG0680035526.01.T01:CDS
TCTGATAAACTTCGTTGCGG+TGG 0.570367 6:-107557034 MsG0680035526.01.T01:CDS
GAAATTGAAGGAATGGAAAG+TGG 0.575817 6:-107556840 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTGGATGTTGAAGCTTTGAG+AGG 0.579083 6:+107555924 None:intergenic
ACTAGAGAATGGAACTTATG+TGG 0.579978 6:-107556011 MsG0680035526.01.T01:CDS
ATGTATGAATATGTACCAAA+TGG 0.583988 6:-107555827 MsG0680035526.01.T01:CDS
CCATTGAGAGTAGTAAGACT+AGG 0.586224 6:+107557310 None:intergenic
TCACAAAATGAACTCTCTGG+TGG 0.588586 6:-107557337 MsG0680035526.01.T01:CDS
TTGTCAACATGTATTGGTGA+TGG 0.596814 6:-107556235 MsG0680035526.01.T01:CDS
TCAAATTAGAAGATGGAGGA+AGG 0.602729 6:+107557824 None:intergenic
ATGCTCAAATTAGAAGATGG+AGG 0.609970 6:+107557820 None:intergenic
ATTCTCAGAATCAGCAGAGA+GGG 0.619040 6:-107556895 MsG0680035526.01.T01:CDS
TGGTGATGGCTCCATAGGAA+AGG 0.626527 6:-107556221 MsG0680035526.01.T01:intron
ACCACGGATTTCGGCAAAAG+CGG 0.627900 6:+107557241 None:intergenic
TTGGGTTATTGTATCGATGG+TGG 0.629258 6:-107555887 MsG0680035526.01.T01:CDS
GCTAAACAAAACCGTGACCA+CGG 0.633937 6:+107557225 None:intergenic
TTGGTTTCCTTAGGAATTTG+GGG 0.641627 6:-107557628 MsG0680035526.01.T01:CDS
GGACCCATTACACGTGACAA+AGG 0.646311 6:-107554539 MsG0680035526.01.T01:CDS
GACAAAGAGAACAATGCCAA+CGG 0.648039 6:+107557106 None:intergenic
GTAGAGTTGTTAGATATGGG+AGG 0.661264 6:-107556934 MsG0680035526.01.T01:CDS
AAGAACTTCTGATGAAACAC+CGG 0.665270 6:+107556682 None:intergenic
TGGTTTCCTTAGGAATTTGG+GGG 0.667593 6:-107557627 MsG0680035526.01.T01:CDS
GATTCTCAGAATCAGCAGAG+AGG 0.697518 6:-107556896 MsG0680035526.01.T01:CDS
AAAGAGAACAATGCCAACGG+CGG 0.709449 6:+107557109 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTGATTATTCTTATTATATT+AGG - Chr6:107557207-107557226 MsG0680035526.01.T01:CDS 10.0%
!! TTTCTTTAAATTATTATCAA+TGG + Chr6:107556713-107556732 None:intergenic 10.0%
!! TCAAAATTATGTTAGATAAA+TGG + Chr6:107556484-107556503 None:intergenic 15.0%
!!! AACATTTTTCATTAATGAAA+AGG - Chr6:107557095-107557114 MsG0680035526.01.T01:CDS 15.0%
!! AATTTCATTGAAGCATAAAA+AGG + Chr6:107556948-107556967 None:intergenic 20.0%
!! ACTAAAGAAAAATACATTTG+AGG - Chr6:107556030-107556049 MsG0680035526.01.T01:intron 20.0%
!! ATACAAAAAATCAGAGAAAA+CGG + Chr6:107556147-107556166 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCATTGAAGCATAAAAA+GGG + Chr6:107556947-107556966 None:intergenic 20.0%
!! TATATATACATATACGATGA+AGG + Chr6:107555512-107555531 None:intergenic 20.0%
!! TTGAAGAAAAATCACTTAAA+GGG - Chr6:107554196-107554215 MsG0680035526.01.T01:intron 20.0%
!! TTTGAAGAAAAATCACTTAA+AGG - Chr6:107554195-107554214 MsG0680035526.01.T01:intron 20.0%
!!! AATTTTAACTATAAGAACCA+AGG - Chr6:107557288-107557307 MsG0680035526.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATAATTGAGCTCAAAATTTT+TGG - Chr6:107553830-107553849 MsG0680035526.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATGATACTATACTAACTTTT+AGG - Chr6:107556574-107556593 MsG0680035526.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTTCTATTCAAGATTTGA+AGG - Chr6:107555330-107555349 MsG0680035526.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATAATGATGTTTACAATTT+TGG - Chr6:107557021-107557040 MsG0680035526.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTATTTTTCTTTAGTTAGTT+TGG + Chr6:107556025-107556044 None:intergenic 20.0%
!!! TCAAAGAATCTTTGTAATTT+TGG - Chr6:107556079-107556098 MsG0680035526.01.T01:intron 20.0%
!!! TCATGAACAACATTTTTTTA+CGG - Chr6:107557406-107557425 MsG0680035526.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTGACAAATTAAAGTTTT+TGG + Chr6:107555362-107555381 None:intergenic 20.0%
!!! TTTAATTTGTCAACATGTAT+TGG - Chr6:107555367-107555386 MsG0680035526.01.T01:CDS 20.0%
! AACAAAGAATCAAACCAATT+AGG + Chr6:107554157-107554176 None:intergenic 25.0%
! ACTAAACTAAAATAGGATGT+CGG + Chr6:107555205-107555224 None:intergenic 25.0%
! ATGTATGAATATGTACCAAA+TGG - Chr6:107555781-107555800 MsG0680035526.01.T01:intron 25.0%
! TATAAAGGTAAACTAGAGAA+TGG - Chr6:107555586-107555605 MsG0680035526.01.T01:intron 25.0%
! TGAATCAATTGAGAAATTCA+TGG + Chr6:107553915-107553934 None:intergenic 25.0%
! TTAAAAAAAGCGAAGTTACA+AGG + Chr6:107555544-107555563 None:intergenic 25.0%
! TTAATGCTCAAATTAGAAGA+TGG + Chr6:107553794-107553813 None:intergenic 25.0%
! TTTAGACCACAATATAACTT+TGG - Chr6:107555091-107555110 MsG0680035526.01.T01:intron 25.0%
! TTTGATGAAGAAAACTAGAA+AGG - Chr6:107554867-107554886 MsG0680035526.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAAGGTACAAAAAGGTAT+AGG + Chr6:107557521-107557540 None:intergenic 25.0%
!! CAATTTTGGATTCATATTGT+TGG - Chr6:107557035-107557054 MsG0680035526.01.T01:CDS 25.0%
!! CATACATAAGATGAAGTTTT+TGG + Chr6:107555768-107555787 None:intergenic 25.0%
!! TTGACCATAGTTGAAATTTT+TGG + Chr6:107554088-107554107 None:intergenic 25.0%
!! TTTTGTTCACTCTGTAAAAA+CGG - Chr6:107557474-107557493 MsG0680035526.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACATTTTTTTACGGTCATAA+CGG - Chr6:107557415-107557434 MsG0680035526.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGACAAATTAAAGTTTTTGG+TGG + Chr6:107555359-107555378 None:intergenic 25.0%
AAACCAAACTAAGAACCTTT+AGG + Chr6:107553967-107553986 None:intergenic 30.0%
AAAGCTTCAACATCCAAATT+TGG - Chr6:107555690-107555709 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
AAATGGTAAAACAGCTACAT+TGG + Chr6:107556467-107556486 None:intergenic 30.0%
AACCAAACTAAGAACCTTTA+GGG + Chr6:107553966-107553985 None:intergenic 30.0%
AATGGTAGAGTTGTTAGATA+TGG - Chr6:107554670-107554689 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
ACACACTCTTTGTCTTTAAT+TGG + Chr6:107556347-107556366 None:intergenic 30.0%
AGAAGATATCGAAAAGTTTG+AGG - Chr6:107556422-107556441 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
ATATTGTTGGAATCACTTGT+TGG - Chr6:107557048-107557067 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAAATTCCAAGTCTATC+AGG + Chr6:107556264-107556283 None:intergenic 30.0%
ATCAAACCAATTAGGCATAT+TGG + Chr6:107554149-107554168 None:intergenic 30.0%
ATGCAACCAAAGTTATATTG+TGG + Chr6:107555100-107555119 None:intergenic 30.0%
ATGGTAGAGTTGTTAGATAT+GGG - Chr6:107554671-107554690 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
ATTCCAAAACTAAGTGACTA+TGG - Chr6:107556384-107556403 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
ATTTCAAGCAACAAGTTAAG+TGG - Chr6:107554616-107554635 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
CATAGAACATCTTCAAATGA+AGG + Chr6:107557795-107557814 None:intergenic 30.0%
CATATAGGATTTCACGATTT+CGG - Chr6:107557345-107557364 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
CATCATCGCTTTCTAATTAA+AGG - Chr6:107556170-107556189 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
CTATATCAGAGTTCTTATCA+AGG + Chr6:107557569-107557588 None:intergenic 30.0%
CTTCATTTGAAGATGTTCTA+TGG - Chr6:107557793-107557812 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
GATTATCATACTCATCTATC+AGG - Chr6:107555805-107555824 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
GTCTAACTGTTTATTCTTTC+AGG - Chr6:107555253-107555272 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
GTCTGCTACTAAACTAAAAT+AGG + Chr6:107555212-107555231 None:intergenic 30.0%
GTGAGAAGAAATCAAAATCA+TGG - Chr6:107556550-107556569 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
GTGAGAGATTGAATCTTATT+AGG + Chr6:107554013-107554032 None:intergenic 30.0%
TACTAAAGACGATACACAAA+AGG + Chr6:107555960-107555979 None:intergenic 30.0%
TCAAAGTCTTAAAGCTAAGT+TGG - Chr6:107555657-107555676 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
TCATTATCCATCTTTGTCTT+TGG + Chr6:107557009-107557028 None:intergenic 30.0%
TCCACCAAAAATTTCAACTA+TGG - Chr6:107554081-107554100 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
TGAGTATGATAATCACCATT+TGG + Chr6:107555799-107555818 None:intergenic 30.0%
TTAAATAACAATCGCAGTCA+AGG - Chr6:107557313-107557332 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
TTATCACAAAATGAACTCTC+TGG - Chr6:107554268-107554287 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
TTATGTGGTGATAAGATCTA+TGG - Chr6:107555612-107555631 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
TTCAATTCACCAAACTTCTT+CGG + Chr6:107554433-107554452 None:intergenic 30.0%
TTCATGGATAGTGTTTGATT+TGG + Chr6:107553899-107553918 None:intergenic 30.0%
TTCGATATCTTCTTTGATGA+CGG + Chr6:107556415-107556434 None:intergenic 30.0%
TTGAAACCATCAAGTTTCAA+TGG - Chr6:107553863-107553882 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
TTGAATAGAAAATTGTCGAC+AGG + Chr6:107555323-107555342 None:intergenic 30.0%
TTGAGCTCAAATTTCCTATT+TGG - Chr6:107554052-107554071 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
TTTATGTGTCAATCACATTG+CGG + Chr6:107555153-107555172 None:intergenic 30.0%
! AAGAATTTTTGTTCCTCTGT+TGG + Chr6:107555048-107555067 None:intergenic 30.0%
! ACCTTTTTGTACCTTTTTCT+CGG - Chr6:107557523-107557542 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
! AGAGAGTTCATTTTGTGATA+AGG + Chr6:107554269-107554288 None:intergenic 30.0%
! ATACCATAGTCACTTAGTTT+TGG + Chr6:107556390-107556409 None:intergenic 30.0%
! TCTCAATGGTTTACATGTTT+TGG - Chr6:107554312-107554331 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
! TTGATTTTGCATAGTGAAGT+TGG + Chr6:107554229-107554248 None:intergenic 30.0%
! TTTGGTTTCCTTAGGAATTT+GGG - Chr6:107553979-107553998 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCTGATAAACTTCGTTG+CGG - Chr6:107554571-107554590 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGGATGGATGAAATTGA+AGG - Chr6:107554756-107554775 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
!! ACCATAGTTGAAATTTTTGG+TGG + Chr6:107554085-107554104 None:intergenic 30.0%
!! GATAGACTTGGAATTTTGAT+TGG - Chr6:107556264-107556283 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
!! GCGATTGTTATTTAAAACCT+TGG + Chr6:107557308-107557327 None:intergenic 30.0%
!! TGTTTGGTGAATAGTTCTAA+TGG - Chr6:107554652-107554671 MsG0680035526.01.T01:intron 30.0%
!!! AATTTTGATTGGAGTTGCAA+AGG - Chr6:107556275-107556294 MsG0680035526.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTGGTTCATGAACTTGTA+CGG + Chr6:107556121-107556140 None:intergenic 30.0%
AACATGTTGTTGTGAACCAT+AGG - Chr6:107557638-107557657 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
AACCCTAAAGGTTCTTAGTT+TGG - Chr6:107553961-107553980 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
AAGAACTTCTGATGAAACAC+CGG + Chr6:107554929-107554948 None:intergenic 35.0%
AATTGGTTGCTAAAACATCC+TGG + Chr6:107556330-107556349 None:intergenic 35.0%
ACTAGAGAATGGAACTTATG+TGG - Chr6:107555597-107555616 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
AGATGGAAGAAGAAAGATTG+TGG - Chr6:107557677-107557696 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTCAAATTAGAAGATGG+AGG + Chr6:107553791-107553810 None:intergenic 35.0%
CAATTTCATCCATCCAAAAC+CGG + Chr6:107554755-107554774 None:intergenic 35.0%
CATCGATACAATAACCCAAA+AGG + Chr6:107555720-107555739 None:intergenic 35.0%
CATTGTTGGATTTCTTCTTG+CGG - Chr6:107554807-107554826 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
CATTTGTGTTTGTGCTTCAT+AGG + Chr6:107556660-107556679 None:intergenic 35.0%
CTCTGTAAAAACGGTGAAAA+CGG - Chr6:107557483-107557502 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCGTCGAATCATCTTAA+GGG - Chr6:107554472-107554491 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
GAAATTGAAGGAATGGAAAG+TGG - Chr6:107554768-107554787 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
GAACTATTCACCAAACAAGA+AGG + Chr6:107554649-107554668 None:intergenic 35.0%
GACAAAGTTGAAAACCCTAA+AGG - Chr6:107553949-107553968 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
GAGCAAGTTGTTAACACTAT+TGG + Chr6:107557705-107557724 None:intergenic 35.0%
GATGGATGAAATTGAAGGAA+TGG - Chr6:107554761-107554780 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
GCAAATCCATTGAAACTTGA+TGG + Chr6:107553872-107553891 None:intergenic 35.0%
GCAACATTTCAGCTGTATAA+AGG - Chr6:107555571-107555590 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
GCAGTACATTTCTTACATAC+TGG - Chr6:107556297-107556316 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
GTTCAAGATAAATCCACAAC+CGG - Chr6:107554907-107554926 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
TATGCACACAATAATGTGCA+TGG + Chr6:107555847-107555866 None:intergenic 35.0%
TCAAATTAGAAGATGGAGGA+AGG + Chr6:107553787-107553806 None:intergenic 35.0%
TCAACACCAATATGCCTAAT+TGG - Chr6:107554140-107554159 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
TCTTTCGTCGAATCATCTTA+AGG - Chr6:107554471-107554490 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
TGAGTCTTGAGCTATACATT+TGG + Chr6:107557763-107557782 None:intergenic 35.0%
TGGTTTACTTCCTTCTTGTT+TGG - Chr6:107554636-107554655 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
TTGGTCATCGAATTTGTCTT+CGG + Chr6:107556006-107556025 None:intergenic 35.0%
TTGGTTTCCTTAGGAATTTG+GGG - Chr6:107553980-107553999 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
TTGTAGTCCAAAGACAAAGA+TGG - Chr6:107556999-107557018 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
TTTAGCAATAACTCGTTCTC+CGG - Chr6:107554400-107554419 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
! ACCGAGAAAAAGGTACAAAA+AGG + Chr6:107557527-107557546 None:intergenic 35.0%
! ATCAGAGAAAACGGTCATTT+TGG + Chr6:107556138-107556157 None:intergenic 35.0%
! GAAGGCATGAAGGATTAAAA+AGG + Chr6:107556629-107556648 None:intergenic 35.0%
! GATATCGAAAAGTTTGAGGT+AGG - Chr6:107556426-107556445 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
! GGTTTTCAACTTTGTCAATG+TGG + Chr6:107553945-107553964 None:intergenic 35.0%
! GTGGTCTAAAACAGTATATG+TGG + Chr6:107555081-107555100 None:intergenic 35.0%
! GTTCTTAGTTTGGTTTCCTT+AGG - Chr6:107553971-107553990 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
! GTTTGGTTTCCTTAGGAATT+TGG - Chr6:107553978-107553997 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
! TTGTCAACATGTATTGGTGA+TGG - Chr6:107555373-107555392 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAGCATTGAAAACCAAGCA+TGG + Chr6:107556917-107556936 None:intergenic 35.0%
!! TTACATACTGGTGTTATACC+AGG - Chr6:107556309-107556328 MsG0680035526.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCAAATTTGGTTAGCCTTTT+GGG - Chr6:107555703-107555722 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
!!! CTTTTGGGTTATTGTATCGA+TGG - Chr6:107555718-107555737 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
!!! GATGTCGGTTTTAAATATCG+TGG + Chr6:107555190-107555209 None:intergenic 35.0%
!!! TCCAAATTTGGTTAGCCTTT+TGG - Chr6:107555702-107555721 MsG0680035526.01.T01:intron 35.0%
AAAACCAAGCATGGTTGTGT+TGG + Chr6:107556908-107556927 None:intergenic 40.0%
AAACTTCTTCGGTATCTCTC+CGG + Chr6:107554422-107554441 None:intergenic 40.0%
AAGTTTCCCCCAAATTCCTA+AGG + Chr6:107553990-107554009 None:intergenic 40.0%
ACGATCTGTTACCGAGAAAA+AGG + Chr6:107557537-107557556 None:intergenic 40.0%
AGGACCAAACTGATAAACGA+GGG - Chr6:107556050-107556069 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
ATTCTCAGAATCAGCAGAGA+GGG - Chr6:107554713-107554732 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
ATTTCTCAAGCAGTGAAGCT+AGG - Chr6:107555280-107555299 MsG0680035526.01.T01:CDS 40.0%
CCATTGAGAGTAGTAAGACT+AGG + Chr6:107554301-107554320 None:intergenic 40.0%
CCCAAAAGGCTAACCAAATT+TGG + Chr6:107555706-107555725 None:intergenic 40.0%
CTACAATGTGGTCAGATTTG+TGG - Chr6:107555013-107555032 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
CTAGCAAACAATGTGCTAAG+TGG - Chr6:107554544-107554563 MsG0680035526.01.T01:CDS 40.0%
GACAAAGAGAACAATGCCAA+CGG + Chr6:107554505-107554524 None:intergenic 40.0%
GCACCAACACTTCAGATAAA+AGG + Chr6:107556829-107556848 None:intergenic 40.0%
GCTTCATAGGTAGAGATTGA+AGG + Chr6:107556647-107556666 None:intergenic 40.0%
GGACTGATATAATCGCGAAA+AGG + Chr6:107554976-107554995 None:intergenic 40.0%
GTAGAGTTGTTAGATATGGG+AGG - Chr6:107554674-107554693 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
TCACAAAATGAACTCTCTGG+TGG - Chr6:107554271-107554290 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
TCACCTTTGTCACGTGTAAT+GGG + Chr6:107557075-107557094 None:intergenic 40.0%
TGAAGCACAAACACAAATGC+TGG - Chr6:107556661-107556680 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
TGGTTTCCTTAGGAATTTGG+GGG - Chr6:107553981-107554000 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
TGTGAACCATAGGCATCATT+TGG - Chr6:107557648-107557667 MsG0680035526.01.T01:CDS 40.0%
TTCACCTTTGTCACGTGTAA+TGG + Chr6:107557076-107557095 None:intergenic 40.0%
TTGGTGGAATGCTACCAAAT+AGG + Chr6:107554069-107554088 None:intergenic 40.0%
TTGTCCCTCGTTTATCAGTT+TGG + Chr6:107556057-107556076 None:intergenic 40.0%
TTTCTCAAGCAGTGAAGCTA+GGG - Chr6:107555281-107555300 MsG0680035526.01.T01:CDS 40.0%
! TGGATTTCTTCTTGCGGTTT+TGG - Chr6:107554813-107554832 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
! TTGGGTTATTGTATCGATGG+TGG - Chr6:107555721-107555740 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
! TTTTTGATCTGCATCTGCTG+TGG + Chr6:107557847-107557866 None:intergenic 40.0%
!! ACGCCTTTTATCTGAAGTGT+TGG - Chr6:107556823-107556842 MsG0680035526.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTAGTCTTACTACTCTCAA+TGG - Chr6:107554298-107554317 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
!! CTGCACAAAAAGCACTTAAG+TGG - Chr6:107556238-107556257 MsG0680035526.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGAAAGGTACCTTTCCTA+TGG + Chr6:107555401-107555420 None:intergenic 40.0%
!! TATTGTAAGGCATCCGGTTT+TGG - Chr6:107554739-107554758 MsG0680035526.01.T01:intron 40.0%
!! TTGGATGTTGAAGCTTTGAG+AGG + Chr6:107555687-107555706 None:intergenic 40.0%
AAAACCGTGACCACGGATTT+CGG + Chr6:107554379-107554398 None:intergenic 45.0%
AAAGAGAACAATGCCAACGG+CGG + Chr6:107554502-107554521 None:intergenic 45.0%
AACAATCGCAGTCAAGGTAG+CGG - Chr6:107557319-107557338 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
AACGGTGAAAACGGTAACGT+CGG - Chr6:107557492-107557511 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
ATCACCAACACAACCATGCT+TGG - Chr6:107556901-107556920 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
CAGTATCACAACACCCGTAA+GGG + Chr6:107557371-107557390 None:intergenic 45.0%
CGGTGGAAAACTTGGTTATG+TGG - Chr6:107554591-107554610 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
CTTAAGTGGCCTGATAGACT+TGG - Chr6:107556252-107556271 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
GAACCATAGGCATCATTTGG+AGG - Chr6:107557651-107557670 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
GAGGACCAAACTGATAAACG+AGG - Chr6:107556049-107556068 MsG0680035526.01.T01:intron 45.0%
GATTCTCAGAATCAGCAGAG+AGG - Chr6:107554712-107554731 MsG0680035526.01.T01:intron 45.0%
GCAATCGTCGCTATCATTGT+TGG - Chr6:107554793-107554812 MsG0680035526.01.T01:intron 45.0%
GCATCATTTGGAGGTCAAGA+TGG - Chr6:107557660-107557679 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
GCTAAACAAAACCGTGACCA+CGG + Chr6:107554386-107554405 None:intergenic 45.0%
GGAGAGATACCGAAGAAGTT+TGG - Chr6:107554421-107554440 MsG0680035526.01.T01:intron 45.0%
TCAGTATCACAACACCCGTA+AGG + Chr6:107557372-107557391 None:intergenic 45.0%
TCTGATAAACTTCGTTGCGG+TGG - Chr6:107554574-107554593 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
TGACCTCCAAATGATGCCTA+TGG + Chr6:107557657-107557676 None:intergenic 45.0%
TTTCACGATTTCGGCCCTTA+CGG - Chr6:107557354-107557373 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
! CTTCAGATAAAAGGCGTGTC+CGG + Chr6:107556820-107556839 None:intergenic 45.0%
! GGTAGAGATTGAAGGCATGA+AGG + Chr6:107556639-107556658 None:intergenic 45.0%
! TCAAGGTAGCGGTCACATAT+AGG - Chr6:107557330-107557349 MsG0680035526.01.T01:CDS 45.0%
! TTCTGATGAAACACCGGTTG+TGG + Chr6:107554923-107554942 None:intergenic 45.0%
!! CAGCGTTTTGAGTGGTTGAA+AGG + Chr6:107555415-107555434 None:intergenic 45.0%
!! CGATCAAACAGCGTTTTGAG+TGG + Chr6:107555423-107555442 None:intergenic 45.0%
!! TGTATTGGTGATGGCTCCAT+AGG - Chr6:107555382-107555401 MsG0680035526.01.T01:intron 45.0%
!!! CTTCTTGCGGTTTTGGTGTT+TGG - Chr6:107554820-107554839 MsG0680035526.01.T01:intron 45.0%
!! ATTTATAATGAATTATTAAA+CGG - Chr6:107555448-107555467 MsG0680035526.01.T01:intron 5.0%
!!! TAAAAATAATTAATTTGTTA+AGG + Chr6:107556977-107556996 None:intergenic 5.0%
ACCACGGATTTCGGCAAAAG+CGG + Chr6:107554370-107554389 None:intergenic 50.0%
CACATGTCTCAGTGTCATGG+TGG - Chr6:107556753-107556772 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
CACCATGACACTGAGACATG+TGG + Chr6:107556755-107556774 None:intergenic 50.0%
CATGAACTTGTACGGCGCTA+TGG + Chr6:107556113-107556132 None:intergenic 50.0%
CTTCGTTGCGGTGGAAAACT+TGG - Chr6:107554583-107554602 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
GACACCAGACATGTTGACAC+CGG - Chr6:107556798-107556817 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
GACCACATGTCTCAGTGTCA+TGG - Chr6:107556750-107556769 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
GCAGAGAGGGTCGTATTGTA+AGG - Chr6:107554726-107554745 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
GGACCCATTACACGTGACAA+AGG - Chr6:107557069-107557088 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
GTCATAACGGTGTTTCGTCG+CGG - Chr6:107557428-107557447 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
TTCACGATTTCGGCCCTTAC+GGG - Chr6:107557355-107557374 MsG0680035526.01.T01:CDS 50.0%
TTTGCCGAAATCCGTGGTCA+CGG - Chr6:107554372-107554391 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
! CAGTCCTTTTCGCGAGAAGT+GGG - Chr6:107554990-107555009 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
! GGGTCGTATTGTAAGGCATC+CGG - Chr6:107554733-107554752 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
! TCAGTCCTTTTCGCGAGAAG+TGG - Chr6:107554989-107555008 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
!! GTTGTGTTGGTGATGCTGTG+TGG + Chr6:107556895-107556914 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGATGGCTCCATAGGAA+AGG - Chr6:107555387-107555406 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
!!! GTAAGGCATCCGGTTTTGGA+TGG - Chr6:107554743-107554762 MsG0680035526.01.T01:intron 50.0%
GTAGCCCACTTCTCGCGAAA+AGG + Chr6:107554997-107555016 None:intergenic 55.0%
GTGGCACAATGTGCCAACAG+AGG - Chr6:107555032-107555051 MsG0680035526.01.T01:intron 55.0%
! GTGTCCGGTGTCAACATGTC+TGG + Chr6:107556805-107556824 None:intergenic 55.0%
!! ACCGCTTTTGCCGAAATCCG+TGG - Chr6:107554366-107554385 MsG0680035526.01.T01:intron 55.0%
!! GCGAGAAGTGGGCTACAATG+TGG - Chr6:107555001-107555020 MsG0680035526.01.T01:intron 55.0%
! TCTTAAGGGTACGCCGCCGT+TGG - Chr6:107554486-107554505 MsG0680035526.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 107553755 107557875 107553755 ID=MsG0680035526.01;Name=MsG0680035526.01
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Gene Sequence

>MsG0680035526.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680035526.01.T01

MENYINDLCYLPPSSNLSIKCEDNSIIELKIFGEKSLKPSSFNGFAIPNQTLSMNFSIDSFFTTLTKLKTLKVLSLVSLGIWGKLPNKIQSLTLLQVFDLSSNFLFGSIPPKISTMVKLQSLTLDENYFNTNMPNWFDSLFNLSILSLKKNHLKGSFPTSLCKIKTLKVISLSQNELSGGLPSLTTLNGLHVLDLRENRFEFELPLLPKSVVTVLFSNNSFSGEIPKKFGELNHLQHLDLSSNHLKGTPPLALFSLSNLSYLNLANNVLSGEFSDKLRCGGKLGYVDISSNKLSGLLPSCLVNSSNGRVVRYGRNCLSVDSQNQQRGSYCKASGFGWMKLKEWKVVAIVAIIVGFLLAVLVFGVLLCKKCRLMKKTRKDVLRKIVQDKSTTGVSSEVLANARFISQAVKLGTQTTLTCRQFSIQDLKEATKNFNLSTCIGDGSIGKLYKGKLENGTYVVIRSMVLSKKCSIQSLKAKLDYLSKLQHPNLVSLLGYCIDGGEQDDSSNQKLHLMYEYVPNGDYHTHLSEYSAQKALKWPDRLGILIGVAKAVHFLHTGVIPGCFSNQLKTKSVLLDEHCIPKLSDYGMSVIKEDIEKFETKSEKKSKSCPKTKMDNDVYNFGFILLESLVGPITRDKGETFFINEKASFGGQDGRRKIVDPIVLTTCSQESLSIAISITTKCIAQDSSSRPSFEDVLWNLQYAAQVQATADADQKSD*